]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - PHOS/AliPHOSGetter.cxx
Corrections for CINT compilation
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSGetter.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 //_________________________________________________________________________
19 //  A singleton. This class should be used in the analysis stage to get 
20 //  reconstructed objects: Digits, RecPoints, TrackSegments and RecParticles,
21 //  instead of directly reading them from galice.root file. This container 
22 //  ensures, that one reads Digits, made of these particular digits, RecPoints, 
23 //  made of these particular RecPoints, TrackSegments and RecParticles. 
24 //  This becomes non trivial if there are several identical branches, produced with
25 //  different set of parameters. 
26 //
27 //  An example of how to use (see also class AliPHOSAnalyser):
28 //  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance("galice.root","test") ;
29 //  for(Int_t irecp = 0; irecp < gime->NRecParticles() ; irecp++)
30 //     AliPHOSRecParticle * part = gime->RecParticle(1) ;
31 //     ................
32 //  gime->Event(event) ;    // reads new event from galice.root
33 //                  
34 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH) & Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
35 //*--         Completely redesigned by Dmitri Peressounko March 2001  
36 //
37 //*-- YS June 2001 : renamed the original AliPHOSIndexToObject and make
38 //*--         systematic usage of TFolders without changing the interface        
39 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
40
41 // --- ROOT system ---
42
43 #include <TFile.h>
44 #include <TROOT.h>
45 #include <TSystem.h>
46 #include <TParticle.h>
47 #include <TF1.h>
48 #include <TGraph.h>
49 //#include <TCanvas.h>
50 //#include <TFrame.h>
51
52 // --- Standard library ---
53
54 // --- AliRoot header files ---
55 #include "AliESD.h"
56 #include "AliHeader.h"  
57 #include "AliMC.h"
58 #include "AliPHOS.h"
59 #include "AliPHOSBeamTestEvent.h"
60 #include "AliPHOSGetter.h"
61 #include "AliPHOSLoader.h"
62 #include "AliRunLoader.h"
63 #include "AliStack.h"  
64 #include "AliPHOSRawStream.h"
65 #include "AliRawReaderFile.h"
66 #include "AliLog.h"
67 #include "AliCDBLocal.h"
68 #include "AliCDBStorage.h"
69 #include "AliCDBManager.h"
70
71 ClassImp(AliPHOSGetter)
72   
73 AliPHOSGetter * AliPHOSGetter::fgObjGetter = 0 ; 
74 AliPHOSLoader * AliPHOSGetter::fgPhosLoader = 0;
75 Int_t AliPHOSGetter::fgDebug = 0;
76 AliPHOSCalibData* AliPHOSGetter::fCalibData = 0;
77
78 //  TFile * AliPHOSGetter::fgFile = 0 ; 
79
80 //____________________________________________________________________________ 
81 AliPHOSGetter::AliPHOSGetter(const char* headerFile, const char* version, Option_t * openingOption)
82 {
83   // ctor only called by Instance()
84
85   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(version) ; 
86   if (!rl) {
87     rl = AliRunLoader::Open(headerFile, version, openingOption);
88     if (!rl) {
89       Fatal("AliPHOSGetter", "Could not find the Run Loader for %s - %s",headerFile, version) ; 
90       return ;
91     } 
92     if (rl->GetAliRun() == 0x0) {
93       rl->LoadgAlice();
94       gAlice = rl->GetAliRun(); // should be removed
95       rl->LoadHeader();
96     }
97   }
98   fgPhosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
99   if ( !fgPhosLoader ) 
100     Error("AliPHOSGetter", "Could not find PHOSLoader") ; 
101   else 
102     fgPhosLoader->SetTitle(version);
103   
104   // initialize data members
105   SetDebug(0) ; 
106   fBTE = 0 ; 
107   fPrimaries = 0 ; 
108   fLoadingStatus = "" ; 
109  
110   fESDFileName = rl->GetFileName()  ; // this should be the galice.root file
111   fESDFileName.ReplaceAll("galice.root", "AliESDs.root") ;  
112   fESDFile = 0 ; 
113   fESD = 0 ; 
114   fESDTree = 0 ; 
115   fRawDigits = kFALSE ;
116
117 }
118
119 //____________________________________________________________________________ 
120 AliPHOSGetter::~AliPHOSGetter()
121 {
122   // dtor
123   if(fgPhosLoader){
124     delete fgPhosLoader ;
125     fgPhosLoader = 0 ;
126   }
127   if(fBTE){
128     delete fBTE ; 
129     fBTE = 0 ;
130   } 
131   if(fPrimaries){
132     fPrimaries->Delete() ; 
133     delete fPrimaries ;
134   } 
135   if (fESD) 
136     delete fESD ; 
137   if (fESDTree) 
138     delete fESDTree ;
139  
140   fgObjGetter = 0;
141 }
142
143 //____________________________________________________________________________ 
144 void AliPHOSGetter::Reset()
145 {
146   // resets things in case the getter is called consecutively with different files
147   // the PHOS Loader is already deleted by the Run Loader
148
149   if (fPrimaries) { 
150     fPrimaries->Delete() ; 
151     delete fPrimaries ;
152   } 
153   fgPhosLoader = 0; 
154   fgObjGetter = 0; 
155 }
156
157 //____________________________________________________________________________ 
158 AliPHOSClusterizer * AliPHOSGetter::Clusterizer()
159
160   // Returns pointer to the Clusterizer task 
161   AliPHOSClusterizer * rv ; 
162   rv =  dynamic_cast<AliPHOSClusterizer *>(PhosLoader()->Reconstructioner()) ;
163   if (!rv) {
164     Event(0, "R") ; 
165     rv =  dynamic_cast<AliPHOSClusterizer*>(PhosLoader()->Reconstructioner()) ;
166   }
167   return rv ; 
168 }
169
170 //____________________________________________________________________________ 
171 TObjArray * AliPHOSGetter::CpvRecPoints() 
172 {
173   // asks the Loader to return the CPV RecPoints container 
174
175   TObjArray * rv = 0 ; 
176   
177   rv = PhosLoader()->CpvRecPoints() ; 
178   if (!rv) {
179     PhosLoader()->MakeRecPointsArray() ;
180     rv = PhosLoader()->CpvRecPoints() ; 
181   }
182   return rv ; 
183 }
184
185 //____________________________________________________________________________ 
186 TClonesArray * AliPHOSGetter::Digits() 
187 {
188   // asks the Loader to return the Digits container 
189
190   TClonesArray * rv = 0 ; 
191   rv = PhosLoader()->Digits() ; 
192
193   if( !rv ) {
194     PhosLoader()->MakeDigitsArray() ; 
195     rv = PhosLoader()->Digits() ;
196   }
197   return rv ; 
198 }
199
200 //____________________________________________________________________________ 
201 AliPHOSDigitizer * AliPHOSGetter::Digitizer() 
202
203   // Returns pointer to the Digitizer task 
204   AliPHOSDigitizer * rv ; 
205   rv =  dynamic_cast<AliPHOSDigitizer *>(PhosLoader()->Digitizer()) ;
206   if (!rv) {
207     Event(0, "D") ; 
208     rv =  dynamic_cast<AliPHOSDigitizer *>(PhosLoader()->Digitizer()) ;
209   }
210   return rv ; 
211 }
212
213
214 //____________________________________________________________________________ 
215 TObjArray * AliPHOSGetter::EmcRecPoints() 
216 {
217   // asks the Loader to return the EMC RecPoints container 
218
219   TObjArray * rv = 0 ; 
220   
221   rv = PhosLoader()->EmcRecPoints() ; 
222   if (!rv) {
223     PhosLoader()->MakeRecPointsArray() ;
224     rv = PhosLoader()->EmcRecPoints() ; 
225   }
226   return rv ; 
227 }
228
229 //____________________________________________________________________________ 
230 TClonesArray * AliPHOSGetter::TrackSegments() 
231 {
232   // asks the Loader to return the TrackSegments container 
233
234   TClonesArray * rv = 0 ; 
235   
236   rv = PhosLoader()->TrackSegments() ; 
237   if (!rv) {
238     PhosLoader()->MakeTrackSegmentsArray() ;
239     rv = PhosLoader()->TrackSegments() ; 
240   }
241   return rv ; 
242 }
243
244 //____________________________________________________________________________ 
245 AliPHOSTrackSegmentMaker * AliPHOSGetter::TrackSegmentMaker()
246
247   // Returns pointer to the TrackSegmentMaker task 
248   AliPHOSTrackSegmentMaker * rv ; 
249   rv =  dynamic_cast<AliPHOSTrackSegmentMaker *>(PhosLoader()->TrackSegmentMaker()) ;
250   if (!rv) {
251     Event(0, "T") ; 
252     rv =  dynamic_cast<AliPHOSTrackSegmentMaker *>(PhosLoader()->TrackSegmentMaker()) ;
253   }
254   return rv ; 
255 }
256
257 //____________________________________________________________________________ 
258 TClonesArray * AliPHOSGetter::RecParticles() 
259 {
260   // asks the Loader to return the TrackSegments container 
261
262   TClonesArray * rv = 0 ; 
263   
264   rv = PhosLoader()->RecParticles() ; 
265   if (!rv) {
266     PhosLoader()->MakeRecParticlesArray() ;
267     rv = PhosLoader()->RecParticles() ; 
268   }
269   return rv ; 
270 }
271 //____________________________________________________________________________ 
272 void AliPHOSGetter::Event(Int_t event, const char* opt) 
273 {
274   // Reads the content of all Tree's S, D and R
275
276 //   if ( event >= MaxEvent() ) {
277 //     Error("Event", "%d not found in TreeE !", event) ; 
278 //     return ; 
279 //   }
280
281   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
282
283 //   // checks if we are dealing with test-beam data
284 //   TBranch * btb = rl->TreeE()->GetBranch("AliPHOSBeamTestEvent") ;
285 //   if(btb){
286 //     if(!fBTE)
287 //       fBTE = new AliPHOSBeamTestEvent() ;
288 //     btb->SetAddress(&fBTE) ;
289 //     btb->GetEntry(event) ;
290 //   }
291 //   else{
292 //     if(fBTE){
293 //       delete fBTE ;
294 //       fBTE = 0 ;
295 //     }
296 //   }
297
298   // Loads the type of object(s) requested
299   
300   rl->GetEvent(event) ;
301
302   if(strstr(opt,"X") || (strcmp(opt,"")==0)){
303     ReadPrimaries() ;
304   }
305   
306   if(strstr(opt,"H")  ){
307     ReadTreeH();
308   }
309   
310   if(strstr(opt,"S")  ){
311     ReadTreeS() ;
312   }
313   
314   if(strstr(opt,"D") ){
315     ReadTreeD() ;
316   }
317   
318   if(strstr(opt,"R") ){
319     ReadTreeR() ;
320   }
321
322   if( strstr(opt,"T") ){
323     ReadTreeT() ;
324   }    
325
326   if( strstr(opt,"P") ){
327     ReadTreeP() ;
328   }    
329
330   if( strstr(opt,"E") ){
331     ReadTreeE(event) ;
332   }
333
334 }
335
336
337 //____________________________________________________________________________ 
338 void AliPHOSGetter::Event(AliRawReader *rawReader, const char* opt) 
339 {
340   // Reads the raw event from rawReader
341
342   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
343   
344   if( strstr(opt,"W")  ){
345     rawReader->NextEvent(); 
346     Int_t iEvent = rl->GetEventNumber();
347     rl->GetEvent(iEvent);
348     ReadRaw(rawReader) ;
349     rl->SetEventNumber(++iEvent);
350   }    
351  
352 }
353
354
355 //____________________________________________________________________________ 
356 Int_t AliPHOSGetter::EventNumber() const
357   {
358   // return the current event number
359   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
360   return static_cast<Int_t>(rl->GetEventNumber()) ;   
361 }
362
363 //____________________________________________________________________________ 
364   TClonesArray * AliPHOSGetter::Hits()  
365 {
366   // asks the loader to return  the Hits container 
367   
368   TClonesArray * rv = 0 ; 
369   
370   rv = PhosLoader()->Hits() ; 
371   if ( !rv ) {
372     PhosLoader()->LoadHits("read"); 
373     rv = PhosLoader()->Hits() ; 
374   }
375   return rv ; 
376 }
377
378 //____________________________________________________________________________ 
379 AliPHOSGetter * AliPHOSGetter::Instance(const char* alirunFileName, const char* version, Option_t * openingOption) 
380 {
381   // Creates and returns the pointer of the unique instance
382   // Must be called only when the environment has changed
383   
384   if(!fgObjGetter){ // first time the getter is called 
385     fgObjGetter = new AliPHOSGetter(alirunFileName, version, openingOption) ;
386   }
387   else { // the getter has been called previously
388     AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fgPhosLoader->GetTitle());
389     if ( rl->GetFileName() == alirunFileName ) {// the alirunFile has the same name
390       // check if the file is already open
391       TFile * galiceFile = dynamic_cast<TFile *>(gROOT->FindObject(rl->GetFileName()) ) ; 
392       
393       if ( !galiceFile ) 
394         fgObjGetter = new AliPHOSGetter(alirunFileName, version, openingOption) ;
395       
396       else {  // the file is already open check the version name
397         TString currentVersionName = rl->GetEventFolder()->GetName() ; 
398         TString newVersionName(version) ; 
399         if (currentVersionName == newVersionName) 
400           if(fgDebug)
401             ::Warning( "Instance", "Files with version %s already open", currentVersionName.Data() ) ;  
402         else {
403           fgObjGetter = new AliPHOSGetter(alirunFileName, version, openingOption) ;      
404         }
405       }
406     }
407     else {
408       AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fgPhosLoader->GetTitle()) ; 
409       if ( strstr(version, AliConfig::GetDefaultEventFolderName()) ) // false in case of merging
410         delete rl ; 
411       fgObjGetter = new AliPHOSGetter(alirunFileName, version, openingOption) ;      
412     }
413   }
414   if (!fgObjGetter) 
415     ::Error("AliPHOSGetter::Instance", "Failed to create the PHOS Getter object") ;
416   else 
417     if (fgDebug)
418       Print() ;
419   
420   return fgObjGetter ;
421 }
422
423 //____________________________________________________________________________ 
424 AliPHOSGetter *  AliPHOSGetter::Instance()
425 {
426   // Returns the pointer of the unique instance already defined
427   
428   if(!fgObjGetter && fgDebug)
429      ::Warning("AliPHOSGetter::Instance", "Getter not initialized") ;
430
431    return fgObjGetter ;
432            
433 }
434
435 //____________________________________________________________________________ 
436 Int_t AliPHOSGetter::MaxEvent() const 
437 {
438   // returns the number of events in the run (from TE)
439
440   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
441   return static_cast<Int_t>(rl->GetNumberOfEvents()) ; 
442 }
443
444 //____________________________________________________________________________ 
445 TParticle * AliPHOSGetter::Primary(Int_t index) const
446 {
447   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
448   return rl->Stack()->Particle(index) ; 
449
450
451 //____________________________________________________________________________ 
452 AliPHOS * AliPHOSGetter:: PHOS() const  
453 {
454   // returns the PHOS object 
455   AliPHOSLoader *    loader = 0;
456   static AliPHOSLoader * oldloader = 0;
457   static AliPHOS * phos = 0;
458
459   loader = PhosLoader();
460
461   if ( loader != oldloader) {
462     phos = dynamic_cast<AliPHOS*>(loader->GetModulesFolder()->FindObject("PHOS")) ;
463     oldloader = loader;
464   }
465   if (!phos) 
466     if (fgDebug)
467       Warning("PHOS", "PHOS module not found in module folders: %s", PhosLoader()->GetModulesFolder()->GetName() ) ; 
468   return phos ; 
469 }  
470
471
472
473 //____________________________________________________________________________ 
474 AliPHOSPID * AliPHOSGetter::PID()
475
476   // Returns pointer to the PID task 
477   AliPHOSPID * rv ; 
478   rv =  dynamic_cast<AliPHOSPID *>(PhosLoader()->PIDTask()) ;
479   if (!rv) {
480     Event(0, "P") ; 
481     rv =  dynamic_cast<AliPHOSPID *>(PhosLoader()->PIDTask()) ;
482   }
483   return rv ; 
484 }
485
486 //____________________________________________________________________________ 
487 AliPHOSGeometry * AliPHOSGetter::PHOSGeometry() const 
488 {
489   // Returns PHOS geometry
490
491   AliPHOSGeometry * rv = 0 ; 
492   if (PHOS() )
493     rv =  PHOS()->GetGeometry() ;
494   return rv ; 
495
496
497 //____________________________________________________________________________ 
498 TClonesArray * AliPHOSGetter::Primaries()  
499 {
500   // creates the Primaries container if needed
501   if ( !fPrimaries ) {
502     if (fgDebug) 
503       Info("Primaries", "Creating a new TClonesArray for primaries") ; 
504     fPrimaries = new TClonesArray("TParticle", 1000) ;
505   } 
506   return fPrimaries ; 
507 }
508
509 //____________________________________________________________________________ 
510 void  AliPHOSGetter::Print() 
511 {
512   // Print usefull information about the getter
513     
514   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fgPhosLoader->GetTitle());
515   ::Info( "Print", "gAlice file is %s -- version name is %s", (rl->GetFileName()).Data(), rl->GetEventFolder()->GetName() ) ; 
516 }
517
518 //____________________________________________________________________________ 
519 void AliPHOSGetter::ReadPrimaries()  
520 {
521   // Read Primaries from Kinematics.root
522   
523   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
524   
525   // gets kine tree from the root file (Kinematics.root)
526   if ( ! rl->TreeK() ) { // load treeK the first time
527     rl->LoadKinematics() ;
528   }
529   
530   fNPrimaries = (rl->GetHeader())->GetNtrack(); 
531   if (fgDebug) 
532     Info( "ReadTreeK", "Found %d particles in event # %d", fNPrimaries, EventNumber() ) ; 
533
534
535   // first time creates the container
536   if ( Primaries() ) 
537     fPrimaries->Clear() ; 
538   
539   Int_t index = 0 ; 
540   for (index = 0 ; index < fNPrimaries; index++) { 
541     new ((*fPrimaries)[index]) TParticle(*(Primary(index)));
542   }
543 }
544
545 //____________________________________________________________________________ 
546 Bool_t AliPHOSGetter::OpenESDFile() 
547 {
548   //Open the ESD file    
549   Bool_t rv = kTRUE ; 
550   if (!fESDFile) {
551     fESDFile = TFile::Open(fESDFileName) ;
552     if (!fESDFile ) 
553       return kFALSE ; 
554   }
555   else if (fESDFile->IsOpen()) {
556     fESDFile->Close() ; 
557     fESDFile = TFile::Open(fESDFileName) ;
558   }
559   if (!fESDFile->IsOpen())
560     rv = kFALSE ; 
561   return rv ; 
562 }
563
564 //____________________________________________________________________________ 
565 void AliPHOSGetter::FitRaw(Bool_t lowGainFlag, TGraph * gLowGain, TGraph * gHighGain, TF1* signalF, Double_t & energy, Double_t & time)
566 {
567   // Fits the raw signal time distribution 
568
569   const Int_t kNoiseThreshold = 0 ;
570   Double_t timezero1 = 0., timezero2 = 0., timemax = 0. ;
571   Double_t signal = 0., signalmax = 0. ;       
572   time   = 0. ; 
573   energy = 0. ; 
574
575   if (lowGainFlag) {
576     timezero1 = timezero2 = signalmax = timemax = 0. ;
577     signalF->FixParameter(0, PHOS()->GetRawFormatLowCharge()) ; 
578     signalF->FixParameter(1, PHOS()->GetRawFormatLowGain()) ; 
579     Int_t index ; 
580     for (index = 0; index < PHOS()->GetRawFormatTimeBins(); index++) {
581       gLowGain->GetPoint(index, time, signal) ; 
582       if (signal > kNoiseThreshold && timezero1 == 0.) 
583         timezero1 = time ;
584       if (signal <= kNoiseThreshold && timezero1 > 0. && timezero2 == 0.)
585         timezero2 = time ; 
586       if (signal > signalmax) {
587         signalmax = signal ; 
588         timemax   = time ; 
589       }
590     }
591     signalmax /= PHOS()->RawResponseFunctionMax(PHOS()->GetRawFormatLowCharge(), 
592                                                 PHOS()->GetRawFormatLowGain()) ;
593     if ( timezero1 + PHOS()->GetRawFormatTimePeak() < PHOS()->GetRawFormatTimeMax() * 0.4 ) { // else its noise 
594       signalF->SetParameter(2, signalmax) ; 
595       signalF->SetParameter(3, timezero1) ;         
596       gLowGain->Fit(signalF, "QRON", "", 0., timezero2); //, "QRON") ; 
597       energy = signalF->GetParameter(2) ; 
598       time   = signalF->GetMaximumX() - PHOS()->GetRawFormatTimePeak() - PHOS()->GetRawFormatTimeTrigger() ;
599     }
600   } else {
601     timezero1 = timezero2 = signalmax = timemax = 0. ;
602     signalF->FixParameter(0, PHOS()->GetRawFormatHighCharge()) ; 
603     signalF->FixParameter(1, PHOS()->GetRawFormatHighGain()) ; 
604     Int_t index ; 
605     for (index = 0; index < PHOS()->GetRawFormatTimeBins(); index++) {
606       gHighGain->GetPoint(index, time, signal) ;               
607       if (signal > kNoiseThreshold && timezero1 == 0.) 
608         timezero1 = time ;
609       if (signal <= kNoiseThreshold && timezero1 > 0. && timezero2 == 0.)
610         timezero2 = time ; 
611       if (signal > signalmax) {
612         signalmax = signal ;   
613         timemax   = time ; 
614       }
615     }
616     signalmax /= PHOS()->RawResponseFunctionMax(PHOS()->GetRawFormatHighCharge(), 
617                                                 PHOS()->GetRawFormatHighGain()) ;;
618     if ( timezero1 + PHOS()->GetRawFormatTimePeak() < PHOS()->GetRawFormatTimeMax() * 0.4 ) { // else its noise  
619       signalF->SetParameter(2, signalmax) ; 
620       signalF->SetParameter(3, timezero1) ;               
621       gHighGain->Fit(signalF, "QRON", "", 0., timezero2) ; 
622       energy = signalF->GetParameter(2) ; 
623       time   = signalF->GetMaximumX() - PHOS()->GetRawFormatTimePeak() - PHOS()->GetRawFormatTimeTrigger() ;
624     }
625   }
626   if (time == 0) energy = 0 ; 
627 }
628
629 //____________________________________________________________________________ 
630 Int_t AliPHOSGetter::CalibrateRaw(Double_t energy, Int_t *relId)
631 {
632   // Convert energy into digitized amplitude for a cell relId
633   // It is a user responsilibity to open CDB and set
634   // AliPHOSCalibData object by the following operators:
635   // 
636   // AliCDBLocal *loc = new AliCDBLocal("deCalibDB");
637   // AliPHOSCalibData* clb = (AliPHOSCalibData*)AliCDBStorage::Instance()
638   //    ->Get(path_to_calibdata,run_number);
639   // AliPHOSGetter* gime = AliPHOSGetter::Instance("galice.root");
640   // gime->SetCalibData(clb);
641
642   if (CalibData() == 0)
643     Warning("CalibrateRaw","Calibration DB is not initiated!");
644
645   Int_t   module = relId[0];
646   Int_t   column = relId[3];
647   Int_t   row    = relId[2];
648
649   Float_t gainFactor = 0.0015; // width of one Emc ADC channel in GeV
650   Float_t pedestal   = 0.005;  // Emc pedestals
651
652   if(CalibData()) {
653     gainFactor = CalibData()->GetADCchannelEmc (module,column,row);
654     pedestal   = CalibData()->GetADCpedestalEmc(module,column,row);
655   }
656   
657   Int_t   amp = static_cast<Int_t>( (energy - pedestal) / gainFactor + 0.5 ) ; 
658   return amp;
659 }
660 //____________________________________________________________________________ 
661 Int_t AliPHOSGetter::ReadRaw(AliRawReader *rawReader)
662 {
663   // reads the raw format data, converts it into digits format and store digits in Digits()
664   // container.
665
666   AliPHOSRawStream in(rawReader);
667  
668   Bool_t first = kTRUE ;
669   
670   TF1 * signalF = new TF1("signal", AliPHOS::RawResponseFunction, 0, PHOS()->GetRawFormatTimeMax(), 4);
671   signalF->SetParNames("Charge", "Gain", "Amplitude", "TimeZero") ; 
672
673   Int_t relId[4], id =0;
674   Bool_t lowGainFlag = kFALSE ; 
675  
676   TClonesArray * digits = Digits() ;
677   digits->Clear() ; 
678   Int_t idigit = 0 ; 
679   Int_t amp    = 0 ; 
680   Double_t energy = 0. ; 
681   Double_t time   = 0. ; 
682
683   TGraph * gLowGain = new TGraph(PHOS()->GetRawFormatTimeBins()) ; 
684   TGraph * gHighGain= new TGraph(PHOS()->GetRawFormatTimeBins()) ;  
685
686   while ( in.Next() ) { // PHOS entries loop 
687     if ( (in.IsNewRow() || in.IsNewColumn() || in.IsNewModule()) ) {
688       relId[0] = in.GetModule() ;
689       if ( relId[0] >= PHOS()->GetRawFormatLowGainOffset() ) { 
690         relId[0] -=  PHOS()->GetRawFormatLowGainOffset() ;
691         lowGainFlag = kTRUE ;
692       } else
693         lowGainFlag = kFALSE ;
694       relId[1] = 0 ;
695       relId[2] = in.GetRow() ;
696       relId[3] = in.GetColumn() ;
697       PHOSGeometry()->RelToAbsNumbering(relId, id) ;
698       if (!first) {
699         FitRaw(lowGainFlag, gLowGain, gHighGain, signalF, energy, time) ; 
700         amp = CalibrateRaw(energy,relId);
701         if (amp > 0) {
702           new((*digits)[idigit]) AliPHOSDigit( -1, id, amp, time) ;     
703           idigit++ ; 
704         }
705         Int_t index ; 
706         for (index = 0; index < PHOS()->GetRawFormatTimeBins(); index++) {
707           gLowGain->SetPoint(index, index * PHOS()->GetRawFormatTimeMax() / PHOS()->GetRawFormatTimeBins(), 0) ;  
708           gHighGain->SetPoint(index, index * PHOS()->GetRawFormatTimeMax() / PHOS()->GetRawFormatTimeBins(), 0) ; 
709         } 
710       }
711       first = kFALSE ; 
712     }
713     if (lowGainFlag)
714       gLowGain->SetPoint(in.GetTime(), 
715                      in.GetTime()* PHOS()->GetRawFormatTimeMax() / PHOS()->GetRawFormatTimeBins(), 
716                      in.GetSignal()) ;
717     else 
718       gHighGain->SetPoint(in.GetTime(), 
719                          in.GetTime() * PHOS()->GetRawFormatTimeMax() / PHOS()->GetRawFormatTimeBins(), 
720                          in.GetSignal() ) ;
721
722   } // PHOS entries loop
723
724   FitRaw(lowGainFlag, gLowGain, gHighGain, signalF, energy, time) ; 
725   amp = CalibrateRaw(energy,relId);
726   if (amp > 0 ) {
727     new((*digits)[idigit]) AliPHOSDigit( -1, id, amp, time) ;
728     idigit++ ; 
729   }
730   digits->Sort() ; 
731
732   delete signalF ; 
733   delete gLowGain;
734   delete gHighGain ; 
735   
736 //   AliInfo(Form("Event %d, digits: %d\n", EventNumber(),digits->GetEntries())); //bvp
737   return digits->GetEntriesFast() ; 
738 }
739
740 //   TClonesArray * digits = Digits() ;
741 //   digits->Clear() ; 
742 //   Int_t idigit = 0 ; 
743
744 //   while ( in.Next() ) { // PHOS entries loop 
745  
746 //     Int_t amp = in.GetSignal() ; 
747 //     Double_t time = in.GetTime() ; 
748 //     Int_t relId[4], id ;
749
750 //     relId[0] = in.GetModule() ;
751 //     if ( relId[0] >= PHOS()->GetRawFormatLowGainOffset() ) { 
752 //       relId[0] -=  PHOS()->GetRawFormatLowGainOffset() ; 
753 //     }
754 //     relId[1] = 0 ; 
755 //     relId[2] = in.GetRow() ; 
756 //     relId[3] = in.GetColumn() ; 
757 //     PHOSGeometry()->RelToAbsNumbering(relId, id) ;   
758     
759 //     if (amp > 0 && id >=0 ) {
760 //       new((*digits)[idigit]) AliPHOSDigit( -1, id, amp, time) ;      
761 //       idigit++ ; 
762 //     }
763     
764 //   } // PHOS entries loop
765   
766 //   digits->Sort() ; 
767   
768 //   return digits->GetEntriesFast() ; 
769 // }
770 //____________________________________________________________________________ 
771 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeD()
772 {
773   // Read the Digits
774   
775   PhosLoader()->CleanDigits() ;    
776   PhosLoader()->LoadDigits("UPDATE") ;
777   PhosLoader()->LoadDigitizer("UPDATE") ;
778   return Digits()->GetEntries() ; 
779 }
780
781 //____________________________________________________________________________ 
782 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeH()
783 {
784   // Read the Hits
785   PhosLoader()->CleanHits() ;
786   // gets TreeH from the root file (PHOS.Hit.root)
787   //if ( !IsLoaded("H") ) {
788     PhosLoader()->LoadHits("UPDATE") ;
789   //  SetLoaded("H") ; 
790   //}  
791   return Hits()->GetEntries() ; 
792 }
793
794 //____________________________________________________________________________ 
795 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeR()
796 {
797   // Read the RecPoints
798   
799   PhosLoader()->CleanRecPoints() ;
800   // gets TreeR from the root file (PHOS.RecPoints.root)
801   //if ( !IsLoaded("R") ) {
802     PhosLoader()->LoadRecPoints("UPDATE") ;
803     PhosLoader()->LoadClusterizer("UPDATE") ;
804     //  SetLoaded("R") ; 
805     //}
806
807   return EmcRecPoints()->GetEntries() ; 
808 }
809
810 //____________________________________________________________________________ 
811 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeT()
812 {
813   // Read the TrackSegments
814   
815   PhosLoader()->CleanTracks() ; 
816   // gets TreeT from the root file (PHOS.TrackSegments.root)
817   //if ( !IsLoaded("T") ) {
818     PhosLoader()->LoadTracks("UPDATE") ;
819     PhosLoader()->LoadTrackSegmentMaker("UPDATE") ;
820     //    SetLoaded("T") ; 
821     //}
822
823   return TrackSegments()->GetEntries() ; 
824 }
825 //____________________________________________________________________________ 
826 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeP()
827 {
828   // Read the RecParticles
829   
830   PhosLoader()->CleanRecParticles() ; 
831
832   // gets TreeT from the root file (PHOS.TrackSegments.root)
833   //  if ( !IsLoaded("P") ) {
834     PhosLoader()->LoadRecParticles("UPDATE") ;
835     PhosLoader()->LoadPID("UPDATE") ;
836     //  SetLoaded("P") ; 
837     //}
838
839   return RecParticles()->GetEntries() ; 
840 }
841 //____________________________________________________________________________ 
842 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeS()
843 {
844   // Read the SDigits
845   
846   PhosLoader()->CleanSDigits() ; 
847   // gets TreeS from the root file (PHOS.SDigits.root)
848   //if ( !IsLoaded("S") ) {
849     PhosLoader()->LoadSDigits("READ") ;
850     PhosLoader()->LoadSDigitizer("READ") ;
851     //  SetLoaded("S") ; 
852     //}
853
854   return SDigits()->GetEntries() ; 
855 }
856
857 //____________________________________________________________________________ 
858 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeE(Int_t event)
859 {
860   // Read the ESD
861   
862   // gets esdTree from the root file (AliESDs.root)
863   if (!fESDFile)
864     if ( !OpenESDFile() ) 
865       return -1 ; 
866
867   fESDTree = static_cast<TTree*>(fESDFile->Get("esdTree")) ; 
868   fESD = new AliESD;
869    if (!fESDTree) {
870
871      Error("ReadTreeE", "no ESD tree found");
872      return -1;
873    }
874    fESDTree->SetBranchAddress("ESD", &fESD);
875    fESDTree->GetEvent(event);
876
877    return event ; 
878 }
879
880 //____________________________________________________________________________ 
881 TClonesArray * AliPHOSGetter::SDigits() 
882 {
883   // asks the Loader to return the Digits container 
884
885   TClonesArray * rv = 0 ; 
886   
887   rv = PhosLoader()->SDigits() ; 
888   if (!rv) {
889     PhosLoader()->MakeSDigitsArray() ;
890     rv = PhosLoader()->SDigits() ; 
891   }
892   return rv ; 
893 }
894
895 //____________________________________________________________________________ 
896 AliPHOSSDigitizer * AliPHOSGetter::SDigitizer()
897
898   // Returns pointer to the SDigitizer task 
899   AliPHOSSDigitizer * rv ; 
900   rv =  dynamic_cast<AliPHOSSDigitizer *>(PhosLoader()->SDigitizer()) ;
901   if (!rv) {
902     Event(0, "S") ; 
903     rv =  dynamic_cast<AliPHOSSDigitizer *>(PhosLoader()->SDigitizer()) ;
904   }
905   return rv ; 
906 }
907
908 //____________________________________________________________________________ 
909 TParticle * AliPHOSGetter::Secondary(const TParticle* p, Int_t index) const
910 {
911   // Return first (index=1) or second (index=2) secondary particle of primary particle p 
912
913   if(index <= 0) 
914     return 0 ;
915   if(index > 2)
916     return 0 ;
917
918   if(p) {
919   Int_t daughterIndex = p->GetDaughter(index-1) ; 
920   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
921   return  rl->GetAliRun()->GetMCApp()->Particle(daughterIndex) ; 
922   }
923   else
924     return 0 ;
925 }
926
927 //____________________________________________________________________________ 
928 void AliPHOSGetter::Track(Int_t itrack) 
929 {
930   // Read the first entry of PHOS branch in hit tree gAlice->TreeH()
931  
932  AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
933
934   if( !TreeH() ) // load treeH the first time
935     rl->LoadHits() ;
936
937   // first time create the container
938   TClonesArray * hits = Hits() ; 
939   if ( hits ) 
940     hits->Clear() ; 
941
942   TBranch * phosbranch = dynamic_cast<TBranch*>(TreeH()->GetBranch("PHOS")) ; 
943   phosbranch->SetAddress(&hits) ;
944   phosbranch->GetEntry(itrack) ;
945 }
946
947 //____________________________________________________________________________ 
948 TTree * AliPHOSGetter::TreeD() const 
949 {
950   // Returns pointer to the Digits Tree
951   TTree * rv = 0 ; 
952   rv = PhosLoader()->TreeD() ; 
953   if ( !rv ) {
954     PhosLoader()->MakeTree("D");
955     rv = PhosLoader()->TreeD() ;
956   } 
957   
958   return rv ; 
959 }
960
961 //____________________________________________________________________________ 
962 TTree * AliPHOSGetter::TreeH() const 
963 {
964   // Returns pointer to the Hits Tree
965   TTree * rv = 0 ; 
966   rv = PhosLoader()->TreeH() ; 
967   if ( !rv ) {
968     PhosLoader()->MakeTree("H");
969     rv = PhosLoader()->TreeH() ;
970   } 
971   
972   return rv ; 
973 }
974
975 //____________________________________________________________________________ 
976 TTree * AliPHOSGetter::TreeR() const 
977 {
978   // Returns pointer to the RecPoints Tree
979   TTree * rv = 0 ; 
980   rv = PhosLoader()->TreeR() ; 
981   if ( !rv ) {
982     PhosLoader()->MakeTree("R");
983     rv = PhosLoader()->TreeR() ;
984   } 
985   
986   return rv ; 
987 }
988
989 //____________________________________________________________________________ 
990 TTree * AliPHOSGetter::TreeT() const 
991 {
992   // Returns pointer to the TrackSegments Tree
993   TTree * rv = 0 ; 
994   rv = PhosLoader()->TreeT() ; 
995   if ( !rv ) {
996     PhosLoader()->MakeTree("T");
997     rv = PhosLoader()->TreeT() ;
998   } 
999   
1000   return rv ; 
1001 }
1002 //____________________________________________________________________________ 
1003 TTree * AliPHOSGetter::TreeP() const 
1004 {
1005   // Returns pointer to the RecParticles  Tree
1006   TTree * rv = 0 ; 
1007   rv = PhosLoader()->TreeP() ; 
1008   if ( !rv ) {
1009     PhosLoader()->MakeTree("P");
1010     rv = PhosLoader()->TreeP() ;
1011   } 
1012   
1013   return rv ; 
1014 }
1015
1016 //____________________________________________________________________________ 
1017 TTree * AliPHOSGetter::TreeS() const 
1018
1019  // Returns pointer to the SDigits Tree
1020   TTree * rv = 0 ; 
1021   rv = PhosLoader()->TreeS() ; 
1022   if ( !rv ) {
1023     PhosLoader()->MakeTree("S");
1024     rv = PhosLoader()->TreeS() ;
1025   } 
1026   
1027   return rv ; 
1028 }
1029
1030 //____________________________________________________________________________ 
1031 Bool_t AliPHOSGetter::VersionExists(TString & opt) const
1032 {
1033   // checks if the version with the present name already exists in the same directory
1034
1035   Bool_t rv = kFALSE ;
1036  
1037   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
1038   TString version( rl->GetEventFolder()->GetName() ) ; 
1039
1040   opt.ToLower() ; 
1041   
1042   if ( opt == "sdigits") {
1043     // add the version name to the root file name
1044     TString fileName( PhosLoader()->GetSDigitsFileName() ) ; 
1045     if (version != AliConfig::GetDefaultEventFolderName()) // only if not the default folder name 
1046       fileName = fileName.ReplaceAll(".root", "") + "_" + version + ".root" ;
1047     if ( !(gSystem->AccessPathName(fileName)) ) { 
1048       Warning("VersionExists", "The file %s already exists", fileName.Data()) ;
1049       rv = kTRUE ; 
1050     }
1051     PhosLoader()->SetSDigitsFileName(fileName) ;
1052   }
1053
1054   if ( opt == "digits") {
1055     // add the version name to the root file name
1056     TString fileName( PhosLoader()->GetDigitsFileName() ) ; 
1057     if (version != AliConfig::GetDefaultEventFolderName()) // only if not the default folder name 
1058       fileName = fileName.ReplaceAll(".root", "") + "_" + version + ".root" ;
1059     if ( !(gSystem->AccessPathName(fileName)) ) {
1060       Warning("VersionExists", "The file %s already exists", fileName.Data()) ;  
1061       rv = kTRUE ; 
1062     }
1063   }
1064
1065   return rv ;
1066
1067 }
1068
1069 //____________________________________________________________________________ 
1070 UShort_t AliPHOSGetter::EventPattern(void) const
1071 {
1072   // Return the pattern (trigger bit register) of the beam-test event
1073   if(fBTE)
1074     return fBTE->GetPattern() ;
1075   else
1076     return 0 ;
1077 }
1078 //____________________________________________________________________________ 
1079 Float_t AliPHOSGetter::BeamEnergy(void) const
1080 {
1081   // Return the beam energy of the beam-test event
1082   if(fBTE)
1083     return fBTE->GetBeamEnergy() ;
1084   else
1085     return 0 ;
1086 }
1087 //____________________________________________________________________________ 
1088
1089 AliPHOSCalibData* AliPHOSGetter::CalibData()
1090
1091
1092   if( !(AliCDBManager::Instance()->IsDefaultStorageSet()) ) {
1093     fCalibData=0x0;
1094     Warning("CalibData","Calibration DB is not initiated!");
1095     return fCalibData;
1096   }
1097
1098   return fCalibData;
1099
1100   
1101 }