PHOS/AliPHOSPreprocessor.cxx

   1 /**************************************************************************
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   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
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  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 // PHOS Preprocessor class. It runs by Shuttle at the end of the run,
  20 // calculates calibration coefficients and dead/bad channels
  21 // to be posted in OCDB
  22 //
  23 // Author: Boris Polichtchouk, 4 October 2006
  24 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 #include "AliPHOSPreprocessor.h"
  27 #include "AliLog.h"
  28 #include "AliCDBMetaData.h"
  29 #include "AliPHOSEmcCalibData.h"
  30 #include "TFile.h"
  31 #include "TH1.h"
  32 #include "TF1.h"
  33 #include "TH2.h"
  34 #include "TMap.h"
  35 #include "TRandom.h"
  36 #include "TKey.h"
  37 #include "TList.h"
  38 #include "TObjString.h"
  39 #include "TObject.h"
  40 #include "TString.h"
  41 #include "TMath.h"
  42 #include "AliPHOSEmcBadChannelsMap.h"
  43
  44 ClassImp(AliPHOSPreprocessor)
  45
  46   Double_t rgaus(Double_t *x, Double_t *par)
  47 {
  48   Double_t gaus = par[0] * TMath::Exp( -(x[0]-par[1])*(x[0]-par[1]) /
  49                                        (2*par[2]*par[2]) );
  50   return gaus;
  51 }
  52
  53 //_______________________________________________________________________________________
  54 AliPHOSPreprocessor::AliPHOSPreprocessor() :
  55 AliPreprocessor("PHS",0)
  56 {
  57   //default constructor
  58 }
  59
  60 //_______________________________________________________________________________________
  61 AliPHOSPreprocessor::AliPHOSPreprocessor(AliShuttleInterface* shuttle):
  62 AliPreprocessor("PHS",shuttle)
  63 {
  64   // Constructor
  65 }
  66
  67 //_______________________________________________________________________________________
  68 UInt_t AliPHOSPreprocessor::Process(TMap* /*valueSet*/)
  69 {
  70   // process data retrieved by the Shuttle
  71
  72   // The fileName with the histograms which have been produced by
  73   // AliPHOSCalibHistoProducer.
  74   // It is a responsibility of the SHUTTLE framework to form the fileName
  75
  76   TString runType = GetRunType();
  77   Log(Form("Run type: %s",runType.Data()));
  78
  79   if(runType=="LED") {
  80     Bool_t ledOK = ProcessLEDRun();
  81     if(ledOK) return 0;
  82     else
  83       return 1;
  84   }
  85
  86   gRandom->SetSeed(0); //the seed is set to the current  machine clock!
  87   AliPHOSEmcCalibData calibData;
  88
  89   TList* list = GetFileSources(kDAQ, "AMPLITUDES");
  90   if(!list) {
  91     Log("Sources list not found, exit.");
  92     return 1;
  93   }
  94
  95   TIter iter(list);
  96   TObjString *source;
  97
  98   while ((source = dynamic_cast<TObjString *> (iter.Next()))) {
  99     AliInfo(Form("found source %s", source->String().Data()));
 100
 101     TString fileName = GetFile(kDAQ, "AMPLITUDES", source->GetName());
 102     AliInfo(Form("Got filename: %s",fileName.Data()));
 103
 104     TFile f(fileName);
 105
 106     if(!f.IsOpen()) {
 107       Log(Form("File %s is not opened, something goes wrong!",fileName.Data()));
 108       return 1;
 109     }
 110
 111     const Int_t nMod=5; // 1:5 modules
 112     const Int_t nCol=56; //1:56 columns in each module
 113     const Int_t nRow=64; //1:64 rows in each module
 114
 115     Double_t coeff;
 116     char hnam[80];
 117     TH2F* h2=0;
 118     TH1D* h1=0;
 119
 120     //Get the reference histogram
 121     //(author: Gustavo Conesa Balbastre)
 122
 123     TList * keylist = f.GetListOfKeys();
 124     Int_t nkeys   = f.GetNkeys();
 125     Bool_t ok = kFALSE;
 126     TKey  *key;
 127     Int_t ikey = 0;
 128     Int_t counter = 0;
 129     TH1D* hRef = 0;
 130
 131     //Check if the file contains any histogram
 132
 133     if(nkeys< 2){
 134       Log(Form("Not enough histograms (%d) for calibration.",nkeys));
 135       return 1;
 136     }
 137
 138     while(!ok){
 139       ikey = gRandom->Integer(nkeys);
 140       key = (TKey*)keylist->At(ikey);
 141       TObject* obj = f.Get(key->GetName());
 142       TString cname(obj->ClassName());
 143       if(cname == "TH2F") {
 144         h2 = (TH2F*)obj;
 145         TString htitl = h2->GetTitle();
 146         if(htitl.Contains("and gain 1")) {
 147           hRef = h2->ProjectionX();
 148           hRef->SetBins(1000,0.,1000.); // to cut off saturation peak at 1023
 149           // Check if the reference histogram has too little statistics
 150           if(hRef->GetEntries()>2) ok=kTRUE;
 151           if(!ok && counter > nkeys){
 152             Log("No histogram with enough statistics for reference.");
 153             return 1;
 154           }
 155         }
 156       }
 157       counter++;
 158     }
 159
 160     Log(Form("reference histogram %s, %.1f entries, mean=%.3f, rms=%.3f.",
 161              hRef->GetName(),hRef->GetEntries(),
 162              hRef->GetMean(),hRef->GetRMS()));
 163
 164     Double_t refMean=hRef->GetMean();
 165
 166     // Calculates relative calibration coefficients for all non-zero channels
 167
 168     for(Int_t mod=0; mod<nMod; mod++) {
 169       for(Int_t col=0; col<nCol; col++) {
 170         for(Int_t row=0; row<nRow; row++) {
 171
 172           //High Gain to Low Gain ratio
 173           Float_t ratio = HG2LG(mod,row,col,&f);
 174           calibData.SetHighLowRatioEmc(mod+1,col+1,row+1,ratio);
 175
 176           sprintf(hnam,"%d_%d_%d_1",mod,row,col); // high gain!
 177           h2 = (TH2F*)f.Get(hnam);
 178
 179           //TODO: dead channels exclusion!
 180           if(h2) {
 181             h1 = h2->ProjectionX();
 182             h1->SetBins(1000,0.,1000.); // to cut off saturation peak at 1023
 183             coeff = h1->GetMean()/refMean;
 184             if(coeff>0)
 185               calibData.SetADCchannelEmc(mod+1,col+1,row+1,1./coeff);
 186             else
 187               calibData.SetADCchannelEmc(mod+1,col+1,row+1,1.);
 188             AliInfo(Form("mod %d col %d row %d  coeff %f\n",mod,col,row,coeff));
 189           }
 190           else
 191             calibData.SetADCchannelEmc(mod+1,col+1,row+1,1.);
 192         }
 193       }
 194     }
 195
 196     f.Close();
 197   }
 198
 199   //Store EMC calibration data
 200
 201   AliCDBMetaData emcMetaData;
 202   Bool_t emcOK = Store("Calib", "EmcGainPedestals", &calibData, &emcMetaData);
 203
 204   if(emcOK) return 0;
 205   else
 206     return 1;
 207
 208 }
 209
 210
 211 Bool_t AliPHOSPreprocessor::ProcessLEDRun()
 212 {
 213   //Process LED run, fill bad channels map.
 214
 215   AliPHOSEmcBadChannelsMap badMap;
 216
 217   TList* list = GetFileSources(kDAQ, "LED");
 218   if(!list) {
 219     Log("Sources list for LED run not found, exit.");
 220     return kFALSE;
 221   }
 222
 223   TIter iter(list);
 224   TObjString *source;
 225   char hnam[80];
 226   TH1F* histo=0;
 227
 228   while ((source = dynamic_cast<TObjString *> (iter.Next()))) {
 229
 230     AliInfo(Form("found source %s", source->String().Data()));
 231
 232     TString fileName = GetFile(kDAQ, "LED", source->GetName());
 233     AliInfo(Form("Got filename: %s",fileName.Data()));
 234
 235     TFile f(fileName);
 236
 237     if(!f.IsOpen()) {
 238       Log(Form("File %s is not opened, something goes wrong!",fileName.Data()));
 239       return kFALSE;
 240     }
 241
 242     const Int_t nMod=5; // 1:5 modules
 243     const Int_t nCol=56; //1:56 columns in each module
 244     const Int_t nRow=64; //1:64 rows in each module
 245
 246     // Check for dead channels
 247     Log(Form("Begin check for dead channels."));
 248
 249     for(Int_t mod=0; mod<nMod; mod++) {
 250       for(Int_t col=0; col<nCol; col++) {
 251         for(Int_t row=0; row<nRow; row++) {
 252           sprintf(hnam,"mod%dcol%drow%d",mod,col,row);
 253           histo = (TH1F*)f.Get(hnam);
 254           if(histo)
 255             if (histo->GetMean()<1) {
 256               Log(Form("Channel: [%d,%d,%d] seems dead, <E>=%.1f.",mod,col,row,histo->GetMean()));
 257               badMap.SetBadChannel(mod,col,row);
 258             }
 259         }
 260       }
 261     }
 262
 263   }
 264
 265   //Store bad channels map
 266   AliCDBMetaData badMapMetaData;
 267
 268   //Bad channels data valid from current run fRun until updated (validityInfinite=kTRUE)
 269   Bool_t result = Store("Calib", "EmcBadChannels", &badMap, &badMapMetaData, fRun, kTRUE);
 270   return result;
 271
 272 }
 273
 274 Float_t AliPHOSPreprocessor::HG2LG(Int_t mod, Int_t X, Int_t Z, TFile* f)
 275 {
 276   //Calculates High gain to Low gain ratio
 277   //for crystal at the position (X,Z) in the PHOS module mod.
 278
 279   char hname[128];
 280   sprintf(hname,"%d_%d_%d",mod,X,Z);
 281
 282   TH1F* h1 = (TH1F*)f->Get(hname);
 283   if(!h1) return 16.;
 284
 285   if(!h1->GetEntries()) return 16.;
 286   if(h1->GetMaximum()<10.) return 16.;
 287
 288   Double_t max = h1->GetBinCenter(h1->GetMaximumBin()); // peak
 289   Double_t xmin = max - (h1->GetRMS()/3);
 290   Double_t xmax = max + (h1->GetRMS()/2);
 291   //       Double_t xmin = max - (h1->GetRMS());
 292   //       Double_t xmax = max + (h1->GetRMS());
 293
 294   TF1* gaus1 = new TF1("gaus1",rgaus,xmin,xmax,3);
 295   gaus1->SetParNames("Constant","Mean","Sigma");
 296   gaus1->SetParameter("Constant",h1->GetMaximum());
 297   gaus1->SetParameter("Mean",max);
 298   gaus1->SetParameter("Sigma",1.);
 299   gaus1->SetLineColor(kBlue);
 300   h1->Fit(gaus1,"LERQ+");
 301
 302   Log(Form("\t%s: %d entries, mean=%.3f, peak=%.3f, rms= %.3f. HG/LG = %.3f\n",
 303            h1->GetTitle(),h1->GetEntries(),h1->GetMean(),max,h1->GetRMS(),
 304            gaus1->GetParameter("Mean")));
 305
 306   return gaus1->GetParameter("Mean");
 307
 308 }