]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - PHOS/AliPHOSRawDigiProducer.cxx
sample quality check added
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSRawDigiProducer.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 2007, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.      *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
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12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 //This class produces PHOS digits of one event
19 //using AliPHOSRawDecoder. 
20 //
21 //   For example:
22 //   TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliPHOSDigit",100);
23 //   AliRawReader* rawReader = new AliRawReaderDate("2006run2211.raw");
24 //   AliPHOSRawDecoder dc(rawReader);
25 //   while (rawReader->NextEvent()) {
26 //     AliPHOSRawDigiProducer producer;
27 //     producer.MakeDigits(digits,&dc);
28 //   }
29
30 // Author: Boris Polichtchouk
31
32 // --- ROOT system ---
33 #include "TClonesArray.h"
34
35 // --- AliRoot header files ---
36 #include "AliPHOSRawDigiProducer.h"
37 #include "AliPHOSRawDecoder.h"
38 #include "AliPHOSGeometry.h"
39 #include "AliPHOSDigit.h"
40 #include "AliPHOSRecoParam.h"
41 #include "AliPHOSCalibData.h"
42 #include "AliLog.h"
43
44 ClassImp(AliPHOSRawDigiProducer)
45
46 AliPHOSCalibData * AliPHOSRawDigiProducer::fgCalibData  = 0 ; 
47
48 //--------------------------------------------------------------------------------------
49 AliPHOSRawDigiProducer::AliPHOSRawDigiProducer():TObject(),
50   fEmcMinE(0.),fCpvMinE(0.),fSampleQualityCut(1.),fEmcCrystals(0),fGeom(0){
51
52 }
53 //--------------------------------------------------------------------------------------
54 AliPHOSRawDigiProducer::AliPHOSRawDigiProducer(const AliPHOSRecoParam* parEmc, const AliPHOSRecoParam* parCpv):TObject(),
55   fEmcMinE(0.),fCpvMinE(0.),fSampleQualityCut(1.),fEmcCrystals(0),fGeom(0){
56
57   if(!parEmc) AliFatal("Reconstruction parameters for EMC not set!");
58   if(!parCpv) AliFatal("Reconstruction parameters for CPV not set!");
59
60   fEmcMinE = parEmc->GetMinE();
61   fCpvMinE = parCpv->GetMinE();
62
63   fSampleQualityCut = parEmc->GetSampleQualityCut() ;
64
65   fGeom=AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
66   if(!fGeom) fGeom = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP");
67
68   fEmcCrystals=fGeom->GetNCristalsInModule()*fGeom->GetNModules() ;
69
70   GetCalibrationParameters() ; 
71 }
72 //--------------------------------------------------------------------------------------                       
73 AliPHOSRawDigiProducer::AliPHOSRawDigiProducer(const AliPHOSRawDigiProducer &dp):TObject(),
74   fEmcMinE(0.),fCpvMinE(0.),fSampleQualityCut(1.),fEmcCrystals(0),fGeom(0){                                                          
75
76   fEmcMinE = dp.fEmcMinE ;
77   fCpvMinE = dp.fCpvMinE ;
78   fEmcCrystals = dp.fEmcCrystals ;
79   fGeom = dp.fGeom ;
80 }
81 //--------------------------------------------------------------------------------------
82 AliPHOSRawDigiProducer& AliPHOSRawDigiProducer::operator= (const AliPHOSRawDigiProducer &dp){
83   if(&dp == this) return *this;
84
85   fEmcMinE = dp.fEmcMinE ;
86   fCpvMinE = dp.fCpvMinE ;
87   fSampleQualityCut = dp.fSampleQualityCut ;
88   fEmcCrystals = dp.fEmcCrystals ;
89   fGeom = dp.fGeom ;
90   return  *this;
91
92  
93 //--------------------------------------------------------------------------------------
94 void AliPHOSRawDigiProducer::MakeDigits(TClonesArray *digits, AliPHOSRawDecoder* decoder) 
95 {
96   //Makes the job.
97   //TClonesArray *digits and raw data decoder should be provided by calling function.
98
99   digits->Clear();
100  
101   Int_t    iDigit   = 0 ;
102   Int_t relId[4], absId =0;
103
104   const Double_t baseLine=1. ; //Minimal energy of digit in ADC ch. 
105   const Double_t highLowDiff=2. ; //Maximal difference between High and Low channels in LG adc channels 
106
107   //Temporary array for LowGain digits
108   TClonesArray tmpLG("AliPHOSDigit",10000) ;
109   Int_t ilgDigit=0 ;
110   
111   while (decoder->NextDigit()) {
112
113     Double_t energy=decoder->GetEnergy() ; 
114     if(energy<=baseLine) //in ADC channels
115       continue ;
116
117     //remove digits with bas shape. Decoder should calculate quality so that 
118     //in default case quality [0,1], while larger values of quality mean somehow 
119     //corrupted samples, 999 means obviously corrupted sample.
120     if(decoder->GetSampleQuality() > fSampleQualityCut )
121        continue ;
122
123     Bool_t lowGainFlag = decoder->IsLowGain();
124
125     relId[0] = decoder->GetModule();
126     relId[1] = 0;
127     relId[2] = decoder->GetRow();
128     relId[3] = decoder->GetColumn();
129     fGeom->RelToAbsNumbering(relId, absId);
130
131     Double_t time = decoder->GetTime() ;
132     time = CalibrateT(time,relId,lowGainFlag) ;
133
134     energy = CalibrateE(energy,relId,lowGainFlag) ;
135
136     if(energy <= 0.) 
137        continue;
138
139     if(lowGainFlag){
140       new(tmpLG[ilgDigit]) AliPHOSDigit(-1,absId,(Float_t)energy,(Float_t)time);
141       ilgDigit++ ; 
142     }
143     else{ 
144       if(decoder->IsOverflow()) //Keep this digit to replace it by Low Gain later.
145                                 //If there is no LogGain it wil be removed by cut on Min E
146         new((*digits)[iDigit]) AliPHOSDigit(-1,absId,-1.f,(Float_t)time);
147       else
148         new((*digits)[iDigit]) AliPHOSDigit(-1,absId,(Float_t)energy,(Float_t)time);
149       iDigit++;
150     }
151   }
152
153   //Now scan created LG and HG digits and keep only those which appeared in both lists 
154   //replace energy of HighGain digits only if there is overflow
155   //negative energy (overflow)
156   digits->Sort() ;
157   tmpLG.Sort() ;
158   Int_t iLG = 0;
159   Int_t nLG1 = tmpLG.GetEntriesFast()-1 ;
160   for(Int_t iDig=0 ; iDig < digits->GetEntriesFast() ; iDig++) { 
161     AliPHOSDigit * digHG = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>(digits->At(iDig)) ;
162     if (!digHG) continue;
163     AliPHOSDigit * digLG = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>(tmpLG.At(iLG)) ;
164     while(iLG<nLG1 && digHG->GetId()> digLG->GetId()){
165       iLG++ ;
166       digLG = dynamic_cast<AliPHOSDigit*>(tmpLG.At(iLG)) ;
167     }
168     if(digLG && digHG->GetId() == digLG->GetId()){ //we found pair
169       if(digHG->GetEnergy()<0.){ //This is overflow in HG
170         digHG->SetTime(digLG->GetTime()) ;
171         digHG->SetEnergy(digLG->GetEnergy()) ;
172       } 
173       else{ //Make approximate comparison of HG and LG energies
174         Double_t de = (digHG->GetEnergy()-digLG->GetEnergy())/16./0.005 ; //aproximate difference in LG ADC ch. 
175         if(TMath::Abs(de)>highLowDiff){ //too strong difference, remove digit
176           digits->RemoveAt(iDig) ;
177         }
178       }
179     }
180     else{ //no pair - remove
181       // temporary fix for dead LG channels
182       Int_t absId=digHG->GetId() ;
183       Int_t relId[4] ;
184       fGeom->AbsToRelNumbering(absId,relId) ;
185       if(relId[2]%2==1 && relId[3]%16==4) 
186         continue ;
187       digits->RemoveAt(iDig) ;                                                                                                            
188     }
189   }
190
191   CleanDigits(digits) ;
192
193 }
194 //____________________________________________________________________________
195 Double_t AliPHOSRawDigiProducer::CalibrateE(Double_t amp, Int_t* relId, Bool_t isLowGain)
196 {
197   // Convert EMC measured amplitude into real energy.
198   // Calibration parameters are taken from calibration data base for raw data,
199   // or from digitizer parameters for simulated data.                        
200   if(fgCalibData){ 
201     Int_t   module = relId[0];  
202     Int_t   column = relId[3];
203     Int_t   row    = relId[2];
204     if(relId[1]==0) { // this is EMC 
205       if(isLowGain){
206         amp*= fgCalibData->GetHighLowRatioEmc(module,column,row);
207       }
208       amp *= fgCalibData->GetADCchannelEmc(module,column,row);                                                          
209       return amp ;         
210     }         
211   }          
212   return 0;        
213 }
214 //____________________________________________________________________________
215 Double_t AliPHOSRawDigiProducer::CalibrateT(Double_t time, Int_t * relId, Bool_t /* isLowGain */)
216 {
217   //Calibrate time
218   if(fgCalibData){
219     Int_t   module = relId[0];
220     Int_t   column = relId[3];
221     Int_t   row    = relId[2];
222     if(relId[1]==0) { // this is EMC
223       time += fgCalibData->GetTimeShiftEmc(module,column,row);                   
224       return time ;             
225     }
226   }
227  
228   return -999.;
229 }
230 //____________________________________________________________________________
231 void AliPHOSRawDigiProducer::CleanDigits(TClonesArray * digits)
232 {
233   // remove digits with amplitudes below threshold.
234   // remove digits in bad channels
235   // sort digits with icreasing AbsId
236   
237   //remove digits in bad map and below threshold
238   Bool_t isBadMap = 0 ;
239   if(fgCalibData->GetNumOfEmcBadChannels()){
240     isBadMap=1 ;
241   }
242   
243   for(Int_t i=0; i<digits->GetEntriesFast(); i++){
244     AliPHOSDigit * digit = static_cast<AliPHOSDigit*>(digits->At(i)) ;
245     if(!digit)
246       continue  ;
247     if ( (IsInEMC(digit) && digit->GetEnergy() < fEmcMinE) ||
248          (IsInCPV(digit) && digit->GetEnergy() < fCpvMinE) ){
249       digits->RemoveAt(i) ;
250       continue ;
251     }
252     if(isBadMap){ //check bad map now
253       Int_t relid[4] ;
254       fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ; 
255       if(fgCalibData->IsBadChannelEmc(relid[0],relid[2],relid[3])){
256         digits->RemoveAt(i) ;
257       }
258     }
259   }
260
261   //Compress, sort and set indexes
262   digits->Compress() ;
263 //  digits->Sort(); already sorted earlier
264   for (Int_t i = 0 ; i < digits->GetEntriesFast() ; i++) { 
265     AliPHOSDigit *digit = static_cast<AliPHOSDigit*>( digits->At(i) ) ; 
266     digit->SetIndexInList(i) ;     
267   }
268 }
269 //____________________________________________________________________________
270 Bool_t AliPHOSRawDigiProducer::IsInEMC(AliPHOSDigit * digit) const
271 {
272   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-EMC module
273   return digit->GetId() <= fEmcCrystals ;
274
275 }
276
277 //____________________________________________________________________________
278 Bool_t AliPHOSRawDigiProducer::IsInCPV(AliPHOSDigit * digit) const
279 {
280   // Tells if (true) or not (false) the digit is in a PHOS-CPV module
281   return digit->GetId() > fEmcCrystals ;
282 }
283 //____________________________________________________________________________
284 void AliPHOSRawDigiProducer::GetCalibrationParameters() 
285 {
286   // Set calibration parameters:
287   // if calibration database exists, they are read from database,
288   // otherwise, reconstruction stops in the constructor of AliPHOSCalibData
289   //
290   // It is a user responsilibity to open CDB before reconstruction, for example: 
291   // AliCDBStorage* storage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage("local://CalibDB");
292
293   if (!fgCalibData){
294     fgCalibData = new AliPHOSCalibData(-1); //use AliCDBManager's run number
295   }
296   if (fgCalibData->GetCalibDataEmc() == 0)
297     AliFatal("Calibration parameters for PHOS EMC not found. Stop reconstruction.\n");
298   if (fgCalibData->GetCalibDataCpv() == 0)
299     AliFatal("Calibration parameters for PHOS CPV not found. Stop reconstruction.\n");
300 }