PHOS/AliPHOSTrigger.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 /* $Log $ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //  Class for trigger analysis.
  20 //  Digits are grouped in TRU's (Trigger Units). A TRU consist of 16x28
  21 //  crystals ordered fNTRUPhi x fNTRUZ. The algorithm searches all possible
  22 //  2x2 and nxn (n multiple of 4) crystal combinations per each TRU, adding the
  23 //  digits amplitude and  finding the maximum. Maxima are transformed in ADC
  24 //  time samples. Each time bin is compared to the trigger threshold until it is larger
  25 //  and then, triggers are set. Thresholds need to be fixed.
  26 //  Usage:
  27 //
  28 //  //Inside the event loop
  29 //  AliEMCALTrigger *tr = new AliEMCALTrigger();//Init Trigger
  30 //  tr->SetL0Threshold(100);
  31 //  tr->SetL1JetLowPtThreshold(1000);
  32 //  tr->SetL1JetHighPtThreshold(20000);
  33 //  tr->Trigger(); //Execute Trigger
  34 //  tr->Print(""); //Print result, with "deb" option all data members
  35 //  //are printed
  36 //
  37 //*-- Author: Gustavo Conesa & Yves Schutz (IFIC, CERN)
  38 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  39
  40
  41 // --- ROOT system ---
  42 //#include "TMatrixD.h"
  43
  44 // --- ALIROOT system ---
  45 #include "AliPHOS.h"
  46 #include "AliPHOSTrigger.h"
  47 #include "AliPHOSGeometry.h"
  48 #include "AliPHOSGetter.h"
  49 #include "AliPHOSPulseGenerator.h"
  50 #include "AliTriggerInput.h"
  51 //#include "AliLog.h"
  52
  53 ClassImp(AliPHOSTrigger)
  54
  55 //______________________________________________________________________
  56 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger()
  57   : AliTriggerDetector(),
  58     f2x2MaxAmp(-1), f2x2CrystalPhi(-1),  f2x2CrystalEta(-1), f2x2SM(0),
  59     fnxnMaxAmp(-1), fnxnCrystalPhi(-1),  fnxnCrystalEta(-1), fnxnSM(0),
  60     fADCValuesHighnxn(0), fADCValuesLownxn(0),
  61     fADCValuesHigh2x2(0), fADCValuesLow2x2(0), fDigitsList(0),
  62     fL0Threshold(50), fL1JetLowPtThreshold(200), fL1JetHighPtThreshold(500),
  63     fNTRU(8), fNTRUZ(2), fNTRUPhi(4),  fPatchSize(1), fSimulation(kTRUE)
  64 {
  65   //ctor
  66   fADCValuesHighnxn = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  67   fADCValuesLownxn  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  68   fADCValuesHigh2x2 = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  69   fADCValuesLow2x2  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  70
  71   SetName("PHOS");
  72   CreateInputs();
  73
  74   //Print("") ;
  75 }
  76
  77 //____________________________________________________________________________
  78 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger(const AliPHOSTrigger & trig) :
  79   AliTriggerDetector(trig),
  80   f2x2MaxAmp(trig.f2x2MaxAmp),
  81   f2x2CrystalPhi(trig.f2x2CrystalPhi),
  82   f2x2CrystalEta(trig.f2x2CrystalEta),
  83   f2x2SM(trig.f2x2SM),
  84   fnxnMaxAmp(trig.fnxnMaxAmp),
  85   fnxnCrystalPhi(trig.fnxnCrystalPhi),
  86   fnxnCrystalEta(trig.fnxnCrystalEta),
  87   fnxnSM(trig.fnxnSM),
  88   fADCValuesHighnxn(trig.fADCValuesHighnxn),
  89   fADCValuesLownxn(trig.fADCValuesLownxn),
  90   fADCValuesHigh2x2(trig.fADCValuesHigh2x2),
  91   fADCValuesLow2x2(trig.fADCValuesLow2x2),
  92   fDigitsList(trig.fDigitsList),
  93   fL0Threshold(trig.fL0Threshold),
  94   fL1JetLowPtThreshold(trig.fL1JetLowPtThreshold),
  95   fL1JetHighPtThreshold(trig.fL1JetHighPtThreshold),
  96   fNTRU(trig.fNTRU),
  97   fNTRUZ(trig.fNTRUZ),
  98   fNTRUPhi(trig.fNTRUPhi),
  99   fPatchSize(trig.fPatchSize), fSimulation(trig.fSimulation)
 100 {
 101   // cpy ctor
 102 }
 103
 104 //_________________________________________________________________________
 105 AliPHOSTrigger & AliPHOSTrigger::operator = (const AliPHOSTrigger &)
 106 {
 107   Fatal("operator =", "no implemented");
 108   return *this;
 109 }
 110
 111 void AliPHOSTrigger::CreateInputs()
 112 {
 113    // inputs
 114
 115    // Do not create inputs again!!
 116    if( fInputs.GetEntriesFast() > 0 ) return;
 117
 118    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_L0",       "PHOS L0", 0x02 ) );
 119    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetHPt_L1","PHOS Jet High Pt L1", 0x04 ) );
 120    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetLPt_L1","PHOS Jet Low Pt L1", 0x08 ) );
 121
 122 }
 123
 124 //____________________________________________________________________________
 125 void AliPHOSTrigger::FillTRU(const TClonesArray * digits, const AliPHOSGeometry * geom, TClonesArray * ampmatrix, TClonesArray * timeRmatrix) const {
 126
 127   //Orders digits ampitudes list and times in fNTRU TRUs (28x16 crystals)
 128   //per module. Each TRU is a TMatrixD, and they are kept in TClonesArrays.
 129   //In a module, the number of TRU in phi is fNTRUPhi, and the number of
 130   //TRU in eta is fNTRUZ.
 131
 132   //Check data members
 133
 134   if(fNTRUZ*fNTRUPhi != fNTRU)
 135     Error("FillTRU"," Wrong number of TRUS per Z or Phi");
 136
 137   //Initilize and declare variables
 138   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
 139   Int_t nCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi ;// 64/4=16
 140   Int_t nCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ ;// 56/2=28
 141   Int_t relid[4] ;
 142   Float_t amp   = -1;
 143   Float_t timeR = -1;
 144   Int_t id      = -1;
 145
 146   //List of TRU matrices initialized to 0.
 147   for(Int_t k = 0; k < fNTRU*nModules ; k++){
 148     TMatrixD  * amptrus   = new TMatrixD(nCrystalsPhi,nCrystalsZ) ;
 149     TMatrixD  * timeRtrus = new TMatrixD(nCrystalsPhi,nCrystalsZ) ;
 150     for(Int_t i = 0; i < nCrystalsPhi; i++){
 151       for(Int_t j = 0; j < nCrystalsZ; j++){
 152         (*amptrus)(i,j)   = 0.0;
 153         (*timeRtrus)(i,j) = 0.0;
 154       }
 155     }
 156     new((*ampmatrix)[k])   TMatrixD(*amptrus) ;
 157     new((*timeRmatrix)[k]) TMatrixD(*timeRtrus) ;
 158   }
 159
 160   AliPHOSDigit * dig ;
 161
 162   //Digits loop to fill TRU matrices with amplitudes.
 163
 164   for(Int_t idig = 0 ; idig < digits->GetEntriesFast() ; idig++){
 165
 166     dig    = static_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(idig)) ;
 167     amp    = dig->GetEnergy() ;   // Energy of the digit
 168     id     = dig->GetId() ;    // Id label of the cell
 169     timeR  = dig->GetTimeR() ; // Earliest time of the digit
 170     geom->AbsToRelNumbering(id, relid) ;
 171     //Transform digit number into 4 numbers
 172     //relid[0] = module
 173     //relid[1] = EMC (0) or CPV (-1)
 174     //relid[2] = row <= 64 (fNPhi)
 175     //relid[3] = column <= 56 (fNZ)
 176
 177     if(relid[1] == 0){//Not CPV, Only EMC digits
 178
 179       //Check to which TRU in the supermodule belongs the crystal.
 180       //Supermodules are divided in a TRU matrix of dimension
 181       //(fNTRUPhi,fNTRUZ).
 182       //Each TRU is a crystal matrix of dimension (nCrystalsPhi,nCrystalsZ)
 183
 184       //First calculate the row and column in the supermodule
 185       //of the TRU to which the crystal belongs.
 186       Int_t col   = (relid[3]-1)/nCrystalsZ+1;
 187       Int_t row   = (relid[2]-1)/nCrystalsPhi+1;
 188
 189       //Calculate label number of the TRU
 190       Int_t itru  = (row-1) + (col-1)*fNTRUPhi + (relid[0]-1)*fNTRU ;
 191
 192       //Fill TRU matrix with crystal values
 193       TMatrixD * amptrus   = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrix->At(itru)) ;
 194       TMatrixD * timeRtrus = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRmatrix->At(itru)) ;
 195
 196       //Calculate row and column of the crystal inside the TRU with number itru
 197       Int_t irow = (relid[2]-1) - (row-1) *  nCrystalsPhi;
 198       Int_t icol = (relid[3]-1) - (col-1) *  nCrystalsZ;
 199
 200       (*amptrus)(irow,icol)   = amp ;
 201       (*timeRtrus)(irow,icol) = timeR ;
 202     }
 203   }
 204 }
 205
 206 //______________________________________________________________________
 207 void AliPHOSTrigger::GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(const Int_t itru,const Int_t iphitru,const Int_t ietatru,Int_t &iphiMod,Int_t &ietaMod,const AliPHOSGeometry* geom) const
 208 {
 209   // This method transforms the (eta,phi) index of a crystals in a
 210   // TRU matrix into Super Module (eta,phi) index.
 211
 212   // Calculate in which row and column in which the TRU are
 213   // ordered in the SM
 214   Int_t col = itru/ fNTRUPhi + 1;
 215   Int_t row = itru - (col-1)*fNTRUPhi + 1;
 216
 217   //Calculate the (eta,phi) index in SM
 218   Int_t nCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi;
 219   Int_t nCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ;
 220
 221   iphiMod = nCrystalsPhi*(row-1) + iphitru + 1 ;
 222   ietaMod = nCrystalsZ*(col-1) + ietatru + 1 ;
 223
 224 }
 225 //____________________________________________________________________________
 226 void AliPHOSTrigger::MakeSlidingCell(const TClonesArray * amptrus, const TClonesArray * timeRtrus, const Int_t imod, TMatrixD *ampmax2, TMatrixD *ampmaxn, const AliPHOSGeometry *geom){
 227   //Sums energy of all possible 2x2 (L0) and nxn (L1) crystals per each TRU.
 228   //Fast signal in the experiment is given by 2x2 crystals,
 229   //for this reason we loop inside the TRU crystals by 2.
 230
 231   //Declare and initialize varibles
 232   Int_t nCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi ;// 64/4=16
 233   Int_t nCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ ;// 56/2=28
 234   Float_t amp2 = 0 ;
 235   Float_t ampn = 0 ;
 236   for(Int_t i = 0; i < 4; i++){
 237     for(Int_t j = 0; j < fNTRU; j++){
 238       (*ampmax2)(i,j) = -1;
 239       (*ampmaxn)(i,j) = -1;
 240     }
 241   }
 242
 243   //Create matrix that will contain 2x2 amplitude sums
 244   //used to calculate the nxn sums
 245   TMatrixD  * tru2x2 = new TMatrixD(nCrystalsPhi/2,nCrystalsZ/2) ;
 246   for(Int_t i = 0; i < nCrystalsPhi/2; i++)
 247     for(Int_t j = 0; j < nCrystalsZ/2; j++)
 248       (*tru2x2)(i,j) = 0.0;
 249
 250   //Loop over all TRUS in a module
 251   for(Int_t itru = 0 + (imod - 1) * fNTRU ; itru < imod*fNTRU ; itru++){
 252     TMatrixD * amptru   = dynamic_cast<TMatrixD *>(amptrus->At(itru)) ;
 253     TMatrixD * timeRtru = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRtrus->At(itru)) ;
 254     Int_t mtru = itru-(imod-1)*fNTRU ; //Number of TRU in Module
 255
 256     //Sliding 2x2, add 2x2 amplitudes (NOT OVERLAP)
 257     for(Int_t irow = 0 ; irow <  nCrystalsPhi; irow += 2){
 258       for(Int_t icol = 0 ; icol < nCrystalsZ ; icol += 2){
 259         amp2 = (*amptru)(irow,icol)+(*amptru)(irow+1,icol)+
 260           (*amptru)(irow,icol+1)+(*amptru)(irow+1,icol+1);
 261
 262         //Fill new matrix with added 2x2 crystals for use in nxn sums
 263         (*tru2x2)(irow/2,icol/2) = amp2 ;
 264         //Select 2x2 maximum sums to select L0
 265         if(amp2 > (*ampmax2)(0,mtru)){
 266           (*ampmax2)(0,mtru) = amp2 ;
 267           (*ampmax2)(1,mtru) = irow;
 268           (*ampmax2)(2,mtru) = icol;
 269         }
 270       }
 271     }
 272
 273     //Find most recent time in the selected 2x2 cell
 274     (*ampmax2)(3,mtru) = 1 ;
 275     Int_t row2 =  static_cast <Int_t> ((*ampmax2)(1,mtru));
 276     Int_t col2 =  static_cast <Int_t> ((*ampmax2)(2,mtru));
 277     for(Int_t i = 0; i<2; i++){
 278       for(Int_t j = 0; j<2; j++){
 279         if((*amptru)(row2+i,col2+j) > 0 &&  (*timeRtru)(row2+i,col2+j)> 0){
 280           if((*timeRtru)(row2+i,col2+j) <  (*ampmax2)(3,mtru)  )
 281             (*ampmax2)(3,mtru) =  (*timeRtru)(row2+i,col2+j);
 282         }
 283       }
 284     }
 285
 286     //Sliding nxn, add nxn amplitudes (OVERLAP)
 287     if(fPatchSize > 0){
 288       for(Int_t irow = 0 ; irow <  nCrystalsPhi/2; irow++){
 289         for(Int_t icol = 0 ; icol < nCrystalsZ/2 ; icol++){
 290           ampn = 0;
 291           if( (irow+fPatchSize) < nCrystalsPhi/2 && (icol+fPatchSize) < nCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
 292             for(Int_t i = 0 ; i <= fPatchSize ; i++)
 293               for(Int_t j = 0 ; j <= fPatchSize ; j++)
 294                 ampn += (*tru2x2)(irow+i,icol+j);
 295             //Select nxn maximum sums to select L1
 296             if(ampn > (*ampmaxn)(0,mtru)){
 297               (*ampmaxn)(0,mtru) = ampn ;
 298               (*ampmaxn)(1,mtru) = irow*2;
 299               (*ampmaxn)(2,mtru) = icol*2;
 300             }
 301           }
 302         }
 303       }
 304
 305       //Find most recent time in selected nxn cell
 306       (*ampmaxn)(3,mtru) = 1 ;
 307       Int_t rown =  static_cast <Int_t> ((*ampmaxn)(1,mtru));
 308       Int_t coln =  static_cast <Int_t> ((*ampmaxn)(2,mtru));
 309       for(Int_t i = 0; i<4*fPatchSize; i++){
 310         for(Int_t j = 0; j<4*fPatchSize; j++){
 311           if( (rown+i) < nCrystalsPhi && (coln+j) < nCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
 312             if((*amptru)(rown+i,coln+j) > 0 &&  (*timeRtru)(rown+i,coln+j)> 0){
 313               if((*timeRtru)(rown+i,coln+j) <  (*ampmaxn)(3,mtru)  )
 314                 (*ampmaxn)(3,mtru) =  (*timeRtru)(rown+i,coln+j);
 315             }
 316           }
 317         }
 318       }
 319     }
 320     else {
 321         (*ampmaxn)(0,mtru) =  (*ampmax2)(0,mtru);
 322         (*ampmaxn)(1,mtru) =  (*ampmax2)(1,mtru);
 323         (*ampmaxn)(2,mtru) =  (*ampmax2)(2,mtru);
 324         (*ampmaxn)(3,mtru) =  (*ampmax2)(3,mtru);
 325       }
 326   }
 327 }
 328 //____________________________________________________________________________
 329 void AliPHOSTrigger::Print(const Option_t * opt) const
 330 {
 331
 332   //Prints main parameters
 333
 334   if(! opt)
 335     return;
 336   AliTriggerInput* in = 0x0 ;
 337
 338   printf( "             Maximum Amplitude after Sliding Crystal, \n") ;
 339   printf( "               -2x2 crystals sum (not overlapped): %10.2f, in Super Module %d\n",
 340           f2x2MaxAmp,f2x2SM) ;
 341   printf( "               -2x2 from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", f2x2CrystalPhi, f2x2CrystalPhi+2, f2x2CrystalEta, f2x2CrystalEta+2) ;
 342
 343   if(fPatchSize > 0){
 344     printf( "             Patch Size, n x n: %d x %d cells\n",4*fPatchSize, 4*fPatchSize);
 345     printf( "               -nxn crystals sum (overlapped)    : %10.2f, in Super Module %d\n",
 346             fnxnMaxAmp,fnxnSM) ;
 347     printf( "               -nxn from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", fnxnCrystalPhi, fnxnCrystalPhi+4, fnxnCrystalEta, fnxnCrystalEta+4) ;
 348   }
 349   printf( "             Threshold for LO %10.1f\n",
 350           fL0Threshold) ;
 351
 352   printf( "             Threshold for LO %10.2f\n", fL0Threshold) ;
 353   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_L0" );
 354   if(in->GetValue())
 355     printf( "             *** PHOS LO is set ***\n") ;
 356
 357   printf( "             Jet Low Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetLowPtThreshold) ;
 358   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_JetLPt_L1" );
 359   if(in->GetValue())
 360     printf( "             *** PHOS Jet Low Pt for L1 is set ***\n") ;
 361
 362   printf( "             Jet High Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetHighPtThreshold) ;
 363   in = (AliTriggerInput*) fInputs.FindObject( "PHOS_JetHPt_L1" );
 364   if(in->GetValue())
 365     printf( "              *** PHOS Jet High Pt for L1 is set ***\n") ;
 366
 367 }
 368
 369 //____________________________________________________________________________
 370 void AliPHOSTrigger::SetTriggers(const Int_t iMod, const TMatrixD * ampmax2, const TMatrixD * ampmaxn, const AliPHOSGeometry *geom)
 371 {
 372   //Checks the 2x2 and nxn maximum amplitude per each TRU and compares
 373   //with the different L0 and L1 triggers thresholds
 374
 375   //Initialize variables
 376   Float_t max2[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 377   Float_t maxn[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 378   Int_t   itru2  = -1 ;
 379   Int_t   itrun  = -1 ;
 380
 381
 382   //Find maximum summed amplitude of all the TRU
 383   //in a Module
 384   for(Int_t i = 0 ; i < fNTRU ; i++){
 385     if(max2[0] < (*ampmax2)(0,i) ){
 386       max2[0] =  (*ampmax2)(0,i) ; // 2x2 summed max amplitude
 387       max2[1] =  (*ampmax2)(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 388       max2[2] =  (*ampmax2)(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 389       max2[3] =  (*ampmax2)(3,i) ; // corresponding most recent time
 390       itru2   = i ; // TRU number
 391     }
 392     if(maxn[0] < (*ampmaxn)(0,i) ){
 393       maxn[0] =  (*ampmaxn)(0,i) ; // nxn summed max amplitude
 394       maxn[1] =  (*ampmaxn)(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 395       maxn[2] =  (*ampmaxn)(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 396       maxn[3] =  (*ampmaxn)(3,i) ; // corresponding most recent time
 397       itrun   = i ; // TRU number
 398     }
 399   }
 400
 401   //Set max amplitude if larger than in other Modules
 402   Float_t maxtimeR2 = -1 ;
 403   Float_t maxtimeRn = -1 ;
 404   // Create a shaper pulse object
 405   AliPHOSPulseGenerator *pulse = new AliPHOSPulseGenerator();
 406   Int_t nTimeBins = pulse->GetRawFormatTimeBins() ;
 407
 408   //Set max 2x2 amplitude and select L0 trigger
 409   if(max2[0] > f2x2MaxAmp ){
 410     f2x2MaxAmp  = max2[0] ;
 411     f2x2SM      = iMod ;
 412     maxtimeR2   = max2[3] ;
 413     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(itru2,
 414                                               static_cast<Int_t>(max2[1]),
 415                                               static_cast<Int_t>(max2[2]),
 416                                               f2x2CrystalPhi,f2x2CrystalEta,geom) ;
 417
 418     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 419     fADCValuesLow2x2  = new Int_t[nTimeBins];
 420     fADCValuesHigh2x2 = new Int_t[nTimeBins];
 421
 422     pulse->SetAmplitude(f2x2MaxAmp);
 423     pulse->SetTZero(maxtimeR2);
 424     pulse->MakeSamples();
 425     pulse->GetSamples(fADCValuesHigh2x2, fADCValuesLow2x2) ;
 426
 427     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 428     //Set L0
 429     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 430       if(fADCValuesHigh2x2[i] >= fL0Threshold || fADCValuesLow2x2[i] >= fL0Threshold) {
 431         SetInput("PHOS_L0") ;
 432         break;
 433       }
 434     }
 435   }
 436
 437   //Set max nxn amplitude and select L1 triggers
 438   if(maxn[0] > fnxnMaxAmp ){
 439     fnxnMaxAmp  = maxn[0] ;
 440     fnxnSM      = iMod ;
 441     maxtimeRn   = maxn[3] ;
 442     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(itrun,
 443                                               static_cast<Int_t>(maxn[1]),
 444                                               static_cast<Int_t>(maxn[2]),
 445                                               fnxnCrystalPhi,fnxnCrystalEta,geom) ;
 446
 447     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 448     fADCValuesHighnxn = new Int_t[nTimeBins];
 449     fADCValuesLownxn  = new Int_t[nTimeBins];
 450
 451     pulse->SetAmplitude(maxtimeRn);
 452     pulse->SetTZero(fnxnMaxAmp);
 453     pulse->MakeSamples();
 454     pulse->GetSamples(fADCValuesHighnxn, fADCValuesLownxn) ;
 455
 456     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 457     //SetL1 Low
 458     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 459       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold  || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold){
 460         SetInput("PHOS_JetLPt_L1") ;
 461         break;
 462       }
 463     }
 464     //SetL1 High
 465     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 466       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold){
 467         SetInput("PHOS_JetHPt_L1") ;
 468         break;
 469       }
 470     }
 471   }
 472 }
 473
 474 //____________________________________________________________________________
 475 void AliPHOSTrigger::Trigger()
 476 {
 477
 478   //Main Method to select triggers.
 479   AliRunLoader *rl = gAlice->GetRunLoader();
 480   //Getter
 481   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance( rl->GetFileName() ) ;
 482   //AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 483
 484   //Get Geometry
 485   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 486
 487   //Define parameters
 488   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
 489
 490   //Intialize data members each time the trigger is called in event loop
 491   f2x2MaxAmp = -1; f2x2CrystalPhi = -1;  f2x2CrystalEta = -1;
 492   fnxnMaxAmp = -1; fnxnCrystalPhi = -1;  fnxnCrystalEta = -1;
 493
 494   //Take the digits list if simulation
 495   if(fSimulation)
 496     fDigitsList = gime->Digits() ;
 497
 498   if(!fDigitsList)
 499     AliFatal("Digits not found !") ;
 500
 501   //Fill TRU Matrix
 502   TClonesArray * amptrus   = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 503   TClonesArray * timeRtrus = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 504   FillTRU(fDigitsList,geom,amptrus, timeRtrus) ;
 505
 506   //Do Crystal Sliding and select Trigger
 507   //Initialize varible that will contain maximum amplitudes and
 508   //its corresponding cell position in eta and phi, and time.
 509   TMatrixD  * ampmax2 = new TMatrixD(4,fNTRU) ;
 510   TMatrixD  * ampmaxn = new TMatrixD(4,fNTRU) ;
 511
 512   for(Int_t imod = 1 ; imod <= nModules ; imod++) {
 513     //Do 2x2 and nxn sums, select maximums.
 514     MakeSlidingCell(amptrus, timeRtrus, imod, ampmax2, ampmaxn, geom);
 515     //Set the trigger
 516     SetTriggers(imod,ampmax2,ampmaxn, geom) ;
 517   }
 518 }