PHOS/AliPHOSTrigger.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16
  17 //_________________________________________________________________________
  18 //  Class for trigger analysis.
  19 //  Digits are grouped in TRU's (Trigger Units). A TRU consist of 16x28
  20 //  crystals ordered fNTRUPhi x fNTRUZ. The algorithm searches all possible
  21 //  2x2 and nxn (n multiple of 2) crystal combinations per each TRU, adding the
  22 //  digits amplitude and  finding the maximum. If found, look if it is isolated.
  23 //  Maxima are transformed in ADC time samples. Each time bin is compared to the trigger
  24 //  threshold until it is larger and then, triggers are set. Thresholds need to be fixed.
  25 //  Usage:
  26 //
  27 //  //Inside the event loop
  28 //  AliPHOSTrigger *tr = new AliPHOSTrigger();//Init Trigger
  29 //  tr->SetL0Threshold(100);
  30 //  tr->SetL1JetLowPtThreshold(1000);
  31 //  tr->SetL1JetMediumPtThreshold(10000);
  32 //  tr->SetL1JetHighPtThreshold(20000);
  33 //  ....
  34 //  tr->Trigger(); //Execute Trigger
  35 //  tr->Print(""); //Print data members after calculation.
  36 //
  37 //
  38 //*-- Author: Gustavo Conesa & Yves Schutz (IFIC, CERN)
  39 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  40
  41
  42 // --- ROOT system ---
  43 #include "TMath.h"
  44
  45 // --- ALIROOT system ---
  46 #include "AliConfig.h"
  47 #include "AliPHOS.h"
  48 #include "AliPHOSTrigger.h"
  49 #include "AliPHOSGeometry.h"
  50 #include "AliPHOSDigit.h"
  51 #include "AliPHOSLoader.h"
  52 #include "AliPHOSPulseGenerator.h"
  53 #include "AliTriggerInput.h"
  54
  55
  56 ClassImp(AliPHOSTrigger)
  57
  58 //______________________________________________________________________
  59 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger()
  60   : AliTriggerDetector(),
  61     f2x2MaxAmp(-1), f2x2CrystalPhi(-1),  f2x2CrystalEta(-1), f2x2SM(0),
  62     fnxnMaxAmp(-1), fnxnCrystalPhi(-1),  fnxnCrystalEta(-1), fnxnSM(0),
  63     fADCValuesHighnxn(0), fADCValuesLownxn(0),
  64     fADCValuesHigh2x2(0), fADCValuesLow2x2(0), fDigitsList(0),
  65     fL0Threshold(50), fL1JetLowPtThreshold(200),   fL1JetMediumPtThreshold(500),
  66     fL1JetHighPtThreshold(1000),
  67     fNTRU(8), fNTRUZ(2), fNTRUPhi(4),
  68     fNCrystalsPhi(16),
  69     fNCrystalsZ(28),
  70     fPatchSize(1), fIsolPatchSize(1),
  71     f2x2AmpOutOfPatch(-1), fnxnAmpOutOfPatch(-1),
  72     f2x2AmpOutOfPatchThres(2),  fnxnAmpOutOfPatchThres(2), //2 GeV out of patch
  73     fIs2x2Isol(kFALSE), fIsnxnIsol(kFALSE),
  74     fSimulation(kTRUE), fIsolateInModule(kTRUE)
  75 {
  76   //ctor
  77   fADCValuesHighnxn = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  78   fADCValuesLownxn  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  79   fADCValuesHigh2x2 = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  80   fADCValuesLow2x2  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  81
  82   SetName("PHOS");
  83   CreateInputs();
  84
  85   //Print("") ;
  86 }
  87
  88 //____________________________________________________________________________
  89 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger(const AliPHOSTrigger & trig) :
  90   AliTriggerDetector(trig),
  91   f2x2MaxAmp(trig.f2x2MaxAmp),
  92   f2x2CrystalPhi(trig.f2x2CrystalPhi),
  93   f2x2CrystalEta(trig.f2x2CrystalEta),
  94   f2x2SM(trig.f2x2SM),
  95   fnxnMaxAmp(trig.fnxnMaxAmp),
  96   fnxnCrystalPhi(trig.fnxnCrystalPhi),
  97   fnxnCrystalEta(trig.fnxnCrystalEta),
  98   fnxnSM(trig.fnxnSM),
  99   fADCValuesHighnxn(trig.fADCValuesHighnxn),
 100   fADCValuesLownxn(trig.fADCValuesLownxn),
 101   fADCValuesHigh2x2(trig.fADCValuesHigh2x2),
 102   fADCValuesLow2x2(trig.fADCValuesLow2x2),
 103   fDigitsList(trig.fDigitsList),
 104   fL0Threshold(trig.fL0Threshold),
 105   fL1JetLowPtThreshold(trig.fL1JetLowPtThreshold),
 106   fL1JetMediumPtThreshold(trig.fL1JetMediumPtThreshold),
 107   fL1JetHighPtThreshold(trig.fL1JetHighPtThreshold),
 108   fNTRU(trig.fNTRU),
 109   fNTRUZ(trig.fNTRUZ),
 110   fNTRUPhi(trig.fNTRUPhi),
 111   fNCrystalsPhi(trig.fNCrystalsPhi),
 112   fNCrystalsZ(trig. fNCrystalsZ),
 113   fPatchSize(trig.fPatchSize),
 114   fIsolPatchSize(trig.fIsolPatchSize),
 115   f2x2AmpOutOfPatch(trig.f2x2AmpOutOfPatch),
 116   fnxnAmpOutOfPatch(trig.fnxnAmpOutOfPatch),
 117   f2x2AmpOutOfPatchThres(trig.f2x2AmpOutOfPatchThres),
 118   fnxnAmpOutOfPatchThres(trig.fnxnAmpOutOfPatchThres),
 119   fIs2x2Isol(trig.fIs2x2Isol),
 120   fIsnxnIsol(trig.fIsnxnIsol),
 121   fSimulation(trig.fSimulation),
 122   fIsolateInModule(trig.fIsolateInModule)
 123 {
 124   // cpy ctor
 125 }
 126
 127 //_________________________________________________________________________
 128 AliPHOSTrigger::~AliPHOSTrigger()
 129 {
 130   // dtor
 131
 132   if(fADCValuesHighnxn)delete [] fADCValuesHighnxn;
 133   if(fADCValuesLownxn)delete [] fADCValuesLownxn;
 134   if(fADCValuesHigh2x2)delete []  fADCValuesHigh2x2;
 135   if(fADCValuesLow2x2)delete [] fADCValuesLow2x2;
 136   // fDigitsList is now ours...
 137 }
 138
 139 //_________________________________________________________________________
 140 AliPHOSTrigger & AliPHOSTrigger::operator = (const AliPHOSTrigger &)
 141 {
 142   Fatal("operator =", "no implemented");
 143   return *this;
 144 }
 145
 146 void AliPHOSTrigger::CreateInputs()
 147 {
 148    // inputs
 149
 150    // Do not create inputs again!!
 151    if( fInputs.GetEntriesFast() > 0 ) return;
 152
 153    TString name = GetName();
 154
 155    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_L0",       name, 0 ) );
 156    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetHPt_L1",name, 1 ) );
 157    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetMPt_L1",name, 1 ) );
 158    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetLPt_L1",name, 1 ) );
 159
 160 }
 161
 162 //____________________________________________________________________________
 163 void AliPHOSTrigger::FillTRU(const TClonesArray * digits, const AliPHOSGeometry * geom, TClonesArray * ampmatrixtru, TClonesArray * ampmatrixmod, TClonesArray * timeRmatrixtru) const {
 164
 165   //Orders digits ampitudes list and times in fNTRU TRUs (28x16 crystals)
 166   //per module. Each TRU is a TMatrixD, and they are kept in TClonesArrays.
 167   //In a module, the number of TRU in phi is fNTRUPhi, and the number of
 168   //TRU in eta is fNTRUZ. Also fill a matrix with all amplitudes in module for isolation studies.
 169
 170   //Check data members
 171
 172   if(fNTRUZ*fNTRUPhi != fNTRU)
 173     Error("FillTRU"," Wrong number of TRUS per Z or Phi");
 174
 175   //Initilize and declare variables
 176   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
 177   Int_t relid[4] ;
 178   Float_t amp   = -1;
 179   Float_t timeR = -1;
 180   Int_t id      = -1;
 181
 182   //List of TRU matrices initialized to 0.
 183   for(Int_t k = 0; k < fNTRU*nModules ; k++){
 184     TMatrixD   amptrus(fNCrystalsPhi,fNCrystalsZ) ;
 185     TMatrixD   timeRtrus(fNCrystalsPhi,fNCrystalsZ) ;
 186     for(Int_t i = 0; i < fNCrystalsPhi; i++){
 187       for(Int_t j = 0; j < fNCrystalsZ; j++){
 188         amptrus(i,j)   = 0.0;
 189         timeRtrus(i,j) = 0.0;
 190       }
 191     }
 192     new((*ampmatrixtru)[k])   TMatrixD(amptrus) ;
 193     new((*timeRmatrixtru)[k]) TMatrixD(timeRtrus) ;
 194   }
 195
 196   //List of Modules matrices initialized to 0.
 197   Int_t nmodphi = geom->GetNPhi();
 198   Int_t nmodz = geom->GetNZ();
 199
 200   for(Int_t k = 0; k < nModules ; k++){
 201     TMatrixD  ampmods(nmodphi,nmodz) ;
 202     for(Int_t i = 0; i < nmodphi; i++){
 203       for(Int_t j = 0; j < nmodz; j++){
 204         ampmods(i,j)   = 0.0;
 205       }
 206     }
 207     new((*ampmatrixmod)[k])   TMatrixD(ampmods) ;
 208   }
 209
 210   AliPHOSDigit * dig ;
 211
 212   //Digits loop to fill TRU matrices with amplitudes.
 213   for(Int_t idig = 0 ; idig < digits->GetEntriesFast() ; idig++){
 214
 215     dig    = static_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(idig)) ;
 216     amp    = dig->GetEnergy() ;   // Energy of the digit
 217     id     = dig->GetId() ;    // Id label of the cell
 218     timeR  = dig->GetTimeR() ; // Earliest time of the digit
 219     geom->AbsToRelNumbering(id, relid) ;
 220     //Transform digit number into 4 numbers
 221     //relid[0] = module
 222     //relid[1] = EMC (0) or CPV (-1)
 223     //relid[2] = row <= 64 (fNPhi)
 224     //relid[3] = column <= 56 (fNZ)
 225
 226     if(relid[1] == 0){//Not CPV, Only EMC digits
 227       //############# TRU ###################
 228       //Check to which TRU in the supermodule belongs the crystal.
 229       //Supermodules are divided in a TRU matrix of dimension
 230       //(fNTRUPhi,fNTRUZ).
 231       //Each TRU is a crystal matrix of dimension (fNCrystalsPhi,fNCrystalsZ)
 232
 233       //First calculate the row and column in the supermodule
 234       //of the TRU to which the crystal belongs.
 235       Int_t col   = (relid[3]-1)/fNCrystalsZ+1;
 236       Int_t row   = (relid[2]-1)/fNCrystalsPhi+1;
 237
 238       //Calculate label number of the TRU
 239       Int_t itru  = (row-1) + (col-1)*fNTRUPhi + (relid[0]-1)*fNTRU ;
 240
 241       //Fill TRU matrix with crystal values
 242       TMatrixD * amptrus   = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrixtru->At(itru)) ;
 243       TMatrixD * timeRtrus = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRmatrixtru->At(itru)) ;
 244
 245       //Calculate row and column of the crystal inside the TRU with number itru
 246       Int_t irow = (relid[2]-1) - (row-1) *  fNCrystalsPhi;
 247       Int_t icol = (relid[3]-1) - (col-1) *  fNCrystalsZ;
 248
 249       (*amptrus)(irow,icol)   = amp ;
 250       (*timeRtrus)(irow,icol) = timeR ;
 251
 252       //####################MODULE MATRIX ##################
 253       TMatrixD * ampmods   = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrixmod->At(relid[0]-1)) ;
 254       (*ampmods)(relid[2]-1,relid[3]-1)   = amp ;
 255     }
 256   }
 257 }
 258
 259 //______________________________________________________________________
 260 void AliPHOSTrigger::GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(const Int_t itru,const Int_t iphitru,const Int_t ietatru,Int_t &iphiMod,Int_t &ietaMod) const
 261 {
 262   // This method transforms the (eta,phi) index of a crystals in a
 263   // TRU matrix into Super Module (eta,phi) index.
 264
 265   // Calculate in which row and column in which the TRU are
 266   // ordered in the SM
 267   Int_t col = itru/ fNTRUPhi + 1;
 268   Int_t row = itru - (col-1)*fNTRUPhi + 1;
 269
 270   //Calculate the (eta,phi) index in SM
 271
 272   iphiMod = fNCrystalsPhi*(row-1) + iphitru + 1 ;
 273   ietaMod = fNCrystalsZ*(col-1)   + ietatru + 1 ;
 274
 275 }
 276
 277 //____________________________________________________________________________
 278 Bool_t AliPHOSTrigger::IsPatchIsolated(Int_t iPatchType, const TClonesArray * ampmatrixes, const Int_t imod, const Int_t mtru, const Float_t maxamp, const Int_t maxphi, const Int_t maxeta) {
 279
 280   //Calculate if the maximum patch found is isolated, find amplitude around maximum (2x2 or nxn) patch,
 281   //inside isolation patch . iPatchType = 0 means calculation for 2x2 patch,
 282   //iPatchType = 1 means calculation for nxn patch.
 283   //In the next table there is an example of the different options of patch size and isolation patch size:
 284   //                                                                                 Patch Size (fPatchSize)
 285   //                                                             0                          1                                  2
 286   //          fIsolPatchSize                 2x2 (not overlap)   4x4 (overlapped)        6x6(overlapped) ...
 287   //                   1                                       4x4                      8x8                              10x10
 288   //                   2                                       6x6                     12x12                           14x14
 289   //                   3                                       8x8                     16x16                           18x18
 290
 291   Bool_t b = kFALSE;
 292   Float_t amp = 0;
 293
 294  //Get matrix of TRU or Module with maximum amplitude patch.
 295   Int_t itru = mtru+imod*fNTRU ; //number of tru, min 0 max 8*5.
 296   TMatrixD * ampmatrix   = 0x0;
 297   Int_t colborder = 0;
 298   Int_t rowborder = 0;
 299
 300   if(fIsolateInModule){
 301     ampmatrix = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrixes->At(imod)) ;
 302     rowborder = fNCrystalsPhi*fNTRUPhi;
 303     colborder = fNCrystalsZ*fNTRUZ;
 304     AliDebug(2,"Isolate trigger in Module");
 305   }
 306   else{
 307     ampmatrix = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrixes->At(itru)) ;
 308     rowborder = fNCrystalsPhi;
 309     colborder = fNCrystalsZ;
 310     AliDebug(2,"Isolate trigger in TRU");
 311   }
 312
 313   //Define patch cells
 314   Int_t isolcells = fIsolPatchSize*(1+iPatchType);
 315   Int_t ipatchcells = 2*(1+fPatchSize*iPatchType);
 316   Int_t minrow =  maxphi - isolcells;
 317   Int_t mincol =  maxeta - isolcells;
 318   Int_t maxrow =  maxphi + isolcells + ipatchcells;
 319   Int_t maxcol = maxeta +  isolcells + ipatchcells;
 320
 321   AliDebug(2,Form("Number of added Isol Cells %d, Patch Size %d",isolcells, ipatchcells));
 322   AliDebug(2,Form("Patch: minrow %d, maxrow %d, mincol %d, maxcol %d",minrow,maxrow,mincol,maxcol));
 323
 324   if(minrow < 0 || mincol < 0 || maxrow > rowborder || maxcol > colborder){
 325     AliDebug(1,Form("Out of Module/TRU range, cannot isolate patch"));
 326     return kFALSE;
 327   }
 328
 329   //Add amplitudes in all isolation patch
 330   for(Int_t irow = minrow ; irow <  maxrow; irow ++)
 331     for(Int_t icol = mincol ; icol < maxcol ; icol ++)
 332       amp += (*ampmatrix)(irow,icol);
 333
 334   AliDebug(2,Form("Type %d, Maximum amplitude %f, patch+isol square %f",iPatchType, maxamp, amp));
 335
 336   if(TMath::Nint(amp*1E5) < TMath::Nint(maxamp*1E5)){
 337     AliError(Form("Bad sum: Type %d, Maximum amplitude %f, patch+isol square %f",iPatchType, maxamp, amp));
 338     return kFALSE;
 339   }
 340   else
 341     amp-=maxamp; //Calculate energy in isolation patch that do not comes from maximum patch.
 342
 343   AliDebug(2, Form("Maximum amplitude %f, Out of patch %f",maxamp, amp));
 344
 345   //Fill isolation amplitude data member and say if patch is isolated.
 346   if(iPatchType == 0){ //2x2 case
 347     f2x2AmpOutOfPatch = amp;
 348     if(amp < f2x2AmpOutOfPatchThres)
 349       b=kTRUE;
 350   }
 351   else  if(iPatchType == 1){ //nxn case
 352     fnxnAmpOutOfPatch = amp;
 353     if(amp < fnxnAmpOutOfPatchThres)
 354       b=kTRUE;
 355   }
 356
 357   return b;
 358
 359 }
 360
 361
 362 //____________________________________________________________________________
 363 void AliPHOSTrigger::MakeSlidingCell(const TClonesArray * amptrus, const TClonesArray * timeRtrus, const Int_t imod, TMatrixD &ampmax2, TMatrixD &ampmaxn){
 364   //Sums energy of all possible 2x2 (L0) and nxn (L1) crystals per each TRU.
 365   //Fast signal in the experiment is given by 2x2 crystals,
 366   //for this reason we loop inside the TRU crystals by 2.
 367
 368   //Declare and initialize varibles
 369   Float_t amp2 = 0 ;
 370   Float_t ampn = 0 ;
 371   for(Int_t i = 0; i < 4; i++){
 372     for(Int_t j = 0; j < fNTRU; j++){
 373       ampmax2(i,j) = -1;
 374       ampmaxn(i,j) = -1;
 375     }
 376   }
 377
 378   //Create matrix that will contain 2x2 amplitude sums
 379   //used to calculate the nxn sums
 380   TMatrixD  tru2x2(fNCrystalsPhi/2,fNCrystalsZ/2) ;
 381   for(Int_t i = 0; i < fNCrystalsPhi/2; i++)
 382     for(Int_t j = 0; j < fNCrystalsZ/2; j++)
 383       tru2x2(i,j) = -1.;
 384
 385   //Loop over all TRUS in a module
 386   for(Int_t itru = 0 + imod  * fNTRU ; itru < (imod+1)*fNTRU ; itru++){
 387     TMatrixD * amptru   = dynamic_cast<TMatrixD *>(amptrus->At(itru)) ;
 388     TMatrixD * timeRtru = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRtrus->At(itru)) ;
 389     Int_t mtru = itru-imod*fNTRU ; //Number of TRU in Module
 390
 391     //Sliding 2x2, add 2x2 amplitudes (NOT OVERLAP)
 392     for(Int_t irow = 0 ; irow <  fNCrystalsPhi; irow += 2){
 393       for(Int_t icol = 0 ; icol < fNCrystalsZ ; icol += 2){
 394         amp2 = (*amptru)(irow,icol)+(*amptru)(irow+1,icol)+
 395           (*amptru)(irow,icol+1)+(*amptru)(irow+1,icol+1);
 396         //Fill new matrix with added 2x2 crystals for use in nxn sums
 397         tru2x2(irow/2,icol/2) = amp2 ;
 398         //Select 2x2 maximum sums to select L0
 399         if(amp2 > ampmax2(0,mtru)){
 400           ampmax2(0,mtru) = amp2 ;
 401           ampmax2(1,mtru) = irow;
 402           ampmax2(2,mtru) = icol;
 403         }
 404       }
 405     }
 406
 407     //Find most recent time in the selected 2x2 cell
 408     ampmax2(3,mtru) = 1 ;
 409     Int_t row2 =  static_cast <Int_t> (ampmax2(1,mtru));
 410     Int_t col2 =  static_cast <Int_t> (ampmax2(2,mtru));
 411     for(Int_t i = 0; i<2; i++){
 412       for(Int_t j = 0; j<2; j++){
 413         if((*amptru)(row2+i,col2+j) > 0 &&  (*timeRtru)(row2+i,col2+j)> 0){
 414           if((*timeRtru)(row2+i,col2+j) <  ampmax2(3,mtru)  )
 415             ampmax2(3,mtru) =  (*timeRtru)(row2+i,col2+j);
 416         }
 417       }
 418     }
 419
 420     //Sliding nxn, add nxn amplitudes (OVERLAP)
 421     if(fPatchSize > 0){
 422       for(Int_t irow = 0 ; irow <  fNCrystalsPhi/2; irow++){
 423         for(Int_t icol = 0 ; icol < fNCrystalsZ/2 ; icol++){
 424           ampn = 0;
 425           if( (irow+fPatchSize) < fNCrystalsPhi/2 && (icol+fPatchSize) < fNCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
 426             for(Int_t i = 0 ; i <= fPatchSize ; i++)
 427               for(Int_t j = 0 ; j <= fPatchSize ; j++)
 428                 ampn += tru2x2(irow+i,icol+j);
 429             //Select nxn maximum sums to select L1
 430             if(ampn > ampmaxn(0,mtru)){
 431               ampmaxn(0,mtru) = ampn ;
 432               ampmaxn(1,mtru) = irow*2;
 433               ampmaxn(2,mtru) = icol*2;
 434             }
 435           }
 436         }
 437       }
 438
 439       //Find most recent time in selected nxn cell
 440       ampmaxn(3,mtru) = 1 ;
 441       Int_t rown =  static_cast <Int_t> (ampmaxn(1,mtru));
 442       Int_t coln =  static_cast <Int_t> (ampmaxn(2,mtru));
 443       for(Int_t i = 0; i<4*fPatchSize; i++){
 444         for(Int_t j = 0; j<4*fPatchSize; j++){
 445           if( (rown+i) < fNCrystalsPhi && (coln+j) < fNCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
 446             if((*amptru)(rown+i,coln+j) > 0 &&  (*timeRtru)(rown+i,coln+j)> 0){
 447               if((*timeRtru)(rown+i,coln+j) <  ampmaxn(3,mtru)  )
 448                 ampmaxn(3,mtru) =  (*timeRtru)(rown+i,coln+j);
 449             }
 450           }
 451         }
 452       }
 453     }
 454     else {
 455         ampmaxn(0,mtru) =  ampmax2(0,mtru);
 456         ampmaxn(1,mtru) =  ampmax2(1,mtru);
 457         ampmaxn(2,mtru) =  ampmax2(2,mtru);
 458         ampmaxn(3,mtru) =  ampmax2(3,mtru);
 459       }
 460   }
 461 }
 462
 463
 464 //____________________________________________________________________________
 465 void AliPHOSTrigger::Print(const Option_t * opt) const
 466 {
 467
 468   //Prints main parameters
 469
 470   if(! opt)
 471     return;
 472   AliTriggerInput* in = 0x0 ;
 473
 474   printf( "             Maximum Amplitude after Sliding Crystal, \n") ;
 475   printf( "               -2x2 crystals sum (not overlapped): %10.2f, in Super Module %d\n",
 476           f2x2MaxAmp,f2x2SM) ;
 477   printf( "               -2x2 from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", f2x2CrystalPhi, f2x2CrystalPhi+2, f2x2CrystalEta, f2x2CrystalEta+2) ;
 478   printf( "               -2x2 Isolation Patch %d x %d, Amplitude out of 2x2 patch is %f, threshold %f, Isolated? %d \n",
 479           2*fIsolPatchSize+2, 2*fIsolPatchSize+2,  f2x2AmpOutOfPatch,  f2x2AmpOutOfPatchThres,static_cast<Int_t> (fIs2x2Isol)) ;
 480   if(fPatchSize > 0){
 481     printf( "             Patch Size, n x n: %d x %d cells\n",2*(fPatchSize+1), 2*(fPatchSize+1));
 482     printf( "               -nxn crystals sum (overlapped)    : %10.2f, in Super Module %d\n",
 483             fnxnMaxAmp,fnxnSM) ;
 484     printf( "               -nxn from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", fnxnCrystalPhi, fnxnCrystalPhi+4*fPatchSize, fnxnCrystalEta, fnxnCrystalEta+4*fPatchSize) ;
 485     printf( "               -nxn Isolation Patch %d x %d, Amplitude out of nxn patch is %f, threshold %f, Isolated? %d \n",
 486             4*fIsolPatchSize+2*(fPatchSize+1),4*fIsolPatchSize+2*(fPatchSize+1) ,  fnxnAmpOutOfPatch,  fnxnAmpOutOfPatchThres,static_cast<Int_t> (fIsnxnIsol) ) ;
 487   }
 488
 489   printf( "             Isolate in Module? %d\n",
 490           fIsolateInModule) ;
 491
 492   printf( "             Threshold for LO %10.1f\n",
 493           fL0Threshold) ;
 494
 495   printf( "             Threshold for LO %10.2f\n", fL0Threshold) ;
 496   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_L0" );
 497   if(in->GetValue())
 498     printf( "             *** PHOS LO is set ***\n") ;
 499
 500   printf( "             Jet Low Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetLowPtThreshold) ;
 501   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_JetLPt_L1" );
 502   if(in->GetValue())
 503     printf( "             *** PHOS Jet Low Pt for L1 is set ***\n") ;
 504
 505   printf( "             Jet Medium Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetMediumPtThreshold) ;
 506   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_JetMPt_L1" );
 507   if(in->GetValue())
 508     printf( "             *** PHOS Jet Medium Pt for L1 is set ***\n") ;
 509
 510   printf( "             Jet High Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetHighPtThreshold) ;
 511   in = (AliTriggerInput*) fInputs.FindObject( "PHOS_JetHPt_L1" );
 512   if(in->GetValue())
 513     printf( "              *** PHOS Jet High Pt for L1 is set ***\n") ;
 514
 515 }
 516
 517 //____________________________________________________________________________
 518 void AliPHOSTrigger::SetTriggers(const TClonesArray * ampmatrix, const Int_t iMod, const TMatrixD & ampmax2, const TMatrixD & ampmaxn)
 519 {
 520   //Checks the 2x2 and nxn maximum amplitude per each TRU and compares
 521   //with the different L0 and L1 triggers thresholds. It finds if maximum amplitudes are isolated.
 522
 523   //Initialize variables
 524   Float_t max2[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 525   Float_t maxn[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 526   Int_t   mtru2  = -1 ;
 527   Int_t   mtrun  = -1 ;
 528
 529
 530   //Find maximum summed amplitude of all the TRU
 531   //in a Module
 532   for(Int_t i = 0 ; i < fNTRU ; i++){
 533     if(max2[0] < ampmax2(0,i) ){
 534       max2[0] =  ampmax2(0,i) ; // 2x2 summed max amplitude
 535       max2[1] =  ampmax2(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 536       max2[2] =  ampmax2(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 537       max2[3] =  ampmax2(3,i) ; // corresponding most recent time
 538       mtru2   = i ; // TRU number in module
 539     }
 540     if(maxn[0] < ampmaxn(0,i) ){
 541       maxn[0] =  ampmaxn(0,i) ; // nxn summed max amplitude
 542       maxn[1] =  ampmaxn(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 543       maxn[2] =  ampmaxn(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 544       maxn[3] =  ampmaxn(3,i) ; // corresponding most recent time
 545       mtrun   = i ; // TRU number in module
 546     }
 547   }
 548
 549   //Set max amplitude if larger than in other Modules
 550   Float_t maxtimeR2 = -1 ;
 551   Float_t maxtimeRn = -1 ;
 552   // Create a shaper pulse object
 553   AliPHOSPulseGenerator pulse ;
 554   Int_t nTimeBins = pulse.GetRawFormatTimeBins() ;
 555
 556   //Set max 2x2 amplitude and select L0 trigger
 557   if(max2[0] > f2x2MaxAmp ){
 558     f2x2MaxAmp  = max2[0] ;
 559     f2x2SM      = iMod ;
 560     maxtimeR2   = max2[3] ;
 561     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(mtru2,
 562                                               static_cast<Int_t>(max2[1]),
 563                                               static_cast<Int_t>(max2[2]),
 564                                               f2x2CrystalPhi,f2x2CrystalEta) ;
 565
 566     //Isolated patch?
 567     if(fIsolateInModule)
 568       fIs2x2Isol =  IsPatchIsolated(0, ampmatrix, iMod, mtru2,  f2x2MaxAmp, f2x2CrystalPhi,f2x2CrystalEta) ;
 569     else
 570       fIs2x2Isol =  IsPatchIsolated(0, ampmatrix, iMod, mtru2,  f2x2MaxAmp,  static_cast<Int_t>(max2[1]), static_cast<Int_t>(max2[2])) ;
 571
 572     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 573     if (fADCValuesLow2x2 == 0) {
 574       fADCValuesLow2x2  = new Int_t[nTimeBins];
 575     }
 576     if(!fADCValuesHigh2x2) fADCValuesHigh2x2 = new Int_t[nTimeBins];
 577
 578
 579     pulse.SetAmplitude(f2x2MaxAmp);
 580     pulse.SetTZero(maxtimeR2);
 581     pulse.MakeSamples();
 582     pulse.GetSamples(fADCValuesHigh2x2, fADCValuesLow2x2) ;
 583
 584     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 585     //Set L0
 586     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 587       if(fADCValuesHigh2x2[i] >= fL0Threshold || fADCValuesLow2x2[i] >= fL0Threshold) {
 588         SetInput("PHOS_L0") ;
 589         break;
 590       }
 591     }
 592   }
 593
 594   //Set max nxn amplitude and select L1 triggers
 595   if(maxn[0] > fnxnMaxAmp  && fPatchSize > 0){
 596     fnxnMaxAmp  = maxn[0] ;
 597     fnxnSM      = iMod ;
 598     maxtimeRn   = maxn[3] ;
 599     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(mtrun,
 600                                               static_cast<Int_t>(maxn[1]),
 601                                               static_cast<Int_t>(maxn[2]),
 602                                               fnxnCrystalPhi,fnxnCrystalEta) ;
 603
 604     //Isolated patch?
 605     if(fIsolateInModule)
 606       fIsnxnIsol =  IsPatchIsolated(1, ampmatrix, iMod, mtrun,  fnxnMaxAmp, fnxnCrystalPhi, fnxnCrystalEta) ;
 607     else
 608       fIsnxnIsol =  IsPatchIsolated(1, ampmatrix, iMod, mtrun,  fnxnMaxAmp,  static_cast<Int_t>(maxn[1]), static_cast<Int_t>(maxn[2])) ;
 609
 610     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 611     if (fADCValuesHighnxn == 0) {
 612       fADCValuesHighnxn = new Int_t[nTimeBins];
 613       fADCValuesLownxn  = new Int_t[nTimeBins];
 614     }
 615
 616     pulse.SetAmplitude(fnxnMaxAmp);
 617     pulse.SetTZero(maxtimeRn);
 618     pulse.MakeSamples();
 619     pulse.GetSamples(fADCValuesHighnxn, fADCValuesLownxn) ;
 620
 621     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 622     //SetL1 Low
 623     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 624       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold  || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold){
 625         SetInput("PHOS_JetLPt_L1") ;
 626         break;
 627       }
 628     }
 629     //SetL1 Medium
 630     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 631       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetMediumPtThreshold  || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetMediumPtThreshold){
 632         SetInput("PHOS_JetMPt_L1") ;
 633         break;
 634       }
 635     }
 636     //SetL1 High
 637     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 638       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold){
 639         SetInput("PHOS_JetHPt_L1") ;
 640         break;
 641       }
 642     }
 643   }
 644 }
 645
 646 //____________________________________________________________________________
 647 void AliPHOSTrigger::Trigger(TClonesArray *digits)
 648 {
 649   //Main Method to select triggers.
 650
 651   fDigitsList = digits;
 652   DoIt() ;
 653 }
 654
 655 //____________________________________________________________________________
 656 void AliPHOSTrigger::DoIt()
 657 {
 658   // does the trigger job
 659
 660   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader() ;
 661   AliPHOSLoader * phosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 662
 663   // Get PHOS Geometry object
 664   AliPHOSGeometry *geom;
 665   if (!(geom = AliPHOSGeometry::GetInstance()))
 666         geom = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP","");
 667
 668   //Define parameters
 669   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
 670   fNCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi ;// 64/4=16
 671   fNCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ ;// 56/2=28
 672
 673   //Intialize data members each time the trigger is called in event loop
 674   f2x2MaxAmp = -1; f2x2CrystalPhi = -1;  f2x2CrystalEta = -1;
 675   fnxnMaxAmp = -1; fnxnCrystalPhi = -1;  fnxnCrystalEta = -1;
 676
 677   //Take the digits list if simulation
 678   if(fSimulation)
 679     fDigitsList = phosLoader->Digits() ;
 680
 681   if(!fDigitsList)
 682     AliFatal("Digits not found !") ;
 683
 684   //Fill TRU Matrix
 685   TClonesArray * amptrus   = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 686   TClonesArray * ampmods   = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 687   TClonesArray * timeRtrus = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 688   FillTRU(fDigitsList,geom,amptrus, ampmods,timeRtrus) ;
 689
 690   //Do Crystal Sliding and select Trigger
 691   //Initialize varible that will contain maximum amplitudes and
 692   //its corresponding cell position in eta and phi, and time.
 693   TMatrixD   ampmax2(4,fNTRU) ;
 694   TMatrixD   ampmaxn(4,fNTRU) ;
 695
 696   for(Int_t imod = 0 ; imod < nModules ; imod++) {
 697
 698     //Do 2x2 and nxn sums, select maximums.
 699     MakeSlidingCell(amptrus, timeRtrus, imod, ampmax2, ampmaxn);
 700     //Set the trigger
 701     if(fIsolateInModule)
 702       SetTriggers(ampmods,imod,ampmax2,ampmaxn) ;
 703     else
 704       SetTriggers(amptrus,imod,ampmax2,ampmaxn) ;
 705   }
 706
 707   amptrus->Delete();
 708   delete amptrus; amptrus=0;
 709   ampmods->Delete();
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