PHOS/AliPHOSTrigger.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 /* $Log $ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //  Class for trigger analysis.
  20 //  Digits are grouped in TRU's (Trigger Units). A TRU consist of 16x28
  21 //  crystals ordered fNTRUPhi x fNTRUZ. The algorithm searches all possible
  22 //  2x2 and nxn (n multiple of 4) crystal combinations per each TRU, adding the
  23 //  digits amplitude and  finding the maximum. Iti is found is maximum is isolated.
  24 //  Maxima are transformed in ADC time samples. Each time bin is compared to the trigger
  25 //  threshold until it is larger and then, triggers are set. Thresholds need to be fixed.
  26 //  Usage:
  27 //
  28 //  //Inside the event loop
  29 //  AliEMCALTrigger *tr = new AliEMCALTrigger();//Init Trigger
  30 //  tr->SetL0Threshold(100);
  31 //  tr->SetL1JetLowPtThreshold(1000);
  32 //  tr->SetL1JetHighPtThreshold(20000);
  33 //  ....
  34 //  tr->Trigger(); //Execute Trigger
  35 //  tr->Print(""); //Print data members after calculation.
  36 //
  37 //
  38 //*-- Author: Gustavo Conesa & Yves Schutz (IFIC, CERN)
  39 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  40
  41
  42 // --- ROOT system ---
  43 //#include "TMatrixD.h"
  44
  45 // --- ALIROOT system ---
  46 #include "AliPHOS.h"
  47 #include "AliPHOSTrigger.h"
  48 #include "AliPHOSGeometry.h"
  49 #include "AliPHOSGetter.h"
  50 #include "AliPHOSPulseGenerator.h"
  51 #include "AliTriggerInput.h"
  52 //#include "AliLog.h"
  53
  54 ClassImp(AliPHOSTrigger)
  55
  56 //______________________________________________________________________
  57 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger()
  58   : AliTriggerDetector(),
  59     f2x2MaxAmp(-1), f2x2CrystalPhi(-1),  f2x2CrystalEta(-1), f2x2SM(0),
  60     fnxnMaxAmp(-1), fnxnCrystalPhi(-1),  fnxnCrystalEta(-1), fnxnSM(0),
  61     fADCValuesHighnxn(0), fADCValuesLownxn(0),
  62     fADCValuesHigh2x2(0), fADCValuesLow2x2(0), fDigitsList(0),
  63     fL0Threshold(50), fL1JetLowPtThreshold(200), fL1JetHighPtThreshold(500),
  64     fNTRU(8), fNTRUZ(2), fNTRUPhi(4),
  65     fNCrystalsPhi(16),
  66     fNCrystalsZ(28),
  67     fPatchSize(1), fIsolPatchSize(1),
  68     f2x2AmpOutOfPatch(-1), fnxnAmpOutOfPatch(-1),
  69     f2x2AmpOutOfPatchThres(2),  fnxnAmpOutOfPatchThres(2), //2 GeV out of patch
  70     fIs2x2Isol(kFALSE), fIsnxnIsol(kFALSE),
  71     fSimulation(kTRUE)
  72 {
  73   //ctor
  74   fADCValuesHighnxn = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  75   fADCValuesLownxn  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  76   fADCValuesHigh2x2 = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  77   fADCValuesLow2x2  = 0x0; //new Int_t[fTimeBins];
  78
  79   SetName("PHOS");
  80   CreateInputs();
  81
  82   //Print("") ;
  83 }
  84
  85 //____________________________________________________________________________
  86 AliPHOSTrigger::AliPHOSTrigger(const AliPHOSTrigger & trig) :
  87   AliTriggerDetector(trig),
  88   f2x2MaxAmp(trig.f2x2MaxAmp),
  89   f2x2CrystalPhi(trig.f2x2CrystalPhi),
  90   f2x2CrystalEta(trig.f2x2CrystalEta),
  91   f2x2SM(trig.f2x2SM),
  92   fnxnMaxAmp(trig.fnxnMaxAmp),
  93   fnxnCrystalPhi(trig.fnxnCrystalPhi),
  94   fnxnCrystalEta(trig.fnxnCrystalEta),
  95   fnxnSM(trig.fnxnSM),
  96   fADCValuesHighnxn(trig.fADCValuesHighnxn),
  97   fADCValuesLownxn(trig.fADCValuesLownxn),
  98   fADCValuesHigh2x2(trig.fADCValuesHigh2x2),
  99   fADCValuesLow2x2(trig.fADCValuesLow2x2),
 100   fDigitsList(trig.fDigitsList),
 101   fL0Threshold(trig.fL0Threshold),
 102   fL1JetLowPtThreshold(trig.fL1JetLowPtThreshold),
 103   fL1JetHighPtThreshold(trig.fL1JetHighPtThreshold),
 104   fNTRU(trig.fNTRU),
 105   fNTRUZ(trig.fNTRUZ),
 106   fNTRUPhi(trig.fNTRUPhi),
 107   fNCrystalsPhi(trig.fNCrystalsPhi),
 108   fNCrystalsZ(trig. fNCrystalsZ),
 109   fPatchSize(trig.fPatchSize),
 110   fIsolPatchSize(trig.fIsolPatchSize),
 111   f2x2AmpOutOfPatch(trig.f2x2AmpOutOfPatch),
 112   fnxnAmpOutOfPatch(trig.fnxnAmpOutOfPatch),
 113   f2x2AmpOutOfPatchThres(trig.f2x2AmpOutOfPatchThres),
 114   fnxnAmpOutOfPatchThres(trig.fnxnAmpOutOfPatchThres),
 115   fIs2x2Isol(trig.fIs2x2Isol),
 116   fIsnxnIsol(trig.fIsnxnIsol),
 117   fSimulation(trig.fSimulation)
 118 {
 119   // cpy ctor
 120 }
 121
 122 //_________________________________________________________________________
 123 AliPHOSTrigger & AliPHOSTrigger::operator = (const AliPHOSTrigger &)
 124 {
 125   Fatal("operator =", "no implemented");
 126   return *this;
 127 }
 128
 129 void AliPHOSTrigger::CreateInputs()
 130 {
 131    // inputs
 132
 133    // Do not create inputs again!!
 134    if( fInputs.GetEntriesFast() > 0 ) return;
 135
 136    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_L0",       "PHOS L0", 0x02 ) );
 137    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetHPt_L1","PHOS Jet High Pt L1", 0x04 ) );
 138    fInputs.AddLast( new AliTriggerInput( "PHOS_JetLPt_L1","PHOS Jet Low Pt L1", 0x08 ) );
 139
 140 }
 141
 142 //____________________________________________________________________________
 143 void AliPHOSTrigger::FillTRU(const TClonesArray * digits, const AliPHOSGeometry * geom, TClonesArray * ampmatrix, TClonesArray * timeRmatrix) const {
 144
 145   //Orders digits ampitudes list and times in fNTRU TRUs (28x16 crystals)
 146   //per module. Each TRU is a TMatrixD, and they are kept in TClonesArrays.
 147   //In a module, the number of TRU in phi is fNTRUPhi, and the number of
 148   //TRU in eta is fNTRUZ.
 149
 150   //Check data members
 151
 152   if(fNTRUZ*fNTRUPhi != fNTRU)
 153     Error("FillTRU"," Wrong number of TRUS per Z or Phi");
 154
 155   //Initilize and declare variables
 156   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
 157   Int_t relid[4] ;
 158   Float_t amp   = -1;
 159   Float_t timeR = -1;
 160   Int_t id      = -1;
 161
 162   //List of TRU matrices initialized to 0.
 163   for(Int_t k = 0; k < fNTRU*nModules ; k++){
 164     TMatrixD  * amptrus   = new TMatrixD(fNCrystalsPhi,fNCrystalsZ) ;
 165     TMatrixD  * timeRtrus = new TMatrixD(fNCrystalsPhi,fNCrystalsZ) ;
 166     for(Int_t i = 0; i < fNCrystalsPhi; i++){
 167       for(Int_t j = 0; j < fNCrystalsZ; j++){
 168         (*amptrus)(i,j)   = 0.0;
 169         (*timeRtrus)(i,j) = 0.0;
 170       }
 171     }
 172     new((*ampmatrix)[k])   TMatrixD(*amptrus) ;
 173     new((*timeRmatrix)[k]) TMatrixD(*timeRtrus) ;
 174   }
 175
 176   AliPHOSDigit * dig ;
 177
 178   //Digits loop to fill TRU matrices with amplitudes.
 179
 180   for(Int_t idig = 0 ; idig < digits->GetEntriesFast() ; idig++){
 181
 182     dig    = static_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(idig)) ;
 183     amp    = dig->GetEnergy() ;   // Energy of the digit
 184     id     = dig->GetId() ;    // Id label of the cell
 185     timeR  = dig->GetTimeR() ; // Earliest time of the digit
 186     geom->AbsToRelNumbering(id, relid) ;
 187     //Transform digit number into 4 numbers
 188     //relid[0] = module
 189     //relid[1] = EMC (0) or CPV (-1)
 190     //relid[2] = row <= 64 (fNPhi)
 191     //relid[3] = column <= 56 (fNZ)
 192
 193     if(relid[1] == 0){//Not CPV, Only EMC digits
 194
 195       //Check to which TRU in the supermodule belongs the crystal.
 196       //Supermodules are divided in a TRU matrix of dimension
 197       //(fNTRUPhi,fNTRUZ).
 198       //Each TRU is a crystal matrix of dimension (fNCrystalsPhi,fNCrystalsZ)
 199
 200       //First calculate the row and column in the supermodule
 201       //of the TRU to which the crystal belongs.
 202       Int_t col   = (relid[3]-1)/fNCrystalsZ+1;
 203       Int_t row   = (relid[2]-1)/fNCrystalsPhi+1;
 204
 205       //Calculate label number of the TRU
 206       Int_t itru  = (row-1) + (col-1)*fNTRUPhi + (relid[0]-1)*fNTRU ;
 207
 208       //Fill TRU matrix with crystal values
 209       TMatrixD * amptrus   = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrix->At(itru)) ;
 210       TMatrixD * timeRtrus = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRmatrix->At(itru)) ;
 211
 212       //Calculate row and column of the crystal inside the TRU with number itru
 213       Int_t irow = (relid[2]-1) - (row-1) *  fNCrystalsPhi;
 214       Int_t icol = (relid[3]-1) - (col-1) *  fNCrystalsZ;
 215
 216       (*amptrus)(irow,icol)   = amp ;
 217       (*timeRtrus)(irow,icol) = timeR ;
 218     }
 219   }
 220 }
 221
 222 //______________________________________________________________________
 223 void AliPHOSTrigger::GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(const Int_t itru,const Int_t iphitru,const Int_t ietatru,Int_t &iphiMod,Int_t &ietaMod) const
 224 {
 225   // This method transforms the (eta,phi) index of a crystals in a
 226   // TRU matrix into Super Module (eta,phi) index.
 227
 228   // Calculate in which row and column in which the TRU are
 229   // ordered in the SM
 230   Int_t col = itru/ fNTRUPhi + 1;
 231   Int_t row = itru - (col-1)*fNTRUPhi + 1;
 232
 233   //Calculate the (eta,phi) index in SM
 234
 235   iphiMod = fNCrystalsPhi*(row-1) + iphitru + 1 ;
 236   ietaMod = fNCrystalsZ*(col-1) + ietatru + 1 ;
 237
 238 }
 239
 240 //____________________________________________________________________________
 241 Bool_t AliPHOSTrigger::IsPatchIsolated(Int_t iPatchType, const TClonesArray * amptrus, const Int_t mtru, const Int_t imod, const Float_t *maxarray) {
 242
 243   //Calculate if the maximum patch found is isolated, find amplitude around maximum (2x2 or nxn) patch,
 244   //inside isolation patch . iPatchType = 0 means calculation for 2x2 patch,
 245   //iPatchType = 1 means calculation for nxn patch.
 246   //In the next table there is an example of the different options of patch size and isolation patch size:
 247   //                                                                                 Patch Size (fPatchSize)
 248   //                                                             0                          1                                  2
 249   //          fIsolPatchSize                 2x2 (not overlap)   4x4 (overlapped)        6x6(overlapped) ...
 250   //                   1                                       4x4                      8x8                              10x10
 251   //                   2                                       6x6                     12x12                           14x14
 252   //                   3                                       8x8                     16x16                           18x18
 253
 254   Bool_t b = kFALSE;
 255   Float_t amp = 0;
 256
 257  //Get matrix of TRU with maximum amplitude patch.
 258   Int_t itru = mtru+imod*fNTRU ; //number of tru, min 0 max 8*5.
 259   TMatrixD * amptru   = dynamic_cast<TMatrixD *>(amptrus->At(itru)) ;
 260
 261   //Define patch cells
 262   Int_t isolcells = fIsolPatchSize*(1+iPatchType);
 263   Int_t ipatchcells = 2*(1+fPatchSize*iPatchType);
 264   Int_t minrow =  static_cast<Int_t>(maxarray[1]) - isolcells;
 265   Int_t mincol =  static_cast<Int_t>(maxarray[2]) - isolcells;
 266   Int_t maxrow =  static_cast<Int_t>(maxarray[1]) + isolcells + ipatchcells;
 267   Int_t maxcol =  static_cast<Int_t>(maxarray[2]) +  isolcells + ipatchcells;
 268
 269   AliDebug(2,Form("Number of added Isol Cells %d, Patch Size %d",isolcells, ipatchcells));
 270   AliDebug(2,Form("Patch: minrow %d, maxrow %d, mincol %d, maxcol %d",minrow,maxrow,mincol,maxcol));
 271
 272   if(minrow < 0 || mincol < 0 || maxrow > fNCrystalsPhi || maxcol > fNCrystalsZ){
 273     AliDebug(1,Form("Out of TRU range, cannot isolate patch"));
 274     return kFALSE;
 275   }
 276
 277   //Add amplitudes in all isolation patch
 278   for(Int_t irow = minrow ; irow <  maxrow; irow ++)
 279     for(Int_t icol = mincol ; icol < maxcol ; icol ++)
 280       amp += (*amptru)(irow,icol);
 281
 282   AliDebug(2,Form("Type %d, Maximum amplitude %f, patch+isol square %f",iPatchType, maxarray[0], amp));
 283
 284   if(amp < maxarray[0]){
 285     AliError(Form("Bad sum: Type %d, Maximum amplitude %f, patch+isol square %f",iPatchType, maxarray[0], amp));
 286     return kFALSE;
 287   }
 288   else
 289     amp-=maxarray[0]; //Calculate energy in isolation patch that do not comes from maximum patch.
 290
 291   AliDebug(2, Form("Maximum amplitude %f, Out of patch %f",maxarray[0], amp));
 292
 293   //Fill isolation amplitude data member and say if patch is isolated.
 294   if(iPatchType == 0){ //2x2 case
 295     f2x2AmpOutOfPatch = amp;
 296     if(amp < f2x2AmpOutOfPatchThres)
 297       b=kTRUE;
 298   }
 299   else  if(iPatchType == 1){ //nxn case
 300     fnxnAmpOutOfPatch = amp;
 301     if(amp < fnxnAmpOutOfPatchThres)
 302       b=kTRUE;
 303   }
 304
 305   return b;
 306
 307 }
 308
 309
 310 //____________________________________________________________________________
 311 void AliPHOSTrigger::MakeSlidingCell(const TClonesArray * amptrus, const TClonesArray * timeRtrus, const Int_t imod, TMatrixD *ampmax2, TMatrixD *ampmaxn){
 312   //Sums energy of all possible 2x2 (L0) and nxn (L1) crystals per each TRU.
 313   //Fast signal in the experiment is given by 2x2 crystals,
 314   //for this reason we loop inside the TRU crystals by 2.
 315
 316   //Declare and initialize varibles
 317   Float_t amp2 = 0 ;
 318   Float_t ampn = 0 ;
 319   for(Int_t i = 0; i < 4; i++){
 320     for(Int_t j = 0; j < fNTRU; j++){
 321       (*ampmax2)(i,j) = -1;
 322       (*ampmaxn)(i,j) = -1;
 323     }
 324   }
 325
 326   //Create matrix that will contain 2x2 amplitude sums
 327   //used to calculate the nxn sums
 328   TMatrixD  * tru2x2 = new TMatrixD(fNCrystalsPhi/2,fNCrystalsZ/2) ;
 329   for(Int_t i = 0; i < fNCrystalsPhi/2; i++)
 330     for(Int_t j = 0; j < fNCrystalsZ/2; j++)
 331       (*tru2x2)(i,j) = -1.;
 332
 333   //Loop over all TRUS in a module
 334   for(Int_t itru = 0 + imod  * fNTRU ; itru < (imod+1)*fNTRU ; itru++){
 335     TMatrixD * amptru   = dynamic_cast<TMatrixD *>(amptrus->At(itru)) ;
 336     TMatrixD * timeRtru = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRtrus->At(itru)) ;
 337     Int_t mtru = itru-imod*fNTRU ; //Number of TRU in Module
 338
 339     //Sliding 2x2, add 2x2 amplitudes (NOT OVERLAP)
 340     for(Int_t irow = 0 ; irow <  fNCrystalsPhi; irow += 2){
 341       for(Int_t icol = 0 ; icol < fNCrystalsZ ; icol += 2){
 342         amp2 = (*amptru)(irow,icol)+(*amptru)(irow+1,icol)+
 343           (*amptru)(irow,icol+1)+(*amptru)(irow+1,icol+1);
 344         //Fill new matrix with added 2x2 crystals for use in nxn sums
 345         (*tru2x2)(irow/2,icol/2) = amp2 ;
 346         //Select 2x2 maximum sums to select L0
 347         if(amp2 > (*ampmax2)(0,mtru)){
 348           (*ampmax2)(0,mtru) = amp2 ;
 349           (*ampmax2)(1,mtru) = irow;
 350           (*ampmax2)(2,mtru) = icol;
 351         }
 352       }
 353     }
 354
 355     //Find most recent time in the selected 2x2 cell
 356     (*ampmax2)(3,mtru) = 1 ;
 357     Int_t row2 =  static_cast <Int_t> ((*ampmax2)(1,mtru));
 358     Int_t col2 =  static_cast <Int_t> ((*ampmax2)(2,mtru));
 359     for(Int_t i = 0; i<2; i++){
 360       for(Int_t j = 0; j<2; j++){
 361         if((*amptru)(row2+i,col2+j) > 0 &&  (*timeRtru)(row2+i,col2+j)> 0){
 362           if((*timeRtru)(row2+i,col2+j) <  (*ampmax2)(3,mtru)  )
 363             (*ampmax2)(3,mtru) =  (*timeRtru)(row2+i,col2+j);
 364         }
 365       }
 366     }
 367
 368     //Sliding nxn, add nxn amplitudes (OVERLAP)
 369     if(fPatchSize > 0){
 370       for(Int_t irow = 0 ; irow <  fNCrystalsPhi/2; irow++){
 371         for(Int_t icol = 0 ; icol < fNCrystalsZ/2 ; icol++){
 372           ampn = 0;
 373           if( (irow+fPatchSize) < fNCrystalsPhi/2 && (icol+fPatchSize) < fNCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
 374             for(Int_t i = 0 ; i <= fPatchSize ; i++)
 375               for(Int_t j = 0 ; j <= fPatchSize ; j++)
 376                 ampn += (*tru2x2)(irow+i,icol+j);
 377             //Select nxn maximum sums to select L1
 378             if(ampn > (*ampmaxn)(0,mtru)){
 379               (*ampmaxn)(0,mtru) = ampn ;
 380               (*ampmaxn)(1,mtru) = irow*2;
 381               (*ampmaxn)(2,mtru) = icol*2;
 382             }
 383           }
 384         }
 385       }
 386
 387       //Find most recent time in selected nxn cell
 388       (*ampmaxn)(3,mtru) = 1 ;
 389       Int_t rown =  static_cast <Int_t> ((*ampmaxn)(1,mtru));
 390       Int_t coln =  static_cast <Int_t> ((*ampmaxn)(2,mtru));
 391       for(Int_t i = 0; i<4*fPatchSize; i++){
 392         for(Int_t j = 0; j<4*fPatchSize; j++){
 393           if( (rown+i) < fNCrystalsPhi && (coln+j) < fNCrystalsZ/2){//Avoid exit the TRU
 394             if((*amptru)(rown+i,coln+j) > 0 &&  (*timeRtru)(rown+i,coln+j)> 0){
 395               if((*timeRtru)(rown+i,coln+j) <  (*ampmaxn)(3,mtru)  )
 396                 (*ampmaxn)(3,mtru) =  (*timeRtru)(rown+i,coln+j);
 397             }
 398           }
 399         }
 400       }
 401     }
 402     else {
 403         (*ampmaxn)(0,mtru) =  (*ampmax2)(0,mtru);
 404         (*ampmaxn)(1,mtru) =  (*ampmax2)(1,mtru);
 405         (*ampmaxn)(2,mtru) =  (*ampmax2)(2,mtru);
 406         (*ampmaxn)(3,mtru) =  (*ampmax2)(3,mtru);
 407       }
 408   }
 409 }
 410
 411
 412 //____________________________________________________________________________
 413 void AliPHOSTrigger::Print(const Option_t * opt) const
 414 {
 415
 416   //Prints main parameters
 417
 418   if(! opt)
 419     return;
 420   AliTriggerInput* in = 0x0 ;
 421
 422   printf( "             Maximum Amplitude after Sliding Crystal, \n") ;
 423   printf( "               -2x2 crystals sum (not overlapped): %10.2f, in Super Module %d\n",
 424           f2x2MaxAmp,f2x2SM) ;
 425   printf( "               -2x2 from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", f2x2CrystalPhi, f2x2CrystalPhi+2, f2x2CrystalEta, f2x2CrystalEta+2) ;
 426   printf( "               -2x2 Isolation Patch %d x %d, Amplitude out of 2x2 patch is %f, threshold %f, Isolated? %d \n",
 427           2*fIsolPatchSize+2, 2*fIsolPatchSize+2,  f2x2AmpOutOfPatch,  f2x2AmpOutOfPatchThres,static_cast<Int_t> (fIs2x2Isol)) ;
 428   if(fPatchSize > 0){
 429     printf( "             Patch Size, n x n: %d x %d cells\n",2*(fPatchSize+1), 2*(fPatchSize+1));
 430     printf( "               -nxn crystals sum (overlapped)    : %10.2f, in Super Module %d\n",
 431             fnxnMaxAmp,fnxnSM) ;
 432     printf( "               -nxn from row %d to row %d and from column %d to column %d\n", fnxnCrystalPhi, fnxnCrystalPhi+4, fnxnCrystalEta, fnxnCrystalEta+4) ;
 433     printf( "               -nxn Isolation Patch %d x %d, Amplitude out of nxn patch is %f, threshold %f, Isolated? %d \n",
 434             4*fIsolPatchSize+2*(fPatchSize+1),4*fIsolPatchSize+2*(fPatchSize+1) ,  fnxnAmpOutOfPatch,  fnxnAmpOutOfPatchThres,static_cast<Int_t> (fIsnxnIsol) ) ;
 435   }
 436   printf( "             Threshold for LO %10.1f\n",
 437           fL0Threshold) ;
 438
 439   printf( "             Threshold for LO %10.2f\n", fL0Threshold) ;
 440   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_L0" );
 441   if(in->GetValue())
 442     printf( "             *** PHOS LO is set ***\n") ;
 443
 444   printf( "             Jet Low Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetLowPtThreshold) ;
 445   in = (AliTriggerInput*)fInputs.FindObject( "PHOS_JetLPt_L1" );
 446   if(in->GetValue())
 447     printf( "             *** PHOS Jet Low Pt for L1 is set ***\n") ;
 448
 449   printf( "             Jet High Pt Threshold for L1 %10.2f\n", fL1JetHighPtThreshold) ;
 450   in = (AliTriggerInput*) fInputs.FindObject( "PHOS_JetHPt_L1" );
 451   if(in->GetValue())
 452     printf( "              *** PHOS Jet High Pt for L1 is set ***\n") ;
 453
 454 }
 455
 456 //____________________________________________________________________________
 457 void AliPHOSTrigger::SetTriggers(const TClonesArray * amptrus, const Int_t iMod, const TMatrixD * ampmax2, const TMatrixD * ampmaxn)
 458 {
 459   //Checks the 2x2 and nxn maximum amplitude per each TRU and compares
 460   //with the different L0 and L1 triggers thresholds. It finds if maximum amplitudes are isolated.
 461
 462   //Initialize variables
 463   Float_t max2[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 464   Float_t maxn[] = {-1,-1,-1,-1} ;
 465   Int_t   mtru2  = -1 ;
 466   Int_t   mtrun  = -1 ;
 467
 468
 469   //Find maximum summed amplitude of all the TRU
 470   //in a Module
 471   for(Int_t i = 0 ; i < fNTRU ; i++){
 472     if(max2[0] < (*ampmax2)(0,i) ){
 473       max2[0] =  (*ampmax2)(0,i) ; // 2x2 summed max amplitude
 474       max2[1] =  (*ampmax2)(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 475       max2[2] =  (*ampmax2)(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 476       max2[3] =  (*ampmax2)(3,i) ; // corresponding most recent time
 477       mtru2   = i ; // TRU number in module
 478     }
 479     if(maxn[0] < (*ampmaxn)(0,i) ){
 480       maxn[0] =  (*ampmaxn)(0,i) ; // nxn summed max amplitude
 481       maxn[1] =  (*ampmaxn)(1,i) ; // corresponding phi position in TRU
 482       maxn[2] =  (*ampmaxn)(2,i) ; // corresponding eta position in TRU
 483       maxn[3] =  (*ampmaxn)(3,i) ; // corresponding most recent time
 484       mtrun   = i ; // TRU number in module
 485     }
 486   }
 487
 488   //Set max amplitude if larger than in other Modules
 489   Float_t maxtimeR2 = -1 ;
 490   Float_t maxtimeRn = -1 ;
 491   // Create a shaper pulse object
 492   AliPHOSPulseGenerator *pulse = new AliPHOSPulseGenerator();
 493   Int_t nTimeBins = pulse->GetRawFormatTimeBins() ;
 494
 495   //Set max 2x2 amplitude and select L0 trigger
 496   if(max2[0] > f2x2MaxAmp ){
 497     f2x2MaxAmp  = max2[0] ;
 498     f2x2SM      = iMod ;
 499     maxtimeR2   = max2[3] ;
 500     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(mtru2,
 501                                               static_cast<Int_t>(max2[1]),
 502                                               static_cast<Int_t>(max2[2]),
 503                                               f2x2CrystalPhi,f2x2CrystalEta) ;
 504
 505     //Isolated patch?
 506     fIs2x2Isol =  IsPatchIsolated(0, amptrus, mtru2, iMod, max2) ;
 507
 508     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 509     fADCValuesLow2x2  = new Int_t[nTimeBins];
 510     fADCValuesHigh2x2 = new Int_t[nTimeBins];
 511
 512     pulse->SetAmplitude(f2x2MaxAmp);
 513     pulse->SetTZero(maxtimeR2);
 514     pulse->MakeSamples();
 515     pulse->GetSamples(fADCValuesHigh2x2, fADCValuesLow2x2) ;
 516
 517     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 518     //Set L0
 519     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 520       if(fADCValuesHigh2x2[i] >= fL0Threshold || fADCValuesLow2x2[i] >= fL0Threshold) {
 521         SetInput("PHOS_L0") ;
 522         break;
 523       }
 524     }
 525   }
 526
 527   //Set max nxn amplitude and select L1 triggers
 528   if(maxn[0] > fnxnMaxAmp  && fPatchSize > 0){
 529     fnxnMaxAmp  = maxn[0] ;
 530     fnxnSM      = iMod ;
 531     maxtimeRn   = maxn[3] ;
 532     GetCrystalPhiEtaIndexInModuleFromTRUIndex(mtrun,
 533                                               static_cast<Int_t>(maxn[1]),
 534                                               static_cast<Int_t>(maxn[2]),
 535                                               fnxnCrystalPhi,fnxnCrystalEta) ;
 536
 537     //Isolated patch?
 538     fIsnxnIsol =  IsPatchIsolated(1, amptrus, mtrun, iMod, maxn) ;
 539
 540     //Transform digit amplitude in Raw Samples
 541     fADCValuesHighnxn = new Int_t[nTimeBins];
 542     fADCValuesLownxn  = new Int_t[nTimeBins];
 543
 544     pulse->SetAmplitude(maxtimeRn);
 545     pulse->SetTZero(fnxnMaxAmp);
 546     pulse->MakeSamples();
 547     pulse->GetSamples(fADCValuesHighnxn, fADCValuesLownxn) ;
 548
 549     //Set Trigger Inputs, compare ADC time bins until threshold is attained
 550     //SetL1 Low
 551     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 552       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold  || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetLowPtThreshold){
 553         SetInput("PHOS_JetLPt_L1") ;
 554         break;
 555       }
 556     }
 557     //SetL1 High
 558     for(Int_t i = 0 ; i < nTimeBins ; i++){
 559       if(fADCValuesHighnxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold || fADCValuesLownxn[i] >= fL1JetHighPtThreshold){
 560         SetInput("PHOS_JetHPt_L1") ;
 561         break;
 562       }
 563     }
 564   }
 565 }
 566
 567 //____________________________________________________________________________
 568 void AliPHOSTrigger::Trigger()
 569 {
 570
 571   //Main Method to select triggers.
 572   AliRunLoader *rl = gAlice->GetRunLoader();
 573   //Getter
 574   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance( rl->GetFileName() ) ;
 575   //AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;
 576
 577   //Get Geometry
 578   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ;
 579
 580   //Define parameters
 581   Int_t nModules     = geom->GetNModules();
 582   fNCrystalsPhi = geom->GetNPhi()/fNTRUPhi ;// 64/4=16
 583   fNCrystalsZ   = geom->GetNZ()/fNTRUZ ;// 56/2=28
 584
 585   //Intialize data members each time the trigger is called in event loop
 586   f2x2MaxAmp = -1; f2x2CrystalPhi = -1;  f2x2CrystalEta = -1;
 587   fnxnMaxAmp = -1; fnxnCrystalPhi = -1;  fnxnCrystalEta = -1;
 588
 589   //Take the digits list if simulation
 590   if(fSimulation)
 591     fDigitsList = gime->Digits() ;
 592
 593   if(!fDigitsList)
 594     AliFatal("Digits not found !") ;
 595
 596   //Fill TRU Matrix
 597   TClonesArray * amptrus   = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 598   TClonesArray * timeRtrus = new TClonesArray("TMatrixD",1000);
 599   FillTRU(fDigitsList,geom,amptrus, timeRtrus) ;
 600
 601   //Do Crystal Sliding and select Trigger
 602   //Initialize varible that will contain maximum amplitudes and
 603   //its corresponding cell position in eta and phi, and time.
 604   TMatrixD  * ampmax2 = new TMatrixD(4,fNTRU) ;
 605   TMatrixD  * ampmaxn = new TMatrixD(4,fNTRU) ;
 606
 607   for(Int_t imod = 0 ; imod < nModules ; imod++) {
 608
 609     //Do 2x2 and nxn sums, select maximums.
 610     MakeSlidingCell(amptrus, timeRtrus, imod, ampmax2, ampmaxn);
 611     //Set the trigger
 612     SetTriggers(amptrus,imod,ampmax2,ampmaxn) ;
 613   }
 614
 615   //Print();
 616
 617 }