PWG/CaloTrackCorrBase/AliCaloTrackReader.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 //_________________________________________________________________________
  17 // Base class for reading data: MonteCarlo, ESD or AOD, of PHOS EMCAL and
  18 // Central Barrel Tracking detectors (CTS).
  19 // Not all MC particles/tracks/clusters are kept, some kinematical/fiducial restrictions are done.
  20 // Mother class of : AliCaloTrackESDReader: Fills ESD data in 3 TObjArrays (PHOS, EMCAL, CTS)
  21 //                 : AliCaloTrackMCReader : Fills Kinematics data in 3 TObjArrays (PHOS, EMCAL, CTS)
  22 //                 : AliCaloTrackAODReader: Fills AOD data in 3 TObjArrays (PHOS, EMCAL, CTS)
  23 //-- Author: Gustavo Conesa (LNF-INFN)
  24 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26
  27 // --- ROOT system ---
  28 #include <TFile.h>
  29 #include <TGeoManager.h>
  30
  31 // ---- ANALYSIS system ----
  32 #include "AliMCEvent.h"
  33 #include "AliAODMCHeader.h"
  34 #include "AliGenPythiaEventHeader.h"
  35 #include "AliESDEvent.h"
  36 #include "AliAODEvent.h"
  37 #include "AliVTrack.h"
  38 #include "AliVParticle.h"
  39 #include "AliMixedEvent.h"
  40 #include "AliESDtrack.h"
  41 #include "AliESDtrackCuts.h"
  42 #include "AliTriggerAnalysis.h"
  43 #include "AliESDVZERO.h"
  44 #include "AliVCaloCells.h"
  45 #include "AliAnalysisManager.h"
  46 #include "AliInputEventHandler.h"
  47
  48 // ---- Detectors ----
  49 #include "AliPHOSGeoUtils.h"
  50 #include "AliEMCALGeometry.h"
  51 #include "AliEMCALRecoUtils.h"
  52
  53 // ---- CaloTrackCorr ---
  54 #include "AliCalorimeterUtils.h"
  55 #include "AliCaloTrackReader.h"
  56
  57 ClassImp(AliCaloTrackReader)
  58
  59
  60 //________________________________________
  61 AliCaloTrackReader::AliCaloTrackReader() :
  62 TObject(),                   fEventNumber(-1), //fCurrentFileName(""),
  63 fDataType(0),                fDebug(0),
  64 fFiducialCut(0x0),           fCheckFidCut(kFALSE),
  65 fComparePtHardAndJetPt(0),   fPtHardAndJetPtFactor(0),
  66 fComparePtHardAndClusterPt(0),fPtHardAndClusterPtFactor(0),
  67 fCTSPtMin(0),                fEMCALPtMin(0),                  fPHOSPtMin(0),
  68 fCTSPtMax(0),                fEMCALPtMax(0),                  fPHOSPtMax(0),
  69 fEMCALTimeCutMin(-10000),    fEMCALTimeCutMax(10000),
  70 fAODBranchList(0x0),
  71 fCTSTracks(0x0),             fEMCALClusters(0x0),             fPHOSClusters(0x0),
  72 fEMCALCells(0x0),            fPHOSCells(0x0),
  73 fInputEvent(0x0),            fOutputEvent(0x0),fMC(0x0),
  74 fFillCTS(0),                 fFillEMCAL(0),                   fFillPHOS(0),
  75 fFillEMCALCells(0),          fFillPHOSCells(0),
  76 fRecalculateClusters(kFALSE),fSelectEmbeddedClusters(kFALSE),
  77 fTrackStatus(0),             fTrackFilterMask(0),
  78 fESDtrackCuts(0),            fConstrainTrack(kFALSE),         fSelectHybridTracks(0),
  79 fTrackMult(0),               fTrackMultEtaCut(0.8),
  80 fReadStack(kFALSE),          fReadAODMCParticles(kFALSE),
  81 fDeltaAODFileName(""),       fFiredTriggerClassName(""),
  82 fEventTriggerMask(0),        fMixEventTriggerMask(0),         fEventTriggerAtSE(0),
  83 fAnaLED(kFALSE),
  84 fTaskName(""),               fCaloUtils(0x0),
  85 fMixedEvent(NULL),           fNMixedEvent(0),                 fVertex(NULL),
  86 fListMixedTracksEvents(),    fListMixedCaloEvents(),
  87 fLastMixedTracksEvent(-1),   fLastMixedCaloEvent(-1),
  88 fWriteOutputDeltaAOD(kFALSE),fOldAOD(kFALSE),                 fCaloFilterPatch(kFALSE),
  89 fEMCALClustersListName(""),  fZvtxCut(0.),
  90 fAcceptFastCluster(kFALSE),  fRemoveLEDEvents(kTRUE),
  91 fDoEventSelection(kFALSE),   fDoV0ANDEventSelection(kFALSE),  fUseEventsWithPrimaryVertex(kFALSE),
  92 fTriggerAnalysis (0x0),
  93 fCentralityClass(""),        fCentralityOpt(0),
  94 fEventPlaneMethod(""),       fImportGeometryFromFile(kFALSE), fImportGeometryFilePath("")
  95 {
  96   //Ctor
  97
  98   //Initialize parameters
  99   InitParameters();
 100 }
 101
 102 //_______________________________________
 103 AliCaloTrackReader::~AliCaloTrackReader()
 104 {
 105   //Dtor
 106
 107   delete fFiducialCut ;
 108
 109   if(fAODBranchList)
 110   {
 111     fAODBranchList->Delete();
 112     delete fAODBranchList ;
 113   }
 114
 115   if(fCTSTracks)
 116   {
 117     if(fDataType!=kMC)fCTSTracks->Clear() ;
 118     else              fCTSTracks->Delete() ;
 119     delete fCTSTracks ;
 120   }
 121
 122   if(fEMCALClusters)
 123   {
 124     if(fDataType!=kMC)fEMCALClusters->Clear("C") ;
 125     else              fEMCALClusters->Delete() ;
 126     delete fEMCALClusters ;
 127   }
 128
 129   if(fPHOSClusters)
 130   {
 131     if(fDataType!=kMC)fPHOSClusters->Clear("C") ;
 132     else              fPHOSClusters->Delete() ;
 133     delete fPHOSClusters ;
 134   }
 135
 136   if(fVertex)
 137   {
 138     for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 139     {
 140       delete [] fVertex[i] ;
 141
 142     }
 143     delete [] fVertex ;
 144         }
 145
 146   delete fESDtrackCuts;
 147   delete fTriggerAnalysis;
 148
 149   //  Pointers not owned, done by the analysis frame
 150   //  if(fInputEvent)  delete fInputEvent ;
 151   //  if(fOutputEvent) delete fOutputEvent ;
 152   //  if(fMC)          delete fMC ;
 153   //  Pointer not owned, deleted by maker
 154   //  if (fCaloUtils) delete fCaloUtils ;
 155
 156 }
 157
 158 //________________________________________________
 159 Bool_t AliCaloTrackReader::ComparePtHardAndJetPt()
 160 {
 161   // Check the event, if the requested ptHard is much smaller than the jet pT, then there is a problem.
 162   // Only for PYTHIA.
 163
 164   //printf("AliCaloTrackReader::ComparePtHardAndJetPt() - GenHeaderName : %s\n",GetGenEventHeader()->ClassName());
 165
 166   if(!strcmp(GetGenEventHeader()->ClassName(), "AliGenPythiaEventHeader"))
 167   {
 168     TParticle * jet =  0;
 169     AliGenPythiaEventHeader* pygeh= (AliGenPythiaEventHeader*) GetGenEventHeader();
 170     Int_t nTriggerJets =  pygeh->NTriggerJets();
 171     Float_t ptHard = pygeh->GetPtHard();
 172
 173     if(fDebug > 1)
 174       printf("AliCaloTrackReader::ComparePtHardAndJetPt() - Njets: %d, pT Hard %f\n",nTriggerJets, ptHard);
 175
 176     Float_t tmpjet[]={0,0,0,0};
 177     for(Int_t ijet = 0; ijet< nTriggerJets; ijet++)
 178     {
 179       pygeh->TriggerJet(ijet, tmpjet);
 180       jet = new TParticle(94, 21, -1, -1, -1, -1, tmpjet[0],tmpjet[1],tmpjet[2],tmpjet[3], 0,0,0,0);
 181
 182       if(fDebug > 1)
 183         printf("AliCaloTrackReader::ComparePtHardAndJetPt() - jet %d; pycell jet pT %f\n",ijet, jet->Pt());
 184
 185       //Compare jet pT and pt Hard
 186       if(jet->Pt() > fPtHardAndJetPtFactor * ptHard)
 187       {
 188         printf("AliCaloTrackReader::ComparePtHardAndJetPt() - Reject jet event with : pT Hard %2.2f, pycell jet pT %2.2f, rejection factor %1.1f\n",
 189                 ptHard, jet->Pt(), fPtHardAndJetPtFactor);
 190         return kFALSE;
 191       }
 192     }
 193
 194     if(jet) delete jet;
 195   }
 196
 197   return kTRUE ;
 198
 199 }
 200
 201 //____________________________________________________________________
 202 Bool_t AliCaloTrackReader::ComparePtHardAndClusterPt()
 203 {
 204   // Check the event, if the requested ptHard is smaller than the calorimeter cluster E, then there is a problem.
 205   // Only for PYTHIA.
 206
 207   if(!strcmp(GetGenEventHeader()->ClassName(), "AliGenPythiaEventHeader"))
 208   {
 209     AliGenPythiaEventHeader* pygeh= (AliGenPythiaEventHeader*) GetGenEventHeader();
 210     Float_t ptHard = pygeh->GetPtHard();
 211
 212     Int_t nclusters = fInputEvent->GetNumberOfCaloClusters();
 213     for (Int_t iclus =  0; iclus <  nclusters; iclus++)
 214     {
 215       AliVCluster * clus = fInputEvent->GetCaloCluster(iclus) ;
 216       Float_t ecluster = clus->E();
 217
 218       if(ecluster > fPtHardAndClusterPtFactor*ptHard)
 219       {
 220         printf("AliCaloTrackReader::ComparePtHardAndClusterPt() - Reject : ecluster %2.2f, calo %d, factor %2.2f, ptHard %f\n",ecluster,clus->GetType(),fPtHardAndClusterPtFactor,ptHard);
 221
 222         return kFALSE;
 223       }
 224     }
 225
 226   }
 227
 228   return kTRUE ;
 229
 230 }
 231
 232 //____________________________________________
 233 AliStack* AliCaloTrackReader::GetStack() const
 234 {
 235   //Return pointer to stack
 236   if(fMC)
 237     return fMC->Stack();
 238   else
 239   {
 240     if(fDebug > 1) printf("AliCaloTrackReader::GetStack() - Stack is not available\n");
 241     return 0x0 ;
 242   }
 243 }
 244
 245 //__________________________________________________
 246 TString AliCaloTrackReader::GetFiredTriggerClasses()
 247 {
 248   // List of triggered classes in a TString
 249
 250   AliESDEvent* esdevent = dynamic_cast<AliESDEvent*> (GetInputEvent());
 251   AliAODEvent* aodevent = dynamic_cast<AliAODEvent*> (GetInputEvent());
 252
 253   if     (esdevent) return esdevent->GetFiredTriggerClasses();
 254   else if(aodevent) return aodevent->GetFiredTriggerClasses();
 255   else              return ""; // Mixed Event, MC event, does not have this trigger info
 256
 257 }
 258
 259 //______________________________________________
 260 AliHeader* AliCaloTrackReader::GetHeader() const
 261 {
 262   //Return pointer to header
 263   if(fMC)
 264   {
 265     return fMC->Header();
 266   }
 267   else
 268   {
 269     printf("AliCaloTrackReader::Header is not available\n");
 270     return 0x0 ;
 271   }
 272 }
 273
 274 //______________________________________________________________
 275 AliGenEventHeader* AliCaloTrackReader::GetGenEventHeader() const
 276 {
 277   //Return pointer to Generated event header
 278   if(fMC)
 279   {
 280     return fMC->GenEventHeader();
 281   }
 282   else
 283   {
 284     if(GetAODMCHeader())
 285     {
 286       //printf("AliCaloTrackReader::GetGenEventHeader() - N headers %d\n",GetAODMCHeader()->GetNCocktailHeaders());
 287       if( GetAODMCHeader()->GetNCocktailHeaders() > 0)
 288         return GetAODMCHeader()->GetCocktailHeader(0) ;
 289       else
 290         return 0x0;
 291     }
 292     else
 293     {
 294       return 0;
 295       printf("AliCaloTrackReader::GetGenEventHeader() - MC header not available!n");
 296     }
 297   }
 298 }
 299
 300 //____________________________________________________________________
 301 TClonesArray* AliCaloTrackReader::GetAODMCParticles(Int_t input) const
 302 {
 303   //Return list of particles in AOD. Do it for the corresponding input event.
 304
 305   TClonesArray * rv = NULL ;
 306   if(fDataType == kAOD)
 307   {
 308     if(input == 0)
 309     {
 310       //Normal input AOD
 311       AliAODEvent * evt = dynamic_cast<AliAODEvent*> (fInputEvent) ;
 312       if(evt)
 313         rv = (TClonesArray*)evt->FindListObject("mcparticles");
 314       else
 315         printf("AliCaloTrackReader::GetAODMCParticles() - wrong AOD input index? %d, or non existing tree? \n",input);
 316     }
 317
 318   }
 319   else
 320   {
 321     printf("AliCaloTrackReader::GetAODMCParticles() - Input are not AODs\n");
 322   }
 323
 324   return rv ;
 325 }
 326
 327 //________________________________________________________
 328 AliAODMCHeader* AliCaloTrackReader::GetAODMCHeader() const
 329 {
 330   //Return MC header in AOD. Do it for the corresponding input event.
 331
 332   AliAODMCHeader *mch = NULL;
 333
 334   if(fDataType == kAOD)
 335   {
 336     AliAODEvent * aod = dynamic_cast<AliAODEvent*> (fInputEvent);
 337     if(aod) mch = dynamic_cast<AliAODMCHeader*>(aod->FindListObject("mcHeader"));
 338   }
 339   else
 340   {
 341     printf("AliCaloTrackReader::GetAODMCHeader() - Input are not AODs\n");
 342   }
 343
 344   return mch;
 345 }
 346
 347 //_____________________________
 348 void AliCaloTrackReader::Init()
 349 {
 350   //Init reader. Method to be called in AliAnaPartCorrMaker
 351
 352   //printf(" AliCaloTrackReader::Init() %p \n",gGeoManager);
 353
 354   if(fReadStack && fReadAODMCParticles)
 355   {
 356     printf("AliCaloTrackReader::Init() - Cannot access stack and mcparticles at the same time, change them \n");
 357     fReadStack          = kFALSE;
 358     fReadAODMCParticles = kFALSE;
 359   }
 360
 361   // Init geometry, I do not like much to do it like this ...
 362   if(fImportGeometryFromFile && !gGeoManager)
 363   {
 364     if(fImportGeometryFilePath=="") // If not specified, set a default location
 365     fImportGeometryFilePath = "$ALICE_ROOT/PWGGA/EMCALTasks/macros/geometry.root"; // "$ALICE_ROOT/EVE/alice-data/default_geo.root"
 366
 367     printf("AliCaloTrackReader::Init() - Import %s\n",fImportGeometryFilePath.Data());
 368     TGeoManager::Import(fImportGeometryFilePath) ; // default need file "geometry.root" in local dir!!!!
 369   }
 370
 371 }
 372
 373 //_______________________________________
 374 void AliCaloTrackReader::InitParameters()
 375 {
 376   //Initialize the parameters of the analysis.
 377   fDataType   = kESD ;
 378   fCTSPtMin   = 0.1 ;
 379   fEMCALPtMin = 0.1 ;
 380   fPHOSPtMin  = 0.1 ;
 381   fCTSPtMax   = 1000. ;
 382   fEMCALPtMax = 1000. ;
 383   fPHOSPtMax  = 1000. ;
 384
 385   //Do not filter the detectors input by default.
 386   fFillEMCAL      = kFALSE;
 387   fFillPHOS       = kFALSE;
 388   fFillCTS        = kFALSE;
 389   fFillEMCALCells = kFALSE;
 390   fFillPHOSCells  = kFALSE;
 391
 392   fReadStack             = kFALSE; // Check in the constructor of the other readers if it was set or in the configuration file
 393   fReadAODMCParticles    = kFALSE; // Check in the constructor of the other readers if it was set or in the configuration file
 394   fDeltaAODFileName      = "deltaAODPartCorr.root";
 395   fFiredTriggerClassName = "";
 396   fEventTriggerMask      = AliVEvent::kAny;
 397   fMixEventTriggerMask   = AliVEvent::kAnyINT;
 398   fEventTriggerAtSE      = kTRUE; // Use only events that pass event selection at SE base class
 399
 400   fAcceptFastCluster = kTRUE;
 401   fAnaLED            = kFALSE;
 402
 403   //We want tracks fitted in the detectors:
 404   //fTrackStatus=AliESDtrack::kTPCrefit;
 405   //fTrackStatus|=AliESDtrack::kITSrefit;
 406   fTrackStatus     = 0;
 407   fTrackFilterMask = 128; //For AODs, but what is the difference between fTrackStatus and fTrackFilterMask?
 408
 409   fESDtrackCuts = AliESDtrackCuts::GetStandardTPCOnlyTrackCuts(); //initialize with TPC only tracks
 410
 411   fConstrainTrack = kFALSE ; // constrain tracks to vertex
 412
 413   fV0ADC[0] = 0;   fV0ADC[1] = 0;
 414   fV0Mul[0] = 0;   fV0Mul[1] = 0;
 415
 416   fZvtxCut   = 10.;
 417
 418   fNMixedEvent = 1;
 419
 420   fPtHardAndJetPtFactor     = 7.;
 421   fPtHardAndClusterPtFactor = 1.;
 422
 423   //Centrality
 424   fCentralityClass  = "V0M";
 425   fCentralityOpt    = 10;
 426   fCentralityBin[0] = fCentralityBin[1]=-1;
 427
 428   fEventPlaneMethod = "V0";
 429
 430   // Allocate memory (not sure this is the right place)
 431   fCTSTracks       = new TObjArray();
 432   fEMCALClusters   = new TObjArray();
 433   fPHOSClusters    = new TObjArray();
 434   fTriggerAnalysis = new AliTriggerAnalysis;
 435   fAODBranchList   = new TList ;
 436
 437   fImportGeometryFromFile = kFALSE;
 438
 439 }
 440
 441 //________________________________________________________
 442 void AliCaloTrackReader::Print(const Option_t * opt) const
 443 {
 444
 445   //Print some relevant parameters set for the analysis
 446   if(! opt)
 447     return;
 448
 449   printf("***** Print: %s %s ******\n",    GetName(), GetTitle() ) ;
 450   printf("Task name      : %s\n",          fTaskName.Data()) ;
 451   printf("Data type      : %d\n",          fDataType) ;
 452   printf("CTS Min pT     : %2.1f GeV/c\n", fCTSPtMin) ;
 453   printf("EMCAL Min pT   : %2.1f GeV/c\n", fEMCALPtMin) ;
 454   printf("PHOS Min pT    : %2.1f GeV/c\n", fPHOSPtMin) ;
 455   printf("CTS Max pT     : %2.1f GeV/c\n", fCTSPtMax) ;
 456   printf("EMCAL Max pT   : %2.1f GeV/c\n", fEMCALPtMax) ;
 457   printf("PHOS Max pT    : %2.1f GeV/c\n", fPHOSPtMax) ;
 458   printf("EMCAL Time Cut: %3.1f < TOF  < %3.1f\n", fEMCALTimeCutMin, fEMCALTimeCutMax);
 459   printf("Use CTS         =     %d\n",     fFillCTS) ;
 460   printf("Use EMCAL       =     %d\n",     fFillEMCAL) ;
 461   printf("Use PHOS        =     %d\n",     fFillPHOS) ;
 462   printf("Use EMCAL Cells =     %d\n",     fFillEMCALCells) ;
 463   printf("Use PHOS  Cells =     %d\n",     fFillPHOSCells) ;
 464   printf("Track status    =     %d\n", (Int_t) fTrackStatus) ;
 465   printf("AODs Track filter mask  =  %d or hybrid %d\n", (Int_t) fTrackFilterMask,fSelectHybridTracks) ;
 466   printf("Track Mult Eta Cut =  %d\n", (Int_t) fTrackMultEtaCut) ;
 467   printf("Write delta AOD =     %d\n",     fWriteOutputDeltaAOD) ;
 468   printf("Recalculate Clusters = %d\n",    fRecalculateClusters) ;
 469
 470   printf("Use Triggers selected in SE base class %d; If not what trigger Mask? %d; Trigger max for mixed %d \n",
 471          fEventTriggerAtSE, fEventTriggerMask,fMixEventTriggerMask);
 472
 473   if(fComparePtHardAndClusterPt)
 474           printf("Compare jet pt and pt hard to accept event, factor = %2.2f",fPtHardAndJetPtFactor);
 475
 476   if(fComparePtHardAndClusterPt)
 477           printf("Compare cluster pt and pt hard to accept event, factor = %2.2f",fPtHardAndClusterPtFactor);
 478
 479   printf("Read Kine from, stack? %d, AOD ? %d \n", fReadStack, fReadAODMCParticles) ;
 480   printf("Delta AOD File Name =     %s\n", fDeltaAODFileName.Data()) ;
 481   printf("Centrality: Class %s, Option %d, Bin [%d,%d] \n", fCentralityClass.Data(),fCentralityOpt,fCentralityBin[0], fCentralityBin[1]) ;
 482
 483   printf("    \n") ;
 484
 485 }
 486
 487 //_________________________________________________________________________
 488 Bool_t AliCaloTrackReader::FillInputEvent(const Int_t iEntry,
 489                                           const char * /*currentFileName*/)
 490 {
 491   //Fill the event counter and input lists that are needed, called by the analysis maker.
 492
 493   fEventNumber = iEntry;
 494   //fCurrentFileName = TString(currentFileName);
 495   if(!fInputEvent)
 496   {
 497           if(fDebug >= 0) printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - Input event not available, skip event analysis\n");
 498           return kFALSE;
 499   }
 500
 501   //Select events only fired by a certain trigger configuration if it is provided
 502   Int_t eventType = 0;
 503   if(fInputEvent->GetHeader())
 504           eventType = ((AliVHeader*)fInputEvent->GetHeader())->GetEventType();
 505
 506   if (GetFiredTriggerClasses().Contains("FAST")  && !GetFiredTriggerClasses().Contains("ALL") && !fAcceptFastCluster)
 507   {
 508     if(fDebug > 0)  printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent - Do not count events from fast cluster, trigger name %s\n",fFiredTriggerClassName.Data());
 509     return kFALSE;
 510   }
 511
 512   //-------------------------------------------------------------------------------------
 513   // Reject event if large clusters with large energy
 514   // Use only for LHC11a data for the moment, and if input is clusterizer V1 or V1+unfolding
 515   // If clusterzer NxN or V2 it does not help
 516   //-------------------------------------------------------------------------------------
 517   Int_t run = fInputEvent->GetRunNumber();
 518   if( fRemoveLEDEvents && run > 146857  && run < 146861 )
 519   {
 520     //printf("Event %d\n",GetEventNumber());
 521
 522     // Count number of cells with energy larger than 0.1 in SM3, cut on this number
 523     Int_t ncellsSM3 = 0;
 524     for(Int_t icell = 0; icell < fInputEvent->GetEMCALCells()->GetNumberOfCells(); icell++)
 525     {
 526       Int_t absID = fInputEvent->GetEMCALCells()->GetCellNumber(icell);
 527       Int_t sm    = GetCaloUtils()->GetEMCALGeometry()->GetSuperModuleNumber(absID);
 528       if(fInputEvent->GetEMCALCells()->GetAmplitude(icell) > 0.1 && sm==3) ncellsSM3++;
 529     }
 530
 531     Int_t ncellcut = 21;
 532     if(fFiredTriggerClassName.Contains("EMC")) ncellcut = 35;
 533
 534     if(ncellsSM3 >= ncellcut)
 535     {
 536       if(fDebug > 0) printf(" AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - reject event with ncells in SM3 %d\n",ncellsSM3);
 537       return kFALSE;
 538     }
 539   }// Remove LED events
 540
 541   // Reject pure LED events?
 542   if( fFiredTriggerClassName  !="" && !fAnaLED)
 543   {
 544     //printf("Event type %d\n",eventType);
 545     if(eventType!=7)
 546       return kFALSE; //Only physics event, do not use for simulated events!!!
 547
 548     if(fDebug > 0)
 549       printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - FiredTriggerClass <%s>, selected class <%s>, compare name %d\n",
 550              GetFiredTriggerClasses().Data(),fFiredTriggerClassName.Data(), GetFiredTriggerClasses().Contains(fFiredTriggerClassName));
 551
 552     if( !GetFiredTriggerClasses().Contains(fFiredTriggerClassName) ) return kFALSE;
 553     else if(fDebug > 0) printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - Accepted triggered event\n");
 554   }
 555   else if(fAnaLED)
 556   {
 557     //    kStartOfRun =       1,    // START_OF_RUN
 558     //    kEndOfRun =         2,    // END_OF_RUN
 559     //    kStartOfRunFiles =  3,    // START_OF_RUN_FILES
 560     //    kEndOfRunFiles =    4,    // END_OF_RUN_FILES
 561     //    kStartOfBurst =     5,    // START_OF_BURST
 562     //    kEndOfBurst =       6,    // END_OF_BURST
 563     //    kPhysicsEvent =     7,    // PHYSICS_EVENT
 564     //    kCalibrationEvent = 8,    // CALIBRATION_EVENT
 565     //    kFormatError =      9,    // EVENT_FORMAT_ERROR
 566     //    kStartOfData =      10,   // START_OF_DATA
 567     //    kEndOfData =        11,   // END_OF_DATA
 568     //    kSystemSoftwareTriggerEvent   = 12, // SYSTEM_SOFTWARE_TRIGGER_EVENT
 569     //    kDetectorSoftwareTriggerEvent = 13  // DETECTOR_SOFTWARE_TRIGGER_EVENT
 570
 571           if(eventType!=7 && fDebug > 1 )printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - DO LED, Event Type <%d>, 8 Calibration \n",  eventType);
 572           if(eventType!=8)return kFALSE;
 573   }
 574
 575   //In case of analysis of events with jets, skip those with jet pt > 5 pt hard
 576   if(fComparePtHardAndJetPt)
 577   {
 578     if(!ComparePtHardAndJetPt()) return kFALSE ;
 579   }
 580
 581   if(fComparePtHardAndClusterPt)
 582   {
 583     if(!ComparePtHardAndClusterPt()) return kFALSE ;
 584   }
 585
 586   //Fill Vertex array
 587   FillVertexArray();
 588   //Reject events with Z vertex too large, only for SE analysis, if not, cut on the analysis code
 589   if(!GetMixedEvent() && TMath::Abs(fVertex[0][2]) > fZvtxCut) return kFALSE;
 590
 591   //------------------------------------------------------
 592   //Event rejection depending on vertex, pileup, v0and
 593   //------------------------------------------------------
 594
 595   if(fUseEventsWithPrimaryVertex)
 596   {
 597     if( !CheckForPrimaryVertex() )              return kFALSE;
 598     if( TMath::Abs(fVertex[0][0] ) < 1.e-6 &&
 599         TMath::Abs(fVertex[0][1] ) < 1.e-6 &&
 600         TMath::Abs(fVertex[0][2] ) < 1.e-6    ) return kFALSE;
 601   }
 602
 603   if(fDoEventSelection)
 604   {
 605     if(!fCaloFilterPatch)
 606     {
 607       //Do not analyze events with pileup
 608       Bool_t bPileup = fInputEvent->IsPileupFromSPD(3, 0.8, 3., 2., 5.); //Default values, if not it does not compile
 609       //Bool_t bPileup = event->IsPileupFromSPD();
 610       if(bPileup) return kFALSE;
 611
 612       if(fDoV0ANDEventSelection)
 613       {
 614         Bool_t bV0AND = kTRUE;
 615         AliESDEvent* esd = dynamic_cast<AliESDEvent*> (fInputEvent);
 616         if(esd)
 617           bV0AND = fTriggerAnalysis->IsOfflineTriggerFired(esd, AliTriggerAnalysis::kV0AND);
 618         //else bV0AND = //FIXME FOR AODs
 619         if(!bV0AND) return kFALSE;
 620       }
 621     }//CaloFilter patch
 622     else
 623     {
 624       if(fInputEvent->GetNumberOfCaloClusters() > 0)
 625       {
 626         AliVCluster * calo = fInputEvent->GetCaloCluster(0);
 627         if(calo->GetNLabels() == 4)
 628         {
 629           Int_t * selection = calo->GetLabels();
 630           Bool_t bPileup = selection[0];
 631           if(bPileup) return kFALSE;
 632
 633           Bool_t bGoodV = selection[1];
 634           if(fUseEventsWithPrimaryVertex && !bGoodV) return kFALSE;
 635
 636           if(fDoV0ANDEventSelection)
 637           {
 638             Bool_t bV0AND = selection[2];
 639             if(!bV0AND) return kFALSE;
 640           }
 641
 642           fTrackMult = selection[3];
 643           if(fTrackMult == 0) return kFALSE;
 644         }
 645         else
 646         {
 647           //First filtered AODs, track multiplicity stored there.
 648           fTrackMult = (Int_t) ((AliAODHeader*)fInputEvent->GetHeader())->GetCentrality();
 649           if(fTrackMult == 0) return kFALSE;
 650         }
 651       }//at least one cluster
 652       else
 653       {
 654         //printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - No clusters in event\n");
 655         //Remove events with  vertex (0,0,0), bad vertex reconstruction
 656         if(fUseEventsWithPrimaryVertex && TMath::Abs(fVertex[0][0]) < 1.e-6 && TMath::Abs(fVertex[0][1]) < 1.e-6 && TMath::Abs(fVertex[0][2]) < 1.e-6) return kFALSE;
 657
 658         //First filtered AODs, track multiplicity stored there.
 659         fTrackMult = (Int_t) ((AliAODHeader*)fInputEvent->GetHeader())->GetCentrality();
 660         if(fTrackMult == 0) return kFALSE;
 661       }// no cluster
 662     }// CaloFileter patch
 663   }// Event selection
 664   //------------------------------------------------------
 665
 666   //Check if there is a centrality value, PbPb analysis, and if a centrality bin selection is requested
 667   //If we need a centrality bin, we select only those events in the corresponding bin.
 668   if(GetCentrality() && fCentralityBin[0]>=0 && fCentralityBin[1]>=0 && fCentralityOpt==100)
 669   {
 670     Int_t cen = GetEventCentrality();
 671     if(cen > fCentralityBin[1] || cen < fCentralityBin[0]) return kFALSE; //reject events out of bin.
 672   }
 673
 674   //Fill the arrays with cluster/tracks/cells data
 675
 676   if(fFillEMCALCells)
 677     FillInputEMCALCells();
 678
 679   if(fFillPHOSCells)
 680     FillInputPHOSCells();
 681
 682   FillInputVZERO();
 683
 684   if(fEventTriggerAtSE)
 685   {
 686     if(fFillCTS)
 687     {
 688       FillInputCTS();
 689       //Accept events with at least one track
 690       if(fTrackMult == 0 && fDoEventSelection) return kFALSE;
 691     }
 692     if(fFillEMCAL)
 693       FillInputEMCAL();
 694     if(fFillPHOS)
 695       FillInputPHOS();
 696   }
 697   else
 698   {
 699     // In case of mixing analysis, all triggers accepted, but trigger particles selected
 700     // only for the specific trigered events selected here. Mixing done only for MB events,
 701     // tracks array filled also for those events and not the others.
 702
 703     AliAnalysisManager *manager = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 704     AliInputEventHandler *inputHandler = dynamic_cast<AliInputEventHandler*>(manager->GetInputEventHandler());
 705
 706     if(!inputHandler) return kFALSE ;  // to content coverity
 707
 708     UInt_t isTrigger = inputHandler->IsEventSelected() & fEventTriggerMask;
 709     UInt_t isMB      = inputHandler->IsEventSelected() & fMixEventTriggerMask;
 710
 711     if(fFillCTS && (isMB || isTrigger))
 712     {
 713       FillInputCTS();
 714       //Accept events with at least one track
 715       if(fTrackMult == 0 && fDoEventSelection) return kFALSE;
 716     }
 717
 718     if(isTrigger)
 719     {
 720       if(fFillEMCAL)
 721         FillInputEMCAL();
 722       if(fFillPHOS)
 723         FillInputPHOS();
 724     }
 725   }
 726
 727   return kTRUE ;
 728 }
 729
 730 //___________________________________
 731 void AliCaloTrackReader::ResetLists()
 732 {
 733   //  Reset lists, called by the analysis maker
 734
 735   if(fCTSTracks)       fCTSTracks     -> Clear();
 736   if(fEMCALClusters)   fEMCALClusters -> Clear("C");
 737   if(fPHOSClusters)    fPHOSClusters  -> Clear("C");
 738
 739   fV0ADC[0] = 0;   fV0ADC[1] = 0;
 740   fV0Mul[0] = 0;   fV0Mul[1] = 0;
 741
 742 }
 743
 744 //____________________________________________________________
 745 void AliCaloTrackReader::SetInputEvent(AliVEvent* const input)
 746 {
 747   fInputEvent  = input;
 748   fMixedEvent = dynamic_cast<AliMixedEvent*>(GetInputEvent()) ;
 749   if (fMixedEvent)
 750     fNMixedEvent = fMixedEvent->GetNumberOfEvents() ;
 751
 752   //Delete previous vertex
 753   if(fVertex)
 754   {
 755     for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 756     {
 757       delete [] fVertex[i] ;
 758     }
 759     delete [] fVertex ;
 760   }
 761
 762   fVertex = new Double_t*[fNMixedEvent] ;
 763   for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 764   {
 765     fVertex[i] = new Double_t[3] ;
 766     fVertex[i][0] = 0.0 ;
 767     fVertex[i][1] = 0.0 ;
 768     fVertex[i][2] = 0.0 ;
 769   }
 770 }
 771
 772 //__________________________________________________
 773 Int_t AliCaloTrackReader::GetEventCentrality() const
 774 {
 775   //Return current event centrality
 776
 777   if(GetCentrality())
 778   {
 779     if     (fCentralityOpt==100) return (Int_t) GetCentrality()->GetCentralityPercentile(fCentralityClass); // 100 bins max
 780     else if(fCentralityOpt==10)  return GetCentrality()->GetCentralityClass10(fCentralityClass);// 10 bins max
 781     else if(fCentralityOpt==20)  return GetCentrality()->GetCentralityClass5(fCentralityClass); // 20 bins max
 782     else
 783     {
 784       printf("AliCaloTrackReader::GetEventCentrality() - Unknown centrality option %d, use 10, 20 or 100\n",fCentralityOpt);
 785       return -1;
 786     }
 787   }
 788   else return -1;
 789
 790 }
 791
 792 //_____________________________________________________
 793 Double_t AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() const
 794 {
 795   //Return current event centrality
 796
 797   if(GetEventPlane())
 798   {
 799     Float_t ep =  GetEventPlane()->GetEventplane(GetEventPlaneMethod(), GetInputEvent());
 800
 801     if(GetEventPlaneMethod()=="Q" && (ep < 0 || ep > TMath::Pi()))
 802     {
 803       if(fDebug > 0 ) printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() -  Bad EP for <Q> method : %f\n",ep);
 804       return -1000;
 805     }
 806     else if(GetEventPlaneMethod().Contains("V0")  )
 807     {
 808       if((ep > TMath::Pi()/2 || ep < -TMath::Pi()/2))
 809       {
 810         if(fDebug > 0 ) printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() -  Bad EP for <%s> method : %f\n",GetEventPlaneMethod().Data(), ep);
 811         return -1000;
 812       }
 813
 814       ep+=TMath::Pi()/2; // put same range as for <Q> method
 815
 816     }
 817
 818     //printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() = %f\n",ep);
 819     if(fDebug > 0 )
 820     {
 821       if     (ep > TMath::Pi()) printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() - Too large angle = %f\n",ep);
 822       else if(ep < 0          ) printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() - Negative angle = %f\n" ,ep);
 823     }
 824
 825     return ep;
 826   }
 827   else
 828   {
 829     if(fDataType!=kMC && fDebug > 0) printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() -  No EP pointer\n");
 830     return -1000;
 831   }
 832
 833 }
 834
 835 //__________________________________________________________
 836 void AliCaloTrackReader::GetVertex(Double_t vertex[3]) const
 837 {
 838   //Return vertex position to be used for single event analysis
 839   vertex[0]=fVertex[0][0];
 840   vertex[1]=fVertex[0][1];
 841   vertex[2]=fVertex[0][2];
 842 }
 843
 844 //____________________________________________________________
 845 void AliCaloTrackReader::GetVertex(Double_t vertex[3],
 846                                    const Int_t evtIndex) const
 847 {
 848   //Return vertex position for mixed event, recover the vertex in a particular event.
 849
 850   vertex[0]=fVertex[evtIndex][0];  vertex[1]=fVertex[evtIndex][1];  vertex[2]=fVertex[evtIndex][2];
 851
 852 }
 853
 854 //________________________________________
 855 void AliCaloTrackReader::FillVertexArray()
 856 {
 857
 858   //Fill data member with vertex
 859   //In case of Mixed event, multiple vertices
 860
 861   //Delete previous vertex
 862   if(fVertex)
 863   {
 864     for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 865     {
 866       delete [] fVertex[i] ;
 867     }
 868     delete [] fVertex ;
 869   }
 870
 871   fVertex = new Double_t*[fNMixedEvent] ;
 872   for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 873   {
 874     fVertex[i] = new Double_t[3] ;
 875     fVertex[i][0] = 0.0 ;
 876     fVertex[i][1] = 0.0 ;
 877     fVertex[i][2] = 0.0 ;
 878   }
 879
 880   if (!fMixedEvent)
 881   { //Single event analysis
 882     if(fDataType!=kMC)
 883     {
 884
 885       if(fInputEvent->GetPrimaryVertex())
 886       {
 887         fInputEvent->GetPrimaryVertex()->GetXYZ(fVertex[0]);
 888       }
 889       else
 890       {
 891         printf("AliCaloTrackReader::FillVertexArray() - NULL primary vertex\n");
 892         fVertex[0][0]=0.;   fVertex[0][1]=0.;   fVertex[0][2]=0.;
 893       }//Primary vertex pointer do not exist
 894
 895     } else
 896     {//MC read event
 897       fVertex[0][0]=0.;   fVertex[0][1]=0.;   fVertex[0][2]=0.;
 898     }
 899
 900     if(fDebug > 1)
 901       printf("AliCaloTrackReader::FillVertexArray() - Single Event Vertex : %f,%f,%f\n",fVertex[0][0],fVertex[0][1],fVertex[0][2]);
 902
 903   } else
 904   { // MultiEvent analysis
 905     for (Int_t iev = 0; iev < fNMixedEvent; iev++)
 906     {
 907       if (fMixedEvent->GetVertexOfEvent(iev))
 908         fMixedEvent->GetVertexOfEvent(iev)->GetXYZ(fVertex[iev]);
 909       else
 910       { // no vertex found !!!!
 911         AliWarning("No vertex found");
 912       }
 913
 914       if(fDebug > 1)
 915         printf("AliCaloTrackReader::FillVertexArray() - Multi Event %d Vertex : %f,%f,%f\n",iev,fVertex[iev][0],fVertex[iev][1],fVertex[iev][2]);
 916
 917     }
 918   }
 919
 920 }
 921
 922 //_____________________________________
 923 void AliCaloTrackReader::FillInputCTS()
 924 {
 925   //Return array with Central Tracking System (CTS) tracks
 926
 927   if(fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS()\n");
 928
 929   Double_t pTrack[3] = {0,0,0};
 930
 931   Int_t nTracks = fInputEvent->GetNumberOfTracks() ;
 932   fTrackMult    = 0;
 933   Int_t nstatus = 0;
 934
 935   for (Int_t itrack =  0; itrack <  nTracks; itrack++)
 936   {////////////// track loop
 937     AliVTrack * track = (AliVTrack*)fInputEvent->GetTrack(itrack) ; // retrieve track from esd
 938
 939     //Select tracks under certain conditions, TPCrefit, ITSrefit ... check the set bits
 940     if (fTrackStatus && !((track->GetStatus() & fTrackStatus) == fTrackStatus))
 941       continue ;
 942
 943     nstatus++;
 944
 945     if     (fDataType==kESD)
 946     {
 947       AliESDtrack* esdTrack = dynamic_cast<AliESDtrack*> (track);
 948
 949       if(esdTrack && fESDtrackCuts->AcceptTrack(esdTrack))
 950       {
 951         track->GetPxPyPz(pTrack) ;
 952
 953         if(fConstrainTrack)
 954         {
 955           if(esdTrack->GetConstrainedParam())
 956           {
 957             const AliExternalTrackParam* constrainParam = esdTrack->GetConstrainedParam();
 958             esdTrack->Set(constrainParam->GetX(),constrainParam->GetAlpha(),constrainParam->GetParameter(),constrainParam->GetCovariance());
 959             esdTrack->GetConstrainedPxPyPz(pTrack);
 960           }
 961           else continue;
 962
 963         } // use constrained tracks
 964
 965       }
 966       else continue;
 967
 968     } // ESD
 969     else if(fDataType==kAOD)
 970     {
 971       AliAODTrack *aodtrack = dynamic_cast <AliAODTrack*>(track);
 972
 973       if(aodtrack)
 974       {
 975        if(fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS():AOD track type: %d (primary %d), hybrid? %d \n",
 976                               aodtrack->GetType(),AliAODTrack::kPrimary,
 977                               aodtrack->IsHybridGlobalConstrainedGlobal());
 978
 979
 980         if (fSelectHybridTracks)
 981         {
 982           if (!aodtrack->IsHybridGlobalConstrainedGlobal())       continue ;
 983         }
 984         else
 985         {
 986           if ( aodtrack->TestFilterBit(fTrackFilterMask)==kFALSE) continue ;
 987         }
 988
 989         if (aodtrack->GetType()!= AliAODTrack::kPrimary)          continue ;
 990
 991         if (fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS(): \t accepted track! \n");
 992
 993         track->GetPxPyPz(pTrack) ;
 994
 995       } // aod track exists
 996       else continue ;
 997
 998     } // AOD
 999
1000     //Count the tracks in eta < 0.9
1001     //printf("Eta %f cut  %f\n",TMath::Abs(track->Eta()),fTrackMultEtaCut);
1002     if(TMath::Abs(track->Eta())< fTrackMultEtaCut) fTrackMult++;
1003
1004     TLorentzVector momentum(pTrack[0],pTrack[1],pTrack[2],0);
1005
1006     if(fCTSPtMin < momentum.Pt() && fCTSPtMax > momentum.Pt())
1007     {
1008       if(fCheckFidCut && !fFiducialCut->IsInFiducialCut(momentum,"CTS"))
1009         continue;
1010
1011       if(fDebug > 2 && momentum.Pt() > 0.1)
1012         printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS() - Selected tracks E %3.2f, pt %3.2f, phi %3.2f, eta %3.2f\n",
1013                momentum.E(),momentum.Pt(),momentum.Phi()*TMath::RadToDeg(),momentum.Eta());
1014
1015       if (fMixedEvent)
1016       {
1017         track->SetID(itrack);
1018       }
1019
1020       fCTSTracks->Add(track);
1021
1022     }//Pt and Fiducial cut passed.
1023   }// track loop
1024
1025   if(fDebug > 1)
1026     printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS()   - aod entries %d, input tracks %d, pass status %d, multipliticy %d\n", fCTSTracks->GetEntriesFast(), nTracks, nstatus, fTrackMult);//fCTSTracksNormalInputEntries);
1027
1028 }
1029
1030 //__________________________________________________________________
1031 void AliCaloTrackReader::FillInputEMCALAlgorithm(AliVCluster * clus,
1032                                                  const Int_t iclus)
1033 {
1034   //Fill the EMCAL data in the array, do it
1035
1036   Int_t vindex = 0 ;
1037   if (fMixedEvent)
1038     vindex = fMixedEvent->EventIndexForCaloCluster(iclus);
1039
1040   //Reject clusters with bad channels, close to borders and exotic;
1041   if(!GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->IsGoodCluster(clus,GetCaloUtils()->GetEMCALGeometry(),GetEMCALCells(),fInputEvent->GetBunchCrossNumber())) return;
1042
1043   //Mask all cells in collumns facing ALICE thick material if requested
1044   if(GetCaloUtils()->GetNMaskCellColumns())
1045   {
1046     Int_t absId   = -1;
1047     Int_t iSupMod = -1;
1048     Int_t iphi    = -1;
1049     Int_t ieta    = -1;
1050     Bool_t shared = kFALSE;
1051     GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->GetMaxEnergyCell(GetCaloUtils()->GetEMCALGeometry(), GetEMCALCells(),clus,absId,iSupMod,ieta,iphi,shared);
1052     if(GetCaloUtils()->MaskFrameCluster(iSupMod, ieta)) return;
1053   }
1054
1055   if(fSelectEmbeddedClusters)
1056   {
1057     if(clus->GetNLabels()==0 || clus->GetLabel() < 0) return;
1058     //else printf("Embedded cluster,  %d, n label %d label %d  \n",iclus,clus->GetNLabels(),clus->GetLabel());
1059   }
1060
1061   //Float_t pos[3];
1062   //clus->GetPosition(pos);
1063   //printf("Before Corrections: e %f, x %f, y %f, z %f\n",clus->E(),pos[0],pos[1],pos[2]);
1064
1065   if(fRecalculateClusters)
1066   {
1067     //Recalibrate the cluster energy
1068     if(GetCaloUtils()->IsRecalibrationOn())
1069     {
1070       Float_t energy = GetCaloUtils()->RecalibrateClusterEnergy(clus, GetEMCALCells());
1071
1072       clus->SetE(energy);
1073       //printf("Recalibrated Energy %f\n",clus->E());
1074
1075       GetCaloUtils()->RecalculateClusterShowerShapeParameters(GetEMCALCells(),clus);
1076       GetCaloUtils()->RecalculateClusterPID(clus);
1077
1078     } // recalculate E
1079
1080     //Recalculate distance to bad channels, if new list of bad channels provided
1081     GetCaloUtils()->RecalculateClusterDistanceToBadChannel(GetEMCALCells(),clus);
1082
1083     //Recalculate cluster position
1084     if(GetCaloUtils()->IsRecalculationOfClusterPositionOn())
1085     {
1086       GetCaloUtils()->RecalculateClusterPosition(GetEMCALCells(),clus);
1087       //clus->GetPosition(pos);
1088       //printf("After  Corrections: e %f, x %f, y %f, z %f\n",clus->E(),pos[0],pos[1],pos[2]);
1089     }
1090
1091     // Recalculate TOF
1092     if(GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->IsTimeRecalibrationOn())
1093     {
1094       Double_t tof      = clus->GetTOF();
1095       Float_t  frac     =-1;
1096       Int_t    absIdMax = GetCaloUtils()->GetMaxEnergyCell(fEMCALCells, clus,frac);
1097
1098       if(fDataType==AliCaloTrackReader::kESD)
1099       {
1100         tof = fEMCALCells->GetCellTime(absIdMax);
1101       }
1102
1103       GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->RecalibrateCellTime(absIdMax,fInputEvent->GetBunchCrossNumber(),tof);
1104
1105       clus->SetTOF(tof);
1106
1107     }// Time recalibration
1108   }
1109
1110   //Correct non linearity
1111   if(GetCaloUtils()->IsCorrectionOfClusterEnergyOn())
1112   {
1113     GetCaloUtils()->CorrectClusterEnergy(clus) ;
1114     //printf("Linearity Corrected Energy %f\n",clus->E());
1115
1116     //In case of MC analysis, to match resolution/calibration in real data
1117     Float_t rdmEnergy = GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->SmearClusterEnergy(clus);
1118     // printf("\t Energy %f, smeared %f\n", clus->E(),rdmEnergy);
1119     clus->SetE(rdmEnergy);
1120   }
1121
1122   TLorentzVector momentum ;
1123
1124   clus->GetMomentum(momentum, fVertex[vindex]);
1125
1126   if(fCheckFidCut && !fFiducialCut->IsInFiducialCut(momentum,"EMCAL")) return;
1127
1128   if(fEMCALPtMin > momentum.E() || fEMCALPtMax < momentum.E())         return;
1129
1130   Double_t tof = clus->GetTOF()*1e9;
1131   if(tof < fEMCALTimeCutMin     || tof > fEMCALTimeCutMax)             return;
1132
1133   if(fDebug > 2 && momentum.E() > 0.1)
1134     printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - Selected clusters E %3.2f, pt %3.2f, phi %3.2f, eta %3.2f\n",
1135            momentum.E(),momentum.Pt(),momentum.Phi()*TMath::RadToDeg(),momentum.Eta());
1136
1137   if (fMixedEvent)
1138     clus->SetID(iclus) ;
1139
1140   fEMCALClusters->Add(clus);
1141
1142 }
1143
1144 //_______________________________________
1145 void AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL()
1146 {
1147   //Return array with EMCAL clusters in aod format
1148
1149   if(fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL()\n");
1150
1151   // First recalibrate cells, time or energy
1152   //  if(GetCaloUtils()->IsRecalibrationOn())
1153   //    GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->RecalibrateCells(GetCaloUtils()->GetEMCALGeometry(),
1154   //                                                          GetEMCALCells(),
1155   //                                                          fInputEvent->GetBunchCrossNumber());
1156
1157   //Loop to select clusters in fiducial cut and fill container with aodClusters
1158   if(fEMCALClustersListName=="")
1159   {
1160     Int_t nclusters = fInputEvent->GetNumberOfCaloClusters();
1161     for (Int_t iclus =  0; iclus <  nclusters; iclus++)
1162     {
1163       AliVCluster * clus = 0;
1164       if ( (clus = fInputEvent->GetCaloCluster(iclus)) )
1165       {
1166         if (IsEMCALCluster(clus))
1167         {
1168           FillInputEMCALAlgorithm(clus, iclus);
1169         }//EMCAL cluster
1170       }// cluster exists
1171     }// cluster loop
1172
1173     //Recalculate track matching
1174     GetCaloUtils()->RecalculateClusterTrackMatching(fInputEvent);
1175
1176   }//Get the clusters from the input event
1177   else
1178   {
1179     TClonesArray * clusterList = 0x0;
1180
1181     if      (fInputEvent->FindListObject(fEMCALClustersListName))
1182     {
1183       clusterList = dynamic_cast<TClonesArray*> (fInputEvent ->FindListObject(fEMCALClustersListName));
1184     }
1185     else if(fOutputEvent)
1186     {
1187       clusterList = dynamic_cast<TClonesArray*> (fOutputEvent->FindListObject(fEMCALClustersListName));
1188     }
1189
1190     if(!clusterList)
1191     {
1192       //printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - Wrong name of list with clusters? Try input event <%s>\n",fEMCALClustersListName.Data());
1193       //List not in output event, try input event
1194       clusterList = dynamic_cast<TClonesArray*> (fInputEvent->FindListObject(fEMCALClustersListName));
1195       if(!clusterList)
1196       {
1197         printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - Wrong name of list with clusters?  <%s>\n",fEMCALClustersListName.Data());
1198         return;
1199       }
1200     }
1201
1202     Int_t nclusters = clusterList->GetEntriesFast();
1203     for (Int_t iclus =  0; iclus <  nclusters; iclus++)
1204     {
1205       AliVCluster * clus = dynamic_cast<AliVCluster*> (clusterList->At(iclus));
1206       //printf("E %f\n",clus->E());
1207       if (clus) FillInputEMCALAlgorithm(clus, iclus);
1208       else printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - Null cluster in list!\n");
1209     }// cluster loop
1210
1211     // Recalculate track matching, not necessary if already done in the reclusterization task.
1212     // in case it was not done ...
1213     GetCaloUtils()->RecalculateClusterTrackMatching(fInputEvent,clusterList);
1214
1215   }
1216
1217   if(fDebug > 1) printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - aod entries %d\n",  fEMCALClusters->GetEntriesFast());
1218
1219 }
1220
1221 //______________________________________
1222 void AliCaloTrackReader::FillInputPHOS()
1223 {
1224   //Return array with PHOS clusters in aod format
1225
1226   if(fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputPHOS()\n");
1227
1228   //Loop to select clusters in fiducial cut and fill container with aodClusters
1229   Int_t nclusters = fInputEvent->GetNumberOfCaloClusters();
1230   for (Int_t iclus = 0; iclus < nclusters; iclus++)
1231   {
1232     AliVCluster * clus = 0;
1233     if ( (clus = fInputEvent->GetCaloCluster(iclus)) )
1234     {
1235       if (IsPHOSCluster(clus))
1236       {
1237         //Check if the cluster contains any bad channel and if close to calorimeter borders
1238         Int_t vindex = 0 ;
1239         if (fMixedEvent)
1240           vindex = fMixedEvent->EventIndexForCaloCluster(iclus);
1241         if( GetCaloUtils()->ClusterContainsBadChannel("PHOS",clus->GetCellsAbsId(), clus->GetNCells()))
1242           continue;
1243         if(!GetCaloUtils()->CheckCellFiducialRegion(clus, fInputEvent->GetPHOSCells(), fInputEvent, vindex))
1244           continue;
1245
1246         if(fRecalculateClusters)
1247         {
1248           //Recalibrate the cluster energy
1249           if(GetCaloUtils()->IsRecalibrationOn())
1250           {
1251             Float_t energy = GetCaloUtils()->RecalibrateClusterEnergy(clus, (AliAODCaloCells*)GetPHOSCells());
1252             clus->SetE(energy);
1253           }
1254         }
1255
1256         TLorentzVector momentum ;
1257
1258         clus->GetMomentum(momentum, fVertex[vindex]);
1259
1260         if(fCheckFidCut && !fFiducialCut->IsInFiducialCut(momentum,"PHOS")) continue;
1261
1262         if(fPHOSPtMin > momentum.E() || fPHOSPtMax < momentum.E())          continue;
1263
1264         if(fDebug > 2 && momentum.E() > 0.1)
1265           printf("AliCaloTrackReader::FillInputPHOS() - Selected clusters E %3.2f, pt %3.2f, phi %3.2f, eta %3.2f\n",
1266                  momentum.E(),momentum.Pt(),momentum.Phi()*TMath::RadToDeg(),momentum.Eta());
1267
1268
1269         if (fMixedEvent)
1270         {
1271           clus->SetID(iclus) ;
1272         }
1273
1274         fPHOSClusters->Add(clus);
1275
1276       }//PHOS cluster
1277     }//cluster exists
1278   }//esd cluster loop
1279
1280   if(fDebug > 1) printf("AliCaloTrackReader::FillInputPHOS()  - aod entries %d\n",  fPHOSClusters->GetEntriesFast());
1281
1282 }
1283
1284 //____________________________________________
1285 void AliCaloTrackReader::FillInputEMCALCells()
1286 {
1287   //Return array with EMCAL cells in aod format
1288
1289   fEMCALCells = fInputEvent->GetEMCALCells();
1290
1291 }
1292
1293 //___________________________________________
1294 void AliCaloTrackReader::FillInputPHOSCells()
1295 {
1296   //Return array with PHOS cells in aod format
1297
1298   fPHOSCells = fInputEvent->GetPHOSCells();
1299
1300 }
1301
1302 //_______________________________________
1303 void AliCaloTrackReader::FillInputVZERO()
1304 {
1305   //Fill VZERO information in data member, add all the channels information.
1306   AliVVZERO* v0 = fInputEvent->GetVZEROData();
1307   //printf("Init V0: ADC (%d,%d), Multiplicity (%d,%d) \n",fV0ADC[0],fV0ADC[1],fV0Mul[0],fV0Mul[1]);
1308
1309   if (v0)
1310   {
1311     AliESDVZERO* esdV0 = dynamic_cast<AliESDVZERO*> (v0);
1312     for (Int_t i = 0; i < 32; i++)
1313     {
1314       if(esdV0)
1315       {//Only available in ESDs
1316         fV0ADC[0] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0C(i);
1317         fV0ADC[1] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0A(i);
1318       }
1319
1320       fV0Mul[0] += (Int_t)v0->GetMultiplicityV0C(i);
1321       fV0Mul[1] += (Int_t)v0->GetMultiplicityV0A(i);
1322     }
1323     if(fDebug > 0)
1324       printf("V0: ADC (%d,%d), Multiplicity (%d,%d) \n",fV0ADC[0],fV0ADC[1],fV0Mul[0],fV0Mul[1]);
1325   }
1326   else
1327   {
1328     if(fDebug > 0)
1329       printf("Cannot retrieve V0 ESD! Run w/ null V0 charges\n ");
1330   }
1331 }
1332
1333
1334 //___________________________________________________________________
1335 Bool_t AliCaloTrackReader::IsEMCALCluster(AliVCluster* cluster) const
1336 {
1337   // Check if it is a cluster from EMCAL. For old AODs cluster type has
1338   // different number and need to patch here
1339
1340   if(fDataType==kAOD && fOldAOD)
1341   {
1342     if (cluster->GetType() == 2) return kTRUE;
1343     else                         return kFALSE;
1344   }
1345   else
1346   {
1347     return cluster->IsEMCAL();
1348   }
1349
1350 }
1351
1352 //___________________________________________________________________
1353 Bool_t AliCaloTrackReader::IsPHOSCluster(AliVCluster * cluster) const
1354 {
1355   //Check if it is a cluster from PHOS.For old AODs cluster type has
1356   // different number and need to patch here
1357
1358   if(fDataType==kAOD && fOldAOD)
1359   {
1360     Int_t type = cluster->GetType();
1361     if (type == 0 || type == 1) return kTRUE;
1362     else                        return kFALSE;
1363   }
1364   else
1365   {
1366     return cluster->IsPHOS();
1367   }
1368
1369 }
1370
1371 //________________________________________________
1372 Bool_t AliCaloTrackReader::CheckForPrimaryVertex()
1373 {
1374   //Check if the vertex was well reconstructed, copy from V0Reader of conversion group
1375   //Only for ESDs ...
1376
1377   AliESDEvent * event = dynamic_cast<AliESDEvent*> (fInputEvent);
1378   if(!event) return kTRUE;
1379
1380   if(event->GetPrimaryVertexTracks()->GetNContributors() > 0)
1381   {
1382     return kTRUE;
1383   }
1384
1385   if(event->GetPrimaryVertexTracks()->GetNContributors() < 1)
1386   {
1387     // SPD vertex
1388     if(event->GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors() > 0)
1389     {
1390       //cout<<"spd vertex type::"<< fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetName() << endl;
1391       return kTRUE;
1392
1393     }
1394     if(event->GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors() < 1)
1395     {
1396       //      cout<<"bad vertex type::"<< event->GetPrimaryVertex()->GetName() << endl;
1397       return kFALSE;
1398     }
1399   }
1400
1401   return kFALSE;
1402
1403 }
1404
1405 //____________________________________________________________
1406 void  AliCaloTrackReader::SetTrackCuts(AliESDtrackCuts * cuts)
1407 {
1408   // Set Track cuts
1409
1410   if(fESDtrackCuts) delete fESDtrackCuts ;
1411
1412   fESDtrackCuts = cuts ;
1413
1414 }
1415