PWG/CaloTrackCorrBase/AliCaloTrackReader.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 //_________________________________________________________________________
  17 // Base class for reading data: MonteCarlo, ESD or AOD, of PHOS EMCAL and
  18 // Central Barrel Tracking detectors (CTS).
  19 // Not all MC particles/tracks/clusters are kept, some kinematical/fiducial restrictions are done.
  20 // Mother class of : AliCaloTrackESDReader: Fills ESD data in 3 TObjArrays (PHOS, EMCAL, CTS)
  21 //                 : AliCaloTrackMCReader : Fills Kinematics data in 3 TObjArrays (PHOS, EMCAL, CTS)
  22 //                 : AliCaloTrackAODReader: Fills AOD data in 3 TObjArrays (PHOS, EMCAL, CTS)
  23 //-- Author: Gustavo Conesa (LNF-INFN)
  24 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26
  27 // --- ROOT system ---
  28 #include <TFile.h>
  29 #include <TGeoManager.h>
  30
  31 // ---- ANALYSIS system ----
  32 #include "AliMCEvent.h"
  33 #include "AliAODMCHeader.h"
  34 #include "AliGenPythiaEventHeader.h"
  35 #include "AliESDEvent.h"
  36 #include "AliAODEvent.h"
  37 #include "AliVTrack.h"
  38 #include "AliVParticle.h"
  39 #include "AliMixedEvent.h"
  40 #include "AliESDtrack.h"
  41 #include "AliESDtrackCuts.h"
  42 #include "AliTriggerAnalysis.h"
  43 #include "AliESDVZERO.h"
  44 #include "AliVCaloCells.h"
  45 #include "AliAnalysisManager.h"
  46 #include "AliInputEventHandler.h"
  47
  48 // ---- Detectors ----
  49 #include "AliPHOSGeoUtils.h"
  50 #include "AliEMCALGeometry.h"
  51 #include "AliEMCALRecoUtils.h"
  52
  53 // ---- CaloTrackCorr ---
  54 #include "AliCalorimeterUtils.h"
  55 #include "AliCaloTrackReader.h"
  56
  57 ClassImp(AliCaloTrackReader)
  58
  59
  60 //________________________________________
  61 AliCaloTrackReader::AliCaloTrackReader() :
  62 TObject(),                   fEventNumber(-1), //fCurrentFileName(""),
  63 fDataType(0),                fDebug(0),
  64 fFiducialCut(0x0),           fCheckFidCut(kFALSE),
  65 fComparePtHardAndJetPt(0),   fPtHardAndJetPtFactor(0),
  66 fCTSPtMin(0),                fEMCALPtMin(0),                  fPHOSPtMin(0),
  67 fCTSPtMax(0),                fEMCALPtMax(0),                  fPHOSPtMax(0),
  68 fEMCALTimeCutMin(-10000),    fEMCALTimeCutMax(10000),
  69 fAODBranchList(0x0),
  70 fCTSTracks(0x0),             fEMCALClusters(0x0),             fPHOSClusters(0x0),
  71 fEMCALCells(0x0),            fPHOSCells(0x0),
  72 fInputEvent(0x0),            fOutputEvent(0x0),fMC(0x0),
  73 fFillCTS(0),                 fFillEMCAL(0),                   fFillPHOS(0),
  74 fFillEMCALCells(0),          fFillPHOSCells(0),
  75 fRecalculateClusters(kFALSE),fSelectEmbeddedClusters(kFALSE),
  76 fTrackStatus(0),             fTrackFilterMask(0),
  77 fESDtrackCuts(0),            fConstrainTrack(kFALSE),          fSelectHybridTracks(0),
  78 fTrackMult(0),               fTrackMultEtaCut(0.8),
  79 fReadStack(kFALSE),          fReadAODMCParticles(kFALSE),
  80 fDeltaAODFileName(""),       fFiredTriggerClassName(""),
  81 fEventTriggerMask(0),        fEventTriggerAtSE(0),
  82 fAnaLED(kFALSE),
  83 fTaskName(""),               fCaloUtils(0x0),
  84 fMixedEvent(NULL),           fNMixedEvent(0),                 fVertex(NULL),
  85 fListMixedTracksEvents(),    //fListMixedPhotonsEvents(),
  86 fLastMixedTracksEvent(-1),   //fLastMixedPhotonsEvent(-1),
  87 fWriteOutputDeltaAOD(kFALSE),fOldAOD(kFALSE),                 fCaloFilterPatch(kFALSE),
  88 fEMCALClustersListName(""),  fZvtxCut(0.),
  89 fAcceptFastCluster(kFALSE),  fRemoveLEDEvents(kTRUE),
  90 fDoEventSelection(kFALSE),   fDoV0ANDEventSelection(kFALSE),  fUseEventsWithPrimaryVertex(kFALSE),
  91 fTriggerAnalysis (0x0),
  92 fCentralityClass(""),        fCentralityOpt(0),
  93 fEventPlaneMethod(""),       fImportGeometryFromFile(kFALSE), fImportGeometryFilePath("")
  94 {
  95   //Ctor
  96
  97   //Initialize parameters
  98   InitParameters();
  99 }
 100
 101 //_______________________________________
 102 AliCaloTrackReader::~AliCaloTrackReader()
 103 {
 104   //Dtor
 105
 106   delete fFiducialCut ;
 107
 108   if(fAODBranchList)
 109   {
 110     fAODBranchList->Delete();
 111     delete fAODBranchList ;
 112   }
 113
 114   if(fCTSTracks)
 115   {
 116     if(fDataType!=kMC)fCTSTracks->Clear() ;
 117     else              fCTSTracks->Delete() ;
 118     delete fCTSTracks ;
 119   }
 120
 121   if(fEMCALClusters)
 122   {
 123     if(fDataType!=kMC)fEMCALClusters->Clear("C") ;
 124     else              fEMCALClusters->Delete() ;
 125     delete fEMCALClusters ;
 126   }
 127
 128   if(fPHOSClusters)
 129   {
 130     if(fDataType!=kMC)fPHOSClusters->Clear("C") ;
 131     else              fPHOSClusters->Delete() ;
 132     delete fPHOSClusters ;
 133   }
 134
 135   if(fVertex)
 136   {
 137     for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 138     {
 139       delete [] fVertex[i] ;
 140
 141     }
 142     delete [] fVertex ;
 143         }
 144
 145   delete fESDtrackCuts;
 146   delete fTriggerAnalysis;
 147
 148   //  Pointers not owned, done by the analysis frame
 149   //  if(fInputEvent)  delete fInputEvent ;
 150   //  if(fOutputEvent) delete fOutputEvent ;
 151   //  if(fMC)          delete fMC ;
 152   //  Pointer not owned, deleted by maker
 153   //  if (fCaloUtils) delete fCaloUtils ;
 154
 155 }
 156
 157 //________________________________________________
 158 Bool_t AliCaloTrackReader::ComparePtHardAndJetPt()
 159 {
 160   // Check the event, if the requested ptHard is much larger than the jet pT, then there is a problem.
 161   // Only for PYTHIA.
 162   if(!fReadStack) return kTRUE; //Information not filtered to AOD
 163
 164   if(!strcmp(GetGenEventHeader()->ClassName(), "AliGenPythiaEventHeader"))
 165   {
 166     TParticle * jet =  0;
 167     AliGenPythiaEventHeader* pygeh= (AliGenPythiaEventHeader*) GetGenEventHeader();
 168     Int_t nTriggerJets =  pygeh->NTriggerJets();
 169     Float_t ptHard = pygeh->GetPtHard();
 170
 171     //if(fDebug > 1) printf("AliMCAnalysisUtils::PythiaEventHeader: Njets: %d, pT Hard %f\n",nTriggerJets, ptHard);
 172     Float_t tmpjet[]={0,0,0,0};
 173     for(Int_t ijet = 0; ijet< nTriggerJets; ijet++)
 174     {
 175       pygeh->TriggerJet(ijet, tmpjet);
 176       jet = new TParticle(94, 21, -1, -1, -1, -1, tmpjet[0],tmpjet[1],tmpjet[2],tmpjet[3], 0,0,0,0);
 177       //Compare jet pT and pt Hard
 178       //if(fDebug > 1) printf("AliMCAnalysisUtils:: %d pycell jet pT %f\n",ijet, jet->Pt());
 179       if(jet->Pt() > fPtHardAndJetPtFactor * ptHard)
 180       {
 181         printf("AliMCAnalysisUtils::PythiaEventHeader: Njets: %d, pT Hard %2.2f, pycell jet pT %2.2f, rejection factor %1.1f\n",
 182                nTriggerJets, ptHard, jet->Pt(), fPtHardAndJetPtFactor);
 183         return kFALSE;
 184       }
 185     }
 186     if(jet) delete jet;
 187   }
 188
 189   return kTRUE ;
 190
 191 }
 192
 193 //____________________________________________
 194 AliStack* AliCaloTrackReader::GetStack() const
 195 {
 196   //Return pointer to stack
 197   if(fMC)
 198     return fMC->Stack();
 199   else
 200   {
 201     if(fDebug > 1) printf("AliCaloTrackReader::GetStack() - Stack is not available\n");
 202     return 0x0 ;
 203   }
 204 }
 205
 206 //__________________________________________________
 207 TString AliCaloTrackReader::GetFiredTriggerClasses()
 208 {
 209   // List of triggered classes in a TString
 210
 211   AliESDEvent* esdevent = dynamic_cast<AliESDEvent*> (GetInputEvent());
 212   AliAODEvent* aodevent = dynamic_cast<AliAODEvent*> (GetInputEvent());
 213
 214   if     (esdevent) return esdevent->GetFiredTriggerClasses();
 215   else if(aodevent) return aodevent->GetFiredTriggerClasses();
 216   else              return ""; // Mixed Event, MC event, does not have this trigger info
 217
 218 }
 219
 220 //______________________________________________
 221 AliHeader* AliCaloTrackReader::GetHeader() const
 222 {
 223   //Return pointer to header
 224   if(fMC)
 225   {
 226     return fMC->Header();
 227   }
 228   else
 229   {
 230     printf("AliCaloTrackReader::Header is not available\n");
 231     return 0x0 ;
 232   }
 233 }
 234
 235 //______________________________________________________________
 236 AliGenEventHeader* AliCaloTrackReader::GetGenEventHeader() const
 237 {
 238   //Return pointer to Generated event header
 239   if(fMC)
 240   {
 241     return fMC->GenEventHeader();
 242   }
 243   else
 244   {
 245     printf("AliCaloTrackReader::GenEventHeader is not available\n");
 246     return 0x0 ;
 247   }
 248 }
 249
 250 //____________________________________________________________________
 251 TClonesArray* AliCaloTrackReader::GetAODMCParticles(Int_t input) const
 252 {
 253   //Return list of particles in AOD. Do it for the corresponding input event.
 254
 255   TClonesArray * rv = NULL ;
 256   if(fDataType == kAOD)
 257   {
 258     if(input == 0)
 259     {
 260       //Normal input AOD
 261       AliAODEvent * evt = dynamic_cast<AliAODEvent*> (fInputEvent) ;
 262       if(evt)
 263         rv = (TClonesArray*)evt->FindListObject("mcparticles");
 264       else
 265         printf("AliCaloTrackReader::GetAODMCParticles() - wrong AOD input index? %d, or non existing tree? \n",input);
 266     }
 267
 268   }
 269   else
 270   {
 271     printf("AliCaloTrackReader::GetAODMCParticles() - Input are not AODs\n");
 272   }
 273
 274   return rv ;
 275 }
 276
 277 //___________________________________________________________________
 278 AliAODMCHeader* AliCaloTrackReader::GetAODMCHeader(Int_t input) const
 279 {
 280   //Return MC header in AOD. Do it for the corresponding input event.
 281
 282   AliAODMCHeader *mch = NULL;
 283
 284   if(fDataType == kAOD)
 285   {
 286     //Normal input AOD
 287     if(input == 0)
 288     {
 289       mch = (AliAODMCHeader*)((AliAODEvent*)fInputEvent)->FindListObject("mcheader");
 290     }
 291     else
 292     {
 293       printf("AliCaloTrackReader::GetAODMCHeader() - wrong AOD input index, %d\n",input);
 294     }
 295   }
 296   else
 297   {
 298     printf("AliCaloTrackReader::GetAODMCHeader() - Input are not AODs\n");
 299   }
 300
 301   return mch;
 302 }
 303
 304 //_____________________________
 305 void AliCaloTrackReader::Init()
 306 {
 307   //Init reader. Method to be called in AliAnaPartCorrMaker
 308
 309   //printf(" AliCaloTrackReader::Init() %p \n",gGeoManager);
 310
 311   if(fReadStack && fReadAODMCParticles)
 312   {
 313     printf("AliCaloTrackReader::Init() - Cannot access stack and mcparticles at the same time, change them \n");
 314     fReadStack          = kFALSE;
 315     fReadAODMCParticles = kFALSE;
 316   }
 317
 318   // Init geometry, I do not like much to do it like this ...
 319   if(fImportGeometryFromFile && !gGeoManager)
 320   {
 321     if(fImportGeometryFilePath=="") // If not specified, set a default location
 322     fImportGeometryFilePath = "$ALICE_ROOT/PWGGA/EMCALTasks/macros/geometry.root"; // "$ALICE_ROOT/EVE/alice-data/default_geo.root"
 323
 324     printf("AliCaloTrackReader::Init() - Import %s\n",fImportGeometryFilePath.Data());
 325     TGeoManager::Import(fImportGeometryFilePath) ; // default need file "geometry.root" in local dir!!!!
 326   }
 327
 328 }
 329
 330 //_______________________________________
 331 void AliCaloTrackReader::InitParameters()
 332 {
 333   //Initialize the parameters of the analysis.
 334   fDataType   = kESD ;
 335   fCTSPtMin   = 0.1 ;
 336   fEMCALPtMin = 0.1 ;
 337   fPHOSPtMin  = 0.1 ;
 338   fCTSPtMax   = 1000. ;
 339   fEMCALPtMax = 1000. ;
 340   fPHOSPtMax  = 1000. ;
 341
 342   //Do not filter the detectors input by default.
 343   fFillEMCAL      = kFALSE;
 344   fFillPHOS       = kFALSE;
 345   fFillCTS        = kFALSE;
 346   fFillEMCALCells = kFALSE;
 347   fFillPHOSCells  = kFALSE;
 348
 349   fReadStack             = kFALSE; // Check in the constructor of the other readers if it was set or in the configuration file
 350   fReadAODMCParticles    = kFALSE; // Check in the constructor of the other readers if it was set or in the configuration file
 351   fDeltaAODFileName      = "deltaAODPartCorr.root";
 352   fFiredTriggerClassName = "";
 353   fEventTriggerMask      = AliVEvent::kAny;
 354   fEventTriggerAtSE      = kTRUE; // Use only events that pass event selection at SE base class
 355
 356   fAcceptFastCluster = kTRUE;
 357   fAnaLED            = kFALSE;
 358
 359   //We want tracks fitted in the detectors:
 360   //fTrackStatus=AliESDtrack::kTPCrefit;
 361   //fTrackStatus|=AliESDtrack::kITSrefit;
 362   fTrackStatus     = 0;
 363   fTrackFilterMask = 128; //For AODs, but what is the difference between fTrackStatus and fTrackFilterMask?
 364
 365   fESDtrackCuts = AliESDtrackCuts::GetStandardTPCOnlyTrackCuts(); //initialize with TPC only tracks
 366
 367   fConstrainTrack = kFALSE ; // constrain tracks to vertex
 368
 369   fV0ADC[0] = 0;   fV0ADC[1] = 0;
 370   fV0Mul[0] = 0;   fV0Mul[1] = 0;
 371
 372   fZvtxCut   = 10.;
 373
 374   fNMixedEvent = 1;
 375
 376   fPtHardAndJetPtFactor = 7;
 377
 378   //Centrality
 379   fCentralityClass  = "V0M";
 380   fCentralityOpt    = 10;
 381   fCentralityBin[0] = fCentralityBin[1]=-1;
 382
 383   fEventPlaneMethod = "V0";
 384
 385   // Allocate memory (not sure this is the right place)
 386   fCTSTracks       = new TObjArray();
 387   fEMCALClusters   = new TObjArray();
 388   fPHOSClusters    = new TObjArray();
 389   fTriggerAnalysis = new AliTriggerAnalysis;
 390   fAODBranchList   = new TList ;
 391
 392   fImportGeometryFromFile = kFALSE;
 393
 394 }
 395
 396 //________________________________________________________
 397 void AliCaloTrackReader::Print(const Option_t * opt) const
 398 {
 399
 400   //Print some relevant parameters set for the analysis
 401   if(! opt)
 402     return;
 403
 404   printf("***** Print: %s %s ******\n",    GetName(), GetTitle() ) ;
 405   printf("Task name      : %s\n",          fTaskName.Data()) ;
 406   printf("Data type      : %d\n",          fDataType) ;
 407   printf("CTS Min pT     : %2.1f GeV/c\n", fCTSPtMin) ;
 408   printf("EMCAL Min pT   : %2.1f GeV/c\n", fEMCALPtMin) ;
 409   printf("PHOS Min pT    : %2.1f GeV/c\n", fPHOSPtMin) ;
 410   printf("CTS Max pT     : %2.1f GeV/c\n", fCTSPtMax) ;
 411   printf("EMCAL Max pT   : %2.1f GeV/c\n", fEMCALPtMax) ;
 412   printf("PHOS Max pT    : %2.1f GeV/c\n", fPHOSPtMax) ;
 413   printf("EMCAL Time Cut: %3.1f < TOF  < %3.1f\n", fEMCALTimeCutMin, fEMCALTimeCutMax);
 414   printf("Use CTS         =     %d\n",     fFillCTS) ;
 415   printf("Use EMCAL       =     %d\n",     fFillEMCAL) ;
 416   printf("Use PHOS        =     %d\n",     fFillPHOS) ;
 417   printf("Use EMCAL Cells =     %d\n",     fFillEMCALCells) ;
 418   printf("Use PHOS  Cells =     %d\n",     fFillPHOSCells) ;
 419   printf("Track status    =     %d\n", (Int_t) fTrackStatus) ;
 420   printf("AODs Track filter mask  =  %d or hybrid %d\n", (Int_t) fTrackFilterMask,fSelectHybridTracks) ;
 421   printf("Track Mult Eta Cut =  %d\n", (Int_t) fTrackMultEtaCut) ;
 422   printf("Write delta AOD =     %d\n",     fWriteOutputDeltaAOD) ;
 423   printf("Recalculate Clusters = %d\n",    fRecalculateClusters) ;
 424
 425   printf("Use Triggers selected in SE base class %d; If not what trigger Mask %d? \n",
 426          fEventTriggerAtSE, fEventTriggerMask);
 427
 428   if(fComparePtHardAndJetPt)
 429           printf("Compare jet pt and pt hard to accept event, factor = %2.2f",fPtHardAndJetPtFactor);
 430
 431   printf("Read Kine from, stack? %d, AOD ? %d \n", fReadStack, fReadAODMCParticles) ;
 432   printf("Delta AOD File Name =     %s\n", fDeltaAODFileName.Data()) ;
 433   printf("Centrality: Class %s, Option %d, Bin [%d,%d] \n", fCentralityClass.Data(),fCentralityOpt,fCentralityBin[0], fCentralityBin[1]) ;
 434
 435   printf("    \n") ;
 436
 437 }
 438
 439 //_________________________________________________________________________
 440 Bool_t AliCaloTrackReader::FillInputEvent(const Int_t iEntry,
 441                                           const char * /*currentFileName*/)
 442 {
 443   //Fill the event counter and input lists that are needed, called by the analysis maker.
 444
 445   fEventNumber = iEntry;
 446   //fCurrentFileName = TString(currentFileName);
 447   if(!fInputEvent)
 448   {
 449           if(fDebug >= 0) printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - Input event not available, skip event analysis\n");
 450           return kFALSE;
 451   }
 452
 453   //Select events only fired by a certain trigger configuration if it is provided
 454   Int_t eventType = 0;
 455   if(fInputEvent->GetHeader())
 456           eventType = ((AliVHeader*)fInputEvent->GetHeader())->GetEventType();
 457
 458   if (GetFiredTriggerClasses().Contains("FAST")  && !GetFiredTriggerClasses().Contains("ALL") && !fAcceptFastCluster)
 459   {
 460     if(fDebug > 0)  printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent - Do not count events from fast cluster, trigger name %s\n",fFiredTriggerClassName.Data());
 461     return kFALSE;
 462   }
 463
 464   //-------------------------------------------------------------------------------------
 465   // Reject event if large clusters with large energy
 466   // Use only for LHC11a data for the moment, and if input is clusterizer V1 or V1+unfolding
 467   // If clusterzer NxN or V2 it does not help
 468   //-------------------------------------------------------------------------------------
 469   Int_t run = fInputEvent->GetRunNumber();
 470   if( fRemoveLEDEvents && run > 140000  && run <= 146860 )
 471   {
 472     //printf("Event %d\n",GetEventNumber());
 473     for (Int_t i = 0; i < fInputEvent->GetNumberOfCaloClusters(); i++)
 474     {
 475       AliVCluster *clus = fInputEvent->GetCaloCluster(i);
 476       if(clus->IsEMCAL())
 477       {
 478         if ((clus->E() > 500 && clus->GetNCells() > 200 ) || clus->GetNCells() > 200)
 479         {
 480           Int_t absID = clus->GetCellsAbsId()[0];
 481           Int_t sm = GetCaloUtils()->GetEMCALGeometry()->GetSuperModuleNumber(absID);
 482           if(fDebug > 0) printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent - reject event %d with cluster : E %f, ncells %d, absId(0) %d, SM %d\n",GetEventNumber(),clus->E(),  clus->GetNCells(),absID, sm);
 483           return kFALSE;
 484         }
 485       }
 486     }
 487
 488     // Count number of cells with energy larger than 0.1 in SM3, cut on this number
 489     Int_t ncellsSM3 = 0;
 490     Int_t ncellsSM4 = 0;
 491     for(Int_t icell = 0; icell < fInputEvent->GetEMCALCells()->GetNumberOfCells(); icell++)
 492     {
 493       Int_t absID = fInputEvent->GetEMCALCells()->GetCellNumber(icell);
 494       Int_t sm    = GetCaloUtils()->GetEMCALGeometry()->GetSuperModuleNumber(absID);
 495       if(fInputEvent->GetEMCALCells()->GetAmplitude(icell) > 0.1 && sm==3) ncellsSM3++;
 496       if(fInputEvent->GetEMCALCells()->GetAmplitude(icell) > 0.1 && sm==4) ncellsSM4++;
 497     }
 498
 499     Int_t ncellcut = 21;
 500     if(fFiredTriggerClassName.Contains("EMC")) ncellcut = 35;
 501
 502     if(ncellsSM3 >= ncellcut || ncellsSM4 >= 100)
 503     {
 504       if(fDebug > 0) printf(" AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - reject event with ncells in SM3 %d and SM4 %d\n",ncellsSM3, ncellsSM4);
 505       return kFALSE;
 506     }
 507   }// Remove LED events
 508
 509   // Reject pure LED events?
 510   if( fFiredTriggerClassName  !="" && !fAnaLED)
 511   {
 512     //printf("Event type %d\n",eventType);
 513     if(eventType!=7)
 514       return kFALSE; //Only physics event, do not use for simulated events!!!
 515
 516     if(fDebug > 0)
 517       printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - FiredTriggerClass <%s>, selected class <%s>, compare name %d\n",
 518              GetFiredTriggerClasses().Data(),fFiredTriggerClassName.Data(), GetFiredTriggerClasses().Contains(fFiredTriggerClassName));
 519
 520     if( !GetFiredTriggerClasses().Contains(fFiredTriggerClassName) ) return kFALSE;
 521     else if(fDebug > 0) printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - Accepted triggered event\n");
 522   }
 523   else if(fAnaLED)
 524   {
 525     //    kStartOfRun =       1,    // START_OF_RUN
 526     //    kEndOfRun =         2,    // END_OF_RUN
 527     //    kStartOfRunFiles =  3,    // START_OF_RUN_FILES
 528     //    kEndOfRunFiles =    4,    // END_OF_RUN_FILES
 529     //    kStartOfBurst =     5,    // START_OF_BURST
 530     //    kEndOfBurst =       6,    // END_OF_BURST
 531     //    kPhysicsEvent =     7,    // PHYSICS_EVENT
 532     //    kCalibrationEvent = 8,    // CALIBRATION_EVENT
 533     //    kFormatError =      9,    // EVENT_FORMAT_ERROR
 534     //    kStartOfData =      10,   // START_OF_DATA
 535     //    kEndOfData =        11,   // END_OF_DATA
 536     //    kSystemSoftwareTriggerEvent   = 12, // SYSTEM_SOFTWARE_TRIGGER_EVENT
 537     //    kDetectorSoftwareTriggerEvent = 13  // DETECTOR_SOFTWARE_TRIGGER_EVENT
 538
 539           if(eventType!=7 && fDebug > 1 )printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - DO LED, Event Type <%d>, 8 Calibration \n",  eventType);
 540           if(eventType!=8)return kFALSE;
 541   }
 542
 543   //In case of analysis of events with jets, skip those with jet pt > 5 pt hard
 544   if(fComparePtHardAndJetPt && GetStack())
 545   {
 546     if(!ComparePtHardAndJetPt()) return kFALSE ;
 547   }
 548
 549   //Fill Vertex array
 550   FillVertexArray();
 551   //Reject events with Z vertex too large, only for SE analysis, if not, cut on the analysis code
 552   if(!GetMixedEvent() && TMath::Abs(fVertex[0][2]) > fZvtxCut) return kFALSE;
 553
 554   //------------------------------------------------------
 555   //Event rejection depending on vertex, pileup, v0and
 556   //------------------------------------------------------
 557
 558   if(fUseEventsWithPrimaryVertex)
 559   {
 560     if( !CheckForPrimaryVertex() )              return kFALSE;
 561     if( TMath::Abs(fVertex[0][0] ) < 1.e-6 &&
 562         TMath::Abs(fVertex[0][1] ) < 1.e-6 &&
 563         TMath::Abs(fVertex[0][2] ) < 1.e-6    ) return kFALSE;
 564   }
 565
 566   if(fDoEventSelection)
 567   {
 568     if(!fCaloFilterPatch)
 569     {
 570       //Do not analyze events with pileup
 571       Bool_t bPileup = fInputEvent->IsPileupFromSPD(3, 0.8, 3., 2., 5.); //Default values, if not it does not compile
 572       //Bool_t bPileup = event->IsPileupFromSPD();
 573       if(bPileup) return kFALSE;
 574
 575       if(fDoV0ANDEventSelection)
 576       {
 577         Bool_t bV0AND = kTRUE;
 578         AliESDEvent* esd = dynamic_cast<AliESDEvent*> (fInputEvent);
 579         if(esd)
 580           bV0AND = fTriggerAnalysis->IsOfflineTriggerFired(esd, AliTriggerAnalysis::kV0AND);
 581         //else bV0AND = //FIXME FOR AODs
 582         if(!bV0AND) return kFALSE;
 583       }
 584     }//CaloFilter patch
 585     else
 586     {
 587       if(fInputEvent->GetNumberOfCaloClusters() > 0)
 588       {
 589         AliVCluster * calo = fInputEvent->GetCaloCluster(0);
 590         if(calo->GetNLabels() == 4)
 591         {
 592           Int_t * selection = calo->GetLabels();
 593           Bool_t bPileup = selection[0];
 594           if(bPileup) return kFALSE;
 595
 596           Bool_t bGoodV = selection[1];
 597           if(fUseEventsWithPrimaryVertex && !bGoodV) return kFALSE;
 598
 599           if(fDoV0ANDEventSelection)
 600           {
 601             Bool_t bV0AND = selection[2];
 602             if(!bV0AND) return kFALSE;
 603           }
 604
 605           fTrackMult = selection[3];
 606           if(fTrackMult == 0) return kFALSE;
 607         }
 608         else
 609         {
 610           //First filtered AODs, track multiplicity stored there.
 611           fTrackMult = (Int_t) ((AliAODHeader*)fInputEvent->GetHeader())->GetCentrality();
 612           if(fTrackMult == 0) return kFALSE;
 613         }
 614       }//at least one cluster
 615       else
 616       {
 617         //printf("AliCaloTrackReader::FillInputEvent() - No clusters in event\n");
 618         //Remove events with  vertex (0,0,0), bad vertex reconstruction
 619         if(fUseEventsWithPrimaryVertex && TMath::Abs(fVertex[0][0]) < 1.e-6 && TMath::Abs(fVertex[0][1]) < 1.e-6 && TMath::Abs(fVertex[0][2]) < 1.e-6) return kFALSE;
 620
 621         //First filtered AODs, track multiplicity stored there.
 622         fTrackMult = (Int_t) ((AliAODHeader*)fInputEvent->GetHeader())->GetCentrality();
 623         if(fTrackMult == 0) return kFALSE;
 624       }// no cluster
 625     }// CaloFileter patch
 626   }// Event selection
 627   //------------------------------------------------------
 628
 629   //Check if there is a centrality value, PbPb analysis, and if a centrality bin selection is requested
 630   //If we need a centrality bin, we select only those events in the corresponding bin.
 631   if(GetCentrality() && fCentralityBin[0]>=0 && fCentralityBin[1]>=0 && fCentralityOpt==100)
 632   {
 633     Int_t cen = GetEventCentrality();
 634     if(cen > fCentralityBin[1] || cen < fCentralityBin[0]) return kFALSE; //reject events out of bin.
 635   }
 636
 637   //Fill the arrays with cluster/tracks/cells data
 638
 639   if(fFillEMCALCells)
 640     FillInputEMCALCells();
 641
 642   if(fFillPHOSCells)
 643     FillInputPHOSCells();
 644
 645   FillInputVZERO();
 646
 647   if(fEventTriggerAtSE)
 648   {
 649     if(fFillCTS)
 650     {
 651       FillInputCTS();
 652       //Accept events with at least one track
 653       if(fTrackMult == 0 && fDoEventSelection) return kFALSE;
 654     }
 655     if(fFillEMCAL)
 656       FillInputEMCAL();
 657     if(fFillPHOS)
 658       FillInputPHOS();
 659   }
 660   else
 661   {
 662     // In case of mixing analysis, all triggers accepted, but trigger particles selected
 663     // only for the specific trigered events selected here. Mixing done only for MB events,
 664     // tracks array filled also for those events and not the others.
 665
 666     AliAnalysisManager *manager = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 667     AliInputEventHandler *inputHandler = dynamic_cast<AliInputEventHandler*>(manager->GetInputEventHandler());
 668
 669     if(!inputHandler) return kFALSE ;  // to content coverity
 670
 671     UInt_t isTrigger = inputHandler->IsEventSelected() & fEventTriggerMask;
 672     UInt_t isMB      = inputHandler->IsEventSelected() & AliVEvent::kMB;
 673
 674     if(fFillCTS && (isMB || isTrigger))
 675     {
 676       FillInputCTS();
 677       //Accept events with at least one track
 678       if(fTrackMult == 0 && fDoEventSelection) return kFALSE;
 679     }
 680
 681     if(isTrigger)
 682     {
 683       if(fFillEMCAL)
 684         FillInputEMCAL();
 685       if(fFillPHOS)
 686         FillInputPHOS();
 687     }
 688   }
 689
 690   return kTRUE ;
 691 }
 692
 693 //___________________________________
 694 void AliCaloTrackReader::ResetLists()
 695 {
 696   //  Reset lists, called by the analysis maker
 697
 698   if(fCTSTracks)       fCTSTracks     -> Clear();
 699   if(fEMCALClusters)   fEMCALClusters -> Clear("C");
 700   if(fPHOSClusters)    fPHOSClusters  -> Clear("C");
 701
 702   fV0ADC[0] = 0;   fV0ADC[1] = 0;
 703   fV0Mul[0] = 0;   fV0Mul[1] = 0;
 704
 705 }
 706
 707 //____________________________________________________________
 708 void AliCaloTrackReader::SetInputEvent(AliVEvent* const input)
 709 {
 710   fInputEvent  = input;
 711   fMixedEvent = dynamic_cast<AliMixedEvent*>(GetInputEvent()) ;
 712   if (fMixedEvent)
 713     fNMixedEvent = fMixedEvent->GetNumberOfEvents() ;
 714
 715   //Delete previous vertex
 716   if(fVertex)
 717   {
 718     for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 719     {
 720       delete [] fVertex[i] ;
 721     }
 722     delete [] fVertex ;
 723   }
 724
 725   fVertex = new Double_t*[fNMixedEvent] ;
 726   for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 727   {
 728     fVertex[i] = new Double_t[3] ;
 729     fVertex[i][0] = 0.0 ;
 730     fVertex[i][1] = 0.0 ;
 731     fVertex[i][2] = 0.0 ;
 732   }
 733 }
 734
 735 //__________________________________________________
 736 Int_t AliCaloTrackReader::GetEventCentrality() const
 737 {
 738   //Return current event centrality
 739
 740   if(GetCentrality())
 741   {
 742     if     (fCentralityOpt==100) return (Int_t) GetCentrality()->GetCentralityPercentile(fCentralityClass); // 100 bins max
 743     else if(fCentralityOpt==10)  return GetCentrality()->GetCentralityClass10(fCentralityClass);// 10 bins max
 744     else if(fCentralityOpt==20)  return GetCentrality()->GetCentralityClass5(fCentralityClass); // 20 bins max
 745     else
 746     {
 747       printf("AliCaloTrackReader::GetEventCentrality() - Unknown centrality option %d, use 10, 20 or 100\n",fCentralityOpt);
 748       return -1;
 749     }
 750   }
 751   else return -1;
 752
 753 }
 754
 755 //_____________________________________________________
 756 Double_t AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() const
 757 {
 758   //Return current event centrality
 759
 760   if(GetEventPlane())
 761   {
 762     Float_t ep =  GetEventPlane()->GetEventplane(GetEventPlaneMethod(), GetInputEvent());
 763
 764     if(GetEventPlaneMethod()=="Q" && (ep < 0 || ep > TMath::Pi()))
 765     {
 766       printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() -  Bad EP for <Q> method : %f\n",ep);
 767       return -1000;
 768     }
 769     else if(GetEventPlaneMethod().Contains("V0")  )
 770     {
 771       if((ep > TMath::Pi()/2 || ep < -TMath::Pi()/2))
 772       {
 773         printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() -  Bad EP for <%s> method : %f\n",GetEventPlaneMethod().Data(), ep);
 774         return -1000;
 775       }
 776
 777       ep+=TMath::Pi()/2; // put same range as for <Q> method
 778
 779     }
 780
 781     //printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() = %f\n",ep);
 782     if     (ep > TMath::Pi()) printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() - Too large angle = %f\n",ep);
 783     else if(ep < 0          ) printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() - Negative angle = %f\n" ,ep);
 784
 785     return ep;
 786   }
 787   else
 788   {
 789     printf("AliCaloTrackReader::GetEventPlaneAngle() -  No EP pointer\n");
 790     return -1000;
 791   }
 792
 793 }
 794
 795 //__________________________________________________________
 796 void AliCaloTrackReader::GetVertex(Double_t vertex[3]) const
 797 {
 798   //Return vertex position to be used for single event analysis
 799   vertex[0]=fVertex[0][0];
 800   vertex[1]=fVertex[0][1];
 801   vertex[2]=fVertex[0][2];
 802 }
 803
 804 //____________________________________________________________
 805 void AliCaloTrackReader::GetVertex(Double_t vertex[3],
 806                                    const Int_t evtIndex) const
 807 {
 808   //Return vertex position for mixed event, recover the vertex in a particular event.
 809
 810   vertex[0]=fVertex[evtIndex][0];  vertex[1]=fVertex[evtIndex][1];  vertex[2]=fVertex[evtIndex][2];
 811
 812 }
 813
 814 //________________________________________
 815 void AliCaloTrackReader::FillVertexArray()
 816 {
 817
 818   //Fill data member with vertex
 819   //In case of Mixed event, multiple vertices
 820
 821   //Delete previous vertex
 822   if(fVertex)
 823   {
 824     for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 825     {
 826       delete [] fVertex[i] ;
 827     }
 828     delete [] fVertex ;
 829   }
 830
 831   fVertex = new Double_t*[fNMixedEvent] ;
 832   for (Int_t i = 0; i < fNMixedEvent; i++)
 833   {
 834     fVertex[i] = new Double_t[3] ;
 835     fVertex[i][0] = 0.0 ;
 836     fVertex[i][1] = 0.0 ;
 837     fVertex[i][2] = 0.0 ;
 838   }
 839
 840   if (!fMixedEvent)
 841   { //Single event analysis
 842     if(fDataType!=kMC)
 843     {
 844
 845       if(fInputEvent->GetPrimaryVertex())
 846       {
 847         fInputEvent->GetPrimaryVertex()->GetXYZ(fVertex[0]);
 848       }
 849       else
 850       {
 851         printf("AliCaloTrackReader::FillVertexArray() - NULL primary vertex\n");
 852         fVertex[0][0]=0.;   fVertex[0][1]=0.;   fVertex[0][2]=0.;
 853       }//Primary vertex pointer do not exist
 854
 855     } else
 856     {//MC read event
 857       fVertex[0][0]=0.;   fVertex[0][1]=0.;   fVertex[0][2]=0.;
 858     }
 859
 860     if(fDebug > 1)
 861       printf("AliCaloTrackReader::FillVertexArray() - Single Event Vertex : %f,%f,%f\n",fVertex[0][0],fVertex[0][1],fVertex[0][2]);
 862
 863   } else
 864   { // MultiEvent analysis
 865     for (Int_t iev = 0; iev < fNMixedEvent; iev++)
 866     {
 867       if (fMixedEvent->GetVertexOfEvent(iev))
 868         fMixedEvent->GetVertexOfEvent(iev)->GetXYZ(fVertex[iev]);
 869       else
 870       { // no vertex found !!!!
 871         AliWarning("No vertex found");
 872       }
 873
 874       if(fDebug > 1)
 875         printf("AliCaloTrackReader::FillVertexArray() - Multi Event %d Vertex : %f,%f,%f\n",iev,fVertex[iev][0],fVertex[iev][1],fVertex[iev][2]);
 876
 877     }
 878   }
 879
 880 }
 881
 882 //_____________________________________
 883 void AliCaloTrackReader::FillInputCTS()
 884 {
 885   //Return array with Central Tracking System (CTS) tracks
 886
 887   if(fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS()\n");
 888
 889   Double_t pTrack[3] = {0,0,0};
 890
 891   Int_t nTracks = fInputEvent->GetNumberOfTracks() ;
 892   fTrackMult    = 0;
 893   Int_t nstatus = 0;
 894
 895   for (Int_t itrack =  0; itrack <  nTracks; itrack++)
 896   {////////////// track loop
 897     AliVTrack * track = (AliVTrack*)fInputEvent->GetTrack(itrack) ; // retrieve track from esd
 898
 899     //Select tracks under certain conditions, TPCrefit, ITSrefit ... check the set bits
 900     if (fTrackStatus && !((track->GetStatus() & fTrackStatus) == fTrackStatus))
 901       continue ;
 902
 903     nstatus++;
 904
 905     if     (fDataType==kESD)
 906     {
 907       AliESDtrack* esdTrack = dynamic_cast<AliESDtrack*> (track);
 908
 909       if(esdTrack && fESDtrackCuts->AcceptTrack(esdTrack))
 910       {
 911         track->GetPxPyPz(pTrack) ;
 912
 913         if(fConstrainTrack)
 914         {
 915           if(esdTrack->GetConstrainedParam())
 916           {
 917             const AliExternalTrackParam* constrainParam = esdTrack->GetConstrainedParam();
 918             esdTrack->Set(constrainParam->GetX(),constrainParam->GetAlpha(),constrainParam->GetParameter(),constrainParam->GetCovariance());
 919             esdTrack->GetConstrainedPxPyPz(pTrack);
 920           }
 921           else continue;
 922
 923         } // use constrained tracks
 924
 925       }
 926       else continue;
 927
 928     } // ESD
 929     else if(fDataType==kAOD)
 930     {
 931       AliAODTrack *aodtrack = dynamic_cast <AliAODTrack*>(track);
 932
 933       if(aodtrack)
 934       {
 935        if(fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS():AOD track type: %d (primary %d), hybrid? %d \n",
 936                               aodtrack->GetType(),AliAODTrack::kPrimary,
 937                               aodtrack->IsHybridGlobalConstrainedGlobal());
 938
 939
 940         if (fSelectHybridTracks)
 941         {
 942           if (!aodtrack->IsHybridGlobalConstrainedGlobal())       continue ;
 943         }
 944         else
 945         {
 946           if ( aodtrack->TestFilterBit(fTrackFilterMask)==kFALSE) continue ;
 947         }
 948
 949         if (aodtrack->GetType()!= AliAODTrack::kPrimary)          continue ;
 950
 951         if (fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS(): \t accepted track! \n");
 952
 953         track->GetPxPyPz(pTrack) ;
 954
 955       } // aod track exists
 956       else continue ;
 957
 958     } // AOD
 959
 960     //Count the tracks in eta < 0.9
 961     //printf("Eta %f cut  %f\n",TMath::Abs(track->Eta()),fTrackMultEtaCut);
 962     if(TMath::Abs(track->Eta())< fTrackMultEtaCut) fTrackMult++;
 963
 964     TLorentzVector momentum(pTrack[0],pTrack[1],pTrack[2],0);
 965
 966     if(fCTSPtMin < momentum.Pt() && fCTSPtMax > momentum.Pt())
 967     {
 968       if(fCheckFidCut && !fFiducialCut->IsInFiducialCut(momentum,"CTS"))
 969         continue;
 970
 971       if(fDebug > 2 && momentum.Pt() > 0.1)
 972         printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS() - Selected tracks E %3.2f, pt %3.2f, phi %3.2f, eta %3.2f\n",
 973                momentum.E(),momentum.Pt(),momentum.Phi()*TMath::RadToDeg(),momentum.Eta());
 974
 975       if (fMixedEvent)
 976       {
 977         track->SetID(itrack);
 978       }
 979
 980       fCTSTracks->Add(track);
 981
 982     }//Pt and Fiducial cut passed.
 983   }// track loop
 984
 985   if(fDebug > 1)
 986     printf("AliCaloTrackReader::FillInputCTS()   - aod entries %d, input tracks %d, pass status %d, multipliticy %d\n", fCTSTracks->GetEntriesFast(), nTracks, nstatus, fTrackMult);//fCTSTracksNormalInputEntries);
 987
 988 }
 989
 990 //__________________________________________________________________
 991 void AliCaloTrackReader::FillInputEMCALAlgorithm(AliVCluster * clus,
 992                                                  const Int_t iclus)
 993 {
 994   //Fill the EMCAL data in the array, do it
 995
 996   Int_t vindex = 0 ;
 997   if (fMixedEvent)
 998     vindex = fMixedEvent->EventIndexForCaloCluster(iclus);
 999
1000   //Reject clusters with bad channels, close to borders and exotic;
1001   if(!GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->IsGoodCluster(clus,GetCaloUtils()->GetEMCALGeometry(),GetEMCALCells(),fInputEvent->GetBunchCrossNumber())) return;
1002
1003   //Mask all cells in collumns facing ALICE thick material if requested
1004   if(GetCaloUtils()->GetNMaskCellColumns())
1005   {
1006     Int_t absId   = -1;
1007     Int_t iSupMod = -1;
1008     Int_t iphi    = -1;
1009     Int_t ieta    = -1;
1010     Bool_t shared = kFALSE;
1011     GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->GetMaxEnergyCell(GetCaloUtils()->GetEMCALGeometry(), GetEMCALCells(),clus,absId,iSupMod,ieta,iphi,shared);
1012     if(GetCaloUtils()->MaskFrameCluster(iSupMod, ieta)) return;
1013   }
1014
1015   if(fSelectEmbeddedClusters)
1016   {
1017     if(clus->GetNLabels()==0 || clus->GetLabel() < 0) return;
1018     //else printf("Embedded cluster,  %d, n label %d label %d  \n",iclus,clus->GetNLabels(),clus->GetLabel());
1019   }
1020
1021   //Float_t pos[3];
1022   //clus->GetPosition(pos);
1023   //printf("Before Corrections: e %f, x %f, y %f, z %f\n",clus->E(),pos[0],pos[1],pos[2]);
1024
1025   if(fRecalculateClusters)
1026   {
1027     //Recalibrate the cluster energy
1028     if(GetCaloUtils()->IsRecalibrationOn())
1029     {
1030       Float_t energy = GetCaloUtils()->RecalibrateClusterEnergy(clus, GetEMCALCells());
1031
1032       clus->SetE(energy);
1033       //printf("Recalibrated Energy %f\n",clus->E());
1034
1035       GetCaloUtils()->RecalculateClusterShowerShapeParameters(GetEMCALCells(),clus);
1036       GetCaloUtils()->RecalculateClusterPID(clus);
1037
1038     } // recalculate E
1039
1040     //Recalculate distance to bad channels, if new list of bad channels provided
1041     GetCaloUtils()->RecalculateClusterDistanceToBadChannel(GetEMCALCells(),clus);
1042
1043     //Recalculate cluster position
1044     if(GetCaloUtils()->IsRecalculationOfClusterPositionOn())
1045     {
1046       GetCaloUtils()->RecalculateClusterPosition(GetEMCALCells(),clus);
1047       //clus->GetPosition(pos);
1048       //printf("After  Corrections: e %f, x %f, y %f, z %f\n",clus->E(),pos[0],pos[1],pos[2]);
1049     }
1050
1051     // Recalculate TOF
1052     if(GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->IsTimeRecalibrationOn())
1053     {
1054       Double_t tof      = clus->GetTOF();
1055       Float_t  frac     =-1;
1056       Int_t    absIdMax = GetCaloUtils()->GetMaxEnergyCell(fEMCALCells, clus,frac);
1057
1058       if(fDataType==AliCaloTrackReader::kESD)
1059       {
1060         tof = fEMCALCells->GetCellTime(absIdMax);
1061       }
1062
1063       GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->RecalibrateCellTime(absIdMax,fInputEvent->GetBunchCrossNumber(),tof);
1064
1065       clus->SetTOF(tof);
1066
1067     }// Time recalibration
1068   }
1069
1070   //Correct non linearity
1071   if(GetCaloUtils()->IsCorrectionOfClusterEnergyOn())
1072   {
1073     GetCaloUtils()->CorrectClusterEnergy(clus) ;
1074     //printf("Linearity Corrected Energy %f\n",clus->E());
1075
1076     //In case of MC analysis, to match resolution/calibration in real data
1077     Float_t rdmEnergy = GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->SmearClusterEnergy(clus);
1078     // printf("\t Energy %f, smeared %f\n", clus->E(),rdmEnergy);
1079     clus->SetE(rdmEnergy);
1080   }
1081
1082   TLorentzVector momentum ;
1083
1084   clus->GetMomentum(momentum, fVertex[vindex]);
1085
1086   if(fCheckFidCut && !fFiducialCut->IsInFiducialCut(momentum,"EMCAL")) return;
1087
1088   if(fEMCALPtMin > momentum.E() || fEMCALPtMax < momentum.E())         return;
1089
1090   Double_t tof = clus->GetTOF()*1e9;
1091   if(tof < fEMCALTimeCutMin     || tof > fEMCALTimeCutMax)             return;
1092
1093   if(fDebug > 2 && momentum.E() > 0.1)
1094     printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - Selected clusters E %3.2f, pt %3.2f, phi %3.2f, eta %3.2f\n",
1095            momentum.E(),momentum.Pt(),momentum.Phi()*TMath::RadToDeg(),momentum.Eta());
1096
1097   if (fMixedEvent)
1098     clus->SetID(iclus) ;
1099
1100   fEMCALClusters->Add(clus);
1101
1102 }
1103
1104 //_______________________________________
1105 void AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL()
1106 {
1107   //Return array with EMCAL clusters in aod format
1108
1109   if(fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL()\n");
1110
1111   // First recalibrate cells, time or energy
1112   //  if(GetCaloUtils()->IsRecalibrationOn())
1113   //    GetCaloUtils()->GetEMCALRecoUtils()->RecalibrateCells(GetCaloUtils()->GetEMCALGeometry(),
1114   //                                                          GetEMCALCells(),
1115   //                                                          fInputEvent->GetBunchCrossNumber());
1116
1117   //Loop to select clusters in fiducial cut and fill container with aodClusters
1118   if(fEMCALClustersListName=="")
1119   {
1120     Int_t nclusters = fInputEvent->GetNumberOfCaloClusters();
1121     for (Int_t iclus =  0; iclus <  nclusters; iclus++)
1122     {
1123       AliVCluster * clus = 0;
1124       if ( (clus = fInputEvent->GetCaloCluster(iclus)) )
1125       {
1126         if (IsEMCALCluster(clus))
1127         {
1128           FillInputEMCALAlgorithm(clus, iclus);
1129         }//EMCAL cluster
1130       }// cluster exists
1131     }// cluster loop
1132
1133     //Recalculate track matching
1134     GetCaloUtils()->RecalculateClusterTrackMatching(fInputEvent);
1135
1136   }//Get the clusters from the input event
1137   else
1138   {
1139     TClonesArray * clusterList = 0x0;
1140
1141     if      (fInputEvent->FindListObject(fEMCALClustersListName))
1142     {
1143       clusterList = dynamic_cast<TClonesArray*> (fInputEvent ->FindListObject(fEMCALClustersListName));
1144     }
1145     else if(fOutputEvent)
1146     {
1147       clusterList = dynamic_cast<TClonesArray*> (fOutputEvent->FindListObject(fEMCALClustersListName));
1148     }
1149
1150     if(!clusterList)
1151     {
1152       //printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - Wrong name of list with clusters? Try input event <%s>\n",fEMCALClustersListName.Data());
1153       //List not in output event, try input event
1154       clusterList = dynamic_cast<TClonesArray*> (fInputEvent->FindListObject(fEMCALClustersListName));
1155       if(!clusterList)
1156       {
1157         printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - Wrong name of list with clusters?  <%s>\n",fEMCALClustersListName.Data());
1158         return;
1159       }
1160     }
1161
1162     Int_t nclusters = clusterList->GetEntriesFast();
1163     for (Int_t iclus =  0; iclus <  nclusters; iclus++)
1164     {
1165       AliVCluster * clus = dynamic_cast<AliVCluster*> (clusterList->At(iclus));
1166       //printf("E %f\n",clus->E());
1167       if (clus) FillInputEMCALAlgorithm(clus, iclus);
1168       else printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - Null cluster in list!\n");
1169     }// cluster loop
1170
1171     // Recalculate track matching, not necessary if already done in the reclusterization task.
1172     // in case it was not done ...
1173     GetCaloUtils()->RecalculateClusterTrackMatching(fInputEvent,clusterList);
1174
1175   }
1176
1177   if(fDebug > 1) printf("AliCaloTrackReader::FillInputEMCAL() - aod entries %d\n",  fEMCALClusters->GetEntriesFast());
1178
1179 }
1180
1181 //______________________________________
1182 void AliCaloTrackReader::FillInputPHOS()
1183 {
1184   //Return array with PHOS clusters in aod format
1185
1186   if(fDebug > 2 ) printf("AliCaloTrackReader::FillInputPHOS()\n");
1187
1188   //Loop to select clusters in fiducial cut and fill container with aodClusters
1189   Int_t nclusters = fInputEvent->GetNumberOfCaloClusters();
1190   for (Int_t iclus = 0; iclus < nclusters; iclus++)
1191   {
1192     AliVCluster * clus = 0;
1193     if ( (clus = fInputEvent->GetCaloCluster(iclus)) )
1194     {
1195       if (IsPHOSCluster(clus))
1196       {
1197         //Check if the cluster contains any bad channel and if close to calorimeter borders
1198         Int_t vindex = 0 ;
1199         if (fMixedEvent)
1200           vindex = fMixedEvent->EventIndexForCaloCluster(iclus);
1201         if( GetCaloUtils()->ClusterContainsBadChannel("PHOS",clus->GetCellsAbsId(), clus->GetNCells()))
1202           continue;
1203         if(!GetCaloUtils()->CheckCellFiducialRegion(clus, fInputEvent->GetPHOSCells(), fInputEvent, vindex))
1204           continue;
1205
1206         if(fRecalculateClusters)
1207         {
1208           //Recalibrate the cluster energy
1209           if(GetCaloUtils()->IsRecalibrationOn())
1210           {
1211             Float_t energy = GetCaloUtils()->RecalibrateClusterEnergy(clus, (AliAODCaloCells*)GetPHOSCells());
1212             clus->SetE(energy);
1213           }
1214         }
1215
1216         TLorentzVector momentum ;
1217
1218         clus->GetMomentum(momentum, fVertex[vindex]);
1219
1220         if(fCheckFidCut && !fFiducialCut->IsInFiducialCut(momentum,"PHOS")) continue;
1221
1222         if(fPHOSPtMin > momentum.E() || fPHOSPtMax < momentum.E())          continue;
1223
1224         if(fDebug > 2 && momentum.E() > 0.1)
1225           printf("AliCaloTrackReader::FillInputPHOS() - Selected clusters E %3.2f, pt %3.2f, phi %3.2f, eta %3.2f\n",
1226                  momentum.E(),momentum.Pt(),momentum.Phi()*TMath::RadToDeg(),momentum.Eta());
1227
1228
1229         if (fMixedEvent)
1230         {
1231           clus->SetID(iclus) ;
1232         }
1233
1234         fPHOSClusters->Add(clus);
1235
1236       }//PHOS cluster
1237     }//cluster exists
1238   }//esd cluster loop
1239
1240   if(fDebug > 1) printf("AliCaloTrackReader::FillInputPHOS()  - aod entries %d\n",  fPHOSClusters->GetEntriesFast());
1241
1242 }
1243
1244 //____________________________________________
1245 void AliCaloTrackReader::FillInputEMCALCells()
1246 {
1247   //Return array with EMCAL cells in aod format
1248
1249   fEMCALCells = fInputEvent->GetEMCALCells();
1250
1251 }
1252
1253 //___________________________________________
1254 void AliCaloTrackReader::FillInputPHOSCells()
1255 {
1256   //Return array with PHOS cells in aod format
1257
1258   fPHOSCells = fInputEvent->GetPHOSCells();
1259
1260 }
1261
1262 //_______________________________________
1263 void AliCaloTrackReader::FillInputVZERO()
1264 {
1265   //Fill VZERO information in data member, add all the channels information.
1266   AliVVZERO* v0 = fInputEvent->GetVZEROData();
1267   //printf("Init V0: ADC (%d,%d), Multiplicity (%d,%d) \n",fV0ADC[0],fV0ADC[1],fV0Mul[0],fV0Mul[1]);
1268
1269   if (v0)
1270   {
1271     AliESDVZERO* esdV0 = dynamic_cast<AliESDVZERO*> (v0);
1272     for (Int_t i = 0; i < 32; i++)
1273     {
1274       if(esdV0)
1275       {//Only available in ESDs
1276         fV0ADC[0] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0C(i);
1277         fV0ADC[1] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0A(i);
1278       }
1279
1280       fV0Mul[0] += (Int_t)v0->GetMultiplicityV0C(i);
1281       fV0Mul[1] += (Int_t)v0->GetMultiplicityV0A(i);
1282     }
1283     if(fDebug > 0)
1284       printf("V0: ADC (%d,%d), Multiplicity (%d,%d) \n",fV0ADC[0],fV0ADC[1],fV0Mul[0],fV0Mul[1]);
1285   }
1286   else
1287   {
1288     if(fDebug > 0)
1289       printf("Cannot retrieve V0 ESD! Run w/ null V0 charges\n ");
1290   }
1291 }
1292
1293
1294 //___________________________________________________________________
1295 Bool_t AliCaloTrackReader::IsEMCALCluster(AliVCluster* cluster) const
1296 {
1297   // Check if it is a cluster from EMCAL. For old AODs cluster type has
1298   // different number and need to patch here
1299
1300   if(fDataType==kAOD && fOldAOD)
1301   {
1302     if (cluster->GetType() == 2) return kTRUE;
1303     else                         return kFALSE;
1304   }
1305   else
1306   {
1307     return cluster->IsEMCAL();
1308   }
1309
1310 }
1311
1312 //___________________________________________________________________
1313 Bool_t AliCaloTrackReader::IsPHOSCluster(AliVCluster * cluster) const
1314 {
1315   //Check if it is a cluster from PHOS.For old AODs cluster type has
1316   // different number and need to patch here
1317
1318   if(fDataType==kAOD && fOldAOD)
1319   {
1320     Int_t type = cluster->GetType();
1321     if (type == 0 || type == 1) return kTRUE;
1322     else                        return kFALSE;
1323   }
1324   else
1325   {
1326     return cluster->IsPHOS();
1327   }
1328
1329 }
1330
1331 //________________________________________________
1332 Bool_t AliCaloTrackReader::CheckForPrimaryVertex()
1333 {
1334   //Check if the vertex was well reconstructed, copy from V0Reader of conversion group
1335   //Only for ESDs ...
1336
1337   AliESDEvent * event = dynamic_cast<AliESDEvent*> (fInputEvent);
1338   if(!event) return kTRUE;
1339
1340   if(event->GetPrimaryVertexTracks()->GetNContributors() > 0)
1341   {
1342     return kTRUE;
1343   }
1344
1345   if(event->GetPrimaryVertexTracks()->GetNContributors() < 1)
1346   {
1347     // SPD vertex
1348     if(event->GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors() > 0)
1349     {
1350       //cout<<"spd vertex type::"<< fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetName() << endl;
1351       return kTRUE;
1352
1353     }
1354     if(event->GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors() < 1)
1355     {
1356       //      cout<<"bad vertex type::"<< event->GetPrimaryVertex()->GetName() << endl;
1357       return kFALSE;
1358     }
1359   }
1360
1361   return kFALSE;
1362
1363 }
1364
1365 //____________________________________________________________
1366 void  AliCaloTrackReader::SetTrackCuts(AliESDtrackCuts * cuts)
1367 {
1368   // Set Track cuts
1369
1370   if(fESDtrackCuts) delete fESDtrackCuts ;
1371
1372   fESDtrackCuts = cuts ;
1373
1374 }
1375