]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - PWG/CaloTrackCorrBase/AliIsolationCut.cxx
temporal commit to avoir breaking compilation
[u/mrichter/AliRoot.git] / PWG / CaloTrackCorrBase / AliIsolationCut.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 //_________________________________________________________________________
17 // Class containing methods for the isolation cut. 
18 // An AOD candidate (AliAODPWG4ParticleCorrelation type)
19 // is passed. Look in a cone around the candidate and study
20 // the hadronic activity inside to decide if the candidate is isolated
21 //
22 //
23 //*-- Author: Gustavo Conesa (LNF-INFN) 
24
25 //-Yaxian Mao (add the possibility for different IC method with different pt range, 01/10/2010)
26 //-Yaxian Mao (check the candidate particle is the leading particle or not at the same hemishere)
27
28 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
29   
30   
31 // --- ROOT system --- 
32 #include <TLorentzVector.h>
33 #include <TObjArray.h>
34
35 // --- AliRoot system --- 
36 #include "AliIsolationCut.h" 
37 #include "AliAODPWG4ParticleCorrelation.h"
38 #include "AliEMCALGeometry.h"
39 #include "AliEMCALGeoParams.h"
40 #include "AliCalorimeterUtils.h"
41 #include "AliAODTrack.h"
42 #include "AliVCluster.h"
43 #include "AliCaloTrackReader.h"
44 #include "AliMixedEvent.h"
45 #include "AliCaloPID.h"
46
47 ClassImp(AliIsolationCut)
48   
49 //____________________________________
50 AliIsolationCut::AliIsolationCut() : 
51 TObject(),
52 fConeSize(0.),
53 fPtThreshold(0.),
54 fPtThresholdMax(10000.), 
55 fSumPtThreshold(0.),
56 fSumPtThresholdMax(10000.),
57 fPtFraction(0.),
58 fICMethod(0),
59 fPartInCone(0),
60 fDebug(-1),
61 fFracIsThresh(1)
62 {
63   //default ctor
64   
65   //Initialize parameters
66   InitParameters();
67   
68 }
69
70 //_________________________________________________________________________________________________________________________________
71 void AliIsolationCut::CalculateUEBandClusterNormalization(AliCaloTrackReader * /*reader*/, Float_t   etaC, Float_t /*phiC*/,
72                                                            Float_t   phiUEptsumCluster,     Float_t   etaUEptsumCluster,
73                                                            Float_t & phiUEptsumClusterNorm, Float_t & etaUEptsumClusterNorm,
74                                                            Float_t & excessFracEta,         Float_t & excessFracPhi         ) const
75 {
76   // Normalize cluster background band
77   
78   Float_t coneA     = fConeSize*fConeSize*TMath::Pi(); // A = pi R^2, isolation cone area
79   
80   //Careful here if EMCal limits changed .. 2010 (4 SM) to 2011-12 (10 SM), for the moment consider 100 deg in phi
81   Float_t emcEtaSize = 0.7*2; // TO FIX
82   Float_t emcPhiSize = TMath::DegToRad()*100.; // TO FIX
83   
84   /* //Catherine code
85    if(((((2*fConeSize*emcPhiSize)-coneA))*phiBandBadCellsCoeff)!=0)phiUEptsumClusterNorm = phiUEptsumCluster*(coneA*coneBadCellsCoeff / (((2*fConeSize*emcPhiSize)-coneA))*phiBandBadCellsCoeff); // pi * R^2 / (2 R * 2 100 deg) -  trigger cone
86    if(((((2*(fConeSize-excess)*emcPhiSize)-(coneA-excessFracEta))*etaBandBadCellsCoeff))!=0)phiUEptsumClusterNorm = phiUEptsumCluster*(coneA *coneBadCellsCoeff/ (((2*(fConeSize-excess)*emcPhiSize)-(coneA/excessFracEta))*etaBandBadCellsCoeff));
87    if(((2*(fConeSize-excess)*emcEtaSize)-(coneA-excessFracPhi))*phiBandBadCellsCoeff!=0) etaUEptsumClusterNorm = etaUEptsumCluster*(coneA*coneBadCellsCoeff / (((2*(fConeSize-excess)*emcEtaSize)-(coneA/excessFracPhi))*phiBandBadCellsCoeff));
88    */
89   
90   if((2*fConeSize*emcPhiSize-coneA)!=0) phiUEptsumClusterNorm = phiUEptsumCluster*(coneA / (((2*fConeSize*emcPhiSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 2 100 deg) -  trigger cone
91   if((2*fConeSize*emcEtaSize-coneA)!=0) etaUEptsumClusterNorm = etaUEptsumCluster*(coneA / (((2*fConeSize*emcEtaSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 2*0.7)  -  trigger cone
92   
93   //out of eta acceptance
94   excessFracEta = 1;
95   excessFracPhi = 1;
96
97   if(TMath::Abs(etaC)+fConeSize > emcEtaSize/2.)
98   {
99     Float_t excess = TMath::Abs(etaC) + fConeSize - emcEtaSize/2.;
100     excessFracEta  = CalculateExcessAreaFraction(excess);
101     
102     if ( excessFracEta != 0) coneA /=  excessFracEta;
103     
104     //UE band is also out of acceptance, need to estimate corrected area
105     if(((2*fConeSize-excess)*emcPhiSize-coneA) != 0 ) phiUEptsumClusterNorm = phiUEptsumCluster*(coneA / ((((2*fConeSize-excess)*emcPhiSize)-coneA)));
106     if(( 2*fConeSize        *emcEtaSize-coneA) != 0 ) etaUEptsumClusterNorm = etaUEptsumCluster*(coneA / ((( 2*fConeSize        *emcEtaSize)-coneA)));
107   }
108   
109 }
110
111 //________________________________________________________________________________________________________________________________
112 void AliIsolationCut::CalculateUEBandTrackNormalization  (AliCaloTrackReader * reader,    Float_t   etaC, Float_t /*phiC*/,
113                                                           Float_t   phiUEptsumTrack,      Float_t   etaUEptsumTrack,
114                                                           Float_t & phiUEptsumTrackNorm,  Float_t & etaUEptsumTrackNorm,
115                                                           Float_t & excessFracEta,        Float_t & excessFracPhi          ) const
116 {
117   // Normalize track background band
118   
119   Float_t coneA     = fConeSize*fConeSize*TMath::Pi(); // A = pi R^2, isolation cone area
120   
121   // Get the cut used for the TPC tracks in the reader, +-0.8, +-0.9 ...
122   // Only valid in simple fidutial cut case and if the cut is applied, careful!
123   Float_t tpcEtaSize = reader->GetFiducialCut()->GetCTSFidCutMaxEtaArray()->At(0) -
124   reader->GetFiducialCut()->GetCTSFidCutMinEtaArray()->At(0) ;
125   Float_t tpcPhiSize = TMath::TwoPi();
126   
127   /*//Catherine code
128    //phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA*coneBadCellsCoeff / (((2*fConeSize*tpcPhiSize)-coneA))*phiBandBadCellsCoeff); // pi * R^2 / (2 R * 2 pi) -  trigger cone
129    //etaUEptsumTrackNorm = etaUEptsumTrack*(coneA*coneBadCellsCoeff / (((2*fConeSize*tpcEtaSize)-coneA))*etaBandBadCellsCoeff); // pi * R^2 / (2 R * 1.6)  -  trigger cone
130    if((2*fConeSize*tpcPhiSize-coneA)!=0)phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA / (((2*fConeSize*tpcPhiSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 2 pi) -  trigger cone
131    if((2*fConeSize*tpcEtaSize-coneA)!=0)etaUEptsumTrackNorm = etaUEptsumTrack*(coneA / (((2*fConeSize*tpcEtaSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 1.6)  -  trigger cone
132    if((2*(fConeSize-excess)*tpcPhiSize)-(coneA-excessFracEta)!=0)phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA / (((2*(fConeSize-excess)*tpcPhiSize)-(coneA/excessFracEta))));
133    */ //end Catherine code
134   
135   //correct out of eta acceptance
136   excessFracEta = 1;
137   excessFracPhi = 1;
138
139   if((2*fConeSize*tpcPhiSize-coneA)!=0) phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA / (((2*fConeSize*tpcPhiSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 2 pi) -  trigger cone
140   if((2*fConeSize*tpcEtaSize-coneA)!=0) etaUEptsumTrackNorm = etaUEptsumTrack*(coneA / (((2*fConeSize*tpcEtaSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 1.6)  -  trigger cone
141   
142   if(TMath::Abs(etaC)+fConeSize > tpcEtaSize/2.)
143   {
144     Float_t excess = TMath::Abs(etaC) + fConeSize - tpcEtaSize/2.;
145     excessFracEta  = CalculateExcessAreaFraction(excess);
146     if (excessFracEta != 0) coneA /=  excessFracEta;
147     
148     //UE band is also out of acceptance, need to estimate corrected area
149     if(((2*fConeSize-excess)*tpcPhiSize - coneA) !=0 ) phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA / ((((2*fConeSize-excess)*tpcPhiSize)-coneA)));
150     if(( 2*fConeSize        *tpcEtaSize - coneA) !=0 ) etaUEptsumTrackNorm = etaUEptsumTrack*(coneA / ((( 2*fConeSize        *tpcEtaSize)-coneA)));
151   }
152   
153 }
154
155 //________________________________________________________________________
156 Float_t AliIsolationCut::CalculateExcessAreaFraction(Float_t excess) const
157 {
158   // Area of a circunference segment segment 1/2 R^2 (angle-sin(angle)), angle = 2*ACos((R-excess)/R)
159   
160   
161   Float_t angle   = 2*TMath::ACos( (fConeSize-excess) / fConeSize );
162   
163   Float_t coneA   = fConeSize*fConeSize*TMath::Pi(); // A = pi R^2, isolation cone area
164   
165   Float_t excessA = fConeSize*fConeSize / 2 * (angle-TMath::Sin(angle));
166   
167   if(coneA > excessA) return coneA / (coneA-excessA);
168   else
169   {
170     printf("AliIsolationCut::CalculateExcessAreaFraction() - Please Check : Excess Track %2.3f, coneA %2.2f,  excessA %2.2f, angle %2.2f,factor %2.2f\n",
171            excess,coneA, excessA, angle*TMath::RadToDeg(), coneA / (coneA-excessA));
172     return  1;
173   }
174 }
175
176 //_______________________________________________________________________________________
177 Float_t AliIsolationCut::GetCellDensity(AliAODPWG4ParticleCorrelation * pCandidate,
178                                         AliCaloTrackReader * reader) const
179 {
180   // Get good cell density (number of active cells over all cells in cone)
181   
182   Double_t coneCells    = 0.; //number of cells in cone with radius fConeSize
183   Double_t coneCellsBad = 0.; //number of bad cells in cone with radius fConeSize
184   Double_t cellDensity  = 1.;
185
186   Float_t phiC  = pCandidate->Phi() ;
187   if(phiC<0) phiC+=TMath::TwoPi();
188   Float_t etaC  = pCandidate->Eta() ;
189   
190   if(pCandidate->GetDetector()=="EMCAL")
191   {
192     AliEMCALGeometry* eGeom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
193     AliCalorimeterUtils *cu = reader->GetCaloUtils();
194     
195     Int_t absId = -999;
196     if (eGeom->GetAbsCellIdFromEtaPhi(etaC,phiC,absId))
197     {
198       //Get absolute (col,row) of candidate
199       Int_t iEta=-1, iPhi=-1, iRCU = -1;      
200       Int_t nSupMod = cu->GetModuleNumberCellIndexes(absId, pCandidate->GetDetectorTag(), iEta, iPhi, iRCU);
201       
202       Int_t colC = iEta;
203       if (nSupMod % 2) colC =  AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols + iEta ;
204       Int_t rowC = iPhi + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(nSupMod/2);
205       
206       Int_t sqrSize = int(fConeSize/0.0143) ; // Size of cell in radians
207       //loop on cells in a square of side fConeSize to check cells in cone    
208       for(Int_t icol = colC-sqrSize; icol < colC+sqrSize;icol++)
209       {
210         for(Int_t irow = rowC-sqrSize; irow < rowC+sqrSize; irow++)
211         {
212           if (Radius(colC, rowC, icol, irow) < sqrSize)
213           {
214             coneCells += 1.;
215             
216             Int_t cellSM  = -999;
217             Int_t cellEta = -999;
218             Int_t cellPhi = -999;
219             if(icol > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols-1) 
220             {
221               cellSM = 0+int(irow/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows)*2;
222               cellEta = icol-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
223               cellPhi = irow-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(cellSM/2);
224             }
225             if(icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols) 
226             {
227               cellSM = 1+int(irow/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows)*2;
228               cellEta = icol;
229               cellPhi = irow-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(cellSM/2);
230             }
231             
232             //Count as bad "cells" out of EMCAL acceptance
233             if(icol < 0 || icol > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols*2 || 
234                irow < 0 || irow > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*16./3) //5*nRows+1/3*nRows
235             {
236               coneCellsBad += 1.;
237             }
238             //Count as bad "cells" marked as bad in the DataBase
239             else if (cu->GetEMCALChannelStatus(cellSM,cellEta,cellPhi)==1) 
240             {
241               coneCellsBad += 1. ;
242             }
243           }
244         }
245       }//end of cells loop
246     }
247     
248     else if(fDebug>0) printf("cluster with bad (eta,phi) in EMCal for energy density calculation\n");
249     
250     if (coneCells > 0.) 
251     {
252       cellDensity = (coneCells-coneCellsBad)/coneCells;
253       //printf("Energy density = %f\n", cellDensity);
254     }
255   }
256
257   return cellDensity;
258   
259 }
260
261 //__________________________________________________________________________________
262 void AliIsolationCut::GetCoeffNormBadCell(AliAODPWG4ParticleCorrelation * pCandidate,
263                                           AliCaloTrackReader * reader,
264                                           Float_t &  coneBadCellsCoeff,
265                                           Float_t &  etaBandBadCellsCoeff,
266                                           Float_t & phiBandBadCellsCoeff)
267 {
268   // Get good cell density (number of active cells over all cells in cone)
269   
270   Double_t coneCells    = 0.; //number of cells in cone with radius fConeSize
271   Double_t phiBandCells = 0.; //number of cells in band phi
272   Double_t etaBandCells = 0.; //number of cells in band eta
273   
274   Float_t phiC  = pCandidate->Phi() ;
275   if(phiC<0) phiC+=TMath::TwoPi();
276   Float_t etaC  = pCandidate->Eta() ;
277   
278   if(pCandidate->GetDetector()=="EMCAL")
279   {
280     AliEMCALGeometry* eGeom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
281     AliCalorimeterUtils *cu = reader->GetCaloUtils();
282     
283     Int_t absId = -999;
284     if (eGeom->GetAbsCellIdFromEtaPhi(etaC,phiC,absId))
285     {
286       //Get absolute (col,row) of candidate
287       Int_t iEta=-1, iPhi=-1, iRCU = -1;
288       Int_t nSupMod = cu->GetModuleNumberCellIndexes(absId, pCandidate->GetDetectorTag(),
289                                                      iEta, iPhi, iRCU);
290       
291       Int_t colC = iEta;
292       if (nSupMod % 2) colC =  AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols + iEta ;
293       Int_t rowC = iPhi + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(nSupMod/2);
294       
295       Int_t sqrSize = int(fConeSize/0.0143) ; // Size of cell in radians
296       for(Int_t icol = 0; icol < 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols-1;icol++)
297       {
298         for(Int_t irow = 0; irow < 5*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows -1; irow++)
299         {
300           //loop on cells in a square of side fConeSize to check cells in cone
301           if     ( Radius(colC, rowC, icol, irow) < sqrSize ) { coneCells    += 1.; }
302           else if( icol>colC-sqrSize  &&  icol<colC+sqrSize ) { phiBandCells += 1 ; }
303           else if( irow>rowC-sqrSize  &&  irow<rowC+sqrSize ) { etaBandCells += 1 ; }
304           
305           Int_t cellSM  = -999;
306           Int_t cellEta = -999;
307           Int_t cellPhi = -999;
308           if(icol > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols-1)
309           {
310             cellSM = 0+int(irow/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows)*2;
311             cellEta = icol-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
312             cellPhi = irow-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(cellSM/2);
313           }
314           if(icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols)
315           {
316             cellSM = 1+int(irow/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows)*2;
317             cellEta = icol;
318             cellPhi = irow-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(cellSM/2);
319           }
320           
321           if( (icol < 0 || icol > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols*2-1 ||
322                irow < 0 || irow > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*5 - 1) //5*nRows+1/3*nRows //Count as bad "cells" out of EMCAL acceptance
323              || (cu->GetEMCALChannelStatus(cellSM,cellEta,cellPhi)==1))  //Count as bad "cells" marked as bad in the DataBase
324           {
325             if     ( Radius(colC, rowC, icol, irow) < sqrSize ) coneBadCellsCoeff    += 1.;
326             else if( icol>colC-sqrSize  &&  icol<colC+sqrSize ) phiBandBadCellsCoeff += 1 ;
327                   else if( irow>rowC-sqrSize  &&  irow<rowC+sqrSize ) etaBandBadCellsCoeff += 1 ;
328           }
329         }
330       }//end of cells loop
331     }
332     
333     else if(fDebug > 0) printf("cluster with bad (eta,phi) in EMCal for energy density coeff calculation\n");
334     
335     if (coneCells > 0.)
336     {
337       //   printf("Energy density coneBadCellsCoeff= %.2f coneCells%.2f\n", coneBadCellsCoeff,coneCells);
338       coneBadCellsCoeff = (coneCells-coneBadCellsCoeff)/coneCells;
339       //  printf("coneBadCellsCoeff= %.2f\n", coneBadCellsCoeff);
340     }
341     if (phiBandCells > 0.)
342     {
343       // printf("Energy density phiBandBadCellsCoeff = %.2f phiBandCells%.2f\n", phiBandBadCellsCoeff,phiBandCells);
344       phiBandBadCellsCoeff = (phiBandCells-phiBandBadCellsCoeff)/phiBandCells;
345       // printf("phiBandBadCellsCoeff = %.2f\n", phiBandBadCellsCoeff);
346     }
347     if (etaBandCells > 0.)
348     {
349       //printf("Energy density etaBandBadCellsCoeff = %.2f etaBandCells%.2f\n", etaBandBadCellsCoeff,etaBandCells);
350       etaBandBadCellsCoeff = (etaBandCells-etaBandBadCellsCoeff)/etaBandCells;
351       // printf("etaBandBadCellsCoeff = %.2f\n",etaBandBadCellsCoeff);
352     }
353     
354   }
355   
356 }
357
358 //____________________________________________
359 TString AliIsolationCut::GetICParametersList()
360 {
361   //Put data member values in string to keep in output container
362   
363   TString parList ; //this will be list of parameters used for this analysis.
364   const Int_t buffersize = 255;
365   char onePar[buffersize] ;
366   
367   snprintf(onePar,buffersize,"--- AliIsolationCut ---\n") ;
368   parList+=onePar ;     
369   snprintf(onePar,buffersize,"fConeSize: (isolation cone size) %1.2f\n",fConeSize) ;
370   parList+=onePar ;
371   snprintf(onePar,buffersize,"fPtThreshold >%2.2f;<%2.2f (isolation pt threshold) \n",fPtThreshold,fPtThresholdMax) ;
372   parList+=onePar ;
373   snprintf(onePar,buffersize,"fSumPtThreshold >%2.2f;<%2.2f (isolation sum pt threshold) \n",fSumPtThreshold,fSumPtThresholdMax) ;
374   parList+=onePar ;
375   snprintf(onePar,buffersize,"fPtFraction=%2.2f (isolation pt threshold fraction) \n",fPtFraction) ;
376   parList+=onePar ;
377   snprintf(onePar,buffersize,"fICMethod=%d (isolation cut case) \n",fICMethod) ;
378   parList+=onePar ;
379   snprintf(onePar,buffersize,"fPartInCone=%d \n",fPartInCone) ;
380   parList+=onePar ;
381   snprintf(onePar,buffersize,"fFracIsThresh=%i \n",fFracIsThresh) ;
382   parList+=onePar ;
383  
384   return parList; 
385 }
386
387 //____________________________________
388 void AliIsolationCut::InitParameters()
389 {
390   //Initialize the parameters of the analysis.
391   
392   fConeSize       = 0.4 ; 
393   fPtThreshold    = 0.5  ;
394   fPtThresholdMax = 10000.  ;
395   fSumPtThreshold    = 1.0 ;
396   fSumPtThresholdMax = 10000. ;
397   fPtFraction     = 0.1 ;
398   fPartInCone     = kNeutralAndCharged;
399   fICMethod       = kSumPtIC; // 0 pt threshol method, 1 cone pt sum method
400   fFracIsThresh   = 1; 
401 }
402
403 //________________________________________________________________________________
404 void  AliIsolationCut::MakeIsolationCut(TObjArray * plCTS, 
405                                         TObjArray * plNe, 
406                                         AliCaloTrackReader * reader, 
407                                         AliCaloPID * pid,
408                                         Bool_t bFillAOD,
409                                         AliAODPWG4ParticleCorrelation  *pCandidate, 
410                                         TString aodArrayRefName,
411                                         Int_t   & n, 
412                                         Int_t   & nfrac, 
413                                         Float_t & coneptsum, Float_t & ptLead,
414                                         Bool_t  & isolated) const
415 {
416   //Search in cone around a candidate particle if it is isolated 
417   Float_t ptC   = pCandidate->Pt() ;
418   Float_t phiC  = pCandidate->Phi() ;
419   if(phiC<0) phiC+=TMath::TwoPi();
420   Float_t etaC  = pCandidate->Eta() ;
421   
422   Float_t pt     = -100. ;
423   Float_t eta    = -100. ;
424   Float_t phi    = -100. ;
425   Float_t rad    = -100. ;
426   
427   Float_t coneptsumCluster = 0;
428   Float_t coneptsumTrack   = 0;
429   
430   Float_t  etaBandPtSumTrack   = 0;
431   Float_t  phiBandPtSumTrack   = 0;
432   Float_t  etaBandPtSumCluster = 0;
433   Float_t  phiBandPtSumCluster = 0;
434   
435   n         = 0 ;
436   nfrac     = 0 ;
437   isolated  = kFALSE;
438   
439   if(fDebug>0) 
440   {
441     printf("AliIsolationCut::MakeIsolationCut() - Cadidate pT %2.2f, eta %2.2f, phi %2.2f, cone %1.2f, thres %2.2f, Fill AOD? %d",
442            pCandidate->Pt(), pCandidate->Eta(), pCandidate->Phi()*TMath::RadToDeg(), fConeSize,fPtThreshold,bFillAOD);
443     if(plCTS) printf(", nTracks %d"  ,plCTS->GetEntriesFast());
444     if(plNe)  printf(", nClusters %d",plNe ->GetEntriesFast());
445     
446     printf("\n");
447   }
448   
449   //Initialize the array with refrences
450   TObjArray * refclusters  = 0x0;
451   TObjArray * reftracks    = 0x0;
452   Int_t       ntrackrefs   = 0;
453   Int_t       nclusterrefs = 0;
454   
455   //Check charged particles in cone.
456   if(plCTS && 
457      (fPartInCone==kOnlyCharged || fPartInCone==kNeutralAndCharged))
458   {
459     TVector3 p3;
460     for(Int_t ipr = 0;ipr < plCTS->GetEntries() ; ipr ++ )
461     {
462       AliVTrack* track = dynamic_cast<AliVTrack*>(plCTS->At(ipr)) ; 
463       
464       if(track)
465       {
466         //Do not count the candidate (pion, conversion photon) or the daughters of the candidate
467         if(track->GetID() == pCandidate->GetTrackLabel(0) || track->GetID() == pCandidate->GetTrackLabel(1) || 
468            track->GetID() == pCandidate->GetTrackLabel(2) || track->GetID() == pCandidate->GetTrackLabel(3)   ) continue ;
469         
470         p3.SetXYZ(track->Px(),track->Py(),track->Pz());
471         pt  = p3.Pt();
472         eta = p3.Eta();
473         phi = p3.Phi() ;
474       }
475       else
476       {// Mixed event stored in AliAODPWG4Particles
477         AliAODPWG4Particle * trackmix = dynamic_cast<AliAODPWG4Particle*>(plCTS->At(ipr)) ; 
478         if(!trackmix)
479         {
480           printf("AliIsolationCut::MakeIsolationCut() - Wrong track data type, continue\n");
481           continue;
482         }
483         
484         pt  = trackmix->Pt();
485         eta = trackmix->Eta();
486         phi = trackmix->Phi() ;
487       }
488
489       if( phi < 0 ) phi+=TMath::TwoPi();
490       
491       rad = Radius(etaC, phiC, eta, phi);
492       
493       // ** For the background out of cone **
494       
495       if(rad > fConeSize)
496       {
497         if(eta > (etaC-fConeSize) && eta < (etaC+fConeSize)) phiBandPtSumTrack += pt;
498         if(phi > (phiC-fConeSize) && phi < (phiC+fConeSize)) etaBandPtSumTrack += pt;
499       }
500       
501       // ** For the isolated particle **
502       
503       // Only loop the particle at the same side of candidate
504       if(TMath::Abs(phi-phiC) > TMath::PiOver2()) continue ;
505       
506 //      // If at the same side has particle larger than candidate, 
507 //      // then candidate can not be the leading, skip such events
508 //      if(pt > ptC)
509 //      {
510 //        n         = -1;
511 //        nfrac     = -1;
512 //        coneptsumTrack = -1;
513 //        isolated  = kFALSE;
514 //        
515 //        pCandidate->SetLeadingParticle(kFALSE);
516 //        
517 //        if(bFillAOD && reftracks) 
518 //        {
519 //          reftracks->Clear(); 
520 //          delete reftracks;
521 //        }
522 //        
523 //        return ;
524 //      }
525       
526       // // Check if there is any particle inside cone with pt larger than  fPtThreshold
527       // Check if the leading particule inside the cone has a ptLead larger than fPtThreshold
528       
529       if( fDebug > 0 )
530         printf("\t track %d, pT %2.2f, eta %1.2f, phi %2.2f, R candidate %2.2f", ipr,pt,eta,phi,rad);
531       
532       if(rad < fConeSize)
533       {
534         if(fDebug > 0)  printf(" -  inside candidate cone");
535         
536         if(bFillAOD)
537         {
538           ntrackrefs++;
539           if(ntrackrefs == 1)
540           {
541             reftracks = new TObjArray(0);
542             //reftracks->SetName(Form("Tracks%s",aodArrayRefName.Data()));
543             TString tempo(aodArrayRefName)  ; 
544             tempo += "Tracks" ; 
545             reftracks->SetName(tempo);
546             reftracks->SetOwner(kFALSE);
547           }
548           reftracks->Add(track);
549         }
550         
551         coneptsumTrack+=pt;
552
553         if( ptLead < pt ) ptLead = pt;
554
555 //        // *Before*, count particles in cone
556 //        if(pt > fPtThreshold && pt < fPtThresholdMax)  n++;
557 //        
558 //        //if fPtFraction*ptC<fPtThreshold then consider the fPtThreshold directly
559 //        if(fFracIsThresh)
560 //        {
561 //          if( fPtFraction*ptC < fPtThreshold )
562 //          {
563 //            if( pt > fPtThreshold )    nfrac++ ;
564 //          }
565 //          else
566 //          {
567 //            if( pt > fPtFraction*ptC ) nfrac++;
568 //          }
569 //        }
570 //        else
571 //        {
572 //          if( pt > fPtFraction*ptC ) nfrac++;
573 //        }
574
575       } // Inside cone
576       
577       if( fDebug > 0 )  printf("\n");
578       
579     }// charged particle loop
580     
581   }//Tracks
582   
583   
584   //Check neutral particles in cone.  
585   if(plNe &&
586      (fPartInCone==kOnlyNeutral || fPartInCone==kNeutralAndCharged))
587   {
588     TLorentzVector mom ;
589     
590     for(Int_t ipr = 0;ipr < plNe->GetEntries() ; ipr ++ )
591     {
592       AliVCluster * calo = dynamic_cast<AliVCluster *>(plNe->At(ipr)) ;
593       
594       if(calo)
595       {
596         //Get the index where the cluster comes, to retrieve the corresponding vertex
597         Int_t evtIndex = 0 ; 
598         if (reader->GetMixedEvent()) 
599           evtIndex=reader->GetMixedEvent()->EventIndexForCaloCluster(calo->GetID()) ; 
600         
601         
602         //Do not count the candidate (photon or pi0) or the daughters of the candidate
603         if(calo->GetID() == pCandidate->GetCaloLabel(0) || 
604            calo->GetID() == pCandidate->GetCaloLabel(1)   ) continue ;      
605         
606         //Skip matched clusters with tracks in case of neutral+charged analysis
607         if( fPartInCone == kNeutralAndCharged && 
608            pid->IsTrackMatched(calo,reader->GetCaloUtils(),reader->GetInputEvent()) ) continue ;
609         
610         //Assume that come from vertex in straight line
611         calo->GetMomentum(mom,reader->GetVertex(evtIndex)) ;
612         
613         pt  = mom.Pt()  ;
614         eta = mom.Eta() ;
615         phi = mom.Phi() ;
616       }
617       else 
618       {// Mixed event stored in AliAODPWG4Particles
619         AliAODPWG4Particle * calomix = dynamic_cast<AliAODPWG4Particle*>(plNe->At(ipr)) ; 
620         if(!calomix)
621         {
622           printf("AliIsolationCut::MakeIsolationCut() - Wrong calo data type, continue\n");
623           continue;
624         }
625         
626         pt  = calomix->Pt();
627         eta = calomix->Eta();
628         phi = calomix->Phi() ;
629       }
630       
631       if( phi < 0 ) phi+=TMath::TwoPi();
632       
633       rad = Radius(etaC, phiC, eta, phi);
634       
635       // ** For the background out of cone **
636       
637       if(rad > fConeSize)
638       {
639         if(eta > (etaC-fConeSize) && eta < (etaC+fConeSize)) phiBandPtSumCluster += pt;
640         if(phi > (phiC-fConeSize) && phi < (phiC+fConeSize)) etaBandPtSumCluster += pt;
641       }
642       
643       // ** For the isolated particle **
644       
645       // Only loop the particle at the same side of candidate
646       if(TMath::Abs(phi-phiC)>TMath::PiOver2()) continue ;
647       
648 //      // If at the same side has particle larger than candidate,
649 //      // then candidate can not be the leading, skip such events
650 //      if(pt > ptC)
651 //      {
652 //        n         = -1;
653 //        nfrac     = -1;
654 //        coneptsumCluster = -1;
655 //        isolated  = kFALSE;
656 //        
657 //        pCandidate->SetLeadingParticle(kFALSE);
658 //        
659 //        if(bFillAOD)
660 //        {
661 //          if(reftracks)
662 //          {  
663 //            reftracks  ->Clear();
664 //            delete reftracks;
665 //          }
666 //          
667 //          if(refclusters)
668 //          {
669 //            refclusters->Clear(); 
670 //            delete refclusters;
671 //          }
672 //        }
673 //        return ;
674 //      }
675       
676       //Check if there is any particle inside cone with pt larger than  fPtThreshold
677       
678       if(fDebug > 0 ) 
679         printf("\t cluster %d, pT %2.2f, eta %1.2f, phi %2.2f, R candidate %2.2f", ipr,pt,eta,phi,rad);
680       
681       if(rad < fConeSize)
682       {
683         if(fDebug > 0 )  printf(" - inside candidate cone");
684         
685         if(bFillAOD) 
686         {
687           nclusterrefs++;
688           if(nclusterrefs==1)
689           {
690             refclusters = new TObjArray(0);
691             //refclusters->SetName(Form("Clusters%s",aodArrayRefName.Data()));
692             TString tempo(aodArrayRefName)  ; 
693             tempo += "Clusters" ; 
694             refclusters->SetName(tempo);
695             refclusters->SetOwner(kFALSE);
696           }
697           refclusters->Add(calo);
698         }
699         
700         coneptsumCluster+=pt;
701         
702         if( ptLead < pt ) ptLead = pt;
703         
704 //        // *Before*, count particles in cone
705 //        if(pt > fPtThreshold && pt < fPtThresholdMax)  n++;
706 //
707 //        //if fPtFraction*ptC<fPtThreshold then consider the fPtThreshold directly
708 //        if(fFracIsThresh)
709 //        {
710 //          if( fPtFraction*ptC < fPtThreshold )
711 //          {
712 //            if( pt > fPtThreshold )    nfrac++ ;
713 //          }
714 //          else 
715 //          {
716 //            if( pt > fPtFraction*ptC ) nfrac++;
717 //          }
718 //        }
719 //        else
720 //        {
721 //          if( pt > fPtFraction*ptC ) nfrac++;
722 //        }
723         
724       }//in cone
725       
726       if(fDebug > 0 )  printf("\n");
727     
728     }// neutral particle loop
729     
730   }//neutrals
731   
732   //Add reference arrays to AOD when filling AODs only
733   if(bFillAOD)
734   {
735     if(refclusters)     pCandidate->AddObjArray(refclusters);
736     if(reftracks)         pCandidate->AddObjArray(reftracks);
737   }
738   
739   coneptsum = coneptsumCluster + coneptsumTrack;
740
741   // *Now*, just check the leading particle in the cone if the threshold is passed
742   if(ptLead > fPtThreshold && ptLead < fPtThresholdMax)  n = 1;
743   
744   //if fPtFraction*ptC<fPtThreshold then consider the fPtThreshold directly
745   if(fFracIsThresh)
746   {
747     if( fPtFraction*ptC < fPtThreshold )
748     {
749       if( ptLead > fPtThreshold )    nfrac = 1 ;
750     }
751     else
752     {
753       if( ptLead > fPtFraction*ptC ) nfrac = 1;
754     }
755   }
756   else
757   {
758     if( ptLead > fPtFraction*ptC ) nfrac = 1;
759   }
760   
761   //-------------------------------------------------------------------
762   //Check isolation, depending on selected isolation criteria requested
763   
764   if( fICMethod == kPtThresIC)
765   {
766     if( n == 0 ) isolated = kTRUE ;
767     
768     if(fDebug > 0 )
769       printf("pT Cand %2.2f, pT Lead %2.2f, %2.2f<pT Lead< %2.2f, isolated %d\n",
770              ptC,ptLead,fPtThreshold,fPtThresholdMax,isolated);
771   }
772   else if( fICMethod == kSumPtIC )
773   {
774     if( coneptsum > fSumPtThreshold &&
775         coneptsum < fSumPtThresholdMax )
776       isolated  =  kFALSE ;
777     else
778       isolated  =  kTRUE  ;
779     
780     if(fDebug > 0 )
781       printf("pT Cand %2.2f, SumPt %2.2f, %2.2f<Sum pT< %2.2f, isolated %d\n",
782              ptC,ptLead,fSumPtThreshold,fSumPtThresholdMax,isolated);
783   }
784   else if( fICMethod == kPtFracIC )
785   {
786     if(nfrac == 0 ) isolated = kTRUE ;
787   }
788   else if( fICMethod == kSumPtFracIC )
789   {
790     //when the fPtFraction*ptC < fSumPtThreshold then consider the later case
791     // printf("photon analysis IsDataMC() ?%i\n",IsDataMC());
792     if( fFracIsThresh )
793     {
794       if( fPtFraction*ptC < fSumPtThreshold  && coneptsum < fSumPtThreshold ) isolated  =  kTRUE ;
795       if( fPtFraction*ptC > fSumPtThreshold  && coneptsum < fPtFraction*ptC ) isolated  =  kTRUE ;
796     }
797     else 
798     {
799       if( coneptsum < fPtFraction*ptC ) isolated  =  kTRUE ;
800     }
801   }
802   else if( fICMethod == kSumDensityIC )
803   {    
804     // Get good cell density (number of active cells over all cells in cone)
805     // and correct energy in cone
806     
807     Float_t cellDensity = GetCellDensity(pCandidate,reader);
808     
809     if( coneptsum < fSumPtThreshold*cellDensity )
810       isolated = kTRUE;
811   }
812   else if( fICMethod == kSumBkgSubIC )
813   {
814     Double_t coneptsumBkg = 0.;
815     Float_t  etaBandPtSumTrackNorm   = 0;
816     Float_t  phiBandPtSumTrackNorm   = 0;
817     Float_t  etaBandPtSumClusterNorm = 0;
818     Float_t  phiBandPtSumClusterNorm = 0;
819     
820     Float_t  excessFracEtaTrack   = 1;
821     Float_t  excessFracPhiTrack   = 1;
822     Float_t  excessFracEtaCluster = 1;
823     Float_t  excessFracPhiCluster = 1;
824     
825     // Normalize background to cone area
826     if     (fPartInCone != kOnlyCharged       )
827       CalculateUEBandClusterNormalization(reader, etaC, phiC,
828                                           phiBandPtSumCluster    , etaBandPtSumCluster,
829                                           phiBandPtSumClusterNorm, etaBandPtSumClusterNorm,
830                                           excessFracEtaCluster   , excessFracPhiCluster    );
831     if     (fPartInCone != kOnlyNeutral       )
832       CalculateUEBandTrackNormalization(reader, etaC, phiC,
833                                           phiBandPtSumTrack    , etaBandPtSumTrack  ,
834                                           phiBandPtSumTrackNorm, etaBandPtSumTrackNorm,
835                                           excessFracEtaTrack   , excessFracPhiTrack    );
836     
837     if     (fPartInCone == kOnlyCharged       ) coneptsumBkg = etaBandPtSumTrackNorm;
838     else if(fPartInCone == kOnlyNeutral       ) coneptsumBkg = etaBandPtSumClusterNorm;
839     else if(fPartInCone == kNeutralAndCharged ) coneptsumBkg = etaBandPtSumClusterNorm + etaBandPtSumTrackNorm;
840     
841     //coneptsumCluster*=(coneBadCellsCoeff*excessFracEtaCluster*excessFracPhiCluster) ; // apply this correction earlier???
842     // line commented out in last modif!!!
843     
844     coneptsum = coneptsumCluster+coneptsumTrack;
845     
846     coneptsum -= coneptsumBkg;
847     
848     if( coneptsum > fSumPtThreshold && coneptsum < fSumPtThresholdMax )
849       isolated  =  kFALSE ;
850     else
851       isolated  =  kTRUE  ;
852
853   }
854   
855 }
856
857 //_____________________________________________________
858 void AliIsolationCut::Print(const Option_t * opt) const
859 {
860   
861   //Print some relevant parameters set for the analysis
862   if(! opt)
863     return;
864   
865   printf("**** Print %s %s **** \n", GetName(), GetTitle() ) ;
866   
867   printf("IC method          =     %d\n",    fICMethod   ) ; 
868   printf("Cone Size          =     %1.2f\n", fConeSize   ) ; 
869   printf("pT threshold       =     >%2.1f;<%2.1f\n", fPtThreshold   ,   fPtThresholdMax) ;
870   printf("Sum pT threshold   =     >%2.1f;<%2.1f\n", fSumPtThreshold,fSumPtThresholdMax) ;
871   printf("pT fraction        =     %3.1f\n", fPtFraction ) ;
872   printf("particle type in cone =  %d\n",    fPartInCone ) ;
873   printf("using fraction for high pt leading instead of frac ? %i\n",fFracIsThresh);
874   printf("    \n") ;
875   
876
877
878 //___________________________________________________________________________
879 Float_t AliIsolationCut::Radius(Float_t etaC, Float_t phiC,
880                                 Float_t eta , Float_t phi) const
881 {
882   // Calculate the distance to trigger from any particle
883
884   Float_t dEta = etaC-eta;
885   Float_t dPhi = phiC-phi;
886   
887   if(TMath::Abs(dPhi) >= TMath::Pi()) 
888     dPhi = TMath::TwoPi()-TMath::Abs(dPhi);
889   
890   return TMath::Sqrt( dEta*dEta + dPhi*dPhi );
891   
892 }
893
894
895