]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - PWG/CaloTrackCorrBase/AliIsolationCut.cxx
fix the filling of the pt of the leading particle in the cone
[u/mrichter/AliRoot.git] / PWG / CaloTrackCorrBase / AliIsolationCut.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 //_________________________________________________________________________
17 // Class containing methods for the isolation cut. 
18 // An AOD candidate (AliAODPWG4ParticleCorrelation type)
19 // is passed. Look in a cone around the candidate and study
20 // the hadronic activity inside to decide if the candidate is isolated
21 //
22 //
23 //*-- Author: Gustavo Conesa (LNF-INFN) 
24
25 //-Yaxian Mao (add the possibility for different IC method with different pt range, 01/10/2010)
26 //-Yaxian Mao (check the candidate particle is the leading particle or not at the same hemishere)
27
28 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
29   
30   
31 // --- ROOT system --- 
32 #include <TLorentzVector.h>
33 #include <TObjArray.h>
34
35 // --- AliRoot system --- 
36 #include "AliIsolationCut.h" 
37 #include "AliAODPWG4ParticleCorrelation.h"
38 #include "AliEMCALGeometry.h"
39 #include "AliEMCALGeoParams.h"
40 #include "AliCalorimeterUtils.h"
41 #include "AliAODTrack.h"
42 #include "AliVCluster.h"
43 #include "AliCaloTrackReader.h"
44 #include "AliMixedEvent.h"
45 #include "AliCaloPID.h"
46
47 ClassImp(AliIsolationCut)
48   
49 //____________________________________
50 AliIsolationCut::AliIsolationCut() : 
51 TObject(),
52 fConeSize(0.),
53 fPtThreshold(0.),
54 fPtThresholdMax(10000.), 
55 fSumPtThreshold(0.),
56 fSumPtThresholdMax(10000.),
57 fPtFraction(0.),
58 fICMethod(0),
59 fPartInCone(0),
60 fDebug(-1),
61 fFracIsThresh(1)
62 {
63   //default ctor
64   
65   //Initialize parameters
66   InitParameters();
67   
68 }
69
70 //_________________________________________________________________________________________________________________________________
71 void AliIsolationCut::CalculateUEBandClusterNormalization(AliCaloTrackReader * /*reader*/, Float_t   etaC, Float_t /*phiC*/,
72                                                            Float_t   phiUEptsumCluster,     Float_t   etaUEptsumCluster,
73                                                            Float_t & phiUEptsumClusterNorm, Float_t & etaUEptsumClusterNorm,
74                                                            Float_t & excessFracEta,         Float_t & excessFracPhi         ) const
75 {
76   // Normalize cluster background band
77   
78   Float_t coneA     = fConeSize*fConeSize*TMath::Pi(); // A = pi R^2, isolation cone area
79   
80   //Careful here if EMCal limits changed .. 2010 (4 SM) to 2011-12 (10 SM), for the moment consider 100 deg in phi
81   Float_t emcEtaSize = 0.7*2; // TO FIX
82   Float_t emcPhiSize = TMath::DegToRad()*100.; // TO FIX
83   
84   /* //Catherine code
85    if(((((2*fConeSize*emcPhiSize)-coneA))*phiBandBadCellsCoeff)!=0)phiUEptsumClusterNorm = phiUEptsumCluster*(coneA*coneBadCellsCoeff / (((2*fConeSize*emcPhiSize)-coneA))*phiBandBadCellsCoeff); // pi * R^2 / (2 R * 2 100 deg) -  trigger cone
86    if(((((2*(fConeSize-excess)*emcPhiSize)-(coneA-excessFracEta))*etaBandBadCellsCoeff))!=0)phiUEptsumClusterNorm = phiUEptsumCluster*(coneA *coneBadCellsCoeff/ (((2*(fConeSize-excess)*emcPhiSize)-(coneA/excessFracEta))*etaBandBadCellsCoeff));
87    if(((2*(fConeSize-excess)*emcEtaSize)-(coneA-excessFracPhi))*phiBandBadCellsCoeff!=0) etaUEptsumClusterNorm = etaUEptsumCluster*(coneA*coneBadCellsCoeff / (((2*(fConeSize-excess)*emcEtaSize)-(coneA/excessFracPhi))*phiBandBadCellsCoeff));
88    */
89   
90   if((2*fConeSize*emcPhiSize-coneA)!=0) phiUEptsumClusterNorm = phiUEptsumCluster*(coneA / (((2*fConeSize*emcPhiSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 2 100 deg) -  trigger cone
91   if((2*fConeSize*emcEtaSize-coneA)!=0) etaUEptsumClusterNorm = etaUEptsumCluster*(coneA / (((2*fConeSize*emcEtaSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 2*0.7)  -  trigger cone
92   
93   //out of eta acceptance
94   excessFracEta = 1;
95   excessFracPhi = 1;
96
97   if(TMath::Abs(etaC)+fConeSize > emcEtaSize/2.)
98   {
99     Float_t excess = TMath::Abs(etaC) + fConeSize - emcEtaSize/2.;
100     excessFracEta  = CalculateExcessAreaFraction(excess);
101     
102     if ( excessFracEta != 0) coneA /=  excessFracEta;
103     
104     //UE band is also out of acceptance, need to estimate corrected area
105     if(((2*fConeSize-excess)*emcPhiSize-coneA) != 0 ) phiUEptsumClusterNorm = phiUEptsumCluster*(coneA / ((((2*fConeSize-excess)*emcPhiSize)-coneA)));
106     if(( 2*fConeSize        *emcEtaSize-coneA) != 0 ) etaUEptsumClusterNorm = etaUEptsumCluster*(coneA / ((( 2*fConeSize        *emcEtaSize)-coneA)));
107   }
108   
109 }
110
111 //________________________________________________________________________________________________________________________________
112 void AliIsolationCut::CalculateUEBandTrackNormalization  (AliCaloTrackReader * reader,    Float_t   etaC, Float_t /*phiC*/,
113                                                           Float_t   phiUEptsumTrack,      Float_t   etaUEptsumTrack,
114                                                           Float_t & phiUEptsumTrackNorm,  Float_t & etaUEptsumTrackNorm,
115                                                           Float_t & excessFracEta,        Float_t & excessFracPhi          ) const
116 {
117   // Normalize track background band
118   
119   Float_t coneA     = fConeSize*fConeSize*TMath::Pi(); // A = pi R^2, isolation cone area
120   
121   // Get the cut used for the TPC tracks in the reader, +-0.8, +-0.9 ...
122   // Only valid in simple fidutial cut case and if the cut is applied, careful!
123   Float_t tpcEtaSize = reader->GetFiducialCut()->GetCTSFidCutMaxEtaArray()->At(0) -
124   reader->GetFiducialCut()->GetCTSFidCutMinEtaArray()->At(0) ;
125   Float_t tpcPhiSize = TMath::TwoPi();
126   
127   /*//Catherine code
128    //phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA*coneBadCellsCoeff / (((2*fConeSize*tpcPhiSize)-coneA))*phiBandBadCellsCoeff); // pi * R^2 / (2 R * 2 pi) -  trigger cone
129    //etaUEptsumTrackNorm = etaUEptsumTrack*(coneA*coneBadCellsCoeff / (((2*fConeSize*tpcEtaSize)-coneA))*etaBandBadCellsCoeff); // pi * R^2 / (2 R * 1.6)  -  trigger cone
130    if((2*fConeSize*tpcPhiSize-coneA)!=0)phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA / (((2*fConeSize*tpcPhiSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 2 pi) -  trigger cone
131    if((2*fConeSize*tpcEtaSize-coneA)!=0)etaUEptsumTrackNorm = etaUEptsumTrack*(coneA / (((2*fConeSize*tpcEtaSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 1.6)  -  trigger cone
132    if((2*(fConeSize-excess)*tpcPhiSize)-(coneA-excessFracEta)!=0)phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA / (((2*(fConeSize-excess)*tpcPhiSize)-(coneA/excessFracEta))));
133    */ //end Catherine code
134   
135   //correct out of eta acceptance
136   excessFracEta = 1;
137   excessFracPhi = 1;
138
139   if((2*fConeSize*tpcPhiSize-coneA)!=0) phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA / (((2*fConeSize*tpcPhiSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 2 pi) -  trigger cone
140   if((2*fConeSize*tpcEtaSize-coneA)!=0) etaUEptsumTrackNorm = etaUEptsumTrack*(coneA / (((2*fConeSize*tpcEtaSize)-coneA))); // pi * R^2 / (2 R * 1.6)  -  trigger cone
141   
142   if(TMath::Abs(etaC)+fConeSize > tpcEtaSize/2.)
143   {
144     Float_t excess = TMath::Abs(etaC) + fConeSize - tpcEtaSize/2.;
145     excessFracEta  = CalculateExcessAreaFraction(excess);
146     if (excessFracEta != 0) coneA /=  excessFracEta;
147     
148     //UE band is also out of acceptance, need to estimate corrected area
149     if(((2*fConeSize-excess)*tpcPhiSize - coneA) !=0 ) phiUEptsumTrackNorm = phiUEptsumTrack*(coneA / ((((2*fConeSize-excess)*tpcPhiSize)-coneA)));
150     if(( 2*fConeSize        *tpcEtaSize - coneA) !=0 ) etaUEptsumTrackNorm = etaUEptsumTrack*(coneA / ((( 2*fConeSize        *tpcEtaSize)-coneA)));
151   }
152   
153 }
154
155 //________________________________________________________________________
156 Float_t AliIsolationCut::CalculateExcessAreaFraction(Float_t excess) const
157 {
158   // Area of a circunference segment segment 1/2 R^2 (angle-sin(angle)), angle = 2*ACos((R-excess)/R)
159   
160   
161   Float_t angle   = 2*TMath::ACos( (fConeSize-excess) / fConeSize );
162   
163   Float_t coneA   = fConeSize*fConeSize*TMath::Pi(); // A = pi R^2, isolation cone area
164   
165   Float_t excessA = fConeSize*fConeSize / 2 * (angle-TMath::Sin(angle));
166   
167   if(coneA > excessA) return coneA / (coneA-excessA);
168   else
169   {
170     printf("AliIsolationCut::CalculateExcessAreaFraction() - Please Check : Excess Track %2.3f, coneA %2.2f,  excessA %2.2f, angle %2.2f,factor %2.2f\n",
171            excess,coneA, excessA, angle*TMath::RadToDeg(), coneA / (coneA-excessA));
172     return  1;
173   }
174 }
175
176 //_______________________________________________________________________________________
177 Float_t AliIsolationCut::GetCellDensity(AliAODPWG4ParticleCorrelation * pCandidate,
178                                         AliCaloTrackReader * reader) const
179 {
180   // Get good cell density (number of active cells over all cells in cone)
181   
182   Double_t coneCells    = 0.; //number of cells in cone with radius fConeSize
183   Double_t coneCellsBad = 0.; //number of bad cells in cone with radius fConeSize
184   Double_t cellDensity  = 1.;
185
186   Float_t phiC  = pCandidate->Phi() ;
187   if(phiC<0) phiC+=TMath::TwoPi();
188   Float_t etaC  = pCandidate->Eta() ;
189   
190   if(pCandidate->GetDetector()=="EMCAL")
191   {
192     AliEMCALGeometry* eGeom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
193     AliCalorimeterUtils *cu = reader->GetCaloUtils();
194     
195     Int_t absId = -999;
196     if (eGeom->GetAbsCellIdFromEtaPhi(etaC,phiC,absId))
197     {
198       //Get absolute (col,row) of candidate
199       Int_t iEta=-1, iPhi=-1, iRCU = -1;      
200       Int_t nSupMod = cu->GetModuleNumberCellIndexes(absId, pCandidate->GetDetector(), iEta, iPhi, iRCU);
201       
202       Int_t colC = iEta;
203       if (nSupMod % 2) colC =  AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols + iEta ;
204       Int_t rowC = iPhi + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(nSupMod/2);
205       
206       Int_t sqrSize = int(fConeSize/0.0143) ; // Size of cell in radians
207       //loop on cells in a square of side fConeSize to check cells in cone    
208       for(Int_t icol = colC-sqrSize; icol < colC+sqrSize;icol++)
209       {
210         for(Int_t irow = rowC-sqrSize; irow < rowC+sqrSize; irow++)
211         {
212           if (Radius(colC, rowC, icol, irow) < sqrSize)
213           {
214             coneCells += 1.;
215             
216             Int_t cellSM  = -999;
217             Int_t cellEta = -999;
218             Int_t cellPhi = -999;
219             if(icol > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols-1) 
220             {
221               cellSM = 0+int(irow/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows)*2;
222               cellEta = icol-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
223               cellPhi = irow-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(cellSM/2);
224             }
225             if(icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols) 
226             {
227               cellSM = 1+int(irow/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows)*2;
228               cellEta = icol;
229               cellPhi = irow-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(cellSM/2);
230             }
231             
232             //Count as bad "cells" out of EMCAL acceptance
233             if(icol < 0 || icol > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols*2 || 
234                irow < 0 || irow > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*16./3) //5*nRows+1/3*nRows
235             {
236               coneCellsBad += 1.;
237             }
238             //Count as bad "cells" marked as bad in the DataBase
239             else if (cu->GetEMCALChannelStatus(cellSM,cellEta,cellPhi)==1) 
240             {
241               coneCellsBad += 1. ;
242             }
243           }
244         }
245       }//end of cells loop
246     }
247     
248     else if(fDebug>0) printf("cluster with bad (eta,phi) in EMCal for energy density calculation\n");
249     
250     if (coneCells > 0.) 
251     {
252       cellDensity = (coneCells-coneCellsBad)/coneCells;
253       //printf("Energy density = %f\n", cellDensity);
254     }
255   }
256
257   return cellDensity;
258   
259 }
260
261 //__________________________________________________________________________________
262 void AliIsolationCut::GetCoeffNormBadCell(AliAODPWG4ParticleCorrelation * pCandidate,
263                                           AliCaloTrackReader * reader,
264                                           Float_t &  coneBadCellsCoeff,
265                                           Float_t &  etaBandBadCellsCoeff,
266                                           Float_t & phiBandBadCellsCoeff)
267 {
268   // Get good cell density (number of active cells over all cells in cone)
269   
270   Double_t coneCells    = 0.; //number of cells in cone with radius fConeSize
271   Double_t phiBandCells = 0.; //number of cells in band phi
272   Double_t etaBandCells = 0.; //number of cells in band eta
273   
274   Float_t phiC  = pCandidate->Phi() ;
275   if(phiC<0) phiC+=TMath::TwoPi();
276   Float_t etaC  = pCandidate->Eta() ;
277   
278   if(pCandidate->GetDetector()=="EMCAL")
279   {
280     AliEMCALGeometry* eGeom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
281     AliCalorimeterUtils *cu = reader->GetCaloUtils();
282     
283     Int_t absId = -999;
284     if (eGeom->GetAbsCellIdFromEtaPhi(etaC,phiC,absId))
285     {
286       //Get absolute (col,row) of candidate
287       Int_t iEta=-1, iPhi=-1, iRCU = -1;
288       Int_t nSupMod = cu->GetModuleNumberCellIndexes(absId, pCandidate->GetDetector(),
289                                                      iEta, iPhi, iRCU);
290       
291       Int_t colC = iEta;
292       if (nSupMod % 2) colC =  AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols + iEta ;
293       Int_t rowC = iPhi + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(nSupMod/2);
294       
295       Int_t sqrSize = int(fConeSize/0.0143) ; // Size of cell in radians
296       for(Int_t icol = 0; icol < 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols-1;icol++)
297       {
298         for(Int_t irow = 0; irow < 5*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows -1; irow++)
299         {
300           //loop on cells in a square of side fConeSize to check cells in cone
301           if     ( Radius(colC, rowC, icol, irow) < sqrSize ) { coneCells    += 1.; }
302           else if( icol>colC-sqrSize  &&  icol<colC+sqrSize ) { phiBandCells += 1 ; }
303           else if( irow>rowC-sqrSize  &&  irow<rowC+sqrSize ) { etaBandCells += 1 ; }
304           
305           Int_t cellSM  = -999;
306           Int_t cellEta = -999;
307           Int_t cellPhi = -999;
308           if(icol > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols-1)
309           {
310             cellSM = 0+int(irow/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows)*2;
311             cellEta = icol-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
312             cellPhi = irow-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(cellSM/2);
313           }
314           if(icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols)
315           {
316             cellSM = 1+int(irow/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows)*2;
317             cellEta = icol;
318             cellPhi = irow-AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*int(cellSM/2);
319           }
320           
321           if( (icol < 0 || icol > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols*2-1 ||
322                irow < 0 || irow > AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows*5 - 1) //5*nRows+1/3*nRows //Count as bad "cells" out of EMCAL acceptance
323              || (cu->GetEMCALChannelStatus(cellSM,cellEta,cellPhi)==1))  //Count as bad "cells" marked as bad in the DataBase
324           {
325             if     ( Radius(colC, rowC, icol, irow) < sqrSize ) coneBadCellsCoeff    += 1.;
326             else if( icol>colC-sqrSize  &&  icol<colC+sqrSize ) phiBandBadCellsCoeff += 1 ;
327                   else if( irow>rowC-sqrSize  &&  irow<rowC+sqrSize ) etaBandBadCellsCoeff += 1 ;
328           }
329         }
330       }//end of cells loop
331     }
332     
333     else if(fDebug > 0) printf("cluster with bad (eta,phi) in EMCal for energy density coeff calculation\n");
334     
335     if (coneCells > 0.)
336     {
337       //   printf("Energy density coneBadCellsCoeff= %.2f coneCells%.2f\n", coneBadCellsCoeff,coneCells);
338       coneBadCellsCoeff = (coneCells-coneBadCellsCoeff)/coneCells;
339       //  printf("coneBadCellsCoeff= %.2f\n", coneBadCellsCoeff);
340     }
341     if (phiBandCells > 0.)
342     {
343       // printf("Energy density phiBandBadCellsCoeff = %.2f phiBandCells%.2f\n", phiBandBadCellsCoeff,phiBandCells);
344       phiBandBadCellsCoeff = (phiBandCells-phiBandBadCellsCoeff)/phiBandCells;
345       // printf("phiBandBadCellsCoeff = %.2f\n", phiBandBadCellsCoeff);
346     }
347     if (etaBandCells > 0.)
348     {
349       //printf("Energy density etaBandBadCellsCoeff = %.2f etaBandCells%.2f\n", etaBandBadCellsCoeff,etaBandCells);
350       etaBandBadCellsCoeff = (etaBandCells-etaBandBadCellsCoeff)/etaBandCells;
351       // printf("etaBandBadCellsCoeff = %.2f\n",etaBandBadCellsCoeff);
352     }
353     
354   }
355   
356 }
357
358 //____________________________________________
359 TString AliIsolationCut::GetICParametersList()
360 {
361   //Put data member values in string to keep in output container
362   
363   TString parList ; //this will be list of parameters used for this analysis.
364   const Int_t buffersize = 255;
365   char onePar[buffersize] ;
366   
367   snprintf(onePar,buffersize,"--- AliIsolationCut ---\n") ;
368   parList+=onePar ;     
369   snprintf(onePar,buffersize,"fConeSize: (isolation cone size) %1.2f\n",fConeSize) ;
370   parList+=onePar ;
371   snprintf(onePar,buffersize,"fPtThreshold =%1.2f (isolation pt threshold) \n",fPtThreshold) ;
372   parList+=onePar ;
373   snprintf(onePar,buffersize,"fPtFraction=%1.2f (isolation pt threshold fraction ) \n",fPtFraction) ;
374   parList+=onePar ;
375   snprintf(onePar,buffersize,"fICMethod=%d (isolation cut case) \n",fICMethod) ;
376   parList+=onePar ;
377   snprintf(onePar,buffersize,"fPartInCone=%d \n",fPartInCone) ;
378   parList+=onePar ;
379  snprintf(onePar,buffersize,"fFracIsThresh=%i \n",fFracIsThresh) ;
380   parList+=onePar ;
381  
382   return parList; 
383 }
384
385 //____________________________________
386 void AliIsolationCut::InitParameters()
387 {
388   //Initialize the parameters of the analysis.
389   
390   fConeSize       = 0.4 ; 
391   fPtThreshold    = 0.5  ;
392   fPtThresholdMax = 10000.  ;
393   fSumPtThreshold    = 1.0 ;
394   fSumPtThresholdMax = 10000. ;
395   fPtFraction     = 0.1 ;
396   fPartInCone     = kNeutralAndCharged;
397   fICMethod       = kSumPtIC; // 0 pt threshol method, 1 cone pt sum method
398   fFracIsThresh   = 1; 
399 }
400
401 //________________________________________________________________________________
402 void  AliIsolationCut::MakeIsolationCut(TObjArray * plCTS, 
403                                         TObjArray * plNe, 
404                                         AliCaloTrackReader * reader, 
405                                         AliCaloPID * pid,
406                                         Bool_t bFillAOD,
407                                         AliAODPWG4ParticleCorrelation  *pCandidate, 
408                                         TString aodArrayRefName,
409                                         Int_t   & n, 
410                                         Int_t   & nfrac, 
411                                         Float_t & coneptsum,  
412                                         Bool_t  & isolated) const
413 {
414   //Search in cone around a candidate particle if it is isolated 
415   Float_t ptC   = pCandidate->Pt() ;
416   Float_t phiC  = pCandidate->Phi() ;
417   if(phiC<0) phiC+=TMath::TwoPi();
418   Float_t etaC  = pCandidate->Eta() ;
419   
420   Float_t ptLead = -100. ;
421   Float_t pt     = -100. ;
422   Float_t eta    = -100. ;
423   Float_t phi    = -100. ;
424   Float_t rad    = -100. ;
425   
426   Float_t coneptsumCluster = 0;
427   Float_t coneptsumTrack   = 0;
428   
429   Float_t  etaBandPtSumTrack   = 0;
430   Float_t  phiBandPtSumTrack   = 0;
431   Float_t  etaBandPtSumCluster = 0;
432   Float_t  phiBandPtSumCluster = 0;
433   
434   n         = 0 ;
435   nfrac     = 0 ;
436   isolated  = kFALSE;
437   
438   if(fDebug>0) 
439   {
440     printf("AliIsolationCut::MakeIsolationCut() - Cadidate pT %2.2f, eta %2.2f, phi %2.2f, cone %1.2f, thres %2.2f, Fill AOD? %d",
441            pCandidate->Pt(), pCandidate->Eta(), pCandidate->Phi()*TMath::RadToDeg(), fConeSize,fPtThreshold,bFillAOD);
442     if(plCTS) printf(", nTracks %d"  ,plCTS->GetEntriesFast());
443     if(plNe)  printf(", nClusters %d",plNe ->GetEntriesFast());
444     
445     printf("\n");
446   }
447   
448   //Initialize the array with refrences
449   TObjArray * refclusters  = 0x0;
450   TObjArray * reftracks    = 0x0;
451   Int_t       ntrackrefs   = 0;
452   Int_t       nclusterrefs = 0;
453   
454   //Check charged particles in cone.
455   if(plCTS && 
456      (fPartInCone==kOnlyCharged || fPartInCone==kNeutralAndCharged))
457   {
458     TVector3 p3;
459     for(Int_t ipr = 0;ipr < plCTS->GetEntries() ; ipr ++ )
460     {
461       AliVTrack* track = dynamic_cast<AliVTrack*>(plCTS->At(ipr)) ; 
462       
463       if(track)
464       {
465         //Do not count the candidate (pion, conversion photon) or the daughters of the candidate
466         if(track->GetID() == pCandidate->GetTrackLabel(0) || track->GetID() == pCandidate->GetTrackLabel(1) || 
467            track->GetID() == pCandidate->GetTrackLabel(2) || track->GetID() == pCandidate->GetTrackLabel(3)   ) continue ;
468         
469         p3.SetXYZ(track->Px(),track->Py(),track->Pz());
470         pt  = p3.Pt();
471         eta = p3.Eta();
472         phi = p3.Phi() ;
473       }
474       else
475       {// Mixed event stored in AliAODPWG4Particles
476         AliAODPWG4Particle * trackmix = dynamic_cast<AliAODPWG4Particle*>(plCTS->At(ipr)) ; 
477         if(!trackmix)
478         {
479           printf("AliIsolationCut::MakeIsolationCut() - Wrong track data type, continue\n");
480           continue;
481         }
482         
483         pt  = trackmix->Pt();
484         eta = trackmix->Eta();
485         phi = trackmix->Phi() ;
486       }
487
488       if( phi < 0 ) phi+=TMath::TwoPi();
489       
490       rad = Radius(etaC, phiC, eta, phi);
491       
492       // ** For the background out of cone **
493       
494       if(rad > fConeSize)
495       {
496         if(eta > (etaC-fConeSize) && eta < (etaC+fConeSize)) phiBandPtSumTrack += pt;
497         if(phi > (phiC-fConeSize) && phi < (phiC+fConeSize)) etaBandPtSumTrack += pt;
498       }
499       
500       // ** For the isolated particle **
501       
502       // Only loop the particle at the same side of candidate
503       if(TMath::Abs(phi-phiC) > TMath::PiOver2()) continue ;
504       
505       // If at the same side has particle larger than candidate, 
506       // then candidate can not be the leading, skip such events
507       if(pt > ptC)
508       {
509         n         = -1;
510         nfrac     = -1;
511         coneptsumTrack = -1;
512         isolated  = kFALSE;
513         
514         pCandidate->SetLeadingParticle(kFALSE);
515         
516         if(bFillAOD && reftracks) 
517         {
518           reftracks->Clear(); 
519           delete reftracks;
520         }
521         
522         return ;
523       }
524       
525       // // Check if there is any particle inside cone with pt larger than  fPtThreshold
526       // Check if the leading particule inside the cone has a ptLead larger than fPtThreshold
527       
528       if( fDebug > 0 )
529         printf("\t track %d, pT %2.2f, eta %1.2f, phi %2.2f, R candidate %2.2f", ipr,pt,eta,phi,rad);
530       
531       if(rad < fConeSize)
532       {
533         if(fDebug > 0)  printf(" -  inside candidate cone");
534         
535         if(bFillAOD)
536         {
537           ntrackrefs++;
538           if(ntrackrefs == 1)
539           {
540             reftracks = new TObjArray(0);
541             //reftracks->SetName(Form("Tracks%s",aodArrayRefName.Data()));
542             TString tempo(aodArrayRefName)  ; 
543             tempo += "Tracks" ; 
544             reftracks->SetName(tempo);
545             reftracks->SetOwner(kFALSE);
546           }
547           reftracks->Add(track);
548         }
549         
550         coneptsumTrack+=pt;
551
552         if( ptLead < pt ) ptLead = pt;
553
554 //        // *Before*, count particles in cone
555 //        if(pt > fPtThreshold && pt < fPtThresholdMax)  n++;
556 //        
557 //        //if fPtFraction*ptC<fPtThreshold then consider the fPtThreshold directly
558 //        if(fFracIsThresh)
559 //        {
560 //          if( fPtFraction*ptC < fPtThreshold )
561 //          {
562 //            if( pt > fPtThreshold )    nfrac++ ;
563 //          }
564 //          else
565 //          {
566 //            if( pt > fPtFraction*ptC ) nfrac++;
567 //          }
568 //        }
569 //        else
570 //        {
571 //          if( pt > fPtFraction*ptC ) nfrac++;
572 //        }
573
574       } // Inside cone
575       
576       if( fDebug > 0 )  printf("\n");
577       
578     }// charged particle loop
579     
580   }//Tracks
581   
582   
583   //Check neutral particles in cone.  
584   if(plNe &&
585      (fPartInCone==kOnlyNeutral || fPartInCone==kNeutralAndCharged))
586   {
587     TLorentzVector mom ;
588     
589     for(Int_t ipr = 0;ipr < plNe->GetEntries() ; ipr ++ )
590     {
591       AliVCluster * calo = dynamic_cast<AliVCluster *>(plNe->At(ipr)) ;
592       
593       if(calo)
594       {
595         //Get the index where the cluster comes, to retrieve the corresponding vertex
596         Int_t evtIndex = 0 ; 
597         if (reader->GetMixedEvent()) 
598           evtIndex=reader->GetMixedEvent()->EventIndexForCaloCluster(calo->GetID()) ; 
599         
600         
601         //Do not count the candidate (photon or pi0) or the daughters of the candidate
602         if(calo->GetID() == pCandidate->GetCaloLabel(0) || 
603            calo->GetID() == pCandidate->GetCaloLabel(1)   ) continue ;      
604         
605         //Skip matched clusters with tracks in case of neutral+charged analysis
606         if( fPartInCone == kNeutralAndCharged && 
607            pid->IsTrackMatched(calo,reader->GetCaloUtils(),reader->GetInputEvent()) ) continue ;
608         
609         //Assume that come from vertex in straight line
610         calo->GetMomentum(mom,reader->GetVertex(evtIndex)) ;
611         
612         pt  = mom.Pt()  ;
613         eta = mom.Eta() ;
614         phi = mom.Phi() ;
615       }
616       else 
617       {// Mixed event stored in AliAODPWG4Particles
618         AliAODPWG4Particle * calomix = dynamic_cast<AliAODPWG4Particle*>(plNe->At(ipr)) ; 
619         if(!calomix)
620         {
621           printf("AliIsolationCut::MakeIsolationCut() - Wrong calo data type, continue\n");
622           continue;
623         }
624         
625         pt  = calomix->Pt();
626         eta = calomix->Eta();
627         phi = calomix->Phi() ;
628       }
629       
630       if( phi < 0 ) phi+=TMath::TwoPi();
631       
632       rad = Radius(etaC, phiC, eta, phi);
633       
634       // ** For the background out of cone **
635       
636       if(rad > fConeSize)
637       {
638         if(eta > (etaC-fConeSize) && eta < (etaC+fConeSize)) phiBandPtSumCluster += pt;
639         if(phi > (phiC-fConeSize) && phi < (phiC+fConeSize)) etaBandPtSumCluster += pt;
640       }
641       
642       // ** For the isolated particle **
643       
644       // Only loop the particle at the same side of candidate
645       if(TMath::Abs(phi-phiC)>TMath::PiOver2()) continue ;
646       
647       // If at the same side has particle larger than candidate, 
648       // then candidate can not be the leading, skip such events
649       if(pt > ptC)
650       {
651         n         = -1;
652         nfrac     = -1;
653         coneptsumCluster = -1;
654         isolated  = kFALSE;
655         
656         pCandidate->SetLeadingParticle(kFALSE);
657         
658         if(bFillAOD)
659         {
660           if(reftracks)
661           {  
662             reftracks  ->Clear();
663             delete reftracks;
664           }
665           
666           if(refclusters)
667           {
668             refclusters->Clear(); 
669             delete refclusters;
670           }
671         }
672         return ;
673       }
674       
675       //Check if there is any particle inside cone with pt larger than  fPtThreshold
676       
677       if(fDebug > 0 ) 
678         printf("\t cluster %d, pT %2.2f, eta %1.2f, phi %2.2f, R candidate %2.2f", ipr,pt,eta,phi,rad);
679       
680       if(rad < fConeSize)
681       {
682         if(fDebug > 0 )  printf(" - inside candidate cone");
683         
684         if(bFillAOD) 
685         {
686           nclusterrefs++;
687           if(nclusterrefs==1)
688           {
689             refclusters = new TObjArray(0);
690             //refclusters->SetName(Form("Clusters%s",aodArrayRefName.Data()));
691             TString tempo(aodArrayRefName)  ; 
692             tempo += "Clusters" ; 
693             refclusters->SetName(tempo);
694             refclusters->SetOwner(kFALSE);
695           }
696           refclusters->Add(calo);
697         }
698         
699         coneptsumCluster+=pt;
700         
701         if( ptLead < pt ) ptLead = pt;
702         
703 //        // *Before*, count particles in cone
704 //        if(pt > fPtThreshold && pt < fPtThresholdMax)  n++;
705 //
706 //        //if fPtFraction*ptC<fPtThreshold then consider the fPtThreshold directly
707 //        if(fFracIsThresh)
708 //        {
709 //          if( fPtFraction*ptC < fPtThreshold )
710 //          {
711 //            if( pt > fPtThreshold )    nfrac++ ;
712 //          }
713 //          else 
714 //          {
715 //            if( pt > fPtFraction*ptC ) nfrac++;
716 //          }
717 //        }
718 //        else
719 //        {
720 //          if( pt > fPtFraction*ptC ) nfrac++;
721 //        }
722         
723       }//in cone
724       
725       if(fDebug > 0 )  printf("\n");
726     
727     }// neutral particle loop
728     
729   }//neutrals
730   
731   //Add reference arrays to AOD when filling AODs only
732   if(bFillAOD)
733   {
734     if(refclusters)     pCandidate->AddObjArray(refclusters);
735     if(reftracks)         pCandidate->AddObjArray(reftracks);
736   }
737   
738   coneptsum = coneptsumCluster + coneptsumTrack;
739
740   // *Now*, just check the leading particle in the cone if the threshold is passed
741   if(ptLead > fPtThreshold && ptLead < fPtThresholdMax)  n = 1;
742   
743   //if fPtFraction*ptC<fPtThreshold then consider the fPtThreshold directly
744   if(fFracIsThresh)
745   {
746     if( fPtFraction*ptC < fPtThreshold )
747     {
748       if( ptLead > fPtThreshold )    nfrac = 1 ;
749     }
750     else
751     {
752       if( ptLead > fPtFraction*ptC ) nfrac = 1;
753     }
754   }
755   else
756   {
757     if( ptLead > fPtFraction*ptC ) nfrac = 1;
758   }
759   
760   //-------------------------------------------------------------------
761   //Check isolation, depending on selected isolation criteria requested
762   
763   if( fICMethod == kPtThresIC)
764   {
765     if( n == 0 ) isolated = kTRUE ;
766   }
767   else if( fICMethod == kSumPtIC )
768   {
769     if( coneptsum > fSumPtThreshold &&
770         coneptsum < fSumPtThresholdMax )
771       isolated  =  kFALSE ;
772     else
773       isolated  =  kTRUE  ;
774   }
775   else if( fICMethod == kPtFracIC )
776   {
777     if(nfrac == 0 ) isolated = kTRUE ;
778   }
779   else if( fICMethod == kSumPtFracIC )
780   {
781     //when the fPtFraction*ptC < fSumPtThreshold then consider the later case
782     // printf("photon analysis IsDataMC() ?%i\n",IsDataMC());
783     if( fFracIsThresh )
784     {
785       if( fPtFraction*ptC < fSumPtThreshold  && coneptsum < fSumPtThreshold ) isolated  =  kTRUE ;
786       if( fPtFraction*ptC > fSumPtThreshold  && coneptsum < fPtFraction*ptC ) isolated  =  kTRUE ;
787     }
788     else 
789     {
790       if( coneptsum < fPtFraction*ptC ) isolated  =  kTRUE ;
791     }
792   }
793   else if( fICMethod == kSumDensityIC )
794   {    
795     // Get good cell density (number of active cells over all cells in cone)
796     // and correct energy in cone
797     
798     Float_t cellDensity = GetCellDensity(pCandidate,reader);
799     
800     if( coneptsum < fSumPtThreshold*cellDensity )
801       isolated = kTRUE;
802   }
803   else if( fICMethod == kSumBkgSubIC )
804   {
805     Double_t coneptsumBkg = 0.;
806     Float_t  etaBandPtSumTrackNorm   = 0;
807     Float_t  phiBandPtSumTrackNorm   = 0;
808     Float_t  etaBandPtSumClusterNorm = 0;
809     Float_t  phiBandPtSumClusterNorm = 0;
810     
811     Float_t  excessFracEtaTrack   = 1;
812     Float_t  excessFracPhiTrack   = 1;
813     Float_t  excessFracEtaCluster = 1;
814     Float_t  excessFracPhiCluster = 1;
815     
816     // Normalize background to cone area
817     if     (fPartInCone != kOnlyCharged       )
818       CalculateUEBandClusterNormalization(reader, etaC, phiC,
819                                           phiBandPtSumCluster    , etaBandPtSumCluster,
820                                           phiBandPtSumClusterNorm, etaBandPtSumClusterNorm,
821                                           excessFracEtaCluster   , excessFracPhiCluster    );
822     if     (fPartInCone != kOnlyNeutral       )
823       CalculateUEBandTrackNormalization(reader, etaC, phiC,
824                                           phiBandPtSumTrack    , etaBandPtSumTrack  ,
825                                           phiBandPtSumTrackNorm, etaBandPtSumTrackNorm,
826                                           excessFracEtaTrack   , excessFracPhiTrack    );
827     
828     if     (fPartInCone == kOnlyCharged       ) coneptsumBkg = etaBandPtSumTrackNorm;
829     else if(fPartInCone == kOnlyNeutral       ) coneptsumBkg = etaBandPtSumClusterNorm;
830     else if(fPartInCone == kNeutralAndCharged ) coneptsumBkg = etaBandPtSumClusterNorm + etaBandPtSumTrackNorm;
831     
832     //coneptsumCluster*=(coneBadCellsCoeff*excessFracEtaCluster*excessFracPhiCluster) ; // apply this correction earlier???
833     // line commented out in last modif!!!
834     
835     coneptsum = coneptsumCluster+coneptsumTrack;
836     
837     coneptsum -= coneptsumBkg;
838     
839     if( coneptsum > fSumPtThreshold && coneptsum < fSumPtThresholdMax )
840       isolated  =  kFALSE ;
841     else
842       isolated  =  kTRUE  ;
843
844   }
845   
846 }
847
848 //_____________________________________________________
849 void AliIsolationCut::Print(const Option_t * opt) const
850 {
851   
852   //Print some relevant parameters set for the analysis
853   if(! opt)
854     return;
855   
856   printf("**** Print %s %s **** \n", GetName(), GetTitle() ) ;
857   
858   printf("IC method          =     %d\n",    fICMethod   ) ; 
859   printf("Cone Size          =     %1.2f\n", fConeSize   ) ; 
860   printf("pT threshold       =     %2.1f\n", fPtThreshold) ;
861   printf("pT fraction        =     %3.1f\n", fPtFraction ) ;
862   printf("particle type in cone =  %d\n",    fPartInCone ) ;
863   printf("using fraction for high pt leading instead of frac ? %i\n",fFracIsThresh);
864   printf("    \n") ;
865   
866
867
868 //___________________________________________________________________________
869 Float_t AliIsolationCut::Radius(Float_t etaC, Float_t phiC,
870                                 Float_t eta , Float_t phi) const
871 {
872   // Calculate the distance to trigger from any particle
873
874   Float_t dEta = etaC-eta;
875   Float_t dPhi = phiC-phi;
876   
877   if(TMath::Abs(dPhi) >= TMath::Pi()) 
878     dPhi = TMath::TwoPi()-TMath::Abs(dPhi);
879   
880   return TMath::Sqrt( dEta*dEta + dPhi*dPhi );
881   
882 }
883
884
885