PWG/FLOW/Tasks/AliFlowTrackCuts.h

   1 /* Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. */
   2 /* See cxx source for full Copyright notice */
   3 /* $Id$ */
   4
   5 // AliFlowTrackESDCuts:
   6 // A cut class for ESD, AOD and MC particles for the flow framework
   7 // author: Mikolaj Krzewicki (mikolaj.krzewicki@cern.ch)
   8 // mods:   Redmer A. Bertens (rbertens@cern.ch)
   9
  10 #ifndef ALIFLOWTRACKCUTS_H
  11 #define ALIFLOWTRACKCUTS_H
  12
  13 #include <TMatrix.h>
  14 #include <TList.h>
  15 #include "AliFlowTrackSimpleCuts.h"
  16 #include "AliFlowTrackSimple.h"
  17 #include "AliESDtrackCuts.h"
  18 #include "TMCProcess.h"
  19 #include "AliESDtrack.h"
  20 #include "AliMuonTrackCuts.h"  // XZhang 20120604
  21 #include "AliPID.h"
  22 #include "AliESDpid.h"
  23
  24 class TBrowser;
  25 class AliVParticle;
  26 class AliMCParticle;
  27 class AliFlowTrack;
  28 class AliMCEvent;
  29 class AliInputEventHandler;
  30 class AliVEvent;
  31 class AliMultiplicity;
  32 class AliAODTracklets;  // XZhang 20120615
  33 class AliAODTrack;
  34 class AliESDtrack;
  35 class AliESDPmdTrack;
  36 class AliFlowBayesianPID;
  37 class AliESDkink;
  38 class AliESDv0;
  39 class AliESDVZERO;
  40
  41 class AliFlowTrackCuts : public AliFlowTrackSimpleCuts {
  42
  43  public:
  44   AliFlowTrackCuts();
  45   AliFlowTrackCuts(const char* name);
  46   AliFlowTrackCuts(const AliFlowTrackCuts& someCuts);
  47   AliFlowTrackCuts& operator=(const AliFlowTrackCuts& someCuts);
  48   virtual ~AliFlowTrackCuts();
  49
  50   static AliFlowTrackCuts* GetStandardTPCStandaloneTrackCuts();
  51   static AliFlowTrackCuts* GetStandardTPCStandaloneTrackCuts2010();
  52   static AliFlowTrackCuts* GetStandardGlobalTrackCuts2010();
  53   static AliFlowTrackCuts* GetStandardITSTPCTrackCuts2009(Bool_t selPrimaries=kTRUE);
  54   static AliFlowTrackCuts* GetStandardVZEROOnlyTrackCuts();
  55   static AliFlowTrackCuts* GetStandardVZEROOnlyTrackCuts2010();
  56   static AliFlowTrackCuts* GetStandardVZEROOnlyTrackCuts2011();
  57   static AliFlowTrackCuts* GetStandardMuonTrackCuts(Bool_t isMC=kFALSE, Int_t passN=2);  // XZhang 20120604
  58
  59   Int_t Count(AliVEvent* event=NULL);
  60
  61   enum trackParameterType { kMC,
  62                             kGlobal,
  63                             kTPCstandalone,
  64                             kSPDtracklet,
  65                             kPMD,
  66                             kV0,    //neutral reconstructed v0 particle
  67                             kVZERO, //forward VZERO detector
  68                             kMUON,  // XZhang 20120604
  69                             kKink
  70                           };
  71   enum trackParameterMix  { kPure,
  72                             kTrackWithMCkine,
  73                             kTrackWithMCPID,
  74                             kTrackWithMCpt,
  75                             kTrackWithPtFromFirstMother,
  76                             kTrackWithTPCInnerParams,
  77                             kTrackWithTPCstandalone
  78                           };
  79   enum PIDsource {
  80                    kTPCpid,      // default TPC pid (via GetTPCpid)
  81                    kTOFpid,      // default TOF pid (via GetTOFpid)
  82                    kTOFbayesian, // TOF bayesian pid (F.Noferini)
  83                    kTOFbeta,     // asymmetric cuts of TOF beta signal
  84                    kTPCdedx,      // asymmetric cuts of TPC dedx signal
  85                    kTOFbetaSimple, //simple TOF only cut
  86                    kTPCbayesian, //bayesian cutTPC
  87                                kTPCNuclei    // added by Natasha for Nuclei
  88                    };
  89
  90   //setters (interface to AliESDtrackCuts)
  91   void SetMinNClustersTPC( Int_t a ) {fCutNClustersTPC=kTRUE; fNClustersTPCMin=a;}
  92   void SetMinNClustersITS( Int_t a ) {fCutNClustersITS=kTRUE; fNClustersITSMin=a;}
  93   void SetClusterRequirementITS( AliESDtrackCuts::Detector det,
  94                                  AliESDtrackCuts::ITSClusterRequirement req = AliESDtrackCuts::kOff )
  95                                  { InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetClusterRequirementITS(det,req); }
  96   void SetMaxChi2PerClusterTPC( Float_t a ) {fMaxChi2PerClusterTPC=a;fCutChi2PerClusterTPC=kTRUE;}
  97   void SetMinChi2PerClusterTPC( Float_t a ) {fMinChi2PerClusterTPC=a;fCutChi2PerClusterTPC=kTRUE;}
  98   void SetMaxChi2PerClusterITS( Float_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxChi2PerClusterITS(a);}
  99   void SetRequireTPCRefit( Bool_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireTPCRefit(a);}
 100   void SetRequireTPCStandAlone( Bool_t a) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireTPCStandAlone(a);}
 101   void SetRequireITSRefit( Bool_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireITSRefit(a);}
 102   void SetRequireITSStandAlone( Bool_t a) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireITSStandAlone(a);}
 103   void SetAcceptKinkDaughters( Bool_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetAcceptKinkDaughters(a);}
 104   void SetMaxDCAToVertexZ( Float_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxDCAToVertexZ(a);fCutDCAToVertexZ=kTRUE;}
 105   void SetMaxDCAToVertexXY( Float_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxDCAToVertexXY(a);fCutDCAToVertexXY=kTRUE;}
 106   void SetMaxDCAToVertexXYPtDep( const char* a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxDCAToVertexXYPtDep(a);}
 107   void SetRequireSigmaToVertex(Bool_t a) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireSigmaToVertex(a);}
 108   void SetMaxNsigmaToVertex(Float_t sigma=1e10) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxNsigmaToVertex(sigma); }
 109   void SetDCAToVertex2D( Bool_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetDCAToVertex2D(a);}
 110   void SetEtaRange( Float_t r1, Float_t r2 ) { SetEtaMin(r1); SetEtaMax(r2); }
 111   void SetPtRange( Float_t r1, Float_t r2 ) { SetPtMin(r1); SetPtMax(r2); }
 112   void SetRequireCharge( Bool_t r ) {fRequireCharge=r;}
 113   void SetFakesAreOK( Bool_t b ) {fFakesAreOK=b;}
 114   void SetSPDtrackletDeltaPhiMax( Double_t m ) {fSPDtrackletDeltaPhiMax=m; fCutSPDtrackletDeltaPhi=kTRUE;}
 115   void SetSPDtrackletDeltaPhiMin( Double_t m ) {fSPDtrackletDeltaPhiMin=m; fCutSPDtrackletDeltaPhi=kTRUE;}
 116   void SetIgnoreTPCzRange( Double_t min, Double_t max )
 117                          { fIgnoreTPCzRange=kTRUE; fIgnoreTPCzRangeMin=min; fIgnoreTPCzRangeMax=max; }
 118   void SetAODfilterBit( UInt_t a ) {fAODFilterBit = a; fUseAODFilterBit = kTRUE;}
 119   void SetMinimalTPCdedx(Double_t d=10.) {fMinimalTPCdedx=d; fCutMinimalTPCdedx=kTRUE;}
 120   void SetPmdDetPlane(Int_t pmdDet){fCutPmdDet=kTRUE; fPmdDet = pmdDet; }
 121   void SetPmdAdc(Float_t pmdAdc){fCutPmdAdc=kTRUE; fPmdAdc = pmdAdc; }
 122   void SetPmdNcell(Float_t pmdNcell) {fCutPmdNcell=kTRUE; fPmdNcell = pmdNcell; }
 123   void SetPriors(Float_t centr = 0); // set my favourite priors for Bayesian PID (requested if Bayesian PID is used)
 124
 125   AliMuonTrackCuts *GetMuonTrackCuts() { InitMuonCuts(); return fMuonTrackCuts; }                           // XZhang 20121014
 126   void SetStandardMuonTrackCuts()      { InitMuonCuts(); fMuonTrackCuts->SetDefaultFilterMask(); return; }  // XZhang 20120604
 127   void SetIsMuonMC(Bool_t isMC)        { InitMuonCuts(); fMuonTrackCuts->SetIsMC(isMC);          return; }  // XZhang 20120604
 128   void SetMuonPassNumber(Int_t passN)  { InitMuonCuts(); fMuonTrackCuts->SetPassNumber(passN);   return; }  // XZhang 20121013
 129   void SetRunsMuon(const AliInputEventHandler* eventHandler) { if (fMuonTrackCuts) fMuonTrackCuts->SetRun(eventHandler); }  // XZhang 20120604
 130
 131   void SetForceTPCstandalone(Bool_t b) {fForceTPCstandalone=b;}
 132
 133   //Kinks
 134   void SetMinKinkAngle(Double_t a) {fMinKinkAngle=a;}
 135   void SetMinKinkRadius(Double_t r) {fMinKinkRadius=r;}
 136   void SetMaxKinkRAdius(Double_t r) {fMaxKinkRadius=r;}
 137   void SetMinKinkQt(Double_t m) {fMinKinkQt=m;}
 138   void SetMaxKinkQt(Double_t m) {fMaxKinkQt=m;}
 139   void SetMaxKinkInvMassKmu(Double_t m) {fMaxKinkInvMassKmu=m;}
 140   void SetMinKinkInvMassKmu(Double_t m) {fMinKinkInvMassKmu=m;}
 141
 142   Double_t GetMinKinkAngle() const {return fMinKinkAngle;}
 143   Double_t GetMinKinkRadius() const {return fMinKinkRadius;}
 144   Double_t GetMaxKinkRadius() const {return fMaxKinkRadius;}
 145   Double_t GetMinKinkQt() const {return fMinKinkQt;}
 146   Double_t GetMaxKinkQt() const {return fMaxKinkQt;}
 147   Double_t GetMaxKinkInvMassKmu() const {return fMaxKinkInvMassKmu;}
 148   Double_t GetMinKinkInvMassKmu() const {return fMinKinkInvMassKmu;}
 149
 150   Int_t GetMinNClustersTPC() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMinNClusterTPC();}
 151   Int_t GetMinNClustersITS() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMinNClustersITS();}
 152   AliESDtrackCuts::ITSClusterRequirement GetClusterRequirementITS( AliESDtrackCuts::Detector det ) const
 153                                  {if (!fAliESDtrackCuts) return AliESDtrackCuts::kOff;  return fAliESDtrackCuts->GetClusterRequirementITS(det); }
 154   Float_t GetMaxChi2PerClusterTPC() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxChi2PerClusterTPC();}
 155   Float_t GetMaxChi2PerClusterITS() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxChi2PerClusterITS();}
 156   Bool_t GetRequireTPCRefit() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireTPCRefit();}
 157   Bool_t GetRequireTPCStandAlone() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireTPCStandAlone();}
 158   Bool_t GetRequireITSRefit() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireITSRefit();}
 159   Bool_t GetRequireITSStandAlone() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireITSStandAlone();}
 160   Bool_t GetAcceptKinkDaughters() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetAcceptKinkDaughters();}
 161   Float_t GetMaxDCAToVertexZ() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxDCAToVertexZ();}
 162   Float_t GetMaxDCAToVertexXY() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxDCAToVertexXY();}
 163   const char* GetMaxDCAToVertexXYPtDep() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxDCAToVertexXYPtDep();}
 164   Bool_t GetRequireSigmaToVertex() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireSigmaToVertex();}
 165   Float_t GetMaxNsigmaToVertex() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxNsigmaToVertex(); }
 166   Bool_t GetDCAToVertex2D() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetDCAToVertex2D();}
 167   void GetEtaRange( Float_t& r1, Float_t& r2 ) const { r1=GetEtaMin(); r2=GetEtaMax(); }
 168   void GetPtRange( Float_t& r1, Float_t& r2 ) const { r1=GetPtMin(); r2=GetPtMax(); }
 169   Bool_t GetRequireCharge() const {return fRequireCharge;}
 170   Bool_t GetFakesAreOK() const {return fFakesAreOK;}
 171   Double_t GetSPDtrackletDeltaPhiMax() const {return fSPDtrackletDeltaPhiMax;}
 172   Double_t GetSPDtrackletDeltaPhiMin() const {return fSPDtrackletDeltaPhiMin;}
 173   UInt_t GetAODFilterBit() const {if (!fUseAODFilterBit) return 0; return fAODFilterBit;}
 174   Double_t GetMinimalTPCdedx() const {return fMinimalTPCdedx;}
 175   Int_t GetPmdDetPlane()const {return fPmdDet; }
 176   Float_t GetPmdAdc()const {return fPmdAdc;}
 177   Float_t GetPmdNcell() const {return fPmdNcell; }
 178   Float_t GetBeta(const AliVTrack* t);
 179   Float_t Getdedx(const AliESDtrack* t) const;
 180   Float_t GetBayesianProb() const {return fProbBayes;};
 181   AliFlowBayesianPID* GetBayesianResponse() const {return  fBayesianResponse;}
 182
 183   Bool_t GetForceTPCstandalone() const {return fForceTPCstandalone;}
 184
 185   void SetQA(Bool_t b=kTRUE) {if (b) DefineHistograms();}
 186   TList* GetQA() const {return fQA;}
 187   TH1* QAbefore(Int_t i) {return static_cast<TH1*>(static_cast<TList*>(fQA->At(0))->At(i));}
 188   TH1* QAafter(Int_t i) {return static_cast<TH1*>(static_cast<TList*>(fQA->At(1))->At(i));}
 189
 190   //MC stuff
 191   void SetIgnoreSignInMCPID( Bool_t b=kTRUE ) {fIgnoreSignInMCPID=b;}
 192   void SetCutMC( Bool_t b=kTRUE );
 193   void SetCutMChasTrackReferences(Bool_t b=kTRUE) {fCutMChasTrackReferences=b;}
 194   void SetMCprocessType( TMCProcess t ) { fMCprocessType = t; fCutMCprocessType=kTRUE; SetCutMC();}
 195   void SetMCisPrimary( Bool_t b=kTRUE ) { fMCisPrimary=b; fCutMCisPrimary=kTRUE; SetCutMC();}
 196   void SetMCPID( Int_t pid ) { fMCPID=pid; fCutMCPID=kTRUE; SetCutMC(); }
 197   void SetMCfirstMotherPID( Int_t pid ) { fMCfirstMotherPID=pid; fCutMCfirstMotherPID=kTRUE; SetCutMC(); }
 198   TMCProcess GetMCprocessType() const { return fMCprocessType; }
 199   Bool_t GetMCisPrimary() const {return fMCisPrimary;}
 200   Int_t GetMCPID() const {return fMCPID;}
 201   void SetRequireTransportBitForPrimaries(Bool_t b) {fRequireTransportBitForPrimaries=b; SetCutMC();}
 202
 203   void SetParamType(trackParameterType paramType) {fParamType=paramType;}
 204   trackParameterType GetParamType() const {return fParamType;}
 205   static const char* GetParamTypeName(trackParameterType type);
 206   void SetParamMix(trackParameterMix paramMix) {fParamMix=paramMix;}
 207   trackParameterMix GetParamMix() const {return fParamMix;}
 208
 209   virtual Bool_t IsSelected(TObject* obj, Int_t id=-666);
 210   virtual Bool_t IsSelectedMCtruth(TObject* obj, Int_t id=-666);
 211   AliVParticle* GetTrack() const {return fTrack;}
 212   AliMCParticle* GetMCparticle() const {return fMCparticle;}
 213   //AliFlowTrack* MakeFlowTrack() const;
 214   Bool_t FillFlowTrack(AliFlowTrack* track) const;
 215   //FillFlowTrackV0(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const
 216   AliFlowTrack* FillFlowTrack(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
 217   Bool_t IsPhysicalPrimary() const;
 218   static Bool_t IsPhysicalPrimary(AliMCEvent* p, Int_t label, Bool_t requiretransported=kTRUE);
 219
 220   void SetMCevent(AliMCEvent* mcEvent) {fMCevent=mcEvent;}
 221   AliMCEvent* GetMCevent() const {return fMCevent;}
 222   void SetEvent(AliVEvent* event, AliMCEvent* mcEvent=NULL);
 223   AliVEvent* GetEvent() const {return fEvent;}
 224   Int_t GetNumberOfInputObjects() const;
 225   TObject* GetInputObject(Int_t i);
 226   void Clear(Option_t* option="");
 227   void ClearTrack(Option_t* option="");
 228
 229   Double_t GetPmdEta(Float_t xPos, Float_t yPos, Float_t zPos);
 230   Double_t GetPmdPhi(Float_t xPos, Float_t yPos);
 231
 232   //PID
 233   void SetPID(AliPID::EParticleType pid, PIDsource s=kTOFpid, Double_t prob=0.9)
 234              {fParticleID=pid; fPIDsource=s; fParticleProbability=prob; fCutPID=kTRUE; InitPIDcuts();}
 235   AliPID::EParticleType GetParticleID() const {return fParticleID;}
 236   Bool_t GetCutPID() const {return fCutPID;}
 237   void SetTPCpidCuts(const TMatrixF* mat) {fTPCpidCuts=new TMatrixF(*mat);}
 238   void SetTOFpidCuts(const TMatrixF* mat) {fTOFpidCuts=new TMatrixF(*mat);}
 239   static const char* PIDsourceName(PIDsource s);
 240   AliESDpid& GetESDpid() {return fESDpid;}
 241   void SetAllowTOFmismatchFlag(Bool_t b=kTRUE) {fAllowTOFmismatchFlag=b;}
 242   Bool_t GetAllowTOFmismatchFlag() const {return fAllowTOFmismatchFlag;}
 243   void SetRequireStrictTOFTPCagreement(Bool_t b=kTRUE) {fRequireStrictTOFTPCagreement=b;}
 244   Bool_t GetRequireStrictTOFTPCagreement() const {return fRequireStrictTOFTPCagreement;}
 245   void SetRejectElectronsWithTPCpid(Bool_t b=kTRUE) {fCutRejectElectronsWithTPCpid=b;}
 246   void SetLinearizeVZEROresponse( Bool_t b=kTRUE ) {fLinearizeVZEROresponse=b;}
 247
 248   //these should maybe be protected
 249   Bool_t PassesCuts(AliVParticle* track);
 250   Bool_t PassesESDcuts(AliESDtrack* track);
 251   Bool_t PassesAODcuts(const AliAODTrack* track, Bool_t passFid=kTRUE);
 252   Bool_t PassesPMDcuts(const AliESDPmdTrack* track);
 253   Bool_t PassesVZEROcuts(Int_t id);
 254   Bool_t PassesCuts(const AliFlowTrackSimple* track);
 255   Bool_t PassesCuts(const AliMultiplicity* track, Int_t id);
 256   Bool_t PassesCuts(const AliAODTracklets* track, Int_t id);  // XZhang 20120615
 257   Bool_t PassesCuts(const AliESDkink* kink);
 258   Bool_t PassesCuts(const AliESDv0* v0);
 259   Bool_t PassesMCcuts();
 260   Bool_t PassesMCcuts(AliMCEvent* mcevent, Int_t label);
 261   Bool_t PassesTPCdedxCut(const AliESDtrack* track);
 262   Bool_t PassesTPCbayesianCut(const AliESDtrack* track);
 263   Bool_t PassesTPCpidCut(const AliESDtrack* track) const;
 264   Bool_t PassesTOFbetaCut(const AliESDtrack* track);
 265   Bool_t PassesTOFbetaSimpleCut(const AliESDtrack* track);
 266   Bool_t PassesTOFpidCut(const AliESDtrack* track) const;
 267   Bool_t PassesESDpidCut(const AliESDtrack* track);
 268   Bool_t PassesAODpidCut(const AliAODTrack* track);
 269   Bool_t PassesMuonCuts(AliVParticle* track);  // XZhang 20120604
 270   Bool_t PassesTPCbayesianCut(const AliAODTrack* track);
 271   Bool_t PassesTOFbayesianCut(const AliAODTrack* track);
 272   Bool_t PassesTOFbetaCut(const AliAODTrack* track);
 273
 274   void Browse(TBrowser* b);
 275   Long64_t Merge(TCollection* list);
 276
 277   //gain equalization and recentering
 278   void SetVZEROgainEqualisation(TH1* g) {fVZEROgainEqualization=g;}
 279   void SetVZEROApol(Int_t ring, Float_t f) {fVZEROApol[ring]=f;}
 280   void SetVZEROCpol(Int_t ring, Float_t f) {fVZEROCpol[ring]=f;}
 281   // set the flag for recentering (which is done in AliFlowEvent)
 282   void SetApplyRecentering(Bool_t r)    { fApplyRecentering = r; }
 283   Bool_t GetApplyRecentering() const    { return fApplyRecentering;}
 284   void SetVZEROgainEqualizationPerRing(Bool_t s)   {fVZEROgainEqualizationPerRing = s;}
 285   Bool_t GetVZEROgainEqualizationPerRing() const {return fVZEROgainEqualizationPerRing;}
 286   // exclude vzero rings: 0 through 7 can be excluded by calling this setter multiple times
 287   // 0 corresponds to segment ID 0 through 7, etc
 288   // disabled vzero rings get weight 0
 289   void SetUseVZERORing(Int_t i, Bool_t u) {
 290       fUseVZERORing[i] = u;
 291       fVZEROgainEqualizationPerRing = kTRUE;       // must be true for this option
 292   }
 293   Bool_t GetUseVZERORing(Int_t i) const {return fUseVZERORing[i];}
 294
 295  protected:
 296   //AliFlowTrack* MakeFlowTrackSPDtracklet() const;
 297   //AliFlowTrack* MakeFlowTrackPMDtrack() const;
 298   //AliFlowTrack* MakeFlowTrackVZERO() const;
 299   //AliFlowTrack* MakeFlowTrackVParticle() const;
 300   Bool_t FillFlowTrackVParticle(AliFlowTrack* t) const;
 301   Bool_t FillFlowTrackGeneric(AliFlowTrack* t) const;
 302   AliFlowTrack* FillFlowTrackKink(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
 303   AliFlowTrack* FillFlowTrackVZERO(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
 304   AliFlowTrack* FillFlowTrackGeneric(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
 305   AliFlowTrack* FillFlowTrackVParticle(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
 306   void HandleESDtrack(AliESDtrack* track);
 307   void HandleVParticle(AliVParticle* track);
 308   void DefineHistograms();
 309   void InitPIDcuts();
 310   void InitESDcuts() {if (!fAliESDtrackCuts) {fAliESDtrackCuts=new AliESDtrackCuts();}}
 311   void InitMuonCuts() { if (!fMuonTrackCuts)  fMuonTrackCuts  =new AliMuonTrackCuts("StdMuCuts","StdMuCuts"); return; }  // XZhang 20120604
 312   // part added by F. Noferini
 313   Bool_t PassesTOFbayesianCut(const AliESDtrack* track);
 314   Bool_t PassesNucleiSelection(const AliESDtrack* track);   // added by Natasha
 315   Bool_t TPCTOFagree(const AliVTrack *track);
 316   // end part added by F. Noferini
 317
 318   //the cuts
 319   AliESDtrackCuts* fAliESDtrackCuts; //alianalysis cuts
 320   AliMuonTrackCuts* fMuonTrackCuts;  // muon selection cuts // XZhang 20120604
 321   TList* fQA;                        //qa histograms go here
 322   Bool_t fCutMC;                     //do we cut on MC?
 323   Bool_t fCutMChasTrackReferences;   //did we leave a trace in the detector?
 324   Bool_t fCutMCprocessType;          //do we cut on mc process type?
 325   TMCProcess fMCprocessType;         //mc process type
 326   Bool_t fCutMCPID;                  //cut on MC pid?
 327   Int_t fMCPID;                      //MC PID
 328   Bool_t fCutMCfirstMotherPID;       //cut on PID of first mother?
 329   Int_t fMCfirstMotherPID;           //PID of the first mother of track
 330   Bool_t fIgnoreSignInMCPID;           //when MC PID cut is set, pass also the antiparticle
 331   Bool_t fCutMCisPrimary;            //do we cut on primaryness?
 332   Bool_t fRequireTransportBitForPrimaries; //require the transport bit to be set for primaries
 333   Bool_t fMCisPrimary;               //is MC primary
 334   Bool_t fRequireCharge;          //is charged?
 335   Bool_t fFakesAreOK;             //are fakes (negative labels) ok?
 336   Bool_t fCutSPDtrackletDeltaPhi; //are we cutting on the trcklet deltaphi?
 337   Double_t fSPDtrackletDeltaPhiMax; //maximal deltaphi for tracklets
 338   Double_t fSPDtrackletDeltaPhiMin; //minimal deltaphi for tracklets
 339   Bool_t fIgnoreTPCzRange;   //ignore tracks going close to central membrane
 340   Double_t fIgnoreTPCzRangeMax; //max z to ignore
 341   Double_t fIgnoreTPCzRangeMin; //min z to ignore
 342   Bool_t fCutChi2PerClusterTPC; //cut on tpc chi2
 343   Float_t fMaxChi2PerClusterTPC; //max chi2 tpc/cluster
 344   Float_t fMinChi2PerClusterTPC; //min chi2 tpc/cluster
 345   Bool_t fCutNClustersTPC;       //cut on clusters?
 346   Int_t fNClustersTPCMax;        //max tpc ncls
 347   Int_t fNClustersTPCMin;        //min tpc clusters
 348   Bool_t fCutNClustersITS;       //cut on clusters?
 349   Int_t fNClustersITSMax;        //max tpc ncls
 350   Int_t fNClustersITSMin;        //min tpc clusters
 351   Bool_t fUseAODFilterBit;       //use AOD filter bit selection?
 352   UInt_t fAODFilterBit;          //AOD filter bit to select
 353   Bool_t fCutDCAToVertexXY;      //dca xy cut
 354   Bool_t fCutDCAToVertexZ;       //dca z cut
 355   Bool_t fCutMinimalTPCdedx;    //cut on minimal dedx in TPC to reject noise tracks
 356   Double_t fMinimalTPCdedx;       //value for minimal TPC dedx
 357   Bool_t fLinearizeVZEROresponse; //linearize VZERO response using AliESDUtil
 358
 359   Bool_t  fCutPmdDet;   //cut on PMD detector plane
 360   Int_t   fPmdDet;      // value of PMD detector plane
 361   Bool_t  fCutPmdAdc;   //cut on cluster ADC
 362   Float_t fPmdAdc;      //value of cluster ADC
 363   Bool_t  fCutPmdNcell; //cut on cluster ncell
 364   Float_t fPmdNcell;    //value of cluster ncell
 365
 366   Double_t fMinKinkAngle; //max kink angle
 367   Double_t fMinKinkRadius; //min kink radius
 368   Double_t fMaxKinkRadius; //max kink radius
 369   Double_t fMinKinkQt; //min kink qt
 370   Double_t fMaxKinkQt; //max kink qt
 371   Double_t fMinKinkInvMassKmu; //max kink inv mass
 372   Double_t fMaxKinkInvMassKmu; //max kink inv mass
 373   Bool_t fForceTPCstandalone; //use TPC parameters when applying cuts on the kink mother
 374   Bool_t fRequireKinkDaughters; //well, the name says it all
 375
 376   trackParameterType fParamType;     //parameter type tu cut on
 377   trackParameterMix fParamMix;       //parameter mixing
 378
 379   AliESDkink* fKink;                 //!placeholder for the current kink
 380   AliESDv0* fV0;                     //!placeholder for the current V0
 381   AliVParticle* fTrack;              //!the track to apply cuts on
 382   Double_t fTrackMass;               //!mass of the particle
 383   Double_t fTrackPt;                 //!track pt
 384   Double_t fTrackPhi;                //!track phi
 385   Double_t fTrackEta;                //!track eta
 386   Double_t fTrackWeight;             //!track weight
 387   Int_t fTrackLabel;                 //!track label, or its absolute value if FakesAreOK
 388   AliMCEvent* fMCevent;              //!mc event
 389   AliMCParticle* fMCparticle;        //!mc particle
 390   AliVEvent* fEvent;                 //!placeholder for current event
 391   AliESDtrack fTPCtrack;             //!placeholder for TPC only track to avoid new/delete on every track
 392
 393   //PID
 394   AliESDpid fESDpid; //pid obj
 395   AliFlowBayesianPID *fBayesianResponse; //! Baysian response with all the TOF tuning (using fESDpid)
 396   PIDsource fPIDsource; //pid source
 397   TMatrixF* fTPCpidCuts; //tpc pid cuts
 398   TMatrixF* fTOFpidCuts; //tof pid cuts
 399   AliPID::EParticleType fParticleID; //alipid
 400   Double_t fParticleProbability; //desired prob for a particle type
 401   Bool_t fAllowTOFmismatchFlag; //allow TOFmismatch flag=1 in ESD
 402   Bool_t fRequireStrictTOFTPCagreement; //require stricter than TOFmismatch flag TOF-TPC agreement
 403   Bool_t fCutRejectElectronsWithTPCpid; //reject electrons with TPC pid
 404
 405   // part added by F. Noferini
 406   static const Int_t fgkPIDptBin = 20; // pT bins for priors
 407   Float_t fC[fgkPIDptBin][5],fBinLimitPID[fgkPIDptBin]; // pt bin limit and priors
 408   Float_t fProbBayes; // bayesian probability
 409   Float_t fCurrCentr; // current centrality used for set the priors
 410   // end part added by F. Noferini
 411
 412   //gain equalization and recentering for vzero
 413   TH1* fVZEROgainEqualization;     //! equalization histo
 414   Bool_t fApplyRecentering;     // apply recentering of q-sub vectors in AliFlowEvent ?
 415   Bool_t fVZEROgainEqualizationPerRing;    // per ring vzero gain calibration
 416   Float_t fVZEROApol[4];           //! calibration info per ring
 417   Float_t fVZEROCpol[4];           //! calibration info per ring
 418   Bool_t fUseVZERORing[8];      // kTRUE means the ring is included
 419   static const Int_t fgkNumberOfVZEROtracks=64; //number of VZERO channels
 420
 421   ClassDef(AliFlowTrackCuts,13)
 422 };
 423
 424 #endif
 425
 426
 427