]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - PWG/FLOW/Tasks/AliFlowTrackCuts.h
fix qa histogram inconsistency (qa histo's were filled before all cuts were applied...
[u/mrichter/AliRoot.git] / PWG / FLOW / Tasks / AliFlowTrackCuts.h
1 /* Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. */
2 /* See cxx source for full Copyright notice */
3 /* $Id$ */
4
5 // AliFlowTrackESDCuts:
6 // A cut class for ESD, AOD and MC particles for the flow framework
7 // author: Mikolaj Krzewicki (mikolaj.krzewicki@cern.ch)
8 // mods:   Redmer A. Bertens (rbertens@cern.ch)
9
10 #ifndef ALIFLOWTRACKCUTS_H
11 #define ALIFLOWTRACKCUTS_H
12
13 #include <TMatrix.h>
14 #include <TList.h>
15 #include "AliFlowTrackSimpleCuts.h"
16 #include "AliFlowTrackSimple.h"
17 #include "AliESDtrackCuts.h"
18 #include "TMCProcess.h"
19 #include "AliESDtrack.h"
20 #include "AliMuonTrackCuts.h"  // XZhang 20120604
21 #include "AliPID.h"
22 #include "AliESDpid.h"
23
24 class TBrowser;
25 class AliVParticle;
26 class AliMCParticle;
27 class AliFlowTrack;
28 class AliMCEvent;
29 class AliInputEventHandler;
30 class AliVEvent;
31 class AliMultiplicity; 
32 class AliAODTracklets;  // XZhang 20120615
33 class AliAODTrack;
34 class AliESDtrack;
35 class AliESDPmdTrack;
36 class AliFlowBayesianPID;
37 class AliESDkink;
38 class AliESDv0;
39 class AliESDVZERO;
40
41 class AliFlowTrackCuts : public AliFlowTrackSimpleCuts {
42
43  public:
44   AliFlowTrackCuts();
45   AliFlowTrackCuts(const char* name);
46   AliFlowTrackCuts(const AliFlowTrackCuts& someCuts);
47   AliFlowTrackCuts& operator=(const AliFlowTrackCuts& someCuts);
48   virtual ~AliFlowTrackCuts();
49
50   static AliFlowTrackCuts* GetStandardTPCStandaloneTrackCuts();
51   static AliFlowTrackCuts* GetStandardTPCStandaloneTrackCuts2010();
52   static AliFlowTrackCuts* GetStandardGlobalTrackCuts2010();
53   static AliFlowTrackCuts* GetStandardITSTPCTrackCuts2009(Bool_t selPrimaries=kTRUE);
54   static AliFlowTrackCuts* GetStandardVZEROOnlyTrackCuts();
55   static AliFlowTrackCuts* GetStandardVZEROOnlyTrackCuts2010();
56   static AliFlowTrackCuts* GetStandardVZEROOnlyTrackCuts2011();
57   static AliFlowTrackCuts* GetStandardMuonTrackCuts(Bool_t isMC=kFALSE, Int_t passN=2);  // XZhang 20120604
58
59   Int_t Count(AliVEvent* event=NULL);
60
61   enum trackParameterType { kMC, 
62                             kGlobal, 
63                             kTPCstandalone, 
64                             kSPDtracklet,
65                             kPMD,
66                             kV0,    //neutral reconstructed v0 particle
67                             kVZERO, //forward VZERO detector
68                             kMUON,  // XZhang 20120604
69                             kKink
70                           };
71   enum trackParameterMix  { kPure, 
72                             kTrackWithMCkine, 
73                             kTrackWithMCPID, 
74                             kTrackWithMCpt, 
75                             kTrackWithPtFromFirstMother,
76                             kTrackWithTPCInnerParams,
77                             kTrackWithTPCstandalone
78                           };
79   enum PIDsource {
80                    kTPCpid,      // default TPC pid (via GetTPCpid)
81                    kTOFpid,      // default TOF pid (via GetTOFpid)
82                    kTOFbayesian, // TOF bayesian pid (F.Noferini)
83                    kTOFbeta,     // asymmetric cuts of TOF beta signal
84                    kTPCdedx,      // asymmetric cuts of TPC dedx signal
85                    kTOFbetaSimple, //simple TOF only cut
86                    kTPCbayesian, //bayesian cutTPC
87                    kTPCNuclei,   // added by Natasha for Nuclei
88                    kTPCTOFNsigma // simple cut on combined tpc tof nsigma
89                    };
90
91   //setters (interface to AliESDtrackCuts)
92   void SetMinNClustersTPC( Int_t a ) {fCutNClustersTPC=kTRUE; fNClustersTPCMin=a;}
93   void SetMinNClustersITS( Int_t a ) {fCutNClustersITS=kTRUE; fNClustersITSMin=a;}
94   void SetClusterRequirementITS( AliESDtrackCuts::Detector det,
95                                  AliESDtrackCuts::ITSClusterRequirement req = AliESDtrackCuts::kOff )
96                                  { InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetClusterRequirementITS(det,req); } 
97   void SetMaxChi2PerClusterTPC( Float_t a ) {fMaxChi2PerClusterTPC=a;fCutChi2PerClusterTPC=kTRUE;}
98   void SetMinChi2PerClusterTPC( Float_t a ) {fMinChi2PerClusterTPC=a;fCutChi2PerClusterTPC=kTRUE;}
99   void SetMaxChi2PerClusterITS( Float_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxChi2PerClusterITS(a);}
100   void SetRequireTPCRefit( Bool_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireTPCRefit(a);}
101   void SetRequireTPCStandAlone( Bool_t a) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireTPCStandAlone(a);}
102   void SetRequireITSRefit( Bool_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireITSRefit(a);}
103   void SetRequireITSStandAlone( Bool_t a) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireITSStandAlone(a);}
104   void SetAcceptKinkDaughters( Bool_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetAcceptKinkDaughters(a);}
105   void SetMaxDCAToVertexZ( Float_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxDCAToVertexZ(a);fCutDCAToVertexZ=kTRUE;}
106   void SetMaxDCAToVertexXY( Float_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxDCAToVertexXY(a);fCutDCAToVertexXY=kTRUE;}
107   void SetMaxDCAToVertexXYPtDep( const char* a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxDCAToVertexXYPtDep(a);}
108   void SetRequireSigmaToVertex(Bool_t a) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetRequireSigmaToVertex(a);}
109   void SetMaxNsigmaToVertex(Float_t sigma=1e10) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetMaxNsigmaToVertex(sigma); }
110   void SetDCAToVertex2D( Bool_t a ) {InitESDcuts(); fAliESDtrackCuts->SetDCAToVertex2D(a);}
111   void SetEtaRange( Float_t r1, Float_t r2 ) { SetEtaMin(r1); SetEtaMax(r2); }
112   void SetPtRange( Float_t r1, Float_t r2 ) { SetPtMin(r1); SetPtMax(r2); }
113   void SetRequireCharge( Bool_t r ) {fRequireCharge=r;}
114   void SetFakesAreOK( Bool_t b ) {fFakesAreOK=b;}
115   void SetSPDtrackletDeltaPhiMax( Double_t m ) {fSPDtrackletDeltaPhiMax=m; fCutSPDtrackletDeltaPhi=kTRUE;}
116   void SetSPDtrackletDeltaPhiMin( Double_t m ) {fSPDtrackletDeltaPhiMin=m; fCutSPDtrackletDeltaPhi=kTRUE;}
117   void SetIgnoreTPCzRange( Double_t min, Double_t max ) 
118                          { fIgnoreTPCzRange=kTRUE; fIgnoreTPCzRangeMin=min; fIgnoreTPCzRangeMax=max; }
119   void SetAODfilterBit( UInt_t a ) {fAODFilterBit = a; fUseAODFilterBit = kTRUE;}                                                
120   void SetMinimalTPCdedx(Double_t d=10.) {fMinimalTPCdedx=d; fCutMinimalTPCdedx=kTRUE;}
121   void SetPmdDetPlane(Int_t pmdDet){fCutPmdDet=kTRUE; fPmdDet = pmdDet; }
122   void SetPmdAdc(Float_t pmdAdc){fCutPmdAdc=kTRUE; fPmdAdc = pmdAdc; }
123   void SetPmdNcell(Float_t pmdNcell) {fCutPmdNcell=kTRUE; fPmdNcell = pmdNcell; }                                                
124   void SetPriors(Float_t centr = 0); // set my favourite priors for Bayesian PID (requested if Bayesian PID is used)
125
126   AliMuonTrackCuts *GetMuonTrackCuts() { InitMuonCuts(); return fMuonTrackCuts; }                           // XZhang 20121014
127   void SetStandardMuonTrackCuts()      { InitMuonCuts(); fMuonTrackCuts->SetDefaultFilterMask(); return; }  // XZhang 20120604
128   void SetIsMuonMC(Bool_t isMC)        { InitMuonCuts(); fMuonTrackCuts->SetIsMC(isMC);          return; }  // XZhang 20120604
129   void SetMuonPassNumber(Int_t passN)  { InitMuonCuts(); fMuonTrackCuts->SetPassNumber(passN);   return; }  // XZhang 20121013
130   void SetRunsMuon(const AliInputEventHandler* eventHandler) { if (fMuonTrackCuts) fMuonTrackCuts->SetRun(eventHandler); }  // XZhang 20120604
131
132   void SetForceTPCstandalone(Bool_t b) {fForceTPCstandalone=b;}
133
134   //Kinks
135   void SetMinKinkAngle(Double_t a) {fMinKinkAngle=a;}
136   void SetMinKinkRadius(Double_t r) {fMinKinkRadius=r;}
137   void SetMaxKinkRAdius(Double_t r) {fMaxKinkRadius=r;}
138   void SetMinKinkQt(Double_t m) {fMinKinkQt=m;}
139   void SetMaxKinkQt(Double_t m) {fMaxKinkQt=m;}
140   void SetMaxKinkInvMassKmu(Double_t m) {fMaxKinkInvMassKmu=m;}
141   void SetMinKinkInvMassKmu(Double_t m) {fMinKinkInvMassKmu=m;}
142
143   Double_t GetMinKinkAngle() const {return fMinKinkAngle;}
144   Double_t GetMinKinkRadius() const {return fMinKinkRadius;}
145   Double_t GetMaxKinkRadius() const {return fMaxKinkRadius;}
146   Double_t GetMinKinkQt() const {return fMinKinkQt;}
147   Double_t GetMaxKinkQt() const {return fMaxKinkQt;}
148   Double_t GetMaxKinkInvMassKmu() const {return fMaxKinkInvMassKmu;}
149   Double_t GetMinKinkInvMassKmu() const {return fMinKinkInvMassKmu;}
150
151   Int_t GetMinNClustersTPC() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMinNClusterTPC();}
152   Int_t GetMinNClustersITS() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMinNClustersITS();}
153   AliESDtrackCuts::ITSClusterRequirement GetClusterRequirementITS( AliESDtrackCuts::Detector det ) const
154                                  {if (!fAliESDtrackCuts) return AliESDtrackCuts::kOff;  return fAliESDtrackCuts->GetClusterRequirementITS(det); } 
155   Float_t GetMaxChi2PerClusterTPC() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxChi2PerClusterTPC();}
156   Float_t GetMaxChi2PerClusterITS() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxChi2PerClusterITS();}
157   Bool_t GetRequireTPCRefit() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireTPCRefit();}
158   Bool_t GetRequireTPCStandAlone() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireTPCStandAlone();}
159   Bool_t GetRequireITSRefit() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireITSRefit();}
160   Bool_t GetRequireITSStandAlone() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireITSStandAlone();}
161   Bool_t GetAcceptKinkDaughters() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetAcceptKinkDaughters();}
162   Float_t GetMaxDCAToVertexZ() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxDCAToVertexZ();}
163   Float_t GetMaxDCAToVertexXY() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxDCAToVertexXY();}
164   const char* GetMaxDCAToVertexXYPtDep() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxDCAToVertexXYPtDep();}
165   Bool_t GetRequireSigmaToVertex() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetRequireSigmaToVertex();}
166   Float_t GetMaxNsigmaToVertex() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetMaxNsigmaToVertex(); }
167   Bool_t GetDCAToVertex2D() const {if (!fAliESDtrackCuts) return 0; return fAliESDtrackCuts->GetDCAToVertex2D();}
168   void GetEtaRange( Float_t& r1, Float_t& r2 ) const { r1=GetEtaMin(); r2=GetEtaMax(); }
169   void GetPtRange( Float_t& r1, Float_t& r2 ) const { r1=GetPtMin(); r2=GetPtMax(); }
170   Bool_t GetRequireCharge() const {return fRequireCharge;}
171   Bool_t GetFakesAreOK() const {return fFakesAreOK;}
172   Double_t GetSPDtrackletDeltaPhiMax() const {return fSPDtrackletDeltaPhiMax;}
173   Double_t GetSPDtrackletDeltaPhiMin() const {return fSPDtrackletDeltaPhiMin;}
174   UInt_t GetAODFilterBit() const {if (!fUseAODFilterBit) return 0; return fAODFilterBit;}
175   Double_t GetMinimalTPCdedx() const {return fMinimalTPCdedx;}
176   Int_t GetPmdDetPlane()const {return fPmdDet; }
177   Float_t GetPmdAdc()const {return fPmdAdc;}
178   Float_t GetPmdNcell() const {return fPmdNcell; }
179   Float_t GetBeta(const AliVTrack* t);
180   Float_t Getdedx(const AliESDtrack* t) const;
181   Float_t GetBayesianProb() const {return fProbBayes;};
182   AliFlowBayesianPID* GetBayesianResponse() const {return  fBayesianResponse;}
183
184   Bool_t GetForceTPCstandalone() const {return fForceTPCstandalone;}
185
186   void SetQA(Bool_t b=kTRUE) {if (b) DefineHistograms();}
187   TList* GetQA() const {return fQA;}
188   TH1* QAbefore(Int_t i) {return static_cast<TH1*>(static_cast<TList*>(fQA->At(0))->At(i));}
189   TH1* QAafter(Int_t i) {return static_cast<TH1*>(static_cast<TList*>(fQA->At(1))->At(i));}  
190
191   //MC stuff
192   void SetIgnoreSignInMCPID( Bool_t b=kTRUE ) {fIgnoreSignInMCPID=b;}
193   void SetCutMC( Bool_t b=kTRUE );
194   void SetCutMChasTrackReferences(Bool_t b=kTRUE) {fCutMChasTrackReferences=b;}
195   void SetMCprocessType( TMCProcess t ) { fMCprocessType = t; fCutMCprocessType=kTRUE; SetCutMC();}
196   void SetMCisPrimary( Bool_t b=kTRUE ) { fMCisPrimary=b; fCutMCisPrimary=kTRUE; SetCutMC();}
197   void SetMCPID( Int_t pid ) { fMCPID=pid; fCutMCPID=kTRUE; SetCutMC(); }
198   void SetMCfirstMotherPID( Int_t pid ) { fMCfirstMotherPID=pid; fCutMCfirstMotherPID=kTRUE; SetCutMC(); }
199   TMCProcess GetMCprocessType() const { return fMCprocessType; }
200   Bool_t GetMCisPrimary() const {return fMCisPrimary;}
201   Int_t GetMCPID() const {return fMCPID;}
202   void SetRequireTransportBitForPrimaries(Bool_t b) {fRequireTransportBitForPrimaries=b; SetCutMC();}
203
204   void SetParamType(trackParameterType paramType) {fParamType=paramType;}
205   trackParameterType GetParamType() const {return fParamType;}
206   static const char* GetParamTypeName(trackParameterType type);
207   void SetParamMix(trackParameterMix paramMix) {fParamMix=paramMix;}
208   trackParameterMix GetParamMix() const {return fParamMix;}
209
210   virtual Bool_t IsSelected(TObject* obj, Int_t id=-666);
211   virtual Bool_t IsSelectedMCtruth(TObject* obj, Int_t id=-666);
212   AliVParticle* GetTrack() const {return fTrack;}
213   AliMCParticle* GetMCparticle() const {return fMCparticle;}
214   //AliFlowTrack* MakeFlowTrack() const;
215   Bool_t FillFlowTrack(AliFlowTrack* track) const;
216   //FillFlowTrackV0(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const
217   AliFlowTrack* FillFlowTrack(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
218   Bool_t IsPhysicalPrimary() const; 
219   static Bool_t IsPhysicalPrimary(AliMCEvent* p, Int_t label, Bool_t requiretransported=kTRUE); 
220   
221   void SetMCevent(AliMCEvent* mcEvent) {fMCevent=mcEvent;}
222   AliMCEvent* GetMCevent() const {return fMCevent;}
223   void SetEvent(AliVEvent* event, AliMCEvent* mcEvent=NULL);
224   AliVEvent* GetEvent() const {return fEvent;}
225   Int_t GetNumberOfInputObjects() const;
226   TObject* GetInputObject(Int_t i);
227   void Clear(Option_t* option="");
228   void ClearTrack(Option_t* option="");
229
230   Double_t GetPmdEta(Float_t xPos, Float_t yPos, Float_t zPos);
231   Double_t GetPmdPhi(Float_t xPos, Float_t yPos);  
232
233   //PID
234   void SetPID(AliPID::EParticleType pid, PIDsource s=kTOFpid, Double_t prob=0.9)
235              {fParticleID=pid; fPIDsource=s; fParticleProbability=prob; fCutPID=kTRUE; InitPIDcuts();}
236   AliPID::EParticleType GetParticleID() const {return fParticleID;}
237   Bool_t GetCutPID() const {return fCutPID;}
238   void SetTPCpidCuts(const TMatrixF* mat) {fTPCpidCuts=new TMatrixF(*mat);}
239   void SetTOFpidCuts(const TMatrixF* mat) {fTOFpidCuts=new TMatrixF(*mat);}
240   static const char* PIDsourceName(PIDsource s);
241   AliESDpid& GetESDpid() {return fESDpid;}
242   void SetAllowTOFmismatchFlag(Bool_t b=kTRUE) {fAllowTOFmismatchFlag=b;}
243   Bool_t GetAllowTOFmismatchFlag() const {return fAllowTOFmismatchFlag;}
244   void SetRequireStrictTOFTPCagreement(Bool_t b=kTRUE) {fRequireStrictTOFTPCagreement=b;}
245   Bool_t GetRequireStrictTOFTPCagreement() const {return fRequireStrictTOFTPCagreement;}
246   void SetRejectElectronsWithTPCpid(Bool_t b=kTRUE) {fCutRejectElectronsWithTPCpid=b;}
247   void SetLinearizeVZEROresponse( Bool_t b=kTRUE ) {fLinearizeVZEROresponse=b;}
248
249   //these should maybe be protected
250   Bool_t PassesCuts(AliVParticle* track);
251   Bool_t PassesESDcuts(AliESDtrack* track);
252   Bool_t PassesAODcuts(const AliAODTrack* track, Bool_t passFid=kTRUE);
253   Bool_t PassesPMDcuts(const AliESDPmdTrack* track);
254   Bool_t PassesVZEROcuts(Int_t id);
255   Bool_t PassesCuts(const AliFlowTrackSimple* track);
256   Bool_t PassesCuts(const AliMultiplicity* track, Int_t id);
257   Bool_t PassesCuts(const AliAODTracklets* track, Int_t id);  // XZhang 20120615
258   Bool_t PassesCuts(const AliESDkink* kink);
259   Bool_t PassesCuts(const AliESDv0* v0);
260   Bool_t PassesMCcuts();
261   Bool_t PassesMCcuts(AliMCEvent* mcevent, Int_t label);
262   Bool_t PassesTPCdedxCut(const AliESDtrack* track);
263   Bool_t PassesTPCbayesianCut(const AliESDtrack* track);
264   Bool_t PassesTPCpidCut(const AliESDtrack* track) const;
265   Bool_t PassesTOFbetaCut(const AliESDtrack* track);
266   Bool_t PassesTOFbetaSimpleCut(const AliESDtrack* track);
267   Bool_t PassesTOFpidCut(const AliESDtrack* track) const;
268   Bool_t PassesESDpidCut(const AliESDtrack* track);
269   Bool_t PassesAODpidCut(const AliAODTrack* track);
270   Bool_t PassesMuonCuts(AliVParticle* track);  // XZhang 20120604
271   Bool_t PassesTPCbayesianCut(const AliAODTrack* track);
272   Bool_t PassesTOFbayesianCut(const AliAODTrack* track);
273   Bool_t PassesTOFbetaCut(const AliAODTrack* track);
274
275   void Browse(TBrowser* b);
276   Long64_t Merge(TCollection* list);
277   
278   //gain equalization and recentering
279   void SetVZEROgainEqualisation(TH1* g) {fVZEROgainEqualization=g;}
280   void SetVZEROApol(Int_t ring, Float_t f) {fVZEROApol[ring]=f;}
281   void SetVZEROCpol(Int_t ring, Float_t f) {fVZEROCpol[ring]=f;}
282   // set the flag for recentering (which is done in AliFlowEvent)
283   void SetApplyRecentering(Bool_t r)    { fApplyRecentering = r; }
284   Bool_t GetApplyRecentering() const    { return fApplyRecentering;}
285   void SetVZEROgainEqualizationPerRing(Bool_t s)   {fVZEROgainEqualizationPerRing = s;}
286   Bool_t GetVZEROgainEqualizationPerRing() const {return fVZEROgainEqualizationPerRing;}
287   // exclude vzero rings: 0 through 7 can be excluded by calling this setter multiple times
288   // 0 corresponds to segment ID 0 through 7, etc
289   // disabled vzero rings get weight 0
290   void SetUseVZERORing(Int_t i, Bool_t u) {
291       fUseVZERORing[i] = u;
292       fVZEROgainEqualizationPerRing = kTRUE;       // must be true for this option
293   }
294   Bool_t GetUseVZERORing(Int_t i) const {return fUseVZERORing[i];}
295
296  protected:
297   //AliFlowTrack* MakeFlowTrackSPDtracklet() const;
298   //AliFlowTrack* MakeFlowTrackPMDtrack() const;
299   //AliFlowTrack* MakeFlowTrackVZERO() const;
300   //AliFlowTrack* MakeFlowTrackVParticle() const;
301   Bool_t FillFlowTrackVParticle(AliFlowTrack* t) const;
302   Bool_t FillFlowTrackGeneric(AliFlowTrack* t) const;
303   AliFlowTrack* FillFlowTrackKink(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
304   AliFlowTrack* FillFlowTrackVZERO(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
305   AliFlowTrack* FillFlowTrackGeneric(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
306   AliFlowTrack* FillFlowTrackVParticle(TObjArray* trackCollection, Int_t trackIndex) const;
307   void HandleESDtrack(AliESDtrack* track);
308   void HandleVParticle(AliVParticle* track);
309   void DefineHistograms();
310   void InitPIDcuts();
311   void InitESDcuts() {if (!fAliESDtrackCuts) {fAliESDtrackCuts=new AliESDtrackCuts();}}
312   void InitMuonCuts() { if (!fMuonTrackCuts)  fMuonTrackCuts  =new AliMuonTrackCuts("StdMuCuts","StdMuCuts"); return; }  // XZhang 20120604
313   // part added by F. Noferini
314   Bool_t PassesTOFbayesianCut(const AliESDtrack* track); 
315   Bool_t PassesNucleiSelection(const AliESDtrack* track);   // added by Natasha
316   Bool_t PassesTPCTOFNsigmaCut(const AliAODTrack* track); 
317   Bool_t PassesTPCTOFNsigmaCut(const AliESDtrack* track);
318   Bool_t TPCTOFagree(const AliVTrack *track);
319   // end part added by F. Noferini
320
321   //the cuts
322   AliESDtrackCuts* fAliESDtrackCuts; //alianalysis cuts
323   AliMuonTrackCuts* fMuonTrackCuts;  // muon selection cuts // XZhang 20120604
324   TList* fQA;                        //qa histograms go here
325   Bool_t fCutMC;                     //do we cut on MC?
326   Bool_t fCutMChasTrackReferences;   //did we leave a trace in the detector?
327   Bool_t fCutMCprocessType;          //do we cut on mc process type?
328   TMCProcess fMCprocessType;         //mc process type
329   Bool_t fCutMCPID;                  //cut on MC pid?
330   Int_t fMCPID;                      //MC PID
331   Bool_t fCutMCfirstMotherPID;       //cut on PID of first mother?
332   Int_t fMCfirstMotherPID;           //PID of the first mother of track
333   Bool_t fIgnoreSignInMCPID;           //when MC PID cut is set, pass also the antiparticle
334   Bool_t fCutMCisPrimary;            //do we cut on primaryness?
335   Bool_t fRequireTransportBitForPrimaries; //require the transport bit to be set for primaries
336   Bool_t fMCisPrimary;               //is MC primary
337   Bool_t fRequireCharge;          //is charged?
338   Bool_t fFakesAreOK;             //are fakes (negative labels) ok?
339   Bool_t fCutSPDtrackletDeltaPhi; //are we cutting on the trcklet deltaphi?
340   Double_t fSPDtrackletDeltaPhiMax; //maximal deltaphi for tracklets
341   Double_t fSPDtrackletDeltaPhiMin; //minimal deltaphi for tracklets
342   Bool_t fIgnoreTPCzRange;   //ignore tracks going close to central membrane
343   Double_t fIgnoreTPCzRangeMax; //max z to ignore
344   Double_t fIgnoreTPCzRangeMin; //min z to ignore
345   Bool_t fCutChi2PerClusterTPC; //cut on tpc chi2
346   Float_t fMaxChi2PerClusterTPC; //max chi2 tpc/cluster
347   Float_t fMinChi2PerClusterTPC; //min chi2 tpc/cluster
348   Bool_t fCutNClustersTPC;       //cut on clusters?
349   Int_t fNClustersTPCMax;        //max tpc ncls
350   Int_t fNClustersTPCMin;        //min tpc clusters  
351   Bool_t fCutNClustersITS;       //cut on clusters?
352   Int_t fNClustersITSMax;        //max tpc ncls
353   Int_t fNClustersITSMin;        //min tpc clusters  
354   Bool_t fUseAODFilterBit;       //use AOD filter bit selection?
355   UInt_t fAODFilterBit;          //AOD filter bit to select
356   Bool_t fCutDCAToVertexXY;      //dca xy cut
357   Bool_t fCutDCAToVertexZ;       //dca z cut
358   Bool_t fCutMinimalTPCdedx;    //cut on minimal dedx in TPC to reject noise tracks
359   Double_t fMinimalTPCdedx;       //value for minimal TPC dedx
360   Bool_t fLinearizeVZEROresponse; //linearize VZERO response using AliESDUtil
361   
362   Bool_t  fCutPmdDet;   //cut on PMD detector plane 
363   Int_t   fPmdDet;      // value of PMD detector plane
364   Bool_t  fCutPmdAdc;   //cut on cluster ADC
365   Float_t fPmdAdc;      //value of cluster ADC
366   Bool_t  fCutPmdNcell; //cut on cluster ncell
367   Float_t fPmdNcell;    //value of cluster ncell
368
369   Double_t fMinKinkAngle; //max kink angle
370   Double_t fMinKinkRadius; //min kink radius
371   Double_t fMaxKinkRadius; //max kink radius
372   Double_t fMinKinkQt; //min kink qt
373   Double_t fMaxKinkQt; //max kink qt
374   Double_t fMinKinkInvMassKmu; //max kink inv mass
375   Double_t fMaxKinkInvMassKmu; //max kink inv mass
376   Bool_t fForceTPCstandalone; //use TPC parameters when applying cuts on the kink mother
377   Bool_t fRequireKinkDaughters; //well, the name says it all
378    
379   trackParameterType fParamType;     //parameter type tu cut on
380   trackParameterMix fParamMix;       //parameter mixing
381   
382   AliESDkink* fKink;                 //!placeholder for the current kink
383   AliESDv0* fV0;                     //!placeholder for the current V0
384   AliVParticle* fTrack;              //!the track to apply cuts on
385   Double_t fTrackMass;               //!mass of the particle
386   Double_t fTrackPt;                 //!track pt
387   Double_t fTrackPhi;                //!track phi
388   Double_t fTrackEta;                //!track eta
389   Double_t fTrackWeight;             //!track weight
390   Int_t fTrackLabel;                 //!track label, or its absolute value if FakesAreOK
391   AliMCEvent* fMCevent;              //!mc event
392   AliMCParticle* fMCparticle;        //!mc particle
393   AliVEvent* fEvent;                 //!placeholder for current event
394   AliESDtrack fTPCtrack;             //!placeholder for TPC only track to avoid new/delete on every track
395
396   //PID
397   AliESDpid fESDpid; //pid obj
398   AliFlowBayesianPID *fBayesianResponse; //! Baysian response with all the TOF tuning (using fESDpid)
399   PIDsource fPIDsource; //pid source
400   TMatrixF* fTPCpidCuts; //tpc pid cuts
401   TMatrixF* fTOFpidCuts; //tof pid cuts
402   AliPID::EParticleType fParticleID; //alipid
403   Double_t fParticleProbability; //desired prob for a particle type
404   Bool_t fAllowTOFmismatchFlag; //allow TOFmismatch flag=1 in ESD
405   Bool_t fRequireStrictTOFTPCagreement; //require stricter than TOFmismatch flag TOF-TPC agreement
406   Bool_t fCutRejectElectronsWithTPCpid; //reject electrons with TPC pid
407
408   // part added by F. Noferini
409   static const Int_t fgkPIDptBin = 20; // pT bins for priors
410   Float_t fC[fgkPIDptBin][5],fBinLimitPID[fgkPIDptBin]; // pt bin limit and priors
411   Float_t fProbBayes; // bayesian probability
412   Float_t fCurrCentr; // current centrality used for set the priors
413   // end part added by F. Noferini
414   
415   //gain equalization and recentering for vzero
416   TH1* fVZEROgainEqualization;     //! equalization histo
417   Bool_t fApplyRecentering;     // apply recentering of q-sub vectors in AliFlowEvent ?
418   Bool_t fVZEROgainEqualizationPerRing;    // per ring vzero gain calibration
419   Float_t fVZEROApol[4];           //! calibration info per ring
420   Float_t fVZEROCpol[4];           //! calibration info per ring
421   Bool_t fUseVZERORing[8];      // kTRUE means the ring is included
422   static const Int_t fgkNumberOfVZEROtracks=64; //number of VZERO channels
423
424   ClassDef(AliFlowTrackCuts,13)
425 };
426
427 #endif
428
429
430