PWG1/ITS/AliAlignmentDataFilterITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-2009, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /////////////////////////////////////////////////////////////
  17 //
  18 // AliAnalysisTask to extract from ESD tracks the AliTrackPointArrays
  19 // with ITS points for selected tracks. This are the input data for alignment
  20 //
  21 // Author: A.Dainese, andrea.dainese@pd.infn.it
  22 /////////////////////////////////////////////////////////////
  23
  24 #include <TTree.h>
  25 #include <TFile.h>
  26 #include <TSystem.h>
  27 #include <TChain.h>
  28 #include <TNtuple.h>
  29 #include <TList.h>
  30 #include <TH1F.h>
  31 #include <TH2F.h>
  32 #include <TMap.h>
  33 #include <TVector3.h>
  34 #include <TGeoManager.h>
  35 #include <TRandom.h>
  36
  37 #include "AliLog.h"
  38 #include "AliCDBEntry.h"
  39 #include "AliGeomManager.h"
  40 #include "AliITSReconstructor.h"
  41 #include "AliITSAlignMille2Module.h"
  42 #include "AliITSgeomTGeo.h"
  43 #include "AliTrackPointArray.h"
  44 #include "AliESDInputHandler.h"
  45 #include "AliESDVertex.h"
  46 #include "AliESDtrack.h"
  47 #include "AliESDEvent.h"
  48 #include "AliESDfriend.h"
  49 #include "AliAnalysisTaskSE.h"
  50 #include "AliAnalysisManager.h"
  51 #include "AliAlignmentDataFilterITS.h"
  52
  53
  54 ClassImp(AliAlignmentDataFilterITS)
  55
  56
  57 //________________________________________________________________________
  58 AliAlignmentDataFilterITS::AliAlignmentDataFilterITS():
  59 AliAnalysisTaskSE(),
  60 fOnlySPDFO(kFALSE),
  61 fDownsamplelowpt(kFALSE),
  62 fGeometryFileName("geometry.root"),
  63 fITSRecoParam(0),
  64 fESD(0),
  65 fListOfHistos(0),
  66 fspTree(0),
  67 fHistNevents(0),
  68 fHistNpoints(0),
  69 fHistPt(0),
  70 fHistLayer0(0),
  71 fHistLayer1(0),
  72 fHistLayer2(0),
  73 fHistLayer3(0),
  74 fHistLayer4(0),
  75 fHistLayer5(0),
  76 fntExtra(0),
  77 fntCosmicMatching(0)
  78 {
  79   // Constructor
  80 }
  81
  82 //________________________________________________________________________
  83 AliAlignmentDataFilterITS::AliAlignmentDataFilterITS(const char *name):
  84 AliAnalysisTaskSE(name),
  85 fOnlySPDFO(kFALSE),
  86 fDownsamplelowpt(kFALSE),
  87 fGeometryFileName("geometry.root"),
  88 fITSRecoParam(0),
  89 fESD(0),
  90 fListOfHistos(0),
  91 fspTree(0),
  92 fHistNevents(0),
  93 fHistNpoints(0),
  94 fHistPt(0),
  95 fHistLayer0(0),
  96 fHistLayer1(0),
  97 fHistLayer2(0),
  98 fHistLayer3(0),
  99 fHistLayer4(0),
 100 fHistLayer5(0),
 101 fntExtra(0),
 102 fntCosmicMatching(0)
 103 {
 104   // Constructor
 105
 106   // Define output slots here
 107
 108   // Output slot #1 writes into a TTree
 109   DefineOutput(1,TTree::Class());  //My private output
 110   // Output slot #2 writes into a TList
 111   DefineOutput(2,TList::Class());  //My private output
 112 }
 113
 114 //________________________________________________________________________
 115 AliAlignmentDataFilterITS::~AliAlignmentDataFilterITS()
 116 {
 117   // Destructor
 118   if (fListOfHistos) {
 119     delete fListOfHistos;
 120     fListOfHistos = 0;
 121   }
 122   if (fspTree) {
 123     delete fspTree;
 124     fspTree = 0;
 125   }
 126   if (fHistNevents) {
 127     delete fHistNevents;
 128     fHistNevents = 0;
 129   }
 130   if (fHistNpoints) {
 131     delete fHistNpoints;
 132     fHistNpoints = 0;
 133   }
 134   if (fHistPt) {
 135     delete fHistPt;
 136     fHistPt = 0;
 137   }
 138   if (fHistLayer0) {
 139     delete fHistLayer0;
 140     fHistLayer0 = 0;
 141   }
 142   if (fHistLayer1) {
 143     delete fHistLayer1;
 144     fHistLayer1 = 0;
 145   }
 146   if (fHistLayer2) {
 147     delete fHistLayer2;
 148     fHistLayer2 = 0;
 149   }
 150   if (fHistLayer3) {
 151     delete fHistLayer3;
 152     fHistLayer3 = 0;
 153   }
 154   if (fHistLayer4) {
 155     delete fHistLayer4;
 156     fHistLayer4 = 0;
 157   }
 158   if (fHistLayer5) {
 159     delete fHistLayer5;
 160     fHistLayer5 = 0;
 161   }
 162   if (fntExtra) {
 163     delete fntExtra;
 164     fntExtra = 0;
 165   }
 166   if (fntCosmicMatching) {
 167     delete fntCosmicMatching;
 168     fntCosmicMatching = 0;
 169   }
 170 }
 171
 172
 173 //________________________________________________________________________
 174 void AliAlignmentDataFilterITS::UserCreateOutputObjects()
 175 {
 176   // Create the output container
 177   //
 178
 179   // load the geometry
 180   if(!gGeoManager) {
 181     printf("AliAlignmentDataFilterITS::CreateOutputObjects(): loading geometry from %s\n",fGeometryFileName.Data());
 182     AliGeomManager::LoadGeometry(fGeometryFileName.Data());
 183     if(!gGeoManager) {
 184       printf("AliAlignmentDataFilterITS::CreateOutputObjects(): no geometry loaded \n");
 185       return;
 186     }
 187   }
 188
 189   // Several histograms are more conveniently managed in a TList
 190   fListOfHistos = new TList();
 191   fListOfHistos->SetOwner();
 192
 193   fHistNevents = new TH1F("fHistNevents", "Number of processed events; N events; bin",5,-0.5,4.5);
 194   fHistNevents->Sumw2();
 195   fHistNevents->SetMinimum(0);
 196   fListOfHistos->Add(fHistNevents);
 197
 198   fHistNpoints = new TH1F("fHistNpoints", "Number of AliTrackPoints per track; N points; tracks",25,-0.5,24.5);
 199   fHistNpoints->Sumw2();
 200   fHistNpoints->SetMinimum(0);
 201   fListOfHistos->Add(fHistNpoints);
 202
 203   fHistPt = new TH1F("fHistPt", "p_{t} of tracks; p_{t} [GeV/c]; tracks",100,0,50);
 204   fHistPt->Sumw2();
 205   fHistPt->SetMinimum(0);
 206   fListOfHistos->Add(fHistPt);
 207
 208
 209   Float_t zmax=14.;
 210   Int_t nbinsphi=20,nbinsz=4;
 211   fHistLayer0 = new TH2F("fHistLayer0","Points in layer inner SPD; global   #phi; global z [cm]",nbinsphi,-3.14,3.14,nbinsz,-zmax,zmax);
 212   fListOfHistos->Add(fHistLayer0);
 213   zmax=14.;
 214   nbinsphi=40;nbinsz=4;
 215   fHistLayer1 = new TH2F("fHistLayer1","Points in layer outer SPD; global   #phi; global z [cm]",nbinsphi,-3.14,3.14,nbinsz,-zmax,zmax);
 216   fListOfHistos->Add(fHistLayer1);
 217   zmax=22.;
 218   nbinsphi=14;nbinsz=6;
 219   fHistLayer2 = new TH2F("fHistLayer2","Points in layer inner SDD; global   #phi; global z [cm]",nbinsphi,-3.14,3.14,nbinsz,-zmax,zmax);
 220   fListOfHistos->Add(fHistLayer2);
 221   zmax=29.5;
 222   nbinsphi=22;nbinsz=8;
 223   fHistLayer3 = new TH2F("fHistLayer3","Points in layer outer SDD; global   #phi; global z [cm]",nbinsphi,-3.14,3.14,nbinsz,-zmax,zmax);
 224   fListOfHistos->Add(fHistLayer3);
 225   zmax=45.;
 226   nbinsphi=34;nbinsz=23;
 227   fHistLayer4 = new TH2F("fHistLayer4","Points in layer inner SSD; global   #phi; global z [cm]",nbinsphi,-3.14,3.14,nbinsz,-zmax,zmax);
 228   fListOfHistos->Add(fHistLayer4);
 229   zmax=51.;
 230   nbinsphi=38;nbinsz=26;
 231   fHistLayer5 = new TH2F("fHistLayer5","Points in layer outer SSD; global   #phi; global z [cm]",nbinsphi,-3.14,3.14,nbinsz,-zmax,zmax);
 232   fListOfHistos->Add(fHistLayer5);
 233
 234
 235   fntExtra = new TNtuple("fntExtra","extra clusters in ITS","ncls:layer:ladder:volid:phi:x:y:z:xloc:zloc:dxy:dz:d0mu:z0mu:pt");
 236   fListOfHistos->Add(fntExtra);
 237
 238   fntCosmicMatching = new TNtuple("fntCosmicMatching","cosmic tracks matching in ITS","ncls1:ncls2:pt1:pt2:sigmad01:sigmad02:sigmaz01:sigmaz02:dxy:dz:phimu:thetamu:d0mu:z0mu");
 239   fListOfHistos->Add(fntCosmicMatching);
 240
 241   fspTree = new TTree("spTree","Tree with ITS track points");
 242   AliTrackPointArray *array = 0;
 243   AliESDVertex *vertex = 0;
 244   Float_t curv=0,curverr=0,runNumber=0;
 245   TObjString *itsaligndata = 0;
 246   TObjString *itscalibrespsdd = 0;
 247   fspTree->Branch("SP","AliTrackPointArray",&array);
 248   fspTree->Branch("vertex","AliESDVertex",&vertex);
 249   fspTree->Branch("curv",&curv);
 250   fspTree->Branch("curverr",&curverr);
 251   fspTree->Branch("run",&runNumber);
 252   fspTree->Branch("ITSAlignData",&itsaligndata);
 253   fspTree->Branch("ITSCalibRespSDD",&itscalibrespsdd);
 254
 255   return;
 256 }
 257
 258 //________________________________________________________________________
 259 void AliAlignmentDataFilterITS::UserExec(Option_t */*option*/)
 260 {
 261   // Execute analysis for current event:
 262   // write ITS AliTrackPoints for selected tracks to fspTree
 263
 264   // check the geometry
 265   if(!gGeoManager) {
 266     printf("AliAlignmentDataFilterITS::Exec(): no geometry loaded \n");
 267     return;
 268   }
 269
 270   // check if we have AliITSRecoParam
 271   if(!GetRecoParam()) {
 272     if(!fITSRecoParam) {
 273       printf("AliAlignmentDataFilterITS::Exec(): no AliITSRecoParam\n");
 274       return;
 275     }
 276   }
 277
 278   fESD = dynamic_cast<AliESDEvent*>(InputEvent());
 279   if(!fESD) {
 280     printf("AliAlignmentDataFilterITS::Exec(): no ESD \n");
 281     return;
 282   }
 283
 284   //AliESDfriend *esdfriend = (AliESDfriend*)(fESD->FindListObject("AliESDfriend"));
 285
 286   //if(!esdfriend) printf("AliAlignmentDataFilterITS::Exec(): no ESDfriend \n");
 287   //fESD->SetESDfriend(esdfriend);
 288
 289   // Post the data for slot 0
 290   fHistNevents->Fill(0);
 291
 292
 293   // write field value to spTree UserInfo
 294   if(!((fspTree->GetUserInfo())->FindObject("BzkGauss"))) {
 295     Double_t bz=fESD->GetMagneticField();
 296     TString bzString; bzString+=bz;
 297     TObjString *bzObjString = new TObjString(bzString);
 298     TList *bzList = new TList();
 299     bzList->SetOwner(1);
 300     bzList->SetName("BzkGauss");
 301     bzList->Add(bzObjString);
 302     fspTree->GetUserInfo()->Add(bzList);
 303   }
 304
 305   // write OCDB info to spTree UserInfo
 306   if(!((fspTree->GetUserInfo())->FindObject("cdbList"))) {
 307     TTree* tree = dynamic_cast<TTree*> (GetInputData(0));
 308     if(!tree) {
 309       printf("ERROR: Could not read chain from input slot 0\n");
 310     } else {
 311       // Get the OCDB path and the list of OCDB objects used for reco
 312       TMap *cdbMap = (TMap*)(tree->GetTree()->GetUserInfo())->FindObject("cdbMap");
 313       TList *cdbList = (TList*)(tree->GetTree()->GetUserInfo())->FindObject("cdbList");
 314
 315       //cdbList->Print();
 316       // write the list to the user info of the output tree
 317       if(!fspTree) {
 318         printf("ERROR: fspTree does not exist\n");
 319       } else {
 320         TMap *cdbMapCopy = new TMap(cdbMap->GetEntries());
 321         cdbMapCopy->SetOwner(1);
 322         cdbMapCopy->SetName("cdbMap");
 323         TIter iter1(cdbMap->GetTable());
 324
 325         TPair* pair = 0;
 326         while((pair = dynamic_cast<TPair*> (iter1.Next()))){
 327           TObjString* keyStr = dynamic_cast<TObjString*> (pair->Key());
 328           TObjString* valStr = dynamic_cast<TObjString*> (pair->Value());
 329           if(keyStr && valStr) cdbMapCopy->Add(new TObjString(keyStr->GetName()), new TObjString(valStr->GetName()));
 330         }
 331
 332         TList *cdbListCopy = new TList();
 333         cdbListCopy->SetOwner(1);
 334         cdbListCopy->SetName("cdbList");
 335
 336         TIter iter2(cdbList);
 337
 338         TObjString* cdbEntry=0;
 339         while((cdbEntry =(TObjString*)(iter2.Next()))) {
 340           cdbListCopy->Add(new TObjString(*cdbEntry));
 341         }
 342         cdbListCopy->Print();
 343
 344
 345         fspTree->GetUserInfo()->Add(cdbMapCopy);
 346         fspTree->GetUserInfo()->Add(cdbListCopy);
 347       }
 348     }
 349   }
 350
 351
 352
 353   // Process event as Cosmic or Collision
 354   if(fESD->GetEventSpecie()<=1) {
 355     printf("AliAlignmentDataFilterITS::Exec(): event specie not set !\n");
 356     if(GetRecoParam()->GetAlignFilterCosmics()) {
 357       FilterCosmic(fESD);
 358     } else {
 359       FilterCollision(fESD);
 360     }
 361   } else if(fESD->GetEventSpecie()==8) {
 362     FilterCosmic(fESD);
 363   } else {
 364     FilterCollision(fESD);
 365   }
 366
 367   PostData(2,fListOfHistos);
 368
 369   return;
 370 }
 371
 372 //________________________________________________________________________
 373 void AliAlignmentDataFilterITS::FilterCosmic(const AliESDEvent *esd)
 374 {
 375   // Extract ITS AliTrackPoints for Cosmics (check angular matching
 376   // of top and bottom track, merge the two tracks, if requested)
 377   //
 378
 379   // Set branch addresses for space points tree
 380   AliTrackPointArray *arrayForTree=0;
 381   AliESDVertex *vertexForTree=0;
 382   Float_t curv,curverr,runNumber;
 383   TObjString *itsaligndata=0;
 384   TObjString *itscalibrespsdd = 0;
 385   fspTree->SetBranchAddress("SP",&arrayForTree);
 386   fspTree->SetBranchAddress("vertex",&vertexForTree);
 387   fspTree->SetBranchAddress("curv",&curv);
 388   fspTree->SetBranchAddress("curverr",&curverr);
 389   fspTree->SetBranchAddress("run",&runNumber);
 390   fspTree->SetBranchAddress("ITSAlignData",&itsaligndata);
 391   fspTree->SetBranchAddress("ITSCalibRespSDD",&itscalibrespsdd);
 392
 393
 394   runNumber = (Float_t)esd->GetRunNumber();
 395   Int_t uid=10000+esd->GetEventNumberInFile();
 396
 397   TTree* esdTree = dynamic_cast<TTree*> (GetInputData(0));
 398   if(!esdTree) return;
 399   // Get the list of OCDB objects used for reco
 400   TList *cdbList = (TList*)(esdTree->GetTree()->GetUserInfo())->FindObject("cdbList");
 401   TIter iter2(cdbList);
 402   TObjString* cdbEntry=0;
 403   TString cdbEntryString;
 404   while((cdbEntry =(TObjString*)(iter2.Next()))) {
 405   cdbEntryString = cdbEntry->GetString();
 406   if(cdbEntryString.Contains("ITS/Align/Data"))
 407     itsaligndata = new TObjString(*cdbEntry);
 408   if(cdbEntryString.Contains("ITS/Calib/RespSDD"))
 409     itscalibrespsdd = new TObjString(*cdbEntry);
 410   }
 411
 412
 413   TString triggeredClass = esd->GetFiredTriggerClasses();
 414   if(fOnlySPDFO && !triggeredClass.Contains("C0SCO-ABCE-NOPF-CENT")) return;
 415
 416
 417   Int_t ntracks = esd->GetNumberOfTracks();
 418   if(ntracks<2) return;
 419
 420   if(esd->GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors()<0) return;
 421
 422   Double_t vtxpos[3]; esd->GetPrimaryVertexSPD()->GetXYZ(vtxpos);
 423
 424   Int_t *goodtracksArray = new Int_t[ntracks];
 425   Float_t *phiArray = new Float_t[ntracks];
 426   Float_t *thetaArray = new Float_t[ntracks];
 427   Int_t *nclsArray = new Int_t[ntracks];
 428   Int_t ngt=0;
 429   Int_t itrack=0;
 430   for (itrack=0; itrack < ntracks; itrack++) {
 431     AliESDtrack *track = esd->GetTrack(itrack);
 432     if (!track) continue;
 433
 434
 435     if(track->GetNcls(0)<GetRecoParam()->GetAlignFilterMinITSPoints()) continue;
 436
 437     if((GetRecoParam()->GetAlignFilterOnlyITSSATracks()) && track->GetNcls(1)>0) continue;
 438     if((GetRecoParam()->GetAlignFilterOnlyITSTPCTracks()) && track->GetNcls(1)==0) continue;
 439
 440     Float_t phi = track->GetAlpha()+TMath::ASin(track->GetSnp());
 441     Float_t theta = 0.5*TMath::Pi()-TMath::ATan(track->GetTgl());
 442
 443     if(track->Pt()<GetRecoParam()->GetAlignFilterMinPt() ||
 444        track->Pt()>GetRecoParam()->GetAlignFilterMaxPt()) continue;
 445
 446     goodtracksArray[ngt] = itrack;
 447     phiArray[ngt]        = phi;
 448     thetaArray[ngt]      = theta;
 449     nclsArray[ngt]       = track->GetNcls(0);
 450     ngt++;
 451   }
 452
 453   if(ngt<2) {
 454     delete [] goodtracksArray; goodtracksArray=0;
 455     delete [] phiArray; phiArray=0;
 456     delete [] thetaArray; thetaArray=0;
 457     delete [] nclsArray; nclsArray=0;
 458     return;
 459   }
 460
 461   // check matching of the two tracks from the muon
 462   Float_t min = 10000000.;
 463   Int_t maxCls = 0;
 464   Int_t good1 = -1, good2 = -1;
 465   for(Int_t itr1=0; itr1<ngt-1; itr1++) {
 466     for(Int_t itr2=itr1+1; itr2<ngt; itr2++) {
 467       Float_t deltatheta = TMath::Abs(TMath::Pi()-thetaArray[itr1]-thetaArray[itr2]);
 468       if(deltatheta>GetRecoParam()->GetAlignFilterMaxMatchingAngle()) continue;
 469       Float_t deltaphi = TMath::Abs(TMath::Abs(phiArray[itr1]-phiArray[itr2])-TMath::Pi());
 470       if(deltaphi>GetRecoParam()->GetAlignFilterMaxMatchingAngle()) continue;
 471       if(nclsArray[itr1]+nclsArray[itr2] > maxCls) {
 472         maxCls = nclsArray[itr1]+nclsArray[itr2];
 473         min = deltatheta+deltaphi;
 474         good1 = goodtracksArray[itr1];
 475         good2 = goodtracksArray[itr2];
 476       } else if(nclsArray[itr1]+nclsArray[itr2] == maxCls) {
 477         if(deltatheta+deltaphi < min) {
 478           min = deltatheta+deltaphi;
 479           good1 = goodtracksArray[itr1];
 480           good2 = goodtracksArray[itr2];
 481         }
 482       }
 483     }
 484   }
 485
 486   delete [] goodtracksArray; goodtracksArray=0;
 487   delete [] phiArray; phiArray=0;
 488   delete [] thetaArray; thetaArray=0;
 489   delete [] nclsArray; nclsArray=0;
 490
 491   if(good1<0) return;
 492   AliDebug(2,"ok track matching");
 493
 494   // track1 will be the inward track (top)
 495   // track2 the outward (bottom)
 496   AliESDtrack *track1=0;
 497   AliESDtrack *track2=0;
 498   AliESDtrack *track = esd->GetTrack(good1);
 499   if(track->Py()>0) {
 500     track1 = esd->GetTrack(good1);
 501     track2 = esd->GetTrack(good2);
 502   } else {
 503     track1 = esd->GetTrack(good2);
 504     track2 = esd->GetTrack(good1);
 505   }
 506
 507   AliTrackPoint point;
 508   const AliTrackPointArray *array=0;
 509   Int_t ipt,volId,modId,layerId,lay,lad,det;
 510   Int_t jpt=0;
 511   Bool_t layerOK[6][2];
 512   Int_t nclsTrk[2]={0,0};
 513
 514   for(Int_t l1=0;l1<6;l1++) for(Int_t l2=0;l2<2;l2++) layerOK[l1][l2]=kFALSE;
 515
 516   for(itrack=0; itrack<2; itrack++) {
 517     if(itrack==0) {
 518       track = track1;
 519     } else {
 520       track = track2;
 521     }
 522     array = track->GetTrackPointArray();
 523     if(!array) {
 524       AliWarning("No tracks points avaialble");
 525       continue;
 526     }
 527     for(ipt=0; ipt<array->GetNPoints(); ipt++) {
 528       array->GetPoint(point,ipt);
 529       volId = point.GetVolumeID();
 530       if(volId<=0) continue;
 531       layerId = AliGeomManager::VolUIDToLayer(volId,modId);
 532       AliDebug(2,Form("%d %d %d  %f\n",ipt,layerId-1,volId,TMath::Sqrt(point.GetX()*point.GetX()+point.GetY()*point.GetY())));
 533       if(point.IsExtra() &&
 534          (GetRecoParam()->GetAlignFilterSkipExtra())) continue;
 535       if(layerId<1 || layerId>6) continue;
 536       if(!GetRecoParam()->GetAlignFilterUseLayer(layerId-1)) continue;
 537       // check minAngleWrtITSModulePlanes
 538       Double_t p[3]; track->GetDirection(p);
 539       TVector3 pvec(p[0],p[1],p[2]);
 540       Double_t rot[9]; AliGeomManager::GetOrigRotation(volId,rot);
 541       TVector3 normvec(rot[1],rot[4],rot[7]);
 542       Double_t angle = pvec.Angle(normvec);
 543       if(angle>0.5*TMath::Pi()) angle = TMath::Pi()-angle;
 544       angle = 0.5*TMath::Pi()-angle;
 545       if(angle<GetRecoParam()->GetAlignFilterMinAngleWrtModulePlanes()) continue;
 546       layerOK[layerId-1][itrack]=kTRUE;
 547       jpt++;
 548       nclsTrk[itrack]++;
 549     }
 550   }
 551   AliDebug(2,Form("nClsTrk1 %d nClsTrk2 %d\n",nclsTrk[0],nclsTrk[1]));
 552
 553   // read ITS cluster maps
 554   Int_t map1[6],map2[6];
 555   for(Int_t ilay=0;ilay<6;ilay++) {
 556     map1[ilay]=0; map2[ilay]=0;
 557     if(track1->HasPointOnITSLayer(ilay)) map1[ilay]=1;
 558     if(track2->HasPointOnITSLayer(ilay)) map2[ilay]=1;
 559   }
 560   AliDebug(2,Form("ITS map 1: %d %d %d %d %d %d pt %f\n",map1[0],map1[1],map1[2],map1[3],map1[4],map1[5],track1->Pt()));
 561   AliDebug(2,Form("ITS map 2: %d %d %d %d %d %d pt %f\n",map2[0],map2[1],map2[2],map2[3],map2[4],map2[5],track2->Pt()));
 562   Int_t idx1[12],idx2[12];
 563   track1->GetITSclusters(idx1);
 564   track2->GetITSclusters(idx2);
 565   AliDebug(2,Form("cls idx 1 %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d\n",idx1[0],idx1[1],idx1[2],idx1[3],idx1[4],idx1[5],idx1[6],idx1[7],idx1[8],idx1[9],idx1[10],idx1[11]));
 566   AliDebug(2,Form("cls idx 2 %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d\n",idx2[0],idx2[1],idx2[2],idx2[3],idx2[4],idx2[5],idx2[6],idx2[7],idx2[8],idx2[9],idx2[10],idx2[11]));
 567
 568
 569   if(jpt<GetRecoParam()->GetAlignFilterMinITSPointsMerged()) return;
 570   AliDebug(2,Form(" Total points %d, accepted\n",jpt));
 571   fHistNpoints->Fill(jpt);
 572   fHistPt->Fill(0.5*(track1->Pt()+track2->Pt()));
 573
 574   Float_t d0z0mu[2];
 575   track1->GetDZ(0,0,0,esd->GetMagneticField(),d0z0mu);
 576   //printf("d0mu %f  z0mu %f\n",d0z0mu[0],d0z0mu[1]);
 577
 578   vertexForTree = new AliESDVertex(*(esd->GetPrimaryVertexSPD()));
 579   vertexForTree->SetID(0);
 580
 581   Float_t dzOverlap[2];
 582   Float_t curvArray[2],curverrArray[2];
 583   Double_t globExtra[3],locExtra[3];
 584   if(GetRecoParam()->GetAlignFilterCosmicMergeTracks()) {
 585     arrayForTree = new AliTrackPointArray(jpt);
 586     arrayForTree->SetUniqueID(uid);
 587   }
 588   jpt=0;
 589   for(itrack=0; itrack<2; itrack++) {
 590     if(itrack==0) {
 591       track = track1;
 592     } else {
 593       track = track2;
 594     }
 595     curvArray[itrack] = track->GetC(esd->GetMagneticField());
 596     curverrArray[itrack] = TMath::Sqrt(track->GetSigma1Pt2())*track->GetC(esd->GetMagneticField())/track->OneOverPt();
 597
 598     if(!(GetRecoParam()->GetAlignFilterCosmicMergeTracks())) {
 599       jpt=0;
 600       arrayForTree = new AliTrackPointArray(nclsTrk[itrack]);
 601       arrayForTree->SetUniqueID(uid);
 602     }
 603     array = track->GetTrackPointArray();
 604     for(ipt=0; ipt<array->GetNPoints(); ipt++) {
 605       array->GetPoint(point,ipt);
 606       volId = point.GetVolumeID();
 607       if(volId<=0) continue;
 608       layerId = AliGeomManager::VolUIDToLayer(volId,modId);
 609       if(layerId<1 || layerId>6 || !layerOK[layerId-1][itrack]) continue;
 610       arrayForTree->AddPoint(jpt,&point);
 611       jpt++;
 612       switch(layerId) {
 613       case 1:
 614         fHistLayer0->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 615         break;
 616       case 2:
 617         fHistLayer1->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 618         break;
 619       case 3:
 620         fHistLayer2->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 621         break;
 622       case 4:
 623         fHistLayer3->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 624         break;
 625       case 5:
 626         fHistLayer4->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 627         break;
 628       case 6:
 629         fHistLayer5->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 630         break;
 631       }
 632       // Post the data for slot 2
 633       if(jpt==1) PostData(2,fListOfHistos); // only if this is the first points
 634       if(!point.IsExtra() ||
 635          !(GetRecoParam()->GetAlignFilterFillQANtuples())) continue;
 636       nclsTrk[itrack]--;
 637       for(Int_t ll=1;ll<layerId;ll++) modId+=AliITSgeomTGeo::GetNLadders(ll)*AliITSgeomTGeo::GetNDetectors(ll);
 638       AliITSgeomTGeo::GetModuleId(modId,lay,lad,det);
 639       globExtra[0]=point.GetX();
 640       globExtra[1]=point.GetY();
 641       globExtra[2]=point.GetZ();
 642       AliITSgeomTGeo::GlobalToLocal(lay,lad,det,globExtra,locExtra);
 643       //printf("%d %d %d %d %d  %f %f %f\n",volId,modId,lay,lad,det,locExtra[0],locExtra[1],locExtra[2]);
 644       track->GetDZ(point.GetX(),point.GetY(),point.GetZ(),esd->GetMagneticField(),dzOverlap);
 645       AliTrackPoint pointT;
 646       Float_t radius,radiusT,phiv,phivT,thetav,thetavT;
 647       for(Int_t lll=0;lll<ipt;lll++) {
 648         array->GetPoint(pointT,lll);
 649         if(pointT.GetVolumeID()<=0) continue;
 650         Int_t layerIdT = AliGeomManager::VolUIDToLayer(pointT.GetVolumeID(),modId);
 651         if(layerIdT!=layerId) continue;
 652         radius=TMath::Sqrt((point.GetX()-vtxpos[0])*(point.GetX()-vtxpos[0])+(point.GetY()-vtxpos[1])*(point.GetY()-vtxpos[1]));
 653         radiusT=TMath::Sqrt((pointT.GetX()-vtxpos[0])*(pointT.GetX()-vtxpos[0])+(pointT.GetY()-vtxpos[1])*(pointT.GetY()-vtxpos[1]));
 654         phiv=TMath::ATan2(point.GetY()-vtxpos[1],point.GetX()-vtxpos[0]);
 655         phivT=TMath::ATan2(pointT.GetY()-vtxpos[1],pointT.GetX()-vtxpos[0]);
 656         if(TMath::Abs(point.GetZ()-vtxpos[2])<0.00001 || TMath::Abs(pointT.GetZ()-vtxpos[2])<0.00001) continue;
 657         thetav=TMath::ATan(radius/(point.GetZ()-vtxpos[2]));
 658         thetavT=TMath::ATan(radiusT/(pointT.GetZ()-vtxpos[2]));
 659         dzOverlap[0]=(Float_t)((phivT-phiv)*0.5*(radiusT+radius));
 660         if(TMath::Abs(TMath::Tan(0.5*(thetav+thetavT)))<0.00001) continue;
 661         dzOverlap[1]=(Float_t)((pointT.GetZ()-point.GetZ())-(radiusT-radius)/TMath::Tan(0.5*(thetav+thetavT)));
 662         fntExtra->Fill((Float_t)nclsTrk[itrack],(Float_t)(layerId-1),lad,volId,TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetX(),point.GetY(),point.GetZ(),locExtra[0],locExtra[2],dzOverlap[0],dzOverlap[1],d0z0mu[0],d0z0mu[1],track->Pt());
 663       }
 664     }
 665
 666     if(!(GetRecoParam()->GetAlignFilterCosmicMergeTracks())) {
 667       curv = curvArray[itrack];
 668       curverr = curverrArray[itrack];
 669       fspTree->Fill();
 670     }
 671   }
 672
 673   if(GetRecoParam()->GetAlignFilterCosmicMergeTracks()) {
 674     curv = 0.5*(curvArray[0]-curvArray[1]);  // the "-" is because the two tracks have opposite curvature!
 675     curverr = 0.5*TMath::Sqrt(curverrArray[0]*curverrArray[0]+curverrArray[1]*curverrArray[1]);
 676     fspTree->Fill();
 677   }
 678   PostData(1,fspTree);
 679
 680   if(!(GetRecoParam()->GetAlignFilterFillQANtuples())) return;
 681   // fill ntuple with track-to-track matching
 682   Float_t phimu,thetamu,phiout,thetaout,dphi,dtheta,rotymu,rotyout,droty;
 683   Float_t d0[2],z0[2];
 684   Float_t sigmad0[2],sigmaz0[2];
 685   phimu = track1->GetAlpha()+TMath::ASin(track1->GetSnp());
 686   thetamu = 0.5*TMath::Pi()-TMath::ATan(track1->GetTgl());
 687   phiout = track2->GetAlpha()+TMath::ASin(track2->GetSnp());
 688   thetaout = 0.5*TMath::Pi()-TMath::ATan(track2->GetTgl());
 689   rotymu = TMath::ATan2(track1->Px(),track1->Pz());
 690   rotyout = TMath::ATan2(track2->Px(),track2->Pz());
 691
 692   dphi = phimu - (phiout+TMath::Pi());
 693   dtheta = thetamu - (TMath::Pi()-thetaout);
 694   if(rotymu>0) {
 695     droty = rotymu - (rotyout+TMath::Pi());
 696   } else {
 697     droty = rotymu - (rotyout-TMath::Pi());
 698   }
 699
 700   Double_t alpha = TMath::ATan2(track1->Py(),track1->Px());
 701
 702   track1->Propagate(alpha,0.,esd->GetMagneticField());
 703   track2->Propagate(alpha,0.,esd->GetMagneticField());
 704   d0[0] = track1->GetY();
 705   z0[0] = track1->GetZ();
 706   d0[1] = track2->GetY();
 707   z0[1] = track2->GetZ();
 708   Float_t dxy = -(d0[0]-d0[1]);
 709   Float_t dz  = z0[0]-z0[1];
 710   sigmad0[0] = TMath::Sqrt(track1->GetSigmaY2());
 711   sigmaz0[0] = TMath::Sqrt(track1->GetSigmaZ2());
 712   sigmad0[1] = TMath::Sqrt(track2->GetSigmaY2());
 713   sigmaz0[1] = TMath::Sqrt(track2->GetSigmaZ2());
 714   /*
 715   Double_t xyz1atxl0[3],xyz1atxl1[3],xyz2atxl0[3],xyz2atxl1[3];
 716   track1->GetXYZAt(0.,esd->GetMagneticField(),xyz1atxl0);
 717   track1->GetXYZAt(1.,esd->GetMagneticField(),xyz1atxl1);
 718   track2->GetXYZAt(0.,esd->GetMagneticField(),xyz2atxl0);
 719   track2->GetXYZAt(1.,esd->GetMagneticField(),xyz2atxl1);
 720   Float_t x1aty0 = (xyz1atxl0[0]*xyz1atxl1[1]-xyz1atxl0[1]*xyz1atxl1[0])/(xyz1atxl1[1]-xyz1atxl0[1]);
 721   Float_t x2aty0 = (xyz2atxl0[0]*xyz2atxl1[1]-xyz2atxl0[1]*xyz2atxl1[0])/(xyz2atxl1[1]-xyz2atxl0[1]);
 722   Float_t dxaty0 = x1aty0-x2aty0;
 723   */
 724   fntCosmicMatching->Fill((Float_t)nclsTrk[0],(Float_t)nclsTrk[1],track1->Pt(),track2->Pt(),sigmad0[0],sigmad0[1],sigmaz0[0],sigmaz0[1],dxy,dz,phimu,thetamu,TMath::Abs(d0z0mu[0]),d0z0mu[1]);
 725
 726   return;
 727 }
 728
 729 //________________________________________________________________________
 730 void AliAlignmentDataFilterITS::FilterCollision(const AliESDEvent *esd)
 731 {
 732   // Extract ITS AliTrackPoints for Cosmics (check angular matching
 733   // of top and bottom track, merge the two tracks, if requested)
 734   //
 735
 736   // Set branch addresses for space points tree
 737   AliTrackPointArray *arrayForTree=0;
 738   AliESDVertex *vertexForTree=0;
 739   Float_t curv,curverr,runNumber;
 740   TObjString *itsaligndata=0;
 741   TObjString *itscalibrespsdd = 0;
 742   fspTree->SetBranchAddress("SP",&arrayForTree);
 743   fspTree->SetBranchAddress("vertex",&vertexForTree);
 744   fspTree->SetBranchAddress("curv",&curv);
 745   fspTree->SetBranchAddress("curverr",&curverr);
 746   fspTree->SetBranchAddress("run",&runNumber);
 747   fspTree->SetBranchAddress("ITSAlignData",&itsaligndata);
 748   fspTree->SetBranchAddress("ITSCalibRespSDD",&itscalibrespsdd);
 749
 750
 751   runNumber = (Float_t)esd->GetRunNumber();
 752   Int_t uid=20000+esd->GetEventNumberInFile();
 753
 754   TTree* esdTree = dynamic_cast<TTree*> (GetInputData(0));
 755   if(!esdTree) return;
 756   // Get the list of OCDB objects used for reco
 757   TList *cdbList = (TList*)(esdTree->GetTree()->GetUserInfo())->FindObject("cdbList");
 758   TIter iter2(cdbList);
 759   TObjString* cdbEntry=0;
 760   TString cdbEntryString;
 761   while((cdbEntry =(TObjString*)(iter2.Next()))) {
 762   cdbEntryString = cdbEntry->GetString();
 763   if(cdbEntryString.Contains("ITS/Align/Data"))
 764     itsaligndata = new TObjString(*cdbEntry);
 765   if(cdbEntryString.Contains("ITS/Calib/RespSDD"))
 766     itscalibrespsdd = new TObjString(*cdbEntry);
 767   }
 768
 769   Int_t ntracks = esd->GetNumberOfTracks();
 770
 771   if(ntracks==0) return;
 772
 773   const AliESDVertex *vertexTracks = esd->GetPrimaryVertexTracks();
 774   if(!vertexTracks) return;
 775   if(vertexTracks->GetNContributors()<=0) return;
 776
 777   Double_t vtxpos[3]; vertexTracks->GetXYZ(vtxpos);
 778
 779   Int_t ncls=0;
 780   Double_t pt=-10000.;
 781   Double_t d0z0[2],covd0z0[3];
 782   const AliTrackPointArray *array = 0;
 783
 784   for (Int_t itrack=0; itrack < ntracks; itrack++) {
 785     AliESDtrack * track = esd->GetTrack(itrack);
 786     if (!track) continue;
 787
 788     if(fDownsamplelowpt && TMath::Abs(esd->GetMagneticField())>0.01 &&
 789        track->Pt()<gRandom->Rndm()) continue;
 790
 791     if(track->GetNcls(0)<GetRecoParam()->GetAlignFilterMinITSPoints()) continue;
 792
 793     if((GetRecoParam()->GetAlignFilterOnlyITSSATracks()) && track->GetNcls(1)>0) continue;
 794     if((GetRecoParam()->GetAlignFilterOnlyITSTPCTracks()) && track->GetNcls(1)==0) continue;
 795
 796     if(track->Pt()<GetRecoParam()->GetAlignFilterMinPt() ||
 797        track->Pt()>GetRecoParam()->GetAlignFilterMaxPt()) continue;
 798
 799     pt = track->Pt();
 800     ncls = track->GetNcls(0);
 801     Double_t maxd=10000.;
 802     track->PropagateToDCA(vertexTracks,esd->GetMagneticField(),maxd,d0z0,covd0z0);
 803
 804     // read ITS cluster map
 805     Int_t map[6];
 806     for(Int_t ilay=0;ilay<6;ilay++) {
 807       map[ilay]=0;
 808       if(track->HasPointOnITSLayer(ilay)) map[ilay]=1;
 809     }
 810     AliDebug(2,Form("ITS map : %d %d %d %d %d %d pt %f\n",map[0],map[1],map[2],map[3],map[4],map[5],track->Pt()));
 811     Int_t idx[12];
 812     track->GetITSclusters(idx);
 813     AliDebug(2,Form("cls idx %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d\n",idx[0],idx[1],idx[2],idx[3],idx[4],idx[5],idx[6],idx[7],idx[8],idx[9],idx[10],idx[11]));
 814
 815
 816     AliTrackPoint point;
 817     Int_t ipt,volId,modId,layerId,lay,lad,det;
 818     Int_t jpt=0;
 819     Bool_t layerOK[6]; for(Int_t l1=0;l1<6;l1++) layerOK[l1]=kFALSE;
 820
 821     array = track->GetTrackPointArray();
 822     if(!array) {printf("no track points\n"); continue;}
 823     for(ipt=0; ipt<array->GetNPoints(); ipt++) {
 824       array->GetPoint(point,ipt);
 825       volId = point.GetVolumeID();
 826       if(volId<=0) continue;
 827       layerId = AliGeomManager::VolUIDToLayer(volId,modId);
 828       if(layerId<1 || layerId>6) continue;
 829       if(point.IsExtra() &&
 830          (GetRecoParam()->GetAlignFilterSkipExtra())) continue;
 831       layerOK[layerId-1]=kTRUE;
 832       jpt++;
 833     }
 834
 835     if(jpt < GetRecoParam()->GetAlignFilterMinITSPoints()) continue;
 836
 837     fHistNpoints->Fill(jpt);
 838     fHistPt->Fill(pt);
 839     PostData(2,fListOfHistos);
 840
 841     Float_t dzOverlap[2];
 842     Double_t globExtra[3],locExtra[3];
 843     arrayForTree = new AliTrackPointArray(jpt);
 844     arrayForTree->SetUniqueID(uid);
 845     jpt=0;
 846     array = track->GetTrackPointArray();
 847     if(!array) continue;
 848     for(ipt=0; ipt<array->GetNPoints(); ipt++) {
 849       array->GetPoint(point,ipt);
 850       volId = point.GetVolumeID();
 851       layerId = AliGeomManager::VolUIDToLayer(volId,modId);
 852       if(layerId<1 || layerId>6 || !layerOK[layerId-1]) continue;
 853       arrayForTree->AddPoint(jpt,&point);
 854       switch(layerId) {
 855       case 1:
 856         fHistLayer0->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 857         break;
 858       case 2:
 859         fHistLayer1->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 860         break;
 861       case 3:
 862         fHistLayer2->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 863         break;
 864       case 4:
 865         fHistLayer3->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 866         break;
 867       case 5:
 868         fHistLayer4->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 869         break;
 870       case 6:
 871         fHistLayer5->Fill(TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetZ());
 872         break;
 873       }
 874       jpt++;
 875       if(!point.IsExtra() ||
 876          !(GetRecoParam()->GetAlignFilterFillQANtuples())) continue;
 877       ncls--;
 878       for(Int_t ll=1;ll<layerId;ll++) modId+=AliITSgeomTGeo::GetNLadders(ll)*AliITSgeomTGeo::GetNDetectors(ll);
 879       AliITSgeomTGeo::GetModuleId(modId,lay,lad,det);
 880       globExtra[0]=point.GetX();
 881       globExtra[1]=point.GetY();
 882       globExtra[2]=point.GetZ();
 883       AliITSgeomTGeo::GlobalToLocal(lay,lad,det,globExtra,locExtra);
 884       track->GetDZ(point.GetX(),point.GetY(),point.GetZ(),esd->GetMagneticField(),dzOverlap);
 885       AliTrackPoint pointT;
 886       Float_t radius,radiusT,phiv,phivT,thetav,thetavT;
 887       for(Int_t lll=0;lll<ipt;lll++) {
 888         array->GetPoint(pointT,lll);
 889         Int_t layerIdT = AliGeomManager::VolUIDToLayer(pointT.GetVolumeID(),modId);
 890         if(layerIdT!=layerId) continue;
 891         radius=TMath::Sqrt((point.GetX()-vtxpos[0])*(point.GetX()-vtxpos[0])+(point.GetY()-vtxpos[1])*(point.GetY()-vtxpos[1]));
 892         radiusT=TMath::Sqrt((pointT.GetX()-vtxpos[0])*(pointT.GetX()-vtxpos[0])+(pointT.GetY()-vtxpos[1])*(pointT.GetY()-vtxpos[1]));
 893         phiv=TMath::ATan2(point.GetY()-vtxpos[1],point.GetX()-vtxpos[0]);
 894         phivT=TMath::ATan2(pointT.GetY()-vtxpos[1],pointT.GetX()-vtxpos[0]);
 895         if(TMath::Abs(point.GetZ()-vtxpos[2])<0.00001 || TMath::Abs(pointT.GetZ()-vtxpos[2])<0.00001) continue;
 896         thetav=TMath::ATan(radius/(point.GetZ()-vtxpos[2]));
 897         thetavT=TMath::ATan(radiusT/(pointT.GetZ()-vtxpos[2]));
 898         dzOverlap[0]=(Float_t)((phivT-phiv)*0.5*(radiusT+radius));
 899         if(TMath::Abs(TMath::Tan(0.5*(thetav+thetavT)))<0.00001) continue;
 900         dzOverlap[1]=(Float_t)((pointT.GetZ()-point.GetZ())-(radiusT-radius)/TMath::Tan(0.5*(thetav+thetavT)));
 901         fntExtra->Fill((Float_t)ncls,(Float_t)(layerId-1),lad,volId,TMath::ATan2(point.GetY(),point.GetX()),point.GetX(),point.GetY(),point.GetZ(),locExtra[0],locExtra[2],dzOverlap[0],dzOverlap[1],d0z0[0],d0z0[1],track->Pt());
 902       }
 903     }
 904
 905     curv = track->GetC(esd->GetMagneticField());
 906     curverr = TMath::Sqrt(track->GetSigma1Pt2())*track->GetC(esd->GetMagneticField())/track->OneOverPt();
 907
 908     vertexForTree = new AliESDVertex(*vertexTracks);
 909     if(vertexTracks->UsesTrack(track->GetID())) {
 910       vertexForTree->SetID(1);
 911     } else {
 912       vertexForTree->SetID(0);
 913     }
 914
 915     fspTree->Fill();
 916
 917   } // end of tracks loop
 918
 919   PostData(1,fspTree);
 920
 921   return;
 922 }
 923
 924 //________________________________________________________________________
 925 void AliAlignmentDataFilterITS::Terminate(Option_t */*option*/)
 926 {
 927   // Terminate analysis
 928   //
 929   AliDebug(2,"AliITSAlignmentDataFiler: Terminate() \n");
 930
 931   fspTree = dynamic_cast<TTree*> (GetOutputData(1));
 932   if (!fspTree) {
 933     printf("ERROR: fspTree not available\n");
 934     return;
 935   }
 936
 937   fListOfHistos = dynamic_cast<TList*> (GetOutputData(2));
 938   if (!fListOfHistos) {
 939     printf("ERROR: fListOfHistos not available\n");
 940     return;
 941   }
 942
 943   fHistNevents = dynamic_cast<TH1F*>(fListOfHistos->FindObject("fHistNevents"));
 944   fHistNpoints = dynamic_cast<TH1F*>(fListOfHistos->FindObject("fHistNpoints"));
 945   fHistPt = dynamic_cast<TH1F*>(fListOfHistos->FindObject("fHistPt"));
 946   fHistLayer0 = dynamic_cast<TH2F*>(fListOfHistos->FindObject("fHistLayer0"));
 947   fHistLayer1 = dynamic_cast<TH2F*>(fListOfHistos->FindObject("fHistLayer1"));
 948   fHistLayer2 = dynamic_cast<TH2F*>(fListOfHistos->FindObject("fHistLayer2"));
 949   fHistLayer3 = dynamic_cast<TH2F*>(fListOfHistos->FindObject("fHistLayer3"));
 950   fHistLayer4 = dynamic_cast<TH2F*>(fListOfHistos->FindObject("fHistLayer4"));
 951   fHistLayer5 = dynamic_cast<TH2F*>(fListOfHistos->FindObject("fHistLayer5"));
 952   fntExtra = dynamic_cast<TNtuple*>(fListOfHistos->FindObject("fntExtra"));
 953   fntCosmicMatching = dynamic_cast<TNtuple*>(fListOfHistos->FindObject("fntCosmicMatching"));
 954
 955
 956
 957   return;
 958 }
 959 //-------------------------------------------------------------------------------
 960 const AliITSRecoParam *AliAlignmentDataFilterITS::GetRecoParam() const
 961 {
 962   //
 963   // Return the ITSRecoParam object
 964   //
 965   if(AliITSReconstructor::GetRecoParam()) {
 966     return AliITSReconstructor::GetRecoParam();
 967   } else if(fITSRecoParam) {
 968     return fITSRecoParam;
 969   } else return NULL;
 970 }
 971 //--------------------------------------------------------------------------------
 972 Int_t AliAlignmentDataFilterITS::WriteTrackPointsInIdealGeom(Char_t *fin,
 973                                                              Char_t *fout,
 974                                                              Char_t *fmis,
 975                                                              Char_t *fgeo,
 976                                                              Bool_t prn)
 977 {
 978   //
 979   // Convert AliTrackPoints in fin, reconstructed with fmis, back
 980   // to ideal geometry
 981   //
 982   // M. Lunardon
 983   //
 984
 985
 986   TGeoHMatrix deltahm;
 987
 988   // Load geometry
 989   if (gSystem->AccessPathName(fgeo)) {
 990     printf("couldn't find geometry file %s - skipping...\n",fmis);
 991     return -1;
 992   }
 993
 994   TFile *geofile=TFile::Open(fgeo);
 995   TGeoManager *fgGeometry=NULL;
 996
 997   fgGeometry=(TGeoManager*)geofile->Get("ALICE");
 998
 999   if (!fgGeometry)
1000     fgGeometry=(TGeoManager*)geofile->Get("Geometry");
1001
1002   if (!fgGeometry) {
1003     AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)geofile->Get("AliCDBEntry");
1004     if (entry)
1005       fgGeometry = (TGeoManager*)entry->GetObject();
1006   }
1007
1008   if (!fgGeometry) return -1;
1009   AliGeomManager::SetGeometry(fgGeometry);
1010   if(!AliGeomManager::GetGeometry()) return -1;
1011
1012
1013   // open alignment file
1014   if (gSystem->AccessPathName(fmis)) {
1015     printf("couldn't open alignment file %s - skipping...\n",fmis);
1016     return -2;
1017   }
1018   TFile *pref = TFile::Open(fmis);
1019   if (!pref->IsOpen()) return -2;
1020
1021
1022   /// apply alignment to ideal geometry
1023   TClonesArray *prea=(TClonesArray*)pref->Get("ITSAlignObjs");
1024   if (!prea) {
1025     if (pref->Get("AliCDBEntry"))
1026       prea = (TClonesArray*) ((AliCDBEntry*)pref->Get("AliCDBEntry"))->GetObject();
1027   }
1028   if (!prea) return -3;
1029   Int_t nprea=prea->GetEntriesFast();
1030   printf("Array of input misalignments with %d entries\n",nprea);
1031   AliGeomManager::ApplyAlignObjsToGeom(*prea); // apply all levels of objs
1032
1033   AliTrackPointArray *tpain=NULL;
1034   TFile *tpainfile=NULL;
1035   TTree *treein=NULL;
1036   AliTrackPoint point;
1037   AliITSAlignMille2Module *m2[2200];
1038   for (Int_t i=0; i<2198; i++)
1039     m2[i]=new AliITSAlignMille2Module(AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(i));
1040
1041   // open input file
1042   if (gSystem->AccessPathName(fin)) {
1043     printf("couldn't open file %s - skipping...\n",fin);
1044     return -4;
1045   }
1046   tpainfile = TFile::Open(fin);
1047   if (!tpainfile->IsOpen()) return -4;
1048
1049   treein=(TTree*)tpainfile->Get("spTree");
1050   if (!treein) return -5;
1051   Float_t curv,curverr,runNumber;
1052   TObjString *itsaligndata=0;
1053   TObjString *itscalibrespsdd = 0;
1054   treein->SetBranchAddress("SP", &tpain);
1055   treein->SetBranchAddress("curv", &curv);
1056   treein->SetBranchAddress("curverr", &curverr);
1057   treein->SetBranchAddress("run",&runNumber);
1058   treein->SetBranchAddress("ITSAlignData",&itsaligndata);
1059   treein->SetBranchAddress("ITSCalibRespSDD",&itscalibrespsdd);
1060
1061   int ntrks=treein->GetEntries();
1062   printf("Reading %d tracks from %s\n",ntrks,fin);
1063
1064
1065   // open output file
1066   TFile *pointsFile = TFile::Open(fout,"RECREATE");
1067   if (!pointsFile || !pointsFile->IsOpen()) {
1068     printf("Can't open output file %s !",fout);
1069     return -6;
1070   }
1071   AliTrackPointArray *array = new AliTrackPointArray();
1072
1073   // new!
1074   TTree *treeout=(TTree*)treein->Clone("spTree");
1075   treeout->Reset();
1076   treeout->SetBranchAddress("SP", &array);
1077   treeout->SetBranchAddress("curv", &curv);
1078   treeout->SetBranchAddress("curverr", &curverr);
1079   treeout->SetBranchAddress("run",&runNumber);
1080   treeout->SetBranchAddress("ITSAlignData",&itsaligndata);
1081   treeout->SetBranchAddress("ITSCalibRespSDD",&itscalibrespsdd);
1082
1083   // tracks main loop
1084   for (Int_t it=0; it<ntrks; it++) {
1085     if (!(it%5000) ) printf("...processing track n. %d\n",it);
1086
1087     treein->GetEvent(it);
1088
1089     //////////////////////////////
1090
1091     AliTrackPointArray *atp=tpain;
1092     AliTrackPointArray *atps=NULL;
1093     Int_t npts=atp->GetNPoints();
1094
1095     AliTrackPoint p;
1096     // check points in specific places
1097
1098     // build a new track
1099     atps=new AliTrackPointArray(npts);
1100
1101     Int_t npto=0;
1102     for (int i=0; i<npts; i++) {
1103       atp->GetPoint(p,i);
1104
1105       UShort_t volid=atp->GetVolumeID()[i];
1106       Int_t index=AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(volid);
1107
1108       if(index<0 || index>=2200) continue;
1109       // dealign point
1110       // get MODIFIED matrix
1111       TGeoHMatrix *svMatrix = m2[index]->GetSensitiveVolumeMatrix(p.GetVolumeID());
1112       //TGeoHMatrix *svOrigMatrix = mm->GetSensitiveVolumeOrigGlobalMatrix(p.GetVolumeID());
1113
1114       Double_t pg[3],pl[3];
1115       pg[0]=p.GetX();
1116       pg[1]=p.GetY();
1117       pg[2]=p.GetZ();
1118       if (prn) printf("Global coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pg[0],pg[1],pg[2]);
1119       svMatrix->MasterToLocal(pg,pl);
1120
1121       // check that things went OK: local y should be 0.
1122       if(TMath::Abs(pl[1])>1.e-6) {
1123         printf("AliAlignmentDataFilterITS::WriteTrackPointsInIdealGeom: ERROR, local y = %f (should be zero)\n",pl[1]);
1124         return -7;
1125       }
1126
1127       if (prn) printf("Local coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pl[0],pl[1],pl[2]);
1128
1129       // update covariance matrix
1130       TGeoHMatrix hcov;
1131       Double_t hcovel[9];
1132       hcovel[0]=(Double_t)(p.GetCov()[0]);
1133       hcovel[1]=(Double_t)(p.GetCov()[1]);
1134       hcovel[2]=(Double_t)(p.GetCov()[2]);
1135       hcovel[3]=(Double_t)(p.GetCov()[1]);
1136       hcovel[4]=(Double_t)(p.GetCov()[3]);
1137       hcovel[5]=(Double_t)(p.GetCov()[4]);
1138       hcovel[6]=(Double_t)(p.GetCov()[2]);
1139       hcovel[7]=(Double_t)(p.GetCov()[4]);
1140       hcovel[8]=(Double_t)(p.GetCov()[5]);
1141       hcov.SetRotation(hcovel);
1142       // now rotate in local system
1143       hcov.Multiply(svMatrix);
1144       hcov.MultiplyLeft(&svMatrix->Inverse());
1145       // now hcov is LOCAL COVARIANCE MATRIX
1146
1147       /// get original matrix of sens. vol.
1148       TGeoHMatrix *svOrigMatrix = m2[index]->GetSensitiveVolumeOrigGlobalMatrix(p.GetVolumeID());
1149       // modify global coordinates according with pre-aligment
1150       svOrigMatrix->LocalToMaster(pl,pg);
1151       // now rotate in local system
1152       hcov.Multiply(&svOrigMatrix->Inverse());
1153       hcov.MultiplyLeft(svOrigMatrix);
1154       // hcov is back in GLOBAL RF
1155       Float_t pcov[6];
1156       pcov[0]=hcov.GetRotationMatrix()[0];
1157       pcov[1]=hcov.GetRotationMatrix()[1];
1158       pcov[2]=hcov.GetRotationMatrix()[2];
1159       pcov[3]=hcov.GetRotationMatrix()[4];
1160       pcov[4]=hcov.GetRotationMatrix()[5];
1161       pcov[5]=hcov.GetRotationMatrix()[8];
1162
1163       p.SetXYZ(pg[0],pg[1],pg[2],pcov);
1164       if (prn) printf("New global coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pg[0],pg[1],pg[2]);
1165       atps->AddPoint(npto,&p);
1166       if (prn) printf("Adding point[%d] = ( %f , %f , %f )     volid = %d\n",npto,atps->GetX()[npto],atps->GetY()[npto],atps->GetZ()[npto],atps->GetVolumeID()[npto] );
1167       if (prn) p.Print("");
1168
1169       npto++;
1170     }
1171
1172
1173     ////////////////////////////////////////////////////////////
1174     array = atps;
1175     treeout->Fill();
1176
1177     delete atps;
1178     atps=NULL;
1179
1180   } // end loop on tracks
1181
1182   pointsFile->Write();
1183   pointsFile->Close();
1184   tpainfile->Close();
1185
1186   return 0;
1187 }