PWG1/TRD/AliTRDcheckDET.cxx

   1 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   2 //                                                                        //
   3 //                                                                        //
   4 //  Basic checks for tracking and detector performance                    //
   5 //
   6 //     For the moment (15.10.2009) the following checks are implemented    //
   7 //       - Number of clusters/track
   8 //       - Number of clusters/tracklet
   9 //       - Number of tracklets/track from different sources (Barrel, StandAlone)
  10 //       - Number of findable tracklets
  11 //       - Number of tracks per event and TRD sector
  12 //       - <PH>
  13 //       - Chi2 distribution for tracks
  14 //       - Charge distribution per cluster and tracklet
  15 //       - Number of events and tracks per trigger source
  16 //       - Trigger purity
  17 //       - Track and Tracklet propagation status
  18 //
  19 //  Authors:                                                              //
  20 //    Anton Andronic <A.Andronic@gsi.de>                                  //
  21 //    Alexandru Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>                                //
  22 //    Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>                                       //
  23 //                                                                        //
  24 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 #include <TAxis.h>
  27 #include <TCanvas.h>
  28 #include <TFile.h>
  29 #include <TH1F.h>
  30 #include <TH1I.h>
  31 #include <TH2F.h>
  32 #include <TF1.h>
  33 #include <TGaxis.h>
  34 #include <TGraph.h>
  35 #include <TGraphErrors.h>
  36 #include <TLegend.h>
  37 #include <TLinearFitter.h>
  38 #include <TMath.h>
  39 #include <TMap.h>
  40 #include <TProfile2D.h>
  41 #include <TObjArray.h>
  42 #include <TObject.h>
  43 #include <TObjString.h>
  44
  45 #include <TPad.h>
  46 #include <TProfile.h>
  47 #include <TProfile2D.h>
  48 #include <TROOT.h>
  49 #include <TChain.h>
  50
  51 #include "AliLog.h"
  52 #include "AliTRDcluster.h"
  53 #include "AliESDHeader.h"
  54 #include "AliESDRun.h"
  55 #include "AliESDtrack.h"
  56 #include "AliExternalTrackParam.h"
  57 #include "AliTRDgeometry.h"
  58 #include "AliTRDpadPlane.h"
  59 #include "AliTRDSimParam.h"
  60 #include "AliTRDseedV1.h"
  61 #include "AliTRDtrackV1.h"
  62 #include "AliTRDtrackerV1.h"
  63 #include "AliTRDReconstructor.h"
  64 #include "AliTrackReference.h"
  65 #include "AliTrackPointArray.h"
  66 #include "AliTracker.h"
  67 #include "TTreeStream.h"
  68
  69 #include "info/AliTRDtrackInfo.h"
  70 #include "info/AliTRDeventInfo.h"
  71 #include "AliTRDcheckDET.h"
  72
  73 #include <cstdio>
  74 #include <iostream>
  75
  76 ClassImp(AliTRDcheckDET)
  77
  78 //_______________________________________________________
  79 AliTRDcheckDET::AliTRDcheckDET():
  80   AliTRDrecoTask()
  81   ,fEventInfo(NULL)
  82   ,fTriggerNames(NULL)
  83   ,fReconstructor(NULL)
  84   ,fGeo(NULL)
  85   ,fFlags(0)
  86 {
  87   //
  88   // Default constructor
  89   //
  90   SetNameTitle("checkDET", "Basic TRD data checker");
  91 }
  92
  93 //_______________________________________________________
  94 AliTRDcheckDET::AliTRDcheckDET(char* name):
  95   AliTRDrecoTask(name, "Basic TRD data checker")
  96   ,fEventInfo(NULL)
  97   ,fTriggerNames(NULL)
  98   ,fReconstructor(NULL)
  99   ,fGeo(NULL)
 100   ,fFlags(0)
 101 {
 102   //
 103   // Default constructor
 104   //
 105   DefineInput(2, AliTRDeventInfo::Class());
 106
 107   fReconstructor = new AliTRDReconstructor;
 108   fReconstructor->SetRecoParam(AliTRDrecoParam::GetLowFluxParam());
 109   fGeo = new AliTRDgeometry;
 110   InitFunctorList();
 111 }
 112
 113
 114 //_______________________________________________________
 115 AliTRDcheckDET::~AliTRDcheckDET(){
 116   //
 117   // Destructor
 118   //
 119   if(fTriggerNames) delete fTriggerNames;
 120   delete fReconstructor;
 121   delete fGeo;
 122 }
 123
 124 //_______________________________________________________
 125 void AliTRDcheckDET::UserCreateOutputObjects(){
 126   //
 127   // Create Output Objects
 128   //
 129   if(!HasFunctorList()) InitFunctorList();
 130   fContainer = Histos();
 131   if(!fTriggerNames) fTriggerNames = new TMap();
 132 }
 133
 134 //_______________________________________________________
 135 void AliTRDcheckDET::UserExec(Option_t *opt){
 136   //
 137   // Execution function
 138   // Filling TRD quality histos
 139   //
 140
 141   fEventInfo = dynamic_cast<AliTRDeventInfo *>(GetInputData(2));
 142   AliDebug(2, Form("EventInfo[%p] Header[%p]", (void*)fEventInfo, (void*)(fEventInfo?fEventInfo->GetEventHeader():NULL)));
 143
 144   AliTRDrecoTask::UserExec(opt);
 145   Int_t nTracks = 0;            // Count the number of tracks per event
 146   Int_t triggermask = fEventInfo->GetEventHeader()->GetTriggerMask();
 147   TString triggername =  fEventInfo->GetRunInfo()->GetFiredTriggerClasses(triggermask);
 148   AliDebug(6, Form("Trigger cluster: %d, Trigger class: %s\n", triggermask, triggername.Data()));
 149   dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTrigger))->Fill(triggermask);
 150   for(Int_t iti = 0; iti < fTracks->GetEntriesFast(); iti++){
 151     if(!fTracks->UncheckedAt(iti)) continue;
 152     AliTRDtrackInfo *fTrackInfo = dynamic_cast<AliTRDtrackInfo *>(fTracks->UncheckedAt(iti));
 153     if(!fTrackInfo->GetTrack()) continue;
 154     nTracks++;
 155   }
 156
 157   if(nTracks){
 158     dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTriggerTracks))->Fill(triggermask);
 159     dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNtracksEvent))->Fill(nTracks);
 160   }
 161   if(triggermask <= 20 && !fTriggerNames->FindObject(Form("%d", triggermask))){
 162     fTriggerNames->Add(new TObjString(Form("%d", triggermask)), new TObjString(triggername));
 163     // also set the label for both histograms
 164     TH1 *histo = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTriggerTracks));
 165     histo->GetXaxis()->SetBinLabel(histo->FindBin(triggermask), triggername);
 166     histo = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTrigger));
 167     histo->GetXaxis()->SetBinLabel(histo->FindBin(triggermask), triggername);
 168   }
 169   PostData(1, fContainer);
 170 }
 171
 172
 173 //_______________________________________________________
 174 Bool_t AliTRDcheckDET::PostProcess(){
 175   //
 176   // Do Postprocessing (for the moment set the number of Reference histograms)
 177   //
 178
 179   TH1 * h = NULL;
 180
 181   // Calculate of the trigger clusters purity
 182   h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->FindObject("hEventsTrigger"));
 183   TH1F *h1 = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->FindObject("hEventsTriggerTracks"));
 184   h1->Divide(h);
 185   Float_t purities[20], val = 0;
 186   TString triggernames[20];
 187   Int_t nTriggerClasses = 0;
 188   for(Int_t ibin = 1; ibin <= h->GetNbinsX(); ibin++){
 189     if((val = h1->GetBinContent(ibin))){
 190       purities[nTriggerClasses] = val;
 191       triggernames[nTriggerClasses] = h1->GetXaxis()->GetBinLabel(ibin);
 192       nTriggerClasses++;
 193     }
 194   }
 195   h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kTriggerPurity));
 196   TAxis *ax = h->GetXaxis();
 197   for(Int_t itrg = 0; itrg < nTriggerClasses; itrg++){
 198     h->Fill(itrg, purities[itrg]);
 199     ax->SetBinLabel(itrg+1, triggernames[itrg].Data());
 200   }
 201   ax->SetRangeUser(-0.5, nTriggerClasses+.5);
 202   h->GetYaxis()->SetRangeUser(0,1);
 203
 204   // track status
 205   h=dynamic_cast<TH1F*>(fContainer->At(kTrackStatus));
 206   Float_t ok = h->GetBinContent(1);
 207   Int_t nerr = h->GetNbinsX();
 208   for(Int_t ierr=nerr; ierr--;){
 209     h->SetBinContent(ierr+1, ok>0.?1.e2*h->GetBinContent(ierr+1)/ok:0.);
 210   }
 211   h->SetBinContent(1, 0.);
 212
 213   // tracklet status
 214
 215   TObjArray *arr = dynamic_cast<TObjArray*>(fContainer->UncheckedAt(kTrackletStatus));
 216   for(Int_t ily = AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 217     h=dynamic_cast<TH1F*>(arr->At(ily));
 218     Float_t okB = h->GetBinContent(1);
 219     Int_t nerrB = h->GetNbinsX();
 220     for(Int_t ierr=nerrB; ierr--;){
 221       h->SetBinContent(ierr+1, okB>0.?1.e2*h->GetBinContent(ierr+1)/okB:0.);
 222     }
 223     h->SetBinContent(1, 0.);
 224   }
 225
 226   fNRefFigures = 17;
 227
 228   return kTRUE;
 229 }
 230
 231 //_______________________________________________________
 232 void AliTRDcheckDET::MakeSummary(){
 233   //
 234   // Create summary plots for TRD check DET
 235   // This function creates 2 summary plots:
 236   // - General Quantities
 237   // - PHS
 238   // The function will reuse GetRefFigure
 239   //
 240
 241   TCanvas *cOut = new TCanvas(Form("summary%s1", GetName()), Form("Summary 1 for task %s", GetName()), 1024, 768);
 242   cOut->Divide(3,3);
 243
 244   // Create figures using GetRefFigure
 245   cOut->cd(1); GetRefFigure(kFigNtracksEvent);
 246   cOut->cd(2); GetRefFigure(kFigNtracksSector);
 247   cOut->cd(3); GetRefFigure(kFigNclustersTrack);
 248   cOut->cd(4); GetRefFigure(kFigNclustersTracklet);
 249   cOut->cd(5); GetRefFigure(kFigNtrackletsTrack);
 250   cOut->cd(6); GetRefFigure(kFigNTrackletsP);
 251   cOut->cd(7); GetRefFigure(kFigChargeCluster);
 252   cOut->cd(8); GetRefFigure(kFigChargeTracklet);
 253   cOut->SaveAs(Form("TRDsummary%s1.gif", GetName()));
 254   delete cOut;
 255
 256   // Second Plot: PHS
 257   cOut = new TCanvas(Form("summary%s2", GetName()), Form("Summary 2 for task %s", GetName()), 1024, 512);
 258   cOut->cd(); GetRefFigure(kFigPH);
 259   cOut->SaveAs(Form("TRDsummary%s2.gif", GetName()));
 260   delete cOut;
 261
 262   // Third Plot: Mean Number of clusters as function of eta, phi and layer
 263    cOut = new TCanvas(Form("summary%s3", GetName()), Form("Summary 3 for task %s", GetName()), 1024, 768);
 264   cOut->cd(); MakePlotMeanClustersLayer();
 265   cOut->SaveAs(Form("TRDsummary%s3.gif", GetName()));
 266   delete cOut;
 267
 268 }
 269
 270 //_______________________________________________________
 271 Bool_t AliTRDcheckDET::GetRefFigure(Int_t ifig){
 272   //
 273   // Setting Reference Figures
 274   //
 275   gPad->SetLogy(0);
 276   gPad->SetLogx(0);
 277   TH1 *h = NULL; TObjArray *arr=NULL;
 278   TLegend *leg = NULL;
 279   Bool_t kFIRST(1);
 280   switch(ifig){
 281   case kFigNclustersTrack:
 282     (h=(TH1F*)fContainer->FindObject("hNcls"))->Draw("pl");
 283     PutTrendValue("NClustersTrack", h->GetMean());
 284     PutTrendValue("NClustersTrackRMS", h->GetRMS());
 285     return kTRUE;
 286   case kFigNclustersTracklet:
 287     (h =(TH1F*)fContainer->FindObject("hNclTls"))->Draw("pc");
 288     PutTrendValue("NClustersTracklet", h->GetMean());
 289     PutTrendValue("NClustersTrackletRMS", h->GetRMS());
 290     return kTRUE;
 291   case kFigNtrackletsTrack:
 292     h=MakePlotNTracklets();
 293     PutTrendValue("NTrackletsTrack", h->GetMean());
 294     PutTrendValue("NTrackletsTrackRMS", h->GetRMS());
 295     return kTRUE;
 296   case kFigNTrackletsP:
 297     MakePlotnTrackletsVsP();
 298     return kTRUE;
 299   case kFigNtrackletsCross:
 300     h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtlsCross");
 301     if(!MakeBarPlot(h, kRed)) break;
 302     PutTrendValue("NTrackletsCross", h->GetMean());
 303     PutTrendValue("NTrackletsCrossRMS", h->GetRMS());
 304     return kTRUE;
 305   case kFigNtrackletsFindable:
 306     h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtlsFindable");
 307     if(!MakeBarPlot(h, kGreen)) break;
 308     PutTrendValue("NTrackletsFindable", h->GetMean());
 309     PutTrendValue("NTrackletsFindableRMS", h->GetRMS());
 310     return kTRUE;
 311   case kFigNtracksEvent:
 312     (h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtrks"))->Draw("pl");
 313     PutTrendValue("NTracksEvent", h->GetMean());
 314     PutTrendValue("NTracksEventRMS", h->GetRMS());
 315     return kTRUE;
 316   case kFigNtracksSector:
 317     h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtrksSector");
 318     if(!MakeBarPlot(h, kGreen)) break;
 319     PutTrendValue("NTracksSector", h->Integral()/h->GetNbinsX());
 320     return kTRUE;
 321   case kFigTrackStatus:
 322     if(!(h=(TH1F *)fContainer->FindObject("hTrackStatus"))) break;
 323     h->GetXaxis()->SetRangeUser(0.5, -1);
 324     h->GetYaxis()->CenterTitle();
 325     h->Draw("c");
 326     PutTrendValue("TrackStatus", h->Integral());
 327     gPad->SetLogy(0);
 328     return kTRUE;
 329   case kFigTrackletStatus:
 330     if(!(arr = dynamic_cast<TObjArray*>(fContainer->At(kTrackletStatus)))) break;
 331     leg = new TLegend(.68, .7, .97, .97);
 332     leg->SetBorderSize(0);leg->SetFillStyle(0);
 333     leg->SetHeader("TRD layer");
 334     for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 335       if(!(h=dynamic_cast<TH1F*>(arr->At(ily)))) continue;
 336       if(kFIRST){
 337         h->Draw("pl");
 338         h->GetXaxis()->SetRangeUser(0.5, -1);
 339         h->GetYaxis()->CenterTitle();
 340         kFIRST = kFALSE;
 341       } else h->Draw("samepl");
 342       leg->AddEntry(h, Form("ly = %d", ily), "l");
 343       PutTrendValue(Form("TrackletStatus%d", ily), h->Integral());
 344     }
 345     leg->Draw();
 346     gPad->SetLogy(0);
 347     return kTRUE;
 348   case kFigChi2:
 349     return kTRUE;
 350     MakePlotChi2();
 351     return kTRUE;
 352   case kFigPH:
 353     gPad->SetMargin(0.125, 0.015, 0.1, 0.1);
 354     MakePlotPulseHeight();
 355     gPad->SetLogy(0);
 356     return kTRUE;
 357   case kFigChargeCluster:
 358     (h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hQcl"))->Draw("c");
 359     gPad->SetLogy(1);
 360     PutTrendValue("ChargeCluster", h->GetMaximumBin());
 361     PutTrendValue("ChargeClusterRMS", h->GetRMS());
 362     return kTRUE;
 363   case kFigChargeTracklet:
 364     (h=(TH1F*)fContainer->FindObject("hQtrklt"))->Draw("c");
 365     PutTrendValue("ChargeTracklet", h->GetMaximumBin());
 366     PutTrendValue("ChargeTrackletRMS", h->GetRMS());
 367     return kTRUE;
 368   case kFigNeventsTrigger:
 369     ((TH1F*)fContainer->FindObject("hEventsTrigger"))->Draw("");
 370     return kTRUE;
 371   case kFigNeventsTriggerTracks:
 372     ((TH1F*)fContainer->FindObject("hEventsTriggerTracks"))->Draw("");
 373     return kTRUE;
 374   case kFigTriggerPurity:
 375     if(!MakeBarPlot((TH1F*)fContainer->FindObject("hTriggerPurity"), kGreen)) break;
 376     break;
 377   default:
 378     break;
 379   }
 380   AliInfo(Form("Reference plot [%d] missing result", ifig));
 381   return kFALSE;
 382 }
 383
 384 //_______________________________________________________
 385 TObjArray *AliTRDcheckDET::Histos(){
 386   //
 387   // Create QA histograms
 388   //
 389
 390   if(fContainer) return fContainer;
 391
 392   fContainer = new TObjArray(20);
 393   //fContainer->SetOwner(kTRUE);
 394
 395   // Register Histograms
 396   TH1 * h = NULL;
 397   TAxis *ax = NULL;
 398   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNcls"))){
 399     h = new TH1F("hNcls", "N_{clusters} / track", 181, -0.5, 180.5);
 400     h->GetXaxis()->SetTitle("N_{clusters}");
 401     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 402   } else h->Reset();
 403   fContainer->AddAt(h, kNclustersTrack);
 404
 405   TObjArray *arr = new TObjArray(AliTRDgeometry::kNlayer);
 406   arr->SetOwner(kTRUE);  arr->SetName("clusters");
 407   fContainer->AddAt(arr, kNclustersLayer);
 408   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 409     if(!(h = (TProfile2D *)gROOT->FindObject(Form("hNcl%d", ily)))){
 410       h = new TProfile2D(Form("hNcl%d", ily), Form("Mean Number of clusters in Layer %d", ily), 100, -1.0, 1.0, 50, -1.1*TMath::Pi(), 1.1*TMath::Pi());
 411       h->GetXaxis()->SetTitle("#eta");
 412       h->GetYaxis()->SetTitle("#phi");
 413     } else h->Reset();
 414     arr->AddAt(h, ily);
 415   }
 416
 417   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNclTls"))){
 418     h = new TH1F("hNclTls","N_{clusters} / tracklet", 51, -0.5, 50.5);
 419     h->GetXaxis()->SetTitle("N_{clusters}");
 420     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 421   } else h->Reset();
 422   fContainer->AddAt(h, kNclustersTracklet);
 423
 424   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtls"))){
 425     h = new TH1F("hNtls", "N_{tracklets} / track", AliTRDgeometry::kNlayer, 0.5, 6.5);
 426     h->GetXaxis()->SetTitle("N^{tracklet}");
 427     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 428   } else h->Reset();
 429   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsTrack);
 430
 431   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("htlsSTA"))){
 432     h = new TH1F("hNtlsSTA", "N_{tracklets} / track (Stand Alone)", AliTRDgeometry::kNlayer, 0.5, 6.5);
 433     h->GetXaxis()->SetTitle("N^{tracklet}");
 434     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 435   }
 436   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsSTA);
 437
 438   // Binning for momentum dependent tracklet Plots
 439   const Int_t kNp(30);
 440   Float_t P=0.2;
 441   Float_t binsP[kNp+1], binsTrklt[AliTRDgeometry::kNlayer+1];
 442   for(Int_t i=0;i<kNp+1; i++,P+=(TMath::Exp(i*i*.001)-1.)) binsP[i]=P;
 443   for(Int_t il = 0; il <= AliTRDgeometry::kNlayer; il++) binsTrklt[il] = 0.5 + il;
 444   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("htlsBAR"))){
 445     // Make tracklets for barrel tracks momentum dependent (if we do not exceed min and max values)
 446     h = new TH2F("hNtlsBAR",
 447     "N_{tracklets} / track;p [GeV/c];N^{tracklet};freq. [%]",
 448     kNp, binsP, AliTRDgeometry::kNlayer, binsTrklt);
 449   }
 450   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsBAR);
 451
 452   //
 453   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtlsCross"))){
 454     h = new TH1F("hNtlsCross", "N_{tracklets}^{cross} / track", 7, -0.5, 6.5);
 455     h->GetXaxis()->SetTitle("n_{row cross}");
 456     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 457   } else h->Reset();
 458   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsCross);
 459
 460   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtlsFindable"))){
 461     h = new TH1F("hNtlsFindable", "Found/Findable Tracklets" , 101, -0.005, 1.005);
 462     h->GetXaxis()->SetTitle("r [a.u]");
 463     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 464   } else h->Reset();
 465   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsFindable);
 466
 467   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtrks"))){
 468     h = new TH1F("hNtrks", "N_{tracks} / event", 100, 0, 100);
 469     h->GetXaxis()->SetTitle("N_{tracks}");
 470     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 471   } else h->Reset();
 472   fContainer->AddAt(h, kNtracksEvent);
 473
 474   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtrksSector"))){
 475     h = new TH1F("hNtrksSector", "N_{tracks} / sector", AliTRDgeometry::kNsector, -0.5, 17.5);
 476     h->GetXaxis()->SetTitle("sector");
 477     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 478   } else h->Reset();
 479   fContainer->AddAt(h, kNtracksSector);
 480
 481   if(!(h = (TH1F*)gROOT->FindObject("hTrackStatus"))){
 482     const Int_t nerr = 7;
 483     h = new TH1F("hTrackStatus", "Track Status", nerr, -0.5, nerr-0.5);
 484     const Char_t *label[nerr] = {"OK", "PROL", "PROP", "AJST", "SNP", "TINI", "UPDT"};
 485     ax = h->GetXaxis();
 486     for(Int_t ierr=nerr; ierr--;) ax->SetBinLabel(ierr+1, label[ierr]);
 487     h->SetYTitle("Relative Error to Good [%]");
 488   }
 489   fContainer->AddAt(h, kTrackStatus);
 490
 491   arr = new TObjArray(AliTRDgeometry::kNlayer);
 492   arr->SetOwner(kTRUE);  arr->SetName("TrackletStatus");
 493   fContainer->AddAt(arr, kTrackletStatus);
 494   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 495     if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject(Form("hTrackletStatus%d", ily)))){
 496       const Int_t nerr = 8;
 497       h = new TH1F(Form("hTrackletStatus%d", ily), "Tracklet status", nerr, -0.5, nerr-0.5);
 498       h->SetLineColor(ily+1);
 499       const Char_t *label[nerr] = {"OK", "Geom", "Bound", "NoCl", "NoAttach", "NoClTr", "NoFit", "Chi2"};
 500       ax = h->GetXaxis();
 501       for(Int_t ierr=nerr; ierr--;) ax->SetBinLabel(ierr+1, label[ierr]);
 502       h->SetYTitle("Relative Error to Good [%]");
 503     } else h->Reset();
 504     arr->AddAt(h, ily);
 505   }
 506
 507   // <PH> histos
 508   arr = new TObjArray(3);
 509   arr->SetOwner(kTRUE);  arr->SetName("<PH>");
 510   fContainer->AddAt(arr, kPH);
 511   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hPHt"))){
 512     h = new TProfile("hPHt", "<PH>", 31, -0.5, 30.5);
 513     h->GetXaxis()->SetTitle("Time / 100ns");
 514     h->GetYaxis()->SetTitle("<PH> [a.u]");
 515   } else h->Reset();
 516   arr->AddAt(h, 0);
 517   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hPHx")))
 518     h = new TProfile("hPHx", "<PH>", 31, -0.08, 4.88);
 519   else h->Reset();
 520   arr->AddAt(h, 1);
 521   if(!(h = (TH2F *)gROOT->FindObject("hPH2D"))){
 522     h = new TH2F("hPH2D", "Charge Distribution / time", 31, -0.5, 30.5, 100, 0, 1024);
 523     h->GetXaxis()->SetTitle("Time / 100ns");
 524     h->GetYaxis()->SetTitle("Charge / a.u.");
 525   } else h->Reset();
 526   arr->AddAt(h, 2);
 527
 528   // Chi2 histos
 529   if(!(h = (TH2S*)gROOT->FindObject("hChi2"))){
 530     h = new TH2S("hChi2", "#chi^{2} per track", AliTRDgeometry::kNlayer, .5, AliTRDgeometry::kNlayer+.5, 100, 0, 50);
 531     h->SetXTitle("ndf");
 532     h->SetYTitle("#chi^{2}/ndf");
 533     h->SetZTitle("entries");
 534   } else h->Reset();
 535   fContainer->AddAt(h, kChi2);
 536
 537   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hQcl"))){
 538     h = new TH1F("hQcl", "Q_{cluster}", 200, 0, 1200);
 539     h->GetXaxis()->SetTitle("Q_{cluster} [a.u.]");
 540     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 541   }else h->Reset();
 542   fContainer->AddAt(h, kChargeCluster);
 543
 544   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hQtrklt"))){
 545     h = new TH1F("hQtrklt", "Q_{tracklet}", 6000, 0, 6000);
 546     h->GetXaxis()->SetTitle("Q_{tracklet} [a.u.]");
 547     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 548   }else h->Reset();
 549   fContainer->AddAt(h, kChargeTracklet);
 550
 551
 552   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hEventsTrigger")))
 553     h = new TH1F("hEventsTrigger", "Trigger Class", 100, 0, 100);
 554   else h->Reset();
 555   printf("Histos Adding \n");
 556
 557   fContainer->AddAt(h, kNeventsTrigger);
 558
 559   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hEventsTriggerTracks")))
 560     h = new TH1F("hEventsTriggerTracks", "Trigger Class (Tracks)", 100, 0, 100);
 561   else h->Reset();
 562   fContainer->AddAt(h, kNeventsTriggerTracks);
 563
 564   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hTriggerPurity"))){
 565     h = new TH1F("hTriggerPurity", "Trigger Purity", 10, -0.5, 9.5);
 566     h->GetXaxis()->SetTitle("Trigger Cluster");
 567     h->GetYaxis()->SetTitle("freq.");
 568   } else h->Reset();
 569   fContainer->AddAt(h, kTriggerPurity);
 570
 571   return fContainer;
 572 }
 573
 574 /*
 575 * Plotting Functions
 576 */
 577
 578 //_______________________________________________________
 579 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotTrackStatus(const AliTRDtrackV1 *track)
 580 {
 581 //
 582 // Plot the track propagation status. The following errors are defined (see AliTRDtrackV1::ETRDtrackError)
 583 //   PROL - track prolongation failure
 584 //   PROP - track propagation failure
 585 //   AJST - crossing sectors failure
 586 //   SNP  - too large bending
 587 //   TINI - tracklet initialization failure
 588 //   UPDT - track position/covariance update failure
 589 //
 590 // Performance plot looks as below:
 591 //Begin_Html
 592 //<img src="TRD/trackStatus.gif">
 593 //End_Html
 594 //
 595   if(track) fkTrack = track;
 596   if(!fkTrack){
 597     AliDebug(4, "No Track defined.");
 598     return NULL;
 599   }
 600   TH1 *h = NULL;
 601   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kTrackStatus)))){
 602     AliWarning("No Histogram defined.");
 603     return NULL;
 604   }
 605   h->Fill(fkTrack->GetStatusTRD());
 606   return h;
 607 }
 608
 609 //_______________________________________________________
 610 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotTrackletStatus(const AliTRDtrackV1 *track)
 611 {
 612 //
 613 // Plot the tracklet propagation status. The following errors are defined for tracklet (see AliTRDtrackV1::ETRDlayerError)
 614 //   Geom   -
 615 //   Bound  - tracklet too close to chamber walls
 616 //   NoCl   - no clusters in the track roads
 617 //   NoAttach - fail to attach clusters
 618 //   NoClTr - fail to use clusters for fit
 619 //   NoFit  - tracklet fit failled
 620 //   Chi2   - chi2 tracklet-track over threshold
 621 //
 622 // Performance plot looks as below:
 623 //Begin_Html
 624 //<img src="TRD/trackletStatus.gif">
 625 //End_Html
 626 //
 627   if(track) fkTrack = track;
 628   if(!fkTrack){
 629     AliDebug(4, "No Track defined.");
 630     return NULL;
 631   }
 632   TObjArray *arr =NULL;
 633   if(!(arr = dynamic_cast<TObjArray*>(fContainer->At(kTrackletStatus)))){
 634     AliWarning("Histograms not defined.");
 635     return NULL;
 636   }
 637
 638   TH1 *h = NULL;
 639   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 640     if(!(h = dynamic_cast<TH1F*>(arr->At(ily)))){
 641       AliWarning(Form("Missing histo for layer %d.", ily));
 642       continue;
 643     }
 644     h->Fill(fkTrack->GetStatusTRD(ily));
 645   }
 646   return h;
 647 }
 648
 649 //_______________________________________________________
 650 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNClustersTracklet(const AliTRDtrackV1 *track){
 651   //
 652   // Plot the mean number of clusters per tracklet
 653   //
 654   if(track) fkTrack = track;
 655   if(!fkTrack){
 656     AliDebug(4, "No Track defined.");
 657     return NULL;
 658   }
 659   AliExternalTrackParam *par = fkTrack->GetTrackIn() ? fkTrack->GetTrackIn() : fkTrack->GetTrackOut();
 660   TH1 *h = NULL;
 661   TProfile2D *hlayer = NULL;
 662   Double_t eta = 0., phi = 0.;
 663   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNclustersTracklet)))){
 664     AliWarning("No Histogram defined.");
 665     return NULL;
 666   }
 667   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 668   TObjArray *histosLayer = dynamic_cast<TObjArray *>(fContainer->At(kNclustersLayer));
 669   if(!histosLayer){
 670     AliWarning("No Histograms for single layer defined");
 671   }
 672   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
 673     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
 674     h->Fill(tracklet->GetN2());
 675     if(histosLayer && par){
 676       if((hlayer = dynamic_cast<TProfile2D *>(histosLayer->At(itl)))){
 677         GetEtaPhiAt(par, tracklet->GetX0(), eta, phi);
 678         hlayer->Fill(eta, phi, tracklet->GetN2());
 679       }
 680     }
 681   }
 682   return h;
 683 }
 684
 685 //_______________________________________________________
 686 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNClustersTrack(const AliTRDtrackV1 *track){
 687   //
 688   // Plot the number of clusters in one track
 689   //
 690   if(track) fkTrack = track;
 691   if(!fkTrack){
 692     AliDebug(4, "No Track defined.");
 693     return NULL;
 694   }
 695   TH1 *h = NULL;
 696   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNclustersTrack)))){
 697     AliWarning("No Histogram defined.");
 698     return NULL;
 699   }
 700
 701   Int_t nclusters = 0;
 702   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 703   AliExternalTrackParam *par = fkTrack->GetTrackOut() ? fkTrack->GetTrackOut() : fkTrack->GetTrackIn();
 704   if(!par) return NULL;
 705   Double_t momentumRec = par->P();
 706   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
 707     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
 708     Int_t n(tracklet->GetN());
 709     nclusters += n;
 710     if(DebugLevel() > 2){
 711       Int_t crossing = Int_t(tracklet->IsRowCross());
 712       Int_t detector = tracklet->GetDetector();
 713       Float_t theta = TMath::ATan(tracklet->GetZref(1));
 714       Float_t phi = TMath::ATan(tracklet->GetYref(1));
 715       Float_t momentumMC = 0.;
 716       Int_t pdg = 0;
 717       Int_t kinkIndex = fkESD ? fkESD->GetKinkIndex() : 0;
 718       UShort_t nclsTPC = fkESD ? fkESD->GetTPCncls() : 0;
 719       if(fkMC){
 720         if(fkMC->GetTrackRef()) momentumMC = fkMC->GetTrackRef()->P();
 721         pdg = fkMC->GetPDG();
 722       }
 723       (*DebugStream()) << "NClustersTrack"
 724         << "Detector="  << detector
 725         << "crossing="  << crossing
 726         << "momentumMC="<< momentumMC
 727         << "momentumRec=" << momentumRec
 728         << "pdg="                               << pdg
 729         << "theta="                     << theta
 730         << "phi="                               << phi
 731         << "kinkIndex=" << kinkIndex
 732         << "TPCncls="           << nclsTPC
 733         << "TRDncls="   << n
 734         << "\n";
 735     }
 736   }
 737   h->Fill(nclusters);
 738   return h;
 739 }
 740
 741
 742 //_______________________________________________________
 743 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNTrackletsTrack(const AliTRDtrackV1 *track){
 744   //
 745   // Plot the number of tracklets
 746   //
 747   if(track) fkTrack = track;
 748   if(!fkTrack){
 749     AliDebug(4, "No Track defined.");
 750     return NULL;
 751   }
 752   TH1 *h = NULL, *hSta = NULL; TH2 *hBarrel = NULL;
 753   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsTrack)))){
 754     AliWarning("No Histogram defined.");
 755     return NULL;
 756   }
 757   Int_t nTracklets = fkTrack->GetNumberOfTracklets();
 758   h->Fill(nTracklets);
 759   if(!fkESD) return h;
 760   Int_t status = fkESD->GetStatus();
 761
 762 /*  printf("in/out/refit/pid: TRD[%d|%d|%d|%d]\n", status &AliESDtrack::kTRDin ? 1 : 0, status &AliESDtrack::kTRDout ? 1 : 0, status &AliESDtrack::kTRDrefit ? 1 : 0, status &AliESDtrack::kTRDpid ? 1 : 0);*/
 763   Double_t p = 0.;
 764   Int_t method = -1;    // to distinguish between stand alone and full barrel tracks in the debugging
 765   if((status & AliESDtrack::kTRDin) != 0){
 766     method = 1;
 767     // Full Barrel Track: Save momentum dependence
 768     if(!(hBarrel = dynamic_cast<TH2F *>(fContainer->At(kNtrackletsBAR)))){
 769       AliWarning("Method: Barrel.  Histogram not processed!");
 770       return NULL;
 771     }
 772     AliExternalTrackParam *par(fkTrack->GetTrackIn());
 773     if(!par){
 774       AliError("Input track params missing");
 775       return NULL;
 776     }
 777     p = par->P(); // p needed later in the debug streaming
 778     hBarrel->Fill(p, nTracklets);
 779   } else {
 780     // Stand alone Track: momentum dependence not usefull
 781     method = 0;
 782     if(!(hSta = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsSTA)))) {
 783       AliWarning("Method: StandAlone.  Histogram not processed!");
 784       return NULL;
 785     }
 786     hSta->Fill(nTracklets);
 787   }
 788
 789   if(DebugLevel() > 2){
 790     AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 791     Int_t sector = -1, stack = -1, detector;
 792     for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
 793       if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !(tracklet->IsOK())) continue;
 794       detector = tracklet->GetDetector();
 795       sector = fGeo->GetSector(detector);
 796       stack = fGeo->GetStack(detector);
 797       break;
 798     }
 799     (*DebugStream()) << "NTrackletsTrack"
 800       << "Sector="      << sector
 801       << "Stack="        << stack
 802       << "NTracklets="  << nTracklets
 803       << "Method="      << method
 804       << "p="           << p
 805       << "\n";
 806   }
 807   if(DebugLevel() > 3){
 808     AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 809     for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 810       if((tracklet = fkTrack->GetTracklet(il)) && tracklet->IsOK()){
 811         (*DebugStream()) << "NTrackletsLayer"
 812         << "Layer=" << il
 813         << "p=" << p
 814         << "\n";
 815       }
 816     }
 817   }
 818   return h;
 819 }
 820
 821
 822 //_______________________________________________________
 823 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNTrackletsRowCross(const AliTRDtrackV1 *track){
 824   //
 825   // Plot the number of tracklets
 826   //
 827   if(track) fkTrack = track;
 828   if(!fkTrack){
 829     AliDebug(4, "No Track defined.");
 830     return NULL;
 831   }
 832   TH1 *h = NULL;
 833   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsCross)))){
 834     AliWarning("No Histogram defined.");
 835     return NULL;
 836   }
 837
 838   Int_t ncross = 0;
 839   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 840   for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 841     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(il)) || !tracklet->IsOK()) continue;
 842
 843     if(tracklet->IsRowCross()) ncross++;
 844   }
 845   h->Fill(ncross);
 846   return h;
 847 }
 848
 849 //_______________________________________________________
 850 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotFindableTracklets(const AliTRDtrackV1 *track){
 851   //
 852   // Plots the ratio of number of tracklets vs.
 853   // number of findable tracklets
 854   //
 855   // Findable tracklets are defined as track prolongation
 856   // to layer i does not hit the dead area +- epsilon
 857   //
 858   // In order to check whether tracklet hist active area in Layer i,
 859   // the track is refitted and the fitted position + an uncertainty
 860   // range is compared to the chamber border (also with a different
 861   // uncertainty)
 862   //
 863   // For the track fit two cases are distinguished:
 864   // If the track is a stand alone track (defined by the status bit
 865   // encoding, then the track is fitted with the tilted Rieman model
 866   // Otherwise the track is fitted with the Kalman fitter in two steps:
 867   // Since the track parameters are give at the outer point, we first
 868   // fit in direction inwards. Afterwards we fit again in direction outwards
 869   // to extrapolate the track to layers which are not reached by the track
 870   // For the Kalman model, the radial track points have to be shifted by
 871   // a distance epsilon in the direction that we want to fit
 872   //
 873   const Float_t epsilon = 0.01;   // dead area tolerance
 874   const Float_t epsilonR = 1;    // shift in radial direction of the anode wire position (Kalman filter only)
 875   const Float_t deltaY = 0.7;    // Tolerance in the track position in y-direction
 876   const Float_t deltaZ = 7.0;    // Tolerance in the track position in z-direction (Padlength)
 877   Double_t xAnode[AliTRDgeometry::kNlayer] = {300.2, 312.8, 325.4, 338.0, 350.6, 363.2}; // Take the default X0
 878
 879   if(track) fkTrack = track;
 880   if(!fkTrack){
 881     AliDebug(4, "No Track defined.");
 882     return NULL;
 883   }
 884   TH1 *h = NULL;
 885   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsFindable)))){
 886     AliWarning("No Histogram defined.");
 887     return NULL;
 888   }
 889   Int_t nFound = 0, nFindable = 0;
 890   Int_t stack = -1;
 891   Double_t ymin = 0., ymax = 0., zmin = 0., zmax = 0.;
 892   Double_t y = 0., z = 0.;
 893   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 894   AliTRDpadPlane *pp;
 895   for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 896     if((tracklet = fkTrack->GetTracklet(il)) && tracklet->IsOK()){
 897       tracklet->SetReconstructor(fReconstructor);
 898       nFound++;
 899     }
 900   }
 901   // 2 Different cases:
 902   // 1st stand alone: here we cannot propagate, but be can do a Tilted Rieman Fit
 903   // 2nd barrel track: here we propagate the track to the layers
 904   AliTrackPoint points[6];
 905   Float_t xyz[3];
 906   memset(xyz, 0, sizeof(Float_t) * 3);
 907   if(((fkESD->GetStatus() & AliESDtrack::kTRDout) > 0) && !((fkESD->GetStatus() & AliESDtrack::kTRDin) > 0)){
 908     // stand alone track
 909     for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 910       xyz[0] = xAnode[il];
 911       points[il].SetXYZ(xyz);
 912     }
 913     AliTRDtrackerV1::FitRiemanTilt(const_cast<AliTRDtrackV1 *>(fkTrack), NULL, kTRUE, 6, points);
 914   } else {
 915     // barrel track
 916     //
 917     // 2 Steps:
 918     // -> Kalman inwards
 919     // -> Kalman outwards
 920     AliTRDtrackV1 copyTrack(*fkTrack);  // Do Kalman on a (non-constant) copy of the track
 921     AliTrackPoint pointsInward[6], pointsOutward[6];
 922     for(Int_t il = AliTRDgeometry::kNlayer; il--;){
 923       // In order to avoid complications in the Kalman filter if the track points have the same radial
 924       // position like the tracklets, we have to shift the radial postion of the anode wire by epsilon
 925       // in the direction we want to go
 926       // The track points have to be in reverse order for the Kalman Filter inwards
 927       xyz[0] = xAnode[AliTRDgeometry::kNlayer - il - 1] - epsilonR;
 928       pointsInward[il].SetXYZ(xyz);
 929       xyz[0] = xAnode[il] + epsilonR;
 930       pointsOutward[il].SetXYZ(xyz);
 931     }
 932     /*for(Int_t ipt = 0; ipt < AliTRDgeometry::kNlayer; ipt++)
 933       printf("%d. X = %f\n", ipt, points[ipt].GetX());*/
 934     // Kalman inwards
 935     AliTRDtrackerV1::FitKalman(&copyTrack, NULL, kFALSE, 6, pointsInward);
 936     memcpy(points, pointsInward, sizeof(AliTrackPoint) * 6); // Preliminary store the inward results in the Array points
 937     // Kalman outwards
 938     AliTRDtrackerV1::FitKalman(&copyTrack, NULL, kTRUE, 6, pointsInward);
 939     memcpy(points, pointsOutward, sizeof(AliTrackPoint) * AliTRDgeometry::kNlayer);
 940   }
 941   for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 942     y = points[il].GetY();
 943     z = points[il].GetZ();
 944     if((stack = fGeo->GetStack(z, il)) < 0) continue; // Not findable
 945     pp = fGeo->GetPadPlane(il, stack);
 946     ymin = pp->GetCol0() + epsilon;
 947     ymax = pp->GetColEnd() - epsilon;
 948     zmin = pp->GetRowEnd() + epsilon;
 949     zmax = pp->GetRow0() - epsilon;
 950     // ignore y-crossing (material)
 951     if((z + deltaZ > zmin && z - deltaZ < zmax) && (y + deltaY > ymin && y - deltaY < ymax)) nFindable++;
 952       if(DebugLevel() > 3){
 953         Double_t posTracklet[2] = {tracklet ? tracklet->GetYfit(0) : 0, tracklet ? tracklet->GetZfit(0) : 0};
 954         Int_t hasTracklet = tracklet ? 1 : 0;
 955         (*DebugStream())   << "FindableTracklets"
 956           << "layer="     << il
 957           << "ytracklet=" << posTracklet[0]
 958           << "ytrack="    << y
 959           << "ztracklet=" << posTracklet[1]
 960           << "ztrack="    << z
 961           << "tracklet="  << hasTracklet
 962           << "\n";
 963       }
 964   }
 965
 966   h->Fill(nFindable > 0 ? TMath::Min(nFound/static_cast<Double_t>(nFindable), 1.) : 1);
 967   AliDebug(2, Form("Findable[Found]: %d[%d|%f]", nFindable, nFound, nFound/static_cast<Float_t>(nFindable > 0 ? nFindable : 1)));
 968   return h;
 969 }
 970
 971
 972 //_______________________________________________________
 973 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotChi2(const AliTRDtrackV1 *track){
 974   //
 975   // Plot the chi2 of the track
 976   //
 977   if(track) fkTrack = track;
 978   if(!fkTrack){
 979     AliDebug(4, "No Track defined.");
 980     return NULL;
 981   }
 982   TH1 *h = NULL;
 983   if(!(h = dynamic_cast<TH2S*>(fContainer->At(kChi2)))) {
 984     AliWarning("No Histogram defined.");
 985     return NULL;
 986   }
 987   Int_t n = fkTrack->GetNumberOfTracklets();
 988   if(!n) return NULL;
 989
 990   h->Fill(n, fkTrack->GetChi2()/n);
 991   return h;
 992 }
 993
 994
 995 //_______________________________________________________
 996 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotPHt(const AliTRDtrackV1 *track){
 997   //
 998   // Plot the average pulse height
 999   //
1000   if(track) fkTrack = track;
1001   if(!fkTrack){
1002     AliDebug(4, "No Track defined.");
1003     return NULL;
1004   }
1005   TProfile *h = NULL; TH2F *phs2D = NULL;
1006   if(!(h = dynamic_cast<TProfile *>(((TObjArray*)(fContainer->At(kPH)))->At(0)))){
1007     AliWarning("No Histogram defined.");
1008     return NULL;
1009   }
1010   if(!(phs2D = dynamic_cast<TH2F *>(((TObjArray*)(fContainer->At(kPH)))->At(2)))){
1011     AliWarning("2D Pulse Height histogram not defined. Histogramm cannot be filled");
1012   }
1013   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1014   AliTRDcluster *c = NULL;
1015   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1016     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK())continue;
1017     Int_t crossing = Int_t(tracklet->IsRowCross());
1018     Int_t detector = tracklet->GetDetector();
1019     tracklet->ResetClusterIter();
1020     while((c = tracklet->NextCluster())){
1021       if(!IsUsingClustersOutsideChamber() && !c->IsInChamber()) continue;
1022       Int_t localtime        = c->GetLocalTimeBin();
1023       Double_t absoluteCharge = TMath::Abs(c->GetQ());
1024       h->Fill(localtime, absoluteCharge);
1025       phs2D->Fill(localtime, absoluteCharge);
1026       if(DebugLevel() > 3){
1027         Int_t inChamber = c->IsInChamber() ? 1 : 0;
1028         Double_t distance[2];
1029         GetDistanceToTracklet(distance, tracklet, c);
1030         Float_t theta = TMath::ATan(tracklet->GetZref(1));
1031         Float_t phi = TMath::ATan(tracklet->GetYref(1));
1032         AliExternalTrackParam *trdPar = fkTrack->GetTrackIn();
1033         Float_t momentumMC = 0, momentumRec = trdPar ? trdPar->P() : track->P(); // prefer Track Low
1034         Int_t pdg = 0;
1035         Int_t kinkIndex = fkESD ? fkESD->GetKinkIndex() : 0;
1036         UShort_t TPCncls = fkESD ? fkESD->GetTPCncls() : 0;
1037         if(fkMC){
1038           if(fkMC->GetTrackRef()) momentumMC = fkMC->GetTrackRef()->P();
1039           pdg = fkMC->GetPDG();
1040         }
1041         (*DebugStream()) << "PHt"
1042           << "Detector="        << detector
1043           << "crossing="        << crossing
1044           << "inChamber=" << inChamber
1045           << "Timebin="         << localtime
1046           << "Charge="          << absoluteCharge
1047           << "momentumMC="      << momentumMC
1048           << "momentumRec="     << momentumRec
1049           << "pdg="                             << pdg
1050           << "theta="                   << theta
1051           << "phi="                             << phi
1052           << "kinkIndex="       << kinkIndex
1053           << "TPCncls="         << TPCncls
1054           << "dy="        << distance[0]
1055           << "dz="        << distance[1]
1056           << "c.="        << c
1057           << "\n";
1058       }
1059     }
1060   }
1061   return h;
1062 }
1063
1064 //_______________________________________________________
1065 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotPHx(const AliTRDtrackV1 *track){
1066   //
1067   // Plots the average pulse height vs the distance from the anode wire
1068   // (plus const anode wire offset)
1069   //
1070   if(track) fkTrack = track;
1071   if(!fkTrack){
1072      AliDebug(4, "No Track defined.");
1073      return NULL;
1074   }
1075   TProfile *h = NULL;
1076   if(!(h = dynamic_cast<TProfile *>(((TObjArray*)(fContainer->At(kPH)))->At(1)))){
1077     AliWarning("No Histogram defined.");
1078     return NULL;
1079   }
1080   AliTRDseedV1 *tracklet(NULL);
1081   AliTRDcluster *c(NULL);
1082   Double_t xd(0.), dqdl(0.);
1083   TVectorD vq(AliTRDseedV1::kNtb), vxd(AliTRDseedV1::kNtb), vdqdl(AliTRDseedV1::kNtb);
1084   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1085     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !(tracklet->IsOK())) continue;
1086     Int_t det(tracklet->GetDetector());
1087     Bool_t rc(tracklet->IsRowCross());
1088     for(Int_t ic(0); ic<AliTRDseedV1::kNtb; ic++){
1089       Bool_t kFIRST(kFALSE);
1090       if(!(c = tracklet->GetClusters(ic))){
1091          if(!(c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) continue;
1092       } else kFIRST=kTRUE;
1093       if(!IsUsingClustersOutsideChamber() && !c->IsInChamber()) continue;
1094       xd = tracklet->GetX0() - c->GetX(); vxd[ic] = xd;
1095       dqdl=tracklet->GetdQdl(ic); vdqdl[ic] = dqdl;
1096       vq[ic]=c->GetQ();
1097       if(kFIRST && (c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) vq[ic]+=c->GetQ();
1098       h->Fill(xd, dqdl);
1099     }
1100     if(DebugLevel() > 3){
1101       (*DebugStream()) << "PHx"
1102         << "det="  << det
1103         << "rc="   << rc
1104         << "xd="   << &vxd
1105         << "q="    << &vq
1106         << "dqdl=" << &vdqdl
1107         << "\n";
1108     }
1109   }
1110   return h;
1111 }
1112
1113 //_______________________________________________________
1114 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotChargeCluster(const AliTRDtrackV1 *track){
1115   //
1116   // Plot the cluster charge
1117   //
1118   if(track) fkTrack = track;
1119   if(!fkTrack){
1120     AliDebug(4, "No Track defined.");
1121     return NULL;
1122   }
1123   TH1 *h = NULL;
1124   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kChargeCluster)))){
1125     AliWarning("No Histogram defined.");
1126     return NULL;
1127   }
1128   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1129   AliTRDcluster *c = NULL;
1130   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1131     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK())continue;
1132     for(Int_t ic(0); ic < AliTRDseedV1::kNtb; ic++){
1133       Bool_t kFIRST(kFALSE);
1134       if(!(c = tracklet->GetClusters(ic))) {
1135         if(!(c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) continue;
1136       } else kFIRST = kTRUE;
1137       Float_t q(c->GetQ());
1138       if(kFIRST && (c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) q+=c->GetQ();
1139       h->Fill(q);
1140     }
1141   }
1142   return h;
1143 }
1144
1145 //_______________________________________________________
1146 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotChargeTracklet(const AliTRDtrackV1 *track){
1147   //
1148   // Plot the charge deposit per chamber
1149   //
1150   if(track) fkTrack = track;
1151   if(!fkTrack){
1152     AliDebug(4, "No Track defined.");
1153     return NULL;
1154   }
1155   TH1 *h = NULL;
1156   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kChargeTracklet)))){
1157     AliWarning("No Histogram defined.");
1158     return NULL;
1159   }
1160   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1161   AliTRDcluster *c = NULL;
1162   Double_t qTot = 0;
1163   Int_t nTracklets =fkTrack->GetNumberOfTracklets();
1164   for(Int_t itl(0); itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1165     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
1166     qTot = 0.;
1167     for(Int_t ic = AliTRDseedV1::kNclusters; ic--;){
1168       if(!(c = tracklet->GetClusters(ic))) continue;
1169       qTot += TMath::Abs(c->GetQ());
1170     }
1171     h->Fill(qTot);
1172     if(DebugLevel() > 3){
1173       Int_t crossing = (Int_t)tracklet->IsRowCross();
1174       Int_t detector = tracklet->GetDetector();
1175       Float_t theta = TMath::ATan(tracklet->GetZfit(1));
1176       Float_t phi = TMath::ATan(tracklet->GetYfit(1));
1177       Float_t momentum = 0.;
1178       Int_t pdg = 0;
1179       Int_t kinkIndex = fkESD ? fkESD->GetKinkIndex() : 0;
1180       UShort_t nclsTPC = fkESD ? fkESD->GetTPCncls() : 0;
1181       if(fkMC){
1182               if(fkMC->GetTrackRef()) momentum = fkMC->GetTrackRef()->P();
1183         pdg = fkMC->GetPDG();
1184       }
1185       (*DebugStream()) << "ChargeTracklet"
1186         << "Detector="  << detector
1187         << "crossing="  << crossing
1188         << "momentum="  << momentum
1189         << "nTracklets="<< nTracklets
1190         << "pdg="                               << pdg
1191         << "theta="                     << theta
1192         << "phi="                               << phi
1193         << "kinkIndex=" << kinkIndex
1194         << "TPCncls="           << nclsTPC
1195         << "QT="        << qTot
1196         << "\n";
1197     }
1198   }
1199   return h;
1200 }
1201
1202 //_______________________________________________________
1203 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNTracksSector(const AliTRDtrackV1 *track){
1204   //
1205   // Plot the number of tracks per Sector
1206   //
1207   if(track) fkTrack = track;
1208   if(!fkTrack){
1209     AliDebug(4, "No Track defined.");
1210     return NULL;
1211   }
1212   TH1 *h = NULL;
1213   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtracksSector)))){
1214     AliWarning("No Histogram defined.");
1215     return NULL;
1216   }
1217
1218   // TODO we should compare with
1219   // sector = Int_t(track->GetAlpha() / AliTRDgeometry::GetAlpha());
1220
1221   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1222   Int_t sector = -1;
1223   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1224     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
1225     sector = static_cast<Int_t>(tracklet->GetDetector()/AliTRDgeometry::kNdets);
1226     break;
1227   }
1228   h->Fill(sector);
1229   return h;
1230 }
1231
1232
1233 //________________________________________________________
1234 void AliTRDcheckDET::SetRecoParam(AliTRDrecoParam *r)
1235 {
1236
1237   fReconstructor->SetRecoParam(r);
1238 }
1239
1240 //________________________________________________________
1241 void AliTRDcheckDET::GetDistanceToTracklet(Double_t *dist, AliTRDseedV1 * const tracklet, AliTRDcluster * const c)
1242 {
1243   Float_t x = c->GetX();
1244   dist[0] = c->GetY() - tracklet->GetYat(x);
1245   dist[1] = c->GetZ() - tracklet->GetZat(x);
1246 }
1247
1248 //________________________________________________________
1249 void AliTRDcheckDET::GetEtaPhiAt(AliExternalTrackParam *track, Double_t x, Double_t &eta, Double_t &phi){
1250   //
1251   // Get phi and eta at a given radial position
1252   //
1253   AliExternalTrackParam workpar(*track);
1254
1255   Double_t posLocal[3];
1256   Bool_t sucPos = workpar.GetXYZAt(x, fEventInfo->GetRunInfo()->GetMagneticField(), posLocal);
1257   Double_t sagPhi = sucPos ? TMath::ATan2(posLocal[1], posLocal[0]) : 0.;
1258   phi = sagPhi;
1259   eta = workpar.Eta();
1260 }
1261
1262
1263 //_______________________________________________________
1264 TH1* AliTRDcheckDET::MakePlotChi2()
1265 {
1266 // Plot chi2/track normalized to number of degree of freedom
1267 // (tracklets) and compare with the theoretical distribution.
1268 //
1269 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
1270
1271   return NULL;
1272
1273   TH2S *h2 = (TH2S*)fContainer->At(kChi2);
1274   TF1 f("fChi2", "[0]*pow(x, [1]-1)*exp(-0.5*x)", 0., 50.);
1275   f.SetParLimits(1,1, 1e100);
1276   TLegend *leg = new TLegend(.7,.7,.95,.95);
1277   leg->SetBorderSize(1); leg->SetHeader("Tracklets per Track");
1278   TH1D *h1 = NULL;
1279   Bool_t kFIRST = kTRUE;
1280   for(Int_t il=1; il<=h2->GetNbinsX(); il++){
1281     h1 = h2->ProjectionY(Form("pyChi2%d", il), il, il);
1282     if(h1->Integral()<50) continue;
1283     h1->Scale(1./h1->Integral());
1284     h1->SetMarkerStyle(7);h1->SetMarkerColor(il);
1285     h1->SetLineColor(il);h1->SetLineStyle(2);
1286     f.SetParameter(1, .5*il);f.SetLineColor(il);
1287     h1->Fit(&f, "QW+", kFIRST ? "pc": "pcsame");
1288     leg->AddEntry(h1, Form("%d", il), "l");
1289     if(kFIRST){
1290       h1->GetXaxis()->SetRangeUser(0., 25.);
1291     }
1292     kFIRST = kFALSE;
1293   }
1294   leg->Draw();
1295   gPad->SetLogy();
1296   return h1;
1297 }
1298
1299
1300 //________________________________________________________
1301 TH1* AliTRDcheckDET::MakePlotNTracklets(){
1302   //
1303   // Make nice bar plot of the number of tracklets in each method
1304   //
1305   TH2F *tmp = (TH2F *)fContainer->FindObject("hNtlsBAR");
1306   TH1D *hBAR = tmp->ProjectionY();
1307   TH1F *hSTA = (TH1F *)fContainer->FindObject("hNtlsSTA");
1308   TH1F *hCON = (TH1F *)fContainer->FindObject("hNtls");
1309   TLegend *leg = new TLegend(0.13, 0.75, 0.39, 0.89);
1310   leg->SetBorderSize(1);
1311   leg->SetFillColor(0);
1312
1313   Float_t scale = hCON->Integral();
1314   hCON->Scale(100./scale);
1315   hCON->SetFillColor(kRed);hCON->SetLineColor(kRed);
1316   hCON->SetBarWidth(0.2);
1317   hCON->SetBarOffset(0.6);
1318   hCON->SetStats(kFALSE);
1319   hCON->GetYaxis()->SetRangeUser(0.,40.);
1320   hCON->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1321   hCON->Draw("bar1"); leg->AddEntry(hCON, "Total", "f");
1322   hCON->SetMaximum(55.);
1323
1324   hBAR->Scale(100./scale);
1325   hBAR->SetFillColor(kGreen);hBAR->SetLineColor(kGreen);
1326   hBAR->SetBarWidth(0.2);
1327   hBAR->SetBarOffset(0.2);
1328   hBAR->SetTitle("");
1329   hBAR->SetStats(kFALSE);
1330   hBAR->GetYaxis()->SetRangeUser(0.,40.);
1331   hBAR->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1332   hBAR->Draw("bar1same"); leg->AddEntry(hBAR, "Barrel", "f");
1333
1334   hSTA->Scale(100./scale);
1335   hSTA->SetFillColor(kBlue);hSTA->SetLineColor(kBlue);
1336   hSTA->SetBarWidth(0.2);
1337   hSTA->SetBarOffset(0.4);
1338   hSTA->SetTitle("");
1339   hSTA->SetStats(kFALSE);
1340   hSTA->GetYaxis()->SetRangeUser(0.,40.);
1341   hSTA->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1342   hSTA->Draw("bar1same"); leg->AddEntry(hSTA, "Stand Alone", "f");
1343   leg->Draw();
1344   gPad->Update();
1345   return hCON;
1346 }
1347
1348 //________________________________________________________
1349 void AliTRDcheckDET::MakePlotnTrackletsVsP(){
1350   //
1351   // Plot abundance of tracks with number of tracklets as function of momentum
1352   //
1353
1354
1355
1356
1357   Color_t color[AliTRDgeometry::kNlayer] = {kBlue, kOrange, kBlack, kGreen, kCyan, kRed};
1358   TH1 *h(NULL); TGraphErrors *g[AliTRDgeometry::kNlayer];
1359   for(Int_t itl(0); itl<AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1360     g[itl] = new TGraphErrors();
1361     g[itl]->SetLineColor(color[itl]);
1362     g[itl]->SetMarkerColor(color[itl]);
1363     g[itl]->SetMarkerStyle(20 + itl);
1364   }
1365
1366   TH2 *hBar = (TH2F *)fContainer->FindObject("hNtlsBAR");
1367   TAxis *ax(hBar->GetXaxis());
1368   Int_t np(ax->GetNbins());
1369   for(Int_t ipBin(1); ipBin<np; ipBin++){
1370     h = hBar->ProjectionY("npBin", ipBin, ipBin);
1371     if(!Int_t(h->Integral())) continue;
1372     h->Scale(100./h->Integral());
1373     Float_t p(ax->GetBinCenter(ipBin));
1374     Float_t dp(ax->GetBinWidth(ipBin));
1375     Int_t ip(g[0]->GetN());
1376     for(Int_t itl(AliTRDgeometry::kNlayer); itl--;){
1377       g[itl]->SetPoint(ip, p, h->GetBinContent(itl+1));
1378       g[itl]->SetPointError(ip, dp/3.46, h->GetBinError(itl+1));
1379     }
1380   }
1381
1382   TLegend *leg = new TLegend(0.76, 0.6, 1., 0.9);
1383   leg->SetBorderSize(0);
1384   leg->SetHeader("Tracklet/Track");
1385   leg->SetFillStyle(0);
1386   h = hBar->ProjectionX("npxBin"); h->Reset();
1387   h->SetTitle("");
1388   h->GetYaxis()->SetRangeUser(1., 99.);
1389   h->GetYaxis()->SetMoreLogLabels();
1390   h->GetYaxis()->CenterTitle();
1391   h->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1392   h->SetYTitle("Prob. [%]");
1393   h->GetXaxis()->SetRangeUser(0.4, 12.);
1394   h->GetXaxis()->SetMoreLogLabels();
1395   h->GetXaxis()->CenterTitle();
1396   h->Draw("p");
1397   for(Int_t itl(AliTRDgeometry::kNlayer); itl--;){
1398     g[itl]->Draw("pc");
1399     leg->AddEntry(g[itl], Form("n = %d", itl+1),"pl");
1400   }
1401
1402   leg->Draw();
1403   gPad->SetLogx();gPad->SetLogy();
1404 }
1405
1406 //________________________________________________________
1407 Bool_t AliTRDcheckDET::MakePlotPulseHeight(){
1408   //
1409   // Create Plot of the Pluse Height Spectrum
1410   //
1411   TCanvas *output = gPad->GetCanvas();
1412   output->Divide(2);
1413   output->cd(1);
1414   TH1 *h, *h1, *h2;
1415   TObjArray *arr = (TObjArray*)fContainer->FindObject("<PH>");
1416   h = (TH1F*)arr->At(0);
1417   h->SetMarkerStyle(24);
1418   h->SetMarkerColor(kBlack);
1419   h->SetLineColor(kBlack);
1420   h->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.5);
1421   h->Draw("e1");
1422   // Trending for the pulse height: plateau value, slope and timebin of the maximum
1423   TLinearFitter fit(1,"pol1");
1424   Double_t time = 0.;
1425   for(Int_t itime = 10; itime <= 20; itime++){
1426     time = static_cast<Double_t>(itime);
1427     fit.AddPoint(&time, h->GetBinContent(itime + 1), h->GetBinError(itime + 1));
1428   }
1429   fit.Eval();
1430   Double_t plateau = fit.GetParameter(0) + 12 * fit.GetParameter(1);
1431   Double_t slope = fit.GetParameter(1);
1432   PutTrendValue("PHplateau", plateau);
1433   PutTrendValue("PHslope", slope);
1434   PutTrendValue("PHamplificationPeak", static_cast<Double_t>(h->GetMaximumBin()-1));
1435   AliDebug(1, Form("plateau %f, slope %f, MaxTime %f", plateau, slope, static_cast<Double_t>(h->GetMaximumBin()-1)));
1436 //   copy the second histogram in a new one with the same x-dimension as the phs with respect to time
1437   h1 = (TH1F *)arr->At(1);
1438   h2 = new TH1F("hphs1","Average PH", 31, -0.5, 30.5);
1439   for(Int_t ibin = h1->GetXaxis()->GetFirst(); ibin < h1->GetNbinsX(); ibin++)
1440     h2->SetBinContent(ibin, h1->GetBinContent(ibin));
1441   h2->SetMarkerStyle(22);
1442   h2->SetMarkerColor(kBlue);
1443   h2->SetLineColor(kBlue);
1444   h2->Draw("e1same");
1445   gPad->Update();
1446 //   create axis according to the histogram dimensions of the original second histogram
1447   TGaxis *axis = new TGaxis(gPad->GetUxmin(),
1448                     gPad->GetUymax(),
1449                     gPad->GetUxmax(),
1450                     gPad->GetUymax(),
1451                     -0.08, 4.88, 510,"-L");
1452   axis->SetLineColor(kBlue);
1453   axis->SetLabelColor(kBlue);
1454   axis->SetTextColor(kBlue);
1455   axis->SetTitle("x_{0}-x_{c} [cm]");
1456   axis->Draw();
1457
1458   output->cd(2);
1459   TH2 *ph2d = (TH2F *)arr->At(2);
1460   ph2d->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.8);
1461   ph2d->SetStats(kFALSE);
1462   ph2d->Draw("colz");
1463   return kTRUE;
1464 }
1465
1466 //________________________________________________________
1467 void AliTRDcheckDET::MakePlotMeanClustersLayer(){
1468   //
1469   // Create Summary plot for the mean number of clusters per layer
1470   //
1471   TCanvas *output = gPad->GetCanvas();
1472   output->Divide(3,2);
1473   TObjArray *histos = (TObjArray *)fContainer->At(kNclustersLayer);
1474   if(!histos){
1475     AliWarning("Histos for each layer not found");
1476     return;
1477   }
1478   TProfile2D *hlayer = NULL;
1479   for(Int_t ily = 0; ily < AliTRDgeometry::kNlayer; ily++){
1480     hlayer = dynamic_cast<TProfile2D *>(histos->At(ily));
1481     output->cd(ily + 1);
1482     gPad->SetGrid(0,0);
1483     hlayer->Draw("colz");
1484   }
1485 }
1486
1487 //________________________________________________________
1488 Bool_t AliTRDcheckDET::MakeBarPlot(TH1 *histo, Int_t color){
1489   //
1490   // Draw nice bar plots
1491   //
1492   if(!histo->GetEntries()) return kFALSE;
1493   histo->Scale(100./histo->Integral());
1494   histo->SetFillColor(color);
1495   histo->SetBarOffset(.2);
1496   histo->SetBarWidth(.6);
1497   histo->Draw("bar1");
1498   return kTRUE;
1499 }