PWG1/TRD/AliTRDcheckDET.cxx

   1 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   2 //                                                                        //
   3 //                                                                        //
   4 //  Basic checks for tracking and detector performance                    //
   5 //
   6 //     For the moment (15.10.2009) the following checks are implemented    //
   7 //       - Number of clusters/track
   8 //       - Number of clusters/tracklet
   9 //       - Number of tracklets/track from different sources (Barrel, StandAlone)
  10 //       - Number of findable tracklets
  11 //       - Number of tracks per event and TRD sector
  12 //       - <PH>
  13 //       - Chi2 distribution for tracks
  14 //       - Charge distribution per cluster and tracklet
  15 //       - Number of events and tracks per trigger source
  16 //       - Trigger purity
  17 //       - Track and Tracklet propagation status
  18 //
  19 //  Authors:                                                              //
  20 //    Anton Andronic <A.Andronic@gsi.de>                                  //
  21 //    Alexandru Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>                                //
  22 //    Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>                                       //
  23 //                                                                        //
  24 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 #include <TAxis.h>
  27 #include <TCanvas.h>
  28 #include <TFile.h>
  29 #include <TH1F.h>
  30 #include <TH1I.h>
  31 #include <TH2F.h>
  32 #include <TF1.h>
  33 #include <TGaxis.h>
  34 #include <TGraph.h>
  35 #include <TGraphErrors.h>
  36 #include <TLegend.h>
  37 #include <TLinearFitter.h>
  38 #include <TMath.h>
  39 #include <TMap.h>
  40 #include <TProfile2D.h>
  41 #include <TObjArray.h>
  42 #include <TObject.h>
  43 #include <TObjString.h>
  44
  45 #include <TPad.h>
  46 #include <TProfile.h>
  47 #include <TProfile2D.h>
  48 #include <TROOT.h>
  49 #include <TChain.h>
  50
  51 #include "AliLog.h"
  52 #include "AliTRDcluster.h"
  53 #include "AliESDHeader.h"
  54 #include "AliESDRun.h"
  55 #include "AliESDtrack.h"
  56 #include "AliExternalTrackParam.h"
  57 #include "AliTRDgeometry.h"
  58 #include "AliTRDpadPlane.h"
  59 #include "AliTRDSimParam.h"
  60 #include "AliTRDseedV1.h"
  61 #include "AliTRDtrackV1.h"
  62 #include "AliTRDtrackerV1.h"
  63 #include "AliTRDReconstructor.h"
  64 #include "AliTrackReference.h"
  65 #include "AliTrackPointArray.h"
  66 #include "AliTracker.h"
  67 #include "TTreeStream.h"
  68
  69 #include "info/AliTRDtrackInfo.h"
  70 #include "info/AliTRDeventInfo.h"
  71 #include "AliTRDcheckDET.h"
  72
  73 #include <cstdio>
  74 #include <iostream>
  75
  76 ClassImp(AliTRDcheckDET)
  77
  78 //_______________________________________________________
  79 AliTRDcheckDET::AliTRDcheckDET():
  80   AliTRDrecoTask()
  81   ,fEventInfo(NULL)
  82   ,fTriggerNames(NULL)
  83   ,fReconstructor(NULL)
  84   ,fGeo(NULL)
  85   ,fFlags(0)
  86 {
  87   //
  88   // Default constructor
  89   //
  90   SetNameTitle("checkDET", "Basic TRD data checker");
  91 }
  92
  93 //_______________________________________________________
  94 AliTRDcheckDET::AliTRDcheckDET(char* name):
  95   AliTRDrecoTask(name, "Basic TRD data checker")
  96   ,fEventInfo(NULL)
  97   ,fTriggerNames(NULL)
  98   ,fReconstructor(NULL)
  99   ,fGeo(NULL)
 100   ,fFlags(0)
 101 {
 102   //
 103   // Default constructor
 104   //
 105   DefineInput(2, AliTRDeventInfo::Class());
 106
 107   fReconstructor = new AliTRDReconstructor;
 108   fReconstructor->SetRecoParam(AliTRDrecoParam::GetLowFluxParam());
 109   fGeo = new AliTRDgeometry;
 110   InitFunctorList();
 111 }
 112
 113
 114 //_______________________________________________________
 115 AliTRDcheckDET::~AliTRDcheckDET(){
 116   //
 117   // Destructor
 118   //
 119   if(fTriggerNames) delete fTriggerNames;
 120   delete fReconstructor;
 121   delete fGeo;
 122 }
 123
 124 //_______________________________________________________
 125 void AliTRDcheckDET::UserCreateOutputObjects(){
 126   //
 127   // Create Output Objects
 128   //
 129   AliTRDrecoTask::UserCreateOutputObjects();
 130   if(!fTriggerNames) fTriggerNames = new TMap();
 131 }
 132
 133 //_______________________________________________________
 134 void AliTRDcheckDET::UserExec(Option_t *opt){
 135   //
 136   // Execution function
 137   // Filling TRD quality histos
 138   //
 139
 140   fEventInfo = dynamic_cast<AliTRDeventInfo *>(GetInputData(2));
 141   AliDebug(2, Form("EventInfo[%p] Header[%p]", (void*)fEventInfo, (void*)(fEventInfo?fEventInfo->GetEventHeader():NULL)));
 142
 143   AliTRDrecoTask::UserExec(opt);
 144   Int_t nTracks = 0;            // Count the number of tracks per event
 145   Int_t triggermask = fEventInfo->GetEventHeader()->GetTriggerMask();
 146   TString triggername =  fEventInfo->GetRunInfo()->GetFiredTriggerClasses(triggermask);
 147   AliDebug(6, Form("Trigger cluster: %d, Trigger class: %s\n", triggermask, triggername.Data()));
 148   dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTrigger))->Fill(triggermask);
 149   for(Int_t iti = 0; iti < fTracks->GetEntriesFast(); iti++){
 150     if(!fTracks->UncheckedAt(iti)) continue;
 151     AliTRDtrackInfo *fTrackInfo = dynamic_cast<AliTRDtrackInfo *>(fTracks->UncheckedAt(iti));
 152     if(!fTrackInfo->GetTrack()) continue;
 153     nTracks++;
 154   }
 155
 156   if(nTracks){
 157     dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTriggerTracks))->Fill(triggermask);
 158     dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNtracksEvent))->Fill(nTracks);
 159   }
 160   if(triggermask <= 20 && !fTriggerNames->FindObject(Form("%d", triggermask))){
 161     fTriggerNames->Add(new TObjString(Form("%d", triggermask)), new TObjString(triggername));
 162     // also set the label for both histograms
 163     TH1 *histo = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTriggerTracks));
 164     histo->GetXaxis()->SetBinLabel(histo->FindBin(triggermask), triggername);
 165     histo = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTrigger));
 166     histo->GetXaxis()->SetBinLabel(histo->FindBin(triggermask), triggername);
 167   }
 168 }
 169
 170
 171 //_______________________________________________________
 172 Bool_t AliTRDcheckDET::PostProcess(){
 173   //
 174   // Do Postprocessing (for the moment set the number of Reference histograms)
 175   //
 176
 177   TH1 * h = NULL;
 178
 179   // Calculate of the trigger clusters purity
 180   h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->FindObject("hEventsTrigger"));
 181   TH1F *h1 = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->FindObject("hEventsTriggerTracks"));
 182   h1->Divide(h);
 183   Float_t purities[20], val = 0;
 184   TString triggernames[20];
 185   Int_t nTriggerClasses = 0;
 186   for(Int_t ibin = 1; ibin <= h->GetNbinsX(); ibin++){
 187     if((val = h1->GetBinContent(ibin))){
 188       purities[nTriggerClasses] = val;
 189       triggernames[nTriggerClasses] = h1->GetXaxis()->GetBinLabel(ibin);
 190       nTriggerClasses++;
 191     }
 192   }
 193   h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kTriggerPurity));
 194   TAxis *ax = h->GetXaxis();
 195   for(Int_t itrg = 0; itrg < nTriggerClasses; itrg++){
 196     h->Fill(itrg, purities[itrg]);
 197     ax->SetBinLabel(itrg+1, triggernames[itrg].Data());
 198   }
 199   ax->SetRangeUser(-0.5, nTriggerClasses+.5);
 200   h->GetYaxis()->SetRangeUser(0,1);
 201
 202   // track status
 203   h=dynamic_cast<TH1F*>(fContainer->At(kTrackStatus));
 204   Float_t ok = h->GetBinContent(1);
 205   Int_t nerr = h->GetNbinsX();
 206   for(Int_t ierr=nerr; ierr--;){
 207     h->SetBinContent(ierr+1, ok>0.?1.e2*h->GetBinContent(ierr+1)/ok:0.);
 208   }
 209   h->SetBinContent(1, 0.);
 210
 211   // tracklet status
 212
 213   TObjArray *arr = dynamic_cast<TObjArray*>(fContainer->UncheckedAt(kTrackletStatus));
 214   for(Int_t ily = AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 215     h=dynamic_cast<TH1F*>(arr->At(ily));
 216     Float_t okB = h->GetBinContent(1);
 217     Int_t nerrB = h->GetNbinsX();
 218     for(Int_t ierr=nerrB; ierr--;){
 219       h->SetBinContent(ierr+1, okB>0.?1.e2*h->GetBinContent(ierr+1)/okB:0.);
 220     }
 221     h->SetBinContent(1, 0.);
 222   }
 223
 224   fNRefFigures = 17;
 225
 226   return kTRUE;
 227 }
 228
 229 //_______________________________________________________
 230 void AliTRDcheckDET::MakeSummary(){
 231   //
 232   // Create summary plots for TRD check DET
 233   // This function creates 2 summary plots:
 234   // - General Quantities
 235   // - PHS
 236   // The function will reuse GetRefFigure
 237   //
 238
 239   TCanvas *cOut = new TCanvas(Form("summary%s1", GetName()), Form("Summary 1 for task %s", GetName()), 1024, 768);
 240   cOut->Divide(3,3);
 241
 242   // Create figures using GetRefFigure
 243   cOut->cd(1); GetRefFigure(kFigNtracksEvent);
 244   cOut->cd(2); GetRefFigure(kFigNtracksSector);
 245   cOut->cd(3); GetRefFigure(kFigNclustersTrack);
 246   cOut->cd(4); GetRefFigure(kFigNclustersTracklet);
 247   cOut->cd(5); GetRefFigure(kFigNtrackletsTrack);
 248   cOut->cd(6); GetRefFigure(kFigNTrackletsP);
 249   cOut->cd(7); GetRefFigure(kFigChargeCluster);
 250   cOut->cd(8); GetRefFigure(kFigChargeTracklet);
 251   cOut->SaveAs(Form("TRDsummary%s1.gif", GetName()));
 252   delete cOut;
 253
 254   // Second Plot: PHS
 255   cOut = new TCanvas(Form("summary%s2", GetName()), Form("Summary 2 for task %s", GetName()), 1024, 512);
 256   cOut->cd(); GetRefFigure(kFigPH);
 257   cOut->SaveAs(Form("TRDsummary%s2.gif", GetName()));
 258   delete cOut;
 259
 260   // Third Plot: Mean Number of clusters as function of eta, phi and layer
 261    cOut = new TCanvas(Form("summary%s3", GetName()), Form("Summary 3 for task %s", GetName()), 1024, 768);
 262   cOut->cd(); MakePlotMeanClustersLayer();
 263   cOut->SaveAs(Form("TRDsummary%s3.gif", GetName()));
 264   delete cOut;
 265
 266 }
 267
 268 //_______________________________________________________
 269 Bool_t AliTRDcheckDET::GetRefFigure(Int_t ifig){
 270   //
 271   // Setting Reference Figures
 272   //
 273   gPad->SetLogy(0);
 274   gPad->SetLogx(0);
 275   TH1 *h = NULL; TObjArray *arr=NULL;
 276   TLegend *leg = NULL;
 277   Bool_t kFIRST(1);
 278   switch(ifig){
 279   case kFigNclustersTrack:
 280     (h=(TH1F*)fContainer->FindObject("hNcls"))->Draw("pl");
 281     PutTrendValue("NClustersTrack", h->GetMean());
 282     PutTrendValue("NClustersTrackRMS", h->GetRMS());
 283     return kTRUE;
 284   case kFigNclustersTracklet:
 285     (h =(TH1F*)fContainer->FindObject("hNclTls"))->Draw("pc");
 286     PutTrendValue("NClustersTracklet", h->GetMean());
 287     PutTrendValue("NClustersTrackletRMS", h->GetRMS());
 288     return kTRUE;
 289   case kFigNtrackletsTrack:
 290     h=MakePlotNTracklets();
 291     PutTrendValue("NTrackletsTrack", h->GetMean());
 292     PutTrendValue("NTrackletsTrackRMS", h->GetRMS());
 293     return kTRUE;
 294   case kFigNTrackletsP:
 295     MakePlotnTrackletsVsP();
 296     return kTRUE;
 297   case kFigNtrackletsCross:
 298     h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtlsCross");
 299     if(!MakeBarPlot(h, kRed)) break;
 300     PutTrendValue("NTrackletsCross", h->GetMean());
 301     PutTrendValue("NTrackletsCrossRMS", h->GetRMS());
 302     return kTRUE;
 303   case kFigNtrackletsFindable:
 304     h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtlsFindable");
 305     if(!MakeBarPlot(h, kGreen)) break;
 306     PutTrendValue("NTrackletsFindable", h->GetMean());
 307     PutTrendValue("NTrackletsFindableRMS", h->GetRMS());
 308     return kTRUE;
 309   case kFigNtracksEvent:
 310     (h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtrks"))->Draw("pl");
 311     PutTrendValue("NTracksEvent", h->GetMean());
 312     PutTrendValue("NTracksEventRMS", h->GetRMS());
 313     return kTRUE;
 314   case kFigNtracksSector:
 315     h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtrksSector");
 316     if(!MakeBarPlot(h, kGreen)) break;
 317     PutTrendValue("NTracksSector", h->Integral()/h->GetNbinsX());
 318     return kTRUE;
 319   case kFigTrackStatus:
 320     if(!(h=(TH1F *)fContainer->FindObject("hTrackStatus"))) break;
 321     h->GetXaxis()->SetRangeUser(0.5, -1);
 322     h->GetYaxis()->CenterTitle();
 323     h->Draw("c");
 324     PutTrendValue("TrackStatus", h->Integral());
 325     gPad->SetLogy(0);
 326     return kTRUE;
 327   case kFigTrackletStatus:
 328     if(!(arr = dynamic_cast<TObjArray*>(fContainer->At(kTrackletStatus)))) break;
 329     leg = new TLegend(.68, .7, .97, .97);
 330     leg->SetBorderSize(0);leg->SetFillStyle(0);
 331     leg->SetHeader("TRD layer");
 332     for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 333       if(!(h=dynamic_cast<TH1F*>(arr->At(ily)))) continue;
 334       if(kFIRST){
 335         h->Draw("pl");
 336         h->GetXaxis()->SetRangeUser(0.5, -1);
 337         h->GetYaxis()->CenterTitle();
 338         kFIRST = kFALSE;
 339       } else h->Draw("samepl");
 340       leg->AddEntry(h, Form("ly = %d", ily), "l");
 341       PutTrendValue(Form("TrackletStatus%d", ily), h->Integral());
 342     }
 343     leg->Draw();
 344     gPad->SetLogy(0);
 345     return kTRUE;
 346   case kFigChi2:
 347     return kTRUE;
 348     MakePlotChi2();
 349     return kTRUE;
 350   case kFigPH:
 351     gPad->SetMargin(0.125, 0.015, 0.1, 0.1);
 352     MakePlotPulseHeight();
 353     gPad->SetLogy(0);
 354     return kTRUE;
 355   case kFigChargeCluster:
 356     (h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hQcl"))->Draw("c");
 357     gPad->SetLogy(1);
 358     PutTrendValue("ChargeCluster", h->GetMaximumBin());
 359     PutTrendValue("ChargeClusterRMS", h->GetRMS());
 360     return kTRUE;
 361   case kFigChargeTracklet:
 362     (h=(TH1F*)fContainer->FindObject("hQtrklt"))->Draw("c");
 363     PutTrendValue("ChargeTracklet", h->GetMaximumBin());
 364     PutTrendValue("ChargeTrackletRMS", h->GetRMS());
 365     return kTRUE;
 366   case kFigNeventsTrigger:
 367     ((TH1F*)fContainer->FindObject("hEventsTrigger"))->Draw("");
 368     return kTRUE;
 369   case kFigNeventsTriggerTracks:
 370     ((TH1F*)fContainer->FindObject("hEventsTriggerTracks"))->Draw("");
 371     return kTRUE;
 372   case kFigTriggerPurity:
 373     if(!MakeBarPlot((TH1F*)fContainer->FindObject("hTriggerPurity"), kGreen)) break;
 374     break;
 375   default:
 376     break;
 377   }
 378   AliInfo(Form("Reference plot [%d] missing result", ifig));
 379   return kFALSE;
 380 }
 381
 382 //_______________________________________________________
 383 TObjArray *AliTRDcheckDET::Histos(){
 384   //
 385   // Create QA histograms
 386   //
 387
 388   if(fContainer) return fContainer;
 389
 390   fContainer = new TObjArray(20);
 391   //fContainer->SetOwner(kTRUE);
 392
 393   // Register Histograms
 394   TH1 * h = NULL;
 395   TAxis *ax = NULL;
 396   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNcls"))){
 397     h = new TH1F("hNcls", "N_{clusters} / track", 181, -0.5, 180.5);
 398     h->GetXaxis()->SetTitle("N_{clusters}");
 399     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 400   } else h->Reset();
 401   fContainer->AddAt(h, kNclustersTrack);
 402
 403   TObjArray *arr = new TObjArray(AliTRDgeometry::kNlayer);
 404   arr->SetOwner(kTRUE);  arr->SetName("clusters");
 405   fContainer->AddAt(arr, kNclustersLayer);
 406   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 407     if(!(h = (TProfile2D *)gROOT->FindObject(Form("hNcl%d", ily)))){
 408       h = new TProfile2D(Form("hNcl%d", ily), Form("Mean Number of clusters in Layer %d", ily), 100, -1.0, 1.0, 50, -1.1*TMath::Pi(), 1.1*TMath::Pi());
 409       h->GetXaxis()->SetTitle("#eta");
 410       h->GetYaxis()->SetTitle("#phi");
 411     } else h->Reset();
 412     arr->AddAt(h, ily);
 413   }
 414
 415   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNclTls"))){
 416     h = new TH1F("hNclTls","N_{clusters} / tracklet", 51, -0.5, 50.5);
 417     h->GetXaxis()->SetTitle("N_{clusters}");
 418     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 419   } else h->Reset();
 420   fContainer->AddAt(h, kNclustersTracklet);
 421
 422   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtls"))){
 423     h = new TH1F("hNtls", "N_{tracklets} / track", AliTRDgeometry::kNlayer, 0.5, 6.5);
 424     h->GetXaxis()->SetTitle("N^{tracklet}");
 425     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 426   } else h->Reset();
 427   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsTrack);
 428
 429   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("htlsSTA"))){
 430     h = new TH1F("hNtlsSTA", "N_{tracklets} / track (Stand Alone)", AliTRDgeometry::kNlayer, 0.5, 6.5);
 431     h->GetXaxis()->SetTitle("N^{tracklet}");
 432     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 433   }
 434   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsSTA);
 435
 436   // Binning for momentum dependent tracklet Plots
 437   const Int_t kNp(30);
 438   Float_t P=0.2;
 439   Float_t binsP[kNp+1], binsTrklt[AliTRDgeometry::kNlayer+1];
 440   for(Int_t i=0;i<kNp+1; i++,P+=(TMath::Exp(i*i*.001)-1.)) binsP[i]=P;
 441   for(Int_t il = 0; il <= AliTRDgeometry::kNlayer; il++) binsTrklt[il] = 0.5 + il;
 442   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("htlsBAR"))){
 443     // Make tracklets for barrel tracks momentum dependent (if we do not exceed min and max values)
 444     h = new TH2F("hNtlsBAR",
 445     "N_{tracklets} / track;p [GeV/c];N^{tracklet};freq. [%]",
 446     kNp, binsP, AliTRDgeometry::kNlayer, binsTrklt);
 447   }
 448   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsBAR);
 449
 450   //
 451   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtlsCross"))){
 452     h = new TH1F("hNtlsCross", "N_{tracklets}^{cross} / track", 7, -0.5, 6.5);
 453     h->GetXaxis()->SetTitle("n_{row cross}");
 454     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 455   } else h->Reset();
 456   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsCross);
 457
 458   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtlsFindable"))){
 459     h = new TH1F("hNtlsFindable", "Found/Findable Tracklets" , 101, -0.005, 1.005);
 460     h->GetXaxis()->SetTitle("r [a.u]");
 461     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 462   } else h->Reset();
 463   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsFindable);
 464
 465   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtrks"))){
 466     h = new TH1F("hNtrks", "N_{tracks} / event", 100, 0, 100);
 467     h->GetXaxis()->SetTitle("N_{tracks}");
 468     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 469   } else h->Reset();
 470   fContainer->AddAt(h, kNtracksEvent);
 471
 472   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtrksSector"))){
 473     h = new TH1F("hNtrksSector", "N_{tracks} / sector", AliTRDgeometry::kNsector, -0.5, 17.5);
 474     h->GetXaxis()->SetTitle("sector");
 475     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 476   } else h->Reset();
 477   fContainer->AddAt(h, kNtracksSector);
 478
 479   if(!(h = (TH1F*)gROOT->FindObject("hTrackStatus"))){
 480     const Int_t nerr = 7;
 481     h = new TH1F("hTrackStatus", "Track Status", nerr, -0.5, nerr-0.5);
 482     const Char_t *label[nerr] = {"OK", "PROL", "PROP", "AJST", "SNP", "TINI", "UPDT"};
 483     ax = h->GetXaxis();
 484     for(Int_t ierr=nerr; ierr--;) ax->SetBinLabel(ierr+1, label[ierr]);
 485     h->SetYTitle("Relative Error to Good [%]");
 486   }
 487   fContainer->AddAt(h, kTrackStatus);
 488
 489   arr = new TObjArray(AliTRDgeometry::kNlayer);
 490   arr->SetOwner(kTRUE);  arr->SetName("TrackletStatus");
 491   fContainer->AddAt(arr, kTrackletStatus);
 492   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 493     if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject(Form("hTrackletStatus%d", ily)))){
 494       const Int_t nerr = 8;
 495       h = new TH1F(Form("hTrackletStatus%d", ily), "Tracklet status", nerr, -0.5, nerr-0.5);
 496       h->SetLineColor(ily+1);
 497       const Char_t *label[nerr] = {"OK", "Geom", "Bound", "NoCl", "NoAttach", "NoClTr", "NoFit", "Chi2"};
 498       ax = h->GetXaxis();
 499       for(Int_t ierr=nerr; ierr--;) ax->SetBinLabel(ierr+1, label[ierr]);
 500       h->SetYTitle("Relative Error to Good [%]");
 501     } else h->Reset();
 502     arr->AddAt(h, ily);
 503   }
 504
 505   // <PH> histos
 506   arr = new TObjArray(3);
 507   arr->SetOwner(kTRUE);  arr->SetName("<PH>");
 508   fContainer->AddAt(arr, kPH);
 509   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hPHt"))){
 510     h = new TProfile("hPHt", "<PH>", 31, -0.5, 30.5);
 511     h->GetXaxis()->SetTitle("Time / 100ns");
 512     h->GetYaxis()->SetTitle("<PH> [a.u]");
 513   } else h->Reset();
 514   arr->AddAt(h, 0);
 515   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hPHx")))
 516     h = new TProfile("hPHx", "<PH>", 31, -0.08, 4.88);
 517   else h->Reset();
 518   arr->AddAt(h, 1);
 519   if(!(h = (TH2F *)gROOT->FindObject("hPH2D"))){
 520     h = new TH2F("hPH2D", "Charge Distribution / time", 31, -0.5, 30.5, 100, 0, 1024);
 521     h->GetXaxis()->SetTitle("Time / 100ns");
 522     h->GetYaxis()->SetTitle("Charge / a.u.");
 523   } else h->Reset();
 524   arr->AddAt(h, 2);
 525
 526   // Chi2 histos
 527   if(!(h = (TH2S*)gROOT->FindObject("hChi2"))){
 528     h = new TH2S("hChi2", "#chi^{2} per track", AliTRDgeometry::kNlayer, .5, AliTRDgeometry::kNlayer+.5, 100, 0, 50);
 529     h->SetXTitle("ndf");
 530     h->SetYTitle("#chi^{2}/ndf");
 531     h->SetZTitle("entries");
 532   } else h->Reset();
 533   fContainer->AddAt(h, kChi2);
 534
 535   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hQcl"))){
 536     h = new TH1F("hQcl", "Q_{cluster}", 200, 0, 1200);
 537     h->GetXaxis()->SetTitle("Q_{cluster} [a.u.]");
 538     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 539   }else h->Reset();
 540   fContainer->AddAt(h, kChargeCluster);
 541
 542   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hQtrklt"))){
 543     h = new TH1F("hQtrklt", "Q_{tracklet}", 6000, 0, 6000);
 544     h->GetXaxis()->SetTitle("Q_{tracklet} [a.u.]");
 545     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 546   }else h->Reset();
 547   fContainer->AddAt(h, kChargeTracklet);
 548
 549
 550   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hEventsTrigger")))
 551     h = new TH1F("hEventsTrigger", "Trigger Class", 100, 0, 100);
 552   else h->Reset();
 553   printf("Histos Adding \n");
 554
 555   fContainer->AddAt(h, kNeventsTrigger);
 556
 557   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hEventsTriggerTracks")))
 558     h = new TH1F("hEventsTriggerTracks", "Trigger Class (Tracks)", 100, 0, 100);
 559   else h->Reset();
 560   fContainer->AddAt(h, kNeventsTriggerTracks);
 561
 562   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hTriggerPurity"))){
 563     h = new TH1F("hTriggerPurity", "Trigger Purity", 10, -0.5, 9.5);
 564     h->GetXaxis()->SetTitle("Trigger Cluster");
 565     h->GetYaxis()->SetTitle("freq.");
 566   } else h->Reset();
 567   fContainer->AddAt(h, kTriggerPurity);
 568
 569   return fContainer;
 570 }
 571
 572 /*
 573 * Plotting Functions
 574 */
 575
 576 //_______________________________________________________
 577 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotTrackStatus(const AliTRDtrackV1 *track)
 578 {
 579 //
 580 // Plot the track propagation status. The following errors are defined (see AliTRDtrackV1::ETRDtrackError)
 581 //   PROL - track prolongation failure
 582 //   PROP - track propagation failure
 583 //   AJST - crossing sectors failure
 584 //   SNP  - too large bending
 585 //   TINI - tracklet initialization failure
 586 //   UPDT - track position/covariance update failure
 587 //
 588 // Performance plot looks as below:
 589 //Begin_Html
 590 //<img src="TRD/trackStatus.gif">
 591 //End_Html
 592 //
 593   if(track) fkTrack = track;
 594   if(!fkTrack){
 595     AliDebug(4, "No Track defined.");
 596     return NULL;
 597   }
 598   TH1 *h = NULL;
 599   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kTrackStatus)))){
 600     AliWarning("No Histogram defined.");
 601     return NULL;
 602   }
 603   h->Fill(fkTrack->GetStatusTRD());
 604   return h;
 605 }
 606
 607 //_______________________________________________________
 608 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotTrackletStatus(const AliTRDtrackV1 *track)
 609 {
 610 //
 611 // Plot the tracklet propagation status. The following errors are defined for tracklet (see AliTRDtrackV1::ETRDlayerError)
 612 //   Geom   -
 613 //   Bound  - tracklet too close to chamber walls
 614 //   NoCl   - no clusters in the track roads
 615 //   NoAttach - fail to attach clusters
 616 //   NoClTr - fail to use clusters for fit
 617 //   NoFit  - tracklet fit failled
 618 //   Chi2   - chi2 tracklet-track over threshold
 619 //
 620 // Performance plot looks as below:
 621 //Begin_Html
 622 //<img src="TRD/trackletStatus.gif">
 623 //End_Html
 624 //
 625   if(track) fkTrack = track;
 626   if(!fkTrack){
 627     AliDebug(4, "No Track defined.");
 628     return NULL;
 629   }
 630   TObjArray *arr =NULL;
 631   if(!(arr = dynamic_cast<TObjArray*>(fContainer->At(kTrackletStatus)))){
 632     AliWarning("Histograms not defined.");
 633     return NULL;
 634   }
 635
 636   TH1 *h = NULL;
 637   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 638     if(!(h = dynamic_cast<TH1F*>(arr->At(ily)))){
 639       AliWarning(Form("Missing histo for layer %d.", ily));
 640       continue;
 641     }
 642     h->Fill(fkTrack->GetStatusTRD(ily));
 643   }
 644   return h;
 645 }
 646
 647 //_______________________________________________________
 648 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNClustersTracklet(const AliTRDtrackV1 *track){
 649   //
 650   // Plot the mean number of clusters per tracklet
 651   //
 652   if(track) fkTrack = track;
 653   if(!fkTrack){
 654     AliDebug(4, "No Track defined.");
 655     return NULL;
 656   }
 657   AliExternalTrackParam *par = fkTrack->GetTrackIn() ? fkTrack->GetTrackIn() : fkTrack->GetTrackOut();
 658   TH1 *h = NULL;
 659   TProfile2D *hlayer = NULL;
 660   Double_t eta = 0., phi = 0.;
 661   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNclustersTracklet)))){
 662     AliWarning("No Histogram defined.");
 663     return NULL;
 664   }
 665   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 666   TObjArray *histosLayer = dynamic_cast<TObjArray *>(fContainer->At(kNclustersLayer));
 667   if(!histosLayer){
 668     AliWarning("No Histograms for single layer defined");
 669   }
 670   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
 671     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
 672     h->Fill(tracklet->GetN2());
 673     if(histosLayer && par){
 674       if((hlayer = dynamic_cast<TProfile2D *>(histosLayer->At(itl)))){
 675         GetEtaPhiAt(par, tracklet->GetX0(), eta, phi);
 676         hlayer->Fill(eta, phi, tracklet->GetN2());
 677       }
 678     }
 679   }
 680   return h;
 681 }
 682
 683 //_______________________________________________________
 684 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNClustersTrack(const AliTRDtrackV1 *track){
 685   //
 686   // Plot the number of clusters in one track
 687   //
 688   if(track) fkTrack = track;
 689   if(!fkTrack){
 690     AliDebug(4, "No Track defined.");
 691     return NULL;
 692   }
 693   TH1 *h = NULL;
 694   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNclustersTrack)))){
 695     AliWarning("No Histogram defined.");
 696     return NULL;
 697   }
 698
 699   Int_t nclusters = 0;
 700   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 701   AliExternalTrackParam *par = fkTrack->GetTrackOut() ? fkTrack->GetTrackOut() : fkTrack->GetTrackIn();
 702   if(!par) return NULL;
 703   Double_t momentumRec = par->P();
 704   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
 705     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
 706     Int_t n(tracklet->GetN());
 707     nclusters += n;
 708     if(DebugLevel() > 2){
 709       Int_t crossing = Int_t(tracklet->IsRowCross());
 710       Int_t detector = tracklet->GetDetector();
 711       Float_t theta = TMath::ATan(tracklet->GetZref(1));
 712       Float_t phi = TMath::ATan(tracklet->GetYref(1));
 713       Float_t momentumMC = 0.;
 714       Int_t pdg = 0;
 715       Int_t kinkIndex = fkESD ? fkESD->GetKinkIndex() : 0;
 716       UShort_t nclsTPC = fkESD ? fkESD->GetTPCncls() : 0;
 717       if(fkMC){
 718         if(fkMC->GetTrackRef()) momentumMC = fkMC->GetTrackRef()->P();
 719         pdg = fkMC->GetPDG();
 720       }
 721       (*DebugStream()) << "NClustersTrack"
 722         << "Detector="  << detector
 723         << "crossing="  << crossing
 724         << "momentumMC="<< momentumMC
 725         << "momentumRec=" << momentumRec
 726         << "pdg="                               << pdg
 727         << "theta="                     << theta
 728         << "phi="                               << phi
 729         << "kinkIndex=" << kinkIndex
 730         << "TPCncls="           << nclsTPC
 731         << "TRDncls="   << n
 732         << "\n";
 733     }
 734   }
 735   h->Fill(nclusters);
 736   return h;
 737 }
 738
 739
 740 //_______________________________________________________
 741 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNTrackletsTrack(const AliTRDtrackV1 *track){
 742   //
 743   // Plot the number of tracklets
 744   //
 745   if(track) fkTrack = track;
 746   if(!fkTrack){
 747     AliDebug(4, "No Track defined.");
 748     return NULL;
 749   }
 750   TH1 *h = NULL, *hSta = NULL; TH2 *hBarrel = NULL;
 751   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsTrack)))){
 752     AliWarning("No Histogram defined.");
 753     return NULL;
 754   }
 755   Int_t nTracklets = fkTrack->GetNumberOfTracklets();
 756   h->Fill(nTracklets);
 757   if(!fkESD) return h;
 758   Int_t status = fkESD->GetStatus();
 759
 760 /*  printf("in/out/refit/pid: TRD[%d|%d|%d|%d]\n", status &AliESDtrack::kTRDin ? 1 : 0, status &AliESDtrack::kTRDout ? 1 : 0, status &AliESDtrack::kTRDrefit ? 1 : 0, status &AliESDtrack::kTRDpid ? 1 : 0);*/
 761   Double_t p = 0.;
 762   Int_t method = -1;    // to distinguish between stand alone and full barrel tracks in the debugging
 763   if((status & AliESDtrack::kTRDin) != 0){
 764     method = 1;
 765     // Full Barrel Track: Save momentum dependence
 766     if(!(hBarrel = dynamic_cast<TH2F *>(fContainer->At(kNtrackletsBAR)))){
 767       AliWarning("Method: Barrel.  Histogram not processed!");
 768       return NULL;
 769     }
 770     AliExternalTrackParam *par(fkTrack->GetTrackIn());
 771     if(!par){
 772       AliError("Input track params missing");
 773       return NULL;
 774     }
 775     p = par->P(); // p needed later in the debug streaming
 776     hBarrel->Fill(p, nTracklets);
 777   } else {
 778     // Stand alone Track: momentum dependence not usefull
 779     method = 0;
 780     if(!(hSta = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsSTA)))) {
 781       AliWarning("Method: StandAlone.  Histogram not processed!");
 782       return NULL;
 783     }
 784     hSta->Fill(nTracklets);
 785   }
 786
 787   if(DebugLevel() > 2){
 788     AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 789     Int_t sector = -1, stack = -1, detector;
 790     for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
 791       if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !(tracklet->IsOK())) continue;
 792       detector = tracklet->GetDetector();
 793       sector = fGeo->GetSector(detector);
 794       stack = fGeo->GetStack(detector);
 795       break;
 796     }
 797     (*DebugStream()) << "NTrackletsTrack"
 798       << "Sector="      << sector
 799       << "Stack="        << stack
 800       << "NTracklets="  << nTracklets
 801       << "Method="      << method
 802       << "p="           << p
 803       << "\n";
 804   }
 805   if(DebugLevel() > 3){
 806     AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 807     for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 808       if((tracklet = fkTrack->GetTracklet(il)) && tracklet->IsOK()){
 809         (*DebugStream()) << "NTrackletsLayer"
 810         << "Layer=" << il
 811         << "p=" << p
 812         << "\n";
 813       }
 814     }
 815   }
 816   return h;
 817 }
 818
 819
 820 //_______________________________________________________
 821 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNTrackletsRowCross(const AliTRDtrackV1 *track){
 822   //
 823   // Plot the number of tracklets
 824   //
 825   if(track) fkTrack = track;
 826   if(!fkTrack){
 827     AliDebug(4, "No Track defined.");
 828     return NULL;
 829   }
 830   TH1 *h = NULL;
 831   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsCross)))){
 832     AliWarning("No Histogram defined.");
 833     return NULL;
 834   }
 835
 836   Int_t ncross = 0;
 837   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 838   for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 839     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(il)) || !tracklet->IsOK()) continue;
 840
 841     if(tracklet->IsRowCross()) ncross++;
 842   }
 843   h->Fill(ncross);
 844   return h;
 845 }
 846
 847 //_______________________________________________________
 848 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotFindableTracklets(const AliTRDtrackV1 *track){
 849   //
 850   // Plots the ratio of number of tracklets vs.
 851   // number of findable tracklets
 852   //
 853   // Findable tracklets are defined as track prolongation
 854   // to layer i does not hit the dead area +- epsilon
 855   //
 856   // In order to check whether tracklet hist active area in Layer i,
 857   // the track is refitted and the fitted position + an uncertainty
 858   // range is compared to the chamber border (also with a different
 859   // uncertainty)
 860   //
 861   // For the track fit two cases are distinguished:
 862   // If the track is a stand alone track (defined by the status bit
 863   // encoding, then the track is fitted with the tilted Rieman model
 864   // Otherwise the track is fitted with the Kalman fitter in two steps:
 865   // Since the track parameters are give at the outer point, we first
 866   // fit in direction inwards. Afterwards we fit again in direction outwards
 867   // to extrapolate the track to layers which are not reached by the track
 868   // For the Kalman model, the radial track points have to be shifted by
 869   // a distance epsilon in the direction that we want to fit
 870   //
 871   const Float_t epsilon = 0.01;   // dead area tolerance
 872   const Float_t epsilonR = 1;    // shift in radial direction of the anode wire position (Kalman filter only)
 873   const Float_t deltaY = 0.7;    // Tolerance in the track position in y-direction
 874   const Float_t deltaZ = 7.0;    // Tolerance in the track position in z-direction (Padlength)
 875   Double_t xAnode[AliTRDgeometry::kNlayer] = {300.2, 312.8, 325.4, 338.0, 350.6, 363.2}; // Take the default X0
 876
 877   if(track) fkTrack = track;
 878   if(!fkTrack){
 879     AliDebug(4, "No Track defined.");
 880     return NULL;
 881   }
 882   TH1 *h = NULL;
 883   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsFindable)))){
 884     AliWarning("No Histogram defined.");
 885     return NULL;
 886   }
 887   Int_t nFound = 0, nFindable = 0;
 888   Int_t stack = -1;
 889   Double_t ymin = 0., ymax = 0., zmin = 0., zmax = 0.;
 890   Double_t y = 0., z = 0.;
 891   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 892   AliTRDpadPlane *pp;
 893   for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 894     if((tracklet = fkTrack->GetTracklet(il)) && tracklet->IsOK()){
 895       tracklet->SetReconstructor(fReconstructor);
 896       nFound++;
 897     }
 898   }
 899   // 2 Different cases:
 900   // 1st stand alone: here we cannot propagate, but be can do a Tilted Rieman Fit
 901   // 2nd barrel track: here we propagate the track to the layers
 902   AliTrackPoint points[6];
 903   Float_t xyz[3];
 904   memset(xyz, 0, sizeof(Float_t) * 3);
 905   if(((fkESD->GetStatus() & AliESDtrack::kTRDout) > 0) && !((fkESD->GetStatus() & AliESDtrack::kTRDin) > 0)){
 906     // stand alone track
 907     for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 908       xyz[0] = xAnode[il];
 909       points[il].SetXYZ(xyz);
 910     }
 911     AliTRDtrackerV1::FitRiemanTilt(const_cast<AliTRDtrackV1 *>(fkTrack), NULL, kTRUE, 6, points);
 912   } else {
 913     // barrel track
 914     //
 915     // 2 Steps:
 916     // -> Kalman inwards
 917     // -> Kalman outwards
 918     AliTRDtrackV1 copyTrack(*fkTrack);  // Do Kalman on a (non-constant) copy of the track
 919     AliTrackPoint pointsInward[6], pointsOutward[6];
 920     for(Int_t il = AliTRDgeometry::kNlayer; il--;){
 921       // In order to avoid complications in the Kalman filter if the track points have the same radial
 922       // position like the tracklets, we have to shift the radial postion of the anode wire by epsilon
 923       // in the direction we want to go
 924       // The track points have to be in reverse order for the Kalman Filter inwards
 925       xyz[0] = xAnode[AliTRDgeometry::kNlayer - il - 1] - epsilonR;
 926       pointsInward[il].SetXYZ(xyz);
 927       xyz[0] = xAnode[il] + epsilonR;
 928       pointsOutward[il].SetXYZ(xyz);
 929     }
 930     /*for(Int_t ipt = 0; ipt < AliTRDgeometry::kNlayer; ipt++)
 931       printf("%d. X = %f\n", ipt, points[ipt].GetX());*/
 932     // Kalman inwards
 933     AliTRDtrackerV1::FitKalman(&copyTrack, NULL, kFALSE, 6, pointsInward);
 934     memcpy(points, pointsInward, sizeof(AliTrackPoint) * 6); // Preliminary store the inward results in the Array points
 935     // Kalman outwards
 936     AliTRDtrackerV1::FitKalman(&copyTrack, NULL, kTRUE, 6, pointsInward);
 937     memcpy(points, pointsOutward, sizeof(AliTrackPoint) * AliTRDgeometry::kNlayer);
 938   }
 939   for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 940     y = points[il].GetY();
 941     z = points[il].GetZ();
 942     if((stack = fGeo->GetStack(z, il)) < 0) continue; // Not findable
 943     pp = fGeo->GetPadPlane(il, stack);
 944     ymin = pp->GetCol0() + epsilon;
 945     ymax = pp->GetColEnd() - epsilon;
 946     zmin = pp->GetRowEnd() + epsilon;
 947     zmax = pp->GetRow0() - epsilon;
 948     // ignore y-crossing (material)
 949     if((z + deltaZ > zmin && z - deltaZ < zmax) && (y + deltaY > ymin && y - deltaY < ymax)) nFindable++;
 950       if(DebugLevel() > 3){
 951         Double_t posTracklet[2] = {tracklet ? tracklet->GetYfit(0) : 0, tracklet ? tracklet->GetZfit(0) : 0};
 952         Int_t hasTracklet = tracklet ? 1 : 0;
 953         (*DebugStream())   << "FindableTracklets"
 954           << "layer="     << il
 955           << "ytracklet=" << posTracklet[0]
 956           << "ytrack="    << y
 957           << "ztracklet=" << posTracklet[1]
 958           << "ztrack="    << z
 959           << "tracklet="  << hasTracklet
 960           << "\n";
 961       }
 962   }
 963
 964   h->Fill(nFindable > 0 ? TMath::Min(nFound/static_cast<Double_t>(nFindable), 1.) : 1);
 965   AliDebug(2, Form("Findable[Found]: %d[%d|%f]", nFindable, nFound, nFound/static_cast<Float_t>(nFindable > 0 ? nFindable : 1)));
 966   return h;
 967 }
 968
 969
 970 //_______________________________________________________
 971 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotChi2(const AliTRDtrackV1 *track){
 972   //
 973   // Plot the chi2 of the track
 974   //
 975   if(track) fkTrack = track;
 976   if(!fkTrack){
 977     AliDebug(4, "No Track defined.");
 978     return NULL;
 979   }
 980   TH1 *h = NULL;
 981   if(!(h = dynamic_cast<TH2S*>(fContainer->At(kChi2)))) {
 982     AliWarning("No Histogram defined.");
 983     return NULL;
 984   }
 985   Int_t n = fkTrack->GetNumberOfTracklets();
 986   if(!n) return NULL;
 987
 988   h->Fill(n, fkTrack->GetChi2()/n);
 989   return h;
 990 }
 991
 992
 993 //_______________________________________________________
 994 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotPHt(const AliTRDtrackV1 *track){
 995   //
 996   // Plot the average pulse height
 997   //
 998   if(track) fkTrack = track;
 999   if(!fkTrack){
1000     AliDebug(4, "No Track defined.");
1001     return NULL;
1002   }
1003   TProfile *h = NULL; TH2F *phs2D = NULL;
1004   if(!(h = dynamic_cast<TProfile *>(((TObjArray*)(fContainer->At(kPH)))->At(0)))){
1005     AliWarning("No Histogram defined.");
1006     return NULL;
1007   }
1008   if(!(phs2D = dynamic_cast<TH2F *>(((TObjArray*)(fContainer->At(kPH)))->At(2)))){
1009     AliWarning("2D Pulse Height histogram not defined. Histogramm cannot be filled");
1010   }
1011   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1012   AliTRDcluster *c = NULL;
1013   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1014     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK())continue;
1015     Int_t crossing = Int_t(tracklet->IsRowCross());
1016     Int_t detector = tracklet->GetDetector();
1017     tracklet->ResetClusterIter();
1018     while((c = tracklet->NextCluster())){
1019       if(!IsUsingClustersOutsideChamber() && !c->IsInChamber()) continue;
1020       Int_t localtime        = c->GetLocalTimeBin();
1021       Double_t absoluteCharge = TMath::Abs(c->GetQ());
1022       h->Fill(localtime, absoluteCharge);
1023       phs2D->Fill(localtime, absoluteCharge);
1024       if(DebugLevel() > 3){
1025         Int_t inChamber = c->IsInChamber() ? 1 : 0;
1026         Double_t distance[2];
1027         GetDistanceToTracklet(distance, tracklet, c);
1028         Float_t theta = TMath::ATan(tracklet->GetZref(1));
1029         Float_t phi = TMath::ATan(tracklet->GetYref(1));
1030         AliExternalTrackParam *trdPar = fkTrack->GetTrackIn();
1031         Float_t momentumMC = 0, momentumRec = trdPar ? trdPar->P() : track->P(); // prefer Track Low
1032         Int_t pdg = 0;
1033         Int_t kinkIndex = fkESD ? fkESD->GetKinkIndex() : 0;
1034         UShort_t TPCncls = fkESD ? fkESD->GetTPCncls() : 0;
1035         if(fkMC){
1036           if(fkMC->GetTrackRef()) momentumMC = fkMC->GetTrackRef()->P();
1037           pdg = fkMC->GetPDG();
1038         }
1039         (*DebugStream()) << "PHt"
1040           << "Detector="        << detector
1041           << "crossing="        << crossing
1042           << "inChamber=" << inChamber
1043           << "Timebin="         << localtime
1044           << "Charge="          << absoluteCharge
1045           << "momentumMC="      << momentumMC
1046           << "momentumRec="     << momentumRec
1047           << "pdg="                             << pdg
1048           << "theta="                   << theta
1049           << "phi="                             << phi
1050           << "kinkIndex="       << kinkIndex
1051           << "TPCncls="         << TPCncls
1052           << "dy="        << distance[0]
1053           << "dz="        << distance[1]
1054           << "c.="        << c
1055           << "\n";
1056       }
1057     }
1058   }
1059   return h;
1060 }
1061
1062 //_______________________________________________________
1063 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotPHx(const AliTRDtrackV1 *track){
1064   //
1065   // Plots the average pulse height vs the distance from the anode wire
1066   // (plus const anode wire offset)
1067   //
1068   if(track) fkTrack = track;
1069   if(!fkTrack){
1070      AliDebug(4, "No Track defined.");
1071      return NULL;
1072   }
1073   TProfile *h = NULL;
1074   if(!(h = dynamic_cast<TProfile *>(((TObjArray*)(fContainer->At(kPH)))->At(1)))){
1075     AliWarning("No Histogram defined.");
1076     return NULL;
1077   }
1078   AliTRDseedV1 *tracklet(NULL);
1079   AliTRDcluster *c(NULL);
1080   Double_t xd(0.), dqdl(0.);
1081   TVectorD vq(AliTRDseedV1::kNtb), vxd(AliTRDseedV1::kNtb), vdqdl(AliTRDseedV1::kNtb);
1082   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1083     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !(tracklet->IsOK())) continue;
1084     Int_t det(tracklet->GetDetector());
1085     Bool_t rc(tracklet->IsRowCross());
1086     for(Int_t ic(0); ic<AliTRDseedV1::kNtb; ic++){
1087       Bool_t kFIRST(kFALSE);
1088       if(!(c = tracklet->GetClusters(ic))){
1089          if(!(c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) continue;
1090       } else kFIRST=kTRUE;
1091       if(!IsUsingClustersOutsideChamber() && !c->IsInChamber()) continue;
1092       xd = tracklet->GetX0() - c->GetX(); vxd[ic] = xd;
1093       dqdl=tracklet->GetdQdl(ic); vdqdl[ic] = dqdl;
1094       vq[ic]=c->GetQ();
1095       if(kFIRST && (c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) vq[ic]+=c->GetQ();
1096       h->Fill(xd, dqdl);
1097     }
1098     if(DebugLevel() > 3){
1099       (*DebugStream()) << "PHx"
1100         << "det="  << det
1101         << "rc="   << rc
1102         << "xd="   << &vxd
1103         << "q="    << &vq
1104         << "dqdl=" << &vdqdl
1105         << "\n";
1106     }
1107   }
1108   return h;
1109 }
1110
1111 //_______________________________________________________
1112 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotChargeCluster(const AliTRDtrackV1 *track){
1113   //
1114   // Plot the cluster charge
1115   //
1116   if(track) fkTrack = track;
1117   if(!fkTrack){
1118     AliDebug(4, "No Track defined.");
1119     return NULL;
1120   }
1121   TH1 *h = NULL;
1122   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kChargeCluster)))){
1123     AliWarning("No Histogram defined.");
1124     return NULL;
1125   }
1126   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1127   AliTRDcluster *c = NULL;
1128   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1129     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK())continue;
1130     for(Int_t ic(0); ic < AliTRDseedV1::kNtb; ic++){
1131       Bool_t kFIRST(kFALSE);
1132       if(!(c = tracklet->GetClusters(ic))) {
1133         if(!(c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) continue;
1134       } else kFIRST = kTRUE;
1135       Float_t q(c->GetQ());
1136       if(kFIRST && (c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) q+=c->GetQ();
1137       h->Fill(q);
1138     }
1139   }
1140   return h;
1141 }
1142
1143 //_______________________________________________________
1144 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotChargeTracklet(const AliTRDtrackV1 *track){
1145   //
1146   // Plot the charge deposit per chamber
1147   //
1148   if(track) fkTrack = track;
1149   if(!fkTrack){
1150     AliDebug(4, "No Track defined.");
1151     return NULL;
1152   }
1153   TH1 *h = NULL;
1154   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kChargeTracklet)))){
1155     AliWarning("No Histogram defined.");
1156     return NULL;
1157   }
1158   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1159   AliTRDcluster *c = NULL;
1160   Double_t qTot = 0;
1161   Int_t nTracklets =fkTrack->GetNumberOfTracklets();
1162   for(Int_t itl(0); itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1163     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
1164     qTot = 0.;
1165     for(Int_t ic = AliTRDseedV1::kNclusters; ic--;){
1166       if(!(c = tracklet->GetClusters(ic))) continue;
1167       qTot += TMath::Abs(c->GetQ());
1168     }
1169     h->Fill(qTot);
1170     if(DebugLevel() > 3){
1171       Int_t crossing = (Int_t)tracklet->IsRowCross();
1172       Int_t detector = tracklet->GetDetector();
1173       Float_t theta = TMath::ATan(tracklet->GetZfit(1));
1174       Float_t phi = TMath::ATan(tracklet->GetYfit(1));
1175       Float_t momentum = 0.;
1176       Int_t pdg = 0;
1177       Int_t kinkIndex = fkESD ? fkESD->GetKinkIndex() : 0;
1178       UShort_t nclsTPC = fkESD ? fkESD->GetTPCncls() : 0;
1179       if(fkMC){
1180               if(fkMC->GetTrackRef()) momentum = fkMC->GetTrackRef()->P();
1181         pdg = fkMC->GetPDG();
1182       }
1183       (*DebugStream()) << "ChargeTracklet"
1184         << "Detector="  << detector
1185         << "crossing="  << crossing
1186         << "momentum="  << momentum
1187         << "nTracklets="<< nTracklets
1188         << "pdg="                               << pdg
1189         << "theta="                     << theta
1190         << "phi="                               << phi
1191         << "kinkIndex=" << kinkIndex
1192         << "TPCncls="           << nclsTPC
1193         << "QT="        << qTot
1194         << "\n";
1195     }
1196   }
1197   return h;
1198 }
1199
1200 //_______________________________________________________
1201 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNTracksSector(const AliTRDtrackV1 *track){
1202   //
1203   // Plot the number of tracks per Sector
1204   //
1205   if(track) fkTrack = track;
1206   if(!fkTrack){
1207     AliDebug(4, "No Track defined.");
1208     return NULL;
1209   }
1210   TH1 *h = NULL;
1211   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtracksSector)))){
1212     AliWarning("No Histogram defined.");
1213     return NULL;
1214   }
1215
1216   // TODO we should compare with
1217   // sector = Int_t(track->GetAlpha() / AliTRDgeometry::GetAlpha());
1218
1219   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1220   Int_t sector = -1;
1221   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1222     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
1223     sector = static_cast<Int_t>(tracklet->GetDetector()/AliTRDgeometry::kNdets);
1224     break;
1225   }
1226   h->Fill(sector);
1227   return h;
1228 }
1229
1230
1231 //________________________________________________________
1232 void AliTRDcheckDET::SetRecoParam(AliTRDrecoParam *r)
1233 {
1234
1235   fReconstructor->SetRecoParam(r);
1236 }
1237
1238 //________________________________________________________
1239 void AliTRDcheckDET::GetDistanceToTracklet(Double_t *dist, AliTRDseedV1 * const tracklet, AliTRDcluster * const c)
1240 {
1241   Float_t x = c->GetX();
1242   dist[0] = c->GetY() - tracklet->GetYat(x);
1243   dist[1] = c->GetZ() - tracklet->GetZat(x);
1244 }
1245
1246 //________________________________________________________
1247 void AliTRDcheckDET::GetEtaPhiAt(AliExternalTrackParam *track, Double_t x, Double_t &eta, Double_t &phi){
1248   //
1249   // Get phi and eta at a given radial position
1250   //
1251   AliExternalTrackParam workpar(*track);
1252
1253   Double_t posLocal[3];
1254   Bool_t sucPos = workpar.GetXYZAt(x, fEventInfo->GetRunInfo()->GetMagneticField(), posLocal);
1255   Double_t sagPhi = sucPos ? TMath::ATan2(posLocal[1], posLocal[0]) : 0.;
1256   phi = sagPhi;
1257   eta = workpar.Eta();
1258 }
1259
1260
1261 //_______________________________________________________
1262 TH1* AliTRDcheckDET::MakePlotChi2()
1263 {
1264 // Plot chi2/track normalized to number of degree of freedom
1265 // (tracklets) and compare with the theoretical distribution.
1266 //
1267 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
1268
1269   return NULL;
1270
1271   TH2S *h2 = (TH2S*)fContainer->At(kChi2);
1272   TF1 f("fChi2", "[0]*pow(x, [1]-1)*exp(-0.5*x)", 0., 50.);
1273   f.SetParLimits(1,1, 1e100);
1274   TLegend *leg = new TLegend(.7,.7,.95,.95);
1275   leg->SetBorderSize(1); leg->SetHeader("Tracklets per Track");
1276   TH1D *h1 = NULL;
1277   Bool_t kFIRST = kTRUE;
1278   for(Int_t il=1; il<=h2->GetNbinsX(); il++){
1279     h1 = h2->ProjectionY(Form("pyChi2%d", il), il, il);
1280     if(h1->Integral()<50) continue;
1281     h1->Scale(1./h1->Integral());
1282     h1->SetMarkerStyle(7);h1->SetMarkerColor(il);
1283     h1->SetLineColor(il);h1->SetLineStyle(2);
1284     f.SetParameter(1, .5*il);f.SetLineColor(il);
1285     h1->Fit(&f, "QW+", kFIRST ? "pc": "pcsame");
1286     leg->AddEntry(h1, Form("%d", il), "l");
1287     if(kFIRST){
1288       h1->GetXaxis()->SetRangeUser(0., 25.);
1289     }
1290     kFIRST = kFALSE;
1291   }
1292   leg->Draw();
1293   gPad->SetLogy();
1294   return h1;
1295 }
1296
1297
1298 //________________________________________________________
1299 TH1* AliTRDcheckDET::MakePlotNTracklets(){
1300   //
1301   // Make nice bar plot of the number of tracklets in each method
1302   //
1303   TH2F *tmp = (TH2F *)fContainer->FindObject("hNtlsBAR");
1304   TH1D *hBAR = tmp->ProjectionY();
1305   TH1F *hSTA = (TH1F *)fContainer->FindObject("hNtlsSTA");
1306   TH1F *hCON = (TH1F *)fContainer->FindObject("hNtls");
1307   TLegend *leg = new TLegend(0.13, 0.75, 0.39, 0.89);
1308   leg->SetBorderSize(1);
1309   leg->SetFillColor(0);
1310
1311   Float_t scale = hCON->Integral();
1312   hCON->Scale(100./scale);
1313   hCON->SetFillColor(kRed);hCON->SetLineColor(kRed);
1314   hCON->SetBarWidth(0.2);
1315   hCON->SetBarOffset(0.6);
1316   hCON->SetStats(kFALSE);
1317   hCON->GetYaxis()->SetRangeUser(0.,40.);
1318   hCON->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1319   hCON->Draw("bar1"); leg->AddEntry(hCON, "Total", "f");
1320   hCON->SetMaximum(55.);
1321
1322   hBAR->Scale(100./scale);
1323   hBAR->SetFillColor(kGreen);hBAR->SetLineColor(kGreen);
1324   hBAR->SetBarWidth(0.2);
1325   hBAR->SetBarOffset(0.2);
1326   hBAR->SetTitle("");
1327   hBAR->SetStats(kFALSE);
1328   hBAR->GetYaxis()->SetRangeUser(0.,40.);
1329   hBAR->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1330   hBAR->Draw("bar1same"); leg->AddEntry(hBAR, "Barrel", "f");
1331
1332   hSTA->Scale(100./scale);
1333   hSTA->SetFillColor(kBlue);hSTA->SetLineColor(kBlue);
1334   hSTA->SetBarWidth(0.2);
1335   hSTA->SetBarOffset(0.4);
1336   hSTA->SetTitle("");
1337   hSTA->SetStats(kFALSE);
1338   hSTA->GetYaxis()->SetRangeUser(0.,40.);
1339   hSTA->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1340   hSTA->Draw("bar1same"); leg->AddEntry(hSTA, "Stand Alone", "f");
1341   leg->Draw();
1342   gPad->Update();
1343   return hCON;
1344 }
1345
1346 //________________________________________________________
1347 void AliTRDcheckDET::MakePlotnTrackletsVsP(){
1348   //
1349   // Plot abundance of tracks with number of tracklets as function of momentum
1350   //
1351
1352
1353
1354
1355   Color_t color[AliTRDgeometry::kNlayer] = {kBlue, kOrange, kBlack, kGreen, kCyan, kRed};
1356   TH1 *h(NULL); TGraphErrors *g[AliTRDgeometry::kNlayer];
1357   for(Int_t itl(0); itl<AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1358     g[itl] = new TGraphErrors();
1359     g[itl]->SetLineColor(color[itl]);
1360     g[itl]->SetMarkerColor(color[itl]);
1361     g[itl]->SetMarkerStyle(20 + itl);
1362   }
1363
1364   TH2 *hBar = (TH2F *)fContainer->FindObject("hNtlsBAR");
1365   TAxis *ax(hBar->GetXaxis());
1366   Int_t np(ax->GetNbins());
1367   for(Int_t ipBin(1); ipBin<np; ipBin++){
1368     h = hBar->ProjectionY("npBin", ipBin, ipBin);
1369     if(!Int_t(h->Integral())) continue;
1370     h->Scale(100./h->Integral());
1371     Float_t p(ax->GetBinCenter(ipBin));
1372     Float_t dp(ax->GetBinWidth(ipBin));
1373     Int_t ip(g[0]->GetN());
1374     for(Int_t itl(AliTRDgeometry::kNlayer); itl--;){
1375       g[itl]->SetPoint(ip, p, h->GetBinContent(itl+1));
1376       g[itl]->SetPointError(ip, dp/3.46, h->GetBinError(itl+1));
1377     }
1378   }
1379
1380   TLegend *leg = new TLegend(0.76, 0.6, 1., 0.9);
1381   leg->SetBorderSize(0);
1382   leg->SetHeader("Tracklet/Track");
1383   leg->SetFillStyle(0);
1384   h = hBar->ProjectionX("npxBin"); h->Reset();
1385   h->SetTitle("");
1386   h->GetYaxis()->SetRangeUser(1., 99.);
1387   h->GetYaxis()->SetMoreLogLabels();
1388   h->GetYaxis()->CenterTitle();
1389   h->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1390   h->SetYTitle("Prob. [%]");
1391   h->GetXaxis()->SetRangeUser(0.4, 12.);
1392   h->GetXaxis()->SetMoreLogLabels();
1393   h->GetXaxis()->CenterTitle();
1394   h->Draw("p");
1395   for(Int_t itl(AliTRDgeometry::kNlayer); itl--;){
1396     g[itl]->Draw("pc");
1397     leg->AddEntry(g[itl], Form("n = %d", itl+1),"pl");
1398   }
1399
1400   leg->Draw();
1401   gPad->SetLogx();gPad->SetLogy();
1402 }
1403
1404 //________________________________________________________
1405 Bool_t AliTRDcheckDET::MakePlotPulseHeight(){
1406   //
1407   // Create Plot of the Pluse Height Spectrum
1408   //
1409   TCanvas *output = gPad->GetCanvas();
1410   output->Divide(2);
1411   output->cd(1);
1412   TH1 *h, *h1, *h2;
1413   TObjArray *arr = (TObjArray*)fContainer->FindObject("<PH>");
1414   h = (TH1F*)arr->At(0);
1415   h->SetMarkerStyle(24);
1416   h->SetMarkerColor(kBlack);
1417   h->SetLineColor(kBlack);
1418   h->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.5);
1419   h->Draw("e1");
1420   // Trending for the pulse height: plateau value, slope and timebin of the maximum
1421   TLinearFitter fit(1,"pol1");
1422   Double_t time = 0.;
1423   for(Int_t itime = 10; itime <= 20; itime++){
1424     time = static_cast<Double_t>(itime);
1425     fit.AddPoint(&time, h->GetBinContent(itime + 1), h->GetBinError(itime + 1));
1426   }
1427   fit.Eval();
1428   Double_t plateau = fit.GetParameter(0) + 12 * fit.GetParameter(1);
1429   Double_t slope = fit.GetParameter(1);
1430   PutTrendValue("PHplateau", plateau);
1431   PutTrendValue("PHslope", slope);
1432   PutTrendValue("PHamplificationPeak", static_cast<Double_t>(h->GetMaximumBin()-1));
1433   AliDebug(1, Form("plateau %f, slope %f, MaxTime %f", plateau, slope, static_cast<Double_t>(h->GetMaximumBin()-1)));
1434 //   copy the second histogram in a new one with the same x-dimension as the phs with respect to time
1435   h1 = (TH1F *)arr->At(1);
1436   h2 = new TH1F("hphs1","Average PH", 31, -0.5, 30.5);
1437   for(Int_t ibin = h1->GetXaxis()->GetFirst(); ibin < h1->GetNbinsX(); ibin++)
1438     h2->SetBinContent(ibin, h1->GetBinContent(ibin));
1439   h2->SetMarkerStyle(22);
1440   h2->SetMarkerColor(kBlue);
1441   h2->SetLineColor(kBlue);
1442   h2->Draw("e1same");
1443   gPad->Update();
1444 //   create axis according to the histogram dimensions of the original second histogram
1445   TGaxis *axis = new TGaxis(gPad->GetUxmin(),
1446                     gPad->GetUymax(),
1447                     gPad->GetUxmax(),
1448                     gPad->GetUymax(),
1449                     -0.08, 4.88, 510,"-L");
1450   axis->SetLineColor(kBlue);
1451   axis->SetLabelColor(kBlue);
1452   axis->SetTextColor(kBlue);
1453   axis->SetTitle("x_{0}-x_{c} [cm]");
1454   axis->Draw();
1455
1456   output->cd(2);
1457   TH2 *ph2d = (TH2F *)arr->At(2);
1458   ph2d->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.8);
1459   ph2d->SetStats(kFALSE);
1460   ph2d->Draw("colz");
1461   return kTRUE;
1462 }
1463
1464 //________________________________________________________
1465 void AliTRDcheckDET::MakePlotMeanClustersLayer(){
1466   //
1467   // Create Summary plot for the mean number of clusters per layer
1468   //
1469   TCanvas *output = gPad->GetCanvas();
1470   output->Divide(3,2);
1471   TObjArray *histos = (TObjArray *)fContainer->At(kNclustersLayer);
1472   if(!histos){
1473     AliWarning("Histos for each layer not found");
1474     return;
1475   }
1476   TProfile2D *hlayer = NULL;
1477   for(Int_t ily = 0; ily < AliTRDgeometry::kNlayer; ily++){
1478     hlayer = dynamic_cast<TProfile2D *>(histos->At(ily));
1479     output->cd(ily + 1);
1480     gPad->SetGrid(0,0);
1481     hlayer->Draw("colz");
1482   }
1483 }
1484
1485 //________________________________________________________
1486 Bool_t AliTRDcheckDET::MakeBarPlot(TH1 *histo, Int_t color){
1487   //
1488   // Draw nice bar plots
1489   //
1490   if(!histo->GetEntries()) return kFALSE;
1491   histo->Scale(100./histo->Integral());
1492   histo->SetFillColor(color);
1493   histo->SetBarOffset(.2);
1494   histo->SetBarWidth(.6);
1495   histo->Draw("bar1");
1496   return kTRUE;
1497 }