PWG4/macros/anaTaggedPhoton.C

   1 /* $Id:  $ */
   2 //--------------------------------------------------
   3 // Example macro to do analysis with the
   4 // analysis classes in PWG4PartCorr
   5 // Can be executed with Root and AliRoot
   6 //
   7 // Pay attention to the options and definitions
   8 // set in the lines below
   9 //
  10 //  Author : Gustavo Conesa Balbastre (INFN-LNF)
  11 //
  12 //-------------------------------------------------
  13 enum anaModes {mLocal, mLocalCAF,mPROOF,mGRID};
  14 //mLocal: Analyze locally files in your computer
  15 //mLocalCAF: Analyze locally CAF files
  16 //mPROOF: Analyze CAF files with PROOF
  17
  18 //---------------------------------------------------------------------------
  19 //Settings to read locally several files, only for "mLocal" mode
  20 //The different values are default, they can be set with environmental
  21 //variables: INDIR, PATTERN, NEVENT, respectivelly
  22 char * kInDir = "/home/blau/data";
  23 char * kPattern = ""; // Data are in diles /data/Run0,
  24 Int_t kEvent = 3; // Number of files
  25 //---------------------------------------------------------------------------
  26 //Collection file for grid analysis
  27 char * kXML = "collection.xml";
  28 //---------------------------------------------------------------------------
  29 //Scale histograms from file. Change to kTRUE when xsection file exists
  30 //Put name of file containing xsection
  31 //Put number of events per ESD file
  32 //This is an specific case for normalization of Pythia files.
  33 const Bool_t kGetXSectionFromFileAndScale = kFALSE ;
  34 const char * kXSFileName = "pyxsec.root";
  35 //const Int_t kNumberOfEventsPerFile = 100;
  36 //---------------------------------------------------------------------------
  37
  38 const Bool_t kMC = kTRUE; //With real data kMC = kFALSE
  39 const TString kInputData = "ESD";//ESD, AOD, MC
  40 TString kTreeName = "esdTree";
  41
  42 void anaPhotonTagging(Int_t mode=mGRID, TString configName = "ConfigAnalysisPhoton")
  43 {
  44   // Main
  45
  46   //--------------------------------------------------------------------
  47   // Load analysis libraries
  48   // Look at the method below,
  49   // change whatever you need for your analysis case
  50   // ------------------------------------------------------------------
  51   LoadLibraries(mode) ;
  52
  53   //-------------------------------------------------------------------------------------------------
  54   //Create chain from ESD and from cross sections files, look below for options.
  55   //-------------------------------------------------------------------------------------------------
  56   if(kInputData == "ESD") kTreeName = "esdTree" ;
  57   else if(kInputData == "AOD") kTreeName = "aodTree" ;
  58   else if (kInputData == "MC") kTreeName = "TE" ;
  59   else {
  60     cout<<"Wrong  data type "<<kInputData<<endl;
  61     break;
  62   }
  63
  64   TChain *chain   = new TChain(kTreeName) ;
  65   TChain * chainxs = new TChain("Xsection") ;
  66   CreateChain(mode, chain, chainxs);
  67
  68   if(chain){
  69     AliLog::SetGlobalLogLevel(AliLog::kError);//Minimum prints on screen
  70
  71     //--------------------------------------
  72     // Make the analysis manager
  73     //-------------------------------------
  74     AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("Manager", "Manager");
  75     // MC handler
  76     if(kMC || kInputData == "MC"){
  77       AliMCEventHandler* mcHandler = new AliMCEventHandler();
  78       mcHandler->SetReadTR(kFALSE);//Do not search TrackRef file
  79       mgr->SetMCtruthEventHandler(mcHandler);
  80     }
  81
  82     // AOD output handler
  83     AliAODHandler* aodoutHandler   = new AliAODHandler();
  84     aodoutHandler->SetOutputFileName("aod.root");
  85     //aodoutHandler->SetCreateNonStandardAOD();
  86     mgr->SetOutputEventHandler(aodoutHandler);
  87
  88     //input
  89     if(kInputData == "ESD"){
  90       // ESD handler
  91       AliESDInputHandler *esdHandler = new AliESDInputHandler();
  92       mgr->SetInputEventHandler(esdHandler);
  93     }
  94     if(kInputData == "AOD"){
  95       // AOD handler
  96       AliAODInputHandler *aodHandler = new AliAODInputHandler();
  97       mgr->SetInputEventHandler(aodHandler);
  98     }
  99
 100     //mgr->SetDebugLevel(-1); // For debugging, do not uncomment if you want no messages.
 101
 102     //-------------------------------------------------------------------------
 103     //Define task, put here any other task that you want to use.
 104     //-------------------------------------------------------------------------
 105 //    AliAnaPi0Conv * task = new AliAnaPi0Conv("Pi0") ;
 106
 107     AliAnalysisTaskTaggedPhotons * taskPHOS = new AliAnalysisTaskTaggedPhotons("TaggedPHOS");
 108     taskPHOS->SetPHOS(kTRUE);
 109     mgr->AddTask(taskPHOS);
 110
 111     AliAnalysisTaskTaggedPhotons * taskEMCAL = new AliAnalysisTaskTaggedPhotons("TaggedEMCAL");
 112     taskEMCAL->SetPHOS(kFALSE);
 113     mgr->AddTask(taskEMCAL);
 114
 115
 116     // Create containers for input/output
 117     AliAnalysisDataContainer *cinput1 = mgr->CreateContainer("cchain",TChain::Class(),
 118                                                              AliAnalysisManager::kInputContainer);
 119     AliAnalysisDataContainer *coutput1 = mgr->CreateContainer("tree", TTree::Class(),
 120                                                               AliAnalysisManager::kOutputContainer, "default");
 121     AliAnalysisDataContainer *coutput2 = mgr->CreateContainer("histosP", TList::Class(),
 122                                                               AliAnalysisManager::kOutputContainer, "histosPHOS.root");
 123     AliAnalysisDataContainer *coutput3 = mgr->CreateContainer("histosE", TList::Class(),
 124                                                               AliAnalysisManager::kOutputContainer, "histosEMCAL.root");
 125
 126     mgr->ConnectInput  (taskPHOS,     0, cinput1);
 127     mgr->ConnectOutput (taskPHOS,     0, coutput1 );
 128     mgr->ConnectOutput (taskPHOS,     1, coutput2 );
 129     mgr->ConnectInput  (taskEMCAL,     0, cinput1);
 130     mgr->ConnectOutput (taskEMCAL,     0, coutput1 );
 131     mgr->ConnectOutput (taskEMCAL,     1, coutput3 );
 132
 133
 134
 135     //-----------------------
 136     // Run the analysis
 137     //-----------------------
 138     TString smode = "";
 139     if (mode==mLocal || mode == mLocalCAF)
 140       smode = "local";
 141     else if (mode==mPROOF)
 142       smode = "proof";
 143     else if (mode==mGRID)
 144       smode = "grid";
 145
 146     mgr->InitAnalysis();
 147     mgr->PrintStatus();
 148     mgr->StartAnalysis("local",chain);
 149 //    mgr->StartAnalysis(smode.Data(),chain);
 150
 151 cout <<" Analysis ended sucessfully "<< endl ;
 152
 153   }
 154   else cout << "Chain was not produced ! "<<endl;
 155
 156 }
 157
 158 void  LoadLibraries(const anaModes mode) {
 159
 160   //--------------------------------------
 161   // Load the needed libraries most of them already loaded by aliroot
 162   //--------------------------------------
 163   gSystem->Load("libTree.so");
 164   gSystem->Load("libGeom.so");
 165   gSystem->Load("libVMC.so");
 166   gSystem->Load("libXMLIO.so");
 167
 168   //----------------------------------------------------------
 169   // >>>>>>>>>>> Local mode <<<<<<<<<<<<<<
 170   //----------------------------------------------------------
 171   if (mode==mLocal || mode == mLocalCAF || mode == mGRID) {
 172     //--------------------------------------------------------
 173     // If you want to use already compiled libraries
 174     // in the aliroot distribution
 175     //--------------------------------------------------------
 176     //gSystem->Load("libSTEERBase");
 177     //gSystem->Load("libESD");
 178     //gSystem->Load("libAOD");
 179     //gSystem->Load("libANALYSIS");
 180     //gSystem->Load("libANALYSISalice");
 181     //gSystem->Load("libPHOSUtils");
 182     //gSystem->Load("libPWG4PartCorrBase");
 183     //gSystem->Load("libPWG4PartCorrDep");
 184
 185     //--------------------------------------------------------
 186     //If you want to use root and par files from aliroot
 187     //--------------------------------------------------------
 188     SetupPar("STEERBase");
 189     SetupPar("ESD");
 190     SetupPar("AOD");
 191     SetupPar("ANALYSIS");
 192     SetupPar("ANALYSISalice");
 193 //If your analysis needs PHOS geometry uncomment following lines
 194         SetupPar("PHOSUtils");
 195 //      //Create Geometry
 196     TGeoManager::Import("geometry.root") ; //need file "geometry.root" in local dir!!!!
 197      SetupPar("PWG4PartCorrBase");
 198      SetupPar("PWG4PartCorrDep");
 199   }
 200
 201   //---------------------------------------------------------
 202   // <<<<<<<<<< PROOF mode >>>>>>>>>>>>
 203   //---------------------------------------------------------
 204   else if (mode==mPROOF) {
 205     //
 206     // Connect to proof
 207     // Put appropriate username here
 208     // TProof::Reset("proof://mgheata@lxb6046.cern.ch");
 209     TProof::Open("proof://mgheata@lxb6046.cern.ch");
 210
 211     //    gProof->ClearPackages();
 212     //    gProof->ClearPackage("ESD");
 213     //    gProof->ClearPackage("AOD");
 214     //    gProof->ClearPackage("ANALYSIS");
 215     //    gProof->ClearPackage("PWG4PartCorrBase");
 216     //    gProof->ClearPackage("PWG4PartCorrDep");
 217
 218     // Enable the STEERBase Package
 219     gProof->UploadPackage("STEERBase.par");
 220     gProof->EnablePackage("STEERBase");
 221     // Enable the ESD Package
 222     gProof->UploadPackage("ESD.par");
 223     gProof->EnablePackage("ESD");
 224     // Enable the AOD Package
 225     gProof->UploadPackage("AOD.par");
 226     gProof->EnablePackage("AOD");
 227     // Enable the Analysis Package
 228     gProof->UploadPackage("ANALYSIS.par");
 229     gProof->EnablePackage("ANALYSIS");
 230         // Enable the PHOS geometry Package
 231     //gProof->UploadPackage("PHOSUtils.par");
 232     //gProof->EnablePackage("PHOSUtils");
 233     // Enable PartCorr analysis
 234     gProof->UploadPackage("PWG4PartCorrBase.par");
 235     gProof->EnablePackage("PWG4PartCorrBase");
 236         gProof->UploadPackage("PWG4PartCorrDep.par");
 237     gProof->EnablePackage("PWG4PartCorrDep");
 238     gProof->ShowEnabledPackages();
 239   }
 240
 241 }
 242
 243 void SetupPar(char* pararchivename)
 244 {
 245   //Load par files, create analysis libraries
 246   //For testing, if par file already decompressed and modified
 247   //classes then do not decompress.
 248
 249   TString cdir(Form("%s", gSystem->WorkingDirectory() )) ;
 250   TString parpar(Form("%s.par", pararchivename)) ;
 251   if ( gSystem->AccessPathName(parpar.Data()) ) {
 252     gSystem->ChangeDirectory(gSystem->Getenv("ALICE_ROOT")) ;
 253     TString processline(Form(".! make %s", parpar.Data())) ;
 254     gROOT->ProcessLine(processline.Data()) ;
 255     gSystem->ChangeDirectory(cdir) ;
 256     processline = Form(".! mv $ALICE_ROOT/%s .", parpar.Data()) ;
 257     gROOT->ProcessLine(processline.Data()) ;
 258   }
 259   if ( gSystem->AccessPathName(pararchivename) ) {
 260     TString processline = Form(".! tar xvzf %s",parpar.Data()) ;
 261     gROOT->ProcessLine(processline.Data());
 262   }
 263
 264   TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
 265   gSystem->ChangeDirectory(pararchivename);
 266
 267   // check for BUILD.sh and execute
 268   if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
 269     printf("*******************************\n");
 270     printf("*** Building PAR archive    ***\n");
 271     cout<<pararchivename<<endl;
 272     printf("*******************************\n");
 273
 274     if (gSystem->Exec("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
 275       Error("runProcess","Cannot Build the PAR Archive! - Abort!");
 276       return -1;
 277     }
 278   }
 279   // check for SETUP.C and execute
 280   if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/SETUP.C")) {
 281     printf("*******************************\n");
 282     printf("*** Setup PAR archive       ***\n");
 283     cout<<pararchivename<<endl;
 284     printf("*******************************\n");
 285     gROOT->Macro("PROOF-INF/SETUP.C");
 286   }
 287
 288   gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data());
 289   printf("Current dir: %s\n", ocwd.Data());
 290 }
 291
 292
 293
 294 void CreateChain(const anaModes mode, TChain * chain, TChain * chainxs){
 295   //Fills chain with data
 296   TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
 297
 298   //-----------------------------------------------------------
 299   //Analysis of CAF data locally and with PROOF
 300   //-----------------------------------------------------------
 301   if(mode ==mPROOF || mode ==mLocalCAF){
 302     // Chain from CAF
 303     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG0/CreateESDChain.C");
 304     // The second parameter is the number of input files in the chain
 305     chain = CreateESDChain("ESD12001.txt", 5);
 306   }
 307
 308   //---------------------------------------
 309   //Local files analysis
 310   //---------------------------------------
 311   else if(mode == mLocal){
 312     //If you want to add several ESD files sitting in a common directory INDIR
 313     //Specify as environmental variables the directory (INDIR), the number of files
 314     //to analyze (NEVENT) and the pattern name of the directories with files (PATTERN)
 315
 316     if(gSystem->Getenv("INDIR"))
 317       kInDir = gSystem->Getenv("INDIR") ;
 318     else cout<<"INDIR not set, use default: "<<kInDir<<endl;
 319
 320     if(gSystem->Getenv("PATTERN"))
 321       kPattern = gSystem->Getenv("PATTERN") ;
 322     else  cout<<"PATTERN not set, use default: "<<kPattern<<endl;
 323
 324     if(gSystem->Getenv("NEVENT"))
 325       kEvent = atoi(gSystem->Getenv("NEVENT")) ;
 326     else cout<<"NEVENT not set, use default: "<<kEvent<<endl;
 327
 328     //Check if env variables are set and are correct
 329     if ( kInDir  && kEvent) {
 330       printf("Get %d files from directory %s\n",kEvent,kInDir);
 331       if ( ! gSystem->cd(kInDir) ) {//check if ESDs directory exist
 332         printf("%s does not exist\n", kInDir) ;
 333         return ;
 334       }
 335       cout<<"INDIR : "<<kInDir<<endl;
 336       cout<<"NEVENT : "<<kEvent<<endl;
 337       cout<<"PATTERN: " <<kPattern<<endl;
 338
 339       TString datafile="";
 340       if(kInputData == "ESD") datafile = "AliESDs.root" ;
 341       else if(kInputData == "AOD") datafile = "aod.root" ;
 342       else if(kInputData == "MC")  datafile = "galice.root" ;
 343
 344       //Loop on ESD files, add them to chain
 345       Int_t event =0;
 346       Int_t skipped=0 ;
 347       char file[120] ;
 348       char filexs[120] ;
 349
 350       for (event = 0 ; event < kEvent ; event++) {
 351         sprintf(file, "%s/%s%d/%s", kInDir,kPattern,event,datafile.Data()) ;
 352         sprintf(filexs, "%s/%s%d/%s", kInDir,kPattern,event,kXSFileName) ;
 353         TFile * fESD = 0 ;
 354         //Check if file exists and add it, if not skip it
 355         if ( fESD = TFile::Open(file)) {
 356           if ( fESD->Get(kTreeName) ) {
 357             printf("++++ Adding %s\n", file) ;
 358             chain->AddFile(file);
 359             chainxs->Add(filexs) ;
 360           }
 361         }
 362         else {
 363           printf("---- Skipping %s\n", file) ;
 364           skipped++ ;
 365         }
 366       }
 367       printf("number of entries # %lld, skipped %d\n", chain->GetEntries(), skipped*100) ;
 368     }
 369     else {
 370       TString input = "AliESDs.root" ;
 371       cout<<">>>>>> No list added, take a single file <<<<<<<<< "<<input<<endl;
 372       chain->AddFile(input);
 373     }
 374
 375   }// local files analysis
 376
 377   //------------------------------
 378   //GRID xml files
 379   //-----------------------------
 380   else if(mode == mGRID){
 381     //Get colection file. It is specified by the environmental
 382     //variable XML
 383
 384     if(gSystem->Getenv("XML") )
 385       kXML = gSystem->Getenv("XML");
 386     else
 387       sprintf(kXML, "collection.xml") ;
 388
 389     if (!TFile::Open(kXML)) {
 390       printf("No collection file with name -- %s -- was found\n",kXML);
 391       return ;
 392     }
 393     else cout<<"XML file "<<kXML<<endl;
 394
 395     //Load necessary libraries and connect to the GRID
 396     gSystem->Load("libNetx.so") ;
 397     gSystem->Load("libRAliEn.so");
 398     TGrid::Connect("alien://") ;
 399
 400     //Feed Grid with collection file
 401     //TGridCollection * collection =  (TGridCollection*)gROOT->ProcessLine(Form("TAlienCollection::Open(\"%s\", 0)", kXML));
 402     TGridCollection * collection = (TGridCollection*) TAlienCollection::Open(kXML);
 403     if (! collection) {
 404       AliError(Form("%s not found", kXML)) ;
 405       return kFALSE ;
 406     }
 407     TGridResult* result = collection->GetGridResult("",0 ,0);
 408
 409     // Makes the ESD chain
 410     printf("*** Getting the Chain       ***\n");
 411     for (Int_t index = 0; index < result->GetEntries(); index++) {
 412       TString alienURL = result->GetKey(index, "turl") ;
 413       cout << "================== " << alienURL << endl ;
 414       chain->Add(alienURL) ;
 415       alienURL.ReplaceAll("AliESDs.root",kXSFileName);
 416       chainxs->Add(alienURL) ;
 417     }
 418   }// xml analysis
 419
 420   gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data());
 421 }
 422
 423 //________________________________________________
 424 void GetAverageXsection(TTree * tree, Double_t & xs, Float_t & ntr)
 425 {
 426   // Read the PYTHIA statistics from the file pyxsec.root created by
 427   // the function WriteXsection():
 428   // integrated cross section (xsection) and
 429   // the  number of Pyevent() calls (ntrials)
 430   // and calculate the weight per one event xsection/ntrials
 431   // The spectrum calculated by a user should be
 432   // multiplied by this weight, something like this:
 433   // TH1F *userSpectrum ... // book and fill the spectrum
 434   // userSpectrum->Scale(weight)
 435   //
 436   // Yuri Kharlov 19 June 2007
 437   // Gustavo Conesa 15 April 2008
 438   Double_t xsection = 0;
 439   UInt_t    ntrials = 0;
 440   xs = 0;
 441   ntr = 0;
 442
 443   Int_t nfiles =  tree->GetEntries()  ;
 444   if (tree && nfiles > 0) {
 445     tree->SetBranchAddress("xsection",&xsection);
 446     tree->SetBranchAddress("ntrials",&ntrials);
 447     for(Int_t i = 0; i < nfiles; i++){
 448       tree->GetEntry(i);
 449       xs += xsection ;
 450       ntr += ntrials ;
 451       cout << "xsection " <<xsection<<" ntrials "<<ntrials<<endl;
 452     }
 453
 454     xs =   xs /  nfiles;
 455     ntr =  ntr / nfiles;
 456     cout << "-----------------------------------------------------------------"<<endl;
 457     cout << "Average of "<< nfiles<<" files: xsection " <<xs<<" ntrials "<<ntr<<endl;
 458     cout << "-----------------------------------------------------------------"<<endl;
 459   }
 460   else cout << " >>>> Empty tree !!!! <<<<< "<<endl;
 461
 462 }
 463
 464
 465