PWGGA/CaloTasks/AliAnalysisTaskCaloFilter.cxx

   1 /**************************************************************************
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   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 //////////////////////////////////////////////////////////
  17 // Filter the ESDCaloClusters and ESDCaloCells of EMCAL,
  18 // PHOS or both, creating the corresponing AODCaloClusters
  19 // and AODCaloCells.
  20 // Keep also the AODHeader information and the vertex.
  21 // Keep tracks, v0s, VZERO if requested
  22 // Select events containing a cluster or track avobe a given threshold
  23 // Copy of AliAnalysisTaskESDfilter.
  24 // Author: Gustavo Conesa Balbastre (INFN - Frascati)
  25 //////////////////////////////////////////////////////////
  26
  27 //Root
  28 #include "TGeoManager.h"
  29 #include "TFile.h"
  30 #include "TROOT.h"
  31 #include "TInterpreter.h"
  32
  33 //STEER
  34 #include "AliESDEvent.h"
  35 #include "AliAODEvent.h"
  36 #include "AliLog.h"
  37 #include "AliVCluster.h"
  38 #include "AliVCaloCells.h"
  39 #include "AliVEventHandler.h"
  40 #include "AliAnalysisManager.h"
  41 #include "AliInputEventHandler.h"
  42
  43 //EMCAL
  44 #include "AliEMCALRecoUtils.h"
  45 #include "AliEMCALGeometry.h"
  46
  47 #include "AliAnalysisTaskCaloFilter.h"
  48
  49 ClassImp(AliAnalysisTaskCaloFilter)
  50
  51 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  52
  53 AliAnalysisTaskCaloFilter::AliAnalysisTaskCaloFilter():
  54 AliAnalysisTaskSE("CaloFilterTask"),
  55 fCaloFilter(0),           fEventSelection(),
  56 fAcceptAllMBEvent(kFALSE),  fCorrect(kFALSE),
  57 fEMCALGeo(0x0),           fEMCALGeoName("EMCAL_COMPLETE12SMV1"),
  58 fEMCALRecoUtils(new AliEMCALRecoUtils),
  59 fLoadEMCALMatrices(kFALSE), //fLoadPHOSMatrices(kFALSE),
  60 fGeoMatrixSet(kFALSE),
  61 fConfigName(""),          fFillAODFile(kTRUE),
  62 fFillTracks(kFALSE),      fFillHybridTracks(kFALSE),
  63 fFillAllVertices(kFALSE), fFillv0s(kFALSE),
  64 fFillVZERO(kFALSE),
  65 fEMCALEnergyCut(0.),      fEMCALNcellsCut (0),
  66 fPHOSEnergyCut(0.),       fPHOSNcellsCut (0),
  67 fTrackPtCut(-1),
  68 fVzCut(100.),             fEvent(0x0),
  69 fESDEvent(0x0),           fAODEvent(0x0)
  70 {
  71   // Default constructor
  72
  73   fEventSelection[0] = kFALSE;
  74   fEventSelection[1] = kFALSE;
  75   fEventSelection[2] = kFALSE;
  76
  77   for(Int_t i = 0; i < 12; i++) fEMCALMatrix[i] = 0 ;
  78   //for(Int_t i = 0; i < 5 ; i++) fPHOSMatrix[i]  = 0 ;
  79
  80 }
  81
  82 //__________________________________________________
  83 AliAnalysisTaskCaloFilter::AliAnalysisTaskCaloFilter(const char* name):
  84 AliAnalysisTaskSE(name),
  85 fCaloFilter(0),           fEventSelection(),
  86 fAcceptAllMBEvent(kFALSE),  fCorrect(kFALSE),
  87 fEMCALGeo(0x0),           fEMCALGeoName("EMCAL_COMPLETE12SMV1"),
  88 fEMCALRecoUtils(new AliEMCALRecoUtils),
  89 fLoadEMCALMatrices(kFALSE), //fLoadPHOSMatrices(kFALSE),
  90 fGeoMatrixSet(kFALSE),
  91 fConfigName(""),          fFillAODFile(kTRUE),
  92 fFillTracks(kFALSE),      fFillHybridTracks(kFALSE),
  93 fFillAllVertices(kFALSE), fFillv0s(kFALSE),
  94 fFillVZERO(kFALSE),
  95 fEMCALEnergyCut(0.),      fEMCALNcellsCut(0),
  96 fPHOSEnergyCut(0.),       fPHOSNcellsCut(0),
  97 fTrackPtCut(-1),
  98 fVzCut(100.),             fEvent(0x0),
  99 fESDEvent(0x0),           fAODEvent(0x0)
 100 {
 101   // Constructor
 102
 103   fEventSelection[0] = kFALSE;
 104   fEventSelection[1] = kFALSE;
 105   fEventSelection[2] = kFALSE;
 106
 107   for(Int_t i = 0; i < 12; i++) fEMCALMatrix[i] = 0 ;
 108   //for(Int_t i = 0; i < 5 ; i++) fPHOSMatrix[i]  = 0 ;
 109
 110 }
 111
 112 //__________________________________________________
 113 AliAnalysisTaskCaloFilter::~AliAnalysisTaskCaloFilter()
 114 {
 115   //Destructor.
 116
 117   if(fEMCALGeo)        delete fEMCALGeo;
 118   if(fEMCALRecoUtils)  delete fEMCALRecoUtils;
 119
 120 }
 121
 122 //_____________________________________________
 123 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEvent()
 124 {
 125   // Define conditions to accept the event to be filtered
 126
 127   Bool_t eventSel = kFALSE;
 128
 129   Bool_t isMB = (((AliInputEventHandler*)(AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetInputEventHandler()))->IsEventSelected() & AliVEvent::kMB);
 130
 131   if     ( isMB && fAcceptAllMBEvent )                eventSel = kTRUE; // accept any MB event
 132
 133   else if( fEventSelection[0] && AcceptEventEMCAL() ) eventSel = kTRUE; // accept event depending on EMCAL activity
 134
 135   else if( fEventSelection[1] && AcceptEventPHOS () ) eventSel = kTRUE; // accept event depending on PHOS  activity
 136
 137   else if( fEventSelection[2] && AcceptEventTrack() ) eventSel = kTRUE; // accept event depending on Track activity
 138
 139   return eventSel ;
 140
 141 }
 142
 143 //__________________________________________________
 144 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventEMCAL()
 145 {
 146   // Accept event given there is a EMCAL cluster with enough energy, and not noisy, exotic
 147
 148   if(fCaloFilter==kPHOS)   return kTRUE; // accept
 149
 150   if(fEMCALEnergyCut <= 0) return kTRUE; // accept
 151
 152   Int_t           nCluster = InputEvent() -> GetNumberOfCaloClusters();
 153   AliVCaloCells * caloCell = InputEvent() -> GetEMCALCells();
 154   Int_t           bc       = InputEvent() -> GetBunchCrossNumber();
 155
 156   for(Int_t icalo = 0; icalo < nCluster; icalo++)
 157   {
 158     AliVCluster *clus = (AliVCluster*) (InputEvent()->GetCaloCluster(icalo));
 159
 160     if( ( clus->IsEMCAL() ) && ( clus->GetNCells() > fEMCALNcellsCut ) && ( clus->E() > fEMCALEnergyCut ) &&
 161        fEMCALRecoUtils->IsGoodCluster(clus,fEMCALGeo,caloCell,bc))
 162     {
 163
 164       if (fDebug > 0) printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventEMCAL() - Accept :  E %2.2f > %2.2f, nCells %d > %d \n",
 165                              clus->E(), fEMCALEnergyCut, clus->GetNCells(), fEMCALNcellsCut);
 166
 167       return kTRUE;
 168     }
 169
 170   }// loop
 171
 172   if (fDebug > 0)  printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventEMCAL() - Reject \n");
 173
 174   return kFALSE;
 175
 176 }
 177
 178 //_________________________________________________
 179 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventPHOS()
 180 {
 181   // Accept event given there is a PHOS cluster with enough energy and not noisy/exotic
 182
 183   if(fCaloFilter==kEMCAL) return kTRUE; // accept
 184
 185   if(fPHOSEnergyCut <= 0) return kTRUE; // accept
 186
 187   Int_t nCluster = InputEvent() -> GetNumberOfCaloClusters();
 188
 189   for(Int_t icalo = 0; icalo < nCluster; icalo++)
 190   {
 191     AliVCluster *clus = (AliVCluster*) (InputEvent()->GetCaloCluster(icalo));
 192
 193     if( ( clus->IsPHOS() ) && ( clus->GetNCells() > fPHOSNcellsCut ) && ( clus->E() > fPHOSEnergyCut ))
 194     {
 195
 196       if (fDebug > 0) printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventPHOS() - Accept :  E %2.2f > %2.2f, nCells %d > %d \n",
 197                              clus->E(), fPHOSEnergyCut, clus->GetNCells(), fPHOSNcellsCut);
 198
 199       return kTRUE;
 200     }
 201
 202   }// loop
 203
 204   if (fDebug > 0)  printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventPHOS() - Reject \n");
 205
 206   return kFALSE;
 207
 208 }
 209
 210 //__________________________________________________
 211 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventTrack()
 212 {
 213   // Accept event if there is a track avobe a certain pT
 214
 215   if(fTrackPtCut <= 0) return kTRUE; // accept
 216
 217   Double_t pTrack[3] = {0,0,0};
 218
 219   for (Int_t nTrack = 0; nTrack < fEvent->GetNumberOfTracks(); ++nTrack)
 220   {
 221     AliVTrack *track = (AliVTrack*) fEvent->GetTrack(nTrack);
 222
 223     // Select only hybrid tracks?
 224     if(fAODEvent && fFillHybridTracks && !((AliAODTrack*)track)->IsHybridGlobalConstrainedGlobal()) continue;
 225
 226     track->GetPxPyPz(pTrack) ;
 227
 228     TLorentzVector momentum(pTrack[0],pTrack[1],pTrack[2],0);
 229
 230     if(momentum.Pt() > fTrackPtCut)
 231     {
 232       if (fDebug > 0) printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventTrack() - Accept :  pT %2.2f > %2.2f \n",
 233                              momentum.Pt(), fTrackPtCut);
 234
 235       return kTRUE;
 236     }
 237
 238   }
 239
 240   if (fDebug > 0)  printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventTrack() - Reject \n");
 241
 242   return kFALSE;
 243
 244 }
 245
 246 //___________________________________________________
 247 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventVertex()
 248 {
 249   // Accept event with good vertex
 250
 251   Double_t v[3];
 252   InputEvent()->GetPrimaryVertex()->GetXYZ(v) ;
 253
 254   if(TMath::Abs(v[2]) > fVzCut)
 255   {
 256     if (fDebug > 0)  printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventVertex() - Vz Reject \n");
 257     return kFALSE ;
 258   }
 259
 260   return CheckForPrimaryVertex();
 261 }
 262
 263 //_______________________________________________________
 264 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::CheckForPrimaryVertex()
 265 {
 266   //Check if the vertex was well reconstructed, copy from v0Reader of conversion group
 267   //It only works for ESDs
 268
 269   // AODs
 270   if(!fESDEvent)
 271   {
 272     // Check that the vertex is not (0,0,0)
 273     Double_t v[3];
 274     InputEvent()->GetPrimaryVertex()->GetXYZ(v) ;
 275
 276     if(TMath::Abs(v[2]) < 1e-6 &&
 277        TMath::Abs(v[1]) < 1e-6 &&
 278        TMath::Abs(v[0]) < 1e-6 )
 279     {
 280       if (fDebug > 0)  printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::CheckForPrimaryVertex() - Reject \n");
 281
 282       return kFALSE ;
 283     }
 284
 285     return kTRUE;
 286   }
 287
 288   // ESDs
 289   if(fESDEvent->GetPrimaryVertexTracks()->GetNContributors() > 0)
 290   {
 291     return kTRUE;
 292   }
 293
 294   if(fESDEvent->GetPrimaryVertexTracks()->GetNContributors() < 1)
 295   {
 296     // SPD vertex
 297     if(fESDEvent->GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors() > 0)
 298     {
 299       //cout<<"spd vertex type::"<< fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetName() << endl;
 300       return kTRUE;
 301
 302     }
 303     if(fESDEvent->GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors() < 1)
 304     {
 305       //      cout<<"bad vertex type::"<< fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetName() << endl;
 306       if (fDebug > 0)  printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::CheckForPrimaryVertex() - Reject \n");
 307       return kFALSE;
 308     }
 309   }
 310
 311   if (fDebug > 0)  printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::CheckForPrimaryVertex() - Reject \n");
 312
 313   return kFALSE;
 314
 315 }
 316
 317 //__________________________________________________
 318 void AliAnalysisTaskCaloFilter::CorrectionsInEMCAL()
 319 {
 320   //If EMCAL, and requested, correct energy, position ...
 321
 322   //Need to do this in a separate loop before filling the ESDs because of the track matching recalculations
 323
 324   if(fCorrect && (fCaloFilter==kEMCAL || fCaloFilter==kBoth) )
 325   {
 326     if(!fGeoMatrixSet)
 327     {
 328       if(fLoadEMCALMatrices)
 329       {
 330         printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::UserExec() - Load user defined EMCAL geometry matrices\n");
 331         for(Int_t mod=0; mod < (fEMCALGeo->GetEMCGeometry())->GetNumberOfSuperModules(); mod++){
 332           if(fEMCALMatrix[mod]){
 333             if(DebugLevel() > 1)
 334               fEMCALMatrix[mod]->Print();
 335             fEMCALGeo->SetMisalMatrix(fEMCALMatrix[mod],mod) ;
 336           }
 337           fGeoMatrixSet=kTRUE;
 338         }//SM loop
 339       }//Load matrices
 340       else if(!gGeoManager)
 341       {
 342         printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::UserExec() - Get geo matrices from data\n");
 343         //Still not implemented in AOD, just a workaround to be able to work at least with ESDs
 344         if(!strcmp(InputEvent()->GetName(),"AliAODEvent"))
 345         {
 346           if(DebugLevel() > 1)
 347             printf("AliAnalysisTaskCaloFilter Use ideal geometry, values geometry matrix not kept in AODs.\n");
 348         }//AOD
 349         else
 350         {
 351           if(DebugLevel() > 1) printf("AliAnalysisTaskCaloFilter Load Misaligned matrices. \n");
 352           AliESDEvent* esd = dynamic_cast<AliESDEvent*>(InputEvent()) ;
 353           if(!esd)
 354           {
 355             printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::UserExec() - This event does not contain ESDs?");
 356             return;
 357           }
 358           for(Int_t mod=0; mod < (fEMCALGeo->GetEMCGeometry())->GetNumberOfSuperModules(); mod++)
 359           {
 360             //if(DebugLevel() > 1)
 361             esd->GetEMCALMatrix(mod)->Print();
 362             if(esd->GetEMCALMatrix(mod)) fEMCALGeo->SetMisalMatrix(esd->GetEMCALMatrix(mod),mod) ;
 363           }
 364           fGeoMatrixSet=kTRUE;
 365         }//ESD
 366       }//Load matrices from Data
 367
 368     }//first event
 369
 370     //Cluster Loop
 371     Int_t nCaloClus = InputEvent()->GetNumberOfCaloClusters();
 372
 373     for (Int_t iClust=0; iClust<nCaloClus; ++iClust)
 374     {
 375       AliVCluster * cluster = InputEvent()->GetCaloCluster(iClust);
 376
 377       if(cluster->IsPHOS()) continue ;
 378
 379       Float_t position[]={0,0,0};
 380       if(DebugLevel() > 2)
 381         printf("Check cluster %d for bad channels and close to border\n",cluster->GetID());
 382       if(fEMCALRecoUtils->ClusterContainsBadChannel(fEMCALGeo,cluster->GetCellsAbsId(), cluster->GetNCells())) continue;
 383
 384       if(DebugLevel() > 2)
 385       {
 386         printf("Filter, before  : i %d, E %f, dispersion %f, m02 %f, m20 %f, distToBad %f\n",iClust,cluster->E(),
 387                cluster->GetDispersion(),cluster->GetM02(),cluster->GetM20(), cluster->GetDistanceToBadChannel());
 388         cluster->GetPosition(position);
 389         printf("Filter, before  : i %d, x %f, y %f, z %f\n",cluster->GetID(), position[0], position[1], position[2]);
 390       }
 391
 392       //Recalculate distance to bad channels, if new list of bad channels provided
 393       fEMCALRecoUtils->RecalculateClusterDistanceToBadChannel(fEMCALGeo, InputEvent()->GetEMCALCells(), cluster);
 394
 395       if(fEMCALRecoUtils->IsRecalibrationOn())
 396       {
 397         fEMCALRecoUtils->RecalibrateClusterEnergy(fEMCALGeo, cluster, InputEvent()->GetEMCALCells());
 398         fEMCALRecoUtils->RecalculateClusterShowerShapeParameters(fEMCALGeo, InputEvent()->GetEMCALCells(),cluster);
 399         fEMCALRecoUtils->RecalculateClusterPID(cluster);
 400       }
 401
 402       fEMCALRecoUtils->RecalculateClusterPosition(fEMCALGeo, InputEvent()->GetEMCALCells(),cluster);
 403
 404       if(DebugLevel() > 2)
 405       {
 406         printf("Filter, after   : i %d, E %f, dispersion %f, m02 %f, m20 %f, distToBad %f\n",cluster->GetID(),cluster->E(),
 407                cluster->GetDispersion(),cluster->GetM02(),cluster->GetM20(), cluster->GetDistanceToBadChannel());
 408         cluster->GetPosition(position);
 409         printf("Filter, after   : i %d, x %f, y %f, z %f\n",cluster->GetID(), position[0], position[1], position[2]);
 410       }
 411
 412       cluster->SetE(fEMCALRecoUtils->CorrectClusterEnergyLinearity(cluster));
 413
 414     }
 415
 416     //Recalculate track-matching
 417     fEMCALRecoUtils->FindMatches(InputEvent(),0,fEMCALGeo);
 418
 419   } // corrections in EMCAL
 420 }
 421
 422 //________________________________________________
 423 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODCaloCells()
 424 {
 425   // Fill EMCAL/PHOS cell info
 426
 427   // EMCAL
 428   if ((fCaloFilter==kBoth ||  fCaloFilter==kEMCAL) && fEvent->GetEMCALCells())
 429   { // protection against missing ESD information
 430     AliVCaloCells &eventEMcells = *(fEvent->GetEMCALCells());
 431     Int_t nEMcell = eventEMcells.GetNumberOfCells() ;
 432
 433     AliAODCaloCells &aodEMcells = *(AODEvent()->GetEMCALCells());
 434     aodEMcells.CreateContainer(nEMcell);
 435     aodEMcells.SetType(AliVCaloCells::kEMCALCell);
 436     Double_t calibFactor = 1.;
 437     for (Int_t iCell = 0; iCell < nEMcell; iCell++)
 438     {
 439       Int_t imod = -1, iphi =-1, ieta=-1,iTower = -1, iIphi = -1, iIeta = -1;
 440       fEMCALGeo->GetCellIndex(eventEMcells.GetCellNumber(iCell),imod,iTower,iIphi,iIeta);
 441       fEMCALGeo->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,iphi,ieta);
 442
 443       if(fCorrect && fEMCALRecoUtils->IsRecalibrationOn())
 444       {
 445         calibFactor = fEMCALRecoUtils->GetEMCALChannelRecalibrationFactor(imod,ieta,iphi);
 446       }
 447
 448       if(!fEMCALRecoUtils->GetEMCALChannelStatus(imod, ieta, iphi))
 449       { //Channel is not declared as bad
 450         aodEMcells.SetCell(iCell,eventEMcells.GetCellNumber(iCell),eventEMcells.GetAmplitude(iCell)*calibFactor,
 451                            eventEMcells.GetTime(iCell),eventEMcells.GetMCLabel(iCell),eventEMcells.GetEFraction(iCell));
 452         //printf("GOOD channel\n");
 453       }
 454       else
 455       {
 456         aodEMcells.SetCell(iCell,eventEMcells.GetCellNumber(iCell),0,-1,-1,0);
 457         //printf("BAD channel\n");
 458       }
 459     }
 460     aodEMcells.Sort();
 461   }
 462
 463   // PHOS
 464   if ((fCaloFilter==kBoth ||  fCaloFilter==kPHOS) && fEvent->GetPHOSCells())
 465   { // protection against missing ESD information
 466     AliVCaloCells &eventPHcells = *(fEvent->GetPHOSCells());
 467     Int_t nPHcell = eventPHcells.GetNumberOfCells() ;
 468
 469     AliAODCaloCells &aodPHcells = *(AODEvent()->GetPHOSCells());
 470     aodPHcells.CreateContainer(nPHcell);
 471     aodPHcells.SetType(AliVCaloCells::kPHOSCell);
 472
 473     for (Int_t iCell = 0; iCell < nPHcell; iCell++)
 474     {
 475       aodPHcells.SetCell(iCell,eventPHcells.GetCellNumber(iCell),eventPHcells.GetAmplitude(iCell),
 476                          eventPHcells.GetTime(iCell),eventPHcells.GetMCLabel(iCell),eventPHcells.GetEFraction(iCell));
 477     }
 478
 479     aodPHcells.Sort();
 480   }
 481 }
 482
 483
 484 //___________________________________________________
 485 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODCaloClusters()
 486 {
 487   // Fill the AOD with caloclusters
 488
 489   // Access to the AOD container of clusters
 490
 491   TClonesArray &caloClusters = *(AODEvent()->GetCaloClusters());
 492   Int_t jClusters=0;
 493   Float_t  posF[3]  ;
 494
 495   Int_t nCaloClus = fEvent->GetNumberOfCaloClusters();
 496   for (Int_t iClust=0; iClust<nCaloClus; ++iClust)
 497   {
 498
 499     AliVCluster * cluster = fEvent->GetCaloCluster(iClust);
 500
 501     //Check which calorimeter information we want to keep.
 502
 503     if(fCaloFilter!=kBoth)
 504     {
 505       if     (fCaloFilter==kPHOS  && cluster->IsEMCAL()) continue ;
 506       else if(fCaloFilter==kEMCAL && cluster->IsPHOS())  continue ;
 507     }
 508
 509     // Get original residuals, in case of previous recalculation, reset them
 510     Float_t dR = cluster->GetTrackDx();
 511     Float_t dZ = cluster->GetTrackDz();
 512
 513     if(DebugLevel() > 2)
 514       printf("Original residuals : dZ %f, dR %f\n ",dZ, dR);
 515
 516     //--------------------------------------------------------------
 517     //If EMCAL and corrections done, get the new matching parameters, do not copy noisy clusters
 518     if(cluster->IsEMCAL() && fCorrect)
 519     {
 520       if(DebugLevel() > 2)
 521         printf("Check cluster %d for bad channels and close to border\n",cluster->GetID());
 522
 523       if(fEMCALRecoUtils->ClusterContainsBadChannel(fEMCALGeo,cluster->GetCellsAbsId(), cluster->GetNCells())) continue;
 524
 525       if(fEMCALRecoUtils->IsExoticCluster(cluster, InputEvent()->GetEMCALCells(),InputEvent()->GetBunchCrossNumber())) continue;
 526
 527       fEMCALRecoUtils->GetMatchedResiduals(cluster->GetID(),dR,dZ);
 528       cluster->SetTrackDistance(dR,dZ);
 529     }
 530
 531     if(DebugLevel() > 2)
 532     {
 533       if(cluster->IsEMCAL()) printf("EMCAL Track-Cluster Residuals : dZ %f, dR %f\n ",dZ, dR);
 534       if(cluster->IsPHOS())  printf("PHOS  Track-Cluster Residuals : dZ %f, dR %f\n ",dZ, dR);
 535     }
 536
 537     //--------------------------------------------------------------
 538
 539     //Now fill AODs
 540
 541     Int_t id       = cluster->GetID();
 542     Float_t energy = cluster->E();
 543     cluster->GetPosition(posF);
 544
 545     AliAODCaloCluster *caloCluster = new(caloClusters[jClusters++])
 546     AliAODCaloCluster(id,
 547                       cluster->GetNLabels(),
 548                       cluster->GetLabels(),
 549                       energy,
 550                       posF,
 551                       NULL,
 552                       cluster->GetType());
 553
 554     caloCluster->SetCaloCluster(cluster->GetDistanceToBadChannel(),
 555                                 cluster->GetDispersion(),
 556                                 cluster->GetM20(), cluster->GetM02(),
 557                                 -1,
 558                                 cluster->GetNExMax(),cluster->GetTOF()) ;
 559
 560     caloCluster->SetPIDFromESD(cluster->GetPID());
 561     caloCluster->SetNCells(cluster->GetNCells());
 562     caloCluster->SetCellsAbsId(cluster->GetCellsAbsId());
 563     caloCluster->SetCellsAmplitudeFraction(cluster->GetCellsAmplitudeFraction());
 564     caloCluster->SetTrackDistance(dR, dZ);
 565
 566     if(DebugLevel() > 2)
 567     {
 568       printf("Filter, aod     : i %d, E %f, dispersion %f, m02 %f, m20 %f\n",caloCluster->GetID(),caloCluster->E(),
 569              caloCluster->GetDispersion(),caloCluster->GetM02(),caloCluster->GetM20());
 570       caloCluster->GetPosition(posF);
 571       printf("Filter, aod     : i %d, x %f, y %f, z %f\n",caloCluster->GetID(), posF[0], posF[1], posF[2]);
 572     }
 573
 574     //Matched tracks, just to know if there was any match, the track pointer is useless if tracks not stored
 575     if(TMath::Abs(dR) < 990 && TMath::Abs(dZ) < 990)
 576     { //Default value in PHOS 999, in EMCAL 1024, why?
 577       caloCluster->AddTrackMatched(new AliAODTrack);
 578     }
 579     // TO DO, in case Tracks available, think how to put the matched track in AOD
 580   }
 581
 582   caloClusters.Expand(jClusters); // resize TObjArray to 'remove' slots
 583
 584 }
 585
 586 //__________________________________________________
 587 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODCaloTrigger()
 588 {
 589   // AOD CaloTrigger copy
 590
 591   AliAODCaloTrigger* triggerEM = AODEvent()->GetCaloTrigger("EMCAL");
 592   AliAODCaloTrigger* triggerPH = AODEvent()->GetCaloTrigger("PHOS");
 593
 594   // Copy from AODs
 595   if(fAODEvent)
 596   {
 597     if(fCaloFilter==kBoth || fCaloFilter==kPHOS)  *triggerPH = *(fAODEvent->GetCaloTrigger("PHOS"));
 598
 599     if(fCaloFilter==kBoth || fCaloFilter==kEMCAL) *triggerEM = *(fAODEvent->GetCaloTrigger("EMCAL"));
 600
 601     return;
 602   }
 603
 604 }
 605
 606 //______________________________________________
 607 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODHeader()
 608 {
 609   // AOD header copy
 610
 611   AliAODHeader* header = AODEvent()->GetHeader();
 612
 613   // Copy from AODs
 614   if(fAODEvent)
 615   {
 616     *header = *(fAODEvent->GetHeader());
 617     return;
 618   }
 619
 620   if(!fESDEvent) return;
 621
 622   // Copy from ESDs
 623
 624   header->SetRunNumber(fEvent->GetRunNumber());
 625
 626   TTree* tree = fInputHandler->GetTree();
 627   if (tree)
 628   {
 629     TFile* file = tree->GetCurrentFile();
 630     if (file) header->SetESDFileName(file->GetName());
 631   }
 632
 633   header->SetBunchCrossNumber(fEvent->GetBunchCrossNumber());
 634   header->SetOrbitNumber(fEvent->GetOrbitNumber());
 635   header->SetPeriodNumber(fEvent->GetPeriodNumber());
 636   header->SetEventType(fEvent->GetEventType());
 637
 638   //Centrality
 639   if(fEvent->GetCentrality())
 640   {
 641     header->SetCentrality(new AliCentrality(*(fEvent->GetCentrality())));
 642   }
 643   else
 644   {
 645     header->SetCentrality(0);
 646   }
 647
 648   //Trigger
 649   header->SetOfflineTrigger(fInputHandler->IsEventSelected()); // propagate the decision of the physics selection
 650   header->SetFiredTriggerClasses(fESDEvent->GetFiredTriggerClasses());
 651   header->SetTriggerMask(fEvent->GetTriggerMask());
 652   header->SetTriggerCluster(fEvent->GetTriggerCluster());
 653   header->SetL0TriggerInputs(fESDEvent->GetHeader()->GetL0TriggerInputs());
 654   header->SetL1TriggerInputs(fESDEvent->GetHeader()->GetL1TriggerInputs());
 655   header->SetL2TriggerInputs(fESDEvent->GetHeader()->GetL2TriggerInputs());
 656
 657   header->SetMagneticField(fEvent->GetMagneticField());
 658   //header->SetMuonMagFieldScale(fESDEvent->GetCurrentDip()/6000.);
 659
 660   header->SetZDCN1Energy(fEvent->GetZDCN1Energy());
 661   header->SetZDCP1Energy(fEvent->GetZDCP1Energy());
 662   header->SetZDCN2Energy(fEvent->GetZDCN2Energy());
 663   header->SetZDCP2Energy(fEvent->GetZDCP2Energy());
 664   header->SetZDCEMEnergy(fEvent->GetZDCEMEnergy(0),fEvent->GetZDCEMEnergy(1));
 665
 666   Float_t diamxy[2]={fEvent->GetDiamondX(),fEvent->GetDiamondY()};
 667   Float_t diamcov[3];
 668   fEvent->GetDiamondCovXY(diamcov);
 669   header->SetDiamond(diamxy,diamcov);
 670   header->SetDiamondZ(fESDEvent->GetDiamondZ(),fESDEvent->GetSigma2DiamondZ());
 671
 672 }
 673
 674 //_____________________________________________
 675 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODTracks()
 676 {
 677   // AOD track copy
 678
 679   if(!fFillTracks) return;
 680
 681   AliAODTrack* aodTrack(0x0);
 682
 683   Double_t pos[3]   = { 0. };
 684   Double_t covTr[21]= { 0. };
 685   Double_t pid[10]  = { 0. };
 686   Double_t p[3]     = { 0. };
 687
 688   // Copy from AODs
 689   if(fAODEvent)
 690   {
 691     //TClonesArray* inTracks = fAODEvent  ->GetTracks();
 692     TClonesArray* ouTracks = AODEvent()->GetTracks();
 693                 //new (ouTracks) TClonesArray(*inTracks);
 694
 695     //printf("N tracks %d\n",fAODEvent->GetNumberOfTracks());
 696     Int_t nCopyTrack = 0;
 697     for (Int_t nTrack = 0; nTrack < fAODEvent->GetNumberOfTracks(); ++nTrack)
 698     {
 699       AliAODTrack *track = fAODEvent->GetTrack(nTrack);
 700
 701       // Select only hybrid tracks?
 702       if(fFillHybridTracks && !track->IsHybridGlobalConstrainedGlobal()) continue;
 703
 704       // Remove PID object to save space
 705       //track->SetDetPID(0x0);
 706
 707       //new((*ouTracks)[nCopyTrack++]) AliAODTrack(*track);
 708
 709       track->GetPxPyPz(p);
 710       Bool_t isDCA  = track->GetPosition(pos);
 711       track->GetCovMatrix(covTr);
 712       track->GetPID(pid);
 713
 714       AliAODVertex* primVertex = (AliAODVertex*) AODEvent()->GetVertices()->At(0); // primary vertex, copied previously!!!
 715
 716       aodTrack = new((*ouTracks)[nCopyTrack++]) AliAODTrack(
 717                                                             track->GetID(),
 718                                                             track->GetLabel(),
 719                                                             p,
 720                                                             kTRUE,
 721                                                             pos,
 722                                                             isDCA,
 723                                                             covTr,
 724                                                             track->Charge(),
 725                                                             track->GetITSClusterMap(),
 726                                                             pid,
 727                                                             primVertex,
 728                                                             track->GetUsedForVtxFit(),
 729                                                             track->GetUsedForPrimVtxFit(),
 730                                                             (AliAODTrack::AODTrk_t) track->GetType(),
 731                                                             track->GetFilterMap(),
 732                                                             track->Chi2perNDF());
 733
 734
 735       aodTrack->SetIsHybridGlobalConstrainedGlobal(track->IsHybridGlobalConstrainedGlobal());
 736       aodTrack->SetIsHybridTPCConstrainedGlobal   (track->IsHybridTPCConstrainedGlobal());
 737       aodTrack->SetIsGlobalConstrained            (track->IsGlobalConstrained());
 738       aodTrack->SetIsTPCConstrained               (track->IsTPCConstrained());
 739
 740       aodTrack->SetTPCFitMap    (track->GetTPCFitMap());
 741       aodTrack->SetTPCClusterMap(track->GetTPCClusterMap());
 742       aodTrack->SetTPCSharedMap (track->GetTPCSharedMap());
 743
 744       aodTrack->SetChi2MatchTrigger(track->GetChi2MatchTrigger());
 745
 746       // set the DCA values to the AOD track
 747
 748       aodTrack->SetPxPyPzAtDCA(track->PxAtDCA(),track->PyAtDCA(),track->PzAtDCA());
 749       aodTrack->SetXYAtDCA    (track->XAtDCA() ,track->YAtDCA());
 750
 751       aodTrack->SetFlags      (track->GetFlags());
 752       aodTrack->SetTPCPointsF (track->GetTPCNclsF());
 753
 754       // Calo
 755
 756       if(track->IsEMCAL()) aodTrack->SetEMCALcluster(track->GetEMCALcluster());
 757       if(track->IsPHOS())  aodTrack->SetPHOScluster (track->GetPHOScluster());
 758       aodTrack->SetTrackPhiEtaOnEMCal( track->GetTrackPhiOnEMCal(),  track->GetTrackPhiOnEMCal() );
 759
 760     }
 761
 762     //printf("Final N tracks %d\n",nCopyTrack);
 763
 764     return;
 765   }
 766
 767 }
 768
 769 //_________________________________________
 770 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODv0s()
 771 {
 772   // Copy v0s (use if you know what you do, use quite a lot of memory)
 773
 774   if(!fFillv0s) return;
 775
 776   // Copy from AODs
 777   if(fAODEvent)
 778   {
 779     TClonesArray* inv0 = fAODEvent  ->GetV0s();
 780     TClonesArray* ouv0 =  AODEvent()->GetV0s();
 781
 782                 //new (ouv0s) TClonesArray(*inv0s);
 783
 784     Int_t allv0s = inv0->GetEntriesFast();
 785
 786     for (Int_t nv0s = 0; nv0s < allv0s; ++nv0s)
 787     {
 788       AliAODv0 *v0 = (AliAODv0*)inv0->At(nv0s);
 789
 790       new((*ouv0)[nv0s]) AliAODv0(*v0);
 791     }
 792
 793     return;
 794   }
 795
 796 }
 797
 798 //____________________________________________
 799 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODVZERO()
 800 {
 801   // Copy VZERO
 802
 803   if(!fFillVZERO) return;
 804
 805   AliAODVZERO* vzeroData = AODEvent()->GetVZEROData();
 806
 807   if(fESDEvent) *vzeroData = *(fESDEvent->GetVZEROData());
 808   else          *vzeroData = *(fAODEvent->GetVZEROData());
 809
 810 }
 811
 812 //_______________________________________________
 813 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODVertices()
 814 {
 815   // Copy vertices
 816
 817   // set arrays and pointers
 818   Double_t pos[3]   ;
 819   Double_t covVtx[6];
 820   for (Int_t i = 0; i < 6; i++)  covVtx[i] = 0.;
 821
 822   // Copy from AODs
 823   if(fAODEvent)
 824   {
 825     TClonesArray* inVertices = fAODEvent  ->GetVertices();
 826     TClonesArray* ouVertices = AODEvent()->GetVertices();
 827
 828                 //new (ouVertices) TClonesArray(*inVertices);
 829
 830     //Keep only the first 3 vertices if not requested
 831     Int_t allVertices = inVertices->GetEntriesFast();
 832
 833     //printf("n Vertices %d\n",allVertices);
 834
 835     if(!fFillAllVertices)
 836     {
 837       if(allVertices >  3) allVertices = 3;
 838     }
 839
 840     //printf("Final n Vertices %d\n",allVertices);
 841
 842     for (Int_t nVertices = 0; nVertices < allVertices; ++nVertices)
 843     {
 844       AliAODVertex *vertex = (AliAODVertex*)inVertices->At(nVertices);
 845
 846       new((*ouVertices)[nVertices]) AliAODVertex(*vertex);
 847     }
 848
 849     return;
 850   }
 851
 852   if(!fESDEvent) return;
 853
 854   // Copy from ESDs
 855
 856   // Access to the AOD container of vertices
 857   Int_t jVertices=0;
 858   TClonesArray &vertices = *(AODEvent()->GetVertices());
 859
 860   // Add primary vertex. The primary tracks will be defined
 861   // after the loops on the composite objects (v0, cascades, kinks)
 862   fEvent   ->GetPrimaryVertex()->GetXYZ(pos);
 863   fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetCovMatrix(covVtx);
 864   Float_t chi = fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetChi2toNDF();
 865
 866   AliAODVertex * primary = new(vertices[jVertices++])
 867   AliAODVertex(pos, covVtx, chi, NULL, -1, AliAODVertex::kPrimary);
 868   primary->SetName(fEvent->GetPrimaryVertex()->GetName());
 869   primary->SetTitle(fEvent->GetPrimaryVertex()->GetTitle());
 870
 871 }
 872
 873 //____________________________________
 874 void AliAnalysisTaskCaloFilter::Init()
 875 {
 876   //Init analysis with configuration macro if available
 877
 878   if(gROOT->LoadMacro(fConfigName) >=0)
 879   {
 880     printf("Configure analysis with %s\n",fConfigName.Data());
 881
 882     AliAnalysisTaskCaloFilter *filter = (AliAnalysisTaskCaloFilter*)gInterpreter->ProcessLine("ConfigCaloFilter()");
 883
 884     fEMCALGeoName      = filter->fEMCALGeoName;
 885     fLoadEMCALMatrices = filter->fLoadEMCALMatrices;
 886     fFillAODFile       = filter->fFillAODFile;
 887     fFillTracks        = filter->fFillTracks;
 888     fFillHybridTracks  = filter->fFillHybridTracks;
 889     fFillv0s           = filter->fFillv0s;
 890     fFillVZERO         = filter->fFillVZERO;
 891     fFillAllVertices   = filter->fFillAllVertices;
 892     fEMCALRecoUtils    = filter->fEMCALRecoUtils;
 893     fConfigName        = filter->fConfigName;
 894     fCaloFilter        = filter->fCaloFilter;
 895     fEventSelection[0] = filter->fEventSelection[0];
 896     fEventSelection[1] = filter->fEventSelection[1];
 897     fEventSelection[2] = filter->fEventSelection[2];
 898     fAcceptAllMBEvent  = filter->fAcceptAllMBEvent;
 899     fCorrect           = filter->fCorrect;
 900     fEMCALEnergyCut    = filter->fEMCALEnergyCut;
 901     fEMCALNcellsCut    = filter->fEMCALNcellsCut;
 902     fPHOSEnergyCut     = filter->fPHOSEnergyCut;
 903     fPHOSNcellsCut     = filter->fPHOSNcellsCut;
 904     fTrackPtCut        = filter->fTrackPtCut;
 905     fVzCut             = filter->fVzCut;
 906
 907     for(Int_t i = 0; i < 12; i++) fEMCALMatrix[i] = filter->fEMCALMatrix[i] ;
 908   }
 909 }
 910
 911 //_________________________________________
 912 void AliAnalysisTaskCaloFilter::PrintInfo()
 913 {
 914   //Print settings
 915
 916   printf("AnalysisCaloFilter::PrintInfo() \n");
 917
 918   printf("\t Not only filter, correct Clusters? %d\n",fCorrect);
 919   printf("\t Calorimeter Filtering Option     ? %d\n",fCaloFilter);
 920
 921   //printf("\t Use handmade geo matrices?   EMCAL %d, PHOS %d\n",fLoadEMCALMatrices, fLoadPHOSMatrices);
 922   printf("\t Use handmade geo matrices?   EMCAL %d, PHOS 0\n",fLoadEMCALMatrices);
 923
 924   printf("\t Fill: AOD file? %d Tracks? %d; all Vertex? %d; v0s? %d; VZERO ? %d\n",
 925          fFillAODFile,fFillTracks,fFillAllVertices, fFillv0s, fFillVZERO);
 926
 927   printf("\t Event Selection based : EMCAL?  %d, PHOS?  %d Tracks? %d - Accept all MB? %d\n",
 928          fEventSelection[0],fEventSelection[1],fEventSelection[2],fAcceptAllMBEvent);
 929
 930   printf("\t \t EMCAL E > %2.2f, EMCAL nCells >= %d, PHOS E > %2.2f, PHOS nCells >= %d, Track pT > %2.2f, |vz| < %2.2f\n",
 931          fEMCALEnergyCut,fEMCALNcellsCut,fPHOSEnergyCut,fPHOSNcellsCut, fTrackPtCut,fVzCut);
 932 }
 933
 934 //_______________________________________________________
 935 void AliAnalysisTaskCaloFilter::UserCreateOutputObjects()
 936 {
 937   // Init geometry
 938
 939   fEMCALGeo =  AliEMCALGeometry::GetInstance(fEMCALGeoName) ;
 940
 941 }
 942
 943 //____________________________________________________________
 944 void AliAnalysisTaskCaloFilter::UserExec(Option_t */*option*/)
 945 {
 946   // Execute analysis for current event
 947   // Copy input ESD or AOD header, vertex, CaloClusters and CaloCells to output AOD
 948
 949   if (fDebug > 0)
 950     printf("CaloFilter: Analysing event # %d\n", (Int_t)Entry());
 951
 952   fEvent    = InputEvent();
 953   fAODEvent = dynamic_cast<AliAODEvent*> (fEvent);
 954   fESDEvent = dynamic_cast<AliESDEvent*> (fEvent);
 955
 956   if(!fEvent)
 957   {
 958     printf("AliAnalysisTaskCaloFilter::UserExec - This event does not contain Input?");
 959     return;
 960   }
 961
 962   // printf("Start processing : %s\n",fAODEvent->GetFiredTriggerClasses().Data());
 963
 964   // Select the event
 965
 966   if(!AcceptEvent()) return ;
 967
 968   //Magic line to write events to file
 969
 970   AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetOutputEventHandler()->SetFillAOD(fFillAODFile);
 971
 972   // Reset output AOD
 973
 974   Int_t nVertices = 0;
 975   if(fFillv0s) nVertices = fEvent->GetNumberOfV0s();
 976   Int_t nCaloClus = fEvent->GetNumberOfCaloClusters();
 977   Int_t nTracks   = fEvent->GetNumberOfTracks();
 978
 979   AODEvent()->ResetStd(nTracks, nVertices, 0, 0, 0, nCaloClus, 0, 0);
 980
 981   // Copy
 982
 983   FillAODHeader();
 984
 985   //
 986   FillAODv0s();
 987
 988   //
 989   FillAODVertices(); // Do it before the track filtering to have the reference to the vertex
 990
 991   //
 992   FillAODVZERO();
 993
 994   //
 995   FillAODTracks();
 996
 997   //
 998   CorrectionsInEMCAL();
 999
1000   //
1001   FillAODCaloClusters();
1002
1003   //
1004   FillAODCaloCells();
1005
1006   //
1007   FillAODCaloTrigger();
1008
1009   //printf("Filtered event, end processing : %s\n",fAODEvent->GetFiredTriggerClasses().Data());
1010
1011 }
1012