PWGGA/CaloTasks/macros/anaCaloFilter.C

   1 /* $Id:  $ */
   2 //--------------------------------------------------
   3 // Example macro to do Calorimeters filtering
   4 // copy ESDs into AODs
   5 //
   6 // Pay attention to the options and definitions
   7 // set in the lines below
   8 //
   9 //  Author : Gustavo Conesa Balbastre (INFN-LNF)
  10 //
  11 //-------------------------------------------------
  12 enum anaModes {mLocal, mLocalCAF,mPROOF,mGRID};
  13 //mLocal: Analyze locally files in your computer
  14 //mLocalCAF: Analyze locally CAF files
  15 //mPROOF: Analyze CAF files with PROOF
  16
  17 //---------------------------------------------------------------------------
  18 //Settings to read locally several files, only for "mLocal" mode
  19 //The different values are default, they can be set with environmental
  20 //variables: INDIR, PATTERN, NFILES, respectivelly
  21 char * kInDir = "/user/data/files/";
  22 char * kPattern = ""; // Data are in files kInDir/kPattern+i
  23 Int_t kFile = 1; // Number of files
  24 //---------------------------------------------------------------------------
  25 //Collection file for grid analysis
  26 char * kXML = "collection.xml";
  27 //---------------------------------------------------------------------------
  28
  29 const TString kInputData = "ESD"; //ESD, AOD, MC
  30 TString kTreeName = "esdTree";
  31 Bool_t kUsePhysSel = kTRUE;
  32
  33 void anaCaloFilter(Int_t mode=mLocal)
  34 {
  35   // Main
  36   char cmd[200] ;
  37   sprintf(cmd, ".! rm -rf AliAOD.root") ;
  38   gROOT->ProcessLine(cmd) ;
  39   //--------------------------------------------------------------------
  40   // Load analysis libraries
  41   // Look at the method below,
  42   // change whatever you need for your analysis case
  43   // ------------------------------------------------------------------
  44   LoadLibraries(mode) ;
  45
  46   //-------------------------------------------------------------------------------------------------
  47   //Create chain from ESD and from cross sections files, look below for options.
  48   //-------------------------------------------------------------------------------------------------
  49   if(kInputData == "ESD") kTreeName = "esdTree" ;
  50   else if(kInputData == "AOD") kTreeName = "aodTree" ;
  51   else {
  52     cout<<"Wrong  data type "<<kInputData<<endl;
  53     break;
  54   }
  55
  56   TChain *chain       = new TChain(kTreeName) ;
  57   CreateChain(mode, chain);
  58
  59   if(chain){
  60     AliLog::SetGlobalLogLevel(AliLog::kError);//Minimum prints on screen
  61
  62     //--------------------------------------
  63     // Make the analysis manager
  64     //-------------------------------------
  65     AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("Manager", "Manager");
  66
  67     // AOD output handler
  68     AliAODHandler* aodoutHandler   = new AliAODHandler();
  69     aodoutHandler->SetOutputFileName("AliAOD.root");
  70     ////aodoutHandler->SetCreateNonStandardAOD();
  71     mgr->SetOutputEventHandler(aodoutHandler);
  72
  73     //input
  74     if(kInputData == "ESD")
  75     {
  76       // ESD handler
  77       AliESDInputHandler *esdHandler = new AliESDInputHandler();
  78       mgr->SetInputEventHandler(esdHandler);
  79       esdHandler->SetReadFriends(kFALSE);
  80       cout<<"ESD handler "<<mgr->GetInputEventHandler()<<endl;
  81     }
  82     if(kInputData == "AOD")
  83     {
  84       // AOD handler
  85       AliAODInputHandler *aodHandler = new AliAODInputHandler();
  86       mgr->SetInputEventHandler(aodHandler);
  87       cout<<"AOD handler "<<mgr->GetInputEventHandler()<<endl;
  88
  89     }
  90
  91     // mgr->SetDebugLevel(1);
  92
  93     //-------------------------------------------------------------------------
  94     //Define task, put here any other task that you want to use.
  95     //-------------------------------------------------------------------------
  96     // ESD physics selection task
  97     if(kInputData == "ESD" && kUsePhysSel)
  98     {
  99       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/OADB/macros/AddTaskPhysicsSelection.C");
 100       AliPhysicsSelectionTask* physSelTask = AddTaskPhysicsSelection();
 101     }
 102
 103     gROOT->LoadMacro("AddTaskCaloFilter.C");
 104     AliAnalysisTaskCaloFilter* filter = AddTaskCaloFilter();
 105
 106     //AliAnalysisTaskCaloFilter * filter = new AliAnalysisTaskCaloFilter();
 107     //filter->SetConfigFileName("ConfigCaloFilter.C");
 108     //mgr->AddTask(filter);
 109
 110     // Create containers for input/output
 111     AliAnalysisDataContainer *cinput1    = mgr->GetCommonInputContainer();
 112     AliAnalysisDataContainer *coutput1   = mgr->GetCommonOutputContainer();
 113     AliAnalysisDataContainer *coutntuple = mgr->CreateContainer("EventNtuple", TNtuple::Class(),
 114                                                                 AliAnalysisManager::kOutputContainer, "eventselection.root");
 115
 116     mgr->ConnectInput  (filter, 0, cinput1);
 117     mgr->ConnectOutput (filter, 0, coutput1 );
 118     mgr->ConnectOutput (filter, 1, coutntuple );
 119
 120     //-----------------------
 121     // Run the analysis
 122     //-----------------------
 123     TString smode = "";
 124     if (mode==mLocal || mode == mLocalCAF)
 125       smode = "local";
 126     else if (mode==mPROOF)
 127       smode = "proof";
 128     else if (mode==mGRID)
 129       smode = "local";
 130
 131     mgr->InitAnalysis();
 132     mgr->PrintStatus();
 133     mgr->StartAnalysis(smode.Data(),chain);
 134
 135     cout <<" Analysis ended sucessfully "<< endl ;
 136
 137   }
 138   else cout << "Chain was not produced ! "<<endl;
 139
 140   //sprintf(cmd, ".! rm -rf CorrectionFiles") ;
 141
 142 }
 143
 144 void  LoadLibraries(const anaModes mode) {
 145
 146   //--------------------------------------
 147   // Load the needed libraries most of them already loaded by aliroot
 148   //--------------------------------------
 149   gSystem->Load("libTree");
 150   gSystem->Load("libGeom");
 151   gSystem->Load("libVMC");
 152   gSystem->Load("libXMLIO");
 153   gSystem->Load("libMatrix");
 154   gSystem->Load("libPhysics");
 155
 156   //----------------------------------------------------------
 157   // >>>>>>>>>>> Local mode <<<<<<<<<<<<<<
 158   //----------------------------------------------------------
 159   if (mode==mLocal || mode == mLocalCAF || mode == mGRID) {
 160     //--------------------------------------------------------
 161     // If you want to use already compiled libraries
 162     // in the aliroot distribution
 163     //--------------------------------------------------------
 164
 165     gSystem->Load("libSTEERBase");
 166     gSystem->Load("libESD");
 167     gSystem->Load("libAOD");
 168     gSystem->Load("libANALYSIS");
 169     gSystem->Load("libANALYSISalice");
 170     gSystem->Load("libANALYSISalice");
 171     gSystem->Load("libCORRFW");
 172     gSystem->Load("libPHOSUtils");
 173     gSystem->Load("libEMCALUtils");
 174     gSystem->Load("libPWGGACaloTasks");
 175
 176     //--------------------------------------------------------
 177     //If you want to use root and par files from aliroot
 178     //--------------------------------------------------------
 179     /*
 180            SetupPar("STEERBase");
 181            SetupPar("ESD");
 182            SetupPar("AOD");
 183            SetupPar("ANALYSIS");
 184            SetupPar("ANALYSISalice");
 185            SetupPar("PHOSUtils");
 186            SetupPar("EMCALUtils");
 187            //Create Geometry
 188            TGeoManager::Import("geometry.root") ; //need file "geometry.root" in local dir!!!!
 189            SetupPar("PWGGACaloTasks");
 190 */
 191   }
 192
 193   //---------------------------------------------------------
 194   // <<<<<<<<<< PROOF mode >>>>>>>>>>>>
 195   //---------------------------------------------------------
 196   else if (mode==mPROOF) {
 197     //
 198     // Connect to proof
 199     // Put appropriate username here
 200     // TProof::Reset("proof://mgheata@lxb6046.cern.ch");
 201     TProof::Open("proof://mgheata@lxb6046.cern.ch");
 202
 203     //    gProof->ClearPackages();
 204     //    gProof->ClearPackage("ESD");
 205     //    gProof->ClearPackage("AOD");
 206     //    gProof->ClearPackage("ANALYSIS");
 207
 208     // Enable the STEERBase Package
 209     gProof->UploadPackage("STEERBase.par");
 210     gProof->EnablePackage("STEERBase");
 211     // Enable the ESD Package
 212     gProof->UploadPackage("ESD.par");
 213     gProof->EnablePackage("ESD");
 214     // Enable the AOD Package
 215     gProof->UploadPackage("AOD.par");
 216     gProof->EnablePackage("AOD");
 217     // Enable the Analysis Package
 218     gProof->UploadPackage("ANALYSIS.par");
 219     gProof->EnablePackage("ANALYSIS");
 220     // Enable the PHOS geometry Package
 221     //gProof->UploadPackage("PHOSUtils.par");
 222     //gProof->EnablePackage("PHOSUtils");
 223     gProof->ShowEnabledPackages();
 224   }
 225
 226 }
 227
 228 void SetupPar(char* pararchivename)
 229 {
 230   //Load par files, create analysis libraries
 231   //For testing, if par file already decompressed and modified
 232   //classes then do not decompress.
 233
 234   TString cdir(Form("%s", gSystem->WorkingDirectory() )) ;
 235   TString parpar(Form("%s.par", pararchivename)) ;
 236   if ( gSystem->AccessPathName(parpar.Data()) ) {
 237     gSystem->ChangeDirectory(gSystem->Getenv("ALICE_ROOT")) ;
 238     TString processline(Form(".! make %s", parpar.Data())) ;
 239     gROOT->ProcessLine(processline.Data()) ;
 240     gSystem->ChangeDirectory(cdir) ;
 241     processline = Form(".! mv $ALICE_ROOT/%s .", parpar.Data()) ;
 242     gROOT->ProcessLine(processline.Data()) ;
 243   }
 244   if ( gSystem->AccessPathName(pararchivename) ) {
 245     TString processline = Form(".! tar xvzf %s",parpar.Data()) ;
 246     gROOT->ProcessLine(processline.Data());
 247   }
 248
 249   TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
 250   gSystem->ChangeDirectory(pararchivename);
 251
 252   // check for BUILD.sh and execute
 253   if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
 254     printf("*******************************\n");
 255     printf("*** Building PAR archive    ***\n");
 256     cout<<pararchivename<<endl;
 257     printf("*******************************\n");
 258
 259     if (gSystem->Exec("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
 260       Error("runProcess","Cannot Build the PAR Archive! - Abort!");
 261       return -1;
 262     }
 263   }
 264   // check for SETUP.C and execute
 265   if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/SETUP.C")) {
 266     printf("*******************************\n");
 267     printf("*** Setup PAR archive       ***\n");
 268     cout<<pararchivename<<endl;
 269     printf("*******************************\n");
 270     gROOT->Macro("PROOF-INF/SETUP.C");
 271   }
 272
 273   gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data());
 274   printf("Current dir: %s\n", ocwd.Data());
 275 }
 276
 277
 278
 279 void CreateChain(const anaModes mode, TChain * chain){
 280   //Fills chain with data
 281   TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
 282
 283   //-----------------------------------------------------------
 284   //Analysis of CAF data locally and with PROOF
 285   //-----------------------------------------------------------
 286   if(mode ==mPROOF || mode ==mLocalCAF){
 287     // Chain from CAF
 288     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG0/CreateESDChain.C");
 289     // The second parameter is the number of input files in the chain
 290     chain = CreateESDChain("ESD12001.txt", 5);
 291   }
 292
 293   //---------------------------------------
 294   //Local files analysis
 295   //---------------------------------------
 296   else if(mode == mLocal){
 297     //If you want to add several ESD files sitting in a common directory INDIR
 298     //Specify as environmental variables the directory (INDIR), the number of files
 299     //to analyze (NFILES) and the pattern name of the directories with files (PATTERN)
 300
 301     if(gSystem->Getenv("INDIR"))
 302       kInDir = gSystem->Getenv("INDIR") ;
 303     else cout<<"INDIR not set, use default: "<<kInDir<<endl;
 304
 305     if(gSystem->Getenv("PATTERN"))
 306       kPattern = gSystem->Getenv("PATTERN") ;
 307     else  cout<<"PATTERN not set, use default: "<<kPattern<<endl;
 308
 309     if(gSystem->Getenv("NFILES"))
 310       kFile = atoi(gSystem->Getenv("NFILES")) ;
 311     else cout<<"NFILES not set, use default: "<<kFile<<endl;
 312
 313     //Check if env variables are set and are correct
 314     if ( kInDir  && kFile) {
 315       printf("Get %d files from directory %s\n",kFile,kInDir);
 316       if ( ! gSystem->cd(kInDir) ) {//check if ESDs directory exist
 317         printf("%s does not exist\n", kInDir) ;
 318         return ;
 319       }
 320
 321
 322       cout<<"INDIR   : "<<kInDir<<endl;
 323       cout<<"NFILES  : "<<kFile<<endl;
 324       cout<<"PATTERN : " <<kPattern<<endl;
 325
 326       TString datafile="";
 327       if(kInputData == "ESD") datafile = "AliESDs.root" ;
 328       else if(kInputData == "AOD") datafile = "AliAOD.root" ;
 329       else if(kInputData == "MC")  datafile = "galice.root" ;
 330
 331       //Loop on ESD files, add them to chain
 332       Int_t event =0;
 333       Int_t skipped=0 ;
 334       char file[120] ;
 335
 336       for (event = 0 ; event < kFile ; event++) {
 337         sprintf(file, "%s/%s%d/%s", kInDir,kPattern,event,datafile.Data()) ;
 338         TFile * fESD = 0 ;
 339         //Check if file exists and add it, if not skip it
 340         if ( fESD = TFile::Open(file)) {
 341           if ( fESD->Get(kTreeName) ) {
 342             printf("++++ Adding %s\n", file) ;
 343             chain->AddFile(file);
 344           }
 345         }
 346         else {
 347           printf("---- Skipping %s\n", file) ;
 348           skipped++ ;
 349         }
 350       }
 351       printf("number of entries # %lld, skipped %d\n", chain->GetEntries(), skipped*100) ;
 352     }
 353     else {
 354       TString input = "AliESDs.root" ;
 355       cout<<">>>>>> No list added, take a single file <<<<<<<<< "<<input<<endl;
 356       chain->AddFile(input);
 357     }
 358
 359   }// local files analysis
 360
 361   //------------------------------
 362   //GRID xml files
 363   //-----------------------------
 364   else if(mode == mGRID){
 365     //Get colection file. It is specified by the environmental
 366     //variable XML
 367
 368     if(gSystem->Getenv("XML") )
 369       kXML = gSystem->Getenv("XML");
 370     else
 371       sprintf(kXML, "collection.xml") ;
 372
 373     if (!TFile::Open(kXML)) {
 374       printf("No collection file with name -- %s -- was found\n",kXML);
 375       return ;
 376     }
 377     else cout<<"XML file "<<kXML<<endl;
 378
 379     //Load necessary libraries and connect to the GRID
 380     gSystem->Load("libNetx") ;
 381     gSystem->Load("libRAliEn");
 382     TGrid::Connect("alien://") ;
 383
 384     //Feed Grid with collection file
 385     //TGridCollection * collection =  (TGridCollection*)gROOT->ProcessLine(Form("TAlienCollection::Open(\"%s\", 0)", kXML));
 386     TGridCollection * collection = (TGridCollection*) TAlienCollection::Open(kXML);
 387     if (! collection) {
 388       AliError(Form("%s not found", kXML)) ;
 389       return kFALSE ;
 390     }
 391     TGridResult* result = collection->GetGridResult("",0 ,0);
 392
 393     // Makes the ESD chain
 394     printf("*** Getting the Chain       ***\n");
 395     for (Int_t index = 0; index < result->GetEntries(); index++) {
 396       TString alienURL = result->GetKey(index, "turl") ;
 397       cout << "================== " << alienURL << endl ;
 398       chain->Add(alienURL) ;
 399     }
 400   }// xml analysis
 401
 402   gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data());
 403 }
 404