PWGLF/STRANGENESS/LambdaK0PbPb/MainStreamAnalysis/run.C

   1 // #include <iostream>
   2 // #include "AliAnalysisManager.h"
   3 // #include "AliESDInputHandler.h"
   4 // #include "AliMCEventHandler.h"
   5 // #include "AliAnalysisGrid.h"
   6 // #include "AliCentralitySelectionTask.h"
   7 // #include "AliAnalysisCentralitySelector.h"
   8 // #include "AliAnalysisTaskPerformanceStrange.h"
   9 // #include "TString.h"
  10 // #include "TChain.h"
  11 // #include "TAlienCollection.h"
  12 // #include <fstream>
  13 // #include "TObjString.h"
  14 // #include "TIterator.h"
  15 // #include "TGrid.h"
  16 // #include "TROOT.h"
  17
  18 // #include "CreateAlienHandler.C"
  19 // #include
  20
  21 using namespace std;
  22
  23 enum { kMyRunModeLocal = 0, kMyRunModeCAF, kMyRunModeGRID};
  24
  25 TList * listToLoad = new TList(); // Additional classes to be loaded, see InitAndLoadLibs
  26
  27 TChain * GetAnalysisChain(const char * incollection);
  28 void InitAndLoadLibs(Int_t runMode=kMyRunModeLocal, Int_t workers=0,Bool_t debug=0) ;
  29
  30 void run(const char * data, const char * passOrPath, Long64_t nev = -1, Long64_t offset = 0, Bool_t debug = kFALSE, Int_t runMode = 2, Bool_t isMC = 0, Bool_t usePID = kTRUE, const char* option = "",TString customSuffix = "", Int_t workers = -1, const char * gridMode="full", Int_t binMin=0, Int_t binMax = 10)
  31 {
  32   // runMode:
  33   //
  34   // 0 local
  35   // 1 proof
  36   // 2 grid
  37
  38   if (nev < 0)
  39     nev = 1234567890;
  40   InitAndLoadLibs(runMode,workers,debug);
  41
  42   // Create the analysis manager
  43   AliAnalysisManager * mgr = new AliAnalysisManager;
  44
  45   // Add ESD handler
  46   AliESDInputHandler* esdH = new AliESDInputHandler;
  47   // Do I need any of this?
  48   // esdH->SetInactiveBranches("AliESDACORDE FMD ALIESDTZERO ALIESDZDC AliRawDataErrorLogs CaloClusters Cascades EMCALCells EMCALTrigger ESDfriend Kinks AliESDTZERO ALIESDACORDE MuonTracks TrdTracks");
  49   mgr->SetInputEventHandler(esdH);
  50
  51   if(isMC) {
  52     AliMCEventHandler* handler = new AliMCEventHandler;
  53     handler->SetPreReadMode(AliMCEventHandler::kLmPreRead);
  54     mgr->SetMCtruthEventHandler(handler);
  55   }
  56
  57
  58   // If we are running on grid, we need the alien handler
  59   if (runMode == kMyRunModeGRID) {
  60     // Create and configure the alien handler plugin
  61     TGrid::Connect("alien://");// Why do I need this? Without a get a bus error...
  62         gROOT->LoadMacro("CreateAlienHandler.C");
  63     AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(data, listToLoad, gridMode, isMC);
  64     if (!alienHandler) {
  65       cout << "Cannot create alien handler" << endl;
  66       exit(1);
  67     }
  68     mgr->SetGridHandler(alienHandler);
  69   }
  70
  71   // PID task
  72   gROOT->ProcessLine(".L $ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPIDResponse.C");
  73   AddTaskPIDResponse(isMC,kTRUE);
  74   //AddTaskPIDResponse();
  75
  76
  77   // Physics selection
  78   gROOT->ProcessLine(".L $ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPhysicsSelection.C");
  79   AliPhysicsSelectionTask * physicsSelectionTask = AddTaskPhysicsSelection(isMC,kTRUE,0);
  80
  81   // Centrality
  82   gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/OADB/macros/AddTaskCentrality.C");
  83   AliCentralitySelectionTask *taskCentrality = AddTaskCentrality();
  84   //taskCentrality->SetPass(2);
  85   if(isMC) taskCentrality->SetMCInput();
  86
  87   AliAnalysisCentralitySelector * centrSelector = new AliAnalysisCentralitySelector();
  88   centrSelector->SetIsMC(isMC);
  89   centrSelector->SetCentralityEstimator("V0M"); // Todo: add parameter to macro?
  90
  91   // Parse option strings
  92   TString optionStr(option);
  93
  94   // remove SAVE option if set
  95   Bool_t doSave = kFALSE;
  96
  97   if (optionStr.Contains("SAVE"))
  98     {
  99       optionStr = optionStr(0,optionStr.Index("SAVE")) + optionStr(optionStr.Index("SAVE")+4, optionStr.Length());
 100       doSave = kTRUE;
 101     }
 102   TString pathsuffix = "";
 103   // Not used, but may be useful
 104   Bool_t useMCKinematics = isMC;
 105   if (optionStr.Contains("NOMCKIN")) {
 106     cout << ">>>> Ignoring MC kinematics" << endl;
 107     useMCKinematics=kFALSE;
 108     pathsuffix+="_NOMCKIN";
 109   }
 110
 111   gROOT->ProcessLine(".L AddTaskLambdaK0PbPb.C");
 112   Int_t nbin = 0; // will contain the number of centrality bins
 113   AliAnalysisTaskPerformanceStrange ** task = AddTaskLambdaK0PbPb("lambdak0.root", centrSelector, nbin, binMin, binMax,isMC); // FIXME also pass cuts, centrality bin type selection(5,10% percentiles, ranges...)
 114   // configure task
 115   //  else if (iAODanalysis) task->SetAnalysisType("AOD");
 116   // FIXME: add options to macro
 117   // FIXME: put physics selection inside the task
 118   cout << nbin << endl;
 119
 120   for(Int_t ibin = 0; ibin < nbin; ibin++){
 121     cout << "ibin " << ibin << "  "<< endl;//task[ibin] << endl;
 122
 123     task[ibin]->SetAnalysisType("ESD");
 124     cout << "1" << endl;
 125     task[ibin]->SetAnalysisMC(isMC); // 0 or 1
 126     cout << "2" << endl;
 127     task[ibin]->SetCollidingSystems(1); // 0 =pp, 1=AA
 128     cout << "3" << endl;
 129     task[ibin]->SetAnalysisCut("no");
 130     cout << "4" << endl;
 131     task[ibin]->SetQASelector(kFALSE);
 132     cout<< "5" << endl;
 133     if(usePID)
 134       task[ibin]->SetUsePID("withPID"); // withPID or withoutPID
 135     else
 136       task[ibin]->SetUsePID("withoutPID"); // withPID or withoutPID
 137         task[ibin]->SetArmenterosCut(0.2);
 138     cout << "6" << endl;
 139   }
 140
 141   // Init and run the analy
 142   if (!mgr->InitAnalysis()) return;
 143
 144   mgr->PrintStatus();
 145
 146   if (runMode == kMyRunModeLocal ) {
 147     // If running in local mode, create chain of ESD files
 148     cout << "RUNNING LOCAL, CHAIN" << endl;
 149     TChain * chain = GetAnalysisChain(data);
 150     //    chain->Print();
 151     mgr->StartAnalysis("local",chain,nev);
 152   } else if (runMode == kMyRunModeCAF) {
 153     mgr->StartAnalysis("proof",TString(passOrPath)+data+"#esdTree",nev);
 154   } else if (runMode == kMyRunModeGRID) {
 155     mgr->StartAnalysis("grid");
 156   } else {
 157     cout << "ERROR: unknown run mode" << endl;
 158   }
 159
 160   pathsuffix += customSuffix;
 161
 162   if (doSave) MoveOutput(data, pathsuffix.Data());
 163
 164
 165 }
 166
 167 void MoveOutput(const char * data, const char * suffix = ""){
 168
 169   //  TString path("output10bins/");
 170   TString path("output10binsNew/");
 171   path = path + TString(data).Tokenize("/")->Last()->GetName() + suffix;
 172
 173   TString fileName = "lambdak0.root";
 174   gSystem->mkdir(path, kTRUE);
 175   gSystem->Rename(fileName, path + "/" + fileName);
 176   for(Int_t ibin = 0; ibin < 20; ibin++){
 177     TString fileBin = fileName;
 178     fileBin.ReplaceAll(".root",Form("_%2.2d.root",ibin));
 179     gSystem->Rename(fileBin, path + "/" + fileBin);
 180   }
 181
 182   gSystem->Rename("event_stat.root", path + "/event_stat.root");
 183   gSystem->Rename("EventStat_temp.root", path + "/EventStat_temp.root");
 184   Printf(">>>>> Moved files to %s", path.Data());
 185 }
 186
 187
 188
 189 TChain * GetAnalysisChain(const char * incollection){
 190   // Builds a chain of esd files
 191   // incollection can be
 192   // - a single root file
 193   // - an xml collection of files on alien
 194   // - a ASCII containing a list of local root files
 195
 196   TChain* analysisChain = 0;
 197   // chain
 198   analysisChain = new TChain("esdTree");
 199   if (TString(incollection).Contains(".root")){
 200     analysisChain->Add(incollection);
 201   }
 202   else if (TString(incollection).Contains("xml")){
 203     TGrid::Connect("alien://");
 204     TGridCollection * coll = TAlienCollection::Open (incollection);
 205     while(coll->Next()){
 206       analysisChain->Add(TString("alien://")+coll->GetLFN());
 207     }
 208   } else {
 209     ifstream file_collect(incollection);
 210     TString line;
 211     while (line.ReadLine(file_collect) ) {
 212       analysisChain->Add(line.Data());
 213     }
 214   }
 215   analysisChain->GetListOfFiles()->Print();
 216
 217   return analysisChain;
 218 }
 219
 220
 221 void InitAndLoadLibs(Int_t runMode, Int_t workers,Bool_t debug) {
 222   // Loads libs and par files + custom task and classes (the order is important)
 223   // listToLoad->Add(new TObjString("$ALICE_ROOT/STEER/AliCentrality.cxx")); // FIXME: why do I have to load it?!?
 224   listToLoad->Add(new TObjString("AliAnalysisCentralitySelector.cxx"));
 225   listToLoad->Add(new TObjString("AliAnalysisTaskPerformanceStrange.cxx"));
 226
 227   if (runMode == kMyRunModeCAF)
 228     {
 229       cout << "Init in CAF mode" << endl;
 230
 231       gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy", "2");
 232       Char_t* alienuser = gSystem->Getenv("alien_API_USER");
 233       TProof * p = TProof::Open(alienuser!=0 ? Form("%s@alice-caf.cern.ch",alienuser) : "alice-caf.cern.ch", workers>0 ? Form("workers=%d",workers) : "");
 234       //TProof * p = TProof::Open("skaf.saske.sk", workers>0 ? Form("workers=%d",workers) : "");
 235       p->Exec("TObject *o = gEnv->GetTable()->FindObject(\"Proof.UseMergers\"); gEnv->GetTable()->Remove(o);", kTRUE); // avoid submerging
 236       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-18-AN");
 237       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-20-AN");
 238       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-21-AN");
 239       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-28-AN");
 240       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-31-AN");
 241       //      gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v4-21-33-AN");
 242       //      gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v5-02-04-AN");
 243       //gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v5-02-08pA-AN");
 244         gProof->EnablePackage("VO_ALICE@AliRoot::v5-03-01-AN");
 245
 246       // Enable the needed package
 247       // FIXME: what if I don't want to use par files?
 248       gSystem->AddIncludePath("-I${ALICE_ROOT}/include/");
 249       gSystem->AddIncludePath("-I${ALICE_ROOT}/STEER/");
 250       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/STEERBase");
 251       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/STEERBase");
 252       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/ESD");
 253       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/ESD");
 254       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/AOD");
 255       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/AOD");
 256       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSIS");
 257       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSIS");
 258       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSISalice");
 259       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/ANALYSISalice");
 260       // gProof->UploadPackage("$ALICE_ROOT/obj/CORRFW");
 261       // gProof->EnablePackage("$ALICE_ROOT/obj/CORRFW");
 262       // gProof->UploadPackage("~/Desktop/OADB");//FIXME
 263       // gProof->EnablePackage("~/Desktop/OADB");//FIXME
 264
 265     }
 266   else
 267     {
 268       cout << "Init in Local or Grid mode" << endl;
 269       gSystem->Load("libCore");
 270       gSystem->Load("libTree");
 271       gSystem->Load("libGeom");
 272       gSystem->Load("libVMC");
 273       gSystem->Load("libPhysics");
 274       gSystem->Load("libSTEERBase");
 275       gSystem->Load("libESD");
 276       gSystem->Load("libAOD");
 277       gSystem->Load("libANALYSIS");
 278       gSystem->Load("libANALYSISalice");
 279
 280       // gSystem->Load("libVMC");
 281       gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/include");
 282       gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/STEER");
 283     }
 284   // Load helper classes
 285   TIterator * iter = listToLoad->MakeIterator();
 286   TObjString * name = 0;
 287   while ((name = (TObjString *)iter->Next())) {
 288     gSystem->ExpandPathName(name->String());
 289     cout << name->String().Data() << endl;
 290     if (runMode == kMyRunModeCAF) {
 291       gProof->Load(name->String()+(debug?"++g":"+"));
 292     } else {
 293       gROOT->LoadMacro(name->String()+(debug?"++g":"+"));
 294     }
 295   }
 296
 297 }