PWGPP/CalibMacros/CPass1/runCPass1.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 # Script to run:
   4 #    1. reconstruction
   5 #    2. calibration
   6 #
   7 # Files assumed to be in working directory:
   8 # recCPass1.C          - reconstruction macro
   9 # runCalibTrain.C     - calibration/filtering macro
  10 # Arguments (run locally):
  11 #    1  - raw data file name
  12 #    2  - number of events to be processed
  13 #    3  - run number
  14 #    4  - OCDBPath
  15 #    5  - optional trigger mask
  16 # example:
  17 # runCPass1.sh raw.root  50  104892 raw://
  18
  19 #ALIEN setting
  20 # $1 = raw input filename
  21 runNum=`echo $1 | cut -d "/" -f 6 | sed 's/^0*//'`
  22 if [ $# -eq 1 ] ; then
  23   # alien Setup
  24   nEvents=99999999
  25   fileName="alien://"$1
  26   ocdbPath="raw://"
  27 fi;
  28 if [ $# -ge 4 ] ; then
  29   # local setup
  30   fileName=$1
  31   nEvents=$2
  32   runNum=$3
  33   ocdbPath=$4
  34   triggerOptions="?Trigger=kCalibBarrel"
  35 fi
  36 if [ $# -eq 5 ] ; then
  37   # local setup in case we specify the trigger mask
  38   triggerOptions=$5
  39
  40 fi
  41
  42 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  43 echo runCPass1.sh Input arguments
  44 echo fileName=$fileName
  45 echo nEvents=$nEvents
  46 echo runNum=$runNum
  47 echo ocdbPath=$ocdbPath
  48 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  49
  50 if [ -f Run0_999999999_v3_s0.root ]; then
  51     mkdir -p TPC/Calib/Correction
  52     mv Run0_999999999_v3_s0.root TPC/Calib/Correction/
  53 fi
  54
  55
  56
  57 echo File to be  processed $1
  58 echo Number of events to be processed $nEvents
  59
  60 echo ">>>>>>>>> PATH is..."
  61 echo $PATH
  62 echo ">>>>>>>>> LD_LIBRARY_PATH is..."
  63 echo $LD_LIBRARY_PATH
  64 echo ">>>>>>>>> recCPass1.C is..."
  65 #cat recCPass1.C
  66 echo
  67
  68 echo ">>>>>>> Running AliRoot to reconstruct $1. Run number is $runNum..."
  69
  70 mkdir Barrel
  71 mkdir OuterDet
  72
  73 [[ -f localOCDBaccessConfig.C ]] && cp localOCDBaccessConfig.C Barrel
  74 [[ -f localOCDBaccessConfig.C ]] && cp localOCDBaccessConfig.C OuterDet
  75
  76 cd Barrel
  77 time aliroot -l -b -q "../recCPass1.C(\"$fileName\", $nEvents, \"$ocdbPath\", \"$triggerOptions\")" 2>&1 | tee rec_Barrel.log
  78 mv syswatch.log syswatch_rec_Barrel.log
  79
  80 echo ">>>>>>> Running AliRoot to make calibration..."
  81 time aliroot -l -b -q "../runCalibTrain.C($runNum,\"AliESDs.root\",\"$ocdbPath\")"   2>&1 | tee calib.log
  82 mv syswatch.log syswatch_calib.log
  83 echo ">>>>>>> Doing ls -l"
  84 ls -l
  85
  86 echo ">>>>>>> Running the QA train..."
  87 time aliroot -b -q "../QAtrain.C($runNum,\"\",0,\"$ocdbPath\")" 2>&1 | tee qa_Barrel.log
  88
  89 for file in *.stat; do
  90     mv $file $file.qa
  91 done
  92
  93 echo ">>>>>>>> Moving files to upper directory"
  94 mv AliESDs.root ../AliESDs_Barrel.root
  95 mv rec_Barrel.log ../rec_Barrel.log
  96 mv calib.log ../calib.log
  97 mv AliESDfriends_v1.root ../AliESDfriends_v1.root
  98 mv qa_Barrel.log ../qa_Barrel.out
  99 mv QAresults.root ../QAresults_Barrel.root
 100 if [ -f AODtpITS.root ] ; then
 101  mv AODtpITS.root ../
 102 fi
 103
 104 cd ../OuterDet
 105 time aliroot -l -b -q ../recCPass1_OuterDet.C\(\""$fileName\", $nEvents, \"$ocdbPath"\"\) 2>&1 | tee rec_Outer.log
 106 mv syswatch.log syswatch_rec_Outer.log
 107
 108 echo ">>>>>>> Running the QA train..."
 109 time aliroot -b -q "../QAtrain.C($runNum,\"\",0,\"$ocdbPath\")" 2>&1 | tee qa_Outer.log
 110
 111 for file in *.stat; do
 112     mv $file $file.qa
 113 done
 114
 115 mv AliESDs.root ../AliESDs_Outer.root
 116 mv rec_Outer.log ../rec_Outer.log
 117 mv qa_Outer.log ../qa_Outer.out
 118 mv QAresults.root ../QAresults_Outer.root
 119
 120
 121 echo ">>>>>>> Extracting system information..."
 122 aliroot -b -q $ALICE_ROOT/PWGPP/CalibMacros/CPass1/makeSyswatchCPass1.C\(\"AliESDfriends_v1.root\"\)