PYTHIA6/AliGenPythiaPlus.cxx

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   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //
  19 // Generator using the TPythia interface (via AliPythia)
  20 // to generate pp collisions.
  21 // Using SetNuclei() also nuclear modifications to the structure functions
  22 // can be taken into account. This makes, of course, only sense for the
  23 // generation of the products of hard processes (heavy flavor, jets ...)
  24 //
  25 // andreas.morsch@cern.ch
  26 //
  27
  28 #include <TClonesArray.h>
  29 #include <TDatabasePDG.h>
  30 #include <TParticle.h>
  31 #include <TPDGCode.h>
  32 #include <TSystem.h>
  33 #include <TTree.h>
  34 #include "AliConst.h"
  35 #include "AliDecayerPythia.h"
  36 #include "AliGenPythiaPlus.h"
  37 #include "AliHeader.h"
  38 #include "AliGenPythiaEventHeader.h"
  39 #include "AliPythiaBase.h"
  40 #include "AliPythiaRndm.h"
  41 #include "AliRun.h"
  42 #include "AliStack.h"
  43 #include "AliRunLoader.h"
  44 #include "AliMC.h"
  45 #include "PyquenCommon.h"
  46
  47 ClassImp(AliGenPythiaPlus)
  48
  49
  50 AliGenPythiaPlus::AliGenPythiaPlus():
  51     AliGenMC(),
  52     fPythia(0),
  53     fProcess(kPyCharm),
  54     fStrucFunc(kCTEQ5L),
  55     fKineBias(0.),
  56     fTrials(0),
  57     fTrialsRun(0),
  58     fQ(0.),
  59     fX1(0.),
  60     fX2(0.),
  61     fEventTime(0.),
  62     fInteractionRate(0.),
  63     fTimeWindow(0.),
  64     fCurSubEvent(0),
  65     fEventsTime(0),
  66     fNev(0),
  67     fFlavorSelect(0),
  68     fXsection(0.),
  69     fPtHardMin(0.),
  70     fPtHardMax(1.e4),
  71     fYHardMin(-1.e10),
  72     fYHardMax(1.e10),
  73     fGinit(1),
  74     fGfinal(1),
  75     fHadronisation(1),
  76     fNpartons(0),
  77     fReadFromFile(0),
  78     fQuench(0),
  79     fPtKick(1.),
  80     fFullEvent(kTRUE),
  81     fDecayer(new AliDecayerPythia()),
  82     fDebugEventFirst(-1),
  83     fDebugEventLast(-1),
  84     fEtMinJet(0.),
  85     fEtMaxJet(1.e4),
  86     fEtaMinJet(-20.),
  87     fEtaMaxJet(20.),
  88     fPhiMinJet(0.),
  89     fPhiMaxJet(2.* TMath::Pi()),
  90     fJetReconstruction(kCell),
  91     fEtaMinGamma(-20.),
  92     fEtaMaxGamma(20.),
  93     fPhiMinGamma(0.),
  94     fPhiMaxGamma(2. * TMath::Pi()),
  95     fPycellEtaMax(2.),
  96     fPycellNEta(274),
  97     fPycellNPhi(432),
  98     fPycellThreshold(0.),
  99     fPycellEtSeed(4.),
 100     fPycellMinEtJet(10.),
 101     fPycellMaxRadius(1.),
 102     fStackFillOpt(kFlavorSelection),
 103     fFeedDownOpt(kTRUE),
 104     fFragmentation(kTRUE),
 105     fSetNuclei(kFALSE),
 106     fNewMIS(kFALSE),
 107     fHFoff(kFALSE),
 108     fTriggerParticle(0),
 109     fTriggerEta(0.9),
 110     fCountMode(kCountAll),
 111     fHeader(0),
 112     fRL(0),
 113     fFileName(0),
 114     fFragPhotonInCalo(kFALSE),
 115     fPi0InCalo(kFALSE) ,
 116     fPhotonInCalo(kFALSE),
 117     fCheckEMCAL(kFALSE),
 118     fCheckPHOS(kFALSE),
 119     fCheckPHOSeta(kFALSE),
 120     fFragPhotonOrPi0MinPt(0),
 121     fPhotonMinPt(0),
 122     fPHOSMinPhi(219.),
 123     fPHOSMaxPhi(321.),
 124     fPHOSEta(0.13),
 125     fEMCALMinPhi(79.),
 126     fEMCALMaxPhi(191.),
 127     fEMCALEta(0.71)
 128
 129 {
 130 // Default Constructor
 131   fEnergyCMS = 5500.;
 132   SetNuclei(0,0);
 133   if (!AliPythiaRndm::GetPythiaRandom())
 134       AliPythiaRndm::SetPythiaRandom(GetRandom());
 135 }
 136
 137 AliGenPythiaPlus::AliGenPythiaPlus(AliPythiaBase* pythia)
 138     :AliGenMC(-1),
 139      fPythia(pythia),
 140      fProcess(kPyCharm),
 141      fStrucFunc(kCTEQ5L),
 142      fKineBias(0.),
 143      fTrials(0),
 144      fTrialsRun(0),
 145      fQ(0.),
 146      fX1(0.),
 147      fX2(0.),
 148      fEventTime(0.),
 149      fInteractionRate(0.),
 150      fTimeWindow(0.),
 151      fCurSubEvent(0),
 152      fEventsTime(0),
 153      fNev(0),
 154      fFlavorSelect(0),
 155      fXsection(0.),
 156      fPtHardMin(0.),
 157      fPtHardMax(1.e4),
 158      fYHardMin(-1.e10),
 159      fYHardMax(1.e10),
 160      fGinit(kTRUE),
 161      fGfinal(kTRUE),
 162      fHadronisation(kTRUE),
 163      fNpartons(0),
 164      fReadFromFile(kFALSE),
 165      fQuench(kFALSE),
 166      fPtKick(1.),
 167      fFullEvent(kTRUE),
 168      fDecayer(new AliDecayerPythia()),
 169      fDebugEventFirst(-1),
 170      fDebugEventLast(-1),
 171      fEtMinJet(0.),
 172      fEtMaxJet(1.e4),
 173      fEtaMinJet(-20.),
 174      fEtaMaxJet(20.),
 175      fPhiMinJet(0.),
 176      fPhiMaxJet(2.* TMath::Pi()),
 177      fJetReconstruction(kCell),
 178      fEtaMinGamma(-20.),
 179      fEtaMaxGamma(20.),
 180      fPhiMinGamma(0.),
 181      fPhiMaxGamma(2. * TMath::Pi()),
 182      fPycellEtaMax(2.),
 183      fPycellNEta(274),
 184      fPycellNPhi(432),
 185      fPycellThreshold(0.),
 186      fPycellEtSeed(4.),
 187      fPycellMinEtJet(10.),
 188      fPycellMaxRadius(1.),
 189      fStackFillOpt(kFlavorSelection),
 190      fFeedDownOpt(kTRUE),
 191      fFragmentation(kTRUE),
 192      fSetNuclei(kFALSE),
 193      fNewMIS(kFALSE),
 194      fHFoff(kFALSE),
 195      fTriggerParticle(0),
 196      fTriggerEta(0.9),
 197      fCountMode(kCountAll),
 198      fHeader(0),
 199      fRL(0),
 200      fFileName(0),
 201      fFragPhotonInCalo(kFALSE),
 202      fPi0InCalo(kFALSE) ,
 203      fPhotonInCalo(kFALSE),
 204      fCheckEMCAL(kFALSE),
 205      fCheckPHOS(kFALSE),
 206      fCheckPHOSeta(kFALSE),
 207      fFragPhotonOrPi0MinPt(0),
 208      fPhotonMinPt(0),
 209      fPHOSMinPhi(219.),
 210      fPHOSMaxPhi(321.),
 211      fPHOSEta(0.13),
 212      fEMCALMinPhi(79.),
 213      fEMCALMaxPhi(191.),
 214      fEMCALEta(0.71)
 215 {
 216 // default charm production at 5. 5 TeV
 217 // semimuonic decay
 218 // structure function GRVHO
 219 //
 220     fEnergyCMS = 5500.;
 221     fName = "Pythia";
 222     fTitle= "Particle Generator using PYTHIA";
 223     SetForceDecay();
 224     // Set random number generator
 225     if (!AliPythiaRndm::GetPythiaRandom())
 226       AliPythiaRndm::SetPythiaRandom(GetRandom());
 227     SetNuclei(0,0);
 228  }
 229
 230 AliGenPythiaPlus::~AliGenPythiaPlus()
 231 {
 232 // Destructor
 233   if(fEventsTime) delete fEventsTime;
 234 }
 235
 236 void AliGenPythiaPlus::SetInteractionRate(Float_t rate,Float_t timewindow)
 237 {
 238 // Generate pileup using user specified rate
 239     fInteractionRate = rate;
 240     fTimeWindow = timewindow;
 241     GeneratePileup();
 242 }
 243
 244 void AliGenPythiaPlus::GeneratePileup()
 245 {
 246 // Generate sub events time for pileup
 247     fEventsTime = 0;
 248     if(fInteractionRate == 0.) {
 249       Warning("GeneratePileup","Zero interaction specified. Skipping pileup generation.\n");
 250       return;
 251     }
 252
 253     Int_t npart = NumberParticles();
 254     if(npart < 0) {
 255       Warning("GeneratePileup","Negative number of particles. Skipping pileup generation.\n");
 256       return;
 257     }
 258
 259     if(fEventsTime) delete fEventsTime;
 260     fEventsTime = new TArrayF(npart);
 261     TArrayF &array = *fEventsTime;
 262     for(Int_t ipart = 0; ipart < npart; ipart++)
 263       array[ipart] = 0.;
 264
 265     Float_t eventtime = 0.;
 266     while(1)
 267       {
 268         eventtime += (AliPythiaRndm::GetPythiaRandom())->Exp(1./fInteractionRate);
 269         if(eventtime > fTimeWindow) break;
 270         array.Set(array.GetSize()+1);
 271         array[array.GetSize()-1] = eventtime;
 272       }
 273
 274     eventtime = 0.;
 275     while(1)
 276       {
 277         eventtime -= (AliPythiaRndm::GetPythiaRandom())->Exp(1./fInteractionRate);
 278         if(TMath::Abs(eventtime) > fTimeWindow) break;
 279         array.Set(array.GetSize()+1);
 280         array[array.GetSize()-1] = eventtime;
 281       }
 282
 283     SetNumberParticles(fEventsTime->GetSize());
 284 }
 285
 286 void AliGenPythiaPlus::SetPycellParameters(Float_t etamax, Int_t neta, Int_t nphi,
 287                                        Float_t thresh, Float_t etseed, Float_t minet, Float_t r)
 288 {
 289 // Set pycell parameters
 290     fPycellEtaMax    =  etamax;
 291     fPycellNEta      =  neta;
 292     fPycellNPhi      =  nphi;
 293     fPycellThreshold =  thresh;
 294     fPycellEtSeed    =  etseed;
 295     fPycellMinEtJet  =  minet;
 296     fPycellMaxRadius =  r;
 297 }
 298
 299
 300
 301 void AliGenPythiaPlus::SetEventListRange(Int_t eventFirst, Int_t eventLast)
 302 {
 303   // Set a range of event numbers, for which a table
 304   // of generated particle will be printed
 305   fDebugEventFirst = eventFirst;
 306   fDebugEventLast  = eventLast;
 307   if (fDebugEventLast==-1) fDebugEventLast=fDebugEventFirst;
 308 }
 309
 310 void AliGenPythiaPlus::Init()
 311 {
 312 // Initialisation
 313
 314 //    SetMC(AliPythia::Instance());
 315 //    fPythia=(AliPythia*) fMCEvGen;
 316
 317 //
 318     fParentWeight=1./Float_t(fNpart);
 319 //
 320
 321
 322     fPythia->SetPtHardRange(fPtHardMin, fPtHardMax);
 323     fPythia->SetYHardRange(fYHardMin, fYHardMax);
 324
 325     if (fAProjectile > 0 && fATarget > 0) fPythia->SetNuclei(fAProjectile, fATarget);
 326     // Fragmentation?
 327     if (fFragmentation) {
 328       fPythia->SetFragmentation(1);
 329     } else {
 330       fPythia->SetFragmentation(0);
 331     }
 332
 333
 334 //  initial state radiation
 335     fPythia->SetInitialAndFinalStateRadiation(fGinit, fGfinal);
 336
 337 //  pt - kick
 338     fPythia->SetIntrinsicKt(fPtKick);
 339
 340     if (fReadFromFile) {
 341         fRL  =  AliRunLoader::Open(fFileName, "Partons");
 342         fRL->LoadKinematics();
 343         fRL->LoadHeader();
 344     } else {
 345         fRL = 0x0;
 346     }
 347  //
 348     fPythia->ProcInit(fProcess, fEnergyCMS, fStrucFunc);
 349     //  Forward Paramters to the AliPythia object
 350     fDecayer->SetForceDecay(fForceDecay);
 351 // Switch off Heavy Flavors on request
 352     if (fHFoff) {
 353         fPythia->SwitchHFOff();
 354         // Switch off g->QQbar splitting in decay table
 355         ((AliDecayerPythia*) fDecayer)->HeavyFlavourOff();
 356     }
 357
 358     fDecayer->Init();
 359
 360
 361 //  Parent and Children Selection
 362     switch (fProcess)
 363     {
 364     case kPyOldUEQ2ordered:
 365     case kPyOldUEQ2ordered2:
 366     case kPyOldPopcorn:
 367       break;
 368     case kPyCharm:
 369     case kPyCharmUnforced:
 370     case kPyCharmPbPbMNR:
 371     case kPyCharmpPbMNR:
 372     case kPyCharmppMNR:
 373     case kPyCharmppMNRwmi:
 374         fParentSelect[0] =   411;
 375         fParentSelect[1] =   421;
 376         fParentSelect[2] =   431;
 377         fParentSelect[3] =  4122;
 378         fParentSelect[4] =  4232;
 379         fParentSelect[5] =  4132;
 380         fParentSelect[6] =  4332;
 381         fFlavorSelect    =  4;
 382         break;
 383     case kPyD0PbPbMNR:
 384     case kPyD0pPbMNR:
 385     case kPyD0ppMNR:
 386         fParentSelect[0] =   421;
 387         fFlavorSelect    =   4;
 388         break;
 389     case kPyDPlusPbPbMNR:
 390     case kPyDPluspPbMNR:
 391     case kPyDPlusppMNR:
 392         fParentSelect[0] =   411;
 393         fFlavorSelect    =   4;
 394         break;
 395     case kPyDPlusStrangePbPbMNR:
 396     case kPyDPlusStrangepPbMNR:
 397     case kPyDPlusStrangeppMNR:
 398         fParentSelect[0] =   431;
 399         fFlavorSelect    =   4;
 400         break;
 401     case kPyLambdacppMNR:
 402         fParentSelect[0] =  4122;
 403         fFlavorSelect    =   4;
 404         break;
 405     case kPyBeauty:
 406     case kPyBeautyJets:
 407     case kPyBeautyPbPbMNR:
 408     case kPyBeautypPbMNR:
 409     case kPyBeautyppMNR:
 410     case kPyBeautyppMNRwmi:
 411         fParentSelect[0]=  511;
 412         fParentSelect[1]=  521;
 413         fParentSelect[2]=  531;
 414         fParentSelect[3]= 5122;
 415         fParentSelect[4]= 5132;
 416         fParentSelect[5]= 5232;
 417         fParentSelect[6]= 5332;
 418         fFlavorSelect   = 5;
 419         break;
 420     case kPyBeautyUnforced:
 421         fParentSelect[0] =  511;
 422         fParentSelect[1] =  521;
 423         fParentSelect[2] =  531;
 424         fParentSelect[3] = 5122;
 425         fParentSelect[4] = 5132;
 426         fParentSelect[5] = 5232;
 427         fParentSelect[6] = 5332;
 428         fFlavorSelect    = 5;
 429         break;
 430     case kPyJpsiChi:
 431     case kPyJpsi:
 432         fParentSelect[0] = 443;
 433         break;
 434     case kPyMbAtlasTuneMC09:
 435     case kPyMbDefault:
 436     case kPyMb:
 437     case kPyMbWithDirectPhoton:
 438     case kPyMbNonDiffr:
 439     case kPyMbMSEL1:
 440     case kPyJets:
 441     case kPyDirectGamma:
 442     case kPyLhwgMb:
 443         break;
 444     case kPyW:
 445     case kPyZ:
 446         break;
 447     }
 448 //
 449 //
 450 //  JetFinder for Trigger
 451 //
 452 //  Configure detector (EMCAL like)
 453 //
 454     fPythia->SetPycellParameters(fPycellEtaMax,fPycellNEta, fPycellNPhi,
 455                                  fPycellThreshold, fPycellEtSeed,
 456                                  fPycellMinEtJet, fPycellMaxRadius);
 457 //
 458 //  This counts the total number of calls to Pyevnt() per run.
 459     fTrialsRun = 0;
 460     fQ         = 0.;
 461     fX1        = 0.;
 462     fX2        = 0.;
 463     fNev       = 0 ;
 464 //
 465 //
 466 //
 467     AliGenMC::Init();
 468 //
 469 //
 470 //
 471     if (fSetNuclei) {
 472         fDyBoost = 0;
 473         Warning("Init","SetNuclei used. Use SetProjectile + SetTarget instead. fDyBoost has been reset to 0\n");
 474     }
 475
 476     if (fQuench) {
 477         fPythia->InitQuenching(0., 0.1, 0.6e6, 0, 0.97, 30);
 478     }
 479
 480 //    fPythia->SetPARJ(200, 0.0);
 481
 482 //    if (fQuench == 3) {
 483 //      // Nestor's change of the splittings
 484 //      fPythia->SetPARJ(200, 0.8);
 485 //      fPythia->SetMSTJ(41, 1);  // QCD radiation only
 486 //      fPythia->SetMSTJ(42, 2);  // angular ordering
 487 //      fPythia->SetMSTJ(44, 2);  // option to run alpha_s
 488 //      fPythia->SetMSTJ(47, 0);  // No correction back to hard scattering element
 489 //      fPythia->SetMSTJ(50, 0);  // No coherence in first branching
 490 //      fPythia->SetPARJ(82, 1.); // Cut off for parton showers
 491 //    }
 492 }
 493
 494 void AliGenPythiaPlus::Generate()
 495 {
 496 // Generate one event
 497
 498     fDecayer->ForceDecay();
 499
 500     Float_t polar[3]   =   {0,0,0};
 501     Float_t origin[3]  =   {0,0,0};
 502     Float_t p[4];
 503 //  converts from mm/c to s
 504     const Float_t kconv=0.001/2.999792458e8;
 505 //
 506     Int_t nt=0;
 507     Int_t jev=0;
 508     Int_t j, kf;
 509     fTrials=0;
 510     fEventTime = 0.;
 511
 512
 513
 514     //  Set collision vertex position
 515     if (fVertexSmear == kPerEvent) Vertex();
 516
 517 //  event loop
 518     while(1)
 519     {
 520 //
 521 // Produce event
 522 //
 523 //
 524 // Switch hadronisation off
 525 //
 526 //      fPythia->SwitchHadronisationOff();
 527 //
 528 // Either produce new event or read partons from file
 529 //
 530         if (!fReadFromFile) {
 531             if (!fNewMIS) {
 532                 fPythia->GenerateEvent();
 533             } else {
 534                 fPythia->GenerateMIEvent();
 535             }
 536             fNpartons = fPythia->GetNumberOfParticles();
 537         } else {
 538             printf("Loading Event %d\n",AliRunLoader::Instance()->GetEventNumber());
 539             fRL->GetEvent(AliRunLoader::Instance()->GetEventNumber());
 540             fPythia->SetNumberOfParticles(0);
 541             fPythia->LoadEvent(fRL->Stack(), 0 , 1);
 542             fPythia->EditEventList(21);
 543         }
 544
 545 //
 546 //  Run quenching routine
 547 //
 548         if (fQuench == 1) {
 549             fPythia->Quench();
 550         } else if (fQuench == 2){
 551             fPythia->Pyquen(208., 0, 0.);
 552         } else if (fQuench == 3) {
 553             // Quenching is via multiplicative correction of the splittings
 554         }
 555
 556 //
 557 // Switch hadronisation on
 558 //
 559 //      fPythia->SwitchHadronisationOn();
 560 //
 561 // .. and perform hadronisation
 562 //      printf("Calling hadronisation %d\n", fPythia->GetN());
 563 //      fPythia->HadronizeEvent();
 564         fTrials++;
 565         fPythia->GetParticles(&fParticles);
 566         Boost();
 567 //
 568 //
 569 //
 570         Int_t i;
 571
 572         fNprimaries = 0;
 573         Int_t np = fParticles.GetEntriesFast();
 574
 575         if (np == 0) continue;
 576 //
 577
 578 //
 579         Int_t* pParent   = new Int_t[np];
 580         Int_t* pSelected = new Int_t[np];
 581         Int_t* trackIt   = new Int_t[np];
 582         for (i = 0; i < np; i++) {
 583             pParent[i]   = -1;
 584             pSelected[i] =  0;
 585             trackIt[i]   =  0;
 586         }
 587
 588         Int_t nc = 0;        // Total n. of selected particles
 589         Int_t nParents = 0;  // Selected parents
 590         Int_t nTkbles = 0;   // Trackable particles
 591         if (fProcess != kPyMbDefault &&
 592             fProcess != kPyMb &&
 593             fProcess != kPyMbWithDirectPhoton &&
 594             fProcess != kPyJets &&
 595             fProcess != kPyDirectGamma &&
 596             fProcess != kPyMbNonDiffr  &&
 597             fProcess != kPyMbMSEL1     &&
 598             fProcess != kPyW &&
 599             fProcess != kPyZ &&
 600             fProcess != kPyCharmppMNRwmi &&
 601             fProcess != kPyBeautyppMNRwmi) {
 602
 603             for (i = 0; i < np; i++) {
 604                 TParticle* iparticle = (TParticle *) fParticles.At(i);
 605                 Int_t ks = iparticle->GetStatusCode();
 606                 kf = CheckPDGCode(iparticle->GetPdgCode());
 607 // No initial state partons
 608                 if (ks==21) continue;
 609 //
 610 // Heavy Flavor Selection
 611 //
 612                 // quark ?
 613                 kf = TMath::Abs(kf);
 614                 Int_t kfl = kf;
 615                 // Resonance
 616
 617                 if (kfl > 100000) kfl %= 100000;
 618                 if (kfl > 10000)  kfl %= 10000;
 619                 // meson ?
 620                 if  (kfl > 10) kfl/=100;
 621                 // baryon
 622                 if (kfl > 10) kfl/=10;
 623                 Int_t ipa = (fPythia->Version() == 6) ? (iparticle->GetFirstMother() - 1) :(iparticle->GetFirstMother()) ;
 624                 Int_t kfMo = 0;
 625 //
 626 // Establish mother daughter relation between heavy quarks and mesons
 627 //
 628                 if (kf >= fFlavorSelect && kf <= 6) {
 629                     Int_t idau = (fPythia->Version() == 6) ? (iparticle->GetFirstDaughter() - 1) :(iparticle->GetFirstDaughter());
 630                     if (idau > -1) {
 631                         TParticle* daughter = (TParticle *) fParticles.At(idau);
 632                         Int_t pdgD = daughter->GetPdgCode();
 633                         if (pdgD == 91 || pdgD == 92) {
 634                             Int_t jmin = (fPythia->Version() == 6) ? (daughter->GetFirstDaughter() - 1) : (daughter->GetFirstDaughter());
 635                             Int_t jmax = (fPythia->Version() == 6) ? (daughter->GetLastDaughter() - 1)  : (daughter->GetLastDaughter());
 636
 637                             for (Int_t jp = jmin; jp <= jmax; jp++)
 638                                 ((TParticle *) fParticles.At(jp))->SetFirstMother(i+1);
 639                         } // is string or cluster
 640                     } // has daughter
 641                 } // heavy quark
 642
 643
 644                 if (ipa > -1) {
 645                     TParticle *  mother = (TParticle *) fParticles.At(ipa);
 646                     kfMo = TMath::Abs(mother->GetPdgCode());
 647                 }
 648
 649                 // What to keep in Stack?
 650                 Bool_t flavorOK = kFALSE;
 651                 Bool_t selectOK = kFALSE;
 652                 if (fFeedDownOpt) {
 653                     if (kfl >= fFlavorSelect) flavorOK = kTRUE;
 654                 } else {
 655                     if (kfl > fFlavorSelect) {
 656                         nc = -1;
 657                         break;
 658                     }
 659                     if (kfl == fFlavorSelect) flavorOK = kTRUE;
 660                 }
 661                 switch (fStackFillOpt) {
 662                 case kFlavorSelection:
 663                     selectOK = kTRUE;
 664                     break;
 665                 case kParentSelection:
 666                     if (ParentSelected(kf) || kf <= 10) selectOK = kTRUE;
 667                     break;
 668                 }
 669                 if (flavorOK && selectOK) {
 670 //
 671 // Heavy flavor hadron or quark
 672 //
 673 // Kinematic seletion on final state heavy flavor mesons
 674                     if (ParentSelected(kf) && !KinematicSelection(iparticle, 0))
 675                     {
 676                         continue;
 677                     }
 678                     pSelected[i] = 1;
 679                     if (ParentSelected(kf)) ++nParents; // Update parent count
 680 //                  printf("\n particle (HF)  %d %d %d", i, pSelected[i], kf);
 681                 } else {
 682 // Kinematic seletion on decay products
 683                     if (fCutOnChild && ParentSelected(kfMo) && ChildSelected(kf)
 684                         && !KinematicSelection(iparticle, 1))
 685                     {
 686                         continue;
 687                     }
 688 //
 689 // Decay products
 690 // Select if mother was selected and is not tracked
 691
 692                     if (pSelected[ipa] &&
 693                         !trackIt[ipa]  &&     // mother will be  tracked ?
 694                         kfMo !=  5 &&         // mother is b-quark, don't store fragments
 695                         kfMo !=  4 &&         // mother is c-quark, don't store fragments
 696                         kf   != 92)           // don't store string
 697                     {
 698 //
 699 // Semi-stable or de-selected: diselect decay products:
 700 //
 701 //
 702                         if (pSelected[i] == -1 ||  fDecayer->GetLifetime(kf) > fMaxLifeTime)
 703                         {
 704                             Int_t ipF = iparticle->GetFirstDaughter();
 705                             Int_t ipL = iparticle->GetLastDaughter();
 706                             if (ipF > 0) for (j = ipF-1; j < ipL; j++) pSelected[j] = -1;
 707                         }
 708 //                      printf("\n particle (decay)  %d %d %d", i, pSelected[i], kf);
 709                         pSelected[i] = (pSelected[i] == -1) ? 0 : 1;
 710                     }
 711                 }
 712                 if (pSelected[i] == -1) pSelected[i] = 0;
 713                 if (!pSelected[i]) continue;
 714                 // Count quarks only if you did not include fragmentation
 715                 if (fFragmentation && kf <= 10) continue;
 716
 717                 nc++;
 718 // Decision on tracking
 719                 trackIt[i] = 0;
 720 //
 721 // Track final state particle
 722                 if (ks == 1) trackIt[i] = 1;
 723 // Track semi-stable particles
 724                 if ((ks == 1) || (fDecayer->GetLifetime(kf) > fMaxLifeTime))  trackIt[i] = 1;
 725 // Track particles selected by process if undecayed.
 726                 if (fForceDecay == kNoDecay) {
 727                     if (ParentSelected(kf)) trackIt[i] = 1;
 728                 } else {
 729                     if (ParentSelected(kf)) trackIt[i] = 0;
 730                 }
 731                 if (trackIt[i] == 1) ++nTkbles; // Update trackable counter
 732 //
 733 //
 734
 735             } // particle selection loop
 736             if (nc > 0) {
 737                 for (i = 0; i < np; i++) {
 738                     if (!pSelected[i]) continue;
 739                     TParticle *  iparticle = (TParticle *) fParticles.At(i);
 740                     kf = CheckPDGCode(iparticle->GetPdgCode());
 741                     Int_t ks = iparticle->GetStatusCode();
 742                     p[0] = iparticle->Px();
 743                     p[1] = iparticle->Py();
 744                     p[2] = iparticle->Pz();
 745                     p[3] = iparticle->Energy();
 746
 747                     origin[0] = fVertex[0]+iparticle->Vx()/10; // [cm]
 748                     origin[1] = fVertex[1]+iparticle->Vy()/10; // [cm]
 749                     origin[2] = fVertex[2]+iparticle->Vz()/10; // [cm]
 750
 751                     Float_t tof   = kconv*iparticle->T();
 752                     Int_t ipa = (fPythia->Version() == 6) ? (iparticle->GetFirstMother() - 1) :(iparticle->GetFirstMother()) ;
 753                     Int_t iparent = (ipa > -1) ? pParent[ipa] : -1;
 754
 755                     PushTrack(fTrackIt*trackIt[i], iparent, kf,
 756                               p[0], p[1], p[2], p[3],
 757                               origin[0], origin[1], origin[2], tof,
 758                               polar[0], polar[1], polar[2],
 759                               kPPrimary, nt, 1., ks);
 760                     pParent[i] = nt;
 761                     KeepTrack(nt);
 762                     fNprimaries++;
 763                 } //  PushTrack loop
 764             }
 765         } else {
 766             nc = GenerateMB();
 767         } // mb ?
 768
 769         GetSubEventTime();
 770
 771         delete[] pParent;
 772         delete[] pSelected;
 773         delete[] trackIt;
 774
 775         if (nc > 0) {
 776           switch (fCountMode) {
 777           case kCountAll:
 778             // printf(" Count all \n");
 779             jev += nc;
 780             break;
 781           case kCountParents:
 782             // printf(" Count parents \n");
 783             jev += nParents;
 784             break;
 785           case kCountTrackables:
 786             // printf(" Count trackable \n");
 787             jev += nTkbles;
 788             break;
 789           }
 790             if (jev >= fNpart || fNpart == -1) {
 791                 fKineBias=Float_t(fNpart)/Float_t(fTrials);
 792                 fPythia->GetXandQ(fQ, fX1, fX2);
 793                 fTrialsRun += fTrials;
 794                 fNev++;
 795                 MakeHeader();
 796                 break;
 797             }
 798         }
 799     } // event loop
 800     SetHighWaterMark(nt);
 801 //  Adjust weight due to kinematic selection
 802 //  AdjustWeights();
 803 //  get cross-section
 804     fXsection = fPythia->GetXSection();
 805 }
 806
 807 Int_t  AliGenPythiaPlus::GenerateMB()
 808 {
 809 //
 810 // Min Bias selection and other global selections
 811 //
 812     Int_t i, kf, nt, iparent;
 813     Int_t nc = 0;
 814     Float_t p[4];
 815     Float_t polar[3]   =   {0,0,0};
 816     Float_t origin[3]  =   {0,0,0};
 817 //  converts from mm/c to s
 818     const Float_t kconv = 0.001 / 2.999792458e8;
 819
 820     Int_t np = (fHadronisation) ? fParticles.GetEntriesFast() : fNpartons;
 821
 822     Int_t* pParent = new Int_t[np];
 823     for (i=0; i< np; i++) pParent[i] = -1;
 824     if (fProcess == kPyJets || fProcess == kPyDirectGamma) {
 825         TParticle* jet1 = (TParticle *) fParticles.At(6);
 826         TParticle* jet2 = (TParticle *) fParticles.At(7);
 827         if (!CheckTrigger(jet1, jet2)) {
 828           delete [] pParent;
 829           return 0;
 830         }
 831     }
 832
 833     // Select jets with fragmentation photon or pi0 going to PHOS or EMCAL
 834     if (fProcess == kPyJets && (fFragPhotonInCalo || fPi0InCalo) ) {
 835
 836       Bool_t ok = kFALSE;
 837
 838       Int_t pdg  = 0;
 839       if (fFragPhotonInCalo) pdg = 22   ; // Photon
 840       else if (fPi0InCalo) pdg = 111 ; // Pi0
 841
 842       for (i=0; i< np; i++) {
 843         TParticle* iparticle = (TParticle *) fParticles.At(i);
 844         if(iparticle->GetStatusCode()==1 && iparticle->GetPdgCode()==pdg &&
 845            iparticle->Pt() > fFragPhotonOrPi0MinPt){
 846             Int_t imother = (fPythia->Version() == 6) ? (iparticle->GetFirstMother() - 1) :(iparticle->GetFirstMother()) ;
 847           TParticle* pmother = (TParticle *) fParticles.At(imother);
 848           if(pdg == 111 ||
 849              (pdg == 22 && pmother->GetStatusCode() != 11))//No photon from hadron decay
 850             {
 851               Float_t phi = iparticle->Phi()*180./TMath::Pi(); //Convert to degrees
 852               Float_t eta =TMath::Abs(iparticle->Eta());//in calos etamin=-etamax
 853               if((fCheckEMCAL && IsInEMCAL(phi,eta)) ||
 854                  (fCheckPHOS    && IsInPHOS(phi,eta)) )
 855                 ok =kTRUE;
 856             }
 857         }
 858       }
 859       if(!ok)
 860         return 0;
 861     }
 862
 863
 864      // Select events with a photon  pt > min pt going to PHOS eta acceptance or exactly PHOS eta phi
 865     if ((fProcess == kPyJets || fProcess == kPyDirectGamma) && fPhotonInCalo && (fCheckPHOSeta || fCheckPHOS)){
 866
 867       Bool_t okd = kFALSE;
 868
 869       Int_t pdg  = 22;
 870       Int_t iphcand = -1;
 871       for (i=0; i< np; i++) {
 872          TParticle* iparticle = (TParticle *) fParticles.At(i);
 873          Float_t phi = iparticle->Phi()*180./TMath::Pi(); //Convert to degrees
 874          Float_t eta =TMath::Abs(iparticle->Eta());//in calos etamin=-etamax
 875
 876          if(iparticle->GetStatusCode() == 1
 877             && iparticle->GetPdgCode() == pdg
 878             && iparticle->Pt() > fPhotonMinPt
 879             && eta < fPHOSEta){
 880
 881             // first check if the photon is in PHOS phi
 882             if(IsInPHOS(phi,eta)){
 883                 okd = kTRUE;
 884                 break;
 885             }
 886             if(fCheckPHOSeta) iphcand = i; // candiate photon to rotate in phi
 887
 888          }
 889       }
 890
 891       if(!okd && iphcand != -1) // execute rotation in phi
 892           RotatePhi(iphcand,okd);
 893
 894       if(!okd)
 895         return 0;
 896     }
 897
 898     if (fTriggerParticle) {
 899         Bool_t triggered = kFALSE;
 900         for (i = 0; i < np; i++) {
 901             TParticle *  iparticle = (TParticle *) fParticles.At(i);
 902             kf = CheckPDGCode(iparticle->GetPdgCode());
 903             if (kf != fTriggerParticle) continue;
 904             if (iparticle->Pt() == 0.) continue;
 905             if (TMath::Abs(iparticle->Eta()) > fTriggerEta) continue;
 906             triggered = kTRUE;
 907             break;
 908         }
 909         if (!triggered) {
 910           delete [] pParent;
 911           return 0;
 912         }
 913     }
 914
 915
 916     // Check if there is a ccbar or bbbar pair with at least one of the two
 917     // in fYMin < y < fYMax
 918     if (fProcess == kPyCharmppMNRwmi || fProcess == kPyBeautyppMNRwmi) {
 919       TParticle *partCheck;
 920       TParticle *mother;
 921       Bool_t  theQ=kFALSE,theQbar=kFALSE,inYcut=kFALSE;
 922       Bool_t  theChild=kFALSE;
 923       Float_t y;
 924       Int_t   pdg,mpdg,mpdgUpperFamily;
 925       for(i=0; i<np; i++) {
 926         partCheck = (TParticle*)fParticles.At(i);
 927         pdg = partCheck->GetPdgCode();
 928         if(TMath::Abs(pdg) == fFlavorSelect) { // quark
 929           if(pdg>0) { theQ=kTRUE; } else { theQbar=kTRUE; }
 930           y = 0.5*TMath::Log((partCheck->Energy()+partCheck->Pz()+1.e-13)/
 931                              (partCheck->Energy()-partCheck->Pz()+1.e-13));
 932           if(y>fYMin && y<fYMax) inYcut=kTRUE;
 933         }
 934
 935         if(fCutOnChild && TMath::Abs(pdg) == fPdgCodeParticleforAcceptanceCut) {
 936           Int_t mi = partCheck->GetFirstMother() - 1;
 937           if(mi<0) continue;
 938           mother = (TParticle*)fParticles.At(mi);
 939           mpdg=TMath::Abs(mother->GetPdgCode());
 940           mpdgUpperFamily=(mpdg>1000 ? mpdg+1000 : mpdg+100); // keep e from c from b
 941           if ( ParentSelected(mpdg) ||
 942               (fFlavorSelect==5 && ParentSelected(mpdgUpperFamily))) {
 943             if (KinematicSelection(partCheck,1)) {
 944               theChild=kTRUE;
 945             }
 946           }
 947         }
 948       }
 949       if (!theQ || !theQbar || !inYcut) { // one of the c/b conditions not satisfied
 950         delete[] pParent;
 951         return 0;
 952       }
 953       if (fCutOnChild && !theChild) { // one of the child conditions not satisfied
 954         delete[] pParent;
 955         return 0;
 956       }
 957
 958     }
 959
 960     //Introducing child cuts in case kPyW, kPyZ, kPyMb, and kPyMbNonDiff
 961     if ( (fProcess == kPyW ||
 962           fProcess == kPyZ ||
 963           fProcess == kPyMbDefault ||
 964           fProcess == kPyMb ||
 965           fProcess == kPyMbWithDirectPhoton ||
 966           fProcess == kPyMbNonDiffr)
 967          && (fCutOnChild == 1) ) {
 968       if ( !CheckKinematicsOnChild() ) {
 969         delete[] pParent;
 970         return 0;
 971       }
 972     }
 973
 974
 975     for (i = 0; i < np; i++) {
 976         Int_t trackIt = 0;
 977         TParticle *  iparticle = (TParticle *) fParticles.At(i);
 978         kf = CheckPDGCode(iparticle->GetPdgCode());
 979         Int_t ks = iparticle->GetStatusCode();
 980         Int_t km = iparticle->GetFirstMother();
 981         if ((ks == 1  && kf!=0 && KinematicSelection(iparticle, 0)) ||
 982             (ks != 1) ||
 983             (fProcess == kPyJets && ks == 21 && km == 0 && i>1)) {
 984             nc++;
 985             if (ks == 1) trackIt = 1;
 986
 987             Int_t ipa = (fPythia->Version() == 6) ? (iparticle->GetFirstMother() - 1) :(iparticle->GetFirstMother()) ;
 988             iparent = (ipa > -1) ? pParent[ipa] : -1;
 989             if (ipa >= np) fPythia->EventListing();
 990
 991 //
 992 // store track information
 993             p[0] = iparticle->Px();
 994             p[1] = iparticle->Py();
 995             p[2] = iparticle->Pz();
 996             p[3] = iparticle->Energy();
 997
 998
 999             origin[0] = fVertex[0]+iparticle->Vx()/10; // [cm]
1000             origin[1] = fVertex[1]+iparticle->Vy()/10; // [cm]
1001             origin[2] = fVertex[2]+iparticle->Vz()/10; // [cm]
1002
1003             Float_t tof = fEventTime + kconv * iparticle->T();
1004
1005             PushTrack(fTrackIt*trackIt, iparent, kf,
1006                       p[0], p[1], p[2], p[3],
1007                       origin[0], origin[1], origin[2], tof,
1008                       polar[0], polar[1], polar[2],
1009                       kPPrimary, nt, 1., ks);
1010             fNprimaries++;
1011
1012
1013             //
1014             // Special Treatment to store color-flow
1015             //
1016             /*
1017             if (ks == 3 || ks == 13 || ks == 14) {
1018                 TParticle* particle = 0;
1019                 if (fStack) {
1020                     particle = fStack->Particle(nt);
1021                 } else {
1022                     particle = AliRunLoader::Instance()->Stack()->Particle(nt);
1023                 }
1024                 particle->SetFirstDaughter(fPythia->GetK(2, i));
1025                 particle->SetLastDaughter(fPythia->GetK(3, i));
1026             }
1027             */
1028             KeepTrack(nt);
1029             pParent[i] = nt;
1030             SetHighWaterMark(nt);
1031
1032         } // select particle
1033     } // particle loop
1034
1035     delete[] pParent;
1036
1037     return 1;
1038 }
1039
1040
1041 void AliGenPythiaPlus::FinishRun()
1042 {
1043 // Print x-section summary
1044     fPythia->PrintStatistics();
1045
1046     if (fNev > 0.) {
1047         fQ  /= fNev;
1048         fX1 /= fNev;
1049         fX2 /= fNev;
1050     }
1051
1052     printf("\nTotal number of Pyevnt() calls %d\n", fTrialsRun);
1053     printf("\nMean Q, x1, x2: %f %f %f\n", fQ, fX1, fX2);
1054 }
1055
1056 void AliGenPythiaPlus::AdjustWeights() const
1057 {
1058 // Adjust the weights after generation of all events
1059 //
1060     if (gAlice) {
1061         TParticle *part;
1062         Int_t ntrack=gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
1063         for (Int_t i=0; i<ntrack; i++) {
1064             part= gAlice->GetMCApp()->Particle(i);
1065             part->SetWeight(part->GetWeight()*fKineBias);
1066         }
1067     }
1068 }
1069
1070 void AliGenPythiaPlus::SetNuclei(Int_t a1, Int_t a2)
1071 {
1072 // Treat protons as inside nuclei with mass numbers a1 and a2
1073
1074     fAProjectile = a1;
1075     fATarget     = a2;
1076     fSetNuclei   = kTRUE;
1077 }
1078
1079
1080 void AliGenPythiaPlus::MakeHeader()
1081 {
1082 //
1083 // Make header for the simulated event
1084 //
1085   if (gAlice) {
1086     if (gAlice->GetEvNumber()>=fDebugEventFirst &&
1087         gAlice->GetEvNumber()<=fDebugEventLast) fPythia->EventListing();
1088   }
1089
1090 // Builds the event header, to be called after each event
1091     if (fHeader) delete fHeader;
1092     fHeader = new AliGenPythiaEventHeader("Pythia");
1093 //
1094 // Event type
1095     ((AliGenPythiaEventHeader*) fHeader)->SetProcessType(fPythia->ProcessCode());
1096 //
1097 // Number of trials
1098     ((AliGenPythiaEventHeader*) fHeader)->SetTrials(fTrials);
1099 //
1100 // Event Vertex
1101     fHeader->SetPrimaryVertex(fVertex);
1102
1103 //
1104 // Number of primaries
1105     fHeader->SetNProduced(fNprimaries);
1106 //
1107 // Jets that have triggered
1108
1109     if (fProcess == kPyJets)
1110     {
1111         Int_t ntrig, njet;
1112         Float_t jets[4][10];
1113         GetJets(njet, ntrig, jets);
1114
1115
1116         for (Int_t i = 0; i < ntrig; i++) {
1117             ((AliGenPythiaEventHeader*) fHeader)->AddJet(jets[0][i], jets[1][i], jets[2][i],
1118                                                         jets[3][i]);
1119         }
1120     }
1121 //
1122 // Copy relevant information from external header, if present.
1123 //
1124     Float_t uqJet[4];
1125
1126     if (fRL) {
1127         AliGenPythiaEventHeader* exHeader = (AliGenPythiaEventHeader*) (fRL->GetHeader()->GenEventHeader());
1128         for (Int_t i = 0; i < exHeader->NTriggerJets(); i++)
1129         {
1130             printf("Adding Jet %d %d \n", i,  exHeader->NTriggerJets());
1131
1132
1133             exHeader->TriggerJet(i, uqJet);
1134             ((AliGenPythiaEventHeader*) fHeader)->AddUQJet(uqJet[0], uqJet[1], uqJet[2], uqJet[3]);
1135         }
1136     }
1137 //
1138 // Store quenching parameters
1139 //
1140     if (fQuench){
1141         Double_t z[4] = {0.};
1142         Double_t xp = 0.;
1143         Double_t yp = 0.;
1144         if (fQuench == 1) {
1145             // Pythia::Quench()
1146             fPythia->GetQuenchingParameters(xp, yp, z);
1147         } else {
1148             // Pyquen
1149             Double_t r1 = PARIMP.rb1;
1150             Double_t r2 = PARIMP.rb2;
1151             Double_t b  = PARIMP.b1;
1152             Double_t r   = 0.5 * TMath::Sqrt(2. * (r1 * r1 + r2 * r2) - b * b);
1153             Double_t phi = PARIMP.psib1;
1154             xp = r * TMath::Cos(phi);
1155             yp = r * TMath::Sin(phi);
1156
1157         }
1158             ((AliGenPythiaEventHeader*) fHeader)->SetXYJet(xp, yp);
1159             ((AliGenPythiaEventHeader*) fHeader)->SetZQuench(z);
1160         }
1161 //
1162 // Store pt^hard
1163     ((AliGenPythiaEventHeader*) fHeader)->SetPtHard(fPythia->GetPtHard());
1164 //
1165 //  Pass header
1166 //
1167     AddHeader(fHeader);
1168     fHeader = 0x0;
1169 }
1170
1171 Bool_t AliGenPythiaPlus::CheckTrigger(TParticle* jet1, TParticle* jet2)
1172 {
1173 // Check the kinematic trigger condition
1174 //
1175     Double_t eta[2];
1176     eta[0] = jet1->Eta();
1177     eta[1] = jet2->Eta();
1178     Double_t phi[2];
1179     phi[0] = jet1->Phi();
1180     phi[1] = jet2->Phi();
1181     Int_t    pdg[2];
1182     pdg[0] = jet1->GetPdgCode();
1183     pdg[1] = jet2->GetPdgCode();
1184     Bool_t   triggered = kFALSE;
1185
1186     if (fProcess == kPyJets) {
1187         Int_t njets = 0;
1188         Int_t ntrig = 0;
1189         Float_t jets[4][10];
1190 //
1191 // Use Pythia clustering on parton level to determine jet axis
1192 //
1193         GetJets(njets, ntrig, jets);
1194
1195         if (ntrig || fEtMinJet == 0.) triggered = kTRUE;
1196 //
1197     } else {
1198         Int_t ij = 0;
1199         Int_t ig = 1;
1200         if (pdg[0] == kGamma) {
1201             ij = 1;
1202             ig = 0;
1203         }
1204         //Check eta range first...
1205         if ((eta[ij] < fEtaMaxJet   && eta[ij] > fEtaMinJet) &&
1206             (eta[ig] < fEtaMaxGamma && eta[ig] > fEtaMinGamma))
1207         {
1208             //Eta is okay, now check phi range
1209             if ((phi[ij] < fPhiMaxJet   && phi[ij] > fPhiMinJet) &&
1210                 (phi[ig] < fPhiMaxGamma && phi[ig] > fPhiMinGamma))
1211             {
1212                 triggered = kTRUE;
1213             }
1214         }
1215     }
1216     return triggered;
1217 }
1218
1219
1220
1221 Bool_t AliGenPythiaPlus::CheckKinematicsOnChild(){
1222 //
1223 //Checking Kinematics on Child (status code 1, particle code ?, kin cuts
1224 //
1225     Bool_t checking = kFALSE;
1226     Int_t j, kcode, ks, km;
1227     Int_t nPartAcc = 0; //number of particles in the acceptance range
1228     Int_t numberOfAcceptedParticles = 1;
1229     if (fNumberOfAcceptedParticles != 0) { numberOfAcceptedParticles = fNumberOfAcceptedParticles; }
1230     Int_t npart = fParticles.GetEntriesFast();
1231
1232     for (j = 0; j<npart; j++) {
1233         TParticle *  jparticle = (TParticle *) fParticles.At(j);
1234         kcode = TMath::Abs( CheckPDGCode(jparticle->GetPdgCode()) );
1235         ks = jparticle->GetStatusCode();
1236         km = jparticle->GetFirstMother();
1237
1238         if( (ks == 1)  &&  (kcode == fPdgCodeParticleforAcceptanceCut)  &&  (KinematicSelection(jparticle,1)) ){
1239             nPartAcc++;
1240         }
1241         if( numberOfAcceptedParticles <= nPartAcc){
1242           checking = kTRUE;
1243           break;
1244         }
1245     }
1246
1247     return checking;
1248 }
1249
1250 void AliGenPythiaPlus::RecJetsUA1(Int_t& njets, Float_t jets [4][50])
1251 {
1252 //
1253 //  Calls the Pythia jet finding algorithm to find jets in the current event
1254 //
1255 //
1256 //
1257 //  Save jets
1258 //
1259 //  Run Jet Finder
1260     fPythia->Pycell(njets);
1261     Int_t i;
1262     for (i = 0; i < njets; i++) {
1263         Float_t px, py, pz, e;
1264         fPythia->GetJet(i, px, py, pz, e);
1265         jets[0][i] = px;
1266         jets[1][i] = py;
1267         jets[2][i] = pz;
1268         jets[3][i] = e;
1269     }
1270 }
1271
1272
1273 void  AliGenPythiaPlus::GetJets(Int_t& nJets, Int_t& nJetsTrig, Float_t jets[4][10])
1274 {
1275 //
1276 //  Calls the Pythia clustering algorithm to find jets in the current event
1277 //
1278     nJets       = 0;
1279     nJetsTrig   = 0;
1280     if (fJetReconstruction == kCluster) {
1281 //
1282 //  Configure cluster algorithm
1283 //
1284 //      fPythia->SetPARU(43, 2.);
1285 //      fPythia->SetMSTU(41, 1);
1286 //
1287 //  Call cluster algorithm
1288 //
1289         fPythia->Pyclus(nJets);
1290 //
1291 //  Loading jets from common block
1292 //
1293     } else {
1294
1295 //
1296 //  Run Jet Finder
1297         fPythia->Pycell(nJets);
1298     }
1299
1300     Int_t i;
1301     for (i = 0; i < nJets; i++) {
1302         Float_t px, py, pz, e;
1303         fPythia->GetJet(i, px, py, pz, e);
1304         Float_t pt    = TMath::Sqrt(px * px + py * py);
1305         Float_t phi   = TMath::Pi() + TMath::ATan2(-py, -px);
1306         Float_t theta = TMath::ATan2(pt,pz);
1307         Float_t et    = e * TMath::Sin(theta);
1308         Float_t eta   = -TMath::Log(TMath::Tan(theta / 2.));
1309         if (
1310             eta > fEtaMinJet && eta < fEtaMaxJet &&
1311             phi > fPhiMinJet && phi < fPhiMaxJet &&
1312             et  > fEtMinJet  && et  < fEtMaxJet
1313             )
1314         {
1315             jets[0][nJetsTrig] = px;
1316             jets[1][nJetsTrig] = py;
1317             jets[2][nJetsTrig] = pz;
1318             jets[3][nJetsTrig] = e;
1319             nJetsTrig++;
1320         } else {
1321         }
1322     }
1323 }
1324
1325 void AliGenPythiaPlus::GetSubEventTime()
1326 {
1327   // Calculates time of the next subevent
1328   fEventTime = 0.;
1329   if (fEventsTime) {
1330     TArrayF &array = *fEventsTime;
1331     fEventTime = array[fCurSubEvent++];
1332   }
1333   //  printf(" Event time: %d %f %p",fCurSubEvent,fEventTime,fEventsTime);
1334   return;
1335 }
1336
1337
1338
1339
1340 Bool_t AliGenPythiaPlus::IsInEMCAL(Float_t phi, Float_t eta)
1341 {
1342   // Is particle in EMCAL acceptance?
1343   // phi in degrees, etamin=-etamax
1344   if(phi > fEMCALMinPhi  && phi < fEMCALMaxPhi &&
1345      eta < fEMCALEta  )
1346     return kTRUE;
1347   else
1348     return kFALSE;
1349 }
1350
1351 Bool_t AliGenPythiaPlus::IsInPHOS(Float_t phi, Float_t eta)
1352 {
1353   // Is particle in PHOS acceptance?
1354   // Acceptance slightly larger considered.
1355   // phi in degrees, etamin=-etamax
1356   if(phi > fPHOSMinPhi  && phi < fPHOSMaxPhi &&
1357      eta < fPHOSEta  )
1358     return kTRUE;
1359   else
1360     return kFALSE;
1361 }
1362
1363 void AliGenPythiaPlus::RotatePhi(Int_t iphcand, Bool_t& okdd)
1364 {
1365   //calculate the new position random between fPHOSMinPhi and fPHOSMaxPhi
1366   Double_t phiPHOSmin = TMath::Pi()*fPHOSMinPhi/180;
1367   Double_t phiPHOSmax = TMath::Pi()*fPHOSMaxPhi/180;
1368   Double_t phiPHOS = gRandom->Uniform(phiPHOSmin,phiPHOSmax);
1369
1370   //calculate deltaphi
1371   TParticle* ph = (TParticle *) fParticles.At(iphcand);
1372   Double_t phphi = ph->Phi();
1373   Double_t deltaphi = phiPHOS - phphi;
1374
1375
1376
1377   //loop for all particles and produce the phi rotation
1378   Int_t np = (fHadronisation) ? fParticles.GetEntriesFast() : fNpartons;
1379   Double_t oldphi, newphi;
1380   Double_t newVx, newVy, R, Vz, time;
1381   Double_t newPx, newPy, pt, Pz, e;
1382   for(Int_t i=0; i< np; i++) {
1383       TParticle* iparticle = (TParticle *) fParticles.At(i);
1384       oldphi = iparticle->Phi();
1385       newphi = oldphi + deltaphi;
1386       if(newphi < 0) newphi = 2*TMath::Pi() + newphi; // correct angle
1387       if(newphi > 2*TMath::Pi()) newphi = newphi - 2*TMath::Pi(); // correct angle
1388
1389       R = iparticle->R();
1390       newVx = R*TMath::Cos(newphi);
1391       newVy = R*TMath::Sin(newphi);
1392       Vz = iparticle->Vz(); // don't transform
1393       time = iparticle->T(); // don't transform
1394
1395       pt = iparticle->Pt();
1396       newPx = pt*TMath::Cos(newphi);
1397       newPy = pt*TMath::Sin(newphi);
1398       Pz = iparticle->Pz(); // don't transform
1399       e = iparticle->Energy(); // don't transform
1400
1401       // apply rotation
1402       iparticle->SetProductionVertex(newVx, newVy, Vz, time);
1403       iparticle->SetMomentum(newPx, newPy, Pz, e);
1404
1405   } //end particle loop
1406
1407    // now let's check that we put correctly the candidate photon in PHOS
1408    Float_t phi = ph->Phi()*180./TMath::Pi(); //Convert to degrees
1409    Float_t eta =TMath::Abs(ph->Eta());//in calos etamin=-etamax
1410    if(IsInPHOS(phi,eta))
1411       okdd = kTRUE;
1412 }
1413
1414
1415 #ifdef never
1416 void AliGenPythiaPlus::Streamer(TBuffer &R__b)
1417 {
1418    // Stream an object of class AliGenPythia.
1419
1420    if (R__b.IsReading()) {
1421       Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
1422       AliGenerator::Streamer(R__b);
1423       R__b >> (Int_t&)fProcess;
1424       R__b >> (Int_t&)fStrucFunc;
1425       R__b >> (Int_t&)fForceDecay;
1426       R__b >> fEnergyCMS;
1427       R__b >> fKineBias;
1428       R__b >> fTrials;
1429       fParentSelect.Streamer(R__b);
1430       fChildSelect.Streamer(R__b);
1431       R__b >> fXsection;
1432 //      (AliPythia::Instance())->Streamer(R__b);
1433       R__b >> fPtHardMin;
1434       R__b >> fPtHardMax;
1435 //      if (fDecayer) fDecayer->Streamer(R__b);
1436    } else {
1437       R__b.WriteVersion(AliGenPythiaPlus::IsA());
1438       AliGenerator::Streamer(R__b);
1439       R__b << (Int_t)fProcess;
1440       R__b << (Int_t)fStrucFunc;
1441       R__b << (Int_t)fForceDecay;
1442       R__b << fEnergyCMS;
1443       R__b << fKineBias;
1444       R__b << fTrials;
1445       fParentSelect.Streamer(R__b);
1446       fChildSelect.Streamer(R__b);
1447       R__b << fXsection;
1448 //      R__b << fPythia;
1449       R__b << fPtHardMin;
1450       R__b << fPtHardMax;
1451       //     fDecayer->Streamer(R__b);
1452    }
1453 }
1454 #endif
1455
1456
1457