STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <RVersion.h>
  25 #include <TBrowser.h>
  26 #include <TStopwatch.h>
  27 #include <TSystem.h>
  28 #include <TVirtualMC.h>
  29 #include <TGeoManager.h>
  30
  31
  32 #include "AliLog.h"
  33 #include "AliDetector.h"
  34 #include "AliGenerator.h"
  35 #include "AliHeader.h"
  36 #include "AliLego.h"
  37 #include "AliMC.h"
  38 #include "AliMCQA.h"
  39 #include "AliRun.h"
  40 #include "AliStack.h"
  41 #include "AliMagF.h"
  42 #include "AliTrackReference.h"
  43
  44
  45 ClassImp(AliMC)
  46
  47 //_______________________________________________________________________
  48 AliMC::AliMC() :
  49   fGenerator(0),
  50   fEventEnergy(0),
  51   fSummEnergy(0),
  52   fSum2Energy(0),
  53   fTrRmax(1.e10),
  54   fTrZmax(1.e10),
  55   fRDecayMax(1.e10),
  56   fRDecayMin(0),
  57   fDecayPdg(0),
  58   fImedia(0),
  59   fTransParName("\0"),
  60   fMCQA(0),
  61   fHitLists(0),
  62   fTrackReferences(0)
  63
  64 {
  65   //default constructor
  66   DecayLimits();
  67 }
  68
  69 //_______________________________________________________________________
  70 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  71   TVirtualMCApplication(name, title),
  72   fGenerator(0),
  73   fEventEnergy(0),
  74   fSummEnergy(0),
  75   fSum2Energy(0),
  76   fTrRmax(1.e10),
  77   fTrZmax(1.e10),
  78   fRDecayMax(1.e10),
  79   fRDecayMin(0),
  80   fDecayPdg(0),
  81   fImedia(new TArrayI(1000)),
  82   fTransParName("\0"),
  83   fMCQA(0),
  84   fHitLists(new TList()),
  85   fTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100))
  86 {
  87   //constructor
  88   // Set transport parameters
  89   SetTransPar();
  90   DecayLimits();
  91   // Prepare the tracking medium lists
  92   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
  93 }
  94
  95 //_______________________________________________________________________
  96 AliMC::AliMC(const AliMC &mc) :
  97   TVirtualMCApplication(mc),
  98   fGenerator(0),
  99   fEventEnergy(0),
 100   fSummEnergy(0),
 101   fSum2Energy(0),
 102   fTrRmax(1.e10),
 103   fTrZmax(1.e10),
 104   fRDecayMax(1.e10),
 105   fRDecayMin(0),
 106   fDecayPdg(0),
 107   fImedia(0),
 108   fTransParName("\0"),
 109   fMCQA(0),
 110   fHitLists(0),
 111   fTrackReferences(0)
 112 {
 113   //
 114   // Copy constructor for AliMC
 115   //
 116   mc.Copy(*this);
 117 }
 118
 119 //_______________________________________________________________________
 120 AliMC::~AliMC()
 121 {
 122   //destructor
 123   delete fGenerator;
 124   delete fImedia;
 125   delete fMCQA;
 126   delete fHitLists;
 127   // Delete track references
 128   if (fTrackReferences) {
 129     fTrackReferences->Delete();
 130     delete fTrackReferences;
 131     fTrackReferences     = 0;
 132   }
 133
 134 }
 135
 136 //_______________________________________________________________________
 137 void AliMC::Copy(TObject &) const
 138 {
 139   //dummy Copy function
 140   AliFatal("Not implemented!");
 141 }
 142
 143 //_______________________________________________________________________
 144 void  AliMC::ConstructGeometry()
 145 {
 146   //
 147   // Either load geometry from file or create it through usual
 148   // loop on detectors. In the first case the method
 149   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
 150   // at InitGeometry().
 151   //
 152
 153   if(gAlice->IsRootGeometry()){
 154     // Load geometry
 155     const char *geomfilename = gAlice->GetGeometryFileName();
 156     if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
 157       AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s\n\n",geomfilename));
 158       TGeoManager::Import(geomfilename);
 159     }else{
 160       AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
 161       return;
 162     }
 163   }else{
 164     // Create modules, materials, geometry
 165     TStopwatch stw;
 166     TIter next(gAlice->Modules());
 167     AliModule *detector;
 168     AliDebug(1, "Geometry creation:");
 169     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 170       stw.Start();
 171       // Initialise detector materials and geometry
 172       detector->CreateMaterials();
 173       detector->CreateGeometry();
 174       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 175                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 176     }
 177   }
 178
 179 }
 180
 181 //_______________________________________________________________________
 182 void  AliMC::InitGeometry()
 183 {
 184   //
 185   // Initialize detectors and display geometry
 186   //
 187
 188   AliInfo("Initialisation:");
 189   TStopwatch stw;
 190   TIter next(gAlice->Modules());
 191   AliModule *detector;
 192   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 193     stw.Start();
 194     // Initialise detector and display geometry
 195     if(gAlice->IsRootGeometry()) detector->CreateMaterials();
 196     detector->Init();
 197     detector->BuildGeometry();
 198     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 199                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 200   }
 201
 202 }
 203
 204 //_______________________________________________________________________
 205 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 206 {
 207   //
 208   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 209   //
 210
 211   Generator()->Generate();
 212 }
 213
 214 //_______________________________________________________________________
 215 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 216 {
 217   //
 218   // Load the event generator
 219   //
 220   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 221 }
 222
 223 //_______________________________________________________________________
 224 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 225 {
 226   //
 227   // Load the event generator
 228   //
 229   if(fGenerator)
 230     if(generator)
 231       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
 232                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()))
 233     else
 234       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
 235                       fGenerator->GetName()));
 236   fGenerator = generator;
 237 }
 238
 239 //_______________________________________________________________________
 240 void AliMC::FinishRun()
 241 {
 242   // Clean generator information
 243   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
 244   fGenerator->FinishRun();
 245
 246   //Output energy summary tables
 247   AliDebug(1, "EnergySummary()");
 248   ToAliDebug(1, EnergySummary());
 249 }
 250
 251 //_______________________________________________________________________
 252 void AliMC::BeginPrimary()
 253 {
 254   //
 255   // Called  at the beginning of each primary track
 256   //
 257
 258   // Reset Hits info
 259   ResetHits();
 260   ResetTrackReferences();
 261
 262 }
 263
 264 //_______________________________________________________________________
 265 void AliMC::PreTrack()
 266 {
 267   // Actions before the track's transport
 268      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 269      AliModule *module;
 270
 271      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 272        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 273          module->PreTrack();
 274
 275      fMCQA->PreTrack();
 276 }
 277
 278 //_______________________________________________________________________
 279 void AliMC::Stepping()
 280 {
 281   //
 282   // Called at every step during transport
 283   //
 284
 285   Int_t id = DetFromMate(gMC->GetMedium());
 286   if (id < 0) return;
 287
 288
 289   if ( gMC->IsNewTrack()            &&
 290        gMC->TrackTime() == 0.       &&
 291        fRDecayMin > 0.              &&
 292        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
 293        gMC->TrackPid() == fDecayPdg )
 294   {
 295       FixParticleDecaytime();
 296   }
 297
 298
 299
 300   //
 301   // --- If lego option, do it and leave
 302   if (gAlice->Lego())
 303     gAlice->Lego()->StepManager();
 304   else {
 305     Int_t copy;
 306     //Update energy deposition tables
 307     AddEnergyDeposit(gMC->CurrentVolID(copy),gMC->Edep());
 308     //
 309     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 310     if (gMC->IsTrackDisappeared()) {
 311         if (gMC->Etot()>0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber());
 312     }
 313
 314     //Call the appropriate stepping routine;
 315     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 316     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 317       fMCQA->StepManager(id);
 318       det->StepManager();
 319     }
 320   }
 321 }
 322
 323 //_______________________________________________________________________
 324 void AliMC::EnergySummary()
 325 {
 326   //
 327   // Print summary of deposited energy
 328   //
 329
 330   Int_t ndep=0;
 331   Float_t edtot=0;
 332   Float_t ed, ed2;
 333   Int_t kn, i, left, j, id;
 334   const Float_t kzero=0;
 335   Int_t ievent=gAlice->GetRunLoader()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 336   //
 337   // Energy loss information
 338   if(ievent) {
 339     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 340     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 341       ed=fSummEnergy[kn];
 342       if(ed>0) {
 343         fEventEnergy[ndep]=kn;
 344         if(ievent>1) {
 345           ed=ed/ievent;
 346           ed2=fSum2Energy[kn];
 347           ed2=ed2/ievent;
 348           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 349         } else
 350           ed2=99;
 351         fSummEnergy[ndep]=ed;
 352         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 353         edtot+=ed;
 354         ndep++;
 355       }
 356     }
 357     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 358       left=ndep-kn*3;
 359       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 360         j=kn*3+i;
 361         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 362         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 363       }
 364       printf("\n");
 365     }
 366     //
 367     // Relative energy loss in different detectors
 368     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 369     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 370     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 371       left=ndep-kn*5;
 372       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 373         j=kn*5+i;
 374         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 375         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 376       }
 377       printf("\n");
 378     }
 379     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 380     printf("\n");
 381   }
 382   //
 383   // Reset the TArray's
 384   //  fEventEnergy.Set(0);
 385   //  fSummEnergy.Set(0);
 386   //  fSum2Energy.Set(0);
 387 }
 388
 389 //_____________________________________________________________________________
 390 void AliMC::BeginEvent()
 391 {
 392   //
 393   // Clean-up previous event
 394   // Energy scores
 395   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 396   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 397   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 398   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
 399   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 400   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 401   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 402
 403     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 404
 405   /*******************************/
 406   /*   Clean after eventual      */
 407   /*   previous event            */
 408   /*******************************/
 409
 410
 411   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 412   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 413   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 414   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
 415
 416   fEventEnergy.Reset();
 417     // Clean detector information
 418
 419   if (runloader->Stack())
 420     runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 421   else
 422     runloader->MakeStack();//or make a new one
 423
 424   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 425    {
 426      AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
 427      runloader->MakeTree("K");
 428    }
 429
 430   AliDebug(1, "gMC->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 431   gMC->SetStack(gAlice->GetRunLoader()->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 432                                      //because we don't have guarantee that
 433                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 434                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 435   //
 436   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 437   //
 438
 439   runloader->GetHeader()->Reset(gAlice->GetRunNumber(),gAlice->GetEvNumber(),
 440     gAlice->GetEventNrInRun());
 441 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 442
 443   if(gAlice->Lego())
 444    {
 445     gAlice->Lego()->BeginEvent();
 446     return;
 447    }
 448
 449
 450   AliDebug(1, "ResetHits()");
 451   ResetHits();
 452
 453   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
 454   runloader->MakeTree("H");
 455
 456   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
 457   runloader->MakeTrackRefsContainer();//for insurance
 458
 459
 460   //create new branches and SetAdresses
 461   TIter next(gAlice->Modules());
 462   AliModule *detector;
 463   while((detector = (AliModule*)next()))
 464    {
 465     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
 466     detector->MakeBranch("H");
 467     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranchTR()",detector->GetName()));
 468     detector->MakeBranchTR();
 469     AliDebug(2, Form("%s->SetTreeAddress()",detector->GetName()));
 470     detector->SetTreeAddress();
 471    }
 472   // make branch for AliRun track References
 473   TTree * treeTR = runloader->TreeTR();
 474   if (treeTR){
 475     // make branch for central track references
 476     if (!fTrackReferences) fTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference",0);
 477     TBranch *branch;
 478     branch = treeTR->Branch("AliRun",&fTrackReferences);
 479     branch->SetAddress(&fTrackReferences);
 480   }
 481   //
 482 }
 483
 484 //_______________________________________________________________________
 485 void AliMC::ResetHits()
 486 {
 487   //
 488   //  Reset all Detectors hits
 489   //
 490   TIter next(gAlice->Modules());
 491   AliModule *detector;
 492   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 493      detector->ResetHits();
 494   }
 495 }
 496
 497 //_______________________________________________________________________
 498 void AliMC::PostTrack()
 499 {
 500   // Posts tracks for each module
 501   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 502   AliModule *module;
 503
 504   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 505     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 506       module->PostTrack();
 507 }
 508
 509 //_______________________________________________________________________
 510 void AliMC::FinishPrimary()
 511 {
 512   //
 513   // Called  at the end of each primary track
 514   //
 515   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 516   //  static Int_t count=0;
 517   //  const Int_t times=10;
 518   // This primary is finished, purify stack
 519 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
 520   if (!(gMC->SecondariesAreOrdered()))
 521        runloader->Stack()->ReorderKine();
 522 #endif
 523   runloader->Stack()->PurifyKine();
 524
 525   TIter next(gAlice->Modules());
 526   AliModule *detector;
 527   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 528     detector->FinishPrimary();
 529     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
 530     if(loader)
 531      {
 532        TTree* treeH = loader->TreeH();
 533        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
 534      }
 535   }
 536
 537   // Write out track references if any
 538   if (runloader->TreeTR()) runloader->TreeTR()->Fill();
 539 }
 540
 541 //_______________________________________________________________________
 542 void AliMC::FinishEvent()
 543 {
 544   //
 545   // Called at the end of the event.
 546   //
 547
 548   //
 549   if(gAlice->Lego()) gAlice->Lego()->FinishEvent();
 550
 551   TIter next(gAlice->Modules());
 552   AliModule *detector;
 553   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 554     detector->FinishEvent();
 555   }
 556
 557   //Update the energy deposit tables
 558   Int_t i;
 559   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
 560    {
 561     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
 562     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
 563    }
 564
 565   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 566
 567   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
 568   AliStack* stack = runloader->Stack();
 569   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
 570    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
 571     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
 572     return;//never reached
 573    }
 574   // Update Header information
 575   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
 576   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
 577
 578
 579   // Write out the kinematics
 580   stack->FinishEvent();
 581
 582   // Write out the event Header information
 583   TTree* treeE = runloader->TreeE();
 584   if (treeE)
 585    {
 586       header->SetStack(stack);
 587       treeE->Fill();
 588    }
 589   else
 590    {
 591     AliError("Can not get TreeE from RL");
 592    }
 593
 594   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 595    {
 596      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
 597      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
 598      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
 599    }
 600
 601   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 602   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 603   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 604   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
 605   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 606   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 607   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 608 }
 609
 610 //_______________________________________________________________________
 611 void AliMC::Field(const Double_t* x, Double_t* b) const
 612 {
 613   // Calculates field "b" at point "x"
 614     gAlice->Field(x,b);
 615 }
 616
 617 //_______________________________________________________________________
 618 void AliMC::Init()
 619 {
 620   // MC initialization
 621
 622    //=================Create Materials and geometry
 623    gMC->Init();
 624    //Read the cuts for all materials
 625    ReadTransPar();
 626    //Build the special IMEDIA table
 627    MediaTable();
 628
 629    //Compute cross-sections
 630    gMC->BuildPhysics();
 631
 632    //Write Geometry object to current file.
 633    gAlice->GetRunLoader()->WriteGeometry();
 634
 635    //Initialise geometry deposition table
 636    fEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 637    fSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 638    fSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 639
 640    //
 641    fMCQA = new AliMCQA(gAlice->GetNdets());
 642
 643    // Register MC in configuration
 644    AliConfig::Instance()->Add(gMC);
 645
 646    // Export TGeo geometry
 647    if (gGeoManager) gGeoManager->Export("geometry.root");
 648
 649 }
 650
 651 //_______________________________________________________________________
 652 void AliMC::MediaTable()
 653 {
 654   //
 655   // Built media table to get from the media number to
 656   // the detector id
 657   //
 658
 659   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 660   //  Int_t ibeg;
 661   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 662   AliModule *det;
 663   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
 664   //
 665   // For all detectors
 666   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
 667     // If detector is defined
 668     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
 669         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 670         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 671
 672         // Find max and min material number
 673         if((idt=idtmed[nz])) {
 674           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 675           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 676         }
 677       }
 678       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 679         det->LoMedium() = 0;
 680         det->HiMedium() = 0;
 681       } else {
 682         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 683           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
 684                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
 685           return;
 686         }
 687         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 688         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 689           (*fImedia)[lz]=kz;
 690         }
 691       }
 692     }
 693   }
 694   //
 695   // Print summary table
 696   AliInfo("Tracking media ranges:");
 697   ToAliInfo(
 698   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
 699     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
 700       ind=i*6+k;
 701       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
 702       if(det)
 703         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 704                det->HiMedium());
 705       else
 706         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 707     }
 708     printf("\n");
 709   }
 710   )
 711 }
 712
 713 //_______________________________________________________________________
 714 void AliMC::ReadTransPar()
 715 {
 716   //
 717   // Read filename to set the transport parameters
 718   //
 719
 720
 721   const Int_t kncuts=10;
 722   const Int_t knflags=11;
 723   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
 724   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 725                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 726                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 727                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 728   char line[256];
 729   char detName[7];
 730   char* filtmp;
 731   Float_t cut[kncuts];
 732   Int_t flag[knflags];
 733   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 734   FILE *lun;
 735   //
 736   // See whether the file is there
 737   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
 738   lun=fopen(filtmp,"r");
 739   delete [] filtmp;
 740   if(!lun) {
 741     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
 742     return;
 743   }
 744   //
 745   while(1) {
 746     // Initialise cuts and flags
 747     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
 748     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
 749     itmed=0;
 750     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 751     // Read up to the end of line excluded
 752     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 753     if(iret<0) {
 754       //End of file
 755       fclose(lun);
 756       return;
 757     }
 758     // Read the end of line
 759     fscanf(lun,"%*c");
 760     if(!iret) continue;
 761     if(line[0]=='*') continue;
 762     // Read the numbers
 763     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 764                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 765                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 766                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 767     if(!iret) continue;
 768     if(iret<0) {
 769       //reading error
 770       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
 771       continue;
 772     }
 773     // Check that the module exist
 774     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
 775     if(mod) {
 776       // Get the array of media numbers
 777       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 778       // Check that the tracking medium code is valid
 779       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 780         ktmed=idtmed[itmed];
 781         if(!ktmed) {
 782           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
 783           continue;
 784         }
 785         // Set energy thresholds
 786         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
 787           if(cut[kz]>=0) {
 788             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
 789                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
 790             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
 791           }
 792         }
 793         // Set transport mechanisms
 794         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
 795           if(flag[kz]>=0) {
 796             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
 797                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
 798             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 799           }
 800         }
 801       } else {
 802         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
 803         continue;
 804       }
 805     } else {
 806       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
 807       continue;
 808     }
 809   }
 810 }
 811
 812 //_______________________________________________________________________
 813 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
 814 {
 815   //
 816   // Sets the file name for transport parameters
 817   //
 818   fTransParName = filename;
 819 }
 820
 821 //_______________________________________________________________________
 822 void AliMC::Browse(TBrowser *b)
 823 {
 824   //
 825   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 826   // of the Root browser.
 827   // It displays the Root Trees and all detectors.
 828   //
 829   //detectors are in folders anyway
 830   b->Add(fMCQA,"AliMCQA");
 831 }
 832
 833 //PH
 834 //_______________________________________________________________________
 835 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 836 {
 837   //
 838   //  Add a hit to detector id
 839   //
 840   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 841   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 842 }
 843
 844 //_______________________________________________________________________
 845 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 846 {
 847   //
 848   // Add digit to detector id
 849   //
 850   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 851   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 852 }
 853
 854 //_______________________________________________________________________
 855 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
 856   //
 857   // Returns current track
 858   //
 859   return gAlice->GetRunLoader()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
 860 }
 861
 862 //_______________________________________________________________________
 863 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
 864 {
 865   //
 866   // Dumps particle i in the stack
 867   //
 868   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 869    if (runloader->Stack())
 870     runloader->Stack()->DumpPart(i);
 871 }
 872
 873 //_______________________________________________________________________
 874 void AliMC::DumpPStack () const
 875 {
 876   //
 877   // Dumps the particle stack
 878   //
 879   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 880    if (runloader->Stack())
 881     runloader->Stack()->DumpPStack();
 882 }
 883
 884 //_______________________________________________________________________
 885 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
 886   //
 887   // Returns number of tracks in stack
 888   //
 889   Int_t ntracks = -1;
 890   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 891    if (runloader->Stack())
 892      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
 893    return ntracks;
 894 }
 895
 896 //_______________________________________________________________________
 897 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
 898 {
 899   //
 900   // return number of primary that has generated track
 901   //
 902   Int_t nprimary = -999;
 903   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 904   if (runloader->Stack())
 905     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
 906   return nprimary;
 907 }
 908
 909 //_______________________________________________________________________
 910 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
 911 {
 912   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
 913   // the remaping done by PurifyKine
 914   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 915   if (runloader)
 916    if (runloader->Stack())
 917     return runloader->Stack()->Particle(i);
 918   return 0x0;
 919 }
 920
 921 //_______________________________________________________________________
 922 TObjArray* AliMC::Particles() const {
 923   //
 924   // Returns pointer to Particles array
 925   //
 926   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 927   if (runloader)
 928    if (runloader->Stack())
 929     return runloader->Stack()->Particles();
 930   return 0x0;
 931 }
 932
 933 //_______________________________________________________________________
 934 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
 935                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
 936                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 937 {
 938 // Delegate to stack
 939 //
 940   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 941   if (runloader)
 942     if (runloader->Stack())
 943       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
 944                                     mech, ntr, weight, is);
 945 }
 946
 947 //_______________________________________________________________________
 948 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
 949                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
 950                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
 951                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
 952                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 953 {
 954   // Delegate to stack
 955   //
 956   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 957   if (runloader)
 958     if (runloader->Stack())
 959       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
 960                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
 961 }
 962
 963 //_______________________________________________________________________
 964 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
 965 {
 966     //
 967     // Set high water mark for last track in event
 968   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 969   if (runloader)
 970     if (runloader->Stack())
 971       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
 972 }
 973
 974 //_______________________________________________________________________
 975 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
 976 {
 977   //
 978   // Delegate to stack
 979   //
 980   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 981   if (runloader)
 982     if (runloader->Stack())
 983       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
 984 }
 985
 986 //_______________________________________________________________________
 987 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
 988 {
 989   // Delegate to stack
 990   //
 991   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 992   if (runloader)
 993     if (runloader->Stack())
 994       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
 995 }
 996
 997 //_______________________________________________________________________
 998 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
 999 {
1000   //
1001   // Set current track number
1002   //
1003   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1004   if (runloader)
1005     if (runloader->Stack())
1006       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
1007 }
1008
1009 //_______________________________________________________________________
1010 void  AliMC::AddTrackReference(Int_t label){
1011   //
1012   // add a trackrefernce to the list
1013   if (!fTrackReferences) {
1014     AliError("Container trackrefernce not active");
1015     return;
1016   }
1017   Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
1018   TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1019   new(lref[nref]) AliTrackReference(label);
1020 }
1021
1022
1023
1024 //_______________________________________________________________________
1025 void AliMC::ResetTrackReferences()
1026 {
1027   //
1028   //  Reset all  references
1029   //
1030   if (fTrackReferences)   fTrackReferences->Clear();
1031
1032   TIter next(gAlice->Modules());
1033   AliModule *detector;
1034   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1035      detector->ResetTrackReferences();
1036   }
1037 }
1038
1039 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(Int_t *map)
1040 {
1041   //
1042   // Remapping track reference
1043   // Called at finish primary
1044   //
1045   if (!fTrackReferences) return;
1046   for (Int_t i=0;i<fTrackReferences->GetEntries();i++){
1047     AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTrackReferences->UncheckedAt(i));
1048     if (ref) {
1049       Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1050       if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1051       else {
1052         //ref->SetTrack(-1);
1053         ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1054         fTrackReferences->RemoveAt(i);
1055       }
1056     }
1057   }
1058   fTrackReferences->Compress();
1059 }
1060
1061 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1062 {
1063     //
1064     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1065     //
1066
1067     TLorentzVector p;
1068     gMC->TrackMomentum(p);
1069     Double_t tmin, tmax;
1070     Double_t b;
1071
1072     // Transverse velocity
1073     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1074
1075     if ((b = gAlice->Field()->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1076
1077         // Radius of helix
1078
1079         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1080
1081         // Revolution frequency
1082
1083         Double_t omega = vt / rho;
1084
1085         // Maximum and minimum decay time
1086         //
1087         // Check for curlers first
1088         if (fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2. > 1.) return;
1089
1090         //
1091
1092         tmax  = TMath::ACos(1. - fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1093         tmin  = TMath::ACos(1. - fRDecayMin * fRDecayMin / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1094     } else {
1095         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct]
1096         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1097     }
1098
1099     //
1100     // Dial t using the two limits
1101     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1102     //
1103     //
1104     // Force decay time in transport code
1105     //
1106     gMC->ForceDecayTime(t);
1107 }