STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <RVersion.h>
  25 #include <TBrowser.h>
  26 #include <TStopwatch.h>
  27 #include <TSystem.h>
  28 #include <TVirtualMC.h>
  29 #include <TGeoManager.h>
  30
  31
  32 #include "AliLog.h"
  33 #include "AliDetector.h"
  34 #include "AliGenerator.h"
  35 #include "AliHeader.h"
  36 #include "AliLego.h"
  37 #include "AliMC.h"
  38 #include "AliMCQA.h"
  39 #include "AliRun.h"
  40 #include "AliStack.h"
  41 #include "AliMagF.h"
  42 #include "AliTrackReference.h"
  43
  44
  45 ClassImp(AliMC)
  46
  47 //_______________________________________________________________________
  48 AliMC::AliMC() :
  49   fGenerator(0),
  50   fEventEnergy(0),
  51   fSummEnergy(0),
  52   fSum2Energy(0),
  53   fTrRmax(1.e10),
  54   fTrZmax(1.e10),
  55   fRDecayMax(1.e10),
  56   fRDecayMin(-1.),
  57   fDecayPdg(0),
  58   fImedia(0),
  59   fTransParName("\0"),
  60   fMCQA(0),
  61   fHitLists(0),
  62   fTrackReferences(0)
  63
  64 {
  65   //default constructor
  66   DecayLimits();
  67 }
  68
  69 //_______________________________________________________________________
  70 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  71   TVirtualMCApplication(name, title),
  72   fGenerator(0),
  73   fEventEnergy(0),
  74   fSummEnergy(0),
  75   fSum2Energy(0),
  76   fTrRmax(1.e10),
  77   fTrZmax(1.e10),
  78   fRDecayMax(1.e10),
  79   fRDecayMin(-1.),
  80   fDecayPdg(0),
  81   fImedia(new TArrayI(1000)),
  82   fTransParName("\0"),
  83   fMCQA(0),
  84   fHitLists(new TList()),
  85   fTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100))
  86 {
  87   //constructor
  88   // Set transport parameters
  89   SetTransPar();
  90   DecayLimits();
  91   // Prepare the tracking medium lists
  92   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
  93 }
  94
  95 //_______________________________________________________________________
  96 AliMC::AliMC(const AliMC &mc) :
  97   TVirtualMCApplication(mc),
  98   fGenerator(0),
  99   fEventEnergy(0),
 100   fSummEnergy(0),
 101   fSum2Energy(0),
 102   fTrRmax(1.e10),
 103   fTrZmax(1.e10),
 104   fRDecayMax(1.e10),
 105   fRDecayMin(-1.),
 106   fDecayPdg(0),
 107   fImedia(0),
 108   fTransParName("\0"),
 109   fMCQA(0),
 110   fHitLists(0),
 111   fTrackReferences(0)
 112 {
 113   //
 114   // Copy constructor for AliMC
 115   //
 116   mc.Copy(*this);
 117 }
 118
 119 //_______________________________________________________________________
 120 AliMC::~AliMC()
 121 {
 122   //destructor
 123   delete fGenerator;
 124   delete fImedia;
 125   delete fMCQA;
 126   delete fHitLists;
 127   // Delete track references
 128   if (fTrackReferences) {
 129     fTrackReferences->Delete();
 130     delete fTrackReferences;
 131     fTrackReferences     = 0;
 132   }
 133
 134 }
 135
 136 //_______________________________________________________________________
 137 void AliMC::Copy(TObject &) const
 138 {
 139   //dummy Copy function
 140   AliFatal("Not implemented!");
 141 }
 142
 143 //_______________________________________________________________________
 144 void  AliMC::ConstructGeometry()
 145 {
 146   //
 147   // Either load geometry from file or create it through usual
 148   // loop on detectors. In the first case the method
 149   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
 150   // at InitGeometry().
 151   //
 152
 153   if(gAlice->IsRootGeometry()){
 154     // Load geometry
 155     const char *geomfilename = gAlice->GetGeometryFileName();
 156     if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
 157       AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s\n\n",geomfilename));
 158       TGeoManager::Import(geomfilename);
 159     }else{
 160       AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
 161       return;
 162     }
 163   }else{
 164     // Create modules, materials, geometry
 165     TStopwatch stw;
 166     TIter next(gAlice->Modules());
 167     AliModule *detector;
 168     AliDebug(1, "Geometry creation:");
 169     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 170       stw.Start();
 171       // Initialise detector materials and geometry
 172       detector->CreateMaterials();
 173       detector->CreateGeometry();
 174       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 175                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 176     }
 177   }
 178
 179 }
 180
 181 //_______________________________________________________________________
 182 void  AliMC::InitGeometry()
 183 {
 184   //
 185   // Initialize detectors and display geometry
 186   //
 187
 188   AliInfo("Initialisation:");
 189   TStopwatch stw;
 190   TIter next(gAlice->Modules());
 191   AliModule *detector;
 192   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 193     stw.Start();
 194     // Initialise detector and display geometry
 195     if(gAlice->IsRootGeometry()) detector->CreateMaterials();
 196     detector->Init();
 197     detector->BuildGeometry();
 198     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 199                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 200   }
 201 }
 202
 203 //_______________________________________________________________________
 204 void  AliMC::SetAllAlignableVolumes()
 205 {
 206   //
 207   // Add alignable volumes (TGeoPNEntries) looping on all
 208   // active modules
 209   //
 210
 211   AliInfo(Form("Setting entries for all alignable volumes of active detectors"));
 212   AliModule *detector;
 213   TIter next(gAlice->Modules());
 214   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 215     detector->AddAlignableVolumes();
 216   }
 217 }
 218
 219 //_______________________________________________________________________
 220 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 221 {
 222   //
 223   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 224   //
 225
 226   Generator()->Generate();
 227 }
 228
 229 //_______________________________________________________________________
 230 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 231 {
 232   //
 233   // Load the event generator
 234   //
 235   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 236 }
 237
 238 //_______________________________________________________________________
 239 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 240 {
 241   //
 242   // Load the event generator
 243   //
 244   if(fGenerator)
 245     if(generator)
 246       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
 247                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()))
 248     else
 249       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
 250                       fGenerator->GetName()));
 251   fGenerator = generator;
 252 }
 253
 254 //_______________________________________________________________________
 255 void AliMC::FinishRun()
 256 {
 257   // Clean generator information
 258   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
 259   fGenerator->FinishRun();
 260
 261   //Output energy summary tables
 262   AliDebug(1, "EnergySummary()");
 263   ToAliDebug(1, EnergySummary());
 264 }
 265
 266 //_______________________________________________________________________
 267 void AliMC::BeginPrimary()
 268 {
 269   //
 270   // Called  at the beginning of each primary track
 271   //
 272
 273   // Reset Hits info
 274   ResetHits();
 275   ResetTrackReferences();
 276
 277 }
 278
 279 //_______________________________________________________________________
 280 void AliMC::PreTrack()
 281 {
 282   // Actions before the track's transport
 283      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 284      AliModule *module;
 285
 286      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 287        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 288          module->PreTrack();
 289
 290      fMCQA->PreTrack();
 291 }
 292
 293 //_______________________________________________________________________
 294 void AliMC::Stepping()
 295 {
 296   //
 297   // Called at every step during transport
 298   //
 299
 300   Int_t id = DetFromMate(gMC->CurrentMedium());
 301   if (id < 0) return;
 302
 303
 304   if ( gMC->IsNewTrack()            &&
 305        gMC->TrackTime() == 0.       &&
 306        fRDecayMin >= 0.             &&
 307        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
 308        gMC->TrackPid() == fDecayPdg )
 309   {
 310       FixParticleDecaytime();
 311   }
 312
 313
 314
 315   //
 316   // --- If lego option, do it and leave
 317   if (gAlice->Lego())
 318     gAlice->Lego()->StepManager();
 319   else {
 320     Int_t copy;
 321     //Update energy deposition tables
 322     AddEnergyDeposit(gMC->CurrentVolID(copy),gMC->Edep());
 323     //
 324     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 325     if (gMC->IsTrackDisappeared()) {
 326         if (gMC->Etot()>0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber());
 327     }
 328
 329     //Call the appropriate stepping routine;
 330     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 331     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 332       if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) fMCQA->StepManager(id);
 333       det->StepManager();
 334     }
 335   }
 336 }
 337
 338 //_______________________________________________________________________
 339 void AliMC::EnergySummary()
 340 {
 341   //
 342   // Print summary of deposited energy
 343   //
 344
 345   Int_t ndep=0;
 346   Float_t edtot=0;
 347   Float_t ed, ed2;
 348   Int_t kn, i, left, j, id;
 349   const Float_t kzero=0;
 350   Int_t ievent=gAlice->GetRunLoader()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 351   //
 352   // Energy loss information
 353   if(ievent) {
 354     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 355     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 356       ed=fSummEnergy[kn];
 357       if(ed>0) {
 358         fEventEnergy[ndep]=kn;
 359         if(ievent>1) {
 360           ed=ed/ievent;
 361           ed2=fSum2Energy[kn];
 362           ed2=ed2/ievent;
 363           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 364         } else
 365           ed2=99;
 366         fSummEnergy[ndep]=ed;
 367         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 368         edtot+=ed;
 369         ndep++;
 370       }
 371     }
 372     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 373       left=ndep-kn*3;
 374       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 375         j=kn*3+i;
 376         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 377         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 378       }
 379       printf("\n");
 380     }
 381     //
 382     // Relative energy loss in different detectors
 383     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 384     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 385     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 386       left=ndep-kn*5;
 387       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 388         j=kn*5+i;
 389         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 390         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 391       }
 392       printf("\n");
 393     }
 394     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 395     printf("\n");
 396   }
 397   //
 398   // Reset the TArray's
 399   //  fEventEnergy.Set(0);
 400   //  fSummEnergy.Set(0);
 401   //  fSum2Energy.Set(0);
 402 }
 403
 404 //_____________________________________________________________________________
 405 void AliMC::BeginEvent()
 406 {
 407   //
 408   // Clean-up previous event
 409   // Energy scores
 410   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 411   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 412   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 413   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
 414   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 415   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 416   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 417
 418     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 419
 420   /*******************************/
 421   /*   Clean after eventual      */
 422   /*   previous event            */
 423   /*******************************/
 424
 425
 426   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 427   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 428   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 429   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
 430
 431   fEventEnergy.Reset();
 432     // Clean detector information
 433
 434   if (runloader->Stack())
 435     runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 436   else
 437     runloader->MakeStack();//or make a new one
 438
 439   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 440    {
 441      AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
 442      runloader->MakeTree("K");
 443    }
 444
 445   AliDebug(1, "gMC->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 446   gMC->SetStack(gAlice->GetRunLoader()->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 447                                      //because we don't have guarantee that
 448                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 449                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 450   //
 451   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 452   //
 453
 454   runloader->GetHeader()->Reset(gAlice->GetRunNumber(),gAlice->GetEvNumber(),
 455     gAlice->GetEventNrInRun());
 456 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 457
 458   if(gAlice->Lego())
 459    {
 460     gAlice->Lego()->BeginEvent();
 461     return;
 462    }
 463
 464
 465   AliDebug(1, "ResetHits()");
 466   ResetHits();
 467
 468   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
 469   runloader->MakeTree("H");
 470
 471   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
 472   runloader->MakeTrackRefsContainer();//for insurance
 473
 474
 475   //create new branches and SetAdresses
 476   TIter next(gAlice->Modules());
 477   AliModule *detector;
 478   while((detector = (AliModule*)next()))
 479    {
 480     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
 481     detector->MakeBranch("H");
 482     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranchTR()",detector->GetName()));
 483     detector->MakeBranchTR();
 484     AliDebug(2, Form("%s->SetTreeAddress()",detector->GetName()));
 485     detector->SetTreeAddress();
 486    }
 487   // make branch for AliRun track References
 488   TTree * treeTR = runloader->TreeTR();
 489   if (treeTR){
 490     // make branch for central track references
 491     if (!fTrackReferences) fTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference",0);
 492     TBranch *branch;
 493     branch = treeTR->Branch("AliRun",&fTrackReferences);
 494     branch->SetAddress(&fTrackReferences);
 495   }
 496   //
 497 }
 498
 499 //_______________________________________________________________________
 500 void AliMC::ResetHits()
 501 {
 502   //
 503   //  Reset all Detectors hits
 504   //
 505   TIter next(gAlice->Modules());
 506   AliModule *detector;
 507   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 508      detector->ResetHits();
 509   }
 510 }
 511
 512 //_______________________________________________________________________
 513 void AliMC::PostTrack()
 514 {
 515   // Posts tracks for each module
 516   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 517   AliModule *module;
 518
 519   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 520     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 521       module->PostTrack();
 522 }
 523
 524 //_______________________________________________________________________
 525 void AliMC::FinishPrimary()
 526 {
 527   //
 528   // Called  at the end of each primary track
 529   //
 530   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 531   //  static Int_t count=0;
 532   //  const Int_t times=10;
 533   // This primary is finished, purify stack
 534 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
 535   if (!(gMC->SecondariesAreOrdered()))
 536        runloader->Stack()->ReorderKine();
 537 #endif
 538   runloader->Stack()->PurifyKine();
 539
 540   TIter next(gAlice->Modules());
 541   AliModule *detector;
 542   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 543     detector->FinishPrimary();
 544     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
 545     if(loader)
 546      {
 547        TTree* treeH = loader->TreeH();
 548        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
 549      }
 550   }
 551
 552   // Write out track references if any
 553   if (runloader->TreeTR()) runloader->TreeTR()->Fill();
 554 }
 555
 556 //_______________________________________________________________________
 557 void AliMC::FinishEvent()
 558 {
 559   //
 560   // Called at the end of the event.
 561   //
 562
 563   //
 564
 565   if(gAlice->Lego()) gAlice->Lego()->FinishEvent();
 566
 567   TIter next(gAlice->Modules());
 568   AliModule *detector;
 569   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 570     detector->FinishEvent();
 571   }
 572
 573   //Update the energy deposit tables
 574   Int_t i;
 575   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
 576    {
 577     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
 578     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
 579    }
 580
 581   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 582
 583   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
 584   AliStack* stack = runloader->Stack();
 585   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
 586    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
 587     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
 588     return;//never reached
 589    }
 590   // Update Header information
 591   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
 592   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
 593
 594
 595   // Write out the kinematics
 596   if (!gAlice->Lego()) stack->FinishEvent();
 597
 598   // Write out the event Header information
 599   TTree* treeE = runloader->TreeE();
 600   if (treeE)
 601    {
 602       header->SetStack(stack);
 603       treeE->Fill();
 604    }
 605   else
 606    {
 607     AliError("Can not get TreeE from RL");
 608    }
 609
 610   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 611    {
 612      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
 613      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
 614      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
 615    }
 616
 617   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 618   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 619   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 620   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
 621   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 622   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 623   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 624 }
 625
 626 //_______________________________________________________________________
 627 void AliMC::Field(const Double_t* x, Double_t* b) const
 628 {
 629   // Calculates field "b" at point "x"
 630     gAlice->Field(x,b);
 631 }
 632
 633 //_______________________________________________________________________
 634 void AliMC::Init()
 635 {
 636   // MC initialization
 637
 638    //=================Create Materials and geometry
 639    gMC->Init();
 640    //Set alignable volumes for the whole geometry
 641    SetAllAlignableVolumes();
 642    //Read the cuts for all materials
 643    ReadTransPar();
 644    //Build the special IMEDIA table
 645    MediaTable();
 646
 647    //Compute cross-sections
 648    gMC->BuildPhysics();
 649
 650    //Write Geometry object to current file.
 651    gAlice->GetRunLoader()->WriteGeometry();
 652
 653    //Initialise geometry deposition table
 654    fEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 655    fSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 656    fSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 657
 658    //
 659    fMCQA = new AliMCQA(gAlice->GetNdets());
 660
 661    // Register MC in configuration
 662    AliConfig::Instance()->Add(gMC);
 663
 664 }
 665
 666 //_______________________________________________________________________
 667 void AliMC::MediaTable()
 668 {
 669   //
 670   // Built media table to get from the media number to
 671   // the detector id
 672   //
 673
 674   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 675   //  Int_t ibeg;
 676   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 677   AliModule *det;
 678   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
 679   //
 680   // For all detectors
 681   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
 682     // If detector is defined
 683     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
 684         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 685         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 686
 687         // Find max and min material number
 688         if((idt=idtmed[nz])) {
 689           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 690           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 691         }
 692       }
 693       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 694         det->LoMedium() = 0;
 695         det->HiMedium() = 0;
 696       } else {
 697         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 698           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
 699                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
 700           return;
 701         }
 702         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 703         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 704           (*fImedia)[lz]=kz;
 705         }
 706       }
 707     }
 708   }
 709   //
 710   // Print summary table
 711   AliInfo("Tracking media ranges:");
 712   ToAliInfo(
 713   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
 714     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
 715       ind=i*6+k;
 716       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
 717       if(det)
 718         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 719                det->HiMedium());
 720       else
 721         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 722     }
 723     printf("\n");
 724   }
 725   )
 726 }
 727
 728 //_______________________________________________________________________
 729 void AliMC::ReadTransPar()
 730 {
 731   //
 732   // Read filename to set the transport parameters
 733   //
 734
 735
 736   const Int_t kncuts=10;
 737   const Int_t knflags=11;
 738   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
 739   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 740                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 741                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 742                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 743   char line[256];
 744   char detName[7];
 745   char* filtmp;
 746   Float_t cut[kncuts];
 747   Int_t flag[knflags];
 748   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 749   FILE *lun;
 750   //
 751   // See whether the file is there
 752   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
 753   lun=fopen(filtmp,"r");
 754   delete [] filtmp;
 755   if(!lun) {
 756     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
 757     return;
 758   }
 759   //
 760   while(1) {
 761     // Initialise cuts and flags
 762     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
 763     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
 764     itmed=0;
 765     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 766     // Read up to the end of line excluded
 767     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 768     if(iret<0) {
 769       //End of file
 770       fclose(lun);
 771       return;
 772     }
 773     // Read the end of line
 774     fscanf(lun,"%*c");
 775     if(!iret) continue;
 776     if(line[0]=='*') continue;
 777     // Read the numbers
 778     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 779                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 780                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 781                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 782     if(!iret) continue;
 783     if(iret<0) {
 784       //reading error
 785       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
 786       continue;
 787     }
 788     // Check that the module exist
 789     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
 790     if(mod) {
 791       // Get the array of media numbers
 792       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 793       // Check that the tracking medium code is valid
 794       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 795         ktmed=idtmed[itmed];
 796         if(!ktmed) {
 797           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
 798           continue;
 799         }
 800         // Set energy thresholds
 801         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
 802           if(cut[kz]>=0) {
 803             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
 804                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
 805             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
 806           }
 807         }
 808         // Set transport mechanisms
 809         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
 810           if(flag[kz]>=0) {
 811             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
 812                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
 813             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 814           }
 815         }
 816       } else {
 817         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
 818         continue;
 819       }
 820     } else {
 821       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
 822       continue;
 823     }
 824   }
 825 }
 826
 827 //_______________________________________________________________________
 828 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
 829 {
 830   //
 831   // Sets the file name for transport parameters
 832   //
 833   fTransParName = filename;
 834 }
 835
 836 //_______________________________________________________________________
 837 void AliMC::Browse(TBrowser *b)
 838 {
 839   //
 840   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 841   // of the Root browser.
 842   // It displays the Root Trees and all detectors.
 843   //
 844   //detectors are in folders anyway
 845   b->Add(fMCQA,"AliMCQA");
 846 }
 847
 848 //PH
 849 //_______________________________________________________________________
 850 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 851 {
 852   //
 853   //  Add a hit to detector id
 854   //
 855   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 856   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 857 }
 858
 859 //_______________________________________________________________________
 860 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 861 {
 862   //
 863   // Add digit to detector id
 864   //
 865   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 866   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 867 }
 868
 869 //_______________________________________________________________________
 870 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
 871   //
 872   // Returns current track
 873   //
 874   return gAlice->GetRunLoader()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
 875 }
 876
 877 //_______________________________________________________________________
 878 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
 879 {
 880   //
 881   // Dumps particle i in the stack
 882   //
 883   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 884    if (runloader->Stack())
 885     runloader->Stack()->DumpPart(i);
 886 }
 887
 888 //_______________________________________________________________________
 889 void AliMC::DumpPStack () const
 890 {
 891   //
 892   // Dumps the particle stack
 893   //
 894   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 895    if (runloader->Stack())
 896     runloader->Stack()->DumpPStack();
 897 }
 898
 899 //_______________________________________________________________________
 900 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
 901   //
 902   // Returns number of tracks in stack
 903   //
 904   Int_t ntracks = -1;
 905   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 906    if (runloader->Stack())
 907      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
 908    return ntracks;
 909 }
 910
 911 //_______________________________________________________________________
 912 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
 913 {
 914   //
 915   // return number of primary that has generated track
 916   //
 917   Int_t nprimary = -999;
 918   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 919   if (runloader->Stack())
 920     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
 921   return nprimary;
 922 }
 923
 924 //_______________________________________________________________________
 925 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
 926 {
 927   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
 928   // the remaping done by PurifyKine
 929   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 930   if (runloader)
 931    if (runloader->Stack())
 932     return runloader->Stack()->Particle(i);
 933   return 0x0;
 934 }
 935
 936 //_______________________________________________________________________
 937 TObjArray* AliMC::Particles() const {
 938   //
 939   // Returns pointer to Particles array
 940   //
 941   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 942   if (runloader)
 943    if (runloader->Stack())
 944     return runloader->Stack()->Particles();
 945   return 0x0;
 946 }
 947
 948 //_______________________________________________________________________
 949 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
 950                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
 951                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 952 {
 953 // Delegate to stack
 954 //
 955   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 956   if (runloader)
 957     if (runloader->Stack())
 958       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
 959                                     mech, ntr, weight, is);
 960 }
 961
 962 //_______________________________________________________________________
 963 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
 964                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
 965                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
 966                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
 967                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 968 {
 969   // Delegate to stack
 970   //
 971   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 972   if (runloader)
 973     if (runloader->Stack())
 974       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
 975                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
 976 }
 977
 978 //_______________________________________________________________________
 979 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
 980 {
 981     //
 982     // Set high water mark for last track in event
 983   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 984   if (runloader)
 985     if (runloader->Stack())
 986       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
 987 }
 988
 989 //_______________________________________________________________________
 990 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
 991 {
 992   //
 993   // Delegate to stack
 994   //
 995   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 996   if (runloader)
 997     if (runloader->Stack())
 998       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
 999 }
1000
1001 //_______________________________________________________________________
1002 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
1003 {
1004   // Delegate to stack
1005   //
1006   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1007   if (runloader)
1008     if (runloader->Stack())
1009       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
1010 }
1011
1012 //_______________________________________________________________________
1013 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
1014 {
1015   //
1016   // Set current track number
1017   //
1018   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1019   if (runloader)
1020     if (runloader->Stack())
1021       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
1022 }
1023
1024 //_______________________________________________________________________
1025 void  AliMC::AddTrackReference(Int_t label){
1026   //
1027   // add a trackrefernce to the list
1028   if (!fTrackReferences) {
1029     AliError("Container trackrefernce not active");
1030     return;
1031   }
1032   Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
1033   TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1034   new(lref[nref]) AliTrackReference(label);
1035 }
1036
1037
1038
1039 //_______________________________________________________________________
1040 void AliMC::ResetTrackReferences()
1041 {
1042   //
1043   //  Reset all  references
1044   //
1045   if (fTrackReferences)   fTrackReferences->Clear();
1046
1047   TIter next(gAlice->Modules());
1048   AliModule *detector;
1049   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1050      detector->ResetTrackReferences();
1051   }
1052 }
1053
1054 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(Int_t *map)
1055 {
1056   //
1057   // Remapping track reference
1058   // Called at finish primary
1059   //
1060   if (!fTrackReferences) return;
1061   Int_t nEntries = fTrackReferences->GetEntries();
1062   for (Int_t i=0; i < nEntries; i++){
1063       AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTrackReferences->UncheckedAt(i));
1064       if (ref) {
1065           Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1066           if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1067           else {
1068               ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1069               fTrackReferences->RemoveAt(i);
1070           }
1071       } // if ref
1072   }
1073   fTrackReferences->Compress();
1074 }
1075
1076 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1077 {
1078     //
1079     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1080     //
1081
1082     TLorentzVector p;
1083     gMC->TrackMomentum(p);
1084     Double_t tmin, tmax;
1085     Double_t b;
1086
1087     // Transverse velocity
1088     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1089
1090     if ((b = gAlice->Field()->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1091
1092         // Radius of helix
1093
1094         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1095
1096         // Revolution frequency
1097
1098         Double_t omega = vt / rho;
1099
1100         // Maximum and minimum decay time
1101         //
1102         // Check for curlers first
1103         if (fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2. > 1.) return;
1104
1105         //
1106
1107         tmax  = TMath::ACos(1. - fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1108         tmin  = TMath::ACos(1. - fRDecayMin * fRDecayMin / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1109     } else {
1110         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct]
1111         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1112     }
1113
1114     //
1115     // Dial t using the two limits
1116     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1117     //
1118     //
1119     // Force decay time in transport code
1120     //
1121     gMC->ForceDecayTime(t / 2.99792458e10);
1122 }