STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <RVersion.h>
  25 #include <TBrowser.h>
  26 #include <TClonesArray.h>
  27 #include <TGeoManager.h>
  28 #include <TStopwatch.h>
  29 #include <TSystem.h>
  30 #include <TVirtualMC.h>
  31 #include <TParticle.h>
  32 #include <TROOT.h>
  33 #include <TFile.h>
  34
  35 #include "AliLog.h"
  36 #include "AliDetector.h"
  37 #include "AliGenerator.h"
  38 #include "AliHeader.h"
  39 #include "AliLego.h"
  40 #include "AliMC.h"
  41 #include "AliMCQA.h"
  42 #include "AliRun.h"
  43 #include "AliHit.h"
  44 #include "AliStack.h"
  45 #include "AliMagF.h"
  46 #include "AliTrackReference.h"
  47 #include "AliSimulation.h"
  48 #include "AliGeomManager.h"
  49 #include "AliCDBManager.h"
  50 #include "AliCDBStorage.h"
  51 #include "AliCDBEntry.h"
  52
  53
  54 ClassImp(AliMC)
  55
  56 //_______________________________________________________________________
  57 AliMC::AliMC() :
  58   fGenerator(0),
  59   fEventEnergy(0),
  60   fSummEnergy(0),
  61   fSum2Energy(0),
  62   fTrRmax(1.e10),
  63   fTrZmax(1.e10),
  64   fRDecayMax(1.e10),
  65   fRDecayMin(-1.),
  66   fDecayPdg(0),
  67   fImedia(0),
  68   fTransParName("\0"),
  69   fMCQA(0),
  70   fHitLists(0),
  71   fTmpTreeTR(0),
  72   fTmpFileTR(0),
  73   fTrackReferences(0),
  74   fTmpTrackReferences(0)
  75
  76 {
  77   //default constructor
  78   DecayLimits();
  79 }
  80
  81 //_______________________________________________________________________
  82 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  83   TVirtualMCApplication(name, title),
  84   fGenerator(0),
  85   fEventEnergy(0),
  86   fSummEnergy(0),
  87   fSum2Energy(0),
  88   fTrRmax(1.e10),
  89   fTrZmax(1.e10),
  90   fRDecayMax(1.e10),
  91   fRDecayMin(-1.),
  92   fDecayPdg(0),
  93   fImedia(new TArrayI(1000)),
  94   fTransParName("\0"),
  95   fMCQA(0),
  96   fHitLists(new TList()),
  97   fTmpTreeTR(0),
  98   fTmpFileTR(0),
  99   fTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100)),
 100   fTmpTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100))
 101 {
 102   //constructor
 103   // Set transport parameters
 104   SetTransPar();
 105   DecayLimits();
 106   // Prepare the tracking medium lists
 107   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
 108 }
 109
 110 //_______________________________________________________________________
 111 AliMC::AliMC(const AliMC &mc) :
 112   TVirtualMCApplication(mc),
 113   fGenerator(0),
 114   fEventEnergy(0),
 115   fSummEnergy(0),
 116   fSum2Energy(0),
 117   fTrRmax(1.e10),
 118   fTrZmax(1.e10),
 119   fRDecayMax(1.e10),
 120   fRDecayMin(-1.),
 121   fDecayPdg(0),
 122   fImedia(0),
 123   fTransParName("\0"),
 124   fMCQA(0),
 125   fHitLists(0),
 126   fTmpTreeTR(0),
 127   fTmpFileTR(0),
 128   fTrackReferences(0),
 129   fTmpTrackReferences(0)
 130 {
 131   //
 132   // Copy constructor for AliMC
 133   //
 134   mc.Copy(*this);
 135 }
 136
 137 //_______________________________________________________________________
 138 AliMC::~AliMC()
 139 {
 140   //destructor
 141   delete fGenerator;
 142   delete fImedia;
 143   delete fMCQA;
 144   delete fHitLists;
 145   // Delete track references
 146   if (fTrackReferences) {
 147     fTrackReferences->Delete();
 148     delete fTrackReferences;
 149     fTrackReferences     = 0;
 150   }
 151
 152 if (fTmpTrackReferences) {
 153     fTmpTrackReferences->Delete();
 154     delete fTmpTrackReferences;
 155     fTmpTrackReferences     = 0;
 156   }
 157
 158 }
 159
 160 //_______________________________________________________________________
 161 void AliMC::Copy(TObject &) const
 162 {
 163   //dummy Copy function
 164   AliFatal("Not implemented!");
 165 }
 166
 167 //_______________________________________________________________________
 168 void  AliMC::ConstructGeometry()
 169 {
 170   //
 171   // Either load geometry from file or create it through usual
 172   // loop on detectors. In the first case the method
 173   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
 174   // at InitGeometry().
 175   //
 176
 177   if(gAlice->IsRootGeometry()){ //load geometry either from CDB or from file
 178     if(gAlice->IsGeomFromCDB()){
 179       AliInfo("Loading geometry from CDB default storage");
 180       AliCDBPath path("GRP","Geometry","Data");
 181       AliCDBEntry *entry=AliCDBManager::Instance()->Get(path.GetPath());
 182       if(!entry) AliFatal("Unable to load geometry from CDB!");
 183       entry->SetOwner(0);
 184       gGeoManager = (TGeoManager*) entry->GetObject();
 185       if (!gGeoManager) AliFatal("TGeoManager object not found in the specified CDB entry!");
 186     }else{
 187       // Load geometry
 188       const char *geomfilename = gAlice->GetGeometryFileName();
 189       if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
 190         AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s",geomfilename));
 191         TGeoManager::Import(geomfilename);
 192       }else{
 193         AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
 194         return;
 195       }
 196     }
 197   }else{
 198     // Create modules, materials, geometry
 199     TStopwatch stw;
 200     TIter next(gAlice->Modules());
 201     AliModule *detector;
 202     AliDebug(1, "Geometry creation:");
 203     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 204       stw.Start();
 205       // Initialise detector materials and geometry
 206       detector->CreateMaterials();
 207       detector->CreateGeometry();
 208       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 209                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 210     }
 211   }
 212
 213 }
 214
 215 //_______________________________________________________________________
 216 Bool_t  AliMC::MisalignGeometry()
 217 {
 218 // Call misalignment code if AliSimulation object was defined.
 219
 220    if(!gAlice->IsRootGeometry()){
 221      //Set alignable volumes for the whole geometry
 222      SetAllAlignableVolumes();
 223    }
 224    // Misalign geometry via AliSimulation instance
 225    if (!AliSimulation::GetInstance()) return kFALSE;
 226    AliGeomManager::SetGeometry(gGeoManager);
 227    return AliSimulation::GetInstance()->MisalignGeometry(gAlice->GetRunLoader());
 228 }
 229
 230 //_______________________________________________________________________
 231 void  AliMC::ConstructOpGeometry()
 232 {
 233   //
 234   // Loop all detector modules and call DefineOpticalProperties() method
 235   //
 236
 237   TIter next(gAlice->Modules());
 238   AliModule *detector;
 239   AliInfo("Optical properties definition");
 240   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 241     // Initialise detector optical properties
 242     detector->DefineOpticalProperties();
 243   }
 244 }
 245
 246 //_______________________________________________________________________
 247 void  AliMC::InitGeometry()
 248 {
 249   //
 250   // Initialize detectors
 251   //
 252
 253   AliInfo("Initialisation:");
 254   TStopwatch stw;
 255   TIter next(gAlice->Modules());
 256   AliModule *detector;
 257   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 258     stw.Start();
 259     // Initialise detector geometry
 260     if(gAlice->IsRootGeometry()) detector->CreateMaterials();
 261     detector->Init();
 262     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 263                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 264   }
 265 }
 266
 267 //_______________________________________________________________________
 268 void  AliMC::SetAllAlignableVolumes()
 269 {
 270   //
 271   // Add alignable volumes (TGeoPNEntries) looping on all
 272   // active modules
 273   //
 274
 275   AliInfo(Form("Setting entries for all alignable volumes of active detectors"));
 276   AliModule *detector;
 277   TIter next(gAlice->Modules());
 278   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 279     detector->AddAlignableVolumes();
 280   }
 281 }
 282
 283 //_______________________________________________________________________
 284 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 285 {
 286   //
 287   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 288   //
 289
 290   Generator()->Generate();
 291 }
 292
 293 //_______________________________________________________________________
 294 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 295 {
 296   //
 297   // Load the event generator
 298   //
 299   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 300 }
 301
 302 //_______________________________________________________________________
 303 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 304 {
 305   //
 306   // Load the event generator
 307   //
 308   if(fGenerator) {
 309     if(generator) {
 310       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
 311                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()));
 312     }
 313     else {
 314       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
 315                       fGenerator->GetName()));
 316     }
 317   }
 318   fGenerator = generator;
 319 }
 320
 321 //_______________________________________________________________________
 322 void AliMC::FinishRun()
 323 {
 324   // Clean generator information
 325   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
 326   fGenerator->FinishRun();
 327
 328   //Output energy summary tables
 329   AliDebug(1, "EnergySummary()");
 330   ToAliDebug(1, EnergySummary());
 331 }
 332
 333 //_______________________________________________________________________
 334 void AliMC::BeginPrimary()
 335 {
 336   //
 337   // Called  at the beginning of each primary track
 338   //
 339
 340   // Reset Hits info
 341   ResetHits();
 342   ResetTrackReferences();
 343 }
 344
 345 //_______________________________________________________________________
 346 void AliMC::PreTrack()
 347 {
 348   // Actions before the track's transport
 349      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 350      AliModule *module;
 351
 352      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 353        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 354          module->PreTrack();
 355
 356      fMCQA->PreTrack();
 357 }
 358
 359 //_______________________________________________________________________
 360 void AliMC::Stepping()
 361 {
 362   //
 363   // Called at every step during transport
 364   //
 365
 366   Int_t id = DetFromMate(gMC->CurrentMedium());
 367   if (id < 0) return;
 368
 369
 370   if ( gMC->IsNewTrack()            &&
 371        gMC->TrackTime() == 0.       &&
 372        fRDecayMin >= 0.             &&
 373        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
 374        gMC->TrackPid() == fDecayPdg )
 375   {
 376       FixParticleDecaytime();
 377   }
 378
 379
 380
 381   //
 382   // --- If lego option, do it and leave
 383   if (gAlice->Lego())
 384     gAlice->Lego()->StepManager();
 385   else {
 386     Int_t copy;
 387     //Update energy deposition tables
 388     AddEnergyDeposit(gMC->CurrentVolID(copy),gMC->Edep());
 389     //
 390     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 391     if (gMC->IsTrackDisappeared()) {
 392         if (gMC->Etot()>0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber(),
 393                                                 AliTrackReference::kDisappeared);
 394     }
 395
 396     //Call the appropriate stepping routine;
 397     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 398     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 399       if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) fMCQA->StepManager(id);
 400       det->StepManager();
 401     }
 402   }
 403 }
 404
 405 //_______________________________________________________________________
 406 void AliMC::EnergySummary()
 407 {
 408   //e
 409   // Print summary of deposited energy
 410   //
 411
 412   Int_t ndep=0;
 413   Float_t edtot=0;
 414   Float_t ed, ed2;
 415   Int_t kn, i, left, j, id;
 416   const Float_t kzero=0;
 417   Int_t ievent=gAlice->GetRunLoader()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 418   //
 419   // Energy loss information
 420   if(ievent) {
 421     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 422     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 423       ed=fSummEnergy[kn];
 424       if(ed>0) {
 425         fEventEnergy[ndep]=kn;
 426         if(ievent>1) {
 427           ed=ed/ievent;
 428           ed2=fSum2Energy[kn];
 429           ed2=ed2/ievent;
 430           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 431         } else
 432           ed2=99;
 433         fSummEnergy[ndep]=ed;
 434         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 435         edtot+=ed;
 436         ndep++;
 437       }
 438     }
 439     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 440       left=ndep-kn*3;
 441       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 442         j=kn*3+i;
 443         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 444         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 445       }
 446       printf("\n");
 447     }
 448     //
 449     // Relative energy loss in different detectors
 450     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 451     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 452     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 453       left=ndep-kn*5;
 454       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 455         j=kn*5+i;
 456         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 457         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 458       }
 459       printf("\n");
 460     }
 461     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 462     printf("\n");
 463   }
 464   //
 465   // Reset the TArray's
 466   //  fEventEnergy.Set(0);
 467   //  fSummEnergy.Set(0);
 468   //  fSum2Energy.Set(0);
 469 }
 470
 471 //_____________________________________________________________________________
 472 void AliMC::BeginEvent()
 473 {
 474   //
 475   // Clean-up previous event
 476   // Energy scores
 477   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 478   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 479   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 480   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
 481   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 482   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 483   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 484
 485   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 486
 487   /*******************************/
 488   /*   Clean after eventual      */
 489   /*   previous event            */
 490   /*******************************/
 491
 492
 493   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 494   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 495   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 496   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
 497
 498   fEventEnergy.Reset();
 499     // Clean detector information
 500
 501   if (runloader->Stack())
 502       runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 503   else
 504       runloader->MakeStack();//or make a new one
 505
 506
 507   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 508   {
 509       AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
 510       runloader->MakeTree("K");
 511   }
 512
 513   AliDebug(1, "gMC->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 514   gMC->SetStack(gAlice->GetRunLoader()->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 515                                      //because we don't have guarantee that
 516                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 517                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 518   //
 519   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 520   //
 521
 522   runloader->GetHeader()->Reset(gAlice->GetRunNumber(),gAlice->GetEvNumber(),
 523                                 gAlice->GetEventNrInRun());
 524 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 525
 526   if(gAlice->Lego())
 527   {
 528       gAlice->Lego()->BeginEvent();
 529       return;
 530   }
 531
 532
 533   AliDebug(1, "ResetHits()");
 534   ResetHits();
 535
 536   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
 537   runloader->MakeTree("H");
 538
 539
 540
 541   MakeTmpTrackRefsTree();
 542   //create new branches and SetAdresses
 543   TIter next(gAlice->Modules());
 544   AliModule *detector;
 545   while((detector = (AliModule*)next()))
 546    {
 547        AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
 548        detector->MakeBranch("H");
 549    }
 550 }
 551
 552 //_______________________________________________________________________
 553 void AliMC::ResetHits()
 554 {
 555   //
 556   //  Reset all Detectors hits
 557   //
 558   TIter next(gAlice->Modules());
 559   AliModule *detector;
 560   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 561      detector->ResetHits();
 562   }
 563 }
 564
 565 //_______________________________________________________________________
 566 void AliMC::PostTrack()
 567 {
 568   // Posts tracks for each module
 569   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 570   AliModule *module;
 571
 572   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 573     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 574       module->PostTrack();
 575 }
 576
 577 //_______________________________________________________________________
 578 void AliMC::FinishPrimary()
 579 {
 580   //
 581   // Called  at the end of each primary track
 582   //
 583   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 584   //  static Int_t count=0;
 585   //  const Int_t times=10;
 586   // This primary is finished, purify stack
 587 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
 588   if (!(gMC->SecondariesAreOrdered())) {
 589       runloader->Stack()->ReorderKine();
 590       RemapHits();
 591   }
 592 #endif
 593   runloader->Stack()->PurifyKine();
 594   RemapHits();
 595
 596   TIter next(gAlice->Modules());
 597   AliModule *detector;
 598   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 599     detector->FinishPrimary();
 600     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
 601     if(loader)
 602      {
 603        TTree* treeH = loader->TreeH();
 604        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
 605      }
 606   }
 607
 608   // Write out track references if any
 609   if (fTmpTreeTR) fTmpTreeTR->Fill();
 610 }
 611
 612 void AliMC::RemapHits()
 613 {
 614 //
 615 // Remaps the track labels of the hits
 616     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 617     AliStack* stack = runloader->Stack();
 618     TList* hitLists = GetHitLists();
 619     TIter next(hitLists);
 620     TCollection *hitList;
 621
 622     while((hitList = dynamic_cast<TCollection*>(next()))) {
 623         TIter nexthit(hitList);
 624         AliHit *hit;
 625         while((hit = dynamic_cast<AliHit*>(nexthit()))) {
 626             hit->SetTrack(stack->TrackLabel(hit->GetTrack()));
 627         }
 628     }
 629
 630     //
 631     // This for detectors which have a special mapping mechanism
 632     // for hits, such as TPC and TRD
 633     //
 634
 635     TObjArray* modules = gAlice->Modules();
 636     TIter nextmod(modules);
 637     AliDetector *detector;
 638     while((detector = dynamic_cast<AliDetector*>(nextmod()))) {
 639         detector->RemapTrackHitIDs(stack->TrackLabelMap());
 640     }
 641     //
 642     RemapTrackReferencesIDs(stack->TrackLabelMap());
 643 }
 644
 645 //_______________________________________________________________________
 646 void AliMC::FinishEvent()
 647 {
 648   //
 649   // Called at the end of the event.
 650   //
 651
 652   //
 653
 654   if(gAlice->Lego()) gAlice->Lego()->FinishEvent();
 655
 656   TIter next(gAlice->Modules());
 657   AliModule *detector;
 658   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 659     detector->FinishEvent();
 660   }
 661
 662   //Update the energy deposit tables
 663   Int_t i;
 664   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
 665    {
 666     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
 667     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
 668    }
 669
 670   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 671
 672   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
 673   AliStack* stack = runloader->Stack();
 674   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
 675    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
 676     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
 677     return;//never reached
 678    }
 679   // Update Header information
 680   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
 681   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
 682
 683   // Write out the kinematics
 684   if (!gAlice->Lego()) stack->FinishEvent();
 685
 686   // Synchronize the TreeTR with TreeK
 687   ReorderAndExpandTreeTR();
 688
 689   // Write out the event Header information
 690   TTree* treeE = runloader->TreeE();
 691   if (treeE)
 692    {
 693       header->SetStack(stack);
 694       treeE->Fill();
 695    }
 696   else
 697    {
 698     AliError("Can not get TreeE from RL");
 699    }
 700
 701   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 702    {
 703      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
 704      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
 705      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
 706    }
 707
 708   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 709   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 710   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 711   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
 712   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 713   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 714   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 715 }
 716
 717 //_______________________________________________________________________
 718 void AliMC::Field(const Double_t* x, Double_t* b) const
 719 {
 720   // Calculates field "b" at point "x"
 721     gAlice->Field(x,b);
 722 }
 723
 724 //_______________________________________________________________________
 725 void AliMC::Init()
 726 {
 727   // MC initialization
 728
 729    //=================Create Materials and geometry
 730    gMC->Init();
 731   // Set alignable volumes for the whole geometry (with old root)
 732 #if ROOT_VERSION_CODE < 331527
 733   SetAllAlignableVolumes();
 734 #endif
 735    //Read the cuts for all materials
 736    ReadTransPar();
 737    //Build the special IMEDIA table
 738    MediaTable();
 739
 740    //Compute cross-sections
 741    gMC->BuildPhysics();
 742
 743    //Initialise geometry deposition table
 744    fEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 745    fSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 746    fSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 747
 748    //
 749    fMCQA = new AliMCQA(gAlice->GetNdets());
 750
 751    // Register MC in configuration
 752    AliConfig::Instance()->Add(gMC);
 753
 754 }
 755
 756 //_______________________________________________________________________
 757 void AliMC::MediaTable()
 758 {
 759   //
 760   // Built media table to get from the media number to
 761   // the detector id
 762   //
 763
 764   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 765   //  Int_t ibeg;
 766   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 767   AliModule *det;
 768   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
 769   //
 770   // For all detectors
 771   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
 772     // If detector is defined
 773     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
 774         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 775         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 776
 777         // Find max and min material number
 778         if((idt=idtmed[nz])) {
 779           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 780           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 781         }
 782       }
 783       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 784         det->LoMedium() = 0;
 785         det->HiMedium() = 0;
 786       } else {
 787         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 788           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
 789                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
 790           return;
 791         }
 792         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 793         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 794           (*fImedia)[lz]=kz;
 795         }
 796       }
 797     }
 798   }
 799   //
 800   // Print summary table
 801   AliInfo("Tracking media ranges:");
 802   ToAliInfo(
 803   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
 804     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
 805       ind=i*6+k;
 806       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
 807       if(det)
 808         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 809                det->HiMedium());
 810       else
 811         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 812     }
 813     printf("\n");
 814   }
 815   )
 816 }
 817
 818 //_______________________________________________________________________
 819 void AliMC::ReadTransPar()
 820 {
 821   //
 822   // Read filename to set the transport parameters
 823   //
 824
 825
 826   const Int_t kncuts=10;
 827   const Int_t knflags=11;
 828   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
 829   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 830                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 831                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 832                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 833   char line[256];
 834   char detName[7];
 835   char* filtmp;
 836   Float_t cut[kncuts];
 837   Int_t flag[knflags];
 838   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 839   FILE *lun;
 840   //
 841   // See whether the file is there
 842   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
 843   lun=fopen(filtmp,"r");
 844   delete [] filtmp;
 845   if(!lun) {
 846     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
 847     return;
 848   }
 849   //
 850   while(1) {
 851     // Initialise cuts and flags
 852     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
 853     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
 854     itmed=0;
 855     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 856     // Read up to the end of line excluded
 857     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 858     if(iret<0) {
 859       //End of file
 860       fclose(lun);
 861       return;
 862     }
 863     // Read the end of line
 864     fscanf(lun,"%*c");
 865     if(!iret) continue;
 866     if(line[0]=='*') continue;
 867     // Read the numbers
 868     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 869                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 870                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 871                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 872     if(!iret) continue;
 873     if(iret<0) {
 874       //reading error
 875       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
 876       continue;
 877     }
 878     // Check that the module exist
 879     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
 880     if(mod) {
 881       // Get the array of media numbers
 882       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 883       // Check that the tracking medium code is valid
 884       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 885         ktmed=idtmed[itmed];
 886         if(!ktmed) {
 887           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
 888           continue;
 889         }
 890         // Set energy thresholds
 891         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
 892           if(cut[kz]>=0) {
 893             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
 894                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
 895             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
 896           }
 897         }
 898         // Set transport mechanisms
 899         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
 900           if(flag[kz]>=0) {
 901             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
 902                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
 903             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 904           }
 905         }
 906       } else {
 907         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
 908         continue;
 909       }
 910     } else {
 911       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
 912       continue;
 913     }
 914   }
 915 }
 916
 917 //_______________________________________________________________________
 918 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
 919 {
 920   //
 921   // Sets the file name for transport parameters
 922   //
 923   fTransParName = filename;
 924 }
 925
 926 //_______________________________________________________________________
 927 void AliMC::Browse(TBrowser *b)
 928 {
 929   //
 930   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 931   // of the Root browser.
 932   // It displays the Root Trees and all detectors.
 933   //
 934   //detectors are in folders anyway
 935   b->Add(fMCQA,"AliMCQA");
 936 }
 937
 938 //_______________________________________________________________________
 939 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 940 {
 941   //
 942   //  Add a hit to detector id
 943   //
 944   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 945   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 946 }
 947
 948 //_______________________________________________________________________
 949 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 950 {
 951   //
 952   // Add digit to detector id
 953   //
 954   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 955   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 956 }
 957
 958 //_______________________________________________________________________
 959 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
 960   //
 961   // Returns current track
 962   //
 963   return gAlice->GetRunLoader()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
 964 }
 965
 966 //_______________________________________________________________________
 967 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
 968 {
 969   //
 970   // Dumps particle i in the stack
 971   //
 972   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 973    if (runloader->Stack())
 974     runloader->Stack()->DumpPart(i);
 975 }
 976
 977 //_______________________________________________________________________
 978 void AliMC::DumpPStack () const
 979 {
 980   //
 981   // Dumps the particle stack
 982   //
 983   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 984    if (runloader->Stack())
 985     runloader->Stack()->DumpPStack();
 986 }
 987
 988 //_______________________________________________________________________
 989 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
 990   //
 991   // Returns number of tracks in stack
 992   //
 993   Int_t ntracks = -1;
 994   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 995    if (runloader->Stack())
 996      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
 997    return ntracks;
 998 }
 999
1000 //_______________________________________________________________________
1001 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
1002 {
1003   //
1004   // return number of primary that has generated track
1005   //
1006   Int_t nprimary = -999;
1007   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1008   if (runloader->Stack())
1009     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
1010   return nprimary;
1011 }
1012
1013 //_______________________________________________________________________
1014 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
1015 {
1016   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
1017   // the remaping done by PurifyKine
1018   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1019   if (runloader)
1020    if (runloader->Stack())
1021     return runloader->Stack()->Particle(i);
1022   return 0x0;
1023 }
1024
1025 //_______________________________________________________________________
1026 TObjArray* AliMC::Particles() const {
1027   //
1028   // Returns pointer to Particles array
1029   //
1030   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1031   if (runloader)
1032    if (runloader->Stack())
1033     return runloader->Stack()->Particles();
1034   return 0x0;
1035 }
1036
1037 //_______________________________________________________________________
1038 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
1039                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
1040                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1041 {
1042 // Delegate to stack
1043 //
1044   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1045   if (runloader)
1046     if (runloader->Stack())
1047       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
1048                                     mech, ntr, weight, is);
1049 }
1050
1051 //_______________________________________________________________________
1052 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
1053                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
1054                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
1055                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
1056                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1057 {
1058   // Delegate to stack
1059   //
1060   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1061   if (runloader)
1062     if (runloader->Stack())
1063       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
1064                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
1065 }
1066
1067 //_______________________________________________________________________
1068 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
1069 {
1070     //
1071     // Set high water mark for last track in event
1072   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1073   if (runloader)
1074     if (runloader->Stack())
1075       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
1076 }
1077
1078 //_______________________________________________________________________
1079 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
1080 {
1081   //
1082   // Delegate to stack
1083   //
1084   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1085   if (runloader)
1086     if (runloader->Stack())
1087       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
1088 }
1089
1090 //_______________________________________________________________________
1091 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
1092 {
1093   // Delegate to stack
1094   //
1095   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1096   if (runloader)
1097     if (runloader->Stack())
1098       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
1099 }
1100
1101 //_______________________________________________________________________
1102 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
1103 {
1104   //
1105   // Set current track number
1106   //
1107   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1108   if (runloader)
1109     if (runloader->Stack())
1110       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
1111 }
1112
1113 //_______________________________________________________________________
1114 AliTrackReference*  AliMC::AddTrackReference(Int_t label, Int_t id)
1115 {
1116   //
1117   // add a trackrefernce to the list
1118   if (!fTrackReferences) {
1119     AliError("Container trackrefernce not active");
1120     return NULL;
1121   }
1122   Int_t primary = GetPrimary(label);
1123   Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
1124
1125   Int_t nref = fTmpTrackReferences->GetEntriesFast();
1126   TClonesArray &lref = *fTmpTrackReferences;
1127   return new(lref[nref]) AliTrackReference(label, id);
1128 }
1129
1130
1131
1132 //_______________________________________________________________________
1133 void AliMC::ResetTrackReferences()
1134 {
1135   //
1136   //  Reset all  references
1137   //
1138   if (fTmpTrackReferences)   fTmpTrackReferences->Clear();
1139 }
1140
1141 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(Int_t *map)
1142 {
1143   //
1144   // Remapping track reference
1145   // Called at finish primary
1146   //
1147   if (!fTmpTrackReferences) return;
1148   Int_t nEntries = fTmpTrackReferences->GetEntries();
1149   for (Int_t i=0; i < nEntries; i++){
1150       AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTmpTrackReferences->UncheckedAt(i));
1151       if (ref) {
1152           Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1153           if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1154           else {
1155               ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1156               fTmpTrackReferences->RemoveAt(i);
1157           }
1158       } // if ref
1159   }
1160   fTmpTrackReferences->Compress();
1161 }
1162
1163 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1164 {
1165     //
1166     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1167     //
1168
1169     TLorentzVector p;
1170     gMC->TrackMomentum(p);
1171     Double_t tmin, tmax;
1172     Double_t b;
1173
1174     // Transverse velocity
1175     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1176
1177     if ((b = gAlice->Field()->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1178
1179         // Radius of helix
1180
1181         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1182
1183         // Revolution frequency
1184
1185         Double_t omega = vt / rho;
1186
1187         // Maximum and minimum decay time
1188         //
1189         // Check for curlers first
1190         if (fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2. > 1.) return;
1191
1192         //
1193
1194         tmax  = TMath::ACos(1. - fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1195         tmin  = TMath::ACos(1. - fRDecayMin * fRDecayMin / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1196     } else {
1197         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct]
1198         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1199     }
1200
1201     //
1202     // Dial t using the two limits
1203     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1204     //
1205     //
1206     // Force decay time in transport code
1207     //
1208     gMC->ForceDecayTime(t / 2.99792458e10);
1209 }
1210
1211 void AliMC::MakeTmpTrackRefsTree()
1212 {
1213     // Make the temporary track reference tree
1214     fTmpFileTR = new TFile("TrackRefsTmp.root", "recreate");
1215     fTmpTreeTR = new TTree("TreeTR", "Track References");
1216     if (!fTmpTrackReferences)  fTmpTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference", 100);
1217     fTmpTreeTR->Branch("TrackReferences", "TClonesArray", &fTmpTrackReferences, 4000);
1218 }
1219
1220 void AliMC::ReorderAndExpandTreeTR()
1221 {
1222 //
1223 //  Reorder and expand the temporary track reference tree in order to match the kinematics tree
1224 //
1225
1226     AliRunLoader *rl = gAlice->GetRunLoader();
1227 //
1228 //  TreeTR
1229     AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
1230     rl->MakeTrackRefsContainer();
1231     TTree * treeTR = rl->TreeTR();
1232     if (treeTR){
1233         // make branch for central track references
1234         if (!fTrackReferences) fTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference",0);
1235         TBranch *branch;
1236         branch = treeTR->Branch("TrackReferences",&fTrackReferences);
1237         branch->SetAddress(&fTrackReferences);
1238     }
1239
1240     AliStack* stack  = rl->Stack();
1241     Int_t np = stack->GetNprimary();
1242     Int_t nt = fTmpTreeTR->GetEntries();
1243     //
1244     // Loop over tracks and find the secondaries with the help of the kine tree
1245     Int_t ifills = 0;
1246     Int_t it = 0;
1247     for (Int_t ip = np - 1; ip > -1; ip--) {
1248         TParticle *part = stack->Particle(ip);
1249 //      printf("Particle %5d %5d %5d %5d %5d \n", ip, part->GetPdgCode(), part->GetFirstMother(), part->GetFirstDaughter(), part->GetLastDaughter());
1250
1251         // Skip primaries that have not been transported
1252         Int_t dau1  = part->GetFirstDaughter();
1253         Int_t dau2  = -1;
1254         // if ((dau1 > -1 && dau1 < np) || part->GetStatusCode() > 1) continue;
1255         if (!part->TestBit(kTransportBit)) continue;
1256         //
1257         fTmpTreeTR->GetEntry(it++);
1258         Int_t nh = fTmpTrackReferences->GetEntries();
1259         // Determine range of secondaries produced by this primary
1260         if (dau1 > -1) {
1261             Int_t inext = ip - 1;
1262             while (dau2 < 0) {
1263                 if (inext >= 0) {
1264                     part = stack->Particle(inext);
1265                     dau2 =  part->GetFirstDaughter();
1266                     if (dau2 == -1 || dau2 < np) {
1267                         dau2 = -1;
1268                     } else {
1269                         dau2--;
1270                     }
1271                 } else {
1272                     dau2 = stack->GetNtrack() - 1;
1273                 }
1274                 inext--;
1275             } // find upper bound
1276         }  // dau2 < 0
1277 //      printf("Check (1) %5d %5d %5d %5d %5d \n", ip, np, it, dau1, dau2);
1278
1279         //
1280         // Loop over reference hits and find secondary label
1281         for (Int_t id = dau1; (id <= dau2) && (dau1 > -1); id++) {
1282             for (Int_t ih = 0; ih < nh; ih++) {
1283                 AliTrackReference* tr = (AliTrackReference*) fTmpTrackReferences->At(ih);
1284                 Int_t label = tr->Label();
1285                 // Skip primaries
1286                 if (label == ip) continue;
1287                 if (label > dau2 || label < dau1)
1288                     AliWarning(Form("Track Reference Label out of range !: %5d %5d %5d \n", label, dau1, dau2));
1289                 if (label == id) {
1290                     // secondary found
1291                     Int_t nref =  fTrackReferences->GetEntriesFast();
1292                     TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1293                     new(lref[nref]) AliTrackReference(*tr);
1294                 }
1295             } // hits
1296             treeTR->Fill();
1297             fTrackReferences->Clear();
1298             ifills++;
1299         } // daughters
1300     } // tracks
1301     //
1302     // Now loop again and write the primaries
1303     it = nt - 1;
1304     for (Int_t ip = 0; ip < np; ip++) {
1305         TParticle* part = stack->Particle(ip);
1306 //      if ((part->GetFirstDaughter() == -1 && part->GetStatusCode() <= 1) || part->GetFirstDaughter() >= np)
1307         if (part->TestBit(kTransportBit))
1308         {
1309             // Skip particles that have not been transported
1310             fTmpTreeTR->GetEntry(it--);
1311             Int_t nh = fTmpTrackReferences->GetEntries();
1312             //
1313             // Loop over reference hits and find primary labels
1314             for (Int_t ih = 0; ih < nh; ih++) {
1315                 AliTrackReference* tr = (AliTrackReference*)  fTmpTrackReferences->At(ih);
1316                 Int_t label = tr->Label();
1317                 if (label == ip) {
1318                     Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
1319                     TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1320                     new(lref[nref]) AliTrackReference(*tr);
1321                 }
1322             }
1323         }
1324         treeTR->Fill();
1325         fTrackReferences->Clear();
1326         ifills++;
1327     } // tracks
1328     // Check
1329     if (ifills != stack->GetNtrack())
1330         AliWarning(Form("Number of entries in TreeTR (%5d) unequal to TreeK (%5d) \n", ifills, stack->GetNtrack()));
1331 //
1332 //  Clean-up
1333     delete fTmpTreeTR;
1334     fTmpFileTR->Close();
1335     delete fTmpFileTR;
1336     delete fTmpTrackReferences;
1337     fTmpTrackReferences = 0;
1338     gSystem->Exec("rm -rf TrackRefsTmp.root");
1339 }
1340