STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <RVersion.h>
  25 #include <TBrowser.h>
  26 #include <TClonesArray.h>
  27 #include <TGeoManager.h>
  28 #include <TStopwatch.h>
  29 #include <TSystem.h>
  30 #include <TVirtualMC.h>
  31
  32 #include "AliLog.h"
  33 #include "AliDetector.h"
  34 #include "AliGenerator.h"
  35 #include "AliHeader.h"
  36 #include "AliLego.h"
  37 #include "AliMC.h"
  38 #include "AliMCQA.h"
  39 #include "AliRun.h"
  40 #include "AliStack.h"
  41 #include "AliMagF.h"
  42 #include "AliTrackReference.h"
  43
  44
  45 ClassImp(AliMC)
  46
  47 //_______________________________________________________________________
  48 AliMC::AliMC() :
  49   fGenerator(0),
  50   fEventEnergy(0),
  51   fSummEnergy(0),
  52   fSum2Energy(0),
  53   fTrRmax(1.e10),
  54   fTrZmax(1.e10),
  55   fRDecayMax(1.e10),
  56   fRDecayMin(-1.),
  57   fDecayPdg(0),
  58   fImedia(0),
  59   fTransParName("\0"),
  60   fMCQA(0),
  61   fHitLists(0),
  62   fTrackReferences(0)
  63
  64 {
  65   //default constructor
  66   DecayLimits();
  67 }
  68
  69 //_______________________________________________________________________
  70 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  71   TVirtualMCApplication(name, title),
  72   fGenerator(0),
  73   fEventEnergy(0),
  74   fSummEnergy(0),
  75   fSum2Energy(0),
  76   fTrRmax(1.e10),
  77   fTrZmax(1.e10),
  78   fRDecayMax(1.e10),
  79   fRDecayMin(-1.),
  80   fDecayPdg(0),
  81   fImedia(new TArrayI(1000)),
  82   fTransParName("\0"),
  83   fMCQA(0),
  84   fHitLists(new TList()),
  85   fTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100))
  86 {
  87   //constructor
  88   // Set transport parameters
  89   SetTransPar();
  90   DecayLimits();
  91   // Prepare the tracking medium lists
  92   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
  93 }
  94
  95 //_______________________________________________________________________
  96 AliMC::AliMC(const AliMC &mc) :
  97   TVirtualMCApplication(mc),
  98   fGenerator(0),
  99   fEventEnergy(0),
 100   fSummEnergy(0),
 101   fSum2Energy(0),
 102   fTrRmax(1.e10),
 103   fTrZmax(1.e10),
 104   fRDecayMax(1.e10),
 105   fRDecayMin(-1.),
 106   fDecayPdg(0),
 107   fImedia(0),
 108   fTransParName("\0"),
 109   fMCQA(0),
 110   fHitLists(0),
 111   fTrackReferences(0)
 112 {
 113   //
 114   // Copy constructor for AliMC
 115   //
 116   mc.Copy(*this);
 117 }
 118
 119 //_______________________________________________________________________
 120 AliMC::~AliMC()
 121 {
 122   //destructor
 123   delete fGenerator;
 124   delete fImedia;
 125   delete fMCQA;
 126   delete fHitLists;
 127   // Delete track references
 128   if (fTrackReferences) {
 129     fTrackReferences->Delete();
 130     delete fTrackReferences;
 131     fTrackReferences     = 0;
 132   }
 133
 134 }
 135
 136 //_______________________________________________________________________
 137 void AliMC::Copy(TObject &) const
 138 {
 139   //dummy Copy function
 140   AliFatal("Not implemented!");
 141 }
 142
 143 //_______________________________________________________________________
 144 void  AliMC::ConstructGeometry()
 145 {
 146   //
 147   // Either load geometry from file or create it through usual
 148   // loop on detectors. In the first case the method
 149   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
 150   // at InitGeometry().
 151   //
 152
 153   if(gAlice->IsRootGeometry()){
 154     // Load geometry
 155     const char *geomfilename = gAlice->GetGeometryFileName();
 156     if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
 157       AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s\n\n",geomfilename));
 158       TGeoManager::Import(geomfilename);
 159     }else{
 160       AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
 161       return;
 162     }
 163   }else{
 164     // Create modules, materials, geometry
 165     TStopwatch stw;
 166     TIter next(gAlice->Modules());
 167     AliModule *detector;
 168     AliDebug(1, "Geometry creation:");
 169     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 170       stw.Start();
 171       // Initialise detector materials and geometry
 172       detector->CreateMaterials();
 173       detector->CreateGeometry();
 174       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 175                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 176     }
 177   }
 178
 179 }
 180
 181 //_______________________________________________________________________
 182 void  AliMC::InitGeometry()
 183 {
 184   //
 185   // Initialize detectors
 186   //
 187
 188   AliInfo("Initialisation:");
 189   TStopwatch stw;
 190   TIter next(gAlice->Modules());
 191   AliModule *detector;
 192   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 193     stw.Start();
 194     // Initialise detector geometry
 195     if(gAlice->IsRootGeometry()) detector->CreateMaterials();
 196     detector->Init();
 197     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 198                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 199   }
 200 }
 201
 202 //_______________________________________________________________________
 203 void  AliMC::SetAllAlignableVolumes()
 204 {
 205   //
 206   // Add alignable volumes (TGeoPNEntries) looping on all
 207   // active modules
 208   //
 209
 210   AliInfo(Form("Setting entries for all alignable volumes of active detectors"));
 211   AliModule *detector;
 212   TIter next(gAlice->Modules());
 213   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 214     detector->AddAlignableVolumes();
 215   }
 216 }
 217
 218 //_______________________________________________________________________
 219 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 220 {
 221   //
 222   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 223   //
 224
 225   Generator()->Generate();
 226 }
 227
 228 //_______________________________________________________________________
 229 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 230 {
 231   //
 232   // Load the event generator
 233   //
 234   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 235 }
 236
 237 //_______________________________________________________________________
 238 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 239 {
 240   //
 241   // Load the event generator
 242   //
 243   if(fGenerator)
 244     if(generator)
 245       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
 246                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()))
 247     else
 248       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
 249                       fGenerator->GetName()));
 250   fGenerator = generator;
 251 }
 252
 253 //_______________________________________________________________________
 254 void AliMC::FinishRun()
 255 {
 256   // Clean generator information
 257   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
 258   fGenerator->FinishRun();
 259
 260   //Output energy summary tables
 261   AliDebug(1, "EnergySummary()");
 262   ToAliDebug(1, EnergySummary());
 263 }
 264
 265 //_______________________________________________________________________
 266 void AliMC::BeginPrimary()
 267 {
 268   //
 269   // Called  at the beginning of each primary track
 270   //
 271
 272   // Reset Hits info
 273   ResetHits();
 274   ResetTrackReferences();
 275
 276 }
 277
 278 //_______________________________________________________________________
 279 void AliMC::PreTrack()
 280 {
 281   // Actions before the track's transport
 282      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 283      AliModule *module;
 284
 285      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 286        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 287          module->PreTrack();
 288
 289      fMCQA->PreTrack();
 290 }
 291
 292 //_______________________________________________________________________
 293 void AliMC::Stepping()
 294 {
 295   //
 296   // Called at every step during transport
 297   //
 298
 299   Int_t id = DetFromMate(gMC->CurrentMedium());
 300   if (id < 0) return;
 301
 302
 303   if ( gMC->IsNewTrack()            &&
 304        gMC->TrackTime() == 0.       &&
 305        fRDecayMin >= 0.             &&
 306        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
 307        gMC->TrackPid() == fDecayPdg )
 308   {
 309       FixParticleDecaytime();
 310   }
 311
 312
 313
 314   //
 315   // --- If lego option, do it and leave
 316   if (gAlice->Lego())
 317     gAlice->Lego()->StepManager();
 318   else {
 319     Int_t copy;
 320     //Update energy deposition tables
 321     AddEnergyDeposit(gMC->CurrentVolID(copy),gMC->Edep());
 322     //
 323     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 324     if (gMC->IsTrackDisappeared()) {
 325         if (gMC->Etot()>0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber());
 326     }
 327
 328     //Call the appropriate stepping routine;
 329     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 330     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 331       if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) fMCQA->StepManager(id);
 332       det->StepManager();
 333     }
 334   }
 335 }
 336
 337 //_______________________________________________________________________
 338 void AliMC::EnergySummary()
 339 {
 340   //
 341   // Print summary of deposited energy
 342   //
 343
 344   Int_t ndep=0;
 345   Float_t edtot=0;
 346   Float_t ed, ed2;
 347   Int_t kn, i, left, j, id;
 348   const Float_t kzero=0;
 349   Int_t ievent=gAlice->GetRunLoader()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 350   //
 351   // Energy loss information
 352   if(ievent) {
 353     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 354     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 355       ed=fSummEnergy[kn];
 356       if(ed>0) {
 357         fEventEnergy[ndep]=kn;
 358         if(ievent>1) {
 359           ed=ed/ievent;
 360           ed2=fSum2Energy[kn];
 361           ed2=ed2/ievent;
 362           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 363         } else
 364           ed2=99;
 365         fSummEnergy[ndep]=ed;
 366         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 367         edtot+=ed;
 368         ndep++;
 369       }
 370     }
 371     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 372       left=ndep-kn*3;
 373       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 374         j=kn*3+i;
 375         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 376         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 377       }
 378       printf("\n");
 379     }
 380     //
 381     // Relative energy loss in different detectors
 382     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 383     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 384     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 385       left=ndep-kn*5;
 386       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 387         j=kn*5+i;
 388         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 389         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 390       }
 391       printf("\n");
 392     }
 393     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 394     printf("\n");
 395   }
 396   //
 397   // Reset the TArray's
 398   //  fEventEnergy.Set(0);
 399   //  fSummEnergy.Set(0);
 400   //  fSum2Energy.Set(0);
 401 }
 402
 403 //_____________________________________________________________________________
 404 void AliMC::BeginEvent()
 405 {
 406   //
 407   // Clean-up previous event
 408   // Energy scores
 409   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 410   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 411   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 412   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
 413   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 414   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 415   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 416
 417     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 418
 419   /*******************************/
 420   /*   Clean after eventual      */
 421   /*   previous event            */
 422   /*******************************/
 423
 424
 425   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 426   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 427   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 428   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
 429
 430   fEventEnergy.Reset();
 431     // Clean detector information
 432
 433   if (runloader->Stack())
 434     runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 435   else
 436     runloader->MakeStack();//or make a new one
 437
 438   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 439    {
 440      AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
 441      runloader->MakeTree("K");
 442    }
 443
 444   AliDebug(1, "gMC->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 445   gMC->SetStack(gAlice->GetRunLoader()->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 446                                      //because we don't have guarantee that
 447                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 448                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 449   //
 450   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 451   //
 452
 453   runloader->GetHeader()->Reset(gAlice->GetRunNumber(),gAlice->GetEvNumber(),
 454     gAlice->GetEventNrInRun());
 455 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 456
 457   if(gAlice->Lego())
 458    {
 459     gAlice->Lego()->BeginEvent();
 460     return;
 461    }
 462
 463
 464   AliDebug(1, "ResetHits()");
 465   ResetHits();
 466
 467   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
 468   runloader->MakeTree("H");
 469
 470   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
 471   runloader->MakeTrackRefsContainer();//for insurance
 472
 473
 474   //create new branches and SetAdresses
 475   TIter next(gAlice->Modules());
 476   AliModule *detector;
 477   while((detector = (AliModule*)next()))
 478    {
 479     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
 480     detector->MakeBranch("H");
 481     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranchTR()",detector->GetName()));
 482     detector->MakeBranchTR();
 483     AliDebug(2, Form("%s->SetTreeAddress()",detector->GetName()));
 484     detector->SetTreeAddress();
 485    }
 486   // make branch for AliRun track References
 487   TTree * treeTR = runloader->TreeTR();
 488   if (treeTR){
 489     // make branch for central track references
 490     if (!fTrackReferences) fTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference",0);
 491     TBranch *branch;
 492     branch = treeTR->Branch("AliRun",&fTrackReferences);
 493     branch->SetAddress(&fTrackReferences);
 494   }
 495   //
 496 }
 497
 498 //_______________________________________________________________________
 499 void AliMC::ResetHits()
 500 {
 501   //
 502   //  Reset all Detectors hits
 503   //
 504   TIter next(gAlice->Modules());
 505   AliModule *detector;
 506   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 507      detector->ResetHits();
 508   }
 509 }
 510
 511 //_______________________________________________________________________
 512 void AliMC::PostTrack()
 513 {
 514   // Posts tracks for each module
 515   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 516   AliModule *module;
 517
 518   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 519     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 520       module->PostTrack();
 521 }
 522
 523 //_______________________________________________________________________
 524 void AliMC::FinishPrimary()
 525 {
 526   //
 527   // Called  at the end of each primary track
 528   //
 529   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 530   //  static Int_t count=0;
 531   //  const Int_t times=10;
 532   // This primary is finished, purify stack
 533 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
 534   if (!(gMC->SecondariesAreOrdered()))
 535        runloader->Stack()->ReorderKine();
 536 #endif
 537   runloader->Stack()->PurifyKine();
 538
 539   TIter next(gAlice->Modules());
 540   AliModule *detector;
 541   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 542     detector->FinishPrimary();
 543     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
 544     if(loader)
 545      {
 546        TTree* treeH = loader->TreeH();
 547        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
 548      }
 549   }
 550
 551   // Write out track references if any
 552   if (runloader->TreeTR()) runloader->TreeTR()->Fill();
 553 }
 554
 555 //_______________________________________________________________________
 556 void AliMC::FinishEvent()
 557 {
 558   //
 559   // Called at the end of the event.
 560   //
 561
 562   //
 563
 564   if(gAlice->Lego()) gAlice->Lego()->FinishEvent();
 565
 566   TIter next(gAlice->Modules());
 567   AliModule *detector;
 568   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 569     detector->FinishEvent();
 570   }
 571
 572   //Update the energy deposit tables
 573   Int_t i;
 574   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
 575    {
 576     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
 577     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
 578    }
 579
 580   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 581
 582   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
 583   AliStack* stack = runloader->Stack();
 584   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
 585    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
 586     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
 587     return;//never reached
 588    }
 589   // Update Header information
 590   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
 591   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
 592
 593
 594   // Write out the kinematics
 595   if (!gAlice->Lego()) stack->FinishEvent();
 596
 597   // Write out the event Header information
 598   TTree* treeE = runloader->TreeE();
 599   if (treeE)
 600    {
 601       header->SetStack(stack);
 602       treeE->Fill();
 603    }
 604   else
 605    {
 606     AliError("Can not get TreeE from RL");
 607    }
 608
 609   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 610    {
 611      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
 612      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
 613      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
 614    }
 615
 616   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 617   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 618   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 619   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
 620   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 621   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 622   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 623 }
 624
 625 //_______________________________________________________________________
 626 void AliMC::Field(const Double_t* x, Double_t* b) const
 627 {
 628   // Calculates field "b" at point "x"
 629     gAlice->Field(x,b);
 630 }
 631
 632 //_______________________________________________________________________
 633 void AliMC::Init()
 634 {
 635   // MC initialization
 636
 637    //=================Create Materials and geometry
 638    gMC->Init();
 639    //Set alignable volumes for the whole geometry
 640    SetAllAlignableVolumes();
 641    //Read the cuts for all materials
 642    ReadTransPar();
 643    //Build the special IMEDIA table
 644    MediaTable();
 645
 646    //Compute cross-sections
 647    gMC->BuildPhysics();
 648
 649    //Initialise geometry deposition table
 650    fEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 651    fSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 652    fSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 653
 654    //
 655    fMCQA = new AliMCQA(gAlice->GetNdets());
 656
 657    // Register MC in configuration
 658    AliConfig::Instance()->Add(gMC);
 659
 660 }
 661
 662 //_______________________________________________________________________
 663 void AliMC::MediaTable()
 664 {
 665   //
 666   // Built media table to get from the media number to
 667   // the detector id
 668   //
 669
 670   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 671   //  Int_t ibeg;
 672   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 673   AliModule *det;
 674   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
 675   //
 676   // For all detectors
 677   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
 678     // If detector is defined
 679     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
 680         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 681         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 682
 683         // Find max and min material number
 684         if((idt=idtmed[nz])) {
 685           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 686           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 687         }
 688       }
 689       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 690         det->LoMedium() = 0;
 691         det->HiMedium() = 0;
 692       } else {
 693         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 694           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
 695                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
 696           return;
 697         }
 698         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 699         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 700           (*fImedia)[lz]=kz;
 701         }
 702       }
 703     }
 704   }
 705   //
 706   // Print summary table
 707   AliInfo("Tracking media ranges:");
 708   ToAliInfo(
 709   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
 710     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
 711       ind=i*6+k;
 712       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
 713       if(det)
 714         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 715                det->HiMedium());
 716       else
 717         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 718     }
 719     printf("\n");
 720   }
 721   )
 722 }
 723
 724 //_______________________________________________________________________
 725 void AliMC::ReadTransPar()
 726 {
 727   //
 728   // Read filename to set the transport parameters
 729   //
 730
 731
 732   const Int_t kncuts=10;
 733   const Int_t knflags=11;
 734   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
 735   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 736                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 737                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 738                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 739   char line[256];
 740   char detName[7];
 741   char* filtmp;
 742   Float_t cut[kncuts];
 743   Int_t flag[knflags];
 744   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 745   FILE *lun;
 746   //
 747   // See whether the file is there
 748   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
 749   lun=fopen(filtmp,"r");
 750   delete [] filtmp;
 751   if(!lun) {
 752     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
 753     return;
 754   }
 755   //
 756   while(1) {
 757     // Initialise cuts and flags
 758     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
 759     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
 760     itmed=0;
 761     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 762     // Read up to the end of line excluded
 763     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 764     if(iret<0) {
 765       //End of file
 766       fclose(lun);
 767       return;
 768     }
 769     // Read the end of line
 770     fscanf(lun,"%*c");
 771     if(!iret) continue;
 772     if(line[0]=='*') continue;
 773     // Read the numbers
 774     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 775                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 776                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 777                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 778     if(!iret) continue;
 779     if(iret<0) {
 780       //reading error
 781       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
 782       continue;
 783     }
 784     // Check that the module exist
 785     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
 786     if(mod) {
 787       // Get the array of media numbers
 788       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 789       // Check that the tracking medium code is valid
 790       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 791         ktmed=idtmed[itmed];
 792         if(!ktmed) {
 793           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
 794           continue;
 795         }
 796         // Set energy thresholds
 797         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
 798           if(cut[kz]>=0) {
 799             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
 800                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
 801             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
 802           }
 803         }
 804         // Set transport mechanisms
 805         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
 806           if(flag[kz]>=0) {
 807             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
 808                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
 809             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 810           }
 811         }
 812       } else {
 813         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
 814         continue;
 815       }
 816     } else {
 817       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
 818       continue;
 819     }
 820   }
 821 }
 822
 823 //_______________________________________________________________________
 824 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
 825 {
 826   //
 827   // Sets the file name for transport parameters
 828   //
 829   fTransParName = filename;
 830 }
 831
 832 //_______________________________________________________________________
 833 void AliMC::Browse(TBrowser *b)
 834 {
 835   //
 836   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 837   // of the Root browser.
 838   // It displays the Root Trees and all detectors.
 839   //
 840   //detectors are in folders anyway
 841   b->Add(fMCQA,"AliMCQA");
 842 }
 843
 844 //_______________________________________________________________________
 845 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 846 {
 847   //
 848   //  Add a hit to detector id
 849   //
 850   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 851   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 852 }
 853
 854 //_______________________________________________________________________
 855 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 856 {
 857   //
 858   // Add digit to detector id
 859   //
 860   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 861   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 862 }
 863
 864 //_______________________________________________________________________
 865 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
 866   //
 867   // Returns current track
 868   //
 869   return gAlice->GetRunLoader()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
 870 }
 871
 872 //_______________________________________________________________________
 873 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
 874 {
 875   //
 876   // Dumps particle i in the stack
 877   //
 878   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 879    if (runloader->Stack())
 880     runloader->Stack()->DumpPart(i);
 881 }
 882
 883 //_______________________________________________________________________
 884 void AliMC::DumpPStack () const
 885 {
 886   //
 887   // Dumps the particle stack
 888   //
 889   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 890    if (runloader->Stack())
 891     runloader->Stack()->DumpPStack();
 892 }
 893
 894 //_______________________________________________________________________
 895 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
 896   //
 897   // Returns number of tracks in stack
 898   //
 899   Int_t ntracks = -1;
 900   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 901    if (runloader->Stack())
 902      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
 903    return ntracks;
 904 }
 905
 906 //_______________________________________________________________________
 907 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
 908 {
 909   //
 910   // return number of primary that has generated track
 911   //
 912   Int_t nprimary = -999;
 913   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 914   if (runloader->Stack())
 915     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
 916   return nprimary;
 917 }
 918
 919 //_______________________________________________________________________
 920 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
 921 {
 922   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
 923   // the remaping done by PurifyKine
 924   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 925   if (runloader)
 926    if (runloader->Stack())
 927     return runloader->Stack()->Particle(i);
 928   return 0x0;
 929 }
 930
 931 //_______________________________________________________________________
 932 TObjArray* AliMC::Particles() const {
 933   //
 934   // Returns pointer to Particles array
 935   //
 936   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 937   if (runloader)
 938    if (runloader->Stack())
 939     return runloader->Stack()->Particles();
 940   return 0x0;
 941 }
 942
 943 //_______________________________________________________________________
 944 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
 945                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
 946                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 947 {
 948 // Delegate to stack
 949 //
 950   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 951   if (runloader)
 952     if (runloader->Stack())
 953       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
 954                                     mech, ntr, weight, is);
 955 }
 956
 957 //_______________________________________________________________________
 958 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
 959                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
 960                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
 961                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
 962                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 963 {
 964   // Delegate to stack
 965   //
 966   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 967   if (runloader)
 968     if (runloader->Stack())
 969       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
 970                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
 971 }
 972
 973 //_______________________________________________________________________
 974 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
 975 {
 976     //
 977     // Set high water mark for last track in event
 978   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 979   if (runloader)
 980     if (runloader->Stack())
 981       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
 982 }
 983
 984 //_______________________________________________________________________
 985 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
 986 {
 987   //
 988   // Delegate to stack
 989   //
 990   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 991   if (runloader)
 992     if (runloader->Stack())
 993       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
 994 }
 995
 996 //_______________________________________________________________________
 997 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
 998 {
 999   // Delegate to stack
1000   //
1001   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1002   if (runloader)
1003     if (runloader->Stack())
1004       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
1005 }
1006
1007 //_______________________________________________________________________
1008 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
1009 {
1010   //
1011   // Set current track number
1012   //
1013   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1014   if (runloader)
1015     if (runloader->Stack())
1016       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
1017 }
1018
1019 //_______________________________________________________________________
1020 void  AliMC::AddTrackReference(Int_t label){
1021   //
1022   // add a trackrefernce to the list
1023   if (!fTrackReferences) {
1024     AliError("Container trackrefernce not active");
1025     return;
1026   }
1027   Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
1028   TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1029   new(lref[nref]) AliTrackReference(label);
1030 }
1031
1032
1033
1034 //_______________________________________________________________________
1035 void AliMC::ResetTrackReferences()
1036 {
1037   //
1038   //  Reset all  references
1039   //
1040   if (fTrackReferences)   fTrackReferences->Clear();
1041
1042   TIter next(gAlice->Modules());
1043   AliModule *detector;
1044   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1045      detector->ResetTrackReferences();
1046   }
1047 }
1048
1049 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(Int_t *map)
1050 {
1051   //
1052   // Remapping track reference
1053   // Called at finish primary
1054   //
1055   if (!fTrackReferences) return;
1056   Int_t nEntries = fTrackReferences->GetEntries();
1057   for (Int_t i=0; i < nEntries; i++){
1058       AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTrackReferences->UncheckedAt(i));
1059       if (ref) {
1060           Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1061           if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1062           else {
1063               ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1064               fTrackReferences->RemoveAt(i);
1065           }
1066       } // if ref
1067   }
1068   fTrackReferences->Compress();
1069 }
1070
1071 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1072 {
1073     //
1074     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1075     //
1076
1077     TLorentzVector p;
1078     gMC->TrackMomentum(p);
1079     Double_t tmin, tmax;
1080     Double_t b;
1081
1082     // Transverse velocity
1083     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1084
1085     if ((b = gAlice->Field()->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1086
1087         // Radius of helix
1088
1089         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1090
1091         // Revolution frequency
1092
1093         Double_t omega = vt / rho;
1094
1095         // Maximum and minimum decay time
1096         //
1097         // Check for curlers first
1098         if (fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2. > 1.) return;
1099
1100         //
1101
1102         tmax  = TMath::ACos(1. - fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1103         tmin  = TMath::ACos(1. - fRDecayMin * fRDecayMin / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1104     } else {
1105         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct]
1106         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1107     }
1108
1109     //
1110     // Dial t using the two limits
1111     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1112     //
1113     //
1114     // Force decay time in transport code
1115     //
1116     gMC->ForceDecayTime(t / 2.99792458e10);
1117 }