STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <RVersion.h>
  25 #include <TBrowser.h>
  26 #include <TClonesArray.h>
  27 #include <TGeoManager.h>
  28 #include <TStopwatch.h>
  29 #include <TSystem.h>
  30 #include <TVirtualMC.h>
  31 #include <TParticle.h>
  32 #include <TROOT.h>
  33 #include <TFile.h>
  34
  35 #include "AliLog.h"
  36 #include "AliDetector.h"
  37 #include "AliGenerator.h"
  38 #include "AliHeader.h"
  39 #include "AliLego.h"
  40 #include "AliMC.h"
  41 #include "AliMCQA.h"
  42 #include "AliRun.h"
  43 #include "AliHit.h"
  44 #include "AliStack.h"
  45 #include "AliMagF.h"
  46 #include "AliTrackReference.h"
  47 #include "AliSimulation.h"
  48 #include "AliGeomManager.h"
  49 #include "AliCDBManager.h"
  50 #include "AliCDBStorage.h"
  51 #include "AliCDBEntry.h"
  52
  53
  54 ClassImp(AliMC)
  55
  56 //_______________________________________________________________________
  57 AliMC::AliMC() :
  58   fGenerator(0),
  59   fEventEnergy(0),
  60   fSummEnergy(0),
  61   fSum2Energy(0),
  62   fTrRmax(1.e10),
  63   fTrZmax(1.e10),
  64   fRDecayMax(1.e10),
  65   fRDecayMin(-1.),
  66   fDecayPdg(0),
  67   fImedia(0),
  68   fTransParName("\0"),
  69   fMCQA(0),
  70   fHitLists(0),
  71   fTmpTreeTR(0),
  72   fTmpFileTR(0),
  73   fTrackReferences(0),
  74   fTmpTrackReferences(0)
  75
  76 {
  77   //default constructor
  78   DecayLimits();
  79 }
  80
  81 //_______________________________________________________________________
  82 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  83   TVirtualMCApplication(name, title),
  84   fGenerator(0),
  85   fEventEnergy(0),
  86   fSummEnergy(0),
  87   fSum2Energy(0),
  88   fTrRmax(1.e10),
  89   fTrZmax(1.e10),
  90   fRDecayMax(1.e10),
  91   fRDecayMin(-1.),
  92   fDecayPdg(0),
  93   fImedia(new TArrayI(1000)),
  94   fTransParName("\0"),
  95   fMCQA(0),
  96   fHitLists(new TList()),
  97   fTmpTreeTR(0),
  98   fTmpFileTR(0),
  99   fTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100)),
 100   fTmpTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100))
 101 {
 102   //constructor
 103   // Set transport parameters
 104   SetTransPar();
 105   DecayLimits();
 106   // Prepare the tracking medium lists
 107   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
 108 }
 109
 110 //_______________________________________________________________________
 111 AliMC::AliMC(const AliMC &mc) :
 112   TVirtualMCApplication(mc),
 113   fGenerator(0),
 114   fEventEnergy(0),
 115   fSummEnergy(0),
 116   fSum2Energy(0),
 117   fTrRmax(1.e10),
 118   fTrZmax(1.e10),
 119   fRDecayMax(1.e10),
 120   fRDecayMin(-1.),
 121   fDecayPdg(0),
 122   fImedia(0),
 123   fTransParName("\0"),
 124   fMCQA(0),
 125   fHitLists(0),
 126   fTmpTreeTR(0),
 127   fTmpFileTR(0),
 128   fTrackReferences(0),
 129   fTmpTrackReferences(0)
 130 {
 131   //
 132   // Copy constructor for AliMC
 133   //
 134   mc.Copy(*this);
 135 }
 136
 137 //_______________________________________________________________________
 138 AliMC::~AliMC()
 139 {
 140   //destructor
 141   delete fGenerator;
 142   delete fImedia;
 143   delete fMCQA;
 144   delete fHitLists;
 145   // Delete track references
 146   if (fTrackReferences) {
 147     fTrackReferences->Delete();
 148     delete fTrackReferences;
 149     fTrackReferences     = 0;
 150   }
 151
 152 if (fTmpTrackReferences) {
 153     fTmpTrackReferences->Delete();
 154     delete fTmpTrackReferences;
 155     fTmpTrackReferences     = 0;
 156   }
 157
 158 }
 159
 160 //_______________________________________________________________________
 161 void AliMC::Copy(TObject &) const
 162 {
 163   //dummy Copy function
 164   AliFatal("Not implemented!");
 165 }
 166
 167 //_______________________________________________________________________
 168 void  AliMC::ConstructGeometry()
 169 {
 170   //
 171   // Either load geometry from file or create it through usual
 172   // loop on detectors. In the first case the method
 173   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
 174   // at InitGeometry().
 175   //
 176
 177   if(gAlice->IsRootGeometry()){ //load geometry either from CDB or from file
 178     if(gAlice->IsGeomFromCDB()){
 179       AliInfo("Loading geometry from CDB default storage");
 180       AliCDBPath path("GRP","Geometry","Data");
 181       AliCDBEntry *entry=AliCDBManager::Instance()->Get(path.GetPath());
 182       if(!entry) AliFatal("Unable to load geometry from CDB!");
 183       entry->SetOwner(0);
 184       gGeoManager = (TGeoManager*) entry->GetObject();
 185       if (!gGeoManager) AliFatal("TGeoManager object not found in the specified CDB entry!");
 186     }else{
 187       // Load geometry
 188       const char *geomfilename = gAlice->GetGeometryFileName();
 189       if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
 190         AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s",geomfilename));
 191         TGeoManager::Import(geomfilename);
 192       }else{
 193         AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
 194         return;
 195       }
 196     }
 197   }else{
 198     // Create modules, materials, geometry
 199     TStopwatch stw;
 200     TIter next(gAlice->Modules());
 201     AliModule *detector;
 202     AliDebug(1, "Geometry creation:");
 203     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 204       stw.Start();
 205       // Initialise detector materials and geometry
 206       detector->CreateMaterials();
 207       detector->CreateGeometry();
 208       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 209                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 210     }
 211   }
 212
 213 }
 214
 215 //_______________________________________________________________________
 216 Bool_t  AliMC::MisalignGeometry()
 217 {
 218 // Call misalignment code if AliSimulation object was defined.
 219
 220    if(!gAlice->IsRootGeometry()){
 221      //Set alignable volumes for the whole geometry
 222      SetAllAlignableVolumes();
 223    }
 224    // Misalign geometry via AliSimulation instance
 225    if (!AliSimulation::GetInstance()) return kFALSE;
 226    AliGeomManager::SetGeometry(gGeoManager);
 227    return AliSimulation::GetInstance()->MisalignGeometry(gAlice->GetRunLoader());
 228 }
 229
 230 //_______________________________________________________________________
 231 void  AliMC::ConstructOpGeometry()
 232 {
 233   //
 234   // Loop all detector modules and call DefineOpticalProperties() method
 235   //
 236
 237   TIter next(gAlice->Modules());
 238   AliModule *detector;
 239   AliInfo("Optical properties definition");
 240   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 241     // Initialise detector optical properties
 242     detector->DefineOpticalProperties();
 243   }
 244 }
 245
 246 //_______________________________________________________________________
 247 void  AliMC::InitGeometry()
 248 {
 249   //
 250   // Initialize detectors
 251   //
 252
 253   AliInfo("Initialisation:");
 254   TStopwatch stw;
 255   TIter next(gAlice->Modules());
 256   AliModule *detector;
 257   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 258     stw.Start();
 259     // Initialise detector geometry
 260     if(gAlice->IsRootGeometry()) detector->CreateMaterials();
 261     detector->Init();
 262     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 263                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 264   }
 265 }
 266
 267 //_______________________________________________________________________
 268 void  AliMC::SetAllAlignableVolumes()
 269 {
 270   //
 271   // Add alignable volumes (TGeoPNEntries) looping on all
 272   // active modules
 273   //
 274
 275   AliInfo(Form("Setting entries for all alignable volumes of active detectors"));
 276   AliModule *detector;
 277   TIter next(gAlice->Modules());
 278   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 279     detector->AddAlignableVolumes();
 280   }
 281 }
 282
 283 //_______________________________________________________________________
 284 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 285 {
 286   //
 287   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 288   //
 289
 290   Generator()->Generate();
 291 }
 292
 293 //_______________________________________________________________________
 294 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 295 {
 296   //
 297   // Load the event generator
 298   //
 299   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 300 }
 301
 302 //_______________________________________________________________________
 303 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 304 {
 305   //
 306   // Load the event generator
 307   //
 308   if(fGenerator) {
 309     if(generator) {
 310       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
 311                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()));
 312     }
 313     else {
 314       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
 315                       fGenerator->GetName()));
 316     }
 317   }
 318   fGenerator = generator;
 319 }
 320
 321 //_______________________________________________________________________
 322 void AliMC::FinishRun()
 323 {
 324   // Clean generator information
 325   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
 326   fGenerator->FinishRun();
 327
 328   //Output energy summary tables
 329   AliDebug(1, "EnergySummary()");
 330   ToAliDebug(1, EnergySummary());
 331 }
 332
 333 //_______________________________________________________________________
 334 void AliMC::BeginPrimary()
 335 {
 336   //
 337   // Called  at the beginning of each primary track
 338   //
 339
 340   // Reset Hits info
 341   ResetHits();
 342   ResetTrackReferences();
 343 }
 344
 345 //_______________________________________________________________________
 346 void AliMC::PreTrack()
 347 {
 348   // Actions before the track's transport
 349      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 350      AliModule *module;
 351
 352      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 353        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 354          module->PreTrack();
 355
 356      fMCQA->PreTrack();
 357 }
 358
 359 //_______________________________________________________________________
 360 void AliMC::Stepping()
 361 {
 362   //
 363   // Called at every step during transport
 364   //
 365
 366   Int_t id = DetFromMate(gMC->CurrentMedium());
 367   if (id < 0) return;
 368
 369
 370   if ( gMC->IsNewTrack()            &&
 371        gMC->TrackTime() == 0.       &&
 372        fRDecayMin >= 0.             &&
 373        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
 374        gMC->TrackPid() == fDecayPdg )
 375   {
 376       FixParticleDecaytime();
 377   }
 378
 379
 380
 381   //
 382   // --- If lego option, do it and leave
 383   if (gAlice->Lego())
 384     gAlice->Lego()->StepManager();
 385   else {
 386     Int_t copy;
 387     //Update energy deposition tables
 388     AddEnergyDeposit(gMC->CurrentVolID(copy),gMC->Edep());
 389     //
 390     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 391
 392     if (gMC->IsTrackDisappeared() && !(gMC->IsTrackAlive())) {
 393         if (gMC->Etot() > 0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber(),
 394                                                 AliTrackReference::kDisappeared);
 395
 396
 397     }
 398
 399     //Call the appropriate stepping routine;
 400     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 401     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 402       if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) fMCQA->StepManager(id);
 403       det->StepManager();
 404     }
 405   }
 406 }
 407
 408 //_______________________________________________________________________
 409 void AliMC::EnergySummary()
 410 {
 411   //e
 412   // Print summary of deposited energy
 413   //
 414
 415   Int_t ndep=0;
 416   Float_t edtot=0;
 417   Float_t ed, ed2;
 418   Int_t kn, i, left, j, id;
 419   const Float_t kzero=0;
 420   Int_t ievent=gAlice->GetRunLoader()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 421   //
 422   // Energy loss information
 423   if(ievent) {
 424     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 425     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 426       ed=fSummEnergy[kn];
 427       if(ed>0) {
 428         fEventEnergy[ndep]=kn;
 429         if(ievent>1) {
 430           ed=ed/ievent;
 431           ed2=fSum2Energy[kn];
 432           ed2=ed2/ievent;
 433           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 434         } else
 435           ed2=99;
 436         fSummEnergy[ndep]=ed;
 437         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 438         edtot+=ed;
 439         ndep++;
 440       }
 441     }
 442     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 443       left=ndep-kn*3;
 444       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 445         j=kn*3+i;
 446         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 447         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 448       }
 449       printf("\n");
 450     }
 451     //
 452     // Relative energy loss in different detectors
 453     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 454     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 455     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 456       left=ndep-kn*5;
 457       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 458         j=kn*5+i;
 459         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 460         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 461       }
 462       printf("\n");
 463     }
 464     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 465     printf("\n");
 466   }
 467   //
 468   // Reset the TArray's
 469   //  fEventEnergy.Set(0);
 470   //  fSummEnergy.Set(0);
 471   //  fSum2Energy.Set(0);
 472 }
 473
 474 //_____________________________________________________________________________
 475 void AliMC::BeginEvent()
 476 {
 477   //
 478   // Clean-up previous event
 479   // Energy scores
 480   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 481   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 482   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 483   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
 484   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 485   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 486   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 487
 488   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 489
 490   /*******************************/
 491   /*   Clean after eventual      */
 492   /*   previous event            */
 493   /*******************************/
 494
 495
 496   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 497   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 498   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 499   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
 500
 501   fEventEnergy.Reset();
 502     // Clean detector information
 503
 504   if (runloader->Stack())
 505       runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 506   else
 507       runloader->MakeStack();//or make a new one
 508
 509
 510   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 511   {
 512       AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
 513       runloader->MakeTree("K");
 514   }
 515
 516   AliDebug(1, "gMC->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 517   gMC->SetStack(gAlice->GetRunLoader()->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 518                                      //because we don't have guarantee that
 519                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 520                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 521   //
 522   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 523   //
 524
 525   runloader->GetHeader()->Reset(gAlice->GetRunNumber(),gAlice->GetEvNumber(),
 526                                 gAlice->GetEventNrInRun());
 527 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 528
 529   if(gAlice->Lego())
 530   {
 531       gAlice->Lego()->BeginEvent();
 532       return;
 533   }
 534
 535
 536   AliDebug(1, "ResetHits()");
 537   ResetHits();
 538
 539   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
 540   runloader->MakeTree("H");
 541
 542
 543
 544   MakeTmpTrackRefsTree();
 545   //create new branches and SetAdresses
 546   TIter next(gAlice->Modules());
 547   AliModule *detector;
 548   while((detector = (AliModule*)next()))
 549    {
 550        AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
 551        detector->MakeBranch("H");
 552    }
 553 }
 554
 555 //_______________________________________________________________________
 556 void AliMC::ResetHits()
 557 {
 558   //
 559   //  Reset all Detectors hits
 560   //
 561   TIter next(gAlice->Modules());
 562   AliModule *detector;
 563   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 564      detector->ResetHits();
 565   }
 566 }
 567
 568 //_______________________________________________________________________
 569 void AliMC::PostTrack()
 570 {
 571   // Posts tracks for each module
 572   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 573   AliModule *module;
 574
 575   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 576     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 577       module->PostTrack();
 578 }
 579
 580 //_______________________________________________________________________
 581 void AliMC::FinishPrimary()
 582 {
 583   //
 584   // Called  at the end of each primary track
 585   //
 586   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 587   //  static Int_t count=0;
 588   //  const Int_t times=10;
 589   // This primary is finished, purify stack
 590 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
 591   if (!(gMC->SecondariesAreOrdered())) {
 592       runloader->Stack()->ReorderKine();
 593       RemapHits();
 594   }
 595 #endif
 596   runloader->Stack()->PurifyKine();
 597
 598   RemapHits();
 599
 600   TIter next(gAlice->Modules());
 601   AliModule *detector;
 602   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 603     detector->FinishPrimary();
 604     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
 605     if(loader)
 606      {
 607        TTree* treeH = loader->TreeH();
 608        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
 609      }
 610   }
 611
 612   // Write out track references if any
 613   if (fTmpTreeTR) fTmpTreeTR->Fill();
 614 }
 615
 616 void AliMC::RemapHits()
 617 {
 618 //
 619 // Remaps the track labels of the hits
 620     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 621     AliStack* stack = runloader->Stack();
 622     TList* hitLists = GetHitLists();
 623     TIter next(hitLists);
 624     TCollection *hitList;
 625
 626     while((hitList = dynamic_cast<TCollection*>(next()))) {
 627         TIter nexthit(hitList);
 628         AliHit *hit;
 629         while((hit = dynamic_cast<AliHit*>(nexthit()))) {
 630             hit->SetTrack(stack->TrackLabel(hit->GetTrack()));
 631         }
 632     }
 633
 634     //
 635     // This for detectors which have a special mapping mechanism
 636     // for hits, such as TPC and TRD
 637     //
 638
 639
 640     TObjArray* modules = gAlice->Modules();
 641     TIter nextmod(modules);
 642     AliModule *module;
 643     while((module = (AliModule*) nextmod())) {
 644         AliDetector* det = dynamic_cast<AliDetector*> (module);
 645         if (det) det->RemapTrackHitIDs(stack->TrackLabelMap());
 646     }
 647     //
 648     RemapTrackReferencesIDs(stack->TrackLabelMap());
 649 }
 650
 651 //_______________________________________________________________________
 652 void AliMC::FinishEvent()
 653 {
 654   //
 655   // Called at the end of the event.
 656   //
 657
 658   //
 659
 660   if(gAlice->Lego()) gAlice->Lego()->FinishEvent();
 661
 662   TIter next(gAlice->Modules());
 663   AliModule *detector;
 664   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 665     detector->FinishEvent();
 666   }
 667
 668   //Update the energy deposit tables
 669   Int_t i;
 670   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
 671    {
 672     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
 673     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
 674    }
 675
 676   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 677
 678   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
 679   AliStack* stack = runloader->Stack();
 680   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
 681    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
 682     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
 683     return;//never reached
 684    }
 685   // Update Header information
 686   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
 687   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
 688
 689   // Write out the kinematics
 690   if (!gAlice->Lego()) stack->FinishEvent();
 691
 692   // Synchronize the TreeTR with TreeK
 693   if (fTmpTreeTR) ReorderAndExpandTreeTR();
 694
 695   // Write out the event Header information
 696   TTree* treeE = runloader->TreeE();
 697   if (treeE)
 698    {
 699       header->SetStack(stack);
 700       treeE->Fill();
 701    }
 702   else
 703    {
 704     AliError("Can not get TreeE from RL");
 705    }
 706
 707   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 708    {
 709      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
 710      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
 711      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
 712    }
 713
 714   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 715   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 716   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 717   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
 718   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 719   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 720   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 721 }
 722
 723 //_______________________________________________________________________
 724 void AliMC::Field(const Double_t* x, Double_t* b) const
 725 {
 726   // Calculates field "b" at point "x"
 727     gAlice->Field(x,b);
 728 }
 729
 730 //_______________________________________________________________________
 731 void AliMC::Init()
 732 {
 733   // MC initialization
 734
 735    //=================Create Materials and geometry
 736    gMC->Init();
 737   // Set alignable volumes for the whole geometry (with old root)
 738 #if ROOT_VERSION_CODE < 331527
 739   SetAllAlignableVolumes();
 740 #endif
 741    //Read the cuts for all materials
 742    ReadTransPar();
 743    //Build the special IMEDIA table
 744    MediaTable();
 745
 746    //Compute cross-sections
 747    gMC->BuildPhysics();
 748
 749    //Initialise geometry deposition table
 750    fEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 751    fSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 752    fSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 753
 754    //
 755    fMCQA = new AliMCQA(gAlice->GetNdets());
 756
 757    // Register MC in configuration
 758    AliConfig::Instance()->Add(gMC);
 759
 760 }
 761
 762 //_______________________________________________________________________
 763 void AliMC::MediaTable()
 764 {
 765   //
 766   // Built media table to get from the media number to
 767   // the detector id
 768   //
 769
 770   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 771   //  Int_t ibeg;
 772   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 773   AliModule *det;
 774   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
 775   //
 776   // For all detectors
 777   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
 778     // If detector is defined
 779     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
 780         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 781         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 782
 783         // Find max and min material number
 784         if((idt=idtmed[nz])) {
 785           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 786           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 787         }
 788       }
 789       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 790         det->LoMedium() = 0;
 791         det->HiMedium() = 0;
 792       } else {
 793         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 794           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
 795                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
 796           return;
 797         }
 798         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 799         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 800           (*fImedia)[lz]=kz;
 801         }
 802       }
 803     }
 804   }
 805   //
 806   // Print summary table
 807   AliInfo("Tracking media ranges:");
 808   ToAliInfo(
 809   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
 810     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
 811       ind=i*6+k;
 812       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
 813       if(det)
 814         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 815                det->HiMedium());
 816       else
 817         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 818     }
 819     printf("\n");
 820   }
 821   )
 822 }
 823
 824 //_______________________________________________________________________
 825 void AliMC::ReadTransPar()
 826 {
 827   //
 828   // Read filename to set the transport parameters
 829   //
 830
 831
 832   const Int_t kncuts=10;
 833   const Int_t knflags=11;
 834   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
 835   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 836                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 837                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 838                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 839   char line[256];
 840   char detName[7];
 841   char* filtmp;
 842   Float_t cut[kncuts];
 843   Int_t flag[knflags];
 844   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 845   FILE *lun;
 846   //
 847   // See whether the file is there
 848   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
 849   lun=fopen(filtmp,"r");
 850   delete [] filtmp;
 851   if(!lun) {
 852     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
 853     return;
 854   }
 855   //
 856   while(1) {
 857     // Initialise cuts and flags
 858     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
 859     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
 860     itmed=0;
 861     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 862     // Read up to the end of line excluded
 863     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 864     if(iret<0) {
 865       //End of file
 866       fclose(lun);
 867       return;
 868     }
 869     // Read the end of line
 870     fscanf(lun,"%*c");
 871     if(!iret) continue;
 872     if(line[0]=='*') continue;
 873     // Read the numbers
 874     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 875                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 876                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 877                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 878     if(!iret) continue;
 879     if(iret<0) {
 880       //reading error
 881       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
 882       continue;
 883     }
 884     // Check that the module exist
 885     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
 886     if(mod) {
 887       // Get the array of media numbers
 888       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 889       // Check that the tracking medium code is valid
 890       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 891         ktmed=idtmed[itmed];
 892         if(!ktmed) {
 893           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
 894           continue;
 895         }
 896         // Set energy thresholds
 897         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
 898           if(cut[kz]>=0) {
 899             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
 900                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
 901             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
 902           }
 903         }
 904         // Set transport mechanisms
 905         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
 906           if(flag[kz]>=0) {
 907             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
 908                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
 909             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 910           }
 911         }
 912       } else {
 913         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
 914         continue;
 915       }
 916     } else {
 917       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
 918       continue;
 919     }
 920   }
 921 }
 922
 923 //_______________________________________________________________________
 924 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
 925 {
 926   //
 927   // Sets the file name for transport parameters
 928   //
 929   fTransParName = filename;
 930 }
 931
 932 //_______________________________________________________________________
 933 void AliMC::Browse(TBrowser *b)
 934 {
 935   //
 936   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 937   // of the Root browser.
 938   // It displays the Root Trees and all detectors.
 939   //
 940   //detectors are in folders anyway
 941   b->Add(fMCQA,"AliMCQA");
 942 }
 943
 944 //_______________________________________________________________________
 945 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 946 {
 947   //
 948   //  Add a hit to detector id
 949   //
 950   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 951   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 952 }
 953
 954 //_______________________________________________________________________
 955 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 956 {
 957   //
 958   // Add digit to detector id
 959   //
 960   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 961   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 962 }
 963
 964 //_______________________________________________________________________
 965 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
 966   //
 967   // Returns current track
 968   //
 969   return gAlice->GetRunLoader()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
 970 }
 971
 972 //_______________________________________________________________________
 973 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
 974 {
 975   //
 976   // Dumps particle i in the stack
 977   //
 978   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 979    if (runloader->Stack())
 980     runloader->Stack()->DumpPart(i);
 981 }
 982
 983 //_______________________________________________________________________
 984 void AliMC::DumpPStack () const
 985 {
 986   //
 987   // Dumps the particle stack
 988   //
 989   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 990    if (runloader->Stack())
 991     runloader->Stack()->DumpPStack();
 992 }
 993
 994 //_______________________________________________________________________
 995 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
 996   //
 997   // Returns number of tracks in stack
 998   //
 999   Int_t ntracks = -1;
1000   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1001    if (runloader->Stack())
1002      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
1003    return ntracks;
1004 }
1005
1006 //_______________________________________________________________________
1007 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
1008 {
1009   //
1010   // return number of primary that has generated track
1011   //
1012   Int_t nprimary = -999;
1013   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1014   if (runloader->Stack())
1015     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
1016   return nprimary;
1017 }
1018
1019 //_______________________________________________________________________
1020 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
1021 {
1022   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
1023   // the remaping done by PurifyKine
1024   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1025   if (runloader)
1026    if (runloader->Stack())
1027     return runloader->Stack()->Particle(i);
1028   return 0x0;
1029 }
1030
1031 //_______________________________________________________________________
1032 TObjArray* AliMC::Particles() const {
1033   //
1034   // Returns pointer to Particles array
1035   //
1036   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1037   if (runloader)
1038    if (runloader->Stack())
1039     return runloader->Stack()->Particles();
1040   return 0x0;
1041 }
1042
1043 //_______________________________________________________________________
1044 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
1045                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
1046                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1047 {
1048 // Delegate to stack
1049 //
1050   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1051   if (runloader)
1052     if (runloader->Stack())
1053       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
1054                                     mech, ntr, weight, is);
1055 }
1056
1057 //_______________________________________________________________________
1058 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
1059                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
1060                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
1061                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
1062                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1063 {
1064   // Delegate to stack
1065   //
1066   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1067   if (runloader)
1068     if (runloader->Stack())
1069       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
1070                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
1071 }
1072
1073 //_______________________________________________________________________
1074 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
1075 {
1076     //
1077     // Set high water mark for last track in event
1078   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1079   if (runloader)
1080     if (runloader->Stack())
1081       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
1082 }
1083
1084 //_______________________________________________________________________
1085 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
1086 {
1087   //
1088   // Delegate to stack
1089   //
1090   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1091   if (runloader)
1092     if (runloader->Stack())
1093       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
1094 }
1095
1096 //_______________________________________________________________________
1097 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
1098 {
1099   // Delegate to stack
1100   //
1101   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1102   if (runloader)
1103     if (runloader->Stack())
1104       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
1105 }
1106
1107 //_______________________________________________________________________
1108 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
1109 {
1110   //
1111   // Set current track number
1112   //
1113   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1114   if (runloader)
1115     if (runloader->Stack())
1116       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
1117 }
1118
1119 //_______________________________________________________________________
1120 AliTrackReference*  AliMC::AddTrackReference(Int_t label, Int_t id)
1121 {
1122   //
1123   // add a trackrefernce to the list
1124   if (!fTrackReferences) {
1125     AliError("Container trackrefernce not active");
1126     return NULL;
1127   }
1128   Int_t primary = GetPrimary(label);
1129   Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
1130
1131   Int_t nref = fTmpTrackReferences->GetEntriesFast();
1132   TClonesArray &lref = *fTmpTrackReferences;
1133   return new(lref[nref]) AliTrackReference(label, id);
1134 }
1135
1136
1137
1138 //_______________________________________________________________________
1139 void AliMC::ResetTrackReferences()
1140 {
1141   //
1142   //  Reset all  references
1143   //
1144   if (fTmpTrackReferences)   fTmpTrackReferences->Clear();
1145 }
1146
1147 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(Int_t *map)
1148 {
1149   //
1150   // Remapping track reference
1151   // Called at finish primary
1152   //
1153   if (!fTmpTrackReferences) return;
1154   Int_t nEntries = fTmpTrackReferences->GetEntries();
1155   for (Int_t i=0; i < nEntries; i++){
1156       AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTmpTrackReferences->UncheckedAt(i));
1157       if (ref) {
1158           Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1159           if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1160           else {
1161               ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1162               fTmpTrackReferences->RemoveAt(i);
1163           }
1164       } // if ref
1165   }
1166   fTmpTrackReferences->Compress();
1167 }
1168
1169 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1170 {
1171     //
1172     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1173     //
1174
1175     TLorentzVector p;
1176     gMC->TrackMomentum(p);
1177     Double_t tmin, tmax;
1178     Double_t b;
1179
1180     // Transverse velocity
1181     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1182
1183     if ((b = gAlice->Field()->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1184
1185         // Radius of helix
1186
1187         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1188
1189         // Revolution frequency
1190
1191         Double_t omega = vt / rho;
1192
1193         // Maximum and minimum decay time
1194         //
1195         // Check for curlers first
1196         if (fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2. > 1.) return;
1197
1198         //
1199
1200         tmax  = TMath::ACos(1. - fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1201         tmin  = TMath::ACos(1. - fRDecayMin * fRDecayMin / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1202     } else {
1203         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct]
1204         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1205     }
1206
1207     //
1208     // Dial t using the two limits
1209     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1210     //
1211     //
1212     // Force decay time in transport code
1213     //
1214     gMC->ForceDecayTime(t / 2.99792458e10);
1215 }
1216
1217 void AliMC::MakeTmpTrackRefsTree()
1218 {
1219     // Make the temporary track reference tree
1220     fTmpFileTR = new TFile("TrackRefsTmp.root", "recreate");
1221     fTmpTreeTR = new TTree("TreeTR", "Track References");
1222     if (!fTmpTrackReferences)  fTmpTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference", 100);
1223     fTmpTreeTR->Branch("TrackReferences", "TClonesArray", &fTmpTrackReferences, 4000);
1224 }
1225
1226 void AliMC::ReorderAndExpandTreeTR()
1227 {
1228 //
1229 //  Reorder and expand the temporary track reference tree in order to match the kinematics tree
1230 //
1231
1232     AliRunLoader *rl = gAlice->GetRunLoader();
1233 //
1234 //  TreeTR
1235     AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
1236     rl->MakeTrackRefsContainer();
1237     TTree * treeTR = rl->TreeTR();
1238     if (treeTR){
1239         // make branch for central track references
1240         if (!fTrackReferences) fTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference",0);
1241         TBranch *branch;
1242         branch = treeTR->Branch("TrackReferences",&fTrackReferences);
1243         branch->SetAddress(&fTrackReferences);
1244     }
1245
1246     AliStack* stack  = rl->Stack();
1247     Int_t np = stack->GetNprimary();
1248     Int_t nt = fTmpTreeTR->GetEntries();
1249     //
1250     // Loop over tracks and find the secondaries with the help of the kine tree
1251     Int_t ifills = 0;
1252     Int_t it = 0;
1253     for (Int_t ip = np - 1; ip > -1; ip--) {
1254         TParticle *part = stack->Particle(ip);
1255 //      printf("Particle %5d %5d %5d %5d %5d \n", ip, part->GetPdgCode(), part->GetFirstMother(), part->GetFirstDaughter(), part->GetLastDaughter());
1256
1257         // Skip primaries that have not been transported
1258         Int_t dau1  = part->GetFirstDaughter();
1259         Int_t dau2  = -1;
1260         // if ((dau1 > -1 && dau1 < np) || part->GetStatusCode() > 1) continue;
1261         if (!part->TestBit(kTransportBit)) continue;
1262         //
1263         fTmpTreeTR->GetEntry(it++);
1264         Int_t nh = fTmpTrackReferences->GetEntries();
1265         // Determine range of secondaries produced by this primary
1266         if (dau1 > -1) {
1267             Int_t inext = ip - 1;
1268             while (dau2 < 0) {
1269                 if (inext >= 0) {
1270                     part = stack->Particle(inext);
1271                     dau2 =  part->GetFirstDaughter();
1272                     if (dau2 == -1 || dau2 < np) {
1273                         dau2 = -1;
1274                     } else {
1275                         dau2--;
1276                     }
1277                 } else {
1278                     dau2 = stack->GetNtrack() - 1;
1279                 }
1280                 inext--;
1281             } // find upper bound
1282         }  // dau2 < 0
1283 //      printf("Check (1) %5d %5d %5d %5d %5d \n", ip, np, it, dau1, dau2);
1284
1285         //
1286         // Loop over reference hits and find secondary label
1287         for (Int_t id = dau1; (id <= dau2) && (dau1 > -1); id++) {
1288             for (Int_t ih = 0; ih < nh; ih++) {
1289                 AliTrackReference* tr = (AliTrackReference*) fTmpTrackReferences->At(ih);
1290                 Int_t label = tr->Label();
1291                 // Skip primaries
1292                 if (label == ip) continue;
1293                 if (label > dau2 || label < dau1)
1294                     AliWarning(Form("Track Reference Label out of range !: %5d %5d %5d \n", label, dau1, dau2));
1295                 if (label == id) {
1296                     // secondary found
1297                     Int_t nref =  fTrackReferences->GetEntriesFast();
1298                     TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1299                     new(lref[nref]) AliTrackReference(*tr);
1300                 }
1301             } // hits
1302             treeTR->Fill();
1303             fTrackReferences->Clear();
1304             ifills++;
1305         } // daughters
1306     } // tracks
1307     //
1308     // Now loop again and write the primaries
1309     it = nt - 1;
1310     for (Int_t ip = 0; ip < np; ip++) {
1311         TParticle* part = stack->Particle(ip);
1312 //      if ((part->GetFirstDaughter() == -1 && part->GetStatusCode() <= 1) || part->GetFirstDaughter() >= np)
1313         if (part->TestBit(kTransportBit))
1314         {
1315             // Skip particles that have not been transported
1316             fTmpTreeTR->GetEntry(it--);
1317             Int_t nh = fTmpTrackReferences->GetEntries();
1318             //
1319             // Loop over reference hits and find primary labels
1320             for (Int_t ih = 0; ih < nh; ih++) {
1321                 AliTrackReference* tr = (AliTrackReference*)  fTmpTrackReferences->At(ih);
1322                 Int_t label = tr->Label();
1323                 if (label == ip) {
1324                     Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
1325                     TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1326                     new(lref[nref]) AliTrackReference(*tr);
1327                 }
1328             }
1329         }
1330         treeTR->Fill();
1331         fTrackReferences->Clear();
1332         ifills++;
1333     } // tracks
1334     // Check
1335     if (ifills != stack->GetNtrack())
1336         AliWarning(Form("Number of entries in TreeTR (%5d) unequal to TreeK (%5d) \n", ifills, stack->GetNtrack()));
1337 //
1338 //  Clean-up
1339     delete fTmpTreeTR;
1340     fTmpFileTR->Close();
1341     delete fTmpFileTR;
1342     delete fTmpTrackReferences;
1343     fTmpTrackReferences = 0;
1344     gSystem->Exec("rm -rf TrackRefsTmp.root");
1345 }
1346