STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <RVersion.h>
  25 #include <TBrowser.h>
  26 #include <TClonesArray.h>
  27 #include <TGeoManager.h>
  28 #include <TStopwatch.h>
  29 #include <TSystem.h>
  30 #include <TVirtualMC.h>
  31 #include <TROOT.h>
  32
  33 #include "AliLog.h"
  34 #include "AliDetector.h"
  35 #include "AliGenerator.h"
  36 #include "AliHeader.h"
  37 #include "AliLego.h"
  38 #include "AliMC.h"
  39 #include "AliMCQA.h"
  40 #include "AliRun.h"
  41 #include "AliHit.h"
  42 #include "AliStack.h"
  43 #include "AliMagF.h"
  44 #include "AliTrackReference.h"
  45 #include "AliSimulation.h"
  46 #include "AliGeomManager.h"
  47 #include "AliCDBManager.h"
  48 #include "AliCDBStorage.h"
  49 #include "AliCDBEntry.h"
  50
  51
  52 ClassImp(AliMC)
  53
  54 //_______________________________________________________________________
  55 AliMC::AliMC() :
  56   fGenerator(0),
  57   fEventEnergy(0),
  58   fSummEnergy(0),
  59   fSum2Energy(0),
  60   fTrRmax(1.e10),
  61   fTrZmax(1.e10),
  62   fRDecayMax(1.e10),
  63   fRDecayMin(-1.),
  64   fDecayPdg(0),
  65   fImedia(0),
  66   fTransParName("\0"),
  67   fMCQA(0),
  68   fHitLists(0),
  69   fTrackReferences(0)
  70
  71 {
  72   //default constructor
  73   DecayLimits();
  74 }
  75
  76 //_______________________________________________________________________
  77 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  78   TVirtualMCApplication(name, title),
  79   fGenerator(0),
  80   fEventEnergy(0),
  81   fSummEnergy(0),
  82   fSum2Energy(0),
  83   fTrRmax(1.e10),
  84   fTrZmax(1.e10),
  85   fRDecayMax(1.e10),
  86   fRDecayMin(-1.),
  87   fDecayPdg(0),
  88   fImedia(new TArrayI(1000)),
  89   fTransParName("\0"),
  90   fMCQA(0),
  91   fHitLists(new TList()),
  92   fTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100))
  93 {
  94   //constructor
  95   // Set transport parameters
  96   SetTransPar();
  97   DecayLimits();
  98   // Prepare the tracking medium lists
  99   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
 100 }
 101
 102 //_______________________________________________________________________
 103 AliMC::AliMC(const AliMC &mc) :
 104   TVirtualMCApplication(mc),
 105   fGenerator(0),
 106   fEventEnergy(0),
 107   fSummEnergy(0),
 108   fSum2Energy(0),
 109   fTrRmax(1.e10),
 110   fTrZmax(1.e10),
 111   fRDecayMax(1.e10),
 112   fRDecayMin(-1.),
 113   fDecayPdg(0),
 114   fImedia(0),
 115   fTransParName("\0"),
 116   fMCQA(0),
 117   fHitLists(0),
 118   fTrackReferences(0)
 119 {
 120   //
 121   // Copy constructor for AliMC
 122   //
 123   mc.Copy(*this);
 124 }
 125
 126 //_______________________________________________________________________
 127 AliMC::~AliMC()
 128 {
 129   //destructor
 130   delete fGenerator;
 131   delete fImedia;
 132   delete fMCQA;
 133   delete fHitLists;
 134   // Delete track references
 135   if (fTrackReferences) {
 136     fTrackReferences->Delete();
 137     delete fTrackReferences;
 138     fTrackReferences     = 0;
 139   }
 140
 141 }
 142
 143 //_______________________________________________________________________
 144 void AliMC::Copy(TObject &) const
 145 {
 146   //dummy Copy function
 147   AliFatal("Not implemented!");
 148 }
 149
 150 //_______________________________________________________________________
 151 void  AliMC::ConstructGeometry()
 152 {
 153   //
 154   // Either load geometry from file or create it through usual
 155   // loop on detectors. In the first case the method
 156   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
 157   // at InitGeometry().
 158   //
 159
 160   if(gAlice->IsRootGeometry()){ //load geometry either from CDB or from file
 161     if(gAlice->IsGeomFromCDB()){
 162       AliInfo("Loading geometry from CDB default storage");
 163       AliCDBPath path("GRP","Geometry","Data");
 164       AliCDBEntry *entry=AliCDBManager::Instance()->Get(path.GetPath());
 165       if(!entry) AliFatal("Unable to load geometry from CDB!");
 166       entry->SetOwner(0);
 167       gGeoManager = (TGeoManager*) entry->GetObject();
 168       if (!gGeoManager) AliFatal("TGeoManager object not found in the specified CDB entry!");
 169     }else{
 170       // Load geometry
 171       const char *geomfilename = gAlice->GetGeometryFileName();
 172       if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
 173         AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s",geomfilename));
 174         TGeoManager::Import(geomfilename);
 175       }else{
 176         AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
 177         return;
 178       }
 179     }
 180   }else{
 181     // Create modules, materials, geometry
 182     TStopwatch stw;
 183     TIter next(gAlice->Modules());
 184     AliModule *detector;
 185     AliDebug(1, "Geometry creation:");
 186     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 187       stw.Start();
 188       // Initialise detector materials and geometry
 189       detector->CreateMaterials();
 190       detector->CreateGeometry();
 191       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 192                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 193     }
 194   }
 195
 196 }
 197
 198 //_______________________________________________________________________
 199 Bool_t  AliMC::MisalignGeometry()
 200 {
 201 // Call misalignment code if AliSimulation object was defined.
 202
 203    if(!gAlice->IsRootGeometry()){
 204      //Set alignable volumes for the whole geometry
 205      SetAllAlignableVolumes();
 206    }
 207    // Misalign geometry via AliSimulation instance
 208    if (!AliSimulation::GetInstance()) return kFALSE;
 209    AliGeomManager::SetGeometry(gGeoManager);
 210    return AliSimulation::GetInstance()->MisalignGeometry(gAlice->GetRunLoader());
 211 }
 212
 213 //_______________________________________________________________________
 214 void  AliMC::ConstructOpGeometry()
 215 {
 216   //
 217   // Loop all detector modules and call DefineOpticalProperties() method
 218   //
 219
 220   TIter next(gAlice->Modules());
 221   AliModule *detector;
 222   AliInfo("Optical properties definition");
 223   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 224     // Initialise detector optical properties
 225     detector->DefineOpticalProperties();
 226   }
 227 }
 228
 229 //_______________________________________________________________________
 230 void  AliMC::InitGeometry()
 231 {
 232   //
 233   // Initialize detectors
 234   //
 235
 236   AliInfo("Initialisation:");
 237   TStopwatch stw;
 238   TIter next(gAlice->Modules());
 239   AliModule *detector;
 240   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 241     stw.Start();
 242     // Initialise detector geometry
 243     if(gAlice->IsRootGeometry()) detector->CreateMaterials();
 244     detector->Init();
 245     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 246                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 247   }
 248 }
 249
 250 //_______________________________________________________________________
 251 void  AliMC::SetAllAlignableVolumes()
 252 {
 253   //
 254   // Add alignable volumes (TGeoPNEntries) looping on all
 255   // active modules
 256   //
 257
 258   AliInfo(Form("Setting entries for all alignable volumes of active detectors"));
 259   AliModule *detector;
 260   TIter next(gAlice->Modules());
 261   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 262     detector->AddAlignableVolumes();
 263   }
 264 }
 265
 266 //_______________________________________________________________________
 267 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 268 {
 269   //
 270   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 271   //
 272
 273   Generator()->Generate();
 274 }
 275
 276 //_______________________________________________________________________
 277 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 278 {
 279   //
 280   // Load the event generator
 281   //
 282   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 283 }
 284
 285 //_______________________________________________________________________
 286 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 287 {
 288   //
 289   // Load the event generator
 290   //
 291   if(fGenerator) {
 292     if(generator) {
 293       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
 294                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()));
 295     }
 296     else {
 297       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
 298                       fGenerator->GetName()));
 299     }
 300   }
 301   fGenerator = generator;
 302 }
 303
 304 //_______________________________________________________________________
 305 void AliMC::FinishRun()
 306 {
 307   // Clean generator information
 308   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
 309   fGenerator->FinishRun();
 310
 311   //Output energy summary tables
 312   AliDebug(1, "EnergySummary()");
 313   ToAliDebug(1, EnergySummary());
 314 }
 315
 316 //_______________________________________________________________________
 317 void AliMC::BeginPrimary()
 318 {
 319   //
 320   // Called  at the beginning of each primary track
 321   //
 322
 323   // Reset Hits info
 324   ResetHits();
 325   ResetTrackReferences();
 326
 327 }
 328
 329 //_______________________________________________________________________
 330 void AliMC::PreTrack()
 331 {
 332   // Actions before the track's transport
 333      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 334      AliModule *module;
 335
 336      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 337        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 338          module->PreTrack();
 339
 340      fMCQA->PreTrack();
 341 }
 342
 343 //_______________________________________________________________________
 344 void AliMC::Stepping()
 345 {
 346   //
 347   // Called at every step during transport
 348   //
 349
 350   Int_t id = DetFromMate(gMC->CurrentMedium());
 351   if (id < 0) return;
 352
 353
 354   if ( gMC->IsNewTrack()            &&
 355        gMC->TrackTime() == 0.       &&
 356        fRDecayMin >= 0.             &&
 357        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
 358        gMC->TrackPid() == fDecayPdg )
 359   {
 360       FixParticleDecaytime();
 361   }
 362
 363
 364
 365   //
 366   // --- If lego option, do it and leave
 367   if (gAlice->Lego())
 368     gAlice->Lego()->StepManager();
 369   else {
 370     Int_t copy;
 371     //Update energy deposition tables
 372     AddEnergyDeposit(gMC->CurrentVolID(copy),gMC->Edep());
 373     //
 374     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 375     if (gMC->IsTrackDisappeared()) {
 376         if (gMC->Etot()>0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber());
 377     }
 378
 379     //Call the appropriate stepping routine;
 380     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 381     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 382       if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) fMCQA->StepManager(id);
 383       det->StepManager();
 384     }
 385   }
 386 }
 387
 388 //_______________________________________________________________________
 389 void AliMC::EnergySummary()
 390 {
 391   //
 392   // Print summary of deposited energy
 393   //
 394
 395   Int_t ndep=0;
 396   Float_t edtot=0;
 397   Float_t ed, ed2;
 398   Int_t kn, i, left, j, id;
 399   const Float_t kzero=0;
 400   Int_t ievent=gAlice->GetRunLoader()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 401   //
 402   // Energy loss information
 403   if(ievent) {
 404     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 405     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 406       ed=fSummEnergy[kn];
 407       if(ed>0) {
 408         fEventEnergy[ndep]=kn;
 409         if(ievent>1) {
 410           ed=ed/ievent;
 411           ed2=fSum2Energy[kn];
 412           ed2=ed2/ievent;
 413           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 414         } else
 415           ed2=99;
 416         fSummEnergy[ndep]=ed;
 417         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 418         edtot+=ed;
 419         ndep++;
 420       }
 421     }
 422     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 423       left=ndep-kn*3;
 424       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 425         j=kn*3+i;
 426         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 427         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 428       }
 429       printf("\n");
 430     }
 431     //
 432     // Relative energy loss in different detectors
 433     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 434     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 435     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 436       left=ndep-kn*5;
 437       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 438         j=kn*5+i;
 439         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 440         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 441       }
 442       printf("\n");
 443     }
 444     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 445     printf("\n");
 446   }
 447   //
 448   // Reset the TArray's
 449   //  fEventEnergy.Set(0);
 450   //  fSummEnergy.Set(0);
 451   //  fSum2Energy.Set(0);
 452 }
 453
 454 //_____________________________________________________________________________
 455 void AliMC::BeginEvent()
 456 {
 457   //
 458   // Clean-up previous event
 459   // Energy scores
 460   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 461   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 462   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 463   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
 464   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 465   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 466   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 467
 468     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 469
 470   /*******************************/
 471   /*   Clean after eventual      */
 472   /*   previous event            */
 473   /*******************************/
 474
 475
 476   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 477   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 478   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 479   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
 480
 481   fEventEnergy.Reset();
 482     // Clean detector information
 483
 484   if (runloader->Stack())
 485     runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 486   else
 487     runloader->MakeStack();//or make a new one
 488
 489   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 490    {
 491      AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
 492      runloader->MakeTree("K");
 493    }
 494
 495   AliDebug(1, "gMC->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 496   gMC->SetStack(gAlice->GetRunLoader()->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 497                                      //because we don't have guarantee that
 498                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 499                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 500   //
 501   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 502   //
 503
 504   runloader->GetHeader()->Reset(gAlice->GetRunNumber(),gAlice->GetEvNumber(),
 505     gAlice->GetEventNrInRun());
 506 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 507
 508   if(gAlice->Lego())
 509    {
 510     gAlice->Lego()->BeginEvent();
 511     return;
 512    }
 513
 514
 515   AliDebug(1, "ResetHits()");
 516   ResetHits();
 517
 518   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
 519   runloader->MakeTree("H");
 520
 521   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
 522   runloader->MakeTrackRefsContainer();//for insurance
 523
 524
 525   //create new branches and SetAdresses
 526   TIter next(gAlice->Modules());
 527   AliModule *detector;
 528   while((detector = (AliModule*)next()))
 529    {
 530     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
 531     detector->MakeBranch("H");
 532     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranchTR()",detector->GetName()));
 533     detector->MakeBranchTR();
 534     AliDebug(2, Form("%s->SetTreeAddress()",detector->GetName()));
 535     detector->SetTreeAddress();
 536    }
 537   // make branch for AliRun track References
 538   TTree * treeTR = runloader->TreeTR();
 539   if (treeTR){
 540     // make branch for central track references
 541     if (!fTrackReferences) fTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference",0);
 542     TBranch *branch;
 543     branch = treeTR->Branch("AliRun",&fTrackReferences);
 544     branch->SetAddress(&fTrackReferences);
 545   }
 546   //
 547 }
 548
 549 //_______________________________________________________________________
 550 void AliMC::ResetHits()
 551 {
 552   //
 553   //  Reset all Detectors hits
 554   //
 555   TIter next(gAlice->Modules());
 556   AliModule *detector;
 557   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 558      detector->ResetHits();
 559   }
 560 }
 561
 562 //_______________________________________________________________________
 563 void AliMC::PostTrack()
 564 {
 565   // Posts tracks for each module
 566   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 567   AliModule *module;
 568
 569   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 570     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 571       module->PostTrack();
 572 }
 573
 574 //_______________________________________________________________________
 575 void AliMC::FinishPrimary()
 576 {
 577   //
 578   // Called  at the end of each primary track
 579   //
 580   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 581   //  static Int_t count=0;
 582   //  const Int_t times=10;
 583   // This primary is finished, purify stack
 584 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
 585   if (!(gMC->SecondariesAreOrdered())) {
 586       runloader->Stack()->ReorderKine();
 587       RemapHits();
 588   }
 589 #endif
 590   runloader->Stack()->PurifyKine();
 591   RemapHits();
 592
 593   TIter next(gAlice->Modules());
 594   AliModule *detector;
 595   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 596     detector->FinishPrimary();
 597     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
 598     if(loader)
 599      {
 600        TTree* treeH = loader->TreeH();
 601        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
 602      }
 603   }
 604
 605   // Write out track references if any
 606   if (runloader->TreeTR()) runloader->TreeTR()->Fill();
 607 }
 608
 609 void AliMC::RemapHits()
 610 {
 611 //
 612 // Remaps the track labels of the hits
 613     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 614     AliStack* stack = runloader->Stack();
 615     TList* hitLists = GetHitLists();
 616     TIter next(hitLists);
 617     TCollection *hitList;
 618
 619     while((hitList = dynamic_cast<TCollection*>(next()))) {
 620         TIter nexthit(hitList);
 621         AliHit *hit;
 622         while((hit = dynamic_cast<AliHit*>(nexthit()))) {
 623             hit->SetTrack(stack->TrackLabel(hit->GetTrack()));
 624         }
 625     }
 626
 627     //
 628     // This for detectors which have a special mapping mechanism
 629     // for hits, such as TPC and TRD
 630     //
 631
 632     TObjArray* modules = gAlice->Modules();
 633     TIter nextmod(modules);
 634     AliModule *detector;
 635     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(nextmod()))) {
 636         detector->RemapTrackHitIDs(stack->TrackLabelMap());
 637         detector->RemapTrackReferencesIDs(stack->TrackLabelMap());
 638     }
 639     //
 640     RemapTrackReferencesIDs(stack->TrackLabelMap());
 641 }
 642
 643 //_______________________________________________________________________
 644 void AliMC::FinishEvent()
 645 {
 646   //
 647   // Called at the end of the event.
 648   //
 649
 650   //
 651
 652   if(gAlice->Lego()) gAlice->Lego()->FinishEvent();
 653
 654   TIter next(gAlice->Modules());
 655   AliModule *detector;
 656   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 657     detector->FinishEvent();
 658   }
 659
 660   //Update the energy deposit tables
 661   Int_t i;
 662   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
 663    {
 664     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
 665     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
 666    }
 667
 668   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 669
 670   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
 671   AliStack* stack = runloader->Stack();
 672   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
 673    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
 674     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
 675     return;//never reached
 676    }
 677   // Update Header information
 678   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
 679   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
 680
 681
 682   // Write out the kinematics
 683   if (!gAlice->Lego()) stack->FinishEvent();
 684
 685   // Write out the event Header information
 686   TTree* treeE = runloader->TreeE();
 687   if (treeE)
 688    {
 689       header->SetStack(stack);
 690       treeE->Fill();
 691    }
 692   else
 693    {
 694     AliError("Can not get TreeE from RL");
 695    }
 696
 697   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 698    {
 699      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
 700      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
 701      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
 702    }
 703
 704   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 705   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 706   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 707   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
 708   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 709   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 710   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 711 }
 712
 713 //_______________________________________________________________________
 714 void AliMC::Field(const Double_t* x, Double_t* b) const
 715 {
 716   // Calculates field "b" at point "x"
 717     gAlice->Field(x,b);
 718 }
 719
 720 //_______________________________________________________________________
 721 void AliMC::Init()
 722 {
 723   // MC initialization
 724
 725    //=================Create Materials and geometry
 726    gMC->Init();
 727   // Set alignable volumes for the whole geometry (with old root)
 728 #if ROOT_VERSION_CODE < 331527
 729   SetAllAlignableVolumes();
 730 #endif
 731    //Read the cuts for all materials
 732    ReadTransPar();
 733    //Build the special IMEDIA table
 734    MediaTable();
 735
 736    //Compute cross-sections
 737    gMC->BuildPhysics();
 738
 739    //Initialise geometry deposition table
 740    fEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 741    fSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 742    fSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 743
 744    //
 745    fMCQA = new AliMCQA(gAlice->GetNdets());
 746
 747    // Register MC in configuration
 748    AliConfig::Instance()->Add(gMC);
 749
 750 }
 751
 752 //_______________________________________________________________________
 753 void AliMC::MediaTable()
 754 {
 755   //
 756   // Built media table to get from the media number to
 757   // the detector id
 758   //
 759
 760   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 761   //  Int_t ibeg;
 762   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 763   AliModule *det;
 764   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
 765   //
 766   // For all detectors
 767   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
 768     // If detector is defined
 769     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
 770         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 771         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 772
 773         // Find max and min material number
 774         if((idt=idtmed[nz])) {
 775           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 776           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 777         }
 778       }
 779       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 780         det->LoMedium() = 0;
 781         det->HiMedium() = 0;
 782       } else {
 783         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 784           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
 785                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
 786           return;
 787         }
 788         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 789         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 790           (*fImedia)[lz]=kz;
 791         }
 792       }
 793     }
 794   }
 795   //
 796   // Print summary table
 797   AliInfo("Tracking media ranges:");
 798   ToAliInfo(
 799   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
 800     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
 801       ind=i*6+k;
 802       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
 803       if(det)
 804         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 805                det->HiMedium());
 806       else
 807         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 808     }
 809     printf("\n");
 810   }
 811   )
 812 }
 813
 814 //_______________________________________________________________________
 815 void AliMC::ReadTransPar()
 816 {
 817   //
 818   // Read filename to set the transport parameters
 819   //
 820
 821
 822   const Int_t kncuts=10;
 823   const Int_t knflags=11;
 824   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
 825   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 826                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 827                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 828                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 829   char line[256];
 830   char detName[7];
 831   char* filtmp;
 832   Float_t cut[kncuts];
 833   Int_t flag[knflags];
 834   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 835   FILE *lun;
 836   //
 837   // See whether the file is there
 838   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
 839   lun=fopen(filtmp,"r");
 840   delete [] filtmp;
 841   if(!lun) {
 842     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
 843     return;
 844   }
 845   //
 846   while(1) {
 847     // Initialise cuts and flags
 848     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
 849     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
 850     itmed=0;
 851     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 852     // Read up to the end of line excluded
 853     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 854     if(iret<0) {
 855       //End of file
 856       fclose(lun);
 857       return;
 858     }
 859     // Read the end of line
 860     fscanf(lun,"%*c");
 861     if(!iret) continue;
 862     if(line[0]=='*') continue;
 863     // Read the numbers
 864     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 865                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 866                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 867                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 868     if(!iret) continue;
 869     if(iret<0) {
 870       //reading error
 871       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
 872       continue;
 873     }
 874     // Check that the module exist
 875     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
 876     if(mod) {
 877       // Get the array of media numbers
 878       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 879       // Check that the tracking medium code is valid
 880       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 881         ktmed=idtmed[itmed];
 882         if(!ktmed) {
 883           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
 884           continue;
 885         }
 886         // Set energy thresholds
 887         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
 888           if(cut[kz]>=0) {
 889             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
 890                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
 891             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
 892           }
 893         }
 894         // Set transport mechanisms
 895         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
 896           if(flag[kz]>=0) {
 897             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
 898                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
 899             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 900           }
 901         }
 902       } else {
 903         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
 904         continue;
 905       }
 906     } else {
 907       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
 908       continue;
 909     }
 910   }
 911 }
 912
 913 //_______________________________________________________________________
 914 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
 915 {
 916   //
 917   // Sets the file name for transport parameters
 918   //
 919   fTransParName = filename;
 920 }
 921
 922 //_______________________________________________________________________
 923 void AliMC::Browse(TBrowser *b)
 924 {
 925   //
 926   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 927   // of the Root browser.
 928   // It displays the Root Trees and all detectors.
 929   //
 930   //detectors are in folders anyway
 931   b->Add(fMCQA,"AliMCQA");
 932 }
 933
 934 //_______________________________________________________________________
 935 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 936 {
 937   //
 938   //  Add a hit to detector id
 939   //
 940   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 941   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 942 }
 943
 944 //_______________________________________________________________________
 945 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 946 {
 947   //
 948   // Add digit to detector id
 949   //
 950   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 951   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 952 }
 953
 954 //_______________________________________________________________________
 955 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
 956   //
 957   // Returns current track
 958   //
 959   return gAlice->GetRunLoader()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
 960 }
 961
 962 //_______________________________________________________________________
 963 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
 964 {
 965   //
 966   // Dumps particle i in the stack
 967   //
 968   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 969    if (runloader->Stack())
 970     runloader->Stack()->DumpPart(i);
 971 }
 972
 973 //_______________________________________________________________________
 974 void AliMC::DumpPStack () const
 975 {
 976   //
 977   // Dumps the particle stack
 978   //
 979   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 980    if (runloader->Stack())
 981     runloader->Stack()->DumpPStack();
 982 }
 983
 984 //_______________________________________________________________________
 985 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
 986   //
 987   // Returns number of tracks in stack
 988   //
 989   Int_t ntracks = -1;
 990   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 991    if (runloader->Stack())
 992      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
 993    return ntracks;
 994 }
 995
 996 //_______________________________________________________________________
 997 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
 998 {
 999   //
1000   // return number of primary that has generated track
1001   //
1002   Int_t nprimary = -999;
1003   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1004   if (runloader->Stack())
1005     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
1006   return nprimary;
1007 }
1008
1009 //_______________________________________________________________________
1010 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
1011 {
1012   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
1013   // the remaping done by PurifyKine
1014   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1015   if (runloader)
1016    if (runloader->Stack())
1017     return runloader->Stack()->Particle(i);
1018   return 0x0;
1019 }
1020
1021 //_______________________________________________________________________
1022 TObjArray* AliMC::Particles() const {
1023   //
1024   // Returns pointer to Particles array
1025   //
1026   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1027   if (runloader)
1028    if (runloader->Stack())
1029     return runloader->Stack()->Particles();
1030   return 0x0;
1031 }
1032
1033 //_______________________________________________________________________
1034 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
1035                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
1036                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1037 {
1038 // Delegate to stack
1039 //
1040   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1041   if (runloader)
1042     if (runloader->Stack())
1043       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
1044                                     mech, ntr, weight, is);
1045 }
1046
1047 //_______________________________________________________________________
1048 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
1049                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
1050                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
1051                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
1052                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1053 {
1054   // Delegate to stack
1055   //
1056   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1057   if (runloader)
1058     if (runloader->Stack())
1059       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
1060                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
1061 }
1062
1063 //_______________________________________________________________________
1064 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
1065 {
1066     //
1067     // Set high water mark for last track in event
1068   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1069   if (runloader)
1070     if (runloader->Stack())
1071       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
1072 }
1073
1074 //_______________________________________________________________________
1075 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
1076 {
1077   //
1078   // Delegate to stack
1079   //
1080   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1081   if (runloader)
1082     if (runloader->Stack())
1083       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
1084 }
1085
1086 //_______________________________________________________________________
1087 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
1088 {
1089   // Delegate to stack
1090   //
1091   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1092   if (runloader)
1093     if (runloader->Stack())
1094       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
1095 }
1096
1097 //_______________________________________________________________________
1098 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
1099 {
1100   //
1101   // Set current track number
1102   //
1103   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1104   if (runloader)
1105     if (runloader->Stack())
1106       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
1107 }
1108
1109 //_______________________________________________________________________
1110 void  AliMC::AddTrackReference(Int_t label){
1111   //
1112   // add a trackrefernce to the list
1113   if (!fTrackReferences) {
1114     AliError("Container trackrefernce not active");
1115     return;
1116   }
1117   Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
1118   TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1119   new(lref[nref]) AliTrackReference(label);
1120 }
1121
1122
1123
1124 //_______________________________________________________________________
1125 void AliMC::ResetTrackReferences()
1126 {
1127   //
1128   //  Reset all  references
1129   //
1130   if (fTrackReferences)   fTrackReferences->Clear();
1131
1132   TIter next(gAlice->Modules());
1133   AliModule *detector;
1134   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1135      detector->ResetTrackReferences();
1136   }
1137 }
1138
1139 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(Int_t *map)
1140 {
1141   //
1142   // Remapping track reference
1143   // Called at finish primary
1144   //
1145   if (!fTrackReferences) return;
1146   Int_t nEntries = fTrackReferences->GetEntries();
1147   for (Int_t i=0; i < nEntries; i++){
1148       AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTrackReferences->UncheckedAt(i));
1149       if (ref) {
1150           Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1151           if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1152           else {
1153               ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1154               fTrackReferences->RemoveAt(i);
1155           }
1156       } // if ref
1157   }
1158   fTrackReferences->Compress();
1159 }
1160
1161 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1162 {
1163     //
1164     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1165     //
1166
1167     TLorentzVector p;
1168     gMC->TrackMomentum(p);
1169     Double_t tmin, tmax;
1170     Double_t b;
1171
1172     // Transverse velocity
1173     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1174
1175     if ((b = gAlice->Field()->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1176
1177         // Radius of helix
1178
1179         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1180
1181         // Revolution frequency
1182
1183         Double_t omega = vt / rho;
1184
1185         // Maximum and minimum decay time
1186         //
1187         // Check for curlers first
1188         if (fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2. > 1.) return;
1189
1190         //
1191
1192         tmax  = TMath::ACos(1. - fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1193         tmin  = TMath::ACos(1. - fRDecayMin * fRDecayMin / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1194     } else {
1195         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct]
1196         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1197     }
1198
1199     //
1200     // Dial t using the two limits
1201     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1202     //
1203     //
1204     // Force decay time in transport code
1205     //
1206     gMC->ForceDecayTime(t / 2.99792458e10);
1207 }