STEER/AliVertexerTracks.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-2003, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 //-----------------------------------------------------------------
  17 //    Implementation of the vertexer from tracks
  18 //
  19 // Origin: AliITSVertexerTracks
  20 //         A.Dainese, Padova,
  21 //         andrea.dainese@pd.infn.it
  22 //         M.Masera,  Torino,
  23 //         massimo.masera@to.infn.it
  24 // Moved to STEER and adapted to ESD tracks:
  25 //         F.Prino,  Torino, prino@to.infn.it
  26 //-----------------------------------------------------------------
  27
  28 //---- Root headers --------
  29 #include <TSystem.h>
  30 #include <TDirectory.h>
  31 #include <TFile.h>
  32 #include <TTree.h>
  33 #include <TMatrixD.h>
  34 //---- AliRoot headers -----
  35 #include "AliStrLine.h"
  36 #include "AliExternalTrackParam.h"
  37 #include "AliESDEvent.h"
  38 #include "AliESDtrack.h"
  39 #include "AliVertexerTracks.h"
  40
  41 ClassImp(AliVertexerTracks)
  42
  43
  44 //----------------------------------------------------------------------------
  45 AliVertexerTracks::AliVertexerTracks():
  46 TObject(),
  47 fVert(),
  48 fCurrentVertex(0),
  49 fMode(0),
  50 fFieldkG(-999.),
  51 fTrkArraySel(),
  52 fIdSel(0),
  53 fTrksToSkip(0),
  54 fNTrksToSkip(0),
  55 fConstraint(kFALSE),
  56 fOnlyFitter(kFALSE),
  57 fMinTracks(1),
  58 fMinClusters(5),
  59 fDCAcut(0.1),
  60 fDCAcutIter0(0.1),
  61 fNSigma(3.),
  62 fMaxd0z0(0.5),
  63 fMinDetFitter(100.),
  64 fMaxTgl(1000.),
  65 fITSrefit(kTRUE),
  66 fFiducialR(3.),
  67 fFiducialZ(30.),
  68 fnSigmaForUi00(1.5),
  69 fDebug(0),
  70 fAlgo(1)
  71 {
  72 //
  73 // Default constructor
  74 //
  75   SetVtxStart();
  76   SetVtxStartSigma();
  77 }
  78 //----------------------------------------------------------------------------
  79 AliVertexerTracks::AliVertexerTracks(Double_t fieldkG):
  80 TObject(),
  81 fVert(),
  82 fCurrentVertex(0),
  83 fMode(0),
  84 fFieldkG(fieldkG),
  85 fTrkArraySel(),
  86 fIdSel(0),
  87 fTrksToSkip(0),
  88 fNTrksToSkip(0),
  89 fConstraint(kFALSE),
  90 fOnlyFitter(kFALSE),
  91 fMinTracks(1),
  92 fMinClusters(5),
  93 fDCAcut(0.1),
  94 fDCAcutIter0(0.1),
  95 fNSigma(3.),
  96 fMaxd0z0(0.5),
  97 fMinDetFitter(100.),
  98 fMaxTgl(1000.),
  99 fITSrefit(kTRUE),
 100 fFiducialR(3.),
 101 fFiducialZ(30.),
 102 fnSigmaForUi00(1.5),
 103 fDebug(0),
 104 fAlgo(1)
 105 {
 106 //
 107 // Standard constructor
 108 //
 109   SetVtxStart();
 110   SetVtxStartSigma();
 111   SetTPCMode();
 112 }
 113 //-----------------------------------------------------------------------------
 114 AliVertexerTracks::~AliVertexerTracks()
 115 {
 116   // Default Destructor
 117   // The objects pointed by the following pointer are not owned
 118   // by this class and are not deleted
 119   fCurrentVertex = 0;
 120   if(fTrksToSkip) { delete [] fTrksToSkip; fTrksToSkip=NULL; }
 121   if(fIdSel) { delete [] fIdSel; fIdSel=NULL; }
 122 }
 123 //----------------------------------------------------------------------------
 124 AliESDVertex* AliVertexerTracks::FindPrimaryVertex(const AliESDEvent *esdEvent)
 125 {
 126 //
 127 // Primary vertex for current ESD event
 128 // (Two iterations:
 129 //  1st with 5*fNSigma*sigma cut w.r.t. to initial vertex
 130 //      + cut on sqrt(d0d0+z0z0) if fConstraint=kFALSE
 131 //  2nd with fNSigma*sigma cut w.r.t. to vertex found in 1st iteration)
 132 //
 133   fCurrentVertex = 0;
 134
 135   // accept 1-track case only if constraint is available
 136   if(!fConstraint && fMinTracks==1) fMinTracks=2;
 137
 138   // read tracks from ESD
 139   Int_t nTrks = (Int_t)esdEvent->GetNumberOfTracks();
 140   if(nTrks<fMinTracks) {
 141     TooFewTracks();
 142     return fCurrentVertex;
 143   }
 144   //
 145
 146   TDirectory * olddir = gDirectory;
 147   TFile *f = 0;
 148   if(nTrks>500) f = new TFile("VertexerTracks.root","recreate");
 149   TObjArray trkArrayOrig(nTrks);
 150   UShort_t *idOrig = new UShort_t[nTrks];
 151
 152   Int_t nTrksOrig=0;
 153   AliExternalTrackParam *t=0;
 154   // loop on ESD tracks
 155   for(Int_t i=0; i<nTrks; i++) {
 156     AliESDtrack *esdt = esdEvent->GetTrack(i);
 157     // check tracks to skip
 158     Bool_t skipThis = kFALSE;
 159     for(Int_t j=0; j<fNTrksToSkip; j++) {
 160       if(esdt->GetID()==fTrksToSkip[j]) {
 161         if(fDebug) printf("skipping track: %d\n",i);
 162         skipThis = kTRUE;
 163       }
 164     }
 165     if(skipThis) continue;
 166
 167     // check number of clusters in ITS or TPC
 168     if(esdt->GetNcls(fMode) < fMinClusters) continue;
 169
 170     if(fMode==0) {        // ITS mode
 171       if(fITSrefit && !(esdt->GetStatus()&AliESDtrack::kITSrefit)) continue;
 172       Double_t x,p[5],cov[15];
 173       esdt->GetExternalParameters(x,p);
 174       esdt->GetExternalCovariance(cov);
 175       t = new AliExternalTrackParam(x,esdt->GetAlpha(),p,cov);
 176     } else if(fMode==1) { // TPC mode
 177       t = (AliExternalTrackParam*)esdt->GetTPCInnerParam();
 178       if(!t) continue;
 179       Double_t radius = 2.8; //something less than the beam pipe radius
 180       if(!PropagateTrackTo(t,radius)) continue;
 181     }
 182     trkArrayOrig.AddLast(t);
 183     idOrig[nTrksOrig]=(UShort_t)esdt->GetID();
 184     nTrksOrig++;
 185   } // end loop on ESD tracks
 186
 187   // call method that will reconstruct the vertex
 188   FindPrimaryVertex(&trkArrayOrig,idOrig);
 189
 190   if(fMode==0) trkArrayOrig.Delete();
 191   delete [] idOrig; idOrig=NULL;
 192
 193   if(f) {
 194     f->Close(); delete f; f = NULL;
 195     gSystem->Unlink("VertexerTracks.root");
 196     olddir->cd();
 197   }
 198
 199   return fCurrentVertex;
 200 }
 201 //----------------------------------------------------------------------------
 202 AliESDVertex* AliVertexerTracks::FindPrimaryVertex(TObjArray *trkArrayOrig,
 203                                                    UShort_t *idOrig)
 204 {
 205 //
 206 // Primary vertex using the AliExternalTrackParam's in the TObjArray.
 207 // idOrig must contain the track IDs from AliESDtrack::GetID()
 208 // (Two iterations:
 209 //  1st with 5*fNSigma*sigma cut w.r.t. to initial vertex
 210 //      + cut on sqrt(d0d0+z0z0) if fConstraint=kFALSE
 211 //  2nd with fNSigma*sigma cut w.r.t. to vertex found in 1st iteration)
 212 //
 213   fCurrentVertex = 0;
 214
 215   // accept 1-track case only if constraint is available
 216   if(!fConstraint && fMinTracks==1) fMinTracks=2;
 217
 218   // read tracks from array
 219   Int_t nTrksOrig = (Int_t)trkArrayOrig->GetEntriesFast();
 220   if(fDebug) printf("Initial number of tracks: %d\n",nTrksOrig);
 221   if(nTrksOrig<fMinTracks) {
 222     if(fDebug) printf("TooFewTracks\n");
 223     TooFewTracks();
 224     return fCurrentVertex;
 225   }
 226
 227   // If fConstraint=kFALSE
 228   // run VertexFinder(1) to get rough estimate of initVertex (x,y)
 229   if(!fConstraint) {
 230     // fill fTrkArraySel, for VertexFinder()
 231     fIdSel = new UShort_t[nTrksOrig];
 232     PrepareTracks(*trkArrayOrig,idOrig,0);
 233     if(fIdSel) { delete [] fIdSel; fIdSel=NULL; }
 234     Double_t cutsave = fDCAcut;
 235     fDCAcut = fDCAcutIter0;
 236     VertexFinder(1); // using weights, cutting dca < fDCAcutIter0
 237     fDCAcut = cutsave;
 238     if(fVert.GetNContributors()>0) {
 239       fVert.GetXYZ(fNominalPos);
 240       fNominalPos[0] = fVert.GetXv();
 241       fNominalPos[1] = fVert.GetYv();
 242       fNominalPos[2] = fVert.GetZv();
 243       if(fDebug) printf("No mean vertex: VertexFinder gives (%f, %f, %f)\n",fNominalPos[0],fNominalPos[1],fNominalPos[2]);
 244     } else {
 245       fNominalPos[0] = 0.;
 246       fNominalPos[1] = 0.;
 247       fNominalPos[2] = 0.;
 248       if(fDebug) printf("No mean vertex and VertexFinder failed\n");
 249     }
 250   }
 251
 252   // TWO ITERATIONS:
 253   //
 254   // ITERATION 1
 255   // propagate tracks to fNominalPos vertex
 256   // preselect them:
 257   // if(constraint) reject for |d0|>5*fNSigma*sigma w.r.t. fNominal... vertex
 258   // else  reject for |d0|\oplus|z0| > 5 mm w.r.t. fNominal... vertex
 259   // ITERATION 2
 260   // propagate tracks to best between initVertex and fCurrentVertex
 261   // preselect tracks (reject for |d0|>fNSigma*sigma w.r.t. best
 262   //                   between initVertex and fCurrentVertex)
 263   for(Int_t iter=1; iter<=2; iter++) {
 264     if(fOnlyFitter && iter==1) continue;
 265     if(fIdSel) { delete [] fIdSel; fIdSel=NULL; }
 266     fIdSel = new UShort_t[nTrksOrig];
 267     Int_t nTrksSel = PrepareTracks(*trkArrayOrig,idOrig,iter);
 268     if(fDebug) printf("N tracks selected in iteration %d: %d\n",iter,nTrksSel);
 269     if(nTrksSel < fMinTracks) {
 270       TooFewTracks();
 271       return fCurrentVertex;
 272     }
 273
 274     // vertex finder
 275     if(!fOnlyFitter) {
 276       if(nTrksSel==1) {
 277         if(fDebug) printf("Just one track\n");
 278         OneTrackVertFinder();
 279       } else {
 280         switch (fAlgo) {
 281         case 1: StrLinVertexFinderMinDist(1); break;
 282         case 2: StrLinVertexFinderMinDist(0); break;
 283         case 3: HelixVertexFinder();          break;
 284         case 4: VertexFinder(1);              break;
 285         case 5: VertexFinder(0);              break;
 286         default: printf("Wrong algorithm\n"); break;
 287         }
 288       }
 289       if(fDebug) printf(" Vertex finding completed\n");
 290     }
 291
 292     // vertex fitter
 293     VertexFitter();
 294   } // end loop on the two iterations
 295
 296
 297   // set indices of used tracks
 298   UShort_t *indices = 0;
 299   if(fCurrentVertex->GetNContributors()>0) {
 300     Int_t nIndices = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast();
 301     indices = new UShort_t[nIndices];
 302     for(Int_t jj=0; jj<nIndices; jj++)
 303       indices[jj] = fIdSel[jj];
 304     fCurrentVertex->SetIndices(nIndices,indices);
 305   }
 306   delete [] indices; indices=NULL;
 307   //
 308
 309   // set vertex title
 310   TString title="VertexerTracksNoConstraint";
 311   if(fConstraint) {
 312     title="VertexerTracksWithConstraint";
 313     if(fOnlyFitter) title.Append("OnlyFitter");
 314   }
 315   fCurrentVertex->SetTitle(title.Data());
 316   //
 317
 318   if(fDebug) {
 319     fCurrentVertex->PrintStatus();
 320     fCurrentVertex->PrintIndices();
 321   }
 322
 323   // clean up
 324   delete [] fIdSel; fIdSel=NULL;
 325   fTrkArraySel.Delete();
 326   if(fTrksToSkip) { delete [] fTrksToSkip; fTrksToSkip=NULL; }
 327   //
 328
 329   return fCurrentVertex;
 330 }
 331 //------------------------------------------------------------------------
 332 Double_t AliVertexerTracks::GetDeterminant3X3(Double_t matr[][3])
 333 {
 334   //
 335   Double_t det=matr[0][0]*matr[1][1]*matr[2][2]-matr[0][0]*matr[1][2]*matr[2][1]-matr[0][1]*matr[1][0]*matr[2][2]+matr[0][1]*matr[1][2]*matr[2][0]+matr[0][2]*matr[1][0]*matr[2][1]-matr[0][2]*matr[1][1]*matr[2][0];
 336  return det;
 337 }
 338 //-------------------------------------------------------------------------
 339 void AliVertexerTracks::GetStrLinDerivMatrix(Double_t *p0,Double_t *p1,Double_t (*m)[3],Double_t *d)
 340 {
 341   //
 342   Double_t x12=p0[0]-p1[0];
 343   Double_t y12=p0[1]-p1[1];
 344   Double_t z12=p0[2]-p1[2];
 345   Double_t kk=x12*x12+y12*y12+z12*z12;
 346   m[0][0]=2-2/kk*x12*x12;
 347   m[0][1]=-2/kk*x12*y12;
 348   m[0][2]=-2/kk*x12*z12;
 349   m[1][0]=-2/kk*x12*y12;
 350   m[1][1]=2-2/kk*y12*y12;
 351   m[1][2]=-2/kk*y12*z12;
 352   m[2][0]=-2/kk*x12*z12;
 353   m[2][1]=-2*y12*z12;
 354   m[2][2]=2-2/kk*z12*z12;
 355   d[0]=2*p0[0]-2/kk*p0[0]*x12*x12-2/kk*p0[2]*x12*z12-2/kk*p0[1]*x12*y12;
 356   d[1]=2*p0[1]-2/kk*p0[1]*y12*y12-2/kk*p0[0]*x12*y12-2/kk*p0[2]*z12*y12;
 357   d[2]=2*p0[2]-2/kk*p0[2]*z12*z12-2/kk*p0[0]*x12*z12-2/kk*p0[1]*z12*y12;
 358
 359 }
 360 //--------------------------------------------------------------------------
 361 void AliVertexerTracks::GetStrLinDerivMatrix(Double_t *p0,Double_t *p1,Double_t *sigmasq,Double_t (*m)[3],Double_t *d)
 362 {
 363   //
 364   Double_t x12=p1[0]-p0[0];
 365   Double_t y12=p1[1]-p0[1];
 366   Double_t z12=p1[2]-p0[2];
 367
 368   Double_t den= x12*x12*sigmasq[1]*sigmasq[2]+y12*y12*sigmasq[0]*sigmasq[2]+z12*z12*sigmasq[0]*sigmasq[1];
 369
 370   Double_t kk= 2*(x12*x12/sigmasq[0]+y12*y12/sigmasq[1]+z12*z12/sigmasq[2]);
 371
 372   Double_t cc[3];
 373   cc[0]=-x12/sigmasq[0];
 374   cc[1]=-y12/sigmasq[1];
 375   cc[2]=-z12/sigmasq[2];
 376
 377   Double_t ww=(-p0[0]*x12*sigmasq[1]*sigmasq[2]-p0[1]*y12*sigmasq[0]*sigmasq[2]-p0[2]*z12*sigmasq[0]*sigmasq[1])/den;
 378
 379   Double_t ss= -p0[0]*cc[0]-p0[1]*cc[1]-p0[2]*cc[2];
 380
 381   Double_t aa[3];
 382   aa[0]=x12*sigmasq[1]*sigmasq[2]/den;
 383   aa[1]=y12*sigmasq[0]*sigmasq[2]/den;
 384   aa[2]=z12*sigmasq[0]*sigmasq[1]/den;
 385
 386   m[0][0]=aa[0]*(aa[0]*kk+2*cc[0])+2*cc[0]*aa[0]+2/sigmasq[0];
 387   m[0][1]=aa[1]*(aa[0]*kk+2*cc[0])+2*cc[1]*aa[0];
 388   m[0][2]=aa[2]*(aa[0]*kk+2*cc[0])+2*cc[2]*aa[0];
 389
 390   m[1][0]=aa[0]*(aa[1]*kk+2*cc[1])+2*cc[0]*aa[1];
 391   m[1][1]=aa[1]*(aa[1]*kk+2*cc[1])+2*cc[1]*aa[1]+2/sigmasq[1];
 392   m[1][2]=aa[2]*(aa[1]*kk+2*cc[1])+2*cc[2]*aa[1];
 393
 394   m[2][0]=aa[0]*(aa[2]*kk+2*cc[2])+2*cc[0]*aa[2];
 395   m[2][1]=aa[1]*(aa[2]*kk+2*cc[2])+2*cc[1]*aa[2];
 396   m[2][2]=aa[2]*(aa[2]*kk+2*cc[2])+2*cc[2]*aa[2]+2/sigmasq[2];
 397
 398   d[0]=-ww*(aa[0]*kk+2*cc[0])-2*ss*aa[0]+2*p0[0]/sigmasq[0];
 399   d[1]=-ww*(aa[1]*kk+2*cc[1])-2*ss*aa[1]+2*p0[1]/sigmasq[1];
 400   d[2]=-ww*(aa[2]*kk+2*cc[2])-2*ss*aa[2]+2*p0[2]/sigmasq[2];
 401
 402   }
 403 //--------------------------------------------------------------------------
 404 Double_t AliVertexerTracks::GetStrLinMinDist(Double_t *p0,Double_t *p1,Double_t *x0)
 405 {
 406   //
 407   Double_t x12=p0[0]-p1[0];
 408   Double_t y12=p0[1]-p1[1];
 409   Double_t z12=p0[2]-p1[2];
 410   Double_t x10=p0[0]-x0[0];
 411   Double_t y10=p0[1]-x0[1];
 412   Double_t z10=p0[2]-x0[2];
 413   //  return ((x10*x10+y10*y10+z10*z10)*(x12*x12+y12*y12+z12*z12)-(x10*x12+y10*y12+z10*z12)*(x10*x12+y10*y12+z10*z12))/(x12*x12+y12*y12+z12*z12);
 414   return ((y10*z12-z10*y12)*(y10*z12-z10*y12)+
 415           (z10*x12-x10*z12)*(z10*x12-x10*z12)+
 416           (x10*y12-y10*x12)*(x10*y12-y10*x12))
 417     /(x12*x12+y12*y12+z12*z12);
 418 }
 419 //---------------------------------------------------------------------------
 420 void AliVertexerTracks::OneTrackVertFinder()
 421 {
 422   // find vertex for events with 1 track, using DCA to nominal beam axis
 423   if(fDebug) printf("Number of prepared tracks =%d - Call OneTrackVertFinder",fTrkArraySel.GetEntries());
 424   AliExternalTrackParam *track1;
 425   track1 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(0);
 426   Double_t alpha=track1->GetAlpha();
 427   Double_t mindist = TMath::Cos(alpha)*fNominalPos[0]+TMath::Sin(alpha)*fNominalPos[1];
 428   Double_t pos[3],dir[3];
 429   track1->GetXYZAt(mindist,GetFieldkG(),pos);
 430   track1->GetPxPyPzAt(mindist,GetFieldkG(),dir);
 431   AliStrLine *line1 = new AliStrLine(pos,dir);
 432   Double_t p1[3]={fNominalPos[0],fNominalPos[1],0.};
 433   Double_t p2[3]={fNominalPos[0],fNominalPos[1],10.};
 434   AliStrLine *zeta=new AliStrLine(p1,p2,kTRUE);
 435   Double_t crosspoint[3]={0.,0.,0.};
 436   Double_t sigma=999.;
 437   Int_t nContrib=-1;
 438   Int_t retcode = zeta->Cross(line1,crosspoint);
 439   if(retcode>=0){
 440     sigma=line1->GetDistFromPoint(crosspoint);
 441     nContrib=1;
 442   }
 443   delete zeta;
 444   delete line1;
 445   fVert.SetXYZ(crosspoint);
 446   fVert.SetDispersion(sigma);
 447   fVert.SetNContributors(nContrib);
 448 }
 449 //---------------------------------------------------------------------------
 450 void AliVertexerTracks::HelixVertexFinder()
 451 {
 452   // Get estimate of vertex position in (x,y) from tracks DCA
 453
 454
 455   Double_t initPos[3];
 456   initPos[2] = 0.;
 457   for(Int_t i=0;i<2;i++)initPos[i]=fNominalPos[i];
 458
 459   Int_t nacc = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast();
 460
 461   Double_t aver[3]={0.,0.,0.};
 462   Double_t averquad[3]={0.,0.,0.};
 463   Double_t sigmaquad[3]={0.,0.,0.};
 464   Double_t sigma=0;
 465   Int_t ncombi = 0;
 466   AliExternalTrackParam *track1;
 467   AliExternalTrackParam *track2;
 468   Double_t distCA;
 469   Double_t x;
 470   Double_t alpha, cs, sn;
 471   Double_t crosspoint[3];
 472   for(Int_t i=0; i<nacc; i++){
 473     track1 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(i);
 474
 475
 476     for(Int_t j=i+1; j<nacc; j++){
 477       track2 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(j);
 478
 479       distCA=track2->PropagateToDCA(track1,GetFieldkG());
 480       if(fDCAcut<=0 ||(fDCAcut>0&&distCA<fDCAcut)){
 481         x=track1->GetX();
 482         alpha=track1->GetAlpha();
 483         cs=TMath::Cos(alpha); sn=TMath::Sin(alpha);
 484         Double_t x1=x*cs - track1->GetY()*sn;
 485         Double_t y1=x*sn + track1->GetY()*cs;
 486         Double_t z1=track1->GetZ();
 487
 488         Double_t sx1=sn*sn*track1->GetSigmaY2(), sy1=cs*cs*track1->GetSigmaY2();
 489         x=track2->GetX();
 490         alpha=track2->GetAlpha();
 491         cs=TMath::Cos(alpha); sn=TMath::Sin(alpha);
 492         Double_t x2=x*cs - track2->GetY()*sn;
 493         Double_t y2=x*sn + track2->GetY()*cs;
 494         Double_t z2=track2->GetZ();
 495         Double_t sx2=sn*sn*track2->GetSigmaY2(), sy2=cs*cs*track2->GetSigmaY2();
 496         Double_t sz1=track1->GetSigmaZ2(), sz2=track2->GetSigmaZ2();
 497         Double_t wx1=sx2/(sx1+sx2), wx2=1.- wx1;
 498         Double_t wy1=sy2/(sy1+sy2), wy2=1.- wy1;
 499         Double_t wz1=sz2/(sz1+sz2), wz2=1.- wz1;
 500         crosspoint[0]=wx1*x1 + wx2*x2;
 501         crosspoint[1]=wy1*y1 + wy2*y2;
 502         crosspoint[2]=wz1*z1 + wz2*z2;
 503
 504         ncombi++;
 505         for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aver[jj]+=crosspoint[jj];
 506         for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)averquad[jj]+=(crosspoint[jj]*crosspoint[jj]);
 507       }
 508     }
 509
 510   }
 511   if(ncombi>0){
 512     for(Int_t jj=0;jj<3;jj++){
 513       initPos[jj] = aver[jj]/ncombi;
 514       averquad[jj]/=ncombi;
 515       sigmaquad[jj]=averquad[jj]-initPos[jj]*initPos[jj];
 516       sigma+=sigmaquad[jj];
 517     }
 518     sigma=TMath::Sqrt(TMath::Abs(sigma));
 519   }
 520   else {
 521     Warning("HelixVertexFinder","Finder did not succed");
 522     sigma=999;
 523   }
 524   fVert.SetXYZ(initPos);
 525   fVert.SetDispersion(sigma);
 526   fVert.SetNContributors(ncombi);
 527 }
 528 //----------------------------------------------------------------------------
 529 Int_t AliVertexerTracks::PrepareTracks(TObjArray &trkArrayOrig,
 530                                        UShort_t *idOrig,
 531                                        Int_t optImpParCut)
 532 {
 533 //
 534 // Propagate tracks to initial vertex position and store them in a TObjArray
 535 //
 536   if(fDebug) printf(" PrepareTracks()\n");
 537
 538   Int_t nTrksOrig = (Int_t)trkArrayOrig.GetEntriesFast();
 539   Int_t nTrksSel = 0;
 540   Double_t maxd0rphi;
 541   Double_t sigmaCurr[3];
 542   Double_t normdistx,normdisty;
 543   Double_t d0z0[2],covd0z0[3];
 544   Double_t sigmad0;
 545
 546   AliESDVertex *initVertex = new AliESDVertex(fNominalPos,fNominalCov,1,1);
 547
 548   if(!fTrkArraySel.IsEmpty()) fTrkArraySel.Delete();
 549
 550   AliExternalTrackParam *track=0;
 551
 552   // loop on tracks
 553   for(Int_t i=0; i<nTrksOrig; i++) {
 554     track = new AliExternalTrackParam(*(AliExternalTrackParam*)trkArrayOrig.At(i));
 555     // tgl cut
 556     if(TMath::Abs(track->GetTgl())>fMaxTgl) {
 557       if(fDebug) printf(" rejecting track with tgl = %f\n",track->GetTgl());
 558       delete track; continue;
 559     }
 560
 561     Bool_t propagateOK = kFALSE;
 562     // propagate track to vertex
 563     if(optImpParCut<2 || fOnlyFitter) { // optImpParCut==1 or 0
 564       propagateOK = track->PropagateToDCA(initVertex,GetFieldkG(),100.,d0z0,covd0z0);
 565     } else {              // optImpParCut==2
 566       fCurrentVertex->GetSigmaXYZ(sigmaCurr);
 567       normdistx = TMath::Abs(fCurrentVertex->GetXv()-fNominalPos[0])/TMath::Sqrt(sigmaCurr[0]*sigmaCurr[0]+fNominalCov[0]);
 568       normdisty = TMath::Abs(fCurrentVertex->GetYv()-fNominalPos[1])/TMath::Sqrt(sigmaCurr[1]*sigmaCurr[1]+fNominalCov[2]);
 569       if(normdistx < 3. && normdisty < 3. &&
 570          (sigmaCurr[0]+sigmaCurr[1])<(TMath::Sqrt(fNominalCov[0])+TMath::Sqrt(fNominalCov[2]))) {
 571         propagateOK = track->PropagateToDCA(fCurrentVertex,GetFieldkG(),100.,d0z0,covd0z0);
 572       } else {
 573         propagateOK = track->PropagateToDCA(initVertex,GetFieldkG(),100.,d0z0,covd0z0);
 574       }
 575     }
 576
 577     if(!propagateOK) {
 578       if(fDebug) printf("     rejected\n");
 579       delete track; continue;
 580     }
 581
 582     sigmad0 = TMath::Sqrt(covd0z0[0]);
 583     maxd0rphi = fNSigma*sigmad0;
 584     if(optImpParCut==1) maxd0rphi *= 5.;
 585     maxd0rphi = TMath::Min(maxd0rphi,fFiducialR);
 586     //sigmad0z0 = TMath::Sqrt(covd0z0[0]+covd0z0[2]); // for future improvement
 587     //maxd0z0 = 10.*fNSigma*sigmad0z0;
 588
 589     if(fDebug) printf("trk %d; id %d; |d0| = %f;  d0 cut = %f; |z0| = %f; |d0|oplus|z0| = %f; d0z0 cut = %f\n",i,(Int_t)idOrig[i],TMath::Abs(d0z0[0]),maxd0rphi,TMath::Abs(d0z0[1]),TMath::Sqrt(d0z0[0]*d0z0[0]+d0z0[1]*d0z0[1]),fMaxd0z0);
 590
 591
 592     //---- track selection based on impact parameters ----//
 593
 594     // always reject tracks outside fiducial volume
 595     if(TMath::Abs(d0z0[0])>fFiducialR || TMath::Abs(d0z0[1])>fFiducialZ) {
 596       if(fDebug) printf("     rejected\n");
 597       delete track; continue;
 598     }
 599
 600     // during iterations 1 and 2 , reject tracks with d0rphi > maxd0rphi
 601     if(optImpParCut>0 && TMath::Abs(d0z0[0])>maxd0rphi) {
 602       if(fDebug) printf("     rejected\n");
 603       delete track; continue;
 604     }
 605
 606     // if fConstraint=kFALSE, during iterations 1 and 2 ||
 607     // if fConstraint=kTRUE, during iteration 2,
 608     // select tracks with d0oplusz0 < fMaxd0z0
 609     if((!fConstraint && optImpParCut>0 && fVert.GetNContributors()>0) ||
 610        ( fConstraint && optImpParCut==2)) {
 611       if(nTrksOrig>=3 &&
 612          TMath::Sqrt(d0z0[0]*d0z0[0]+d0z0[1]*d0z0[1])>fMaxd0z0) {
 613         if(fDebug) printf("     rejected\n");
 614         delete track; continue;
 615       }
 616     }
 617
 618     // track passed all selections
 619     fTrkArraySel.AddLast(track);
 620     fIdSel[nTrksSel] = idOrig[i];
 621     nTrksSel++;
 622   } // end loop on tracks
 623
 624   delete initVertex;
 625
 626   return nTrksSel;
 627 }
 628 //----------------------------------------------------------------------------
 629 Bool_t AliVertexerTracks::PropagateTrackTo(AliExternalTrackParam *track,
 630                                            Double_t xToGo) {
 631   //----------------------------------------------------------------
 632   // COPIED from AliTracker
 633   //
 634   // Propagates the track to the plane X=xk (cm).
 635   //
 636   //  Origin: Marian Ivanov,  Marian.Ivanov@cern.ch
 637   //----------------------------------------------------------------
 638
 639   const Double_t kEpsilon = 0.00001;
 640   Double_t xpos = track->GetX();
 641   Double_t dir = (xpos<xToGo) ? 1. : -1.;
 642   Double_t maxStep = 5;
 643   Double_t maxSnp = 0.8;
 644   //
 645   while ( (xToGo-xpos)*dir > kEpsilon){
 646     Double_t step = dir*TMath::Min(TMath::Abs(xToGo-xpos), maxStep);
 647     Double_t x    = xpos+step;
 648     Double_t xyz0[3],xyz1[3];
 649     track->GetXYZ(xyz0);   //starting global position
 650
 651     if(!track->GetXYZAt(x,GetFieldkG(),xyz1)) return kFALSE;   // no prolongation
 652     xyz1[2]+=kEpsilon; // waiting for bug correction in geo
 653
 654     if(TMath::Abs(track->GetSnpAt(x,GetFieldkG())) >= maxSnp) return kFALSE;
 655     if(!track->PropagateTo(x,GetFieldkG()))  return kFALSE;
 656
 657     if(TMath::Abs(track->GetSnp()) >= maxSnp) return kFALSE;
 658     track->GetXYZ(xyz0);   // global position
 659     Double_t alphan = TMath::ATan2(xyz0[1], xyz0[0]);
 660     //
 661     Double_t ca=TMath::Cos(alphan-track->GetAlpha()),
 662       sa=TMath::Sin(alphan-track->GetAlpha());
 663     Double_t sf=track->GetSnp(), cf=TMath::Sqrt(1.- sf*sf);
 664     Double_t sinNew =  sf*ca - cf*sa;
 665     if(TMath::Abs(sinNew) >= maxSnp) return kFALSE;
 666     if(!track->Rotate(alphan)) return kFALSE;
 667
 668     xpos = track->GetX();
 669   }
 670   return kTRUE;
 671 }
 672 //---------------------------------------------------------------------------
 673 AliESDVertex* AliVertexerTracks::RemoveTracksFromVertex(AliESDVertex *inVtx,
 674                                                         TObjArray *trkArray,
 675                                                         UShort_t *id,
 676                                                         Float_t *diamondxy)
 677 {
 678 //
 679 // Removes tracks in trksTree from fit of inVtx
 680 //
 681
 682   if(!strstr(inVtx->GetTitle(),"VertexerTracksWithConstraint")) {
 683     printf("ERROR: primary vertex has no constraint: cannot remove tracks\n");
 684     return 0x0;
 685   }
 686   if(!strstr(inVtx->GetTitle(),"VertexerTracksWithConstraintOnlyFitter"))
 687     printf("WARNING: result of tracks' removal will be only approximately correct\n");
 688
 689   TMatrixD rv(3,1);
 690   rv(0,0) = inVtx->GetXv();
 691   rv(1,0) = inVtx->GetYv();
 692   rv(2,0) = inVtx->GetZv();
 693   TMatrixD vV(3,3);
 694   Double_t cov[6];
 695   inVtx->GetCovMatrix(cov);
 696   vV(0,0) = cov[0];
 697   vV(0,1) = cov[1]; vV(1,0) = cov[1];
 698   vV(1,1) = cov[2];
 699   vV(0,2) = cov[3]; vV(2,0) = cov[3];
 700   vV(1,2) = cov[4]; vV(2,1) = cov[4];
 701   vV(2,2) = cov[5];
 702
 703   TMatrixD sumWi(TMatrixD::kInverted,vV);
 704   TMatrixD sumWiri(sumWi,TMatrixD::kMult,rv);
 705
 706   Int_t nUsedTrks = inVtx->GetNIndices();
 707   Double_t chi2 = inVtx->GetChi2();
 708
 709   AliExternalTrackParam *track = 0;
 710   Int_t ntrks = (Int_t)trkArray->GetEntriesFast();
 711   for(Int_t i=0;i<ntrks;i++) {
 712     track = (AliExternalTrackParam*)trkArray->At(i);
 713     if(!inVtx->UsesTrack(id[i])) {
 714       printf("track %d was not used in vertex fit\n",id[i]);
 715       continue;
 716     }
 717     Double_t alpha = track->GetAlpha();
 718     Double_t xl = diamondxy[0]*TMath::Cos(alpha)+diamondxy[1]*TMath::Sin(alpha);
 719     track->PropagateTo(xl,GetFieldkG());
 720     // vector of track global coordinates
 721     TMatrixD ri(3,1);
 722     // covariance matrix of ri
 723     TMatrixD wWi(3,3);
 724
 725     // get space point from track
 726     if(!TrackToPoint(track,ri,wWi)) continue;
 727
 728     TMatrixD wWiri(wWi,TMatrixD::kMult,ri);
 729
 730     sumWi -= wWi;
 731     sumWiri -= wWiri;
 732
 733     // track chi2
 734     TMatrixD deltar = rv; deltar -= ri;
 735     TMatrixD wWideltar(wWi,TMatrixD::kMult,deltar);
 736     Double_t chi2i = deltar(0,0)*wWideltar(0,0)+
 737                      deltar(1,0)*wWideltar(1,0)+
 738                      deltar(2,0)*wWideltar(2,0);
 739     // remove from total chi2
 740     chi2 -= chi2i;
 741
 742     nUsedTrks--;
 743     if(nUsedTrks<2) {
 744       printf("Trying to remove too many tracks!\n");
 745       return 0x0;
 746     }
 747   }
 748
 749   TMatrixD rvnew(3,1);
 750   TMatrixD vVnew(3,3);
 751
 752   // new inverted of weights matrix
 753   TMatrixD invsumWi(TMatrixD::kInverted,sumWi);
 754   vVnew = invsumWi;
 755   // new position of primary vertex
 756   rvnew.Mult(vVnew,sumWiri);
 757
 758   Double_t position[3];
 759   position[0] = rvnew(0,0);
 760   position[1] = rvnew(1,0);
 761   position[2] = rvnew(2,0);
 762   cov[0] = vVnew(0,0);
 763   cov[1] = vVnew(0,1);
 764   cov[2] = vVnew(1,1);
 765   cov[3] = vVnew(0,2);
 766   cov[4] = vVnew(1,2);
 767   cov[5] = vVnew(2,2);
 768
 769   // store data in the vertex object
 770   AliESDVertex *outVtx = new AliESDVertex(position,cov,chi2,nUsedTrks);
 771   outVtx->SetTitle(inVtx->GetTitle());
 772   UShort_t *inindices = inVtx->GetIndices();
 773   Int_t nIndices = nUsedTrks;
 774   UShort_t *outindices = new UShort_t[nIndices];
 775   Int_t j=0;
 776   for(Int_t k=0; k<inVtx->GetNIndices(); k++) {
 777     Bool_t copyindex=kTRUE;
 778     for(Int_t l=0; l<ntrks; l++) {
 779       if(inindices[k]==id[l]) copyindex=kFALSE;
 780     }
 781     if(copyindex) {
 782       outindices[j] = inindices[k]; j++;
 783     }
 784   }
 785   outVtx->SetIndices(nIndices,outindices);
 786   delete [] outindices;
 787
 788   if(fDebug) {
 789     printf("Vertex before removing tracks:\n");
 790     inVtx->PrintStatus();
 791     inVtx->PrintIndices();
 792     printf("Vertex after removing tracks:\n");
 793     outVtx->PrintStatus();
 794     outVtx->PrintIndices();
 795   }
 796
 797   return outVtx;
 798 }
 799 //---------------------------------------------------------------------------
 800 void AliVertexerTracks::SetCuts(Double_t *cuts)
 801 {
 802 //
 803 //  Cut values
 804 //
 805   SetDCAcut(cuts[0]);
 806   SetDCAcutIter0(cuts[1]);
 807   SetMaxd0z0(cuts[2]);
 808   SetMinClusters((Int_t)(cuts[3]));
 809   SetMinTracks((Int_t)(cuts[4]));
 810   SetNSigmad0(cuts[5]);
 811   SetMinDetFitter(cuts[6]);
 812   SetMaxTgl(cuts[7]);
 813   SetFiducialRZ(cuts[8],cuts[9]);
 814
 815   return;
 816 }
 817 //---------------------------------------------------------------------------
 818 void AliVertexerTracks::SetITSMode(Double_t dcacut,
 819                                    Double_t dcacutIter0,
 820                                    Double_t maxd0z0,
 821                                    Int_t minCls,
 822                                    Int_t mintrks,
 823                                    Double_t nsigma,
 824                                    Double_t mindetfitter,
 825                                    Double_t maxtgl,
 826                                    Double_t fidR,
 827                                    Double_t fidZ)
 828 {
 829 //
 830 //  Cut values for ITS mode
 831 //
 832   fMode = 0;
 833   SetITSrefitRequired();
 834   SetDCAcut(dcacut);
 835   SetDCAcutIter0(dcacutIter0);
 836   SetMaxd0z0(maxd0z0);
 837   SetMinClusters(minCls);
 838   SetMinTracks(mintrks);
 839   SetNSigmad0(nsigma);
 840   SetMinDetFitter(mindetfitter);
 841   SetMaxTgl(maxtgl);
 842   SetFiducialRZ(fidR,fidZ);
 843
 844   return;
 845 }
 846 //---------------------------------------------------------------------------
 847 void AliVertexerTracks::SetTPCMode(Double_t dcacut,
 848                                    Double_t dcacutIter0,
 849                                    Double_t maxd0z0,
 850                                    Int_t minCls,
 851                                    Int_t mintrks,
 852                                    Double_t nsigma,
 853                                    Double_t mindetfitter,
 854                                    Double_t maxtgl,
 855                                    Double_t fidR,
 856                                    Double_t fidZ)
 857 {
 858 //
 859 //  Cut values for TPC mode
 860 //
 861   fMode = 1;
 862   SetITSrefitNotRequired();
 863   SetDCAcut(dcacut);
 864   SetDCAcutIter0(dcacutIter0);
 865   SetMaxd0z0(maxd0z0);
 866   SetMinClusters(minCls);
 867   SetMinTracks(mintrks);
 868   SetNSigmad0(nsigma);
 869   SetMinDetFitter(mindetfitter);
 870   SetMaxTgl(maxtgl);
 871   SetFiducialRZ(fidR,fidZ);
 872
 873   return;
 874 }
 875 //---------------------------------------------------------------------------
 876 void AliVertexerTracks::SetSkipTracks(Int_t n,Int_t *skipped)
 877 {
 878 //
 879 // Mark the tracks not to be used in the vertex reconstruction.
 880 // Tracks are identified by AliESDtrack::GetID()
 881 //
 882   fNTrksToSkip = n;  fTrksToSkip = new Int_t[n];
 883   for(Int_t i=0;i<n;i++) fTrksToSkip[i] = skipped[i];
 884   return;
 885 }
 886 //---------------------------------------------------------------------------
 887 void  AliVertexerTracks::SetVtxStart(AliESDVertex *vtx)
 888 {
 889 //
 890 // Set initial vertex knowledge
 891 //
 892   vtx->GetXYZ(fNominalPos);
 893   vtx->GetCovMatrix(fNominalCov);
 894   SetConstraintOn();
 895   return;
 896 }
 897 //---------------------------------------------------------------------------
 898 void AliVertexerTracks::StrLinVertexFinderMinDist(Int_t optUseWeights)
 899 {
 900   AliExternalTrackParam *track1;
 901   const Int_t knacc = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast();
 902   static TClonesArray linarray("AliStrLine",knacc);
 903   for(Int_t i=0; i<knacc; i++){
 904     track1 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(i);
 905     Double_t alpha=track1->GetAlpha();
 906     Double_t mindist = TMath::Cos(alpha)*fNominalPos[0]+TMath::Sin(alpha)*fNominalPos[1];
 907     Double_t pos[3],dir[3],sigmasq[3];
 908     track1->GetXYZAt(mindist,GetFieldkG(),pos);
 909     track1->GetPxPyPzAt(mindist,GetFieldkG(),dir);
 910     sigmasq[0]=TMath::Sin(alpha)*TMath::Sin(alpha)*track1->GetSigmaY2();
 911     sigmasq[1]=TMath::Cos(alpha)*TMath::Cos(alpha)*track1->GetSigmaY2();
 912     sigmasq[2]=track1->GetSigmaZ2();
 913     TMatrixD ri(3,1);
 914     TMatrixD wWi(3,3);
 915     if(!TrackToPoint(track1,ri,wWi)) continue;
 916     Double_t wmat[9];
 917     Int_t iel=0;
 918     for(Int_t ia=0;ia<3;ia++){
 919       for(Int_t ib=0;ib<3;ib++){
 920         wmat[iel]=wWi(ia,ib);
 921         iel++;
 922       }
 923     }
 924     new(linarray[i]) AliStrLine(pos,sigmasq,wmat,dir);
 925   }
 926   fVert=TrackletVertexFinder(&linarray,optUseWeights);
 927   linarray.Clear("C");
 928 }
 929 //---------------------------------------------------------------------------
 930 AliESDVertex AliVertexerTracks::TrackletVertexFinder(TClonesArray *lines, Int_t optUseWeights)
 931 {
 932   // Calculate the point at minimum distance to prepared tracks
 933
 934   const Int_t knacc = (Int_t)lines->GetEntriesFast();
 935   Double_t initPos[3]={0.,0.,0.};
 936
 937   Double_t (*vectP0)[3]=new Double_t [knacc][3];
 938   Double_t (*vectP1)[3]=new Double_t [knacc][3];
 939
 940   Double_t sum[3][3];
 941   Double_t dsum[3]={0,0,0};
 942   TMatrixD sumWi(3,3);
 943   for(Int_t i=0;i<3;i++){
 944     for(Int_t j=0;j<3;j++){
 945       sum[i][j]=0;
 946       sumWi(i,j)=0.;
 947     }
 948   }
 949
 950   for(Int_t i=0; i<knacc; i++){
 951     AliStrLine* line1 = (AliStrLine*)lines->At(i);
 952     Double_t p0[3],cd[3],sigmasq[3];
 953     Double_t wmat[9];
 954     line1->GetP0(p0);
 955     line1->GetCd(cd);
 956     line1->GetSigma2P0(sigmasq);
 957     line1->GetWMatrix(wmat);
 958     TMatrixD wWi(3,3);
 959     Int_t iel=0;
 960     for(Int_t ia=0;ia<3;ia++){
 961       for(Int_t ib=0;ib<3;ib++){
 962         wWi(ia,ib)=wmat[iel];
 963         iel++;
 964       }
 965     }
 966
 967     sumWi+=wWi;
 968
 969     Double_t p1[3]={p0[0]+cd[0],p0[1]+cd[1],p0[2]+cd[2]};
 970     vectP0[i][0]=p0[0];
 971     vectP0[i][1]=p0[1];
 972     vectP0[i][2]=p0[2];
 973     vectP1[i][0]=p1[0];
 974     vectP1[i][1]=p1[1];
 975     vectP1[i][2]=p1[2];
 976
 977     Double_t matr[3][3];
 978     Double_t dknow[3];
 979     if(optUseWeights==0)GetStrLinDerivMatrix(p0,p1,matr,dknow);
 980     else GetStrLinDerivMatrix(p0,p1,sigmasq,matr,dknow);
 981
 982
 983     for(Int_t iii=0;iii<3;iii++){
 984       dsum[iii]+=dknow[iii];
 985       for(Int_t lj=0;lj<3;lj++) sum[iii][lj]+=matr[iii][lj];
 986     }
 987   }
 988
 989   TMatrixD invsumWi(TMatrixD::kInverted,sumWi);
 990   Double_t covmatrix[6];
 991   covmatrix[0] = invsumWi(0,0);
 992   covmatrix[1] = invsumWi(0,1);
 993   covmatrix[2] = invsumWi(1,1);
 994   covmatrix[3] = invsumWi(0,2);
 995   covmatrix[4] = invsumWi(1,2);
 996   covmatrix[5] = invsumWi(2,2);
 997
 998   Double_t vett[3][3];
 999   Double_t det=GetDeterminant3X3(sum);
1000   Double_t sigma=0;
1001
1002   if(det!=0){
1003     for(Int_t zz=0;zz<3;zz++){
1004       for(Int_t ww=0;ww<3;ww++){
1005         for(Int_t kk=0;kk<3;kk++) vett[ww][kk]=sum[ww][kk];
1006       }
1007       for(Int_t kk=0;kk<3;kk++) vett[kk][zz]=dsum[kk];
1008       initPos[zz]=GetDeterminant3X3(vett)/det;
1009     }
1010
1011
1012     for(Int_t i=0; i<knacc; i++){
1013       Double_t p0[3]={0,0,0},p1[3]={0,0,0};
1014       for(Int_t ii=0;ii<3;ii++){
1015         p0[ii]=vectP0[i][ii];
1016         p1[ii]=vectP1[i][ii];
1017       }
1018       sigma+=GetStrLinMinDist(p0,p1,initPos);
1019     }
1020
1021     if(sigma>0.) {sigma=TMath::Sqrt(sigma);}else{sigma=999;}
1022   }else{
1023     sigma=999;
1024   }
1025   AliESDVertex theVert(initPos,covmatrix,99999.,knacc);
1026   theVert.SetDispersion(sigma);
1027   delete vectP0;
1028   delete vectP1;
1029   return theVert;
1030 }
1031 //---------------------------------------------------------------------------
1032 Bool_t AliVertexerTracks::TrackToPoint(AliExternalTrackParam *t,
1033                                        TMatrixD &ri,TMatrixD &wWi,
1034                                        Bool_t uUi3by3) const
1035 {
1036 //
1037 // Extract from the AliExternalTrackParam the global coordinates ri and covariance matrix
1038 // wWi of the space point that it represents (to be used in VertexFitter())
1039 //
1040
1041
1042   Double_t rotAngle = t->GetAlpha();
1043   if(rotAngle<0.) rotAngle += 2.*TMath::Pi();
1044   Double_t cosRot = TMath::Cos(rotAngle);
1045   Double_t sinRot = TMath::Sin(rotAngle);
1046
1047   ri(0,0) = t->GetX()*cosRot-t->GetY()*sinRot;
1048   ri(1,0) = t->GetX()*sinRot+t->GetY()*cosRot;
1049   ri(2,0) = t->GetZ();
1050
1051
1052
1053   if(!uUi3by3) {
1054     // matrix to go from global (x,y,z) to local (y,z);
1055     TMatrixD qQi(2,3);
1056     qQi(0,0) = -sinRot;
1057     qQi(0,1) = cosRot;
1058     qQi(0,2) = 0.;
1059     qQi(1,0) = 0.;
1060     qQi(1,1) = 0.;
1061     qQi(1,2) = 1.;
1062
1063     // covariance matrix of local (y,z) - inverted
1064     TMatrixD uUi(2,2);
1065     uUi(0,0) = t->GetSigmaY2();
1066     uUi(0,1) = t->GetSigmaZY();
1067     uUi(1,0) = t->GetSigmaZY();
1068     uUi(1,1) = t->GetSigmaZ2();
1069     //printf(" Ui :\n");
1070     //printf(" %f   %f\n",uUi(0,0),uUi(0,1));
1071     //printf(" %f   %f\n",uUi(1,0),uUi(1,1));
1072
1073     if(uUi.Determinant() <= 0.) return kFALSE;
1074     TMatrixD uUiInv(TMatrixD::kInverted,uUi);
1075
1076     // weights matrix: wWi = qQiT * uUiInv * qQi
1077     TMatrixD uUiInvQi(uUiInv,TMatrixD::kMult,qQi);
1078     TMatrixD m(qQi,TMatrixD::kTransposeMult,uUiInvQi);
1079     wWi = m;
1080   } else {
1081     if(fVert.GetNContributors()<1) AliFatal("Vertex from finder is empty");
1082     // matrix to go from global (x,y,z) to local (x,y,z);
1083     TMatrixD qQi(3,3);
1084     qQi(0,0) = cosRot;
1085     qQi(0,1) = sinRot;
1086     qQi(0,2) = 0.;
1087     qQi(1,0) = -sinRot;
1088     qQi(1,1) = cosRot;
1089     qQi(1,2) = 0.;
1090     qQi(2,0) = 0.;
1091     qQi(2,1) = 0.;
1092     qQi(2,2) = 1.;
1093
1094     // covariance of fVert along the track
1095     Double_t p[3],pt,ptot;
1096     t->GetPxPyPz(p);
1097     pt = TMath::Sqrt(p[0]*p[0]+p[1]*p[1]);
1098     ptot = TMath::Sqrt(pt*pt+p[2]*p[2]);
1099     Double_t cphi = p[0]/pt;               //cos(phi)=px/pt
1100     Double_t sphi = p[1]/pt;               //sin(phi)=py/pt
1101     Double_t clambda = pt/ptot;            //cos(lambda)=pt/ptot
1102     Double_t slambda = p[2]/ptot;            //sin(lambda)=pz/ptot
1103     Double_t covfVert[6];
1104     fVert.GetCovMatrix(covfVert);
1105     Double_t covfVertalongt =
1106        covfVert[0]*cphi*cphi*clambda*clambda
1107       +covfVert[1]*2.*cphi*sphi*clambda*clambda
1108       +covfVert[3]*2.*cphi*clambda*slambda
1109       +covfVert[2]*sphi*sphi*clambda*clambda
1110       +covfVert[4]*2.*sphi*clambda*slambda
1111       +covfVert[5]*slambda*slambda;
1112     // covariance matrix of local (x,y,z) - inverted
1113     TMatrixD uUi(3,3);
1114     uUi(0,0) = covfVertalongt * fnSigmaForUi00 * fnSigmaForUi00;
1115     if(fDebug) printf("=====> sqrtUi00 cm  %f\n",TMath::Sqrt(uUi(0,0)));
1116     uUi(0,1) = 0.;
1117     uUi(0,2) = 0.;
1118     uUi(1,0) = 0.;
1119     uUi(1,1) = t->GetSigmaY2();
1120     uUi(1,2) = t->GetSigmaZY();
1121     uUi(2,0) = 0.;
1122     uUi(2,1) = t->GetSigmaZY();
1123     uUi(2,2) = t->GetSigmaZ2();
1124     //printf(" Ui :\n");
1125     //printf(" %f   %f\n",uUi(0,0),uUi(0,1));
1126     //printf(" %f   %f\n",uUi(1,0),uUi(1,1));
1127
1128     if(uUi.Determinant() <= 0.) return kFALSE;
1129     TMatrixD uUiInv(TMatrixD::kInverted,uUi);
1130
1131     // weights matrix: wWi = qQiT * uUiInv * qQi
1132     TMatrixD uUiInvQi(uUiInv,TMatrixD::kMult,qQi);
1133     TMatrixD m(qQi,TMatrixD::kTransposeMult,uUiInvQi);
1134     wWi = m;
1135   }
1136
1137
1138   return kTRUE;
1139 }
1140 //---------------------------------------------------------------------------
1141 void AliVertexerTracks::TooFewTracks()
1142 {
1143 //
1144 // When the number of tracks is < fMinTracks,
1145 // deal with vertices not found and prepare to exit
1146 //
1147   if(fDebug) printf("TooFewTracks\n");
1148
1149   Double_t pos[3],err[3];
1150   pos[0] = fNominalPos[0];
1151   err[0] = TMath::Sqrt(fNominalCov[0]);
1152   pos[1] = fNominalPos[1];
1153   err[1] = TMath::Sqrt(fNominalCov[2]);
1154   pos[2] = fNominalPos[2];
1155   err[2] = TMath::Sqrt(fNominalCov[5]);
1156   Int_t    ncontr = (err[0]>1. ? -1 : -3);
1157   fCurrentVertex = 0;
1158   fCurrentVertex = new AliESDVertex(pos,err);
1159   fCurrentVertex->SetNContributors(ncontr);
1160
1161   if(fConstraint) {
1162     fCurrentVertex->SetTitle("VertexerTracksWithConstraint");
1163   } else {
1164     fCurrentVertex->SetTitle("VertexerTracksNoConstraint");
1165   }
1166
1167   if(!fTrkArraySel.IsEmpty()) fTrkArraySel.Delete();
1168   if(fIdSel) {delete [] fIdSel; fIdSel=NULL;}
1169   if(fTrksToSkip) {delete [] fTrksToSkip; fTrksToSkip=NULL;}
1170
1171   return;
1172 }
1173 //---------------------------------------------------------------------------
1174 void AliVertexerTracks::VertexFinder(Int_t optUseWeights)
1175 {
1176
1177   // Get estimate of vertex position in (x,y) from tracks DCA
1178
1179   Double_t initPos[3];
1180   initPos[2] = 0.;
1181   for(Int_t i=0;i<2;i++)initPos[i]=fNominalPos[i];
1182   Int_t nacc = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast();
1183   Double_t aver[3]={0.,0.,0.};
1184   Double_t aversq[3]={0.,0.,0.};
1185   Double_t sigmasq[3]={0.,0.,0.};
1186   Double_t sigma=0;
1187   Int_t ncombi = 0;
1188   AliExternalTrackParam *track1;
1189   AliExternalTrackParam *track2;
1190   Double_t pos[3],dir[3];
1191   Double_t alpha,mindist;
1192
1193   for(Int_t i=0; i<nacc; i++){
1194     track1 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(i);
1195     alpha=track1->GetAlpha();
1196     mindist = TMath::Cos(alpha)*fNominalPos[0]+TMath::Sin(alpha)*fNominalPos[1];
1197     track1->GetXYZAt(mindist,GetFieldkG(),pos);
1198     track1->GetPxPyPzAt(mindist,GetFieldkG(),dir);
1199     AliStrLine *line1 = new AliStrLine(pos,dir);
1200
1201    //    AliStrLine *line1 = new AliStrLine();
1202    //    track1->ApproximateHelixWithLine(mindist,GetFieldkG(),line1);
1203
1204     for(Int_t j=i+1; j<nacc; j++){
1205       track2 = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(j);
1206       alpha=track2->GetAlpha();
1207       mindist = TMath::Cos(alpha)*fNominalPos[0]+TMath::Sin(alpha)*fNominalPos[1];
1208       track2->GetXYZAt(mindist,GetFieldkG(),pos);
1209       track2->GetPxPyPzAt(mindist,GetFieldkG(),dir);
1210       AliStrLine *line2 = new AliStrLine(pos,dir);
1211     //      AliStrLine *line2 = new AliStrLine();
1212     //  track2->ApproximateHelixWithLine(mindist,GetFieldkG(),line2);
1213       Double_t distCA=line2->GetDCA(line1);
1214       //printf("%d   %d   %f\n",i,j,distCA);
1215        if(fDCAcut<=0 || (fDCAcut>0&&distCA<fDCAcut)){
1216         Double_t pnt1[3],pnt2[3],crosspoint[3];
1217
1218         if(optUseWeights<=0){
1219           Int_t retcode = line2->Cross(line1,crosspoint);
1220           if(retcode>=0){
1221             ncombi++;
1222             for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aver[jj]+=crosspoint[jj];
1223             for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aversq[jj]+=(crosspoint[jj]*crosspoint[jj]);
1224           }
1225         }
1226         if(optUseWeights>0){
1227           Int_t retcode = line1->CrossPoints(line2,pnt1,pnt2);
1228           if(retcode>=0){
1229             Double_t cs, sn;
1230             alpha=track1->GetAlpha();
1231             cs=TMath::Cos(alpha); sn=TMath::Sin(alpha);
1232             Double_t sx1=sn*sn*track1->GetSigmaY2(), sy1=cs*cs*track1->GetSigmaY2();
1233             alpha=track2->GetAlpha();
1234             cs=TMath::Cos(alpha); sn=TMath::Sin(alpha);
1235             Double_t sx2=sn*sn*track2->GetSigmaY2(), sy2=cs*cs*track2->GetSigmaY2();
1236             Double_t sz1=track1->GetSigmaZ2(), sz2=track2->GetSigmaZ2();
1237             Double_t wx1=sx2/(sx1+sx2), wx2=1.- wx1;
1238             Double_t wy1=sy2/(sy1+sy2), wy2=1.- wy1;
1239             Double_t wz1=sz2/(sz1+sz2), wz2=1.- wz1;
1240             crosspoint[0]=wx1*pnt1[0] + wx2*pnt2[0];
1241             crosspoint[1]=wy1*pnt1[1] + wy2*pnt2[1];
1242             crosspoint[2]=wz1*pnt1[2] + wz2*pnt2[2];
1243
1244             ncombi++;
1245             for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aver[jj]+=crosspoint[jj];
1246             for(Int_t jj=0;jj<3;jj++)aversq[jj]+=(crosspoint[jj]*crosspoint[jj]);
1247           }
1248         }
1249       }
1250       delete line2;
1251     }
1252     delete line1;
1253   }
1254   if(ncombi>0){
1255     for(Int_t jj=0;jj<3;jj++){
1256       initPos[jj] = aver[jj]/ncombi;
1257       //printf("%f\n",initPos[jj]);
1258       aversq[jj]/=ncombi;
1259       sigmasq[jj]=aversq[jj]-initPos[jj]*initPos[jj];
1260       sigma+=sigmasq[jj];
1261     }
1262     sigma=TMath::Sqrt(TMath::Abs(sigma));
1263   }
1264   else {
1265     Warning("VertexFinder","Finder did not succed");
1266     sigma=999;
1267   }
1268   fVert.SetXYZ(initPos);
1269   fVert.SetDispersion(sigma);
1270   fVert.SetNContributors(ncombi);
1271 }
1272 //---------------------------------------------------------------------------
1273 void AliVertexerTracks::VertexFitter()
1274 {
1275 //
1276 // The optimal estimate of the vertex position is given by a "weighted
1277 // average of tracks positions".
1278 // Original method: V. Karimaki, CMS Note 97/0051
1279 //
1280   Bool_t useConstraint = fConstraint;
1281   Double_t initPos[3];
1282   if(!fOnlyFitter) {
1283     fVert.GetXYZ(initPos);
1284   } else {
1285     initPos[0]=fNominalPos[0];
1286     initPos[1]=fNominalPos[1];
1287     initPos[2]=fNominalPos[2];
1288   }
1289
1290   Int_t nTrksSel = (Int_t)fTrkArraySel.GetEntries();
1291   if(nTrksSel==1) useConstraint=kTRUE;
1292   if(fDebug) {
1293     printf("--- VertexFitter(): start\n");
1294     printf(" Number of tracks in array: %d\n",nTrksSel);
1295     printf(" Minimum # tracks required in fit: %d\n",fMinTracks);
1296     printf(" Vertex position after finder: %f,%f,%f\n",initPos[0],initPos[1],initPos[2]);
1297     if(useConstraint) printf(" This vertex will be used in fit: (%f+-%f,%f+-%f)\n",fNominalPos[0],TMath::Sqrt(fNominalCov[0]),fNominalPos[1],TMath::Sqrt(fNominalCov[2]));
1298   }
1299
1300   // special treatment for few-tracks fits (e.g. secondary vertices)
1301   Bool_t uUi3by3 = kFALSE; if(nTrksSel<5 && !useConstraint) uUi3by3 = kTRUE;
1302
1303   Int_t i,j,k,step=0;
1304   TMatrixD rv(3,1);
1305   TMatrixD vV(3,3);
1306   rv(0,0) = initPos[0];
1307   rv(1,0) = initPos[1];
1308   rv(2,0) = 0.;
1309   Double_t xlStart,alpha;
1310   Int_t nTrksUsed;
1311   Double_t chi2,chi2i,chi2b;
1312   AliExternalTrackParam *t = 0;
1313   Int_t failed = 0;
1314
1315   // initial vertex covariance matrix
1316   TMatrixD vVb(3,3);
1317   vVb(0,0) = fNominalCov[0];
1318   vVb(0,1) = fNominalCov[1];
1319   vVb(0,2) = 0.;
1320   vVb(1,0) = fNominalCov[1];
1321   vVb(1,1) = fNominalCov[2];
1322   vVb(1,2) = 0.;
1323   vVb(2,0) = 0.;
1324   vVb(2,1) = 0.;
1325   vVb(2,2) = fNominalCov[5];
1326   TMatrixD vVbInv(TMatrixD::kInverted,vVb);
1327   TMatrixD rb(3,1);
1328   rb(0,0) = fNominalPos[0];
1329   rb(1,0) = fNominalPos[1];
1330   rb(2,0) = fNominalPos[2];
1331   TMatrixD vVbInvrb(vVbInv,TMatrixD::kMult,rb);
1332
1333
1334   // 2 steps:
1335   // 1st - estimate of vtx using all tracks
1336   // 2nd - estimate of global chi2
1337   for(step=0; step<2; step++) {
1338     if(fDebug) printf(" step = %d\n",step);
1339     chi2 = 0.;
1340     nTrksUsed = 0;
1341
1342     if(step==1) { initPos[0]=rv(0,0); initPos[0]=rv(1,0); }
1343
1344     TMatrixD sumWiri(3,1);
1345     TMatrixD sumWi(3,3);
1346     for(i=0; i<3; i++) {
1347       sumWiri(i,0) = 0.;
1348       for(j=0; j<3; j++) sumWi(j,i) = 0.;
1349     }
1350
1351     // mean vertex constraint
1352     if(useConstraint) {
1353       for(i=0;i<3;i++) {
1354         sumWiri(i,0) += vVbInvrb(i,0);
1355         for(k=0;k<3;k++) sumWi(i,k) += vVbInv(i,k);
1356       }
1357       // chi2
1358       TMatrixD deltar = rv; deltar -= rb;
1359       TMatrixD vVbInvdeltar(vVbInv,TMatrixD::kMult,deltar);
1360       chi2b = deltar(0,0)*vVbInvdeltar(0,0)+
1361               deltar(1,0)*vVbInvdeltar(1,0)+
1362               deltar(2,0)*vVbInvdeltar(2,0);
1363       chi2 += chi2b;
1364     }
1365
1366     // loop on tracks
1367     for(k=0; k<nTrksSel; k++) {
1368       // get track from track array
1369       t = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(k);
1370       alpha = t->GetAlpha();
1371       xlStart = initPos[0]*TMath::Cos(alpha)+initPos[1]*TMath::Sin(alpha);
1372       // to vtxSeed (from finder)
1373       t->PropagateTo(xlStart,GetFieldkG());
1374
1375       // vector of track global coordinates
1376       TMatrixD ri(3,1);
1377       // covariance matrix of ri
1378       TMatrixD wWi(3,3);
1379
1380       // get space point from track
1381       if(!TrackToPoint(t,ri,wWi,uUi3by3)) continue;
1382       TMatrixD wWiri(wWi,TMatrixD::kMult,ri);
1383
1384       // track chi2
1385       TMatrixD deltar = rv; deltar -= ri;
1386       TMatrixD wWideltar(wWi,TMatrixD::kMult,deltar);
1387       chi2i = deltar(0,0)*wWideltar(0,0)+
1388               deltar(1,0)*wWideltar(1,0)+
1389               deltar(2,0)*wWideltar(2,0);
1390
1391       // add to total chi2
1392       chi2 += chi2i;
1393
1394       sumWiri += wWiri;
1395       sumWi   += wWi;
1396
1397       nTrksUsed++;
1398     } // end loop on tracks
1399
1400     if(nTrksUsed < fMinTracks) {
1401       failed=1;
1402       continue;
1403     }
1404
1405     Double_t determinant = sumWi.Determinant();
1406     if(determinant < fMinDetFitter)  {
1407       printf("det(V) = %f (<%f)\n",determinant,fMinDetFitter);
1408       failed=1;
1409       continue;
1410     }
1411
1412     if(step==0) {
1413       // inverted of weights matrix
1414       TMatrixD invsumWi(TMatrixD::kInverted,sumWi);
1415       vV = invsumWi;
1416       // position of primary vertex
1417       rv.Mult(vV,sumWiri);
1418     }
1419   } // end loop on the 2 steps
1420
1421   if(failed) {
1422     TooFewTracks();
1423     return;
1424   }
1425
1426   Double_t position[3];
1427   position[0] = rv(0,0);
1428   position[1] = rv(1,0);
1429   position[2] = rv(2,0);
1430   Double_t covmatrix[6];
1431   covmatrix[0] = vV(0,0);
1432   covmatrix[1] = vV(0,1);
1433   covmatrix[2] = vV(1,1);
1434   covmatrix[3] = vV(0,2);
1435   covmatrix[4] = vV(1,2);
1436   covmatrix[5] = vV(2,2);
1437
1438   // for correct chi2/ndf, count constraint as additional "track"
1439   if(fConstraint) nTrksUsed++;
1440   // store data in the vertex object
1441   fCurrentVertex = new AliESDVertex(position,covmatrix,chi2,nTrksUsed);
1442
1443   if(fDebug) {
1444     printf(" Vertex after fit:\n");
1445     fCurrentVertex->PrintStatus();
1446     printf("--- VertexFitter(): finish\n");
1447   }
1448
1449   return;
1450 }
1451 //----------------------------------------------------------------------------
1452 AliESDVertex* AliVertexerTracks::VertexForSelectedTracks(TObjArray *trkArray,
1453                                                          UShort_t *id,
1454                                                          Bool_t optUseFitter,
1455                                                          Bool_t optPropagate)
1456 {
1457 //
1458 // Return vertex from tracks (AliExternalTrackParam) in array
1459 //
1460
1461   SetConstraintOff();
1462
1463   // get tracks and propagate them to initial vertex position
1464   fIdSel = new UShort_t[(Int_t)trkArray->GetEntriesFast()];
1465   Int_t nTrksSel = PrepareTracks(*trkArray,id,0);
1466   if(nTrksSel <  TMath::Max(2,fMinTracks)) {
1467     TooFewTracks();
1468     return fCurrentVertex;
1469   }
1470
1471   // vertex finder
1472   switch (fAlgo) {
1473     case 1: StrLinVertexFinderMinDist(1); break;
1474     case 2: StrLinVertexFinderMinDist(0); break;
1475     case 3: HelixVertexFinder();          break;
1476     case 4: VertexFinder(1);              break;
1477     case 5: VertexFinder(0);              break;
1478     default: printf("Wrong algorithm\n"); break;
1479   }
1480   if(fDebug) printf(" Vertex finding completed\n");
1481
1482   // vertex fitter
1483   if(optUseFitter) {
1484     VertexFitter();
1485   } else {
1486     Double_t position[3]={fVert.GetXv(),fVert.GetYv(),fVert.GetZv()};
1487     Double_t covmatrix[6];
1488     fVert.GetCovMatrix(covmatrix);
1489     Double_t chi2=99999.;
1490     Int_t    nTrksUsed=fVert.GetNContributors();
1491     fCurrentVertex = new AliESDVertex(position,covmatrix,chi2,nTrksUsed);
1492   }
1493   fCurrentVertex->SetDispersion(fVert.GetDispersion());
1494
1495
1496   // set indices of used tracks and propagate track to found vertex
1497   UShort_t *indices = 0;
1498   Double_t d0z0[2],covd0z0[3];
1499   AliExternalTrackParam *t = 0;
1500   if(fCurrentVertex->GetNContributors()>0) {
1501     indices = new UShort_t[fCurrentVertex->GetNContributors()];
1502     for(Int_t jj=0; jj<(Int_t)fTrkArraySel.GetEntriesFast(); jj++) {
1503       indices[jj] = fIdSel[jj];
1504       t = (AliExternalTrackParam*)fTrkArraySel.At(jj);
1505       if(optPropagate && optUseFitter) {
1506         if(TMath::Sqrt(fCurrentVertex->GetXv()*fCurrentVertex->GetXv()+fCurrentVertex->GetYv()*fCurrentVertex->GetYv())<3.) {
1507           t->PropagateToDCA(fCurrentVertex,GetFieldkG(),100.,d0z0,covd0z0);
1508           if(fDebug) printf("Track %d propagated to found vertex\n",jj);
1509         } else {
1510           AliWarning("Found vertex outside beam pipe!");
1511         }
1512       }
1513     }
1514     fCurrentVertex->SetIndices(fCurrentVertex->GetNContributors(),indices);
1515   }
1516
1517   // clean up
1518   delete [] indices; indices=NULL;
1519   delete [] fIdSel; fIdSel=NULL;
1520   fTrkArraySel.Delete();
1521
1522   return fCurrentVertex;
1523 }
1524 //----------------------------------------------------------------------------
1525 AliESDVertex* AliVertexerTracks::VertexForSelectedESDTracks(TObjArray *trkArray,
1526                                                          Bool_t optUseFitter,
1527                                                          Bool_t optPropagate)
1528 {
1529 //
1530 // Return vertex from array of ESD tracks
1531 //
1532
1533   Int_t nTrks = (Int_t)trkArray->GetEntriesFast();
1534   UShort_t *id = new UShort_t[nTrks];
1535
1536   AliESDtrack *esdt = 0;
1537   for(Int_t i=0; i<nTrks; i++){
1538     esdt = (AliESDtrack*)trkArray->At(i);
1539     id[i] = (UShort_t)esdt->GetID();
1540   }
1541
1542   VertexForSelectedTracks(trkArray,id,optUseFitter,optPropagate);
1543
1544   delete [] id; id=NULL;
1545
1546   return fCurrentVertex;
1547 }
1548 //--------------------------------------------------------------------------