STEER/STEERBase/AliPIDResponse.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id: AliPIDResponse.cxx 46193 2010-12-21 09:00:14Z wiechula $ */
  17
  18 //-----------------------------------------------------------------
  19 //        Base class for handling the pid response               //
  20 //        functions of all detectors                             //
  21 //        and give access to the nsigmas                         //
  22 //                                                               //
  23 //   Origin: Jens Wiechula, Uni Tuebingen, jens.wiechula@cern.ch //
  24 //-----------------------------------------------------------------
  25
  26 #include <TList.h>
  27 #include <TObjArray.h>
  28 #include <TPRegexp.h>
  29 #include <TF1.h>
  30 #include <TH2D.h>
  31 #include <TSpline.h>
  32 #include <TFile.h>
  33 #include <TArrayI.h>
  34 #include <TArrayF.h>
  35 #include <TLinearFitter.h>
  36 #include <TSystem.h>
  37 #include <TMD5.h>
  38
  39 #include <AliVEvent.h>
  40 #include <AliVTrack.h>
  41 #include <AliLog.h>
  42 #include <AliPID.h>
  43 #include <AliOADBContainer.h>
  44 #include <AliTRDPIDResponseObject.h>
  45 #include <AliTRDdEdxParams.h>
  46 #include <AliTOFPIDParams.h>
  47 #include <AliHMPIDPIDParams.h>
  48
  49 #include "AliPIDResponse.h"
  50 #include "AliDetectorPID.h"
  51
  52 #include "AliCentrality.h"
  53
  54 ClassImp(AliPIDResponse);
  55
  56 Float_t AliPIDResponse::fgTOFmismatchProb = 0.0;
  57
  58 AliPIDResponse::AliPIDResponse(Bool_t isMC/*=kFALSE*/) :
  59 TNamed("PIDResponse","PIDResponse"),
  60 fITSResponse(isMC),
  61 fTPCResponse(),
  62 fTRDResponse(),
  63 fTOFResponse(),
  64 fHMPIDResponse(),
  65 fEMCALResponse(),
  66 fRange(5.),
  67 fITSPIDmethod(kITSTruncMean),
  68 fTuneMConData(kFALSE),
  69 fTuneMConDataMask(kDetTOF|kDetTPC),
  70 fIsMC(isMC),
  71 fCachePID(kFALSE),
  72 fOADBPath(),
  73 fCustomTPCpidResponse(),
  74 fCustomTPCetaMaps(),
  75 fBeamType("PP"),
  76 fLHCperiod(),
  77 fMCperiodTPC(),
  78 fMCperiodUser(),
  79 fCurrentFile(),
  80 fCurrentAliRootRev(-1),
  81 fRecoPass(0),
  82 fRecoPassUser(-1),
  83 fRun(-1),
  84 fOldRun(-1),
  85 fResT0A(75.),
  86 fResT0C(65.),
  87 fResT0AC(55.),
  88 fArrPidResponseMaster(NULL),
  89 fResolutionCorrection(NULL),
  90 fOADBvoltageMaps(NULL),
  91 fUseTPCEtaCorrection(kFALSE),
  92 fUseTPCMultiplicityCorrection(kFALSE),
  93 fTRDPIDResponseObject(NULL),
  94 fTRDdEdxParams(NULL),
  95 fTOFtail(0.9),
  96 fTOFPIDParams(NULL),
  97 fHMPIDPIDParams(NULL),
  98 fEMCALPIDParams(NULL),
  99 fCurrentEvent(NULL),
 100 fCurrCentrality(0.0),
 101 fBeamTypeNum(kPP),
 102 fNoTOFmism(kFALSE)
 103 {
 104   //
 105   // default ctor
 106   //
 107   AliLog::SetClassDebugLevel("AliPIDResponse",0);
 108   AliLog::SetClassDebugLevel("AliESDpid",0);
 109   AliLog::SetClassDebugLevel("AliAODpidUtil",0);
 110
 111 }
 112
 113 //______________________________________________________________________________
 114 AliPIDResponse::~AliPIDResponse()
 115 {
 116   //
 117   // dtor
 118   //
 119   delete fArrPidResponseMaster;
 120   delete fTRDPIDResponseObject;
 121   delete fTRDdEdxParams;
 122   delete fTOFPIDParams;
 123 }
 124
 125 //______________________________________________________________________________
 126 AliPIDResponse::AliPIDResponse(const AliPIDResponse &other) :
 127 TNamed(other),
 128 fITSResponse(other.fITSResponse),
 129 fTPCResponse(other.fTPCResponse),
 130 fTRDResponse(other.fTRDResponse),
 131 fTOFResponse(other.fTOFResponse),
 132 fHMPIDResponse(other.fHMPIDResponse),
 133 fEMCALResponse(other.fEMCALResponse),
 134 fRange(other.fRange),
 135 fITSPIDmethod(other.fITSPIDmethod),
 136 fTuneMConData(other.fTuneMConData),
 137 fTuneMConDataMask(other.fTuneMConDataMask),
 138 fIsMC(other.fIsMC),
 139 fCachePID(other.fCachePID),
 140 fOADBPath(other.fOADBPath),
 141 fCustomTPCpidResponse(other.fCustomTPCpidResponse),
 142 fCustomTPCetaMaps(other.fCustomTPCetaMaps),
 143 fBeamType("PP"),
 144 fLHCperiod(),
 145 fMCperiodTPC(),
 146 fMCperiodUser(other.fMCperiodUser),
 147 fCurrentFile(),
 148 fCurrentAliRootRev(other.fCurrentAliRootRev),
 149 fRecoPass(0),
 150 fRecoPassUser(other.fRecoPassUser),
 151 fRun(-1),
 152 fOldRun(-1),
 153 fResT0A(75.),
 154 fResT0C(65.),
 155 fResT0AC(55.),
 156 fArrPidResponseMaster(NULL),
 157 fResolutionCorrection(NULL),
 158 fOADBvoltageMaps(NULL),
 159 fUseTPCEtaCorrection(other.fUseTPCEtaCorrection),
 160 fUseTPCMultiplicityCorrection(other.fUseTPCMultiplicityCorrection),
 161 fTRDPIDResponseObject(NULL),
 162 fTRDdEdxParams(NULL),
 163 fTOFtail(0.9),
 164 fTOFPIDParams(NULL),
 165 fHMPIDPIDParams(NULL),
 166 fEMCALPIDParams(NULL),
 167 fCurrentEvent(NULL),
 168 fCurrCentrality(0.0),
 169 fBeamTypeNum(kPP),
 170 fNoTOFmism(other.fNoTOFmism)
 171 {
 172   //
 173   // copy ctor
 174   //
 175 }
 176
 177 //______________________________________________________________________________
 178 AliPIDResponse& AliPIDResponse::operator=(const AliPIDResponse &other)
 179 {
 180   //
 181   // copy ctor
 182   //
 183   if(this!=&other) {
 184     delete fArrPidResponseMaster;
 185     TNamed::operator=(other);
 186     fITSResponse=other.fITSResponse;
 187     fTPCResponse=other.fTPCResponse;
 188     fTRDResponse=other.fTRDResponse;
 189     fTOFResponse=other.fTOFResponse;
 190     fHMPIDResponse=other.fHMPIDResponse;
 191     fEMCALResponse=other.fEMCALResponse;
 192     fRange=other.fRange;
 193     fITSPIDmethod=other.fITSPIDmethod;
 194     fOADBPath=other.fOADBPath;
 195     fCustomTPCpidResponse=other.fCustomTPCpidResponse;
 196     fCustomTPCetaMaps=other.fCustomTPCetaMaps;
 197     fTuneMConData=other.fTuneMConData;
 198     fTuneMConDataMask=other.fTuneMConDataMask;
 199     fIsMC=other.fIsMC;
 200     fCachePID=other.fCachePID;
 201     fBeamType="PP";
 202     fBeamTypeNum=kPP;
 203     fLHCperiod="";
 204     fMCperiodTPC="";
 205     fMCperiodUser=other.fMCperiodUser;
 206     fCurrentFile="";
 207     fCurrentAliRootRev=other.fCurrentAliRootRev;
 208     fRecoPass=0;
 209     fRecoPassUser=other.fRecoPassUser;
 210     fRun=-1;
 211     fOldRun=-1;
 212     fResT0A=75.;
 213     fResT0C=65.;
 214     fResT0AC=55.;
 215     fArrPidResponseMaster=NULL;
 216     fResolutionCorrection=NULL;
 217     fOADBvoltageMaps=NULL;
 218     fUseTPCEtaCorrection=other.fUseTPCEtaCorrection;
 219     fUseTPCMultiplicityCorrection=other.fUseTPCMultiplicityCorrection;
 220     fTRDPIDResponseObject=NULL;
 221     fTRDdEdxParams=NULL;
 222     fEMCALPIDParams=NULL;
 223     fTOFtail=0.9;
 224     fTOFPIDParams=NULL;
 225     fHMPIDPIDParams=NULL;
 226     fCurrentEvent=other.fCurrentEvent;
 227     fNoTOFmism = other.fNoTOFmism;
 228
 229   }
 230   return *this;
 231 }
 232
 233 //______________________________________________________________________________
 234 Float_t AliPIDResponse::NumberOfSigmas(EDetector detector, const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
 235 {
 236   //
 237   // NumberOfSigmas for 'detCode'
 238   //
 239
 240   const AliVTrack *track=static_cast<const AliVTrack*>(vtrack);
 241   // look for cached value first
 242   const AliDetectorPID *detPID=track->GetDetectorPID();
 243
 244   if ( detPID && detPID->HasNumberOfSigmas(detector)){
 245     return detPID->GetNumberOfSigmas(detector, type);
 246   } else if (fCachePID) {
 247     FillTrackDetectorPID(track, detector);
 248     detPID=track->GetDetectorPID();
 249     return detPID->GetNumberOfSigmas(detector, type);
 250   }
 251
 252   return GetNumberOfSigmas(detector, track, type);
 253 }
 254
 255 //______________________________________________________________________________
 256 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::NumberOfSigmas(EDetector detCode, const AliVParticle *track,
 257                                                              AliPID::EParticleType type, Double_t &val) const
 258 {
 259   //
 260   // NumberOfSigmas with detector status as return value
 261   //
 262
 263   val=NumberOfSigmas(detCode, track, type);
 264   return CheckPIDStatus(detCode, (AliVTrack*)track);
 265 }
 266
 267 //______________________________________________________________________________
 268 // public buffered versions of the PID calculation
 269 //
 270
 271 //______________________________________________________________________________
 272 Float_t AliPIDResponse::NumberOfSigmasITS(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
 273 {
 274   //
 275   // Calculate the number of sigmas in the ITS
 276   //
 277
 278   return NumberOfSigmas(kITS, vtrack, type);
 279 }
 280
 281 //______________________________________________________________________________
 282 Float_t AliPIDResponse::NumberOfSigmasTPC(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
 283 {
 284   //
 285   // Calculate the number of sigmas in the TPC
 286   //
 287
 288   return NumberOfSigmas(kTPC, vtrack, type);
 289 }
 290
 291 //______________________________________________________________________________
 292 Float_t AliPIDResponse::NumberOfSigmasTPC( const AliVParticle *vtrack,
 293                                            AliPID::EParticleType type,
 294                                            AliTPCPIDResponse::ETPCdEdxSource dedxSource) const
 295 {
 296   //get number of sigmas according the selected TPC gain configuration scenario
 297   const AliVTrack *track=static_cast<const AliVTrack*>(vtrack);
 298
 299   Float_t nSigma=fTPCResponse.GetNumberOfSigmas(track, type, dedxSource, fUseTPCEtaCorrection, fUseTPCMultiplicityCorrection);
 300
 301   return nSigma;
 302 }
 303
 304 //______________________________________________________________________________
 305 Float_t AliPIDResponse::NumberOfSigmasTRD(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
 306 {
 307   //
 308   // Calculate the number of sigmas in the TRD
 309   //
 310   return NumberOfSigmas(kTRD, vtrack, type);
 311 }
 312
 313 //______________________________________________________________________________
 314 Float_t AliPIDResponse::NumberOfSigmasTOF(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
 315 {
 316   //
 317   // Calculate the number of sigmas in the TOF
 318   //
 319
 320   return NumberOfSigmas(kTOF, vtrack, type);
 321 }
 322
 323 //______________________________________________________________________________
 324 Float_t AliPIDResponse::NumberOfSigmasHMPID(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
 325 {
 326   //
 327   // Calculate the number of sigmas in the EMCAL
 328   //
 329
 330   return NumberOfSigmas(kHMPID, vtrack, type);
 331 }
 332
 333 //______________________________________________________________________________
 334 Float_t AliPIDResponse::NumberOfSigmasEMCAL(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
 335 {
 336   //
 337   // Calculate the number of sigmas in the EMCAL
 338   //
 339
 340   return NumberOfSigmas(kEMCAL, vtrack, type);
 341 }
 342
 343 //______________________________________________________________________________
 344 Float_t  AliPIDResponse::NumberOfSigmasEMCAL(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type, Double_t &eop, Double_t showershape[4])  const
 345 {
 346   //
 347   // emcal nsigma with eop and showershape
 348   //
 349   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
 350
 351   AliVCluster *matchedClus = NULL;
 352
 353   Double_t mom     = -1.;
 354   Double_t pt      = -1.;
 355   Double_t EovP    = -1.;
 356   Double_t fClsE   = -1.;
 357
 358   // initialize eop and shower shape parameters
 359   eop = -1.;
 360   for(Int_t i = 0; i < 4; i++){
 361     showershape[i] = -1.;
 362   }
 363
 364   Int_t nMatchClus = -1;
 365   Int_t charge     = 0;
 366
 367   // Track matching
 368   nMatchClus = track->GetEMCALcluster();
 369   if(nMatchClus > -1){
 370
 371     mom    = track->P();
 372     pt     = track->Pt();
 373     charge = track->Charge();
 374
 375     matchedClus = (AliVCluster*)fCurrentEvent->GetCaloCluster(nMatchClus);
 376
 377     if(matchedClus){
 378
 379       // matched cluster is EMCAL
 380       if(matchedClus->IsEMCAL()){
 381
 382         fClsE       = matchedClus->E();
 383         EovP        = fClsE/mom;
 384
 385         // fill used EMCAL variables here
 386         eop            = EovP; // E/p
 387         showershape[0] = matchedClus->GetNCells(); // number of cells in cluster
 388         showershape[1] = matchedClus->GetM02(); // long axis
 389         showershape[2] = matchedClus->GetM20(); // short axis
 390         showershape[3] = matchedClus->GetDispersion(); // dispersion
 391
 392         // look for cached value first
 393         const AliDetectorPID *detPID=track->GetDetectorPID();
 394         const EDetector detector=kEMCAL;
 395
 396         if ( detPID && detPID->HasNumberOfSigmas(detector)){
 397           return detPID->GetNumberOfSigmas(detector, type);
 398         } else if (fCachePID) {
 399           FillTrackDetectorPID(track, detector);
 400           detPID=track->GetDetectorPID();
 401           return detPID->GetNumberOfSigmas(detector, type);
 402         }
 403
 404         // NSigma value really meaningful only for electrons!
 405         return fEMCALResponse.GetNumberOfSigmas(pt,EovP,type,charge);
 406       }
 407     }
 408   }
 409   return -999;
 410 }
 411
 412 //______________________________________________________________________________
 413 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetSignalDelta(EDetector detector, const AliVParticle *track, AliPID::EParticleType type, Double_t &val, Bool_t ratio/*=kFALSE*/) const
 414 {
 415   //
 416   //
 417   //
 418   val=-9999.;
 419   switch (detector){
 420     case kITS:   return GetSignalDeltaITS(track,type,val,ratio); break;
 421     case kTPC:   return GetSignalDeltaTPC(track,type,val,ratio); break;
 422     case kTRD:   return GetSignalDeltaTRD(track,type,val,ratio); break;
 423     case kTOF:   return GetSignalDeltaTOF(track,type,val,ratio); break;
 424     case kHMPID: return GetSignalDeltaHMPID(track,type,val,ratio); break;
 425     default: return kDetNoSignal;
 426   }
 427   return kDetNoSignal;
 428 }
 429
 430 //______________________________________________________________________________
 431 Double_t AliPIDResponse::GetSignalDelta(EDetector detCode, const AliVParticle *track, AliPID::EParticleType type, Bool_t ratio/*=kFALSE*/) const
 432 {
 433   //
 434   //
 435   //
 436   Double_t val=-9999.;
 437   EDetPidStatus stat=GetSignalDelta(detCode, track, type, val, ratio);
 438   if ( stat==kDetNoSignal ) val=-9999.;
 439   return val;
 440 }
 441
 442 //______________________________________________________________________________
 443 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputePIDProbability  (EDetCode  detCode, const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
 444 {
 445   // Compute PID response of 'detCode'
 446
 447   // find detector code from detector bit mask
 448   Int_t detector=-1;
 449   for (Int_t idet=0; idet<kNdetectors; ++idet) if ( (detCode&(1<<idet)) ) { detector=idet; break; }
 450   if (detector==-1) return kDetNoSignal;
 451
 452   return ComputePIDProbability((EDetector)detector, track, nSpecies, p);
 453 }
 454
 455 //______________________________________________________________________________
 456 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputePIDProbability  (EDetector detector,  const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
 457 {
 458   //
 459   // Compute PID response of 'detector'
 460   //
 461
 462   const AliDetectorPID *detPID=track->GetDetectorPID();
 463
 464   if ( detPID && detPID->HasRawProbability(detector)){
 465     return detPID->GetRawProbability(detector, p, nSpecies);
 466   } else if (fCachePID) {
 467     FillTrackDetectorPID(track, detector);
 468     detPID=track->GetDetectorPID();
 469     return detPID->GetRawProbability(detector, p, nSpecies);
 470   }
 471
 472   //if no caching return values calculated from scratch
 473   return GetComputePIDProbability(detector, track, nSpecies, p);
 474 }
 475
 476 //______________________________________________________________________________
 477 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputeITSProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
 478 {
 479   // Compute PID response for the ITS
 480   return ComputePIDProbability(kITS, track, nSpecies, p);
 481 }
 482
 483 //______________________________________________________________________________
 484 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputeTPCProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
 485 {
 486   // Compute PID response for the TPC
 487   return ComputePIDProbability(kTPC, track, nSpecies, p);
 488 }
 489
 490 //______________________________________________________________________________
 491 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputeTOFProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
 492 {
 493   // Compute PID response for the
 494   return ComputePIDProbability(kTOF, track, nSpecies, p);
 495 }
 496
 497 //______________________________________________________________________________
 498 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputeTRDProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
 499 {
 500   // Compute PID response for the
 501   return ComputePIDProbability(kTRD, track, nSpecies, p);
 502 }
 503
 504 //______________________________________________________________________________
 505 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputeEMCALProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
 506 {
 507   // Compute PID response for the EMCAL
 508   return ComputePIDProbability(kEMCAL, track, nSpecies, p);
 509 }
 510 //______________________________________________________________________________
 511 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputePHOSProbability (const AliVTrack */*track*/, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
 512 {
 513   // Compute PID response for the PHOS
 514
 515   // set flat distribution (no decision)
 516   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
 517   return kDetNoSignal;
 518 }
 519
 520 //______________________________________________________________________________
 521 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputeHMPIDProbability(const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
 522 {
 523   // Compute PID response for the HMPID
 524   return ComputePIDProbability(kHMPID, track, nSpecies, p);
 525 }
 526
 527 //______________________________________________________________________________
 528 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::ComputeTRDProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[],AliTRDPIDResponse::ETRDPIDMethod PIDmethod) const
 529 {
 530   // Compute PID response for the
 531   return GetComputeTRDProbability(track, nSpecies, p, PIDmethod);
 532 }
 533
 534 //______________________________________________________________________________
 535 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::CheckPIDStatus(EDetector detector, const AliVTrack *track) const
 536 {
 537   // calculate detector pid status
 538
 539   const Int_t iDetCode=(Int_t)detector;
 540   if (iDetCode<0||iDetCode>=kNdetectors) return kDetNoSignal;
 541   const AliDetectorPID *detPID=track->GetDetectorPID();
 542
 543   if ( detPID ){
 544     return detPID->GetPIDStatus(detector);
 545   } else if (fCachePID) {
 546     FillTrackDetectorPID(track, detector);
 547     detPID=track->GetDetectorPID();
 548     return detPID->GetPIDStatus(detector);
 549   }
 550
 551   // if not buffered and no buffering is requested
 552   return GetPIDStatus(detector, track);
 553 }
 554
 555 //______________________________________________________________________________
 556 void AliPIDResponse::InitialiseEvent(AliVEvent *event, Int_t pass, Int_t run)
 557 {
 558   //
 559   // Apply settings for the current event
 560   //
 561   fRecoPass=pass;
 562
 563
 564   fCurrentEvent=NULL;
 565   if (!event) return;
 566   fCurrentEvent=event;
 567   if (run>0) fRun=run;
 568   else fRun=event->GetRunNumber();
 569
 570   if (fRun!=fOldRun){
 571     ExecNewRun();
 572     fOldRun=fRun;
 573   }
 574
 575   //TPC resolution parametrisation PbPb
 576   if ( fResolutionCorrection ){
 577     Double_t corrSigma=fResolutionCorrection->Eval(GetTPCMultiplicityBin(event));
 578     fTPCResponse.SetSigma(3.79301e-03*corrSigma, 2.21280e+04);
 579   }
 580
 581   // Set up TPC multiplicity for PbPb
 582   if (fUseTPCMultiplicityCorrection) {
 583     Int_t numESDtracks = event->GetNumberOfESDTracks();
 584     if (numESDtracks < 0) {
 585       AliError("Cannot obtain event multiplicity (number of ESD tracks < 0). If you are using AODs, this might be a too old production. Please disable the multiplicity correction to get a reliable PID result!");
 586       numESDtracks = 0;
 587     }
 588     fTPCResponse.SetCurrentEventMultiplicity(numESDtracks);
 589   }
 590   else
 591     fTPCResponse.SetCurrentEventMultiplicity(0);
 592
 593   //TOF resolution
 594   SetTOFResponse(event, (AliPIDResponse::EStartTimeType_t)fTOFPIDParams->GetStartTimeMethod());
 595
 596
 597   // Get and set centrality
 598   AliCentrality *centrality = event->GetCentrality();
 599   if(centrality){
 600     fCurrCentrality = centrality->GetCentralityPercentile("V0M");
 601   }
 602   else{
 603     fCurrCentrality = -1;
 604   }
 605
 606   // Set centrality percentile for EMCAL
 607   fEMCALResponse.SetCentrality(fCurrCentrality);
 608
 609   // switch off some TOF channel according to OADB to match data TOF matching eff
 610   if (fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTOF) == kDetTOF) && fTOFPIDParams->GetTOFmatchingLossMC() > 0.01){
 611     Int_t ntrk = event->GetNumberOfTracks();
 612     for(Int_t i=0;i < ntrk;i++){
 613       AliVParticle *trk = event->GetTrack(i);
 614       Int_t channel = GetTOFResponse().GetTOFchannel(trk);
 615       Int_t swoffEachOfThem = Int_t(100./fTOFPIDParams->GetTOFmatchingLossMC() + 0.5);
 616       if(!(channel%swoffEachOfThem)) ((AliVTrack *) trk)->ResetStatus(AliVTrack::kTOFout);
 617     }
 618   }
 619
 620 }
 621
 622 //______________________________________________________________________________
 623 void AliPIDResponse::ExecNewRun()
 624 {
 625   //
 626   // Things to Execute upon a new run
 627   //
 628   SetRecoInfo();
 629
 630   SetITSParametrisation();
 631
 632   SetTPCPidResponseMaster();
 633   SetTPCParametrisation();
 634   SetTPCEtaMaps();
 635
 636   SetTRDPidResponseMaster();
 637   //has to precede InitializeTRDResponse(), otherwise the read-out fTRDdEdxParams is not pased in TRDResponse!
 638   SetTRDdEdxParams();
 639   InitializeTRDResponse();
 640
 641   SetEMCALPidResponseMaster();
 642   InitializeEMCALResponse();
 643
 644   SetTOFPidResponseMaster();
 645   InitializeTOFResponse();
 646
 647   SetHMPIDPidResponseMaster();
 648   InitializeHMPIDResponse();
 649
 650   if (fCurrentEvent) fTPCResponse.SetMagField(fCurrentEvent->GetMagneticField());
 651 }
 652
 653 //______________________________________________________________________________
 654 Double_t AliPIDResponse::GetTPCMultiplicityBin(const AliVEvent * const event)
 655 {
 656   //
 657   // Get TPC multiplicity in bins of 150
 658   //
 659
 660   const AliVVertex* vertexTPC = event->GetPrimaryVertex();
 661   Double_t tpcMulti=0.;
 662   if(vertexTPC){
 663     Double_t vertexContribTPC=vertexTPC->GetNContributors();
 664     tpcMulti=vertexContribTPC/150.;
 665     if (tpcMulti>20.) tpcMulti=20.;
 666   }
 667
 668   return tpcMulti;
 669 }
 670
 671 //______________________________________________________________________________
 672 void AliPIDResponse::SetRecoInfo()
 673 {
 674   //
 675   // Set reconstruction information
 676   //
 677
 678   //reset information
 679   fLHCperiod="";
 680   fMCperiodTPC="";
 681
 682   fBeamType="";
 683
 684   fBeamType="PP";
 685   fBeamTypeNum=kPP;
 686
 687   Bool_t hasProdInfo=(fCurrentFile.BeginsWith("LHC"));
 688
 689   TPRegexp reg(".*(LHC1[1-3][a-z]+[0-9]+[a-z_]*)[/_].*");
 690   if (hasProdInfo) reg=TPRegexp("LHC1[1-2][a-z]+[0-9]+[a-z_]*");
 691   TPRegexp reg12a17("LHC1[2-4][a-z]");
 692
 693   //find the period by run number (UGLY, but not stored in ESD and AOD... )
 694   if (fRun>=114737&&fRun<=117223)      { fLHCperiod="LHC10B"; fMCperiodTPC="LHC10D1";  }
 695   else if (fRun>=118503&&fRun<=121040) { fLHCperiod="LHC10C"; fMCperiodTPC="LHC10D1";  }
 696   else if (fRun>=122195&&fRun<=126437) { fLHCperiod="LHC10D"; fMCperiodTPC="LHC10F6A"; }
 697   else if (fRun>=127710&&fRun<=130850) { fLHCperiod="LHC10E"; fMCperiodTPC="LHC10F6A"; }
 698   else if (fRun>=133004&&fRun<=135029) { fLHCperiod="LHC10F"; fMCperiodTPC="LHC10F6A"; }
 699   else if (fRun>=135654&&fRun<=136377) { fLHCperiod="LHC10G"; fMCperiodTPC="LHC10F6A"; }
 700   else if (fRun>=136851&&fRun<=139846) {
 701     fLHCperiod="LHC10H";
 702     fMCperiodTPC="LHC10H8";
 703     if (reg.MatchB(fCurrentFile)) fMCperiodTPC="LHC11A10";
 704     // exception for 13d2 and later
 705     if (fCurrentAliRootRev >= 62714) fMCperiodTPC="LHC13D2";
 706     fBeamType="PBPB";
 707     fBeamTypeNum=kPBPB;
 708   }
 709   else if (fRun>=139847&&fRun<=146974) { fLHCperiod="LHC11A"; fMCperiodTPC="LHC10F6A"; }
 710   //TODO: periods 11B (146975-150721), 11C (150722-155837) are not yet treated assume 11d for the moment
 711   else if (fRun>=146975&&fRun<=155837) { fLHCperiod="LHC11D"; fMCperiodTPC="LHC10F6A"; }
 712   else if (fRun>=155838&&fRun<=159649) { fLHCperiod="LHC11D"; fMCperiodTPC="LHC10F6A"; }
 713   // also for 11e (159650-162750),f(162751-165771) use 11d
 714   else if (fRun>=159650&&fRun<=162750) { fLHCperiod="LHC11D"; fMCperiodTPC="LHC10F6A"; }
 715   else if (fRun>=162751&&fRun<=165771) { fLHCperiod="LHC11D"; fMCperiodTPC="LHC10F6A"; }
 716
 717   else if (fRun>=165772 && fRun<=170718) {
 718     fLHCperiod="LHC11H";
 719     fMCperiodTPC="LHC11A10";
 720     fBeamType="PBPB";
 721     fBeamTypeNum=kPBPB;
 722     if (reg12a17.MatchB(fCurrentFile)) fMCperiodTPC="LHC12A17";
 723   }
 724   if (fRun>=170719 && fRun<=177311) {
 725     fLHCperiod="LHC12A";
 726     fBeamType="PP";
 727     fBeamTypeNum=kPP;
 728     fMCperiodTPC="LHC10F6A";
 729     if (fCurrentAliRootRev >= 62714)
 730       fMCperiodTPC="LHC14E2";
 731   }
 732   // for the moment use LHC12b parameters up to LHC12d
 733   if (fRun>=177312 /*&& fRun<=179356*/) {
 734     fLHCperiod="LHC12B";
 735     fBeamType="PP";
 736     fBeamTypeNum=kPP;
 737     fMCperiodTPC="LHC10F6A";
 738     if (fCurrentAliRootRev >= 62714)
 739       fMCperiodTPC="LHC14E2";
 740   }
 741 //   if (fRun>=179357 && fRun<=183173) { fLHCperiod="LHC12C"; fBeamType="PP"; fBeamTypeNum=kPP;/*fMCperiodTPC="";*/ }
 742 //   if (fRun>=183174 && fRun<=186345) { fLHCperiod="LHC12D"; fBeamType="PP"; fBeamTypeNum=kPP;/*fMCperiodTPC="";*/ }
 743 //   if (fRun>=186346 && fRun<=186635) { fLHCperiod="LHC12E"; fBeamType="PP"; fBeamTypeNum=kPP;/*fMCperiodTPC="";*/ }
 744
 745 //   if (fRun>=186636 && fRun<=188166) { fLHCperiod="LHC12F"; fBeamType="PP"; fBeamTypeNum=kPP;/*fMCperiodTPC="";*/ }
 746 //   if (fRun >= 188167 && fRun <= 188355 ) { fLHCperiod="LHC12G"; fBeamType="PP"; fBeamTypeNum=kPP;/*fMCperiodTPC="";*/ }
 747 //   if (fRun >= 188356 && fRun <= 188503 ) { fLHCperiod="LHC12G"; fBeamType="PPB"; fBeamTypeNum=kPPB;/*fMCperiodTPC="";*/ }
 748 // for the moment use 12g parametrisation for all full gain runs (LHC12e+)
 749   if (fRun >= 186346 && fRun < 188719) { fLHCperiod="LHC12G"; fBeamType="PPB";fBeamTypeNum=kPPB; fMCperiodTPC="LHC12G"; }
 750
 751   // Dedicated splines for periods 12g and 12i(j) (and use more appropriate MC)
 752   if (fRun >= 188720 && fRun <= 192738) {
 753     fLHCperiod="LHC12H";
 754     fBeamType="PP";
 755     fBeamTypeNum=kPP;
 756     fMCperiodTPC="LHC10F6A";
 757     if (fCurrentAliRootRev >= 62714)
 758       fMCperiodTPC="LHC13B2_FIXn1";
 759   }
 760   if (fRun >= 192739 && fRun <= 194479) {
 761     fLHCperiod="LHC12I";
 762     fBeamType="PP";
 763     fBeamTypeNum=kPP;
 764     fMCperiodTPC="LHC10F6A";
 765     if (fCurrentAliRootRev >= 62714)
 766       fMCperiodTPC="LHC13B2_FIXn1";
 767   }
 768
 769   // New parametrisation for 2013 pPb runs
 770   if (fRun >= 194480) {
 771     fLHCperiod="LHC13B";
 772     fBeamType="PPB";
 773     fBeamTypeNum=kPPB;
 774     fMCperiodTPC="LHC12G";
 775
 776     if (fCurrentAliRootRev >= 61605)
 777       fMCperiodTPC="LHC13B2_FIX";
 778     if (fCurrentAliRootRev >= 62714)
 779       fMCperiodTPC="LHC13B2_FIXn1";
 780
 781     // High luminosity pPb runs require different parametrisations
 782     if (fRun >= 195875 && fRun <= 197411) {
 783       fLHCperiod="LHC13F";
 784     }
 785   }
 786
 787   //exception new pp MC productions from 2011 (11a periods have 10f6a splines!)
 788   if (fBeamType=="PP" && reg.MatchB(fCurrentFile) && !fCurrentFile.Contains("LHC11a")) { fMCperiodTPC="LHC11B2"; fBeamType="PP";fBeamTypeNum=kPP; }
 789   // exception for 11f1
 790   if (fCurrentFile.Contains("LHC11f1")) fMCperiodTPC="LHC11F1";
 791   // exception for 12f1a, 12f1b and 12i3
 792   if (fCurrentFile.Contains("LHC12f1") || fCurrentFile.Contains("LHC12i3")) fMCperiodTPC="LHC12F1";
 793   // exception for 12c4
 794   if (fCurrentFile.Contains("LHC12c4")) fMCperiodTPC="LHC12C4";
 795   // exception for 13d1 11d anchored prod
 796   if (fLHCperiod=="LHC11D" && fCurrentFile.Contains("LHC13d1")) fMCperiodTPC="LHC13D1";
 797 }
 798
 799 //______________________________________________________________________________
 800 void AliPIDResponse::SetITSParametrisation()
 801 {
 802   //
 803   // Set the ITS parametrisation
 804   //
 805 }
 806
 807
 808 //______________________________________________________________________________
 809 void AliPIDResponse::AddPointToHyperplane(TH2D* h, TLinearFitter* linExtrapolation, Int_t binX, Int_t binY)
 810 {
 811   if (h->GetBinContent(binX, binY) <= 1e-4)
 812     return; // Reject bins without content (within some numerical precision) or with strange content
 813
 814   Double_t coord[2] = {0, 0};
 815   coord[0] = h->GetXaxis()->GetBinCenter(binX);
 816   coord[1] = h->GetYaxis()->GetBinCenter(binY);
 817   Double_t binError = h->GetBinError(binX, binY);
 818   if (binError <= 0) {
 819     binError = 1000; // Should not happen because bins without content are rejected for the map (TH2D* h)
 820     printf("ERROR: This should never happen: Trying to add bin in addPointToHyperplane with error not set....\n");
 821   }
 822   linExtrapolation->AddPoint(coord, h->GetBinContent(binX, binY, binError));
 823 }
 824
 825
 826 //______________________________________________________________________________
 827 TH2D* AliPIDResponse::RefineHistoViaLinearInterpolation(TH2D* h, Double_t refineFactorX, Double_t refineFactorY)
 828 {
 829   if (!h)
 830     return 0x0;
 831
 832   // Interpolate to finer map
 833   TLinearFitter* linExtrapolation = new TLinearFitter(2, "hyp2", "");
 834
 835   Double_t upperMapBoundY = h->GetYaxis()->GetBinUpEdge(h->GetYaxis()->GetNbins());
 836   Double_t lowerMapBoundY = h->GetYaxis()->GetBinLowEdge(1);
 837   Int_t nBinsX = 30;
 838   // Binning was find to yield good results, if 40 bins are chosen for the range 0.0016 to 0.02. For the new variable range,
 839   // scale the number of bins correspondingly
 840   Int_t nBinsY = TMath::Nint((upperMapBoundY - lowerMapBoundY) / (0.02 - 0.0016) * 40);
 841   Int_t nBinsXrefined = nBinsX * refineFactorX;
 842   Int_t nBinsYrefined = nBinsY * refineFactorY;
 843
 844   TH2D* hRefined = new TH2D(Form("%s_refined", h->GetName()),  Form("%s (refined)", h->GetTitle()),
 845                             nBinsXrefined, h->GetXaxis()->GetBinLowEdge(1), h->GetXaxis()->GetBinUpEdge(h->GetXaxis()->GetNbins()),
 846                             nBinsYrefined, lowerMapBoundY, upperMapBoundY);
 847
 848   for (Int_t binX = 1; binX <= nBinsXrefined; binX++)  {
 849     for (Int_t binY = 1; binY <= nBinsYrefined; binY++)  {
 850
 851       hRefined->SetBinContent(binX, binY, 1); // Default value is 1
 852
 853       Double_t centerX = hRefined->GetXaxis()->GetBinCenter(binX);
 854       Double_t centerY = hRefined->GetYaxis()->GetBinCenter(binY);
 855
 856       /*OLD
 857       linExtrapolation->ClearPoints();
 858
 859       // For interpolation: Just take the corresponding bin from the old histo.
 860       // For extrapolation: take the last available bin from the old histo.
 861       // If the boundaries are to be skipped, also skip the corresponding bins
 862       Int_t oldBinX = h->GetXaxis()->FindBin(centerX);
 863       if (oldBinX < 1)
 864         oldBinX = 1;
 865       if (oldBinX > nBinsX)
 866         oldBinX = nBinsX;
 867
 868       Int_t oldBinY = h->GetYaxis()->FindBin(centerY);
 869       if (oldBinY < 1)
 870         oldBinY = 1;
 871       if (oldBinY > nBinsY)
 872         oldBinY = nBinsY;
 873
 874       // Neighbours left column
 875       if (oldBinX >= 2) {
 876         if (oldBinY >= 2) {
 877           AddPointToHyperplane(h, linExtrapolation, oldBinX - 1, oldBinY - 1);
 878         }
 879
 880         AddPointToHyperplane(h, linExtrapolation, oldBinX - 1, oldBinY);
 881
 882         if (oldBinY < nBinsY) {
 883           AddPointToHyperplane(h, linExtrapolation, oldBinX - 1, oldBinY + 1);
 884         }
 885       }
 886
 887       // Neighbours (and point itself) same column
 888       if (oldBinY >= 2) {
 889         AddPointToHyperplane(h, linExtrapolation, oldBinX, oldBinY - 1);
 890       }
 891
 892       AddPointToHyperplane(h, linExtrapolation, oldBinX, oldBinY);
 893
 894       if (oldBinY < nBinsY) {
 895         AddPointToHyperplane(h, linExtrapolation, oldBinX, oldBinY + 1);
 896       }
 897
 898       // Neighbours right column
 899       if (oldBinX < nBinsX) {
 900         if (oldBinY >= 2) {
 901           AddPointToHyperplane(h, linExtrapolation, oldBinX + 1, oldBinY - 1);
 902         }
 903
 904         AddPointToHyperplane(h, linExtrapolation, oldBinX + 1, oldBinY);
 905
 906         if (oldBinY < nBinsY) {
 907           AddPointToHyperplane(h, linExtrapolation, oldBinX + 1, oldBinY + 1);
 908         }
 909       }
 910
 911
 912       // Fit 2D-hyperplane
 913       if (linExtrapolation->GetNpoints() <= 0)
 914         continue;
 915
 916       if (linExtrapolation->Eval() != 0)// EvalRobust -> Takes much, much, [...], much more time (~hours instead of seconds)
 917         continue;
 918
 919       // Fill the bin of the refined histogram with the extrapolated value
 920       Double_t interpolatedValue = linExtrapolation->GetParameter(0) + linExtrapolation->GetParameter(1) * centerX
 921                                  + linExtrapolation->GetParameter(2) * centerY;
 922       */
 923       Double_t interpolatedValue = h->Interpolate(centerX, centerY) ;
 924       hRefined->SetBinContent(binX, binY, interpolatedValue);
 925     }
 926   }
 927
 928
 929   // Problem: Interpolation does not work before/beyond center of first/last bin (as the name suggests).
 930   // Therefore, for each row in dEdx: Take last bin from old map and interpolate values from center and edge.
 931   // Assume line through these points and extropolate to last bin of refined map
 932   const Double_t firstOldXbinUpEdge = h->GetXaxis()->GetBinUpEdge(1);
 933   const Double_t firstOldXbinCenter = h->GetXaxis()->GetBinCenter(1);
 934
 935   const Double_t oldXbinHalfWidth = firstOldXbinUpEdge - firstOldXbinCenter;
 936
 937   const Double_t lastOldXbinLowEdge = h->GetXaxis()->GetBinLowEdge(h->GetNbinsX());
 938   const Double_t lastOldXbinCenter = h->GetXaxis()->GetBinCenter(h->GetNbinsX());
 939
 940   for (Int_t binY = 1; binY <= nBinsYrefined; binY++)  {
 941     Double_t centerY = hRefined->GetYaxis()->GetBinCenter(binY);
 942
 943     const Double_t interpolatedCenterFirstXbin = h->Interpolate(firstOldXbinCenter, centerY);
 944     const Double_t interpolatedUpEdgeFirstXbin = h->Interpolate(firstOldXbinUpEdge, centerY);
 945
 946     const Double_t extrapolationSlopeFirstXbin = (interpolatedUpEdgeFirstXbin - interpolatedCenterFirstXbin) / oldXbinHalfWidth;
 947     const Double_t extrapolationOffsetFirstXbin = interpolatedCenterFirstXbin;
 948
 949
 950     const Double_t interpolatedCenterLastXbin = h->Interpolate(lastOldXbinCenter, centerY);
 951     const Double_t interpolatedLowEdgeLastXbin = h->Interpolate(lastOldXbinLowEdge, centerY);
 952
 953     const Double_t extrapolationSlopeLastXbin = (interpolatedCenterLastXbin - interpolatedLowEdgeLastXbin) / oldXbinHalfWidth;
 954     const Double_t extrapolationOffsetLastXbin = interpolatedCenterLastXbin;
 955
 956     for (Int_t binX = 1; binX <= nBinsXrefined; binX++)  {
 957       Double_t centerX = hRefined->GetXaxis()->GetBinCenter(binX);
 958
 959       if (centerX < firstOldXbinCenter) {
 960         Double_t extrapolatedValue = extrapolationOffsetFirstXbin + (centerX - firstOldXbinCenter) * extrapolationSlopeFirstXbin;
 961         hRefined->SetBinContent(binX, binY, extrapolatedValue);
 962       }
 963       else if (centerX <= lastOldXbinCenter) {
 964         continue;
 965       }
 966       else {
 967         Double_t extrapolatedValue = extrapolationOffsetLastXbin + (centerX - lastOldXbinCenter) * extrapolationSlopeLastXbin;
 968         hRefined->SetBinContent(binX, binY, extrapolatedValue);
 969       }
 970     }
 971   }
 972
 973   delete linExtrapolation;
 974
 975   return hRefined;
 976 }
 977
 978 //______________________________________________________________________________
 979 void AliPIDResponse::SetTPCEtaMaps(Double_t refineFactorMapX, Double_t refineFactorMapY,
 980                                    Double_t refineFactorSigmaMapX, Double_t refineFactorSigmaMapY)
 981 {
 982   //
 983   // Load the TPC eta correction maps from the OADB
 984   //
 985
 986   if (fUseTPCEtaCorrection == kFALSE) {
 987     // Disable eta correction via setting no maps
 988     if (!fTPCResponse.SetEtaCorrMap(0x0))
 989       AliInfo("Request to disable TPC eta correction -> Eta correction has been disabled");
 990     else
 991       AliError("Request to disable TPC eta correction -> Some error occured when unloading the correction maps");
 992
 993     if (!fTPCResponse.SetSigmaParams(0x0, 0))
 994       AliInfo("Request to disable TPC eta correction -> Using old parametrisation for sigma");
 995     else
 996       AliError("Request to disable TPC eta correction -> Some error occured when unloading the sigma maps");
 997
 998     return;
 999   }
1000
1001   TString dataType = "DATA";
1002   TString period = fLHCperiod.IsNull() ? "No period information" : fLHCperiod;
1003
1004   if (fIsMC)  {
1005     if (!(fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC))) {
1006       period=fMCperiodTPC;
1007       dataType="MC";
1008     }
1009     fRecoPass = 1;
1010
1011     if (!(fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC)) && fMCperiodTPC.IsNull()) {
1012       AliFatal("MC detected, but no MC period set -> Not changing eta maps!");
1013       return;
1014     }
1015   }
1016
1017   Int_t recopass = fRecoPass;
1018   if (fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC) )
1019     recopass = fRecoPassUser;
1020
1021   TString defaultObj = Form("Default_%s_pass%d", dataType.Data(), recopass);
1022
1023   AliInfo(Form("Current period and reco pass: %s.pass%d", period.Data(), recopass));
1024
1025   // Invalidate old maps
1026   fTPCResponse.SetEtaCorrMap(0x0);
1027   fTPCResponse.SetSigmaParams(0x0, 0);
1028
1029
1030   TString fileNameMaps(Form("%s/COMMON/PID/data/TPCetaMaps.root", fOADBPath.Data()));
1031   if (!fCustomTPCetaMaps.IsNull()) fileNameMaps=fCustomTPCetaMaps;
1032
1033   // Load the eta correction maps
1034   AliOADBContainer etaMapsCont(Form("TPCetaMaps_%s_pass%d", dataType.Data(), recopass));
1035
1036   Int_t statusCont = etaMapsCont.InitFromFile(fileNameMaps.Data(), Form("TPCetaMaps_%s_pass%d", dataType.Data(), recopass));
1037   if (statusCont) {
1038     AliError("Failed initializing TPC eta correction maps from OADB -> Disabled eta correction");
1039     fUseTPCEtaCorrection = kFALSE;
1040   }
1041   else {
1042     AliInfo(Form("Loading TPC eta correction map from %s", fileNameMaps.Data()));
1043
1044     TH2D* etaMap = 0x0;
1045
1046     if (fIsMC && !(fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC))) {
1047       TString searchMap = Form("TPCetaMaps_%s_%s_pass%d", dataType.Data(), period.Data(), recopass);
1048       etaMap = dynamic_cast<TH2D *>(etaMapsCont.GetDefaultObject(searchMap.Data()));
1049       if (!etaMap) {
1050         // Try default object
1051         etaMap = dynamic_cast<TH2D *>(etaMapsCont.GetDefaultObject(defaultObj.Data()));
1052       }
1053     }
1054     else {
1055       etaMap = dynamic_cast<TH2D *>(etaMapsCont.GetObject(fRun, defaultObj.Data()));
1056     }
1057
1058
1059     if (!etaMap) {
1060       AliError(Form("TPC eta correction map not found for run %d and also no default map found -> Disabled eta correction!!!", fRun));
1061       fUseTPCEtaCorrection = kFALSE;
1062     }
1063     else {
1064       TH2D* etaMapRefined = RefineHistoViaLinearInterpolation(etaMap, refineFactorMapX, refineFactorMapY);
1065
1066       if (etaMapRefined) {
1067         if (!fTPCResponse.SetEtaCorrMap(etaMapRefined)) {
1068           AliError(Form("Failed to set TPC eta correction map for run %d -> Disabled eta correction!!!", fRun));
1069           fTPCResponse.SetEtaCorrMap(0x0);
1070           fUseTPCEtaCorrection = kFALSE;
1071         }
1072         else {
1073           AliInfo(Form("Loaded TPC eta correction map (refine factors %.2f/%.2f) from %s: %s (MD5(map) = %s)",
1074                        refineFactorMapX, refineFactorMapY, fileNameMaps.Data(), fTPCResponse.GetEtaCorrMap()->GetTitle(),
1075                        GetChecksum(fTPCResponse.GetEtaCorrMap()).Data()));
1076         }
1077
1078         delete etaMapRefined;
1079       }
1080       else {
1081         AliError(Form("Failed to set TPC eta correction map for run %d (map was loaded, but couldn't be refined) -> Disabled eta correction!!!", fRun));
1082         fUseTPCEtaCorrection = kFALSE;
1083       }
1084     }
1085   }
1086
1087   // If there was some problem loading the eta maps, it makes no sense to load the sigma maps (that require eta corrected data)
1088   if (fUseTPCEtaCorrection == kFALSE) {
1089     AliError("Failed to load TPC eta correction map required by sigma maps -> Using old parametrisation for sigma");
1090     return;
1091   }
1092
1093   // Load the sigma parametrisation (1/dEdx vs tanTheta_local (~eta))
1094   AliOADBContainer etaSigmaMapsCont(Form("TPCetaSigmaMaps_%s_pass%d", dataType.Data(), recopass));
1095
1096   statusCont = etaSigmaMapsCont.InitFromFile(fileNameMaps.Data(), Form("TPCetaSigmaMaps_%s_pass%d", dataType.Data(), recopass));
1097   if (statusCont) {
1098     AliError("Failed initializing TPC eta sigma maps from OADB -> Using old sigma parametrisation");
1099   }
1100   else {
1101     AliInfo(Form("Loading TPC eta sigma map from %s", fileNameMaps.Data()));
1102
1103     TObjArray* etaSigmaPars = 0x0;
1104
1105     if (fIsMC && !(fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC))) {
1106       TString searchMap = Form("TPCetaSigmaMaps_%s_%s_pass%d", dataType.Data(), period.Data(), recopass);
1107       etaSigmaPars = dynamic_cast<TObjArray *>(etaSigmaMapsCont.GetDefaultObject(searchMap.Data()));
1108       if (!etaSigmaPars) {
1109         // Try default object
1110         etaSigmaPars = dynamic_cast<TObjArray *>(etaSigmaMapsCont.GetDefaultObject(defaultObj.Data()));
1111       }
1112     }
1113     else {
1114       etaSigmaPars = dynamic_cast<TObjArray *>(etaSigmaMapsCont.GetObject(fRun, defaultObj.Data()));
1115     }
1116
1117     if (!etaSigmaPars) {
1118       AliError(Form("TPC eta sigma parametrisation not found for run %d -> Using old sigma parametrisation!!!", fRun));
1119     }
1120     else {
1121       TH2D* etaSigmaPar1Map = dynamic_cast<TH2D *>(etaSigmaPars->FindObject("sigmaPar1Map"));
1122       TNamed* sigmaPar0Info = dynamic_cast<TNamed *>(etaSigmaPars->FindObject("sigmaPar0"));
1123       Double_t sigmaPar0 = 0.0;
1124
1125       if (sigmaPar0Info) {
1126         TString sigmaPar0String = sigmaPar0Info->GetTitle();
1127         sigmaPar0 = sigmaPar0String.Atof();
1128       }
1129       else {
1130         // Something is weired because the object for parameter 0 could not be loaded -> New sigma parametrisation can not be used!
1131         etaSigmaPar1Map = 0x0;
1132       }
1133
1134       TH2D* etaSigmaPar1MapRefined = RefineHistoViaLinearInterpolation(etaSigmaPar1Map, refineFactorSigmaMapX, refineFactorSigmaMapY);
1135
1136
1137       if (etaSigmaPar1MapRefined) {
1138         if (!fTPCResponse.SetSigmaParams(etaSigmaPar1MapRefined, sigmaPar0)) {
1139           AliError(Form("Failed to set TPC eta sigma map for run %d -> Using old sigma parametrisation!!!", fRun));
1140           fTPCResponse.SetSigmaParams(0x0, 0);
1141         }
1142         else {
1143           AliInfo(Form("Loaded TPC sigma correction map (refine factors %.2f/%.2f) from %s: %s (MD5(map) = %s, sigmaPar0 = %f)",
1144                        refineFactorSigmaMapX, refineFactorSigmaMapY, fileNameMaps.Data(), fTPCResponse.GetSigmaPar1Map()->GetTitle(),
1145                        GetChecksum(fTPCResponse.GetSigmaPar1Map()).Data(), sigmaPar0));
1146         }
1147
1148         delete etaSigmaPar1MapRefined;
1149       }
1150       else {
1151         AliError(Form("Failed to set TPC eta sigma map for run %d (map was loaded, but couldn't be refined) -> Using old sigma parametrisation!!!",
1152                       fRun));
1153       }
1154     }
1155   }
1156 }
1157
1158 //______________________________________________________________________________
1159 void AliPIDResponse::SetTPCPidResponseMaster()
1160 {
1161   //
1162   // Load the TPC pid response functions from the OADB
1163   // Load the TPC voltage maps from OADB
1164   //
1165   //don't load twice for the moment
1166    if (fArrPidResponseMaster) return;
1167
1168
1169   //reset the PID response functions
1170   delete fArrPidResponseMaster;
1171   fArrPidResponseMaster=NULL;
1172
1173   TFile *f=NULL;
1174
1175   TString fileNamePIDresponse(Form("%s/COMMON/PID/data/TPCPIDResponse.root", fOADBPath.Data()));
1176   if (!fCustomTPCpidResponse.IsNull()) fileNamePIDresponse=fCustomTPCpidResponse;
1177
1178   f=TFile::Open(fileNamePIDresponse.Data());
1179   if (f && f->IsOpen() && !f->IsZombie()){
1180     fArrPidResponseMaster=dynamic_cast<TObjArray*>(f->Get("TPCPIDResponse"));
1181   }
1182   delete f;
1183
1184   TString fileNameVoltageMaps(Form("%s/COMMON/PID/data/TPCvoltageSettings.root", fOADBPath.Data()));
1185   f=TFile::Open(fileNameVoltageMaps.Data());
1186   if (f && f->IsOpen() && !f->IsZombie()){
1187     fOADBvoltageMaps=dynamic_cast<AliOADBContainer*>(f->Get("TPCvoltageSettings"));
1188   }
1189   delete f;
1190
1191   if (!fArrPidResponseMaster){
1192     AliFatal(Form("Could not retrieve the TPC pid response from: %s",fileNamePIDresponse.Data()));
1193     return;
1194   }
1195   fArrPidResponseMaster->SetOwner();
1196
1197   if (!fOADBvoltageMaps)
1198   {
1199     AliFatal(Form("Could not retrieve the TPC voltage maps from: %s",fileNameVoltageMaps.Data()));
1200   }
1201   fArrPidResponseMaster->SetOwner();
1202 }
1203
1204 //______________________________________________________________________________
1205 void AliPIDResponse::SetTPCParametrisation()
1206 {
1207   //
1208   // Change BB parametrisation for current run
1209   //
1210
1211   //
1212   //reset old splines
1213   //
1214   fTPCResponse.ResetSplines();
1215
1216   if (fLHCperiod.IsNull()) {
1217     AliError("No period set, not changing parametrisation");
1218     return;
1219   }
1220
1221   //
1222   // Set default parametrisations for data and MC
1223   //
1224
1225   //data type
1226   TString datatype="DATA";
1227   //in case of mc fRecoPass is per default 1
1228   if (fIsMC) {
1229       if(!(fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC))) datatype="MC";
1230       fRecoPass=1;
1231   }
1232
1233   // period
1234   TString period=fLHCperiod;
1235   if (fIsMC && !(fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC))) period=fMCperiodTPC;
1236
1237   Int_t recopass = fRecoPass;
1238   if(fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC)) recopass = fRecoPassUser;
1239
1240   AliInfo(Form("Searching splines for: %s %s PASS%d %s",datatype.Data(),period.Data(),recopass,fBeamType.Data()));
1241   Bool_t found=kFALSE;
1242   //
1243   //set the new PID splines
1244   //
1245   if (fArrPidResponseMaster){
1246     //for MC don't use period information
1247     //if (fIsMC) period="[A-Z0-9]*";
1248     //for MC use MC period information
1249     //pattern for the default entry (valid for all particles)
1250     TPRegexp reg(Form("TSPLINE3_%s_([A-Z]*)_%s_PASS%d_%s_MEAN(_*)([A-Z1-9]*)",datatype.Data(),period.Data(),recopass,fBeamType.Data()));
1251
1252     //find particle id and gain scenario
1253     for (Int_t igainScenario=0; igainScenario<AliTPCPIDResponse::fgkNumberOfGainScenarios; igainScenario++)
1254     {
1255       TObject *grAll=NULL;
1256       TString gainScenario = AliTPCPIDResponse::GainScenarioName(igainScenario);
1257       gainScenario.ToUpper();
1258       //loop over entries and filter them
1259       for (Int_t iresp=0; iresp<fArrPidResponseMaster->GetEntriesFast();++iresp)
1260       {
1261         TObject *responseFunction=fArrPidResponseMaster->At(iresp);
1262         if (responseFunction==NULL) continue;
1263         TString responseName=responseFunction->GetName();
1264
1265         if (!reg.MatchB(responseName)) continue;
1266
1267         TObjArray *arr=reg.MatchS(responseName); if (!arr) continue;
1268         TObject* tmp=NULL;
1269         tmp=arr->At(1); if (!tmp) continue;
1270         TString particleName=tmp->GetName();
1271         tmp=arr->At(3); if (!tmp) continue;
1272         TString gainScenarioName=tmp->GetName();
1273         delete arr;
1274         if (particleName.IsNull()) continue;
1275         if (!grAll && particleName=="ALL" && gainScenarioName==gainScenario) grAll=responseFunction;
1276         else
1277         {
1278           for (Int_t ispec=0; ispec<(AliTPCPIDResponse::fgkNumberOfParticleSpecies); ++ispec)
1279           {
1280             TString particle=AliPID::ParticleName(ispec);
1281             particle.ToUpper();
1282             //std::cout<<responseName<<" "<<particle<<" "<<particleName<<" "<<gainScenario<<" "<<gainScenarioName<<std::endl;
1283             if ( particle == particleName && gainScenario == gainScenarioName )
1284             {
1285               fTPCResponse.SetResponseFunction( responseFunction,
1286                                                 (AliPID::EParticleType)ispec,
1287                                                 (AliTPCPIDResponse::ETPCgainScenario)igainScenario );
1288               fTPCResponse.SetUseDatabase(kTRUE);
1289               AliInfo(Form("Adding graph: %d %d - %s (MD5(spline) = %s)",ispec,igainScenario,responseFunction->GetName(),
1290                            GetChecksum((TSpline3*)responseFunction).Data()));
1291               found=kTRUE;
1292               break;
1293             }
1294           }
1295         }
1296       }
1297
1298       // Retrieve responsefunction for pions - will (if available) be used for muons if there are no dedicated muon splines.
1299       // For light nuclei, try to set the proton spline, if no dedicated splines are available.
1300       // In both cases: Use default splines, if no dedicated splines and no pion/proton splines are available.
1301       TObject* responseFunctionPion = fTPCResponse.GetResponseFunction( (AliPID::EParticleType)AliPID::kPion,
1302                                                                         (AliTPCPIDResponse::ETPCgainScenario)igainScenario);
1303       TObject* responseFunctionProton = fTPCResponse.GetResponseFunction( (AliPID::EParticleType)AliPID::kProton,
1304                                                                           (AliTPCPIDResponse::ETPCgainScenario)igainScenario);
1305
1306       for (Int_t ispec=0; ispec<(AliTPCPIDResponse::fgkNumberOfParticleSpecies); ++ispec)
1307       {
1308         if (!fTPCResponse.GetResponseFunction( (AliPID::EParticleType)ispec,
1309           (AliTPCPIDResponse::ETPCgainScenario)igainScenario))
1310         {
1311           if (ispec == AliPID::kMuon) { // Muons
1312             if (responseFunctionPion) {
1313               fTPCResponse.SetResponseFunction( responseFunctionPion,
1314                                                 (AliPID::EParticleType)ispec,
1315                                                 (AliTPCPIDResponse::ETPCgainScenario)igainScenario );
1316               fTPCResponse.SetUseDatabase(kTRUE);
1317               AliInfo(Form("Adding graph: %d %d - %s (MD5(spline) = %s)",ispec,igainScenario,responseFunctionPion->GetName(),
1318                            GetChecksum((TSpline3*)responseFunctionPion).Data()));
1319               found=kTRUE;
1320             }
1321             else if (grAll) {
1322               fTPCResponse.SetResponseFunction( grAll,
1323                                                 (AliPID::EParticleType)ispec,
1324                                                 (AliTPCPIDResponse::ETPCgainScenario)igainScenario );
1325               fTPCResponse.SetUseDatabase(kTRUE);
1326               AliInfo(Form("Adding graph: %d %d - %s (MD5(spline) = %s)",ispec,igainScenario,grAll->GetName(),
1327                            GetChecksum((TSpline3*)grAll).Data()));
1328               found=kTRUE;
1329             }
1330             //else
1331             //  AliError(Form("No splines found for muons (also no pion splines and no default splines) for gain scenario %d!", igainScenario));
1332           }
1333           else if (ispec >= AliPID::kSPECIES) { // Light nuclei
1334             if (responseFunctionProton) {
1335               fTPCResponse.SetResponseFunction( responseFunctionProton,
1336                                                 (AliPID::EParticleType)ispec,
1337                                                 (AliTPCPIDResponse::ETPCgainScenario)igainScenario );
1338               fTPCResponse.SetUseDatabase(kTRUE);
1339               AliInfo(Form("Adding graph: %d %d - %s (MD5(spline) = %s)",ispec,igainScenario,responseFunctionProton->GetName(),
1340                            GetChecksum((TSpline3*)responseFunctionProton).Data()));
1341               found=kTRUE;
1342             }
1343             else if (grAll) {
1344               fTPCResponse.SetResponseFunction( grAll,
1345                                                 (AliPID::EParticleType)ispec,
1346                                                 (AliTPCPIDResponse::ETPCgainScenario)igainScenario );
1347               fTPCResponse.SetUseDatabase(kTRUE);
1348               AliInfo(Form("Adding graph: %d %d - %s (MD5(spline) = %s)",ispec,igainScenario,grAll->GetName(),
1349                            GetChecksum((TSpline3*)grAll).Data()));
1350               found=kTRUE;
1351             }
1352             //else
1353             //  AliError(Form("No splines found for species %d (also no proton splines and no default splines) for gain scenario %d!",
1354             //                ispec, igainScenario));
1355           }
1356         }
1357       }
1358     }
1359   }
1360   else AliInfo("no fArrPidResponseMaster");
1361
1362   if (!found){
1363     AliError(Form("No splines found for: %s %s PASS%d %s",datatype.Data(),period.Data(),recopass,fBeamType.Data()));
1364   }
1365
1366
1367   //
1368   // Setup multiplicity correction (only used for non-pp collisions)
1369   //
1370
1371   const Bool_t isPP = (fBeamType.CompareTo("PP") == 0);
1372
1373   // 2013 pPb data taking at low luminosity
1374   const Bool_t isPPb2013LowLuminosity = period.Contains("LHC13B") || period.Contains("LHC13C") || period.Contains("LHC13D");
1375   // PbPb 2010, period 10h.pass2
1376   //TODO Needs further development const Bool_t is10hpass2 = period.Contains("LHC10H") && recopass == 2;
1377
1378
1379   // In case of MC without(!) tune on data activated for the TPC, don't use the multiplicity correction for the moment
1380   Bool_t isMCandNotTPCtuneOnData = fIsMC && !(fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC));
1381
1382   // If correction is available, but disabled (highly NOT recommended!), print warning
1383   if (!fUseTPCMultiplicityCorrection && !isPP && !isMCandNotTPCtuneOnData) {
1384     //TODO: Needs further development if (is10hpass2 || isPPb2013LowLuminosity) {
1385     if (isPPb2013LowLuminosity) {
1386       AliWarning("Mulitplicity correction disabled, but correction parameters for this period exist. It is highly recommended to use enable the correction. Otherwise the splines might be off!");
1387     }
1388   }
1389
1390   if (fUseTPCMultiplicityCorrection && !isPP && !isMCandNotTPCtuneOnData) {
1391     AliInfo("Multiplicity correction enabled!");
1392
1393     //TODO After testing, load parameters from outside
1394     /*TODO no correction for MC
1395     if (period.Contains("LHC11A10"))  {//LHC11A10A
1396       AliInfo("Using multiplicity correction parameters for 11a10!");
1397       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(0, 6.90133e-06);
1398       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(1, -1.22123e-03);
1399       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(2, 1.80220e-02);
1400       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(3, 0.1);
1401       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(4, 6.45306e-03);
1402
1403       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(0, -2.85505e-07);
1404       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(1, -1.31911e-06);
1405       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(2, -0.5);
1406
1407       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(0, -4.29665e-05);
1408       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(1, 1.37023e-02);
1409       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(2, -6.36337e-01);
1410       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(3, 1.13479e-02);
1411     }
1412     else*/ if (isPPb2013LowLuminosity)  {// 2013 pPb data taking at low luminosity
1413       AliInfo("Using multiplicity correction parameters for 13b.pass2 (at least also valid for 13{c,d} and pass 3)!");
1414
1415       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(0, -5.906e-06);
1416       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(1, -5.064e-04);
1417       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(2, -3.521e-02);
1418       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(3, 2.469e-02);
1419       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(4, 0);
1420
1421       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(0, -5.32e-06);
1422       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(1, 1.177e-05);
1423       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(2, -0.5);
1424
1425       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(0, 0.);
1426       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(1, 0.);
1427       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(2, 0.);
1428       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(3, 0.);
1429
1430       /* Not too bad, but far from perfect in the details
1431       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(0, -6.27187e-06);
1432       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(1, -4.60649e-04);
1433       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(2, -4.26450e-02);
1434       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(3, 2.40590e-02);
1435       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(4, 0);
1436
1437       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(0, -5.338e-06);
1438       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(1, 1.220e-05);
1439       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(2, -0.5);
1440
1441       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(0, 7.89237e-05);
1442       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(1, -1.30662e-02);
1443       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(2, 8.91548e-01);
1444       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(3, 1.47931e-02);
1445       */
1446     }
1447     /*TODO: Needs further development
1448     else if (is10hpass2) {
1449       AliInfo("Using multiplicity correction parameters for 10h.pass2!");
1450       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(0, 3.21636e-07);
1451       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(1, -6.65876e-04);
1452       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(2, 1.28786e-03);
1453       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(3, 1.47677e-02);
1454       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrection(4, 0);
1455
1456       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(0, 7.23591e-08);
1457       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(1, 2.7469e-06);
1458       fTPCResponse.SetParameterMultiplicityCorrectionTanTheta(2, -0.5);
1459
1460       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(0, -1.22590e-05);
1461       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(1, 6.88888e-03);
1462       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(2, -3.20788e-01);
1463       fTPCResponse.SetParameterMultiplicitySigmaCorrection(3, 1.07345e-02);
1464     }
1465     */
1466     else {
1467       AliError(Form("Multiplicity correction is enabled, but no multiplicity correction parameters have been found for period %s.pass%d -> Mulitplicity correction DISABLED!", period.Data(), recopass));
1468       fUseTPCMultiplicityCorrection = kFALSE;
1469       fTPCResponse.ResetMultiplicityCorrectionFunctions();
1470     }
1471   }
1472   else {
1473     // Just set parameters such that overall correction factor is 1, i.e. no correction.
1474     // This is just a reasonable choice for the parameters for safety reasons. Disabling
1475     // the multiplicity correction will anyhow skip the calculation of the corresponding
1476     // correction factor inside THIS class. Nevertheless, experts can access the TPCPIDResponse
1477     // directly and use it for calculations - which should still give valid results, even if
1478     // the multiplicity correction is explicitely enabled in such expert calls.
1479
1480     TString reasonForDisabling = "requested by user";
1481     if (fUseTPCMultiplicityCorrection) {
1482       if (isPP)
1483         reasonForDisabling = "pp collisions";
1484       else
1485         reasonForDisabling = "MC w/o tune on data";
1486     }
1487
1488     AliInfo(Form("Multiplicity correction %sdisabled (%s)!", fUseTPCMultiplicityCorrection ? "automatically " : "",
1489                  reasonForDisabling.Data()));
1490
1491     fUseTPCMultiplicityCorrection = kFALSE;
1492     fTPCResponse.ResetMultiplicityCorrectionFunctions();
1493   }
1494
1495   if (fUseTPCMultiplicityCorrection) {
1496     for (Int_t i = 0; i <= 4 + 1; i++) {
1497       AliInfo(Form("parMultCorr: %d, %e", i, fTPCResponse.GetMultiplicityCorrectionFunction()->GetParameter(i)));
1498     }
1499     for (Int_t j = 0; j <= 2 + 1; j++) {
1500       AliInfo(Form("parMultCorrTanTheta: %d, %e", j, fTPCResponse.GetMultiplicityCorrectionFunctionTanTheta()->GetParameter(j)));
1501     }
1502     for (Int_t j = 0; j <= 3 + 1; j++) {
1503       AliInfo(Form("parMultSigmaCorr: %d, %e", j, fTPCResponse.GetMultiplicitySigmaCorrectionFunction()->GetParameter(j)));
1504     }
1505   }
1506
1507   //
1508   // Setup old resolution parametrisation
1509   //
1510
1511   //default
1512   fTPCResponse.SetSigma(3.79301e-03, 2.21280e+04);
1513
1514   if (fRun>=122195){ //LHC10d
1515     fTPCResponse.SetSigma(2.30176e-02, 5.60422e+02);
1516   }
1517
1518   if (fRun>=170719){ // LHC12a
1519     fTPCResponse.SetSigma(2.95714e-03, 1.01953e+05);
1520   }
1521
1522   if (fRun>=177312){ // LHC12b
1523     fTPCResponse.SetSigma(3.74633e-03, 7.11829e+04 );
1524   }
1525
1526   if (fRun>=186346){ // LHC12e
1527     fTPCResponse.SetSigma(8.62022e-04, 9.08156e+05);
1528   }
1529
1530   if (fArrPidResponseMaster)
1531   fResolutionCorrection=(TF1*)fArrPidResponseMaster->FindObject(Form("TF1_%s_ALL_%s_PASS%d_%s_SIGMA",datatype.Data(),period.Data(),recopass,fBeamType.Data()));
1532
1533   if (fResolutionCorrection) AliInfo(Form("Setting multiplicity correction function: %s  (MD5(corr function) = %s)",
1534                                           fResolutionCorrection->GetName(), GetChecksum(fResolutionCorrection).Data()));
1535
1536   //read in the voltage map
1537   TVectorF* gsm = 0x0;
1538   if (fOADBvoltageMaps) gsm=dynamic_cast<TVectorF*>(fOADBvoltageMaps->GetObject(fRun));
1539   if (gsm)
1540   {
1541     fTPCResponse.SetVoltageMap(*gsm);
1542     TString vals;
1543     AliInfo(Form("Reading the voltage map for run %d\n",fRun));
1544     vals="IROC A: "; for (Int_t i=0; i<18; i++){vals+=Form("%.2f ",(*gsm)[i]);}
1545     AliInfo(vals.Data());
1546     vals="IROC C: "; for (Int_t i=18; i<36; i++){vals+=Form("%.2f ",(*gsm)[i]);}
1547     AliInfo(vals.Data());
1548     vals="OROC A: "; for (Int_t i=36; i<54; i++){vals+=Form("%.2f ",(*gsm)[i]);}
1549     AliInfo(vals.Data());
1550     vals="OROC C: "; for (Int_t i=54; i<72; i++){vals+=Form("%.2f ",(*gsm)[i]);}
1551     AliInfo(vals.Data());
1552   }
1553   else AliInfo("no voltage map, ideal default assumed");
1554 }
1555
1556 //______________________________________________________________________________
1557 void AliPIDResponse::SetTRDPidResponseMaster()
1558 {
1559   //
1560   // Load the TRD pid params and references from the OADB
1561   //
1562   if(fTRDPIDResponseObject) return;
1563   AliOADBContainer contParams("contParams");
1564
1565   Int_t statusResponse = contParams.InitFromFile(Form("%s/COMMON/PID/data/TRDPIDResponse.root", fOADBPath.Data()), "AliTRDPIDResponseObject");
1566   if(statusResponse){
1567     AliError("Failed initializing PID Response Object from OADB");
1568   } else {
1569     AliInfo(Form("Loading TRD Response from %s/COMMON/PID/data/TRDPIDResponse.root", fOADBPath.Data()));
1570     fTRDPIDResponseObject = dynamic_cast<AliTRDPIDResponseObject *>(contParams.GetObject(fRun));
1571     if(!fTRDPIDResponseObject){
1572       AliError(Form("TRD Response not found in run %d", fRun));
1573     }
1574   }
1575 }
1576
1577 //______________________________________________________________________________
1578 void AliPIDResponse::InitializeTRDResponse(){
1579   //
1580   // Set PID Params and references to the TRD PID response
1581   //
1582     fTRDResponse.SetPIDResponseObject(fTRDPIDResponseObject);
1583     fTRDResponse.SetdEdxParams(fTRDdEdxParams);
1584 }
1585
1586 //______________________________________________________________________________
1587 void AliPIDResponse::SetTRDSlices(UInt_t TRDslicesForPID[2],AliTRDPIDResponse::ETRDPIDMethod method) const{
1588
1589     if(fLHCperiod.Contains("LHC10D") || fLHCperiod.Contains("LHC10E")){
1590         // backward compatibility for setting with 8 slices
1591         TRDslicesForPID[0] = 0;
1592         TRDslicesForPID[1] = 7;
1593     }
1594     else{
1595         if(method==AliTRDPIDResponse::kLQ1D){
1596             TRDslicesForPID[0] = 0; // first Slice contains normalized dEdx
1597             TRDslicesForPID[1] = 0;
1598         }
1599         if(method==AliTRDPIDResponse::kLQ2D){
1600             TRDslicesForPID[0] = 1;
1601             TRDslicesForPID[1] = 7;
1602         }
1603     }
1604     AliDebug(1,Form("Slice Range set to %d - %d",TRDslicesForPID[0],TRDslicesForPID[1]));
1605 }
1606 //______________________________________________________________________________
1607 void AliPIDResponse::SetTRDdEdxParams()
1608 {
1609   if(fTRDdEdxParams) return;
1610
1611   const TString containerName = "TRDdEdxParamsContainer";
1612   AliOADBContainer cont(containerName.Data());
1613
1614   const TString filePathNamePackage=Form("%s/COMMON/PID/data/TRDdEdxParams.root", fOADBPath.Data());
1615
1616   const Int_t statusCont = cont.InitFromFile(filePathNamePackage.Data(), cont.GetName());
1617   if (statusCont){
1618     AliFatal("Failed initializing settings from OADB");
1619   }
1620   else{
1621     AliInfo(Form("Loading %s from %s\n", cont.GetName(), filePathNamePackage.Data()));
1622
1623     fTRDdEdxParams = (AliTRDdEdxParams*)(cont.GetObject(fRun, "default"));
1624     //fTRDdEdxParams->Print();
1625
1626     if(!fTRDdEdxParams){
1627       AliError(Form("TRD dEdx Params default not found"));
1628     }
1629   }
1630 }
1631
1632 //______________________________________________________________________________
1633 void AliPIDResponse::SetTOFPidResponseMaster()
1634 {
1635   //
1636   // Load the TOF pid params from the OADB
1637   //
1638
1639   if (fTOFPIDParams) delete fTOFPIDParams;
1640   fTOFPIDParams=NULL;
1641
1642   TFile *oadbf = new TFile(Form("%s/COMMON/PID/data/TOFPIDParams.root",fOADBPath.Data()));
1643   if (oadbf && oadbf->IsOpen()) {
1644     AliInfo(Form("Loading TOF Params from %s/COMMON/PID/data/TOFPIDParams.root", fOADBPath.Data()));
1645     AliOADBContainer *oadbc = (AliOADBContainer *)oadbf->Get("TOFoadb");
1646     if (oadbc) fTOFPIDParams = dynamic_cast<AliTOFPIDParams *>(oadbc->GetObject(fRun,"TOFparams"));
1647     oadbf->Close();
1648     delete oadbc;
1649   }
1650   delete oadbf;
1651
1652   if (!fTOFPIDParams) AliFatal("TOFPIDParams could not be retrieved");
1653 }
1654
1655 //______________________________________________________________________________
1656 void AliPIDResponse::InitializeTOFResponse(){
1657   //
1658   // Set PID Params to the TOF PID response
1659   //
1660
1661   AliInfo("TOF PID Params loaded from OADB");
1662   AliInfo(Form("  TOF resolution %5.2f [ps]",fTOFPIDParams->GetTOFresolution()));
1663   AliInfo(Form("  StartTime method %d",fTOFPIDParams->GetStartTimeMethod()));
1664   AliInfo(Form("  TOF res. mom. params: %5.2f %5.2f %5.2f %5.2f",
1665                fTOFPIDParams->GetSigParams(0),fTOFPIDParams->GetSigParams(1),fTOFPIDParams->GetSigParams(2),fTOFPIDParams->GetSigParams(3)));
1666   AliInfo(Form("  Fraction of tracks within gaussian behaviour: %6.4f",fTOFPIDParams->GetTOFtail()));
1667   AliInfo(Form("  MC: Fraction of tracks (percentage) to cut to fit matching in data: %6.2f%%",fTOFPIDParams->GetTOFmatchingLossMC()));
1668   AliInfo(Form("  MC: Fraction of random hits (percentage) to add to fit mismatch in data: %6.2f%%",fTOFPIDParams->GetTOFadditionalMismForMC()));
1669   AliInfo(Form("  Start Time Offset %6.2f ps",fTOFPIDParams->GetTOFtimeOffset()));
1670
1671   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
1672     fTOFResponse.SetTrackParameter(i,fTOFPIDParams->GetSigParams(i));
1673   }
1674   fTOFResponse.SetTimeResolution(fTOFPIDParams->GetTOFresolution());
1675
1676   AliInfo("TZERO resolution loaded from ESDrun/AODheader");
1677   Float_t t0Spread[4];
1678   for (Int_t i=0;i<4;i++) t0Spread[i]=fCurrentEvent->GetT0spread(i);
1679   AliInfo(Form("  TZERO spreads from data: (A+C)/2 %f A %f C %f (A'-C')/2: %f",t0Spread[0],t0Spread[1],t0Spread[2],t0Spread[3]));
1680   Float_t a = t0Spread[1]*t0Spread[1]-t0Spread[0]*t0Spread[0]+t0Spread[3]*t0Spread[3];
1681   Float_t c = t0Spread[2]*t0Spread[2]-t0Spread[0]*t0Spread[0]+t0Spread[3]*t0Spread[3];
1682   if ( (t0Spread[0] > 50. && t0Spread[0] < 400.) && (a > 0.) && (c>0.)) {
1683     fResT0AC=t0Spread[3];
1684     fResT0A=TMath::Sqrt(a);
1685     fResT0C=TMath::Sqrt(c);
1686   } else {
1687     AliInfo("  TZERO spreads not present or inconsistent, loading default");
1688     fResT0A=75.;
1689     fResT0C=65.;
1690     fResT0AC=55.;
1691   }
1692   AliInfo(Form("  TZERO resolution set to: T0A: %f [ps] T0C: %f [ps] T0AC %f [ps]",fResT0A,fResT0C,fResT0AC));
1693
1694 }
1695
1696 //______________________________________________________________________________
1697 void AliPIDResponse::SetHMPIDPidResponseMaster()
1698 {
1699   //
1700   // Load the HMPID pid params from the OADB
1701   //
1702
1703   if (fHMPIDPIDParams) delete fHMPIDPIDParams;
1704   fHMPIDPIDParams=NULL;
1705
1706   TFile *oadbf;
1707   if(!fIsMC) oadbf = new TFile(Form("%s/COMMON/PID/data/HMPIDPIDParams.root",fOADBPath.Data()));
1708   else       oadbf = new TFile(Form("%s/COMMON/PID/MC/HMPIDPIDParams.root",fOADBPath.Data()));
1709   if (oadbf && oadbf->IsOpen()) {
1710     AliInfo(Form("Loading HMPID Params from %s/COMMON/PID/data/HMPIDPIDParams.root", fOADBPath.Data()));
1711     AliOADBContainer *oadbc = (AliOADBContainer *)oadbf->Get("HMPoadb");
1712     if (oadbc) fHMPIDPIDParams = dynamic_cast<AliHMPIDPIDParams *>(oadbc->GetObject(fRun,"HMPparams"));
1713     oadbf->Close();
1714     delete oadbc;
1715   }
1716   delete oadbf;
1717
1718   if (!fHMPIDPIDParams) AliFatal("HMPIDPIDParams could not be retrieved");
1719 }
1720
1721 //______________________________________________________________________________
1722 void AliPIDResponse::InitializeHMPIDResponse(){
1723   //
1724   // Set PID Params to the HMPID PID response
1725   //
1726
1727   fHMPIDResponse.SetRefIndexArray(fHMPIDPIDParams->GetHMPIDrefIndex());
1728 }
1729
1730 //______________________________________________________________________________
1731 Bool_t AliPIDResponse::IdentifiedAsElectronTRD(const AliVTrack *vtrack,Double_t efficiencyLevel,Double_t centrality,AliTRDPIDResponse::ETRDPIDMethod PIDmethod) const {
1732     // old function for compatibility
1733     Int_t ntracklets=0;
1734     return IdentifiedAsElectronTRD(vtrack,ntracklets,efficiencyLevel,centrality,PIDmethod);
1735 }
1736
1737 //______________________________________________________________________________
1738 Bool_t AliPIDResponse::IdentifiedAsElectronTRD(const AliVTrack *vtrack, Int_t &ntracklets,Double_t efficiencyLevel,Double_t centrality,AliTRDPIDResponse::ETRDPIDMethod PIDmethod) const {
1739   //
1740   // Check whether track is identified as electron under a given electron efficiency hypothesis
1741     //
1742     // ntracklets is the number of tracklets that has been used to calculate the PID signal
1743
1744   Double_t probs[AliPID::kSPECIES];
1745
1746   ntracklets =CalculateTRDResponse(vtrack,probs,PIDmethod);
1747
1748   // Take mean of the TRD momenta in the given tracklets
1749   Float_t p = 0, trdmomenta[AliVTrack::kTRDnPlanes];
1750   Int_t nmomenta = 0;
1751   for(Int_t iPl=0;iPl<AliVTrack::kTRDnPlanes;iPl++){
1752     if(vtrack->GetTRDmomentum(iPl) > 0.){
1753       trdmomenta[nmomenta++] = vtrack->GetTRDmomentum(iPl);
1754     }
1755   }
1756   p = TMath::Mean(nmomenta, trdmomenta);
1757
1758   return fTRDResponse.IdentifiedAsElectron(ntracklets, probs, p, efficiencyLevel,centrality,PIDmethod);
1759 }
1760
1761 //______________________________________________________________________________
1762 void AliPIDResponse::SetEMCALPidResponseMaster()
1763 {
1764   //
1765   // Load the EMCAL pid response functions from the OADB
1766   //
1767   TObjArray* fEMCALPIDParamsRun      = NULL;
1768   TObjArray* fEMCALPIDParamsPass     = NULL;
1769
1770   if(fEMCALPIDParams) return;
1771   AliOADBContainer contParams("contParams");
1772
1773   Int_t statusPars = contParams.InitFromFile(Form("%s/COMMON/PID/data/EMCALPIDParams.root", fOADBPath.Data()), "AliEMCALPIDParams");
1774   if(statusPars){
1775     AliError("Failed initializing PID Params from OADB");
1776   }
1777   else {
1778     AliInfo(Form("Loading EMCAL Params from %s/COMMON/PID/data/EMCALPIDParams.root", fOADBPath.Data()));
1779
1780     fEMCALPIDParamsRun = dynamic_cast<TObjArray *>(contParams.GetObject(fRun));
1781     if(fEMCALPIDParamsRun)  fEMCALPIDParamsPass = dynamic_cast<TObjArray *>(fEMCALPIDParamsRun->FindObject(Form("pass%d",fRecoPass)));
1782     if(fEMCALPIDParamsPass) fEMCALPIDParams     = dynamic_cast<TObjArray *>(fEMCALPIDParamsPass->FindObject(Form("EMCALPIDParams_Particles")));
1783
1784     if(!fEMCALPIDParams){
1785       AliInfo(Form("EMCAL Params not found in run %d pass %d", fRun, fRecoPass));
1786       AliInfo("Will take the standard LHC11d instead ...");
1787
1788       fEMCALPIDParamsRun = dynamic_cast<TObjArray *>(contParams.GetObject(156477));
1789       if(fEMCALPIDParamsRun)  fEMCALPIDParamsPass = dynamic_cast<TObjArray *>(fEMCALPIDParamsRun->FindObject(Form("pass%d",1)));
1790       if(fEMCALPIDParamsPass) fEMCALPIDParams     = dynamic_cast<TObjArray *>(fEMCALPIDParamsPass->FindObject(Form("EMCALPIDParams_Particles")));
1791
1792       if(!fEMCALPIDParams){
1793         AliError(Form("DEFAULT EMCAL Params (LHC11d) not found in file %s/COMMON/PID/data/EMCALPIDParams.root", fOADBPath.Data()));
1794       }
1795     }
1796   }
1797 }
1798
1799 //______________________________________________________________________________
1800 void AliPIDResponse::InitializeEMCALResponse(){
1801   //
1802   // Set PID Params to the EMCAL PID response
1803   //
1804   fEMCALResponse.SetPIDParams(fEMCALPIDParams);
1805
1806 }
1807
1808 //______________________________________________________________________________
1809 void AliPIDResponse::FillTrackDetectorPID(const AliVTrack *track, EDetector detector) const
1810 {
1811   //
1812   // create detector PID information and setup the transient pointer in the track
1813   //
1814
1815   // check if detector number is inside accepted range
1816   if (detector == kNdetectors) return;
1817
1818   // get detector pid
1819   AliDetectorPID *detPID=const_cast<AliDetectorPID*>(track->GetDetectorPID());
1820   if (!detPID) {
1821     detPID=new AliDetectorPID;
1822     (const_cast<AliVTrack*>(track))->SetDetectorPID(detPID);
1823   }
1824
1825   //check if values exist
1826   if (detPID->HasRawProbability(detector) && detPID->HasNumberOfSigmas(detector)) return;
1827
1828   //TODO: which particles to include? See also the loops below...
1829   Double_t values[AliPID::kSPECIESC]={0};
1830
1831   //probabilities
1832   EDetPidStatus status=GetComputePIDProbability(detector,track,AliPID::kSPECIESC,values);
1833   detPID->SetRawProbability(detector, values, (Int_t)AliPID::kSPECIESC, status);
1834
1835   //nsigmas
1836   for (Int_t ipart=0; ipart<AliPID::kSPECIESC; ++ipart)
1837     values[ipart]=GetNumberOfSigmas(detector,track,(AliPID::EParticleType)ipart);
1838   // the pid status is the same for probabilities and nSigmas, so it is
1839   // fine to use the one from the probabilities also here
1840   detPID->SetNumberOfSigmas(detector, values, (Int_t)AliPID::kSPECIESC, status);
1841
1842 }
1843
1844 //______________________________________________________________________________
1845 void AliPIDResponse::FillTrackDetectorPID()
1846 {
1847   //
1848   // create detector PID information and setup the transient pointer in the track
1849   //
1850
1851   if (!fCurrentEvent) return;
1852
1853   for (Int_t itrack=0; itrack<fCurrentEvent->GetNumberOfTracks(); ++itrack){
1854     AliVTrack *track=dynamic_cast<AliVTrack*>(fCurrentEvent->GetTrack(itrack));
1855     if (!track) continue;
1856
1857     for (Int_t idet=0; idet<kNdetectors; ++idet){
1858       FillTrackDetectorPID(track, (EDetector)idet);
1859     }
1860   }
1861 }
1862
1863 //______________________________________________________________________________
1864 void AliPIDResponse::SetTOFResponse(AliVEvent *vevent,EStartTimeType_t option){
1865   //
1866   // Set TOF response function
1867   // Input option for event_time used
1868   //
1869
1870     Float_t t0spread = 0.; //vevent->GetEventTimeSpread();
1871     if(t0spread < 10) t0spread = 80;
1872
1873     // T0-FILL and T0-TO offset (because of TOF misallignment
1874     Float_t starttimeoffset = 0;
1875     if(fTOFPIDParams && !(fIsMC)) starttimeoffset=fTOFPIDParams->GetTOFtimeOffset();
1876     if(fTOFPIDParams){
1877       fTOFtail = fTOFPIDParams->GetTOFtail();
1878       GetTOFResponse().SetTOFtail(fTOFtail);
1879     }
1880
1881     // T0 from TOF algorithm
1882     Bool_t flagT0TOF=kFALSE;
1883     Bool_t flagT0T0=kFALSE;
1884     Float_t *startTime = new Float_t[fTOFResponse.GetNmomBins()];
1885     Float_t *startTimeRes = new Float_t[fTOFResponse.GetNmomBins()];
1886     Int_t *startTimeMask = new Int_t[fTOFResponse.GetNmomBins()];
1887
1888     // T0-TOF arrays
1889     Float_t *estimatedT0event = new Float_t[fTOFResponse.GetNmomBins()];
1890     Float_t *estimatedT0resolution = new Float_t[fTOFResponse.GetNmomBins()];
1891     for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
1892       estimatedT0event[i]=0.0;
1893       estimatedT0resolution[i]=0.0;
1894       startTimeMask[i] = 0;
1895     }
1896
1897     Float_t resT0A=fResT0A;
1898     Float_t resT0C=fResT0C;
1899     Float_t resT0AC=fResT0AC;
1900     if(vevent->GetT0TOF()){ // check if T0 detector information is available
1901         flagT0T0=kTRUE;
1902     }
1903
1904
1905     AliTOFHeader *tofHeader = (AliTOFHeader*)vevent->GetTOFHeader();
1906
1907     if (tofHeader) { // read global info and T0-TOF
1908       //      fTOFResponse.SetTimeResolution(tofHeader->GetTOFResolution()); // read from OADB in the initialization
1909       t0spread = tofHeader->GetT0spread(); // read t0 sprad
1910       if(t0spread < 10) t0spread = 80;
1911
1912       flagT0TOF=kTRUE;
1913       for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){ // read T0-TOF default value
1914         startTime[i]=tofHeader->GetDefaultEventTimeVal();
1915         startTimeRes[i]=tofHeader->GetDefaultEventTimeRes();
1916         if(startTimeRes[i] < 1.e-5) startTimeRes[i] = t0spread;
1917
1918         if(startTimeRes[i] > t0spread - 10 && TMath::Abs(startTime[i]) < 0.001) startTime[i] = -starttimeoffset; // apply offset for T0-fill
1919       }
1920
1921       TArrayI *ibin=(TArrayI*)tofHeader->GetNvalues();
1922       TArrayF *t0Bin=(TArrayF*)tofHeader->GetEventTimeValues();
1923       TArrayF *t0ResBin=(TArrayF*)tofHeader->GetEventTimeRes();
1924       for(Int_t j=0;j < tofHeader->GetNbins();j++){ // fill T0-TOF in p-bins
1925         Int_t icurrent = (Int_t)ibin->GetAt(j);
1926         startTime[icurrent]=t0Bin->GetAt(j);
1927         startTimeRes[icurrent]=t0ResBin->GetAt(j);
1928         if(startTimeRes[icurrent] < 1.e-5) startTimeRes[icurrent] = t0spread;
1929         if(startTimeRes[icurrent] > t0spread - 10 && TMath::Abs(startTime[icurrent]) < 0.001) startTime[icurrent] = -starttimeoffset; // apply offset for T0-fill
1930       }
1931     }
1932
1933     // for cut of 3 sigma on t0 spread
1934     Float_t t0cut = 3 * t0spread;
1935     if(t0cut < 500) t0cut = 500;
1936
1937     if(option == kFILL_T0){ // T0-FILL is used
1938         for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
1939           estimatedT0event[i]=0.0-starttimeoffset;
1940           estimatedT0resolution[i]=t0spread;
1941         }
1942         fTOFResponse.SetT0event(estimatedT0event);
1943         fTOFResponse.SetT0resolution(estimatedT0resolution);
1944     }
1945
1946     if(option == kTOF_T0){ // T0-TOF is used when available (T0-FILL otherwise) from ESD
1947         if(flagT0TOF){
1948             fTOFResponse.SetT0event(startTime);
1949             fTOFResponse.SetT0resolution(startTimeRes);
1950             for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
1951               if(startTimeRes[i]<t0spread) startTimeMask[i]=1;
1952               fTOFResponse.SetT0binMask(i,startTimeMask[i]);
1953             }
1954         }
1955         else{
1956             for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
1957               estimatedT0event[i]=0.0-starttimeoffset;
1958               estimatedT0resolution[i]=t0spread;
1959               fTOFResponse.SetT0binMask(i,startTimeMask[i]);
1960             }
1961             fTOFResponse.SetT0event(estimatedT0event);
1962             fTOFResponse.SetT0resolution(estimatedT0resolution);
1963         }
1964     }
1965     else if(option == kBest_T0){ // T0-T0 or T0-TOF are used when available (T0-FILL otherwise) from ESD
1966         Float_t t0AC=-10000;
1967         Float_t t0A=-10000;
1968         Float_t t0C=-10000;
1969         if(flagT0T0){
1970             t0A= vevent->GetT0TOF()[1] - starttimeoffset;
1971             t0C= vevent->GetT0TOF()[2] - starttimeoffset;
1972         //      t0AC= vevent->GetT0TOF()[0];
1973             t0AC= t0A/resT0A/resT0A + t0C/resT0C/resT0C;
1974             resT0AC= 1./TMath::Sqrt(1./resT0A/resT0A + 1./resT0C/resT0C);
1975             t0AC *= resT0AC*resT0AC;
1976         }
1977
1978         Float_t t0t0Best = 0;
1979         Float_t t0t0BestRes = 9999;
1980         Int_t t0used=0;
1981         if(TMath::Abs(t0A) < t0cut && TMath::Abs(t0C) < t0cut && TMath::Abs(t0C-t0A) < 500){
1982             t0t0Best = t0AC;
1983             t0t0BestRes = resT0AC;
1984             t0used=6;
1985         }
1986         else if(TMath::Abs(t0C) < t0cut){
1987             t0t0Best = t0C;
1988             t0t0BestRes = resT0C;
1989             t0used=4;
1990         }
1991         else if(TMath::Abs(t0A) < t0cut){
1992             t0t0Best = t0A;
1993             t0t0BestRes = resT0A;
1994             t0used=2;
1995         }
1996
1997         if(flagT0TOF){ // if T0-TOF info is available
1998             for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
1999                 if(t0t0BestRes < 999){
2000                   if(startTimeRes[i] < t0spread){
2001                     Double_t wtot = 1./startTimeRes[i]/startTimeRes[i] + 1./t0t0BestRes/t0t0BestRes;
2002                     Double_t t0best = startTime[i]/startTimeRes[i]/startTimeRes[i] + t0t0Best/t0t0BestRes/t0t0BestRes;
2003                     estimatedT0event[i]=t0best / wtot;
2004                     estimatedT0resolution[i]=1./TMath::Sqrt(wtot);
2005                     startTimeMask[i] = t0used+1;
2006                   }
2007                   else {
2008                     estimatedT0event[i]=t0t0Best;
2009                     estimatedT0resolution[i]=t0t0BestRes;
2010                     startTimeMask[i] = t0used;
2011                   }
2012                 }
2013                 else{
2014                   estimatedT0event[i]=startTime[i];
2015                   estimatedT0resolution[i]=startTimeRes[i];
2016                   if(startTimeRes[i]<t0spread) startTimeMask[i]=1;
2017                 }
2018                 fTOFResponse.SetT0binMask(i,startTimeMask[i]);
2019             }
2020             fTOFResponse.SetT0event(estimatedT0event);
2021             fTOFResponse.SetT0resolution(estimatedT0resolution);
2022         }
2023         else{ // if no T0-TOF info is available
2024             for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
2025               fTOFResponse.SetT0binMask(i,t0used);
2026               if(t0t0BestRes < 999){
2027                 estimatedT0event[i]=t0t0Best;
2028                 estimatedT0resolution[i]=t0t0BestRes;
2029               }
2030               else{
2031                 estimatedT0event[i]=0.0-starttimeoffset;
2032                 estimatedT0resolution[i]=t0spread;
2033               }
2034             }
2035             fTOFResponse.SetT0event(estimatedT0event);
2036             fTOFResponse.SetT0resolution(estimatedT0resolution);
2037         }
2038     }
2039
2040     else if(option == kT0_T0){ // T0-T0 is used when available (T0-FILL otherwise)
2041         Float_t t0AC=-10000;
2042         Float_t t0A=-10000;
2043         Float_t t0C=-10000;
2044         if(flagT0T0){
2045             t0A= vevent->GetT0TOF()[1] - starttimeoffset;
2046             t0C= vevent->GetT0TOF()[2] - starttimeoffset;
2047         //      t0AC= vevent->GetT0TOF()[0];
2048             t0AC= t0A/resT0A/resT0A + t0C/resT0C/resT0C;
2049             resT0AC= 1./TMath::Sqrt(1./resT0A/resT0A + 1./resT0C/resT0C);
2050             t0AC *= resT0AC*resT0AC;
2051         }
2052
2053         if(TMath::Abs(t0A) < t0cut && TMath::Abs(t0C) < t0cut && TMath::Abs(t0C-t0A) < 500){
2054             for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
2055               estimatedT0event[i]=t0AC;
2056               estimatedT0resolution[i]=resT0AC;
2057               fTOFResponse.SetT0binMask(i,6);
2058             }
2059         }
2060         else if(TMath::Abs(t0C) < t0cut){
2061             for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
2062               estimatedT0event[i]=t0C;
2063               estimatedT0resolution[i]=resT0C;
2064               fTOFResponse.SetT0binMask(i,4);
2065             }
2066         }
2067         else if(TMath::Abs(t0A) < t0cut){
2068             for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
2069               estimatedT0event[i]=t0A;
2070               estimatedT0resolution[i]=resT0A;
2071               fTOFResponse.SetT0binMask(i,2);
2072             }
2073         }
2074         else{
2075             for(Int_t i=0;i<fTOFResponse.GetNmomBins();i++){
2076               estimatedT0event[i]= 0.0 - starttimeoffset;
2077               estimatedT0resolution[i]=t0spread;
2078               fTOFResponse.SetT0binMask(i,0);
2079             }
2080         }
2081         fTOFResponse.SetT0event(estimatedT0event);
2082         fTOFResponse.SetT0resolution(estimatedT0resolution);
2083     }
2084
2085     delete [] startTime;
2086     delete [] startTimeRes;
2087     delete [] startTimeMask;
2088     delete [] estimatedT0event;
2089     delete [] estimatedT0resolution;
2090 }
2091
2092 //______________________________________________________________________________
2093 // private non cached versions of the PID calculation
2094 //
2095
2096
2097 //______________________________________________________________________________
2098 Float_t AliPIDResponse::GetNumberOfSigmas(EDetector detector, const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
2099 {
2100   //
2101   // NumberOfSigmas for 'detCode'
2102   //
2103
2104   const AliVTrack *track=static_cast<const AliVTrack*>(vtrack);
2105
2106   switch (detector){
2107     case kITS:   return GetNumberOfSigmasITS(track, type);   break;
2108     case kTPC:   return GetNumberOfSigmasTPC(track, type);   break;
2109     case kTRD:   return GetNumberOfSigmasTRD(track, type);   break;
2110     case kTOF:   return GetNumberOfSigmasTOF(track, type);   break;
2111     case kHMPID: return GetNumberOfSigmasHMPID(track, type); break;
2112     case kEMCAL: return GetNumberOfSigmasEMCAL(track, type); break;
2113     default: return -999.;
2114   }
2115
2116   return -999.;
2117 }
2118
2119 //______________________________________________________________________________
2120 Float_t AliPIDResponse::GetNumberOfSigmasITS(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
2121 {
2122   //
2123   // Calculate the number of sigmas in the ITS
2124   //
2125
2126   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2127
2128   const EDetPidStatus pidStatus=GetITSPIDStatus(track);
2129   if (pidStatus!=kDetPidOk) return -999.;
2130
2131   return fITSResponse.GetNumberOfSigmas(track,type);
2132 }
2133
2134 //______________________________________________________________________________
2135 Float_t AliPIDResponse::GetNumberOfSigmasTPC(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
2136 {
2137   //
2138   // Calculate the number of sigmas in the TPC
2139   //
2140
2141   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2142
2143   const EDetPidStatus pidStatus=GetTPCPIDStatus(track);
2144   if (pidStatus==kDetNoSignal) return -999.;
2145
2146   // the following call is needed in order to fill the transient data member
2147   // fTPCsignalTuned which is used in the TPCPIDResponse to judge
2148   // if using tuned on data
2149   if (fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC))
2150     this->GetTPCsignalTunedOnData(track);
2151
2152   return fTPCResponse.GetNumberOfSigmas(track, type, AliTPCPIDResponse::kdEdxDefault, fUseTPCEtaCorrection, fUseTPCMultiplicityCorrection);
2153 }
2154
2155 //______________________________________________________________________________
2156 Float_t AliPIDResponse::GetNumberOfSigmasTRD(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
2157 {
2158   //
2159   // Calculate the number of sigmas in the TRD
2160   //
2161
2162   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2163
2164   const EDetPidStatus pidStatus=GetTRDPIDStatus(track);
2165   if (pidStatus!=kDetPidOk) return -999.;
2166
2167   return fTRDResponse.GetNumberOfSigmas(track,type);
2168 }
2169
2170 //______________________________________________________________________________
2171 Float_t AliPIDResponse::GetNumberOfSigmasTOF(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
2172 {
2173   //
2174   // Calculate the number of sigmas in the TOF
2175   //
2176
2177   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2178
2179   const EDetPidStatus pidStatus=GetTOFPIDStatus(track);
2180   if (pidStatus!=kDetPidOk) return -999.;
2181
2182   return GetNumberOfSigmasTOFold(vtrack, type);
2183 }
2184 //______________________________________________________________________________
2185
2186 Float_t AliPIDResponse::GetNumberOfSigmasHMPID(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
2187 {
2188   //
2189   // Calculate the number of sigmas in the HMPID
2190   //
2191   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2192
2193   const EDetPidStatus pidStatus=GetHMPIDPIDStatus(track);
2194   if (pidStatus!=kDetPidOk) return -999.;
2195
2196   return fHMPIDResponse.GetNumberOfSigmas(track, type);
2197 }
2198
2199 //______________________________________________________________________________
2200 Float_t AliPIDResponse::GetNumberOfSigmasEMCAL(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type) const
2201 {
2202   //
2203   // Calculate the number of sigmas in the EMCAL
2204   //
2205
2206   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2207
2208   const EDetPidStatus pidStatus=GetEMCALPIDStatus(track);
2209   if (pidStatus!=kDetPidOk) return -999.;
2210
2211   const Int_t nMatchClus = track->GetEMCALcluster();
2212   AliVCluster *matchedClus = (AliVCluster*)fCurrentEvent->GetCaloCluster(nMatchClus);
2213
2214   const Double_t mom    = track->P();
2215   const Double_t pt     = track->Pt();
2216   const Int_t    charge = track->Charge();
2217   const Double_t fClsE  = matchedClus->E();
2218   const Double_t EovP   = fClsE/mom;
2219
2220   return fEMCALResponse.GetNumberOfSigmas(pt,EovP,type,charge);
2221 }
2222
2223 //______________________________________________________________________________
2224 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetSignalDeltaITS(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type, Double_t &val, Bool_t ratio/*=kFALSE*/) const
2225 {
2226   //
2227   // Signal minus expected Signal for ITS
2228   //
2229   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2230   val=fITSResponse.GetSignalDelta(track,type,ratio);
2231
2232   return GetITSPIDStatus(track);
2233 }
2234
2235 //______________________________________________________________________________
2236 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetSignalDeltaTPC(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type, Double_t &val, Bool_t ratio/*=kFALSE*/) const
2237 {
2238   //
2239   // Signal minus expected Signal for TPC
2240   //
2241   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2242
2243   // the following call is needed in order to fill the transient data member
2244   // fTPCsignalTuned which is used in the TPCPIDResponse to judge
2245   // if using tuned on data
2246   if (fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC))
2247     this->GetTPCsignalTunedOnData(track);
2248
2249   val=fTPCResponse.GetSignalDelta(track, type, AliTPCPIDResponse::kdEdxDefault, fUseTPCEtaCorrection, fUseTPCMultiplicityCorrection, ratio);
2250
2251   return GetTPCPIDStatus(track);
2252 }
2253
2254 //______________________________________________________________________________
2255 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetSignalDeltaTRD(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type, Double_t &val, Bool_t ratio/*=kFALSE*/) const
2256 {
2257   //
2258   // Signal minus expected Signal for TRD
2259   //
2260   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2261   val=fTRDResponse.GetSignalDelta(track,type,ratio);
2262
2263   return GetTRDPIDStatus(track);
2264 }
2265
2266 //______________________________________________________________________________
2267 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetSignalDeltaTOF(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type, Double_t &val, Bool_t ratio/*=kFALSE*/) const
2268 {
2269   //
2270   // Signal minus expected Signal for TOF
2271   //
2272   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2273   val=GetSignalDeltaTOFold(track, type, ratio);
2274
2275   return GetTOFPIDStatus(track);
2276 }
2277
2278 //______________________________________________________________________________
2279 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetSignalDeltaHMPID(const AliVParticle *vtrack, AliPID::EParticleType type, Double_t &val, Bool_t ratio/*=kFALSE*/) const
2280 {
2281   //
2282   // Signal minus expected Signal for HMPID
2283   //
2284   AliVTrack *track=(AliVTrack*)vtrack;
2285   val=fHMPIDResponse.GetSignalDelta(track, type, ratio);
2286
2287   return GetHMPIDPIDStatus(track);
2288 }
2289
2290 //______________________________________________________________________________
2291 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetComputePIDProbability  (EDetector detCode,  const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
2292 {
2293   //
2294   // Compute PID response of 'detCode'
2295   //
2296
2297   switch (detCode){
2298     case kITS: return GetComputeITSProbability(track, nSpecies, p); break;
2299     case kTPC: return GetComputeTPCProbability(track, nSpecies, p); break;
2300     case kTRD: return GetComputeTRDProbability(track, nSpecies, p); break;
2301     case kTOF: return GetComputeTOFProbability(track, nSpecies, p); break;
2302     case kPHOS: return GetComputePHOSProbability(track, nSpecies, p); break;
2303     case kEMCAL: return GetComputeEMCALProbability(track, nSpecies, p); break;
2304     case kHMPID: return GetComputeHMPIDProbability(track, nSpecies, p); break;
2305     default: return kDetNoSignal;
2306   }
2307 }
2308
2309 //______________________________________________________________________________
2310 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetComputeITSProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
2311 {
2312   //
2313   // Compute PID response for the ITS
2314   //
2315
2316   // set flat distribution (no decision)
2317   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
2318
2319   const EDetPidStatus pidStatus=GetITSPIDStatus(track);
2320   if (pidStatus!=kDetPidOk) return pidStatus;
2321
2322   if (track->GetDetectorPID()){
2323     return track->GetDetectorPID()->GetRawProbability(kITS, p, nSpecies);
2324   }
2325
2326   //check for ITS standalone tracks
2327   Bool_t isSA=kTRUE;
2328   if( track->GetStatus() & AliVTrack::kTPCin ) isSA=kFALSE;
2329
2330   Double_t mom=track->P();
2331   Double_t dedx=track->GetITSsignal();
2332   Double_t momITS=mom;
2333   UChar_t clumap=track->GetITSClusterMap();
2334   Int_t nPointsForPid=0;
2335   for(Int_t i=2; i<6; i++){
2336     if(clumap&(1<<i)) ++nPointsForPid;
2337   }
2338
2339   Bool_t mismatch=kTRUE/*, heavy=kTRUE*/;
2340   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) {
2341     Double_t mass=AliPID::ParticleMassZ(j);//GeV/c^2
2342     const Double_t chargeFactor = TMath::Power(AliPID::ParticleCharge(j),2.);
2343     Double_t bethe=fITSResponse.Bethe(momITS,mass)*chargeFactor;
2344     //TODO: in case of the electron, use the SA parametrisation,
2345     //      this needs to be changed if ITS provides a parametrisation
2346     //      for electrons also for ITS+TPC tracks
2347     Double_t sigma=fITSResponse.GetResolution(bethe,nPointsForPid,isSA || (j==(Int_t)AliPID::kElectron));
2348     if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
2349       p[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
2350     } else {
2351       p[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
2352       mismatch=kFALSE;
2353     }
2354   }
2355
2356   if (mismatch){
2357     for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
2358   }
2359
2360   return kDetPidOk;
2361 }
2362 //______________________________________________________________________________
2363 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetComputeTPCProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
2364 {
2365   //
2366   // Compute PID response for the TPC
2367   //
2368
2369   // set flat distribution (no decision)
2370   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
2371
2372   const EDetPidStatus pidStatus=GetTPCPIDStatus(track);
2373   if (pidStatus==kDetNoSignal) return pidStatus;
2374
2375   Double_t dedx=track->GetTPCsignal();
2376   Bool_t mismatch=kTRUE/*, heavy=kTRUE*/;
2377
2378   if (fTuneMConData && ((fTuneMConDataMask & kDetTPC) == kDetTPC)) dedx = this->GetTPCsignalTunedOnData(track);
2379
2380   Double_t bethe = 0.;
2381   Double_t sigma = 0.;
2382
2383   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) {
2384     AliPID::EParticleType type=AliPID::EParticleType(j);
2385
2386     bethe=fTPCResponse.GetExpectedSignal(track, type, AliTPCPIDResponse::kdEdxDefault, fUseTPCEtaCorrection, fUseTPCMultiplicityCorrection);
2387     sigma=fTPCResponse.GetExpectedSigma(track, type, AliTPCPIDResponse::kdEdxDefault, fUseTPCEtaCorrection, fUseTPCMultiplicityCorrection);
2388
2389     if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
2390       p[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
2391     } else {
2392       p[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
2393       mismatch=kFALSE;
2394     }
2395   }
2396
2397   if (mismatch){
2398     for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
2399   }
2400
2401   return pidStatus;
2402 }
2403 //______________________________________________________________________________
2404 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetComputeTOFProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[],Bool_t kNoMism) const
2405 {
2406   //
2407   // Compute PID probabilities for TOF
2408   //
2409
2410   fgTOFmismatchProb = 1E-8;
2411
2412   // centrality --> fCurrCentrality
2413   // Beam type --> fBeamTypeNum
2414   // N TOF cluster --> TOF header --> to get the TOF header we need to add a virtual method in AliVTrack extended to ESD and AOD tracks
2415   // isMC --> fIsMC
2416   Float_t pt = track->Pt();
2417   Float_t mismPropagationFactor[10] = {1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.};
2418   if(! (kNoMism | fNoTOFmism)){ // this flag allows to disable mismatch for iterative procedure to get priors
2419     mismPropagationFactor[3] = 1 + TMath::Exp(1 - 1.12*pt);// it has to be alligned with the one in AliPIDCombined
2420     mismPropagationFactor[4] = 1 + 1./(4.71114 - 5.72372*pt + 2.94715*pt*pt);// it has to be alligned with the one in AliPIDCombined
2421
2422   Int_t nTOFcluster = 0;
2423   if(track->GetTOFHeader() && track->GetTOFHeader()->GetTriggerMask() && track->GetTOFHeader()->GetNumberOfTOFclusters() > -1){ // N TOF clusters available
2424     nTOFcluster = track->GetTOFHeader()->GetNumberOfTOFclusters();
2425     if(fIsMC) nTOFcluster = Int_t(nTOFcluster * 1.5); // +50% in MC
2426   }
2427   else{
2428     switch(fBeamTypeNum){
2429       case kPP: // pp
2430         nTOFcluster = 80;
2431         break;
2432       case kPPB: // pPb 5.05 ATeV
2433         nTOFcluster = Int_t(308 - 2.12*fCurrCentrality + TMath::Exp(4.917 -0.1604*fCurrCentrality));
2434         break;
2435       case kPBPB: // PbPb 2.76 ATeV
2436         nTOFcluster = Int_t(TMath::Exp(9.4 - 0.022*fCurrCentrality));
2437         break;
2438     }
2439   }
2440
2441     switch(fBeamTypeNum){ // matching window factors for 3 cm and 10 cm (about (10/3)^2)
2442     case kPP: // pp 7 TeV
2443       nTOFcluster *= 10;
2444       break;
2445     case kPPB: // pPb 5.05 ATeV
2446       nTOFcluster *= 10;
2447       break;
2448     case kPBPB: // pPb 5.05 ATeV
2449       //       nTOFcluster *= 1;
2450       break;
2451     }
2452
2453     if(nTOFcluster < 0) nTOFcluster = 10;
2454
2455
2456     fgTOFmismatchProb=fTOFResponse.GetMismatchProbability(track->GetTOFsignal(),track->Eta()) * nTOFcluster *6E-6 * (1 + 2.90505e-01/pt/pt); // mism weight * tof occupancy (including matching window factor) * pt dependence
2457
2458   }
2459
2460   // set flat distribution (no decision)
2461   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
2462
2463   const EDetPidStatus pidStatus=GetTOFPIDStatus(track);
2464   if (pidStatus!=kDetPidOk) return pidStatus;
2465
2466   const Double_t meanCorrFactor = 0.07/fTOFtail; // Correction factor on the mean because of the tail (should be ~ 0.1 with tail = 1.1)
2467
2468   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) {
2469     AliPID::EParticleType type=AliPID::EParticleType(j);
2470     const Double_t nsigmas=GetNumberOfSigmasTOFold(track,type) + meanCorrFactor;
2471
2472     const Double_t expTime = fTOFResponse.GetExpectedSignal(track,type);
2473     const Double_t sig     = fTOFResponse.GetExpectedSigma(track->P(),expTime,AliPID::ParticleMassZ(type));
2474
2475     if(nsigmas < fTOFtail)
2476       p[j] = TMath::Exp(-0.5*nsigmas*nsigmas)/sig;
2477     else
2478       p[j] = TMath::Exp(-(nsigmas - fTOFtail*0.5)*fTOFtail)/sig;
2479
2480     p[j] += fgTOFmismatchProb*mismPropagationFactor[j];
2481   }
2482
2483   return kDetPidOk;
2484 }
2485
2486 Int_t AliPIDResponse::CalculateTRDResponse(const AliVTrack *track,Double_t p[],AliTRDPIDResponse::ETRDPIDMethod PIDmethod) const
2487 {
2488     // new function for backward compatibility
2489     // returns number of tracklets PID
2490
2491     UInt_t TRDslicesForPID[2];
2492     SetTRDSlices(TRDslicesForPID,PIDmethod);
2493
2494     Float_t mom[6]={0.};
2495     Double_t dedx[48]={0.};  // Allocate space for the maximum number of TRD slices
2496     Int_t nslices = TRDslicesForPID[1] - TRDslicesForPID[0] + 1;
2497     AliDebug(1, Form("First Slice: %d, Last Slice: %d, Number of slices: %d",  TRDslicesForPID[0], TRDslicesForPID[1], nslices));
2498     for(UInt_t ilayer = 0; ilayer < 6; ilayer++){
2499         mom[ilayer] = track->GetTRDmomentum(ilayer);
2500         for(UInt_t islice = TRDslicesForPID[0]; islice <= TRDslicesForPID[1]; islice++){
2501             dedx[ilayer*nslices+islice-TRDslicesForPID[0]] = track->GetTRDslice(ilayer, islice);
2502         }
2503     }
2504
2505     return fTRDResponse.GetResponse(nslices, dedx, mom, p,PIDmethod);
2506
2507 }
2508 //______________________________________________________________________________
2509 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetComputeTRDProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[],AliTRDPIDResponse::ETRDPIDMethod PIDmethod) const
2510 {
2511   //
2512   // Compute PID probabilities for the TRD
2513   //
2514
2515   // set flat distribution (no decision)
2516   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
2517
2518   const EDetPidStatus pidStatus=GetTRDPIDStatus(track);
2519   if (pidStatus!=kDetPidOk) return pidStatus;
2520
2521   CalculateTRDResponse(track,p,PIDmethod);
2522
2523   return kDetPidOk;
2524 }
2525
2526 //______________________________________________________________________________
2527 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetComputeEMCALProbability  (const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
2528 {
2529   //
2530   // Compute PID response for the EMCAL
2531   //
2532
2533   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
2534
2535   const EDetPidStatus pidStatus=GetEMCALPIDStatus(track);
2536   if (pidStatus!=kDetPidOk) return pidStatus;
2537
2538   const Int_t nMatchClus = track->GetEMCALcluster();
2539   AliVCluster *matchedClus = (AliVCluster*)fCurrentEvent->GetCaloCluster(nMatchClus);
2540
2541   const Double_t mom    = track->P();
2542   const Double_t pt     = track->Pt();
2543   const Int_t    charge = track->Charge();
2544   const Double_t fClsE  = matchedClus->E();
2545   const Double_t EovP   = fClsE/mom;
2546
2547   // compute the probabilities
2548   fEMCALResponse.ComputeEMCALProbability(nSpecies,pt,EovP,charge,p);
2549   return kDetPidOk;
2550 }
2551
2552 //______________________________________________________________________________
2553 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetComputePHOSProbability (const AliVTrack */*track*/, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
2554 {
2555   //
2556   // Compute PID response for the PHOS
2557   //
2558
2559   // set flat distribution (no decision)
2560   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
2561   return kDetNoSignal;
2562 }
2563
2564 //______________________________________________________________________________
2565 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetComputeHMPIDProbability(const AliVTrack *track, Int_t nSpecies, Double_t p[]) const
2566 {
2567   //
2568   // Compute PID response for the HMPID
2569   //
2570
2571   // set flat distribution (no decision)
2572   for (Int_t j=0; j<nSpecies; j++) p[j]=1./nSpecies;
2573
2574   const EDetPidStatus pidStatus=GetHMPIDPIDStatus(track);
2575   if (pidStatus!=kDetPidOk) return pidStatus;
2576
2577   fHMPIDResponse.GetProbability(track,nSpecies,p);
2578
2579   return kDetPidOk;
2580 }
2581
2582 //______________________________________________________________________________
2583 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetITSPIDStatus(const AliVTrack *track) const
2584 {
2585   // compute ITS pid status
2586
2587   // check status bits
2588   if ((track->GetStatus()&AliVTrack::kITSin)==0 &&
2589     (track->GetStatus()&AliVTrack::kITSout)==0) return kDetNoSignal;
2590
2591   const Float_t dEdx=track->GetITSsignal();
2592   if (dEdx<=0) return kDetNoSignal;
2593
2594   // requite at least 3 pid clusters
2595   const UChar_t clumap=track->GetITSClusterMap();
2596   Int_t nPointsForPid=0;
2597   for(Int_t i=2; i<6; i++){
2598     if(clumap&(1<<i)) ++nPointsForPid;
2599   }
2600
2601   if(nPointsForPid<3) {
2602     return kDetNoSignal;
2603   }
2604
2605   return kDetPidOk;
2606 }
2607
2608 //______________________________________________________________________________
2609 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse:: GetTPCPIDStatus(const AliVTrack *track) const
2610 {
2611   // compute TPC pid status
2612
2613   // check quality of the track
2614   if ( (track->GetStatus()&AliVTrack::kTPCin )==0 && (track->GetStatus()&AliVTrack::kTPCout)==0 ) return kDetNoSignal;
2615
2616   // check pid values
2617   const Double_t dedx=track->GetTPCsignal();
2618   const UShort_t signalN=track->GetTPCsignalN();
2619   if (signalN<10 || dedx<10) return kDetNoSignal;
2620
2621   if (!(fArrPidResponseMaster && fArrPidResponseMaster->At(AliPID::kPion))) return kDetNoParams;
2622
2623   return kDetPidOk;
2624 }
2625
2626 //______________________________________________________________________________
2627 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetTRDPIDStatus(const AliVTrack *track) const
2628 {
2629   // compute TRD pid status
2630
2631   if((track->GetStatus()&AliVTrack::kTRDout)==0) return kDetNoSignal;
2632   return kDetPidOk;
2633 }
2634
2635 //______________________________________________________________________________
2636 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetTOFPIDStatus(const AliVTrack *track) const
2637 {
2638   // compute TOF pid status
2639
2640   if ((track->GetStatus()&AliVTrack::kTOFout)==0) return kDetNoSignal;
2641   if ((track->GetStatus()&AliVTrack::kTIME)==0) return kDetNoSignal;
2642
2643   return kDetPidOk;
2644 }
2645
2646 //______________________________________________________________________________
2647 Float_t AliPIDResponse::GetTOFMismatchProbability(const AliVTrack *track) const
2648 {
2649   // compute mismatch probability cross-checking at 5 sigmas with TPC
2650   // currently just implemented as a 5 sigma compatibility cut
2651
2652   if(!track) return fgTOFmismatchProb;
2653
2654   // check pid status
2655   const EDetPidStatus tofStatus=GetTOFPIDStatus(track);
2656   if (tofStatus!=kDetPidOk) return 0.;
2657
2658   //mismatch
2659   const EDetPidStatus tpcStatus=GetTPCPIDStatus(track);
2660   if (tpcStatus==kDetNoSignal) return 0.;
2661
2662   const Double_t meanCorrFactor = 0.11/fTOFtail; // Correction factor on the mean because of the tail (should be ~ 0.1 with tail = 1.1)
2663   Bool_t mismatch = kTRUE/*, heavy = kTRUE*/;
2664   for (Int_t j=0; j<AliPID::kSPECIESC; j++) {
2665     AliPID::EParticleType type=AliPID::EParticleType(j);
2666     const Double_t nsigmas=GetNumberOfSigmasTOFold(track,type) + meanCorrFactor;
2667
2668     if (TMath::Abs(nsigmas)<5.){
2669       const Double_t nsigmasTPC=GetNumberOfSigmasTPC(track,type);
2670       if (TMath::Abs(nsigmasTPC)<5.) mismatch=kFALSE;
2671     }
2672   }
2673
2674   if (mismatch){
2675     return 1.;
2676   }
2677
2678   return 0.;
2679 }
2680
2681 //______________________________________________________________________________
2682 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse:: GetHMPIDPIDStatus(const AliVTrack *track) const
2683 {
2684   // compute HMPID pid status
2685
2686   Int_t ch = track->GetHMPIDcluIdx()/1000000;
2687   Double_t HMPIDsignal = track->GetHMPIDsignal();
2688
2689   if((track->GetStatus()&AliVTrack::kHMPIDpid)==0 || ch<0 || ch>6 || HMPIDsignal<0) return kDetNoSignal;
2690
2691   return kDetPidOk;
2692 }
2693
2694 //______________________________________________________________________________
2695 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse:: GetPHOSPIDStatus(const AliVTrack */*track*/) const
2696 {
2697   // compute PHOS pid status
2698   return kDetNoSignal;
2699 }
2700
2701 //______________________________________________________________________________
2702 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse:: GetEMCALPIDStatus(const AliVTrack *track) const
2703 {
2704   // compute EMCAL pid status
2705
2706
2707   // Track matching
2708   const Int_t nMatchClus = track->GetEMCALcluster();
2709   if (nMatchClus<0) return kDetNoSignal;
2710
2711   AliVCluster *matchedClus = (AliVCluster*)fCurrentEvent->GetCaloCluster(nMatchClus);
2712
2713   if (!(matchedClus && matchedClus->IsEMCAL())) return kDetNoSignal;
2714
2715   const Int_t charge = track->Charge();
2716   if (TMath::Abs(charge)!=1) return kDetNoSignal;
2717
2718   if (!(fEMCALPIDParams && fEMCALPIDParams->At(AliPID::kElectron))) return kDetNoParams;
2719
2720   return kDetPidOk;
2721
2722 }
2723
2724 //______________________________________________________________________________
2725 AliPIDResponse::EDetPidStatus AliPIDResponse::GetPIDStatus(EDetector detector, const AliVTrack *track) const
2726 {
2727   //
2728   // check pid status for a track
2729   //
2730
2731   switch (detector){
2732     case kITS:   return GetITSPIDStatus(track);   break;
2733     case kTPC:   return GetTPCPIDStatus(track);   break;
2734     case kTRD:   return GetTRDPIDStatus(track);   break;
2735     case kTOF:   return GetTOFPIDStatus(track);   break;
2736     case kPHOS:  return GetPHOSPIDStatus(track);  break;
2737     case kEMCAL: return GetEMCALPIDStatus(track); break;
2738     case kHMPID: return GetHMPIDPIDStatus(track); break;
2739     default: return kDetNoSignal;
2740   }
2741   return kDetNoSignal;
2742
2743 }
2744
2745 //______________________________________________________________________________
2746 TString AliPIDResponse::GetChecksum(const TObject* obj) const
2747 {
2748   // Return the checksum for an object obj (tested to work properly at least for histograms and TSplines).
2749
2750   TString fileName = Form("tempChecksum.C"); // File name must be fixed for data type "TSpline3", since the file name will end up in the file content!
2751
2752   // For parallel processing, a unique file pathname is required. Uniqueness can be guaranteed by using a unique directory name
2753   UInt_t index = 0;
2754   TString uniquePathName = Form("tempChecksum_%u", index);
2755
2756   // To get a unique path name, increase the index until no directory
2757   // of such a name exists.
2758   // NOTE: gSystem->AccessPathName(...) returns kTRUE, if the access FAILED!
2759   while (!gSystem->AccessPathName(uniquePathName.Data()))
2760     uniquePathName = Form("tempChecksum_%u", ++index);
2761
2762   if (gSystem->mkdir(uniquePathName.Data()) < 0) {
2763     AliError("Could not create temporary directory to store temp file for checksum determination!");
2764     return "ERROR";
2765   }
2766
2767   TString option = "";
2768
2769   // Save object as a macro, which will be deleted immediately after the checksum has been computed
2770   // (does not work for desired data types if saved as *.root for some reason) - one only wants to compare the content, not
2771   // the modification time etc. ...
2772   if (dynamic_cast<const TH1*>(obj))
2773     option = "colz"; // Histos need this option, since w/o this option, a counter is added to the filename
2774
2775
2776   // SaveAs must be called with the fixed fileName only, since the first argument goes into the file content
2777   // for some object types. Thus, change the directory, save the file and then go back
2778   TString oldDir = gSystem->pwd();
2779   gSystem->cd(uniquePathName.Data());
2780   obj->SaveAs(fileName.Data(), option.Data());
2781   gSystem->cd(oldDir.Data());
2782
2783   // Use the file to calculate the MD5 checksum
2784   TMD5* md5 = TMD5::FileChecksum(Form("%s/%s", uniquePathName.Data(), fileName.Data()));
2785   TString checksum = md5->AsString();
2786
2787   // Clean up
2788   delete md5;
2789   gSystem->Exec(Form("rm -rf %s", uniquePathName.Data()));
2790
2791   return checksum;
2792 }