TOF/AliTOFtrackerMI.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 //-----------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                 //
  18 //   AliTOFtracker Class                                           //
  19 //   Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters   //
  20 //   and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters   //
  21 //                                                                 //
  22 //-----------------------------------------------------------------//
  23
  24 #include <Rtypes.h>
  25
  26 #include "TClonesArray.h"
  27 #include "TTree.h"
  28 #include "TTreeStream.h"
  29
  30 #include "AliESDEvent.h"
  31 #include "AliESDtrack.h"
  32
  33 #include "AliTOFRecoParam.h"
  34 #include "AliTOFReconstructor.h"
  35 #include "AliTOFcluster.h"
  36 #include "AliTOFGeometry.h"
  37 #include "AliTOFtrackerMI.h"
  38 #include "AliTOFtrack.h"
  39 #include "AliTOFpidESD.h"
  40
  41 class TGeoManager;
  42
  43 extern TGeoManager *gGeoManager;
  44
  45 ClassImp(AliTOFtrackerMI)
  46
  47 //_____________________________________________________________________________
  48 AliTOFtrackerMI::AliTOFtrackerMI():
  49   fRecoParam(0x0),
  50   fGeom(0x0),
  51   fPid(0x0),
  52   fN(0),
  53   fNseeds(0),
  54   fNseedsTOF(0),
  55   fngoodmatch(0),
  56   fnbadmatch(0),
  57   fnunmatch(0),
  58   fnmatch(0),
  59   fR(379.),
  60   fTOFHeigth(15.3),
  61   fdCut(3.),
  62   fDx(1.5),
  63   fDy(0),
  64   fDz(0),
  65   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  66   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
  67   fDebugStreamer(0x0)
  68  {
  69   //AliTOFtrackerMI main Ctor
  70
  71    fDy=AliTOFGeometry::XPad();
  72    fDz=AliTOFGeometry::ZPad();
  73    fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TOFdebug.root");
  74 }
  75
  76 //_____________________________________________________________________________
  77 AliTOFtrackerMI::~AliTOFtrackerMI(){
  78   //
  79   //
  80   //
  81   if (fDebugStreamer) {
  82     //fDebugStreamer->Close();
  83     delete fDebugStreamer;
  84   }
  85   delete fRecoParam;
  86   delete fGeom;
  87   delete fPid;
  88   if (fTracks){
  89     fTracks->Delete();
  90     delete fTracks;
  91     fTracks=0x0;
  92   }
  93   if (fSeeds){
  94     fSeeds->Delete();
  95     delete fSeeds;
  96     fSeeds=0x0;
  97   }
  98 }
  99
 100 //_____________________________________________________________________________
 101 Int_t AliTOFtrackerMI::PropagateBack(AliESDEvent* event) {
 102   //
 103   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 104   //
 105
 106   // initialize RecoParam for current event
 107   AliDebug(1,"Initializing params for TOF");
 108
 109   fRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 110
 111   if (fRecoParam == 0x0) {
 112     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 113   }
 114   //fRecoParam->Dump();
 115   //if(fRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fRecoParam=fRecoParam->GetPbPbparam();
 116   //fRecoParam->PrintParameters();
 117
 118   Double_t parPID[2];
 119   parPID[0]=fRecoParam->GetTimeResolution();
 120   parPID[1]=fRecoParam->GetTimeNSigma();
 121   fPid=new AliTOFpidESD(parPID);
 122
 123   //Initialise some counters
 124
 125   fNseeds=0;
 126   fNseedsTOF=0;
 127   fngoodmatch=0;
 128   fnbadmatch=0;
 129   fnunmatch=0;
 130   fnmatch=0;
 131
 132   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 133   fNseeds = ntrk;
 134   TClonesArray &aESDTrack = *fSeeds;
 135
 136
 137   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 138
 139   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 140     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 141     new(aESDTrack[i]) AliESDtrack(*t);
 142   }
 143
 144   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 145   CollectESD();
 146
 147   //First Step with Strict Matching Criterion
 148   //MatchTracks(kFALSE);
 149
 150   //Second Step with Looser Matching Criterion
 151   //MatchTracks(kTRUE);
 152   MatchTracksMI(kFALSE);  // assign track to clusters
 153   MatchTracksMI(kTRUE);   // assign clusters to esd
 154
 155   AliInfo(Form("Number of matched tracks = %d (good = %d, bad = %d)",fnmatch,fngoodmatch,fnbadmatch));
 156
 157   //Update the matched ESD tracks
 158
 159   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 160     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 161     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 162
 163     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
 164       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
 165       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
 166       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
 167         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
 168         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 169         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 170         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 171         t->SetTOFLabel(tlab);
 172
 173         // Check done:
 174         //       by calling the AliESDtrack::UpdateTrackParams,
 175         //       the current track parameters are changed
 176         //       and it could cause refit problems.
 177         //       We need to update only the following track parameters:
 178         //            the track length and expected times.
 179         //       Removed AliESDtrack::UpdateTrackParams call
 180         //       Called AliESDtrack::SetIntegratedTimes(...) and
 181         //       AliESDtrack::SetIntegratedLength() routines.
 182         /*
 183         AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 184         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout);
 185         delete track;
 186         */
 187
 188         Double_t times[10]; seed->GetIntegratedTimes(times);
 189         t->SetIntegratedTimes(times);
 190         t->SetIntegratedLength(seed->GetIntegratedLength());
 191         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 192         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 193         //
 194         // Make attention, please:
 195         //      AliESDtrack::fTOFInfo array does not be stored in the AliESDs.root file
 196         //      it is there only for a check during the reconstruction step.
 197         Float_t info[10];
 198         seed->GetTOFInfo(info);
 199         t->SetTOFInfo(info);
 200       }
 201     }
 202   }
 203
 204
 205   //Make TOF PID
 206   fPid->MakePID(event);
 207
 208   fSeeds->Clear();
 209   fTracks->Clear();
 210   return 0;
 211
 212 }
 213 //_________________________________________________________________________
 214 void AliTOFtrackerMI::CollectESD() {
 215    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 216
 217   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 218   Int_t c0=0;
 219   Int_t c1=0;
 220   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 221
 222     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 223     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 224
 225     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 226     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
 227
 228     // TRD good tracks, already propagated at 371 cm
 229     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 230          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
 231       if  ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 232         track->SetSeedIndex(i);
 233         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 234         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 235         fNseedsTOF++;
 236         c0++;
 237         delete track;
 238       }
 239     }
 240
 241     // Propagate the rest of TPCbp
 242     else {
 243       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) { // temporary solution
 244         track->SetSeedIndex(i);
 245         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 246         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 247         fNseedsTOF++;
 248         c1++;
 249       }
 250       delete track;
 251     }
 252   }
 253   //
 254   //
 255   printf("TRD\tOn\t%d\tOff\t%d\n",c0,c1);
 256
 257   // Sort according uncertainties on track position
 258   fTracks->Sort();
 259
 260 }
 261
 262
 263
 264
 265
 266
 267
 268 //
 269 //
 270 //_________________________________________________________________________
 271 void AliTOFtrackerMI::MatchTracks( Bool_t /*mLastStep*/){
 272   return;
 273 }
 274 //
 275 //
 276 //_________________________________________________________________________
 277 void AliTOFtrackerMI::MatchTracksMI(Bool_t mLastStep){
 278
 279   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 280   const Float_t kTofOffset   = 26;  // time offset
 281   const Float_t kMinQuality  = -6.; // minimal quality
 282   const Float_t kMaxQualityD = 1.;  // max delta quality if cluster used
 283   const Float_t kForbiddenR  = 0.1; // minimal PID according TPC
 284
 285   static const Double_t kMasses[]={
 286     0.000511, 0.105658, 0.139570, 0.493677, 0.938272, 1.875613
 287   };
 288
 289   Int_t nSteps=(Int_t)(fTOFHeigth/0.1);
 290
 291   //AliTOFcalib *calib = new AliTOFcalib(); // AdC
 292
 293   //PH Arrays (moved outside of the loop)
 294   Float_t * trackPos[4];
 295   for (Int_t ii=0; ii<4; ii++) trackPos[ii] = new Float_t[nSteps];
 296   Int_t * clind = new Int_t[fN];
 297
 298   // Some init
 299   const Int_t kNclusterMax = 1000; // related to fN value
 300   AliTOFcluster *clusters[kNclusterMax];
 301   Int_t         index[kNclusterMax];
 302   Float_t       quality[kNclusterMax];
 303   Float_t       dist3D[kNclusterMax][6];
 304   Double_t      times[kNclusterMax][6];
 305   Float_t       mintimedist[kNclusterMax];
 306   Float_t       likelihood[kNclusterMax];
 307   Float_t       length[kNclusterMax];
 308   Double_t      tpcpid[5];
 309   dist3D[0][0]=1;
 310
 311   for (Int_t i=0; i<fNseedsTOF; i++) {
 312
 313     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(i);
 314     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(track->GetSeedIndex());
 315     Bool_t hasTime = ( (t->GetStatus()& AliESDtrack::kTIME)>0) ? kTRUE:kFALSE;   // did we integrate time
 316     Float_t trdquality = t->GetTRDQuality();
 317     //
 318     // Normalize tpc pid
 319     //
 320     t->GetTPCpid(tpcpid);
 321     Double_t sumpid=0;
 322     for (Int_t ipid=0;ipid<5;ipid++){
 323       sumpid+=tpcpid[ipid];
 324     }
 325     for (Int_t ipid=0;ipid<5;ipid++){
 326       if (sumpid>0) tpcpid[ipid]/=sumpid;
 327       else{
 328         tpcpid[ipid]=0.2;
 329       }
 330     }
 331
 332     if (trdquality<0) continue; // no chance
 333     //
 334     AliTOFtrack *trackTOFin =new AliTOFtrack(*track);
 335     //
 336     //propagat track to the middle of TOF
 337     //
 338     Float_t xs = 379.2;  // should be defined in the TOF geometry
 339     Double_t ymax=xs*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 340     Bool_t skip=kFALSE;
 341     Double_t ysect=trackTOFin->GetYat(xs,skip);
 342     if (skip){
 343       xs = 373.;
 344       ymax=xs*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 345       ysect=trackTOFin->GetYat(xs,skip);
 346     }
 347     if (ysect > ymax) {
 348       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 349         continue;
 350       }
 351     } else if (ysect <-ymax) {
 352       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 353         continue;
 354       }
 355     }
 356     if(!trackTOFin->PropagateTo(xs)) {
 357       continue;
 358     }
 359     //
 360     // Determine a window around the track
 361     //
 362     Double_t x,par[5];
 363     trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 364     Double_t cov[15];
 365     trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 366
 367     if (cov[0]<0. || cov[2]<0.) {
 368       AliWarning(Form("Very strange track (%d)! At least one of its covariance matrix diagonal elements is negative!",i));
 369       //delete trackTOFin;
 370       //continue;
 371     }
 372
 373     Float_t scalefact=3.;
 374     Double_t dphi=
 375       scalefact*
 376       ((5*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[0])) + 3.*fDy + 10.*TMath::Abs(par[2]))/fR);
 377     Double_t dz=
 378       scalefact*
 379       (5*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[2])) + 3.*fDz + 10.*TMath::Abs(par[3]));
 380
 381     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 382     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 383     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 384     Double_t z=par[1];
 385
 386     Int_t nc     =0;
 387     Int_t nfound =0;
 388     // find the clusters in the window of the track
 389
 390     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 391
 392       if (nc>=kNclusterMax) {
 393         AliWarning("No more matchable clusters can be stored! Please, increase the corresponding vectors size.");
 394         break;
 395       }
 396
 397       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 398       if (c->GetZ() > z+dz) break;
 399       //      if (c->IsUsed()) continue;
 400
 401       Double_t dph=TMath::Abs(c->GetPhi()-phi);
 402       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 403       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 404
 405       clind[nc] = k;
 406       nc++;
 407     }
 408
 409     AliDebug(1,Form(" Number of matchable TOF clusters for the track number %d: %d",i,nc));
 410
 411     //
 412     // select close clusters
 413     //
 414     Double_t mom=t->GetP();
 415     //    Bool_t dump = kTRUE;
 416     for (Int_t icl=0; icl<nc; icl++){
 417       Float_t distances[5];
 418
 419       index[nfound]=clind[icl];
 420       AliTOFcluster *cluster = fClusters[clind[icl]];
 421       GetLinearDistances(trackTOFin, cluster, distances);
 422       dist3D[nfound][0] = distances[4];
 423       dist3D[nfound][1] = distances[1];
 424       dist3D[nfound][2] = distances[2];
 425       // cut on distance
 426       if (TMath::Abs(dist3D[nfound][1])>20 || TMath::Abs(dist3D[nfound][2])>20) continue;
 427       //
 428       GetLikelihood(distances[1],distances[2],cov,trackTOFin, dist3D[nfound][3], dist3D[nfound][4]);
 429       //
 430       // cut on likelihood
 431       if (dist3D[nfound][3]*dist3D[nfound][4]<0.00000000000001) continue;  // log likelihood
 432       if (TMath::Log(dist3D[nfound][3]*dist3D[nfound][4])<-9) continue;  // log likelihood
 433       //
 434       clusters[nfound] = cluster;
 435       //
 436       //length and TOF updates
 437       trackTOFin->GetIntegratedTimes(times[nfound]);
 438       length[nfound] = trackTOFin->GetIntegratedLength();
 439       length[nfound]+=distances[4];
 440       mintimedist[nfound]=1000;
 441       Double_t tof2=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*cluster->GetTDC()+kTofOffset; // in ps
 442       // Float_t tgamma = TMath::Sqrt(cluster->GetR()*cluster->GetR()+cluster->GetZ()*cluster->GetZ())/0.03;  //time for "primary" gamma
 443       //if (trackTOFin->GetPt()<0.7 && TMath::Abs(tgamma-tof2)<350) continue;  // gamma conversion candidate - TEMPORARY
 444       for(Int_t j=0;j<=5;j++){
 445         Double_t mass=kMasses[j];
 446         times[nfound][j]+=distances[4]/3e-2*TMath::Sqrt(mom*mom+mass*mass)/mom;   // add time distance
 447         if ( TMath::Abs(times[nfound][j]-tof2)<mintimedist[nfound] && tpcpid[j]>kForbiddenR){
 448           mintimedist[nfound]=TMath::Abs(times[nfound][j]-tof2);
 449         }
 450       }
 451       //
 452       Float_t   liketime =  TMath::Exp(-mintimedist[nfound]/90.)+0.25*TMath::Exp(-mintimedist[nfound]/180.);
 453       if (!hasTime)  liketime=0.2;
 454       likelihood[nfound] = TMath::Log(dist3D[nfound][3]*dist3D[nfound][4]*liketime);
 455
 456       if (TMath::Log(dist3D[nfound][3]*dist3D[nfound][4])<-1){
 457         if (likelihood[nfound]<-9.) continue;
 458       }
 459       //
 460       nfound++;
 461     }
 462
 463     AliDebug(1,Form(" Number of track points for the track number %d: %d",i,nfound));
 464
 465     if (nfound == 0 ) {
 466       fnunmatch++;
 467       delete trackTOFin;
 468       continue;
 469     }
 470     //
 471     //choose the best cluster
 472     //
 473     //Float_t quality[kNclusterMax];
 474     //Int_t   index[kNclusterMax];
 475     for (Int_t kk=0; kk<kNclusterMax; kk++) quality[kk]=0;
 476     //
 477     AliTOFcluster * cgold=0;
 478     Int_t igold =-1;
 479     for (Int_t icl=0;icl<nfound;icl++){
 480       quality[icl] = dist3D[icl][3]*dist3D[icl][4];
 481     }
 482     TMath::Sort(nfound,quality,index,kTRUE);
 483     igold =  index[0];
 484     cgold =  clusters[igold];
 485     if (nfound>1 &&likelihood[index[1]]>likelihood[index[0]]){
 486       if ( quality[index[0]]<quality[index[1]]+0.5){
 487         igold = index[1];
 488         cgold =  clusters[igold];
 489       }
 490     }
 491     //
 492     //
 493     Float_t qualityGold = TMath::Log(0.0000001+(quality[igold]*(0.1+TMath::Exp(-mintimedist[igold]/80.))*(0.2+trdquality)));
 494     if (!mLastStep){
 495       if (cgold->GetQuality()<qualityGold) cgold->SetQuality(qualityGold);
 496       continue;
 497     }
 498     //
 499     if (mLastStep){
 500       //signed better cluster
 501       if (cgold->GetQuality()>qualityGold+kMaxQualityD) continue;
 502       if (2.*qualityGold-cgold->GetQuality()<kMinQuality) continue;
 503     }
 504
 505     Int_t inonfake=-1;
 506
 507     for (Int_t icl=0;icl<nfound;icl++){
 508       if (
 509           (clusters[index[icl]]->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 510           ||
 511           (clusters[index[icl]]->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 512           ||
 513           (clusters[index[icl]]->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 514           ) {
 515         inonfake = icl;
 516         break;
 517       }
 518     }
 519     fnmatch++;;
 520     if (inonfake==0) fngoodmatch++;
 521     else{
 522       fnbadmatch++;
 523     }
 524
 525     Int_t tlab[3];
 526     tlab[0]=cgold->GetLabel(0);
 527     tlab[1]=cgold->GetLabel(1);
 528     tlab[2]=cgold->GetLabel(2);
 529     //    Double_t tof2=25.*cgold->GetTDC()-350; // in ps
 530     Double_t tof2=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*cgold->GetTDC()+kTofOffset; // in ps
 531     Float_t tgamma = TMath::Sqrt(cgold->GetR()*cgold->GetR()+cgold->GetZ()*cgold->GetZ())/0.03;
 532     Float_t info[10]={dist3D[igold][0],
 533                       dist3D[igold][1],
 534                       dist3D[igold][2],
 535                       dist3D[igold][3],
 536                       dist3D[igold][4],
 537                       mintimedist[igold],
 538                       -1,
 539                       tgamma,
 540                       qualityGold,
 541                       cgold->GetQuality()};
 542     //    GetLinearDistances(trackTOFin,cgold,&info[6]);
 543     if (inonfake>=0){
 544       info[6] = inonfake;
 545       //      info[7] = mintimedist[index[inonfake]];
 546     }
 547     //
 548     //  Store quantities to be used for TOF Calibration
 549     Float_t tToT=cgold->GetToT(); // in ps
 550     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 551     Int_t ind[5];
 552     ind[0]=cgold->GetDetInd(0);
 553     ind[1]=cgold->GetDetInd(1);
 554     ind[2]=cgold->GetDetInd(2);
 555     ind[3]=cgold->GetDetInd(3);
 556     ind[4]=cgold->GetDetInd(4);
 557     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 558     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 559
 560     t->SetTOFInfo(info);
 561     t->SetTOFsignal(tof2);
 562     t->SetTOFcluster(cgold->GetIndex());
 563
 564     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 565                      i,
 566                      fnmatch-1,
 567                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 568                      tlab[0], tlab[1], tlab[2],
 569                      igold)); // AdC
 570
 571     AliTOFtrack *trackTOFout = new AliTOFtrack(*t);
 572     trackTOFout->PropagateTo(379.);
 573
 574     // Fill the track residual histograms.
 575     FillResiduals(trackTOFout,cgold,kFALSE);
 576
 577     t->UpdateTrackParams(trackTOFout,AliESDtrack::kTOFout);
 578     t->SetIntegratedLength(length[igold]);
 579     t->SetIntegratedTimes(times[igold]);
 580     t->SetTOFLabel(tlab);
 581     //
 582     delete trackTOFin;
 583     delete trackTOFout;
 584     //
 585   }
 586   //
 587   //
 588   //
 589   for (Int_t ii=0; ii<4; ii++) delete [] trackPos[ii];
 590   delete [] clind;
 591   //delete calib; // AdC
 592 }
 593 //_________________________________________________________________________
 594
 595 Int_t AliTOFtrackerMI::LoadClusters(TTree *cTree) {
 596   //--------------------------------------------------------------------
 597   //This function loads the TOF clusters
 598   //--------------------------------------------------------------------
 599
 600   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 601   if (!branch) {
 602     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 603     return 1;
 604   }
 605
 606   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 607   dummy.Clear();
 608   TClonesArray *clusters=&dummy;
 609   branch->SetAddress(&clusters);
 610
 611   cTree->GetEvent(0);
 612   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 613   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 614
 615   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 616     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 617
 618 //PH    fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 619     fClusters[i]=c; fN++;
 620
 621     //AliInfo(Form("%4i %4i  %f %f %f  %f %f   %2i %1i %2i %1i %2i",i, fClusters[i]->GetIndex(),fClusters[i]->GetZ(),fClusters[i]->GetR(),fClusters[i]->GetPhi(), fClusters[i]->GetTDC(),fClusters[i]->GetADC(),fClusters[i]->GetDetInd(0),fClusters[i]->GetDetInd(1),fClusters[i]->GetDetInd(2),fClusters[i]->GetDetInd(3),fClusters[i]->GetDetInd(4)));
 622     //AliInfo(Form("%i %f",i, fClusters[i]->GetZ()));
 623   }
 624
 625   //AliInfo(Form("Number of clusters: %d",fN));
 626
 627   return 0;
 628 }
 629 //_________________________________________________________________________
 630 void AliTOFtrackerMI::UnloadClusters() {
 631   //--------------------------------------------------------------------
 632   //This function unloads TOF clusters
 633   //--------------------------------------------------------------------
 634   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 635 //PH    delete fClusters[i];
 636     fClusters[i] = 0x0;
 637   }
 638   fN=0;
 639 }
 640
 641
 642
 643
 644 //_________________________________________________________________________
 645 Int_t AliTOFtrackerMI::InsertCluster(AliTOFcluster *c) {
 646   //--------------------------------------------------------------------
 647   //This function adds a cluster to the array of clusters sorted in Z
 648   //--------------------------------------------------------------------
 649   if (fN==kMaxCluster) {
 650     AliError("Too many clusters !");
 651     return 1;
 652   }
 653
 654   if (fN==0) {fClusters[fN++]=c; return 0;}
 655   Int_t i=FindClusterIndex(c->GetZ());
 656   memmove(fClusters+i+1 ,fClusters+i,(fN-i)*sizeof(AliTOFcluster*));
 657   fClusters[i]=c; fN++;
 658
 659   return 0;
 660 }
 661
 662 //_________________________________________________________________________
 663 Int_t AliTOFtrackerMI::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 664   //--------------------------------------------------------------------
 665   // This function returns the index of the nearest cluster
 666   //--------------------------------------------------------------------
 667   if (fN==0) return 0;
 668   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 669   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 670   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 671   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 672     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 673     else e=m;
 674   }
 675   return m;
 676 }
 677
 678 //_________________________________________________________________________
 679 Float_t AliTOFtrackerMI::GetLinearDistances(AliTOFtrack * track, AliTOFcluster *cluster, Float_t distances[5])
 680 {
 681   //
 682   // calclates distance between cluster and track
 683   // use linear aproximation
 684   //
 685   //const Float_t kRaddeg = 180/3.14159265358979312;
 686   const Float_t kRaddeg = TMath::RadToDeg();
 687   //
 688   //  Float_t tiltangle  = fGeom->GetAngles(cluster->fdetIndex[1],cluster->fdetIndex[2])/kRaddeg;  //tiltangle
 689   Int_t cind[5];
 690   cind[0]= cluster->GetDetInd(0);
 691   cind[1]= cluster->GetDetInd(1);
 692   cind[2]= cluster->GetDetInd(2);
 693   cind[3]= cluster->GetDetInd(3);
 694   cind[4]= cluster->GetDetInd(4);
 695   Float_t tiltangle  = AliTOFGeometry::GetAngles(cluster->GetDetInd(1),cluster->GetDetInd(2))/kRaddeg;  //tiltangle
 696
 697   Float_t cpos[3];  //cluster position
 698   Float_t cpos0[3];  //cluster position
 699   //  fGeom->GetPos(cluster->fdetIndex,cpos);
 700   //fGeom->GetPos(cluster->fdetIndex,cpos0);
 701   //
 702   fGeom->GetPos(cind,cpos);
 703   fGeom->GetPos(cind,cpos0);
 704
 705   Float_t phi = TMath::ATan2(cpos[1],cpos[0]);
 706   if(phi<0) phi=2.*TMath::Pi()+phi;
 707   //  Get the local angle in the sector philoc
 708   Float_t phiangle = (Int_t (phi*kRaddeg/20.) + 0.5)*20./kRaddeg;
 709   //
 710   Double_t v0[3];
 711   Double_t dir[3];
 712   track->GetXYZ(v0);
 713   track->GetPxPyPz(dir);
 714   dir[0]/=track->GetP();
 715   dir[1]/=track->GetP();
 716   dir[2]/=track->GetP();
 717   //
 718   //
 719   //rotate 0
 720   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle);
 721   Float_t cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 722   Float_t sinth  = TMath::Sin(tiltangle);
 723   Float_t costh  = TMath::Cos(tiltangle);
 724   //
 725   Float_t temp;
 726   temp    =  cpos[0]*cosphi+cpos[1]*sinphi;
 727   cpos[1] = -cpos[0]*sinphi+cpos[1]*cosphi;
 728   cpos[0] = temp;
 729   temp  =  v0[0]*cosphi+v0[1]*sinphi;
 730   v0[1] = -v0[0]*sinphi+v0[1]*cosphi;
 731   v0[0] = temp;
 732   //
 733   temp    =  cpos[0]*costh+cpos[2]*sinth;
 734   cpos[2] = -cpos[0]*sinth+cpos[2]*costh;
 735   cpos[0] = temp;
 736   temp   =  v0[0]*costh+v0[2]*sinth;
 737   v0[2]  = -v0[0]*sinth+v0[2]*costh;
 738   v0[0]  = temp;
 739   //
 740   //
 741   //rotate direction vector
 742   //
 743   temp   =  dir[0]*cosphi+dir[1]*sinphi;
 744   dir[1] = -dir[0]*sinphi+dir[1]*cosphi;
 745   dir[0] = temp;
 746   //
 747   temp   =  dir[0]*costh+dir[2]*sinth;
 748   dir[2] = -dir[0]*sinth+dir[2]*costh;
 749   dir[0] = temp;
 750   //
 751   Float_t v3[3];
 752   Float_t k = (cpos[0]-v0[0])/dir[0];
 753   v3[0] = v0[0]+k*dir[0];
 754   v3[1] = v0[1]+k*dir[1];
 755   v3[2] = v0[2]+k*dir[2];
 756   //
 757   distances[0] = v3[0]-cpos[0];
 758   distances[1] = v3[1]-cpos[1];
 759   distances[2] = v3[2]-cpos[2];
 760   distances[3] = TMath::Sqrt( distances[0]*distances[0]+distances[1]*distances[1]+distances[2]*distances[2]); //distance
 761   distances[4] = k;  //length
 762
 763   //
 764   // Debuging part of the matching
 765   //
 766   if (track->GetLabel()==cluster->GetLabel(0) ||
 767       track->GetLabel()==cluster->GetLabel(1) ||
 768       track->GetLabel()==cluster->GetLabel(2) ){
 769     TTreeSRedirector& cstream = *fDebugStreamer;
 770     Float_t tdc = cluster->GetTDC();
 771     cstream<<"Tracks"<<
 772       "TOF.="<<track<<
 773       "Cx="<<cpos0[0]<<
 774       "Cy="<<cpos0[1]<<
 775       "Cz="<<cpos0[2]<<
 776       "Dist="<<k<<
 777       "Dist0="<<distances[0]<<
 778       "Dist1="<<distances[1]<<
 779       "Dist2="<<distances[2]<<
 780       "TDC="<<tdc<<
 781       "\n";
 782   }
 783   return distances[3];
 784 }
 785
 786 //_________________________________________________________________________
 787 void    AliTOFtrackerMI::GetLikelihood(Float_t dy, Float_t dz, const Double_t *cov, AliTOFtrack * /*track*/, Float_t & py, Float_t &pz)
 788 {
 789   //
 790   //  get likelihood - track covariance taken
 791   //  75 % of gauss with expected sigma
 792   //  25 % of gauss with extended sigma
 793
 794   Double_t kMaxSigmaY  = 0.6;  // ~ 90% of TRD tracks
 795   Double_t kMaxSigmaZ  = 1.2;  // ~ 90% of TRD tracks
 796   Double_t kMeanSigmaY = 0.25; // mean TRD sigma
 797   Double_t kMeanSigmaZ = 0.5;  // mean TRD sigma
 798
 799
 800   Float_t normwidth, normd, p0,p1;
 801   Float_t sigmay = TMath::Max(TMath::Sqrt(cov[0]+kMeanSigmaY*kMeanSigmaY),kMaxSigmaY);
 802   Float_t sigmaz = TMath::Max(TMath::Sqrt(cov[2]+kMeanSigmaZ*kMeanSigmaZ),kMaxSigmaZ);
 803
 804   py=0;
 805   pz=0;
 806   //
 807   // py calculation   - 75% admixture of original sigma - 25% tails
 808   //
 809   normwidth = fDy/sigmay;
 810   normd     = dy/sigmay;
 811   p0 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd-normwidth*0.5));
 812   p1 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd+normwidth*0.5));
 813   py+= 0.75*(p1-p0);
 814   //
 815   normwidth = fDy/(3.*sigmay);
 816   normd     = dy/(3.*sigmay);
 817   p0 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd-normwidth*0.5));
 818   p1 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd+normwidth*0.5));
 819   py+= 0.25*(p1-p0);
 820   //
 821   // pz calculation   - 75% admixture of original sigma - 25% tails
 822   //
 823   normwidth = fDz/sigmaz;
 824   normd     = dz/sigmaz;
 825   p0 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd-normwidth*0.5));
 826   p1 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd+normwidth*0.5));
 827   pz+= 0.75*(p1-p0);
 828   //
 829   normwidth = fDz/(3.*sigmaz);
 830   normd     = dz/(3.*sigmaz);
 831   p0 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd-normwidth*0.5));
 832   p1 = 0.5*(1+TMath::Erf(normd+normwidth*0.5));
 833   pz+= 0.25*(p1-p0);
 834 }
 835 //_________________________________________________________________________
 836
 837 void AliTOFtrackerMI::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 838 {
 839   //
 840   // Returns the TOF cluster array
 841   //
 842
 843   if (fN==0)
 844     arr = 0x0;
 845   else
 846     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 847
 848 }