TOF/AliTOFtrackerV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 //--------------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                    //
  18 // AliTOFtrackerV1 Class                                              //
  19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
  20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
  21 //                                                                    //
  22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
  23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
  24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
  25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
  26 //                                                                    //
  27 //--------------------------------------------------------------------//
  28
  29 #include <Rtypes.h>
  30 #include <TROOT.h>
  31
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TTree.h>
  34 #include <TFile.h>
  35 #include <TH1F.h>
  36 #include <TH2F.h>
  37 #include <TSeqCollection.h>
  38
  39 #include "AliESDtrack.h"
  40 #include "AliESDEvent.h"
  41 #include "AliLog.h"
  42 #include "AliTrackPointArray.h"
  43 #include "AliGeomManager.h"
  44 #include "AliCDBManager.h"
  45
  46 #include "AliTOFRecoParam.h"
  47 #include "AliTOFReconstructor.h"
  48 #include "AliTOFcluster.h"
  49 #include "AliTOFGeometry.h"
  50 #include "AliTOFtrackerV1.h"
  51 #include "AliTOFtrack.h"
  52 #include "AliTOFpidESD.h"
  53
  54 extern TROOT *gROOT;
  55
  56 ClassImp(AliTOFtrackerV1)
  57
  58 //_____________________________________________________________________________
  59 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1():
  60   fRecoParam(0x0),
  61   fPid(0x0),
  62   fN(0),
  63   fNseeds(0),
  64   fNseedsTOF(0),
  65   fngoodmatch(0),
  66   fnbadmatch(0),
  67   fnunmatch(0),
  68   fnmatch(0),
  69   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  70   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
  71   fHDigClusMap(0x0),
  72   fHDigNClus(0x0),
  73   fHDigClusTime(0x0),
  74   fHDigClusToT(0x0),
  75   fHRecNClus(0x0),
  76   fHRecChi2(0x0),
  77   fHRecDistZ(0x0),
  78   fHRecSigYVsP(0x0),
  79   fHRecSigZVsP(0x0),
  80   fHRecSigYVsPWin(0x0),
  81   fHRecSigZVsPWin(0x0)
  82  {
  83   //AliTOFtrackerV1 main Ctor
  84
  85    InitCheckHists();
  86
  87 }
  88 //_____________________________________________________________________________
  89 AliTOFtrackerV1::~AliTOFtrackerV1() {
  90   //
  91   // Dtor
  92   //
  93
  94   SaveCheckHists();
  95
  96   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
  97     delete fRecoParam;
  98   }
  99   delete fPid;
 100   delete fHDigClusMap;
 101   delete fHDigNClus;
 102   delete fHDigClusTime;
 103   delete fHDigClusToT;
 104   delete fHRecNClus;
 105   delete fHRecChi2;
 106   delete fHRecDistZ;
 107   delete fHRecSigYVsP;
 108   delete fHRecSigZVsP;
 109   delete fHRecSigYVsPWin;
 110   delete fHRecSigZVsPWin;
 111   if (fTracks){
 112     fTracks->Delete();
 113     delete fTracks;
 114     fTracks=0x0;
 115   }
 116   if (fSeeds){
 117     fSeeds->Delete();
 118     delete fSeeds;
 119     fSeeds=0x0;
 120   }
 121 }
 122 //_____________________________________________________________________________
 123 Int_t AliTOFtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent* event) {
 124   //
 125   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 126   //
 127
 128   // initialize RecoParam for current event
 129   AliDebug(1,"Initializing params for TOF");
 130
 131   fRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 132
 133   if (fRecoParam == 0x0) {
 134     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 135   }
 136   //fRecoParam->Dump();
 137   //if(fRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fRecoParam=fRecoParam->GetPbPbparam();
 138   //fRecoParam->PrintParameters();
 139
 140   Double_t parPID[2];
 141   parPID[0]=fRecoParam->GetTimeResolution();
 142   parPID[1]=fRecoParam->GetTimeNSigma();
 143   fPid=new AliTOFpidESD(parPID);
 144
 145   //Initialise some counters
 146
 147   fNseeds=0;
 148   fNseedsTOF=0;
 149   fngoodmatch=0;
 150   fnbadmatch=0;
 151   fnunmatch=0;
 152   fnmatch=0;
 153
 154   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 155   fNseeds = ntrk;
 156   TClonesArray &aESDTrack = *fSeeds;
 157
 158
 159   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 160
 161   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 162     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 163     new(aESDTrack[i]) AliESDtrack(*t);
 164   }
 165
 166   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 167   CollectESD();
 168
 169   //Matching Step
 170   MatchTracks();
 171
 172   AliInfo(Form("Number of matched tracks = %d (good = %d, bad = %d)",fnmatch,fngoodmatch,fnbadmatch));
 173
 174   //Update the matched ESD tracks
 175
 176   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 177     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 178     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 179
 180     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
 181       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
 182       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
 183       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
 184         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
 185         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 186         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 187         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 188         t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
 189         t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
 190         t->SetTOFsignalDx(seed->GetTOFsignalDx());
 191         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 192         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 193         t->SetTOFLabel(tlab);
 194
 195         Double_t alphaA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetAlpha();
 196         Double_t xA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetX();
 197         Double_t yA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetY();
 198         Double_t zA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetZ();
 199         Double_t p1A = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetSnp();
 200         Double_t p2A = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetTgl();
 201         Double_t p3A = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetSigned1Pt();
 202         const Double_t *covA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetCovariance();
 203
 204         // Make attention, please:
 205         //      AliESDtrack::fTOFInfo array does not be stored in the AliESDs.root file
 206         //      it is there only for a check during the reconstruction step.
 207         Float_t info[10]={0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 208         seed->GetTOFInfo(info);
 209         t->SetTOFInfo(info);
 210         AliDebug(2,Form(" distance=%f; residual in the pad reference frame: dX=%f, dZ=%f", info[0],info[1],info[2]));
 211
 212         // Check done:
 213         //       by calling the AliESDtrack::UpdateTrackParams,
 214         //       the current track parameters are changed
 215         //       and it could cause refit problems.
 216         //       We need to update only the following track parameters:
 217         //            the track length and expected times.
 218         //       Removed AliESDtrack::UpdateTrackParams call
 219         //       Called AliESDtrack::SetIntegratedTimes(...) and
 220         //       AliESDtrack::SetIntegratedLength() routines.
 221         /*
 222           AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 223           t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout); // to be checked - AdC
 224           delete track;
 225           Double_t time[10]; t->GetIntegratedTimes(time);
 226         */
 227
 228         Double_t time[10]; seed->GetIntegratedTimes(time);
 229         t->SetIntegratedTimes(time);
 230
 231         Double_t length =  seed->GetIntegratedLength();
 232         t->SetIntegratedLength(length);
 233
 234         Double_t alphaB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetAlpha();
 235         Double_t xB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetX();
 236         Double_t yB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetY();
 237         Double_t zB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetZ();
 238         Double_t p1B = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetSnp();
 239         Double_t p2B = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetTgl();
 240         Double_t p3B = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetSigned1Pt();
 241         const Double_t *covB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetCovariance();
 242         AliDebug(2,"Track params -now(before)-:");
 243         AliDebug(2,Form("    X: %f(%f), Y: %f(%f), Z: %f(%f) --- alpha: %f(%f)",
 244                         xB,xA,
 245                         yB,yA,
 246                         zB,zA,
 247                         alphaB,alphaA));
 248         AliDebug(2,Form("    p1: %f(%f), p2: %f(%f), p3: %f(%f)",
 249                         p1B,p1A,
 250                         p2B,p2A,
 251                         p3B,p3A));
 252         AliDebug(2,Form("    cov1: %f(%f), cov2: %f(%f), cov3: %f(%f)"
 253                         " cov4: %f(%f), cov5: %f(%f), cov6: %f(%f)"
 254                         " cov7: %f(%f), cov8: %f(%f), cov9: %f(%f)"
 255                         " cov10: %f(%f), cov11: %f(%f), cov12: %f(%f)"
 256                         " cov13: %f(%f), cov14: %f(%f), cov15: %f(%f)",
 257                         covB[0],covA[0],
 258                         covB[1],covA[1],
 259                         covB[2],covA[2],
 260                         covB[3],covA[3],
 261                         covB[4],covA[4],
 262                         covB[5],covA[5],
 263                         covB[6],covA[6],
 264                         covB[7],covA[7],
 265                         covB[8],covA[8],
 266                         covB[9],covA[9],
 267                         covB[10],covA[10],
 268                         covB[11],covA[11],
 269                         covB[12],covA[12],
 270                         covB[13],covA[13],
 271                         covB[14],covA[14]
 272                         ));
 273         AliDebug(3,Form(" %6d  %f %f %f %f % %6d %3d %f  %f %f %f %f %f",
 274                         i,
 275                         t->GetTOFsignalRaw(),
 276                         t->GetTOFsignal(),
 277                         t->GetTOFsignalToT(),
 278                         t->GetTOFsignalDz(),
 279                         t->GetTOFsignalDx(),
 280                         t->GetTOFCalChannel(),
 281                         t->GetTOFcluster(),
 282                         t->GetIntegratedLength(),
 283                         time[0], time[1], time[2], time[3], time[4]
 284                         )
 285                  );
 286       }
 287     }
 288   }
 289
 290   //Handle Time Zero information
 291
 292   Double_t timeZero=0.;
 293   Double_t timeZeroMax=99999.;
 294   Bool_t usetimeZero     = fRecoParam->UseTimeZero();
 295   Bool_t timeZeroFromT0  = fRecoParam->GetTimeZerofromT0();
 296   Bool_t timeZeroFromTOF = fRecoParam->GetTimeZerofromTOF();
 297
 298   AliDebug(2,Form("Use Time Zero?: %d",usetimeZero));
 299   AliDebug(2,Form("Time Zero from T0? : %d",timeZeroFromT0));
 300   AliDebug(2,Form("Time Zero From TOF? : %d",timeZeroFromTOF));
 301
 302   if(usetimeZero){
 303     if(timeZeroFromT0){
 304       timeZero=GetTimeZerofromT0(event);
 305     }
 306     if(timeZeroFromTOF && (timeZero>timeZeroMax || !timeZeroFromT0)){
 307       timeZero=GetTimeZerofromTOF(event);
 308     }
 309   }
 310   AliDebug(2,Form("time Zero used in PID: %f",timeZero));
 311   //Make TOF PID
 312   fPid->MakePID(event,timeZero);
 313
 314   fSeeds->Clear();
 315   fTracks->Clear();
 316   return 0;
 317
 318 }
 319 //_________________________________________________________________________
 320 void AliTOFtrackerV1::CollectESD() {
 321    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 322
 323   Int_t seedsTOF1=0;
 324   Int_t seedsTOF2=0;
 325
 326   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 327   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 328
 329     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 330     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 331
 332     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 333     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
 334
 335     // TRD 'good' tracks, already propagated at 371 cm
 336     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 337          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
 338       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 339
 340         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 341                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 342                         x, (Float_t)track->GetX()));
 343
 344         track->SetSeedIndex(i);
 345         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 346         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 347         fNseedsTOF++;
 348         seedsTOF1++;
 349       }
 350       delete track;
 351     }
 352
 353     // Propagate the rest of TPCbp
 354     else {
 355       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 356
 357         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 358                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 359                         x, (Float_t)track->GetX()));
 360
 361         track->SetSeedIndex(i);
 362         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 363         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 364         fNseedsTOF++;
 365         seedsTOF2++;
 366       }
 367       delete track;
 368     }
 369   }
 370
 371   AliInfo(Form("Number of TOF seeds = %d (Type 1 = %d, Type 2 = %d)",fNseedsTOF,seedsTOF1,seedsTOF2));
 372
 373   // Sort according uncertainties on track position
 374   fTracks->Sort();
 375
 376 }
 377 //_________________________________________________________________________
 378 void AliTOFtrackerV1::MatchTracks( ){
 379   //
 380   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 381   //
 382
 383
 384   // Parameters regulating the reconstruction
 385   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad();
 386   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad();
 387
 388   const Float_t kTimeOffset = 32.; // time offset for tracking algorithm [ps]
 389
 390   const Int_t kncmax = 100;
 391   Float_t sensRadius = fRecoParam->GetSensRadius();
 392   Float_t scaleFact   = fRecoParam->GetWindowScaleFact();
 393   Float_t dyMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxY();
 394   Float_t dzMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
 395   Double_t maxChi2=fRecoParam->GetMaxChi2();
 396   Bool_t timeWalkCorr    = fRecoParam->GetTimeWalkCorr();
 397   AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
 398   AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
 399   AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
 400   AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
 401   AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
 402   AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
 403   AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));
 404
 405
 406   //The matching loop
 407   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
 408
 409     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
 410     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(track->GetSeedIndex());
 411     //if ( t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
 412     if ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) continue;
 413     AliTOFtrack *trackTOFin =new AliTOFtrack(*track);
 414
 415     // Determine a window around the track
 416     Double_t x,par[5]; trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 417     Double_t cov[15]; trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 418
 419     if (cov[0]<0. || cov[2]<0.) {
 420       AliWarning(Form("Very strange track (%d)! At least one of its covariance matrix diagonal elements is negative!",iseed));
 421       //delete trackTOFin;
 422       //continue;
 423     }
 424
 425     Double_t z    = par[1];
 426     Double_t dz   =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[2])+dZ*dZ/12.);
 427     Double_t dphi =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[0])+dY*dY/12.)/sensRadius;
 428
 429     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 430     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 431     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 432
 433     //upper limit on window's size.
 434     if(dz> dzMax) dz=dzMax;
 435     if(dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
 436
 437     // find the clusters inside the selected window
 438     Int_t nc=0;
 439     AliTOFcluster *clusters[kncmax]; // pointers to the clusters in the window
 440     Int_t index[kncmax];//to keep track of the cluster index
 441     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 442       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 443       //      if(nc>kncmax)break; /* R+ fix (buffer overflow) */
 444       if (nc>=kncmax) {
 445         AliWarning("No more matchable clusters can be stored! Please, increase the corresponding vectors size.");
 446         break; /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 447       }
 448       if(c->GetZ() > z+dz) break;
 449       if(c->IsUsed()) continue;
 450       if(!c->GetStatus()) {
 451         AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
 452         continue; // skip bad channels as declared in OCDB
 453       }
 454       Float_t xyz[3]; c->GetGlobalXYZ(xyz);
 455       Double_t clPhi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 456       Double_t dph=TMath::Abs(clPhi-phi);
 457       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 458       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 459       clusters[nc]=c;
 460       index[nc] = k;
 461       nc++;
 462     }
 463
 464     AliDebug(1,Form(" Number of matchable TOF clusters for the track number %d: %d",iseed,nc));
 465
 466     //start propagation: go to the average TOF pad middle plane at ~379.5 cm
 467
 468     Float_t  xTOF = sensRadius;
 469     Double_t ymax = xTOF*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 470     Bool_t skip = kFALSE;
 471     Double_t ysect = trackTOFin->GetYat(xTOF,skip);
 472     if (skip) break;
 473     if (ysect > ymax) {
 474       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 475         break;
 476       }
 477     } else if (ysect <-ymax) {
 478       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 479         break;
 480       }
 481     }
 482     if(!trackTOFin->PropagateTo(xTOF)) {
 483       break;
 484     }
 485
 486
 487     AliTOFcluster *bestCluster=0;
 488     Double_t bestChi2=maxChi2;
 489     Int_t idclus=-1;
 490     //    for (Int_t i=0; i<nc; i++){ /* R+ fix (unsafe) */
 491     for (Int_t i=0; i<nc && i<kncmax; i++){ /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 492       AliTOFcluster *c=clusters[i];  // one of the preselected clusters
 493       Double_t chi2=trackTOFin->GetPredictedChi2((AliCluster3D*)c);
 494       if (chi2 >= bestChi2) continue;
 495       bestChi2=chi2;
 496       bestCluster=c;
 497       idclus=index[i];
 498     }
 499
 500     if (!bestCluster) {  // no matching , go to the next track
 501       fnunmatch++;
 502       delete trackTOFin;
 503       continue;
 504     }
 505
 506     fnmatch++;
 507
 508     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 509                      iseed,
 510                      fnmatch-1,
 511                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 512                      bestCluster->GetLabel(0),
 513                      bestCluster->GetLabel(1),
 514                      bestCluster->GetLabel(2),
 515                      idclus)); // AdC
 516
 517     bestCluster->Use();
 518     if (
 519         (bestCluster->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 520         ||
 521         (bestCluster->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 522         ||
 523         (bestCluster->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 524         ) {
 525       fngoodmatch++;
 526        AliDebug(2,Form(" track label good %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 527
 528     }
 529     else{
 530       fnbadmatch++;
 531       AliDebug(2,Form(" track label bad %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 532     }
 533
 534     //Propagate the track to the best matched cluster
 535     trackTOFin->PropagateTo(bestCluster);
 536
 537     // Fill the track residual histograms.
 538     FillResiduals(trackTOFin,bestCluster,kFALSE);
 539
 540     //now take the local distance in Z from the pad center for time walk correction
 541     Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(bestCluster->GetDetInd(1),bestCluster->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 542     Double_t dzTW=trackTOFin->GetZ()-bestCluster->GetZ(); // in cm - in the ALICE RF -
 543     dzTW/=TMath::Cos(tiltangle); // from ALICE/tracking RF to pad RF (1)
 544     dzTW=-dzTW; // from ALICE/tracking RF to pad RF (2)
 545     if (tiltangle!=0.) AliDebug(2,Form(" rho_track = %f --- rho_cluster = %f ",trackTOFin->GetX(),bestCluster->GetX()));
 546
 547     //update the ESD track and delete the TOFtrack
 548     t->UpdateTrackParams(trackTOFin,AliESDtrack::kTOFout);
 549
 550     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
 551     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*bestCluster->GetToT()*1E-3; // in ns
 552     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 553     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDCRAW()+kTimeOffset; // RAW time,in ps
 554     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
 555     t->SetTOFsignalDz(dzTW);
 556
 557     Float_t deltaY = trackTOFin->GetY()-bestCluster->GetY();
 558     t->SetTOFsignalDx(deltaY);
 559
 560     Float_t distR = (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX())*
 561       (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX());
 562     distR+=deltaY*deltaY;
 563     distR+=dzTW*dzTW;
 564     distR = TMath::Sqrt(distR);
 565     Float_t info[10] = {distR, deltaY, dzTW,
 566                         0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 567     t->SetTOFInfo(info);
 568
 569     Int_t ind[5];
 570     ind[0]=bestCluster->GetDetInd(0);
 571     ind[1]=bestCluster->GetDetInd(1);
 572     ind[2]=bestCluster->GetDetInd(2);
 573     ind[3]=bestCluster->GetDetInd(3);
 574     ind[4]=bestCluster->GetDetInd(4);
 575     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 576     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 577
 578     // keep track of the track labels in the matched cluster
 579     Int_t tlab[3];
 580     tlab[0]=bestCluster->GetLabel(0);
 581     tlab[1]=bestCluster->GetLabel(1);
 582     tlab[2]=bestCluster->GetLabel(2);
 583     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %6d = ",bestCluster->GetTDC()));
 584     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDC()+kTimeOffset; // in ps
 585     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
 586     Double_t tofcorr=tof;
 587     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(dzTW,tof);
 588     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));
 589     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
 590     t->SetTOFsignal(tofcorr);
 591     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
 592     t->SetTOFLabel(tlab);
 593
 594     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f  z distance: %f  corrected time: %f",rawTime,dzTW,tofcorr));
 595
 596     Double_t mom=t->GetP();
 597     AliDebug(2,Form(" Momentum for track %d -> %f", iseed,mom));
 598     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
 599     fHRecNClus->Fill(nc);
 600     fHRecChi2->Fill(bestChi2);
 601     fHRecDistZ->Fill(dzTW);
 602     fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
 603     fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
 604     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
 605     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
 606
 607     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
 608     // no longer there - all info is in the ESDs now
 609
 610     delete trackTOFin;
 611   }
 612
 613 }
 614 //_________________________________________________________________________
 615 Int_t AliTOFtrackerV1::LoadClusters(TTree *cTree) {
 616   //--------------------------------------------------------------------
 617   //This function loads the TOF clusters
 618   //--------------------------------------------------------------------
 619
 620   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
 621   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
 622   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 623   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 624   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 625
 626   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 627   if (!branch) {
 628     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 629     return 1;
 630   }
 631
 632   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 633   dummy.Clear();
 634   TClonesArray *clusters=&dummy;
 635   branch->SetAddress(&clusters);
 636
 637   cTree->GetEvent(0);
 638   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 639   fHDigNClus->Fill(nc);
 640
 641   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 642
 643   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 644     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 645 //PH    fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 646     fClusters[i]=c; fN++;
 647
 648   // Fill Digits QA histos
 649
 650     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
 651     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
 652     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
 653     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
 654     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
 655
 656     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
 657     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
 658
 659     Int_t stripOffset = 0;
 660     switch (iplate) {
 661     case 0:
 662       stripOffset = 0;
 663       break;
 664     case 1:
 665       stripOffset = nStripC;
 666       break;
 667     case 2:
 668       stripOffset = nStripC+nStripB;
 669       break;
 670     case 3:
 671       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 672       break;
 673     case 4:
 674       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 675       break;
 676     default:
 677       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 678       break;
 679     };
 680     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
 681     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
 682     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
 683     fHDigClusTime->Fill(time);
 684     fHDigClusToT->Fill(tot);
 685   }
 686
 687
 688   return 0;
 689 }
 690 //_________________________________________________________________________
 691 void AliTOFtrackerV1::UnloadClusters() {
 692   //--------------------------------------------------------------------
 693   //This function unloads TOF clusters
 694   //--------------------------------------------------------------------
 695   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 696 //PH    delete fClusters[i];
 697     fClusters[i] = 0x0;
 698   }
 699   fN=0;
 700 }
 701
 702 //_________________________________________________________________________
 703 Int_t AliTOFtrackerV1::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 704   //--------------------------------------------------------------------
 705   // This function returns the index of the nearest cluster
 706   //--------------------------------------------------------------------
 707   //MOD
 708   //Here we need to get the Z in the tracking system
 709
 710   if (fN==0) return 0;
 711   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 712   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 713   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 714   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 715     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 716     else e=m;
 717   }
 718   return m;
 719 }
 720
 721 //_________________________________________________________________________
 722 Bool_t AliTOFtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
 723 {
 724   // Get track space point with index i
 725   // Coordinates are in the global system
 726   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
 727   Float_t xyz[3];
 728   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
 729   Float_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 730   Float_t phiangle = (Int_t(phi*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
 731   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 732   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 733   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
 734   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
 735   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 736   Float_t cov[6];
 737   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 738   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 739   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
 740   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 741   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
 742   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
 743   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
 744
 745   // Detector numbering scheme
 746   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
 747   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
 748   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 749   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 750   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 751
 752   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
 753   if (isector >= nSector)
 754     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
 755   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
 756   if (iplate >= nPlate)
 757     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 758   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
 759
 760   Int_t stripOffset = 0;
 761   switch (iplate) {
 762   case 0:
 763     stripOffset = 0;
 764     break;
 765   case 1:
 766     stripOffset = nStripC;
 767     break;
 768   case 2:
 769     stripOffset = nStripC+nStripB;
 770     break;
 771   case 3:
 772     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 773     break;
 774   case 4:
 775     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 776     break;
 777   default:
 778     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 779     break;
 780   };
 781
 782   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
 783                stripOffset +
 784                istrip;
 785   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
 786   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
 787   return kTRUE;
 788 }
 789 //_________________________________________________________________________
 790 void AliTOFtrackerV1::InitCheckHists() {
 791
 792   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
 793
 794   TDirectory *dir = gDirectory;
 795   TFile *logFileTOF = 0;
 796
 797   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 798   int n = list->GetEntries();
 799   Bool_t isThere=kFALSE;
 800   for(int i=0; i<n; i++) {
 801     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 802     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 803       isThere=kTRUE;
 804       break;
 805     }
 806   }
 807
 808   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
 809   logFileTOF->cd();
 810
 811   //Digits "QA"
 812   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);
 813   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);
 814   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);
 815   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);
 816
 817   //Reco "QA"
 818   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
 819   fHRecDistZ=new TH1F("TOFRec_DistZ", "",50,0.5,10.5);
 820   fHRecChi2=new TH1F("TOFRec_Chi2", "",100,0.,10.);
 821   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 822   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 823   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 824   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 825
 826   dir->cd();
 827
 828 }
 829
 830 //_________________________________________________________________________
 831 void AliTOFtrackerV1::SaveCheckHists() {
 832
 833   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
 834
 835   TDirectory *dir = gDirectory;
 836   TFile *logFile = 0;
 837   TFile *logFileTOF = 0;
 838
 839   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 840   int n = list->GetEntries();
 841   for(int i=0; i<n; i++) {
 842     logFile = (TFile*)list->At(i);
 843     if (strstr(logFile->GetName(), "AliESDs.root")) break;
 844   }
 845
 846   Bool_t isThere=kFALSE;
 847   for(int i=0; i<n; i++) {
 848     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 849     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 850       isThere=kTRUE;
 851       break;
 852     }
 853   }
 854
 855   if(!isThere) {
 856           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
 857           return;
 858   }
 859   logFile->cd();
 860   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
 861   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 862   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
 863   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
 864   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 865   fHRecChi2->Write(fHRecChi2->GetName(), TObject::kOverwrite);
 866   fHRecDistZ->Write(fHRecDistZ->GetName(), TObject::kOverwrite);
 867   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 868   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 869   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 870   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 871   logFile->Flush();
 872
 873   dir->cd();
 874
 875   }
 876 //_________________________________________________________________________
 877 Float_t AliTOFtrackerV1::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) {
 878
 879   //dummy, for the moment
 880   Float_t tofcorr=0.;
 881   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
 882     tofcorr=tof;
 883     //place here the actual correction
 884   }else{
 885     tofcorr=tof;
 886   }
 887   return tofcorr;
 888 }
 889 //_________________________________________________________________________
 890 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromT0(AliESDEvent *event) const {
 891
 892   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
 893
 894   return event->GetT0();
 895 }
 896 //_________________________________________________________________________
 897 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
 898
 899   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
 900   {
 901     //place T0 algo here...
 902   }
 903   return 0.;
 904 }
 905 //_________________________________________________________________________
 906
 907 void AliTOFtrackerV1::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 908 {
 909   //
 910   // Returns the TOF cluster array
 911   //
 912
 913   if (fN==0)
 914     arr = 0x0;
 915   else
 916     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 917
 918 }