TOF/AliTOFtrackerV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 //--------------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                    //
  18 // AliTOFtrackerV1 Class                                              //
  19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
  20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
  21 //                                                                    //
  22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
  23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
  24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
  25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
  26 //                                                                    //
  27 //--------------------------------------------------------------------//
  28
  29 #include <Rtypes.h>
  30 #include <TROOT.h>
  31
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TTree.h>
  34 #include <TFile.h>
  35 #include <TH1F.h>
  36 #include <TH2F.h>
  37 #include <TSeqCollection.h>
  38
  39 #include "AliESDtrack.h"
  40 #include "AliESDEvent.h"
  41 #include "AliLog.h"
  42 #include "AliTrackPointArray.h"
  43 #include "AliGeomManager.h"
  44 #include "AliCDBManager.h"
  45
  46 #include "AliTOFRecoParam.h"
  47 #include "AliTOFReconstructor.h"
  48 #include "AliTOFcluster.h"
  49 #include "AliTOFGeometry.h"
  50 #include "AliTOFtrackerV1.h"
  51 #include "AliTOFtrack.h"
  52 #include "AliTOFpidESD.h"
  53
  54 extern TROOT *gROOT;
  55
  56 ClassImp(AliTOFtrackerV1)
  57
  58 //_____________________________________________________________________________
  59 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1():
  60   fRecoParam(0x0),
  61   fPid(0x0),
  62   fN(0),
  63   fNseeds(0),
  64   fNseedsTOF(0),
  65   fngoodmatch(0),
  66   fnbadmatch(0),
  67   fnunmatch(0),
  68   fnmatch(0),
  69   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  70   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
  71   fHDigClusMap(0x0),
  72   fHDigNClus(0x0),
  73   fHDigClusTime(0x0),
  74   fHDigClusToT(0x0),
  75   fHRecNClus(0x0),
  76   fHRecChi2(0x0),
  77   fHRecDistZ(0x0),
  78   fHRecSigYVsP(0x0),
  79   fHRecSigZVsP(0x0),
  80   fHRecSigYVsPWin(0x0),
  81   fHRecSigZVsPWin(0x0)
  82  {
  83   //AliTOFtrackerV1 main Ctor
  84
  85    InitCheckHists();
  86
  87 }
  88 //_____________________________________________________________________________
  89 AliTOFtrackerV1::~AliTOFtrackerV1() {
  90   //
  91   // Dtor
  92   //
  93
  94   SaveCheckHists();
  95
  96   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
  97     delete fRecoParam;
  98   }
  99   delete fPid;
 100   delete fHDigClusMap;
 101   delete fHDigNClus;
 102   delete fHDigClusTime;
 103   delete fHDigClusToT;
 104   delete fHRecNClus;
 105   delete fHRecChi2;
 106   delete fHRecDistZ;
 107   delete fHRecSigYVsP;
 108   delete fHRecSigZVsP;
 109   delete fHRecSigYVsPWin;
 110   delete fHRecSigZVsPWin;
 111   if (fTracks){
 112     fTracks->Delete();
 113     delete fTracks;
 114     fTracks=0x0;
 115   }
 116   if (fSeeds){
 117     fSeeds->Delete();
 118     delete fSeeds;
 119     fSeeds=0x0;
 120   }
 121 }
 122 //_____________________________________________________________________________
 123 Int_t AliTOFtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent* event) {
 124   //
 125   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 126   //
 127
 128   // initialize RecoParam for current event
 129
 130   AliInfo("Initializing params for TOF... ");
 131
 132   fRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 133
 134   if (fRecoParam == 0x0) {
 135     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 136   }
 137   //fRecoParam->Dump();
 138   //if(fRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fRecoParam=fRecoParam->GetPbPbparam();
 139   //fRecoParam->PrintParameters();
 140
 141   Double_t parPID[2];
 142   parPID[0]=fRecoParam->GetTimeResolution();
 143   parPID[1]=fRecoParam->GetTimeNSigma();
 144   fPid=new AliTOFpidESD(parPID);
 145
 146   //Initialise some counters
 147
 148   fNseeds=0;
 149   fNseedsTOF=0;
 150   fngoodmatch=0;
 151   fnbadmatch=0;
 152   fnunmatch=0;
 153   fnmatch=0;
 154
 155   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 156   fNseeds = ntrk;
 157   TClonesArray &aESDTrack = *fSeeds;
 158
 159
 160   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 161
 162   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 163     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 164     new(aESDTrack[i]) AliESDtrack(*t);
 165   }
 166
 167   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 168   CollectESD();
 169
 170   //Matching Step
 171   MatchTracks();
 172
 173   AliInfo(Form("Number of matched tracks = %d (good = %d, bad = %d)",fnmatch,fngoodmatch,fnbadmatch));
 174
 175   //Update the matched ESD tracks
 176
 177   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 178     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 179     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 180
 181     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
 182       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
 183       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
 184       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
 185         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
 186         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 187         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 188         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 189         t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
 190         t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
 191         t->SetTOFsignalDx(seed->GetTOFsignalDx());
 192         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 193         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 194         t->SetTOFLabel(tlab);
 195
 196         Double_t alphaA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetAlpha();
 197         Double_t xA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetX();
 198         Double_t yA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetY();
 199         Double_t zA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetZ();
 200         Double_t p1A = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetSnp();
 201         Double_t p2A = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetTgl();
 202         Double_t p3A = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetSigned1Pt();
 203         const Double_t *covA = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetCovariance();
 204
 205         // Make attention, please:
 206         //      AliESDtrack::fTOFInfo array does not be stored in the AliESDs.root file
 207         //      it is there only for a check during the reconstruction step.
 208         Float_t info[10]={0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 209         seed->GetTOFInfo(info);
 210         t->SetTOFInfo(info);
 211         AliDebug(2,Form(" distance=%f; residual in the pad reference frame: dX=%f, dZ=%f", info[0],info[1],info[2]));
 212
 213         // Check done:
 214         //       by calling the AliESDtrack::UpdateTrackParams,
 215         //       the current track parameters are changed
 216         //       and it could cause refit problems.
 217         //       We need to update only the following track parameters:
 218         //            the track length and expected times.
 219         //       Removed AliESDtrack::UpdateTrackParams call
 220         //       Called AliESDtrack::SetIntegratedTimes(...) and
 221         //       AliESDtrack::SetIntegratedLength() routines.
 222         /*
 223           AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 224           t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout); // to be checked - AdC
 225           delete track;
 226           Double_t time[10]; t->GetIntegratedTimes(time);
 227         */
 228
 229         Double_t time[10]; seed->GetIntegratedTimes(time);
 230         t->SetIntegratedTimes(time);
 231
 232         Double_t length =  seed->GetIntegratedLength();
 233         t->SetIntegratedLength(length);
 234
 235         Double_t alphaB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetAlpha();
 236         Double_t xB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetX();
 237         Double_t yB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetY();
 238         Double_t zB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetZ();
 239         Double_t p1B = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetSnp();
 240         Double_t p2B = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetTgl();
 241         Double_t p3B = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetSigned1Pt();
 242         const Double_t *covB = dynamic_cast<AliExternalTrackParam*>(t)->GetCovariance();
 243         AliDebug(2,"Track params -now(before)-:");
 244         AliDebug(2,Form("    X: %f(%f), Y: %f(%f), Z: %f(%f) --- alpha: %f(%f)",
 245                         xB,xA,
 246                         yB,yA,
 247                         zB,zA,
 248                         alphaB,alphaA));
 249         AliDebug(2,Form("    p1: %f(%f), p2: %f(%f), p3: %f(%f)",
 250                         p1B,p1A,
 251                         p2B,p2A,
 252                         p3B,p3A));
 253         AliDebug(2,Form("    cov1: %f(%f), cov2: %f(%f), cov3: %f(%f)"
 254                         " cov4: %f(%f), cov5: %f(%f), cov6: %f(%f)"
 255                         " cov7: %f(%f), cov8: %f(%f), cov9: %f(%f)"
 256                         " cov10: %f(%f), cov11: %f(%f), cov12: %f(%f)"
 257                         " cov13: %f(%f), cov14: %f(%f), cov15: %f(%f)",
 258                         covB[0],covA[0],
 259                         covB[1],covA[1],
 260                         covB[2],covA[2],
 261                         covB[3],covA[3],
 262                         covB[4],covA[4],
 263                         covB[5],covA[5],
 264                         covB[6],covA[6],
 265                         covB[7],covA[7],
 266                         covB[8],covA[8],
 267                         covB[9],covA[9],
 268                         covB[10],covA[10],
 269                         covB[11],covA[11],
 270                         covB[12],covA[12],
 271                         covB[13],covA[13],
 272                         covB[14],covA[14]
 273                         ));
 274         AliDebug(3,Form(" %6d  %f %f %f %f % %6d %3d %f  %f %f %f %f %f",
 275                         i,
 276                         t->GetTOFsignalRaw(),
 277                         t->GetTOFsignal(),
 278                         t->GetTOFsignalToT(),
 279                         t->GetTOFsignalDz(),
 280                         t->GetTOFsignalDx(),
 281                         t->GetTOFCalChannel(),
 282                         t->GetTOFcluster(),
 283                         t->GetIntegratedLength(),
 284                         time[0], time[1], time[2], time[3], time[4]
 285                         )
 286                  );
 287       }
 288     }
 289   }
 290
 291   //Handle Time Zero information
 292
 293   Double_t timeZero=0.;
 294   Double_t timeZeroMax=99999.;
 295   Bool_t usetimeZero     = fRecoParam->UseTimeZero();
 296   Bool_t timeZeroFromT0  = fRecoParam->GetTimeZerofromT0();
 297   Bool_t timeZeroFromTOF = fRecoParam->GetTimeZerofromTOF();
 298
 299   AliDebug(2,Form("Use Time Zero?: %d",usetimeZero));
 300   AliDebug(2,Form("Time Zero from T0? : %d",timeZeroFromT0));
 301   AliDebug(2,Form("Time Zero From TOF? : %d",timeZeroFromTOF));
 302
 303   if(usetimeZero){
 304     if(timeZeroFromT0){
 305       timeZero=GetTimeZerofromT0(event);
 306     }
 307     if(timeZeroFromTOF && (timeZero>timeZeroMax || !timeZeroFromT0)){
 308       timeZero=GetTimeZerofromTOF(event);
 309     }
 310   }
 311   AliDebug(2,Form("time Zero used in PID: %f",timeZero));
 312   //Make TOF PID
 313   fPid->MakePID(event,timeZero);
 314
 315   fSeeds->Clear();
 316   fTracks->Clear();
 317   return 0;
 318
 319 }
 320 //_________________________________________________________________________
 321 void AliTOFtrackerV1::CollectESD() {
 322    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 323
 324   Int_t seedsTOF1=0;
 325   Int_t seedsTOF2=0;
 326
 327   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 328   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 329
 330     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 331     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 332
 333     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 334     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
 335
 336     // TRD 'good' tracks, already propagated at 371 cm
 337     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 338          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
 339       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 340
 341         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 342                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 343                         x, (Float_t)track->GetX()));
 344
 345         track->SetSeedIndex(i);
 346         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 347         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 348         fNseedsTOF++;
 349         seedsTOF1++;
 350       }
 351       delete track;
 352     }
 353
 354     // Propagate the rest of TPCbp
 355     else {
 356       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 357
 358         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 359                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 360                         x, (Float_t)track->GetX()));
 361
 362         track->SetSeedIndex(i);
 363         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 364         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 365         fNseedsTOF++;
 366         seedsTOF2++;
 367       }
 368       delete track;
 369     }
 370   }
 371
 372   AliInfo(Form("Number of TOF seeds = %d (Type 1 = %d, Type 2 = %d)",fNseedsTOF,seedsTOF1,seedsTOF2));
 373
 374   // Sort according uncertainties on track position
 375   fTracks->Sort();
 376
 377 }
 378 //_________________________________________________________________________
 379 void AliTOFtrackerV1::MatchTracks( ){
 380   //
 381   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 382   //
 383
 384
 385   // Parameters regulating the reconstruction
 386   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad();
 387   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad();
 388
 389   const Float_t kTimeOffset = 32.; // time offset for tracking algorithm [ps]
 390
 391   const Int_t kncmax = 100;
 392   Float_t sensRadius = fRecoParam->GetSensRadius();
 393   Float_t scaleFact   = fRecoParam->GetWindowScaleFact();
 394   Float_t dyMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxY();
 395   Float_t dzMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
 396   Double_t maxChi2=fRecoParam->GetMaxChi2();
 397   Bool_t timeWalkCorr    = fRecoParam->GetTimeWalkCorr();
 398   AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
 399   AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
 400   AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
 401   AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
 402   AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
 403   AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
 404   AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));
 405
 406
 407   //The matching loop
 408   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
 409
 410     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
 411     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(track->GetSeedIndex());
 412     //if ( t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
 413     if ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) continue;
 414     AliTOFtrack *trackTOFin =new AliTOFtrack(*track);
 415
 416     // Determine a window around the track
 417     Double_t x,par[5]; trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 418     Double_t cov[15]; trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 419
 420     if (cov[0]<0. || cov[2]<0.) {
 421       AliWarning(Form("Very strange track (%d)! At least one of its covariance matrix diagonal elements is negative!",iseed));
 422       //delete trackTOFin;
 423       //continue;
 424     }
 425
 426     Double_t z    = par[1];
 427     Double_t dz   =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[2])+dZ*dZ/12.);
 428     Double_t dphi =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[0])+dY*dY/12.)/sensRadius;
 429
 430     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 431     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 432     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 433
 434     //upper limit on window's size.
 435     if(dz> dzMax) dz=dzMax;
 436     if(dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
 437
 438     // find the clusters inside the selected window
 439     Int_t nc=0;
 440     AliTOFcluster *clusters[kncmax]; // pointers to the clusters in the window
 441     Int_t index[kncmax];//to keep track of the cluster index
 442     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 443       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 444       //      if(nc>kncmax)break; /* R+ fix (buffer overflow) */
 445       if (nc>=kncmax) {
 446         AliWarning("No more matchable clusters can be stored! Please, increase the corresponding vectors size.");
 447         break; /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 448       }
 449       if(c->GetZ() > z+dz) break;
 450       if(c->IsUsed()) continue;
 451       if(!c->GetStatus()) {
 452         AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
 453         continue; // skip bad channels as declared in OCDB
 454       }
 455       Float_t xyz[3]; c->GetGlobalXYZ(xyz);
 456       Double_t clPhi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 457       Double_t dph=TMath::Abs(clPhi-phi);
 458       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 459       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 460       clusters[nc]=c;
 461       index[nc] = k;
 462       nc++;
 463     }
 464
 465     AliDebug(1,Form(" Number of matchable TOF clusters for the track number %d: %d",iseed,nc));
 466
 467     //start propagation: go to the average TOF pad middle plane at ~379.5 cm
 468
 469     Float_t  xTOF = sensRadius;
 470     Double_t ymax = xTOF*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 471     Bool_t skip = kFALSE;
 472     Double_t ysect = trackTOFin->GetYat(xTOF,skip);
 473     if (skip) break;
 474     if (ysect > ymax) {
 475       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 476         break;
 477       }
 478     } else if (ysect <-ymax) {
 479       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 480         break;
 481       }
 482     }
 483     if(!trackTOFin->PropagateTo(xTOF)) {
 484       break;
 485     }
 486
 487
 488     AliTOFcluster *bestCluster=0;
 489     Double_t bestChi2=maxChi2;
 490     Int_t idclus=-1;
 491     //    for (Int_t i=0; i<nc; i++){ /* R+ fix (unsafe) */
 492     for (Int_t i=0; i<nc && i<kncmax; i++){ /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 493       AliTOFcluster *c=clusters[i];  // one of the preselected clusters
 494       Double_t chi2=trackTOFin->GetPredictedChi2((AliCluster3D*)c);
 495       if (chi2 >= bestChi2) continue;
 496       bestChi2=chi2;
 497       bestCluster=c;
 498       idclus=index[i];
 499     }
 500
 501     if (!bestCluster) {  // no matching , go to the next track
 502       fnunmatch++;
 503       delete trackTOFin;
 504       continue;
 505     }
 506
 507     fnmatch++;
 508
 509     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 510                      iseed,
 511                      fnmatch-1,
 512                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 513                      bestCluster->GetLabel(0),
 514                      bestCluster->GetLabel(1),
 515                      bestCluster->GetLabel(2),
 516                      idclus)); // AdC
 517
 518     bestCluster->Use();
 519     if (
 520         (bestCluster->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 521         ||
 522         (bestCluster->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 523         ||
 524         (bestCluster->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 525         ) {
 526       fngoodmatch++;
 527        AliDebug(2,Form(" track label good %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 528
 529     }
 530     else{
 531       fnbadmatch++;
 532       AliDebug(2,Form(" track label bad %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 533     }
 534
 535     //Propagate the track to the best matched cluster
 536     trackTOFin->PropagateTo(bestCluster);
 537
 538     // Fill the track residual histograms.
 539     FillResiduals(trackTOFin,bestCluster,kFALSE);
 540
 541     //now take the local distance in Z from the pad center for time walk correction
 542     Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(bestCluster->GetDetInd(1),bestCluster->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 543     Double_t dzTW=trackTOFin->GetZ()-bestCluster->GetZ(); // in cm - in the ALICE RF -
 544     dzTW/=TMath::Cos(tiltangle); // from ALICE/tracking RF to pad RF (1)
 545     dzTW=-dzTW; // from ALICE/tracking RF to pad RF (2)
 546     if (tiltangle!=0.) AliDebug(2,Form(" rho_track = %f --- rho_cluster = %f ",trackTOFin->GetX(),bestCluster->GetX()));
 547
 548     //update the ESD track and delete the TOFtrack
 549     t->UpdateTrackParams(trackTOFin,AliESDtrack::kTOFout);
 550
 551     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
 552     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*bestCluster->GetToT()*1E-3; // in ns
 553     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 554     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDCRAW()+kTimeOffset; // RAW time,in ps
 555     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
 556     t->SetTOFsignalDz(dzTW);
 557
 558     Float_t deltaY = trackTOFin->GetY()-bestCluster->GetY();
 559     t->SetTOFsignalDx(deltaY);
 560
 561     Float_t distR = (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX())*
 562       (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX());
 563     distR+=deltaY*deltaY;
 564     distR+=dzTW*dzTW;
 565     distR = TMath::Sqrt(distR);
 566     Float_t info[10] = {distR, deltaY, dzTW,
 567                         0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 568     t->SetTOFInfo(info);
 569
 570     Int_t ind[5];
 571     ind[0]=bestCluster->GetDetInd(0);
 572     ind[1]=bestCluster->GetDetInd(1);
 573     ind[2]=bestCluster->GetDetInd(2);
 574     ind[3]=bestCluster->GetDetInd(3);
 575     ind[4]=bestCluster->GetDetInd(4);
 576     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 577     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 578
 579     // keep track of the track labels in the matched cluster
 580     Int_t tlab[3];
 581     tlab[0]=bestCluster->GetLabel(0);
 582     tlab[1]=bestCluster->GetLabel(1);
 583     tlab[2]=bestCluster->GetLabel(2);
 584     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %6d = ",bestCluster->GetTDC()));
 585     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDC()+kTimeOffset; // in ps
 586     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
 587     Double_t tofcorr=tof;
 588     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(dzTW,tof);
 589     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));
 590     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
 591     t->SetTOFsignal(tofcorr);
 592     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
 593     t->SetTOFLabel(tlab);
 594
 595     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f  z distance: %f  corrected time: %f",rawTime,dzTW,tofcorr));
 596
 597     Double_t mom=t->GetP();
 598     AliDebug(2,Form(" Momentum for track %d -> %f", iseed,mom));
 599     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
 600     fHRecNClus->Fill(nc);
 601     fHRecChi2->Fill(bestChi2);
 602     fHRecDistZ->Fill(dzTW);
 603     fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
 604     fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
 605     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
 606     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
 607
 608     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
 609     // no longer there - all info is in the ESDs now
 610
 611     delete trackTOFin;
 612   }
 613
 614 }
 615 //_________________________________________________________________________
 616 Int_t AliTOFtrackerV1::LoadClusters(TTree *cTree) {
 617   //--------------------------------------------------------------------
 618   //This function loads the TOF clusters
 619   //--------------------------------------------------------------------
 620
 621   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
 622   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
 623   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 624   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 625   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 626
 627   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 628   if (!branch) {
 629     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 630     return 1;
 631   }
 632
 633   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 634   dummy.Clear();
 635   TClonesArray *clusters=&dummy;
 636   branch->SetAddress(&clusters);
 637
 638   cTree->GetEvent(0);
 639   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 640   fHDigNClus->Fill(nc);
 641
 642   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 643
 644   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 645     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 646 //PH    fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 647     fClusters[i]=c; fN++;
 648
 649   // Fill Digits QA histos
 650
 651     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
 652     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
 653     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
 654     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
 655     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
 656
 657     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
 658     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
 659
 660     Int_t stripOffset = 0;
 661     switch (iplate) {
 662     case 0:
 663       stripOffset = 0;
 664       break;
 665     case 1:
 666       stripOffset = nStripC;
 667       break;
 668     case 2:
 669       stripOffset = nStripC+nStripB;
 670       break;
 671     case 3:
 672       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 673       break;
 674     case 4:
 675       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 676       break;
 677     default:
 678       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 679       break;
 680     };
 681     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
 682     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
 683     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
 684     fHDigClusTime->Fill(time);
 685     fHDigClusToT->Fill(tot);
 686   }
 687
 688
 689   return 0;
 690 }
 691 //_________________________________________________________________________
 692 void AliTOFtrackerV1::UnloadClusters() {
 693   //--------------------------------------------------------------------
 694   //This function unloads TOF clusters
 695   //--------------------------------------------------------------------
 696   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 697 //PH    delete fClusters[i];
 698     fClusters[i] = 0x0;
 699   }
 700   fN=0;
 701 }
 702
 703 //_________________________________________________________________________
 704 Int_t AliTOFtrackerV1::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 705   //--------------------------------------------------------------------
 706   // This function returns the index of the nearest cluster
 707   //--------------------------------------------------------------------
 708   //MOD
 709   //Here we need to get the Z in the tracking system
 710
 711   if (fN==0) return 0;
 712   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 713   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 714   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 715   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 716     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 717     else e=m;
 718   }
 719   return m;
 720 }
 721
 722 //_________________________________________________________________________
 723 Bool_t AliTOFtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
 724 {
 725   // Get track space point with index i
 726   // Coordinates are in the global system
 727   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
 728   Float_t xyz[3];
 729   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
 730   Float_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 731   Float_t phiangle = (Int_t(phi*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
 732   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 733   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 734   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
 735   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
 736   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 737   Float_t cov[6];
 738   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 739   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 740   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
 741   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 742   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
 743   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
 744   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
 745
 746   // Detector numbering scheme
 747   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
 748   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
 749   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 750   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 751   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 752
 753   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
 754   if (isector >= nSector)
 755     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
 756   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
 757   if (iplate >= nPlate)
 758     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 759   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
 760
 761   Int_t stripOffset = 0;
 762   switch (iplate) {
 763   case 0:
 764     stripOffset = 0;
 765     break;
 766   case 1:
 767     stripOffset = nStripC;
 768     break;
 769   case 2:
 770     stripOffset = nStripC+nStripB;
 771     break;
 772   case 3:
 773     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 774     break;
 775   case 4:
 776     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 777     break;
 778   default:
 779     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 780     break;
 781   };
 782
 783   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
 784                stripOffset +
 785                istrip;
 786   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
 787   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
 788   return kTRUE;
 789 }
 790 //_________________________________________________________________________
 791 void AliTOFtrackerV1::InitCheckHists() {
 792
 793   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
 794
 795   TDirectory *dir = gDirectory;
 796   TFile *logFileTOF = 0;
 797
 798   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 799   int n = list->GetEntries();
 800   Bool_t isThere=kFALSE;
 801   for(int i=0; i<n; i++) {
 802     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 803     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 804       isThere=kTRUE;
 805       break;
 806     }
 807   }
 808
 809   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
 810   logFileTOF->cd();
 811
 812   //Digits "QA"
 813   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);
 814   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);
 815   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);
 816   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);
 817
 818   //Reco "QA"
 819   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
 820   fHRecDistZ=new TH1F("TOFRec_DistZ", "",50,0.5,10.5);
 821   fHRecChi2=new TH1F("TOFRec_Chi2", "",100,0.,10.);
 822   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 823   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 824   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 825   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 826
 827   dir->cd();
 828
 829 }
 830
 831 //_________________________________________________________________________
 832 void AliTOFtrackerV1::SaveCheckHists() {
 833
 834   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
 835
 836   TDirectory *dir = gDirectory;
 837   TFile *logFile = 0;
 838   TFile *logFileTOF = 0;
 839
 840   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 841   int n = list->GetEntries();
 842   for(int i=0; i<n; i++) {
 843     logFile = (TFile*)list->At(i);
 844     if (strstr(logFile->GetName(), "AliESDs.root")) break;
 845   }
 846
 847   Bool_t isThere=kFALSE;
 848   for(int i=0; i<n; i++) {
 849     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 850     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 851       isThere=kTRUE;
 852       break;
 853     }
 854   }
 855
 856   if(!isThere) {
 857           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
 858           return;
 859   }
 860   logFile->cd();
 861   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
 862   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 863   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
 864   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
 865   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 866   fHRecChi2->Write(fHRecChi2->GetName(), TObject::kOverwrite);
 867   fHRecDistZ->Write(fHRecDistZ->GetName(), TObject::kOverwrite);
 868   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 869   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 870   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 871   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 872   logFile->Flush();
 873
 874   dir->cd();
 875
 876   }
 877 //_________________________________________________________________________
 878 Float_t AliTOFtrackerV1::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) {
 879
 880   //dummy, for the moment
 881   Float_t tofcorr=0.;
 882   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
 883     tofcorr=tof;
 884     //place here the actual correction
 885   }else{
 886     tofcorr=tof;
 887   }
 888   return tofcorr;
 889 }
 890 //_________________________________________________________________________
 891 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromT0(AliESDEvent *event) const {
 892
 893   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
 894
 895   return event->GetT0();
 896 }
 897 //_________________________________________________________________________
 898 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
 899
 900   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
 901   {
 902     //place T0 algo here...
 903   }
 904   return 0.;
 905 }
 906 //_________________________________________________________________________
 907
 908 void AliTOFtrackerV1::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 909 {
 910   //
 911   // Returns the TOF cluster array
 912   //
 913
 914   if (fN==0)
 915     arr = 0x0;
 916   else
 917     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 918
 919 }