TOF/AliTOFtrackerV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 //--------------------------------------------------------------------//
  17 //                                                                    //
  18 // AliTOFtrackerV1 Class                                              //
  19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
  20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
  21 //                                                                    //
  22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
  23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
  24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
  25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
  26 //                                                                    //
  27 //--------------------------------------------------------------------//
  28
  29 #include <Rtypes.h>
  30 #include <TROOT.h>
  31
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TObjArray.h>
  34 #include <TTree.h>
  35 #include <TFile.h>
  36 #include <TH1F.h>
  37 #include <TH2F.h>
  38 #include <TSeqCollection.h>
  39
  40 #include "AliESDtrack.h"
  41 #include "AliESDEvent.h"
  42 #include "AliESDpid.h"
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliTrackPointArray.h"
  45 #include "AliGeomManager.h"
  46 #include "AliCDBManager.h"
  47
  48 #include "AliTOFRecoParam.h"
  49 #include "AliTOFReconstructor.h"
  50 #include "AliTOFcluster.h"
  51 #include "AliTOFGeometry.h"
  52 #include "AliTOFtrackerV1.h"
  53 #include "AliTOFtrack.h"
  54
  55 extern TROOT *gROOT;
  56
  57 ClassImp(AliTOFtrackerV1)
  58
  59 //_____________________________________________________________________________
  60 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1():
  61   fkRecoParam(0x0),
  62   fN(0),
  63   fNseeds(0),
  64   fNseedsTOF(0),
  65   fngoodmatch(0),
  66   fnbadmatch(0),
  67   fnunmatch(0),
  68   fnmatch(0),
  69   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
  70   fSeeds(new TObjArray(100)),
  71   fHDigClusMap(0x0),
  72   fHDigNClus(0x0),
  73   fHDigClusTime(0x0),
  74   fHDigClusToT(0x0),
  75   fHRecNClus(0x0),
  76   fHRecChi2(0x0),
  77   fHRecDistZ(0x0),
  78   fHRecSigYVsP(0x0),
  79   fHRecSigZVsP(0x0),
  80   fHRecSigYVsPWin(0x0),
  81   fHRecSigZVsPWin(0x0)
  82  {
  83    //AliTOFtrackerV1 main Ctor
  84
  85    for (Int_t ii=0; ii<kMaxCluster; ii++) fClusters[ii]=0x0;
  86
  87    InitCheckHists();
  88
  89 }
  90 //_____________________________________________________________________________
  91 AliTOFtrackerV1::~AliTOFtrackerV1() {
  92   //
  93   // Dtor
  94   //
  95
  96   SaveCheckHists();
  97
  98   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
  99     delete fkRecoParam;
 100   }
 101   delete fHDigClusMap;
 102   delete fHDigNClus;
 103   delete fHDigClusTime;
 104   delete fHDigClusToT;
 105   delete fHRecNClus;
 106   delete fHRecChi2;
 107   delete fHRecDistZ;
 108   delete fHRecSigYVsP;
 109   delete fHRecSigZVsP;
 110   delete fHRecSigYVsPWin;
 111   delete fHRecSigZVsPWin;
 112   if (fTracks){
 113     fTracks->Delete();
 114     delete fTracks;
 115     fTracks=0x0;
 116   }
 117   if (fSeeds){
 118     fSeeds->Delete();
 119     delete fSeeds;
 120     fSeeds=0x0;
 121   }
 122
 123
 124   if (fClusters) {
 125     for (Int_t ii=0; ii<kMaxCluster; ii++)
 126       if (fClusters[ii]) fClusters[ii]->Delete();
 127   }
 128
 129 }
 130 //_____________________________________________________________________________
 131 void AliTOFtrackerV1::GetPidSettings(AliESDpid *esdPID) {
 132   //
 133   // Sets TOF resolution from RecoParams
 134   //
 135   if (fkRecoParam)
 136     esdPID->GetTOFResponse().SetTimeResolution(fkRecoParam->GetTimeResolution());
 137   else
 138     AliWarning("fkRecoParam not yet set; cannot set PID settings");
 139 }
 140 //_____________________________________________________________________________
 141 Int_t AliTOFtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent * const event) {
 142   //
 143   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
 144   //
 145
 146   // initialize RecoParam for current event
 147   AliDebug(1,"Initializing params for TOF");
 148
 149   fkRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
 150
 151   if (fkRecoParam == 0x0) {
 152     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
 153   }
 154   //fkRecoParam->Dump();
 155   //if(fkRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fkRecoParam=fkRecoParam->GetPbPbparam();
 156   //fkRecoParam->PrintParameters();
 157
 158   //Initialise some counters
 159
 160   fNseeds=0;
 161   fNseedsTOF=0;
 162   fngoodmatch=0;
 163   fnbadmatch=0;
 164   fnunmatch=0;
 165   fnmatch=0;
 166
 167   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
 168   fNseeds = ntrk;
 169
 170   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
 171   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++)
 172     fSeeds->AddLast(event->GetTrack(i));
 173
 174   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
 175   CollectESD();
 176
 177   //Matching Step
 178   MatchTracks();
 179
 180   AliInfo(Form("Number of matched tracks = %d (good = %d, bad = %d)",fnmatch,fngoodmatch,fnbadmatch));
 181
 182   //Update the matched ESD tracks
 183
 184   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
 185     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
 186     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->At(i);
 187
 188     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
 189       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
 190       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
 191       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
 192         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
 193         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
 194         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
 195         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
 196         t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
 197         t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
 198         t->SetTOFsignalDx(seed->GetTOFsignalDx());
 199         t->SetTOFDeltaBC(seed->GetTOFDeltaBC());
 200         t->SetTOFL0L1(seed->GetTOFL0L1());
 201         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
 202         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
 203         t->SetTOFLabel(tlab);
 204
 205         Double_t alphaA = (Double_t)t->GetAlpha();
 206         Double_t xA = (Double_t)t->GetX();
 207         Double_t yA = (Double_t)t->GetY();
 208         Double_t zA = (Double_t)t->GetZ();
 209         Double_t p1A = (Double_t)t->GetSnp();
 210         Double_t p2A = (Double_t)t->GetTgl();
 211         Double_t p3A = (Double_t)t->GetSigned1Pt();
 212         const Double_t *covA = (Double_t*)t->GetCovariance();
 213
 214         // Make attention, please:
 215         //      AliESDtrack::fTOFInfo array does not be stored in the AliESDs.root file
 216         //      it is there only for a check during the reconstruction step.
 217         Float_t info[10]={0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 218         seed->GetTOFInfo(info);
 219         t->SetTOFInfo(info);
 220         AliDebug(2,Form(" distance=%f; residual in the pad reference frame: dX=%f, dZ=%f", info[0],info[1],info[2]));
 221
 222         // Check done:
 223         //       by calling the AliESDtrack::UpdateTrackParams,
 224         //       the current track parameters are changed
 225         //       and it could cause refit problems.
 226         //       We need to update only the following track parameters:
 227         //            the track length and expected times.
 228         //       Removed AliESDtrack::UpdateTrackParams call
 229         //       Called AliESDtrack::SetIntegratedTimes(...) and
 230         //       AliESDtrack::SetIntegratedLength() routines.
 231         /*
 232           AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
 233           t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout); // to be checked - AdC
 234           delete track;
 235           Double_t time[10]; t->GetIntegratedTimes(time);
 236         */
 237
 238         Double_t time[10]; seed->GetIntegratedTimes(time);
 239         t->SetIntegratedTimes(time);
 240
 241         Double_t length =  seed->GetIntegratedLength();
 242         t->SetIntegratedLength(length);
 243
 244         Double_t alphaB = (Double_t)t->GetAlpha();
 245         Double_t xB = (Double_t)t->GetX();
 246         Double_t yB = (Double_t)t->GetY();
 247         Double_t zB = (Double_t)t->GetZ();
 248         Double_t p1B = (Double_t)t->GetSnp();
 249         Double_t p2B = (Double_t)t->GetTgl();
 250         Double_t p3B = (Double_t)t->GetSigned1Pt();
 251         const Double_t *covB = (Double_t*)t->GetCovariance();
 252         AliDebug(2,"Track params -now(before)-:");
 253         AliDebug(2,Form("    X: %f(%f), Y: %f(%f), Z: %f(%f) --- alpha: %f(%f)",
 254                         xB,xA,
 255                         yB,yA,
 256                         zB,zA,
 257                         alphaB,alphaA));
 258         AliDebug(2,Form("    p1: %f(%f), p2: %f(%f), p3: %f(%f)",
 259                         p1B,p1A,
 260                         p2B,p2A,
 261                         p3B,p3A));
 262         AliDebug(2,Form("    cov1: %f(%f), cov2: %f(%f), cov3: %f(%f)"
 263                         " cov4: %f(%f), cov5: %f(%f), cov6: %f(%f)"
 264                         " cov7: %f(%f), cov8: %f(%f), cov9: %f(%f)"
 265                         " cov10: %f(%f), cov11: %f(%f), cov12: %f(%f)"
 266                         " cov13: %f(%f), cov14: %f(%f), cov15: %f(%f)",
 267                         covB[0],covA[0],
 268                         covB[1],covA[1],
 269                         covB[2],covA[2],
 270                         covB[3],covA[3],
 271                         covB[4],covA[4],
 272                         covB[5],covA[5],
 273                         covB[6],covA[6],
 274                         covB[7],covA[7],
 275                         covB[8],covA[8],
 276                         covB[9],covA[9],
 277                         covB[10],covA[10],
 278                         covB[11],covA[11],
 279                         covB[12],covA[12],
 280                         covB[13],covA[13],
 281                         covB[14],covA[14]
 282                         ));
 283         AliDebug(3,Form(" %6d  %f %f %f %f %f %6d %3d %f  %f %f %f %f %f",
 284                         i,
 285                         t->GetTOFsignalRaw(),
 286                         t->GetTOFsignal(),
 287                         t->GetTOFsignalToT(),
 288                         t->GetTOFsignalDz(),
 289                         t->GetTOFsignalDx(),
 290                         t->GetTOFCalChannel(),
 291                         t->GetTOFcluster(),
 292                         t->GetIntegratedLength(),
 293                         time[0], time[1], time[2], time[3], time[4]
 294                         )
 295                  );
 296       }
 297     }
 298   }
 299
 300   fSeeds->Clear();
 301   fTracks->Delete();
 302   return 0;
 303
 304 }
 305 //_________________________________________________________________________
 306 void AliTOFtrackerV1::CollectESD() {
 307    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
 308
 309   Int_t seedsTOF1=0;
 310   Int_t seedsTOF2=0;
 311
 312   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
 313   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
 314
 315     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->At(i);
 316     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
 317
 318     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
 319     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
 320
 321     // TRD 'good' tracks, already propagated at 371 cm
 322     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) &&
 323          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
 324       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 325
 326         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 327                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 328                         x, (Float_t)track->GetX()));
 329
 330         track->SetSeedIndex(i);
 331         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 332         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 333         fNseedsTOF++;
 334         seedsTOF1++;
 335       }
 336       delete track;
 337     }
 338
 339     // Propagate the rest of TPCbp
 340     else {
 341       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
 342
 343         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
 344                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
 345                         x, (Float_t)track->GetX()));
 346
 347         track->SetSeedIndex(i);
 348         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
 349         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
 350         fNseedsTOF++;
 351         seedsTOF2++;
 352       }
 353       delete track;
 354     }
 355   }
 356
 357   AliInfo(Form("Number of TOF seeds = %d (Type 1 = %d, Type 2 = %d)",fNseedsTOF,seedsTOF1,seedsTOF2));
 358
 359   // Sort according uncertainties on track position
 360   fTracks->Sort();
 361
 362 }
 363 //_________________________________________________________________________
 364 void AliTOFtrackerV1::MatchTracks( ){
 365   //
 366   //Match ESD tracks to clusters in TOF
 367   //
 368
 369
 370   // Parameters regulating the reconstruction
 371   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad();
 372   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad();
 373
 374   const Float_t kTimeOffset = 0.; // time offset for tracking algorithm [ps]
 375
 376   const Int_t kncmax = 100;
 377   Float_t sensRadius = fkRecoParam->GetSensRadius();
 378   Float_t scaleFact   = fkRecoParam->GetWindowScaleFact();
 379   Float_t dyMax=fkRecoParam->GetWindowSizeMaxY();
 380   Float_t dzMax=fkRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
 381   Double_t maxChi2=fkRecoParam->GetMaxChi2();
 382   Bool_t timeWalkCorr    = fkRecoParam->GetTimeWalkCorr();
 383   AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
 384   AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
 385   AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
 386   AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
 387   AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
 388   AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
 389   AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));
 390
 391
 392   //The matching loop
 393   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
 394
 395     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
 396     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->At(track->GetSeedIndex());
 397     //if ( t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
 398     if ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) continue;
 399     AliTOFtrack *trackTOFin = new AliTOFtrack(*track);
 400
 401     // Determine a window around the track
 402     Double_t x,par[5]; trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
 403     Double_t cov[15]; trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
 404
 405     if (cov[0]<0. || cov[2]<0.) {
 406       AliWarning(Form("Very strange track (%d)! At least one of its covariance matrix diagonal elements is negative!",iseed));
 407       //delete trackTOFin;
 408       //continue;
 409     }
 410
 411     Double_t z    = par[1];
 412     Double_t dz   = scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[2])+dZ*dZ/12.);
 413     Double_t dphi = scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[0])+dY*dY/12.)/sensRadius;
 414
 415     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
 416     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
 417     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
 418
 419     //upper limit on window's size.
 420     if (dz> dzMax) dz=dzMax;
 421     if (dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
 422
 423     // find the clusters inside the selected window
 424     Int_t nc=0;
 425     AliTOFcluster *clusters[kncmax]; // pointers to the clusters in the window
 426     Int_t index[kncmax];//to keep track of the cluster index
 427     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {
 428       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
 429       //      if(nc>kncmax)break; /* R+ fix (buffer overflow) */
 430       if (nc>=kncmax) {
 431         AliWarning("No more matchable clusters can be stored! Please, increase the corresponding vectors size.");
 432         break; /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 433       }
 434       if (c->GetZ() > z+dz) break;
 435       if (c->IsUsed()) continue;
 436       if (!c->GetStatus()) {
 437         AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
 438         continue; // skip bad channels as declared in OCDB
 439       }
 440       Float_t xyz[3]; c->GetGlobalXYZ(xyz);
 441       Double_t clPhi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 442       Double_t dph=TMath::Abs(clPhi-phi);
 443       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
 444       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
 445       clusters[nc]=c;
 446       index[nc] = k;
 447       nc++;
 448     }
 449
 450     AliDebug(1,Form(" Number of matchable TOF clusters for the track number %d: %d",iseed,nc));
 451
 452     //start propagation: go to the average TOF pad middle plane at ~379.5 cm
 453
 454     Float_t  xTOF = sensRadius;
 455     Double_t ymax = xTOF*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
 456     Bool_t skip = kFALSE;
 457     Double_t ysect = trackTOFin->GetYat(xTOF,skip);
 458     if (skip) break;
 459     if (ysect > ymax) {
 460       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 461         break;
 462       }
 463     } else if (ysect <-ymax) {
 464       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
 465         break;
 466       }
 467     }
 468     if(!trackTOFin->PropagateTo(xTOF)) {
 469       break;
 470     }
 471
 472
 473     AliTOFcluster *bestCluster=0;
 474     Double_t bestChi2=maxChi2;
 475     Int_t idclus=-1;
 476     //    for (Int_t i=0; i<nc; i++){ /* R+ fix (unsafe) */
 477     for (Int_t i=0; i<nc && i<kncmax; i++){ /* R+ fix (buffer overflow protection) */
 478       AliTOFcluster *c=clusters[i];  // one of the preselected clusters
 479       Double_t chi2=trackTOFin->GetPredictedChi2((AliCluster3D*)c);
 480       if (chi2 >= bestChi2) continue;
 481       bestChi2=chi2;
 482       bestCluster=c;
 483       idclus=index[i];
 484     }
 485
 486     if (!bestCluster) {  // no matching , go to the next track
 487       fnunmatch++;
 488       delete trackTOFin;
 489       continue;
 490     }
 491
 492     fnmatch++;
 493
 494     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
 495                      iseed,
 496                      fnmatch-1,
 497                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
 498                      bestCluster->GetLabel(0),
 499                      bestCluster->GetLabel(1),
 500                      bestCluster->GetLabel(2),
 501                      idclus)); // AdC
 502
 503     bestCluster->Use();
 504     if (
 505         (bestCluster->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 506         ||
 507         (bestCluster->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 508         ||
 509         (bestCluster->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
 510         ) {
 511       fngoodmatch++;
 512        AliDebug(2,Form(" track label good %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 513
 514     }
 515     else{
 516       fnbadmatch++;
 517       AliDebug(2,Form(" track label bad %5d",trackTOFin->GetLabel()));
 518     }
 519
 520     //Propagate the track to the best matched cluster
 521     trackTOFin->PropagateTo(bestCluster);
 522
 523     // Fill the track residual histograms.
 524     FillResiduals(trackTOFin,bestCluster,kFALSE);
 525
 526     //now take the local distance in Z from the pad center for time walk correction
 527     Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(bestCluster->GetDetInd(1),bestCluster->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 528     Double_t dzTW=trackTOFin->GetZ()-bestCluster->GetZ(); // in cm - in the ALICE RF -
 529     dzTW/=TMath::Cos(tiltangle); // from ALICE/tracking RF to pad RF (1)
 530     dzTW=-dzTW; // from ALICE/tracking RF to pad RF (2)
 531     if (tiltangle!=0.) AliDebug(2,Form(" rho_track = %f --- rho_cluster = %f ",trackTOFin->GetX(),bestCluster->GetX()));
 532
 533     //update the ESD track and delete the TOFtrack
 534     t->UpdateTrackParams(trackTOFin,AliESDtrack::kTOFout);
 535
 536     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
 537     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*bestCluster->GetToT()*1E-3; // in ns
 538     t->SetTOFsignalToT(tToT);
 539     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDCRAW()+kTimeOffset; // RAW time,in ps
 540     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
 541     t->SetTOFsignalDz(dzTW);
 542
 543     Float_t deltaY = trackTOFin->GetY()-bestCluster->GetY();
 544     t->SetTOFsignalDx(deltaY);
 545
 546     t->SetTOFDeltaBC(bestCluster->GetDeltaBC());
 547     t->SetTOFL0L1(bestCluster->GetL0L1Latency());
 548
 549     Float_t distR = (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX())*
 550       (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX());
 551     distR+=deltaY*deltaY;
 552     distR+=dzTW*dzTW;
 553     distR = TMath::Sqrt(distR);
 554     Float_t info[10] = {distR, deltaY, dzTW,
 555                         0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
 556     t->SetTOFInfo(info);
 557
 558     Int_t ind[5];
 559     ind[0]=bestCluster->GetDetInd(0);
 560     ind[1]=bestCluster->GetDetInd(1);
 561     ind[2]=bestCluster->GetDetInd(2);
 562     ind[3]=bestCluster->GetDetInd(3);
 563     ind[4]=bestCluster->GetDetInd(4);
 564     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
 565     t->SetTOFCalChannel(calindex);
 566
 567     // keep track of the track labels in the matched cluster
 568     Int_t tlab[3];
 569     tlab[0]=bestCluster->GetLabel(0);
 570     tlab[1]=bestCluster->GetLabel(1);
 571     tlab[2]=bestCluster->GetLabel(2);
 572     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %6d = ",bestCluster->GetTDC()));
 573     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDC()+kTimeOffset; // in ps
 574     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
 575     Double_t tofcorr=tof;
 576     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(dzTW,tof);
 577     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));
 578     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
 579     t->SetTOFsignal(tofcorr);
 580     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
 581     t->SetTOFLabel(tlab);
 582
 583     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f  z distance: %f  corrected time: %f",rawTime,dzTW,tofcorr));
 584
 585     Double_t mom=t->GetP();
 586     AliDebug(2,Form(" Momentum for track %d -> %f", iseed,mom));
 587     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
 588     fHRecNClus->Fill(nc);
 589     fHRecChi2->Fill(bestChi2);
 590     fHRecDistZ->Fill(dzTW);
 591     if (cov[0]>=0.)
 592       fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
 593     else
 594       fHRecSigYVsP->Fill(mom,-TMath::Sqrt(-cov[0]));
 595     if (cov[2]>=0.)
 596       fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
 597     else
 598       fHRecSigZVsP->Fill(mom,-TMath::Sqrt(-cov[2]));
 599     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
 600     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
 601
 602     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
 603     // no longer there - all info is in the ESDs now
 604
 605     delete trackTOFin;
 606   }
 607
 608 }
 609 //_________________________________________________________________________
 610 Int_t AliTOFtrackerV1::LoadClusters(TTree *cTree) {
 611   //--------------------------------------------------------------------
 612   //This function loads the TOF clusters
 613   //--------------------------------------------------------------------
 614
 615   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
 616   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
 617   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 618   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 619   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 620
 621   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
 622   if (!branch) {
 623     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
 624     return 1;
 625   }
 626
 627   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
 628   dummy.Clear();
 629   TClonesArray *clusters=&dummy;
 630   branch->SetAddress(&clusters);
 631
 632   cTree->GetEvent(0);
 633   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
 634   fHDigNClus->Fill(nc);
 635
 636   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
 637
 638   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
 639     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
 640 //PH    fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
 641     fClusters[i]=c; fN++;
 642
 643   // Fill Digits QA histos
 644
 645     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
 646     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
 647     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
 648     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
 649     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
 650
 651     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
 652     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
 653
 654     Int_t stripOffset = 0;
 655     switch (iplate) {
 656     case 0:
 657       stripOffset = 0;
 658       break;
 659     case 1:
 660       stripOffset = nStripC;
 661       break;
 662     case 2:
 663       stripOffset = nStripC+nStripB;
 664       break;
 665     case 3:
 666       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 667       break;
 668     case 4:
 669       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 670       break;
 671     default:
 672       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 673       break;
 674     };
 675     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
 676     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
 677     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
 678     fHDigClusTime->Fill(time);
 679     fHDigClusToT->Fill(tot);
 680   }
 681
 682
 683   return 0;
 684 }
 685 //_________________________________________________________________________
 686 void AliTOFtrackerV1::UnloadClusters() {
 687   //--------------------------------------------------------------------
 688   //This function unloads TOF clusters
 689   //--------------------------------------------------------------------
 690   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
 691 //PH    delete fClusters[i];
 692     fClusters[i] = 0x0;
 693   }
 694   fN=0;
 695 }
 696
 697 //_________________________________________________________________________
 698 Int_t AliTOFtrackerV1::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 699   //--------------------------------------------------------------------
 700   // This function returns the index of the nearest cluster
 701   //--------------------------------------------------------------------
 702   //MOD
 703   //Here we need to get the Z in the tracking system
 704
 705   if (fN==0) return 0;
 706   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
 707   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
 708   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
 709   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 710     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 711     else e=m;
 712   }
 713   return m;
 714 }
 715
 716 //_________________________________________________________________________
 717 Bool_t AliTOFtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
 718 {
 719   // Get track space point with index i
 720   // Coordinates are in the global system
 721   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
 722   Float_t xyz[3];
 723   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
 724   Float_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 725   Float_t phiangle = (Int_t(phi*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
 726   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
 727   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
 728   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
 729   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
 730   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
 731   Float_t cov[6];
 732   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 733   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 734   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
 735   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
 736   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
 737   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
 738   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
 739
 740   // Detector numbering scheme
 741   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
 742   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
 743   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
 744   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
 745   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
 746
 747   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
 748   if (isector >= nSector)
 749     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
 750   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
 751   if (iplate >= nPlate)
 752     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 753   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
 754
 755   Int_t stripOffset = 0;
 756   switch (iplate) {
 757   case 0:
 758     stripOffset = 0;
 759     break;
 760   case 1:
 761     stripOffset = nStripC;
 762     break;
 763   case 2:
 764     stripOffset = nStripC+nStripB;
 765     break;
 766   case 3:
 767     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
 768     break;
 769   case 4:
 770     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
 771     break;
 772   default:
 773     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
 774     break;
 775   };
 776
 777   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
 778                stripOffset +
 779                istrip;
 780   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
 781   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
 782   return kTRUE;
 783 }
 784 //_________________________________________________________________________
 785 void AliTOFtrackerV1::InitCheckHists() {
 786
 787   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
 788
 789   TDirectory *dir = gDirectory;
 790   TFile *logFileTOF = 0;
 791
 792   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 793   int n = list->GetEntries();
 794   Bool_t isThere=kFALSE;
 795   for(int i=0; i<n; i++) {
 796     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 797     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 798       isThere=kTRUE;
 799       break;
 800     }
 801   }
 802
 803   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
 804   logFileTOF->cd();
 805
 806   //Digits "QA"
 807   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);
 808   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);
 809   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);
 810   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);
 811
 812   //Reco "QA"
 813   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
 814   fHRecDistZ=new TH1F("TOFRec_DistZ", "",50,0.5,10.5);
 815   fHRecChi2=new TH1F("TOFRec_Chi2", "",100,0.,10.);
 816   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 817   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
 818   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 819   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
 820
 821   dir->cd();
 822
 823 }
 824
 825 //_________________________________________________________________________
 826 void AliTOFtrackerV1::SaveCheckHists() {
 827
 828   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
 829
 830   TDirectory *dir = gDirectory;
 831   TFile *logFile = 0;
 832   TFile *logFileTOF = 0;
 833
 834   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
 835   int n = list->GetEntries();
 836   for(int i=0; i<n; i++) {
 837     logFile = (TFile*)list->At(i);
 838     if (strstr(logFile->GetName(), "AliESDs.root")) break;
 839   }
 840
 841   Bool_t isThere=kFALSE;
 842   for(int i=0; i<n; i++) {
 843     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
 844     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
 845       isThere=kTRUE;
 846       break;
 847     }
 848   }
 849
 850   if(!isThere) {
 851           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
 852           return;
 853   }
 854   logFile->cd();
 855   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
 856   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 857   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
 858   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
 859   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
 860   fHRecChi2->Write(fHRecChi2->GetName(), TObject::kOverwrite);
 861   fHRecDistZ->Write(fHRecDistZ->GetName(), TObject::kOverwrite);
 862   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 863   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
 864   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 865   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
 866   logFile->Flush();
 867
 868   dir->cd();
 869
 870   }
 871 //_________________________________________________________________________
 872 Float_t AliTOFtrackerV1::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) const {
 873
 874   //dummy, for the moment
 875   Float_t tofcorr=0.;
 876   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
 877     tofcorr=tof;
 878     //place here the actual correction
 879   }else{
 880     tofcorr=tof;
 881   }
 882   return tofcorr;
 883 }
 884 //_________________________________________________________________________
 885 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromT0(const AliESDEvent * const event) const {
 886
 887   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
 888
 889   return event->GetT0();
 890 }
 891 //_________________________________________________________________________
 892 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
 893
 894   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
 895   {
 896     //place T0 algo here...
 897   }
 898   return 0.;
 899 }
 900 //_________________________________________________________________________
 901
 902 void AliTOFtrackerV1::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
 903 {
 904   //
 905   // Returns the TOF cluster array
 906   //
 907
 908   if (fN==0)
 909     arr = 0x0;
 910   else
 911     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
 912
 913 }