]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - TOF/AliTOFtrackerV1.cxx
TOF residual information update: added also rhoXphi residuals (i.e. residuals in...
[u/mrichter/AliRoot.git] / TOF / AliTOFtrackerV1.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14 **************************************************************************/
15
16 //--------------------------------------------------------------------//
17 //                                                                    //
18 // AliTOFtrackerV1 Class                                              //
19 // Task: Perform association of the ESD tracks to TOF Clusters        //
20 // and Update ESD track with associated TOF Cluster parameters        //
21 //                                                                    //
22 // -- Authors : S. Arcelli, C. Zampolli (Bologna University and INFN) //
23 // -- Contacts: Annalisa.De.Caro@cern.ch                              //
24 // --         : Chiara.Zampolli@bo.infn.it                            //
25 // --         : Silvia.Arcelli@bo.infn.it                             //
26 //                                                                    //
27 //--------------------------------------------------------------------//
28
29 #include <Rtypes.h>
30 #include <TROOT.h>
31
32 #include <TClonesArray.h>
33 #include <TTree.h>
34 #include <TFile.h>
35 #include <TH1F.h>
36 #include <TH2F.h>
37 #include <TSeqCollection.h>
38
39 #include "AliESDtrack.h"
40 #include "AliESDEvent.h"
41 #include "AliLog.h"
42 #include "AliTrackPointArray.h"
43 #include "AliGeomManager.h"
44 #include "AliCDBManager.h"
45
46 #include "AliTOFRecoParam.h"
47 #include "AliTOFReconstructor.h"
48 #include "AliTOFcluster.h"
49 #include "AliTOFGeometry.h"
50 #include "AliTOFtrackerV1.h"
51 #include "AliTOFtrack.h"
52 #include "AliTOFpidESD.h"
53
54 extern TROOT *gROOT;
55
56 ClassImp(AliTOFtrackerV1)
57
58 //_____________________________________________________________________________
59 AliTOFtrackerV1::AliTOFtrackerV1():
60   fRecoParam(0x0),
61   fPid(0x0),
62   fN(0),
63   fNseeds(0),
64   fNseedsTOF(0),
65   fngoodmatch(0),
66   fnbadmatch(0),
67   fnunmatch(0),
68   fnmatch(0),
69   fTracks(new TClonesArray("AliTOFtrack")),
70   fSeeds(new TClonesArray("AliESDtrack")),
71   fHDigClusMap(0x0),
72   fHDigNClus(0x0),
73   fHDigClusTime(0x0),
74   fHDigClusToT(0x0),
75   fHRecNClus(0x0),
76   fHRecChi2(0x0),
77   fHRecDistZ(0x0),
78   fHRecSigYVsP(0x0),
79   fHRecSigZVsP(0x0),
80   fHRecSigYVsPWin(0x0),
81   fHRecSigZVsPWin(0x0)
82  { 
83   //AliTOFtrackerV1 main Ctor
84
85    InitCheckHists();
86
87 }
88 //_____________________________________________________________________________
89 AliTOFtrackerV1::~AliTOFtrackerV1() {
90   //
91   // Dtor
92   //
93
94   SaveCheckHists();
95
96   if(!(AliCDBManager::Instance()->GetCacheFlag())){
97     delete fRecoParam;
98   }
99   delete fPid; 
100   delete fHDigClusMap;
101   delete fHDigNClus;
102   delete fHDigClusTime;
103   delete fHDigClusToT;
104   delete fHRecNClus;
105   delete fHRecChi2;
106   delete fHRecDistZ;
107   delete fHRecSigYVsP;
108   delete fHRecSigZVsP;
109   delete fHRecSigYVsPWin;
110   delete fHRecSigZVsPWin;
111   if (fTracks){
112     fTracks->Delete();
113     delete fTracks;
114     fTracks=0x0;
115   }
116   if (fSeeds){
117     fSeeds->Delete();
118     delete fSeeds;
119     fSeeds=0x0;
120   }
121 }
122 //_____________________________________________________________________________
123 Int_t AliTOFtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent* event) {
124   //
125   // Gets seeds from ESD event and Match with TOF Clusters
126   //
127
128   // initialize RecoParam for current event
129
130   AliInfo("Initializing params for TOF... ");
131
132   fRecoParam = AliTOFReconstructor::GetRecoParam();  // instantiate reco param from STEER...
133
134   if (fRecoParam == 0x0) { 
135     AliFatal("No Reco Param found for TOF!!!");
136   }
137   //fRecoParam->Dump();
138   //if(fRecoParam->GetApplyPbPbCuts())fRecoParam=fRecoParam->GetPbPbparam();
139   //fRecoParam->PrintParameters();
140
141   Double_t parPID[2];   
142   parPID[0]=fRecoParam->GetTimeResolution();
143   parPID[1]=fRecoParam->GetTimeNSigma();
144   fPid=new AliTOFpidESD(parPID);
145
146   //Initialise some counters
147
148   fNseeds=0;
149   fNseedsTOF=0;
150   fngoodmatch=0;
151   fnbadmatch=0;
152   fnunmatch=0;
153   fnmatch=0;
154
155   Int_t ntrk=event->GetNumberOfTracks();
156   fNseeds = ntrk;
157   TClonesArray &aESDTrack = *fSeeds;
158
159
160   //Load ESD tracks into a local Array of ESD Seeds
161
162   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
163     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
164     new(aESDTrack[i]) AliESDtrack(*t);
165   }
166
167   //Prepare ESD tracks candidates for TOF Matching
168   CollectESD();
169
170   //Matching Step
171   MatchTracks();
172
173   AliInfo(Form("Number of matched tracks: %d",fnmatch));
174   AliInfo(Form("Number of good matched tracks: %d",fngoodmatch));
175   AliInfo(Form("Number of bad  matched tracks: %d",fnbadmatch));
176
177   //Update the matched ESD tracks
178
179   for (Int_t i=0; i<ntrk; i++) {
180     AliESDtrack *t=event->GetTrack(i);
181     AliESDtrack *seed =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
182
183     if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFin)!=0 ) {
184       t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFin);
185       //if(seed->GetTOFsignal()>0){
186       if ( (seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) {
187         t->SetStatus(AliESDtrack::kTOFout);
188         t->SetTOFsignal(seed->GetTOFsignal());
189         t->SetTOFcluster(seed->GetTOFcluster());
190         t->SetTOFsignalToT(seed->GetTOFsignalToT());
191         t->SetTOFsignalRaw(seed->GetTOFsignalRaw());
192         t->SetTOFsignalDz(seed->GetTOFsignalDz());
193         t->SetTOFCalChannel(seed->GetTOFCalChannel());
194         Int_t tlab[3]; seed->GetTOFLabel(tlab);
195         t->SetTOFLabel(tlab);
196
197         Float_t info[10]={0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
198         seed->GetTOFInfo(info);
199         t->SetTOFInfo(info);
200         AliDebug(2,Form(" distance=%f; residual in the pad reference frame: dX=%f, dZ=%f", info[0],info[1],info[2]));
201
202         AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*seed);
203         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFout); // to be checked - AdC
204         delete track;
205
206         Double_t time[10]; t->GetIntegratedTimes(time);
207         AliDebug(2,Form(" %6d  %f %f %f %f %6d %3d %f  %f %f %f %f %f",
208                         i,
209                         t->GetTOFsignalRaw(),
210                         t->GetTOFsignal(),
211                         t->GetTOFsignalToT(),
212                         t->GetTOFsignalDz(),
213                         t->GetTOFCalChannel(),
214                         t->GetTOFcluster(),
215                         t->GetIntegratedLength(),
216                         time[0], time[1], time[2], time[3], time[4]
217                         )
218                  );
219       }
220     }
221   }
222
223   //Handle Time Zero information
224
225   Double_t timeZero=0.;
226   Double_t timeZeroMax=99999.;
227   Bool_t usetimeZero     = fRecoParam->UseTimeZero();
228   Bool_t timeZeroFromT0  = fRecoParam->GetTimeZerofromT0();
229   Bool_t timeZeroFromTOF = fRecoParam->GetTimeZerofromTOF();
230
231   AliDebug(2,Form("Use Time Zero?: %d",usetimeZero));
232   AliDebug(2,Form("Time Zero from T0? : %d",timeZeroFromT0));
233   AliDebug(2,Form("Time Zero From TOF? : %d",timeZeroFromTOF));
234
235   if(usetimeZero){
236     if(timeZeroFromT0){
237       timeZero=GetTimeZerofromT0(event); 
238     }
239     if(timeZeroFromTOF && (timeZero>timeZeroMax || !timeZeroFromT0)){
240       timeZero=GetTimeZerofromTOF(event); 
241     }
242   }
243   AliDebug(2,Form("time Zero used in PID: %f",timeZero));
244   //Make TOF PID
245   fPid->MakePID(event,timeZero);
246
247   fSeeds->Clear();
248   fTracks->Clear();
249   return 0;
250   
251 }
252 //_________________________________________________________________________
253 void AliTOFtrackerV1::CollectESD() {
254    //prepare the set of ESD tracks to be matched to clusters in TOF
255
256   Int_t seedsTOF1=0;
257   Int_t seedsTOF2=0;
258  
259   TClonesArray &aTOFTrack = *fTracks;
260   for (Int_t i=0; i<fNseeds; i++) {
261
262     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
263     if ((t->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout)==0)continue;
264
265     AliTOFtrack *track = new AliTOFtrack(*t); // New
266     Float_t x = (Float_t)track->GetX(); //New
267
268     // TRD 'good' tracks, already propagated at 371 cm
269     if ( ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDout)!=0 ) && 
270          ( x >= AliTOFGeometry::Rmin() ) ) {
271       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
272
273         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
274                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
275                         x, (Float_t)track->GetX()));
276
277         track->SetSeedIndex(i);
278         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
279         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
280         fNseedsTOF++;
281         seedsTOF1++;
282       }
283       delete track;
284     }
285
286     // Propagate the rest of TPCbp
287     else {
288       if ( track->PropagateToInnerTOF() ) {
289
290         AliDebug(1,Form(" TRD propagated track till rho = %fcm."
291                         " And then the track has been propagated till rho = %fcm.",
292                         x, (Float_t)track->GetX()));
293
294         track->SetSeedIndex(i);
295         t->UpdateTrackParams(track,AliESDtrack::kTOFin);
296         new(aTOFTrack[fNseedsTOF]) AliTOFtrack(*track);
297         fNseedsTOF++;
298         seedsTOF2++;
299       }
300       delete track;
301     }
302   }
303
304   AliInfo(Form("Number of TOF seeds %d",fNseedsTOF));
305   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 1 %d",seedsTOF1));
306   AliInfo(Form("Number of TOF seeds Type 2 %d",seedsTOF2));
307
308   // Sort according uncertainties on track position 
309   fTracks->Sort();
310
311 }
312 //_________________________________________________________________________
313 void AliTOFtrackerV1::MatchTracks( ){
314   //
315   //Match ESD tracks to clusters in TOF
316   //
317
318
319   // Parameters regulating the reconstruction
320   Float_t dY=AliTOFGeometry::XPad(); 
321   Float_t dZ=AliTOFGeometry::ZPad(); 
322
323   const Float_t kTimeOffset = 32.; // time offset for tracking algorithm [ps]
324
325   const Int_t kncmax = 100;
326   Float_t sensRadius = fRecoParam->GetSensRadius();
327   Float_t scaleFact   = fRecoParam->GetWindowScaleFact();
328   Float_t dyMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxY(); 
329   Float_t dzMax=fRecoParam->GetWindowSizeMaxZ();
330   Double_t maxChi2=fRecoParam->GetMaxChi2();
331   Bool_t timeWalkCorr    = fRecoParam->GetTimeWalkCorr();
332   AliDebug(1,"++++++++++++++TOF Reconstruction Parameters:++++++++++++ \n");
333   AliDebug(1,Form("TOF sens radius: %f",sensRadius));
334   AliDebug(1,Form("TOF Window scale factor: %f",scaleFact));
335   AliDebug(1,Form("TOF Window max dy: %f",dyMax));
336   AliDebug(1,Form("TOF Window max dz: %f",dzMax));
337   AliDebug(1,Form("TOF Max Chi2: %f",maxChi2));
338   AliDebug(1,Form("Time Walk Correction? : %d",timeWalkCorr));   
339
340
341   //The matching loop
342   for (Int_t iseed=0; iseed<fNseedsTOF; iseed++) {
343
344     AliTOFtrack *track =(AliTOFtrack*)fTracks->UncheckedAt(iseed);
345     AliESDtrack *t =(AliESDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(track->GetSeedIndex());
346     //if ( t->GetTOFsignal()>0. ) continue;
347     if ( (t->GetStatus()&AliESDtrack::kTOFout)!=0 ) continue;
348     AliTOFtrack *trackTOFin =new AliTOFtrack(*track);
349      
350     // Determine a window around the track
351     Double_t x,par[5]; trackTOFin->GetExternalParameters(x,par);
352     Double_t cov[15]; trackTOFin->GetExternalCovariance(cov);
353
354     if (cov[0]<0. || cov[2]<0.) {
355       AliWarning(Form("Very strange track (%d)! At least one of its covariance matrix diagonal elements is negative!",iseed));
356       //delete trackTOFin;
357       //continue;
358     }
359
360     Double_t z    = par[1];   
361     Double_t dz   =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[2])+dZ*dZ/12.);
362     Double_t dphi =  scaleFact*3.*TMath::Sqrt(TMath::Abs(cov[0])+dY*dY/12.)/sensRadius; 
363
364     Double_t phi=TMath::ATan2(par[0],x) + trackTOFin->GetAlpha();
365     if (phi<-TMath::Pi())phi+=2*TMath::Pi();
366     if (phi>=TMath::Pi())phi-=2*TMath::Pi();
367
368     //upper limit on window's size.
369     if(dz> dzMax) dz=dzMax;
370     if(dphi*sensRadius> dyMax) dphi=dyMax/sensRadius;
371
372     // find the clusters inside the selected window 
373     Int_t nc=0;
374     AliTOFcluster *clusters[kncmax]; // pointers to the clusters in the window
375     Int_t index[kncmax];//to keep track of the cluster index
376     for (Int_t k=FindClusterIndex(z-dz); k<fN; k++) {  
377       AliTOFcluster *c=fClusters[k];
378       //      if(nc>kncmax)break; /* R+ fix (buffer overflow) */
379       if (nc>=kncmax) {
380         AliWarning("No more matchable clusters can be stored! Please, increase the corresponding vectors size.");
381         break; /* R+ fix (buffer overflow protection) */
382       }
383       if(c->GetZ() > z+dz) break;
384       if(c->IsUsed()) continue;      
385       if(!c->GetStatus()) {
386         AliDebug(1,"Cluster in channel declared bad!");
387         continue; // skip bad channels as declared in OCDB  
388       }
389       Float_t xyz[3]; c->GetGlobalXYZ(xyz);
390       Double_t clPhi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
391       Double_t dph=TMath::Abs(clPhi-phi);
392       if (dph>TMath::Pi()) dph-=2.*TMath::Pi();
393       if (TMath::Abs(dph)>dphi) continue;
394       clusters[nc]=c;
395       index[nc] = k;      
396       nc++;  
397     }
398
399     AliDebug(1,Form(" Number of matchable TOF clusters for the track number %d: %d",iseed,nc));
400
401     //start propagation: go to the average TOF pad middle plane at ~379.5 cm
402
403     Float_t  xTOF = sensRadius;
404     Double_t ymax = xTOF*TMath::Tan(0.5*AliTOFGeometry::GetAlpha());
405     Bool_t skip = kFALSE;
406     Double_t ysect = trackTOFin->GetYat(xTOF,skip);
407     if (skip) break;
408     if (ysect > ymax) {
409       if (!trackTOFin->Rotate(AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
410         break;
411       }
412     } else if (ysect <-ymax) {
413       if (!trackTOFin->Rotate(-AliTOFGeometry::GetAlpha())) {
414         break;
415       }
416     }
417     if(!trackTOFin->PropagateTo(xTOF)) {
418       break;
419     }
420
421
422     AliTOFcluster *bestCluster=0;
423     Double_t bestChi2=maxChi2; 
424     Int_t idclus=-1;
425     //    for (Int_t i=0; i<nc; i++){ /* R+ fix (unsafe) */
426     for (Int_t i=0; i<nc && i<kncmax; i++){ /* R+ fix (buffer overflow protection) */
427       AliTOFcluster *c=clusters[i];  // one of the preselected clusters     
428       Double_t chi2=trackTOFin->GetPredictedChi2((AliCluster3D*)c); 
429       if (chi2 >= bestChi2) continue;
430       bestChi2=chi2;
431       bestCluster=c;
432       idclus=index[i];
433     }
434     
435     if (!bestCluster) {  // no matching , go to the next track 
436       fnunmatch++;
437       delete trackTOFin;
438       continue;
439     }
440
441     fnmatch++;
442
443     AliDebug(2, Form("%7i     %7i     %10i     %10i  %10i  %10i      %7i",
444                      iseed,
445                      fnmatch-1,
446                      TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()),
447                      bestCluster->GetLabel(0), 
448                      bestCluster->GetLabel(1), 
449                      bestCluster->GetLabel(2),
450                      idclus)); // AdC
451
452     bestCluster->Use(); 
453     if (
454         (bestCluster->GetLabel(0)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
455         ||
456         (bestCluster->GetLabel(1)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
457         ||
458         (bestCluster->GetLabel(2)==TMath::Abs(trackTOFin->GetLabel()))
459         ) {
460       fngoodmatch++;
461        AliDebug(2,Form(" track label good %5d",trackTOFin->GetLabel()));
462
463     }
464     else{
465       fnbadmatch++;
466       AliDebug(2,Form(" track label bad %5d",trackTOFin->GetLabel()));
467     }
468
469     //Propagate the track to the best matched cluster
470     trackTOFin->PropagateTo(bestCluster);
471
472     // Fill the track residual histograms.
473     FillResiduals(trackTOFin,bestCluster,kFALSE);
474
475     //now take the local distance in Z from the pad center for time walk correction
476     Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(bestCluster->GetDetInd(1),bestCluster->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
477     Double_t dzTW=trackTOFin->GetZ()-bestCluster->GetZ(); // in cm - in the ALICE RF -
478     dzTW/=TMath::Cos(tiltangle); // from ALICE/tracking RF to pad RF (1)
479     dzTW=-dzTW; // from ALICE/tracking RF to pad RF (2)
480     if (tiltangle!=0.) AliDebug(2,Form(" rho_track = %f --- rho_cluster = %f ",trackTOFin->GetX(),bestCluster->GetX()));
481
482     //update the ESD track and delete the TOFtrack
483     t->UpdateTrackParams(trackTOFin,AliESDtrack::kTOFout);
484
485     //  Store quantities to be used in the TOF Calibration
486     Float_t tToT=AliTOFGeometry::ToTBinWidth()*bestCluster->GetToT()*1E-3; // in ns
487     t->SetTOFsignalToT(tToT);
488     Float_t rawTime=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDCRAW()+kTimeOffset; // RAW time,in ps
489     t->SetTOFsignalRaw(rawTime);
490     t->SetTOFsignalDz(dzTW);
491
492
493     Float_t deltaY = trackTOFin->GetY()-bestCluster->GetY();
494
495     Float_t distR = (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX())*
496       (trackTOFin->GetX()-bestCluster->GetX());
497     distR+=deltaY*deltaY;
498     distR+=dzTW*dzTW;
499     distR = TMath::Sqrt(distR);
500     Float_t info[10] = {distR, deltaY, dzTW,
501                         0.,0.,0.,0.,0.,0.,0.};
502     t->SetTOFInfo(info);
503
504     Int_t ind[5];
505     ind[0]=bestCluster->GetDetInd(0);
506     ind[1]=bestCluster->GetDetInd(1);
507     ind[2]=bestCluster->GetDetInd(2);
508     ind[3]=bestCluster->GetDetInd(3);
509     ind[4]=bestCluster->GetDetInd(4);
510     Int_t calindex = AliTOFGeometry::GetIndex(ind);
511     t->SetTOFCalChannel(calindex);
512
513     // keep track of the track labels in the matched cluster
514     Int_t tlab[3];
515     tlab[0]=bestCluster->GetLabel(0);
516     tlab[1]=bestCluster->GetLabel(1);
517     tlab[2]=bestCluster->GetLabel(2);
518     AliDebug(2,Form(" tdc time of the matched track %6d = ",bestCluster->GetTDC()));    
519     Double_t tof=AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*bestCluster->GetTDC()+kTimeOffset; // in ps
520     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track: %f = ",tof));
521     Double_t tofcorr=tof;
522     if(timeWalkCorr)tofcorr=CorrectTimeWalk(dzTW,tof);
523     AliDebug(2,Form(" tof time of the matched track, after TW corr: %f = ",tofcorr));    
524     //Set TOF time signal and pointer to the matched cluster
525     t->SetTOFsignal(tofcorr);
526     t->SetTOFcluster(idclus); // pointing to the recPoints tree
527     t->SetTOFLabel(tlab);
528
529     AliDebug(2,Form(" Setting TOF raw time: %f  z distance: %f  corrected time: %f",rawTime,dzTW,tofcorr));
530
531     Double_t mom=t->GetP();
532     AliDebug(2,Form(" Momentum for track %d -> %f", iseed,mom));
533     // Fill Reco-QA histos for Reconstruction
534     fHRecNClus->Fill(nc);
535     fHRecChi2->Fill(bestChi2);
536     fHRecDistZ->Fill(dzTW);
537     fHRecSigYVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[0]));
538     fHRecSigZVsP->Fill(mom,TMath::Sqrt(cov[2]));
539     fHRecSigYVsPWin->Fill(mom,dphi*sensRadius);
540     fHRecSigZVsPWin->Fill(mom,dz);
541
542     // Fill Tree for on-the-fly offline Calibration
543     // no longer there - all info is in the ESDs now
544
545     delete trackTOFin;
546   }
547
548 }
549 //_________________________________________________________________________
550 Int_t AliTOFtrackerV1::LoadClusters(TTree *cTree) {
551   //--------------------------------------------------------------------
552   //This function loads the TOF clusters
553   //--------------------------------------------------------------------
554
555   Int_t npadX = AliTOFGeometry::NpadX();
556   Int_t npadZ = AliTOFGeometry::NpadZ();
557   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
558   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
559   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
560
561   TBranch *branch=cTree->GetBranch("TOF");
562   if (!branch) { 
563     AliError("can't get the branch with the TOF clusters !");
564     return 1;
565   }
566
567   static TClonesArray dummy("AliTOFcluster",10000);
568   dummy.Clear();
569   TClonesArray *clusters=&dummy;
570   branch->SetAddress(&clusters);
571
572   cTree->GetEvent(0);
573   Int_t nc=clusters->GetEntriesFast();
574   fHDigNClus->Fill(nc);
575
576   AliInfo(Form("Number of clusters: %d",nc));
577
578   for (Int_t i=0; i<nc; i++) {
579     AliTOFcluster *c=(AliTOFcluster*)clusters->UncheckedAt(i);
580     fClusters[i]=new AliTOFcluster(*c); fN++;
581
582   // Fill Digits QA histos
583  
584     Int_t isector = c->GetDetInd(0);
585     Int_t iplate = c->GetDetInd(1);
586     Int_t istrip = c->GetDetInd(2);
587     Int_t ipadX = c->GetDetInd(4);
588     Int_t ipadZ = c->GetDetInd(3);
589
590     Float_t time =(AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetTDC())*1E-3; // in ns
591     Float_t tot = (AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*c->GetToT())*1E-3;//in ns
592  
593     Int_t stripOffset = 0;
594     switch (iplate) {
595     case 0:
596       stripOffset = 0;
597       break;
598     case 1:
599       stripOffset = nStripC;
600       break;
601     case 2:
602       stripOffset = nStripC+nStripB;
603       break;
604     case 3:
605       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
606       break;
607     case 4:
608       stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
609       break;
610     default:
611       AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
612       break;
613     };
614     Int_t zindex=npadZ*(istrip+stripOffset)+(ipadZ+1);
615     Int_t phiindex=npadX*isector+ipadX+1;
616     fHDigClusMap->Fill(zindex,phiindex);
617     fHDigClusTime->Fill(time);
618     fHDigClusToT->Fill(tot);
619   }
620
621
622   return 0;
623 }
624 //_________________________________________________________________________
625 void AliTOFtrackerV1::UnloadClusters() {
626   //--------------------------------------------------------------------
627   //This function unloads TOF clusters
628   //--------------------------------------------------------------------
629   for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
630     delete fClusters[i];
631     fClusters[i] = 0x0;
632   }
633   fN=0;
634 }
635
636 //_________________________________________________________________________
637 Int_t AliTOFtrackerV1::FindClusterIndex(Double_t z) const {
638   //--------------------------------------------------------------------
639   // This function returns the index of the nearest cluster 
640   //--------------------------------------------------------------------
641   //MOD
642   //Here we need to get the Z in the tracking system
643
644   if (fN==0) return 0;
645   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
646   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
647   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
648   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
649     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
650     else e=m; 
651   }
652   return m;
653 }
654
655 //_________________________________________________________________________
656 Bool_t AliTOFtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const
657 {
658   // Get track space point with index i
659   // Coordinates are in the global system
660   AliTOFcluster *cl = fClusters[index];
661   Float_t xyz[3];
662   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
663   Float_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
664   Float_t phiangle = (Int_t(phi*TMath::RadToDeg()/20.)+0.5)*20.*TMath::DegToRad();
665   Float_t sinphi = TMath::Sin(phiangle), cosphi = TMath::Cos(phiangle);
666   Float_t tiltangle = AliTOFGeometry::GetAngles(cl->GetDetInd(1),cl->GetDetInd(2))*TMath::DegToRad();
667   Float_t sinth = TMath::Sin(tiltangle), costh = TMath::Cos(tiltangle);
668   Float_t sigmay2 = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
669   Float_t sigmaz2 = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
670   Float_t cov[6];
671   cov[0] = sinphi*sinphi*sigmay2 + cosphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
672   cov[1] = -sinphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*cosphi*sinth*sinth*sigmaz2;
673   cov[2] = -cosphi*sinth*costh*sigmaz2;
674   cov[3] = cosphi*cosphi*sigmay2 + sinphi*sinphi*sinth*sinth*sigmaz2;
675   cov[4] = -sinphi*sinth*costh*sigmaz2;
676   cov[5] = costh*costh*sigmaz2;
677   p.SetXYZ(xyz[0],xyz[1],xyz[2],cov);
678
679   // Detector numbering scheme
680   Int_t nSector = AliTOFGeometry::NSectors();
681   Int_t nPlate  = AliTOFGeometry::NPlates();
682   Int_t nStripA = AliTOFGeometry::NStripA();
683   Int_t nStripB = AliTOFGeometry::NStripB();
684   Int_t nStripC = AliTOFGeometry::NStripC();
685
686   Int_t isector = cl->GetDetInd(0);
687   if (isector >= nSector)
688     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
689   Int_t iplate = cl->GetDetInd(1);
690   if (iplate >= nPlate)
691     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
692   Int_t istrip = cl->GetDetInd(2);
693
694   Int_t stripOffset = 0;
695   switch (iplate) {
696   case 0:
697     stripOffset = 0;
698     break;
699   case 1:
700     stripOffset = nStripC;
701     break;
702   case 2:
703     stripOffset = nStripC+nStripB;
704     break;
705   case 3:
706     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
707     break;
708   case 4:
709     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
710     break;
711   default:
712     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
713     break;
714   };
715
716   Int_t idet = (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
717                stripOffset +
718                istrip;
719   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,idet);
720   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
721   return kTRUE;
722 }
723 //_________________________________________________________________________
724 void AliTOFtrackerV1::InitCheckHists() {
725
726   //Init histos for Digits/Reco QA and Calibration
727
728   TDirectory *dir = gDirectory;
729   TFile *logFileTOF = 0;
730
731   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
732   int n = list->GetEntries();
733   Bool_t isThere=kFALSE;
734   for(int i=0; i<n; i++) {
735     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
736     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
737       isThere=kTRUE;
738       break;
739     } 
740   }
741
742   if(!isThere)logFileTOF = new TFile( "TOFQA.root","RECREATE");
743   logFileTOF->cd(); 
744
745   //Digits "QA" 
746   fHDigClusMap = new TH2F("TOFDig_ClusMap", "",182,0.5,182.5,864, 0.5,864.5);  
747   fHDigNClus = new TH1F("TOFDig_NClus", "",200,0.5,200.5);  
748   fHDigClusTime = new TH1F("TOFDig_ClusTime", "",2000,0.,200.);  
749   fHDigClusToT = new TH1F("TOFDig_ClusToT", "",500,0.,100);  
750
751   //Reco "QA"
752   fHRecNClus =new TH1F("TOFRec_NClusW", "",50,0.5,50.5);
753   fHRecDistZ=new TH1F("TOFRec_DistZ", "",50,0.5,10.5);
754   fHRecChi2=new TH1F("TOFRec_Chi2", "",100,0.,10.);
755   fHRecSigYVsP=new TH2F("TOFDig_SigYVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
756   fHRecSigZVsP=new TH2F("TOFDig_SigZVsP", "",40,0.,4.,100, 0.,5.);
757   fHRecSigYVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigYVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
758   fHRecSigZVsPWin=new TH2F("TOFDig_SigZVsPWin", "",40,0.,4.,100, 0.,50.);
759
760   dir->cd();
761
762 }
763
764 //_________________________________________________________________________
765 void AliTOFtrackerV1::SaveCheckHists() {
766
767   //write histos for Digits/Reco QA and Calibration
768
769   TDirectory *dir = gDirectory;
770   TFile *logFile = 0;
771   TFile *logFileTOF = 0;
772
773   TSeqCollection *list = gROOT->GetListOfFiles();
774   int n = list->GetEntries();
775   for(int i=0; i<n; i++) {
776     logFile = (TFile*)list->At(i);
777     if (strstr(logFile->GetName(), "AliESDs.root")) break;
778   }
779
780   Bool_t isThere=kFALSE;
781   for(int i=0; i<n; i++) {
782     logFileTOF = (TFile*)list->At(i);
783     if (strstr(logFileTOF->GetName(), "TOFQA.root")){
784       isThere=kTRUE;
785       break;
786     } 
787   }
788    
789   if(!isThere) {
790           AliError(Form("File TOFQA.root not found!! not wring histograms...."));
791           return;
792   }
793   logFile->cd();
794   fHDigClusMap->Write(fHDigClusMap->GetName(), TObject::kOverwrite);
795   fHDigNClus->Write(fHDigNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
796   fHDigClusTime->Write(fHDigClusTime->GetName(), TObject::kOverwrite);
797   fHDigClusToT->Write(fHDigClusToT->GetName(), TObject::kOverwrite);
798   fHRecNClus->Write(fHRecNClus->GetName(), TObject::kOverwrite);
799   fHRecChi2->Write(fHRecChi2->GetName(), TObject::kOverwrite);
800   fHRecDistZ->Write(fHRecDistZ->GetName(), TObject::kOverwrite);
801   fHRecSigYVsP->Write(fHRecSigYVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
802   fHRecSigZVsP->Write(fHRecSigZVsP->GetName(), TObject::kOverwrite);
803   fHRecSigYVsPWin->Write(fHRecSigYVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
804   fHRecSigZVsPWin->Write(fHRecSigZVsPWin->GetName(), TObject::kOverwrite);
805   logFile->Flush();  
806
807   dir->cd();
808
809   }
810 //_________________________________________________________________________
811 Float_t AliTOFtrackerV1::CorrectTimeWalk( Float_t dist, Float_t tof) {
812
813   //dummy, for the moment
814   Float_t tofcorr=0.;
815   if(dist<AliTOFGeometry::ZPad()*0.5){
816     tofcorr=tof;
817     //place here the actual correction
818   }else{
819     tofcorr=tof; 
820   } 
821   return tofcorr;
822 }
823 //_________________________________________________________________________
824 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromT0(AliESDEvent *event) const {
825
826   //Returns TimeZero as measured by T0 detector
827
828   return event->GetT0();
829 }
830 //_________________________________________________________________________
831 Float_t AliTOFtrackerV1::GetTimeZerofromTOF(AliESDEvent * /*event*/) const {
832
833   //dummy, for the moment. T0 algorithm using tracks on TOF
834   {
835     //place T0 algo here...
836   }
837   return 0.;
838 }
839 //_________________________________________________________________________
840
841 void AliTOFtrackerV1::FillClusterArray(TObjArray* arr) const
842 {
843   //
844   // Returns the TOF cluster array
845   //
846
847   if (fN==0)
848     arr = 0x0;
849   else
850     for (Int_t i=0; i<fN; ++i) arr->Add(fClusters[i]);
851
852 }