TPC/AliTPC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 //                                                                           //
  20 //  Time Projection Chamber                                                  //
  21 //  This class contains the basic functions for the Time Projection Chamber  //
  22 //  detector. Functions specific to one particular geometry are              //
  23 //  contained in the derived classes                                         //
  24 //                                                                           //
  25 //Begin_Html
  26 /*
  27 <img src="picts/AliTPCClass.gif">
  28 */
  29 //End_Html
  30 //                                                                           //
  31 //                                                                          //
  32 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  33
  34 //
  35
  36 #include <Riostream.h>
  37 #include <stdlib.h>
  38
  39 #include <TFile.h>
  40 #include <TGeometry.h>
  41 #include <TInterpreter.h>
  42 #include <TMath.h>
  43 #include <TMatrixF.h>
  44 #include <TVector.h>
  45 #include <TNode.h>
  46 #include <TObjectTable.h>
  47 #include <TParticle.h>
  48 #include <TROOT.h>
  49 #include <TRandom.h>
  50 #include <TSystem.h>
  51 #include <TTUBS.h>
  52 #include <TTree.h>
  53 #include <TVirtualMC.h>
  54 #include <TString.h>
  55 #include <TF2.h>
  56 #include <TStopwatch.h>
  57
  58 #include "AliDigits.h"
  59 #include "AliMagF.h"
  60 #include "AliPoints.h"
  61 #include "AliRun.h"
  62 #include "AliRunLoader.h"
  63 #include "AliSimDigits.h"
  64 #include "AliTPC.h"
  65 #include "AliTPC.h"
  66 #include "AliTPCDigitsArray.h"
  67 #include "AliTPCLoader.h"
  68 #include "AliTPCPRF2D.h"
  69 #include "AliTPCParamSR.h"
  70 #include "AliTPCRF1D.h"
  71 //#include "AliTPCTrackHits.h"
  72 #include "AliTPCTrackHitsV2.h"
  73 #include "AliTrackReference.h"
  74 #include "AliMC.h"
  75 #include "AliTPCDigitizer.h"
  76 #include "AliTPCBuffer.h"
  77 #include "AliTPCDDLRawData.h"
  78 #include "AliLog.h"
  79
  80
  81 ClassImp(AliTPC)
  82 //_____________________________________________________________________________
  83 AliTPC::AliTPC()
  84 {
  85   //
  86   // Default constructor
  87   //
  88   fIshunt   = 0;
  89   fHits     = 0;
  90   fDigits   = 0;
  91   fNsectors = 0;
  92   fDigitsArray = 0;
  93   fDefaults = 0;
  94   fTrackHits = 0;
  95   //  fTrackHitsOld = 0;
  96 #if ROOT_VERSION_CODE >= ROOT_VERSION(4,0,1)
  97   fHitType = 4; // ROOT containers
  98 #else
  99   fHitType = 2; //default CONTAINERS - based on ROOT structure
 100 #endif
 101   fTPCParam = 0;
 102   fNoiseTable = 0;
 103   fActiveSectors =0;
 104   fSens = 0;
 105
 106 }
 107
 108 //_____________________________________________________________________________
 109 AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
 110       : AliDetector(name,title)
 111 {
 112   //
 113   // Standard constructor
 114   //
 115
 116   //
 117   // Initialise arrays of hits and digits
 118   fHits     = new TClonesArray("AliTPChit",  176);
 119   gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 120   fDigitsArray = 0;
 121   fDefaults = 0;
 122   //
 123   fTrackHits = new AliTPCTrackHitsV2;
 124   fTrackHits->SetHitPrecision(0.002);
 125   fTrackHits->SetStepPrecision(0.003);
 126   fTrackHits->SetMaxDistance(100);
 127
 128   //fTrackHitsOld = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
 129   //fTrackHitsOld->SetHitPrecision(0.002);
 130   //fTrackHitsOld->SetStepPrecision(0.003);
 131   //fTrackHitsOld->SetMaxDistance(100);
 132
 133   fNoiseTable =0;
 134
 135 #if ROOT_VERSION_CODE >= ROOT_VERSION(4,0,1)
 136   fHitType = 4; // ROOT containers
 137 #else
 138   fHitType = 2;
 139 #endif
 140   fActiveSectors = 0;
 141   //
 142   // Initialise counters
 143   fNsectors = 0;
 144
 145   //
 146   fIshunt     =  0;
 147   //
 148   // Initialise color attributes
 149   SetMarkerColor(kYellow);
 150
 151   //
 152   //  Set TPC parameters
 153   //
 154
 155
 156   if (!strcmp(title,"Default")) {
 157     fTPCParam = new AliTPCParamSR;
 158   } else {
 159     AliWarning("In Config.C you must set non-default parameters.");
 160     fTPCParam=0;
 161   }
 162   fSens = 0;
 163
 164 }
 165
 166 //_____________________________________________________________________________
 167 AliTPC::AliTPC(const AliTPC& t):AliDetector(t){
 168   //
 169   // dummy copy constructor
 170   //
 171 }
 172 AliTPC::~AliTPC()
 173 {
 174   //
 175   // TPC destructor
 176   //
 177
 178   fIshunt   = 0;
 179   delete fHits;
 180   delete fDigits;
 181   delete fTPCParam;
 182   delete fTrackHits; //MI 15.09.2000
 183   //  delete fTrackHitsOld; //MI 10.12.2001
 184   if (fNoiseTable) delete [] fNoiseTable;
 185
 186 }
 187
 188 //_____________________________________________________________________________
 189 void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
 190 {
 191   //
 192   // Add a hit to the list
 193   //
 194   if (fHitType&1){
 195     TClonesArray &lhits = *fHits;
 196     new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
 197   }
 198   if (fHitType>1)
 199     AddHit2(track,vol,hits);
 200 }
 201
 202 //_____________________________________________________________________________
 203 void AliTPC::BuildGeometry()
 204 {
 205
 206   //
 207   // Build TPC ROOT TNode geometry for the event display
 208   //
 209   TNode *nNode, *nTop;
 210   TTUBS *tubs;
 211   Int_t i;
 212   const int kColorTPC=19;
 213   char name[5], title[25];
 214   const Double_t kDegrad=TMath::Pi()/180;
 215   const Double_t kRaddeg=180./TMath::Pi();
 216
 217
 218   Float_t innerOpenAngle = fTPCParam->GetInnerAngle();
 219   Float_t outerOpenAngle = fTPCParam->GetOuterAngle();
 220
 221   Float_t innerAngleShift = fTPCParam->GetInnerAngleShift();
 222   Float_t outerAngleShift = fTPCParam->GetOuterAngleShift();
 223
 224   Int_t nLo = fTPCParam->GetNInnerSector()/2;
 225   Int_t nHi = fTPCParam->GetNOuterSector()/2;
 226
 227   const Double_t kloAng = (Double_t)TMath::Nint(innerOpenAngle*kRaddeg);
 228   const Double_t khiAng = (Double_t)TMath::Nint(outerOpenAngle*kRaddeg);
 229   const Double_t kloAngSh = (Double_t)TMath::Nint(innerAngleShift*kRaddeg);
 230   const Double_t khiAngSh = (Double_t)TMath::Nint(outerAngleShift*kRaddeg);
 231
 232
 233   const Double_t kloCorr = 1/TMath::Cos(0.5*kloAng*kDegrad);
 234   const Double_t khiCorr = 1/TMath::Cos(0.5*khiAng*kDegrad);
 235
 236   Double_t rl,ru;
 237
 238
 239   //
 240   // Get ALICE top node
 241   //
 242
 243   nTop=gAlice->GetGeometry()->GetNode("alice");
 244
 245   //  inner sectors
 246
 247   rl = fTPCParam->GetInnerRadiusLow();
 248   ru = fTPCParam->GetInnerRadiusUp();
 249
 250
 251   for(i=0;i<nLo;i++) {
 252     sprintf(name,"LS%2.2d",i);
 253     name[4]='\0';
 254     sprintf(title,"TPC low sector %3d",i);
 255     title[24]='\0';
 256
 257     tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*kloCorr,ru*kloCorr,250.,
 258                      kloAng*(i-0.5)+kloAngSh,kloAng*(i+0.5)+kloAngSh);
 259     tubs->SetNumberOfDivisions(1);
 260     nTop->cd();
 261     nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
 262     nNode->SetLineColor(kColorTPC);
 263     fNodes->Add(nNode);
 264   }
 265
 266   // Outer sectors
 267
 268   rl = fTPCParam->GetOuterRadiusLow();
 269   ru = fTPCParam->GetOuterRadiusUp();
 270
 271   for(i=0;i<nHi;i++) {
 272     sprintf(name,"US%2.2d",i);
 273     name[4]='\0';
 274     sprintf(title,"TPC upper sector %d",i);
 275     title[24]='\0';
 276     tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*khiCorr,ru*khiCorr,250,
 277                      khiAng*(i-0.5)+khiAngSh,khiAng*(i+0.5)+khiAngSh);
 278     tubs->SetNumberOfDivisions(1);
 279     nTop->cd();
 280     nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
 281     nNode->SetLineColor(kColorTPC);
 282     fNodes->Add(nNode);
 283   }
 284
 285 }
 286
 287 //_____________________________________________________________________________
 288 void AliTPC::CreateMaterials()
 289 {
 290   //-----------------------------------------------
 291   // Create Materials for for TPC simulations
 292   //-----------------------------------------------
 293
 294   //-----------------------------------------------------------------
 295   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
 296   //-----------------------------------------------------------------
 297
 298    Int_t iSXFLD=gAlice->Field()->Integ();
 299   Float_t sXMGMX=gAlice->Field()->Max();
 300
 301   Float_t amat[5]; // atomic numbers
 302   Float_t zmat[5]; // z
 303   Float_t wmat[5]; // proportions
 304
 305   Float_t density;
 306
 307
 308
 309   //***************** Gases *************************
 310
 311
 312   //--------------------------------------------------------------
 313   // gases - air and CO2
 314   //--------------------------------------------------------------
 315
 316   // CO2
 317
 318   amat[0]=12.011;
 319   amat[1]=15.9994;
 320
 321   zmat[0]=6.;
 322   zmat[1]=8.;
 323
 324   wmat[0]=0.2729;
 325   wmat[1]=0.7271;
 326
 327   density=0.001977;
 328
 329
 330   AliMixture(10,"CO2",amat,zmat,density,2,wmat);
 331   //
 332   // Air
 333   //
 334   amat[0]=15.9994;
 335   amat[1]=14.007;
 336   //
 337   zmat[0]=8.;
 338   zmat[1]=7.;
 339   //
 340   wmat[0]=0.233;
 341   wmat[1]=0.767;
 342   //
 343   density=0.001205;
 344
 345   AliMixture(11,"Air",amat,zmat,density,2,wmat);
 346
 347   //----------------------------------------------------------------
 348   // drift gases
 349   //----------------------------------------------------------------
 350
 351
 352   // Drift gases 1 - nonsensitive, 2 - sensitive
 353   // Ne-CO2-N (85-10-5)
 354
 355   amat[0]= 20.18;
 356   amat[1]=12.011;
 357   amat[2]=15.9994;
 358   amat[3]=14.007;
 359
 360   zmat[0]= 10.;
 361   zmat[1]=6.;
 362   zmat[2]=8.;
 363   zmat[3]=7.;
 364
 365   wmat[0]=0.7707;
 366   wmat[1]=0.0539;
 367   wmat[2]=0.1438;
 368   wmat[3]=0.0316;
 369
 370   density=0.0010252;
 371
 372   AliMixture(12,"Ne-CO2-N-1",amat,zmat,density,4,wmat);
 373   AliMixture(13,"Ne-CO2-N-2",amat,zmat,density,4,wmat);
 374
 375   //----------------------------------------------------------------------
 376   //               solid materials
 377   //----------------------------------------------------------------------
 378
 379
 380   // Kevlar C14H22O2N2
 381
 382   amat[0] = 12.011;
 383   amat[1] = 1.;
 384   amat[2] = 15.999;
 385   amat[3] = 14.006;
 386
 387   zmat[0] = 6.;
 388   zmat[1] = 1.;
 389   zmat[2] = 8.;
 390   zmat[3] = 7.;
 391
 392   wmat[0] = 14.;
 393   wmat[1] = 22.;
 394   wmat[2] = 2.;
 395   wmat[3] = 2.;
 396
 397   density = 1.45;
 398
 399   AliMixture(14,"Kevlar",amat,zmat,density,-4,wmat);
 400
 401   // NOMEX
 402
 403   amat[0] = 12.011;
 404   amat[1] = 1.;
 405   amat[2] = 15.999;
 406   amat[3] = 14.006;
 407
 408   zmat[0] = 6.;
 409   zmat[1] = 1.;
 410   zmat[2] = 8.;
 411   zmat[3] = 7.;
 412
 413   wmat[0] = 14.;
 414   wmat[1] = 22.;
 415   wmat[2] = 2.;
 416   wmat[3] = 2.;
 417
 418   density = 0.029;
 419
 420   AliMixture(15,"NOMEX",amat,zmat,density,-4,wmat);
 421
 422   // Makrolon C16H18O3
 423
 424   amat[0] = 12.011;
 425   amat[1] = 1.;
 426   amat[2] = 15.999;
 427
 428   zmat[0] = 6.;
 429   zmat[1] = 1.;
 430   zmat[2] = 8.;
 431
 432   wmat[0] = 16.;
 433   wmat[1] = 18.;
 434   wmat[2] = 3.;
 435
 436   density = 1.2;
 437
 438   AliMixture(16,"Makrolon",amat,zmat,density,-3,wmat);
 439
 440   // Tedlar C2H3F
 441
 442   amat[0] = 12.011;
 443   amat[1] = 1.;
 444   amat[2] = 18.998;
 445
 446   zmat[0] = 6.;
 447   zmat[1] = 1.;
 448   zmat[2] = 9.;
 449
 450   wmat[0] = 2.;
 451   wmat[1] = 3.;
 452   wmat[2] = 1.;
 453
 454   density = 1.71;
 455
 456   AliMixture(17, "Tedlar",amat,zmat,density,-3,wmat);
 457
 458   // Mylar C5H4O2
 459
 460   amat[0]=12.011;
 461   amat[1]=1.;
 462   amat[2]=15.9994;
 463
 464   zmat[0]=6.;
 465   zmat[1]=1.;
 466   zmat[2]=8.;
 467
 468   wmat[0]=5.;
 469   wmat[1]=4.;
 470   wmat[2]=2.;
 471
 472   density = 1.39;
 473
 474   AliMixture(18, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat);
 475   // material for "prepregs"
 476   // Epoxy - C14 H20 O3
 477   // Quartz SiO2
 478   // Carbon C
 479   // prepreg1 60% C-fiber, 40% epoxy (vol)
 480   amat[0]=12.011;
 481   amat[1]=1.;
 482   amat[2]=15.994;
 483
 484   zmat[0]=6.;
 485   zmat[1]=1.;
 486   zmat[2]=8.;
 487
 488   wmat[0]=0.923;
 489   wmat[1]=0.023;
 490   wmat[2]=0.054;
 491
 492   density=1.859;
 493
 494   AliMixture(19, "Prepreg1",amat,zmat,density,3,wmat);
 495
 496   //prepreg2 60% glass-fiber, 40% epoxy
 497
 498   amat[0]=12.01;
 499   amat[1]=1.;
 500   amat[2]=15.994;
 501   amat[3]=28.086;
 502
 503   zmat[0]=6.;
 504   zmat[1]=1.;
 505   zmat[2]=8.;
 506   zmat[3]=14.;
 507
 508   wmat[0]=0.194;
 509   wmat[1]=0.023;
 510   wmat[2]=0.443;
 511   wmat[3]=0.340;
 512
 513   density=1.82;
 514
 515   AliMixture(20, "Prepreg2",amat,zmat,density,4,wmat);
 516
 517   //prepreg3 50% glass-fiber, 50% epoxy
 518
 519   amat[0]=12.01;
 520   amat[1]=1.;
 521   amat[2]=15.994;
 522   amat[3]=28.086;
 523
 524   zmat[0]=6.;
 525   zmat[1]=1.;
 526   zmat[2]=8.;
 527   zmat[3]=14.;
 528
 529   wmat[0]=0.225;
 530   wmat[1]=0.03;
 531   wmat[2]=0.443;
 532   wmat[3]=0.3;
 533
 534   density=1.163;
 535
 536   AliMixture(21, "Prepreg3",amat,zmat,density,4,wmat);
 537
 538   // G10 60% SiO2 40% epoxy
 539
 540   amat[0]=12.01;
 541   amat[1]=1.;
 542   amat[2]=15.994;
 543   amat[3]=28.086;
 544
 545   zmat[0]=6.;
 546   zmat[1]=1.;
 547   zmat[2]=8.;
 548   zmat[3]=14.;
 549
 550   wmat[0]=0.194;
 551   wmat[1]=0.023;
 552   wmat[2]=0.443;
 553   wmat[3]=0.340;
 554
 555   density=1.7;
 556
 557   AliMixture(22, "G10",amat,zmat,density,4,wmat);
 558
 559   // Al
 560
 561   amat[0] = 26.98;
 562   zmat[0] = 13.;
 563
 564   density = 2.7;
 565
 566   AliMaterial(23,"Al",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 567
 568   // Si (for electronics
 569
 570   amat[0] = 28.086;
 571   zmat[0] = 14.;
 572
 573   density = 2.33;
 574
 575   AliMaterial(24,"Si",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 576
 577   // Cu
 578
 579   amat[0] = 63.546;
 580   zmat[0] = 29.;
 581
 582   density = 8.96;
 583
 584   AliMaterial(25,"Cu",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 585
 586   // Epoxy - C14 H20 O3
 587
 588   amat[0]=12.011;
 589   amat[1]=1.;
 590   amat[2]=15.9994;
 591
 592   zmat[0]=6.;
 593   zmat[1]=1.;
 594   zmat[2]=8.;
 595
 596   wmat[0]=14.;
 597   wmat[1]=20.;
 598   wmat[2]=3.;
 599
 600   density=1.25;
 601
 602   AliMixture(26,"Epoxy",amat,zmat,density,-3,wmat);
 603
 604   // Plexiglas  C5H8O2
 605
 606   amat[0]=12.011;
 607   amat[1]=1.;
 608   amat[2]=15.9994;
 609
 610   zmat[0]=6.;
 611   zmat[1]=1.;
 612   zmat[2]=8.;
 613
 614   wmat[0]=5.;
 615   wmat[1]=8.;
 616   wmat[2]=2.;
 617
 618   density=1.18;
 619
 620   AliMixture(27,"Plexiglas",amat,zmat,density,-3,wmat);
 621
 622   // Carbon
 623
 624   amat[0]=12.011;
 625   zmat[0]=6.;
 626   density= 2.265;
 627
 628   AliMaterial(28,"C",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 629
 630   // Fe (steel for the inner heat screen)
 631
 632   amat[0]=55.845;
 633
 634   zmat[0]=26.;
 635
 636   density=7.87;
 637
 638   AliMaterial(29,"Fe",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 639
 640   //----------------------------------------------------------
 641   // tracking media for gases
 642   //----------------------------------------------------------
 643
 644   AliMedium(0, "Air", 11, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .01, .1);
 645   AliMedium(1, "Ne-CO2-N-1", 12, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
 646   AliMedium(2, "Ne-CO2-N-2", 13, 1, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
 647   AliMedium(3,"CO2",10,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
 648
 649   //-----------------------------------------------------------
 650   // tracking media for solids
 651   //-----------------------------------------------------------
 652
 653   AliMedium(4,"Al",23,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
 654   AliMedium(5,"Kevlar",14,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
 655   AliMedium(6,"Nomex",15,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
 656   AliMedium(7,"Makrolon",16,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
 657   AliMedium(8,"Mylar",18,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
 658   AliMedium(9,"Tedlar",17,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
 659   //
 660   AliMedium(10,"Prepreg1",19,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
 661   AliMedium(11,"Prepreg2",20,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
 662   AliMedium(12,"Prepreg3",21,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
 663   AliMedium(13,"Epoxy",26,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
 664
 665   AliMedium(14,"Cu",25,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
 666   AliMedium(15,"Si",24,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
 667   AliMedium(16,"G10",22,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
 668   AliMedium(17,"Plexiglas",27,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
 669   AliMedium(18,"Steel",29,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
 670
 671 }
 672
 673 void AliTPC::GenerNoise(Int_t tablesize)
 674 {
 675   //
 676   //Generate table with noise
 677   //
 678   if (fTPCParam==0) {
 679     // error message
 680     fNoiseDepth=0;
 681     return;
 682   }
 683   if (fNoiseTable)  delete[] fNoiseTable;
 684   fNoiseTable = new Float_t[tablesize];
 685   fNoiseDepth = tablesize;
 686   fCurrentNoise =0; //!index of the noise in  the noise table
 687
 688   Float_t norm = fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac();
 689   for (Int_t i=0;i<tablesize;i++) fNoiseTable[i]= gRandom->Gaus(0,norm);
 690 }
 691
 692 Float_t AliTPC::GetNoise()
 693 {
 694   // get noise from table
 695   //  if ((fCurrentNoise%10)==0)
 696   //  fCurrentNoise= gRandom->Rndm()*fNoiseDepth;
 697   if (fCurrentNoise>=fNoiseDepth) fCurrentNoise=0;
 698   return fNoiseTable[fCurrentNoise++];
 699   //gRandom->Gaus(0, fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac());
 700 }
 701
 702
 703 Bool_t  AliTPC::IsSectorActive(Int_t sec) const
 704 {
 705   //
 706   // check if the sector is active
 707   if (!fActiveSectors) return kTRUE;
 708   else return fActiveSectors[sec];
 709 }
 710
 711 void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t * sectors, Int_t n)
 712 {
 713   // activate interesting sectors
 714   SetTreeAddress();//just for security
 715   if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
 716   fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
 717   for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
 718   for (Int_t i=0;i<n;i++)
 719     if ((sectors[i]>=0) && sectors[i]<fTPCParam->GetNSector())  fActiveSectors[sectors[i]]=kTRUE;
 720
 721 }
 722
 723 void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t flag)
 724 {
 725   //
 726   // activate sectors which were hitted by tracks
 727   //loop over tracks
 728   SetTreeAddress();//just for security
 729   if (fHitType==0) return;  // if Clones hit - not short volume ID information
 730   if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
 731   fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
 732   if (flag) {
 733     for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kTRUE;
 734     return;
 735   }
 736   for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
 737   TBranch * branch=0;
 738   if (TreeH() == 0x0)
 739    {
 740      AliFatal("Can not find TreeH in folder");
 741      return;
 742    }
 743   if (fHitType>1) branch = TreeH()->GetBranch("TPC2");
 744   else branch = TreeH()->GetBranch("TPC");
 745   Stat_t ntracks = TreeH()->GetEntries();
 746   // loop over all hits
 747   AliDebug(1,Form("Got %d tracks",ntracks));
 748
 749   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++) {
 750     ResetHits();
 751     //
 752     if (fTrackHits && fHitType&4) {
 753       TBranch * br1 = TreeH()->GetBranch("fVolumes");
 754       TBranch * br2 = TreeH()->GetBranch("fNVolumes");
 755       br1->GetEvent(track);
 756       br2->GetEvent(track);
 757       Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
 758       for (Int_t j=0;j<fTrackHits->GetNVolumes(); j++)
 759         fActiveSectors[volumes[j]]=kTRUE;
 760     }
 761
 762     //
 763 //     if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
 764 //       TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
 765 //       br->GetEvent(track);
 766 //       AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
 767 //       for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
 768 //      fActiveSectors[((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID] =kTRUE;
 769 //       }
 770 //     }
 771   }
 772 }
 773
 774
 775
 776
 777 //_____________________________________________________________________________
 778 void AliTPC::Digits2Raw()
 779 {
 780 // convert digits of the current event to raw data
 781
 782   static const Int_t kThreshold = 0;
 783
 784   fLoader->LoadDigits();
 785   TTree* digits = fLoader->TreeD();
 786   if (!digits) {
 787     AliError("No digits tree");
 788     return;
 789   }
 790
 791   AliSimDigits digarr;
 792   AliSimDigits* digrow = &digarr;
 793   digits->GetBranch("Segment")->SetAddress(&digrow);
 794
 795   const char* fileName = "AliTPCDDL.dat";
 796   AliTPCBuffer* buffer  = new AliTPCBuffer(fileName);
 797   //Verbose level
 798   // 0: Silent
 799   // 1: cout messages
 800   // 2: txt files with digits
 801   //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
 802   //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
 803   //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
 804   //quickly several MB wasting time and disk space.
 805   buffer->SetVerbose(0);
 806
 807   Int_t nEntries = Int_t(digits->GetEntries());
 808   Int_t previousSector = -1;
 809   Int_t subSector = 0;
 810   for (Int_t i = 0; i < nEntries; i++) {
 811     digits->GetEntry(i);
 812     Int_t sector, row;
 813     fTPCParam->AdjustSectorRow(digarr.GetID(), sector, row);
 814     if(previousSector != sector) {
 815       subSector = 0;
 816       previousSector = sector;
 817     }
 818
 819     if (sector < 36) { //inner sector [0;35]
 820       if (row != 30) {
 821         //the whole row is written into the output file
 822         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 0, 0, 0,
 823                                sector, subSector, row);
 824       } else {
 825         //only the pads in the range [37;48] are written into the output file
 826         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 37, 48, 1,
 827                                sector, subSector, row);
 828         subSector = 1;
 829         //only the pads outside the range [37;48] are written into the output file
 830         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 37, 48, 2,
 831                                sector, subSector, row);
 832       }//end else
 833
 834     } else { //outer sector [36;71]
 835       if (row == 54) subSector = 2;
 836       if ((row != 27) && (row != 76)) {
 837         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 0, 0, 0,
 838                                sector, subSector, row);
 839       } else if (row == 27) {
 840         //only the pads outside the range [43;46] are written into the output file
 841         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 43, 46, 2,
 842                                  sector, subSector, row);
 843         subSector = 1;
 844         //only the pads in the range [43;46] are written into the output file
 845         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 43, 46, 1,
 846                                  sector, subSector, row);
 847       } else if (row == 76) {
 848         //only the pads outside the range [33;88] are written into the output file
 849         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 33, 88, 2,
 850                                sector, subSector, row);
 851         subSector = 3;
 852         //only the pads in the range [33;88] are written into the output file
 853         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 33, 88, 1,
 854                                  sector, subSector, row);
 855       }
 856     }//end else
 857   }//end for
 858
 859   delete buffer;
 860   fLoader->UnloadDigits();
 861
 862   AliTPCDDLRawData rawWriter;
 863   rawWriter.SetVerbose(0);
 864
 865   rawWriter.RawData(fileName);
 866   gSystem->Unlink(fileName);
 867
 868 }
 869
 870
 871
 872 //______________________________________________________________________
 873 AliDigitizer* AliTPC::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
 874 {
 875   return new AliTPCDigitizer(manager);
 876 }
 877 //__
 878 void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t /*eventnumber*/)
 879 {
 880   //create digits from summable digits
 881   GenerNoise(500000); //create teble with noise
 882
 883   //conect tree with sSDigits
 884   TTree *t = fLoader->TreeS();
 885
 886   if (t == 0x0) {
 887     fLoader->LoadSDigits("READ");
 888     t = fLoader->TreeS();
 889     if (t == 0x0) {
 890       AliError("Can not get input TreeS");
 891       return;
 892     }
 893   }
 894
 895   if (fLoader->TreeD() == 0x0) fLoader->MakeTree("D");
 896
 897   AliSimDigits digarr, *dummy=&digarr;
 898   TBranch* sdb = t->GetBranch("Segment");
 899   if (sdb == 0x0) {
 900     AliError("Can not find branch with segments in TreeS.");
 901     return;
 902   }
 903
 904   sdb->SetAddress(&dummy);
 905
 906   Stat_t nentries = t->GetEntries();
 907
 908   // set zero suppression
 909
 910   fTPCParam->SetZeroSup(2);
 911
 912   // get zero suppression
 913
 914   Int_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
 915
 916   //make tree with digits
 917
 918   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray;
 919   arr->SetClass("AliSimDigits");
 920   arr->Setup(fTPCParam);
 921   arr->MakeTree(fLoader->TreeD());
 922
 923   AliTPCParam * par = fTPCParam;
 924
 925   //Loop over segments of the TPC
 926
 927   for (Int_t n=0; n<nentries; n++) {
 928     t->GetEvent(n);
 929     Int_t sec, row;
 930     if (!par->AdjustSectorRow(digarr.GetID(),sec,row)) {
 931       AliWarning(Form("Invalid segment ID ! %d",digarr.GetID()));
 932       continue;
 933     }
 934     if (!IsSectorActive(sec)) continue;
 935
 936     AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
 937     Int_t nrows = digrow->GetNRows();
 938     Int_t ncols = digrow->GetNCols();
 939
 940     digrow->ExpandBuffer();
 941     digarr.ExpandBuffer();
 942     digrow->ExpandTrackBuffer();
 943     digarr.ExpandTrackBuffer();
 944
 945
 946     Short_t * pamp0 = digarr.GetDigits();
 947     Int_t   * ptracks0 = digarr.GetTracks();
 948     Short_t * pamp1 = digrow->GetDigits();
 949     Int_t   * ptracks1 = digrow->GetTracks();
 950     Int_t  nelems =nrows*ncols;
 951     Int_t saturation = fTPCParam->GetADCSat();
 952     //use internal structure of the AliDigits - for speed reason
 953     //if you cahnge implementation
 954     //of the Alidigits - it must be rewriten -
 955     for (Int_t i= 0; i<nelems; i++){
 956       Float_t q = TMath::Nint(Float_t(*pamp0)/16.+GetNoise());
 957       if (q>zerosup){
 958         if (q>saturation) q=saturation;
 959         *pamp1=(Short_t)q;
 960
 961         ptracks1[0]=ptracks0[0];
 962         ptracks1[nelems]=ptracks0[nelems];
 963         ptracks1[2*nelems]=ptracks0[2*nelems];
 964       }
 965       pamp0++;
 966       pamp1++;
 967       ptracks0++;
 968       ptracks1++;
 969     }
 970
 971     arr->StoreRow(sec,row);
 972     arr->ClearRow(sec,row);
 973   }
 974
 975
 976   //write results
 977   fLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
 978
 979   delete arr;
 980 }
 981 //__________________________________________________________________
 982 void AliTPC::SetDefaults(){
 983   //
 984   // setting the defaults
 985   //
 986
 987   // Set response functions
 988
 989   //
 990   AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::GetRunLoaderName());
 991   rl->CdGAFile();
 992   AliTPCParamSR *param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60");
 993   if(param){
 994     AliInfo("You are using 2 pad-length geom hits with 3 pad-lenght geom digits...");
 995     delete param;
 996     param = new AliTPCParamSR();
 997   }
 998   else {
 999     param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60");
1000   }
1001   if(!param){
1002     AliFatal("No TPC parameters found");
1003   }
1004
1005
1006   AliTPCPRF2D    * prfinner   = new AliTPCPRF2D;
1007   AliTPCPRF2D    * prfouter1   = new AliTPCPRF2D;
1008   AliTPCPRF2D    * prfouter2   = new AliTPCPRF2D;
1009   AliTPCRF1D     * rf    = new AliTPCRF1D(kTRUE);
1010   rf->SetGauss(param->GetZSigma(),param->GetZWidth(),1.);
1011   rf->SetOffset(3*param->GetZSigma());
1012   rf->Update();
1013
1014   TDirectory *savedir=gDirectory;
1015   TFile *f=TFile::Open("$ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root");
1016   if (!f->IsOpen())
1017     AliFatal("Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !");
1018
1019   TString s;
1020   prfinner->Read("prf_07504_Gati_056068_d02");
1021   //PH Set different names
1022   s=prfinner->GetGRF()->GetName();
1023   s+="in";
1024   prfinner->GetGRF()->SetName(s.Data());
1025
1026   prfouter1->Read("prf_10006_Gati_047051_d03");
1027   s=prfouter1->GetGRF()->GetName();
1028   s+="out1";
1029   prfouter1->GetGRF()->SetName(s.Data());
1030
1031   prfouter2->Read("prf_15006_Gati_047051_d03");
1032   s=prfouter2->GetGRF()->GetName();
1033   s+="out2";
1034   prfouter2->GetGRF()->SetName(s.Data());
1035
1036   f->Close();
1037   savedir->cd();
1038
1039   param->SetInnerPRF(prfinner);
1040   param->SetOuter1PRF(prfouter1);
1041   param->SetOuter2PRF(prfouter2);
1042   param->SetTimeRF(rf);
1043
1044   // set fTPCParam
1045
1046   SetParam(param);
1047
1048
1049   fDefaults = 1;
1050
1051 }
1052 //__________________________________________________________________
1053 void AliTPC::Hits2Digits()
1054 {
1055   //
1056   // creates digits from hits
1057   //
1058   if (!fTPCParam->IsGeoRead()){
1059     //
1060     // read transformation matrices for gGeoManager
1061     //
1062     fTPCParam->ReadGeoMatrices();
1063   }
1064
1065   fLoader->LoadHits("read");
1066   fLoader->LoadDigits("recreate");
1067   AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader();
1068
1069   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1070     runLoader->GetEvent(iEvent);
1071     SetActiveSectors();
1072     Hits2Digits(iEvent);
1073   }
1074
1075   fLoader->UnloadHits();
1076   fLoader->UnloadDigits();
1077 }
1078 //__________________________________________________________________
1079 void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)
1080 {
1081  //----------------------------------------------------
1082  // Loop over all sectors for a single event
1083  //----------------------------------------------------
1084   AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::GetRunLoaderName());
1085   rl->GetEvent(eventnumber);
1086   if (fLoader->TreeH() == 0x0) {
1087     if(fLoader->LoadHits()) {
1088       AliError("Can not load hits.");
1089     }
1090   }
1091   SetTreeAddress();
1092
1093   if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) {
1094     fLoader->MakeTree("D");
1095     if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) {
1096       AliError("Can not get TreeD");
1097       return;
1098     }
1099   }
1100
1101   if(fDefaults == 0) SetDefaults();  // check if the parameters are set
1102   GenerNoise(500000); //create teble with noise
1103
1104   //setup TPCDigitsArray
1105
1106   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
1107
1108   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray;
1109   arr->SetClass("AliSimDigits");
1110   arr->Setup(fTPCParam);
1111
1112   arr->MakeTree(fLoader->TreeD());
1113   SetDigitsArray(arr);
1114
1115   fDigitsSwitch=0; // standard digits
1116
1117   for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++)
1118     if (IsSectorActive(isec)) {
1119       AliDebug(1,Form("Hits2Digits","Sector %d is active.",isec));
1120       Hits2DigitsSector(isec);
1121     }
1122     else {
1123       AliDebug(1,Form("Hits2Digits","Sector %d is NOT active.",isec));
1124     }
1125
1126   fLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
1127
1128 //this line prevents the crash in the similar one
1129 //on the beginning of this method
1130 //destructor attempts to reset the tree, which is deleted by the loader
1131 //need to be redesign
1132   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
1133   SetDigitsArray(0x0);
1134
1135 }
1136
1137 //__________________________________________________________________
1138 void AliTPC::Hits2SDigits2(Int_t eventnumber)
1139 {
1140
1141   //-----------------------------------------------------------
1142   //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
1143   //-----------------------------------------------------------
1144
1145   //----------------------------------------------------
1146   // Loop over all sectors for a single event
1147   //----------------------------------------------------
1148
1149   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
1150
1151   rl->GetEvent(eventnumber);
1152   if (fLoader->TreeH() == 0x0) {
1153     if(fLoader->LoadHits()) {
1154       AliError("Can not load hits.");
1155       return;
1156     }
1157   }
1158   SetTreeAddress();
1159
1160
1161   if (fLoader->TreeS() == 0x0 ) {
1162     fLoader->MakeTree("S");
1163   }
1164
1165   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
1166
1167   GenerNoise(500000); //create table with noise
1168   //setup TPCDigitsArray
1169
1170   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
1171
1172
1173   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray;
1174   arr->SetClass("AliSimDigits");
1175   arr->Setup(fTPCParam);
1176   arr->MakeTree(fLoader->TreeS());
1177
1178   SetDigitsArray(arr);
1179
1180   fDigitsSwitch=1; // summable digits
1181
1182     // set zero suppression to "0"
1183
1184   fTPCParam->SetZeroSup(0);
1185
1186   for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++)
1187     if (IsSectorActive(isec)) {
1188       Hits2DigitsSector(isec);
1189     }
1190
1191   fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
1192
1193 //this line prevents the crash in the similar one
1194 //on the beginning of this method
1195 //destructor attempts to reset the tree, which is deleted by the loader
1196 //need to be redesign
1197   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
1198   SetDigitsArray(0x0);
1199 }
1200 //__________________________________________________________________
1201
1202 void AliTPC::Hits2SDigits()
1203 {
1204
1205   //-----------------------------------------------------------
1206   //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
1207   //-----------------------------------------------------------
1208
1209   if (!fTPCParam->IsGeoRead()){
1210     //
1211     // read transformation matrices for gGeoManager
1212     //
1213     fTPCParam->ReadGeoMatrices();
1214   }
1215
1216   fLoader->LoadHits("read");
1217   fLoader->LoadSDigits("recreate");
1218   AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader();
1219
1220   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
1221     runLoader->GetEvent(iEvent);
1222     SetTreeAddress();
1223     SetActiveSectors();
1224     Hits2SDigits2(iEvent);
1225   }
1226
1227   fLoader->UnloadHits();
1228   fLoader->UnloadSDigits();
1229 }
1230 //_____________________________________________________________________________
1231
1232 void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
1233 {
1234   //-------------------------------------------------------------------
1235   // TPC conversion from hits to digits.
1236   //-------------------------------------------------------------------
1237
1238   //-----------------------------------------------------------------
1239   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
1240   //-----------------------------------------------------------------
1241
1242   //-------------------------------------------------------
1243   //  Get the access to the track hits
1244   //-------------------------------------------------------
1245
1246   // check if the parameters are set - important if one calls this method
1247   // directly, not from the Hits2Digits
1248
1249   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
1250
1251   TTree *tH = TreeH(); // pointer to the hits tree
1252   if (tH == 0x0) {
1253     AliFatal("Can not find TreeH in folder");
1254     return;
1255   }
1256
1257   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
1258
1259   if( ntracks > 0){
1260
1261   //-------------------------------------------
1262   //  Only if there are any tracks...
1263   //-------------------------------------------
1264
1265     TObjArray **row;
1266
1267     Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
1268
1269     row= new TObjArray* [nrows+2]; // 2 extra rows for cross talk
1270
1271     MakeSector(isec,nrows,tH,ntracks,row);
1272
1273     //--------------------------------------------------------
1274     //   Digitize this sector, row by row
1275     //   row[i] is the pointer to the TObjArray of TVectors,
1276     //   each one containing electrons accepted on this
1277     //   row, assigned into tracks
1278     //--------------------------------------------------------
1279
1280     Int_t i;
1281
1282     if (fDigitsArray->GetTree()==0) {
1283       AliFatal("Tree not set in fDigitsArray");
1284     }
1285
1286     for (i=0;i<nrows;i++){
1287
1288       AliDigits * dig = fDigitsArray->CreateRow(isec,i);
1289
1290       DigitizeRow(i,isec,row);
1291
1292       fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
1293
1294       Int_t ndig = dig->GetDigitSize();
1295
1296       AliDebug(10,
1297                Form("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",
1298                     isec,i,ndig));
1299
1300       fDigitsArray->ClearRow(isec,i);
1301
1302
1303     } // end of the sector digitization
1304
1305     for(i=0;i<nrows+2;i++){
1306       row[i]->Delete();
1307       delete row[i];
1308     }
1309
1310     delete [] row; // delete the array of pointers to TObjArray-s
1311
1312   } // ntracks >0
1313
1314 } // end of Hits2DigitsSector
1315
1316
1317 //_____________________________________________________________________________
1318 void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
1319 {
1320   //-----------------------------------------------------------
1321   // Single row digitization, coupling from the neighbouring
1322   // rows taken into account
1323   //-----------------------------------------------------------
1324
1325   //-----------------------------------------------------------------
1326   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
1327   // Modified: Marian Ivanov GSI Darmstadt, m.ivanov@gsi.de
1328   //-----------------------------------------------------------------
1329
1330   Float_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
1331
1332   fCurrentIndex[1]= isec;
1333
1334
1335   Int_t nofPads = fTPCParam->GetNPads(isec,irow);
1336   Int_t nofTbins = fTPCParam->GetMaxTBin();
1337   Int_t indexRange[4];
1338   //
1339   //  Integrated signal for this row
1340   //  and a single track signal
1341   //
1342
1343   TMatrixF *m1 = new TMatrixF(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
1344   TMatrixF *m2 = new TMatrixF(0,nofPads,0,nofTbins); // single
1345   //
1346   TMatrixF &total  = *m1;
1347
1348   //  Array of pointers to the label-signal list
1349
1350   Int_t nofDigits = nofPads*nofTbins; // number of digits for this row
1351   Float_t  **pList = new Float_t* [nofDigits];
1352
1353   Int_t lp;
1354   Int_t i1;
1355   for(lp=0;lp<nofDigits;lp++)pList[lp]=0; // set all pointers to NULL
1356   //
1357   //calculate signal
1358   //
1359   Int_t row1=irow;
1360   Int_t row2=irow+2;
1361   for (Int_t row= row1;row<=row2;row++){
1362     Int_t nTracks= rows[row]->GetEntries();
1363     for (i1=0;i1<nTracks;i1++){
1364       fCurrentIndex[2]= row;
1365       fCurrentIndex[3]=irow+1;
1366       if (row==irow+1){
1367         m2->Zero();  // clear single track signal matrix
1368         Float_t trackLabel = GetSignal(rows[row],i1,m2,m1,indexRange);
1369         GetList(trackLabel,nofPads,m2,indexRange,pList);
1370       }
1371       else   GetSignal(rows[row],i1,0,m1,indexRange);
1372     }
1373   }
1374
1375   Int_t tracks[3];
1376
1377   AliDigits *dig = fDigitsArray->GetRow(isec,irow);
1378   Int_t gi=-1;
1379   Float_t fzerosup = zerosup+0.5;
1380   for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
1381     for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
1382       gi++;
1383       Float_t q=total(ip,it);
1384       if(fDigitsSwitch == 0){
1385         q+=GetNoise();
1386         if(q <=fzerosup) continue; // do not fill zeros
1387         q = TMath::Nint(q);
1388         if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
1389
1390       }
1391
1392       else {
1393         if(q <= 0.) continue; // do not fill zeros
1394         if(q>2000.) q=2000.;
1395         q *= 16.;
1396         q = TMath::Nint(q);
1397       }
1398
1399       //
1400       //  "real" signal or electronic noise (list = -1)?
1401       //
1402
1403       for(Int_t j1=0;j1<3;j1++){
1404         tracks[j1] = (pList[gi]) ?(Int_t)(*(pList[gi]+j1)) : -2;
1405       }
1406
1407 //Begin_Html
1408 /*
1409   <A NAME="AliDigits"></A>
1410   using of AliDigits object
1411 */
1412 //End_Html
1413       dig->SetDigitFast((Short_t)q,it,ip);
1414       if (fDigitsArray->IsSimulated()) {
1415         ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[0],it,ip,0);
1416         ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[1],it,ip,1);
1417         ((AliSimDigits*)dig)->SetTrackIDFast(tracks[2],it,ip,2);
1418       }
1419
1420     } // end of loop over time buckets
1421   }  // end of lop over pads
1422
1423   //
1424   //  This row has been digitized, delete nonused stuff
1425   //
1426
1427   for(lp=0;lp<nofDigits;lp++){
1428     if(pList[lp]) delete [] pList[lp];
1429   }
1430
1431   delete [] pList;
1432
1433   delete m1;
1434   delete m2;
1435
1436 } // end of DigitizeRow
1437
1438 //_____________________________________________________________________________
1439
1440 Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr,
1441              TMatrixF *m1, TMatrixF *m2,Int_t *indexRange)
1442 {
1443
1444   //---------------------------------------------------------------
1445   //  Calculates 2-D signal (pad,time) for a single track,
1446   //  returns a pointer to the signal matrix and the track label
1447   //  No digitization is performed at this level!!!
1448   //---------------------------------------------------------------
1449
1450   //-----------------------------------------------------------------
1451   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
1452   // Modified: Marian Ivanov
1453   //-----------------------------------------------------------------
1454
1455   TVector *tv;
1456
1457   tv = (TVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
1458   TVector &v = *tv;
1459
1460   Float_t label = v(0);
1461   Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]-1))/2;
1462
1463   Int_t nElectrons = (tv->GetNrows()-1)/5;
1464   indexRange[0]=9999; // min pad
1465   indexRange[1]=-1; // max pad
1466   indexRange[2]=9999; //min time
1467   indexRange[3]=-1; // max time
1468
1469   TMatrixF &signal = *m1;
1470   TMatrixF &total = *m2;
1471   //
1472   //  Loop over all electrons
1473   //
1474   for(Int_t nel=0; nel<nElectrons; nel++){
1475     Int_t idx=nel*5;
1476     Float_t aval =  v(idx+4);
1477     Float_t eltoadcfac=aval*fTPCParam->GetTotalNormFac();
1478     Float_t xyz[4]={v(idx+1),v(idx+2),v(idx+3),v(idx+5)};
1479     Int_t n = ((AliTPCParamSR*)fTPCParam)->CalcResponseFast(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
1480
1481     Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(0);
1482     Float_t *weight = & (fTPCParam->GetResWeight(0));
1483
1484     if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){
1485       Int_t pad=index[1]+centralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
1486
1487       if (pad>=0){
1488         Int_t time=index[2];
1489         Float_t qweight = *(weight)*eltoadcfac;
1490
1491         if (m1!=0) signal(pad,time)+=qweight;
1492         total(pad,time)+=qweight;
1493         if (indexRange[0]>pad) indexRange[0]=pad;
1494         if (indexRange[1]<pad) indexRange[1]=pad;
1495         if (indexRange[2]>time) indexRange[2]=time;
1496         if (indexRange[3]<time) indexRange[3]=time;
1497
1498         index+=3;
1499         weight++;
1500
1501       }
1502     }
1503   } // end of loop over electrons
1504
1505   return label; // returns track label when finished
1506 }
1507
1508 //_____________________________________________________________________________
1509 void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrixF *m,
1510                      Int_t *indexRange, Float_t **pList)
1511 {
1512   //----------------------------------------------------------------------
1513   //  Updates the list of tracks contributing to digits for a given row
1514   //----------------------------------------------------------------------
1515
1516   //-----------------------------------------------------------------
1517   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
1518   //-----------------------------------------------------------------
1519
1520   TMatrixF &signal = *m;
1521
1522   // lop over nonzero digits
1523
1524   for(Int_t it=indexRange[2];it<indexRange[3]+1;it++){
1525     for(Int_t ip=indexRange[0];ip<indexRange[1]+1;ip++){
1526
1527
1528       // accept only the contribution larger than 500 electrons (1/2 s_noise)
1529
1530       if(signal(ip,it)<0.5) continue;
1531
1532       Int_t globalIndex = it*np+ip; // globalIndex starts from 0!
1533
1534       if(!pList[globalIndex]){
1535
1536         //
1537         // Create new list (6 elements - 3 signals and 3 labels),
1538         //
1539
1540         pList[globalIndex] = new Float_t [6];
1541
1542         // set list to -1
1543
1544         *pList[globalIndex] = -1.;
1545         *(pList[globalIndex]+1) = -1.;
1546         *(pList[globalIndex]+2) = -1.;
1547         *(pList[globalIndex]+3) = -1.;
1548         *(pList[globalIndex]+4) = -1.;
1549         *(pList[globalIndex]+5) = -1.;
1550
1551         *pList[globalIndex] = label;
1552         *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
1553       }
1554       else {
1555
1556         // check the signal magnitude
1557
1558         Float_t highest = *(pList[globalIndex]+3);
1559         Float_t middle = *(pList[globalIndex]+4);
1560         Float_t lowest = *(pList[globalIndex]+5);
1561
1562         //
1563         //  compare the new signal with already existing list
1564         //
1565
1566         if(signal(ip,it)<lowest) continue; // neglect this track
1567
1568         //
1569
1570         if (signal(ip,it)>highest){
1571           *(pList[globalIndex]+5) = middle;
1572           *(pList[globalIndex]+4) = highest;
1573           *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
1574
1575           *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
1576           *(pList[globalIndex]+1) = *pList[globalIndex];
1577           *pList[globalIndex] = label;
1578         }
1579         else if (signal(ip,it)>middle){
1580           *(pList[globalIndex]+5) = middle;
1581           *(pList[globalIndex]+4) = signal(ip,it);
1582
1583           *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
1584           *(pList[globalIndex]+1) = label;
1585         }
1586         else{
1587           *(pList[globalIndex]+5) = signal(ip,it);
1588           *(pList[globalIndex]+2) = label;
1589         }
1590       }
1591
1592     } // end of loop over pads
1593   } // end of loop over time bins
1594
1595 }//end of GetList
1596 //___________________________________________________________________
1597 void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
1598                         Stat_t ntracks,TObjArray **row)
1599 {
1600
1601   //-----------------------------------------------------------------
1602   // Prepares the sector digitization, creates the vectors of
1603   // tracks for each row of this sector. The track vector
1604   // contains the track label and the position of electrons.
1605   //-----------------------------------------------------------------
1606
1607   //-----------------------------------------------------------------
1608   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
1609   //-----------------------------------------------------------------
1610
1611   Float_t gasgain = fTPCParam->GetGasGain();
1612   Int_t i;
1613   Float_t xyz[5];
1614
1615   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
1616   //MI change
1617   TBranch * branch=0;
1618   if (fHitType>1) branch = TH->GetBranch("TPC2");
1619   else branch = TH->GetBranch("TPC");
1620
1621
1622   //----------------------------------------------
1623   // Create TObjArray-s, one for each row,
1624   // each TObjArray will store the TVectors
1625   // of electrons, one TVectors per each track.
1626   //----------------------------------------------
1627
1628   Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows+2]; // electron counter for each row
1629   TVector **tracks = new TVector* [nrows+2]; //pointers to the track vectors
1630
1631   for(i=0; i<nrows+2; i++){
1632     row[i] = new TObjArray;
1633     nofElectrons[i]=0;
1634     tracks[i]=0;
1635   }
1636
1637
1638
1639   //--------------------------------------------------------------------
1640   //  Loop over tracks, the "track" contains the full history
1641   //--------------------------------------------------------------------
1642
1643   Int_t previousTrack,currentTrack;
1644   previousTrack = -1; // nothing to store so far!
1645
1646   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
1647     Bool_t isInSector=kTRUE;
1648     ResetHits();
1649     isInSector = TrackInVolume(isec,track);
1650     if (!isInSector) continue;
1651     //MI change
1652     branch->GetEntry(track); // get next track
1653
1654     //M.I. changes
1655
1656     tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
1657
1658     //--------------------------------------------------------------
1659     //  Loop over hits
1660     //--------------------------------------------------------------
1661
1662
1663     while(tpcHit){
1664
1665       Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
1666       if(sector != isec){
1667         tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
1668         continue;
1669       }
1670
1671       currentTrack = tpcHit->Track(); // track number
1672
1673       if(currentTrack != previousTrack){
1674
1675         // store already filled fTrack
1676
1677         for(i=0;i<nrows+2;i++){
1678           if(previousTrack != -1){
1679             if(nofElectrons[i]>0){
1680               TVector &v = *tracks[i];
1681               v(0) = previousTrack;
1682               tracks[i]->ResizeTo(5*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
1683               row[i]->Add(tracks[i]);
1684             }
1685             else {
1686               delete tracks[i]; // delete empty TVector
1687               tracks[i]=0;
1688             }
1689           }
1690
1691           nofElectrons[i]=0;
1692           tracks[i] = new TVector(601); // TVectors for the next fTrack
1693
1694         } // end of loop over rows
1695
1696         previousTrack=currentTrack; // update track label
1697       }
1698
1699       Int_t qI = (Int_t) (tpcHit->fQ); // energy loss (number of electrons)
1700
1701       //---------------------------------------------------
1702       //  Calculate the electron attachment probability
1703       //---------------------------------------------------
1704
1705
1706       Float_t time = 1.e6*(fTPCParam->GetZLength()-TMath::Abs(tpcHit->Z()))
1707         /fTPCParam->GetDriftV();
1708       // in microseconds!
1709       Float_t attProb = fTPCParam->GetAttCoef()*
1710         fTPCParam->GetOxyCont()*time; //  fraction!
1711
1712       //-----------------------------------------------
1713       //  Loop over electrons
1714       //-----------------------------------------------
1715       Int_t index[3];
1716       index[1]=isec;
1717       for(Int_t nel=0;nel<qI;nel++){
1718         // skip if electron lost due to the attachment
1719         if((gRandom->Rndm(0)) < attProb) continue; // electron lost!
1720         xyz[0]=tpcHit->X();
1721         xyz[1]=tpcHit->Y();
1722         xyz[2]=tpcHit->Z();
1723         //
1724         // protection for the nonphysical avalanche size (10**6 maximum)
1725         //
1726         Double_t rn=TMath::Max(gRandom->Rndm(0),1.93e-22);
1727         xyz[3]= (Float_t) (-gasgain*TMath::Log(rn));
1728         index[0]=1;
1729
1730         TransportElectron(xyz,index);
1731         Int_t rowNumber;
1732         fTPCParam->GetPadRow(xyz,index);
1733         // Electron track time (for pileup simulation)
1734         xyz[4] = tpcHit->Time()/fTPCParam->GetTSample();
1735         // row 0 - cross talk from the innermost row
1736         // row fNRow+1 cross talk from the outermost row
1737         rowNumber = index[2]+1;
1738         //transform position to local digit coordinates
1739         //relative to nearest pad row
1740         if ((rowNumber<0)||rowNumber>fTPCParam->GetNRow(isec)+1) continue;
1741         Float_t x1,y1;
1742         if (isec <fTPCParam->GetNInnerSector()) {
1743           x1 = xyz[1]*fTPCParam->GetInnerPadPitchWidth();
1744           y1 = fTPCParam->GetYInner(rowNumber);
1745         }
1746         else{
1747           x1=xyz[1]*fTPCParam->GetOuterPadPitchWidth();
1748           y1 = fTPCParam->GetYOuter(rowNumber);
1749         }
1750         // gain inefficiency at the wires edges - linear
1751         x1=TMath::Abs(x1);
1752         y1-=1.;
1753         if(x1>y1) xyz[3]*=TMath::Max(1.e-6,(y1-x1+1.));
1754
1755         nofElectrons[rowNumber]++;
1756         //----------------------------------
1757         // Expand vector if necessary
1758         //----------------------------------
1759         if(nofElectrons[rowNumber]>120){
1760           Int_t range = tracks[rowNumber]->GetNrows();
1761           if((nofElectrons[rowNumber])>(range-1)/5){
1762
1763             tracks[rowNumber]->ResizeTo(range+500); // Add 100 electrons
1764           }
1765         }
1766
1767         TVector &v = *tracks[rowNumber];
1768         Int_t idx = 5*nofElectrons[rowNumber]-4;
1769         Real_t * position = &(((TVector&)v)(idx)); //make code faster
1770         memcpy(position,xyz,5*sizeof(Float_t));
1771
1772       } // end of loop over electrons
1773
1774       tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
1775
1776     } // end of loop over hits
1777   } // end of loop over tracks
1778
1779     //
1780     //   store remaining track (the last one) if not empty
1781     //
1782
1783   for(i=0;i<nrows+2;i++){
1784     if(nofElectrons[i]>0){
1785       TVector &v = *tracks[i];
1786       v(0) = previousTrack;
1787       tracks[i]->ResizeTo(5*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
1788       row[i]->Add(tracks[i]);
1789     }
1790     else{
1791       delete tracks[i];
1792       tracks[i]=0;
1793     }
1794   }
1795
1796   delete [] tracks;
1797   delete [] nofElectrons;
1798
1799 } // end of MakeSector
1800
1801
1802 //_____________________________________________________________________________
1803 void AliTPC::Init()
1804 {
1805   //
1806   // Initialise TPC detector after definition of geometry
1807   //
1808   AliDebug(1,"*********************************************");
1809 }
1810
1811 //_____________________________________________________________________________
1812 void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option)
1813 {
1814   //
1815   // Create Tree branches for the TPC.
1816   //
1817   AliDebug(1,"");
1818   Int_t buffersize = 4000;
1819   char branchname[10];
1820   sprintf(branchname,"%s",GetName());
1821
1822   const char *h = strstr(option,"H");
1823
1824   if ( h && (fHitType<=1) && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliTPChit", 176);//skowron 20.06.03
1825
1826   AliDetector::MakeBranch(option);
1827
1828   const char *d = strstr(option,"D");
1829
1830   if (fDigits   && fLoader->TreeD() && d) {
1831     MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), branchname, &fDigits, buffersize, 0);
1832   }
1833
1834   if (fHitType>1) MakeBranch2(option,0); // MI change 14.09.2000
1835 }
1836
1837 //_____________________________________________________________________________
1838 void AliTPC::ResetDigits()
1839 {
1840   //
1841   // Reset number of digits and the digits array for this detector
1842   //
1843   fNdigits   = 0;
1844   if (fDigits)   fDigits->Clear();
1845 }
1846
1847
1848
1849 //_____________________________________________________________________________
1850 void AliTPC::SetSens(Int_t sens)
1851 {
1852
1853   //-------------------------------------------------------------
1854   // Activates/deactivates the sensitive strips at the center of
1855   // the pad row -- this is for the space-point resolution calculations
1856   //-------------------------------------------------------------
1857
1858   //-----------------------------------------------------------------
1859   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
1860   //-----------------------------------------------------------------
1861
1862   fSens = sens;
1863 }
1864
1865
1866 void AliTPC::SetSide(Float_t side=0.)
1867 {
1868   // choice of the TPC side
1869
1870   fSide = side;
1871
1872 }
1873 //_____________________________________________________________________________
1874
1875 void AliTPC::TransportElectron(Float_t *xyz, Int_t *index)
1876 {
1877   //
1878   // electron transport taking into account:
1879   // 1. diffusion,
1880   // 2.ExB at the wires
1881   // 3. nonisochronity
1882   //
1883   // xyz and index must be already transformed to system 1
1884   //
1885
1886   fTPCParam->Transform1to2(xyz,index);
1887
1888   //add diffusion
1889   Float_t driftl=xyz[2];
1890   if(driftl<0.01) driftl=0.01;
1891   driftl=TMath::Sqrt(driftl);
1892   Float_t sigT = driftl*(fTPCParam->GetDiffT());
1893   Float_t sigL = driftl*(fTPCParam->GetDiffL());
1894   xyz[0]=gRandom->Gaus(xyz[0],sigT);
1895   xyz[1]=gRandom->Gaus(xyz[1],sigT);
1896   xyz[2]=gRandom->Gaus(xyz[2],sigL);
1897
1898   // ExB
1899
1900   if (fTPCParam->GetMWPCReadout()==kTRUE){
1901     Float_t dx = fTPCParam->Transform2to2NearestWire(xyz,index);
1902     xyz[1]+=dx*(fTPCParam->GetOmegaTau());
1903   }
1904   //add nonisochronity (not implemented yet)
1905 }
1906
1907 ClassImp(AliTPChit)
1908
1909 //_____________________________________________________________________________
1910 AliTPChit::AliTPChit(Int_t shunt, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits):
1911 AliHit(shunt,track)
1912 {
1913   //
1914   // Creates a TPC hit object
1915   //
1916   fSector     = vol[0];
1917   fPadRow     = vol[1];
1918   fX          = hits[0];
1919   fY          = hits[1];
1920   fZ          = hits[2];
1921   fQ          = hits[3];
1922   fTime       = hits[4];
1923 }
1924
1925 //________________________________________________________________________
1926 // Additional code because of the AliTPCTrackHitsV2
1927
1928 void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char */*file*/)
1929 {
1930   //
1931   // Create a new branch in the current Root Tree
1932   // The branch of fHits is automatically split
1933   // MI change 14.09.2000
1934   AliDebug(1,"");
1935   if (fHitType<2) return;
1936   char branchname[10];
1937   sprintf(branchname,"%s2",GetName());
1938   //
1939   // Get the pointer to the header
1940   const char *cH = strstr(option,"H");
1941   //
1942   if (fTrackHits   && TreeH() && cH && fHitType&4) {
1943     AliDebug(1,"Making branch for Type 4 Hits");
1944     TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits,fBufferSize,99);
1945   }
1946
1947 //   if (fTrackHitsOld   && TreeH() && cH && fHitType&2) {
1948 //     AliDebug(1,"Making branch for Type 2 Hits");
1949 //     AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHitsOld,
1950 //                                                    TreeH(),fBufferSize,99);
1951 //     TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
1952 //   }
1953 }
1954
1955 void AliTPC::SetTreeAddress()
1956 {
1957   //Sets tree address for hits
1958   if (fHitType<=1) {
1959     if (fHits == 0x0 ) fHits = new TClonesArray("AliTPChit", 176);//skowron 20.06.03
1960     AliDetector::SetTreeAddress();
1961   }
1962   if (fHitType>1) SetTreeAddress2();
1963 }
1964
1965 void AliTPC::SetTreeAddress2()
1966 {
1967   //
1968   // Set branch address for the TrackHits Tree
1969   //
1970   AliDebug(1,"");
1971
1972   TBranch *branch;
1973   char branchname[20];
1974   sprintf(branchname,"%s2",GetName());
1975   //
1976   // Branch address for hit tree
1977   TTree *treeH = TreeH();
1978   if ((treeH)&&(fHitType&4)) {
1979     branch = treeH->GetBranch(branchname);
1980     if (branch) {
1981       branch->SetAddress(&fTrackHits);
1982       AliDebug(1,"fHitType&4 Setting");
1983     }
1984     else
1985       AliDebug(1,"fHitType&4 Failed (can not find branch)");
1986
1987   }
1988  //  if ((treeH)&&(fHitType&2)) {
1989 //     branch = treeH->GetBranch(branchname);
1990 //     if (branch) {
1991 //       branch->SetAddress(&fTrackHitsOld);
1992 //       AliDebug(1,"fHitType&2 Setting");
1993 //     }
1994 //     else
1995 //       AliDebug(1,"fHitType&2 Failed (can not find branch)");
1996 //   }
1997   //set address to TREETR
1998
1999   TTree *treeTR = TreeTR();
2000   if (treeTR && fTrackReferences) {
2001     branch = treeTR->GetBranch(GetName());
2002     if (branch) branch->SetAddress(&fTrackReferences);
2003   }
2004
2005 }
2006
2007 void AliTPC::FinishPrimary()
2008 {
2009   if (fTrackHits &&fHitType&4)      fTrackHits->FlushHitStack();
2010   //  if (fTrackHitsOld && fHitType&2)  fTrackHitsOld->FlushHitStack();
2011 }
2012
2013
2014 void AliTPC::AddHit2(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
2015 {
2016   //
2017   // add hit to the list
2018   Int_t rtrack;
2019   if (fIshunt) {
2020     int primary = gAlice->GetMCApp()->GetPrimary(track);
2021     gAlice->GetMCApp()->Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
2022     rtrack=primary;
2023   } else {
2024     rtrack=track;
2025     gAlice->GetMCApp()->FlagTrack(track);
2026   }
2027   if (fTrackHits && fHitType&4)
2028     fTrackHits->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
2029                              hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3],hits[4]);
2030  //  if (fTrackHitsOld &&fHitType&2 )
2031 //     fTrackHitsOld->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
2032 //                                 hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
2033
2034 }
2035
2036 void AliTPC::ResetHits()
2037 {
2038   if (fHitType&1) AliDetector::ResetHits();
2039   if (fHitType>1) ResetHits2();
2040 }
2041
2042 void AliTPC::ResetHits2()
2043 {
2044   //
2045   //reset hits
2046   if (fTrackHits && fHitType&4) fTrackHits->Clear();
2047   // if (fTrackHitsOld && fHitType&2) fTrackHitsOld->Clear();
2048
2049 }
2050
2051 AliHit* AliTPC::FirstHit(Int_t track)
2052 {
2053   if (fHitType>1) return FirstHit2(track);
2054   return AliDetector::FirstHit(track);
2055 }
2056 AliHit* AliTPC::NextHit()
2057 {
2058   //
2059   // gets next hit
2060   //
2061   if (fHitType>1) return NextHit2();
2062
2063   return AliDetector::NextHit();
2064 }
2065
2066 AliHit* AliTPC::FirstHit2(Int_t track)
2067 {
2068   //
2069   // Initialise the hit iterator
2070   // Return the address of the first hit for track
2071   // If track>=0 the track is read from disk
2072   // while if track<0 the first hit of the current
2073   // track is returned
2074   //
2075   if(track>=0) {
2076     gAlice->ResetHits();
2077     TreeH()->GetEvent(track);
2078   }
2079   //
2080   if (fTrackHits && fHitType&4) {
2081     fTrackHits->First();
2082     return fTrackHits->GetHit();
2083   }
2084  //  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
2085 //     fTrackHitsOld->First();
2086 //     return fTrackHitsOld->GetHit();
2087 //   }
2088
2089   else return 0;
2090 }
2091
2092 AliHit* AliTPC::NextHit2()
2093 {
2094   //
2095   //Return the next hit for the current track
2096
2097
2098 //   if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
2099 //     fTrackHitsOld->Next();
2100 //     return fTrackHitsOld->GetHit();
2101 //   }
2102   if (fTrackHits) {
2103     fTrackHits->Next();
2104     return fTrackHits->GetHit();
2105   }
2106   else
2107     return 0;
2108 }
2109
2110 void AliTPC::LoadPoints(Int_t)
2111 {
2112   //
2113   Int_t a = 0;
2114
2115   if(fHitType==1) AliDetector::LoadPoints(a);
2116   else LoadPoints2(a);
2117 }
2118
2119
2120 void AliTPC::RemapTrackHitIDs(Int_t *map)
2121 {
2122   //
2123   // remapping
2124   //
2125   if (!fTrackHits) return;
2126
2127 //   if (fTrackHitsOld && fHitType&2){
2128 //     AliObjectArray * arr = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
2129 //     for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
2130 //       AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
2131 //       info->fTrackID = map[info->fTrackID];
2132 //     }
2133 //   }
2134 //  if (fTrackHitsOld && fHitType&4){
2135   if (fTrackHits && fHitType&4){
2136     TClonesArray * arr = fTrackHits->GetArray();;
2137     for (Int_t i=0;i<arr->GetEntriesFast();i++){
2138       AliTrackHitsParamV2 * info = (AliTrackHitsParamV2 *)(arr->At(i));
2139       info->fTrackID = map[info->fTrackID];
2140     }
2141   }
2142 }
2143
2144 Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
2145 {
2146   //return bool information - is track in given volume
2147   //load only part of the track information
2148   //return true if current track is in volume
2149   //
2150   //  return kTRUE;
2151  //  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
2152 //     TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
2153 //     br->GetEvent(track);
2154 //     AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
2155 //     for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
2156 //       if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==id) return kTRUE;
2157 //     }
2158 //   }
2159
2160   if (fTrackHits && fHitType&4) {
2161     TBranch * br1 = TreeH()->GetBranch("fVolumes");
2162     TBranch * br2 = TreeH()->GetBranch("fNVolumes");
2163     br2->GetEvent(track);
2164     br1->GetEvent(track);
2165     Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
2166     Int_t nvolumes = fTrackHits->GetNVolumes();
2167     if (!volumes && nvolumes>0) {
2168       AliWarning(Form("Problematic track\t%d\t%d",track,nvolumes));
2169       return kFALSE;
2170     }
2171     for (Int_t j=0;j<nvolumes; j++)
2172       if (volumes[j]==id) return kTRUE;
2173   }
2174
2175   if (fHitType&1) {
2176     TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fSector");
2177     br->GetEvent(track);
2178     for (Int_t j=0;j<fHits->GetEntriesFast();j++){
2179       if (  ((AliTPChit*)fHits->At(j))->fSector==id) return kTRUE;
2180     }
2181   }
2182   return kFALSE;
2183
2184 }
2185
2186 //_____________________________________________________________________________
2187 void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
2188 {
2189   //
2190   // Store x, y, z of all hits in memory
2191   //
2192   //  if (fTrackHits == 0 && fTrackHitsOld==0) return;
2193   if (fTrackHits == 0 ) return;
2194   //
2195   Int_t nhits =0;
2196   if (fHitType&4) nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
2197   //  if (fHitType&2) nhits = fTrackHitsOld->GetEntriesFast();
2198
2199   if (nhits == 0) return;
2200   Int_t tracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
2201   if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(tracks);
2202   AliHit *ahit;
2203   //
2204   Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
2205   Int_t *limi=new Int_t[tracks];
2206   Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
2207   for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
2208     ntrk[i]=0;
2209     coor[i]=0;
2210     limi[i]=0;
2211   }
2212   //
2213   AliPoints *points = 0;
2214   Float_t *fp=0;
2215   Int_t trk;
2216   Int_t chunk=nhits/4+1;
2217   //
2218   // Loop over all the hits and store their position
2219   //
2220   ahit = FirstHit2(-1);
2221   while (ahit){
2222     trk=ahit->GetTrack();
2223     if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
2224       //
2225       // Initialise a new track
2226       fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
2227       if(coor[trk]) {
2228         memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
2229         delete [] coor[trk];
2230       }
2231       limi[trk]+=chunk;
2232       coor[trk] = fp;
2233     } else {
2234       fp = coor[trk];
2235     }
2236     fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
2237     fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
2238     fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
2239     ntrk[trk]++;
2240     ahit = NextHit2();
2241   }
2242
2243
2244
2245   //
2246   for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
2247     if(ntrk[trk]) {
2248       points = new AliPoints();
2249       points->SetMarkerColor(GetMarkerColor());
2250       points->SetMarkerSize(GetMarkerSize());
2251       points->SetDetector(this);
2252       points->SetParticle(trk);
2253       points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],GetMarkerStyle());
2254       fPoints->AddAt(points,trk);
2255       delete [] coor[trk];
2256       coor[trk]=0;
2257     }
2258   }
2259   delete [] coor;
2260   delete [] ntrk;
2261   delete [] limi;
2262 }
2263
2264
2265 //_____________________________________________________________________________
2266 void AliTPC::LoadPoints3(Int_t)
2267 {
2268   //
2269   // Store x, y, z of all hits in memory
2270   // - only intersection point with pad row
2271   if (fTrackHits == 0) return;
2272   //
2273   Int_t nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
2274   if (nhits == 0) return;
2275   Int_t tracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
2276   if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(2*tracks);
2277   fPoints->Expand(2*tracks);
2278   AliHit *ahit;
2279   //
2280   Int_t *ntrk=new Int_t[tracks];
2281   Int_t *limi=new Int_t[tracks];
2282   Float_t **coor=new Float_t*[tracks];
2283   for(Int_t i=0;i<tracks;i++) {
2284     ntrk[i]=0;
2285     coor[i]=0;
2286     limi[i]=0;
2287   }
2288   //
2289   AliPoints *points = 0;
2290   Float_t *fp=0;
2291   Int_t trk;
2292   Int_t chunk=nhits/4+1;
2293   //
2294   // Loop over all the hits and store their position
2295   //
2296   ahit = FirstHit2(-1);
2297
2298   Int_t lastrow = -1;
2299   while (ahit){
2300     trk=ahit->GetTrack();
2301     Float_t  x[3]={ahit->X(),ahit->Y(),ahit->Z()};
2302     Int_t    index[3]={1,((AliTPChit*)ahit)->fSector,0};
2303     Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;
2304     if (currentrow!=lastrow){
2305       lastrow = currentrow;
2306       //later calculate intersection point
2307       if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
2308         //
2309         // Initialise a new track
2310         fp=new Float_t[3*(limi[trk]+chunk)];
2311         if(coor[trk]) {
2312           memcpy(fp,coor[trk],sizeof(Float_t)*3*limi[trk]);
2313           delete [] coor[trk];
2314         }
2315         limi[trk]+=chunk;
2316         coor[trk] = fp;
2317       } else {
2318         fp = coor[trk];
2319       }
2320       fp[3*ntrk[trk]  ] = ahit->X();
2321       fp[3*ntrk[trk]+1] = ahit->Y();
2322       fp[3*ntrk[trk]+2] = ahit->Z();
2323       ntrk[trk]++;
2324     }
2325     ahit = NextHit2();
2326   }
2327
2328   //
2329   for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
2330     if(ntrk[trk]) {
2331       points = new AliPoints();
2332       points->SetMarkerColor(GetMarkerColor()+1);
2333       points->SetMarkerStyle(5);
2334       points->SetMarkerSize(0.2);
2335       points->SetDetector(this);
2336       points->SetParticle(trk);
2337       points->SetPolyMarker(ntrk[trk],coor[trk],30);
2338       fPoints->AddAt(points,tracks+trk);
2339       delete [] coor[trk];
2340       coor[trk]=0;
2341     }
2342   }
2343   delete [] coor;
2344   delete [] ntrk;
2345   delete [] limi;
2346 }
2347
2348
2349
2350 AliLoader* AliTPC::MakeLoader(const char* topfoldername)
2351 {
2352   //Makes TPC loader
2353   fLoader = new AliTPCLoader(GetName(),topfoldername);
2354   return fLoader;
2355 }
2356
2357 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
2358 AliTPCParam* AliTPC::LoadTPCParam(TFile *file) {
2359 //
2360 // load TPC paarmeters from a given file or create new if the object
2361 // is not found there
2362 // 12/05/2003 This method should be moved to the AliTPCLoader
2363 // and one has to decide where to store the TPC parameters
2364 // M.Kowalski
2365   char paramName[50];
2366   sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
2367   AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)file->Get(paramName);
2368   if (paramTPC) {
2369     AliDebugClass(1,Form("TPC parameters %s found.",paramName));
2370   } else {
2371     AliWarningClass("TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)");
2372     paramTPC = new AliTPCParamSR;
2373   }
2374   return paramTPC;
2375
2376 // the older version of parameters can be accessed with this code.
2377 // In some cases, we have old parameters saved in the file but
2378 // digits were created with new parameters, it can be distinguish
2379 // by the name of TPC TreeD. The code here is just for the case
2380 // we would need to compare with old data, uncomment it if needed.
2381 //
2382 //  char paramName[50];
2383 //  sprintf(paramName,"75x40_100x60");
2384 //  AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)in->Get(paramName);
2385 //  if (paramTPC) {
2386 //    cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
2387 //  } else {
2388 //    sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
2389 //    paramTPC=(AliTPCParam*)in->Get(paramName);
2390 //    if (paramTPC) {
2391 //      cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
2392 //    } else {
2393 //      cerr<<"TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)."
2394 //          <<endl;
2395 //      paramTPC = new AliTPCParamSR;
2396 //    }
2397 //  }
2398 //  return paramTPC;
2399
2400 }
2401
2402