]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - TPC/AliTPCcalibCosmic.cxx
Marian + Jens
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCcalibCosmic.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /*
17     Comments to be written here: 
18     1. What do we calibrate.
19     2. How to interpret results
20     3. Simple example
21     4. Analysis using debug streamers.
22
23
24
25     3.Simple example
26     // To make cosmic scan the user interaction neccessary
27     //
28     .x ~/UliStyle.C
29     gSystem->Load("libANALYSIS");
30     gSystem->Load("libTPCcalib");
31     TFile fcalib("CalibObjects.root");
32     TObjArray * array = (TObjArray*)fcalib.Get("TPCCalib");
33     AliTPCcalibCosmic * cosmic = ( AliTPCcalibCosmic *)array->FindObject("cosmicTPC");
34     
35
36     //
37     //
38     gSystem->AddIncludePath("-I$ALICE_ROOT/TPC/macros");
39     gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/TPC/macros/AliXRDPROOFtoolkit.cxx+")
40     AliXRDPROOFtoolkit tool;
41     TChain * chainCosmic = tool.MakeChainRandom("cosmic.txt","Track0",0,10000); 
42   
43
44 */
45
46
47
48 #include "Riostream.h"
49 #include "TChain.h"
50 #include "TTree.h"
51 #include "TH1F.h"
52 #include "TH2F.h"
53 #include "TList.h"
54 #include "TMath.h"
55 #include "TCanvas.h"
56 #include "TFile.h"
57 #include "TF1.h"
58 #include "THnSparse.h"
59
60 #include "AliTPCclusterMI.h"
61 #include "AliTPCseed.h"
62 #include "AliESDVertex.h"
63 #include "AliESDEvent.h"
64 #include "AliESDfriend.h"
65 #include "AliESDInputHandler.h"
66 #include "AliAnalysisManager.h"
67
68 #include "AliTracker.h"
69 #include "AliMagF.h"
70 #include "AliTPCCalROC.h"
71
72 #include "AliLog.h"
73
74 #include "AliTPCcalibCosmic.h"
75 #include "TTreeStream.h"
76 #include "AliTPCTracklet.h"
77 #include "AliESDcosmic.h"
78
79
80 ClassImp(AliTPCcalibCosmic)
81
82
83 AliTPCcalibCosmic::AliTPCcalibCosmic() 
84   :AliTPCcalibBase(),
85    fHistNTracks(0),
86    fClusters(0),
87    fModules(0),
88    fHistPt(0),
89    fDeDx(0),
90    fDeDxMIP(0),
91    fMIPvalue(1), 
92    fCutMaxD(5),        // maximal distance in rfi ditection
93    fCutMaxDz(40),      // maximal distance in z ditection
94    fCutTheta(0.03),    // maximal distan theta
95    fCutMinDir(-0.99)   // direction vector products
96 {  
97   AliInfo("Default Constructor");    
98   for (Int_t ihis=0; ihis<6;ihis++){
99     fHistoDelta[ihis]=0;
100     fHistoPull[ihis]=0;
101   }
102   for (Int_t ihis=0; ihis<4;ihis++){
103     fHistodEdxMax[ihis]    =0;
104     fHistodEdxTot[ihis]    =0;
105   }
106 }
107
108
109 AliTPCcalibCosmic::AliTPCcalibCosmic(const Text_t *name, const Text_t *title) 
110   :AliTPCcalibBase(),
111    fHistNTracks(0),
112    fClusters(0),
113    fModules(0),
114    fHistPt(0),
115    fDeDx(0),
116    fDeDxMIP(0),
117    fMIPvalue(1),
118    fCutMaxD(5),        // maximal distance in rfi ditection 
119    fCutMaxDz(40),      // maximal distance in z ditection
120    fCutTheta(0.03),    // maximal distan theta
121    fCutMinDir(-0.99)   // direction vector products
122 {  
123   SetName(name);
124   SetTitle(title);
125
126   fHistNTracks = new TH1F("ntracks","Number of Tracks per Event; number of tracks per event; number of tracks",501,-0.5,500.5);
127   fClusters = new TH1F("signal","Number of Clusters per track; number of clusters per track n_{cl}; counts",160,0,160);
128   fModules = new TH2F("sector","Acorde hits; z (cm); x(cm)",1200,-650,650,600,-700,700);
129   fHistPt = new TH1F("Pt","Pt distribution; p_{T} (GeV); counts",2000,0,50);
130   fDeDx = new TH2F("DeDx","dEdx; momentum p (GeV); TPC signal (a.u.)",500,0.01,100.,500,2.,1000);
131   BinLogX(fDeDx);
132   fDeDxMIP =  new TH1F("DeDxMIP","MIP region; TPC signal (a.u.);counts ",500,2.,1000);
133   Init();
134   AliInfo("Non Default Constructor");  
135   //
136 }
137
138 AliTPCcalibCosmic::~AliTPCcalibCosmic(){
139   //
140   //
141   //
142   for (Int_t ihis=0; ihis<6;ihis++){
143     delete fHistoDelta[ihis];
144     delete fHistoPull[ihis];
145   }
146   for (Int_t ihis=0; ihis<4;ihis++){
147     delete fHistodEdxTot[ihis];
148     delete fHistodEdxMax[ihis];
149   }
150
151   delete fHistNTracks;            //  histogram showing number of ESD tracks per event
152   delete fClusters;               //  histogram showing the number of clusters per track
153   delete fModules;                //  2d histogram of tracks which are propagated to the ACORDE scintillator array
154   delete fHistPt;                 //  Pt histogram of reconstructed tracks
155   delete fDeDx;                   //  dEdx spectrum showing the different particle types
156   delete fDeDxMIP;                //  TPC signal close to the MIP region of muons 0.4 < p < 0.45 GeV
157 }
158
159
160 void AliTPCcalibCosmic::Init(){
161   //
162   // init component
163   // Make performance histograms
164   //
165
166   // tracking performance bins
167   // 0 - delta of interest
168   // 1 - min (track0, track1) number of clusters
169   // 2 - R  - vertex radius
170   // 3 - P1 - mean z
171   // 4 - P2 - snp(phi)    at inner wall of TPC
172   // 5 - P3 - tan(theta)  at inner wall of TPC
173   // 6 - P4 - 1/pt mean
174   // 7 - pt - pt mean
175   // 8 - alpha
176
177   Double_t xminTrack[9], xmaxTrack[9];
178   Int_t binsTrack[9];
179   TString axisName[9];
180   //
181   binsTrack[0] =100;
182   axisName[0]  ="#Delta";
183   //
184   binsTrack[1] =8;
185   xminTrack[1] =80; xmaxTrack[1]=160;
186   axisName[1]  ="N_{cl}";
187   //
188   binsTrack[2] =10;
189   xminTrack[2] =0; xmaxTrack[2]=90;  // 
190   axisName[2]  ="dca_{r} (cm)";
191   //
192   binsTrack[3] =25;
193   xminTrack[3] =-250; xmaxTrack[3]=250;  // 
194   axisName[3]  ="z (cm)";
195   //
196   binsTrack[4] =10;
197   xminTrack[4] =-0.8; xmaxTrack[4]=0.8;  // 
198   axisName[4]  ="sin(#phi)";
199   //
200   binsTrack[5] =10;
201   xminTrack[5] =-1; xmaxTrack[5]=1;  // 
202   axisName[5]  ="tan(#theta)";
203   //
204   binsTrack[6] =10;
205   xminTrack[6] =0; xmaxTrack[6]=2;  // 
206   axisName[6]  ="1/pt (1/GeV)";
207   //
208   binsTrack[7] =40;
209   xminTrack[7] =0.2; xmaxTrack[7]=50;  // 
210   axisName[7]  ="pt (GeV)";
211   //
212   binsTrack[8] =32;
213   xminTrack[8] =0; xmaxTrack[8]=TMath::Pi();  // 
214   axisName[8]  ="alpha";
215   //
216   // delta y
217   xminTrack[0] =-1; xmaxTrack[0]=1;  // 
218   fHistoDelta[0] = new THnSparseS("#Delta_{Y} (cm)","#Delta_{Y} (cm)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
219   xminTrack[0] =-5; xmaxTrack[0]=5;  // 
220   fHistoPull[0] = new THnSparseS("#Delta_{Y} (unit)","#Delta_{Y} (unit)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
221   //
222   // delta z
223   xminTrack[0] =-1; xmaxTrack[0]=1;  // 
224   fHistoDelta[1] = new THnSparseS("#Delta_{Z} (cm)","#Delta_{Z} (cm)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
225   xminTrack[0] =-5; xmaxTrack[0]=5;  // 
226   fHistoPull[1] = new THnSparseS("#Delta_{Z} (unit)","#Delta_{Z} (unit)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
227   //
228   // delta P2
229   xminTrack[0] =-10; xmaxTrack[0]=10;  // 
230   fHistoDelta[2] = new THnSparseS("#Delta_{#phi} (mrad)","#Delta_{#phi} (mrad)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
231   xminTrack[0] =-5; xmaxTrack[0]=5;  // 
232   fHistoPull[2] = new THnSparseS("#Delta_{#phi} (unit)","#Delta_{#phi} (unit)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
233   //
234   // delta P3
235   xminTrack[0] =-10; xmaxTrack[0]=10;  // 
236   fHistoDelta[3] = new THnSparseS("#Delta_{#theta} (mrad)","#Delta_{#theta} (mrad)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
237   xminTrack[0] =-5; xmaxTrack[0]=5;  // 
238   fHistoPull[3] = new THnSparseS("#Delta_{#theta} (unit)","#Delta_{#theta} (unit)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
239   //
240   // delta P4
241   xminTrack[0] =-0.2; xmaxTrack[0]=0.2;  // 
242   fHistoDelta[4] = new THnSparseS("#Delta_{1/pt} (1/GeV)","#Delta_{1/pt} (1/GeV)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
243   xminTrack[0] =-5; xmaxTrack[0]=5;  // 
244   fHistoPull[4] = new THnSparseS("#Delta_{1/pt} (unit)","#Delta_{1/pt} (unit)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
245   
246   //
247   // delta Pt
248   xminTrack[0] =-0.5; xmaxTrack[0]=0.5;  // 
249   fHistoDelta[5] = new THnSparseS("#Delta_{pt}/p_{t}","#Delta_{pt}/p_{t}", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
250   xminTrack[0] =-5; xmaxTrack[0]=5;  // 
251   fHistoPull[5] = new THnSparseS("#Delta_{pt}/p_{t} (unit)","#Delta_{pt}/p_{t} (unit)", 9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
252   //
253
254   for (Int_t idedx=0;idedx<4;idedx++){
255     xminTrack[0] =0.5; xmaxTrack[0]=1.5;  // 
256     binsTrack[1] =40;
257     xminTrack[1] =10; xmaxTrack[1]=160;
258
259     fHistodEdxMax[idedx] = new THnSparseS(Form("dEdx_{MaxUp}/dEdx_{MaxDown}_Pad%d",idedx),
260                                           Form("dEdx_{MaxUp}/dEdx_{MaxDown}_Pad%d",idedx), 
261                                           9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
262     fHistodEdxTot[idedx] = new THnSparseS(Form("dEdx_{TotUp}/dEdx_{TotDown}_Pad%d",idedx),
263                                           Form("dEdx_{TotUp}/dEdx_{TotDown}_Pad%d",idedx), 
264                                           9, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
265   }
266   
267
268
269   for (Int_t ivar=0;ivar<6;ivar++){
270     for (Int_t ivar2=0;ivar2<9;ivar2++){      
271       fHistoDelta[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
272       fHistoDelta[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisName[ivar2].Data());
273       fHistoPull[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
274       fHistoPull[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisName[ivar2].Data());
275       BinLogX(fHistoDelta[ivar],7);
276       BinLogX(fHistoPull[ivar],7);
277       if (ivar<4){
278         fHistodEdxMax[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
279         fHistodEdxMax[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisName[ivar2].Data());
280         fHistodEdxTot[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
281         fHistodEdxTot[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisName[ivar2].Data());
282         BinLogX(fHistodEdxMax[ivar],7);
283         BinLogX(fHistodEdxTot[ivar],7);
284       }
285     }
286   }
287 }
288
289
290 void AliTPCcalibCosmic::Add(const AliTPCcalibCosmic* cosmic){
291   //
292   //
293   //
294   for (Int_t ivar=0; ivar<6;ivar++){
295     if (fHistoDelta[ivar] && cosmic->fHistoDelta[ivar]){
296       fHistoDelta[ivar]->Add(cosmic->fHistoDelta[ivar]);
297     }
298     if (fHistoPull[ivar] && cosmic->fHistoPull[ivar]){
299       fHistoPull[ivar]->Add(cosmic->fHistoPull[ivar]);
300     }
301   }
302   for (Int_t ivar=0; ivar<4;ivar++){
303     if (fHistodEdxMax[ivar] && cosmic->fHistodEdxMax[ivar]){
304       fHistodEdxMax[ivar]->Add(cosmic->fHistodEdxMax[ivar]);
305     }
306     if (fHistodEdxTot[ivar] && cosmic->fHistodEdxTot[ivar]){
307       fHistodEdxTot[ivar]->Add(cosmic->fHistodEdxTot[ivar]);
308     }
309   }
310 }
311
312
313
314
315 void AliTPCcalibCosmic::Process(AliESDEvent *event) {
316   //
317   //
318   //
319   if (!event) {
320     Printf("ERROR: ESD not available");
321     return;
322   }  
323   AliESDfriend *ESDfriend=static_cast<AliESDfriend*>(event->FindListObject("AliESDfriend"));
324   if (!ESDfriend) {
325    Printf("ERROR: ESDfriend not available");
326    return;
327   }
328    
329
330   FindPairs(event); // nearly everything takes place in find pairs...
331
332   if (GetDebugLevel()>20) printf("Hallo world: Im here and processing an event\n");
333   Int_t ntracks=event->GetNumberOfTracks(); 
334   fHistNTracks->Fill(ntracks);
335   if (ntracks==0) return;
336  //  AliESDcosmic cosmicESD;    
337 //   TTreeSRedirector * cstream =  GetDebugStreamer();
338 //   cosmicESD.SetDebugStreamer(cstream);
339 //   cosmicESD.ProcessEvent(event);
340 //   if (cstream) cosmicESD.DumpToTree();
341       
342   
343 }
344
345
346 void AliTPCcalibCosmic::FillHistoPerformance(AliExternalTrackParam *par0, AliExternalTrackParam *par1, AliExternalTrackParam *inner0, AliExternalTrackParam *inner1, AliTPCseed *seed0,  AliTPCseed *seed1){
347   //
348   //
349   //
350   Int_t kMinCldEdx =20;
351   Int_t ncl0 = seed0->GetNumberOfClusters();
352   Int_t ncl1 = seed1->GetNumberOfClusters();
353
354   const Double_t kpullCut    = 10;
355   Double_t x[9];
356   Double_t xyz0[3];
357   Double_t xyz1[3];
358   par0->GetXYZ(xyz0);
359   par1->GetXYZ(xyz1);
360   Double_t radius0 = TMath::Sqrt(xyz0[0]*xyz0[0]+xyz0[1]*xyz0[1]);
361   Double_t radius1 = TMath::Sqrt(xyz1[0]*xyz1[0]+xyz1[1]*xyz1[1]);
362   inner0->GetXYZ(xyz0);
363   Double_t alpha = TMath::ATan2(xyz0[1],xyz0[0]);
364   // bin parameters
365   x[1] = TMath::Min(ncl0,ncl1);
366   x[2] = (radius0+radius1)*0.5;
367   x[3] = (inner0->GetZ()+inner1->GetZ())*0.5;
368   x[4] = (inner0->GetSnp()-inner1->GetSnp())*0.5;
369   x[5] = (inner0->GetTgl()-inner1->GetTgl())*0.5;
370   x[6] = (1/par0->Pt()+1/par1->Pt())*0.5;
371   x[7] = (par0->Pt()+par1->Pt())*0.5;
372   x[8] = alpha;
373   // deltas
374   Double_t delta[6];
375   Double_t sigma[6];
376   delta[0] = (par0->GetY()+par1->GetY());
377   delta[1] = (par0->GetZ()-par1->GetZ());
378   delta[2] = (par0->GetAlpha()-par1->GetAlpha()-TMath::Pi());
379   delta[3] = (par0->GetTgl()+par1->GetTgl());
380   delta[4] = (par0->GetParameter()[4]+par1->GetParameter()[4]);
381   delta[5] = (par0->Pt()-par1->Pt())/((par0->Pt()+par1->Pt())*0.5);
382   //
383   sigma[0] = TMath::Sqrt(par0->GetSigmaY2()+par1->GetSigmaY2());
384   sigma[1] = TMath::Sqrt(par0->GetSigmaZ2()+par1->GetSigmaZ2());
385   sigma[2] = TMath::Sqrt(par0->GetSigmaSnp2()+par1->GetSigmaSnp2());
386   sigma[3] = TMath::Sqrt(par0->GetSigmaTgl2()+par1->GetSigmaTgl2());
387   sigma[4] = TMath::Sqrt(par0->GetSigma1Pt2()+par1->GetSigma1Pt2());
388   sigma[5] = sigma[4]*((par0->Pt()+par1->Pt())*0.5);
389   //
390   Bool_t isOK = kTRUE;
391   for (Int_t ivar=0;ivar<6;ivar++){
392     if (sigma[ivar]==0) isOK=kFALSE;
393     x[0]= delta[ivar]/sigma[ivar];
394     if (TMath::Abs(x[0])>kpullCut) isOK = kFALSE;
395   }
396   //
397
398   if (isOK) for (Int_t ivar=0;ivar<6;ivar++){
399     x[0]= delta[ivar]/TMath::Sqrt(2);
400     if (ivar==2 || ivar ==3) x[0]*=1000;
401     fHistoDelta[ivar]->Fill(x);
402     if (sigma[ivar]>0){
403       x[0]= delta[ivar]/sigma[ivar];
404       fHistoPull[ivar]->Fill(x);
405     }
406   }
407
408   //                                            
409   // Fill dedx performance
410   //
411   for (Int_t ipad=0; ipad<4;ipad++){
412     //
413     //
414     //
415     Int_t row0=0;
416     Int_t row1=160;
417     if (ipad==0) row1=63;
418     if (ipad==1) {row0=63; row1=63+64;}
419     if (ipad==2) {row0=128;}
420     Int_t   nclUp       = TMath::Nint(seed0->CookdEdxAnalytical(0.01,0.7,0,row0,row1,2));
421     Int_t   nclDown     = TMath::Nint(seed1->CookdEdxAnalytical(0.01,0.7,0,row0,row1,2));
422     Int_t   minCl       = TMath::Min(nclUp,nclDown);
423     if (minCl<kMinCldEdx) continue;
424     x[1] = minCl;
425     //
426     Float_t dEdxTotUp   = seed0->CookdEdxAnalytical(0.01,0.7,0,row0,row1);
427     Float_t dEdxTotDown = seed1->CookdEdxAnalytical(0.01,0.7,0,row0,row1);
428     Float_t dEdxMaxUp   = seed0->CookdEdxAnalytical(0.01,0.7,1,row0,row1);
429     Float_t dEdxMaxDown = seed1->CookdEdxAnalytical(0.01,0.7,1,row0,row1);
430     //
431     if (dEdxTotDown<=0) continue;
432     if (dEdxMaxDown<=0) continue;
433     x[0]=dEdxTotUp/dEdxTotDown;
434     fHistodEdxTot[ipad]->Fill(x);
435     x[0]=dEdxMaxUp/dEdxMaxDown;
436     fHistodEdxMax[ipad]->Fill(x);
437   }
438
439
440   
441 }
442
443
444
445 void AliTPCcalibCosmic::Analyze() {
446
447   fMIPvalue = CalculateMIPvalue(fDeDxMIP);
448
449   return;
450
451 }
452
453
454
455 void AliTPCcalibCosmic::FindPairs(AliESDEvent *event) {
456   //
457   // Find cosmic pairs
458   // 
459   // Track0 is choosen in upper TPC part
460   // Track1 is choosen in lower TPC part
461   //
462   if (GetDebugLevel()>20) printf("Hallo world: Im here\n");
463   AliESDfriend *ESDfriend=static_cast<AliESDfriend*>(event->FindListObject("AliESDfriend"));
464   Int_t ntracks=event->GetNumberOfTracks(); 
465   TObjArray  tpcSeeds(ntracks);
466   if (ntracks==0) return;
467   Double_t vtxx[3]={0,0,0};
468   Double_t svtxx[3]={0.000001,0.000001,100.};
469   AliESDVertex vtx(vtxx,svtxx);
470   //
471   //track loop
472   //
473   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
474    AliESDtrack *track = event->GetTrack(i);
475    fClusters->Fill(track->GetTPCNcls()); 
476   
477    const AliExternalTrackParam * trackIn = track->GetInnerParam();
478    const AliExternalTrackParam * trackOut = track->GetOuterParam();
479    if (!trackIn) continue;
480    if (!trackOut) continue;
481    if (ntracks>4 && TMath::Abs(trackIn->GetTgl())<0.0015) continue;  // filter laser 
482
483
484    AliESDfriendTrack *friendTrack = ESDfriend->GetTrack(i);
485    TObject *calibObject;
486    AliTPCseed *seed = 0;
487    for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) {
488      if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
489    }
490    if (seed) tpcSeeds.AddAt(seed,i);
491
492    Double_t meanP = 0.5*(trackIn->GetP() + trackOut->GetP());
493    if (seed && track->GetTPCNcls() > 80 + 60/(1+TMath::Exp(-meanP+5))) {
494      fDeDx->Fill(meanP, seed->CookdEdxNorm(0.0,0.45,0,0,159));
495      //
496      if (meanP > 0.4 && meanP < 0.45) fDeDxMIP->Fill(seed->CookdEdxNorm(0.0,0.45,0,0,159));
497      //
498      if (GetDebugLevel()>0&&meanP>0.2&&seed->CookdEdxNorm(0.0,0.45,0,0,159)>300) {
499        TFile *curfile = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetTree()->GetCurrentFile();
500        if (curfile) printf(">>> p+ in file: %s \t event: %i \t Number of ESD tracks: %i \n", curfile->GetName(), (int)event->GetEventNumberInFile(), (int)ntracks);
501        if (track->GetOuterParam()->GetAlpha()<0) cout << " Polartiy: " << track->GetSign() << endl;
502      }
503
504    }
505
506   }
507
508   if (ntracks<2) return;
509   //
510   // Find pairs
511   //
512   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
513     AliESDtrack *track0 = event->GetTrack(i);     
514     // track0 - choosen upper part
515     if (!track0) continue;
516     if (!track0->GetOuterParam()) continue;
517     if (track0->GetOuterParam()->GetAlpha()<0) continue;
518     Double_t dir0[3];
519     track0->GetDirection(dir0);    
520     for (Int_t j=0;j<ntracks;++j) {
521       if (i==j) continue;
522       AliESDtrack *track1 = event->GetTrack(j);   
523       //track 1 lower part
524       if (!track1) continue;
525       if (!track1->GetOuterParam()) continue;
526       if (track1->GetOuterParam()->GetAlpha()>0) continue;
527       //
528       Double_t dir1[3];
529       track1->GetDirection(dir1);
530       
531       AliTPCseed * seed0 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(i);
532       AliTPCseed * seed1 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(j);
533       if (! seed0) continue;
534       if (! seed1) continue;
535       Float_t dedx0 = seed0->CookdEdxNorm(0.05,0.55,0,0,159);
536       Float_t dedx1 = seed1->CookdEdxNorm(0.05,0.55,0,0,159);
537       //
538       Float_t dedx0I = seed0->CookdEdxNorm(0.05,0.55,0,0,63);
539       Float_t dedx1I = seed1->CookdEdxNorm(0.05,0.55,0,0,63);
540       //
541       Float_t dedx0O = seed0->CookdEdxNorm(0.05,0.55,0,64,159);
542       Float_t dedx1O = seed1->CookdEdxNorm(0.05,0.55,0,64,159);
543       //
544       Float_t dir = (dir0[0]*dir1[0] + dir0[1]*dir1[1] + dir0[2]*dir1[2]);
545       Float_t d0  = track0->GetLinearD(0,0);
546       Float_t d1  = track1->GetLinearD(0,0);
547       //
548       // conservative cuts - convergence to be guarantied
549       // applying before track propagation
550       if (TMath::Abs(d0+d1)>fCutMaxD) continue;   // distance to the 0,0
551       if (dir>fCutMinDir) continue;               // direction vector product
552       Float_t bz = AliTracker::GetBz();
553       Float_t dvertex0[2];   //distance to 0,0
554       Float_t dvertex1[2];   //distance to 0,0 
555       track0->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
556       track1->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
557       if (TMath::Abs(dvertex0[1])>250) continue;
558       if (TMath::Abs(dvertex1[1])>250) continue;
559       //
560       //
561       //
562       Float_t dmax = TMath::Max(TMath::Abs(d0),TMath::Abs(d1));
563       AliExternalTrackParam param0(*track0);
564       AliExternalTrackParam param1(*track1);
565       //
566       // Propagate using Magnetic field and correct fo material budget
567       //
568       AliTracker::PropagateTrackTo(&param0,dmax+1,0.0005,3,kTRUE);
569       AliTracker::PropagateTrackTo(&param1,dmax+1,0.0005,3,kTRUE);
570       //
571       // Propagate rest to the 0,0 DCA - z should be ignored
572       //
573       Bool_t b0 = param0.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
574       Bool_t b1 = param1.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
575       //      
576       param0.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
577       param1.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
578       if (TMath::Abs(param0.GetZ()-param1.GetZ())>fCutMaxDz) continue;
579       //
580       Double_t xyz0[3];//,pxyz0[3];
581       Double_t xyz1[3];//,pxyz1[3];
582       param0.GetXYZ(xyz0);
583       param1.GetXYZ(xyz1);
584       Bool_t isPair = IsPair(&param0,&param1);
585       //
586       if (isPair) FillAcordeHist(track0);
587       //
588       // combined track params 
589       //
590       AliExternalTrackParam *par0U=MakeCombinedTrack(&param0,&param1);
591       AliExternalTrackParam *par1U=MakeCombinedTrack(&param1,&param0);
592
593
594       //
595       if (fStreamLevel>0){
596         TTreeSRedirector * cstream =  GetDebugStreamer();
597         //printf("My stream=%p\n",(void*)cstream);
598         AliExternalTrackParam *ip0 = (AliExternalTrackParam *)track0->GetInnerParam();
599         AliExternalTrackParam *ip1 = (AliExternalTrackParam *)track1->GetInnerParam();
600         AliExternalTrackParam *op0 = (AliExternalTrackParam *)track0->GetOuterParam();
601         AliExternalTrackParam *op1 = (AliExternalTrackParam *)track1->GetOuterParam();
602         Bool_t isCrossI = ip0->GetZ()*ip1->GetZ()<0;
603         Bool_t isCrossO = op0->GetZ()*op1->GetZ()<0;
604         Double_t alpha0 = TMath::ATan2(dir0[1],dir0[0]);
605         Double_t alpha1 = TMath::ATan2(dir1[1],dir1[0]);
606         //
607         //
608         //
609         FillHistoPerformance(&param0, &param1, ip0, ip1, seed0, seed1);
610
611         if (cstream) {
612           (*cstream) << "Track0" <<
613             "run="<<fRun<<              //  run number
614             "event="<<fEvent<<          //  event number
615             "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
616             "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
617             "triggerClass="<<&fTriggerClass<<      //  trigger
618             "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
619             "dir="<<dir<<               //  direction
620             "OK="<<isPair<<             //  will be accepted
621             "b0="<<b0<<                 //  propagate status
622             "b1="<<b1<<                 //  propagate status
623             "crossI="<<isCrossI<<       //  cross inner
624             "crossO="<<isCrossO<<       //  cross outer
625             //
626             "Orig0.=" << track0 <<      //  original track  0
627             "Orig1.=" << track1 <<      //  original track  1
628             "Tr0.="<<&param0<<          //  track propagated to the DCA 0,0
629             "Tr1.="<<&param1<<          //  track propagated to the DCA 0,0        
630             "Ip0.="<<ip0<<              //  inner param - upper
631             "Ip1.="<<ip1<<              //  inner param - lower
632             "Op0.="<<op0<<              //  outer param - upper
633             "Op1.="<<op1<<              //  outer param - lower
634             "Up0.="<<par0U<<           //  combined track 0
635             "Up1.="<<par1U<<           //  combined track 1
636             //
637             "v00="<<dvertex0[0]<<       //  distance using kalman
638             "v01="<<dvertex0[1]<<       // 
639             "v10="<<dvertex1[0]<<       //
640             "v11="<<dvertex1[1]<<       // 
641             "d0="<<d0<<                 //  linear distance to 0,0
642             "d1="<<d1<<                 //  linear distance to 0,0
643             //
644             //
645             //
646             "x00="<<xyz0[0]<<           // global position close to vertex
647             "x01="<<xyz0[1]<<
648             "x02="<<xyz0[2]<<
649             //
650             "x10="<<xyz1[0]<<           // global position close to vertex
651             "x11="<<xyz1[1]<<
652             "x12="<<xyz1[2]<<
653             //
654             "alpha0="<<alpha0<<
655             "alpha1="<<alpha1<<
656             "dir00="<<dir0[0]<<           // direction upper
657             "dir01="<<dir0[1]<<
658             "dir02="<<dir0[2]<<
659             //
660             "dir10="<<dir1[0]<<           // direction lower
661             "dir11="<<dir1[1]<<
662             "dir12="<<dir1[2]<<
663             //
664             //
665             "Seed0.=" << seed0 <<       //  original seed 0
666             "Seed1.=" << seed1 <<       //  original seed 1
667             //
668             "dedx0="<<dedx0<<           //  dedx0 - all
669             "dedx1="<<dedx1<<           //  dedx1 - all
670             //
671             "dedx0I="<<dedx0I<<         //  dedx0 - inner ROC
672             "dedx1I="<<dedx1I<<         //  dedx1 - inner ROC
673             //
674             "dedx0O="<<dedx0O<<         //  dedx0 - outer ROC
675             "dedx1O="<<dedx1O<<         //  dedx1 - outer ROC
676             "\n";
677         }
678       }
679       delete par0U;
680       delete par1U;
681     }
682   }  
683 }    
684
685
686
687
688 void  AliTPCcalibCosmic::FillAcordeHist(AliESDtrack *upperTrack) {
689
690   // Pt cut to select straight tracks which can be easily propagated to ACORDE which is outside the magnetic field
691   if (upperTrack->Pt() < 10 || upperTrack->GetTPCNcls() < 80) return;
692     
693   const Double_t AcordePlane = 850.; // distance of the central Acorde detectors to the beam line at y =0
694   const Double_t roof = 210.5;       // distance from x =0 to end of magnet roof
695
696   Double_t r[3];
697   upperTrack->GetXYZ(r);
698   Double_t d[3];
699   upperTrack->GetDirection(d);
700   Double_t x,z;
701   z = r[2] + (d[2]/d[1])*(AcordePlane - r[1]);
702   x = r[0] + (d[0]/d[1])*(AcordePlane - r[1]);
703   
704   if (x > roof) {
705     x = r[0] + (d[0]/(d[0]+d[1]))*(AcordePlane+roof-r[0]-r[1]);
706     z = r[2] + (d[2]/(d[0]+d[1]))*(AcordePlane+roof-r[0]-r[1]);
707   }
708   if (x < -roof) {
709     x = r[0] + (d[0]/(d[1]-d[0]))*(AcordePlane+roof+r[0]-r[1]);       
710     z = r[2] + (d[2]/(d[1]-d[0]))*(AcordePlane+roof+r[0]-r[1]);
711   } 
712
713   fModules->Fill(z, x);
714  
715 }
716
717
718
719 Long64_t AliTPCcalibCosmic::Merge(TCollection *li) {
720
721   TIterator* iter = li->MakeIterator();
722   AliTPCcalibCosmic* cal = 0;
723
724   while ((cal = (AliTPCcalibCosmic*)iter->Next())) {
725     if (!cal->InheritsFrom(AliTPCcalibCosmic::Class())) {
726       //Error("Merge","Attempt to add object of class %s to a %s", cal->ClassName(), this->ClassName());
727       return -1;
728     }
729     
730     fHistNTracks->Add(cal->GetHistNTracks());
731     fClusters->Add(cal-> GetHistClusters());
732     fModules->Add(cal->GetHistAcorde());
733     fHistPt->Add(cal->GetHistPt());
734     fDeDx->Add(cal->GetHistDeDx());
735     fDeDxMIP->Add(cal->GetHistMIP());
736     Add(cal);
737   }
738   return 0;
739   
740 }
741
742
743 Bool_t  AliTPCcalibCosmic::IsPair(AliExternalTrackParam *tr0, AliExternalTrackParam *tr1){
744   //
745   //
746   /*
747   // 0. Same direction - OPOSITE  - cutDir +cutT    
748   TCut cutDir("cutDir","dir<-0.99")
749   // 1. 
750   TCut cutT("cutT","abs(Tr1.fP[3]+Tr0.fP[3])<0.03")
751   //
752   // 2. The same rphi 
753   TCut cutD("cutD","abs(Tr0.fP[0]+Tr1.fP[0])<5")
754   //
755   //
756   //
757   TCut cutPt("cutPt","abs(Tr1.fP[4]+Tr0.fP[4])<1&&abs(Tr0.fP[4])+abs(Tr1.fP[4])<10");  
758   // 1/Pt diff cut
759   */
760   const Double_t *p0 = tr0->GetParameter();
761   const Double_t *p1 = tr1->GetParameter();
762   if (TMath::Abs(p0[3]+p1[3])>fCutTheta) return kFALSE;
763   if (TMath::Abs(p0[1]-p1[1])>fCutMaxDz) return kFALSE;
764   if (TMath::Abs(p0[0]+p1[0])>fCutMaxD)  return kFALSE;
765   
766   Double_t d0[3], d1[3];
767   tr0->GetDirection(d0);    
768   tr1->GetDirection(d1);       
769   if (d0[0]*d1[0] + d0[1]*d1[1] + d0[2]*d1[2] >fCutMinDir) return kFALSE;
770   //
771   return kTRUE;  
772 }
773  
774
775
776 Double_t AliTPCcalibCosmic::CalculateMIPvalue(TH1F * hist) {
777
778   TF1 * funcDoubleGaus = new TF1("funcDoubleGaus", "gaus(0)+gaus(3)",0,1000);
779   funcDoubleGaus->SetParameters(hist->GetEntries()*0.75,hist->GetMean()/1.3,hist->GetMean()*0.10,
780                                 hist->GetEntries()*0.25,hist->GetMean()*1.3,hist->GetMean()*0.10);
781   hist->Fit(funcDoubleGaus);
782   Double_t MIPvalue = TMath::Min(funcDoubleGaus->GetParameter(1),funcDoubleGaus->GetParameter(4));
783
784   delete funcDoubleGaus;
785
786   return MIPvalue;
787
788 }
789
790
791
792
793 void AliTPCcalibCosmic::CalculateBetheParams(TH2F */*hist*/, Double_t * /*initialParam*/) {
794   //
795   // Not implemented yet
796   //
797   return;
798
799 }
800
801
802 void AliTPCcalibCosmic::BinLogX(THnSparse *h, Int_t axisDim) {
803
804   // Method for the correct logarithmic binning of histograms
805
806   TAxis *axis = h->GetAxis(axisDim);
807   int bins = axis->GetNbins();
808
809   Double_t from = axis->GetXmin();
810   Double_t to = axis->GetXmax();
811   Double_t *new_bins = new Double_t[bins + 1];
812
813   new_bins[0] = from;
814   Double_t factor = pow(to/from, 1./bins);
815
816   for (int i = 1; i <= bins; i++) {
817    new_bins[i] = factor * new_bins[i-1];
818   }
819   axis->Set(bins, new_bins);
820   delete new_bins;
821
822 }
823
824
825 void AliTPCcalibCosmic::BinLogX(TH1 *h) {
826
827   // Method for the correct logarithmic binning of histograms
828
829   TAxis *axis = h->GetXaxis();
830   int bins = axis->GetNbins();
831
832   Double_t from = axis->GetXmin();
833   Double_t to = axis->GetXmax();
834   Double_t *new_bins = new Double_t[bins + 1];
835    
836   new_bins[0] = from;
837   Double_t factor = pow(to/from, 1./bins);
838   
839   for (int i = 1; i <= bins; i++) {
840    new_bins[i] = factor * new_bins[i-1];
841   }
842   axis->Set(bins, new_bins);
843   delete new_bins;
844   
845 }
846
847
848 AliExternalTrackParam *AliTPCcalibCosmic::MakeTrack(const AliExternalTrackParam *track0, const AliExternalTrackParam *track1){
849   //
850   // 
851   //
852   AliExternalTrackParam *par1R= new AliExternalTrackParam(*track1);
853   par1R->Rotate(track0->GetAlpha());
854   par1R->PropagateTo(track0->GetX(),AliTracker::GetBz()); 
855   //
856   //
857   Double_t * param = (Double_t*)par1R->GetParameter();
858   Double_t * covar = (Double_t*)par1R->GetCovariance();
859
860   param[0]*=1;  //OK
861   param[1]*=1;  //OK
862   param[2]*=1;  //?
863   param[3]*=-1; //OK
864   param[4]*=-1; //OK
865   //
866   covar[6] *=-1.; covar[7] *=-1.; covar[8] *=-1.;
867   //covar[10]*=-1.; covar[11]*=-1.; covar[12]*=-1.;
868   covar[13]*=-1.;
869   return par1R;
870 }
871
872 AliExternalTrackParam *AliTPCcalibCosmic::MakeCombinedTrack(const AliExternalTrackParam *track0, const AliExternalTrackParam *track1){
873   //
874   // Make combined track
875   //
876   //
877   AliExternalTrackParam * par1T = MakeTrack(track0,track1);
878   AliExternalTrackParam * par0U = new AliExternalTrackParam(*track0);
879   //
880   UpdateTrack(*par0U,*par1T);
881   delete par1T;
882   return par0U;
883 }
884
885
886 void AliTPCcalibCosmic::UpdateTrack(AliExternalTrackParam &track1, const AliExternalTrackParam &track2){
887   //
888   // Update track 1 with track 2
889   //
890   //
891   //
892   TMatrixD vecXk(5,1);    // X vector
893   TMatrixD covXk(5,5);    // X covariance 
894   TMatrixD matHk(5,5);    // vector to mesurement
895   TMatrixD measR(5,5);    // measurement error 
896   TMatrixD vecZk(5,1);    // measurement
897   //
898   TMatrixD vecYk(5,1);    // Innovation or measurement residual
899   TMatrixD matHkT(5,5);
900   TMatrixD matSk(5,5);    // Innovation (or residual) covariance
901   TMatrixD matKk(5,5);    // Optimal Kalman gain
902   TMatrixD mat1(5,5);     // update covariance matrix
903   TMatrixD covXk2(5,5);   // 
904   TMatrixD covOut(5,5);
905   //
906   Double_t *param1=(Double_t*) track1.GetParameter();
907   Double_t *covar1=(Double_t*) track1.GetCovariance();
908   Double_t *param2=(Double_t*) track2.GetParameter();
909   Double_t *covar2=(Double_t*) track2.GetCovariance();
910   //
911   // copy data to the matrix
912   for (Int_t ipar=0; ipar<5; ipar++){
913     for (Int_t jpar=0; jpar<5; jpar++){
914       covXk(ipar,jpar) = covar1[track1.GetIndex(ipar, jpar)];
915       measR(ipar,jpar) = covar2[track2.GetIndex(ipar, jpar)];
916       matHk(ipar,jpar)=0;
917       mat1(ipar,jpar)=0;
918     }
919     vecXk(ipar,0) = param1[ipar];
920     vecZk(ipar,0) = param2[ipar];
921     matHk(ipar,ipar)=1;
922     mat1(ipar,ipar)=0;
923   }
924   //
925   //
926   //
927   //
928   //
929   vecYk = vecZk-matHk*vecXk;                 // Innovation or measurement residual
930   matHkT=matHk.T(); matHk.T();
931   matSk = (matHk*(covXk*matHkT))+measR;      // Innovation (or residual) covariance
932   matSk.Invert();
933   matKk = (covXk*matHkT)*matSk;              //  Optimal Kalman gain
934   vecXk += matKk*vecYk;                      //  updated vector 
935   covXk2 = (mat1-(matKk*matHk));
936   covOut =  covXk2*covXk; 
937   //
938   //
939   //
940   // copy from matrix to parameters
941   if (0) {
942     vecXk.Print();
943     vecZk.Print();
944     //
945     measR.Print();
946     covXk.Print();
947     covOut.Print();
948     //
949     track1.Print();
950     track2.Print();
951   }
952
953   for (Int_t ipar=0; ipar<5; ipar++){
954     param1[ipar]= vecXk(ipar,0) ;
955     for (Int_t jpar=0; jpar<5; jpar++){
956       covar1[track1.GetIndex(ipar, jpar)]=covOut(ipar,jpar);
957     }
958   }
959 }
960
961
962
963