TPC/AliTPCcalibDButil.h

   1 #ifndef AliTPCcalibDButil_H
   2 #define AliTPCcalibDButil_H
   3
   4 /* Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   5  * See cxx source for full Copyright notice                               */
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   7 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   8 //                                                                           //
   9 // Class providing the calculation of derived quantities (mean,rms,fits,...) //
  10 //       of calibration entries                                              //
  11 //                                                                           //
  12 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  13
  14 #include <TObject.h>
  15 #include <TArrayI.h>
  16 #include <TVectorD.h>
  17 #include <TVectorF.h>
  18
  19 class TGraph;
  20 class TMap;
  21 class AliDCSSensorArray;
  22 class AliTPCcalibDB;
  23 class AliTPCCalPad;
  24 class AliTPCCalROC;
  25 class AliTPCmapper;
  26 class AliTPCCalibRaw;
  27 class AliCDBEntry;
  28 class AliDCSSensor;
  29 class AliDCSSensorArray;
  30 class AliTPCSensorTempArray;
  31 class AliTPCdataQA;
  32 class TGraphErrors;
  33 class TTreeSRedirector;
  34 class AliTPCCalROC;
  35 class AliTPCcalibDButil : public TObject
  36 {
  37 public:
  38   AliTPCcalibDButil();
  39   virtual ~AliTPCcalibDButil();
  40
  41   void UpdateFromCalibDB();
  42   //data processing functions
  43   void ProcessCEdata(const char* fitFormula, TVectorD &fitResultsA, TVectorD &fitResultsC,
  44                      Int_t &noutliersCE, Double_t & chi2A, Double_t &chi2C, AliTPCCalPad *outCE=0);
  45   void ProcessCEgraphs(TVectorD &vecTEntries, TVectorD &vecTMean, TVectorD &vecTRMS, TVectorD &vecTMedian,
  46                        TVectorD &vecQEntries, TVectorD &vecQMean, TVectorD &vecQRMS, TVectorD &vecQMedian,
  47                        Float_t &driftTimeA, Float_t &driftTimeC );
  48   void ProcessNoiseData(TVectorD &vNoiseMean, TVectorD &vNoiseMeanSenRegions,
  49                         TVectorD &vNoiseRMS, TVectorD &vNoiseRMSSenRegions,
  50                         Int_t &nonMaskedZero, Int_t &nNaN);
  51   void ProcessPulser(TVectorD &vMeanTime);
  52   void ProcessALTROConfig(Int_t &nMasked);
  53   void ProcessGoofie(TVectorD & vecEntries, TVectorD & vecMedian, TVectorD &vecMean, TVectorD &vecRMS);
  54
  55   //processing functions using reference data
  56   void ProcessPedestalVariations(TVectorF &pedestalDeviations);
  57   void ProcessNoiseVariations(TVectorF &noiseDeviations);
  58   void ProcessPulserVariations(TVectorF &pulserQdeviations, Float_t &varQMean, Int_t &npadsOutOneTB, Int_t &npadsOffAdd);
  59
  60   //getter preprocess information
  61   Int_t GetNPulserOutliers() const {return fNpulserOutliers;}
  62   Float_t GetMeanAltro(const AliTPCCalROC *roc, const Int_t row, const Int_t pad, AliTPCCalROC *rocOut=0x0);
  63   AliTPCCalPad *GetPulserOutlierMap() const {return fPulserOutlier;}
  64
  65   //getters ref data
  66   TMap *GetReferenceMap() const {return fRefMap;}
  67   const Int_t GetReferenceRun(const char* type) const;
  68   const char* GetRefValidity() const {return fRefValidity.Data();}
  69
  70   AliTPCCalPad* GetRefPadNoise() const {return fRefPadNoise;}
  71   AliTPCCalPad* GetRefPedestals() const {return fRefPedestals;}
  72   AliTPCCalPad* GetRefPedestalMasked() const {return fRefPedestalMasked;}
  73   AliTPCCalPad* GetRefPulserTmean() const {return fRefPulserTmean;}
  74   AliTPCCalPad* GetRefPulserTrms() const {return fRefPulserTrms;}
  75   AliTPCCalPad* GetRefPulserQmean() const {return fRefPulserQmean;}
  76   AliTPCCalPad* GetRefPulserOutlier() const {return fRefPulserOutlier;}
  77   AliTPCCalPad* GetRefPulserMasked() const {return fRefPulserMasked;}
  78   AliTPCCalPad* GetRefCETmean() const {return fRefCETmean;}
  79   AliTPCCalPad* GetRefCETrms() const {return fRefCETrms;}
  80   AliTPCCalPad* GetRefCEQmean() const {return fRefCEQmean;}
  81   AliTPCCalPad* GetRefCEMasked() const {return fRefCEMasked;}
  82   AliTPCCalPad* GetRefALTROFPED() const {return fRefALTROFPED;}
  83   AliTPCCalPad* GetRefALTROZsThr() const {return fRefALTROZsThr;}
  84   AliTPCCalPad* GetRefALTROAcqStart() const {return fRefALTROAcqStart;}
  85   AliTPCCalPad* GetRefALTROAcqStop() const {return fRefALTROAcqStop;}
  86   AliTPCCalPad* GetRefALTROMasked() const {return fRefALTROMasked;}
  87
  88
  89   //setters for pad by pad information
  90   void SetPulserData(AliTPCCalPad *tmean, AliTPCCalPad *trms=0x0, AliTPCCalPad *qmean=0x0)
  91                 {fPulserTmean=tmean; fPulserTrms=trms; fPulserQmean=qmean;}
  92   void SetCEData(AliTPCCalPad *tmean, AliTPCCalPad *trms=0x0, AliTPCCalPad *qmean=0x0)
  93                 {fCETmean=tmean; fCETrms=trms; fCEQmean=qmean;}
  94   void SetNoisePedestal(AliTPCCalPad *noise, AliTPCCalPad *pedestal=0x0)
  95                 {fPadNoise=noise; fPedestals=pedestal;}
  96   void SetALTROData(AliTPCCalPad *masked)
  97                 {fALTROMasked=masked;}
  98   void SetGoofieArray(AliDCSSensorArray *arr) {fGoofieArray=arr;}
  99
 100   //setters for pad by pad information
 101   void SetRefFile(const char* filename);
 102   void SetReferenceRun(Int_t run=-1);
 103   void UpdateRefDataFromOCDB();
 104   void SetRefPulserData(AliTPCCalPad *tmean, AliTPCCalPad *trms=0x0, AliTPCCalPad *qmean=0x0)
 105                 {fRefPulserTmean=tmean; fRefPulserTrms=trms; fRefPulserQmean=qmean;}
 106   void SetRefCEData(AliTPCCalPad *tmean, AliTPCCalPad *trms=0x0, AliTPCCalPad *qmean=0x0)
 107                 {fRefCETmean=tmean; fRefCETrms=trms; fRefCEQmean=qmean;}
 108   void SetRefNoisePedestal(AliTPCCalPad *noise, AliTPCCalPad *pedestal=0x0)
 109                 {fRefPadNoise=noise; fRefPedestals=pedestal;}
 110   void SetRefALTROData(AliTPCCalPad *masked)
 111                 {fRefALTROMasked=masked;}
 112
 113   //creation of derived pad by pad calibration data
 114   AliTPCCalPad *CreatePadTime0(Int_t model, Double_t &gyA, Double_t &gyC, Double_t &chi2A, Double_t &chi2C);
 115   //
 116   // create outlyer maps
 117   //
 118   AliTPCCalPad *CreateCEOutlyerMap(Int_t &noutliersCE, AliTPCCalPad *ceOut=0, Float_t minSignal=10, Float_t cutTrmsMin=0.9, Float_t cutTrmsMax=1.2, Float_t cutMaxDistT=0.7);
 119   AliTPCCalPad *CreatePulserOutlyerMap(Int_t &noutliersPulser, AliTPCCalPad *pulserOut=0, Float_t cutTime=3, Float_t cutnRMSQ=5, Float_t cutnRMSrms=5);
 120   //
 121   AliTPCCalPad *CreatePadTime0CE(TVectorD &fitResultsA, TVectorD&fitResultsC, Int_t &nOut, Double_t &chi2A, Double_t &chi2C, const char *dumpfile=0);
 122   //
 123
 124   void UpdatePulserOutlierMap();
 125   void UpdateRefPulserOutlierMap();
 126   void PulserOutlierMap(AliTPCCalPad *pulOut, const AliTPCCalPad *pulT, const AliTPCCalPad *pulQ);
 127
 128   const char* GetGUIRefTreeDefaultName();
 129
 130   Bool_t CreateGUIRefTree(const char* filename="");
 131   //
 132   // graph tools
 133   //
 134   static Double_t GetLaserTime0(Int_t run, Int_t timeStamp, Int_t deltaT, Int_t side);
 135   static TGraph* FilterGraphMedian(TGraph * graph, Float_t sigmaCut, Double_t &medianY);
 136   static TGraph* FilterGraphMedianAbs(TGraph * graph, Float_t cut, Double_t &medianY);
 137   static TGraphErrors* FilterGraphMedianErr(TGraphErrors * graph, Float_t sigmaCut,Double_t &medianY);
 138   //
 139   static void Sort(TGraph *graph);
 140   static void SmoothGraph(TGraph *graph, Double_t delta);
 141   static Int_t     GetNearest(TGraph *graph, Double_t xref, Double_t &dx, Double_t &y);
 142   static Double_t EvalGraphConst(TGraph *graph, Double_t xref);
 143   //
 144   // Filter sensors
 145   //
 146   static Float_t FilterSensor(AliDCSSensor * sensor, Double_t ymin, Double_t ymax, Double_t maxdy, Double_t sigmaCut);
 147   //
 148   // Filter AliRelAlignmentKalman - Alignment/Drift velocity
 149   //
 150   static TMatrixD* MakeStatRelKalman(TObjArray *array, Float_t minFraction, Int_t minStat, Float_t maxvd);
 151   static TObjArray *SmoothRelKalman(TObjArray *array,TMatrixD & stat, Bool_t direction, Float_t sigmaCut);
 152   static TObjArray *SmoothRelKalman(TObjArray *arrayP, TObjArray *arrayM);
 153   static void FilterCE(Double_t deltaT=100, Double_t cutAbs=10, Double_t cutSigma=4., TTreeSRedirector *pcstream=0);
 154   static void FilterTracks(Int_t run, Double_t cutSigma=20., TTreeSRedirector *pcstream=0);
 155   static Float_t FilterTemperature(AliTPCSensorTempArray *tempArray, Double_t ymin=15, Double_t ymax=22, Double_t sigmaCut=5);
 156
 157   static   void FilterGoofie(AliDCSSensorArray * goofieArray, Double_t deltaT=2, Double_t cutSigma=4.,  Double_t minVdn=8.5, Double_t maxVdn=9.05, TTreeSRedirector *pcstream=0);
 158   static Double_t  GetTriggerOffsetTPC(Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=86400, Double_t deltaTLaser=3600, Int_t valType=0);
 159   static Double_t  GetVDriftTPC(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=86400, Double_t deltaTLaser=3600, Int_t valType=0);
 160   static Double_t  GetVDriftTPCLaserTracks(Double_t &dist,Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=43200, Int_t side=2);
 161   static Double_t  GetVDriftTPCCE(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=43200, Int_t side=2);
 162   static Double_t  GetVDriftTPCITS(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp);
 163   static Double_t  GetTime0TPCITS(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp);
 164   Int_t MakeRunList(Int_t startRun, Int_t stopRun); // find the list of usable runs
 165   Int_t FindRunTPC(Int_t    itime, Bool_t debug=kFALSE);
 166 private:
 167   AliTPCcalibDB *fCalibDB;            //pointer to calibDB object
 168   AliTPCCalPad  *fPadNoise;           //noise information
 169   AliTPCCalPad  *fPedestals;          //pedestal information
 170   AliTPCCalPad  *fPulserTmean;        //pulser mean time information
 171   AliTPCCalPad  *fPulserTrms;         //pulser rms time information
 172   AliTPCCalPad  *fPulserQmean;        //pulser mean q information
 173   AliTPCCalPad  *fPulserOutlier;      //pulser outlier map
 174   AliTPCCalPad  *fCETmean;            //central electrode mean time information
 175   AliTPCCalPad  *fCETrms;             //central electrode rms time information
 176   AliTPCCalPad  *fCEQmean;            //central electrode mean q information
 177   AliTPCCalPad  *fALTROMasked;        //ALTRO masked channels information
 178   //
 179   AliTPCCalibRaw *fCalibRaw;          //raw calibration object
 180   //
 181   AliTPCdataQA   *fDataQA;            //data qa
 182   //reference data
 183   TMap *fRefMap;                        // latest map to reference information
 184   TMap *fCurrentRefMap;                 // reference data map of entries currently loaded
 185   TString fRefValidity;                 // validity range of reference data
 186   //
 187   AliTPCCalPad  *fRefPadNoise;           //Reference noise information
 188   AliTPCCalPad  *fRefPedestals;          //Reference pedestal information
 189   AliTPCCalPad  *fRefPedestalMasked;     //Reference masked channels in pedestal run
 190   AliTPCCalPad  *fRefPulserTmean;        //Reference pulser mean time information
 191   AliTPCCalPad  *fRefPulserTrms;         //Reference pulser rms time information
 192   AliTPCCalPad  *fRefPulserQmean;        //Reference pulser mean q information
 193   AliTPCCalPad  *fRefPulserOutlier;      //Reference pulser outlier map
 194   AliTPCCalPad  *fRefPulserMasked;       //Reference masked channels in pulser run
 195   AliTPCCalPad  *fRefCETmean;            //Reference central electrode mean time information
 196   AliTPCCalPad  *fRefCETrms;             //Reference central electrode rms time information
 197   AliTPCCalPad  *fRefCEQmean;            //Reference central electrode mean q information
 198   AliTPCCalPad  *fRefCEMasked;           //Reference masked channels in laser run
 199   AliTPCCalPad  *fRefALTROFPED;          //Reference fixed pedestal value
 200   AliTPCCalPad  *fRefALTROZsThr;         //Reference zero suppression threshol
 201   AliTPCCalPad  *fRefALTROAcqStart;      //Reference accquistion start time bin
 202   AliTPCCalPad  *fRefALTROAcqStop;       //Reference accquistion stop time bin
 203   AliTPCCalPad  *fRefALTROMasked;        //Reference ALTRO masked channels information
 204   //
 205   AliTPCCalibRaw *fRefCalibRaw;          //Reference raw calibration object
 206   //
 207   AliTPCdataQA   *fRefDataQA;            //Reference data QA
 208   //
 209   AliDCSSensorArray* fGoofieArray;    //Goofie Data
 210   //
 211   AliTPCmapper  *fMapper;             //TPC mapping handler
 212   Int_t fNpulserOutliers;             //number of outliers from Pulser calibration
 213
 214   Float_t fIrocTimeOffset;               //timing offset between IROC and OROC in timebins
 215   Float_t fCETmaxLimitAbs;               //maximum variation in CE data before pads will be treated as outliers
 216   Float_t fPulTmaxLimitAbs;              //maximum variation of Pulser Signals (time) before pads will be treated as outliers
 217   Float_t fPulQmaxLimitAbs;              //maximum variation of Pulser Signals (charge) before pads will be treated as outliers
 218   Float_t fPulQminLimit;                 //minimum charge value for Pulser Signals before pads will be treated as outliers
 219
 220   //
 221   // helpers to get the run number for given time stamps
 222   //
 223   // filters
 224
 225 public:
 226   TArrayI fRuns;                         // run list with OCDB info
 227   TArrayI fRunsStart;                    // start time for given run
 228   TArrayI fRunsStop;                     // stop time for given run
 229 private:
 230   AliTPCcalibDButil (const AliTPCcalibDButil& );
 231   AliTPCcalibDButil& operator= (const AliTPCcalibDButil& );
 232
 233   AliTPCCalPad* GetRefCalPad(AliCDBEntry *entry, const char* objName);
 234   AliTPCCalPad* GetRefCalPad(AliCDBEntry *entry);
 235   AliTPCCalPad* GetAltroMasked(const char* cdbPath, const char* name);
 236   Bool_t HasRefChanged(const char *cdbPath);
 237   const Int_t GetCurrentReferenceRun(const char* type);
 238   AliCDBEntry* GetRefEntry(const char* cdbPath);
 239
 240   ClassDef(AliTPCcalibDButil,0)
 241 };
 242
 243
 244 #endif