TPC/AliTPCcalibTime.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 Comments to be written here:
  18
  19 1. What do we calibrate.
  20
  21   Time dependence of gain and drift velocity in order to account for changes in: temperature, pressure, gas composition.
  22
  23   AliTPCcalibTime *calibTime = new AliTPCcalibTime("cosmicTime","cosmicTime",0, 1213.9e+06, 1213.96e+06, 0.04e+04, 0.04e+04);
  24
  25 2. How to interpret results
  26
  27 3. Simple example
  28
  29   a) determine the required time range:
  30
  31   AliXRDPROOFtoolkit tool;
  32   TChain * chain = tool.MakeChain("pass2.txt","esdTree",0,6000);
  33   chain->Draw("GetTimeStamp()")
  34
  35   b) analyse calibration object on Proof in calibration train
  36
  37   AliTPCcalibTime *calibTime = new AliTPCcalibTime("cosmicTime","cosmicTime", StartTimeStamp, EndTimeStamp, IntegrationTimeVdrift);
  38
  39   c) plot results
  40   .x ~/NimStyle.C
  41   gSystem->Load("libANALYSIS");
  42   gSystem->Load("libTPCcalib");
  43
  44   TFile f("CalibObjectsTrain1.root");
  45   AliTPCcalibTime *calib = (AliTPCcalibTime *)f->Get("calibTime");
  46   calib->GetHistoDrift("all")->Projection(2,0)->Draw()
  47   calib->GetFitDrift("all")->Draw("lp")
  48
  49 4. Analysis using debug streamers.
  50
  51   gSystem->AddIncludePath("-I$ALICE_ROOT/TPC/macros");
  52   gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/TPC/macros/AliXRDPROOFtoolkit.cxx+")
  53   AliXRDPROOFtoolkit tool;
  54   TChain * chainTime = tool.MakeChainRandom("time.txt","trackInfo",0,10000);
  55
  56   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timetpctpc.txt","* tpctpc",1)
  57   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timetoftpc.txt","* toftpc",1)
  58   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timeitstpc.txt","* itstpc",1)
  59   AliXRDPROOFtoolkit::FilterList("timelaser.txt","* laserInfo",1)
  60   TChain * chainTPCTPC = tool.MakeChainRandom("timetpctpc.txt.Good","tpctpc",0,10000);
  61   TChain * chainTPCITS = tool.MakeChainRandom("timeitstpc.txt.Good","itstpc",0,10000);
  62   TChain * chainTPCTOF = tool.MakeChainRandom("timetoftpc.txt.Good","toftpc",0,10000);
  63   TChain * chainLaser = tool.MakeChainRandom("timelaser.txt.Good","laserInfo",0,10000);
  64   chainTime->Lookup();
  65   chainLaser->Lookup();
  66 */
  67
  68 #include "Riostream.h"
  69 #include "TDatabasePDG.h"
  70 #include "TGraphErrors.h"
  71 #include "TH1F.h"
  72 #include "THnSparse.h"
  73 #include "TList.h"
  74 #include "TMath.h"
  75 #include "TTimeStamp.h"
  76 #include "TTree.h"
  77 #include "TVectorD.h"
  78 //#include "TChain.h"
  79 //#include "TFile.h"
  80
  81 #include "AliDCSSensor.h"
  82 #include "AliDCSSensorArray.h"
  83 #include "AliESDEvent.h"
  84 #include "AliESDInputHandler.h"
  85 #include "AliESDVertex.h"
  86 #include "AliESDfriend.h"
  87 #include "AliLog.h"
  88 #include "AliRelAlignerKalman.h"
  89 #include "AliTPCCalROC.h"
  90 #include "AliTPCParam.h"
  91 #include "AliTPCTracklet.h"
  92 #include "AliTPCcalibDB.h"
  93 #include "AliTPCcalibLaser.h"
  94 #include "AliTPCcalibTime.h"
  95 #include "AliTPCclusterMI.h"
  96 #include "AliTPCseed.h"
  97 #include "AliTrackPointArray.h"
  98 #include "AliTracker.h"
  99
 100 ClassImp(AliTPCcalibTime)
 101
 102
 103 AliTPCcalibTime::AliTPCcalibTime()
 104   :AliTPCcalibBase(),
 105    fLaser(0),       // pointer to laser calibration
 106    fDz(0),          // current delta z
 107    fCutMaxD(3),        // maximal distance in rfi ditection
 108    fCutMaxDz(25),      // maximal distance in rfi ditection
 109    fCutTheta(0.03),    // maximal distan theta
 110    fCutMinDir(-0.99),  // direction vector products
 111    fCutTracks(100),
 112    fArrayDz(0),          //NEW! Tmap of V drifts for different triggers
 113    fAlignITSTPC(0),      //alignemnt array ITS TPC match
 114    fAlignTRDTPC(0),      //alignemnt array TRD TPC match
 115    fAlignTOFTPC(0),      //alignemnt array TOF TPC match
 116    fTimeBins(0),
 117    fTimeStart(0),
 118    fTimeEnd(0),
 119    fPtBins(0),
 120    fPtStart(0),
 121    fPtEnd(0),
 122    fVdriftBins(0),
 123    fVdriftStart(0),
 124    fVdriftEnd(0),
 125    fRunBins(0),
 126    fRunStart(0),
 127    fRunEnd(0)
 128 {
 129   //
 130   // default constructor
 131   //
 132   AliInfo("Default Constructor");
 133   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
 134     fHistVdriftLaserA[i]=0;
 135     fHistVdriftLaserC[i]=0;
 136   }
 137   for (Int_t i=0;i<10;i++) {
 138     fCosmiMatchingHisto[i]=0;
 139   }
 140   //
 141   for (Int_t i=0;i<5;i++) {
 142     fResHistoTPCITS[i]=0;
 143     fResHistoTPCTRD[i]=0;
 144     fResHistoTPCvertex[i]=0;
 145   }
 146
 147 }
 148
 149 AliTPCcalibTime::AliTPCcalibTime(const Text_t *name, const Text_t *title, UInt_t StartTime, UInt_t EndTime, Int_t deltaIntegrationTimeVdrift)
 150   :AliTPCcalibBase(),
 151    fLaser(0),            // pointer to laser calibration
 152    fDz(0),               // current delta z
 153    fCutMaxD(5*0.5356),   // maximal distance in rfi ditection
 154    fCutMaxDz(40),   // maximal distance in rfi ditection
 155    fCutTheta(5*0.004644),// maximal distan theta
 156    fCutMinDir(-0.99),    // direction vector products
 157    fCutTracks(100),
 158    fArrayDz(0),            //Tmap of V drifts for different triggers
 159    fAlignITSTPC(0),      //alignemnt array ITS TPC match
 160    fAlignTRDTPC(0),      //alignemnt array TRD TPC match
 161    fAlignTOFTPC(0),      //alignemnt array TOF TPC match
 162    fTimeBins(0),
 163    fTimeStart(0),
 164    fTimeEnd(0),
 165    fPtBins(0),
 166    fPtStart(0),
 167    fPtEnd(0),
 168    fVdriftBins(0),
 169    fVdriftStart(0),
 170    fVdriftEnd(0),
 171    fRunBins(0),
 172    fRunStart(0),
 173    fRunEnd(0)
 174 {
 175   //
 176   // Non deafaul constructor - to be used in the Calibration setups
 177   //
 178
 179   SetName(name);
 180   SetTitle(title);
 181   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
 182     fHistVdriftLaserA[i]=0;
 183     fHistVdriftLaserC[i]=0;
 184   }
 185
 186   for (Int_t i=0;i<5;i++) {
 187     fResHistoTPCITS[i]=0;
 188     fResHistoTPCTRD[i]=0;
 189     fResHistoTPCvertex[i]=0;
 190   }
 191
 192
 193   AliInfo("Non Default Constructor");
 194   fTimeBins   =(EndTime-StartTime)/deltaIntegrationTimeVdrift;
 195   fTimeStart  =StartTime; //(((TObjString*)(mapGRP->GetValue("fAliceStartTime")))->GetString()).Atoi();
 196   fTimeEnd    =EndTime;   //(((TObjString*)(mapGRP->GetValue("fAliceStopTime")))->GetString()).Atoi();
 197   fPtBins     = 400;
 198   fPtStart    = -0.04;
 199   fPtEnd      =  0.04;
 200   fVdriftBins = 500;
 201   fVdriftStart= -0.1;
 202   fVdriftEnd  =  0.1;
 203   fRunBins    = 1000001;
 204   fRunStart   = -1.5;
 205   fRunEnd     = 999999.5;
 206
 207   Int_t    binsVdriftLaser[4] = {fTimeBins , fPtBins , fVdriftBins*20, fRunBins };
 208   Double_t xminVdriftLaser[4] = {fTimeStart, fPtStart, fVdriftStart  , fRunStart};
 209   Double_t xmaxVdriftLaser[4] = {fTimeEnd  , fPtEnd  , fVdriftEnd    , fRunEnd  };
 210   TString axisTitle[4]={
 211     "T",
 212     "#delta_{P/T}",
 213     "value",
 214     "run"
 215   };
 216   TString histoName[3]={
 217     "Loffset",
 218     "Lcorr",
 219     "Lgy"
 220   };
 221
 222
 223   for (Int_t i=0;i<3;i++) {
 224     fHistVdriftLaserA[i] = new THnSparseF("HistVdriftLaser","HistVdriftLaser;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,binsVdriftLaser,xminVdriftLaser,xmaxVdriftLaser);
 225     fHistVdriftLaserC[i] = new THnSparseF("HistVdriftLaser","HistVdriftLaser;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,binsVdriftLaser,xminVdriftLaser,xmaxVdriftLaser);
 226     fHistVdriftLaserA[i]->SetName(histoName[i]);
 227     fHistVdriftLaserC[i]->SetName(histoName[i]);
 228     for (Int_t iaxis=0; iaxis<4;iaxis++){
 229       fHistVdriftLaserA[i]->GetAxis(iaxis)->SetName(axisTitle[iaxis]);
 230       fHistVdriftLaserC[i]->GetAxis(iaxis)->SetName(axisTitle[iaxis]);
 231     }
 232   }
 233   fBinsVdrift[0] = fTimeBins;
 234   fBinsVdrift[1] = fPtBins;
 235   fBinsVdrift[2] = fVdriftBins;
 236   fBinsVdrift[3] = fRunBins;
 237   fXminVdrift[0] = fTimeStart;
 238   fXminVdrift[1] = fPtStart;
 239   fXminVdrift[2] = fVdriftStart;
 240   fXminVdrift[3] = fRunStart;
 241   fXmaxVdrift[0] = fTimeEnd;
 242   fXmaxVdrift[1] = fPtEnd;
 243   fXmaxVdrift[2] = fVdriftEnd;
 244   fXmaxVdrift[3] = fRunEnd;
 245
 246   fArrayDz=new TObjArray();
 247   fAlignITSTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
 248   fAlignTRDTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
 249   fAlignTOFTPC = new TObjArray;      //alignemnt array ITS TPC match
 250   fAlignITSTPC->SetOwner(kTRUE);
 251   fAlignTRDTPC->SetOwner(kTRUE);
 252   fAlignTOFTPC->SetOwner(kTRUE);
 253
 254
 255   fCosmiMatchingHisto[0]=new TH1F("Cosmics matching","p0-all"   ,100,-10*0.5356  ,10*0.5356  );
 256   fCosmiMatchingHisto[1]=new TH1F("Cosmics matching","p1-all"   ,100,-10*4.541   ,10*4.541   );
 257   fCosmiMatchingHisto[2]=new TH1F("Cosmics matching","p2-all"   ,100,-10*0.01134 ,10*0.01134 );
 258   fCosmiMatchingHisto[3]=new TH1F("Cosmics matching","p3-all"   ,100,-10*0.004644,10*0.004644);
 259   fCosmiMatchingHisto[4]=new TH1F("Cosmics matching","p4-all"   ,100,-10*0.03773 ,10*0.03773 );
 260   fCosmiMatchingHisto[5]=new TH1F("Cosmics matching","p0-isPair",100,-10*0.5356  ,10*0.5356  );
 261   fCosmiMatchingHisto[6]=new TH1F("Cosmics matching","p1-isPair",100,-10*4.541   ,10*4.541   );
 262   fCosmiMatchingHisto[7]=new TH1F("Cosmics matching","p2-isPair",100,-10*0.01134 ,10*0.01134 );
 263   fCosmiMatchingHisto[8]=new TH1F("Cosmics matching","p3-isPair",100,-10*0.004644,10*0.004644);
 264   fCosmiMatchingHisto[9]=new TH1F("Cosmics matching","p4-isPair",100,-10*0.03773 ,10*0.03773 );
 265   BookDistortionMaps();
 266 }
 267
 268 AliTPCcalibTime::~AliTPCcalibTime(){
 269   //
 270   // Virtual Destructor
 271   //
 272   for(Int_t i=0;i<3;i++){
 273     if(fHistVdriftLaserA[i]){
 274       delete fHistVdriftLaserA[i];
 275       fHistVdriftLaserA[i]=NULL;
 276     }
 277     if(fHistVdriftLaserC[i]){
 278       delete fHistVdriftLaserC[i];
 279       fHistVdriftLaserC[i]=NULL;
 280     }
 281   }
 282   if(fArrayDz){
 283     fArrayDz->SetOwner();
 284     fArrayDz->Delete();
 285     delete fArrayDz;
 286     fArrayDz=NULL;
 287   }
 288   for(Int_t i=0;i<5;i++){
 289     if(fCosmiMatchingHisto[i]){
 290       delete fCosmiMatchingHisto[i];
 291       fCosmiMatchingHisto[i]=NULL;
 292     }
 293   }
 294
 295   for (Int_t i=0;i<5;i++) {
 296     delete fResHistoTPCITS[i];
 297     delete fResHistoTPCTRD[i];
 298     delete fResHistoTPCvertex[i];
 299     fResHistoTPCITS[i]=0;
 300     fResHistoTPCTRD[i]=0;
 301     fResHistoTPCvertex[i]=0;
 302   }
 303
 304
 305   fAlignITSTPC->SetOwner(kTRUE);
 306   fAlignTRDTPC->SetOwner(kTRUE);
 307   fAlignTOFTPC->SetOwner(kTRUE);
 308
 309   fAlignITSTPC->Delete();
 310   fAlignTRDTPC->Delete();
 311   fAlignTOFTPC->Delete();
 312   delete fAlignITSTPC;
 313   delete fAlignTRDTPC;
 314   delete fAlignTOFTPC;
 315 }
 316
 317 Bool_t AliTPCcalibTime::IsLaser(const AliESDEvent *const /*event*/){
 318   //
 319   // Indicator is laser event not yet implemented  - to be done using trigger info or event specie
 320   //
 321   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
 322 }
 323 Bool_t AliTPCcalibTime::IsCosmics(const AliESDEvent *const /*event*/){
 324   //
 325   // Indicator is cosmic event not yet implemented - to be done using trigger info or event specie
 326   //
 327
 328   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
 329 }
 330 Bool_t AliTPCcalibTime::IsBeam(const AliESDEvent *const /*event*/){
 331   //
 332   // Indicator is physic event not yet implemented - to be done using trigger info or event specie
 333   //
 334
 335   return kTRUE; //More accurate creteria to be added
 336 }
 337 void AliTPCcalibTime::ResetCurrent(){
 338   fDz=0; //Reset current dz
 339 }
 340
 341
 342
 343 void AliTPCcalibTime::Process(AliESDEvent *event){
 344   //
 345   // main function to make calibration
 346   //
 347   if(!event) return;
 348   if (event->GetNumberOfTracks()<2) return;
 349   ResetCurrent();
 350   if(IsLaser  (event)) ProcessLaser (event);
 351   if(IsCosmics(event)) ProcessCosmic(event);
 352   if(IsBeam   (event)) ProcessBeam  (event);
 353 }
 354
 355 void AliTPCcalibTime::ProcessLaser(AliESDEvent *event){
 356   //
 357   // Fit drift velocity using laser
 358   //
 359   // 0. cuts
 360   const Int_t    kMinTracks     = 40;    // minimal number of laser tracks
 361   const Int_t    kMinTracksSide = 20;    // minimal number of tracks per side
 362   const Float_t  kMaxDeltaZ     = 30.;   // maximal trigger delay
 363   const Float_t  kMaxDeltaV     = 0.05;  // maximal deltaV
 364   const Float_t  kMaxRMS        = 0.1;   // maximal RMS of tracks
 365   //
 366   /*
 367     TCut cutRMS("sqrt(laserA.fElements[4])<0.1&&sqrt(laserC.fElements[4])<0.1");
 368     TCut cutZ("abs(laserA.fElements[0]-laserC.fElements[0])<3");
 369     TCut cutV("abs(laserA.fElements[1]-laserC.fElements[1])<0.01");
 370     TCut cutY("abs(laserA.fElements[2]-laserC.fElements[2])<2");
 371     TCut cutAll = cutRMS+cutZ+cutV+cutY;
 372   */
 373   if (event->GetNumberOfTracks()<kMinTracks) return;
 374   //
 375   if(!fLaser) fLaser = new AliTPCcalibLaser("laserTPC","laserTPC",kFALSE);
 376   fLaser->Process(event);
 377   if (fLaser->GetNtracks()<kMinTracks) return;   // small amount of tracks cut
 378   if (fLaser->fFitAside->GetNrows()==0  && fLaser->fFitCside->GetNrows()==0) return;  // no fit neither a or C side
 379   //
 380   // debug streamer  - activate stream level
 381   // Use it for tuning of the cuts
 382   //
 383   // cuts to be applied
 384   //
 385   Int_t isReject[2]={0,0};
 386   //
 387   // not enough tracks
 388   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[3]) < kMinTracksSide) isReject[0]|=1;
 389   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[3]) < kMinTracksSide) isReject[1]|=1;
 390   // unreasonable z offset
 391   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[0])>kMaxDeltaZ)  isReject[0]|=2;
 392   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[0])>kMaxDeltaZ)  isReject[1]|=2;
 393   // unreasonable drift velocity
 394   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[1]-1)>kMaxDeltaV)  isReject[0]|=4;
 395   if (TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[1]-1)>kMaxDeltaV)  isReject[1]|=4;
 396   // big chi2
 397   if (TMath::Sqrt(TMath::Abs((*fLaser->fFitAside)[4]))>kMaxRMS ) isReject[0]|=8;
 398   if (TMath::Sqrt(TMath::Abs((*fLaser->fFitCside)[4]))>kMaxRMS ) isReject[1]|=8;
 399
 400
 401
 402
 403   if (fStreamLevel>0){
 404     printf("Trigger: %s\n",event->GetFiredTriggerClasses().Data());
 405
 406     TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
 407     if (cstream){
 408       TTimeStamp tstamp(fTime);
 409       (*cstream)<<"laserInfo"<<
 410         "run="<<fRun<<              //  run number
 411         "event="<<fEvent<<          //  event number
 412         "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
 413         "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
 414         "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
 415         //laser
 416         "rejectA="<<isReject[0]<<
 417         "rejectC="<<isReject[1]<<
 418         "laserA.="<<fLaser->fFitAside<<
 419         "laserC.="<<fLaser->fFitCside<<
 420         "laserAC.="<<fLaser->fFitACside<<
 421         "trigger="<<event->GetFiredTriggerClasses()<<
 422         "\n";
 423     }
 424   }
 425   //
 426   // fill histos
 427   //
 428   TVectorD vdriftA(5), vdriftC(5),vdriftAC(5);
 429   vdriftA=*(fLaser->fFitAside);
 430   vdriftC=*(fLaser->fFitCside);
 431   vdriftAC=*(fLaser->fFitACside);
 432   Int_t npointsA=0, npointsC=0;
 433   Float_t chi2A=0, chi2C=0;
 434   npointsA= TMath::Nint(vdriftA[3]);
 435   chi2A= vdriftA[4];
 436   npointsC= TMath::Nint(vdriftC[3]);
 437   chi2C= vdriftC[4];
 438
 439   TTimeStamp tstamp(fTime);
 440   Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
 441   Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
 442   Double_t driftA=0, driftC=0;
 443   if (vdriftA[1]>1.-kMaxDeltaV) driftA = 1./vdriftA[1]-1.;
 444   if (vdriftC[1]>1.-kMaxDeltaV) driftC = 1./vdriftC[1]-1.;
 445   //
 446   Double_t vecDriftLaserA[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,driftA,event->GetRunNumber()};
 447   Double_t vecDriftLaserC[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,driftC,event->GetRunNumber()};
 448   //  Double_t vecDrift[4]      ={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,1./((*(fLaser->fFitACside))[1])-1,event->GetRunNumber()};
 449
 450   for (Int_t icalib=0;icalib<3;icalib++){
 451     if (icalib==0){ //z0 shift
 452       vecDriftLaserA[2]=vdriftA[0]/250.;
 453       vecDriftLaserC[2]=vdriftC[0]/250.;
 454     }
 455     if (icalib==1){ //vdrel shift
 456       vecDriftLaserA[2]=driftA;
 457       vecDriftLaserC[2]=driftC;
 458     }
 459     if (icalib==2){ //gy shift - full gy - full drift
 460       vecDriftLaserA[2]=vdriftA[2]/250.;
 461       vecDriftLaserC[2]=vdriftC[2]/250.;
 462     }
 463     //if (isReject[0]==0) fHistVdriftLaserA[icalib]->Fill(vecDriftLaserA);
 464     //if (isReject[1]==0) fHistVdriftLaserC[icalib]->Fill(vecDriftLaserC);
 465     fHistVdriftLaserA[icalib]->Fill(vecDriftLaserA);
 466     fHistVdriftLaserC[icalib]->Fill(vecDriftLaserC);
 467   }
 468
 469 //   THnSparse* curHist=new THnSparseF("","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 470 //   TString shortName=curHist->ClassName();
 471 //   shortName+="_MEAN_DRIFT_LASER_";
 472 //   delete curHist;
 473 //   curHist=NULL;
 474 //   TString name="";
 475
 476 //   name=shortName;
 477 //   name+=event->GetFiredTriggerClasses();
 478 //   name.ToUpper();
 479 //   curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
 480 //   if(!curHist){
 481 //     curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 482 //     fArrayDz->AddLast(curHist);
 483 //   }
 484 //   curHist->Fill(vecDrift);
 485
 486 //   name=shortName;
 487 //   name+="ALL";
 488 //   name.ToUpper();
 489 //   curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
 490 //   if(!curHist){
 491 //     curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 492 //     fArrayDz->AddLast(curHist);
 493 //   }
 494 //   curHist->Fill(vecDrift);
 495 }
 496
 497 void AliTPCcalibTime::ProcessCosmic(const AliESDEvent *const event){
 498   //
 499   // process Cosmic event - track matching A side C side
 500   //
 501   if (!event) {
 502     Printf("ERROR: ESD not available");
 503     return;
 504   }
 505   if (event->GetTimeStamp() == 0 ) {
 506     Printf("no time stamp!");
 507     return;
 508   }
 509
 510   //fd
 511   // Find cosmic pairs
 512   //
 513   // Track0 is choosen in upper TPC part
 514   // Track1 is choosen in lower TPC part
 515   //
 516   const Int_t kMinClustersCross =30;
 517   const Int_t kMinClusters      =80;
 518   Int_t ntracks=event->GetNumberOfTracks();
 519   if (ntracks==0) return;
 520   if (ntracks > fCutTracks) return;
 521
 522   if (GetDebugLevel()>20) printf("Hallo world: Im here\n");
 523   AliESDfriend *esdFriend=(AliESDfriend*)(((AliESDEvent*)event)->FindListObject("AliESDfriend"));
 524
 525   TObjArray  tpcSeeds(ntracks);
 526   Double_t vtxx[3]={0,0,0};
 527   Double_t svtxx[3]={0.000001,0.000001,100.};
 528   AliESDVertex vtx(vtxx,svtxx);
 529   //
 530   // track loop
 531   //
 532   TArrayI clusterSideA(ntracks);
 533   TArrayI clusterSideC(ntracks);
 534   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
 535     clusterSideA[i]=0;
 536     clusterSideC[i]=0;
 537     AliESDtrack *track = event->GetTrack(i);
 538
 539     const AliExternalTrackParam * trackIn = track->GetInnerParam();
 540     const AliExternalTrackParam * trackOut = track->GetOuterParam();
 541     if (!trackIn) continue;
 542     if (!trackOut) continue;
 543
 544     AliESDfriendTrack *friendTrack = esdFriend->GetTrack(i);
 545     if (!friendTrack) continue;
 546     if (friendTrack) ProcessSame(track,friendTrack,event);
 547     if (friendTrack) ProcessAlignITS(track,friendTrack,event,esdFriend);
 548     if (friendTrack) ProcessAlignTRD(track,friendTrack);
 549     if (friendTrack) ProcessAlignTOF(track,friendTrack);
 550     TObject *calibObject;
 551     AliTPCseed *seed = 0;
 552     for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
 553     if (seed) {
 554       tpcSeeds.AddAt(seed,i);
 555       Int_t nA=0, nC=0;
 556       for (Int_t irow=159;irow>0;irow--) {
 557         AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
 558         if (!cl) continue;
 559         if ((cl->GetDetector()%36)<18) nA++;
 560         if ((cl->GetDetector()%36)>=18) nC++;
 561       }
 562       clusterSideA[i]=nA;
 563       clusterSideC[i]=nC;
 564     }
 565   }
 566   if (ntracks<2) return;
 567   //
 568   // Find pairs
 569   //
 570
 571   for (Int_t i=0;i<ntracks;++i) {
 572     AliESDtrack *track0 = event->GetTrack(i);
 573     // track0 - choosen upper part
 574     if (!track0) continue;
 575     if (!track0->GetOuterParam()) continue;
 576     if (track0->GetOuterParam()->GetAlpha()<0) continue;
 577     Double_t d1[3];
 578     track0->GetDirection(d1);
 579     for (Int_t j=0;j<ntracks;++j) {
 580       if (i==j) continue;
 581       AliESDtrack *track1 = event->GetTrack(j);
 582       //track 1 lower part
 583       if (!track1) continue;
 584       if (!track1->GetOuterParam()) continue;
 585       if (track0->GetTPCNcls()+ track1->GetTPCNcls()< kMinClusters) continue;
 586       Int_t nAC = TMath::Max( TMath::Min(clusterSideA[i], clusterSideC[j]),
 587                               TMath::Min(clusterSideC[i], clusterSideA[j]));
 588       if (nAC<kMinClustersCross) continue;
 589       Int_t nA0=clusterSideA[i];
 590       Int_t nC0=clusterSideC[i];
 591       Int_t nA1=clusterSideA[j];
 592       Int_t nC1=clusterSideC[j];
 593       //      if (track1->GetOuterParam()->GetAlpha()>0) continue;
 594       //
 595       Double_t d2[3];
 596       track1->GetDirection(d2);
 597
 598       AliTPCseed * seed0 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(i);
 599       AliTPCseed * seed1 = (AliTPCseed*) tpcSeeds.At(j);
 600       if (! seed0) continue;
 601       if (! seed1) continue;
 602       Float_t dir = (d1[0]*d2[0] + d1[1]*d2[1] + d1[2]*d2[2]);
 603       Float_t dist0  = track0->GetLinearD(0,0);
 604       Float_t dist1  = track1->GetLinearD(0,0);
 605       //
 606       // conservative cuts - convergence to be guarantied
 607       // applying before track propagation
 608       if (TMath::Abs(TMath::Abs(dist0)-TMath::Abs(dist1))>fCutMaxD) continue;   // distance to the 0,0
 609       if (TMath::Abs(dir)<TMath::Abs(fCutMinDir)) continue;               // direction vector product
 610       Float_t bz = AliTracker::GetBz();
 611       Float_t dvertex0[2];   //distance to 0,0
 612       Float_t dvertex1[2];   //distance to 0,0
 613       track0->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
 614       track1->GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
 615       if (TMath::Abs(dvertex0[1])>250) continue;
 616       if (TMath::Abs(dvertex1[1])>250) continue;
 617       //
 618       //
 619       //
 620       Float_t dmax = TMath::Max(TMath::Abs(dist0),TMath::Abs(dist1));
 621       AliExternalTrackParam param0(*track0);
 622       AliExternalTrackParam param1(*track1);
 623       //
 624       // Propagate using Magnetic field and correct fo material budget
 625       //
 626       AliTracker::PropagateTrackTo(&param0,dmax+1,TDatabasePDG::Instance()->GetParticle("e-")->Mass(),3,kTRUE);
 627       AliTracker::PropagateTrackTo(&param1,dmax+1,TDatabasePDG::Instance()->GetParticle("e-")->Mass(),3,kTRUE);
 628       //
 629       // Propagate rest to the 0,0 DCA - z should be ignored
 630       //
 631       //Bool_t b0 = ;
 632       param0.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
 633       //Bool_t b1 =
 634       param1.PropagateToDCA(&vtx,bz,1000);
 635       param0.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex0);
 636       param1.GetDZ(0,0,0,bz,dvertex1);
 637       Double_t xyz0[3];
 638       Double_t xyz1[3];
 639       param0.GetXYZ(xyz0);
 640       param1.GetXYZ(xyz1);
 641       Bool_t isPair = IsPair(&param0,&param1);
 642       Bool_t isCross = IsCross(track0, track1);
 643       Bool_t isSame = IsSame(track0, track1);
 644
 645       THnSparse* hist=new THnSparseF("","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 646       TString shortName=hist->ClassName();
 647       shortName+="_MEAN_VDRIFT_COSMICS_";
 648       delete hist;
 649       hist=NULL;
 650
 651       if((isSame) || (isCross && isPair)){
 652         if (track0->GetTPCNcls()+ track1->GetTPCNcls()> 80) {
 653           fDz = param0.GetZ() - param1.GetZ();
 654           Double_t sign=(nA0>nA1)? 1:-1;
 655           fDz*=sign;
 656           TTimeStamp tstamp(fTime);
 657           Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
 658           Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
 659           Double_t vecDrift[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,fDz/500.0,event->GetRunNumber()};
 660           THnSparse* curHist=NULL;
 661           TString name="";
 662
 663           name=shortName;
 664           name+=event->GetFiredTriggerClasses();
 665           name.ToUpper();
 666           curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
 667           if(!curHist){
 668             curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 669             fArrayDz->AddLast(curHist);
 670           }
 671 //        curHist=(THnSparseF*)(fMapDz->GetValue(event->GetFiredTriggerClasses()));
 672 //        if(!curHist){
 673 //          curHist=new THnSparseF(event->GetFiredTriggerClasses(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 674 //          fMapDz->Add(new TObjString(event->GetFiredTriggerClasses()),curHist);
 675 //        }
 676           curHist->Fill(vecDrift);
 677
 678           name=shortName;
 679           name+="ALL";
 680           name.ToUpper();
 681           curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
 682           if(!curHist){
 683             curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 684             fArrayDz->AddLast(curHist);
 685           }
 686 //        curHist=(THnSparseF*)(fMapDz->GetValue("all"));
 687 //        if(!curHist){
 688 //          curHist=new THnSparseF("all","HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 689 //          fMapDz->Add(new TObjString("all"),curHist);
 690 //        }
 691           curHist->Fill(vecDrift);
 692         }
 693       }
 694       TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
 695       if (fStreamLevel>0){
 696         if (cstream){
 697         (*cstream)<<"trackInfo"<<
 698           "tr0.="<<track0<<
 699           "tr1.="<<track1<<
 700           "p0.="<<&param0<<
 701           "p1.="<<&param1<<
 702           "nAC="<<nAC<<
 703           "nA0="<<nA0<<
 704           "nA1="<<nA1<<
 705           "nC0="<<nC0<<
 706           "nC1="<<nC1<<
 707           "isPair="<<isPair<<
 708           "isCross="<<isCross<<
 709           "isSame="<<isSame<<
 710           "fDz="<<fDz<<
 711           "fRun="<<fRun<<
 712           "fTime="<<fTime<<
 713           "\n";
 714         }
 715       }
 716     } // end 2nd order loop
 717   } // end 1st order loop
 718
 719   if (fStreamLevel>0){
 720     TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
 721     if (cstream){
 722       (*cstream)<<"timeInfo"<<
 723         "run="<<fRun<<              //  run number
 724         "event="<<fEvent<<          //  event number
 725         "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
 726         "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
 727         "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
 728         // Environment values
 729         //
 730         // accumulated values
 731         //
 732         "fDz="<<fDz<<          //! current delta z
 733         "trigger="<<event->GetFiredTriggerClasses()<<
 734         "\n";
 735     }
 736   }
 737   if (GetDebugLevel()>20) printf("Trigger: %s\n",event->GetFiredTriggerClasses().Data());
 738 }
 739
 740 void AliTPCcalibTime::ProcessBeam(const AliESDEvent *const /*event*/){
 741   //
 742   // Not special treatment yet - the same for cosmic and physic event
 743   //
 744 }
 745
 746 void AliTPCcalibTime::Analyze(){
 747   //
 748   // Special macro to analyze result of calibration and extract calibration entries
 749   // Not yet ported to the Analyze function yet
 750   //
 751 }
 752
 753 THnSparse* AliTPCcalibTime::GetHistoDrift(const char* name) const
 754 {
 755   //
 756   // Get histogram for given trigger mask
 757   //
 758   TIterator* iterator = fArrayDz->MakeIterator();
 759   iterator->Reset();
 760   TString newName=name;
 761   newName.ToUpper();
 762   THnSparse* newHist=new THnSparseF(newName,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 763   THnSparse* addHist=NULL;
 764   while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())){
 765   if(!addHist) continue;
 766     TString histName=addHist->GetName();
 767     if(!histName.Contains(newName)) continue;
 768     addHist->Print();
 769     newHist->Add(addHist);
 770   }
 771   return newHist;
 772 }
 773
 774 TObjArray* AliTPCcalibTime::GetHistoDrift() const
 775 {
 776   //
 777   // return array of histograms
 778   //
 779   return fArrayDz;
 780 }
 781
 782 TGraphErrors* AliTPCcalibTime::GetGraphDrift(const char* name){
 783   //
 784   // Make a drift velocity (delta Z) graph
 785   //
 786   THnSparse* histoDrift=GetHistoDrift(name);
 787   TGraphErrors* graphDrift=NULL;
 788   if(histoDrift){
 789     graphDrift=FitSlices(histoDrift,2,0,400,100,0.05,0.95, kTRUE);
 790     TString end=histoDrift->GetName();
 791     Int_t pos=end.Index("_");
 792     end=end(pos,end.Capacity()-pos);
 793     TString graphName=graphDrift->ClassName();
 794     graphName+=end;
 795     graphName.ToUpper();
 796     graphDrift->SetName(graphName);
 797   }
 798   return graphDrift;
 799 }
 800
 801 TObjArray* AliTPCcalibTime::GetGraphDrift(){
 802   //
 803   // make a array of drift graphs
 804   //
 805   TObjArray* arrayGraphDrift=new TObjArray();
 806   TIterator* iterator=fArrayDz->MakeIterator();
 807   iterator->Reset();
 808   THnSparse* addHist=NULL;
 809   while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())) arrayGraphDrift->AddLast(GetGraphDrift(addHist->GetName()));
 810   return arrayGraphDrift;
 811 }
 812
 813 AliSplineFit* AliTPCcalibTime::GetFitDrift(const char* name){
 814   //
 815   // Make a fit AliSplinefit  of drift velocity
 816   //
 817   TGraph* graphDrift=GetGraphDrift(name);
 818   AliSplineFit* fitDrift=NULL;
 819   if(graphDrift && graphDrift->GetN()){
 820     fitDrift=new AliSplineFit();
 821     fitDrift->SetGraph(graphDrift);
 822     fitDrift->SetMinPoints(graphDrift->GetN()+1);
 823     fitDrift->InitKnots(graphDrift,2,0,0.001);
 824     fitDrift->SplineFit(0);
 825     TString end=graphDrift->GetName();
 826     Int_t pos=end.Index("_");
 827     end=end(pos,end.Capacity()-pos);
 828     TString fitName=fitDrift->ClassName();
 829     fitName+=end;
 830     fitName.ToUpper();
 831     //fitDrift->SetName(fitName);
 832     delete graphDrift;
 833     graphDrift=NULL;
 834   }
 835   return fitDrift;
 836 }
 837
 838
 839 Long64_t AliTPCcalibTime::Merge(TCollection *const li) {
 840   //
 841   // Object specific merging procedure
 842   //
 843   TIterator* iter = li->MakeIterator();
 844   AliTPCcalibTime* cal = 0;
 845
 846   while ((cal = (AliTPCcalibTime*)iter->Next())) {
 847     if (!cal->InheritsFrom(AliTPCcalibTime::Class())) {
 848       Error("Merge","Attempt to add object of class %s to a %s", cal->ClassName(), this->ClassName());
 849       return -1;
 850     }
 851     for (Int_t imeas=0; imeas<3; imeas++){
 852       if (cal->GetHistVdriftLaserA(imeas) && cal->GetHistVdriftLaserA(imeas)){
 853         fHistVdriftLaserA[imeas]->Add(cal->GetHistVdriftLaserA(imeas));
 854         fHistVdriftLaserC[imeas]->Add(cal->GetHistVdriftLaserC(imeas));
 855       }
 856     }
 857     //
 858     for (Int_t imeas=0; imeas<5; imeas++){
 859       if (cal->GetResHistoTPCITS(imeas) && cal->GetResHistoTPCITS(imeas)){
 860         fResHistoTPCITS[imeas]->Add(cal->fResHistoTPCITS[imeas]);
 861         fResHistoTPCvertex[imeas]->Add(cal->fResHistoTPCvertex[imeas]);
 862         fResHistoTPCTRD[imeas]->Add(cal->fResHistoTPCTRD[imeas]);
 863       }
 864     }
 865     TObjArray* addArray=cal->GetHistoDrift();
 866     if(!addArray) return 0;
 867     TIterator* iterator = addArray->MakeIterator();
 868     iterator->Reset();
 869     THnSparse* addHist=NULL;
 870     while((addHist=(THnSparseF*)iterator->Next())){
 871       if(!addHist) continue;
 872       addHist->Print();
 873       THnSparse* localHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(addHist->GetName());
 874       if(!localHist){
 875         localHist=new THnSparseF(addHist->GetName(),"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
 876         fArrayDz->AddLast(localHist);
 877       }
 878       localHist->Add(addHist);
 879     }
 880
 881     for(Int_t i=0;i<10;i++) if (cal->GetCosmiMatchingHisto(i)) fCosmiMatchingHisto[i]->Add(cal->GetCosmiMatchingHisto(i));
 882     //
 883     // Merge alignment
 884     //
 885     for (Int_t itype=0; itype<3; itype++){
 886       //
 887       //
 888       TObjArray *arr0= 0;
 889       TObjArray *arr1= 0;
 890       if (itype==0) {arr0=fAlignITSTPC; arr1=cal->fAlignITSTPC;}
 891       if (itype==1) {arr0=fAlignTRDTPC; arr1=cal->fAlignTRDTPC;}
 892       if (itype==2) {arr0=fAlignTOFTPC; arr1=cal->fAlignTOFTPC;}
 893       if (!arr1) continue;
 894       if (!arr0) arr0=new TObjArray(arr1->GetEntriesFast());
 895       if (arr1->GetEntriesFast()>arr0->GetEntriesFast()){
 896         arr0->Expand(arr1->GetEntriesFast());
 897       }
 898       for (Int_t i=0;i<arr1->GetEntriesFast(); i++){
 899         AliRelAlignerKalman *kalman1 = (AliRelAlignerKalman *)arr1->UncheckedAt(i);
 900         AliRelAlignerKalman *kalman0 = (AliRelAlignerKalman *)arr0->UncheckedAt(i);
 901         if (!kalman1)  continue;
 902         if (!kalman0) {arr0->AddAt(new AliRelAlignerKalman(*kalman1),i); continue;}
 903         kalman0->SetRejectOutliers(kFALSE);
 904         kalman0->Merge(kalman1);
 905       }
 906     }
 907
 908   }
 909   return 0;
 910 }
 911
 912 Bool_t  AliTPCcalibTime::IsPair(AliExternalTrackParam *tr0, AliExternalTrackParam *tr1){
 913   /*
 914   // 0. Same direction - OPOSITE  - cutDir +cutT
 915   TCut cutDir("cutDir","dir<-0.99")
 916   // 1.
 917   TCut cutT("cutT","abs(Tr1.fP[3]+Tr0.fP[3])<0.03")
 918   //
 919   // 2. The same rphi
 920   TCut cutD("cutD","abs(Tr0.fP[0]+Tr1.fP[0])<5")
 921   //
 922   TCut cutPt("cutPt","abs(Tr1.fP[4]+Tr0.fP[4])<1&&abs(Tr0.fP[4])+abs(Tr1.fP[4])<10");
 923   // 1/Pt diff cut
 924   */
 925   const Double_t *p0 = tr0->GetParameter();
 926   const Double_t *p1 = tr1->GetParameter();
 927   fCosmiMatchingHisto[0]->Fill(p0[0]+p1[0]);
 928   fCosmiMatchingHisto[1]->Fill(p0[1]-p1[1]);
 929   fCosmiMatchingHisto[2]->Fill(tr1->GetAlpha()-tr0->GetAlpha()+TMath::Pi());
 930   fCosmiMatchingHisto[3]->Fill(p0[3]+p1[3]);
 931   fCosmiMatchingHisto[4]->Fill(p0[4]+p1[4]);
 932
 933   if (TMath::Abs(p0[3]+p1[3])>fCutTheta) return kFALSE;
 934   if (TMath::Abs(p0[0]+p1[0])>fCutMaxD)  return kFALSE;
 935   if (TMath::Abs(p0[1]-p1[1])>fCutMaxDz)  return kFALSE;
 936   Double_t d0[3], d1[3];
 937   tr0->GetDirection(d0);
 938   tr1->GetDirection(d1);
 939   if (d0[0]*d1[0] + d0[1]*d1[1] + d0[2]*d1[2] >fCutMinDir) return kFALSE;
 940
 941   fCosmiMatchingHisto[5]->Fill(p0[0]+p1[0]);
 942   fCosmiMatchingHisto[6]->Fill(p0[1]-p1[1]);
 943   fCosmiMatchingHisto[7]->Fill(tr1->GetAlpha()-tr0->GetAlpha()+TMath::Pi());
 944   fCosmiMatchingHisto[8]->Fill(p0[3]+p1[3]);
 945   fCosmiMatchingHisto[9]->Fill(p0[4]+p1[4]);
 946
 947   return kTRUE;
 948 }
 949 Bool_t AliTPCcalibTime::IsCross(AliESDtrack *const tr0, AliESDtrack *const tr1){
 950   //
 951   // check if the cosmic pair of tracks crossed A/C side
 952   //
 953   Bool_t result= tr0->GetOuterParam()->GetZ()*tr1->GetOuterParam()->GetZ()<0;
 954   if (result==kFALSE) return result;
 955   result=kTRUE;
 956   return result;
 957 }
 958
 959 Bool_t AliTPCcalibTime::IsSame(AliESDtrack *const tr0, AliESDtrack *const tr1){
 960   //
 961   // track crossing the CE
 962   // 0. minimal number of clusters
 963   // 1. Same sector +-1
 964   // 2. Inner and outer track param on opposite side
 965   // 3. Outer and inner track parameter close each to other
 966   // 3.
 967   Bool_t result=kTRUE;
 968   //
 969   // inner and outer on opposite sides in z
 970   //
 971   const Int_t knclCut0  = 30;
 972   const Double_t kalphaCut = 0.4;
 973   //
 974   // 0. minimal number of clusters
 975   //
 976   if (tr0->GetTPCNcls()<knclCut0) return kFALSE;
 977   if (tr1->GetTPCNcls()<knclCut0) return kFALSE;
 978   //
 979   // 1. alpha cut - sector+-1
 980   //
 981   if (TMath::Abs(tr0->GetOuterParam()->GetAlpha()-tr1->GetOuterParam()->GetAlpha())>kalphaCut) return kFALSE;
 982   //
 983   // 2. Z crossing
 984   //
 985   if (tr0->GetOuterParam()->GetZ()*tr0->GetInnerParam()->GetZ()>0) result&=kFALSE;
 986   if (tr1->GetOuterParam()->GetZ()*tr1->GetInnerParam()->GetZ()>0) result&=kFALSE;
 987   if (result==kFALSE){
 988     return result;
 989   }
 990   //
 991   //
 992   const Double_t *p0I = tr0->GetInnerParam()->GetParameter();
 993   const Double_t *p1I = tr1->GetInnerParam()->GetParameter();
 994   const Double_t *p0O = tr0->GetOuterParam()->GetParameter();
 995   const Double_t *p1O = tr1->GetOuterParam()->GetParameter();
 996   //
 997   if (TMath::Abs(p0I[0]-p1I[0])>fCutMaxD)  result&=kFALSE;
 998   if (TMath::Abs(p0I[1]-p1I[1])>fCutMaxDz) result&=kFALSE;
 999   if (TMath::Abs(p0I[2]-p1I[2])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1000   if (TMath::Abs(p0I[3]-p1I[3])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1001   if (TMath::Abs(p0O[0]-p1O[0])>fCutMaxD)  result&=kFALSE;
1002   if (TMath::Abs(p0O[1]-p1O[1])>fCutMaxDz) result&=kFALSE;
1003   if (TMath::Abs(p0O[2]-p1O[2])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1004   if (TMath::Abs(p0O[3]-p1O[3])>fCutTheta) result&=kFALSE;
1005   if (result==kTRUE){
1006     result=kTRUE; // just to put break point here
1007   }
1008   return result;
1009 }
1010
1011
1012 void  AliTPCcalibTime::ProcessSame(AliESDtrack *const track, AliESDfriendTrack *const friendTrack, const AliESDEvent *const event){
1013   //
1014   // Process  TPC tracks crossing CE
1015   //
1016   // 0. Select only track crossing the CE
1017   // 1. Cut on the track length
1018   // 2. Refit the terack on A and C side separatelly
1019   // 3. Fill time histograms
1020   const Int_t kMinNcl=100;
1021   const Int_t kMinNclS=25;  // minimul number of clusters on the sides
1022   if (!friendTrack->GetTPCOut()) return;
1023   //
1024   // 0. Select only track crossing the CE
1025   //
1026   if (track->GetInnerParam()->GetZ()*friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()>0) return;
1027   //
1028   // 1. cut on track length
1029   //
1030   if (track->GetTPCNcls()<kMinNcl) return;
1031   //
1032   // 2. Refit track sepparatel on A and C side
1033   //
1034   TObject *calibObject;
1035   AliTPCseed *seed = 0;
1036   for (Int_t l=0;(calibObject=friendTrack->GetCalibObject(l));++l) {
1037     if ((seed=dynamic_cast<AliTPCseed*>(calibObject))) break;
1038   }
1039   if (!seed) return;
1040   //
1041   AliExternalTrackParam trackIn(*track->GetInnerParam());
1042   AliExternalTrackParam trackOut(*track->GetOuterParam());
1043   Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //use the same errors
1044   Double_t xyz[3]={0,0.,0.0};
1045   Double_t bz   =0;
1046   Int_t nclIn=0,nclOut=0;
1047   trackIn.ResetCovariance(30.);
1048   trackOut.ResetCovariance(30.);
1049   //
1050   //2.a Refit inner
1051   //
1052   for (Int_t irow=0;irow<159;irow++) {
1053     AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
1054     if (!cl) continue;
1055     if (cl->GetX()<80) continue;
1056     if (track->GetInnerParam()->GetZ()<0 &&(cl->GetDetector()%36)<18) break;
1057     if (track->GetInnerParam()->GetZ()>0 &&(cl->GetDetector()%36)>=18) break;
1058     Int_t sector = cl->GetDetector();
1059     Float_t dalpha = TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-trackIn.GetAlpha();
1060     if (TMath::Abs(dalpha)>0.01){
1061       if (!trackIn.Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.))) break;
1062     }
1063     Double_t r[3]={cl->GetX(),cl->GetY(),cl->GetZ()};
1064     trackIn.GetXYZ(xyz);
1065     bz = AliTracker::GetBz(xyz);
1066     if (!trackIn.PropagateTo(r[0],bz)) break;
1067     nclIn++;
1068     trackIn.Update(&r[1],cov);
1069   }
1070   //
1071   //2.b Refit outer
1072   //
1073   for (Int_t irow=159;irow>0;irow--) {
1074     AliTPCclusterMI *cl=seed->GetClusterPointer(irow);
1075     if (!cl) continue;
1076     if (cl->GetX()<80) continue;
1077     if (cl->GetZ()*track->GetOuterParam()->GetZ()<0) break;
1078     if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()<0 &&(cl->GetDetector()%36)<18) break;
1079     if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()>0 &&(cl->GetDetector()%36)>=18) break;
1080     Int_t sector = cl->GetDetector();
1081     Float_t dalpha = TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-trackOut.GetAlpha();
1082     if (TMath::Abs(dalpha)>0.01){
1083       if (!trackOut.Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.))) break;
1084     }
1085     Double_t r[3]={cl->GetX(),cl->GetY(),cl->GetZ()};
1086     trackOut.GetXYZ(xyz);
1087     bz = AliTracker::GetBz(xyz);
1088     if (!trackOut.PropagateTo(r[0],bz)) break;
1089     nclOut++;
1090     trackOut.Update(&r[1],cov);
1091   }
1092   trackOut.Rotate(trackIn.GetAlpha());
1093   Double_t meanX = (trackIn.GetX()+trackOut.GetX())*0.5;
1094   trackIn.PropagateTo(meanX,bz);
1095   trackOut.PropagateTo(meanX,bz);
1096   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
1097   if (cstream){
1098     TVectorD gxyz(3);
1099     trackIn.GetXYZ(gxyz.GetMatrixArray());
1100     TTimeStamp tstamp(fTime);
1101     (*cstream)<<"tpctpc"<<
1102       "run="<<fRun<<              //  run number
1103       "event="<<fEvent<<          //  event number
1104       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1105       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1106       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1107       //
1108       "xyz.="<<&gxyz<<             // global position
1109       "tIn.="<<&trackIn<<         // refitterd track in
1110       "tOut.="<<&trackOut<<       // refitter track out
1111       "nclIn="<<nclIn<<           //
1112       "nclOut="<<nclOut<<         //
1113       "\n";
1114   }
1115   //
1116   // 3. Fill time histograms
1117   // Debug stremaer expression
1118   // chainTPCTPC->Draw("(tIn.fP[1]-tOut.fP[1])*sign(-tIn.fP[3]):tIn.fP[3]","min(nclIn,nclOut)>30","")
1119   if (TMath::Min(nclIn,nclOut)>kMinNclS){
1120     fDz = trackOut.GetZ()-trackIn.GetZ();
1121     if (trackOut.GetTgl()<0) fDz*=-1.;
1122     TTimeStamp tstamp(fTime);
1123     Double_t ptrelative0 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,0);
1124     Double_t ptrelative1 = AliTPCcalibDB::GetPTRelative(tstamp,fRun,1);
1125     Double_t vecDrift[4]={fTime,(ptrelative0+ptrelative1)/2.0,fDz/500.0,event->GetRunNumber()};
1126     //
1127     // fill histograms per trigger class and itegrated
1128     //
1129     THnSparse* curHist=NULL;
1130     for (Int_t itype=0; itype<2; itype++){
1131       TString name="MEAN_VDRIFT_CROSS_";
1132       if (itype==0){
1133         name+=event->GetFiredTriggerClasses();
1134         name.ToUpper();
1135       }else{
1136         name+="ALL";
1137       }
1138       curHist=(THnSparseF*)fArrayDz->FindObject(name);
1139       if(!curHist){
1140         curHist=new THnSparseF(name,"HistVdrift;time;p/T ratio;Vdrift;run",4,fBinsVdrift,fXminVdrift,fXmaxVdrift);
1141         fArrayDz->AddLast(curHist);
1142       }
1143       curHist->Fill(vecDrift);
1144     }
1145   }
1146
1147 }
1148
1149 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignITS(AliESDtrack *const track, AliESDfriendTrack *const friendTrack, const AliESDEvent *const event, AliESDfriend *const esdFriend){
1150   //
1151   // Process track - Update TPC-ITS alignment
1152   // Updates:
1153   // 0. Apply standartd cuts
1154   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1155   // 2. Apply median+-rms cut
1156   // 3. Update kalman filter
1157   //
1158   const Int_t    kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1159   const Int_t    kMinITS  = 3;     // minimal number of ITS cluster
1160   const Double_t kMinZ    = 10;    // maximal dz distance
1161   const Double_t kMaxDy   = 2.;    // maximal dy distance
1162   const Double_t kMaxAngle= 0.015;  // maximal angular distance
1163   const Double_t kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1164   const Double_t kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction
1165   const Double_t kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction
1166   const Double_t kOutCut  = 1.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1167   const Double_t kMinPt   = 0.3;   // minimal pt
1168   const  Int_t     kN=50;         // deepnes of history
1169   static Int_t     kglast=0;
1170   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1171   /*
1172     0. Standrd cuts:
1173     TCut cut="abs(pTPC.fP[2]-pITS.fP[2])<0.01&&abs(pTPC.fP[3]-pITS.fP[3])<0.01&&abs(pTPC.fP[2]-pITS.fP[2])<1";
1174   */
1175   //
1176   // 0. Apply standard cuts
1177   //
1178   Int_t dummycl[1000];
1179   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1180   if (track->GetITSclusters(dummycl)<kMinITS) return;  // minimal amount of clusters
1181   if (!track->IsOn(AliESDtrack::kTPCrefit)) return;
1182   if (!friendTrack->GetITSOut()) return;
1183   if (!track->GetInnerParam())   return;
1184   if (!track->GetOuterParam())   return;
1185   if (track->GetInnerParam()->Pt()<kMinPt)  return;
1186   // exclude crossing track
1187   if (track->GetOuterParam()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1188   if (TMath::Abs(track->GetInnerParam()->GetZ())<kMinZ)   return;
1189   if (track->GetInnerParam()->GetX()>90)   return;
1190   //
1191   AliExternalTrackParam &pTPC=(AliExternalTrackParam &)(*(track->GetInnerParam()));
1192   AliExternalTrackParam pITS(*(friendTrack->GetITSOut()));   // ITS standalone if possible
1193   AliExternalTrackParam pITS2(*(friendTrack->GetITSOut()));  //TPC-ITS track
1194   pITS2.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1195   //  pITS2.PropagateTo(pTPC.GetX(),fMagF);
1196   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pITS2,pTPC.GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
1197
1198   AliESDfriendTrack *itsfriendTrack=0;
1199   //
1200   // try to find standalone ITS track corresponing to the TPC if possible
1201   //
1202   Bool_t hasAlone=kFALSE;
1203   Int_t ntracks=event->GetNumberOfTracks();
1204   for (Int_t i=0; i<ntracks; i++){
1205     AliESDtrack *trackS = event->GetTrack(i);
1206     if (trackS->GetTPCNcls()>0) continue;   //continue if has TPC info
1207     itsfriendTrack = esdFriend->GetTrack(i);
1208     if (!itsfriendTrack) continue;
1209     if (!itsfriendTrack->GetITSOut()) continue;
1210     if (TMath::Abs(pITS2.GetTgl()-itsfriendTrack->GetITSOut()->GetTgl())> kMaxAngle) continue;
1211     pITS=(*(itsfriendTrack->GetITSOut()));
1212     //
1213     pITS.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1214     //pITS.PropagateTo(pTPC.GetX(),fMagF);
1215     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pITS,pTPC.GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
1216     if (TMath::Abs(pITS2.GetY()-pITS.GetY())> kMaxDy) continue;
1217     hasAlone=kTRUE;
1218   }
1219   if (!hasAlone) pITS=pITS2;
1220   //
1221   if (TMath::Abs(pITS.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1222   if (TMath::Abs(pITS.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1223   if (TMath::Abs(pITS.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1224   //
1225   // 1. Update median and RMS info
1226   //
1227   TVectorD vecDelta(5),vecMedian(5), vecRMS(5);
1228   TVectorD vecDeltaN(5);
1229   Double_t sign=(pITS.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1230   vecDelta[4]=0;
1231   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1232     vecDelta[i]=(pITS.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1233     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1234   }
1235   kglast=(kglast+1);
1236   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1237   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1238     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1239     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1240     vecDeltaN[i] = 0;
1241     if (vecRMS[i]>0.){
1242       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/vecRMS[i];
1243       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1244     }
1245   }
1246   //
1247   // 2. Apply median+-rms cut
1248   //
1249   if (kglast<3)  return;   //median and RMS to be defined
1250   if ( vecDeltaN[4]/4.>kSigmaCut) return;
1251   //
1252   // 3. Update alignment
1253   //
1254   Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1255   if (fAlignITSTPC->GetEntriesFast()<htime){
1256     fAlignITSTPC->Expand(htime*2+20);
1257   }
1258   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignITSTPC->At(htime);
1259   if (!align){
1260     // make Alignment object if doesn't exist
1261     align=new AliRelAlignerKalman();
1262     align->SetRunNumber(fRun);
1263     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1264     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1265     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1266     align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1267
1268     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1269     align->SetMagField(fMagF);
1270     fAlignITSTPC->AddAt(align,htime);
1271   }
1272   align->AddTrackParams(&pITS,&pTPC);
1273   align->SetTimeStamp(fTime);
1274   align->SetRunNumber(fRun );
1275   Float_t dca[2],cov[3];
1276   track->GetImpactParameters(dca,cov);
1277   if (TMath::Abs(dca[0])<kMaxDy){
1278     FillResHistoTPCITS(&pTPC,&pITS);
1279     FillResHistoTPC(track);
1280   }
1281   //
1282   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1283   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates));
1284   align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1285   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
1286   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1287     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1288     TVectorD gpITS(3), gdITS(3);
1289     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1290     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1291     pITS.GetXYZ(gpITS.GetMatrixArray());
1292     pITS.GetDirection(gdITS.GetMatrixArray());
1293     (*cstream)<<"itstpc"<<
1294       "run="<<fRun<<              //  run number
1295       "event="<<fEvent<<          //  event number
1296       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1297       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1298       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1299       //
1300       "hasAlone="<<hasAlone<<    // has ITS standalone ?
1301       "track.="<<track<<  // track info
1302       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1303       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1304       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1305       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1306       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1307       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1308       "a.="<<align<<            // current alignment
1309       "pITS.="<<&pITS<<         // track param ITS
1310       "pITS2.="<<&pITS2<<       // track param ITS+TPC
1311       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1312       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1313       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1314       "gpITS.="<<&gpITS<<       // global position  ITS
1315       "gdITS.="<<&gdITS<<       // global position  ITS
1316       "\n";
1317   }
1318 }
1319
1320
1321
1322
1323 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignTRD(AliESDtrack *const track, AliESDfriendTrack *const friendTrack){
1324   //
1325   // Process track - Update TPC-TRD alignment
1326   // Updates:
1327   // 0. Apply standartd cuts
1328   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1329   // 2. Apply median+-rms cut
1330   // 3. Update kalman filter
1331   //
1332   const Int_t    kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1333   const Int_t    kMinTRD  = 50;    // minimal number of TRD cluster
1334   const Double_t kMinZ    = 20;    // maximal dz distance
1335   const Double_t kMaxDy   = 5.;    // maximal dy distance
1336   const Double_t kMaxAngle= 0.1;  // maximal angular distance
1337   const Double_t kSigmaCut= 10;     // maximal sigma distance to median
1338   const Double_t kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction
1339   const Double_t kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction
1340   const Double_t kOutCut  = 1.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1341   const Double_t kRefX    = 275;   // reference X
1342   const  Int_t     kN=50;         // deepnes of history
1343   static Int_t     kglast=0;
1344   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1345   //
1346   // 0. Apply standard cuts
1347   //
1348   Int_t dummycl[1000];
1349   if (track->GetTRDclusters(dummycl)<kMinTRD) return;  // minimal amount of clusters
1350   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1351   if (!friendTrack->GetTRDIn()) return;
1352   if (!track->IsOn(AliESDtrack::kTRDrefit)) return;
1353   if (!track->IsOn(AliESDtrack::kTRDout)) return;
1354   if (!track->GetInnerParam())   return;
1355   if (!friendTrack->GetTPCOut())   return;
1356   // exclude crossing track
1357   if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1358   if (TMath::Abs(track->GetInnerParam()->GetZ())<kMinZ)   return;
1359   //
1360   AliExternalTrackParam &pTPC=(AliExternalTrackParam &)(*(friendTrack->GetTPCOut()));
1361   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,kRefX,0.1,0.1,kFALSE);
1362   AliExternalTrackParam pTRD(*(friendTrack->GetTRDIn()));
1363   pTRD.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1364   //  pTRD.PropagateTo(pTPC.GetX(),fMagF);
1365   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTRD,pTPC.GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
1366
1367   ((Double_t*)pTRD.GetCovariance())[2]+=3.*3.;   // increas sys errors
1368   ((Double_t*)pTRD.GetCovariance())[9]+=0.1*0.1; // increse sys errors
1369
1370   if (TMath::Abs(pTRD.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1371   if (TMath::Abs(pTRD.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1372   //  if (TMath::Abs(pTRD.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1373   //
1374   // 1. Update median and RMS info
1375   //
1376   TVectorD vecDelta(5),vecMedian(5), vecRMS(5);
1377   TVectorD vecDeltaN(5);
1378   Double_t sign=(pTRD.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1379   vecDelta[4]=0;
1380   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1381     vecDelta[i]=(pTRD.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1382     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1383   }
1384   kglast=(kglast+1);
1385   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1386   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1387     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1388
1389     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1390     vecDeltaN[i] = 0;
1391     if (vecRMS[i]>0.){
1392       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/vecRMS[i];
1393       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1394     }
1395   }
1396   //
1397   // 2. Apply median+-rms cut
1398   //
1399   if (kglast<3)  return;   //median and RMS to be defined
1400   if ( vecDeltaN[4]/4.>kSigmaCut) return;
1401   //
1402   // 3. Update alignment
1403   //
1404   Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1405   if (fAlignTRDTPC->GetEntriesFast()<htime){
1406     fAlignTRDTPC->Expand(htime*2+20);
1407   }
1408   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignTRDTPC->At(htime);
1409   if (!align){
1410     // make Alignment object if doesn't exist
1411     align=new AliRelAlignerKalman();
1412     align->SetRunNumber(fRun);
1413     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1414     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1415     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1416     align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1417     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1418     align->SetMagField(fMagF);
1419     fAlignTRDTPC->AddAt(align,htime);
1420   }
1421   align->AddTrackParams(&pTRD,&pTPC);
1422   align->SetTimeStamp(fTime);
1423   align->SetRunNumber(fRun );
1424   FillResHistoTPCTRD(&pTPC,&pTRD);
1425   //
1426   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1427   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates));
1428   align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1429   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
1430   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1431     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1432     TVectorD gpTRD(3), gdTRD(3);
1433     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1434     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1435     pTRD.GetXYZ(gpTRD.GetMatrixArray());
1436     pTRD.GetDirection(gdTRD.GetMatrixArray());
1437     (*cstream)<<"trdtpc"<<
1438       "run="<<fRun<<              //  run number
1439       "event="<<fEvent<<          //  event number
1440       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1441       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1442       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1443       //
1444       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1445       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1446       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1447       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1448       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1449       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1450       "a.="<<align<<            // current alignment
1451       "pTRD.="<<&pTRD<<         // track param TRD
1452       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1453       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1454       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1455       "gpTRD.="<<&gpTRD<<       // global position  TRD
1456       "gdTRD.="<<&gdTRD<<       // global position  TRD
1457       "\n";
1458   }
1459 }
1460
1461
1462 void  AliTPCcalibTime::ProcessAlignTOF(AliESDtrack *const track, AliESDfriendTrack *const friendTrack){
1463   //
1464   //
1465   // Process track - Update TPC-TOF alignment
1466   // Updates:
1467   // -1. Make a TOF "track"
1468   // 0. Apply standartd cuts
1469   // 1. Recalucluate the current statistic median/RMS
1470   // 2. Apply median+-rms cut
1471   // 3. Update kalman filter
1472   //
1473   const Int_t      kMinTPC  = 80;    // minimal number of TPC cluster
1474   //  const Double_t   kMinZ    = 10;    // maximal dz distance
1475   const Double_t   kMaxDy   = 5.;    // maximal dy distance
1476   const Double_t   kMaxAngle= 0.015;  // maximal angular distance
1477   const Double_t   kSigmaCut= 5;     // maximal sigma distance to median
1478   const Double_t   kVdErr   = 0.1;  // initial uncertainty of the vd correction
1479   const Double_t   kVdYErr  = 0.05;  // initial uncertainty of the vd correction
1480
1481   const Double_t   kOutCut  = 1.0;   // outlyer cut in AliRelAlgnmentKalman
1482   const  Int_t     kN=50;         // deepnes of history
1483   static Int_t     kglast=0;
1484   static Double_t* kgdP[4]={new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN], new Double_t[kN]};
1485   //
1486   // -1. Make a TOF track-
1487   //     Clusters are not in friends - use alingment points
1488   //
1489   if (track->GetTOFsignal()<=0)  return;
1490   if (!friendTrack->GetTPCOut()) return;
1491   if (!track->GetInnerParam())   return;
1492   if (!friendTrack->GetTPCOut())   return;
1493   const AliTrackPointArray *points=friendTrack->GetTrackPointArray();
1494   if (!points) return;
1495   AliExternalTrackParam pTPC(*(friendTrack->GetTPCOut()));
1496   AliExternalTrackParam pTOF(pTPC);
1497   Double_t mass = TDatabasePDG::Instance()->GetParticle("mu+")->Mass();
1498   Int_t npoints = points->GetNPoints();
1499   AliTrackPoint point;
1500   Int_t naccept=0;
1501   //
1502   for (Int_t ipoint=0;ipoint<npoints;ipoint++){
1503     points->GetPoint(point,ipoint);
1504     Float_t xyz[3];
1505     point.GetXYZ(xyz);
1506     Double_t r=TMath::Sqrt(xyz[0]*xyz[0]+xyz[1]*xyz[1]);
1507     if (r<350)  continue;
1508     if (r>400)  continue;
1509     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,r,mass,2.,kTRUE);
1510     AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPC,r,mass,0.1,kTRUE);
1511     AliTrackPoint lpoint = point.Rotate(pTPC.GetAlpha());
1512     pTPC.PropagateTo(lpoint.GetX(),fMagF);
1513     pTOF=pTPC;
1514     ((Double_t*)pTOF.GetParameter())[0] =lpoint.GetY();
1515     ((Double_t*)pTOF.GetParameter())[1] =lpoint.GetZ();
1516     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[0]+=3.*3./12.;
1517     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[2]+=3.*3./12.;
1518     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[5]+=0.1*0.1;
1519     ((Double_t*)pTOF.GetCovariance())[9]+=0.1*0.1;
1520     naccept++;
1521   }
1522   if (naccept==0) return;  // no tof match clusters
1523   //
1524   // 0. Apply standard cuts
1525   //
1526   if (track->GetTPCNcls()<kMinTPC) return;  // minimal amount of clusters cut
1527   // exclude crossing track
1528   if (friendTrack->GetTPCOut()->GetZ()*track->GetInnerParam()->GetZ()<0)   return;
1529   //
1530   if (TMath::Abs(pTOF.GetY()-pTPC.GetY())    >kMaxDy)    return;
1531   if (TMath::Abs(pTOF.GetSnp()-pTPC.GetSnp())>kMaxAngle) return;
1532   if (TMath::Abs(pTOF.GetTgl()-pTPC.GetTgl())>kMaxAngle) return;
1533   //
1534   // 1. Update median and RMS info
1535   //
1536   TVectorD vecDelta(5),vecMedian(5), vecRMS(5);
1537   TVectorD vecDeltaN(5);
1538   Double_t sign=(pTOF.GetParameter()[1]>0)? 1.:-1.;
1539   vecDelta[4]=0;
1540   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1541     vecDelta[i]=(pTOF.GetParameter()[i]-pTPC.GetParameter()[i])*sign;
1542     kgdP[i][kglast%kN]=vecDelta[i];
1543   }
1544   kglast=(kglast+1);
1545   Int_t entries=(kglast<kN)?kglast:kN;
1546   Bool_t isOK=kTRUE;
1547   for (Int_t i=0;i<4;i++){
1548     vecMedian[i] = TMath::Median(entries,kgdP[i]);
1549     vecRMS[i]    = TMath::RMS(entries,kgdP[i]);
1550     vecDeltaN[i] = 0;
1551     if (vecRMS[i]>0.){
1552       vecDeltaN[i] = (vecDelta[i]-vecMedian[i])/(vecRMS[i]+1.);
1553       vecDeltaN[4]+= TMath::Abs(vecDeltaN[i]);  //sum of abs residuals
1554       if (TMath::Abs(vecDeltaN[i])>kSigmaCut) isOK=kFALSE;
1555     }
1556   }
1557   //
1558   // 2. Apply median+-rms cut
1559   //
1560   if (kglast<10)  return;   //median and RMS to be defined
1561   if (!isOK) return;
1562   //
1563   // 3. Update alignment
1564   //
1565   Int_t htime = fTime/3600; //time in hours
1566   if (fAlignTOFTPC->GetEntriesFast()<htime){
1567     fAlignTOFTPC->Expand(htime*2+20);
1568   }
1569   AliRelAlignerKalman* align =  (AliRelAlignerKalman*)fAlignTOFTPC->At(htime);
1570   if (!align){
1571     // make Alignment object if doesn't exist
1572     align=new AliRelAlignerKalman();
1573     align->SetRunNumber(fRun);
1574     (*align->GetStateCov())(6,6)=kVdErr*kVdErr;
1575     (*align->GetStateCov())(8,8)=kVdYErr*kVdYErr;
1576     align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN);
1577     align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1578     align->SetTPCvd(AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetDriftV()/1000000.);
1579     align->SetMagField(fMagF);
1580     fAlignTOFTPC->AddAt(align,htime);
1581   }
1582   align->AddTrackParams(&pTOF,&pTPC);
1583   align->SetTimeStamp(fTime);
1584   align->SetRunNumber(fRun );
1585   //
1586   Int_t nupdates=align->GetNUpdates();
1587   align->SetOutRejSigma(kOutCut+kOutCut*kN/Double_t(nupdates));
1588   align->SetRejectOutliers(kFALSE);
1589   TTreeSRedirector *cstream = GetDebugStreamer();
1590   if (cstream && align->GetState() && align->GetState()->GetNrows()>2 ){
1591     TVectorD gpTPC(3), gdTPC(3);
1592     TVectorD gpTOF(3), gdTOF(3);
1593     pTPC.GetXYZ(gpTPC.GetMatrixArray());
1594     pTPC.GetDirection(gdTPC.GetMatrixArray());
1595     pTOF.GetXYZ(gpTOF.GetMatrixArray());
1596     pTOF.GetDirection(gdTOF.GetMatrixArray());
1597     (*cstream)<<"toftpc"<<
1598       "run="<<fRun<<              //  run number
1599       "event="<<fEvent<<          //  event number
1600       "time="<<fTime<<            //  time stamp of event
1601       "trigger="<<fTrigger<<      //  trigger
1602       "mag="<<fMagF<<             //  magnetic field
1603       //
1604       "nmed="<<kglast<<        // number of entries to define median and RMS
1605       "vMed.="<<&vecMedian<<    // median of deltas
1606       "vRMS.="<<&vecRMS<<       // rms of deltas
1607       "vDelta.="<<&vecDelta<<   // delta in respect to median
1608       "vDeltaN.="<<&vecDeltaN<< // normalized delta in respect to median
1609       "t.="<<track<<            // ful track - find proper cuts
1610       "a.="<<align<<            // current alignment
1611       "pTOF.="<<&pTOF<<         // track param TOF
1612       "pTPC.="<<&pTPC<<         // track param TPC
1613       "gpTPC.="<<&gpTPC<<       // global position  TPC
1614       "gdTPC.="<<&gdTPC<<       // global direction TPC
1615       "gpTOF.="<<&gpTOF<<       // global position  TOF
1616       "gdTOF.="<<&gdTOF<<       // global position  TOF
1617       "\n";
1618   }
1619 }
1620
1621
1622 void  AliTPCcalibTime::BookDistortionMaps(){
1623   //
1624   //   Book ndimensional histograms of distortions/residuals
1625   //   Only primary tracks are selected for analysis
1626   //
1627
1628   Double_t xminTrack[4], xmaxTrack[4];
1629   Int_t binsTrack[4];
1630   TString axisName[4];
1631   TString axisTitle[4];
1632   //
1633   binsTrack[0]  =50;
1634   axisName[0]   ="#Delta";
1635   axisTitle[0]  ="#Delta";
1636   //
1637   binsTrack[1] =20;
1638   xminTrack[1] =-1.5; xmaxTrack[1]=1.5;
1639   axisName[1]  ="tanTheta";
1640   axisTitle[1]  ="tan(#Theta)";
1641   //
1642   binsTrack[2] =90;
1643   xminTrack[2] =-TMath::Pi(); xmaxTrack[2]=TMath::Pi();
1644   axisName[2]  ="phi";
1645   axisTitle[2]  ="#phi";
1646   //
1647   binsTrack[3] =20;
1648   xminTrack[3] =-1.; xmaxTrack[3]=1.;   // 0.33 GeV cut
1649   axisName[3]  ="snp";
1650   //
1651   // delta y
1652   xminTrack[0] =-1.5; xmaxTrack[0]=1.5;  //
1653   fResHistoTPCITS[0] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{Y} (cm)","#Delta_{Y} (cm)",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1654   fResHistoTPCvertex[0]    = new THnSparseS("TPCVertex#Delta_{Y} (cm)","#Delta_{Y} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1655   xminTrack[0] =-1.5; xmaxTrack[0]=1.5;  //
1656   fResHistoTPCTRD[0] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{Y} (cm)","#Delta_{Y} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1657   //
1658   // delta z
1659   xminTrack[0] =-3.; xmaxTrack[0]=3.;  //
1660   fResHistoTPCITS[1] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{Z} (cm)","#Delta_{Z} (cm)",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1661   fResHistoTPCvertex[1]    = new THnSparseS("TPCVertex#Delta_{Z} (cm)","#Delta_{Z} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1662   fResHistoTPCTRD[1] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{Z} (cm)","#Delta_{Z} (cm)", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1663   //
1664   // delta snp-P2
1665   xminTrack[0] =-0.015; xmaxTrack[0]=0.015;  //
1666   fResHistoTPCITS[2] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{#phi}","#Delta_{#phi}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1667   fResHistoTPCvertex[2] = new THnSparseS("TPCITSv#Delta_{#phi}","#Delta_{#phi}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1668   fResHistoTPCTRD[2] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{#phi}","#Delta_{#phi}", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1669   //
1670   // delta theta-P3
1671   xminTrack[0] =-0.025; xmaxTrack[0]=0.025;  //
1672   fResHistoTPCITS[3] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{#theta}","#Delta_{#theta}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1673   fResHistoTPCvertex[3] = new THnSparseS("TPCITSv#Delta_{#theta}","#Delta_{#theta}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1674   fResHistoTPCTRD[3] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{#theta}","#Delta_{#theta}", 4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1675   //
1676   // delta theta-P4
1677   xminTrack[0] =-0.2; xmaxTrack[0]=0.2;  //
1678   fResHistoTPCITS[4] = new THnSparseS("TPCITS#Delta_{1/pt}","#Delta_{1/pt}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1679   fResHistoTPCvertex[4] = new THnSparseS("TPCITSv#Delta_{1/pt}","#Delta_{1/pt}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1680   fResHistoTPCTRD[4] = new THnSparseS("TPCTRD#Delta_{1/pt}","#Delta_{1/pt}",    4, binsTrack,xminTrack, xmaxTrack);
1681   //
1682   for (Int_t ivar=0;ivar<4;ivar++){
1683     for (Int_t ivar2=0;ivar2<4;ivar2++){
1684       fResHistoTPCITS[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
1685       fResHistoTPCITS[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisTitle[ivar2].Data());
1686       fResHistoTPCTRD[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
1687       fResHistoTPCTRD[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisTitle[ivar2].Data());
1688       fResHistoTPCvertex[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetName(axisName[ivar2].Data());
1689       fResHistoTPCvertex[ivar]->GetAxis(ivar2)->SetTitle(axisTitle[ivar2].Data());
1690     }
1691   }
1692 }
1693
1694
1695 void        AliTPCcalibTime::FillResHistoTPCITS(const AliExternalTrackParam * pTPCIn, const AliExternalTrackParam * pITSOut ){
1696   //
1697   // fill residual histograms pTPCIn-pITSOut
1698   // Histogram is filled only for primary tracks
1699   //
1700   Double_t histoX[4];
1701   Double_t xyz[3];
1702   pTPCIn->GetXYZ(xyz);
1703   Double_t phi= TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
1704   histoX[1]= pTPCIn->GetTgl();
1705   histoX[2]= phi;
1706   histoX[3]= pTPCIn->GetSnp();
1707   AliExternalTrackParam lits(*pITSOut);
1708   lits.Rotate(pTPCIn->GetAlpha());
1709   lits.PropagateTo(pTPCIn->GetX(),fMagF);
1710   //
1711   for (Int_t ihisto=0; ihisto<5; ihisto++){
1712     histoX[0]=pTPCIn->GetParameter()[ihisto]-lits.GetParameter()[ihisto];
1713     fResHistoTPCITS[ihisto]->Fill(histoX);
1714   }
1715 }
1716
1717
1718 void        AliTPCcalibTime::FillResHistoTPC(const AliESDtrack * pTrack){
1719   //
1720   // fill residual histograms pTPC - vertex
1721   // Histogram is filled only for primary tracks
1722   //
1723   Double_t histoX[4];
1724   const AliExternalTrackParam * pTPCIn = pTrack->GetInnerParam();
1725   AliExternalTrackParam pTPCvertex(*(pTrack->GetInnerParam()));
1726   //
1727   AliExternalTrackParam lits(*pTrack);
1728   if (TMath::Abs(pTrack->GetY())>3) return;  // beam pipe
1729   pTPCvertex.Rotate(lits.GetAlpha());
1730   //pTPCvertex.PropagateTo(pTPCvertex->GetX(),fMagF);
1731   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPCvertex,lits.GetX(),0.1,2,kFALSE);
1732   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&pTPCvertex,lits.GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
1733   Double_t xyz[3];
1734   pTPCIn->GetXYZ(xyz);
1735   Double_t phi= TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
1736   histoX[1]= pTPCIn->GetTgl();
1737   histoX[2]= phi;
1738   histoX[3]= pTPCIn->GetSnp();
1739   //
1740   Float_t dca[2], cov[3];
1741   pTrack->GetImpactParametersTPC(dca,cov);
1742   for (Int_t ihisto=0; ihisto<5; ihisto++){
1743     histoX[0]=pTPCvertex.GetParameter()[ihisto]-lits.GetParameter()[ihisto];
1744     //    if (ihisto<2) histoX[0]=dca[ihisto];
1745     fResHistoTPCvertex[ihisto]->Fill(histoX);
1746   }
1747 }
1748
1749
1750 void        AliTPCcalibTime::FillResHistoTPCTRD(const AliExternalTrackParam * pTPCOut, const AliExternalTrackParam * pTRDIn ){
1751   //
1752   // fill resuidual histogram TPCout-TRDin
1753   //
1754   Double_t histoX[4];
1755   Double_t xyz[3];
1756   pTPCOut->GetXYZ(xyz);
1757   Double_t phi= TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
1758   histoX[1]= pTPCOut->GetTgl();
1759   histoX[2]= phi;
1760   histoX[3]= pTPCOut->GetSnp();
1761   //
1762   AliExternalTrackParam ltrd(*pTRDIn);
1763   ltrd.Rotate(pTPCOut->GetAlpha());
1764   //  ltrd.PropagateTo(pTPCOut->GetX(),fMagF);
1765   AliTracker::PropagateTrackToBxByBz(&ltrd,pTPCOut->GetX(),0.1,0.1,kFALSE);
1766
1767   for (Int_t ihisto=0; ihisto<5; ihisto++){
1768     histoX[0]=pTPCOut->GetParameter()[ihisto]-ltrd.GetParameter()[ihisto];
1769     fResHistoTPCTRD[ihisto]->Fill(histoX);
1770   }
1771
1772 }