]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - TPC/AliTPCseed.cxx
make equation work for not equal subevents
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCseed.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17
18
19 //-----------------------------------------------------------------
20 //           Implementation of the TPC seed class
21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
23 //-----------------------------------------------------------------
24 #include "TClonesArray.h"
25 #include "AliTPCseed.h"
26 #include "AliTPCReconstructor.h"
27 #include "AliTPCClusterParam.h"
28 #include "AliTPCCalPad.h"
29 #include "AliTPCCalROC.h"
30 #include "AliTPCcalibDB.h"
31 #include "AliTPCParam.h"
32
33
34
35 ClassImp(AliTPCseed)
36
37
38
39 AliTPCseed::AliTPCseed():
40   AliTPCtrack(),
41   fEsd(0x0),
42   fClusterOwner(kFALSE),
43   fRow(0),
44   fSector(-1),
45   fRelativeSector(-1),
46   fCurrentSigmaY2(1e10),
47   fCurrentSigmaZ2(1e10),
48   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
49   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
50   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
51   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
52   //
53   fErrorY2(1e10),
54   fErrorZ2(1e10),
55   fCurrentCluster(0x0),
56   fCurrentClusterIndex1(-1),
57   fInDead(kFALSE),
58   fIsSeeding(kFALSE),
59   fNoCluster(0),
60   fSort(0),
61   fBSigned(kFALSE),
62   fSeedType(0),
63   fSeed1(-1),
64   fSeed2(-1),
65   fMAngular(0),
66   fCircular(0),
67   fClusterMap(159),
68   fSharedMap(159)
69 {
70   //
71   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
72   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
73   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
74   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
75   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
76     fDEDX[i] = 0.;
77     fSDEDX[i] = 1e10;
78     fNCDEDX[i] = 0;
79   }
80   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
81   //  for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
82   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
83   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
84   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
85
86 }
87
88 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
89   AliTPCtrack(s),
90   fEsd(0x0),
91   fClusterOwner(clusterOwner),
92   fRow(0),
93   fSector(-1),
94   fRelativeSector(-1),
95   fCurrentSigmaY2(-1),
96   fCurrentSigmaZ2(-1),
97   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
98   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
99   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
100   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
101   fErrorY2(1e10),
102   fErrorZ2(1e10),
103   fCurrentCluster(0x0),
104   fCurrentClusterIndex1(-1),
105   fInDead(kFALSE),
106   fIsSeeding(kFALSE),
107   fNoCluster(0),
108   fSort(0),
109   fBSigned(kFALSE),
110   fSeedType(0),
111   fSeed1(-1),
112   fSeed2(-1),
113   fMAngular(0),
114   fCircular(0),
115   fClusterMap(s.fClusterMap),
116   fSharedMap(s.fSharedMap)
117 {
118   //---------------------
119   // dummy copy constructor
120   //-------------------------
121   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
122     fClusterPointer[i]=0;
123     if (fClusterOwner){
124       if (s.fClusterPointer[i])
125         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
126     }else{
127       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
128     }
129     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
130   }
131   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
132   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
133   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
134     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
135     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
136     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
137   }
138   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
139
140 }
141
142
143 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
144   AliTPCtrack(t),
145   fEsd(0x0),
146   fClusterOwner(kFALSE),
147   fRow(0),
148   fSector(-1),
149   fRelativeSector(-1),
150   fCurrentSigmaY2(-1),
151   fCurrentSigmaZ2(-1),
152   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
153   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
154   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
155   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
156   fErrorY2(1e10),
157   fErrorZ2(1e10),
158   fCurrentCluster(0x0),
159   fCurrentClusterIndex1(-1),
160   fInDead(kFALSE),
161   fIsSeeding(kFALSE),
162   fNoCluster(0),
163   fSort(0),
164   fBSigned(kFALSE),
165   fSeedType(0),
166   fSeed1(-1),
167   fSeed2(-1),
168   fMAngular(0),
169   fCircular(0),
170   fClusterMap(159),
171   fSharedMap(159)
172 {
173   //
174   // Constructor from AliTPCtrack
175   //
176   fFirstPoint =0;
177   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
178   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
179     fClusterPointer[i] = 0;
180     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
181     if (index>=-1){ 
182       SetClusterIndex2(i,index);
183     }
184     else{
185       SetClusterIndex2(i,-3); 
186     }    
187   }
188   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
189     fDEDX[i] = 0.;
190     fSDEDX[i] = 1e10;
191     fNCDEDX[i] = 0;
192   }
193   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
194   
195   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
196   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
197   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
198   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
199
200 }
201
202 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
203                        const Double_t cc[15], Int_t index):      
204   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
205   fEsd(0x0),
206   fClusterOwner(kFALSE),
207   fRow(0),
208   fSector(-1),
209   fRelativeSector(-1),
210   fCurrentSigmaY2(-1),
211   fCurrentSigmaZ2(-1),
212   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
213   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
214   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
215   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
216   fErrorY2(1e10),
217   fErrorZ2(1e10),
218   fCurrentCluster(0x0),
219   fCurrentClusterIndex1(-1),
220   fInDead(kFALSE),
221   fIsSeeding(kFALSE),
222   fNoCluster(0),
223   fSort(0),
224   fBSigned(kFALSE),
225   fSeedType(0),
226   fSeed1(-1),
227   fSeed2(-1),
228   fMAngular(0),
229   fCircular(0),
230   fClusterMap(159),
231   fSharedMap(159)
232 {
233   //
234   // Constructor
235   //
236   fFirstPoint =0;
237   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
238   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
239   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
240   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
241     fDEDX[i] = 0.;
242     fSDEDX[i] = 1e10;
243     fNCDEDX[i] = 0;
244   }
245   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
246 }
247
248 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
249   //
250   // destructor
251   fNoCluster =0;
252   if (fClusterOwner){
253     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
254       delete fClusterPointer[icluster];
255     }
256   }
257
258 }
259 //_________________________________________________
260 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
261 {
262   //
263   // assignment operator 
264   //
265   if(this!=&param){
266     AliTPCtrack::operator=(param);
267     fEsd =param.fEsd; 
268     for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i]; // this is not allocated by AliTPCSeed
269     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
270     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
271     // but deleted in the dtor... strange...
272     fRow            = param.fRow;
273     fSector         = param.fSector;
274     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
275     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
276     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
277     fErrorY2        = param.fErrorY2;
278     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
279     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
280     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1; 
281     fInDead         = param.fInDead;
282     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
283     fNoCluster      = param.fNoCluster;
284     fSort           = param.fSort;
285     fBSigned        = param.fBSigned;
286     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
287       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
288       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
289       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
290     }
291     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
292     
293     fSeedType = param.fSeedType;
294     fSeed1    = param.fSeed1;
295     fSeed2    = param.fSeed2;
296     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
297     fMAngular = param.fMAngular;
298     fCircular = param.fCircular;
299     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
300     fClusterMap = param.fClusterMap;
301     fSharedMap = param.fSharedMap;
302   }
303   return (*this);
304 }
305 //____________________________________________________
306 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
307 {
308   //
309   // 
310   return &fTrackPoints[i];
311 }
312
313
314
315 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
316 {
317   //
318   //
319   // return cluster for n rows bellow first point
320   Int_t nfoundable = 1;
321   Int_t nfound      = 1;
322   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
323     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
324     if (index!=-1) nfoundable++;
325     if (index>0) nfound++;
326   }
327   if (nfoundable<n) return 0;
328   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
329
330 }
331
332
333 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
334 {
335   // get cluster stat.  on given region
336   //
337   found       = 0;
338   foundable   = 0;
339   shared      =0;
340   for (Int_t i=first;i<last; i++){
341     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
342     if (index!=-1) foundable++;
343     if (index&0x8000) continue;
344     if (fClusterPointer[i]) {
345       found++;
346     }
347     else 
348       continue;
349
350     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
351       shared++;
352       continue;
353     }
354     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
355     //
356     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
357       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
358         shared++;
359         continue;
360       }
361     }
362     if ( fClusterPointer[i+1]){
363       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
364         shared++;
365         continue;
366       }
367     }
368     
369   }
370   //if (shared>found){
371     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
372   //}
373 }
374
375
376
377
378
379 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
380 {
381   //
382   //
383   SetNumberOfClusters(0);
384   fNFoundable = 0;
385   SetChi2(0);
386   ResetCovariance(10.);
387   /*
388   if (fTrackPoints){
389     for (Int_t i=0;i<8;i++){
390       delete [] fTrackPoints[i];
391     }
392     delete fTrackPoints;
393     fTrackPoints =0;
394   }
395   */
396
397   if (all){   
398     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
399     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
400   }
401
402 }
403
404
405 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
406 {
407
408   //------------------------------------------------------------------
409   //This function makes a track forget its history :)  
410   //------------------------------------------------------------------
411   if (factor<=0) {
412     ResetCovariance(10.);
413     return;
414   }
415   ResetCovariance(factor);
416
417   SetNumberOfClusters(0);
418   fNFoundable =0;
419   SetChi2(0);
420   fRemoval = 0;
421   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
422   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
423   fNoCluster     = 0;
424   //fFirstPoint = 160;
425   //fLastPoint  = 0;
426 }
427
428
429
430
431 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
432 {
433   //-----------------------------------------------------------------
434   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
435   // doesn't change internal state of the track
436   //-----------------------------------------------------------------
437   
438   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
439
440   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {   
441     return 0;
442   }
443
444   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
445   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
446   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
447   
448   y = GetY();
449   z = GetZ();
450   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
451   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
452   
453   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
454   Double_t dz = 0;
455   //
456   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
457   /*
458   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
459     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
460   }else{
461     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
462   }
463   */
464   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
465   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
466   //
467   y+=dy;
468   z+=dz;
469   
470
471   return 1;  
472 }
473
474
475 //_____________________________________________________________________________
476 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const 
477 {
478   //-----------------------------------------------------------------
479   // This function calculates a predicted chi2 increment.
480   //-----------------------------------------------------------------
481   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
482   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
483   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
484 }
485
486 //_________________________________________________________________________________________
487
488
489 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
490   //-----------------------------------------------------------------
491   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
492   //-----------------------------------------------------------------
493   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
494
495   if (fSort == 0){
496     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
497     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
498     Double_t z2 = t->GetZ();
499     Double_t z1 = GetZ();
500     if (z2>z1) return 1;
501     if (z2<z1) return -1;
502     return 0;
503   }
504   else {
505     Float_t f2 =1;
506     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
507     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
508
509     Float_t f1 =1;
510     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
511
512     if (fBConstrain)   f1=1.2;
513  
514     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
515     else return +1;
516   }
517 }
518
519
520
521
522 //_____________________________________________________________________________
523 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t index)
524 {
525   //-----------------------------------------------------------------
526   // This function associates a cluster with this track.
527   //-----------------------------------------------------------------
528   Int_t n=GetNumberOfClusters();
529   Int_t idx=GetClusterIndex(n);    // save the current cluster index
530
531   AliCluster cl(*c);  cl.SetSigmaY2(fErrorY2); cl.SetSigmaZ2(fErrorZ2);
532   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
533   if (TMath::Abs(dx)>0){
534     Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
535     Float_t dy = dx*ty;
536     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
537     cl.SetY(c->GetY()-dy);  
538     cl.SetZ(c->GetZ()-dz);  
539   }
540
541   if (!AliTPCtrack::Update(&cl,chisq,index)) return kFALSE;
542   
543   if (fCMeanSigmaY2p30<0){
544     fCMeanSigmaY2p30= c->GetSigmaY2();   //! current mean sigma Y2 - mean30%
545     fCMeanSigmaZ2p30= c->GetSigmaZ2();   //! current mean sigma Z2 - mean30%    
546     fCMeanSigmaY2p30R = 1;   //! current mean sigma Y2 - mean5%
547     fCMeanSigmaZ2p30R = 1;   //! current mean sigma Z2 - mean5%
548   }
549   //
550   fCMeanSigmaY2p30= 0.70*fCMeanSigmaY2p30 +0.30*c->GetSigmaY2();   
551   fCMeanSigmaZ2p30= 0.70*fCMeanSigmaZ2p30 +0.30*c->GetSigmaZ2();  
552   if (fCurrentSigmaY2>0){
553     fCMeanSigmaY2p30R = 0.7*fCMeanSigmaY2p30R  +0.3*c->GetSigmaY2()/fCurrentSigmaY2;  
554     fCMeanSigmaZ2p30R = 0.7*fCMeanSigmaZ2p30R  +0.3*c->GetSigmaZ2()/fCurrentSigmaZ2;   
555   }
556
557
558   SetClusterIndex(n,idx);          // restore the current cluster index
559   return kTRUE;
560 }
561
562
563
564 //_____________________________________________________________________________
565 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
566   //-----------------------------------------------------------------
567   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
568   //-----------------------------------------------------------------
569   AliTPCParam *param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
570   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
571   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
572   Int_t row2 = row1+param->GetNRowUp2();
573   //
574   //
575   //
576   fDEDX[0]      = CookdEdxNorm(low,up,0 ,i1  ,i2,  kTRUE,kFALSE,2,0);
577   fDEDX[1]      = CookdEdxNorm(low,up,0 ,0   ,row0,kTRUE,kFALSE,2,0);
578   fDEDX[2]      = CookdEdxNorm(low,up,0 ,row0,row1,kTRUE,kFALSE,2,0);
579   fDEDX[3]      = CookdEdxNorm(low,up,0 ,row1,row2,kTRUE,kFALSE,2,0);
580   //
581   fSDEDX[0]     = CookdEdxNorm(low,up,0 ,i1  ,i2,  kTRUE,kFALSE,2,1);
582   fSDEDX[1]     = CookdEdxNorm(low,up,0 ,0   ,row0,kTRUE,kFALSE,2,1);
583   fSDEDX[2]     = CookdEdxNorm(low,up,0 ,row0,row1,kTRUE,kFALSE,2,1);
584   fSDEDX[3]     = CookdEdxNorm(low,up,0 ,row1,row2,kTRUE,kFALSE,2,1);
585   //
586   fNCDEDX[0]    = TMath::Nint(CookdEdxNorm(low,up,0 ,i1  ,i2,  kTRUE,kFALSE,2,2));
587   fNCDEDX[1]    = TMath::Nint(CookdEdxNorm(low,up,0 ,0   ,row0,kTRUE,kFALSE,2,2));
588   fNCDEDX[2]    = TMath::Nint(CookdEdxNorm(low,up,0 ,row0,row1,kTRUE,kFALSE,2,2));
589   fNCDEDX[3]    = TMath::Nint(CookdEdxNorm(low,up,0 ,row1,row2,kTRUE,kFALSE,2,2));
590
591   SetdEdx(fDEDX[0]);
592   return fDEDX[0];
593
594 //  return CookdEdxNorm(low,up,0,i1,i2,1,0,2);
595
596
597 //   Float_t amp[200];
598 //   Float_t angular[200];
599 //   Float_t weight[200];
600 //   Int_t index[200];
601 //   //Int_t nc = 0;
602 //   Float_t meanlog = 100.;
603   
604 //   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
605 //   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
606 //   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
607 //   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
608 //   //
609 //   //
610 //   fNShared =0;
611
612 //   Float_t gainGG = 1;
613 //   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
614 //     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000.;  //relative gas gain
615 //   }
616
617
618 //   for (Int_t of =0; of<4; of++){    
619 //     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
620 //       {
621 //      Int_t clindex = fIndex[i];
622 //      if (clindex<0||clindex&0x8000) continue;
623
624 //      //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
625 //      AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
626 //      //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
627 //      //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
628 //      //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
629
630 //      if (point==0) continue;
631 //      AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
632 //      if (cl==0) continue;    
633 //      if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
634 //      if (cl->IsUsed(11)) {
635 //        fNShared++;
636 //        continue;
637 //      }
638 //      Int_t   type   = cl->GetType();
639 //      //if (point->fIsShared){
640 //      //  fNShared++;
641 //      //  continue;
642 //      //}
643 //      //if (pointm) 
644 //      //  if (pointm->fIsShared) continue;
645 //      //if (pointp) 
646 //      //  if (pointp->fIsShared) continue;
647
648 //      if (type<0) continue;
649 //      //if (type>10) continue;       
650 //      //if (point->GetErrY()==0) continue;
651 //      //if (point->GetErrZ()==0) continue;
652
653 //      //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
654 //      //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
655 //      //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue; 
656
657
658 //      //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
659 //      if (cl->GetMax()<5) continue;
660 //      Float_t angley = point->GetAngleY();
661 //      Float_t anglez = point->GetAngleZ();
662
663 //      Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
664 //      Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
665 //      /*
666 //      Float_t ns = 1.;
667 //      if (pointm){
668 //        rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
669 //        rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
670 //        ns+=1.;
671 //      }
672 //      if (pointp){
673 //        rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
674 //        rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
675 //        ns+=1.;
676 //      }
677 //      rsigmay/=ns;
678 //      rsigmaz/=ns;
679 //      */
680
681 //      Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
682
683 //      Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
684 //      if (i>64){
685 //        //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
686 //        ampc = 1.*cl->GetMax();
687 //        //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();          
688 //        //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
689 //        //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
690 //        // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
691 //        //Float_t dz = 
692 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
693 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
694 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
695 //        //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
696 //        //ampc               *=zfactor; 
697 //      }
698 //      else{ 
699 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax(); 
700 //        ampc = 1.0*cl->GetMax(); 
701 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ(); 
702 //        //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
703 //        // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
704 //        //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
705 //        //Float_t dz = 
706 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
707
708 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
709 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
710 //        //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
711 //        //ampc               *=zfactor; 
712
713 //      }
714 //      ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
715 //      //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
716 //      Float_t w      =  1.;
717 //      //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5); 
718 //      //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
719 //      if (i<64) {
720 //        ampc /= 0.6;
721 //        //ampc /= (1+0.0008*z);
722 //      } else
723 //        if (i>128){
724 //          ampc /=1.5;
725 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
726 //        }else{
727 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
728 //        }
729         
730 //      if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
731 //        // w*= 2.;
732           
733 //        continue;
734 //      }
735 //      if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
736 //      amp[nc[of]]        = ampc;
737 //      amp[nc[of]]       /=gainGG;
738 //      angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
739 //      weight[nc[of]]     = w;
740 //      nc[of]++;
741 //       }
742     
743 //     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
744 //     Float_t sumamp=0;
745 //     Float_t sumamp2=0;
746 //     Float_t sumw=0;
747 //     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
748 //     meanlog = 50;
749 //     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
750 //       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
751 //       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
752 //       //
753 //       sumw    += weight[index[i]]; 
754 //       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
755 //       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
756 //       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
757 //     }
758 //     if (sumw<1){ 
759 //       SetdEdx(0);  
760 //     }
761 //     else {
762 //       norm[of] /= sumw;
763 //       mean[of]  = sumamp/sumw;
764 //       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
765 //       if (sigma[of]>0.1) 
766 //      sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
767 //       else
768 //      sigma[of] = 1000;
769       
770 //     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
771 //     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
772 //     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
773 //     }
774 //   }
775
776 //   Float_t dedx =0;
777 //   fSdEdx =0;
778 //   fMAngular =0;
779 //   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
780 //   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
781
782   
783 //   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/ 
784 //   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
785
786 //   Int_t norm2 = 0;
787 //   Int_t norm3 = 0;
788 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
789 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
790 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
791 //       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
792 //       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
793 //       norm2     += nc[i];
794 //       norm3     += nc[i]-2;
795 //     }
796 //     fDEDX[i]  = mean[i];             
797 //     fSDEDX[i] = sigma[i];            
798 //     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
799 //   }
800
801 //   if (norm3>0){
802 //     dedx   /=norm2;
803 //     fSdEdx /=norm3;
804 //     fMAngular/=norm2;
805 //   }
806 //   else{
807 //     SetdEdx(0);
808 //     return 0;
809 //   }
810 //   //  Float_t dedx1 =dedx;
811 //   /*
812 //   dedx =0;
813 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
814 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
815 //       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
816 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
817 //     }
818 //     fDEDX[i]  = mean[i];                
819 //   }
820 //   dedx /= norm2;
821 //   */
822
823   
824 //   SetdEdx(dedx);
825 //   return dedx;
826 }
827 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
828   //
829   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
830   //
831   Double_t bg2=bg*bg;
832   Double_t bethe;
833   if (bg<3.5e1) 
834     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
835   else // Density effect ( approximately :) 
836     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
837   return bethe/11.091;
838 }
839
840 void AliTPCseed::CookPID()
841 {
842   //
843   // cook PID information according dEdx
844   //
845   Double_t fRange = 10.;
846   Double_t fRes   = 0.1;
847   Double_t fMIP   = 47.;
848   //
849   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
850   Double_t sumr =0;
851   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
852     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
853     Double_t mom=GetP();
854     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
855     Double_t bethe=Bethe(mom/mass); 
856     Double_t sigma=fRes*bethe;
857     if (sigma>0.001){
858       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
859         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
860         sumr+=fTPCr[j];
861         continue;
862       }
863       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
864       sumr+=fTPCr[j];
865     }
866     else{
867       fTPCr[j]=1.;
868       sumr+=fTPCr[j];
869     }
870   }
871   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
872     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
873   }
874 }
875
876 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
877 //-----------------------------------------------------------------
878 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
879 //-----------------------------------------------------------------
880   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
881     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
882     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
883     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
884     Double_t r2=TMath::Sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
885     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
886 }
887
888 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
889 {
890   fClusterMap[ibit] = state;
891 }
892 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
893 {
894   return fClusterMap[ibit];
895 }
896 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
897 {
898   fSharedMap[ibit] = state;
899 }
900 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
901 {
902   return fSharedMap[ibit];
903 }
904
905
906
907
908
909 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxNorm(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Bool_t shapeNorm,Bool_t posNorm, Int_t padNorm, Int_t returnVal){
910  
911   //
912   // calculates dedx using the cluster
913   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
914   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster 
915   //           //2- max no corr 3- total+ correction
916   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
917   // shapeNorm - kTRUE  -taken from OCDB
918   //           
919   // posNorm   - usage of pos normalization 
920   // padNorm   - pad type normalization
921   // returnVal - 0 return mean
922   //           - 1 return RMS
923   //           - 2 return number of clusters
924   //           
925   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
926   //
927   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
928   AliTPCParam * param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
929   if (!parcl)  return 0;
930   if (!param) return 0;
931   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
932   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
933
934   Float_t amp[160];
935   Int_t   indexes[160];
936   Int_t   ncl=0;
937   //
938   //
939   Float_t gainGG      = 1;  // gas gain factor -always enabled
940   Float_t gainPad     = 1;  // gain map  - used always
941   Float_t corrShape   = 1;  // correction due angular effect, diffusion and electron attachment
942   Float_t corrPos     = 1;  // local position correction - if posNorm enabled
943   Float_t corrPadType = 1;  // pad type correction - if padNorm enabled
944   Float_t corrNorm    = 1;  // normalization factor - set Q to channel 50
945   //   
946   //
947   //
948   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
949     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000;  //relative gas gain
950   }
951
952   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
953   const Float_t kedgey =3.;
954   //
955   //
956   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
957     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
958     if (!cluster) continue;
959     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
960     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
961     Int_t  ipad= 0;
962     if (irow>=row0) ipad=1;
963     if (irow>=row1) ipad=2;    
964     //
965     //
966     //
967     AliTPCCalPad * gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
968     if (gainMap) {
969       //
970       // Get gainPad - pad by pad calibration
971       //
972       Float_t factor = 1;      
973       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
974       if (irow < row0) { // IROC
975         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
976       } else {         // OROC
977         factor = roc->GetValue(irow - row0, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
978       }
979       if (factor>0.5) gainPad=factor;
980     }
981     //
982     //do position and angular normalization
983     //
984     if (shapeNorm){
985       if (type<=1){
986         //      
987         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
988         Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
989         Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
990         
991         Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
992         corrShape  = parcl->Qnorm(ipad,type,dr,ty,tz);
993       }
994     }
995     
996     if (posNorm){
997       //
998       // Do position normalization - relative distance to 
999       // center of pad- time bin
1000       // Work in progress
1001       corrPos = parcl->QnormPos(ipad,type, cluster->GetPad(),
1002                                 cluster->GetTimeBin(), cluster->GetZ(),
1003                                 cluster->GetSigmaY2(),cluster->GetSigmaZ2(),
1004                                 cluster->GetMax(),cluster->GetQ());
1005     }
1006
1007     if (padNorm==1){
1008       //taken from OCDB
1009       if (type==0 && parcl->fQpadTnorm) corrPadType = (*parcl->fQpadTnorm)[ipad];
1010       if (type==1 && parcl->fQpadTnorm) corrPadType = (*parcl->fQpadMnorm)[ipad];
1011     }
1012     if (padNorm==2){
1013       corrPadType  =param->GetPadPitchLength(cluster->GetDetector(),cluster->GetRow());
1014       //use hardwired - temp fix
1015       if (type==0) corrNorm=3.;
1016       if (type==1) corrNorm=1.;
1017     }
1018     //
1019     amp[ncl]=charge;
1020     amp[ncl]/=gainGG;
1021     amp[ncl]/=gainPad;
1022     amp[ncl]/=corrShape;
1023     amp[ncl]/=corrPadType;
1024     amp[ncl]/=corrPos;
1025     amp[ncl]/=corrNorm; 
1026     //
1027     ncl++;
1028   }
1029
1030   if (type>3) return ncl; 
1031   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1032
1033   if (ncl<10) return 0;
1034   
1035   Float_t suma=0;
1036   Float_t suma2=0;  
1037   Float_t sumn=0;
1038   Int_t icl0=TMath::Nint(ncl*low);
1039   Int_t icl1=TMath::Nint(ncl*up);
1040   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1041     suma+=amp[indexes[icl]];
1042     suma2+=amp[indexes[icl]]*amp[indexes[icl]];
1043     sumn++;
1044   }
1045   Float_t mean =suma/sumn;
1046   Float_t rms  =TMath::Sqrt(TMath::Abs(suma2/sumn-mean*mean));
1047   if (returnVal==1) return rms;
1048   if (returnVal==2) return ncl;
1049   return mean;
1050 }
1051
1052
1053 Double_t AliTPCseed::BetheMass(Double_t mass){
1054   //
1055   // return bethe-bloch
1056   //
1057   Float_t bg= P()/mass; 
1058   const Double_t kp1=0.76176e-1;
1059   const Double_t kp2=10.632;
1060   const Double_t kp3=0.13279e-4;
1061   const Double_t kp4=1.8631;
1062   const Double_t kp5=1.9479;
1063
1064   Double_t dbg = (Double_t) bg;
1065
1066   Double_t beta = dbg/TMath::Sqrt(1.+dbg*dbg);
1067
1068   Double_t aa = TMath::Power(beta,kp4);
1069   Double_t bb = TMath::Power(1./dbg,kp5);
1070
1071   bb=TMath::Log(kp3+bb);
1072   
1073   return ((Float_t)((kp2-aa-bb)*kp1/aa));
1074 }
1075
1076
1077 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1078   //
1079   //
1080   //
1081  //-----------------------------------------------------------------
1082   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1083   //-----------------------------------------------------------------
1084   Float_t means=0;
1085   Float_t meanc=0;
1086   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1087     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1088     if (point==0) continue;
1089
1090     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1091     if (cl==0) continue;        
1092     
1093     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1094     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1095     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1096     if (type==0) means+=rsigma;
1097     if (type==1) means+=rsigmay;
1098     if (type==2) means+=rsigmaz;
1099     meanc++;
1100   }
1101   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1102   return mean;
1103 }
1104
1105
1106
1107 Int_t  AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed *seed, AliExternalTrackParam * parin, AliExternalTrackParam * parout){
1108   //
1109   // Refit the track
1110   // return value - number of used clusters
1111   // 
1112   //
1113   const Int_t kMinNcl =10;
1114   AliTPCseed *track=new AliTPCseed(*seed);
1115   Int_t sector=-1;
1116   // reset covariance
1117   //
1118   Double_t covar[15];
1119   for (Int_t i=0;i<15;i++) covar[i]=0;
1120   covar[0]=10.*10.;
1121   covar[2]=10.*10.;
1122   covar[5]=10.*10./(64.*64.);
1123   covar[9]=10.*10./(64.*64.);
1124   covar[14]=1*1;
1125   //
1126
1127   Float_t xmin=1000, xmax=-10000;
1128   Int_t imin=158, imax=0;
1129   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
1130     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1131     if (!c) continue;
1132     if (sector<0) sector = c->GetDetector();
1133     if (c->GetX()<xmin) xmin=c->GetX();
1134     if (c->GetX()>xmax) xmax=c->GetX();
1135     if (i<imin) imin=i;
1136     if (i>imax) imax=i;
1137   }
1138   if(imax-imin<kMinNcl) {
1139     delete track;
1140     return 0 ;
1141   }
1142   // Not succes to rotate
1143   if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1144     delete track;
1145     return 0;
1146   }
1147   //
1148   //
1149   // fit from inner to outer row
1150   //
1151   AliExternalTrackParam paramIn;
1152   AliExternalTrackParam paramOut;
1153   Bool_t isOK=kTRUE;
1154   Int_t ncl=0;
1155   //
1156   //
1157   //
1158   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1159     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1160     if (!c) continue;
1161     //    if (RejectCluster(c,track)) continue;
1162     sector = (c->GetDetector()%18);
1163     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1164       //continue;
1165     }
1166     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1167     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1168     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1169       isOK=kFALSE;
1170     }
1171     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1172   }
1173   if (!isOK) { delete track; return 0;}
1174   track->AddCovariance(covar);
1175   //
1176   //
1177   //
1178   for (Int_t i=imax; i>=imin; i--){
1179     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1180     if (!c) continue;
1181     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1182     sector = (c->GetDetector()%18);
1183     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1184       //continue;
1185     }
1186     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1187     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1188     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1189       isOK=kFALSE;
1190     }
1191     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1192   }
1193   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1194   paramIn = *track;
1195   track->AddCovariance(covar);
1196   //
1197   //
1198   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1199     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1200     if (!c) continue;
1201     sector = (c->GetDetector()%18);
1202     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1203       //continue;
1204     }
1205     ncl++;
1206     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1207     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1208     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1209     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1210       isOK=kFALSE;
1211     }
1212     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1213   }
1214   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1215   paramOut=*track;
1216   //
1217   //
1218   //
1219   if (parin) (*parin)=paramIn;
1220   if (parout) (*parout)=paramOut;
1221   return ncl;
1222 }
1223
1224
1225
1226 Bool_t AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed* /*seed*/, Bool_t /*out*/){
1227   //
1228   //
1229   //
1230   return kFALSE;
1231 }
1232
1233
1234
1235
1236
1237
1238 void  AliTPCseed::GetError(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param, 
1239                                   Double_t& erry, Double_t &errz)
1240 {
1241   //
1242   // Get cluster error at given position
1243   //
1244   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1245   Double_t tany,tanz;  
1246   Double_t snp1=param->GetSnp();
1247   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1248   //
1249   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1250   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1251   //
1252   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1253   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1254     padSize = 1;                              // medium pads 
1255     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1256   }
1257
1258   erry  = clusterParam->GetError0Par( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany) );
1259   errz  = clusterParam->GetError0Par( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) );
1260 }
1261
1262
1263 void  AliTPCseed::GetShape(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param, 
1264                                   Double_t& rmsy, Double_t &rmsz)
1265 {
1266   //
1267   // Get cluster error at given position
1268   //
1269   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1270   Double_t tany,tanz;  
1271   Double_t snp1=param->GetSnp();
1272   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1273   //
1274   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1275   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1276   //
1277   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1278   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1279     padSize = 1;                              // medium pads 
1280     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1281   }
1282
1283   rmsy  = clusterParam->GetRMSQ( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany), TMath::Abs(cluster->GetMax()) );
1284   rmsz  = clusterParam->GetRMSQ( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) ,TMath::Abs(cluster->GetMax()));
1285 }
1286
1287
1288
1289 Double_t AliTPCseed::GetQCorrGeom(Float_t ty, Float_t tz){
1290   //Geoetrical
1291   //ty    - tangent in local y direction
1292   //tz    - tangent 
1293   //
1294   Float_t norm=TMath::Sqrt(1+ty*ty+tz*tz);
1295   return norm;
1296 }
1297
1298 Double_t AliTPCseed::GetQCorrShape(Int_t ipad, Int_t type,Float_t z, Float_t ty, Float_t tz, Float_t /*q*/, Float_t /*thr*/){
1299   //
1300   // Q normalization
1301   //
1302   // return value =  Q Normalization factor
1303   // Normalization - 1 - shape factor part for full drift          
1304   //                 1 - electron attachment for 0 drift
1305
1306   // Input parameters:
1307   //
1308   // ipad - 0 short pad
1309   //        1 medium pad
1310   //        2 long pad
1311   //
1312   // type - 0 qmax
1313   //      - 1 qtot
1314   //
1315   //z     - z position (-250,250 cm)
1316   //ty    - tangent in local y direction
1317   //tz    - tangent 
1318   //
1319
1320   AliTPCClusterParam * paramCl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1321   AliTPCParam   * paramTPC = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
1322  
1323   if (!paramCl) return 1;
1324   //
1325   Double_t dr =  250.-TMath::Abs(z); 
1326   Double_t sy =  paramCl->GetRMS0( 0,ipad, dr, TMath::Abs(ty));
1327   Double_t sy0=  paramCl->GetRMS0(0,ipad, 250, 0);
1328   Double_t sz =  paramCl->GetRMS0( 1,ipad, dr, TMath::Abs(tz));
1329   Double_t sz0=  paramCl->GetRMS0(1,ipad, 250, 0);
1330
1331   Double_t sfactorMax = TMath::Sqrt(sy0*sz0/(sy*sz));
1332
1333  
1334   Double_t dt = 1000000*(dr/paramTPC->GetDriftV());  //time in microsecond
1335   Double_t attProb = TMath::Exp(-paramTPC->GetAttCoef()*paramTPC->GetOxyCont()*dt);
1336   //
1337   //
1338   if (type==0) return sfactorMax*attProb;
1339
1340   return attProb;
1341
1342
1343 }
1344