TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //           Implementation of the TPC seed class
  21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  23 //-----------------------------------------------------------------
  24 #include "TClonesArray.h"
  25 #include "AliTPCseed.h"
  26 #include "AliTPCReconstructor.h"
  27
  28 ClassImp(AliTPCseed)
  29
  30
  31
  32 AliTPCseed::AliTPCseed():AliTPCtrack(){
  33   //
  34   fRow=0;
  35   fRemoval =0;
  36   for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  37   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  38   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  39   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  40   fPoints = 0;
  41   fEPoints = 0;
  42   fNFoundable =0;
  43   fNShared  =0;
  44   fRemoval = 0;
  45   fSort =0;
  46   fFirstPoint =0;
  47   fNoCluster =0;
  48   fBSigned = kFALSE;
  49   fSeed1 =-1;
  50   fSeed2 =-1;
  51   fCurrentCluster =0;
  52   fCurrentSigmaY2=0;
  53   fCurrentSigmaZ2=0;
  54   fEsd =0;
  55   fCircular = 0;  // not curling track
  56 }
  57 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s):AliTPCtrack(s){
  58   //---------------------
  59   // dummy copy constructor
  60   //-------------------------
  61   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
  62   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
  63
  64   fPoints  = 0;
  65   fEPoints = 0;
  66   fCircular =0;
  67   fEsd =0;
  68 }
  69 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):AliTPCtrack(t){
  70   //
  71   //copy constructor
  72   fPoints = 0;
  73   fEPoints = 0;
  74   fNShared  =0;
  75   //  fTrackPoints =0;
  76   fRemoval =0;
  77   fSort =0;
  78   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=t.GetKinkIndex(i);
  79   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  80   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
  81     fClusterPointer[i] = 0;
  82     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
  83     if (index>=-1){
  84       SetClusterIndex2(i,index);
  85     }
  86     else{
  87       SetClusterIndex2(i,-3);
  88     }
  89   }
  90   fFirstPoint =0;
  91   fNoCluster =0;
  92   fBSigned = kFALSE;
  93   fSeed1 =-1;
  94   fSeed2 =-1;
  95   fCurrentCluster =0;
  96   fCurrentSigmaY2=0;
  97   fCurrentSigmaZ2=0;
  98   fCircular =0;
  99   fEsd =0;
 100 }
 101
 102 AliTPCseed::AliTPCseed(UInt_t index,  const Double_t xx[5], const Double_t cc[15],
 103                                         Double_t xr, Double_t alpha):
 104   AliTPCtrack(index, xx, cc, xr, alpha) {
 105    //
 106   //
 107   //constructor
 108   fRow =0;
 109   for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 110   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 111   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
 112   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 113
 114   fPoints = 0;
 115   fEPoints = 0;
 116   fNFoundable =0;
 117   fNShared  = 0;
 118   //  fTrackPoints =0;
 119   fRemoval =0;
 120   fSort =0;
 121   fFirstPoint =0;
 122   //  fHelixIn = new TClonesArray("AliHelix",0);
 123   //fHelixOut = new TClonesArray("AliHelix",0);
 124   fNoCluster =0;
 125   fBSigned = kFALSE;
 126   fSeed1 =-1;
 127   fSeed2 =-1;
 128   fCurrentCluster =0;
 129   fCurrentSigmaY2=0;
 130   fCurrentSigmaZ2=0;
 131   fEsd =0;
 132 }
 133
 134 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 135   //
 136   // destructor
 137   if (fPoints) delete fPoints;
 138   fPoints =0;
 139   if (fEPoints) delete fEPoints;
 140   fEPoints = 0;
 141   fNoCluster =0;
 142 }
 143
 144 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 145 {
 146   //
 147   //
 148   return &fTrackPoints[i];
 149 }
 150
 151 void AliTPCseed::RebuildSeed()
 152 {
 153   //
 154   // rebuild seed to be ready for storing
 155   AliTPCclusterMI cldummy;
 156   cldummy.SetQ(0);
 157   AliTPCTrackPoint pdummy;
 158   pdummy.GetTPoint().fIsShared = 10;
 159   for (Int_t i=0;i<160;i++){
 160     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
 161     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);
 162     if (cl0){
 163       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
 164       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
 165       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
 166     }
 167     else{
 168       *trpoint = pdummy;
 169       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
 170     }
 171
 172   }
 173
 174 }
 175
 176
 177 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 178 {
 179   //
 180   //
 181   // return cluster for n rows bellow first point
 182   Int_t nfoundable = 1;
 183   Int_t nfound      = 1;
 184   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 185     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 186     if (index!=-1) nfoundable++;
 187     if (index>0) nfound++;
 188   }
 189   if (nfoundable<n) return 0;
 190   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 191
 192 }
 193
 194
 195 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 196 {
 197   // get cluster stat.  on given region
 198   //
 199   found       = 0;
 200   foundable   = 0;
 201   shared      =0;
 202   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 203     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 204     if (index!=-1) foundable++;
 205     if (fClusterPointer[i]) {
 206       found++;
 207     }
 208     else
 209       continue;
 210
 211     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 212       shared++;
 213       continue;
 214     }
 215     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 216     //
 217     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 218       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 219         shared++;
 220         continue;
 221       }
 222     }
 223     if ( fClusterPointer[i+1]){
 224       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 225         shared++;
 226         continue;
 227       }
 228     }
 229
 230   }
 231   //if (shared>found){
 232     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 233   //}
 234 }
 235
 236
 237
 238
 239
 240 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 241 {
 242   //
 243   //
 244   SetNumberOfClusters(0);
 245   fNFoundable = 0;
 246   SetChi2(0);
 247   ResetCovariance();
 248   /*
 249   if (fTrackPoints){
 250     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 251       delete [] fTrackPoints[i];
 252     }
 253     delete fTrackPoints;
 254     fTrackPoints =0;
 255   }
 256   */
 257
 258   if (all){
 259     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 260     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 261   }
 262
 263 }
 264
 265
 266 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 267 {
 268
 269   //------------------------------------------------------------------
 270   //This function makes a track forget its history :)
 271   //------------------------------------------------------------------
 272   if (factor<=0) {
 273     ResetCovariance();
 274     return;
 275   }
 276   fC00*=factor;
 277   fC10*=0;  fC11*=factor;
 278   fC20*=0;  fC21*=0;  fC22*=factor;
 279   fC30*=0;  fC31*=0;  fC32*=0;  fC33*=factor;
 280   fC40*=0;  fC41*=0;  fC42*=0;  fC43*=0;  fC44*=factor;
 281   SetNumberOfClusters(0);
 282   fNFoundable =0;
 283   SetChi2(0);
 284   fRemoval = 0;
 285   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 286   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 287   fNoCluster     = 0;
 288   //fFirstPoint = 160;
 289   //fLastPoint  = 0;
 290 }
 291
 292
 293
 294
 295 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 296 {
 297   //-----------------------------------------------------------------
 298   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 299   // doesn't change internal state of the track
 300   //-----------------------------------------------------------------
 301
 302   Double_t x1=fX, x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 303
 304   if (TMath::Abs(fP4*xk - fP2) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 305     return 0;
 306   }
 307
 308   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 309   Double_t c1=fP4*x1 - fP2, r1=sqrt(1.- c1*c1);
 310   Double_t c2=fP4*x2 - fP2, r2=sqrt(1.- c2*c2);
 311
 312   y = fP0;
 313   z = fP1;
 314   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 315   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 316
 317   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 318   Double_t dz = 0;
 319   //
 320   Double_t delta = fP4*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 321   /*
 322   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 323     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 324   }else{
 325     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 326   }
 327   */
 328   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 329   dz =  fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 330   //
 331   y+=dy;
 332   z+=dz;
 333
 334
 335   return 1;
 336 }
 337
 338
 339 //_____________________________________________________________________________
 340 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 341 {
 342   //-----------------------------------------------------------------
 343   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 344   //-----------------------------------------------------------------
 345   //Double_t r00=c->GetSigmaY2(), r01=0., r11=c->GetSigmaZ2();
 346   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
 347   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
 348
 349   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
 350   if (TMath::Abs(det) < 1.e-10) {
 351     //Int_t n=GetNumberOfClusters();
 352     //if (n>4) cerr<<n<<" AliKalmanTrack warning: Singular matrix !\n";
 353     return 1e10;
 354   }
 355   Double_t tmp=r00; r00=r11; r11=tmp; r01=-r01;
 356
 357   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
 358
 359   return (dy*r00*dy + 2*r01*dy*dz + dz*r11*dz)/det;
 360 }
 361
 362
 363 //_________________________________________________________________________________________
 364
 365
 366 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 367   //-----------------------------------------------------------------
 368   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 369   //-----------------------------------------------------------------
 370   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 371
 372   if (fSort == 0){
 373     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 374     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 375     Double_t z2 = t->GetZ();
 376     Double_t z1 = GetZ();
 377     if (z2>z1) return 1;
 378     if (z2<z1) return -1;
 379     return 0;
 380   }
 381   else {
 382     Float_t f2 =1;
 383     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->fC44)/(TMath::Abs(t->GetC())+0.0066);
 384     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 385
 386     Float_t f1 =1;
 387     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(fC44)/(TMath::Abs(GetC())+0.0066);
 388
 389     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 390
 391     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 392     else return +1;
 393   }
 394 }
 395
 396
 397
 398
 399 //_____________________________________________________________________________
 400 Int_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, UInt_t /*index*/) {
 401   //-----------------------------------------------------------------
 402   // This function associates a cluster with this track.
 403   //-----------------------------------------------------------------
 404   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
 405
 406   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
 407   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
 408   Double_t tmp=r00; r00=r11/det; r11=tmp/det; r01=-r01/det;
 409
 410   Double_t k00=fC00*r00+fC10*r01, k01=fC00*r01+fC10*r11;
 411   Double_t k10=fC10*r00+fC11*r01, k11=fC10*r01+fC11*r11;
 412   Double_t k20=fC20*r00+fC21*r01, k21=fC20*r01+fC21*r11;
 413   Double_t k30=fC30*r00+fC31*r01, k31=fC30*r01+fC31*r11;
 414   Double_t k40=fC40*r00+fC41*r01, k41=fC40*r01+fC41*r11;
 415
 416   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
 417   Double_t cur=fP4 + k40*dy + k41*dz, eta=fP2 + k20*dy + k21*dz;
 418   if (TMath::Abs(cur*fX-eta) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 419     return 0;
 420   }
 421
 422   fP0 += k00*dy + k01*dz;
 423   fP1 += k10*dy + k11*dz;
 424   fP2  = eta;
 425   fP3 += k30*dy + k31*dz;
 426   fP4  = cur;
 427
 428   Double_t c01=fC10, c02=fC20, c03=fC30, c04=fC40;
 429   Double_t c12=fC21, c13=fC31, c14=fC41;
 430
 431   fC00-=k00*fC00+k01*fC10; fC10-=k00*c01+k01*fC11;
 432   fC20-=k00*c02+k01*c12;   fC30-=k00*c03+k01*c13;
 433   fC40-=k00*c04+k01*c14;
 434
 435   fC11-=k10*c01+k11*fC11;
 436   fC21-=k10*c02+k11*c12;   fC31-=k10*c03+k11*c13;
 437   fC41-=k10*c04+k11*c14;
 438
 439   fC22-=k20*c02+k21*c12;   fC32-=k20*c03+k21*c13;
 440   fC42-=k20*c04+k21*c14;
 441
 442   fC33-=k30*c03+k31*c13;
 443   fC43-=k40*c03+k41*c13;
 444
 445   fC44-=k40*c04+k41*c14;
 446
 447   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 448   //  fIndex[n]=index;
 449   SetNumberOfClusters(n+1);
 450   SetChi2(GetChi2()+chisq);
 451
 452   return 1;
 453 }
 454
 455
 456
 457 //_____________________________________________________________________________
 458 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
 459   //-----------------------------------------------------------------
 460   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 461   //-----------------------------------------------------------------
 462
 463   Float_t amp[200];
 464   Float_t angular[200];
 465   Float_t weight[200];
 466   Int_t index[200];
 467   //Int_t nc = 0;
 468   //  TClonesArray & arr = *fPoints;
 469   Float_t meanlog = 100.;
 470
 471   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 472   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 473   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 474   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 475   //
 476   //
 477   fNShared =0;
 478
 479   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 480     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 481       {
 482         Int_t index = fIndex[i];
 483         if (index<0||index&0x8000) continue;
 484
 485         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 486         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 487         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 488         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 489         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 490
 491         if (point==0) continue;
 492         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 493         if (cl==0) continue;
 494         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 495         if (cl->IsUsed(11)) {
 496           fNShared++;
 497           continue;
 498         }
 499         Int_t   type   = cl->GetType();
 500         //if (point->fIsShared){
 501         //  fNShared++;
 502         //  continue;
 503         //}
 504         //if (pointm)
 505         //  if (pointm->fIsShared) continue;
 506         //if (pointp)
 507         //  if (pointp->fIsShared) continue;
 508
 509         if (type<0) continue;
 510         //if (type>10) continue;
 511         //if (point->GetErrY()==0) continue;
 512         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 513
 514         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 515         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 516         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 517
 518
 519         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 520         if (cl->GetMax()<5) continue;
 521         Float_t angley = point->GetAngleY();
 522         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 523
 524         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 525         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 526         /*
 527         Float_t ns = 1.;
 528         if (pointm){
 529           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 530           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 531           ns+=1.;
 532         }
 533         if (pointp){
 534           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 535           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 536           ns+=1.;
 537         }
 538         rsigmay/=ns;
 539         rsigmaz/=ns;
 540         */
 541
 542         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 543
 544         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 545         if (i>64){
 546           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 547           ampc = 1.*cl->GetMax();
 548           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 549           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 550           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 551           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 552           //Float_t dz =
 553           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 554           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 555           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 556           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 557           //ampc               *=zfactor;
 558         }
 559         else{
 560           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 561           ampc = 1.0*cl->GetMax();
 562           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 563           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 564           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 565           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 566           //Float_t dz =
 567           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 568
 569           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 570           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 571           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 572           //ampc               *=zfactor;
 573
 574         }
 575         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 576         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 577         Float_t w      =  1.;
 578         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 579         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 580         if (i<64) {
 581           ampc /= 0.6;
 582           //ampc /= (1+0.0008*z);
 583         } else
 584           if (i>128){
 585             ampc /=1.5;
 586             //ampc /= (1+0.0008*z);
 587           }else{
 588             //ampc /= (1+0.0008*z);
 589           }
 590
 591         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 592           // w*= 2.;
 593
 594           continue;
 595         }
 596         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 597         amp[nc[of]]        = ampc;
 598         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 599         weight[nc[of]]     = w;
 600         nc[of]++;
 601       }
 602
 603     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 604     Float_t sumamp=0;
 605     Float_t sumamp2=0;
 606     Float_t sumw=0;
 607     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 608     meanlog = 50;
 609     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 610       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 611       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 612       //
 613       sumw    += weight[index[i]];
 614       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 615       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 616       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 617     }
 618     if (sumw<1){
 619       SetdEdx(0);
 620     }
 621     else {
 622       norm[of] /= sumw;
 623       mean[of]  = sumamp/sumw;
 624       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 625       if (sigma[of]>0.1)
 626         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 627       else
 628         sigma[of] = 1000;
 629
 630     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 631     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 632     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 633     }
 634   }
 635
 636   Float_t dedx =0;
 637   fSdEdx =0;
 638   fMAngular =0;
 639   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 640   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 641
 642
 643   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 644   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 645
 646   Int_t norm2 = 0;
 647   Int_t norm3 = 0;
 648   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 649     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 650       dedx      += mean[i] *nc[i];
 651       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 652       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 653       norm2     += nc[i];
 654       norm3     += nc[i]-2;
 655     }
 656     fDEDX[i]  = mean[i];
 657     fSDEDX[i] = sigma[i];
 658     fNCDEDX[i]= nc[i];
 659   }
 660
 661   if (norm3>0){
 662     dedx   /=norm2;
 663     fSdEdx /=norm3;
 664     fMAngular/=norm2;
 665   }
 666   else{
 667     SetdEdx(0);
 668     return 0;
 669   }
 670   //  Float_t dedx1 =dedx;
 671   /*
 672   dedx =0;
 673   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 674     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 675       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 676       dedx      += mean[i] *nc[i];
 677     }
 678     fDEDX[i]  = mean[i];
 679   }
 680   dedx /= norm2;
 681   */
 682
 683
 684   SetdEdx(dedx);
 685   return dedx;
 686 }
 687 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
 688   //
 689   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
 690   //
 691   Double_t bg2=bg*bg;
 692   Double_t bethe;
 693   if (bg<3.5e1)
 694     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
 695   else // Density effect ( approximately :)
 696     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
 697   return bethe/11.091;
 698 }
 699
 700 void AliTPCseed::CookPID()
 701 {
 702   //
 703   // cook PID information according dEdx
 704   //
 705   Double_t fRange = 10.;
 706   Double_t fRes   = 0.1;
 707   Double_t fMIP   = 47.;
 708   //
 709   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 710   Double_t sumr =0;
 711   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 712     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 713     Double_t mom=P();
 714     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 715     Double_t bethe=Bethe(mom/mass);
 716     Double_t sigma=fRes*bethe;
 717     if (sigma>0.001){
 718       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 719         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 720         sumr+=fTPCr[j];
 721         continue;
 722       }
 723       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 724       sumr+=fTPCr[j];
 725     }
 726     else{
 727       fTPCr[j]=1.;
 728       sumr+=fTPCr[j];
 729     }
 730   }
 731   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 732     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 733   }
 734 }
 735
 736 /*
 737 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
 738   //-----------------------------------------------------------------
 739   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 740   //-----------------------------------------------------------------
 741
 742   Float_t amp[200];
 743   Float_t angular[200];
 744   Float_t weight[200];
 745   Int_t index[200];
 746   Bool_t inlimit[200];
 747   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
 748   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
 749   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
 750
 751
 752   //
 753   Float_t meanlog = 100.;
 754   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
 755
 756   Float_t amean     =0;
 757   Float_t asigma    =0;
 758   Float_t anc       =0;
 759   Float_t anorm     =0;
 760
 761   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 762   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 763   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 764   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 765   //
 766   //
 767   fNShared =0;
 768
 769   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){
 770   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 771   for (Int_t i =0; i<160;i++)
 772     {
 773         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
 774         if (point==0) continue;
 775         if (point->fIsShared){
 776           fNShared++;
 777           continue;
 778         }
 779         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
 780         if (type<0) continue;
 781         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 782         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
 783         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
 784         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
 785         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
 786         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
 787
 788         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 789         if (i>64){
 790           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
 791         }
 792         else{
 793           ampc = point->GetCPoint().GetMax();
 794         }
 795         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 796         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
 797
 798         Float_t w      =  1.;
 799         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
 800         if (i<64) {
 801           ampc /= 0.63;
 802         } else
 803           if (i>128){
 804             ampc /=1.51;
 805           }
 806         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 807           continue;
 808         }
 809         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 810         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 811         amp[i]        = ampc/angular[i];
 812         weight[i]     = w;
 813         anc++;
 814     }
 815
 816   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
 817   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){
 818     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
 819   }
 820
 821   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
 822   meanlog =10000.;
 823   for (Int_t of =0; of<3; of++){
 824     Float_t sumamp=0;
 825     Float_t sumamp2=0;
 826     Float_t sumw=0;
 827    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 828       {
 829         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
 830         Float_t ampl      = amp[i];
 831         ///angular[i];
 832         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 833         //
 834         sumw    += weight[i];
 835         sumamp  += weight[i]*ampl;
 836         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
 837         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
 838         nc[of]++;
 839       }
 840    if (sumw<1){
 841      SetdEdx(0);
 842    }
 843    else {
 844      norm[of] /= sumw;
 845      mean[of]  = sumamp/sumw;
 846      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 847      if (sigma[of]>0.1)
 848        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 849      else
 850        sigma[of] = 1000;
 851      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 852    }
 853   }
 854
 855   Float_t dedx =0;
 856   fSdEdx =0;
 857   fMAngular =0;
 858   //
 859   Int_t norm2 = 0;
 860   Int_t norm3 = 0;
 861   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
 862   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
 863
 864   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 865     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 866       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
 867       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 868       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 869       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
 870       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 871     }
 872     fDEDX[i]  = mean[i];
 873     fSDEDX[i] = sigma[i];
 874     fNCDEDX[i]= nc[i];
 875   }
 876
 877   if (norm3>0){
 878     dedx   /=norm2;
 879     fSdEdx /=norm3;
 880     fMAngular/=norm2;
 881   }
 882   else{
 883     SetdEdx(0);
 884     return;
 885   }
 886   //  Float_t dedx1 =dedx;
 887
 888   dedx =0;
 889   Float_t norm4 = 0;
 890   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 891     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
 892       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 893       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
 894       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
 895     }
 896     fDEDX[i]  = mean[i];
 897   }
 898   if (norm4>0) dedx /= norm4;
 899
 900
 901
 902   SetdEdx(dedx);
 903
 904   //mi deDX
 905
 906 }
 907 */