TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //           Implementation of the TPC seed class
  21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  23 //-----------------------------------------------------------------
  24 #include "TClonesArray.h"
  25 #include "AliTPCseed.h"
  26 #include "AliTPCReconstructor.h"
  27
  28 ClassImp(AliTPCseed)
  29
  30
  31
  32 AliTPCseed::AliTPCseed():
  33   AliTPCtrack(),
  34   fEsd(0x0),
  35   fClusterOwner(kFALSE),
  36   fPoints(0x0),
  37   fEPoints(0x0),
  38   fRow(0),
  39   fSector(-1),
  40   fRelativeSector(-1),
  41   fCurrentSigmaY2(1e10),
  42   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  43   fErrorY2(1e10),
  44   fErrorZ2(1e10),
  45   fCurrentCluster(0x0),
  46   fCurrentClusterIndex1(-1),
  47   fInDead(kFALSE),
  48   fIsSeeding(kFALSE),
  49   fNoCluster(0),
  50   fSort(0),
  51   fBSigned(kFALSE),
  52   fSeedType(0),
  53   fSeed1(-1),
  54   fSeed2(-1),
  55   fMAngular(0),
  56   fCircular(0),
  57   fClusterMap(159),
  58   fSharedMap(159)
  59 {
  60   //
  61   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  62   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  63   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  64   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  65   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  66     fDEDX[i] = 0.;
  67     fSDEDX[i] = 1e10;
  68     fNCDEDX[i] = 0;
  69   }
  70   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  71   //  for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
  72   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
  73   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
  74   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
  75
  76 }
  77
  78 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  79   AliTPCtrack(s),
  80   fEsd(0x0),
  81   fClusterOwner(clusterOwner),
  82   fPoints(0x0),
  83   fEPoints(0x0),
  84   fRow(0),
  85   fSector(-1),
  86   fRelativeSector(-1),
  87   fCurrentSigmaY2(1e10),
  88   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  89   fErrorY2(1e10),
  90   fErrorZ2(1e10),
  91   fCurrentCluster(0x0),
  92   fCurrentClusterIndex1(-1),
  93   fInDead(kFALSE),
  94   fIsSeeding(kFALSE),
  95   fNoCluster(0),
  96   fSort(0),
  97   fBSigned(kFALSE),
  98   fSeedType(0),
  99   fSeed1(-1),
 100   fSeed2(-1),
 101   fMAngular(0),
 102   fCircular(0),
 103   fClusterMap(s.fClusterMap),
 104   fSharedMap(s.fSharedMap)
 105 {
 106   //---------------------
 107   // dummy copy constructor
 108   //-------------------------
 109   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 110     fClusterPointer[i]=0;
 111     if (fClusterOwner){
 112       if (s.fClusterPointer[i])
 113         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 114     }else{
 115       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 116     }
 117     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 118   }
 119   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 120   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
 121   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 122     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
 123     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
 124     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
 125   }
 126   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
 127
 128 }
 129
 130
 131 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 132   AliTPCtrack(t),
 133   fEsd(0x0),
 134   fClusterOwner(kFALSE),
 135   fPoints(0x0),
 136   fEPoints(0x0),
 137   fRow(0),
 138   fSector(-1),
 139   fRelativeSector(-1),
 140   fCurrentSigmaY2(1e10),
 141   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 142   fErrorY2(1e10),
 143   fErrorZ2(1e10),
 144   fCurrentCluster(0x0),
 145   fCurrentClusterIndex1(-1),
 146   fInDead(kFALSE),
 147   fIsSeeding(kFALSE),
 148   fNoCluster(0),
 149   fSort(0),
 150   fBSigned(kFALSE),
 151   fSeedType(0),
 152   fSeed1(-1),
 153   fSeed2(-1),
 154   fMAngular(0),
 155   fCircular(0),
 156   fClusterMap(159),
 157   fSharedMap(159)
 158 {
 159   //
 160   // Constructor from AliTPCtrack
 161   //
 162   fFirstPoint =0;
 163   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 164   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 165     fClusterPointer[i] = 0;
 166     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 167     if (index>=-1){
 168       SetClusterIndex2(i,index);
 169     }
 170     else{
 171       SetClusterIndex2(i,-3);
 172     }
 173   }
 174   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 175     fDEDX[i] = 0.;
 176     fSDEDX[i] = 1e10;
 177     fNCDEDX[i] = 0;
 178   }
 179   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 180
 181   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
 182   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
 183   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
 184   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
 185
 186 }
 187
 188 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
 189                        const Double_t cc[15], Int_t index):
 190   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
 191   fEsd(0x0),
 192   fClusterOwner(kFALSE),
 193   fPoints(0x0),
 194   fEPoints(0x0),
 195   fRow(0),
 196   fSector(-1),
 197   fRelativeSector(-1),
 198   fCurrentSigmaY2(1e10),
 199   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 200   fErrorY2(1e10),
 201   fErrorZ2(1e10),
 202   fCurrentCluster(0x0),
 203   fCurrentClusterIndex1(-1),
 204   fInDead(kFALSE),
 205   fIsSeeding(kFALSE),
 206   fNoCluster(0),
 207   fSort(0),
 208   fBSigned(kFALSE),
 209   fSeedType(0),
 210   fSeed1(-1),
 211   fSeed2(-1),
 212   fMAngular(0),
 213   fCircular(0),
 214   fClusterMap(159),
 215   fSharedMap(159)
 216 {
 217   //
 218   // Constructor
 219   //
 220   fFirstPoint =0;
 221   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 222   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 223   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 224   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 225     fDEDX[i] = 0.;
 226     fSDEDX[i] = 1e10;
 227     fNCDEDX[i] = 0;
 228   }
 229   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 230 }
 231
 232 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 233   //
 234   // destructor
 235   if (fPoints) delete fPoints;
 236   fPoints =0;
 237   if (fEPoints) delete fEPoints;
 238   fEPoints = 0;
 239   fNoCluster =0;
 240   if (fClusterOwner){
 241     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 242       delete fClusterPointer[icluster];
 243     }
 244   }
 245
 246 }
 247 //_________________________________________________
 248 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
 249 {
 250   //
 251   // assignment operator
 252   //
 253   if(this!=&param){
 254     AliTPCtrack::operator=(param);
 255     fEsd =param.fEsd;
 256     for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i]; // this is not allocated by AliTPCSeed
 257     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
 258     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
 259     // but deleted in the dtor... strange...
 260     // fPoints =
 261     // fEPoints =
 262     fRow            = param.fRow;
 263     fSector         = param.fSector;
 264     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
 265     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
 266     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
 267     fErrorY2        = param.fErrorY2;
 268     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
 269     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
 270     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1;
 271     fInDead         = param.fInDead;
 272     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
 273     fNoCluster      = param.fNoCluster;
 274     fSort           = param.fSort;
 275     fBSigned        = param.fBSigned;
 276     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
 277       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
 278       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
 279       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
 280     }
 281     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
 282
 283     fSeedType = param.fSeedType;
 284     fSeed1    = param.fSeed1;
 285     fSeed2    = param.fSeed2;
 286     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
 287     fMAngular = param.fMAngular;
 288     fCircular = param.fCircular;
 289     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
 290     fClusterMap = param.fClusterMap;
 291     fSharedMap = param.fSharedMap;
 292   }
 293   return (*this);
 294 }
 295 //____________________________________________________
 296 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 297 {
 298   //
 299   //
 300   return &fTrackPoints[i];
 301 }
 302
 303 void AliTPCseed::RebuildSeed()
 304 {
 305   //
 306   // rebuild seed to be ready for storing
 307   AliTPCclusterMI cldummy;
 308   cldummy.SetQ(0);
 309   AliTPCTrackPoint pdummy;
 310   pdummy.GetTPoint().SetShared(10);
 311   for (Int_t i=0;i<160;i++){
 312     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
 313     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);
 314     if (cl0){
 315       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
 316       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
 317       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
 318     }
 319     else{
 320       *trpoint = pdummy;
 321       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
 322     }
 323
 324   }
 325
 326 }
 327
 328
 329 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 330 {
 331   //
 332   //
 333   // return cluster for n rows bellow first point
 334   Int_t nfoundable = 1;
 335   Int_t nfound      = 1;
 336   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 337     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 338     if (index!=-1) nfoundable++;
 339     if (index>0) nfound++;
 340   }
 341   if (nfoundable<n) return 0;
 342   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 343
 344 }
 345
 346
 347 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 348 {
 349   // get cluster stat.  on given region
 350   //
 351   found       = 0;
 352   foundable   = 0;
 353   shared      =0;
 354   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 355     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 356     if (index!=-1) foundable++;
 357     if (index&0x8000) continue;
 358     if (fClusterPointer[i]) {
 359       found++;
 360     }
 361     else
 362       continue;
 363
 364     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 365       shared++;
 366       continue;
 367     }
 368     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 369     //
 370     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 371       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 372         shared++;
 373         continue;
 374       }
 375     }
 376     if ( fClusterPointer[i+1]){
 377       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 378         shared++;
 379         continue;
 380       }
 381     }
 382
 383   }
 384   //if (shared>found){
 385     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 386   //}
 387 }
 388
 389
 390
 391
 392
 393 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 394 {
 395   //
 396   //
 397   SetNumberOfClusters(0);
 398   fNFoundable = 0;
 399   SetChi2(0);
 400   ResetCovariance(10.);
 401   /*
 402   if (fTrackPoints){
 403     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 404       delete [] fTrackPoints[i];
 405     }
 406     delete fTrackPoints;
 407     fTrackPoints =0;
 408   }
 409   */
 410
 411   if (all){
 412     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 413     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 414   }
 415
 416 }
 417
 418
 419 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 420 {
 421
 422   //------------------------------------------------------------------
 423   //This function makes a track forget its history :)
 424   //------------------------------------------------------------------
 425   if (factor<=0) {
 426     ResetCovariance(10.);
 427     return;
 428   }
 429   ResetCovariance(factor);
 430
 431   SetNumberOfClusters(0);
 432   fNFoundable =0;
 433   SetChi2(0);
 434   fRemoval = 0;
 435   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 436   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 437   fNoCluster     = 0;
 438   //fFirstPoint = 160;
 439   //fLastPoint  = 0;
 440 }
 441
 442
 443
 444
 445 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 446 {
 447   //-----------------------------------------------------------------
 448   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 449   // doesn't change internal state of the track
 450   //-----------------------------------------------------------------
 451
 452   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 453
 454   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 455     return 0;
 456   }
 457
 458   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 459   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
 460   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
 461
 462   y = GetY();
 463   z = GetZ();
 464   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 465   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 466
 467   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 468   Double_t dz = 0;
 469   //
 470   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 471   /*
 472   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 473     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 474   }else{
 475     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 476   }
 477   */
 478   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 479   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
 480   //
 481   y+=dy;
 482   z+=dz;
 483
 484
 485   return 1;
 486 }
 487
 488
 489 //_____________________________________________________________________________
 490 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 491 {
 492   //-----------------------------------------------------------------
 493   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 494   //-----------------------------------------------------------------
 495   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 496   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 497   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
 498 }
 499
 500 //_________________________________________________________________________________________
 501
 502
 503 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 504   //-----------------------------------------------------------------
 505   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 506   //-----------------------------------------------------------------
 507   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 508
 509   if (fSort == 0){
 510     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 511     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 512     Double_t z2 = t->GetZ();
 513     Double_t z1 = GetZ();
 514     if (z2>z1) return 1;
 515     if (z2<z1) return -1;
 516     return 0;
 517   }
 518   else {
 519     Float_t f2 =1;
 520     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
 521     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 522
 523     Float_t f1 =1;
 524     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
 525
 526     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 527
 528     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 529     else return +1;
 530   }
 531 }
 532
 533
 534
 535
 536 //_____________________________________________________________________________
 537 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t /*index*/)
 538 {
 539   //-----------------------------------------------------------------
 540   // This function associates a cluster with this track.
 541   //-----------------------------------------------------------------
 542   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 543   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 544
 545   if (!AliExternalTrackParam::Update(p,cov)) return kFALSE;
 546
 547   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 548   //  fIndex[n]=index;
 549   SetNumberOfClusters(n+1);
 550   SetChi2(GetChi2()+chisq);
 551
 552   return kTRUE;
 553 }
 554
 555
 556
 557 //_____________________________________________________________________________
 558 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
 559   //-----------------------------------------------------------------
 560   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 561   //-----------------------------------------------------------------
 562
 563   Float_t amp[200];
 564   Float_t angular[200];
 565   Float_t weight[200];
 566   Int_t index[200];
 567   //Int_t nc = 0;
 568   //  TClonesArray & arr = *fPoints;
 569   Float_t meanlog = 100.;
 570
 571   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 572   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 573   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 574   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 575   //
 576   //
 577   fNShared =0;
 578
 579   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 580     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 581       {
 582         Int_t index = fIndex[i];
 583         if (index<0||index&0x8000) continue;
 584
 585         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 586         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 587         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 588         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 589         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 590
 591         if (point==0) continue;
 592         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 593         if (cl==0) continue;
 594         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 595         if (cl->IsUsed(11)) {
 596           fNShared++;
 597           continue;
 598         }
 599         Int_t   type   = cl->GetType();
 600         //if (point->fIsShared){
 601         //  fNShared++;
 602         //  continue;
 603         //}
 604         //if (pointm)
 605         //  if (pointm->fIsShared) continue;
 606         //if (pointp)
 607         //  if (pointp->fIsShared) continue;
 608
 609         if (type<0) continue;
 610         //if (type>10) continue;
 611         //if (point->GetErrY()==0) continue;
 612         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 613
 614         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 615         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 616         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 617
 618
 619         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 620         if (cl->GetMax()<5) continue;
 621         Float_t angley = point->GetAngleY();
 622         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 623
 624         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 625         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 626         /*
 627         Float_t ns = 1.;
 628         if (pointm){
 629           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 630           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 631           ns+=1.;
 632         }
 633         if (pointp){
 634           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 635           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 636           ns+=1.;
 637         }
 638         rsigmay/=ns;
 639         rsigmaz/=ns;
 640         */
 641
 642         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 643
 644         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 645         if (i>64){
 646           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 647           ampc = 1.*cl->GetMax();
 648           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 649           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 650           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 651           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 652           //Float_t dz =
 653           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 654           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 655           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 656           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 657           //ampc               *=zfactor;
 658         }
 659         else{
 660           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 661           ampc = 1.0*cl->GetMax();
 662           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 663           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 664           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 665           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 666           //Float_t dz =
 667           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 668
 669           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 670           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 671           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 672           //ampc               *=zfactor;
 673
 674         }
 675         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 676         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 677         Float_t w      =  1.;
 678         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 679         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 680         if (i<64) {
 681           ampc /= 0.6;
 682           //ampc /= (1+0.0008*z);
 683         } else
 684           if (i>128){
 685             ampc /=1.5;
 686             //ampc /= (1+0.0008*z);
 687           }else{
 688             //ampc /= (1+0.0008*z);
 689           }
 690
 691         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 692           // w*= 2.;
 693
 694           continue;
 695         }
 696         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 697         amp[nc[of]]        = ampc;
 698         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 699         weight[nc[of]]     = w;
 700         nc[of]++;
 701       }
 702
 703     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 704     Float_t sumamp=0;
 705     Float_t sumamp2=0;
 706     Float_t sumw=0;
 707     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 708     meanlog = 50;
 709     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 710       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 711       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 712       //
 713       sumw    += weight[index[i]];
 714       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 715       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 716       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 717     }
 718     if (sumw<1){
 719       SetdEdx(0);
 720     }
 721     else {
 722       norm[of] /= sumw;
 723       mean[of]  = sumamp/sumw;
 724       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 725       if (sigma[of]>0.1)
 726         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 727       else
 728         sigma[of] = 1000;
 729
 730     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 731     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 732     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 733     }
 734   }
 735
 736   Float_t dedx =0;
 737   fSdEdx =0;
 738   fMAngular =0;
 739   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 740   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 741
 742
 743   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 744   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 745
 746   Int_t norm2 = 0;
 747   Int_t norm3 = 0;
 748   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 749     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 750       dedx      += mean[i] *nc[i];
 751       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 752       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 753       norm2     += nc[i];
 754       norm3     += nc[i]-2;
 755     }
 756     fDEDX[i]  = mean[i];
 757     fSDEDX[i] = sigma[i];
 758     fNCDEDX[i]= nc[i];
 759   }
 760
 761   if (norm3>0){
 762     dedx   /=norm2;
 763     fSdEdx /=norm3;
 764     fMAngular/=norm2;
 765   }
 766   else{
 767     SetdEdx(0);
 768     return 0;
 769   }
 770   //  Float_t dedx1 =dedx;
 771   /*
 772   dedx =0;
 773   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 774     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 775       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 776       dedx      += mean[i] *nc[i];
 777     }
 778     fDEDX[i]  = mean[i];
 779   }
 780   dedx /= norm2;
 781   */
 782
 783
 784   SetdEdx(dedx);
 785   return dedx;
 786 }
 787 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
 788   //
 789   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
 790   //
 791   Double_t bg2=bg*bg;
 792   Double_t bethe;
 793   if (bg<3.5e1)
 794     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
 795   else // Density effect ( approximately :)
 796     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
 797   return bethe/11.091;
 798 }
 799
 800 void AliTPCseed::CookPID()
 801 {
 802   //
 803   // cook PID information according dEdx
 804   //
 805   Double_t fRange = 10.;
 806   Double_t fRes   = 0.1;
 807   Double_t fMIP   = 47.;
 808   //
 809   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 810   Double_t sumr =0;
 811   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 812     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 813     Double_t mom=GetP();
 814     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 815     Double_t bethe=Bethe(mom/mass);
 816     Double_t sigma=fRes*bethe;
 817     if (sigma>0.001){
 818       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 819         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 820         sumr+=fTPCr[j];
 821         continue;
 822       }
 823       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 824       sumr+=fTPCr[j];
 825     }
 826     else{
 827       fTPCr[j]=1.;
 828       sumr+=fTPCr[j];
 829     }
 830   }
 831   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 832     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 833   }
 834 }
 835
 836 /*
 837 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
 838   //-----------------------------------------------------------------
 839   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 840   //-----------------------------------------------------------------
 841
 842   Float_t amp[200];
 843   Float_t angular[200];
 844   Float_t weight[200];
 845   Int_t index[200];
 846   Bool_t inlimit[200];
 847   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
 848   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
 849   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
 850
 851
 852   //
 853   Float_t meanlog = 100.;
 854   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
 855
 856   Float_t amean     =0;
 857   Float_t asigma    =0;
 858   Float_t anc       =0;
 859   Float_t anorm     =0;
 860
 861   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 862   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 863   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 864   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 865   //
 866   //
 867   fNShared =0;
 868
 869   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){
 870   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 871   for (Int_t i =0; i<160;i++)
 872     {
 873         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
 874         if (point==0) continue;
 875         if (point->fIsShared){
 876           fNShared++;
 877           continue;
 878         }
 879         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
 880         if (type<0) continue;
 881         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 882         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
 883         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
 884         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
 885         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
 886         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
 887
 888         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 889         if (i>64){
 890           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
 891         }
 892         else{
 893           ampc = point->GetCPoint().GetMax();
 894         }
 895         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 896         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
 897
 898         Float_t w      =  1.;
 899         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
 900         if (i<64) {
 901           ampc /= 0.63;
 902         } else
 903           if (i>128){
 904             ampc /=1.51;
 905           }
 906         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 907           continue;
 908         }
 909         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 910         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 911         amp[i]        = ampc/angular[i];
 912         weight[i]     = w;
 913         anc++;
 914     }
 915
 916   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
 917   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){
 918     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
 919   }
 920
 921   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
 922   meanlog =10000.;
 923   for (Int_t of =0; of<3; of++){
 924     Float_t sumamp=0;
 925     Float_t sumamp2=0;
 926     Float_t sumw=0;
 927    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 928       {
 929         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
 930         Float_t ampl      = amp[i];
 931         ///angular[i];
 932         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 933         //
 934         sumw    += weight[i];
 935         sumamp  += weight[i]*ampl;
 936         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
 937         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
 938         nc[of]++;
 939       }
 940    if (sumw<1){
 941      SetdEdx(0);
 942    }
 943    else {
 944      norm[of] /= sumw;
 945      mean[of]  = sumamp/sumw;
 946      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 947      if (sigma[of]>0.1)
 948        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 949      else
 950        sigma[of] = 1000;
 951      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 952    }
 953   }
 954
 955   Float_t dedx =0;
 956   fSdEdx =0;
 957   fMAngular =0;
 958   //
 959   Int_t norm2 = 0;
 960   Int_t norm3 = 0;
 961   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
 962   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
 963
 964   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 965     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 966       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
 967       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 968       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 969       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
 970       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 971     }
 972     fDEDX[i]  = mean[i];
 973     fSDEDX[i] = sigma[i];
 974     fNCDEDX[i]= nc[i];
 975   }
 976
 977   if (norm3>0){
 978     dedx   /=norm2;
 979     fSdEdx /=norm3;
 980     fMAngular/=norm2;
 981   }
 982   else{
 983     SetdEdx(0);
 984     return;
 985   }
 986   //  Float_t dedx1 =dedx;
 987
 988   dedx =0;
 989   Float_t norm4 = 0;
 990   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 991     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
 992       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 993       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
 994       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
 995     }
 996     fDEDX[i]  = mean[i];
 997   }
 998   if (norm4>0) dedx /= norm4;
 999
1000
1001
1002   SetdEdx(dedx);
1003
1004   //mi deDX
1005
1006 }
1007 */
1008 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
1009 //-----------------------------------------------------------------
1010 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
1011 //-----------------------------------------------------------------
1012   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
1013     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
1014     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
1015     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
1016     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
1017     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
1018 }
1019
1020 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
1021 {
1022   fClusterMap[ibit] = state;
1023 }
1024 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
1025 {
1026   return fClusterMap[ibit];
1027 }
1028 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
1029 {
1030   fSharedMap[ibit] = state;
1031 }
1032 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
1033 {
1034   return fSharedMap[ibit];
1035 }
1036
1037
1038 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1039   //
1040   //
1041   //
1042  //-----------------------------------------------------------------
1043   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1044   //-----------------------------------------------------------------
1045   Float_t means=0;
1046   Float_t meanc=0;
1047   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1048     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1049     if (point==0) continue;
1050
1051     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1052     if (cl==0) continue;
1053
1054     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1055     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1056     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1057     if (type==0) means+=rsigma;
1058     if (type==1) means+=rsigmay;
1059     if (type==2) means+=rsigmaz;
1060     meanc++;
1061   }
1062   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1063   return mean;
1064 }