TPC/AliTPCtrackerMI.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17 //-------------------------------------------------------
  18 //          Implementation of the TPC tracker
  19 //
  20 //   Origin: Marian Ivanov   Marian.Ivanov@cern.ch
  21 //
  22 //  AliTPC parallel tracker -
  23 //  How to use?  -
  24 //  run AliTPCFindClusters.C macro - clusters neccessary for tracker are founded
  25 //  run AliTPCFindTracksMI.C macro - to find tracks
  26 //  tracks are written to AliTPCtracks.root file
  27 //  for comparison also seeds are written to the same file - to special branch
  28 //-------------------------------------------------------
  29
  30
  31 /* $Id$ */
  32
  33 #include "Riostream.h"
  34 #include <TClonesArray.h>
  35 #include <TFile.h>
  36 #include <TObjArray.h>
  37 #include <TTree.h>
  38
  39 #include "AliComplexCluster.h"
  40 #include "AliESD.h"
  41 #include "AliESDkink.h"
  42 #include "AliHelix.h"
  43 #include "AliRunLoader.h"
  44 #include "AliTPCClustersRow.h"
  45 #include "AliTPCParam.h"
  46 #include "AliTPCReconstructor.h"
  47 #include "AliTPCclusterMI.h"
  48 #include "AliTPCpolyTrack.h"
  49 #include "AliTPCreco.h"
  50 #include "AliTPCseed.h"
  51 #include "AliTPCtrackerMI.h"
  52 #include "TStopwatch.h"
  53 #include "AliTPCReconstructor.h"
  54 #include "AliESDkink.h"
  55 #include "AliPID.h"
  56 #include "TTreeStream.h"
  57 #include "AliAlignObj.h"
  58 #include "AliTrackPointArray.h"
  59
  60 //
  61
  62 ClassImp(AliTPCtrackerMI)
  63
  64
  65 class AliTPCFastMath {
  66 public:
  67   AliTPCFastMath();
  68   static Double_t FastAsin(Double_t x);
  69  private:
  70   static Double_t fgFastAsin[20000];  //lookup table for fast asin computation
  71 };
  72
  73 Double_t AliTPCFastMath::fgFastAsin[20000];
  74 AliTPCFastMath gAliTPCFastMath; // needed to fill the LUT
  75
  76 AliTPCFastMath::AliTPCFastMath(){
  77   //
  78   // initialized lookup table;
  79   for (Int_t i=0;i<10000;i++){
  80     fgFastAsin[2*i] = TMath::ASin(i/10000.);
  81     fgFastAsin[2*i+1] = (TMath::ASin((i+1)/10000.)-fgFastAsin[2*i]);
  82   }
  83 }
  84
  85 Double_t AliTPCFastMath::FastAsin(Double_t x){
  86   //
  87   // return asin using lookup table
  88   if (x>0){
  89     Int_t index = int(x*10000);
  90     return fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1];
  91   }
  92   x*=-1;
  93   Int_t index = int(x*10000);
  94   return -(fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1]);
  95 }
  96
  97
  98
  99
 100 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateTrack(AliTPCseed * track, Int_t accept){
 101   //
 102   //update track information using current cluster - track->fCurrentCluster
 103
 104
 105   AliTPCclusterMI* c =track->fCurrentCluster;
 106   if (accept>0) track->fCurrentClusterIndex1 |=0x8000;  //sign not accepted clusters
 107
 108   UInt_t i = track->fCurrentClusterIndex1;
 109
 110   Int_t sec=(i&0xff000000)>>24;
 111   //Int_t row = (i&0x00ff0000)>>16;
 112   track->fRow=(i&0x00ff0000)>>16;
 113   track->fSector = sec;
 114   //  Int_t index = i&0xFFFF;
 115   if (sec>=fParam->GetNInnerSector()) track->fRow += fParam->GetNRowLow();
 116   track->SetClusterIndex2(track->fRow, i);
 117   //track->fFirstPoint = row;
 118   //if ( track->fLastPoint<row) track->fLastPoint =row;
 119   //  if (track->fRow<0 || track->fRow>160) {
 120   //  printf("problem\n");
 121   //}
 122   if (track->fFirstPoint>track->fRow)
 123     track->fFirstPoint = track->fRow;
 124   if (track->fLastPoint<track->fRow)
 125     track->fLastPoint  = track->fRow;
 126
 127
 128   track->fClusterPointer[track->fRow] = c;
 129   //
 130
 131   Double_t angle2 = track->GetSnp()*track->GetSnp();
 132   angle2 = TMath::Sqrt(angle2/(1-angle2));
 133   //
 134   //SET NEW Track Point
 135   //
 136   //  if (debug)
 137   {
 138     AliTPCTrackerPoint   &point =*(track->GetTrackPoint(track->fRow));
 139     //
 140     point.SetSigmaY(c->GetSigmaY2()/track->fCurrentSigmaY2);
 141     point.SetSigmaZ(c->GetSigmaZ2()/track->fCurrentSigmaZ2);
 142     point.SetErrY(sqrt(track->fErrorY2));
 143     point.SetErrZ(sqrt(track->fErrorZ2));
 144     //
 145     point.SetX(track->GetX());
 146     point.SetY(track->GetY());
 147     point.SetZ(track->GetZ());
 148     point.SetAngleY(angle2);
 149     point.SetAngleZ(track->GetTgl());
 150     if (point.fIsShared){
 151       track->fErrorY2 *= 4;
 152       track->fErrorZ2 *= 4;
 153     }
 154   }
 155
 156   Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2(track->fCurrentCluster);
 157   //
 158   track->fErrorY2 *= 1.3;
 159   track->fErrorY2 += 0.01;
 160   track->fErrorZ2 *= 1.3;
 161   track->fErrorZ2 += 0.005;
 162     //}
 163   if (accept>0) return 0;
 164   if (track->GetNumberOfClusters()%20==0){
 165     //    if (track->fHelixIn){
 166     //  TClonesArray & larr = *(track->fHelixIn);
 167     //  Int_t ihelix = larr.GetEntriesFast();
 168     //  new(larr[ihelix]) AliHelix(*track) ;
 169     //}
 170   }
 171   track->fNoCluster =0;
 172   return track->Update(c,chi2,i);
 173 }
 174
 175
 176
 177 Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluster, Float_t factor,
 178                                       Float_t cory, Float_t corz)
 179 {
 180   //
 181   // decide according desired precision to accept given
 182   // cluster for tracking
 183   Double_t sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
 184   Double_t sz2=ErrZ2(seed,cluster)*corz;
 185   //sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
 186   //sz2=ErrZ2(seed,cluster)*cory;
 187
 188   Double_t sdistancey2 = sy2+seed->GetSigmaY2();
 189   Double_t sdistancez2 = sz2+seed->GetSigmaZ2();
 190
 191   Double_t rdistancey2 = (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())*
 192     (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())/sdistancey2;
 193   Double_t rdistancez2 = (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())*
 194     (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())/sdistancez2;
 195
 196   Double_t rdistance2  = rdistancey2+rdistancez2;
 197   //Int_t  accept =0;
 198
 199   if (rdistance2>16) return 3;
 200
 201
 202   if ((rdistancey2>9.*factor || rdistancez2>9.*factor) && cluster->GetType()==0)
 203     return 2;  //suspisiouce - will be changed
 204
 205   if ((rdistancey2>6.25*factor || rdistancez2>6.25*factor) && cluster->GetType()>0)
 206     // strict cut on overlaped cluster
 207     return  2;  //suspisiouce - will be changed
 208
 209   if ( (rdistancey2>1.*factor || rdistancez2>6.25*factor )
 210        && cluster->GetType()<0){
 211     seed->fNFoundable--;
 212     return 2;
 213   }
 214   return 0;
 215 }
 216
 217
 218
 219
 220 //_____________________________________________________________________________
 221 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCParam *par):
 222 AliTracker(), fkNIS(par->GetNInnerSector()/2), fkNOS(par->GetNOuterSector()/2)
 223 {
 224   //---------------------------------------------------------------------
 225   // The main TPC tracker constructor
 226   //---------------------------------------------------------------------
 227   fInnerSec=new AliTPCSector[fkNIS];
 228   fOuterSec=new AliTPCSector[fkNOS];
 229
 230   Int_t i;
 231   for (i=0; i<fkNIS; i++) fInnerSec[i].Setup(par,0);
 232   for (i=0; i<fkNOS; i++) fOuterSec[i].Setup(par,1);
 233
 234   fN=0;  fSectors=0;
 235
 236   fSeeds=0;
 237   fNtracks = 0;
 238   fParam = par;
 239   Int_t nrowlow = par->GetNRowLow();
 240   Int_t nrowup = par->GetNRowUp();
 241
 242
 243   for (Int_t i=0;i<nrowlow;i++){
 244     fXRow[i]     = par->GetPadRowRadiiLow(i);
 245     fPadLength[i]= par->GetPadPitchLength(0,i);
 246     fYMax[i]     = fXRow[i]*TMath::Tan(0.5*par->GetInnerAngle());
 247   }
 248
 249
 250   for (Int_t i=0;i<nrowup;i++){
 251     fXRow[i+nrowlow]      = par->GetPadRowRadiiUp(i);
 252     fPadLength[i+nrowlow] = par->GetPadPitchLength(60,i);
 253     fYMax[i+nrowlow]      = fXRow[i+nrowlow]*TMath::Tan(0.5*par->GetOuterAngle());
 254   }
 255   fSeeds=0;
 256   //
 257   fInput    = 0;
 258   fOutput   = 0;
 259   fSeedTree = 0;
 260   fTreeDebug =0;
 261   fNewIO     =0;
 262   fDebug     =0;
 263   fEvent     =0;
 264   fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TPCdebug.root");
 265 }
 266 //________________________________________________________________________
 267 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCtrackerMI &t):
 268   AliTracker(t),
 269   fkNIS(t.fkNIS),
 270   fkNOS(t.fkNOS)
 271 {
 272   //------------------------------------
 273   // dummy copy constructor
 274   //------------------------------------------------------------------
 275 }
 276 AliTPCtrackerMI & AliTPCtrackerMI::operator=(const AliTPCtrackerMI& /*r*/){
 277   //------------------------------
 278   // dummy
 279   //--------------------------------------------------------------
 280   return *this;
 281 }
 282 //_____________________________________________________________________________
 283 AliTPCtrackerMI::~AliTPCtrackerMI() {
 284   //------------------------------------------------------------------
 285   // TPC tracker destructor
 286   //------------------------------------------------------------------
 287   delete[] fInnerSec;
 288   delete[] fOuterSec;
 289   if (fSeeds) {
 290     fSeeds->Delete();
 291     delete fSeeds;
 292   }
 293   if (fDebugStreamer) delete fDebugStreamer;
 294 }
 295
 296 void AliTPCtrackerMI::SetIO()
 297 {
 298   //
 299   fNewIO   =  kTRUE;
 300   fInput   =  AliRunLoader::GetTreeR("TPC", kFALSE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 301
 302   fOutput  =  AliRunLoader::GetTreeT("TPC", kTRUE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 303   if (fOutput){
 304     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 305     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 306     delete iotrack;
 307   }
 308 }
 309
 310
 311 void AliTPCtrackerMI::SetIO(TTree * input, TTree * output, AliESD * event)
 312 {
 313
 314   // set input
 315   fNewIO = kFALSE;
 316   fInput    = 0;
 317   fOutput   = 0;
 318   fSeedTree = 0;
 319   fTreeDebug =0;
 320   fInput = input;
 321   if (input==0){
 322     return;
 323   }
 324   //set output
 325   fOutput = output;
 326   if (output){
 327     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 328     //    iotrack->fHelixIn   = new TClonesArray("AliHelix");
 329     //iotrack->fHelixOut  = new TClonesArray("AliHelix");
 330     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 331     delete iotrack;
 332   }
 333   if (output && (fDebug&2)){
 334     //write the full seed information if specified in debug mode
 335     //
 336     fSeedTree =  new TTree("Seeds","Seeds");
 337     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
 338     //
 339     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
 340     arrtr->ExpandCreateFast(160);
 341     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
 342     //
 343     vseed->fPoints = arrtr;
 344     vseed->fEPoints = arre;
 345     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
 346     fSeedTree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
 347     delete arrtr;
 348     delete arre;
 349     fTreeDebug = new TTree("trackDebug","trackDebug");
 350     TClonesArray * arrd = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint2",0);
 351     fTreeDebug->Branch("debug",&arrd,32000,99);
 352   }
 353
 354
 355   //set ESD event
 356   fEvent  = event;
 357 }
 358
 359 void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
 360 {
 361   //
 362   //
 363   //fill esds using updated tracks
 364   if (fEvent){
 365     // write tracks to the event
 366     // store index of the track
 367     Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
 368     //FindKinks(arr,fEvent);
 369     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 370       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
 371       if (!pt) continue;
 372       pt->UpdatePoints();
 373       //      pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
 374       if (pt->GetKinkIndex(0)<=0){  //don't propagate daughter tracks
 375         pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
 376       }
 377
 378       if (( pt->GetPoints()[2]- pt->GetPoints()[0])>5 && pt->GetPoints()[3]>0.8){
 379         AliESDtrack iotrack;
 380         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 381         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 382         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 383         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 384         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 385         //iotrack.SetTPCindex(i);
 386         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 387         continue;
 388       }
 389
 390       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>70)&& (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.55) {
 391         AliESDtrack iotrack;
 392         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 393         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 394         //iotrack.SetTPCindex(i);
 395         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 396         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 397         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 398         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 399         continue;
 400       }
 401       //
 402       // short tracks  - maybe decays
 403
 404       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.70) {
 405         Int_t found,foundable,shared;
 406         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
 407         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2)){
 408           AliESDtrack iotrack;
 409           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 410           //iotrack.SetTPCindex(i);
 411           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 412           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 413           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 414           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 415           fEvent->AddTrack(&iotrack);
 416           continue;
 417         }
 418       }
 419
 420       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>20) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.8) {
 421         Int_t found,foundable,shared;
 422         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
 423         if (found<20) continue;
 424         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
 425         //
 426         AliESDtrack iotrack;
 427         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 428         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 429         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 430         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 431         //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 432         //iotrack.SetTPCindex(i);
 433         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 434         continue;
 435       }
 436       // short tracks  - secondaties
 437       //
 438       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) ) {
 439         Int_t found,foundable,shared;
 440         pt->GetClusterStatistic(128,158,found, foundable,shared,kFALSE);
 441         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2) &&float(found)/float(foundable)>0.8){
 442           AliESDtrack iotrack;
 443           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 444           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 445           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 446           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 447           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 448           //iotrack.SetTPCindex(i);
 449           fEvent->AddTrack(&iotrack);
 450           continue;
 451         }
 452       }
 453
 454       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>15)) {
 455         Int_t found,foundable,shared;
 456         pt->GetClusterStatistic(138,158,found, foundable,shared,kFALSE);
 457         if (found<15) continue;
 458         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
 459         if (float(found)/float(foundable)<0.8) continue;
 460         //
 461         AliESDtrack iotrack;
 462         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 463         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 464         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 465         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 466         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 467         //iotrack.SetTPCindex(i);
 468         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 469         continue;
 470       }
 471     }
 472   }
 473   printf("Number of filled ESDs-\t%d\n",fEvent->GetNumberOfTracks());
 474 }
 475
 476 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks(TTree * tree)
 477 {
 478   //
 479   // write tracks from seed array to selected tree
 480   //
 481   fOutput  = tree;
 482   if (fOutput){
 483     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 484     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 485   }
 486   WriteTracks();
 487 }
 488
 489 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks()
 490 {
 491   //
 492   // write tracks to the given output tree -
 493   // output specified with SetIO routine
 494   if (!fSeeds)  return;
 495   if (!fOutput){
 496     SetIO();
 497   }
 498
 499   if (fOutput){
 500     AliTPCtrack *iotrack= 0;
 501     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 502     //for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 503     //  iotrack= (AliTPCtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 504     //  if (iotrack) break;
 505     //}
 506     //TBranch * br = fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 507     TBranch * br = fOutput->GetBranch("tracks");
 508     br->SetAddress(&iotrack);
 509     //
 510     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 511       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 512       if (!pt) continue;
 513       AliTPCtrack * track = new AliTPCtrack(*pt);
 514       iotrack = track;
 515       pt->fLab2 =i;
 516       //      br->SetAddress(&iotrack);
 517       fOutput->Fill();
 518       delete track;
 519       iotrack =0;
 520     }
 521     //fOutput->GetDirectory()->cd();
 522     //fOutput->Write();
 523   }
 524   // delete iotrack;
 525   //
 526   if (fSeedTree){
 527     //write the full seed information if specified in debug mode
 528
 529     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
 530     //
 531     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
 532     arrtr->ExpandCreateFast(160);
 533     //TClonesArray * arrcl = new TClonesArray("AliTPCclusterMI",160);
 534     //arrcl->ExpandCreateFast(160);
 535     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
 536     //
 537     vseed->fPoints = arrtr;
 538     vseed->fEPoints = arre;
 539     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
 540     //TBranch * brseed = seedtree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
 541     TBranch * brseed = fSeedTree->GetBranch("seeds");
 542
 543     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 544
 545     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 546       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 547       if (!pt) continue;
 548       pt->fPoints = arrtr;
 549       //      pt->fClusterPoints = arrcl;
 550       pt->fEPoints       = arre;
 551       pt->RebuildSeed();
 552       vseed = pt;
 553       brseed->SetAddress(&vseed);
 554       fSeedTree->Fill();
 555       pt->fPoints  = 0;
 556       pt->fEPoints = 0;
 557       //      pt->fClusterPoints = 0;
 558     }
 559     fSeedTree->Write();
 560     if (fTreeDebug) fTreeDebug->Write();
 561   }
 562
 563 }
 564
 565
 566
 567
 568 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrY2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 569   //
 570   //
 571   //seed->SetErrorY2(0.1);
 572   //return 0.1;
 573   //calculate look-up table at the beginning
 574   static Bool_t  ginit = kFALSE;
 575   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
 576   static Float_t ggg1[10000];
 577   static Float_t ggg2[10000];
 578   static Float_t ggg3[10000];
 579   static Float_t glandau1[10000];
 580   static Float_t glandau2[10000];
 581   static Float_t glandau3[10000];
 582   //
 583   static Float_t gcor01[500];
 584   static Float_t gcor02[500];
 585   static Float_t gcorp[500];
 586   //
 587
 588   //
 589   if (ginit==kFALSE){
 590     for (Int_t i=1;i<500;i++){
 591       Float_t rsigma = float(i)/100.;
 592       gcor02[i] = TMath::Max(0.78 +TMath::Exp(7.4*(rsigma-1.2)),0.6);
 593       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(3.36*(rsigma-1.2)),0.6);
 594       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
 595     }
 596
 597     //
 598     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
 599       //
 600       //
 601       // inner sector
 602       Float_t amp = float(i);
 603       Float_t padlength =0.75;
 604       gnoise1 = 0.0004/padlength;
 605       Float_t nel     = 0.268*amp;
 606       Float_t nprim   = 0.155*amp;
 607       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 608       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 609       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
 610       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;
 611       //
 612       // outer short
 613       padlength =1.;
 614       gnoise2   = 0.0004/padlength;
 615       nel       = 0.3*amp;
 616       nprim     = 0.133*amp;
 617       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 618       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 619       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
 620       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
 621       //
 622       //
 623       // outer long
 624       padlength =1.5;
 625       gnoise3   = 0.0004/padlength;
 626       nel       = 0.3*amp;
 627       nprim     = 0.133*amp;
 628       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 629       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 630       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
 631       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
 632       //
 633     }
 634     ginit = kTRUE;
 635   }
 636   //
 637   //
 638   //
 639   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));
 640   if (amp>9999) {
 641     seed->SetErrorY2(1.);
 642     return 1.;
 643   }
 644   Float_t snoise2;
 645   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 646   Int_t ctype = cl->GetType();
 647   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
 648   Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 649   angle2 = angle2/(1-angle2);
 650   //
 651   //cluster "quality"
 652   Int_t rsigmay = int(100.*cl->GetSigmaY2()/(seed->fCurrentSigmaY2));
 653   Float_t res;
 654   //
 655   if (fSectors==fInnerSec){
 656     snoise2 = gnoise1;
 657     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;
 658     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmay];
 659     if ((ctype>0)){
 660       res+=0.002;
 661       res*= gcorp[rsigmay];
 662     }
 663   }
 664   else {
 665     if (padlength<1.1){
 666       snoise2 = gnoise2;
 667       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2;
 668       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
 669       if ((ctype>0)){
 670         res+=0.002;
 671         res*= gcorp[rsigmay];
 672       }
 673     }
 674     else{
 675       snoise2 = gnoise3;
 676       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2;
 677       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
 678       if ((ctype>0)){
 679         res+=0.002;
 680         res*= gcorp[rsigmay];
 681       }
 682     }
 683   }
 684
 685   if (ctype<0){
 686     res+=0.005;
 687     res*=2.4;  // overestimate error 2 times
 688   }
 689   res+= snoise2;
 690
 691   if (res<2*snoise2)
 692     res = 2*snoise2;
 693
 694   seed->SetErrorY2(res);
 695   return res;
 696
 697
 698 }
 699
 700
 701
 702 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 703   //
 704   //
 705   //seed->SetErrorY2(0.1);
 706   //return 0.1;
 707   //calculate look-up table at the beginning
 708   static Bool_t  ginit = kFALSE;
 709   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
 710   static Float_t ggg1[10000];
 711   static Float_t ggg2[10000];
 712   static Float_t ggg3[10000];
 713   static Float_t glandau1[10000];
 714   static Float_t glandau2[10000];
 715   static Float_t glandau3[10000];
 716   //
 717   static Float_t gcor01[1000];
 718   static Float_t gcor02[1000];
 719   static Float_t gcorp[1000];
 720   //
 721
 722   //
 723   if (ginit==kFALSE){
 724     for (Int_t i=1;i<1000;i++){
 725       Float_t rsigma = float(i)/100.;
 726       gcor02[i] = TMath::Max(0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigma-1.2)),0.6);
 727       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigma-1.2)),0.6);
 728       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
 729     }
 730
 731     //
 732     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
 733       //
 734       //
 735       // inner sector
 736       Float_t amp = float(i);
 737       Float_t padlength =0.75;
 738       gnoise1 = 0.0004/padlength;
 739       Float_t nel     = 0.268*amp;
 740       Float_t nprim   = 0.155*amp;
 741       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 742       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 743       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
 744       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;
 745       //
 746       // outer short
 747       padlength =1.;
 748       gnoise2   = 0.0004/padlength;
 749       nel       = 0.3*amp;
 750       nprim     = 0.133*amp;
 751       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 752       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 753       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
 754       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
 755       //
 756       //
 757       // outer long
 758       padlength =1.5;
 759       gnoise3   = 0.0004/padlength;
 760       nel       = 0.3*amp;
 761       nprim     = 0.133*amp;
 762       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 763       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 764       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
 765       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
 766       //
 767     }
 768     ginit = kTRUE;
 769   }
 770   //
 771   //
 772   //
 773   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));
 774   if (amp>9999) {
 775     seed->SetErrorY2(1.);
 776     return 1.;
 777   }
 778   Float_t snoise2;
 779   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 780   Int_t ctype = cl->GetType();
 781   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
 782   //
 783   Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 784   //  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
 785   angle2 = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1+angle2/(1-angle2));
 786   //
 787   //cluster "quality"
 788   Int_t rsigmaz = int(100.*cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2));
 789   Float_t res;
 790   //
 791   if (fSectors==fInnerSec){
 792     snoise2 = gnoise1;
 793     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;
 794     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmaz];
 795     if ((ctype>0)){
 796       res+=0.002;
 797       res*= gcorp[rsigmaz];
 798     }
 799   }
 800   else {
 801     if (padlength<1.1){
 802       snoise2 = gnoise2;
 803       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2;
 804       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
 805       if ((ctype>0)){
 806         res+=0.002;
 807         res*= gcorp[rsigmaz];
 808       }
 809     }
 810     else{
 811       snoise2 = gnoise3;
 812       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2;
 813       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
 814       if ((ctype>0)){
 815         res+=0.002;
 816         res*= gcorp[rsigmaz];
 817       }
 818     }
 819   }
 820
 821   if (ctype<0){
 822     res+=0.002;
 823     res*=1.3;
 824   }
 825   if ((ctype<0) &&amp<70){
 826     res+=0.002;
 827     res*=1.3;
 828   }
 829   res += snoise2;
 830   if (res<2*snoise2)
 831      res = 2*snoise2;
 832   if (res>3) res =3;
 833   seed->SetErrorZ2(res);
 834   return res;
 835 }
 836
 837
 838
 839 /*
 840 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 841   //
 842   //
 843   //seed->SetErrorZ2(0.1);
 844   //return 0.1;
 845
 846   Float_t snoise2;
 847   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 848   //
 849   Float_t rsigmaz = cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2);
 850   Int_t ctype = cl->GetType();
 851   Float_t amp = TMath::Abs(cl->GetQ());
 852
 853   Float_t nel;
 854   Float_t nprim;
 855   //
 856   Float_t landau=2 ;    //landau fluctuation part
 857   Float_t gg=2;         // gg fluctuation part
 858   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetX());
 859
 860   if (fSectors==fInnerSec){
 861     snoise2 = 0.0004/padlength;
 862     nel     = 0.268*amp;
 863     nprim   = 0.155*amp;
 864     gg      = (2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 865     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 866     if (landau>1) landau=1;
 867   }
 868   else {
 869     snoise2 = 0.0004/padlength;
 870     nel     = 0.3*amp;
 871     nprim   = 0.133*amp;
 872     gg      = (2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 873     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 874     if (landau>1) landau=1;
 875   }
 876   Float_t sdiff = gg*fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*z;
 877
 878   //
 879   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 880   angle2 = TMath::Sqrt((1-angle2));
 881   if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
 882   //angle2 = 1;
 883
 884   Float_t angle = seed->GetTgl()/angle2;
 885   Float_t angular = landau*angle*angle*padlength*padlength/12.;
 886   Float_t res = sdiff + angular;
 887
 888
 889   if ((ctype==0) && (fSectors ==fOuterSec))
 890     res *= 0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigmaz-1.2));
 891
 892   if ((ctype==0) && (fSectors ==fInnerSec))
 893     res *= 0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigmaz-1.2));
 894
 895   if ((ctype>0)){
 896     res+=0.005;
 897     res*= TMath::Power(rsigmaz+0.5,1.5);  //0.31+0.147*ctype;
 898   }
 899   if (ctype<0){
 900     res+=0.002;
 901     res*=1.3;
 902   }
 903   if ((ctype<0) &&amp<70){
 904     res+=0.002;
 905     res*=1.3;
 906   }
 907   res += snoise2;
 908   if (res<2*snoise2)
 909      res = 2*snoise2;
 910
 911   seed->SetErrorZ2(res);
 912   return res;
 913 }
 914 */
 915
 916
 917
 918
 919 void AliTPCtrackerMI::RotateToLocal(AliTPCseed *seed)
 920 {
 921   //rotate to track "local coordinata
 922   Float_t x = seed->GetX();
 923   Float_t y = seed->GetY();
 924   Float_t ymax = x*TMath::Tan(0.5*fSectors->GetAlpha());
 925
 926   if (y > ymax) {
 927     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector+1) % fN;
 928     if (!seed->Rotate(fSectors->GetAlpha()))
 929       return;
 930   } else if (y <-ymax) {
 931     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector-1+fN) % fN;
 932     if (!seed->Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
 933       return;
 934   }
 935
 936 }
 937
 938
 939
 940 //_____________________________________________________________________________
 941 Double_t AliTPCtrackerMI::F1old(Double_t x1,Double_t y1,
 942                    Double_t x2,Double_t y2,
 943                    Double_t x3,Double_t y3)
 944 {
 945   //-----------------------------------------------------------------
 946   // Initial approximation of the track curvature
 947   //-----------------------------------------------------------------
 948   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
 949   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
 950                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
 951   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
 952                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
 953
 954   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
 955   if ( xr*xr+yr*yr<=0.00000000000001) return 100;
 956   return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
 957 }
 958
 959
 960
 961 //_____________________________________________________________________________
 962 Double_t AliTPCtrackerMI::F1(Double_t x1,Double_t y1,
 963                    Double_t x2,Double_t y2,
 964                    Double_t x3,Double_t y3)
 965 {
 966   //-----------------------------------------------------------------
 967   // Initial approximation of the track curvature
 968   //-----------------------------------------------------------------
 969   x3 -=x1;
 970   x2 -=x1;
 971   y3 -=y1;
 972   y2 -=y1;
 973   //
 974   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
 975   if (det==0) {
 976     return 100;
 977   }
 978   //
 979   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
 980   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
 981   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
 982   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
 983   if (det<0) c2*=-1;
 984   return c2;
 985 }
 986
 987
 988 Double_t AliTPCtrackerMI::F2(Double_t x1,Double_t y1,
 989                    Double_t x2,Double_t y2,
 990                    Double_t x3,Double_t y3)
 991 {
 992   //-----------------------------------------------------------------
 993   // Initial approximation of the track curvature
 994   //-----------------------------------------------------------------
 995   x3 -=x1;
 996   x2 -=x1;
 997   y3 -=y1;
 998   y2 -=y1;
 999   //
1000   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
1001   if (det==0) {
1002     return 100;
1003   }
1004   //
1005   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
1006   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
1007   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
1008   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
1009   if (det<0) c2*=-1;
1010   x0+=x1;
1011   x0*=c2;
1012   return x0;
1013 }
1014
1015
1016
1017 //_____________________________________________________________________________
1018 Double_t AliTPCtrackerMI::F2old(Double_t x1,Double_t y1,
1019                    Double_t x2,Double_t y2,
1020                    Double_t x3,Double_t y3)
1021 {
1022   //-----------------------------------------------------------------
1023   // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
1024   //-----------------------------------------------------------------
1025   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
1026   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
1027                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
1028   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
1029                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
1030
1031   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
1032
1033   return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
1034 }
1035
1036 //_____________________________________________________________________________
1037 Double_t AliTPCtrackerMI::F3(Double_t x1,Double_t y1,
1038                    Double_t x2,Double_t y2,
1039                    Double_t z1,Double_t z2)
1040 {
1041   //-----------------------------------------------------------------
1042   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1043   //-----------------------------------------------------------------
1044   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1045 }
1046
1047
1048 Double_t AliTPCtrackerMI::F3n(Double_t x1,Double_t y1,
1049                    Double_t x2,Double_t y2,
1050                    Double_t z1,Double_t z2, Double_t c)
1051 {
1052   //-----------------------------------------------------------------
1053   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1054   //-----------------------------------------------------------------
1055
1056   //  Double_t angle1;
1057
1058   //angle1    =  (z1-z2)*c/(TMath::ASin(c*x1-ni)-TMath::ASin(c*x2-ni));
1059   //
1060   Double_t d  =  TMath::Sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1061   if (TMath::Abs(d*c*0.5)>1) return 0;
1062   //  Double_t   angle2    =  TMath::ASin(d*c*0.5);
1063   //  Double_t   angle2    =  AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1064   Double_t   angle2    = (d*c*0.5>0.1)? TMath::ASin(d*c*0.5): AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1065
1066   angle2  = (z1-z2)*c/(angle2*2.);
1067   return angle2;
1068 }
1069
1070 Bool_t   AliTPCtrackerMI::GetProlongation(Double_t x1, Double_t x2, Double_t x[5], Double_t &y, Double_t &z)
1071 {//-----------------------------------------------------------------
1072   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=x2.
1073   //-----------------------------------------------------------------
1074
1075   Double_t dx=x2-x1;
1076
1077   if (TMath::Abs(x[4]*x1 - x[2]) >= 0.999) {
1078     return kFALSE;
1079   }
1080
1081   Double_t c1=x[4]*x1 - x[2], r1=sqrt(1.- c1*c1);
1082   Double_t c2=x[4]*x2 - x[2], r2=sqrt(1.- c2*c2);
1083   y = x[0];
1084   z = x[1];
1085
1086   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
1087   Double_t dz = 0;
1088   //
1089   Double_t delta = x[4]*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
1090
1091   if (TMath::Abs(delta)>0.01){
1092     dz = x[3]*TMath::ASin(delta)/x[4];
1093   }else{
1094     dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1095   }
1096
1097   //dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1098
1099   y+=dy;
1100   z+=dz;
1101
1102   return kTRUE;
1103 }
1104
1105 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters (TTree *tree)
1106 {
1107   //
1108   //
1109   fInput = tree;
1110   return LoadClusters();
1111 }
1112
1113 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
1114 {
1115   //
1116   // load clusters to the memory
1117   AliTPCClustersRow *clrow= new AliTPCClustersRow;
1118   clrow->SetClass("AliTPCclusterMI");
1119   clrow->SetArray(0);
1120   clrow->GetArray()->ExpandCreateFast(10000);
1121   //
1122   //  TTree * tree = fClustersArray.GetTree();
1123
1124   TTree * tree = fInput;
1125   TBranch * br = tree->GetBranch("Segment");
1126   br->SetAddress(&clrow);
1127   //
1128   Int_t j=Int_t(tree->GetEntries());
1129   for (Int_t i=0; i<j; i++) {
1130     br->GetEntry(i);
1131     //
1132     Int_t sec,row;
1133     fParam->AdjustSectorRow(clrow->GetID(),sec,row);
1134     //
1135     AliTPCRow * tpcrow=0;
1136     Int_t left=0;
1137     if (sec<fkNIS*2){
1138       tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1139       left = sec/fkNIS;
1140     }
1141     else{
1142       tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1143       left = (sec-fkNIS*2)/fkNOS;
1144     }
1145     if (left ==0){
1146       tpcrow->fN1 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1147       tpcrow->fClusters1 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN1];
1148       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN1;i++)
1149         tpcrow->fClusters1[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1150     }
1151     if (left ==1){
1152       tpcrow->fN2 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1153       tpcrow->fClusters2 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN2];
1154       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN2;i++)
1155         tpcrow->fClusters2[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1156     }
1157   }
1158   //
1159   delete clrow;
1160   LoadOuterSectors();
1161   LoadInnerSectors();
1162   return 0;
1163 }
1164
1165
1166 void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
1167 {
1168   //
1169   // unload clusters from the memory
1170   //
1171   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1172   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1173     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1174       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1175       //      if (tpcrow){
1176       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1;
1177       //        if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2;
1178       //}
1179       tpcrow->ResetClusters();
1180     }
1181   //
1182   nrows = fInnerSec->GetNRows();
1183   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1184     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1185       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1186       //if (tpcrow){
1187       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1;
1188       //if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2;
1189       //}
1190       tpcrow->ResetClusters();
1191     }
1192
1193   return ;
1194 }
1195
1196
1197 //_____________________________________________________________________________
1198 Int_t AliTPCtrackerMI::LoadOuterSectors() {
1199   //-----------------------------------------------------------------
1200   // This function fills outer TPC sectors with clusters.
1201   //-----------------------------------------------------------------
1202   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1203   UInt_t index=0;
1204   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1205     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1206       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1207       Int_t sec2 = sec+2*fkNIS;
1208       //left
1209       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1210       while (ncl--) {
1211         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1212         index=(((sec2<<8)+row)<<16)+ncl;
1213         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1214       }
1215       //right
1216       ncl = tpcrow->fN2;
1217       while (ncl--) {
1218         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1219         index=((((sec2+fkNOS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1220         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1221       }
1222       //
1223       // write indexes for fast acces
1224       //
1225       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1226         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1227       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1228         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1229         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1230       }
1231       Int_t last = 0;
1232       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1233         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1234           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1235         else
1236           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1237       }
1238     }
1239   fN=fkNOS;
1240   fSectors=fOuterSec;
1241   return 0;
1242 }
1243
1244
1245 //_____________________________________________________________________________
1246 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadInnerSectors() {
1247   //-----------------------------------------------------------------
1248   // This function fills inner TPC sectors with clusters.
1249   //-----------------------------------------------------------------
1250   Int_t nrows = fInnerSec->GetNRows();
1251   UInt_t index=0;
1252   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1253     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1254       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1255       //
1256       //left
1257       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1258       while (ncl--) {
1259         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1260         index=(((sec<<8)+row)<<16)+ncl;
1261         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1262       }
1263       //right
1264       ncl = tpcrow->fN2;
1265       while (ncl--) {
1266         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1267         index=((((sec+fkNIS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1268         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1269       }
1270       //
1271       // write indexes for fast acces
1272       //
1273       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1274         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1275       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1276         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1277         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1278       }
1279       Int_t last = 0;
1280       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1281         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1282           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1283         else
1284           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1285       }
1286
1287     }
1288
1289   fN=fkNIS;
1290   fSectors=fInnerSec;
1291   return 0;
1292 }
1293
1294
1295
1296 //_________________________________________________________________________
1297 AliTPCclusterMI *AliTPCtrackerMI::GetClusterMI(Int_t index) const {
1298   //--------------------------------------------------------------------
1299   //       Return pointer to a given cluster
1300   //--------------------------------------------------------------------
1301   Int_t sec=(index&0xff000000)>>24;
1302   Int_t row=(index&0x00ff0000)>>16;
1303   Int_t ncl=(index&0x00007fff)>>00;
1304
1305   const AliTPCRow * tpcrow=0;
1306   AliTPCclusterMI * clrow =0;
1307
1308   if (sec<fkNIS*2){
1309     tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1310     if (tpcrow==0) return 0;
1311
1312     if (sec<fkNIS) {
1313       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1314       clrow = tpcrow->fClusters1;
1315     }
1316     else {
1317       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1318       clrow = tpcrow->fClusters2;
1319     }
1320   }
1321   else {
1322     tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1323     if (tpcrow==0) return 0;
1324
1325     if (sec-2*fkNIS<fkNOS) {
1326       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1327       clrow = tpcrow->fClusters1;
1328     }
1329     else {
1330       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1331       clrow = tpcrow->fClusters2;
1332     }
1333   }
1334
1335   return &(clrow[ncl]);
1336
1337 }
1338
1339
1340
1341 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1342   //-----------------------------------------------------------------
1343   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1344   //-----------------------------------------------------------------
1345   //
1346   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1347   AliTPCclusterMI *cl=0;
1348   Int_t tpcindex= t.GetClusterIndex2(nr);
1349   //
1350   // update current shape info every 5 pad-row
1351   //  if ( (nr%5==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1352     GetShape(&t,nr);
1353     //}
1354   //
1355   if (fIteration>0 && tpcindex>=-1){  //if we have already clusters
1356     //
1357     if (tpcindex==-1) return 0; //track in dead zone
1358     if (tpcindex>0){     //
1359       cl = t.fClusterPointer[nr];
1360       if ( (cl==0) ) cl = GetClusterMI(tpcindex);
1361       t.fCurrentClusterIndex1 = tpcindex;
1362     }
1363     if (cl){
1364       Int_t relativesector = ((tpcindex&0xff000000)>>24)%18;  // if previously accepted cluster in different sector
1365       Float_t angle = relativesector*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift();
1366       //
1367       if (angle<-TMath::Pi()) angle += 2*TMath::Pi();
1368       if (angle>=TMath::Pi()) angle -= 2*TMath::Pi();
1369
1370       if (TMath::Abs(angle-t.GetAlpha())>0.001){
1371         Double_t rotation = angle-t.GetAlpha();
1372         t.fRelativeSector= relativesector;
1373         if (!t.Rotate(rotation)) return 0;
1374       }
1375       if (!t.PropagateTo(x)) return 0;
1376       //
1377       t.fCurrentCluster = cl;
1378       t.fRow = nr;
1379       Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1380       if ((tpcindex&0x8000)==0) accept =0;
1381       if (accept<3) {
1382         //if founded cluster is acceptible
1383         if (cl->IsUsed(11)) {  // id cluster is shared inrease uncertainty
1384           t.fErrorY2 += 0.03;
1385           t.fErrorZ2 += 0.03;
1386           t.fErrorY2 *= 3;
1387           t.fErrorZ2 *= 3;
1388         }
1389         t.fNFoundable++;
1390         UpdateTrack(&t,accept);
1391         return 1;
1392       }
1393     }
1394   }
1395   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker()) return 0;  // cut on angle
1396   if (fIteration>1){
1397     // not look for new cluster during refitting
1398     t.fNFoundable++;
1399     return 0;
1400   }
1401   //
1402   UInt_t index=0;
1403   //  if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95 || TMath::Abs(x*t.GetC()-t.GetEta())>0.95) return 0;// patch 28 fev 06
1404   Double_t  y=t.GetYat(x);
1405   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1406     if (y > ymax) {
1407       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1408       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1409         return 0;
1410     } else if (y <-ymax) {
1411       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1412       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1413         return 0;
1414     }
1415     //return 1;
1416   }
1417   //
1418   if (!t.PropagateTo(x)) {
1419     if (fIteration==0) t.fRemoval = 10;
1420     return 0;
1421   }
1422   y=t.GetY();
1423   Double_t z=t.GetZ();
1424   //
1425   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1426   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1427   Double_t  roady  =1.;
1428   Double_t  roadz = 1.;
1429   //
1430   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1431     t.fInDead = kTRUE;
1432     t.SetClusterIndex2(nr,-1);
1433     return 0;
1434   }
1435   else
1436     {
1437       if (TMath::Abs(z)<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10) && TMath::Abs(z)<fParam->GetZLength() && (TMath::Abs(t.GetSnp())<AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker()))
1438         t.fNFoundable++;
1439       else
1440         return 0;
1441     }
1442   //calculate
1443   if (krow) {
1444     //    cl = krow.FindNearest2(y+10.,z,roady,roadz,index);
1445     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);
1446     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);
1447   }
1448   if (cl) {
1449     t.fCurrentCluster = cl;
1450     t.fRow = nr;
1451     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(10)) return 0;
1452     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1453     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(11)) {
1454       t.fErrorY2 += 0.03;
1455       t.fErrorZ2 += 0.03;
1456       t.fErrorY2 *= 3;
1457       t.fErrorZ2 *= 3;
1458     }
1459     /*
1460     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1461       //
1462       //
1463
1464       t.fNShared++;
1465       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1466         t.fRemoval =10;
1467         return 0;
1468       }
1469     }
1470     */
1471     if (accept<3) UpdateTrack(&t,accept);
1472
1473   } else {
1474     if ( fIteration==0 && t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) t.fRemoval=10;
1475
1476   }
1477   return 1;
1478 }
1479
1480 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1481   //-----------------------------------------------------------------
1482   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1483   //-----------------------------------------------------------------
1484   //
1485   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1486   Double_t y,z;
1487   if (!t.GetProlongation(x,y,z)) {
1488     t.fRemoval = 10;
1489     return 0;
1490   }
1491   //
1492   //
1493   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1494
1495     if (y > ymax) {
1496       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1497       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1498         return 0;
1499     } else if (y <-ymax) {
1500       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1501       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1502         return 0;
1503     }
1504     if (!t.PropagateTo(x)) {
1505       return 0;
1506     }
1507     t.GetProlongation(x,y,z);
1508   }
1509   //
1510   // update current shape info every 3 pad-row
1511   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1512     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1513     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1514     GetShape(&t,nr);
1515   }
1516   //
1517   AliTPCclusterMI *cl=0;
1518   UInt_t index=0;
1519
1520
1521   //Int_t nr2 = nr;
1522   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1523   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1524   Double_t  roady  =1.;
1525   Double_t  roadz = 1.;
1526   //
1527   Int_t row = nr;
1528   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1529     t.fInDead = kTRUE;
1530     t.SetClusterIndex2(row,-1);
1531     return 0;
1532   }
1533   else
1534     {
1535       if (TMath::Abs(z)>(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10)) t.SetClusterIndex2(row,-1);
1536     }
1537   //calculate
1538
1539   if ((cl==0)&&(krow)) {
1540     //    cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,index);
1541     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);
1542
1543     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);
1544   }
1545
1546   if (cl) {
1547     t.fCurrentCluster = cl;
1548     //    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1549     //if (accept<3){
1550       t.SetClusterIndex2(row,index);
1551       t.fClusterPointer[row] = cl;
1552       //}
1553   }
1554   return 1;
1555 }
1556
1557
1558
1559 //_________________________________________________________________________
1560 Bool_t AliTPCtrackerMI::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint &p ) const
1561 {
1562   // Get track space point by index
1563   // return false in case the cluster doesn't exist
1564   AliTPCclusterMI *cl = GetClusterMI(index);
1565   if (!cl) return kFALSE;
1566   Int_t sector = (index&0xff000000)>>24;
1567   Int_t row = (index&0x00ff0000)>>16;
1568   Float_t xyz[3];
1569   xyz[0] = fParam->GetPadRowRadii(sector,row);
1570   xyz[1] = cl->GetY();
1571   xyz[2] = cl->GetZ();
1572   Float_t sin,cos;
1573   fParam->AdjustCosSin(sector,cos,sin);
1574   Float_t x = cos*xyz[0]-sin*xyz[1];
1575   Float_t y = cos*xyz[1]+sin*xyz[0];
1576   Float_t cov[6];
1577   Float_t sigmaY2 = 0.027*cl->GetSigmaY2();
1578   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaY2 *= 2.07;
1579   Float_t sigmaZ2 = 0.066*cl->GetSigmaZ2();
1580   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaZ2 *= 1.77;
1581   cov[0] = sin*sin*sigmaY2;
1582   cov[1] = -sin*cos*sigmaY2;
1583   cov[2] = 0.;
1584   cov[3] = cos*cos*sigmaY2;
1585   cov[4] = 0.;
1586   cov[5] = sigmaZ2;
1587   p.SetXYZ(x,y,xyz[2],cov);
1588   AliAlignObj::ELayerID iLayer;
1589   Int_t idet;
1590   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) {
1591     iLayer = AliAlignObj::kTPC1;
1592     idet = sector;
1593   }
1594   else {
1595     iLayer = AliAlignObj::kTPC2;
1596     idet = sector - fParam->GetNInnerSector();
1597   }
1598   UShort_t volid = AliAlignObj::LayerToVolUID(iLayer,idet);
1599   p.SetVolumeID(volid);
1600   return kTRUE;
1601 }
1602
1603
1604
1605 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateClusters(AliTPCseed& t,  Int_t nr) {
1606   //-----------------------------------------------------------------
1607   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1608   //-----------------------------------------------------------------
1609   t.fCurrentCluster  = 0;
1610   t.fCurrentClusterIndex1 = 0;
1611
1612   Double_t xt=t.GetX();
1613   Int_t     row = GetRowNumber(xt)-1;
1614   Double_t  ymax= GetMaxY(nr);
1615
1616   if (row < nr) return 1; // don't prolongate if not information until now -
1617 //   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.9 && t.GetNumberOfClusters()>40. && fIteration!=2) {
1618 //     t.fRemoval =10;
1619 //     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1620 //   }
1621 //   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95) {
1622 //     t.fRemoval =10;
1623 //     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1624 //   }// patch 28 fev 06
1625
1626   Double_t x= GetXrow(nr);
1627   Double_t y,z;
1628   //t.PropagateTo(x+0.02);
1629   //t.PropagateTo(x+0.01);
1630   if (!t.PropagateTo(x)){
1631     return 0;
1632   }
1633   //
1634   y=t.GetY();
1635   z=t.GetZ();
1636
1637   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1638     if (y > ymax) {
1639       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1640       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1641         return 0;
1642     } else if (y <-ymax) {
1643       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1644       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1645         return 0;
1646     }
1647     //    if (!t.PropagateTo(x)){
1648     //  return 0;
1649     //}
1650     return 1;
1651     //y = t.GetY();
1652   }
1653   //
1654   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker()) return 0;
1655   AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1656
1657   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1658     t.fInDead = kTRUE;
1659     t.SetClusterIndex2(nr,-1);
1660     return 0;
1661   }
1662   else
1663     {
1664       if (TMath::Abs(t.GetZ())<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*t.GetX()+10) && (TMath::Abs(t.GetSnp())<AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker())) t.fNFoundable++;
1665       else
1666         return 0;
1667     }
1668
1669   // update current
1670   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2){
1671     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1672     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1673     GetShape(&t,nr);
1674   }
1675
1676   AliTPCclusterMI *cl=0;
1677   Int_t index=0;
1678   //
1679   Double_t roady = 1.;
1680   Double_t roadz = 1.;
1681   //
1682
1683   if (!cl){
1684     index = t.GetClusterIndex2(nr);
1685     if ( (index>0) && (index&0x8000)==0){
1686       cl = t.fClusterPointer[nr];
1687       if ( (cl==0) && (index>0)) cl = GetClusterMI(index);
1688       t.fCurrentClusterIndex1 = index;
1689       if (cl) {
1690         t.fCurrentCluster  = cl;
1691         return 1;
1692       }
1693     }
1694   }
1695
1696   //  if (index<0) return 0;
1697   UInt_t uindex = TMath::Abs(index);
1698
1699   if (krow) {
1700     //cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,uindex);
1701     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,uindex);
1702   }
1703
1704   if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(uindex);
1705   t.fCurrentCluster  = cl;
1706
1707   return 1;
1708 }
1709
1710
1711 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextCluster(AliTPCseed & t, Int_t nr) {
1712   //-----------------------------------------------------------------
1713   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1714   //-----------------------------------------------------------------
1715
1716   //update error according neighborhoud
1717
1718   if (t.fCurrentCluster) {
1719     t.fRow = nr;
1720     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1721
1722     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1723       //
1724       //
1725       //  t.fErrorZ2*=2;
1726       //  t.fErrorY2*=2;
1727       t.fNShared++;
1728       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1729         t.fRemoval =10;
1730         return 0;
1731       }
1732     }
1733     if (fIteration>0) accept = 0;
1734     if (accept<3)  UpdateTrack(&t,accept);
1735
1736   } else {
1737     if (fIteration==0){
1738       if ( ( (t.GetSigmaY2()+t.GetSigmaZ2())>0.16)&& t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;
1739       if (  t.GetChi2()/t.GetNumberOfClusters()>6 &&t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;
1740
1741       if (( (t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) || t.fNoCluster>15)) t.fRemoval=10;
1742     }
1743   }
1744   return 1;
1745 }
1746
1747
1748
1749 //_____________________________________________________________________________
1750 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1751   //-----------------------------------------------------------------
1752   // This function tries to find a track prolongation.
1753   //-----------------------------------------------------------------
1754   Double_t xt=t.GetX();
1755   //
1756   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1757   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1758   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1759   //
1760   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1761
1762   Int_t first = GetRowNumber(xt)-1;
1763   for (Int_t nr= first; nr>=rf; nr-=step) {
1764     // update kink info
1765     if (t.GetKinkIndexes()[0]>0){
1766       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1767         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1768         if (index==0) break;
1769         if (index<0) continue;
1770         //
1771         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1772         if (!kink){
1773           printf("PROBLEM\n");
1774         }
1775         else{
1776           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()+2+Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1777           if (kinkrow==nr){
1778             AliExternalTrackParam paramd(t);
1779             kink->SetDaughter(paramd);
1780             kink->SetStatus(2,5);
1781             kink->Update();
1782           }
1783         }
1784       }
1785     }
1786
1787     if (nr==80) t.UpdateReference();
1788     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
1789       fSectors = fInnerSec;
1790     else
1791       fSectors = fOuterSec;
1792     if (FollowToNext(t,nr)==0)
1793       if (!t.IsActive())
1794         return 0;
1795
1796   }
1797   return 1;
1798 }
1799
1800
1801 //_____________________________________________________________________________
1802 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongationFast(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1803   //-----------------------------------------------------------------
1804   // This function tries to find a track prolongation.
1805   //-----------------------------------------------------------------
1806   Double_t xt=t.GetX();
1807   //
1808   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1809   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1810   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1811   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1812
1813   for (Int_t nr=GetRowNumber(xt)-1; nr>=rf; nr-=step) {
1814
1815     if (FollowToNextFast(t,nr)==0)
1816       if (!t.IsActive()) return 0;
1817
1818   }
1819   return 1;
1820 }
1821
1822
1823
1824
1825
1826 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowBackProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf) {
1827   //-----------------------------------------------------------------
1828   // This function tries to find a track prolongation.
1829   //-----------------------------------------------------------------
1830   //
1831   Double_t xt=t.GetX();
1832   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1833   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1834   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1835   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1836
1837   Int_t first = t.fFirstPoint;
1838   if (first<GetRowNumber(xt)+1) first = GetRowNumber(xt)+1;
1839   //
1840   if (first<0) first=0;
1841   for (Int_t nr=first; nr<=rf; nr++) {
1842     //    if ( (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95)) break;//patch 28 fev 06
1843     if (t.GetKinkIndexes()[0]<0){
1844       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1845         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1846         if (index==0) break;
1847         if (index>0) continue;
1848         index = TMath::Abs(index);
1849         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1850         if (!kink){
1851           printf("PROBLEM\n");
1852         }
1853         else{
1854           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()-2-Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1855           if (kinkrow==nr){
1856             AliExternalTrackParam paramm(t);
1857             kink->SetMother(paramm);
1858             kink->SetStatus(2,1);
1859             kink->Update();
1860           }
1861         }
1862       }
1863     }
1864     //
1865     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
1866       fSectors = fInnerSec;
1867     else
1868       fSectors = fOuterSec;
1869     FollowToNext(t,nr);
1870   }
1871   return 1;
1872 }
1873
1874
1875
1876
1877
1878 Float_t AliTPCtrackerMI::OverlapFactor(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2, Int_t &sum1, Int_t & sum2)
1879 {
1880   //
1881   //
1882   sum1=0;
1883   sum2=0;
1884   Int_t sum=0;
1885   //
1886   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1887   dz2*=dz2;
1888
1889   Float_t dy2 =TMath::Abs((s1->GetY() - s2->GetY()));
1890   dy2*=dy2;
1891   Float_t distance = TMath::Sqrt(dz2+dy2);
1892   if (distance>4.) return 0; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1893
1894   //  Int_t offset =0;
1895   Int_t firstpoint = TMath::Min(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1896   Int_t lastpoint = TMath::Max(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1897   if (lastpoint>160)
1898     lastpoint =160;
1899   if (firstpoint<0)
1900     firstpoint = 0;
1901   if (firstpoint>lastpoint) {
1902     firstpoint =lastpoint;
1903     //    lastpoint  =160;
1904   }
1905
1906
1907   for (Int_t i=firstpoint-1;i<lastpoint+1;i++){
1908     if (s1->GetClusterIndex2(i)>0) sum1++;
1909     if (s2->GetClusterIndex2(i)>0) sum2++;
1910     if (s1->GetClusterIndex2(i)==s2->GetClusterIndex2(i) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1911       sum++;
1912     }
1913   }
1914   if (sum<5) return 0;
1915
1916   Float_t summin = TMath::Min(sum1+1,sum2+1);
1917   Float_t ratio = (sum+1)/Float_t(summin);
1918   return ratio;
1919 }
1920
1921 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2)
1922 {
1923   //
1924   //
1925   if (TMath::Abs(s1->GetC()-s2->GetC())>0.004) return;
1926   if (TMath::Abs(s1->GetTgl()-s2->GetTgl())>0.6) return;
1927
1928   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1929   dz2*=dz2;
1930   Float_t dy2 =(s1->GetY() - s2->GetY());
1931   dy2*=dy2;
1932   Float_t distance = dz2+dy2;
1933   if (distance>325.) return ; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1934
1935   //
1936   Int_t sumshared=0;
1937   //
1938   Int_t firstpoint = TMath::Max(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1939   Int_t lastpoint = TMath::Min(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1940   //
1941   if (firstpoint>=lastpoint-5) return;;
1942
1943   for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1944     //    if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1945     if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1946       sumshared++;
1947     }
1948   }
1949   if (sumshared>4){
1950     // sign clusters
1951     //
1952     for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1953       //      if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1954       if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1955         AliTPCTrackerPoint *p1  = s1->GetTrackPoint(i);
1956         AliTPCTrackerPoint *p2  = s2->GetTrackPoint(i);;
1957         if (s1->IsActive()&&s2->IsActive()){
1958           p1->fIsShared = kTRUE;
1959           p2->fIsShared = kTRUE;
1960         }
1961       }
1962     }
1963   }
1964   //
1965   if (sumshared>10){
1966     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1967       if (s1->fOverlapLabels[3*i]==0){
1968         s1->fOverlapLabels[3*i] = s2->GetLabel();
1969         s1->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1970         s1->fOverlapLabels[3*i+2] = s2->GetUniqueID();
1971         break;
1972       }
1973     }
1974     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1975       if (s2->fOverlapLabels[3*i]==0){
1976         s2->fOverlapLabels[3*i] = s1->GetLabel();
1977         s2->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1978         s2->fOverlapLabels[3*i+2] = s1->GetUniqueID();
1979         break;
1980       }
1981     }
1982   }
1983
1984 }
1985
1986 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(TObjArray * arr)
1987 {
1988   //
1989   //sort trackss according sectors
1990   //
1991   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
1992     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
1993     if (!pt) continue;
1994     //if (pt) RotateToLocal(pt);
1995     pt->fSort = 0;
1996   }
1997   arr->UnSort();
1998   arr->Sort();  // sorting according z
1999   arr->Expand(arr->GetEntries());
2000   //
2001   //
2002   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2003   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2004     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2005     if (!pt) continue;
2006     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2007       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2008     }
2009   }
2010   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2011     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2012     if (!pt) continue;
2013     if (pt->fRemoval>10) continue;
2014     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2015       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2016       //      if (pt2){
2017       if (pt2->fRemoval<=10) {
2018         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2019         SignShared(pt,pt2);
2020       }
2021     }
2022   }
2023 }
2024
2025 void  AliTPCtrackerMI::RemoveDouble(TObjArray * arr, Float_t factor1, Float_t factor2,  Int_t removalindex)
2026 {
2027   //
2028   //sort trackss according sectors
2029   //
2030   if (fDebug&1) {
2031     Info("RemoveDouble","Number of tracks before double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2032   }
2033   //
2034   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
2035     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2036     if (!pt) continue;
2037     pt->fSort = 0;
2038   }
2039   arr->UnSort();
2040   arr->Sort();  // sorting according z
2041   arr->Expand(arr->GetEntries());
2042   //
2043   //reset overlap labels
2044   //
2045   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2046   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2047     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2048     if (!pt) continue;
2049     pt->SetUniqueID(i);
2050     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2051       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2052     }
2053   }
2054   //
2055   //sign shared tracks
2056   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2057     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2058     if (!pt) continue;
2059     if (pt->fRemoval>10) continue;
2060     Float_t deltac = pt->GetC()*0.1;
2061     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2062       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2063       //      if (pt2){
2064       if (pt2->fRemoval<=10) {
2065         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2066         if (TMath::Abs(pt->GetC()  -pt2->GetC())>deltac) continue;
2067         if (TMath::Abs(pt->GetTgl()-pt2->GetTgl())>0.05) continue;
2068         //
2069         SignShared(pt,pt2);
2070       }
2071     }
2072   }
2073   //
2074   // remove highly shared tracks
2075   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2076     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2077     if (!pt) continue;
2078     if (pt->fRemoval>10) continue;
2079     //
2080     Int_t sumshared =0;
2081     for (Int_t j=0;j<4;j++){
2082       sumshared = pt->fOverlapLabels[j*3+1];
2083     }
2084     Float_t factor = factor1;
2085     if (pt->fRemoval>0) factor = factor2;
2086     if (sumshared/pt->GetNumberOfClusters()>factor){
2087       for (Int_t j=0;j<4;j++){
2088         if (pt->fOverlapLabels[3*j]==0) continue;
2089         if (pt->fOverlapLabels[3*j+1]<5) continue;
2090         if (pt->fRemoval==removalindex) continue;
2091         AliTPCseed * pt2 = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(pt->fOverlapLabels[3*j+2]);
2092         if (!pt2) continue;
2093         if (pt2->GetSigma2C()<pt->GetSigma2C()){
2094           //      pt->fRemoval = removalindex;
2095           delete arr->RemoveAt(i);
2096           break;
2097         }
2098       }
2099     }
2100   }
2101   arr->Compress();
2102   if (fDebug&1) {
2103     Info("RemoveDouble","Number of tracks after double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2104   }
2105 }
2106
2107
2108
2109
2110
2111
2112 void AliTPCtrackerMI::SortTracks(TObjArray * arr, Int_t mode) const
2113 {
2114   //
2115   //sort tracks in array according mode criteria
2116   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2117   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2118     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2119     if (!pt) {
2120       continue;
2121     }
2122     pt->fSort = mode;
2123   }
2124   arr->UnSort();
2125   arr->Sort();
2126 }
2127
2128 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t removalindex)
2129 {
2130
2131   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2132   //
2133   //
2134   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2135   Int_t good =0;
2136
2137   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2138     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2139     if (!pt) {
2140       delete arr->RemoveAt(i);
2141     }
2142     else{
2143       pt->fSort =1;
2144       pt->fBSigned = kFALSE;
2145     }
2146   }
2147   arr->Compress();
2148   nseed = arr->GetEntriesFast();
2149   arr->UnSort();
2150   arr->Sort();
2151   //
2152   //unsign used
2153   UnsignClusters();
2154   //
2155   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2156     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2157     if (!pt) {
2158       continue;
2159     }
2160     Int_t found,foundable,shared;
2161     if (pt->IsActive())
2162       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kFALSE);
2163     else
2164       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kTRUE);
2165     //
2166     Double_t factor = factor2;
2167     if (pt->fBConstrain) factor = factor1;
2168
2169     if ((Float_t(shared)/Float_t(found))>factor){
2170       pt->Desactivate(removalindex);
2171       continue;
2172     }
2173
2174     good++;
2175     for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2176       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2177       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2178       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2179       if (!c) continue;
2180       //      if (!c->IsUsed(10)) c->Use(10);
2181       //if (pt->IsActive())
2182       c->Use(10);
2183       //else
2184       //        c->Use(5);
2185     }
2186
2187   }
2188   fNtracks = good;
2189   if (fDebug>0){
2190     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2191   }
2192 }
2193
2194
2195 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed2(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t minimal)
2196 {
2197
2198   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2199   //
2200   //
2201   UnsignClusters();
2202   //
2203   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2204   Float_t * quality = new Float_t[nseed];
2205   Int_t   * indexes = new Int_t[nseed];
2206   Int_t good =0;
2207   //
2208   //
2209   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2210     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2211     if (!pt){
2212       quality[i]=-1;
2213       continue;
2214     }
2215     pt->UpdatePoints();    //select first last max dens points
2216     Float_t * points = pt->GetPoints();
2217     if (points[3]<0.8) quality[i] =-1;
2218     //
2219     quality[i] = (points[2]-points[0])+pt->GetNumberOfClusters();
2220   }
2221   TMath::Sort(nseed,quality,indexes);
2222   //
2223   //
2224   for (Int_t itrack=0; itrack<nseed; itrack++) {
2225     Int_t trackindex = indexes[itrack];
2226     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(trackindex);
2227     if (quality[trackindex]<0){
2228       if (pt) {
2229         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2230       }
2231       else{
2232         arr->RemoveAt(trackindex);
2233       }
2234       continue;
2235     }
2236     //
2237     Int_t first = Int_t(pt->GetPoints()[0]);
2238     Int_t last  = Int_t(pt->GetPoints()[2]);
2239     Double_t factor = (pt->fBConstrain) ? factor1: factor2;
2240     //
2241     Int_t found,foundable,shared;
2242     pt->GetClusterStatistic(first,last, found, foundable,shared,kFALSE);
2243     Float_t sharedfactor = Float_t(shared+1)/Float_t(found+1);
2244     Bool_t itsgold =kFALSE;
2245     if (pt->fEsd){
2246       UInt_t dummy[12];
2247       if (pt->fEsd->GetITSclusters(dummy)>4) itsgold= kTRUE;
2248     }
2249     if (!itsgold){
2250       //
2251       if (Float_t(shared+1)/Float_t(found+1)>factor){
2252         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2253         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2254         continue;
2255       }
2256       if (pt->GetNumberOfClusters()<50&&(found-0.5*shared)<minimal){  //remove short tracks
2257         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2258         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2259         continue;
2260       }
2261     }
2262
2263     good++;
2264     if (sharedfactor>0.4) continue;
2265     if (pt->GetKinkIndexes()[0]>0) continue;
2266     for (Int_t i=first; i<last; i++) {
2267       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2268       // if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2269       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2270       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2271       if (!c) continue;
2272       c->Use(10);
2273     }
2274   }
2275   fNtracks = good;
2276   if (fDebug>0){
2277     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2278   }
2279   delete []quality;
2280   delete []indexes;
2281 }
2282
2283 void AliTPCtrackerMI::UnsignClusters()
2284 {
2285   //
2286   // loop over all clusters and unsign them
2287   //
2288
2289   for (Int_t sec=0;sec<fkNIS;sec++){
2290     for (Int_t row=0;row<fInnerSec->GetNRows();row++){
2291       AliTPCclusterMI *cl = fInnerSec[sec][row].fClusters1;
2292       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN1;icl++)
2293         //      if (cl[icl].IsUsed(10))
2294         cl[icl].Use(-1);
2295       cl = fInnerSec[sec][row].fClusters2;
2296       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN2;icl++)
2297         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2298           cl[icl].Use(-1);
2299     }
2300   }
2301
2302   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
2303     for (Int_t row=0;row<fOuterSec->GetNRows();row++){
2304       AliTPCclusterMI *cl = fOuterSec[sec][row].fClusters1;
2305       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN1;icl++)
2306         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2307           cl[icl].Use(-1);
2308       cl = fOuterSec[sec][row].fClusters2;
2309       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN2;icl++)
2310         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2311         cl[icl].Use(-1);
2312     }
2313   }
2314
2315 }
2316
2317
2318
2319 void AliTPCtrackerMI::SignClusters(TObjArray * arr, Float_t fnumber, Float_t fdensity)
2320 {
2321   //
2322   //sign clusters to be "used"
2323   //
2324   // snumber and sdensity sign number of sigmas - bellow mean value to be accepted
2325   // loop over "primaries"
2326
2327   Float_t sumdens=0;
2328   Float_t sumdens2=0;
2329   Float_t sumn   =0;
2330   Float_t sumn2  =0;
2331   Float_t sumchi =0;
2332   Float_t sumchi2 =0;
2333
2334   Float_t sum    =0;
2335
2336   TStopwatch timer;
2337   timer.Start();
2338
2339   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2340   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2341     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2342     if (!pt) {
2343       continue;
2344     }
2345     if (!(pt->IsActive())) continue;
2346     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2347     if ( (dens>0.7) && (pt->GetNumberOfClusters()>70)){
2348       sumdens += dens;
2349       sumdens2+= dens*dens;
2350       sumn    += pt->GetNumberOfClusters();
2351       sumn2   += pt->GetNumberOfClusters()*pt->GetNumberOfClusters();
2352       Float_t chi2 = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2353       if (chi2>5) chi2=5;
2354       sumchi  +=chi2;
2355       sumchi2 +=chi2*chi2;
2356       sum++;
2357     }
2358   }
2359
2360   Float_t mdensity = 0.9;
2361   Float_t meann    = 130;
2362   Float_t meanchi  = 1;
2363   Float_t sdensity = 0.1;
2364   Float_t smeann    = 10;
2365   Float_t smeanchi  =0.4;
2366
2367
2368   if (sum>20){
2369     mdensity = sumdens/sum;
2370     meann    = sumn/sum;
2371     meanchi  = sumchi/sum;
2372     //
2373     sdensity = sumdens2/sum-mdensity*mdensity;
2374     sdensity = TMath::Sqrt(sdensity);
2375     //
2376     smeann   = sumn2/sum-meann*meann;
2377     smeann   = TMath::Sqrt(smeann);
2378     //
2379     smeanchi = sumchi2/sum - meanchi*meanchi;
2380     smeanchi = TMath::Sqrt(smeanchi);
2381   }
2382
2383
2384   //REMOVE  SHORT DELTAS or tracks going out of sensitive volume of TPC
2385   //
2386   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2387     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2388     if (!pt) {
2389       continue;
2390     }
2391     if (pt->fBSigned) continue;
2392     if (pt->fBConstrain) continue;
2393     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2394     /*
2395     Int_t found,foundable,shared;
2396     pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared);
2397     if (shared/float(found)>0.3) {
2398       if (shared/float(found)>0.9 ){
2399         //delete arr->RemoveAt(i);
2400       }
2401       continue;
2402     }
2403     */
2404     Bool_t isok =kFALSE;
2405     if ( (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.5) &&pt->GetNumberOfClusters()>60)
2406       isok = kTRUE;
2407     if ((TMath::Abs(1/pt->GetC())<100.) && (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.7))
2408       isok =kTRUE;
2409     if  (TMath::Abs(pt->GetZ()/pt->GetX())>1.1)
2410       isok =kTRUE;
2411     if ( (TMath::Abs(pt->GetSnp()>0.7) && pt->GetD(0,0)>60.))
2412       isok =kTRUE;
2413
2414     if (isok)
2415       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2416         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2417         if (index<0) continue;
2418         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2419         if (!c) continue;
2420         //if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();
2421         c->Use(10);
2422       }
2423   }
2424
2425
2426   //
2427   Double_t maxchi  = meanchi+2.*smeanchi;
2428
2429   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2430     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2431     if (!pt) {
2432       continue;
2433     }
2434     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2435     if (pt->fBSigned) continue;
2436     Double_t chi     = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2437     if (chi>maxchi) continue;
2438
2439     Float_t bfactor=1;
2440     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2441
2442     //sign only tracks with enoug big density at the beginning
2443
2444     if ((pt->GetDensityFirst(40)<0.75) && pt->GetNumberOfClusters()<meann) continue;
2445
2446
2447     Double_t mindens = TMath::Max(double(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor),0.65);
2448     Double_t minn    = TMath::Max(Int_t(meann-fnumber*smeann*bfactor),50);
2449
2450     //    if (pt->fBConstrain) mindens = TMath::Max(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor,0.65);
2451     if ( (pt->fRemoval==10) && (pt->GetSnp()>0.8)&&(dens>mindens))
2452       minn=0;
2453
2454     if ((dens>mindens && pt->GetNumberOfClusters()>minn) && chi<maxchi ){
2455       //Int_t noc=pt->GetNumberOfClusters();
2456       pt->fBSigned = kTRUE;
2457       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2458
2459         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2460         if (index<0) continue;
2461         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2462         if (!c) continue;
2463         //      if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();
2464         c->Use(10);
2465       }
2466     }
2467   }
2468   //  gLastCheck = nseed;
2469   //  arr->Compress();
2470   if (fDebug>0){
2471     timer.Print();
2472   }
2473 }
2474
2475
2476 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(TObjArray * arr, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1, Float_t th2) const
2477 {
2478   // stop not active tracks
2479   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2480   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows
2481   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2482   //
2483   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2484     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2485     if (!pt) {
2486       continue;
2487     }
2488     if (!(pt->IsActive())) continue;
2489     StopNotActive(pt,row0,th0, th1,th2);
2490   }
2491 }
2492
2493
2494
2495 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(AliTPCseed * seed, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1,
2496  Float_t th2) const
2497 {
2498   // stop not active tracks
2499   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2500   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows
2501   Int_t sumgood1  = 0;
2502   Int_t sumgood2  = 0;
2503   Int_t foundable = 0;
2504   Int_t maxindex = seed->fLastPoint;  //last foundable row
2505   if (seed->fNFoundable*th0 > seed->GetNumberOfClusters()) {
2506     seed->Desactivate(10) ;
2507     return;
2508   }
2509
2510   for (Int_t i=row0; i<maxindex; i++){
2511     Int_t index = seed->GetClusterIndex2(i);
2512     if (index!=-1) foundable++;
2513     //if (!c) continue;
2514     if (foundable<=30) sumgood1++;
2515     if (foundable<=50) {
2516       sumgood2++;
2517     }
2518     else{
2519       break;
2520     }
2521   }
2522   if (foundable>=30.){
2523      if (sumgood1<(th1*30.)) seed->Desactivate(10);
2524   }
2525   if (foundable>=50)
2526     if (sumgood2<(th2*50.)) seed->Desactivate(10);
2527 }
2528
2529
2530 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESD *event)
2531 {
2532   //
2533   // back propagation of ESD tracks
2534   //
2535   //return 0;
2536   fEvent = event;
2537   ReadSeeds(event,2);
2538   fIteration=2;
2539   //PrepareForProlongation(fSeeds,1);
2540   PropagateForward2(fSeeds);
2541
2542   Int_t ntracks=0;
2543   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2544   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2545     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2546     if (!seed) continue;
2547     if (seed->GetKinkIndex(0)>0)  UpdateKinkQualityD(seed);  // update quality informations for kinks
2548
2549     seed->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
2550     seed->UpdatePoints();
2551     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2552     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2553     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2554     //
2555     if (0 && seed!=0&&esd!=0) {
2556       TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
2557       cstream<<"Crefit"<<
2558         "Esd.="<<esd<<
2559         "Track.="<<seed<<
2560         "\n";
2561     }
2562     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2563       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCrefit);
2564       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2565       esd->SetTPCPointsF(seed->fNFoundable);
2566       Int_t ndedx   = seed->fNCDEDX[0]+seed->fNCDEDX[1]+seed->fNCDEDX[2]+seed->fNCDEDX[3];
2567       Float_t sdedx = (seed->fSDEDX[0]+seed->fSDEDX[1]+seed->fSDEDX[2]+seed->fSDEDX[3])*0.25;
2568       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
2569       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
2570       ntracks++;
2571     }
2572     else{
2573       //printf("problem\n");
2574     }
2575   }
2576   //FindKinks(fSeeds,event);
2577   Info("RefitInward","Number of refitted tracks %d",ntracks);
2578   fEvent =0;
2579   //WriteTracks();
2580   return 0;
2581 }
2582
2583
2584 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESD *event)
2585 {
2586   //
2587   // back propagation of ESD tracks
2588   //
2589
2590   fEvent = event;
2591   fIteration = 1;
2592   ReadSeeds(event,1);
2593   PropagateBack(fSeeds);
2594   RemoveUsed2(fSeeds,0.4,0.4,20);
2595   //
2596   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2597   Int_t ntracks=0;
2598   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2599     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2600     if (!seed) continue;
2601     if (seed->GetKinkIndex(0)<0)  UpdateKinkQualityM(seed);  // update quality informations for kinks
2602     seed->UpdatePoints();
2603     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2604     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2605     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2606     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2607       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCout);
2608       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2609       esd->SetTPCPointsF(seed->fNFoundable);
2610       Int_t ndedx   = seed->fNCDEDX[0]+seed->fNCDEDX[1]+seed->fNCDEDX[2]+seed->fNCDEDX[3];
2611       Float_t sdedx = (seed->fSDEDX[0]+seed->fSDEDX[1]+seed->fSDEDX[2]+seed->fSDEDX[3])*0.25;
2612       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
2613       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
2614       ntracks++;
2615       Int_t eventnumber = event->GetEventNumber();// patch 28 fev 06
2616       (*fDebugStreamer)<<"Cback"<<
2617         "Tr0.="<<seed<<
2618         "EventNr="<<eventnumber<<
2619         "\n"; // patch 28 fev 06
2620     }
2621   }
2622   //FindKinks(fSeeds,event);
2623   Info("PropagateBack","Number of back propagated tracks %d",ntracks);
2624   fEvent =0;
2625   //WriteTracks();
2626   return 0;
2627 }
2628
2629
2630 void AliTPCtrackerMI::DeleteSeeds()
2631 {
2632   //
2633   //delete Seeds
2634   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2635   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2636     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*)fSeeds->At(i);
2637     if (seed) delete fSeeds->RemoveAt(i);
2638   }
2639   delete fSeeds;
2640   fSeeds =0;
2641 }
2642
2643 void AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(AliESD *event, Int_t direction)
2644 {
2645   //
2646   //read seeds from the event
2647
2648   Int_t nentr=event->GetNumberOfTracks();
2649   if (fDebug>0){
2650     Info("ReadSeeds", "Number of ESD tracks: %d\n", nentr);
2651   }
2652   if (fSeeds)
2653     DeleteSeeds();
2654   if (!fSeeds){
2655     fSeeds = new TObjArray(nentr);
2656   }
2657   UnsignClusters();
2658   //  Int_t ntrk=0;
2659   for (Int_t i=0; i<nentr; i++) {
2660     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2661     ULong_t status=esd->GetStatus();
2662     if (!(status&AliESDtrack::kTPCin)) continue;
2663     AliTPCtrack t(*esd);
2664     t.SetNumberOfClusters(0);
2665     //    AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t,t.GetAlpha());
2666     AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t/*,t.GetAlpha()*/);
2667     for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++) {
2668       Int_t index = esd->GetKinkIndex(ikink);
2669       seed->GetKinkIndexes()[ikink] = index;
2670       if (index==0) continue;
2671       index = TMath::Abs(index);
2672       AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
2673       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)<0){
2674         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,2);
2675         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,0);
2676       }
2677       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)>0){
2678         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,6);
2679         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,4);
2680       }
2681
2682     }
2683     if (((status&AliESDtrack::kITSout)==0)&&(direction==1)) seed->ResetCovariance();
2684     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) == 0 ) seed->ResetCovariance();
2685     if ( direction ==2 && ((status & AliESDtrack::kTPCout) == 0) ) {
2686       fSeeds->AddAt(0,i);
2687       delete seed;
2688       continue;
2689     }
2690     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) > 0 )  {
2691       Double_t par0[5],par1[5],alpha,x;
2692       esd->GetInnerExternalParameters(alpha,x,par0);
2693       esd->GetExternalParameters(x,par1);
2694       Double_t delta1 = TMath::Abs(par0[4]-par1[4])/(0.000000001+TMath::Abs(par0[4]+par1[4]));
2695       Double_t delta2 = TMath::Abs(par0[3]-par1[3]);
2696       Double_t trdchi2=0;
2697       if (esd->GetTRDncls()>0) trdchi2 = esd->GetTRDchi2()/esd->GetTRDncls();
2698       //reset covariance if suspicious
2699       if ( (delta1>0.1) || (delta2>0.006) ||trdchi2>7.)
2700         seed->ResetCovariance();
2701     }
2702
2703     //
2704     //
2705     // rotate to the local coordinate system
2706     //
2707     fSectors=fInnerSec; fN=fkNIS;
2708     Double_t alpha=seed->GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
2709     if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
2710     if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
2711     Int_t ns=Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha())%fN;
2712     alpha =ns*fSectors->GetAlpha() + fSectors->GetAlphaShift();
2713     if (alpha<-TMath::Pi()) alpha += 2*TMath::Pi();
2714     if (alpha>=TMath::Pi()) alpha -= 2*TMath::Pi();
2715     alpha-=seed->GetAlpha();
2716     if (!seed->Rotate(alpha)) {
2717       delete seed;
2718       continue;
2719     }
2720     seed->fEsd = esd;
2721     // sign clusters
2722     if (esd->GetKinkIndex(0)<=0){
2723       for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
2724         Int_t index = seed->GetClusterIndex2(irow);
2725         if (index>0){
2726           //
2727           AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(index);
2728           seed->fClusterPointer[irow] = cl;
2729           if (cl){
2730             if ((index & 0x8000)==0){
2731               cl->Use(10);  // accepted cluster
2732             }else{
2733               cl->Use(6);   // close cluster not accepted
2734             }
2735           }else{
2736             Info("ReadSeeds","Not found cluster");
2737           }
2738         }
2739       }
2740     }
2741     fSeeds->AddAt(seed,i);
2742   }
2743 }
2744
2745
2746
2747 //_____________________________________________________________________________
2748 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds3(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
2749                                  Float_t deltay, Int_t ddsec) {
2750   //-----------------------------------------------------------------
2751   // This function creates track seeds.
2752   // SEEDING WITH VERTEX CONSTRAIN
2753   //-----------------------------------------------------------------
2754   // cuts[0]   - fP4 cut
2755   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
2756   // cuts[2]   - zvertex cut
2757   // cuts[3]   - fP3 cut
2758   Int_t nin0  = 0;
2759   Int_t nin1  = 0;
2760   Int_t nin2  = 0;
2761   Int_t nin   = 0;
2762   Int_t nout1 = 0;
2763   Int_t nout2 = 0;
2764
2765   Double_t x[5], c[15];
2766   //  Int_t di = i1-i2;
2767   //
2768   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
2769   Double_t alpha=fSectors->GetAlpha(), shift=fSectors->GetAlphaShift();
2770   Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
2771   //
2772   //  Double_t x1 =fOuterSec->GetX(i1);
2773   //Double_t xx2=fOuterSec->GetX(i2);
2774
2775   Double_t x1 =GetXrow(i1);
2776   Double_t xx2=GetXrow(i2);
2777
2778   Double_t x3=GetX(), y3=GetY(), z3=GetZ();
2779
2780   Int_t imiddle = (i2+i1)/2;    //middle pad row index
2781   Double_t xm = GetXrow(imiddle); // radius of middle pad-row
2782   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,imiddle); //middle pad -row
2783   //
2784   Int_t ns =sec;
2785
2786   const AliTPCRow& kr1=GetRow(ns,i1);
2787   Double_t ymax  = GetMaxY(i1)-kr1.fDeadZone-1.5;
2788   Double_t ymaxm = GetMaxY(imiddle)-kr1.fDeadZone-1.5;
2789
2790   //
2791   // change cut on curvature if it can't reach this layer
2792   // maximal curvature set to reach it
2793   Double_t dvertexmax  = TMath::Sqrt((x1-x3)*(x1-x3)+(ymax+5-y3)*(ymax+5-y3));
2794   if (dvertexmax*0.5*cuts[0]>0.85){
2795     cuts[0] = 0.85/(dvertexmax*0.5+1.);
2796   }
2797   Double_t r2min = 1/(cuts[0]*cuts[0]);  //minimal square of radius given by cut
2798
2799   //  Int_t ddsec = 1;
2800   if (deltay>0) ddsec = 0;
2801   // loop over clusters
2802   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
2803     //
2804     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
2805     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();
2806     //if (TMath::Abs(y1)>ymax) continue;
2807
2808     if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
2809
2810     // find possible directions
2811     Float_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
2812     Float_t extraz = z1 - anglez*(x1-xx2);  // extrapolated z
2813     //
2814     //
2815     //find   rotation angles relative to line given by vertex and point 1
2816     Double_t dvertex2 = (x1-x3)*(x1-x3)+(y1-y3)*(y1-y3);
2817     Double_t dvertex  = TMath::Sqrt(dvertex2);
2818     Double_t angle13  = TMath::ATan((y1-y3)/(x1-x3));
2819     Double_t cs13     = cos(-angle13), sn13 = sin(-angle13);
2820
2821     //
2822     // loop over 2 sectors
2823     Int_t dsec1=-ddsec;
2824     Int_t dsec2= ddsec;
2825     if (y1<0)  dsec2= 0;
2826     if (y1>0)  dsec1= 0;
2827
2828     Double_t dddz1=0;  // direction of delta inclination in z axis
2829     Double_t dddz2=0;
2830     if ( (z1-z3)>0)
2831       dddz1 =1;
2832     else
2833       dddz2 =1;
2834     //
2835     for (Int_t dsec = dsec1; dsec<=dsec2;dsec++){
2836       Int_t sec2 = sec + dsec;
2837       //
2838       //      AliTPCRow&  kr2  = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][i2];
2839       //AliTPCRow&  kr2m = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][imiddle];
2840       AliTPCRow&  kr2  = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,i2);
2841       AliTPCRow&  kr2m = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,imiddle);
2842       Int_t  index1 = TMath::Max(kr2.Find(extraz-0.6-dddz1*TMath::Abs(z1)*0.05)-1,0);
2843       Int_t  index2 = TMath::Min(kr2.Find(extraz+0.6+dddz2*TMath::Abs(z1)*0.05)+1,kr2);
2844
2845       // rotation angles to p1-p3
2846       Double_t cs13r     = cos(-angle13+dsec*alpha)/dvertex, sn13r = sin(-angle13+dsec*alpha)/dvertex;
2847       Double_t x2,   y2,   z2;
2848       //
2849       //      Double_t dymax = maxangle*TMath::Abs(x1-xx2);
2850
2851       //
2852       Double_t dxx0 =  (xx2-x3)*cs13r;
2853       Double_t dyy0 =  (xx2-x3)*sn13r;
2854       for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
2855         const AliTPCclusterMI *kcl = kr2[js];
2856         if (kcl->IsUsed(10)) continue;
2857         //
2858         //calcutate parameters
2859         //
2860         Double_t yy0 =  dyy0 +(kcl->GetY()-y3)*cs13r;
2861         // stright track
2862         if (TMath::Abs(yy0)<0.000001) continue;
2863         Double_t xx0 =  dxx0 -(kcl->GetY()-y3)*sn13r;
2864         Double_t y0  =  0.5*(xx0*xx0+yy0*yy0-xx0)/yy0;
2865         Double_t r02 = (0.25+y0*y0)*dvertex2;
2866         //curvature (radius) cut
2867         if (r02<r2min) continue;
2868
2869         nin0++;
2870         //
2871         Double_t c0  = 1/TMath::Sqrt(r02);
2872         if (yy0>0) c0*=-1.;
2873
2874
2875         //Double_t dfi0   = 2.*TMath::ASin(dvertex*c0*0.5);
2876         //Double_t dfi1   = 2.*TMath::ASin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2877         Double_t dfi0   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(dvertex*c0*0.5);
2878         Double_t dfi1   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2879         //
2880         //
2881         Double_t z0  =  kcl->GetZ();
2882         Double_t zzzz2    = z1-(z1-z3)*dfi1/dfi0;
2883         if (TMath::Abs(zzzz2-z0)>0.5) continue;
2884         nin1++;
2885         //
2886         Double_t dip    = (z1-z0)*c0/dfi1;
2887         Double_t x0 = (0.5*cs13+y0*sn13)*dvertex*c0;
2888         //
2889         y2 = kcl->GetY();
2890         if (dsec==0){
2891           x2 = xx2;
2892           z2 = kcl->GetZ();
2893         }
2894         else
2895           {
2896             // rotation
2897             z2 = kcl->GetZ();
2898             x2= xx2*cs-y2*sn*dsec;
2899             y2=+xx2*sn*dsec+y2*cs;
2900           }
2901
2902         x[0] = y1;
2903         x[1] = z1;
2904         x[2] = x0;
2905         x[3] = dip;
2906         x[4] = c0;
2907         //
2908         //
2909         // do we have cluster at the middle ?
2910         Double_t ym,zm;
2911         GetProlongation(x1,xm,x,ym,zm);
2912         UInt_t dummy;
2913         AliTPCclusterMI * cm=0;
2914         if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2915           cm = krm.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2916           if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {
2917             continue;
2918           }
2919         }
2920         else{
2921           // rotate y1 to system 0
2922           // get state vector in rotated system
2923           Double_t yr1  = (-0.5*sn13+y0*cs13)*dvertex*c0;
2924           Double_t xr2  =  x0*cs+yr1*sn*dsec;
2925           Double_t xr[5]={kcl->GetY(),kcl->GetZ(), xr2, dip, c0};
2926           //
2927           GetProlongation(xx2,xm,xr,ym,zm);
2928           if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2929             cm = kr2m.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2930             if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {
2931               continue;
2932             }
2933           }
2934         }
2935
2936
2937         Double_t dym = 0;
2938         Double_t dzm = 0;
2939         if (cm){
2940           dym = ym - cm->GetY();
2941           dzm = zm - cm->GetZ();
2942         }
2943         nin2++;
2944
2945
2946         //
2947         //
2948         Double_t sy1=kr1[is]->GetSigmaY2()*2., sz1=kr1[is]->GetSigmaZ2()*2.;
2949         Double_t sy2=kcl->GetSigmaY2()*2.,     sz2=kcl->GetSigmaZ2()*2.;
2950         //Double_t sy3=400*3./12., sy=0.1, sz=0.1;
2951         Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
2952         //Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]*60+0.5, sy=0.1, sz=0.1;
2953
2954         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
2955         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
2956         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
2957         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
2958         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
2959         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
2960
2961         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
2962         Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
2963         Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
2964         Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
2965
2966         c[0]=sy1;
2967         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
2968         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
2969         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
2970                        c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
2971         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
2972         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
2973         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
2974
2975         //      if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
2976
2977         UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
2978         AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, ns*alpha+shift);
2979
2980         track->fIsSeeding = kTRUE;
2981         track->fSeed1 = i1;
2982         track->fSeed2 = i2;
2983         track->fSeedType=3;
2984
2985
2986         //if (dsec==0) {
2987           FollowProlongation(*track, (i1+i2)/2,1);
2988           Int_t foundable,found,shared;
2989           track->GetClusterStatistic((i1+i2)/2,i1, found, foundable, shared, kTRUE);
2990           if ((found<0.55*foundable)  || shared>0.5*found || (track->GetSigmaY2()+track->GetSigmaZ2())>0.5){
2991             seed->Reset();
2992             seed->~AliTPCseed();
2993             continue;
2994           }
2995           //}
2996
2997         nin++;
2998         FollowProlongation(*track, i2,1);
2999
3000
3001         //Int_t rc = 1;
3002         track->fBConstrain =1;
3003         //      track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3004         track->fLastPoint = i1;  // first cluster in track position
3005         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3006
3007         if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
3008             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 ||
3009             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters() ) {
3010           seed->Reset();
3011           seed->~AliTPCseed();
3012           continue;
3013         }
3014         nout1++;
3015         // Z VERTEX CONDITION
3016         Double_t zv;
3017         zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3018           ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3019         if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]) {
3020           FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-20,0));
3021           zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3022             ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3023           if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]){
3024             FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-40,0));
3025             zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3026               ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3027             if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2] &&(track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.7)){
3028               // make seed without constrain
3029               AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,1.);
3030               FollowProlongation(*track2, i2,1);
3031               track2->fBConstrain = kFALSE;
3032               track2->fSeedType = 1;
3033               arr->AddLast(track2);
3034               seed->Reset();
3035               seed->~AliTPCseed();
3036               continue;
3037             }
3038             else{
3039               seed->Reset();
3040               seed->~AliTPCseed();
3041               continue;
3042
3043             }
3044           }
3045         }
3046
3047         track->fSeedType =0;
3048         arr->AddLast(track);
3049         seed = new AliTPCseed;
3050         nout2++;
3051         // don't consider other combinations
3052         if (track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.8)
3053           break;
3054       }
3055     }
3056   }
3057   if (fDebug>3){
3058     Info("MakeSeeds3","\nSeeding statistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2);
3059   }
3060   delete seed;
3061 }
3062
3063
3064 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
3065                                  Float_t deltay) {
3066
3067
3068
3069   //-----------------------------------------------------------------
3070   // This function creates track seeds.
3071   //-----------------------------------------------------------------
3072   // cuts[0]   - fP4 cut
3073   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3074   // cuts[2]   - zvertex cut
3075   // cuts[3]   - fP3 cut
3076
3077
3078   Int_t nin0  = 0;
3079   Int_t nin1  = 0;
3080   Int_t nin2  = 0;
3081   Int_t nin   = 0;
3082   Int_t nout1 = 0;
3083   Int_t nout2 = 0;
3084   Int_t nout3 =0;
3085   Double_t x[5], c[15];
3086   //
3087   // make temporary seed
3088   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3089   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3090   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3091   //
3092   //
3093
3094   // first 3 padrows
3095   Double_t x1 = GetXrow(i1-1);
3096   const    AliTPCRow& kr1=GetRow(sec,i1-1);
3097   Double_t y1max  = GetMaxY(i1-1)-kr1.fDeadZone-1.5;
3098   //
3099   Double_t x1p = GetXrow(i1);
3100   const    AliTPCRow& kr1p=GetRow(sec,i1);
3101   //
3102   Double_t x1m = GetXrow(i1-2);
3103   const    AliTPCRow& kr1m=GetRow(sec,i1-2);
3104
3105   //
3106   //last 3 padrow for seeding
3107   AliTPCRow&  kr3  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-7);
3108   Double_t    x3   =  GetXrow(i1-7);
3109   //  Double_t    y3max= GetMaxY(i1-7)-kr3.fDeadZone-1.5;
3110   //
3111   AliTPCRow&  kr3p  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-6);
3112   Double_t    x3p   = GetXrow(i1-6);
3113   //
3114   AliTPCRow&  kr3m  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-8);
3115   Double_t    x3m   = GetXrow(i1-8);
3116
3117   //
3118   //
3119   // middle padrow
3120   Int_t im = i1-4;                           //middle pad row index
3121   Double_t xm         = GetXrow(im);         // radius of middle pad-row
3122   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,im);   //middle pad -row
3123   //  Double_t ymmax = GetMaxY(im)-kr1.fDeadZone-1.5;
3124   //
3125   //
3126   Double_t deltax  = x1-x3;
3127   Double_t dymax   = deltax*cuts[1];
3128   Double_t dzmax   = deltax*cuts[3];
3129   //
3130   // loop over clusters
3131   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
3132     //
3133     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
3134     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();
3135     //
3136     if (deltay>0 && TMath::Abs(y1max-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3137     //
3138     Int_t  index1 = TMath::Max(kr3.Find(z1-dzmax)-1,0);
3139     Int_t  index2 = TMath::Min(kr3.Find(z1+dzmax)+1,kr3);
3140     //
3141     Double_t y3,   z3;
3142     //
3143     //
3144     UInt_t index;
3145     for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
3146       const AliTPCclusterMI *kcl = kr3[js];
3147       if (kcl->IsUsed(10)) continue;
3148       y3 = kcl->GetY();
3149       // apply angular cuts
3150       if (TMath::Abs(y1-y3)>dymax) continue;
3151       x3 = x3;
3152       z3 = kcl->GetZ();
3153       if (TMath::Abs(z1-z3)>dzmax) continue;
3154       //
3155       Double_t angley = (y1-y3)/(x1-x3);
3156       Double_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
3157       //
3158       Double_t erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3159       Double_t errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3160       //
3161       Double_t yyym = angley*(xm-x1)+y1;
3162       Double_t zzzm = anglez*(xm-x1)+z1;
3163
3164       const AliTPCclusterMI *kcm = krm.FindNearest2(yyym,zzzm,erry,errz,index);
3165       if (!kcm) continue;
3166       if (kcm->IsUsed(10)) continue;
3167
3168       erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3169       errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3170       //
3171       //
3172       //
3173       Int_t used  =0;
3174       Int_t found =0;
3175       //
3176       // look around first
3177       const AliTPCclusterMI *kc1m = kr1m.FindNearest2(angley*(x1m-x1)+y1,
3178                                                       anglez*(x1m-x1)+z1,
3179                                                       erry,errz,index);
3180       //
3181       if (kc1m){
3182         found++;
3183         if (kc1m->IsUsed(10)) used++;
3184       }
3185       const AliTPCclusterMI *kc1p = kr1p.FindNearest2(angley*(x1p-x1)+y1,
3186                                                       anglez*(x1p-x1)+z1,
3187                                                       erry,errz,index);
3188       //
3189       if (kc1p){
3190         found++;
3191         if (kc1p->IsUsed(10)) used++;
3192       }
3193       if (used>1)  continue;
3194       if (found<1) continue;
3195
3196       //
3197       // look around last
3198       const AliTPCclusterMI *kc3m = kr3m.FindNearest2(angley*(x3m-x3)+y3,
3199                                                       anglez*(x3m-x3)+z3,
3200                                                       erry,errz,index);
3201       //
3202       if (kc3m){
3203         found++;
3204         if (kc3m->IsUsed(10)) used++;
3205       }
3206       else
3207         continue;
3208       const AliTPCclusterMI *kc3p = kr3p.FindNearest2(angley*(x3p-x3)+y3,
3209                                                       anglez*(x3p-x3)+z3,
3210                                                       erry,errz,index);
3211       //
3212       if (kc3p){
3213         found++;
3214         if (kc3p->IsUsed(10)) used++;
3215       }
3216       else
3217         continue;
3218       if (used>1)  continue;
3219       if (found<3) continue;
3220       //
3221       Double_t x2,y2,z2;
3222       x2 = xm;
3223       y2 = kcm->GetY();
3224       z2 = kcm->GetZ();
3225       //
3226
3227       x[0]=y1;
3228       x[1]=z1;
3229       x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3230       //if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;
3231       nin0++;
3232       //
3233       x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3234       nin1++;
3235       //
3236       x[3]=F3n(x1,y1,x2,y2,z1,z2,x[4]);
3237       //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3238       nin2++;
3239       //
3240       //
3241       Double_t sy1=0.1,  sz1=0.1;
3242       Double_t sy2=0.1,  sz2=0.1;
3243       Double_t sy3=0.1,  sy=0.1, sz=0.1;
3244
3245       Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3246       Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3247       Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3248       Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3249       Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3250       Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3251
3252       Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
3253       Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
3254       Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
3255       Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
3256
3257       c[0]=sy1;
3258       c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3259       c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3260       c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3261       c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3262       c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3263       c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3264       c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3265
3266       //        if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
3267
3268       UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
3269       AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3270
3271       track->fIsSeeding = kTRUE;
3272
3273       nin++;
3274       FollowProlongation(*track, i1-7,1);
3275       if (track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.75 ||
3276           track->fNShared>0.6*track->GetNumberOfClusters() || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.6){
3277         seed->Reset();
3278         seed->~AliTPCseed();
3279         continue;
3280       }
3281       nout1++;
3282       nout2++;
3283       //Int_t rc = 1;
3284       FollowProlongation(*track, i2,1);
3285       track->fBConstrain =0;
3286       track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3287       track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3288
3289       if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
3290           track->GetNumberOfClusters()<track->fNFoundable*0.7 ||
3291           track->fNShared>2. || track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()>6 || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.5 ) {
3292         seed->Reset();
3293         seed->~AliTPCseed();
3294         continue;
3295       }
3296
3297       {
3298         FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-10,0),1);
3299         AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,0.9);
3300         FollowProlongation(*track2, i2,1);
3301         track2->fBConstrain = kFALSE;
3302         track2->fSeedType = 4;
3303         arr->AddLast(track2);
3304         seed->Reset();
3305         seed->~AliTPCseed();
3306       }
3307
3308
3309       //arr->AddLast(track);
3310       //seed = new AliTPCseed;
3311       nout3++;
3312     }
3313   }
3314
3315   if (fDebug>3){
3316     Info("MakeSeeds5","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2,nout3);
3317   }
3318   delete seed;
3319 }
3320
3321
3322 //_____________________________________________________________________________
3323 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds2(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2, Float_t */*cuts[4]*/,
3324                                  Float_t deltay, Bool_t /*bconstrain*/) {
3325   //-----------------------------------------------------------------
3326   // This function creates track seeds - without vertex constraint
3327   //-----------------------------------------------------------------
3328   // cuts[0]   - fP4 cut        - not applied
3329   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3330   // cuts[2]   - zvertex cut    - not applied
3331   // cuts[3]   - fP3 cut
3332   Int_t nin0=0;
3333   Int_t nin1=0;
3334   Int_t nin2=0;
3335   Int_t nin3=0;
3336   //  Int_t nin4=0;
3337   //Int_t nin5=0;
3338
3339
3340
3341   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3342   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3343   Int_t row0 = (i1+i2)/2;
3344   Int_t drow = (i1-i2)/2;
3345   const AliTPCRow& kr0=fSectors[sec][row0];
3346   AliTPCRow * kr=0;
3347
3348   AliTPCpolyTrack polytrack;
3349   Int_t nclusters=fSectors[sec][row0];
3350   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3351
3352   Int_t sumused=0;
3353   Int_t cused=0;
3354   Int_t cnused=0;
3355   for (Int_t is=0; is < nclusters; is++) {  //LOOP over clusters
3356     Int_t nfound =0;
3357     Int_t nfoundable =0;
3358     for (Int_t iter =1; iter<2; iter++){   //iterations
3359       const AliTPCRow& krm=fSectors[sec][row0-iter];
3360       const AliTPCRow& krp=fSectors[sec][row0+iter];
3361       const AliTPCclusterMI * cl= kr0[is];
3362
3363       if (cl->IsUsed(10)) {
3364         cused++;
3365       }
3366       else{
3367         cnused++;
3368       }
3369       Double_t x = kr0.GetX();
3370       // Initialization of the polytrack
3371       nfound =0;
3372       nfoundable =0;
3373       polytrack.Reset();
3374       //
3375       Double_t y0= cl->GetY();
3376       Double_t z0= cl->GetZ();
3377       Float_t erry = 0;
3378       Float_t errz = 0;
3379
3380       Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row0)-kr0.fDeadZone-1.5;
3381       if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3382
3383       erry = (0.5)*cl->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;
3384       errz = (0.5)*cl->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;
3385       polytrack.AddPoint(x,y0,z0,erry, errz);
3386
3387       sumused=0;
3388       if (cl->IsUsed(10)) sumused++;
3389
3390
3391       Float_t roady = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+0.2)+1.)*iter;
3392       Float_t roadz = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaZ2()+0.2)+1.)*iter;
3393       //
3394       x = krm.GetX();
3395       AliTPCclusterMI * cl1 = krm.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3396       if (cl1 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))) {
3397         erry = (0.5)*cl1->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3398         errz = (0.5)*cl1->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3399         if (cl1->IsUsed(10))  sumused++;
3400         polytrack.AddPoint(x,cl1->GetY(),cl1->GetZ(),erry,errz);
3401       }
3402       //
3403       x = krp.GetX();
3404       AliTPCclusterMI * cl2 = krp.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3405       if (cl2) {
3406         erry = (0.5)*cl2->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3407         errz = (0.5)*cl2->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3408         if (cl2->IsUsed(10)) sumused++;
3409         polytrack.AddPoint(x,cl2->GetY(),cl2->GetZ(),erry,errz);
3410       }
3411       //
3412       if (sumused>0) continue;
3413       nin0++;
3414       polytrack.UpdateParameters();
3415       // follow polytrack
3416       roadz = 1.2;
3417       roady = 1.2;
3418       //
3419       Double_t yn,zn;
3420       nfoundable = polytrack.GetN();
3421       nfound     = nfoundable;
3422       //
3423       for (Int_t ddrow = iter+1; ddrow<drow;ddrow++){
3424         Float_t maxdist = 0.8*(1.+3./(ddrow));
3425         for (Int_t delta = -1;delta<=1;delta+=2){
3426           Int_t row = row0+ddrow*delta;
3427           kr = &(fSectors[sec][row]);
3428           Double_t xn = kr->GetX();
3429           Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row)-kr->fDeadZone-1.5;
3430           polytrack.GetFitPoint(xn,yn,zn);
3431           if (TMath::Abs(yn)>ymax) continue;
3432           nfoundable++;
3433           AliTPCclusterMI * cln = kr->FindNearest(yn,zn,roady,roadz);
3434           if (cln) {
3435             Float_t dist =  TMath::Sqrt(  (yn-cln->GetY())*(yn-cln->GetY())+(zn-cln->GetZ())*(zn-cln->GetZ()));
3436             if (dist<maxdist){
3437               /*
3438               erry = (dist+0.3)*cln->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3439               errz = (dist+0.3)*cln->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3440               if (cln->IsUsed(10)) {
3441                 //      printf("used\n");
3442                 sumused++;
3443                 erry*=2;
3444                 errz*=2;
3445               }
3446               */
3447               erry=0.1;
3448               errz=0.1;
3449               polytrack.AddPoint(xn,cln->GetY(),cln->GetZ(),erry, errz);
3450               nfound++;
3451             }
3452           }
3453         }
3454         if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound) || (nfound<0.6*nfoundable))  break;
3455         polytrack.UpdateParameters();
3456       }
3457     }
3458     if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound))  {
3459       //printf("sumused   %d\n",sumused);
3460       continue;
3461     }
3462     nin1++;
3463     Double_t dy,dz;
3464     polytrack.GetFitDerivation(kr0.GetX(),dy,dz);
3465     AliTPCpolyTrack track2;
3466
3467     polytrack.Refit(track2,0.5+TMath::Abs(dy)*0.3,0.4+TMath::Abs(dz)*0.3);
3468     if (track2.GetN()<0.5*nfoundable) continue;
3469     nin2++;
3470
3471     if ((nfound>0.6*nfoundable) &&( nfoundable>0.4*(i1-i2))) {
3472       //
3473       // test seed with and without constrain
3474       for (Int_t constrain=0; constrain<=0;constrain++){
3475         // add polytrack candidate
3476
3477         Double_t x[5], c[15];
3478         Double_t x1,x2,x3,y1,y2,y3,z1,z2,z3;
3479         track2.GetBoundaries(x3,x1);
3480         x2 = (x1+x3)/2.;
3481         track2.GetFitPoint(x1,y1,z1);
3482         track2.GetFitPoint(x2,y2,z2);
3483         track2.GetFitPoint(x3,y3,z3);
3484         //
3485         //is track pointing to the vertex ?
3486         Double_t x0,y0,z0;
3487         x0=0;
3488         polytrack.GetFitPoint(x0,y0,z0);
3489
3490         if (constrain) {
3491           x2 = x3;
3492           y2 = y3;
3493           z2 = z3;
3494
3495           x3 = 0;
3496           y3 = 0;
3497           z3 = 0;
3498         }
3499         x[0]=y1;
3500         x[1]=z1;
3501         x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3502
3503         //      if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;  //
3504         x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3505
3506         //if (TMath::Abs(x[4]*x1-x[2]) >= cuts[1]) continue;
3507         //x[3]=F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
3508         x[3]=F3n(x1,y1,x3,y3,z1,z3,x[4]);
3509         //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3510
3511
3512         Double_t sy =0.1, sz =0.1;
3513         Double_t sy1=0.02, sz1=0.02;
3514         Double_t sy2=0.02, sz2=0.02;
3515         Double_t sy3=0.02;
3516
3517         if (constrain){
3518           sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
3519         }
3520
3521         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3522         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3523         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3524         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3525         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3526         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3527
3528         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x3,y3,z1,z3)-x[3])/sy;
3529         Double_t f31=(F3(x1,y1,x3,y3,z1+sz,z3)-x[3])/sz;
3530         Double_t f32=(F3(x1,y1,x3,y3+sy,z1,z3)-x[3])/sy;
3531         Double_t f34=(F3(x1,y1,x3,y3,z1,z3+sz)-x[3])/sz;
3532
3533
3534         c[0]=sy1;
3535         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3536         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3537         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3538         c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3539         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3540         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3541         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3542
3543         //Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x1);
3544         Int_t row1 = GetRowNumber(x1);
3545
3546         UInt_t index=0;
3547         //kr0.GetIndex(is);
3548         AliTPCseed *track=new (seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3549         track->fIsSeeding = kTRUE;
3550         Int_t rc=FollowProlongation(*track, i2);
3551         if (constrain) track->fBConstrain =1;
3552         else
3553           track->fBConstrain =0;
3554         track->fLastPoint = row1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3555         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3556
3557         if (rc==0 || track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
3558             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 ||
3559             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters()) {
3560           //delete track;
3561           seed->Reset();
3562           seed->~AliTPCseed();
3563         }
3564         else {
3565           arr->AddLast(track);
3566           seed = new AliTPCseed;
3567         }
3568         nin3++;
3569       }
3570     }  // if accepted seed
3571   }
3572   if (fDebug>3){
3573     Info("MakeSeeds2","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin3);
3574   }
3575   delete seed;
3576 }
3577
3578
3579 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::MakeSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3580 {
3581   //
3582   //
3583   //reseed using track points
3584   Int_t p0 = int(r0*track->GetNumberOfClusters());     // point 0
3585   Int_t p1 = int(r1*track->GetNumberOfClusters());
3586   Int_t p2 = int(r2*track->GetNumberOfClusters());   // last point
3587   Int_t pp2=0;
3588   Double_t  x0[3],x1[3],x2[3];
3589   for (Int_t i=0;i<3;i++){
3590     x0[i]=-1;
3591     x1[i]=-1;
3592     x2[i]=-1;
3593   }
3594
3595   // find track position at given ratio of the length
3596   Int_t  sec0=0, sec1=0, sec2=0;
3597   Int_t index=-1;
3598   Int_t clindex;
3599   for (Int_t i=0;i<160;i++){
3600     if (track->fClusterPointer[i]){
3601       index++;
3602       AliTPCTrackerPoint   *trpoint =track->GetTrackPoint(i);
3603       if ( (index<p0) || x0[0]<0 ){
3604         if (trpoint->GetX()>1){
3605           clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3606           if (clindex>0){
3607             x0[0] = trpoint->GetX();
3608             x0[1] = trpoint->GetY();
3609             x0[2] = trpoint->GetZ();
3610             sec0  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3611           }
3612         }
3613       }
3614
3615       if ( (index<p1) &&(trpoint->GetX()>1)){
3616         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3617         if (clindex>0){
3618           x1[0] = trpoint->GetX();
3619           x1[1] = trpoint->GetY();
3620           x1[2] = trpoint->GetZ();
3621           sec1  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3622         }
3623       }
3624       if ( (index<p2) &&(trpoint->GetX()>1)){
3625         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3626         if (clindex>0){
3627           x2[0] = trpoint->GetX();
3628           x2[1] = trpoint->GetY();
3629           x2[2] = trpoint->GetZ();
3630           sec2  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3631           pp2 = i;
3632         }
3633       }
3634     }
3635   }
3636
3637   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3638   //
3639   alpha = (sec1-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3640   cs = TMath::Cos(alpha);
3641   sn = TMath::Sin(alpha);
3642   xx2= x1[0]*cs-x1[1]*sn;
3643   yy2= x1[0]*sn+x1[1]*cs;
3644   x1[0] = xx2;
3645   x1[1] = yy2;
3646   //
3647   alpha = (sec0-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3648   cs = TMath::Cos(alpha);
3649   sn = TMath::Sin(alpha);
3650   xx2= x0[0]*cs-x0[1]*sn;
3651   yy2= x0[0]*sn+x0[1]*cs;
3652   x0[0] = xx2;
3653   x0[1] = yy2;
3654   //
3655   //
3656   //
3657   Double_t x[5],c[15];
3658   //
3659   x[0]=x2[1];
3660   x[1]=x2[2];
3661   x[4]=F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3662   //  if (x[4]>1) return 0;
3663   x[2]=F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3664   x[3]=F3n(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2],x[4]);
3665   //if (TMath::Abs(x[3]) > 2.2)  return 0;
3666   //if (TMath::Abs(x[2]) > 1.99) return 0;
3667   //
3668   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3669   //
3670   Double_t sy1=0.02+track->GetSigmaY2(), sz1=0.02+track->GetSigmaZ2();
3671   Double_t sy2=0.01+track->GetSigmaY2(), sz2=0.01+track->GetSigmaZ2();
3672   Double_t sy3=0.01+track->GetSigmaY2();
3673   //
3674   Double_t f40=(F1(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3675   Double_t f42=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3676   Double_t f43=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[4])/sy;
3677   Double_t f20=(F2(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3678   Double_t f22=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3679   Double_t f23=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[2])/sy;
3680   //
3681   Double_t f30=(F3(x2[0],x2[1]+sy,x0[0],x0[1],x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3682   Double_t f31=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2]+sz,x0[2])-x[3])/sz;
3683   Double_t f32=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1]+sy,x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3684   Double_t f34=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2]+sz)-x[3])/sz;
3685
3686
3687   c[0]=sy1;
3688   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3689   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3690   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3691   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3692   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3693   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3694   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3695
3696   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x2[0]);
3697   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, x2[0], sec2*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3698   //  Double_t y0,z0,y1,z1, y2,z2;
3699   //seed->GetProlongation(x0[0],y0,z0);
3700   // seed->GetProlongation(x1[0],y1,z1);
3701   //seed->GetProlongation(x2[0],y2,z2);
3702   //  seed =0;
3703   seed->fLastPoint  = pp2;
3704   seed->fFirstPoint = pp2;
3705
3706
3707   return seed;
3708 }
3709
3710
3711 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3712 {
3713   //
3714   //
3715   //reseed using founded clusters
3716   //
3717   // Find the number of clusters
3718   Int_t nclusters = 0;
3719   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
3720     if (track->GetClusterIndex(irow)>0) nclusters++;
3721   }
3722   //
3723   Int_t ipos[3];
3724   ipos[0] = TMath::Max(int(r0*nclusters),0);             // point 0 cluster
3725   ipos[1] = TMath::Min(int(r1*nclusters),nclusters-1);   //
3726   ipos[2] = TMath::Min(int(r2*nclusters),nclusters-1);   // last point
3727   //
3728   //
3729   Double_t  xyz[3][3];
3730   Int_t     row[3],sec[3]={0,0,0};
3731   //
3732   // find track row position at given ratio of the length
3733   Int_t index=-1;
3734   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
3735     if (track->GetClusterIndex2(irow)<0) continue;
3736     index++;
3737     for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3738       if (index<=ipos[ipoint]) row[ipoint] = irow;
3739     }
3740   }
3741   //
3742   //Get cluster and sector position
3743   for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3744     Int_t clindex = track->GetClusterIndex2(row[ipoint]);
3745     AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3746     if (cl==0) {
3747       //Error("Bug\n");
3748       //      AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3749       return 0;
3750     }
3751     sec[ipoint]     = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3752     xyz[ipoint][0]  = GetXrow(row[ipoint]);
3753     xyz[ipoint][1]  = cl->GetY();
3754     xyz[ipoint][2]  = cl->GetZ();
3755   }
3756   //
3757   //
3758   // Calculate seed state vector and covariance matrix
3759
3760   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3761   //
3762   alpha = (sec[1]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3763   cs = TMath::Cos(alpha);
3764   sn = TMath::Sin(alpha);
3765   xx2= xyz[1][0]*cs-xyz[1][1]*sn;
3766   yy2= xyz[1][0]*sn+xyz[1][1]*cs;
3767   xyz[1][0] = xx2;
3768   xyz[1][1] = yy2;
3769   //
3770   alpha = (sec[0]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3771   cs = TMath::Cos(alpha);
3772   sn = TMath::Sin(alpha);
3773   xx2= xyz[0][0]*cs-xyz[0][1]*sn;
3774   yy2= xyz[0][0]*sn+xyz[0][1]*cs;
3775   xyz[0][0] = xx2;
3776   xyz[0][1] = yy2;
3777   //
3778   //
3779   //
3780   Double_t x[5],c[15];
3781   //
3782   x[0]=xyz[2][1];
3783   x[1]=xyz[2][2];
3784   x[4]=F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3785   x[2]=F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3786   x[3]=F3n(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2],x[4]);
3787   //
3788   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3789   //
3790   Double_t sy1=0.2, sz1=0.2;
3791   Double_t sy2=0.2, sz2=0.2;
3792   Double_t sy3=0.2;
3793   //
3794   Double_t f40=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3795   Double_t f42=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3796   Double_t f43=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[4])/sy;
3797   Double_t f20=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3798   Double_t f22=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3799   Double_t f23=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[2])/sy;
3800   //
3801   Double_t f30=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3802   Double_t f31=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2]+sz,xyz[0][2])-x[3])/sz;
3803   Double_t f32=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy,xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3804   Double_t f34=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2]+sz)-x[3])/sz;
3805
3806
3807   c[0]=sy1;
3808   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3809   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3810   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3811   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3812   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3813   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3814   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3815
3816   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(xyz[2][0]);
3817   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, xyz[2][0], sec[2]*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3818   seed->fLastPoint  = row[2];
3819   seed->fFirstPoint = row[2];
3820   return seed;
3821 }
3822
3823
3824 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *track,Int_t r0, Bool_t forward)
3825 {
3826   //
3827   //
3828   //reseed using founded clusters
3829   //
3830   Double_t  xyz[3][3];
3831   Int_t     row[3]={0,0,0};
3832   Int_t     sec[3]={0,0,0};
3833   //
3834   // forward direction
3835   if (forward){
3836     for (Int_t irow=r0;irow<160;irow++){
3837       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3838         row[0] = irow;
3839         break;
3840       }
3841     }
3842     for (Int_t irow=160;irow>r0;irow--){
3843       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3844         row[2] = irow;
3845         break;
3846       }
3847     }
3848     for (Int_t irow=row[2]-15;irow>row[0];irow--){
3849       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3850         row[1] = irow;
3851         break;
3852       }
3853     }
3854     //
3855   }
3856   if (!forward){
3857     for (Int_t irow=0;irow<r0;irow++){
3858       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3859         row[0] = irow;
3860         break;
3861       }
3862     }
3863     for (Int_t irow=r0;irow>0;irow--){
3864       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3865         row[2] = irow;
3866         break;
3867       }
3868     }
3869     for (Int_t irow=row[2]-15;irow>row[0];irow--){
3870       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3871         row[1] = irow;
3872         break;
3873       }
3874     }
3875   }
3876   //
3877   if ((row[2]-row[0])<20) return 0;
3878   if (row[1]==0) return 0;
3879   //
3880   //
3881   //Get cluster and sector position
3882   for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3883     Int_t clindex = track->GetClusterIndex2(row[ipoint]);
3884     AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3885     if (cl==0) {
3886       //Error("Bug\n");
3887       //      AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3888       return 0;
3889     }
3890     sec[ipoint]     = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3891     xyz[ipoint][0]  = GetXrow(row[ipoint]);
3892     AliTPCTrackerPoint * point = track->GetTrackPoint(row[ipoint]);
3893     if (point&&ipoint<2){
3894       //
3895        xyz[ipoint][1]  = point->GetY();
3896        xyz[ipoint][2]  = point->GetZ();
3897     }
3898     else{
3899       xyz[ipoint][1]  = cl->GetY();
3900       xyz[ipoint][2]  = cl->GetZ();
3901     }
3902   }
3903   //
3904   //
3905   //
3906   //
3907   // Calculate seed state vector and covariance matrix
3908
3909   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3910   //
3911   alpha = (sec[1]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3912   cs = TMath::Cos(alpha);
3913   sn = TMath::Sin(alpha);
3914   xx2= xyz[1][0]*cs-xyz[1][1]*sn;
3915   yy2= xyz[1][0]*sn+xyz[1][1]*cs;
3916   xyz[1][0] = xx2;
3917   xyz[1][1] = yy2;
3918   //
3919   alpha = (sec[0]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3920   cs = TMath::Cos(alpha);
3921   sn = TMath::Sin(alpha);
3922   xx2= xyz[0][0]*cs-xyz[0][1]*sn;
3923   yy2= xyz[0][0]*sn+xyz[0][1]*cs;
3924   xyz[0][0] = xx2;
3925   xyz[0][1] = yy2;
3926   //
3927   //
3928   //
3929   Double_t x[5],c[15];
3930   //
3931   x[0]=xyz[2][1];
3932   x[1]=xyz[2][2];
3933   x[4]=F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3934   x[2]=F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3935   x[3]=F3n(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2],x[4]);
3936   //
3937   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3938   //
3939   Double_t sy1=0.2, sz1=0.2;
3940   Double_t sy2=0.2, sz2=0.2;
3941   Double_t sy3=0.2;
3942   //
3943   Double_t f40=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3944   Double_t f42=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3945   Double_t f43=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[4])/sy;
3946   Double_t f20=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3947   Double_t f22=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3948   Double_t f23=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[2])/sy;
3949   //
3950   Double_t f30=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3951   Double_t f31=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2]+sz,xyz[0][2])-x[3])/sz;
3952   Double_t f32=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy,xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3953   Double_t f34=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2]+sz)-x[3])/sz;
3954
3955
3956   c[0]=sy1;
3957   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3958   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3959   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3960   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3961   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3962   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3963   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3964
3965   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(xyz[2][0]);
3966   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, xyz[2][0], sec[2]*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3967   seed->fLastPoint  = row[2];
3968   seed->fFirstPoint = row[2];
3969   for (Int_t i=row[0];i<row[2];i++){
3970     seed->fIndex[i] = track->fIndex[i];
3971   }
3972
3973   return seed;
3974 }
3975
3976 void  AliTPCtrackerMI::FindKinks(TObjArray * array, AliESD *esd)
3977 {
3978   //
3979   //  find kinks
3980   //
3981   //
3982
3983   TObjArray *kinks= new TObjArray(10000);
3984   //  TObjArray *v0s= new TObjArray(10000);
3985   Int_t nentries = array->GetEntriesFast();
3986   AliHelix *helixes      = new AliHelix[nentries];
3987   Int_t    *sign         = new Int_t[nentries];
3988   Int_t    *nclusters    = new Int_t[nentries];
3989   Float_t  *alpha        = new Float_t[nentries];
3990   AliESDkink * kink      = new AliESDkink();
3991   Int_t      * usage     = new Int_t[nentries];
3992   Float_t  *zm           = new Float_t[nentries];
3993   Float_t  *z0           = new Float_t[nentries];
3994   Float_t  *fim          = new Float_t[nentries];
3995   Float_t  *shared       = new Float_t[nentries];
3996   Bool_t   *circular     = new Bool_t[nentries];
3997   Float_t *dca          = new Float_t[nentries];
3998   //const AliESDVertex * primvertex = esd->GetVertex();
3999   //
4000   //  nentries = array->GetEntriesFast();
4001   //
4002
4003   //
4004   //
4005   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4006     sign[i]=0;
4007     usage[i]=0;
4008     AliTPCseed* track = (AliTPCseed*)array->At(i);
4009     if (!track) continue;
4010     track->fCircular =0;
4011     shared[i] = kFALSE;
4012     track->UpdatePoints();
4013     if (( track->GetPoints()[2]- track->GetPoints()[0])>5 && track->GetPoints()[3]>0.8){
4014     }
4015     nclusters[i]=track->GetNumberOfClusters();
4016     alpha[i] = track->GetAlpha();
4017     new (&helixes[i]) AliHelix(*track);
4018     Double_t xyz[3];
4019     helixes[i].Evaluate(0,xyz);
4020     sign[i] = (track->GetC()>0) ? -1:1;
4021     Double_t x,y,z;
4022     x=160;
4023     if (track->GetProlongation(x,y,z)){
4024       zm[i]  = z;
4025       fim[i] = alpha[i]+TMath::ATan2(y,x);
4026     }
4027     else{
4028       zm[i]  = track->GetZ();
4029       fim[i] = alpha[i];
4030     }
4031     z0[i]=1000;
4032     circular[i]= kFALSE;
4033     if (track->GetProlongation(0,y,z))  z0[i] = z;
4034     dca[i] = track->GetD(0,0);
4035   }
4036   //
4037   //
4038   TStopwatch timer;
4039   timer.Start();
4040   Int_t ncandidates =0;
4041   Int_t nall =0;
4042   Int_t ntracks=0;
4043   Double_t phase[2][2],radius[2];
4044
4045   //
4046   // Find circling track
4047   TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
4048   //
4049   for (Int_t i0=0;i0<nentries;i0++){
4050     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i0);
4051     if (!track0) continue;
4052     if (track0->fN<40) continue;
4053     if (TMath::Abs(1./track0->fP4)>200) continue;
4054     for (Int_t i1=i0+1;i1<nentries;i1++){
4055       AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(i1);
4056       if (!track1) continue;
4057       if (track1->fN<40)                  continue;
4058       if ( TMath::Abs(track1->fP3+track0->fP3)>0.1) continue;
4059       if (track0->fBConstrain&&track1->fBConstrain) continue;
4060       if (TMath::Abs(1./track1->fP4)>200) continue;
4061       if (track1->fP4*track0->fP4>0)      continue;
4062       if (track1->fP3*track0->fP3>0)      continue;
4063       if (max(TMath::Abs(1./track0->fP4),TMath::Abs(1./track1->fP4))>190) continue;
4064       if (track0->fBConstrain&&TMath::Abs(track1->fP4)<TMath::Abs(track0->fP4)) continue; //returning - lower momenta
4065       if (track1->fBConstrain&&TMath::Abs(track0->fP4)<TMath::Abs(track1->fP4)) continue; //returning - lower momenta
4066       //
4067       Float_t mindcar = TMath::Min(TMath::Abs(dca[i0]),TMath::Abs(dca[i1]));
4068       if (mindcar<5)   continue;
4069       Float_t mindcaz = TMath::Min(TMath::Abs(z0[i0]-GetZ()),TMath::Abs(z0[i1]-GetZ()));
4070       if (mindcaz<5) continue;
4071       if (mindcar+mindcaz<20) continue;
4072       //
4073       //
4074       Float_t xc0 = helixes[i0].GetHelix(6);
4075       Float_t yc0 = helixes[i0].GetHelix(7);
4076       Float_t r0  = helixes[i0].GetHelix(8);
4077       Float_t xc1 = helixes[i1].GetHelix(6);
4078       Float_t yc1 = helixes[i1].GetHelix(7);
4079       Float_t r1  = helixes[i1].GetHelix(8);
4080
4081       Float_t rmean = (r0+r1)*0.5;
4082       Float_t delta =TMath::Sqrt((xc1-xc0)*(xc1-xc0)+(yc1-yc0)*(yc1-yc0));
4083       //if (delta>30) continue;
4084       if (delta>rmean*0.25) continue;
4085       if (TMath::Abs(r0-r1)/rmean>0.3) continue;
4086       //
4087       Int_t npoints = helixes[i0].GetRPHIintersections(helixes[i1], phase, radius,10);
4088       if (npoints==0) continue;
4089       helixes[i0].GetClosestPhases(helixes[i1], phase);
4090       //
4091       Double_t xyz0[3];
4092       Double_t xyz1[3];
4093       Double_t hangles[3];
4094       helixes[i0].Evaluate(phase[0][0],xyz0);
4095       helixes[i1].Evaluate(phase[0][1],xyz1);
4096
4097       helixes[i0].GetAngle(phase[0][0],helixes[i1],phase[0][1],hangles);
4098       Double_t deltah[2],deltabest;
4099       if (hangles[2]<2.8) continue;
4100       /*
4101       cstream<<"C"<<track0->fLab<<track1->fLab<<
4102         track0->fP3<<track1->fP3<<
4103         track0->fP4<<track1->fP4<<
4104         delta<<rmean<<npoints<<
4105         hangles[0]<<hangles[2]<<
4106         xyz0[2]<<xyz1[2]<<radius[0]<<"\n";
4107       */
4108       if (npoints>0){
4109         Int_t ibest=0;
4110         helixes[i0].ParabolicDCA(helixes[i1],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],deltah[0],2);
4111         if (npoints==2){
4112           helixes[i0].ParabolicDCA(helixes[i1],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],deltah[1],2);
4113           if (deltah[1]<deltah[0]) ibest=1;
4114         }
4115         deltabest  = TMath::Sqrt(deltah[ibest]);
4116         helixes[i0].Evaluate(phase[ibest][0],xyz0);
4117         helixes[i1].Evaluate(phase[ibest][1],xyz1);
4118         helixes[i0].GetAngle(phase[ibest][0],helixes[i1],phase[ibest][1],hangles);
4119         Double_t radiusbest = TMath::Sqrt(radius[ibest]);
4120         //
4121         if (deltabest>6) continue;
4122         if (mindcar+mindcaz<40 && (hangles[2]<3.12||deltabest>3)) continue;
4123         Bool_t sign =kFALSE;
4124         if (hangles[2]>3.06) sign =kTRUE;
4125         //
4126         if (sign){
4127           circular[i0] = kTRUE;
4128           circular[i1] = kTRUE;
4129           if (TMath::Abs(track0->fP4)<TMath::Abs(track1->fP4)){
4130             track0->fCircular += 1;
4131             track1->fCircular += 2;
4132           }
4133           else{
4134             track1->fCircular += 1;
4135             track0->fCircular += 2;
4136           }
4137         }
4138         if (sign&&0){
4139           //debug stream
4140           cstream<<"Curling"<<
4141             "lab0="<<track0->fLab<<
4142             "lab1="<<track1->fLab<<
4143             "Tr0.="<<track0<<
4144             "Tr1.="<<track1<<
4145             "dca0="<<dca[i0]<<
4146             "dca1="<<dca[i1]<<
4147             "mindcar="<<mindcar<<
4148             "mindcaz="<<mindcaz<<
4149             "delta="<<delta<<
4150             "rmean="<<rmean<<
4151             "npoints="<<npoints<<
4152             "hangles0="<<hangles[0]<<
4153             "hangles2="<<hangles[2]<<
4154             "xyz0="<<xyz0[2]<<
4155             "xyzz1="<<xyz1[2]<<
4156             "z0="<<z0[i0]<<
4157             "z1="<<z0[i1]<<
4158             "radius="<<radiusbest<<
4159             "deltabest="<<deltabest<<
4160             "phase0="<<phase[ibest][0]<<
4161             "phase1="<<phase[ibest][1]<<
4162             "\n";
4163         }
4164       }
4165     }
4166   }
4167   //
4168   //  Finf kinks loop
4169   //
4170   //
4171   for (Int_t i =0;i<nentries;i++){
4172     if (sign[i]==0) continue;
4173     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4174     ntracks++;
4175     //
4176     Double_t cradius0 = 40*40;
4177     Double_t cradius1 = 270*270;
4178     Double_t cdist1=8.;
4179     Double_t cdist2=8.;
4180     Double_t cdist3=0.55;
4181     for (Int_t j =i+1;j<nentries;j++){
4182       nall++;
4183       if (sign[j]*sign[i]<1) continue;
4184       if ( (nclusters[i]+nclusters[j])>200) continue;
4185       if ( (nclusters[i]+nclusters[j])<80) continue;
4186       if ( TMath::Abs(zm[i]-zm[j])>60.) continue;
4187       if ( TMath::Abs(fim[i]-fim[j])>0.6 && TMath::Abs(fim[i]-fim[j])<5.7 ) continue;
4188       //AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(j);  Double_t phase[2][2],radius[2];
4189       Int_t npoints = helixes[i].GetRPHIintersections(helixes[j], phase, radius,20);
4190       if (npoints<1) continue;
4191       // cuts on radius
4192       if (npoints==1){
4193         if (radius[0]<cradius0||radius[0]>cradius1) continue;
4194       }
4195       else{
4196         if ( (radius[0]<cradius0||radius[0]>cradius1) && (radius[1]<cradius0||radius[1]>cradius1) ) continue;
4197       }
4198       //
4199       Double_t delta1=10000,delta2=10000;
4200       // cuts on the intersection radius
4201       helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
4202       if (radius[0]<20&&delta1<1) continue; //intersection at vertex
4203       if (radius[0]<10&&delta1<3) continue; //intersection at vertex
4204       if (npoints==2){
4205         helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
4206         if (radius[1]<20&&delta2<1) continue;  //intersection at vertex
4207         if (radius[1]<10&&delta2<3) continue;  //intersection at vertex
4208       }
4209       //
4210       Double_t distance1 = TMath::Min(delta1,delta2);
4211       if (distance1>cdist1) continue;  // cut on DCA linear approximation
4212       //
4213       npoints = helixes[i].GetRPHIintersections(helixes[j], phase, radius,20);
4214       helixes[i].ParabolicDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
4215       if (radius[0]<20&&delta1<1) continue; //intersection at vertex
4216       if (radius[0]<10&&delta1<3) continue; //intersection at vertex
4217       //
4218       if (npoints==2){
4219         helixes[i].ParabolicDCA(helixes[j],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
4220         if (radius[1]<20&&delta2<1) continue;  //intersection at vertex
4221         if (radius[1]<10&&delta2<3) continue;  //intersection at vertex
4222       }
4223       distance1 = TMath::Min(delta1,delta2);
4224       Float_t rkink =0;
4225       if (delta1<delta2){
4226         rkink = TMath::Sqrt(radius[0]);
4227       }
4228       else{
4229         rkink = TMath::Sqrt(radius[1]);
4230       }
4231       if (distance1>cdist2) continue;
4232       //
4233       //
4234       AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(j);
4235       //
4236       //
4237       Int_t row0 = GetRowNumber(rkink);
4238       if (row0<10)  continue;
4239       if (row0>150) continue;
4240       //
4241       //
4242       Float_t dens00=-1,dens01=-1;
4243       Float_t dens10=-1,dens11=-1;
4244       //
4245       Int_t found,foundable,shared;
4246       track0->GetClusterStatistic(0,row0-5, found, foundable,shared,kFALSE);
4247       if (foundable>5) dens00 = Float_t(found)/Float_t(foundable);
4248       track0->GetClusterStatistic(row0+5,155, found, foundable,shared,kFALSE);
4249       if (foundable>5) dens01 = Float_t(found)/Float_t(foundable);
4250       //
4251       track1->GetClusterStatistic(0,row0-5, found, foundable,shared,kFALSE);
4252       if (foundable>10) dens10 = Float_t(found)/Float_t(foundable);
4253       track1->GetClusterStatistic(row0+5,155, found, foundable,shared,kFALSE);
4254       if (foundable>10) dens11 = Float_t(found)/Float_t(foundable);
4255       //
4256       if (dens00<dens10 && dens01<dens11) continue;
4257       if (dens00>dens10 && dens01>dens11) continue;
4258       if (TMath::Max(dens00,dens10)<0.1)  continue;
4259       if (TMath::Max(dens01,dens11)<0.3)  continue;
4260       //
4261       if (TMath::Min(dens00,dens10)>0.6)  continue;
4262       if (TMath::Min(dens01,dens11)>0.6)  continue;
4263
4264       //
4265       AliTPCseed * ktrack0, *ktrack1;
4266       if (dens00>dens10){
4267         ktrack0 = track0;
4268         ktrack1 = track1;
4269       }
4270       else{
4271         ktrack0 = track1;
4272         ktrack1 = track0;
4273       }
4274       if (TMath::Abs(ktrack0->GetC())>5) continue; // cut on the curvature for mother particle
4275       AliExternalTrackParam paramm(*ktrack0);
4276       AliExternalTrackParam paramd(*ktrack1);
4277       if (row0>60&&ktrack1->GetReference().GetX()>90.) new (&paramd) AliExternalTrackParam(ktrack1->GetReference());
4278       //
4279       //
4280       kink->SetMother(paramm);
4281       kink->SetDaughter(paramd);
4282       kink->Update();
4283
4284       Float_t x[3] = { kink->GetPosition()[0],kink->GetPosition()[1],kink->GetPosition()[2]};
4285       Int_t index[4];
4286       fParam->Transform0to1(x,index);
4287       fParam->Transform1to2(x,index);
4288       row0 = GetRowNumber(x[0]);
4289
4290       if (kink->GetR()<100) continue;
4291       if (kink->GetR()>240) continue;
4292       if (kink->GetPosition()[2]/kink->GetR()>AliTPCReconstructor::GetCtgRange()) continue;  //out of fiducial volume
4293       if (kink->GetDistance()>cdist3) continue;
4294       Float_t dird = kink->GetDaughterP()[0]*kink->GetPosition()[0]+kink->GetDaughterP()[1]*kink->GetPosition()[1];  // rough direction estimate
4295       if (dird<0) continue;
4296
4297       Float_t dirm = kink->GetMotherP()[0]*kink->GetPosition()[0]+kink->GetMotherP()[1]*kink->GetPosition()[1];  // rough direction estimate
4298       if (dirm<0) continue;
4299       Float_t mpt = TMath::Sqrt(kink->GetMotherP()[0]*kink->GetMotherP()[0]+kink->GetMotherP()[1]*kink->GetMotherP()[1]);
4300       if (mpt<0.2) continue;
4301
4302       if (mpt<1){
4303         //for high momenta momentum not defined well in first iteration
4304         Double_t qt   =  TMath::Sin(kink->GetAngle(2))*ktrack1->P();
4305         if (qt>0.35) continue;
4306       }
4307
4308       kink->SetLabel(CookLabel(ktrack0,0.4,0,row0),0);
4309       kink->SetLabel(CookLabel(ktrack1,0.4,row0,160),1);
4310       if (dens00>dens10){
4311         kink->SetTPCDensity(dens00,0,0);
4312         kink->SetTPCDensity(dens01,0,1);
4313         kink->SetTPCDensity(dens10,1,0);
4314         kink->SetTPCDensity(dens11,1,1);
4315         kink->SetIndex(i,0);
4316         kink->SetIndex(j,1);
4317       }
4318       else{
4319         kink->SetTPCDensity(dens10,0,0);
4320         kink->SetTPCDensity(dens11,0,1);
4321         kink->SetTPCDensity(dens00,1,0);
4322         kink->SetTPCDensity(dens01,1,1);
4323         kink->SetIndex(j,0);
4324         kink->SetIndex(i,1);
4325       }
4326
4327       if (mpt<1||kink->GetAngle(2)>0.1){
4328         //      angle and densities  not defined yet
4329         if (kink->GetTPCDensityFactor()<0.8) continue;
4330         if ((2-kink->GetTPCDensityFactor())*kink->GetDistance() >0.25) continue;
4331         if (kink->GetAngle(2)*ktrack0->P()<0.003) continue; //too small angle
4332         if (kink->GetAngle(2)>0.2&&kink->GetTPCDensityFactor()<1.15) continue;
4333         if (kink->GetAngle(2)>0.2&&kink->GetTPCDensity(0,1)>0.05) continue;
4334
4335         Float_t criticalangle = track0->fC22+track0->fC33;
4336         criticalangle+= track1->fC22+track1->fC33;
4337         criticalangle= 3*TMath::Sqrt(criticalangle);
4338         if (criticalangle>0.02) criticalangle=0.02;
4339         if (kink->GetAngle(2)<criticalangle) continue;
4340       }
4341       //
4342       Int_t drow = Int_t(2.+0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));  // overlap region defined
4343       Float_t shapesum =0;
4344       Float_t sum = 0;
4345       for ( Int_t row = row0-drow; row<row0+drow;row++){
4346         if (row<0) continue;
4347         if (row>155) continue;
4348         if (ktrack0->fClusterPointer[row]){
4349           AliTPCTrackerPoint *point =ktrack0->GetTrackPoint(row);
4350           shapesum+=point->GetSigmaY()+point->GetSigmaZ();
4351           sum++;
4352         }
4353         if (ktrack1->fClusterPointer[row]){
4354           AliTPCTrackerPoint *point =ktrack1->GetTrackPoint(row);
4355           shapesum+=point->GetSigmaY()+point->GetSigmaZ();
4356           sum++;
4357         }
4358       }
4359       if (sum<4){
4360         kink->SetShapeFactor(-1.);
4361       }
4362       else{
4363         kink->SetShapeFactor(shapesum/sum);
4364       }
4365       //      esd->AddKink(kink);
4366       kinks->AddLast(kink);
4367       kink = new AliESDkink;
4368       ncandidates++;
4369     }
4370   }
4371   //
4372   // sort the kinks according quality - and refit them towards vertex
4373   //
4374   Int_t       nkinks    = kinks->GetEntriesFast();
4375   Float_t    *quality   = new Float_t[nkinks];
4376   Int_t      *indexes   = new Int_t[nkinks];
4377   AliTPCseed *mothers   = new AliTPCseed[nkinks];
4378   AliTPCseed *daughters = new AliTPCseed[nkinks];
4379   //
4380   //
4381   for (Int_t i=0;i<nkinks;i++){
4382     quality[i] =100000;
4383     AliESDkink *kink = (AliESDkink*)kinks->At(i);
4384     //
4385     // refit kinks towards vertex
4386     //
4387     Int_t index0 = kink->GetIndex(0);
4388     Int_t index1 = kink->GetIndex(1);
4389     AliTPCseed * ktrack0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
4390     AliTPCseed * ktrack1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
4391     //
4392     Int_t sumn=ktrack0->fN+ktrack1->fN;
4393     //
4394     // Refit Kink under if too small angle
4395     //
4396     if (kink->GetAngle(2)<0.05){
4397       kink->SetTPCRow0(GetRowNumber(kink->GetR()));
4398       Int_t row0 = kink->GetTPCRow0();
4399       Int_t drow = Int_t(2.+0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
4400       //
4401       //
4402       Int_t last  = row0-drow;
4403       if (last<40) last=40;
4404       if (last<ktrack0->fFirstPoint+25) last = ktrack0->fFirstPoint+25;
4405       AliTPCseed* seed0 = ReSeed(ktrack0,last,kFALSE);
4406       //
4407       //
4408       Int_t first = row0+drow;
4409       if (first>130) first=130;
4410       if (first>ktrack1->fLastPoint-25) first = TMath::Max(ktrack1->fLastPoint-25,30);
4411       AliTPCseed* seed1 = ReSeed(ktrack1,first,kTRUE);
4412       //
4413       if (seed0 && seed1){
4414         kink->SetStatus(1,8);
4415         if (RefitKink(*seed0,*seed1,*kink)) kink->SetStatus(1,9);
4416         row0 = GetRowNumber(kink->GetR());
4417         sumn = seed0->fN+seed1->fN;
4418         new (&mothers[i])   AliTPCseed(*seed0);
4419         new (&daughters[i]) AliTPCseed(*seed1);
4420       }
4421       else{
4422         delete kinks->RemoveAt(i);
4423         if (seed0) delete seed0;
4424         if (seed1) delete seed1;
4425         continue;
4426       }
4427       if (kink->GetDistance()>0.5 || kink->GetR()<110 || kink->GetR()>240) {
4428         delete kinks->RemoveAt(i);
4429         if (seed0) delete seed0;
4430         if (seed1) delete seed1;
4431         continue;
4432       }
4433       //
4434       delete seed0;
4435       delete seed1;
4436     }
4437     //
4438     if (kink) quality[i] = 160*((0.1+kink->GetDistance())*(2.-kink->GetTPCDensityFactor()))/(sumn+40.);  //the longest -clossest will win
4439   }
4440   TMath::Sort(nkinks,quality,indexes,kFALSE);
4441   //
4442   //remove double find kinks
4443   //
4444   for (Int_t ikink0=1;ikink0<nkinks;ikink0++){
4445     AliESDkink * kink0 = (AliESDkink*) kinks->At(indexes[ikink0]);
4446     if (!kink0) continue;
4447     //
4448     for (Int_t ikink1=0;ikink1<ikink0;ikink1++){
4449       if (!kink0) continue;
4450       AliESDkink * kink1 = (AliESDkink*) kinks->At(indexes[ikink1]);
4451       if (!kink1) continue;
4452       // if not close kink continue
4453       if (TMath::Abs(kink1->GetPosition()[2]-kink0->GetPosition()[2])>10) continue;
4454       if (TMath::Abs(kink1->GetPosition()[1]-kink0->GetPosition()[1])>10) continue;
4455       if (TMath::Abs(kink1->GetPosition()[0]-kink0->GetPosition()[0])>10) continue;
4456       //
4457       AliTPCseed &mother0   = mothers[indexes[ikink0]];
4458       AliTPCseed &daughter0 = daughters[indexes[ikink0]];
4459       AliTPCseed &mother1   = mothers[indexes[ikink1]];
4460       AliTPCseed &daughter1 = daughters[indexes[ikink1]];
4461       Int_t row0 = (kink0->GetTPCRow0()+kink1->GetTPCRow0())/2;
4462       //
4463       Int_t same  = 0;
4464       Int_t both  = 0;
4465       Int_t samem = 0;
4466       Int_t bothm = 0;
4467       Int_t samed = 0;
4468       Int_t bothd = 0;
4469       //
4470       for (Int_t i=0;i<row0;i++){
4471         if (mother0.fIndex[i]>0 && mother1.fIndex[i]>0){
4472           both++;
4473           bothm++;
4474           if (mother0.fIndex[i]==mother1.fIndex[i]){
4475             same++;
4476             samem++;
4477           }
4478         }
4479       }
4480
4481       for (Int_t i=row0;i<158;i++){
4482         if (daughter0.fIndex[i]>0 && daughter0.fIndex[i]>0){
4483           both++;
4484           bothd++;
4485           if (mother0.fIndex[i]==mother1.fIndex[i]){
4486             same++;
4487             samed++;
4488           }
4489         }
4490       }
4491       Float_t ratio = Float_t(same+1)/Float_t(both+1);
4492       Float_t ratiom = Float_t(samem+1)/Float_t(bothm+1);
4493       Float_t ratiod = Float_t(samed+1)/Float_t(bothd+1);
4494       if (ratio>0.3 && ratiom>0.5 &&ratiod>0.5) {
4495         Int_t sum0 = mother0.fN+daughter0.fN;
4496         Int_t sum1 = mother1.fN+daughter1.fN;
4497         if (sum1>sum0){
4498           shared[kink0->GetIndex(0)]= kTRUE;
4499           shared[kink0->GetIndex(1)]= kTRUE;
4500           delete kinks->RemoveAt(indexes[ikink0]);
4501         }
4502         else{
4503           shared[kink1->GetIndex(0)]= kTRUE;
4504           shared[kink1->GetIndex(1)]= kTRUE;
4505           delete kinks->RemoveAt(indexes[ikink1]);
4506         }
4507       }
4508     }
4509   }
4510
4511
4512   for (Int_t i=0;i<nkinks;i++){
4513     AliESDkink * kink = (AliESDkink*) kinks->At(indexes[i]);
4514     if (!kink) continue;
4515     kink->SetTPCRow0(GetRowNumber(kink->GetR()));
4516     Int_t index0 = kink->GetIndex(0);
4517     Int_t index1 = kink->GetIndex(1);
4518     if (circular[index0]||circular[index1]&&kink->GetDistance()>0.2) continue;
4519     kink->SetMultiple(usage[index0],0);
4520     kink->SetMultiple(usage[index1],1);
4521     if (kink->GetMultiple()[0]+kink->GetMultiple()[1]>2) continue;
4522     if (kink->GetMultiple()[0]+kink->GetMultiple()[1]>0 && quality[indexes[i]]>0.2) continue;
4523     if (kink->GetMultiple()[0]+kink->GetMultiple()[1]>0 && kink->GetDistance()>0.2) continue;
4524     if (circular[index0]||circular[index1]&&kink->GetDistance()>0.1) continue;
4525
4526     AliTPCseed * ktrack0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
4527     AliTPCseed * ktrack1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
4528     if (!ktrack0 || !ktrack1) continue;
4529     Int_t index = esd->AddKink(kink);
4530     //
4531     //
4532     if ( ktrack0->fKinkIndexes[0]==0 && ktrack1->fKinkIndexes[0]==0) {  //best kink
4533       if (mothers[indexes[i]].fN>20 && daughters[indexes[i]].fN>20 && (mothers[indexes[i]].fN+daughters[indexes[i]].fN)>100){
4534         new (ktrack0) AliTPCseed(mothers[indexes[i]]);
4535         new (ktrack1) AliTPCseed(daughters[indexes[i]]);
4536       }
4537     }
4538     //
4539     ktrack0->fKinkIndexes[usage[index0]] = -(index+1);
4540     ktrack1->fKinkIndexes[usage[index1]] =  (index+1);
4541     usage[index0]++;
4542     usage[index1]++;
4543   }
4544   //
4545   // Remove tracks corresponding to shared kink's
4546   //
4547   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4548     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4549     if (!track0) continue;
4550     if (track0->fKinkIndexes[0]!=0) continue;
4551     if (shared[i]) delete array->RemoveAt(i);
4552   }
4553
4554   //
4555   //
4556   RemoveUsed2(array,0.5,0.4,30);
4557   UnsignClusters();
4558   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4559     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4560     if (!track0) continue;
4561     track0->CookdEdx(0.02,0.6);
4562     track0->CookPID();
4563   }
4564   //
4565   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4566     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4567     if (!track0) continue;
4568     if (track0->Pt()<1.4) continue;
4569     //remove double high momenta tracks - overlapped with kink candidates
4570     Int_t shared=0;
4571     Int_t all   =0;
4572     for (Int_t icl=track0->fFirstPoint;icl<track0->fLastPoint; icl++){
4573       if (track0->fClusterPointer[icl]!=0){
4574         all++;
4575         if (track0->fClusterPointer[icl]->IsUsed(10)) shared++;
4576       }
4577     }
4578     if (Float_t(shared+1)/Float_t(nall+1)>0.5) {
4579       delete array->RemoveAt(i);
4580     }
4581     //
4582     if (track0->fKinkIndexes[0]!=0) continue;
4583     if (track0->GetNumberOfClusters()<80) continue;
4584
4585     AliTPCseed *pmother = new AliTPCseed();
4586     AliTPCseed *pdaughter = new AliTPCseed();
4587     AliESDkink *pkink = new AliESDkink;
4588
4589     AliTPCseed & mother = *pmother;
4590     AliTPCseed & daughter = *pdaughter;
4591     AliESDkink & kink = *pkink;
4592     if (CheckKinkPoint(track0,mother,daughter, kink)){
4593       if (mother.fN<30||daughter.fN<20) {
4594         delete pmother;
4595         delete pdaughter;
4596         delete pkink;
4597         continue;  //too short tracks
4598       }
4599       if (mother.Pt()<1.4) {
4600         delete pmother;
4601         delete pdaughter;
4602         delete pkink;
4603         continue;
4604       }
4605       Int_t row0= kink.GetTPCRow0();
4606       if (kink.GetDistance()>0.5 || kink.GetR()<110. || kink.GetR()>240.) {
4607         delete pmother;
4608         delete pdaughter;
4609         delete pkink;
4610         continue;
4611       }
4612       //
4613       Int_t index = esd->AddKink(&kink);
4614       mother.fKinkIndexes[0] = -(index+1);
4615       daughter.fKinkIndexes[0] = index+1;
4616       if (mother.fN>50) {
4617         delete array->RemoveAt(i);
4618         array->AddAt(new AliTPCseed(mother),i);
4619       }
4620       else{
4621         array->AddLast(new AliTPCseed(mother));
4622       }
4623       array->AddLast(new AliTPCseed(daughter));
4624       for (Int_t icl=0;icl<row0;icl++) {
4625         if (mother.fClusterPointer[icl]) mother.fClusterPointer[icl]->Use(20);
4626       }
4627       //
4628       for (Int_t icl=row0;icl<158;icl++) {
4629         if (daughter.fClusterPointer[icl]) daughter.fClusterPointer[icl]->Use(20);
4630       }
4631       //
4632     }
4633     delete pmother;
4634     delete pdaughter;
4635     delete pkink;
4636   }
4637
4638   delete [] daughters;
4639   delete [] mothers;
4640   //
4641   //
4642   delete [] dca;
4643   delete []circular;
4644   delete []shared;
4645   delete []quality;
4646   delete []indexes;
4647   //
4648   delete kink;
4649   delete[]fim;
4650   delete[] zm;
4651   delete[] z0;
4652   delete [] usage;
4653   delete[] alpha;
4654   delete[] nclusters;
4655   delete[] sign;
4656   delete[] helixes;
4657   kinks->Delete();
4658   delete kinks;
4659
4660   printf("Ncandidates=\t%d\t%d\t%d\t%d\n",esd->GetNumberOfKinks(),ncandidates,ntracks,nall);
4661   timer.Print();
4662 }
4663
4664 void  AliTPCtrackerMI::FindV0s(TObjArray * array, AliESD *esd)
4665 {
4666   //
4667   //  find V0s
4668   //
4669   //
4670   TObjArray *tpcv0s      = new TObjArray(100000);
4671   Int_t     nentries     = array->GetEntriesFast();
4672   AliHelix *helixes      = new AliHelix[nentries];
4673   Int_t    *sign         = new Int_t[nentries];
4674   Float_t  *alpha        = new Float_t[nentries];
4675   Float_t  *z0           = new Float_t[nentries];
4676   Float_t  *dca          = new Float_t[nentries];
4677   Float_t  *sdcar        = new Float_t[nentries];
4678   Float_t  *cdcar        = new Float_t[nentries];
4679   Float_t  *pulldcar     = new Float_t[nentries];
4680   Float_t  *pulldcaz     = new Float_t[nentries];
4681   Float_t  *pulldca      = new Float_t[nentries];
4682   Bool_t   *isPrim       = new Bool_t[nentries];
4683   const AliESDVertex * primvertex = esd->GetVertex();
4684   Double_t             zvertex = primvertex->GetZv();
4685   //
4686   //  nentries = array->GetEntriesFast();
4687   //
4688   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4689     sign[i]=0;
4690     isPrim[i]=0;
4691     AliTPCseed* track = (AliTPCseed*)array->At(i);
4692     if (!track) continue;
4693     track->GetV0Indexes()[0] = 0;  //rest v0 indexes
4694     track->GetV0Indexes()[1] = 0;  //rest v0 indexes
4695     track->GetV0Indexes()[2] = 0;  //rest v0 indexes
4696     //
4697     alpha[i] = track->GetAlpha();
4698     new (&helixes[i]) AliHelix(*track);
4699     Double_t xyz[3];
4700     helixes[i].Evaluate(0,xyz);
4701     sign[i] = (track->GetC()>0) ? -1:1;
4702     Double_t x,y,z;
4703     x=160;
4704     z0[i]=1000;
4705     if (track->GetProlongation(0,y,z))  z0[i] = z;
4706     dca[i] = track->GetD(0,0);
4707     //
4708     // dca error parrameterezation + pulls
4709     //
4710     sdcar[i]      = TMath::Sqrt(0.150*0.150+(100*track->fP4)*(100*track->fP4));
4711     if (TMath::Abs(track->fP3)>1) sdcar[i]*=2.5;
4712     cdcar[i]      = TMath::Exp((TMath::Abs(track->fP4)-0.0106)*525.3);
4713     pulldcar[i]   = (dca[i]-cdcar[i])/sdcar[i];
4714     pulldcaz[i]   = (z0[i]-zvertex)/sdcar[i];
4715     pulldca[i]    = TMath::Sqrt(pulldcar[i]*pulldcar[i]+pulldcaz[i]*pulldcaz[i]);
4716     if (track->fTPCr[1]+track->fTPCr[2]+track->fTPCr[3]>0.5) {
4717       if (pulldca[i]<3.) isPrim[i]=kTRUE;  //pion, muon and Kaon  3 sigma cut
4718     }
4719     if (track->fTPCr[4]>0.5) {
4720       if (pulldca[i]<0.5) isPrim[i]=kTRUE;  //proton 0.5 sigma cut
4721     }
4722     if (track->fTPCr[0]>0.4) {
4723       isPrim[i]=kFALSE;  //electron no  sigma cut
4724     }
4725   }
4726   //
4727   //
4728   TStopwatch timer;
4729   timer.Start();
4730   Int_t ncandidates =0;
4731   Int_t nall =0;
4732   Int_t ntracks=0;
4733   Double_t phase[2][2],radius[2];
4734   //
4735   //  Finf V0s loop
4736   //
4737   //
4738   // //
4739   TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
4740   Float_t fprimvertex[3]={GetX(),GetY(),GetZ()};
4741   AliESDV0MI vertex;
4742   Double_t cradius0 = 10*10;
4743   Double_t cradius1 = 200*200;
4744   Double_t cdist1=3.;
4745   Double_t cdist2=4.;
4746   Double_t cpointAngle = 0.95;
4747   //
4748   Double_t delta[2]={10000,10000};
4749   for (Int_t i =0;i<nentries;i++){
4750     if (sign[i]==0) continue;
4751     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4752     if (!track0) continue;
4753     cstream<<"Tracks"<<
4754       "Tr0.="<<track0<<
4755       "dca="<<dca[i]<<
4756       "z0="<<z0[i]<<
4757       "zvertex="<<zvertex<<
4758       "sdcar0="<<sdcar[i]<<
4759       "cdcar0="<<cdcar[i]<<
4760       "pulldcar0="<<pulldcar[i]<<
4761       "pulldcaz0="<<pulldcaz[i]<<
4762       "pulldca0="<<pulldca[i]<<
4763       "isPrim="<<isPrim[i]<<
4764       "\n";
4765     //
4766     if (track0->fP4<0) continue;
4767     if (track0->GetKinkIndex(0)>0||isPrim[i]) continue;   //daughter kink
4768     //
4769     if (TMath::Abs(helixes[i].GetHelix(4))<0.000000001) continue;
4770     ntracks++;
4771     // debug output
4772
4773
4774     for (Int_t j =0;j<nentries;j++){
4775       AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(j);
4776       if (!track1) continue;
4777       if (track1->GetKinkIndex(0)>0 || isPrim[j]) continue; //daughter kink
4778       if (sign[j]*sign[i]>0) continue;
4779       if (TMath::Abs(helixes[j].GetHelix(4))<0.000001) continue;
4780       if (track0->fCircular+track1->fCircular>1) continue;    //circling -returning track
4781       nall++;
4782       //
4783       // DCA to prim vertex cut
4784       //
4785       //
4786       delta[0]=10000;
4787       delta[1]=10000;
4788
4789       Int_t npoints = helixes[i].GetRPHIintersections(helixes[j], phase, radius,cdist2);
4790       if (npoints<1) continue;
4791       Int_t iclosest=0;
4792       // cuts on radius
4793       if (npoints==1){
4794         if (radius[0]<cradius0||radius[0]>cradius1) continue;
4795         helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta[0]);
4796         if (delta[0]>cdist1) continue;
4797       }
4798       else{
4799         if (TMath::Max(radius[0],radius[1])<cradius0|| TMath::Min(radius[0],radius[1])>cradius1) continue;
4800         helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta[0]);
4801         helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta[1]);
4802         if (delta[1]<delta[0]) iclosest=1;
4803         if (delta[iclosest]>cdist1) continue;
4804       }
4805       helixes[i].ParabolicDCA(helixes[j],phase[iclosest][0],phase[iclosest][1],radius[iclosest],delta[iclosest]);
4806       if (radius[iclosest]<cradius0 || radius[iclosest]>cradius1 || delta[iclosest]>cdist1) continue;
4807       //
4808       Double_t pointAngle = helixes[i].GetPointAngle(helixes[j],phase[iclosest],fprimvertex);
4809       if (pointAngle<cpointAngle) continue;
4810       //
4811       Bool_t isGamma = kFALSE;
4812       vertex.SetP(*track0); //track0 - plus
4813       vertex.SetM(*track1); //track1 - minus
4814       vertex.Update(fprimvertex);
4815       if (track0->fTPCr[0]>0.3&&track1->fTPCr[0]>0.3&&vertex.GetAnglep()[2]<0.15) isGamma=kTRUE;              // gamma conversion candidate
4816       Double_t pointAngle2 = vertex.GetPointAngle();
4817       //continue;
4818       if (vertex.GetPointAngle()<cpointAngle && (!isGamma)) continue; // point angle cut
4819       if (vertex.GetDist2()>2&&(!isGamma)) continue;         // point angle cut
4820       Float_t sigmae     = 0.15*0.15;
4821       if (vertex.GetRr()<80)
4822         sigmae += (sdcar[i]*sdcar[i]+sdcar[j]*sdcar[j])*(1.-vertex.GetRr()/80.)*(1.-vertex.GetRr()/80.);
4823       sigmae+= TMath::Sqrt(sigmae);
4824       if (vertex.GetDist2()/sigmae>3.&&(!isGamma)) continue;
4825       Float_t densb0=0,densb1=0,densa0=0,densa1=0;
4826       Int_t row0 = GetRowNumber(vertex.GetRr());
4827       if (row0>15){
4828         if (vertex.GetDist2()>0.2) continue;
4829         densb0     = track0->Density2(0,row0-5);
4830         densb1     = track1->Density2(0,row0-5);
4831         if (densb0>0.3|| densb1>0.3) continue;            //clusters before vertex
4832         densa0     = track0->Density2(row0+5,row0+40);
4833         densa1     = track1->Density2(row0+5,row0+40);
4834         if ((densa0<0.4|| densa1<0.4)&&(!isGamma)) continue;            //missing clusters after vertex
4835       }
4836       else{
4837         densa0     = track0->Density2(0,40);  //cluster density
4838         densa1     = track1->Density2(0,40);  //cluster density
4839         if ((vertex.GetRr()<80&&densa0+densa1<1.)&&(!isGamma)) continue;
4840       }
4841       vertex.SetLab(0,track0->GetLabel());
4842       vertex.SetLab(1,track1->GetLabel());
4843       vertex.SetChi2After((densa0+densa1)*0.5);
4844       vertex.SetChi2Before((densb0+densb1)*0.5);
4845       vertex.SetIndex(0,i);
4846       vertex.SetIndex(1,j);
4847       vertex.SetStatus(1); // TPC v0 candidate
4848       vertex.SetRp(track0->fTPCr);
4849       vertex.SetRm(track1->fTPCr);
4850       tpcv0s->AddLast(new AliESDV0MI(vertex));
4851       ncandidates++;
4852       {
4853         Int_t eventNr = esd->GetEventNumber();
4854         Double_t radiusm= (delta[0]<delta[1])? TMath::Sqrt(radius[0]):TMath::Sqrt(radius[1]);
4855         Double_t deltam= (delta[0]<delta[1])? TMath::Sqrt(delta[0]):TMath::Sqrt(delta[1]);
4856         cstream<<"V0"<<
4857           "Event="<<eventNr<<
4858           "vertex.="<<&vertex<<
4859           "Tr0.="<<track0<<
4860           "lab0="<<track0->fLab<<
4861           "Helix0.="<<&helixes[i]<<
4862           "Tr1.="<<track1<<
4863           "lab1="<<track1->fLab<<
4864           "Helix1.="<<&helixes[j]<<
4865           "pointAngle="<<pointAngle<<
4866           "pointAngle2="<<pointAngle2<<
4867           "dca0="<<dca[i]<<
4868           "dca1="<<dca[j]<<
4869           "z0="<<z0[i]<<
4870           "z1="<<z0[j]<<
4871           "zvertex="<<zvertex<<
4872           "circular0="<<track0->fCircular<<
4873           "circular1="<<track1->fCircular<<
4874           "npoints="<<npoints<<
4875           "radius0="<<radius[0]<<
4876           "delta0="<<delta[0]<<
4877           "radius1="<<radius[1]<<
4878           "delta1="<<delta[1]<<
4879           "radiusm="<<radiusm<<
4880           "deltam="<<deltam<<
4881           "sdcar0="<<sdcar[i]<<
4882           "sdcar1="<<sdcar[j]<<
4883           "cdcar0="<<cdcar[i]<<
4884           "cdcar1="<<cdcar[j]<<
4885           "pulldcar0="<<pulldcar[i]<<
4886           "pulldcar1="<<pulldcar[j]<<
4887           "pulldcaz0="<<pulldcaz[i]<<
4888           "pulldcaz1="<<pulldcaz[j]<<
4889           "pulldca0="<<pulldca[i]<<
4890           "pulldca1="<<pulldca[j]<<
4891           "densb0="<<densb0<<
4892           "densb1="<<densb1<<
4893           "densa0="<<densa0<<
4894           "densa1="<<densa1<<
4895           "sigmae="<<sigmae<<
4896           "\n";
4897       }
4898     }
4899   }
4900   Float_t *quality = new Float_t[ncandidates];
4901   Int_t *indexes = new Int_t[ncandidates];
4902   Int_t naccepted =0;
4903   for (Int_t i=0;i<ncandidates;i++){
4904     quality[i]     = 0;
4905     AliESDV0MI *v0 = (AliESDV0MI*)tpcv0s->At(i);
4906     quality[i]     = 1./(1.00001-v0->GetPointAngle());   //base point angle
4907     // quality[i]    /= (0.5+v0->GetDist2());
4908     // quality[i]    *= v0->GetChi2After();               //density factor
4909     Double_t minpulldca = TMath::Min(2.+pulldca[v0->GetIndex(0)],(2.+pulldca[v0->GetIndex(1)]) );     //pull
4910     Int_t index0 = v0->GetIndex(0);
4911     Int_t index1 = v0->GetIndex(1);
4912     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
4913     AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
4914     if (track0->fTPCr[0]>0.3&&track1->fTPCr[0]>0.3&&v0->GetAnglep()[2]<0.15) quality[i]+=1000000;              // gamma conversion candidate
4915     if (track0->fTPCr[4]>0.9||track1->fTPCr[4]>0.9&&minpulldca>4) quality[i]*=10;    // lambda candidate candidate
4916   }
4917
4918   TMath::Sort(ncandidates,quality,indexes,kTRUE);
4919   //
4920   //
4921   for (Int_t i=0;i<ncandidates;i++){
4922     AliESDV0MI * v0 = (AliESDV0MI*)tpcv0s->At(indexes[i]);
4923     if (!v0) continue;
4924     Int_t index0 = v0->GetIndex(0);
4925     Int_t index1 = v0->GetIndex(1);
4926     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
4927     AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
4928     if (!track0||!track1) {
4929       printf("Bug\n");
4930       continue;
4931     }
4932     Bool_t accept =kTRUE;  //default accept
4933     Int_t *v0indexes0 = track0->GetV0Indexes();
4934     Int_t *v0indexes1 = track1->GetV0Indexes();
4935     //
4936     Int_t order0 = (v0indexes0[0]!=0) ? 1:0;
4937     Int_t order1 = (v0indexes1[0]!=0) ? 1:0;
4938     if (v0indexes0[1]!=0) order0 =2;
4939     if (v0indexes1[1]!=0) order1 =2;
4940     //
4941     if (v0indexes0[2]!=0) {order0=3; accept=kFALSE;}
4942     if (v0indexes0[2]!=0) {order1=3; accept=kFALSE;}
4943     //
4944     AliESDV0MI * v02 = v0;
4945     if (accept){
4946       v0->SetOrder(0,order0);
4947       v0->SetOrder(1,order1);
4948       v0->SetOrder(1,order0+order1);
4949       Int_t index = esd->AddV0MI(v0);
4950       v02 = esd->GetV0MI(index);
4951       v0indexes0[order0]=index;
4952       v0indexes1[order1]=index;
4953       naccepted++;
4954     }
4955     {
4956       Int_t eventNr = esd->GetEventNumber();
4957       cstream<<"V02"<<
4958         "Event="<<eventNr<<
4959         "vertex.="<<v0<<
4960         "vertex2.="<<v02<<
4961         "Tr0.="<<track0<<
4962         "lab0="<<track0->fLab<<
4963         "Tr1.="<<track1<<
4964         "lab1="<<track1->fLab<<
4965         "dca0="<<dca[index0]<<
4966         "dca1="<<dca[index1]<<
4967         "order0="<<order0<<
4968         "order1="<<order1<<
4969         "accept="<<accept<<
4970         "quality="<<quality[i]<<
4971         "pulldca0="<<pulldca[index0]<<
4972         "pulldca1="<<pulldca[index1]<<
4973         "index="<<i<<
4974         "\n";
4975     }
4976   }
4977
4978
4979   //
4980   //
4981   delete []quality;
4982   delete []indexes;
4983 //
4984   delete [] isPrim;
4985   delete [] pulldca;
4986   delete [] pulldcaz;
4987   delete [] pulldcar;
4988   delete [] cdcar;
4989   delete [] sdcar;
4990   delete [] dca;
4991   //
4992   delete[] z0;
4993   delete[] alpha;
4994   delete[] sign;
4995   delete[] helixes;
4996   printf("TPC V0 finder : naccepted\t%d\tncandidates\t%d\tntracks\t%d\tnall\t%d\n",naccepted,ncandidates,ntracks,nall);
4997   timer.Print();
4998 }
4999
5000 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitKink(AliTPCseed &mother, AliTPCseed &daughter, AliESDkink &kink)
5001 {
5002   //
5003   // refit kink towards to the vertex
5004   //
5005   //
5006   Int_t row0 = GetRowNumber(kink.GetR());
5007   FollowProlongation(mother,0);
5008   mother.Reset(kFALSE);
5009   //
5010   FollowProlongation(daughter,row0);
5011   daughter.Reset(kFALSE);
5012   FollowBackProlongation(daughter,158);
5013   daughter.Reset(kFALSE);
5014   Int_t first = TMath::Max(row0-20,30);
5015   Int_t last  = TMath::Min(row0+20,140);
5016   //
5017   const Int_t kNdiv =5;
5018   AliTPCseed  param0[kNdiv];  // parameters along the track
5019   AliTPCseed  param1[kNdiv];  // parameters along the track
5020   AliESDkink   kinks[kNdiv];   // corresponding kink parameters
5021   //
5022   Int_t rows[kNdiv];
5023   for (Int_t irow=0; irow<kNdiv;irow++){
5024     rows[irow] = first +((last-first)*irow)/(kNdiv-1);
5025   }
5026   // store parameters along the track
5027   //
5028   for (Int_t irow=0;irow<kNdiv;irow++){
5029     FollowBackProlongation(mother, rows[irow]);
5030     FollowProlongation(daughter,rows[kNdiv-1-irow]);
5031     new(&param0[irow])     AliTPCseed(mother);
5032     new(&param1[kNdiv-1-irow])   AliTPCseed(daughter);
5033   }
5034   //
5035   // define kinks
5036   for (Int_t irow=0; irow<kNdiv-1;irow++){
5037     if (param0[irow].fN<kNdiv||param1[irow].fN<kNdiv) continue;
5038     kinks[irow].SetMother(param0[irow]);
5039     kinks[irow].SetDaughter(param1[irow]);
5040     kinks[irow].Update();
5041   }
5042   //
5043   // choose kink with best "quality"
5044   Int_t index =-1;
5045   Double_t mindist = 10000;
5046   for (Int_t irow=0;irow<kNdiv;irow++){
5047     if (param0[irow].fN<20||param1[irow].fN<20) continue;
5048     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())>240.) continue;
5049     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())<100.) continue;
5050     //
5051     Float_t normdist = TMath::Abs(param0[irow].fX-kinks[irow].GetR())*(0.1+kink.GetDistance());
5052     normdist/= (param0[irow].fN+param1[irow].fN+40.);
5053     if (normdist < mindist){
5054       mindist = normdist;
5055       index = irow;
5056     }
5057   }
5058   //
5059   if (index==-1) return 0;
5060   //
5061   //
5062   param0[index].Reset(kTRUE);
5063   FollowProlongation(param0[index],0);
5064   //
5065   new (&mother) AliTPCseed(param0[index]);
5066   new (&daughter) AliTPCseed(param1[index]);  // daughter in vertex
5067   //
5068   kink.SetMother(mother);
5069   kink.SetDaughter(daughter);
5070   kink.Update();
5071   kink.SetTPCRow0(GetRowNumber(kink.GetR()));
5072   kink.SetTPCncls(param0[index].fN,0);
5073   kink.SetTPCncls(param1[index].fN,1);
5074   kink.SetLabel(CookLabel(&mother,0.4, 0,kink.GetTPCRow0()),0);
5075   kink.SetLabel(CookLabel(&daughter,0.4, kink.GetTPCRow0(),160),1);
5076   mother.SetLabel(kink.GetLabel(0));
5077   daughter.SetLabel(kink.GetLabel(1));
5078
5079   return 1;
5080 }
5081
5082
5083 void AliTPCtrackerMI::UpdateKinkQualityM(AliTPCseed * seed){
5084   //
5085   // update Kink quality information for mother after back propagation
5086   //
5087   if (seed->GetKinkIndex(0)>=0) return;
5088   for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++){
5089     Int_t index = seed->GetKinkIndex(ikink);
5090     if (index>=0) break;
5091     index = TMath::Abs(index)-1;
5092     AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index);
5093     //kink->fTPCdensity2[0][0]=-1;
5094     //kink->fTPCdensity2[0][1]=-1;
5095     kink->SetTPCDensity2(-1,0,0);
5096     kink->SetTPCDensity2(1,0,1);
5097     //
5098     Int_t row0 = kink->GetTPCRow0() - 2 - Int_t( 0.5/ (0.05+kink->GetAngle(2)));
5099     if (row0<15) row0=15;
5100     //
5101     Int_t row1 = kink->GetTPCRow0() + 2 +  Int_t( 0.5/ (0.05+kink->GetAngle(2)));
5102     if (row1>145) row1=145;
5103     //
5104     Int_t found,foundable,shared;
5105     seed->GetClusterStatistic(0,row0, found, foundable,shared,kFALSE);
5106     if (foundable>5)   kink->SetTPCDensity2(Float_t(found)/Float_t(foundable),0,0);
5107     seed->GetClusterStatistic(row1,155, found, foundable,shared,kFALSE);
5108     if (foundable>5)   kink->SetTPCDensity2(Float_t(found)/Float_t(foundable),0,1);
5109   }
5110
5111 }
5112
5113 void AliTPCtrackerMI::UpdateKinkQualityD(AliTPCseed * seed){
5114   //
5115   // update Kink quality information for daughter after refit
5116   //
5117   if (seed->GetKinkIndex(0)<=0) return;
5118   for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++){
5119     Int_t index = seed->GetKinkIndex(ikink);
5120     if (index<=0) break;
5121     index = TMath::Abs(index)-1;
5122     AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index);
5123     kink->SetTPCDensity2(-1,1,0);
5124     kink->SetTPCDensity2(-1,1,1);
5125     //
5126     Int_t row0 = kink->GetTPCRow0() -2 - Int_t( 0.5/ (0.05+kink->GetAngle(2)));
5127     if (row0<15) row0=15;
5128     //
5129     Int_t row1 = kink->GetTPCRow0() +2 +  Int_t( 0.5/ (0.05+kink->GetAngle(2)));
5130     if (row1>145) row1=145;
5131     //
5132     Int_t found,foundable,shared;
5133     seed->GetClusterStatistic(0,row0, found, foundable,shared,kFALSE);
5134     if (foundable>5)   kink->SetTPCDensity2(Float_t(found)/Float_t(foundable),1,0);
5135     seed->GetClusterStatistic(row1,155, found, foundable,shared,kFALSE);
5136     if (foundable>5)   kink->SetTPCDensity2(Float_t(found)/Float_t(foundable),1,1);
5137   }
5138
5139 }
5140
5141
5142 Int_t  AliTPCtrackerMI::CheckKinkPoint(AliTPCseed*seed,AliTPCseed &mother, AliTPCseed &daughter, AliESDkink &kink)
5143 {
5144   //
5145   // check kink point for given track
5146   // if return value=0 kink point not found
5147   // otherwise seed0 correspond to mother particle
5148   //           seed1 correspond to daughter particle
5149   //           kink  parameter of kink point
5150
5151   Int_t middlerow = (seed->fFirstPoint+seed->fLastPoint)/2;
5152   Int_t first = seed->fFirstPoint;
5153   Int_t last  = seed->fLastPoint;
5154   if (last-first<20) return 0;          // shortest length - 2*30 = 60 pad-rows
5155
5156
5157   AliTPCseed *seed1 = ReSeed(seed,middlerow+20, kTRUE);  //middle of chamber
5158   if (!seed1) return 0;
5159   FollowProlongation(*seed1,seed->fLastPoint-20);
5160   seed1->Reset(kTRUE);
5161   FollowProlongation(*seed1,158);
5162   seed1->Reset(kTRUE);
5163   last = seed1->fLastPoint;
5164   //
5165   AliTPCseed *seed0 = new AliTPCseed(*seed);
5166   seed0->Reset(kFALSE);
5167   seed0->Reset();
5168   //
5169   AliTPCseed  param0[20];  // parameters along the track
5170   AliTPCseed  param1[20];  // parameters along the track
5171   AliESDkink            kinks[20];   // corresponding kink parameters
5172   Int_t rows[20];
5173   for (Int_t irow=0; irow<20;irow++){
5174     rows[irow] = first +((last-first)*irow)/19;
5175   }
5176   // store parameters along the track
5177   //
5178   for (Int_t irow=0;irow<20;irow++){
5179     FollowBackProlongation(*seed0, rows[irow]);
5180     FollowProlongation(*seed1,rows[19-irow]);
5181     new(&param0[irow])     AliTPCseed(*seed0);
5182     new(&param1[19-irow])   AliTPCseed(*seed1);
5183   }
5184   //
5185   // define kinks
5186   for (Int_t irow=0; irow<19;irow++){
5187     kinks[irow].SetMother(param0[irow]);
5188     kinks[irow].SetDaughter(param1[irow]);
5189     kinks[irow].Update();
5190   }
5191   //
5192   // choose kink with biggest change of angle
5193   Int_t index =-1;
5194   Double_t maxchange= 0;
5195   for (Int_t irow=1;irow<19;irow++){
5196     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())>240.) continue;
5197     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())<110.) continue;
5198     Float_t quality = TMath::Abs(kinks[irow].GetAngle(2))/(3.+TMath::Abs(kinks[irow].GetR()-param0[irow].fX));
5199     if ( quality > maxchange){
5200       maxchange = quality;
5201       index = irow;
5202       //
5203     }
5204   }
5205   delete seed0;
5206   delete seed1;
5207   if (index<0) return 0;
5208   //
5209   Int_t row0    = GetRowNumber(kinks[index].GetR());   //row 0 estimate
5210   seed0 = new AliTPCseed(param0[index]);
5211   seed1 = new AliTPCseed(param1[index]);
5212   seed0->Reset(kFALSE);
5213   seed1->Reset(kFALSE);
5214   seed0->ResetCovariance();
5215   seed1->ResetCovariance();
5216   FollowProlongation(*seed0,0);
5217   FollowBackProlongation(*seed1,158);
5218   new (&mother) AliTPCseed(*seed0);  // backup mother at position 0
5219   seed0->Reset(kFALSE);
5220   seed1->Reset(kFALSE);
5221   seed0->ResetCovariance();
5222   seed1->ResetCovariance();
5223   //
5224   first = TMath::Max(row0-20,0);
5225   last  = TMath::Min(row0+20,158);
5226   //
5227   for (Int_t irow=0; irow<20;irow++){
5228     rows[irow] = first +((last-first)*irow)/19;
5229   }
5230   // store parameters along the track
5231   //
5232   for (Int_t irow=0;irow<20;irow++){
5233     FollowBackProlongation(*seed0, rows[irow]);
5234     FollowProlongation(*seed1,rows[19-irow]);
5235     new(&param0[irow])     AliTPCseed(*seed0);
5236     new(&param1[19-irow])   AliTPCseed(*seed1);
5237   }
5238   //
5239   // define kinks
5240   for (Int_t irow=0; irow<19;irow++){
5241     kinks[irow].SetMother(param0[irow]);
5242     kinks[irow].SetDaughter(param1[irow]);
5243     //    param0[irow].Dump();
5244     //param1[irow].Dump();
5245     kinks[irow].Update();
5246   }
5247   //
5248   // choose kink with biggest change of angle
5249   index =-1;
5250   maxchange= 0;
5251   for (Int_t irow=0;irow<20;irow++){
5252     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())>250.) continue;
5253     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())<90.) continue;
5254     Float_t quality = TMath::Abs(kinks[irow].GetAngle(2))/(3.+TMath::Abs(kinks[irow].GetR()-param0[irow].fX));
5255     if ( quality > maxchange){
5256       maxchange = quality;
5257       index = irow;
5258       //
5259     }
5260   }
5261   //
5262   //
5263   if (index==-1 || param0[index].fN+param1[index].fN<100){
5264     delete seed0;
5265     delete seed1;
5266     return 0;
5267   }
5268   //  Float_t anglesigma = TMath::Sqrt(param0[index].fC22+param0[index].fC33+param1[index].fC22+param1[index].fC33);
5269
5270   kink.SetMother(param0[index]);
5271   kink.SetDaughter(param1[index]);
5272   kink.Update();
5273   row0    = GetRowNumber(kink.GetR());
5274   kink.SetTPCRow0(row0);
5275   kink.SetLabel(CookLabel(seed0,0.5,0,row0),0);
5276   kink.SetLabel(CookLabel(seed1,0.5,row0,158),1);
5277   kink.SetIndex(-10,0);
5278   kink.SetIndex(int(param0[index].fN+param1[index].fN),1);
5279   kink.SetTPCncls(param0[index].fN,0);
5280   kink.SetTPCncls(param1[index].fN,1);
5281   //
5282   //
5283   //  new (&mother) AliTPCseed(param0[index]);
5284   new (&daughter) AliTPCseed(param1[index]);
5285   daughter.SetLabel(kink.GetLabel(1));
5286   param0[index].Reset(kTRUE);
5287   FollowProlongation(param0[index],0);
5288   new (&mother) AliTPCseed(param0[index]);
5289   mother.SetLabel(kink.GetLabel(0));
5290   delete seed0;
5291   delete seed1;
5292   //
5293   return 1;
5294 }
5295
5296
5297
5298
5299 AliTPCseed*  AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *t)
5300 {
5301   //
5302   // reseed - refit -  track
5303   //
5304   Int_t first = 0;
5305   //  Int_t last  = fSectors->GetNRows()-1;
5306   //
5307   if (fSectors == fOuterSec){
5308     first = TMath::Max(first, t->fFirstPoint-fInnerSec->GetNRows());
5309     //last  =
5310   }
5311   else
5312     first = t->fFirstPoint;
5313   //
5314   AliTPCseed * seed = MakeSeed(t,0.1,0.5,0.9);
5315   FollowBackProlongation(*t,fSectors->GetNRows()-1);
5316   t->Reset(kFALSE);
5317   FollowProlongation(*t,first);
5318   return seed;
5319 }
5320
5321
5322
5323
5324
5325
5326
5327 //_____________________________________________________________________________
5328 Int_t AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(const TFile *inp) {
5329   //-----------------------------------------------------------------
5330   // This function reades track seeds.
5331   //-----------------------------------------------------------------
5332   TDirectory *savedir=gDirectory;
5333
5334   TFile *in=(TFile*)inp;
5335   if (!in->IsOpen()) {
5336      cerr<<"AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(): input file is not open !\n";
5337      return 1;
5338   }
5339
5340   in->cd();
5341   TTree *seedTree=(TTree*)in->Get("Seeds");
5342   if (!seedTree) {
5343      cerr<<"AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(): ";
5344      cerr<<"can't get a tree with track seeds !\n";
5345      return 2;
5346   }
5347   AliTPCtrack *seed=new AliTPCtrack;
5348   seedTree->SetBranchAddress("tracks",&seed);
5349
5350   if (fSeeds==0) fSeeds=new TObjArray(15000);
5351
5352   Int_t n=(Int_t)seedTree->GetEntries();
5353   for (Int_t i=0; i<n; i++) {
5354      seedTree->GetEvent(i);
5355      fSeeds->AddLast(new AliTPCseed(*seed/*,seed->GetAlpha()*/));
5356   }
5357
5358   delete seed;
5359   delete seedTree;
5360   savedir->cd();
5361   return 0;
5362 }
5363
5364 Int_t AliTPCtrackerMI::Clusters2Tracks (AliESD *esd)
5365 {
5366   //
5367   if (fSeeds) DeleteSeeds();
5368   fEvent = esd;
5369   Clusters2Tracks();
5370   if (!fSeeds) return 1;
5371   FillESD(fSeeds);
5372   return 0;
5373   //
5374 }
5375
5376
5377 //_____________________________________________________________________________
5378 Int_t AliTPCtrackerMI::Clusters2Tracks() {
5379   //-----------------------------------------------------------------
5380   // This is a track finder.
5381   //-----------------------------------------------------------------
5382   TDirectory *savedir=gDirectory;
5383   TStopwatch timer;
5384
5385   fIteration = 0;
5386   fSeeds = Tracking();
5387
5388   if (fDebug>0){
5389     Info("Clusters2Tracks","Time for tracking: \t");timer.Print();timer.Start();
5390   }
5391   //activate again some tracks
5392   for (Int_t i=0; i<fSeeds->GetEntriesFast(); i++) {
5393     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5394     if (!pt) continue;
5395     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5396     if (nc<20) {
5397       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5398       continue;
5399     }
5400     CookLabel(pt,0.1);
5401     if (pt->fRemoval==10) {
5402       if (pt->GetDensityFirst(20)>0.8 || pt->GetDensityFirst(30)>0.8 || pt->GetDensityFirst(40)>0.7)
5403         pt->Desactivate(10);  // make track again active
5404       else{
5405         pt->Desactivate(20);
5406         delete fSeeds->RemoveAt(i);
5407       }
5408     }
5409   }
5410   //
5411   RemoveUsed2(fSeeds,0.85,0.85,0);
5412   FindKinks(fSeeds,fEvent);
5413   RemoveUsed2(fSeeds,0.5,0.4,20);
5414  //  //
5415 //   // refit short tracks
5416 //   //
5417   Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
5418 //   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5419 //     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5420 //     if (!pt) continue;
5421 //     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5422 //     if (nc<15) {
5423 //       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5424 //       continue;
5425 //     }
5426 //     if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue; // ignore kink candidates
5427 //     if (nc>100) continue;                     // hopefully, enough for ITS
5428 //     AliTPCseed *seed2 = new AliTPCseed(*pt);
5429 //     //seed2->Reset(kFALSE);
5430 //     //pt->ResetCovariance();
5431 //     seed2->Modify(1);
5432 //     FollowBackProlongation(*seed2,158);
5433 //     //seed2->Reset(kFALSE);
5434 //     seed2->Modify(10);
5435 //     FollowProlongation(*seed2,0);
5436 //     TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
5437 //     cstream<<"Crefit"<<
5438 //       "Tr0.="<<pt<<
5439 //       "Tr1.="<<seed2<<
5440 //       "\n";
5441 //     if (seed2->fN>pt->fN){
5442 //       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5443 //       fSeeds->AddAt(seed2,i);
5444 //     }else{
5445 //       delete seed2;
5446 //     }
5447 //   }
5448 //   RemoveUsed2(fSeeds,0.6,0.6,50);
5449
5450 //  FindV0s(fSeeds,fEvent);
5451   //RemoveDouble(fSeeds,0.2,0.6,11);
5452
5453   //
5454   Int_t found = 0;
5455   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5456     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5457     if (!pt) continue;
5458     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5459     if (nc<15) {
5460       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5461       continue;
5462     }
5463     CookLabel(pt,0.1); //For comparison only
5464     //if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )&& nc>50 &&pt->GetNumberOfClusters()>0.4*pt->fNFoundable){
5465     if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )){
5466       found++;
5467       if (fDebug>0) cerr<<found<<'\r';
5468       pt->fLab2 = i;
5469     }
5470     else
5471       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5472   }
5473
5474
5475   //RemoveOverlap(fSeeds,0.99,7,kTRUE);
5476   SignShared(fSeeds);
5477   //RemoveUsed(fSeeds,0.9,0.9,6);
5478   //
5479   nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
5480   found = 0;
5481   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5482     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5483     if (!pt) continue;
5484     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5485     if (nc<15) {
5486       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5487       continue;
5488     }
5489     t.SetUniqueID(i);
5490     t.CookdEdx(0.02,0.6);
5491     //    CheckKinkPoint(&t,0.05);
5492     //if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )&& nc>50 &&pt->GetNumberOfClusters()>0.4*pt->fNFoundable){
5493     if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )){
5494       found++;
5495       if (fDebug>0){
5496         cerr<<found<<'\r';
5497       }
5498       pt->fLab2 = i;
5499     }
5500     else
5501       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5502     //AliTPCseed * seed1 = ReSeed(pt,0.05,0.5,1);
5503     //if (seed1){
5504     //  FollowProlongation(*seed1,0);
5505     //  Int_t n = seed1->GetNumberOfClusters();
5506     //  printf("fP4\t%f\t%f\n",seed1->GetC(),pt->GetC());
5507     //  printf("fN\t%d\t%d\n", seed1->GetNumberOfClusters(),pt->GetNumberOfClusters());
5508     //
5509     //}
5510     //AliTPCseed * seed2 = ReSeed(pt,0.95,0.5,0.05);
5511
5512   }
5513
5514   SortTracks(fSeeds, 1);
5515
5516   /*
5517   fIteration = 1;
5518   PrepareForBackProlongation(fSeeds,5.);
5519   PropagateBack(fSeeds);
5520   printf("Time for back propagation: \t");timer.Print();timer.Start();
5521
5522   fIteration = 2;
5523
5524   PrepareForProlongation(fSeeds,5.);
5525   PropagateForward2(fSeeds);
5526
5527   printf("Time for FORWARD propagation: \t");timer.Print();timer.Start();
5528   // RemoveUsed(fSeeds,0.7,0.7,6);
5529   //RemoveOverlap(fSeeds,0.9,7,kTRUE);
5530
5531   nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
5532   found = 0;
5533   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5534     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5535     if (!pt) continue;
5536     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5537     if (nc<15) {
5538       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5539       continue;
5540     }
5541     t.CookdEdx(0.02,0.6);
5542     //    CookLabel(pt,0.1); //For comparison only
5543     //if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )&& nc>50 &&pt->GetNumberOfClusters()>0.4*pt->fNFoundable){
5544     if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )){
5545       cerr<<found++<<'\r';
5546     }
5547     else
5548       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5549     pt->fLab2 = i;
5550   }
5551   */
5552
5553   //  fNTracks = found;
5554   if (fDebug>0){
5555     Info("Clusters2Tracks","Time for overlap removal, track writing and dedx cooking: \t"); timer.Print();timer.Start();
5556   }
5557   //
5558   //  cerr<<"Number of found tracks : "<<"\t"<<found<<endl;
5559   Info("Clusters2Tracks","Number of found tracks %d",found);
5560   savedir->cd();
5561   //  UnloadClusters();
5562   //
5563   return 0;
5564 }
5565
5566 void AliTPCtrackerMI::Tracking(TObjArray * arr)
5567 {
5568   //
5569   // tracking of the seeds
5570   //
5571
5572   fSectors = fOuterSec;
5573   ParallelTracking(arr,150,63);
5574   fSectors = fOuterSec;
5575   ParallelTracking(arr,63,0);
5576 }
5577
5578 TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking(Int_t seedtype, Int_t i1, Int_t i2, Float_t cuts[4], Float_t dy, Int_t dsec)
5579 {
5580   //
5581   //
5582   //tracking routine
5583   TObjArray * arr = new TObjArray;
5584   //
5585   fSectors = fOuterSec;
5586   TStopwatch timer;
5587   timer.Start();
5588   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
5589     if (seedtype==3) MakeSeeds3(arr,sec,i1,i2,cuts,dy, dsec);
5590     if (seedtype==4) MakeSeeds5(arr,sec,i1,i2,cuts,dy);
5591     if (seedtype==2) MakeSeeds2(arr,sec,i1,i2,cuts,dy);
5592   }
5593   if (fDebug>0){
5594     Info("Tracking","\nSeeding - %d\t%d\t%d\t%d\n",seedtype,i1,i2,arr->GetEntriesFast());
5595     timer.Print();
5596     timer.Start();
5597   }
5598   Tracking(arr);
5599   if (fDebug>0){
5600     timer.Print();
5601   }
5602
5603   return arr;
5604 }
5605
5606 TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking()
5607 {
5608   //
5609   //
5610   TStopwatch timer;
5611   timer.Start();
5612   Int_t nup=fOuterSec->GetNRows()+fInnerSec->GetNRows();
5613
5614   TObjArray * seeds = new TObjArray;
5615   TObjArray * arr=0;
5616
5617   Int_t gap =20;
5618   Float_t cuts[4];
5619   cuts[0] = 0.002;
5620   cuts[1] = 1.5;
5621   cuts[2] = 3.;
5622   cuts[3] = 3.;
5623   Float_t fnumber  = 3.0;
5624   Float_t fdensity = 3.0;
5625
5626   //
5627   //find primaries
5628   cuts[0]=0.0066;
5629   for (Int_t delta = 0; delta<18; delta+=6){
5630     //
5631     cuts[0]=0.0070;
5632     cuts[1] = 1.5;
5633     arr = Tracking(3,nup-1-delta,nup-1-delta-gap,cuts,-1,1);
5634     SumTracks(seeds,arr);
5635     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5636     //
5637     for (Int_t i=2;i<6;i+=2){
5638       // seed high pt tracks
5639       cuts[0]=0.0022;
5640       cuts[1]=0.3;
5641       arr = Tracking(3,nup-i-delta,nup-i-delta-gap,cuts,-1,0);
5642       SumTracks(seeds,arr);
5643       SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5644     }
5645   }
5646   fnumber  = 4;
5647   fdensity = 4.;
5648   //  RemoveUsed(seeds,0.9,0.9,1);
5649   //  UnsignClusters();
5650   //  SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5651
5652   //find primaries
5653   cuts[0]=0.0077;
5654   for (Int_t delta = 20; delta<120; delta+=10){
5655     //
5656     // seed high pt tracks
5657     cuts[0]=0.0060;
5658     cuts[1]=0.3;
5659     cuts[2]=6.;
5660     arr = Tracking(3,nup-delta,nup-delta-gap,cuts,-1);
5661     SumTracks(seeds,arr);
5662     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5663
5664     cuts[0]=0.003;
5665     cuts[1]=0.3;
5666     cuts[2]=6.;
5667     arr = Tracking(3,nup-delta-5,nup-delta-5-gap,cuts,-1);
5668     SumTracks(seeds,arr);
5669     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5670   }
5671
5672   cuts[0] = 0.01;
5673   cuts[1] = 2.0;
5674   cuts[2] = 3.;
5675   cuts[3] = 2.0;
5676   fnumber  = 2.;
5677   fdensity = 2.;
5678
5679   if (fDebug>0){
5680     Info("Tracking()","\n\nPrimary seeding\t%d\n\n",seeds->GetEntriesFast());
5681     timer.Print();
5682     timer.Start();
5683   }
5684   //  RemoveUsed(seeds,0.75,0.75,1);
5685   //UnsignClusters();
5686   //SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5687
5688   // find secondaries
5689
5690   cuts[0] = 0.3;
5691   cuts[1] = 1.5;
5692   cuts[2] = 3.;
5693   cuts[3] = 1.5;
5694
5695   arr = Tracking(4,nup-1,nup-1-gap,cuts,-1);
5696   SumTracks(seeds,arr);
5697   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5698   //
5699   arr = Tracking(4,nup-2,nup-2-gap,cuts,-1);
5700   SumTracks(seeds,arr);
5701   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5702   //
5703   arr = Tracking(4,nup-3,nup-3-gap,cuts,-1);
5704   SumTracks(seeds,arr);
5705   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5706   //
5707
5708
5709   for (Int_t delta = 3; delta<30; delta+=5){
5710     //
5711     cuts[0] = 0.3;
5712     cuts[1] = 1.5;
5713     cuts[2] = 3.;
5714     cuts[3] = 1.5;
5715     arr = Tracking(4,nup-1-delta,nup-1-delta-gap,cuts,-1);
5716     SumTracks(seeds,arr);
5717     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5718     //
5719     arr = Tracking(4,nup-3-delta,nup-5-delta-gap,cuts,4);
5720     SumTracks(seeds,arr);
5721     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5722     //
5723   }
5724   fnumber  = 1;
5725   fdensity = 1;
5726   //
5727   // change cuts
5728   fnumber  = 2.;
5729   fdensity = 2.;
5730   cuts[0]=0.0080;
5731
5732   // find secondaries
5733   for (Int_t delta = 30; delta<90; delta+=10){
5734     //
5735     cuts[0] = 0.3;
5736     cuts[1] = 3.5;
5737     cuts[2] = 3.;
5738     cuts[3] = 3.5;
5739     arr = Tracking(4,nup-1-delta,nup-1-delta-gap,cuts,-1);
5740     SumTracks(seeds,arr);
5741     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5742     //
5743     arr = Tracking(4,nup-5-delta,nup-5-delta-gap,cuts,5 );
5744     SumTracks(seeds,arr);
5745     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5746   }
5747
5748   if (fDebug>0){
5749     Info("Tracking()","\n\nSecondary seeding\t%d\n\n",seeds->GetEntriesFast());
5750     timer.Print();
5751     timer.Start();
5752   }
5753
5754   return seeds;
5755   //
5756
5757 }
5758
5759
5760 void AliTPCtrackerMI::SumTracks(TObjArray *arr1,TObjArray *arr2) const
5761 {
5762   //
5763   //sum tracks to common container
5764   //remove suspicious tracks
5765   Int_t nseed = arr2->GetEntriesFast();
5766   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5767     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr2->UncheckedAt(i);
5768     if (pt){
5769        // REMOVE VERY SHORT  TRACKS
5770       if (pt->GetNumberOfClusters()<20){
5771         delete arr2->RemoveAt(i);
5772         continue;
5773       }// patch 28 fev06
5774       // NORMAL ACTIVE TRACK
5775       if (pt->IsActive()){
5776         arr1->AddLast(arr2->RemoveAt(i));
5777         continue;
5778       }
5779       //remove not usable tracks
5780       if (pt->fRemoval!=10){
5781         delete arr2->RemoveAt(i);
5782         continue;
5783       }
5784
5785       // ENABLE ONLY ENOUGH GOOD STOPPED TRACKS
5786       if (pt->GetDensityFirst(20)>0.8 || pt->GetDensityFirst(30)>0.8 || pt->GetDensityFirst(40)>0.7)
5787         arr1->AddLast(arr2->RemoveAt(i));
5788       else{
5789         delete arr2->RemoveAt(i);
5790       }
5791     }
5792   }
5793   delete arr2;
5794 }
5795
5796
5797
5798 void  AliTPCtrackerMI::ParallelTracking(TObjArray * arr, Int_t rfirst, Int_t rlast)
5799 {
5800   //
5801   // try to track in parralel
5802
5803   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
5804   //prepare seeds for tracking
5805   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5806     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5807     if (!pt) continue;
5808     if (!t.IsActive()) continue;
5809     // follow prolongation to the first layer
5810     if ( (fSectors ==fInnerSec) || (t.fFirstPoint-fParam->GetNRowLow()>rfirst+1) )
5811       FollowProlongation(t, rfirst+1);
5812   }
5813
5814
5815   //
5816   for (Int_t nr=rfirst; nr>=rlast; nr--){
5817     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
5818       fSectors = fInnerSec;
5819     else
5820       fSectors = fOuterSec;
5821     // make indexes with the cluster tracks for given
5822
5823     // find nearest cluster
5824     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5825       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5826       if (!pt) continue;
5827       if (nr==80) pt->UpdateReference();
5828       if (!pt->IsActive()) continue;
5829       //      if ( (fSectors ==fOuterSec) && (pt->fFirstPoint-fParam->GetNRowLow())<nr) continue;
5830       if (pt->fRelativeSector>17) {
5831         continue;
5832       }
5833       UpdateClusters(t,nr);
5834     }
5835     // prolonagate to the nearest cluster - if founded
5836     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5837       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5838       if (!pt) continue;
5839       if (!pt->IsActive()) continue;
5840       // if ((fSectors ==fOuterSec) && (pt->fFirstPoint-fParam->GetNRowLow())<nr) continue;
5841       if (pt->fRelativeSector>17) {
5842         continue;
5843       }
5844       FollowToNextCluster(*pt,nr);
5845     }
5846   }
5847 }
5848
5849 void AliTPCtrackerMI::PrepareForBackProlongation(TObjArray * arr,Float_t fac) const
5850 {
5851   //
5852   //
5853   // if we use TPC track itself we have to "update" covariance
5854   //
5855   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
5856   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5857     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5858     if (pt) {
5859       pt->Modify(fac);
5860       //
5861       //rotate to current local system at first accepted  point
5862       Int_t index  = pt->GetClusterIndex2(pt->fFirstPoint);
5863       Int_t sec    = (index&0xff000000)>>24;
5864       sec = sec%18;
5865       Float_t angle1 = fInnerSec->GetAlpha()*sec+fInnerSec->GetAlphaShift();
5866       if (angle1>TMath::Pi())
5867         angle1-=2.*TMath::Pi();
5868       Float_t angle2 = pt->GetAlpha();
5869
5870       if (TMath::Abs(angle1-angle2)>0.001){
5871         pt->Rotate(angle1-angle2);
5872         //angle2 = pt->GetAlpha();
5873         //pt->fRelativeSector = pt->GetAlpha()/fInnerSec->GetAlpha();
5874         //if (pt->GetAlpha()<0)
5875         //  pt->fRelativeSector+=18;
5876         //sec = pt->fRelativeSector;
5877       }
5878
5879     }
5880
5881   }
5882
5883
5884 }
5885 void AliTPCtrackerMI::PrepareForProlongation(TObjArray * arr, Float_t fac) const
5886 {
5887   //
5888   //
5889   // if we use TPC track itself we have to "update" covariance
5890   //
5891   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
5892   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5893     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5894     if (pt) {
5895       pt->Modify(fac);
5896       pt->fFirstPoint = pt->fLastPoint;
5897     }
5898
5899   }
5900
5901
5902 }
5903
5904 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(TObjArray * arr)
5905 {
5906   //
5907   // make back propagation
5908   //
5909   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
5910   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5911     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5912     if (pt&& pt->GetKinkIndex(0)<=0) {
5913       //AliTPCseed *pt2 = new AliTPCseed(*pt);
5914       fSectors = fInnerSec;
5915       //FollowBackProlongation(*pt,fInnerSec->GetNRows()-1);
5916       //fSectors = fOuterSec;
5917       FollowBackProlongation(*pt,fInnerSec->GetNRows()+fOuterSec->GetNRows()-1);
5918       //if (pt->GetNumberOfClusters()<(pt->fEsd->GetTPCclusters(0)) ){
5919       //        Error("PropagateBack","Not prolonged track %d",pt->GetLabel());
5920       //        FollowBackProlongation(*pt2,fInnerSec->GetNRows()+fOuterSec->GetNRows()-1);
5921       //}
5922     }
5923     if (pt&& pt->GetKinkIndex(0)>0) {
5924       AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(pt->GetKinkIndex(0)-1);
5925       pt->fFirstPoint = kink->GetTPCRow0();
5926       fSectors = fInnerSec;
5927       FollowBackProlongation(*pt,fInnerSec->GetNRows()+fOuterSec->GetNRows()-1);
5928     }
5929
5930   }
5931   return 0;
5932 }
5933
5934
5935 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateForward2(TObjArray * arr)
5936 {
5937   //
5938   // make forward propagation
5939   //
5940   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
5941   //
5942   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5943     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5944     if (pt) {
5945       FollowProlongation(*pt,0);
5946     }
5947   }
5948   return 0;
5949 }
5950
5951
5952 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateForward()
5953 {
5954   //
5955   // propagate track forward
5956   //UnsignClusters();
5957   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
5958   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5959     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
5960     if (pt){
5961       AliTPCseed &t = *pt;
5962       Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
5963       if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
5964       if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
5965       t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
5966     }
5967   }
5968
5969   fSectors = fOuterSec;
5970   ParallelTracking(fSeeds,fOuterSec->GetNRows()+fInnerSec->GetNRows()-1,fInnerSec->GetNRows());
5971   fSectors = fInnerSec;
5972   ParallelTracking(fSeeds,fInnerSec->GetNRows()-1,0);
5973   //WriteTracks();
5974   return 1;
5975 }
5976
5977
5978
5979
5980
5981
5982 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliTPCseed * pt, Int_t row0, Int_t row1)
5983 {
5984   //
5985   // make back propagation, in between row0 and row1
5986   //
5987
5988   if (pt) {
5989     fSectors = fInnerSec;
5990     Int_t  r1;
5991     //
5992     if (row1<fSectors->GetNRows())
5993       r1 = row1;
5994     else
5995       r1 = fSectors->GetNRows()-1;
5996
5997     if (row0<fSectors->GetNRows()&& r1>0 )
5998       FollowBackProlongation(*pt,r1);
5999     if (row1<=fSectors->GetNRows())
6000       return 0;
6001     //
6002     r1 = row1 - fSectors->GetNRows();
6003     if (r1<=0) return 0;
6004     if (r1>=fOuterSec->GetNRows()) return 0;
6005     fSectors = fOuterSec;
6006     return FollowBackProlongation(*pt,r1);
6007   }
6008   return 0;
6009 }
6010
6011
6012
6013
6014 void  AliTPCtrackerMI::GetShape(AliTPCseed * seed, Int_t row)
6015 {
6016   //
6017   //
6018   Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
6019   //  Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
6020   Float_t padlength =  GetPadPitchLength(row);
6021   //
6022   Float_t sresy = (seed->fSector < fParam->GetNSector()/2) ? 0.2 :0.3;
6023   Double_t angulary  = seed->GetSnp();
6024   angulary = angulary*angulary/(1-angulary*angulary);
6025   seed->fCurrentSigmaY2 = sd2+padlength*padlength*angulary/12.+sresy*sresy;
6026   //
6027   Float_t sresz = fParam->GetZSigma();
6028   Float_t angularz  = seed->GetTgl();
6029   seed->fCurrentSigmaZ2 = sd2+padlength*padlength*angularz*angularz*(1+angulary)/12.+sresz*sresz;
6030   /*
6031   Float_t wy = GetSigmaY(seed);
6032   Float_t wz = GetSigmaZ(seed);
6033   wy*=wy;
6034   wz*=wz;
6035   if (TMath::Abs(wy/seed->fCurrentSigmaY2-1)>0.0001 || TMath::Abs(wz/seed->fCurrentSigmaZ2-1)>0.0001 ){
6036     printf("problem\n");
6037   }
6038   */
6039 }
6040
6041
6042 Float_t  AliTPCtrackerMI::GetSigmaY(AliTPCseed * seed)
6043 {
6044   //
6045   //
6046   Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
6047   Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
6048   Float_t sres = (seed->fSector < fParam->GetNSector()/2) ? 0.2 :0.3;
6049   Float_t angular  = seed->GetSnp();
6050   angular = angular*angular/(1-angular*angular);
6051   //  angular*=angular;
6052   //angular  = TMath::Sqrt(angular/(1-angular));
6053   Float_t res = TMath::Sqrt(sd2+padlength*padlength*angular/12.+sres*sres);
6054   return res;
6055 }
6056 Float_t  AliTPCtrackerMI::GetSigmaZ(AliTPCseed * seed)
6057 {
6058   //
6059   //
6060   Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
6061   Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
6062   Float_t sres = fParam->GetZSigma();
6063   Float_t angular  = seed->GetTgl();
6064   Float_t res = TMath::Sqrt(sd2+padlength*padlength*angular*angular/12.+sres*sres);
6065   return res;
6066 }
6067
6068
6069 //__________________________________________________________________________
6070 void AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliKalmanTrack *tk, Float_t wrong) const {
6071   //--------------------------------------------------------------------
6072   //This function "cooks" a track label. If label<0, this track is fake.
6073   //--------------------------------------------------------------------
6074   AliTPCseed * t = (AliTPCseed*)tk;
6075   Int_t noc=t->GetNumberOfClusters();
6076   if (noc<10){
6077     //printf("\nnot founded prolongation\n\n\n");
6078     //t->Dump();
6079     return ;
6080   }
6081   Int_t lb[160];
6082   Int_t mx[160];
6083   AliTPCclusterMI *clusters[160];
6084   //
6085   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
6086     clusters[i]=0;
6087     lb[i]=mx[i]=0;
6088   }
6089
6090   Int_t i;
6091   Int_t current=0;
6092   for (i=0; i<160 && current<noc; i++) {
6093
6094      Int_t index=t->GetClusterIndex2(i);
6095      if (index<=0) continue;
6096      if (index&0x8000) continue;
6097      //
6098      //clusters[current]=GetClusterMI(index);
6099      if (t->fClusterPointer[i]){
6100        clusters[current]=t->fClusterPointer[i];
6101        current++;
6102      }
6103   }
6104   noc = current;
6105
6106   Int_t lab=123456789;
6107   for (i=0; i<noc; i++) {
6108     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6109     if (!c) continue;
6110     lab=TMath::Abs(c->GetLabel(0));
6111     Int_t j;
6112     for (j=0; j<noc; j++) if (lb[j]==lab || mx[j]==0) break;
6113     lb[j]=lab;
6114     (mx[j])++;
6115   }
6116
6117   Int_t max=0;
6118   for (i=0; i<noc; i++) if (mx[i]>max) {max=mx[i]; lab=lb[i];}
6119
6120   for (i=0; i<noc; i++) {
6121     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6122     if (!c) continue;
6123     if (TMath::Abs(c->GetLabel(1)) == lab ||
6124         TMath::Abs(c->GetLabel(2)) == lab ) max++;
6125   }
6126
6127   if ((1.- Float_t(max)/noc) > wrong) lab=-lab;
6128
6129   else {
6130      Int_t tail=Int_t(0.10*noc);
6131      max=0;
6132      Int_t ind=0;
6133      for (i=1; i<=160&&ind<tail; i++) {
6134        //       AliTPCclusterMI *c=clusters[noc-i];
6135        AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6136        if (!c) continue;
6137        if (lab == TMath::Abs(c->GetLabel(0)) ||
6138            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(1)) ||
6139            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(2))) max++;
6140        ind++;
6141      }
6142      if (max < Int_t(0.5*tail)) lab=-lab;
6143   }
6144
6145   t->SetLabel(lab);
6146
6147   //  delete[] lb;
6148   //delete[] mx;
6149   //delete[] clusters;
6150 }
6151
6152
6153 //__________________________________________________________________________
6154 Int_t AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliTPCseed *t, Float_t wrong,Int_t first, Int_t last) const {
6155   //--------------------------------------------------------------------
6156   //This function "cooks" a track label. If label<0, this track is fake.
6157   //--------------------------------------------------------------------
6158   Int_t noc=t->GetNumberOfClusters();
6159   if (noc<10){
6160     //printf("\nnot founded prolongation\n\n\n");
6161     //t->Dump();
6162     return -1;
6163   }
6164   Int_t lb[160];
6165   Int_t mx[160];
6166   AliTPCclusterMI *clusters[160];
6167   //
6168   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
6169     clusters[i]=0;
6170     lb[i]=mx[i]=0;
6171   }
6172
6173   Int_t i;
6174   Int_t current=0;
6175   for (i=0; i<160 && current<noc; i++) {
6176     if (i<first) continue;
6177     if (i>last)  continue;
6178      Int_t index=t->GetClusterIndex2(i);
6179      if (index<=0) continue;
6180      if (index&0x8000) continue;
6181      //
6182      //clusters[current]=GetClusterMI(index);
6183      if (t->fClusterPointer[i]){
6184        clusters[current]=t->fClusterPointer[i];
6185        current++;
6186      }
6187   }
6188   noc = current;
6189   if (noc<5) return -1;
6190   Int_t lab=123456789;
6191   for (i=0; i<noc; i++) {
6192     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6193     if (!c) continue;
6194     lab=TMath::Abs(c->GetLabel(0));
6195     Int_t j;
6196     for (j=0; j<noc; j++) if (lb[j]==lab || mx[j]==0) break;
6197     lb[j]=lab;
6198     (mx[j])++;
6199   }
6200
6201   Int_t max=0;
6202   for (i=0; i<noc; i++) if (mx[i]>max) {max=mx[i]; lab=lb[i];}
6203
6204   for (i=0; i<noc; i++) {
6205     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6206     if (!c) continue;
6207     if (TMath::Abs(c->GetLabel(1)) == lab ||
6208         TMath::Abs(c->GetLabel(2)) == lab ) max++;
6209   }
6210
6211   if ((1.- Float_t(max)/noc) > wrong) lab=-lab;
6212
6213   else {
6214      Int_t tail=Int_t(0.10*noc);
6215      max=0;
6216      Int_t ind=0;
6217      for (i=1; i<=160&&ind<tail; i++) {
6218        //       AliTPCclusterMI *c=clusters[noc-i];
6219        AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6220        if (!c) continue;
6221        if (lab == TMath::Abs(c->GetLabel(0)) ||
6222            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(1)) ||
6223            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(2))) max++;
6224        ind++;
6225      }
6226      if (max < Int_t(0.5*tail)) lab=-lab;
6227   }
6228
6229   //  t->SetLabel(lab);
6230   return lab;
6231   //  delete[] lb;
6232   //delete[] mx;
6233   //delete[] clusters;
6234 }
6235
6236
6237 Int_t  AliTPCtrackerMI::AliTPCSector::GetRowNumber(Double_t x) const
6238 {
6239   //return pad row number for this x
6240   Double_t r;
6241   if (fN < 64){
6242     r=fRow[fN-1].GetX();
6243     if (x > r) return fN;
6244     r=fRow[0].GetX();
6245     if (x < r) return -1;
6246     return Int_t((x-r)/fPadPitchLength + 0.5);}
6247   else{
6248     r=fRow[fN-1].GetX();
6249     if (x > r) return fN;
6250     r=fRow[0].GetX();
6251     if (x < r) return -1;
6252     Double_t r1=fRow[64].GetX();
6253     if(x<r1){
6254       return Int_t((x-r)/f1PadPitchLength + 0.5);}
6255     else{
6256       return (Int_t((x-r1)/f2PadPitchLength + 0.5)+64);}
6257   }
6258 }
6259
6260 Int_t  AliTPCtrackerMI::GetRowNumber(Double_t x[3]) const
6261 {
6262   //return pad row number for given x vector
6263   Float_t phi = TMath::ATan2(x[1],x[0]);
6264   if(phi<0) phi=2.*TMath::Pi()+phi;
6265   //  Get the local angle in the sector philoc
6266   const Float_t kRaddeg = 180/3.14159265358979312;
6267   Float_t phiangle   = (Int_t (phi*kRaddeg/20.) + 0.5)*20./kRaddeg;
6268   Double_t localx    = x[0]*TMath::Cos(phiangle)-x[1]*TMath::Sin(phiangle);
6269   return GetRowNumber(localx);
6270 }
6271
6272 //_________________________________________________________________________
6273 void AliTPCtrackerMI::AliTPCSector::Setup(const AliTPCParam *par, Int_t f) {
6274   //-----------------------------------------------------------------------
6275   // Setup inner sector
6276   //-----------------------------------------------------------------------
6277   if (f==0) {
6278      fAlpha=par->GetInnerAngle();
6279      fAlphaShift=par->GetInnerAngleShift();
6280      fPadPitchWidth=par->GetInnerPadPitchWidth();
6281      fPadPitchLength=par->GetInnerPadPitchLength();
6282      fN=par->GetNRowLow();
6283      fRow=new AliTPCRow[fN];
6284      for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
6285        fRow[i].SetX(par->GetPadRowRadiiLow(i));
6286        fRow[i].fDeadZone =1.5;  //1.5 cm of dead zone
6287      }
6288   } else {
6289      fAlpha=par->GetOuterAngle();
6290      fAlphaShift=par->GetOuterAngleShift();
6291      fPadPitchWidth  = par->GetOuterPadPitchWidth();
6292      fPadPitchLength = par->GetOuter1PadPitchLength();
6293      f1PadPitchLength = par->GetOuter1PadPitchLength();
6294      f2PadPitchLength = par->GetOuter2PadPitchLength();
6295
6296      fN=par->GetNRowUp();
6297      fRow=new AliTPCRow[fN];
6298      for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
6299        fRow[i].SetX(par->GetPadRowRadiiUp(i));
6300        fRow[i].fDeadZone =1.5;  // 1.5 cm of dead zone
6301      }
6302   }
6303 }
6304
6305 AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::AliTPCRow() {
6306   //
6307   // default constructor
6308   fN=0;
6309   fN1=0;
6310   fN2=0;
6311   fClusters1=0;
6312   fClusters2=0;
6313 }
6314
6315 AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::~AliTPCRow(){
6316   //
6317
6318 }
6319
6320
6321
6322 //_________________________________________________________________________
6323 void
6324 AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::InsertCluster(const AliTPCclusterMI* c, UInt_t index) {
6325   //-----------------------------------------------------------------------
6326   // Insert a cluster into this pad row in accordence with its y-coordinate
6327   //-----------------------------------------------------------------------
6328   if (fN==kMaxClusterPerRow) {
6329     cerr<<"AliTPCRow::InsertCluster(): Too many clusters !\n"; return;
6330   }
6331   if (fN==0) {fIndex[0]=index; fClusters[fN++]=c; return;}
6332   Int_t i=Find(c->GetZ());
6333   memmove(fClusters+i+1 ,fClusters+i,(fN-i)*sizeof(AliTPCclusterMI*));
6334   memmove(fIndex   +i+1 ,fIndex   +i,(fN-i)*sizeof(UInt_t));
6335   fIndex[i]=index; fClusters[i]=c; fN++;
6336 }
6337
6338 void AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::ResetClusters() {
6339    //
6340    // reset clusters
6341    fN  = 0;
6342    fN1 = 0;
6343    fN2 = 0;
6344    //delete[] fClusterArray;
6345    if (fClusters1) delete []fClusters1;
6346    if (fClusters2) delete []fClusters2;
6347    //fClusterArray=0;
6348    fClusters1 = 0;
6349    fClusters2 = 0;
6350 }
6351
6352
6353 //___________________________________________________________________
6354 Int_t AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::Find(Double_t z) const {
6355   //-----------------------------------------------------------------------
6356   // Return the index of the nearest cluster
6357   //-----------------------------------------------------------------------
6358   if (fN==0) return 0;
6359   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
6360   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
6361   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
6362   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
6363     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
6364     else e=m;
6365   }
6366   return m;
6367 }
6368
6369
6370
6371 //___________________________________________________________________
6372 AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz) const {
6373   //-----------------------------------------------------------------------
6374   // Return the index of the nearest cluster in z y
6375   //-----------------------------------------------------------------------
6376   Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
6377
6378   AliTPCclusterMI *cl =0;
6379   for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
6380       AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
6381       if (c->GetZ() > z+roadz) break;
6382       if ( (c->GetY()-y) >  roady ) continue;
6383       Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
6384       if (maxdistance>distance) {
6385         maxdistance = distance;
6386         cl=c;
6387       }
6388   }
6389   return cl;
6390 }
6391
6392 AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest2(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz,UInt_t & index) const
6393 {
6394   //-----------------------------------------------------------------------
6395   // Return the index of the nearest cluster in z y
6396   //-----------------------------------------------------------------------
6397   Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
6398   AliTPCclusterMI *cl =0;
6399
6400   //PH Check boundaries. 510 is the size of fFastCluster
6401   Int_t iz1 = Int_t(z-roadz+254.5);
6402   if (iz1<0 || iz1>=510) return cl;
6403   iz1 = TMath::Max(fFastCluster[iz1]-1,0);
6404   Int_t iz2 = Int_t(z+roadz+255.5);
6405   if (iz2<0 || iz2>=510) return cl;
6406   iz2 = TMath::Min(fFastCluster[iz2]+1,fN);
6407
6408   //FindNearest3(y,z,roady,roadz,index);
6409   //  for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
6410   for (Int_t i=iz1; i<iz2; i++) {
6411       AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
6412       if (c->GetZ() > z+roadz) break;
6413       if ( c->GetY()-y >  roady ) continue;
6414       if ( y-c->GetY() >  roady ) continue;
6415       Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
6416       if (maxdistance>distance) {
6417         maxdistance = distance;
6418         cl=c;
6419         index =i;
6420         //roady = TMath::Sqrt(maxdistance);
6421       }
6422   }
6423   return cl;
6424 }
6425
6426
6427
6428 AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest3(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz,UInt_t & index) const
6429 {
6430   //-----------------------------------------------------------------------
6431   // Return the index of the nearest cluster in z y
6432   //-----------------------------------------------------------------------
6433   Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
6434   //  Int_t iz = Int_t(z+255.);
6435   AliTPCclusterMI *cl =0;
6436   for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
6437     //for (Int_t i=fFastCluster[iz-2]; i<fFastCluster[iz+2]; i++) {
6438       AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
6439       if (c->GetZ() > z+roadz) break;
6440       if ( c->GetY()-y >  roady ) continue;
6441       if ( y-c->GetY() >  roady ) continue;
6442       Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
6443       if (maxdistance>distance) {
6444         maxdistance = distance;
6445         cl=c;
6446         index =i;
6447         //roady = TMath::Sqrt(maxdistance);
6448       }
6449   }
6450   return cl;
6451 }
6452
6453
6454
6455
6456
6457 // AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
6458 // {
6459 //   //
6460 //   //
6461 //   return &fTrackPoints[i];
6462 // }
6463
6464