TPC/AliTPCtrackerMI.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17 //-------------------------------------------------------
  18 //          Implementation of the TPC tracker
  19 //
  20 //   Origin: Marian Ivanov   Marian.Ivanov@cern.ch
  21 //
  22 //  AliTPC parallel tracker -
  23 //  How to use?  -
  24 //  run AliTPCFindClusters.C macro - clusters neccessary for tracker are founded
  25 //  run AliTPCFindTracksMI.C macro - to find tracks
  26 //  tracks are written to AliTPCtracks.root file
  27 //  for comparison also seeds are written to the same file - to special branch
  28 //-------------------------------------------------------
  29
  30
  31 /* $Id$ */
  32
  33 #include "Riostream.h"
  34 #include <TClonesArray.h>
  35 #include <TFile.h>
  36 #include <TObjArray.h>
  37 #include <TTree.h>
  38
  39 #include "AliComplexCluster.h"
  40 #include "AliESD.h"
  41 #include "AliESDkink.h"
  42 #include "AliHelix.h"
  43 #include "AliRunLoader.h"
  44 #include "AliTPCClustersRow.h"
  45 #include "AliTPCParam.h"
  46 #include "AliTPCReconstructor.h"
  47 #include "AliTPCclusterMI.h"
  48 #include "AliTPCpolyTrack.h"
  49 #include "AliTPCreco.h"
  50 #include "AliTPCseed.h"
  51 #include "AliTPCtrackerMI.h"
  52 #include "TStopwatch.h"
  53 #include "AliTPCReconstructor.h"
  54 #include "AliESDkink.h"
  55 #include "AliPID.h"
  56 #include "TTreeStream.h"
  57 #include "AliAlignObj.h"
  58 #include "AliTrackPointArray.h"
  59
  60 //
  61
  62 ClassImp(AliTPCtrackerMI)
  63
  64
  65 class AliTPCFastMath {
  66 public:
  67   AliTPCFastMath();
  68   static Double_t FastAsin(Double_t x);
  69  private:
  70   static Double_t fgFastAsin[20000];  //lookup table for fast asin computation
  71 };
  72
  73 Double_t AliTPCFastMath::fgFastAsin[20000];
  74 AliTPCFastMath gAliTPCFastMath; // needed to fill the LUT
  75
  76 AliTPCFastMath::AliTPCFastMath(){
  77   //
  78   // initialized lookup table;
  79   for (Int_t i=0;i<10000;i++){
  80     fgFastAsin[2*i] = TMath::ASin(i/10000.);
  81     fgFastAsin[2*i+1] = (TMath::ASin((i+1)/10000.)-fgFastAsin[2*i]);
  82   }
  83 }
  84
  85 Double_t AliTPCFastMath::FastAsin(Double_t x){
  86   //
  87   // return asin using lookup table
  88   if (x>0){
  89     Int_t index = int(x*10000);
  90     return fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1];
  91   }
  92   x*=-1;
  93   Int_t index = int(x*10000);
  94   return -(fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1]);
  95 }
  96
  97
  98
  99
 100 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateTrack(AliTPCseed * track, Int_t accept){
 101   //
 102   //update track information using current cluster - track->fCurrentCluster
 103
 104
 105   AliTPCclusterMI* c =track->fCurrentCluster;
 106   if (accept>0) track->fCurrentClusterIndex1 |=0x8000;  //sign not accepted clusters
 107
 108   UInt_t i = track->fCurrentClusterIndex1;
 109
 110   Int_t sec=(i&0xff000000)>>24;
 111   //Int_t row = (i&0x00ff0000)>>16;
 112   track->fRow=(i&0x00ff0000)>>16;
 113   track->fSector = sec;
 114   //  Int_t index = i&0xFFFF;
 115   if (sec>=fParam->GetNInnerSector()) track->fRow += fParam->GetNRowLow();
 116   track->SetClusterIndex2(track->fRow, i);
 117   //track->fFirstPoint = row;
 118   //if ( track->fLastPoint<row) track->fLastPoint =row;
 119   //  if (track->fRow<0 || track->fRow>160) {
 120   //  printf("problem\n");
 121   //}
 122   if (track->fFirstPoint>track->fRow)
 123     track->fFirstPoint = track->fRow;
 124   if (track->fLastPoint<track->fRow)
 125     track->fLastPoint  = track->fRow;
 126
 127
 128   track->fClusterPointer[track->fRow] = c;
 129   //
 130
 131   Float_t angle2 = track->GetSnp()*track->GetSnp();
 132   angle2 = TMath::Sqrt(angle2/(1-angle2));
 133   //
 134   //SET NEW Track Point
 135   //
 136   //  if (debug)
 137   {
 138     AliTPCTrackerPoint   &point =*(track->GetTrackPoint(track->fRow));
 139     //
 140     point.SetSigmaY(c->GetSigmaY2()/track->fCurrentSigmaY2);
 141     point.SetSigmaZ(c->GetSigmaZ2()/track->fCurrentSigmaZ2);
 142     point.SetErrY(sqrt(track->fErrorY2));
 143     point.SetErrZ(sqrt(track->fErrorZ2));
 144     //
 145     point.SetX(track->GetX());
 146     point.SetY(track->GetY());
 147     point.SetZ(track->GetZ());
 148     point.SetAngleY(angle2);
 149     point.SetAngleZ(track->GetTgl());
 150     if (point.fIsShared){
 151       track->fErrorY2 *= 4;
 152       track->fErrorZ2 *= 4;
 153     }
 154   }
 155
 156   Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2(track->fCurrentCluster);
 157   //
 158   track->fErrorY2 *= 1.3;
 159   track->fErrorY2 += 0.01;
 160   track->fErrorZ2 *= 1.3;
 161   track->fErrorZ2 += 0.005;
 162     //}
 163   if (accept>0) return 0;
 164   if (track->GetNumberOfClusters()%20==0){
 165     //    if (track->fHelixIn){
 166     //  TClonesArray & larr = *(track->fHelixIn);
 167     //  Int_t ihelix = larr.GetEntriesFast();
 168     //  new(larr[ihelix]) AliHelix(*track) ;
 169     //}
 170   }
 171   track->fNoCluster =0;
 172   return track->Update(c,chi2,i);
 173 }
 174
 175
 176
 177 Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluster, Float_t factor,
 178                                       Float_t cory, Float_t corz)
 179 {
 180   //
 181   // decide according desired precision to accept given
 182   // cluster for tracking
 183   Double_t sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
 184   Double_t sz2=ErrZ2(seed,cluster)*corz;
 185   //sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
 186   //sz2=ErrZ2(seed,cluster)*cory;
 187
 188   Double_t sdistancey2 = sy2+seed->GetSigmaY2();
 189   Double_t sdistancez2 = sz2+seed->GetSigmaZ2();
 190
 191   Double_t rdistancey2 = (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())*
 192     (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())/sdistancey2;
 193   Double_t rdistancez2 = (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())*
 194     (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())/sdistancez2;
 195
 196   Double_t rdistance2  = rdistancey2+rdistancez2;
 197   //Int_t  accept =0;
 198
 199   if (rdistance2>16) return 3;
 200
 201
 202   if ((rdistancey2>9.*factor || rdistancez2>9.*factor) && cluster->GetType()==0)
 203     return 2;  //suspisiouce - will be changed
 204
 205   if ((rdistancey2>6.25*factor || rdistancez2>6.25*factor) && cluster->GetType()>0)
 206     // strict cut on overlaped cluster
 207     return  2;  //suspisiouce - will be changed
 208
 209   if ( (rdistancey2>1.*factor || rdistancez2>6.25*factor )
 210        && cluster->GetType()<0){
 211     seed->fNFoundable--;
 212     return 2;
 213   }
 214   return 0;
 215 }
 216
 217
 218
 219
 220 //_____________________________________________________________________________
 221 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCParam *par):
 222 AliTracker(), fkNIS(par->GetNInnerSector()/2), fkNOS(par->GetNOuterSector()/2)
 223 {
 224   //---------------------------------------------------------------------
 225   // The main TPC tracker constructor
 226   //---------------------------------------------------------------------
 227   fInnerSec=new AliTPCSector[fkNIS];
 228   fOuterSec=new AliTPCSector[fkNOS];
 229
 230   Int_t i;
 231   for (i=0; i<fkNIS; i++) fInnerSec[i].Setup(par,0);
 232   for (i=0; i<fkNOS; i++) fOuterSec[i].Setup(par,1);
 233
 234   fN=0;  fSectors=0;
 235
 236   fSeeds=0;
 237   fNtracks = 0;
 238   fParam = par;
 239   Int_t nrowlow = par->GetNRowLow();
 240   Int_t nrowup = par->GetNRowUp();
 241
 242
 243   for (Int_t i=0;i<nrowlow;i++){
 244     fXRow[i]     = par->GetPadRowRadiiLow(i);
 245     fPadLength[i]= par->GetPadPitchLength(0,i);
 246     fYMax[i]     = fXRow[i]*TMath::Tan(0.5*par->GetInnerAngle());
 247   }
 248
 249
 250   for (Int_t i=0;i<nrowup;i++){
 251     fXRow[i+nrowlow]      = par->GetPadRowRadiiUp(i);
 252     fPadLength[i+nrowlow] = par->GetPadPitchLength(60,i);
 253     fYMax[i+nrowlow]      = fXRow[i+nrowlow]*TMath::Tan(0.5*par->GetOuterAngle());
 254   }
 255   fSeeds=0;
 256   //
 257   fInput    = 0;
 258   fOutput   = 0;
 259   fSeedTree = 0;
 260   fTreeDebug =0;
 261   fNewIO     =0;
 262   fDebug     =0;
 263   fEvent     =0;
 264   fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TPCdebug.root");
 265 }
 266 //________________________________________________________________________
 267 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCtrackerMI &t):
 268   AliTracker(t),
 269   fkNIS(t.fkNIS),
 270   fkNOS(t.fkNOS)
 271 {
 272   //------------------------------------
 273   // dummy copy constructor
 274   //------------------------------------------------------------------
 275 }
 276 AliTPCtrackerMI & AliTPCtrackerMI::operator=(const AliTPCtrackerMI& /*r*/){
 277   //------------------------------
 278   // dummy
 279   //--------------------------------------------------------------
 280   return *this;
 281 }
 282 //_____________________________________________________________________________
 283 AliTPCtrackerMI::~AliTPCtrackerMI() {
 284   //------------------------------------------------------------------
 285   // TPC tracker destructor
 286   //------------------------------------------------------------------
 287   delete[] fInnerSec;
 288   delete[] fOuterSec;
 289   if (fSeeds) {
 290     fSeeds->Delete();
 291     delete fSeeds;
 292   }
 293   if (fDebugStreamer) delete fDebugStreamer;
 294 }
 295
 296 void AliTPCtrackerMI::SetIO()
 297 {
 298   //
 299   fNewIO   =  kTRUE;
 300   fInput   =  AliRunLoader::GetTreeR("TPC", kFALSE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 301
 302   fOutput  =  AliRunLoader::GetTreeT("TPC", kTRUE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 303   if (fOutput){
 304     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 305     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 306     delete iotrack;
 307   }
 308 }
 309
 310
 311 void AliTPCtrackerMI::SetIO(TTree * input, TTree * output, AliESD * event)
 312 {
 313
 314   // set input
 315   fNewIO = kFALSE;
 316   fInput    = 0;
 317   fOutput   = 0;
 318   fSeedTree = 0;
 319   fTreeDebug =0;
 320   fInput = input;
 321   if (input==0){
 322     return;
 323   }
 324   //set output
 325   fOutput = output;
 326   if (output){
 327     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 328     //    iotrack->fHelixIn   = new TClonesArray("AliHelix");
 329     //iotrack->fHelixOut  = new TClonesArray("AliHelix");
 330     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 331     delete iotrack;
 332   }
 333   if (output && (fDebug&2)){
 334     //write the full seed information if specified in debug mode
 335     //
 336     fSeedTree =  new TTree("Seeds","Seeds");
 337     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
 338     //
 339     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
 340     arrtr->ExpandCreateFast(160);
 341     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
 342     //
 343     vseed->fPoints = arrtr;
 344     vseed->fEPoints = arre;
 345     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
 346     fSeedTree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
 347     delete arrtr;
 348     delete arre;
 349     fTreeDebug = new TTree("trackDebug","trackDebug");
 350     TClonesArray * arrd = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint2",0);
 351     fTreeDebug->Branch("debug",&arrd,32000,99);
 352   }
 353
 354
 355   //set ESD event
 356   fEvent  = event;
 357 }
 358
 359 void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
 360 {
 361   //
 362   //
 363   //fill esds using updated tracks
 364   if (fEvent){
 365     // write tracks to the event
 366     // store index of the track
 367     Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
 368     //FindKinks(arr,fEvent);
 369     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 370       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
 371       if (!pt) continue;
 372       pt->UpdatePoints();
 373       //      pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
 374       if (pt->GetKinkIndex(0)<=0){  //don't propagate daughter tracks
 375         pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
 376       }
 377
 378       if (( pt->GetPoints()[2]- pt->GetPoints()[0])>5 && pt->GetPoints()[3]>0.8){
 379         AliESDtrack iotrack;
 380         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 381         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 382         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 383         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 384         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 385         //iotrack.SetTPCindex(i);
 386         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 387         continue;
 388       }
 389
 390       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>70)&& (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.55) {
 391         AliESDtrack iotrack;
 392         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 393         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 394         //iotrack.SetTPCindex(i);
 395         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 396         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 397         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 398         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 399         continue;
 400       }
 401       //
 402       // short tracks  - maybe decays
 403
 404       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.70) {
 405         Int_t found,foundable,shared;
 406         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
 407         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2)){
 408           AliESDtrack iotrack;
 409           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 410           //iotrack.SetTPCindex(i);
 411           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 412           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 413           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 414           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 415           fEvent->AddTrack(&iotrack);
 416           continue;
 417         }
 418       }
 419
 420       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>20) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.8) {
 421         Int_t found,foundable,shared;
 422         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
 423         if (found<20) continue;
 424         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
 425         //
 426         AliESDtrack iotrack;
 427         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 428         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 429         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 430         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 431         //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 432         //iotrack.SetTPCindex(i);
 433         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 434         continue;
 435       }
 436       // short tracks  - secondaties
 437       //
 438       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) ) {
 439         Int_t found,foundable,shared;
 440         pt->GetClusterStatistic(128,158,found, foundable,shared,kFALSE);
 441         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2) &&float(found)/float(foundable)>0.8){
 442           AliESDtrack iotrack;
 443           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 444           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 445           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 446           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 447           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 448           //iotrack.SetTPCindex(i);
 449           fEvent->AddTrack(&iotrack);
 450           continue;
 451         }
 452       }
 453
 454       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>15)) {
 455         Int_t found,foundable,shared;
 456         pt->GetClusterStatistic(138,158,found, foundable,shared,kFALSE);
 457         if (found<15) continue;
 458         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
 459         if (float(found)/float(foundable)<0.8) continue;
 460         //
 461         AliESDtrack iotrack;
 462         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 463         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 464         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 465         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 466         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 467         //iotrack.SetTPCindex(i);
 468         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 469         continue;
 470       }
 471     }
 472   }
 473   printf("Number of filled ESDs-\t%d\n",fEvent->GetNumberOfTracks());
 474 }
 475
 476 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks(TTree * tree)
 477 {
 478   //
 479   // write tracks from seed array to selected tree
 480   //
 481   fOutput  = tree;
 482   if (fOutput){
 483     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 484     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 485   }
 486   WriteTracks();
 487 }
 488
 489 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks()
 490 {
 491   //
 492   // write tracks to the given output tree -
 493   // output specified with SetIO routine
 494   if (!fSeeds)  return;
 495   if (!fOutput){
 496     SetIO();
 497   }
 498
 499   if (fOutput){
 500     AliTPCtrack *iotrack= 0;
 501     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 502     //for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 503     //  iotrack= (AliTPCtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 504     //  if (iotrack) break;
 505     //}
 506     //TBranch * br = fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 507     TBranch * br = fOutput->GetBranch("tracks");
 508     br->SetAddress(&iotrack);
 509     //
 510     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 511       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 512       if (!pt) continue;
 513       AliTPCtrack * track = new AliTPCtrack(*pt);
 514       iotrack = track;
 515       pt->fLab2 =i;
 516       //      br->SetAddress(&iotrack);
 517       fOutput->Fill();
 518       delete track;
 519       iotrack =0;
 520     }
 521     //fOutput->GetDirectory()->cd();
 522     //fOutput->Write();
 523   }
 524   // delete iotrack;
 525   //
 526   if (fSeedTree){
 527     //write the full seed information if specified in debug mode
 528
 529     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
 530     //
 531     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
 532     arrtr->ExpandCreateFast(160);
 533     //TClonesArray * arrcl = new TClonesArray("AliTPCclusterMI",160);
 534     //arrcl->ExpandCreateFast(160);
 535     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
 536     //
 537     vseed->fPoints = arrtr;
 538     vseed->fEPoints = arre;
 539     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
 540     //TBranch * brseed = seedtree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
 541     TBranch * brseed = fSeedTree->GetBranch("seeds");
 542
 543     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 544
 545     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 546       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 547       if (!pt) continue;
 548       pt->fPoints = arrtr;
 549       //      pt->fClusterPoints = arrcl;
 550       pt->fEPoints       = arre;
 551       pt->RebuildSeed();
 552       vseed = pt;
 553       brseed->SetAddress(&vseed);
 554       fSeedTree->Fill();
 555       pt->fPoints  = 0;
 556       pt->fEPoints = 0;
 557       //      pt->fClusterPoints = 0;
 558     }
 559     fSeedTree->Write();
 560     if (fTreeDebug) fTreeDebug->Write();
 561   }
 562
 563 }
 564
 565
 566
 567
 568 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrY2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 569   //
 570   //
 571   //seed->SetErrorY2(0.1);
 572   //return 0.1;
 573   //calculate look-up table at the beginning
 574   static Bool_t  ginit = kFALSE;
 575   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
 576   static Float_t ggg1[10000];
 577   static Float_t ggg2[10000];
 578   static Float_t ggg3[10000];
 579   static Float_t glandau1[10000];
 580   static Float_t glandau2[10000];
 581   static Float_t glandau3[10000];
 582   //
 583   static Float_t gcor01[500];
 584   static Float_t gcor02[500];
 585   static Float_t gcorp[500];
 586   //
 587
 588   //
 589   if (ginit==kFALSE){
 590     for (Int_t i=1;i<500;i++){
 591       Float_t rsigma = float(i)/100.;
 592       gcor02[i] = TMath::Max(0.78 +TMath::Exp(7.4*(rsigma-1.2)),0.6);
 593       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(3.36*(rsigma-1.2)),0.6);
 594       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
 595     }
 596
 597     //
 598     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
 599       //
 600       //
 601       // inner sector
 602       Float_t amp = float(i);
 603       Float_t padlength =0.75;
 604       gnoise1 = 0.0004/padlength;
 605       Float_t nel     = 0.268*amp;
 606       Float_t nprim   = 0.155*amp;
 607       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 608       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 609       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
 610       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;
 611       //
 612       // outer short
 613       padlength =1.;
 614       gnoise2   = 0.0004/padlength;
 615       nel       = 0.3*amp;
 616       nprim     = 0.133*amp;
 617       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 618       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 619       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
 620       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
 621       //
 622       //
 623       // outer long
 624       padlength =1.5;
 625       gnoise3   = 0.0004/padlength;
 626       nel       = 0.3*amp;
 627       nprim     = 0.133*amp;
 628       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 629       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 630       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
 631       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
 632       //
 633     }
 634     ginit = kTRUE;
 635   }
 636   //
 637   //
 638   //
 639   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));
 640   if (amp>9999) {
 641     seed->SetErrorY2(1.);
 642     return 1.;
 643   }
 644   Float_t snoise2;
 645   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 646   Int_t ctype = cl->GetType();
 647   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
 648   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 649   angle2 = angle2/(1-angle2);
 650   //
 651   //cluster "quality"
 652   Int_t rsigmay = int(100.*cl->GetSigmaY2()/(seed->fCurrentSigmaY2));
 653   Float_t res;
 654   //
 655   if (fSectors==fInnerSec){
 656     snoise2 = gnoise1;
 657     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;
 658     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmay];
 659     if ((ctype>0)){
 660       res+=0.002;
 661       res*= gcorp[rsigmay];
 662     }
 663   }
 664   else {
 665     if (padlength<1.1){
 666       snoise2 = gnoise2;
 667       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2;
 668       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
 669       if ((ctype>0)){
 670         res+=0.002;
 671         res*= gcorp[rsigmay];
 672       }
 673     }
 674     else{
 675       snoise2 = gnoise3;
 676       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2;
 677       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
 678       if ((ctype>0)){
 679         res+=0.002;
 680         res*= gcorp[rsigmay];
 681       }
 682     }
 683   }
 684
 685   if (ctype<0){
 686     res+=0.005;
 687     res*=2.4;  // overestimate error 2 times
 688   }
 689   res+= snoise2;
 690
 691   if (res<2*snoise2)
 692     res = 2*snoise2;
 693
 694   seed->SetErrorY2(res);
 695   return res;
 696
 697
 698 }
 699
 700
 701
 702 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 703   //
 704   //
 705   //seed->SetErrorY2(0.1);
 706   //return 0.1;
 707   //calculate look-up table at the beginning
 708   static Bool_t  ginit = kFALSE;
 709   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
 710   static Float_t ggg1[10000];
 711   static Float_t ggg2[10000];
 712   static Float_t ggg3[10000];
 713   static Float_t glandau1[10000];
 714   static Float_t glandau2[10000];
 715   static Float_t glandau3[10000];
 716   //
 717   static Float_t gcor01[1000];
 718   static Float_t gcor02[1000];
 719   static Float_t gcorp[1000];
 720   //
 721
 722   //
 723   if (ginit==kFALSE){
 724     for (Int_t i=1;i<1000;i++){
 725       Float_t rsigma = float(i)/100.;
 726       gcor02[i] = TMath::Max(0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigma-1.2)),0.6);
 727       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigma-1.2)),0.6);
 728       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
 729     }
 730
 731     //
 732     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
 733       //
 734       //
 735       // inner sector
 736       Float_t amp = float(i);
 737       Float_t padlength =0.75;
 738       gnoise1 = 0.0004/padlength;
 739       Float_t nel     = 0.268*amp;
 740       Float_t nprim   = 0.155*amp;
 741       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 742       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 743       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
 744       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;
 745       //
 746       // outer short
 747       padlength =1.;
 748       gnoise2   = 0.0004/padlength;
 749       nel       = 0.3*amp;
 750       nprim     = 0.133*amp;
 751       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 752       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 753       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
 754       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
 755       //
 756       //
 757       // outer long
 758       padlength =1.5;
 759       gnoise3   = 0.0004/padlength;
 760       nel       = 0.3*amp;
 761       nprim     = 0.133*amp;
 762       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 763       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 764       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
 765       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
 766       //
 767     }
 768     ginit = kTRUE;
 769   }
 770   //
 771   //
 772   //
 773   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));
 774   if (amp>9999) {
 775     seed->SetErrorY2(1.);
 776     return 1.;
 777   }
 778   Float_t snoise2;
 779   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 780   Int_t ctype = cl->GetType();
 781   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
 782   //
 783   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 784   //  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
 785   angle2 = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1+angle2/(1-angle2));
 786   //
 787   //cluster "quality"
 788   Int_t rsigmaz = int(100.*cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2));
 789   Float_t res;
 790   //
 791   if (fSectors==fInnerSec){
 792     snoise2 = gnoise1;
 793     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;
 794     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmaz];
 795     if ((ctype>0)){
 796       res+=0.002;
 797       res*= gcorp[rsigmaz];
 798     }
 799   }
 800   else {
 801     if (padlength<1.1){
 802       snoise2 = gnoise2;
 803       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2;
 804       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
 805       if ((ctype>0)){
 806         res+=0.002;
 807         res*= gcorp[rsigmaz];
 808       }
 809     }
 810     else{
 811       snoise2 = gnoise3;
 812       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2;
 813       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
 814       if ((ctype>0)){
 815         res+=0.002;
 816         res*= gcorp[rsigmaz];
 817       }
 818     }
 819   }
 820
 821   if (ctype<0){
 822     res+=0.002;
 823     res*=1.3;
 824   }
 825   if ((ctype<0) &&amp<70){
 826     res+=0.002;
 827     res*=1.3;
 828   }
 829   res += snoise2;
 830   if (res<2*snoise2)
 831      res = 2*snoise2;
 832   if (res>3) res =3;
 833   seed->SetErrorZ2(res);
 834   return res;
 835 }
 836
 837
 838
 839 /*
 840 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 841   //
 842   //
 843   //seed->SetErrorZ2(0.1);
 844   //return 0.1;
 845
 846   Float_t snoise2;
 847   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 848   //
 849   Float_t rsigmaz = cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2);
 850   Int_t ctype = cl->GetType();
 851   Float_t amp = TMath::Abs(cl->GetQ());
 852
 853   Float_t nel;
 854   Float_t nprim;
 855   //
 856   Float_t landau=2 ;    //landau fluctuation part
 857   Float_t gg=2;         // gg fluctuation part
 858   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetX());
 859
 860   if (fSectors==fInnerSec){
 861     snoise2 = 0.0004/padlength;
 862     nel     = 0.268*amp;
 863     nprim   = 0.155*amp;
 864     gg      = (2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 865     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 866     if (landau>1) landau=1;
 867   }
 868   else {
 869     snoise2 = 0.0004/padlength;
 870     nel     = 0.3*amp;
 871     nprim   = 0.133*amp;
 872     gg      = (2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 873     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 874     if (landau>1) landau=1;
 875   }
 876   Float_t sdiff = gg*fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*z;
 877
 878   //
 879   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 880   angle2 = TMath::Sqrt((1-angle2));
 881   if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
 882   //angle2 = 1;
 883
 884   Float_t angle = seed->GetTgl()/angle2;
 885   Float_t angular = landau*angle*angle*padlength*padlength/12.;
 886   Float_t res = sdiff + angular;
 887
 888
 889   if ((ctype==0) && (fSectors ==fOuterSec))
 890     res *= 0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigmaz-1.2));
 891
 892   if ((ctype==0) && (fSectors ==fInnerSec))
 893     res *= 0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigmaz-1.2));
 894
 895   if ((ctype>0)){
 896     res+=0.005;
 897     res*= TMath::Power(rsigmaz+0.5,1.5);  //0.31+0.147*ctype;
 898   }
 899   if (ctype<0){
 900     res+=0.002;
 901     res*=1.3;
 902   }
 903   if ((ctype<0) &&amp<70){
 904     res+=0.002;
 905     res*=1.3;
 906   }
 907   res += snoise2;
 908   if (res<2*snoise2)
 909      res = 2*snoise2;
 910
 911   seed->SetErrorZ2(res);
 912   return res;
 913 }
 914 */
 915
 916
 917
 918
 919 void AliTPCtrackerMI::RotateToLocal(AliTPCseed *seed)
 920 {
 921   //rotate to track "local coordinata
 922   Float_t x = seed->GetX();
 923   Float_t y = seed->GetY();
 924   Float_t ymax = x*TMath::Tan(0.5*fSectors->GetAlpha());
 925
 926   if (y > ymax) {
 927     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector+1) % fN;
 928     if (!seed->Rotate(fSectors->GetAlpha()))
 929       return;
 930   } else if (y <-ymax) {
 931     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector-1+fN) % fN;
 932     if (!seed->Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
 933       return;
 934   }
 935
 936 }
 937
 938
 939
 940 //_____________________________________________________________________________
 941 Double_t AliTPCtrackerMI::F1old(Double_t x1,Double_t y1,
 942                    Double_t x2,Double_t y2,
 943                    Double_t x3,Double_t y3)
 944 {
 945   //-----------------------------------------------------------------
 946   // Initial approximation of the track curvature
 947   //-----------------------------------------------------------------
 948   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
 949   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
 950                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
 951   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
 952                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
 953
 954   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
 955   if ( xr*xr+yr*yr<=0.00000000000001) return 100;
 956   return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
 957 }
 958
 959
 960
 961 //_____________________________________________________________________________
 962 Double_t AliTPCtrackerMI::F1(Double_t x1,Double_t y1,
 963                    Double_t x2,Double_t y2,
 964                    Double_t x3,Double_t y3)
 965 {
 966   //-----------------------------------------------------------------
 967   // Initial approximation of the track curvature
 968   //-----------------------------------------------------------------
 969   x3 -=x1;
 970   x2 -=x1;
 971   y3 -=y1;
 972   y2 -=y1;
 973   //
 974   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
 975   if (det==0) {
 976     return 100;
 977   }
 978   //
 979   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
 980   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
 981   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
 982   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
 983   if (det<0) c2*=-1;
 984   return c2;
 985 }
 986
 987
 988 Double_t AliTPCtrackerMI::F2(Double_t x1,Double_t y1,
 989                    Double_t x2,Double_t y2,
 990                    Double_t x3,Double_t y3)
 991 {
 992   //-----------------------------------------------------------------
 993   // Initial approximation of the track curvature
 994   //-----------------------------------------------------------------
 995   x3 -=x1;
 996   x2 -=x1;
 997   y3 -=y1;
 998   y2 -=y1;
 999   //
1000   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
1001   if (det==0) {
1002     return 100;
1003   }
1004   //
1005   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
1006   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
1007   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
1008   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
1009   if (det<0) c2*=-1;
1010   x0+=x1;
1011   x0*=c2;
1012   return x0;
1013 }
1014
1015
1016
1017 //_____________________________________________________________________________
1018 Double_t AliTPCtrackerMI::F2old(Double_t x1,Double_t y1,
1019                    Double_t x2,Double_t y2,
1020                    Double_t x3,Double_t y3)
1021 {
1022   //-----------------------------------------------------------------
1023   // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
1024   //-----------------------------------------------------------------
1025   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
1026   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
1027                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
1028   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
1029                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
1030
1031   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
1032
1033   return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
1034 }
1035
1036 //_____________________________________________________________________________
1037 Double_t AliTPCtrackerMI::F3(Double_t x1,Double_t y1,
1038                    Double_t x2,Double_t y2,
1039                    Double_t z1,Double_t z2)
1040 {
1041   //-----------------------------------------------------------------
1042   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1043   //-----------------------------------------------------------------
1044   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1045 }
1046
1047
1048 Double_t AliTPCtrackerMI::F3n(Double_t x1,Double_t y1,
1049                    Double_t x2,Double_t y2,
1050                    Double_t z1,Double_t z2, Double_t c)
1051 {
1052   //-----------------------------------------------------------------
1053   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1054   //-----------------------------------------------------------------
1055
1056   //  Double_t angle1;
1057
1058   //angle1    =  (z1-z2)*c/(TMath::ASin(c*x1-ni)-TMath::ASin(c*x2-ni));
1059   //
1060   Double_t d  =  TMath::Sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1061   if (TMath::Abs(d*c*0.5)>1) return 0;
1062   //  Double_t   angle2    =  TMath::ASin(d*c*0.5);
1063   //  Double_t   angle2    =  AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1064   Double_t   angle2    = (d*c*0.5>0.1)? TMath::ASin(d*c*0.5): AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1065
1066   angle2  = (z1-z2)*c/(angle2*2.);
1067   return angle2;
1068 }
1069
1070 Bool_t   AliTPCtrackerMI::GetProlongation(Double_t x1, Double_t x2, Double_t x[5], Double_t &y, Double_t &z)
1071 {//-----------------------------------------------------------------
1072   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=x2.
1073   //-----------------------------------------------------------------
1074
1075   Double_t dx=x2-x1;
1076
1077   if (TMath::Abs(x[4]*x1 - x[2]) >= 0.999) {
1078     return kFALSE;
1079   }
1080
1081   Double_t c1=x[4]*x1 - x[2], r1=sqrt(1.- c1*c1);
1082   Double_t c2=x[4]*x2 - x[2], r2=sqrt(1.- c2*c2);
1083   y = x[0];
1084   z = x[1];
1085
1086   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
1087   Double_t dz = 0;
1088   //
1089   Double_t delta = x[4]*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
1090
1091   if (TMath::Abs(delta)>0.01){
1092     dz = x[3]*TMath::ASin(delta)/x[4];
1093   }else{
1094     dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1095   }
1096
1097   //dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1098
1099   y+=dy;
1100   z+=dz;
1101
1102   return kTRUE;
1103 }
1104
1105 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters (TTree *tree)
1106 {
1107   //
1108   //
1109   fInput = tree;
1110   return LoadClusters();
1111 }
1112
1113 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
1114 {
1115   //
1116   // load clusters to the memory
1117   AliTPCClustersRow *clrow= new AliTPCClustersRow;
1118   clrow->SetClass("AliTPCclusterMI");
1119   clrow->SetArray(0);
1120   clrow->GetArray()->ExpandCreateFast(10000);
1121   //
1122   //  TTree * tree = fClustersArray.GetTree();
1123
1124   TTree * tree = fInput;
1125   TBranch * br = tree->GetBranch("Segment");
1126   br->SetAddress(&clrow);
1127   //
1128   Int_t j=Int_t(tree->GetEntries());
1129   for (Int_t i=0; i<j; i++) {
1130     br->GetEntry(i);
1131     //
1132     Int_t sec,row;
1133     fParam->AdjustSectorRow(clrow->GetID(),sec,row);
1134     //
1135     AliTPCRow * tpcrow=0;
1136     Int_t left=0;
1137     if (sec<fkNIS*2){
1138       tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1139       left = sec/fkNIS;
1140     }
1141     else{
1142       tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1143       left = (sec-fkNIS*2)/fkNOS;
1144     }
1145     if (left ==0){
1146       tpcrow->fN1 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1147       tpcrow->fClusters1 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN1];
1148       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN1;i++)
1149         tpcrow->fClusters1[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1150     }
1151     if (left ==1){
1152       tpcrow->fN2 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1153       tpcrow->fClusters2 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN2];
1154       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN2;i++)
1155         tpcrow->fClusters2[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1156     }
1157   }
1158   //
1159   delete clrow;
1160   LoadOuterSectors();
1161   LoadInnerSectors();
1162   return 0;
1163 }
1164
1165
1166 void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
1167 {
1168   //
1169   // unload clusters from the memory
1170   //
1171   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1172   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1173     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1174       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1175       //      if (tpcrow){
1176       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1;
1177       //        if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2;
1178       //}
1179       tpcrow->ResetClusters();
1180     }
1181   //
1182   nrows = fInnerSec->GetNRows();
1183   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1184     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1185       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1186       //if (tpcrow){
1187       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1;
1188       //if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2;
1189       //}
1190       tpcrow->ResetClusters();
1191     }
1192
1193   return ;
1194 }
1195
1196
1197 //_____________________________________________________________________________
1198 Int_t AliTPCtrackerMI::LoadOuterSectors() {
1199   //-----------------------------------------------------------------
1200   // This function fills outer TPC sectors with clusters.
1201   //-----------------------------------------------------------------
1202   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1203   UInt_t index=0;
1204   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1205     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1206       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1207       Int_t sec2 = sec+2*fkNIS;
1208       //left
1209       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1210       while (ncl--) {
1211         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1212         index=(((sec2<<8)+row)<<16)+ncl;
1213         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1214       }
1215       //right
1216       ncl = tpcrow->fN2;
1217       while (ncl--) {
1218         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1219         index=((((sec2+fkNOS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1220         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1221       }
1222       //
1223       // write indexes for fast acces
1224       //
1225       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1226         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1227       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1228         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1229         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1230       }
1231       Int_t last = 0;
1232       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1233         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1234           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1235         else
1236           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1237       }
1238     }
1239   fN=fkNOS;
1240   fSectors=fOuterSec;
1241   return 0;
1242 }
1243
1244
1245 //_____________________________________________________________________________
1246 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadInnerSectors() {
1247   //-----------------------------------------------------------------
1248   // This function fills inner TPC sectors with clusters.
1249   //-----------------------------------------------------------------
1250   Int_t nrows = fInnerSec->GetNRows();
1251   UInt_t index=0;
1252   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1253     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1254       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1255       //
1256       //left
1257       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1258       while (ncl--) {
1259         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1260         index=(((sec<<8)+row)<<16)+ncl;
1261         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1262       }
1263       //right
1264       ncl = tpcrow->fN2;
1265       while (ncl--) {
1266         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1267         index=((((sec+fkNIS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1268         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1269       }
1270       //
1271       // write indexes for fast acces
1272       //
1273       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1274         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1275       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1276         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1277         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1278       }
1279       Int_t last = 0;
1280       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1281         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1282           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1283         else
1284           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1285       }
1286
1287     }
1288
1289   fN=fkNIS;
1290   fSectors=fInnerSec;
1291   return 0;
1292 }
1293
1294
1295
1296 //_________________________________________________________________________
1297 AliTPCclusterMI *AliTPCtrackerMI::GetClusterMI(Int_t index) const {
1298   //--------------------------------------------------------------------
1299   //       Return pointer to a given cluster
1300   //--------------------------------------------------------------------
1301   Int_t sec=(index&0xff000000)>>24;
1302   Int_t row=(index&0x00ff0000)>>16;
1303   Int_t ncl=(index&0x00007fff)>>00;
1304
1305   const AliTPCRow * tpcrow=0;
1306   AliTPCclusterMI * clrow =0;
1307
1308   if (sec<fkNIS*2){
1309     tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1310     if (tpcrow==0) return 0;
1311
1312     if (sec<fkNIS) {
1313       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1314       clrow = tpcrow->fClusters1;
1315     }
1316     else {
1317       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1318       clrow = tpcrow->fClusters2;
1319     }
1320   }
1321   else {
1322     tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1323     if (tpcrow==0) return 0;
1324
1325     if (sec-2*fkNIS<fkNOS) {
1326       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1327       clrow = tpcrow->fClusters1;
1328     }
1329     else {
1330       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1331       clrow = tpcrow->fClusters2;
1332     }
1333   }
1334
1335   return &(clrow[ncl]);
1336
1337 }
1338
1339
1340
1341 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1342   //-----------------------------------------------------------------
1343   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1344   //-----------------------------------------------------------------
1345   //
1346   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1347   AliTPCclusterMI *cl=0;
1348   Int_t tpcindex= t.GetClusterIndex2(nr);
1349   //
1350   // update current shape info every 5 pad-row
1351   //  if ( (nr%5==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1352     GetShape(&t,nr);
1353     //}
1354   //
1355   if (fIteration>0 && tpcindex>=-1){  //if we have already clusters
1356     //
1357     if (tpcindex==-1) return 0; //track in dead zone
1358     if (tpcindex>0){     //
1359       cl = t.fClusterPointer[nr];
1360       if ( (cl==0) ) cl = GetClusterMI(tpcindex);
1361       t.fCurrentClusterIndex1 = tpcindex;
1362     }
1363     if (cl){
1364       Int_t relativesector = ((tpcindex&0xff000000)>>24)%18;  // if previously accepted cluster in different sector
1365       Float_t angle = relativesector*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift();
1366       //
1367       if (angle<-TMath::Pi()) angle += 2*TMath::Pi();
1368       if (angle>=TMath::Pi()) angle -= 2*TMath::Pi();
1369
1370       if (TMath::Abs(angle-t.GetAlpha())>0.001){
1371         Double_t rotation = angle-t.GetAlpha();
1372         t.fRelativeSector= relativesector;
1373         t.Rotate(rotation);
1374       }
1375       t.PropagateTo(x);
1376       //
1377       t.fCurrentCluster = cl;
1378       t.fRow = nr;
1379       Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1380       if ((tpcindex&0x8000)==0) accept =0;
1381       if (accept<3) {
1382         //if founded cluster is acceptible
1383         if (cl->IsUsed(11)) {  // id cluster is shared inrease uncertainty
1384           t.fErrorY2 += 0.03;
1385           t.fErrorZ2 += 0.03;
1386           t.fErrorY2 *= 3;
1387           t.fErrorZ2 *= 3;
1388         }
1389         t.fNFoundable++;
1390         UpdateTrack(&t,accept);
1391         return 1;
1392       }
1393     }
1394   }
1395   if (fIteration>1) {t.fNFoundable++; return 0;}  // not look for new cluster during refitting
1396   //
1397   UInt_t index=0;
1398   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95 || TMath::Abs(x*t.GetC()-t.GetEta())>0.95) return 0;
1399   Double_t  y=t.GetYat(x);
1400   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1401     if (y > ymax) {
1402       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1403       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1404         return 0;
1405     } else if (y <-ymax) {
1406       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1407       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1408         return 0;
1409     }
1410     //return 1;
1411   }
1412   //
1413   if (!t.PropagateTo(x)) {
1414     if (fIteration==0) t.fRemoval = 10;
1415     return 0;
1416   }
1417   y=t.GetY();
1418   Double_t z=t.GetZ();
1419   //
1420   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1421   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1422   Double_t  roady  =1.;
1423   Double_t  roadz = 1.;
1424   //
1425   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1426     t.fInDead = kTRUE;
1427     t.SetClusterIndex2(nr,-1);
1428     return 0;
1429   }
1430   else
1431     {
1432       if (TMath::Abs(z)<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10) && TMath::Abs(z)<fParam->GetZLength() ) t.fNFoundable++;
1433       else
1434         return 0;
1435     }
1436   //calculate
1437   if (krow) {
1438     //    cl = krow.FindNearest2(y+10.,z,roady,roadz,index);
1439     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);
1440     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);
1441   }
1442   if (cl) {
1443     t.fCurrentCluster = cl;
1444     t.fRow = nr;
1445     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(10)) return 0;
1446     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1447     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(11)) {
1448       t.fErrorY2 += 0.03;
1449       t.fErrorZ2 += 0.03;
1450       t.fErrorY2 *= 3;
1451       t.fErrorZ2 *= 3;
1452     }
1453     /*
1454     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1455       //
1456       //
1457
1458       t.fNShared++;
1459       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1460         t.fRemoval =10;
1461         return 0;
1462       }
1463     }
1464     */
1465     if (accept<3) UpdateTrack(&t,accept);
1466
1467   } else {
1468     if ( fIteration==0 && t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) t.fRemoval=10;
1469
1470   }
1471   return 1;
1472 }
1473
1474 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1475   //-----------------------------------------------------------------
1476   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1477   //-----------------------------------------------------------------
1478   //
1479   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1480   Double_t y,z;
1481   if (!t.GetProlongation(x,y,z)) {
1482     t.fRemoval = 10;
1483     return 0;
1484   }
1485   //
1486   //
1487   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1488
1489     if (y > ymax) {
1490       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1491       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1492         return 0;
1493     } else if (y <-ymax) {
1494       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1495       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1496         return 0;
1497     }
1498     if (!t.PropagateTo(x)) {
1499       return 0;
1500     }
1501     t.GetProlongation(x,y,z);
1502   }
1503   //
1504   // update current shape info every 3 pad-row
1505   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1506     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1507     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1508     GetShape(&t,nr);
1509   }
1510   //
1511   AliTPCclusterMI *cl=0;
1512   UInt_t index=0;
1513
1514
1515   //Int_t nr2 = nr;
1516   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1517   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1518   Double_t  roady  =1.;
1519   Double_t  roadz = 1.;
1520   //
1521   Int_t row = nr;
1522   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1523     t.fInDead = kTRUE;
1524     t.SetClusterIndex2(row,-1);
1525     return 0;
1526   }
1527   else
1528     {
1529       if (TMath::Abs(z)>(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10)) t.SetClusterIndex2(row,-1);
1530     }
1531   //calculate
1532
1533   if ((cl==0)&&(krow)) {
1534     //    cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,index);
1535     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);
1536
1537     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);
1538   }
1539
1540   if (cl) {
1541     t.fCurrentCluster = cl;
1542     //    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1543     //if (accept<3){
1544       t.SetClusterIndex2(row,index);
1545       t.fClusterPointer[row] = cl;
1546       //}
1547   }
1548   return 1;
1549 }
1550
1551
1552
1553 //_________________________________________________________________________
1554 Bool_t AliTPCtrackerMI::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint &p ) const
1555 {
1556   // Get track space point by index
1557   // return false in case the cluster doesn't exist
1558   AliTPCclusterMI *cl = GetClusterMI(index);
1559   if (!cl) return kFALSE;
1560   Int_t sector = (index&0xff000000)>>24;
1561   Int_t row = (index&0x00ff0000)>>16;
1562   Float_t xyz[3];
1563   xyz[0] = fParam->GetPadRowRadii(sector,row);
1564   xyz[1] = cl->GetY();
1565   xyz[2] = cl->GetZ();
1566   Float_t sin,cos;
1567   fParam->AdjustCosSin(sector,cos,sin);
1568   Float_t x = cos*xyz[0]-sin*xyz[1];
1569   Float_t y = cos*xyz[1]+sin*xyz[0];
1570   Float_t cov[6];
1571   Float_t sigmaY2 = 0.027*cl->GetSigmaY2();
1572   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaY2 *= 2.07;
1573   Float_t sigmaZ2 = 0.066*cl->GetSigmaZ2();
1574   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaZ2 *= 1.77;
1575   cov[0] = sin*sin*sigmaY2;
1576   cov[1] = -sin*cos*sigmaY2;
1577   cov[2] = 0.;
1578   cov[3] = cos*cos*sigmaY2;
1579   cov[4] = 0.;
1580   cov[5] = sigmaZ2;
1581   p.SetXYZ(x,y,xyz[2],cov);
1582   AliAlignObj::ELayerID iLayer;
1583   Int_t idet;
1584   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) {
1585     iLayer = AliAlignObj::kTPC1;
1586     idet = sector;
1587   }
1588   else {
1589     iLayer = AliAlignObj::kTPC2;
1590     idet = sector - fParam->GetNInnerSector();
1591   }
1592   UShort_t volid = AliAlignObj::LayerToVolUID(iLayer,idet);
1593   p.SetVolumeID(volid);
1594   return kTRUE;
1595 }
1596
1597
1598
1599 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateClusters(AliTPCseed& t,  Int_t nr) {
1600   //-----------------------------------------------------------------
1601   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1602   //-----------------------------------------------------------------
1603   t.fCurrentCluster  = 0;
1604   t.fCurrentClusterIndex1 = 0;
1605
1606   Double_t xt=t.GetX();
1607   Int_t     row = GetRowNumber(xt)-1;
1608   Double_t  ymax= GetMaxY(nr);
1609
1610   if (row < nr) return 1; // don't prolongate if not information until now -
1611   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.9 && t.GetNumberOfClusters()>40. && fIteration!=2) {
1612     t.fRemoval =10;
1613     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1614   }
1615   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95) {
1616     t.fRemoval =10;
1617     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1618   }
1619
1620   Double_t x= GetXrow(nr);
1621   Double_t y,z;
1622   //t.PropagateTo(x+0.02);
1623   //t.PropagateTo(x+0.01);
1624   if (!t.PropagateTo(x)){
1625     return 0;
1626   }
1627   //
1628   y=t.GetY();
1629   z=t.GetZ();
1630
1631   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1632     if (y > ymax) {
1633       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1634       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1635         return 0;
1636     } else if (y <-ymax) {
1637       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1638       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1639         return 0;
1640     }
1641     //    if (!t.PropagateTo(x)){
1642     //  return 0;
1643     //}
1644     return 1;
1645     //y = t.GetY();
1646   }
1647   //
1648
1649   AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1650
1651   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1652     t.fInDead = kTRUE;
1653     t.SetClusterIndex2(nr,-1);
1654     return 0;
1655   }
1656   else
1657     {
1658       if (TMath::Abs(t.GetZ())<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*t.GetX()+10)) t.fNFoundable++;
1659       else
1660         return 0;
1661     }
1662
1663   // update current
1664   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2){
1665     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1666     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1667     GetShape(&t,nr);
1668   }
1669
1670   AliTPCclusterMI *cl=0;
1671   Int_t index=0;
1672   //
1673   Double_t roady = 1.;
1674   Double_t roadz = 1.;
1675   //
1676
1677   if (!cl){
1678     index = t.GetClusterIndex2(nr);
1679     if ( (index>0) && (index&0x8000)==0){
1680       cl = t.fClusterPointer[nr];
1681       if ( (cl==0) && (index>0)) cl = GetClusterMI(index);
1682       t.fCurrentClusterIndex1 = index;
1683       if (cl) {
1684         t.fCurrentCluster  = cl;
1685         return 1;
1686       }
1687     }
1688   }
1689
1690   //  if (index<0) return 0;
1691   UInt_t uindex = TMath::Abs(index);
1692
1693   if (krow) {
1694     //cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,uindex);
1695     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,uindex);
1696   }
1697
1698   if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(uindex);
1699   t.fCurrentCluster  = cl;
1700
1701   return 1;
1702 }
1703
1704
1705 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextCluster(AliTPCseed & t, Int_t nr) {
1706   //-----------------------------------------------------------------
1707   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1708   //-----------------------------------------------------------------
1709
1710   //update error according neighborhoud
1711
1712   if (t.fCurrentCluster) {
1713     t.fRow = nr;
1714     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1715
1716     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1717       //
1718       //
1719       //  t.fErrorZ2*=2;
1720       //  t.fErrorY2*=2;
1721       t.fNShared++;
1722       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1723         t.fRemoval =10;
1724         return 0;
1725       }
1726     }
1727     if (fIteration>0) accept = 0;
1728     if (accept<3)  UpdateTrack(&t,accept);
1729
1730   } else {
1731     if (fIteration==0){
1732       if ( ( (t.GetSigmaY2()+t.GetSigmaZ2())>0.16)&& t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;
1733       if (  t.GetChi2()/t.GetNumberOfClusters()>6 &&t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;
1734
1735       if (( (t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) || t.fNoCluster>15)) t.fRemoval=10;
1736     }
1737   }
1738   return 1;
1739 }
1740
1741
1742
1743 //_____________________________________________________________________________
1744 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1745   //-----------------------------------------------------------------
1746   // This function tries to find a track prolongation.
1747   //-----------------------------------------------------------------
1748   Double_t xt=t.GetX();
1749   //
1750   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1751   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1752   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1753   //
1754   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1755
1756   Int_t first = GetRowNumber(xt)-1;
1757   for (Int_t nr= first; nr>=rf; nr-=step) {
1758     // update kink info
1759     if (t.GetKinkIndexes()[0]>0){
1760       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1761         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1762         if (index==0) break;
1763         if (index<0) continue;
1764         //
1765         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1766         if (!kink){
1767           printf("PROBLEM\n");
1768         }
1769         else{
1770           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()+2+Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1771           if (kinkrow==nr){
1772             AliExternalTrackParam paramd(t);
1773             kink->SetDaughter(paramd);
1774             kink->SetStatus(2,5);
1775             kink->Update();
1776           }
1777         }
1778       }
1779     }
1780
1781     if (nr==80) t.UpdateReference();
1782     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
1783       fSectors = fInnerSec;
1784     else
1785       fSectors = fOuterSec;
1786     if (FollowToNext(t,nr)==0)
1787       if (!t.IsActive())
1788         return 0;
1789
1790   }
1791   return 1;
1792 }
1793
1794
1795 //_____________________________________________________________________________
1796 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongationFast(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1797   //-----------------------------------------------------------------
1798   // This function tries to find a track prolongation.
1799   //-----------------------------------------------------------------
1800   Double_t xt=t.GetX();
1801   //
1802   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1803   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1804   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1805   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1806
1807   for (Int_t nr=GetRowNumber(xt)-1; nr>=rf; nr-=step) {
1808
1809     if (FollowToNextFast(t,nr)==0)
1810       if (!t.IsActive()) return 0;
1811
1812   }
1813   return 1;
1814 }
1815
1816
1817
1818
1819
1820 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowBackProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf) {
1821   //-----------------------------------------------------------------
1822   // This function tries to find a track prolongation.
1823   //-----------------------------------------------------------------
1824   //
1825   Double_t xt=t.GetX();
1826   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1827   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1828   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1829   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1830
1831   Int_t first = t.fFirstPoint;
1832   if (first<GetRowNumber(xt)+1) first = GetRowNumber(xt)+1;
1833   //
1834   if (first<0) first=0;
1835   for (Int_t nr=first; nr<=rf; nr++) {
1836     if ( (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95)) break;
1837     if (t.GetKinkIndexes()[0]<0){
1838       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1839         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1840         if (index==0) break;
1841         if (index>0) continue;
1842         index = TMath::Abs(index);
1843         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1844         if (!kink){
1845           printf("PROBLEM\n");
1846         }
1847         else{
1848           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()-2-Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1849           if (kinkrow==nr){
1850             AliExternalTrackParam paramm(t);
1851             kink->SetMother(paramm);
1852             kink->SetStatus(2,1);
1853             kink->Update();
1854           }
1855         }
1856       }
1857     }
1858     //
1859     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
1860       fSectors = fInnerSec;
1861     else
1862       fSectors = fOuterSec;
1863     FollowToNext(t,nr);
1864   }
1865   return 1;
1866 }
1867
1868
1869
1870
1871
1872 Float_t AliTPCtrackerMI::OverlapFactor(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2, Int_t &sum1, Int_t & sum2)
1873 {
1874   //
1875   //
1876   sum1=0;
1877   sum2=0;
1878   Int_t sum=0;
1879   //
1880   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1881   dz2*=dz2;
1882
1883   Float_t dy2 =TMath::Abs((s1->GetY() - s2->GetY()));
1884   dy2*=dy2;
1885   Float_t distance = TMath::Sqrt(dz2+dy2);
1886   if (distance>4.) return 0; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1887
1888   //  Int_t offset =0;
1889   Int_t firstpoint = TMath::Min(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1890   Int_t lastpoint = TMath::Max(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1891   if (lastpoint>160)
1892     lastpoint =160;
1893   if (firstpoint<0)
1894     firstpoint = 0;
1895   if (firstpoint>lastpoint) {
1896     firstpoint =lastpoint;
1897     //    lastpoint  =160;
1898   }
1899
1900
1901   for (Int_t i=firstpoint-1;i<lastpoint+1;i++){
1902     if (s1->GetClusterIndex2(i)>0) sum1++;
1903     if (s2->GetClusterIndex2(i)>0) sum2++;
1904     if (s1->GetClusterIndex2(i)==s2->GetClusterIndex2(i) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1905       sum++;
1906     }
1907   }
1908   if (sum<5) return 0;
1909
1910   Float_t summin = TMath::Min(sum1+1,sum2+1);
1911   Float_t ratio = (sum+1)/Float_t(summin);
1912   return ratio;
1913 }
1914
1915 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2)
1916 {
1917   //
1918   //
1919   if (TMath::Abs(s1->GetC()-s2->GetC())>0.004) return;
1920   if (TMath::Abs(s1->GetTgl()-s2->GetTgl())>0.6) return;
1921
1922   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1923   dz2*=dz2;
1924   Float_t dy2 =(s1->GetY() - s2->GetY());
1925   dy2*=dy2;
1926   Float_t distance = dz2+dy2;
1927   if (distance>325.) return ; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1928
1929   //
1930   Int_t sumshared=0;
1931   //
1932   Int_t firstpoint = TMath::Max(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1933   Int_t lastpoint = TMath::Min(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1934   //
1935   if (firstpoint>=lastpoint-5) return;;
1936
1937   for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1938     //    if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1939     if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1940       sumshared++;
1941     }
1942   }
1943   if (sumshared>4){
1944     // sign clusters
1945     //
1946     for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1947       //      if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1948       if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1949         AliTPCTrackerPoint *p1  = s1->GetTrackPoint(i);
1950         AliTPCTrackerPoint *p2  = s2->GetTrackPoint(i);;
1951         if (s1->IsActive()&&s2->IsActive()){
1952           p1->fIsShared = kTRUE;
1953           p2->fIsShared = kTRUE;
1954         }
1955       }
1956     }
1957   }
1958   //
1959   if (sumshared>10){
1960     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1961       if (s1->fOverlapLabels[3*i]==0){
1962         s1->fOverlapLabels[3*i] = s2->GetLabel();
1963         s1->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1964         s1->fOverlapLabels[3*i+2] = s2->GetUniqueID();
1965         break;
1966       }
1967     }
1968     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1969       if (s2->fOverlapLabels[3*i]==0){
1970         s2->fOverlapLabels[3*i] = s1->GetLabel();
1971         s2->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1972         s2->fOverlapLabels[3*i+2] = s1->GetUniqueID();
1973         break;
1974       }
1975     }
1976   }
1977
1978 }
1979
1980 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(TObjArray * arr)
1981 {
1982   //
1983   //sort trackss according sectors
1984   //
1985   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
1986     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
1987     if (!pt) continue;
1988     //if (pt) RotateToLocal(pt);
1989     pt->fSort = 0;
1990   }
1991   arr->UnSort();
1992   arr->Sort();  // sorting according z
1993   arr->Expand(arr->GetEntries());
1994   //
1995   //
1996   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
1997   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
1998     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
1999     if (!pt) continue;
2000     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2001       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2002     }
2003   }
2004   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2005     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2006     if (!pt) continue;
2007     if (pt->fRemoval>10) continue;
2008     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2009       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2010       //      if (pt2){
2011       if (pt2->fRemoval<=10) {
2012         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2013         SignShared(pt,pt2);
2014       }
2015     }
2016   }
2017 }
2018
2019 void  AliTPCtrackerMI::RemoveDouble(TObjArray * arr, Float_t factor1, Float_t factor2,  Int_t removalindex)
2020 {
2021   //
2022   //sort trackss according sectors
2023   //
2024   if (fDebug&1) {
2025     Info("RemoveDouble","Number of tracks before double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2026   }
2027   //
2028   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
2029     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2030     if (!pt) continue;
2031     pt->fSort = 0;
2032   }
2033   arr->UnSort();
2034   arr->Sort();  // sorting according z
2035   arr->Expand(arr->GetEntries());
2036   //
2037   //reset overlap labels
2038   //
2039   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2040   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2041     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2042     if (!pt) continue;
2043     pt->SetUniqueID(i);
2044     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2045       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2046     }
2047   }
2048   //
2049   //sign shared tracks
2050   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2051     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2052     if (!pt) continue;
2053     if (pt->fRemoval>10) continue;
2054     Float_t deltac = pt->GetC()*0.1;
2055     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2056       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2057       //      if (pt2){
2058       if (pt2->fRemoval<=10) {
2059         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2060         if (TMath::Abs(pt->GetC()  -pt2->GetC())>deltac) continue;
2061         if (TMath::Abs(pt->GetTgl()-pt2->GetTgl())>0.05) continue;
2062         //
2063         SignShared(pt,pt2);
2064       }
2065     }
2066   }
2067   //
2068   // remove highly shared tracks
2069   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2070     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2071     if (!pt) continue;
2072     if (pt->fRemoval>10) continue;
2073     //
2074     Int_t sumshared =0;
2075     for (Int_t j=0;j<4;j++){
2076       sumshared = pt->fOverlapLabels[j*3+1];
2077     }
2078     Float_t factor = factor1;
2079     if (pt->fRemoval>0) factor = factor2;
2080     if (sumshared/pt->GetNumberOfClusters()>factor){
2081       for (Int_t j=0;j<4;j++){
2082         if (pt->fOverlapLabels[3*j]==0) continue;
2083         if (pt->fOverlapLabels[3*j+1]<5) continue;
2084         if (pt->fRemoval==removalindex) continue;
2085         AliTPCseed * pt2 = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(pt->fOverlapLabels[3*j+2]);
2086         if (!pt2) continue;
2087         if (pt2->GetSigma2C()<pt->GetSigma2C()){
2088           //      pt->fRemoval = removalindex;
2089           delete arr->RemoveAt(i);
2090           break;
2091         }
2092       }
2093     }
2094   }
2095   arr->Compress();
2096   if (fDebug&1) {
2097     Info("RemoveDouble","Number of tracks after double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2098   }
2099 }
2100
2101
2102
2103
2104
2105
2106 void AliTPCtrackerMI::SortTracks(TObjArray * arr, Int_t mode) const
2107 {
2108   //
2109   //sort tracks in array according mode criteria
2110   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2111   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2112     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2113     if (!pt) {
2114       continue;
2115     }
2116     pt->fSort = mode;
2117   }
2118   arr->UnSort();
2119   arr->Sort();
2120 }
2121
2122 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t removalindex)
2123 {
2124
2125   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2126   //
2127   //
2128   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2129   Int_t good =0;
2130
2131   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2132     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2133     if (!pt) {
2134       delete arr->RemoveAt(i);
2135     }
2136     else{
2137       pt->fSort =1;
2138       pt->fBSigned = kFALSE;
2139     }
2140   }
2141   arr->Compress();
2142   nseed = arr->GetEntriesFast();
2143   arr->UnSort();
2144   arr->Sort();
2145   //
2146   //unsign used
2147   UnsignClusters();
2148   //
2149   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2150     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2151     if (!pt) {
2152       continue;
2153     }
2154     Int_t found,foundable,shared;
2155     if (pt->IsActive())
2156       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kFALSE);
2157     else
2158       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kTRUE);
2159     //
2160     Double_t factor = factor2;
2161     if (pt->fBConstrain) factor = factor1;
2162
2163     if ((Float_t(shared)/Float_t(found))>factor){
2164       pt->Desactivate(removalindex);
2165       continue;
2166     }
2167
2168     good++;
2169     for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2170       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2171       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2172       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2173       if (!c) continue;
2174       //      if (!c->IsUsed(10)) c->Use(10);
2175       //if (pt->IsActive())
2176       c->Use(10);
2177       //else
2178       //        c->Use(5);
2179     }
2180
2181   }
2182   fNtracks = good;
2183   if (fDebug>0){
2184     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2185   }
2186 }
2187
2188
2189 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed2(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t minimal)
2190 {
2191
2192   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2193   //
2194   //
2195   UnsignClusters();
2196   //
2197   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2198   Float_t * quality = new Float_t[nseed];
2199   Int_t   * indexes = new Int_t[nseed];
2200   Int_t good =0;
2201   //
2202   //
2203   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2204     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2205     if (!pt){
2206       quality[i]=-1;
2207       continue;
2208     }
2209     pt->UpdatePoints();    //select first last max dens points
2210     Float_t * points = pt->GetPoints();
2211     if (points[3]<0.8) quality[i] =-1;
2212     //
2213     quality[i] = (points[2]-points[0])+pt->GetNumberOfClusters();
2214   }
2215   TMath::Sort(nseed,quality,indexes);
2216   //
2217   //
2218   for (Int_t itrack=0; itrack<nseed; itrack++) {
2219     Int_t trackindex = indexes[itrack];
2220     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(trackindex);
2221     if (quality[trackindex]<0){
2222       if (pt) {
2223         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2224       }
2225       else{
2226         arr->RemoveAt(trackindex);
2227       }
2228       continue;
2229     }
2230     //
2231     Int_t first = Int_t(pt->GetPoints()[0]);
2232     Int_t last  = Int_t(pt->GetPoints()[2]);
2233     Double_t factor = (pt->fBConstrain) ? factor1: factor2;
2234     //
2235     Int_t found,foundable,shared;
2236     pt->GetClusterStatistic(first,last, found, foundable,shared,kFALSE);
2237     Float_t sharedfactor = Float_t(shared+1)/Float_t(found+1);
2238     Bool_t itsgold =kFALSE;
2239     if (pt->fEsd){
2240       UInt_t dummy[12];
2241       if (pt->fEsd->GetITSclusters(dummy)>4) itsgold= kTRUE;
2242     }
2243     if (!itsgold){
2244       //
2245       if (Float_t(shared+1)/Float_t(found+1)>factor){
2246         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2247         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2248         continue;
2249       }
2250       if (pt->GetNumberOfClusters()<50&&(found-0.5*shared)<minimal){  //remove short tracks
2251         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2252         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2253         continue;
2254       }
2255     }
2256
2257     good++;
2258     if (sharedfactor>0.4) continue;
2259     if (pt->GetKinkIndexes()[0]>0) continue;
2260     for (Int_t i=first; i<last; i++) {
2261       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2262       // if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2263       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2264       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2265       if (!c) continue;
2266       c->Use(10);
2267     }
2268   }
2269   fNtracks = good;
2270   if (fDebug>0){
2271     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2272   }
2273   delete []quality;
2274   delete []indexes;
2275 }
2276
2277 void AliTPCtrackerMI::UnsignClusters()
2278 {
2279   //
2280   // loop over all clusters and unsign them
2281   //
2282
2283   for (Int_t sec=0;sec<fkNIS;sec++){
2284     for (Int_t row=0;row<fInnerSec->GetNRows();row++){
2285       AliTPCclusterMI *cl = fInnerSec[sec][row].fClusters1;
2286       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN1;icl++)
2287         //      if (cl[icl].IsUsed(10))
2288         cl[icl].Use(-1);
2289       cl = fInnerSec[sec][row].fClusters2;
2290       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN2;icl++)
2291         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2292           cl[icl].Use(-1);
2293     }
2294   }
2295
2296   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
2297     for (Int_t row=0;row<fOuterSec->GetNRows();row++){
2298       AliTPCclusterMI *cl = fOuterSec[sec][row].fClusters1;
2299       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN1;icl++)
2300         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2301           cl[icl].Use(-1);
2302       cl = fOuterSec[sec][row].fClusters2;
2303       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN2;icl++)
2304         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2305         cl[icl].Use(-1);
2306     }
2307   }
2308
2309 }
2310
2311
2312
2313 void AliTPCtrackerMI::SignClusters(TObjArray * arr, Float_t fnumber, Float_t fdensity)
2314 {
2315   //
2316   //sign clusters to be "used"
2317   //
2318   // snumber and sdensity sign number of sigmas - bellow mean value to be accepted
2319   // loop over "primaries"
2320
2321   Float_t sumdens=0;
2322   Float_t sumdens2=0;
2323   Float_t sumn   =0;
2324   Float_t sumn2  =0;
2325   Float_t sumchi =0;
2326   Float_t sumchi2 =0;
2327
2328   Float_t sum    =0;
2329
2330   TStopwatch timer;
2331   timer.Start();
2332
2333   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2334   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2335     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2336     if (!pt) {
2337       continue;
2338     }
2339     if (!(pt->IsActive())) continue;
2340     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2341     if ( (dens>0.7) && (pt->GetNumberOfClusters()>70)){
2342       sumdens += dens;
2343       sumdens2+= dens*dens;
2344       sumn    += pt->GetNumberOfClusters();
2345       sumn2   += pt->GetNumberOfClusters()*pt->GetNumberOfClusters();
2346       Float_t chi2 = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2347       if (chi2>5) chi2=5;
2348       sumchi  +=chi2;
2349       sumchi2 +=chi2*chi2;
2350       sum++;
2351     }
2352   }
2353
2354   Float_t mdensity = 0.9;
2355   Float_t meann    = 130;
2356   Float_t meanchi  = 1;
2357   Float_t sdensity = 0.1;
2358   Float_t smeann    = 10;
2359   Float_t smeanchi  =0.4;
2360
2361
2362   if (sum>20){
2363     mdensity = sumdens/sum;
2364     meann    = sumn/sum;
2365     meanchi  = sumchi/sum;
2366     //
2367     sdensity = sumdens2/sum-mdensity*mdensity;
2368     sdensity = TMath::Sqrt(sdensity);
2369     //
2370     smeann   = sumn2/sum-meann*meann;
2371     smeann   = TMath::Sqrt(smeann);
2372     //
2373     smeanchi = sumchi2/sum - meanchi*meanchi;
2374     smeanchi = TMath::Sqrt(smeanchi);
2375   }
2376
2377
2378   //REMOVE  SHORT DELTAS or tracks going out of sensitive volume of TPC
2379   //
2380   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2381     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2382     if (!pt) {
2383       continue;
2384     }
2385     if (pt->fBSigned) continue;
2386     if (pt->fBConstrain) continue;
2387     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2388     /*
2389     Int_t found,foundable,shared;
2390     pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared);
2391     if (shared/float(found)>0.3) {
2392       if (shared/float(found)>0.9 ){
2393         //delete arr->RemoveAt(i);
2394       }
2395       continue;
2396     }
2397     */
2398     Bool_t isok =kFALSE;
2399     if ( (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.5) &&pt->GetNumberOfClusters()>60)
2400       isok = kTRUE;
2401     if ((TMath::Abs(1/pt->GetC())<100.) && (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.7))
2402       isok =kTRUE;
2403     if  (TMath::Abs(pt->GetZ()/pt->GetX())>1.1)
2404       isok =kTRUE;
2405     if ( (TMath::Abs(pt->GetSnp()>0.7) && pt->GetD(0,0)>60.))
2406       isok =kTRUE;
2407
2408     if (isok)
2409       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2410         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2411         if (index<0) continue;
2412         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2413         if (!c) continue;
2414         //if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();
2415         c->Use(10);
2416       }
2417   }
2418
2419
2420   //
2421   Double_t maxchi  = meanchi+2.*smeanchi;
2422
2423   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2424     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2425     if (!pt) {
2426       continue;
2427     }
2428     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2429     if (pt->fBSigned) continue;
2430     Double_t chi     = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2431     if (chi>maxchi) continue;
2432
2433     Float_t bfactor=1;
2434     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2435
2436     //sign only tracks with enoug big density at the beginning
2437
2438     if ((pt->GetDensityFirst(40)<0.75) && pt->GetNumberOfClusters()<meann) continue;
2439
2440
2441     Double_t mindens = TMath::Max(double(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor),0.65);
2442     Double_t minn    = TMath::Max(Int_t(meann-fnumber*smeann*bfactor),50);
2443
2444     //    if (pt->fBConstrain) mindens = TMath::Max(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor,0.65);
2445     if ( (pt->fRemoval==10) && (pt->GetSnp()>0.8)&&(dens>mindens))
2446       minn=0;
2447
2448     if ((dens>mindens && pt->GetNumberOfClusters()>minn) && chi<maxchi ){
2449       //Int_t noc=pt->GetNumberOfClusters();
2450       pt->fBSigned = kTRUE;
2451       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2452
2453         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2454         if (index<0) continue;
2455         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2456         if (!c) continue;
2457         //      if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();
2458         c->Use(10);
2459       }
2460     }
2461   }
2462   //  gLastCheck = nseed;
2463   //  arr->Compress();
2464   if (fDebug>0){
2465     timer.Print();
2466   }
2467 }
2468
2469
2470 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(TObjArray * arr, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1, Float_t th2) const
2471 {
2472   // stop not active tracks
2473   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2474   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows
2475   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2476   //
2477   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2478     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2479     if (!pt) {
2480       continue;
2481     }
2482     if (!(pt->IsActive())) continue;
2483     StopNotActive(pt,row0,th0, th1,th2);
2484   }
2485 }
2486
2487
2488
2489 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(AliTPCseed * seed, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1,
2490  Float_t th2) const
2491 {
2492   // stop not active tracks
2493   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2494   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows
2495   Int_t sumgood1  = 0;
2496   Int_t sumgood2  = 0;
2497   Int_t foundable = 0;
2498   Int_t maxindex = seed->fLastPoint;  //last foundable row
2499   if (seed->fNFoundable*th0 > seed->GetNumberOfClusters()) {
2500     seed->Desactivate(10) ;
2501     return;
2502   }
2503
2504   for (Int_t i=row0; i<maxindex; i++){
2505     Int_t index = seed->GetClusterIndex2(i);
2506     if (index!=-1) foundable++;
2507     //if (!c) continue;
2508     if (foundable<=30) sumgood1++;
2509     if (foundable<=50) {
2510       sumgood2++;
2511     }
2512     else{
2513       break;
2514     }
2515   }
2516   if (foundable>=30.){
2517      if (sumgood1<(th1*30.)) seed->Desactivate(10);
2518   }
2519   if (foundable>=50)
2520     if (sumgood2<(th2*50.)) seed->Desactivate(10);
2521 }
2522
2523
2524 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESD *event)
2525 {
2526   //
2527   // back propagation of ESD tracks
2528   //
2529   //return 0;
2530   fEvent = event;
2531   ReadSeeds(event,2);
2532   fIteration=2;
2533   //PrepareForProlongation(fSeeds,1);
2534   PropagateForward2(fSeeds);
2535
2536   Int_t ntracks=0;
2537   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2538   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2539     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2540     if (!seed) continue;
2541     if (seed->GetKinkIndex(0)>0)  UpdateKinkQualityD(seed);  // update quality informations for kinks
2542
2543     seed->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
2544     seed->UpdatePoints();
2545     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2546     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2547     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2548     //
2549     if (0 && seed!=0&&esd!=0) {
2550       TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
2551       cstream<<"Crefit"<<
2552         "Esd.="<<esd<<
2553         "Track.="<<seed<<
2554         "\n";
2555     }
2556     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2557       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCrefit);
2558       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2559       esd->SetTPCPointsF(seed->fNFoundable);
2560       Int_t ndedx   = seed->fNCDEDX[0]+seed->fNCDEDX[1]+seed->fNCDEDX[2]+seed->fNCDEDX[3];
2561       Float_t sdedx = (seed->fSDEDX[0]+seed->fSDEDX[1]+seed->fSDEDX[2]+seed->fSDEDX[3])*0.25;
2562       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
2563       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
2564       ntracks++;
2565     }
2566     else{
2567       //printf("problem\n");
2568     }
2569   }
2570   //FindKinks(fSeeds,event);
2571   Info("RefitInward","Number of refitted tracks %d",ntracks);
2572   fEvent =0;
2573   //WriteTracks();
2574   return 0;
2575 }
2576
2577
2578 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESD *event)
2579 {
2580   //
2581   // back propagation of ESD tracks
2582   //
2583
2584   fEvent = event;
2585   fIteration = 1;
2586   ReadSeeds(event,1);
2587   PropagateBack(fSeeds);
2588   RemoveUsed2(fSeeds,0.4,0.4,20);
2589   //
2590   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2591   Int_t ntracks=0;
2592   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2593     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2594     if (!seed) continue;
2595     if (seed->GetKinkIndex(0)<0)  UpdateKinkQualityM(seed);  // update quality informations for kinks
2596     seed->UpdatePoints();
2597     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2598     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2599     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2600     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2601       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCout);
2602       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2603       esd->SetTPCPointsF(seed->fNFoundable);
2604       Int_t ndedx   = seed->fNCDEDX[0]+seed->fNCDEDX[1]+seed->fNCDEDX[2]+seed->fNCDEDX[3];
2605       Float_t sdedx = (seed->fSDEDX[0]+seed->fSDEDX[1]+seed->fSDEDX[2]+seed->fSDEDX[3])*0.25;
2606       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
2607       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
2608       ntracks++;
2609     }
2610   }
2611   //FindKinks(fSeeds,event);
2612   Info("PropagateBack","Number of back propagated tracks %d",ntracks);
2613   fEvent =0;
2614   //WriteTracks();
2615   return 0;
2616 }
2617
2618
2619 void AliTPCtrackerMI::DeleteSeeds()
2620 {
2621   //
2622   //delete Seeds
2623   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2624   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2625     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*)fSeeds->At(i);
2626     if (seed) delete fSeeds->RemoveAt(i);
2627   }
2628   delete fSeeds;
2629   fSeeds =0;
2630 }
2631
2632 void AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(AliESD *event, Int_t direction)
2633 {
2634   //
2635   //read seeds from the event
2636
2637   Int_t nentr=event->GetNumberOfTracks();
2638   if (fDebug>0){
2639     Info("ReadSeeds", "Number of ESD tracks: %d\n", nentr);
2640   }
2641   if (fSeeds)
2642     DeleteSeeds();
2643   if (!fSeeds){
2644     fSeeds = new TObjArray(nentr);
2645   }
2646   UnsignClusters();
2647   //  Int_t ntrk=0;
2648   for (Int_t i=0; i<nentr; i++) {
2649     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2650     ULong_t status=esd->GetStatus();
2651     if (!(status&AliESDtrack::kTPCin)) continue;
2652     AliTPCtrack t(*esd);
2653     t.SetNumberOfClusters(0);
2654     //    AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t,t.GetAlpha());
2655     AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t/*,t.GetAlpha()*/);
2656     for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++) {
2657       Int_t index = esd->GetKinkIndex(ikink);
2658       seed->GetKinkIndexes()[ikink] = index;
2659       if (index==0) continue;
2660       index = TMath::Abs(index);
2661       AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
2662       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)<0){
2663         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,2);
2664         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,0);
2665       }
2666       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)>0){
2667         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,6);
2668         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,4);
2669       }
2670
2671     }
2672     if (((status&AliESDtrack::kITSout)==0)&&(direction==1)) seed->ResetCovariance();
2673     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) == 0 ) seed->ResetCovariance();
2674     if ( direction ==2 && ((status & AliESDtrack::kTPCout) == 0) ) {
2675       fSeeds->AddAt(0,i);
2676       delete seed;
2677       continue;
2678     }
2679     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) > 0 )  {
2680       Double_t par0[5],par1[5],alpha,x;
2681       esd->GetInnerExternalParameters(alpha,x,par0);
2682       esd->GetExternalParameters(x,par1);
2683       Double_t delta1 = TMath::Abs(par0[4]-par1[4])/(0.000000001+TMath::Abs(par0[4]+par1[4]));
2684       Double_t delta2 = TMath::Abs(par0[3]-par1[3]);
2685       Double_t trdchi2=0;
2686       if (esd->GetTRDncls()>0) trdchi2 = esd->GetTRDchi2()/esd->GetTRDncls();
2687       //reset covariance if suspicious
2688       if ( (delta1>0.1) || (delta2>0.006) ||trdchi2>7.)
2689         seed->ResetCovariance();
2690     }
2691
2692     //
2693     //
2694     // rotate to the local coordinate system
2695     //
2696     fSectors=fInnerSec; fN=fkNIS;
2697     Double_t alpha=seed->GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
2698     if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
2699     if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
2700     Int_t ns=Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha())%fN;
2701     alpha =ns*fSectors->GetAlpha() + fSectors->GetAlphaShift();
2702     if (alpha<-TMath::Pi()) alpha += 2*TMath::Pi();
2703     if (alpha>=TMath::Pi()) alpha -= 2*TMath::Pi();
2704     alpha-=seed->GetAlpha();
2705     if (!seed->Rotate(alpha)) {
2706       delete seed;
2707       continue;
2708     }
2709     seed->fEsd = esd;
2710     // sign clusters
2711     if (esd->GetKinkIndex(0)<=0){
2712       for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
2713         Int_t index = seed->GetClusterIndex2(irow);
2714         if (index>0){
2715           //
2716           AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(index);
2717           seed->fClusterPointer[irow] = cl;
2718           if (cl){
2719             if ((index & 0x8000)==0){
2720               cl->Use(10);  // accepted cluster
2721             }else{
2722               cl->Use(6);   // close cluster not accepted
2723             }
2724           }else{
2725             Info("ReadSeeds","Not found cluster");
2726           }
2727         }
2728       }
2729     }
2730     fSeeds->AddAt(seed,i);
2731   }
2732 }
2733
2734
2735
2736 //_____________________________________________________________________________
2737 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds3(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
2738                                  Float_t deltay, Int_t ddsec) {
2739   //-----------------------------------------------------------------
2740   // This function creates track seeds.
2741   // SEEDING WITH VERTEX CONSTRAIN
2742   //-----------------------------------------------------------------
2743   // cuts[0]   - fP4 cut
2744   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
2745   // cuts[2]   - zvertex cut
2746   // cuts[3]   - fP3 cut
2747   Int_t nin0  = 0;
2748   Int_t nin1  = 0;
2749   Int_t nin2  = 0;
2750   Int_t nin   = 0;
2751   Int_t nout1 = 0;
2752   Int_t nout2 = 0;
2753
2754   Double_t x[5], c[15];
2755   //  Int_t di = i1-i2;
2756   //
2757   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
2758   Double_t alpha=fSectors->GetAlpha(), shift=fSectors->GetAlphaShift();
2759   Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
2760   //
2761   //  Double_t x1 =fOuterSec->GetX(i1);
2762   //Double_t xx2=fOuterSec->GetX(i2);
2763
2764   Double_t x1 =GetXrow(i1);
2765   Double_t xx2=GetXrow(i2);
2766
2767   Double_t x3=GetX(), y3=GetY(), z3=GetZ();
2768
2769   Int_t imiddle = (i2+i1)/2;    //middle pad row index
2770   Double_t xm = GetXrow(imiddle); // radius of middle pad-row
2771   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,imiddle); //middle pad -row
2772   //
2773   Int_t ns =sec;
2774
2775   const AliTPCRow& kr1=GetRow(ns,i1);
2776   Double_t ymax  = GetMaxY(i1)-kr1.fDeadZone-1.5;
2777   Double_t ymaxm = GetMaxY(imiddle)-kr1.fDeadZone-1.5;
2778
2779   //
2780   // change cut on curvature if it can't reach this layer
2781   // maximal curvature set to reach it
2782   Double_t dvertexmax  = TMath::Sqrt((x1-x3)*(x1-x3)+(ymax+5-y3)*(ymax+5-y3));
2783   if (dvertexmax*0.5*cuts[0]>0.85){
2784     cuts[0] = 0.85/(dvertexmax*0.5+1.);
2785   }
2786   Double_t r2min = 1/(cuts[0]*cuts[0]);  //minimal square of radius given by cut
2787
2788   //  Int_t ddsec = 1;
2789   if (deltay>0) ddsec = 0;
2790   // loop over clusters
2791   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
2792     //
2793     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
2794     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();
2795     //if (TMath::Abs(y1)>ymax) continue;
2796
2797     if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
2798
2799     // find possible directions
2800     Float_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
2801     Float_t extraz = z1 - anglez*(x1-xx2);  // extrapolated z
2802     //
2803     //
2804     //find   rotation angles relative to line given by vertex and point 1
2805     Double_t dvertex2 = (x1-x3)*(x1-x3)+(y1-y3)*(y1-y3);
2806     Double_t dvertex  = TMath::Sqrt(dvertex2);
2807     Double_t angle13  = TMath::ATan((y1-y3)/(x1-x3));
2808     Double_t cs13     = cos(-angle13), sn13 = sin(-angle13);
2809
2810     //
2811     // loop over 2 sectors
2812     Int_t dsec1=-ddsec;
2813     Int_t dsec2= ddsec;
2814     if (y1<0)  dsec2= 0;
2815     if (y1>0)  dsec1= 0;
2816
2817     Double_t dddz1=0;  // direction of delta inclination in z axis
2818     Double_t dddz2=0;
2819     if ( (z1-z3)>0)
2820       dddz1 =1;
2821     else
2822       dddz2 =1;
2823     //
2824     for (Int_t dsec = dsec1; dsec<=dsec2;dsec++){
2825       Int_t sec2 = sec + dsec;
2826       //
2827       //      AliTPCRow&  kr2  = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][i2];
2828       //AliTPCRow&  kr2m = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][imiddle];
2829       AliTPCRow&  kr2  = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,i2);
2830       AliTPCRow&  kr2m = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,imiddle);
2831       Int_t  index1 = TMath::Max(kr2.Find(extraz-0.6-dddz1*TMath::Abs(z1)*0.05)-1,0);
2832       Int_t  index2 = TMath::Min(kr2.Find(extraz+0.6+dddz2*TMath::Abs(z1)*0.05)+1,kr2);
2833
2834       // rotation angles to p1-p3
2835       Double_t cs13r     = cos(-angle13+dsec*alpha)/dvertex, sn13r = sin(-angle13+dsec*alpha)/dvertex;
2836       Double_t x2,   y2,   z2;
2837       //
2838       //      Double_t dymax = maxangle*TMath::Abs(x1-xx2);
2839
2840       //
2841       Double_t dxx0 =  (xx2-x3)*cs13r;
2842       Double_t dyy0 =  (xx2-x3)*sn13r;
2843       for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
2844         const AliTPCclusterMI *kcl = kr2[js];
2845         if (kcl->IsUsed(10)) continue;
2846         //
2847         //calcutate parameters
2848         //
2849         Double_t yy0 =  dyy0 +(kcl->GetY()-y3)*cs13r;
2850         // stright track
2851         if (TMath::Abs(yy0)<0.000001) continue;
2852         Double_t xx0 =  dxx0 -(kcl->GetY()-y3)*sn13r;
2853         Double_t y0  =  0.5*(xx0*xx0+yy0*yy0-xx0)/yy0;
2854         Double_t r02 = (0.25+y0*y0)*dvertex2;
2855         //curvature (radius) cut
2856         if (r02<r2min) continue;
2857
2858         nin0++;
2859         //
2860         Double_t c0  = 1/TMath::Sqrt(r02);
2861         if (yy0>0) c0*=-1.;
2862
2863
2864         //Double_t dfi0   = 2.*TMath::ASin(dvertex*c0*0.5);
2865         //Double_t dfi1   = 2.*TMath::ASin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2866         Double_t dfi0   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(dvertex*c0*0.5);
2867         Double_t dfi1   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2868         //
2869         //
2870         Double_t z0  =  kcl->GetZ();
2871         Double_t zzzz2    = z1-(z1-z3)*dfi1/dfi0;
2872         if (TMath::Abs(zzzz2-z0)>0.5) continue;
2873         nin1++;
2874         //
2875         Double_t dip    = (z1-z0)*c0/dfi1;
2876         Double_t x0 = (0.5*cs13+y0*sn13)*dvertex*c0;
2877         //
2878         y2 = kcl->GetY();
2879         if (dsec==0){
2880           x2 = xx2;
2881           z2 = kcl->GetZ();
2882         }
2883         else
2884           {
2885             // rotation
2886             z2 = kcl->GetZ();
2887             x2= xx2*cs-y2*sn*dsec;
2888             y2=+xx2*sn*dsec+y2*cs;
2889           }
2890
2891         x[0] = y1;
2892         x[1] = z1;
2893         x[2] = x0;
2894         x[3] = dip;
2895         x[4] = c0;
2896         //
2897         //
2898         // do we have cluster at the middle ?
2899         Double_t ym,zm;
2900         GetProlongation(x1,xm,x,ym,zm);
2901         UInt_t dummy;
2902         AliTPCclusterMI * cm=0;
2903         if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2904           cm = krm.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2905           if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {
2906             continue;
2907           }
2908         }
2909         else{
2910           // rotate y1 to system 0
2911           // get state vector in rotated system
2912           Double_t yr1  = (-0.5*sn13+y0*cs13)*dvertex*c0;
2913           Double_t xr2  =  x0*cs+yr1*sn*dsec;
2914           Double_t xr[5]={kcl->GetY(),kcl->GetZ(), xr2, dip, c0};
2915           //
2916           GetProlongation(xx2,xm,xr,ym,zm);
2917           if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2918             cm = kr2m.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2919             if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {
2920               continue;
2921             }
2922           }
2923         }
2924
2925
2926         Double_t dym = 0;
2927         Double_t dzm = 0;
2928         if (cm){
2929           dym = ym - cm->GetY();
2930           dzm = zm - cm->GetZ();
2931         }
2932         nin2++;
2933
2934
2935         //
2936         //
2937         Double_t sy1=kr1[is]->GetSigmaY2()*2., sz1=kr1[is]->GetSigmaZ2()*2.;
2938         Double_t sy2=kcl->GetSigmaY2()*2.,     sz2=kcl->GetSigmaZ2()*2.;
2939         //Double_t sy3=400*3./12., sy=0.1, sz=0.1;
2940         Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
2941         //Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]*60+0.5, sy=0.1, sz=0.1;
2942
2943         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
2944         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
2945         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
2946         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
2947         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
2948         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
2949
2950         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
2951         Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
2952         Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
2953         Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
2954
2955         c[0]=sy1;
2956         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
2957         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
2958         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
2959                        c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
2960         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
2961         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
2962         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
2963
2964         //      if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
2965
2966         UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
2967         AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, ns*alpha+shift);
2968
2969         track->fIsSeeding = kTRUE;
2970         track->fSeed1 = i1;
2971         track->fSeed2 = i2;
2972         track->fSeedType=3;
2973
2974
2975         //if (dsec==0) {
2976           FollowProlongation(*track, (i1+i2)/2,1);
2977           Int_t foundable,found,shared;
2978           track->GetClusterStatistic((i1+i2)/2,i1, found, foundable, shared, kTRUE);
2979           if ((found<0.55*foundable)  || shared>0.5*found || (track->GetSigmaY2()+track->GetSigmaZ2())>0.5){
2980             seed->Reset();
2981             seed->~AliTPCseed();
2982             continue;
2983           }
2984           //}
2985
2986         nin++;
2987         FollowProlongation(*track, i2,1);
2988
2989
2990         //Int_t rc = 1;
2991         track->fBConstrain =1;
2992         //      track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
2993         track->fLastPoint = i1;  // first cluster in track position
2994         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
2995
2996         if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
2997             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 ||
2998             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters() ) {
2999           seed->Reset();
3000           seed->~AliTPCseed();
3001           continue;
3002         }
3003         nout1++;
3004         // Z VERTEX CONDITION
3005         Double_t zv;
3006         zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3007           ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3008         if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]) {
3009           FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-20,0));
3010           zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3011             ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3012           if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]){
3013             FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-40,0));
3014             zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3015               ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3016             if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2] &&(track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.7)){
3017               // make seed without constrain
3018               AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,1.);
3019               FollowProlongation(*track2, i2,1);
3020               track2->fBConstrain = kFALSE;
3021               track2->fSeedType = 1;
3022               arr->AddLast(track2);
3023               seed->Reset();
3024               seed->~AliTPCseed();
3025               continue;
3026             }
3027             else{
3028               seed->Reset();
3029               seed->~AliTPCseed();
3030               continue;
3031
3032             }
3033           }
3034         }
3035
3036         track->fSeedType =0;
3037         arr->AddLast(track);
3038         seed = new AliTPCseed;
3039         nout2++;
3040         // don't consider other combinations
3041         if (track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.8)
3042           break;
3043       }
3044     }
3045   }
3046   if (fDebug>3){
3047     Info("MakeSeeds3","\nSeeding statistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2);
3048   }
3049   delete seed;
3050 }
3051
3052
3053 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
3054                                  Float_t deltay) {
3055
3056
3057
3058   //-----------------------------------------------------------------
3059   // This function creates track seeds.
3060   //-----------------------------------------------------------------
3061   // cuts[0]   - fP4 cut
3062   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3063   // cuts[2]   - zvertex cut
3064   // cuts[3]   - fP3 cut
3065
3066
3067   Int_t nin0  = 0;
3068   Int_t nin1  = 0;
3069   Int_t nin2  = 0;
3070   Int_t nin   = 0;
3071   Int_t nout1 = 0;
3072   Int_t nout2 = 0;
3073   Int_t nout3 =0;
3074   Double_t x[5], c[15];
3075   //
3076   // make temporary seed
3077   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3078   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3079   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3080   //
3081   //
3082
3083   // first 3 padrows
3084   Double_t x1 = GetXrow(i1-1);
3085   const    AliTPCRow& kr1=GetRow(sec,i1-1);
3086   Double_t y1max  = GetMaxY(i1-1)-kr1.fDeadZone-1.5;
3087   //
3088   Double_t x1p = GetXrow(i1);
3089   const    AliTPCRow& kr1p=GetRow(sec,i1);
3090   //
3091   Double_t x1m = GetXrow(i1-2);
3092   const    AliTPCRow& kr1m=GetRow(sec,i1-2);
3093
3094   //
3095   //last 3 padrow for seeding
3096   AliTPCRow&  kr3  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-7);
3097   Double_t    x3   =  GetXrow(i1-7);
3098   //  Double_t    y3max= GetMaxY(i1-7)-kr3.fDeadZone-1.5;
3099   //
3100   AliTPCRow&  kr3p  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-6);
3101   Double_t    x3p   = GetXrow(i1-6);
3102   //
3103   AliTPCRow&  kr3m  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-8);
3104   Double_t    x3m   = GetXrow(i1-8);
3105
3106   //
3107   //
3108   // middle padrow
3109   Int_t im = i1-4;                           //middle pad row index
3110   Double_t xm         = GetXrow(im);         // radius of middle pad-row
3111   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,im);   //middle pad -row
3112   //  Double_t ymmax = GetMaxY(im)-kr1.fDeadZone-1.5;
3113   //
3114   //
3115   Double_t deltax  = x1-x3;
3116   Double_t dymax   = deltax*cuts[1];
3117   Double_t dzmax   = deltax*cuts[3];
3118   //
3119   // loop over clusters
3120   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
3121     //
3122     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
3123     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();
3124     //
3125     if (deltay>0 && TMath::Abs(y1max-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3126     //
3127     Int_t  index1 = TMath::Max(kr3.Find(z1-dzmax)-1,0);
3128     Int_t  index2 = TMath::Min(kr3.Find(z1+dzmax)+1,kr3);
3129     //
3130     Double_t y3,   z3;
3131     //
3132     //
3133     UInt_t index;
3134     for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
3135       const AliTPCclusterMI *kcl = kr3[js];
3136       if (kcl->IsUsed(10)) continue;
3137       y3 = kcl->GetY();
3138       // apply angular cuts
3139       if (TMath::Abs(y1-y3)>dymax) continue;
3140       x3 = x3;
3141       z3 = kcl->GetZ();
3142       if (TMath::Abs(z1-z3)>dzmax) continue;
3143       //
3144       Double_t angley = (y1-y3)/(x1-x3);
3145       Double_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
3146       //
3147       Double_t erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3148       Double_t errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3149       //
3150       Double_t yyym = angley*(xm-x1)+y1;
3151       Double_t zzzm = anglez*(xm-x1)+z1;
3152
3153       const AliTPCclusterMI *kcm = krm.FindNearest2(yyym,zzzm,erry,errz,index);
3154       if (!kcm) continue;
3155       if (kcm->IsUsed(10)) continue;
3156
3157       erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3158       errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3159       //
3160       //
3161       //
3162       Int_t used  =0;
3163       Int_t found =0;
3164       //
3165       // look around first
3166       const AliTPCclusterMI *kc1m = kr1m.FindNearest2(angley*(x1m-x1)+y1,
3167                                                       anglez*(x1m-x1)+z1,
3168                                                       erry,errz,index);
3169       //
3170       if (kc1m){
3171         found++;
3172         if (kc1m->IsUsed(10)) used++;
3173       }
3174       const AliTPCclusterMI *kc1p = kr1p.FindNearest2(angley*(x1p-x1)+y1,
3175                                                       anglez*(x1p-x1)+z1,
3176                                                       erry,errz,index);
3177       //
3178       if (kc1p){
3179         found++;
3180         if (kc1p->IsUsed(10)) used++;
3181       }
3182       if (used>1)  continue;
3183       if (found<1) continue;
3184
3185       //
3186       // look around last
3187       const AliTPCclusterMI *kc3m = kr3m.FindNearest2(angley*(x3m-x3)+y3,
3188                                                       anglez*(x3m-x3)+z3,
3189                                                       erry,errz,index);
3190       //
3191       if (kc3m){
3192         found++;
3193         if (kc3m->IsUsed(10)) used++;
3194       }
3195       else
3196         continue;
3197       const AliTPCclusterMI *kc3p = kr3p.FindNearest2(angley*(x3p-x3)+y3,
3198                                                       anglez*(x3p-x3)+z3,
3199                                                       erry,errz,index);
3200       //
3201       if (kc3p){
3202         found++;
3203         if (kc3p->IsUsed(10)) used++;
3204       }
3205       else
3206         continue;
3207       if (used>1)  continue;
3208       if (found<3) continue;
3209       //
3210       Double_t x2,y2,z2;
3211       x2 = xm;
3212       y2 = kcm->GetY();
3213       z2 = kcm->GetZ();
3214       //
3215
3216       x[0]=y1;
3217       x[1]=z1;
3218       x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3219       //if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;
3220       nin0++;
3221       //
3222       x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3223       nin1++;
3224       //
3225       x[3]=F3n(x1,y1,x2,y2,z1,z2,x[4]);
3226       //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3227       nin2++;
3228       //
3229       //
3230       Double_t sy1=0.1,  sz1=0.1;
3231       Double_t sy2=0.1,  sz2=0.1;
3232       Double_t sy3=0.1,  sy=0.1, sz=0.1;
3233
3234       Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3235       Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3236       Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3237       Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3238       Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3239       Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3240
3241       Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
3242       Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
3243       Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
3244       Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
3245
3246       c[0]=sy1;
3247       c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3248       c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3249       c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3250       c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3251       c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3252       c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3253       c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3254
3255       //        if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
3256
3257       UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
3258       AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3259
3260       track->fIsSeeding = kTRUE;
3261
3262       nin++;
3263       FollowProlongation(*track, i1-7,1);
3264       if (track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.75 ||
3265           track->fNShared>0.6*track->GetNumberOfClusters() || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.6){
3266         seed->Reset();
3267         seed->~AliTPCseed();
3268         continue;
3269       }
3270       nout1++;
3271       nout2++;
3272       //Int_t rc = 1;
3273       FollowProlongation(*track, i2,1);
3274       track->fBConstrain =0;
3275       track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3276       track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3277
3278       if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
3279           track->GetNumberOfClusters()<track->fNFoundable*0.7 ||
3280           track->fNShared>2. || track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()>6 || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.5 ) {
3281         seed->Reset();
3282         seed->~AliTPCseed();
3283         continue;
3284       }
3285
3286       {
3287         FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-10,0),1);
3288         AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,0.9);
3289         FollowProlongation(*track2, i2,1);
3290         track2->fBConstrain = kFALSE;
3291         track2->fSeedType = 4;
3292         arr->AddLast(track2);
3293         seed->Reset();
3294         seed->~AliTPCseed();
3295       }
3296
3297
3298       //arr->AddLast(track);
3299       //seed = new AliTPCseed;
3300       nout3++;
3301     }
3302   }
3303
3304   if (fDebug>3){
3305     Info("MakeSeeds5","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2,nout3);
3306   }
3307   delete seed;
3308 }
3309
3310
3311 //_____________________________________________________________________________
3312 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds2(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2, Float_t */*cuts[4]*/,
3313                                  Float_t deltay, Bool_t /*bconstrain*/) {
3314   //-----------------------------------------------------------------
3315   // This function creates track seeds - without vertex constraint
3316   //-----------------------------------------------------------------
3317   // cuts[0]   - fP4 cut        - not applied
3318   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3319   // cuts[2]   - zvertex cut    - not applied
3320   // cuts[3]   - fP3 cut
3321   Int_t nin0=0;
3322   Int_t nin1=0;
3323   Int_t nin2=0;
3324   Int_t nin3=0;
3325   //  Int_t nin4=0;
3326   //Int_t nin5=0;
3327
3328
3329
3330   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3331   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3332   Int_t row0 = (i1+i2)/2;
3333   Int_t drow = (i1-i2)/2;
3334   const AliTPCRow& kr0=fSectors[sec][row0];
3335   AliTPCRow * kr=0;
3336
3337   AliTPCpolyTrack polytrack;
3338   Int_t nclusters=fSectors[sec][row0];
3339   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3340
3341   Int_t sumused=0;
3342   Int_t cused=0;
3343   Int_t cnused=0;
3344   for (Int_t is=0; is < nclusters; is++) {  //LOOP over clusters
3345     Int_t nfound =0;
3346     Int_t nfoundable =0;
3347     for (Int_t iter =1; iter<2; iter++){   //iterations
3348       const AliTPCRow& krm=fSectors[sec][row0-iter];
3349       const AliTPCRow& krp=fSectors[sec][row0+iter];
3350       const AliTPCclusterMI * cl= kr0[is];
3351
3352       if (cl->IsUsed(10)) {
3353         cused++;
3354       }
3355       else{
3356         cnused++;
3357       }
3358       Double_t x = kr0.GetX();
3359       // Initialization of the polytrack
3360       nfound =0;
3361       nfoundable =0;
3362       polytrack.Reset();
3363       //
3364       Double_t y0= cl->GetY();
3365       Double_t z0= cl->GetZ();
3366       Float_t erry = 0;
3367       Float_t errz = 0;
3368
3369       Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row0)-kr0.fDeadZone-1.5;
3370       if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3371
3372       erry = (0.5)*cl->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;
3373       errz = (0.5)*cl->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;
3374       polytrack.AddPoint(x,y0,z0,erry, errz);
3375
3376       sumused=0;
3377       if (cl->IsUsed(10)) sumused++;
3378
3379
3380       Float_t roady = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+0.2)+1.)*iter;
3381       Float_t roadz = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaZ2()+0.2)+1.)*iter;
3382       //
3383       x = krm.GetX();
3384       AliTPCclusterMI * cl1 = krm.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3385       if (cl1 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))) {
3386         erry = (0.5)*cl1->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3387         errz = (0.5)*cl1->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3388         if (cl1->IsUsed(10))  sumused++;
3389         polytrack.AddPoint(x,cl1->GetY(),cl1->GetZ(),erry,errz);
3390       }
3391       //
3392       x = krp.GetX();
3393       AliTPCclusterMI * cl2 = krp.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3394       if (cl2) {
3395         erry = (0.5)*cl2->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3396         errz = (0.5)*cl2->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3397         if (cl2->IsUsed(10)) sumused++;
3398         polytrack.AddPoint(x,cl2->GetY(),cl2->GetZ(),erry,errz);
3399       }
3400       //
3401       if (sumused>0) continue;
3402       nin0++;
3403       polytrack.UpdateParameters();
3404       // follow polytrack
3405       roadz = 1.2;
3406       roady = 1.2;
3407       //
3408       Double_t yn,zn;
3409       nfoundable = polytrack.GetN();
3410       nfound     = nfoundable;
3411       //
3412       for (Int_t ddrow = iter+1; ddrow<drow;ddrow++){
3413         Float_t maxdist = 0.8*(1.+3./(ddrow));
3414         for (Int_t delta = -1;delta<=1;delta+=2){
3415           Int_t row = row0+ddrow*delta;
3416           kr = &(fSectors[sec][row]);
3417           Double_t xn = kr->GetX();
3418           Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row)-kr->fDeadZone-1.5;
3419           polytrack.GetFitPoint(xn,yn,zn);
3420           if (TMath::Abs(yn)>ymax) continue;
3421           nfoundable++;
3422           AliTPCclusterMI * cln = kr->FindNearest(yn,zn,roady,roadz);
3423           if (cln) {
3424             Float_t dist =  TMath::Sqrt(  (yn-cln->GetY())*(yn-cln->GetY())+(zn-cln->GetZ())*(zn-cln->GetZ()));
3425             if (dist<maxdist){
3426               /*
3427               erry = (dist+0.3)*cln->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3428               errz = (dist+0.3)*cln->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3429               if (cln->IsUsed(10)) {
3430                 //      printf("used\n");
3431                 sumused++;
3432                 erry*=2;
3433                 errz*=2;
3434               }
3435               */
3436               erry=0.1;
3437               errz=0.1;
3438               polytrack.AddPoint(xn,cln->GetY(),cln->GetZ(),erry, errz);
3439               nfound++;
3440             }
3441           }
3442         }
3443         if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound) || (nfound<0.6*nfoundable))  break;
3444         polytrack.UpdateParameters();
3445       }
3446     }
3447     if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound))  {
3448       //printf("sumused   %d\n",sumused);
3449       continue;
3450     }
3451     nin1++;
3452     Double_t dy,dz;
3453     polytrack.GetFitDerivation(kr0.GetX(),dy,dz);
3454     AliTPCpolyTrack track2;
3455
3456     polytrack.Refit(track2,0.5+TMath::Abs(dy)*0.3,0.4+TMath::Abs(dz)*0.3);
3457     if (track2.GetN()<0.5*nfoundable) continue;
3458     nin2++;
3459
3460     if ((nfound>0.6*nfoundable) &&( nfoundable>0.4*(i1-i2))) {
3461       //
3462       // test seed with and without constrain
3463       for (Int_t constrain=0; constrain<=0;constrain++){
3464         // add polytrack candidate
3465
3466         Double_t x[5], c[15];
3467         Double_t x1,x2,x3,y1,y2,y3,z1,z2,z3;
3468         track2.GetBoundaries(x3,x1);
3469         x2 = (x1+x3)/2.;
3470         track2.GetFitPoint(x1,y1,z1);
3471         track2.GetFitPoint(x2,y2,z2);
3472         track2.GetFitPoint(x3,y3,z3);
3473         //
3474         //is track pointing to the vertex ?
3475         Double_t x0,y0,z0;
3476         x0=0;
3477         polytrack.GetFitPoint(x0,y0,z0);
3478
3479         if (constrain) {
3480           x2 = x3;
3481           y2 = y3;
3482           z2 = z3;
3483
3484           x3 = 0;
3485           y3 = 0;
3486           z3 = 0;
3487         }
3488         x[0]=y1;
3489         x[1]=z1;
3490         x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3491
3492         //      if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;  //
3493         x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3494
3495         //if (TMath::Abs(x[4]*x1-x[2]) >= cuts[1]) continue;
3496         //x[3]=F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
3497         x[3]=F3n(x1,y1,x3,y3,z1,z3,x[4]);
3498         //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3499
3500
3501         Double_t sy =0.1, sz =0.1;
3502         Double_t sy1=0.02, sz1=0.02;
3503         Double_t sy2=0.02, sz2=0.02;
3504         Double_t sy3=0.02;
3505
3506         if (constrain){
3507           sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
3508         }
3509
3510         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3511         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3512         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3513         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3514         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3515         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3516
3517         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x3,y3,z1,z3)-x[3])/sy;
3518         Double_t f31=(F3(x1,y1,x3,y3,z1+sz,z3)-x[3])/sz;
3519         Double_t f32=(F3(x1,y1,x3,y3+sy,z1,z3)-x[3])/sy;
3520         Double_t f34=(F3(x1,y1,x3,y3,z1,z3+sz)-x[3])/sz;
3521
3522
3523         c[0]=sy1;
3524         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3525         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3526         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3527         c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3528         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3529         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3530         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3531
3532         //Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x1);
3533         Int_t row1 = GetRowNumber(x1);
3534
3535         UInt_t index=0;
3536         //kr0.GetIndex(is);
3537         AliTPCseed *track=new (seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3538         track->fIsSeeding = kTRUE;
3539         Int_t rc=FollowProlongation(*track, i2);
3540         if (constrain) track->fBConstrain =1;
3541         else
3542           track->fBConstrain =0;
3543         track->fLastPoint = row1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3544         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3545
3546         if (rc==0 || track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
3547             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 ||
3548             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters()) {
3549           //delete track;
3550           seed->Reset();
3551           seed->~AliTPCseed();
3552         }
3553         else {
3554           arr->AddLast(track);
3555           seed = new AliTPCseed;
3556         }
3557         nin3++;
3558       }
3559     }  // if accepted seed
3560   }
3561   if (fDebug>3){
3562     Info("MakeSeeds2","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin3);
3563   }
3564   delete seed;
3565 }
3566
3567
3568 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::MakeSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3569 {
3570   //
3571   //
3572   //reseed using track points
3573   Int_t p0 = int(r0*track->GetNumberOfClusters());     // point 0
3574   Int_t p1 = int(r1*track->GetNumberOfClusters());
3575   Int_t p2 = int(r2*track->GetNumberOfClusters());   // last point
3576   Int_t pp2=0;
3577   Double_t  x0[3],x1[3],x2[3];
3578   for (Int_t i=0;i<3;i++){
3579     x0[i]=-1;
3580     x1[i]=-1;
3581     x2[i]=-1;
3582   }
3583
3584   // find track position at given ratio of the length
3585   Int_t  sec0=0, sec1=0, sec2=0;
3586   Int_t index=-1;
3587   Int_t clindex;
3588   for (Int_t i=0;i<160;i++){
3589     if (track->fClusterPointer[i]){
3590       index++;
3591       AliTPCTrackerPoint   *trpoint =track->GetTrackPoint(i);
3592       if ( (index<p0) || x0[0]<0 ){
3593         if (trpoint->GetX()>1){
3594           clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3595           if (clindex>0){
3596             x0[0] = trpoint->GetX();
3597             x0[1] = trpoint->GetY();
3598             x0[2] = trpoint->GetZ();
3599             sec0  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3600           }
3601         }
3602       }
3603
3604       if ( (index<p1) &&(trpoint->GetX()>1)){
3605         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3606         if (clindex>0){
3607           x1[0] = trpoint->GetX();
3608           x1[1] = trpoint->GetY();
3609           x1[2] = trpoint->GetZ();
3610           sec1  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3611         }
3612       }
3613       if ( (index<p2) &&(trpoint->GetX()>1)){
3614         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3615         if (clindex>0){
3616           x2[0] = trpoint->GetX();
3617           x2[1] = trpoint->GetY();
3618           x2[2] = trpoint->GetZ();
3619           sec2  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3620           pp2 = i;
3621         }
3622       }
3623     }
3624   }
3625
3626   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3627   //
3628   alpha = (sec1-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3629   cs = TMath::Cos(alpha);
3630   sn = TMath::Sin(alpha);
3631   xx2= x1[0]*cs-x1[1]*sn;
3632   yy2= x1[0]*sn+x1[1]*cs;
3633   x1[0] = xx2;
3634   x1[1] = yy2;
3635   //
3636   alpha = (sec0-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3637   cs = TMath::Cos(alpha);
3638   sn = TMath::Sin(alpha);
3639   xx2= x0[0]*cs-x0[1]*sn;
3640   yy2= x0[0]*sn+x0[1]*cs;
3641   x0[0] = xx2;
3642   x0[1] = yy2;
3643   //
3644   //
3645   //
3646   Double_t x[5],c[15];
3647   //
3648   x[0]=x2[1];
3649   x[1]=x2[2];
3650   x[4]=F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3651   //  if (x[4]>1) return 0;
3652   x[2]=F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3653   x[3]=F3n(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2],x[4]);
3654   //if (TMath::Abs(x[3]) > 2.2)  return 0;
3655   //if (TMath::Abs(x[2]) > 1.99) return 0;
3656   //
3657   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3658   //
3659   Double_t sy1=0.02+track->GetSigmaY2(), sz1=0.02+track->GetSigmaZ2();
3660   Double_t sy2=0.01+track->GetSigmaY2(), sz2=0.01+track->GetSigmaZ2();
3661   Double_t sy3=0.01+track->GetSigmaY2();
3662   //
3663   Double_t f40=(F1(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3664   Double_t f42=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3665   Double_t f43=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[4])/sy;
3666   Double_t f20=(F2(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3667   Double_t f22=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3668   Double_t f23=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[2])/sy;
3669   //
3670   Double_t f30=(F3(x2[0],x2[1]+sy,x0[0],x0[1],x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3671   Double_t f31=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2]+sz,x0[2])-x[3])/sz;
3672   Double_t f32=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1]+sy,x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3673   Double_t f34=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2]+sz)-x[3])/sz;
3674
3675
3676   c[0]=sy1;
3677   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3678   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3679   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3680   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3681   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3682   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3683   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3684
3685   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x2[0]);
3686   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, x2[0], sec2*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3687   //  Double_t y0,z0,y1,z1, y2,z2;
3688   //seed->GetProlongation(x0[0],y0,z0);
3689   // seed->GetProlongation(x1[0],y1,z1);
3690   //seed->GetProlongation(x2[0],y2,z2);
3691   //  seed =0;
3692   seed->fLastPoint  = pp2;
3693   seed->fFirstPoint = pp2;
3694
3695
3696   return seed;
3697 }
3698
3699
3700 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3701 {
3702   //
3703   //
3704   //reseed using founded clusters
3705   //
3706   // Find the number of clusters
3707   Int_t nclusters = 0;
3708   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
3709     if (track->GetClusterIndex(irow)>0) nclusters++;
3710   }
3711   //
3712   Int_t ipos[3];
3713   ipos[0] = TMath::Max(int(r0*nclusters),0);             // point 0 cluster
3714   ipos[1] = TMath::Min(int(r1*nclusters),nclusters-1);   //
3715   ipos[2] = TMath::Min(int(r2*nclusters),nclusters-1);   // last point
3716   //
3717   //
3718   Double_t  xyz[3][3];
3719   Int_t     row[3],sec[3]={0,0,0};
3720   //
3721   // find track row position at given ratio of the length
3722   Int_t index=-1;
3723   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
3724     if (track->GetClusterIndex2(irow)<0) continue;
3725     index++;
3726     for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3727       if (index<=ipos[ipoint]) row[ipoint] = irow;
3728     }
3729   }
3730   //
3731   //Get cluster and sector position
3732   for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3733     Int_t clindex = track->GetClusterIndex2(row[ipoint]);
3734     AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3735     if (cl==0) {
3736       //Error("Bug\n");
3737       //      AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3738       return 0;
3739     }
3740     sec[ipoint]     = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3741     xyz[ipoint][0]  = GetXrow(row[ipoint]);
3742     xyz[ipoint][1]  = cl->GetY();
3743     xyz[ipoint][2]  = cl->GetZ();
3744   }
3745   //
3746   //
3747   // Calculate seed state vector and covariance matrix
3748
3749   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3750   //
3751   alpha = (sec[1]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3752   cs = TMath::Cos(alpha);
3753   sn = TMath::Sin(alpha);
3754   xx2= xyz[1][0]*cs-xyz[1][1]*sn;
3755   yy2= xyz[1][0]*sn+xyz[1][1]*cs;
3756   xyz[1][0] = xx2;
3757   xyz[1][1] = yy2;
3758   //
3759   alpha = (sec[0]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3760   cs = TMath::Cos(alpha);
3761   sn = TMath::Sin(alpha);
3762   xx2= xyz[0][0]*cs-xyz[0][1]*sn;
3763   yy2= xyz[0][0]*sn+xyz[0][1]*cs;
3764   xyz[0][0] = xx2;
3765   xyz[0][1] = yy2;
3766   //
3767   //
3768   //
3769   Double_t x[5],c[15];
3770   //
3771   x[0]=xyz[2][1];
3772   x[1]=xyz[2][2];
3773   x[4]=F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3774   x[2]=F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3775   x[3]=F3n(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2],x[4]);
3776   //
3777   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3778   //
3779   Double_t sy1=0.2, sz1=0.2;
3780   Double_t sy2=0.2, sz2=0.2;
3781   Double_t sy3=0.2;
3782   //
3783   Double_t f40=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3784   Double_t f42=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3785   Double_t f43=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[4])/sy;
3786   Double_t f20=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3787   Double_t f22=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3788   Double_t f23=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[2])/sy;
3789   //
3790   Double_t f30=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3791   Double_t f31=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2]+sz,xyz[0][2])-x[3])/sz;
3792   Double_t f32=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy,xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3793   Double_t f34=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2]+sz)-x[3])/sz;
3794
3795
3796   c[0]=sy1;
3797   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3798   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3799   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3800   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3801   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3802   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3803   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3804
3805   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(xyz[2][0]);
3806   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, xyz[2][0], sec[2]*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3807   seed->fLastPoint  = row[2];
3808   seed->fFirstPoint = row[2];
3809   return seed;
3810 }
3811
3812
3813 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *track,Int_t r0, Bool_t forward)
3814 {
3815   //
3816   //
3817   //reseed using founded clusters
3818   //
3819   Double_t  xyz[3][3];
3820   Int_t     row[3]={0,0,0};
3821   Int_t     sec[3]={0,0,0};
3822   //
3823   // forward direction
3824   if (forward){
3825     for (Int_t irow=r0;irow<160;irow++){
3826       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3827         row[0] = irow;
3828         break;
3829       }
3830     }
3831     for (Int_t irow=160;irow>r0;irow--){
3832       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3833         row[2] = irow;
3834         break;
3835       }
3836     }
3837     for (Int_t irow=row[2]-15;irow>row[0];irow--){
3838       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3839         row[1] = irow;
3840         break;
3841       }
3842     }
3843     //
3844   }
3845   if (!forward){
3846     for (Int_t irow=0;irow<r0;irow++){
3847       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3848         row[0] = irow;
3849         break;
3850       }
3851     }
3852     for (Int_t irow=r0;irow>0;irow--){
3853       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3854         row[2] = irow;
3855         break;
3856       }
3857     }
3858     for (Int_t irow=row[2]-15;irow>row[0];irow--){
3859       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3860         row[1] = irow;
3861         break;
3862       }
3863     }
3864   }
3865   //
3866   if ((row[2]-row[0])<20) return 0;
3867   if (row[1]==0) return 0;
3868   //
3869   //
3870   //Get cluster and sector position
3871   for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3872     Int_t clindex = track->GetClusterIndex2(row[ipoint]);
3873     AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3874     if (cl==0) {
3875       //Error("Bug\n");
3876       //      AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3877       return 0;
3878     }
3879     sec[ipoint]     = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3880     xyz[ipoint][0]  = GetXrow(row[ipoint]);
3881     AliTPCTrackerPoint * point = track->GetTrackPoint(row[ipoint]);
3882     if (point&&ipoint<2){
3883       //
3884        xyz[ipoint][1]  = point->GetY();
3885        xyz[ipoint][2]  = point->GetZ();
3886     }
3887     else{
3888       xyz[ipoint][1]  = cl->GetY();
3889       xyz[ipoint][2]  = cl->GetZ();
3890     }
3891   }
3892   //
3893   //
3894   //
3895   //
3896   // Calculate seed state vector and covariance matrix
3897
3898   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3899   //
3900   alpha = (sec[1]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3901   cs = TMath::Cos(alpha);
3902   sn = TMath::Sin(alpha);
3903   xx2= xyz[1][0]*cs-xyz[1][1]*sn;
3904   yy2= xyz[1][0]*sn+xyz[1][1]*cs;
3905   xyz[1][0] = xx2;
3906   xyz[1][1] = yy2;
3907   //
3908   alpha = (sec[0]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3909   cs = TMath::Cos(alpha);
3910   sn = TMath::Sin(alpha);
3911   xx2= xyz[0][0]*cs-xyz[0][1]*sn;
3912   yy2= xyz[0][0]*sn+xyz[0][1]*cs;
3913   xyz[0][0] = xx2;
3914   xyz[0][1] = yy2;
3915   //
3916   //
3917   //
3918   Double_t x[5],c[15];
3919   //
3920   x[0]=xyz[2][1];
3921   x[1]=xyz[2][2];
3922   x[4]=F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3923   x[2]=F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3924   x[3]=F3n(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2],x[4]);
3925   //
3926   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3927   //
3928   Double_t sy1=0.2, sz1=0.2;
3929   Double_t sy2=0.2, sz2=0.2;
3930   Double_t sy3=0.2;
3931   //
3932   Double_t f40=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3933   Double_t f42=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3934   Double_t f43=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[4])/sy;
3935   Double_t f20=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3936   Double_t f22=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3937   Double_t f23=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[2])/sy;
3938   //
3939   Double_t f30=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3940   Double_t f31=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2]+sz,xyz[0][2])-x[3])/sz;
3941   Double_t f32=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy,xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3942   Double_t f34=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2]+sz)-x[3])/sz;
3943
3944
3945   c[0]=sy1;
3946   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3947   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3948   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3949   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3950   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3951   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3952   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3953
3954   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(xyz[2][0]);
3955   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, xyz[2][0], sec[2]*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3956   seed->fLastPoint  = row[2];
3957   seed->fFirstPoint = row[2];
3958   for (Int_t i=row[0];i<row[2];i++){
3959     seed->fIndex[i] = track->fIndex[i];
3960   }
3961
3962   return seed;
3963 }
3964
3965 void  AliTPCtrackerMI::FindKinks(TObjArray * array, AliESD *esd)
3966 {
3967   //
3968   //  find kinks
3969   //
3970   //
3971
3972   TObjArray *kinks= new TObjArray(10000);
3973   //  TObjArray *v0s= new TObjArray(10000);
3974   Int_t nentries = array->GetEntriesFast();
3975   AliHelix *helixes      = new AliHelix[nentries];
3976   Int_t    *sign         = new Int_t[nentries];
3977   Int_t    *nclusters    = new Int_t[nentries];
3978   Float_t  *alpha        = new Float_t[nentries];
3979   AliESDkink * kink      = new AliESDkink();
3980   Int_t      * usage     = new Int_t[nentries];
3981   Float_t  *zm           = new Float_t[nentries];
3982   Float_t  *z0           = new Float_t[nentries];
3983   Float_t  *fim          = new Float_t[nentries];
3984   Float_t  *shared       = new Float_t[nentries];
3985   Bool_t   *circular     = new Bool_t[nentries];
3986   Float_t *dca          = new Float_t[nentries];
3987   //const AliESDVertex * primvertex = esd->GetVertex();
3988   //
3989   //  nentries = array->GetEntriesFast();
3990   //
3991
3992   //
3993   //
3994   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
3995     sign[i]=0;
3996     usage[i]=0;
3997     AliTPCseed* track = (AliTPCseed*)array->At(i);
3998     if (!track) continue;
3999     track->fCircular =0;
4000     shared[i] = kFALSE;
4001     track->UpdatePoints();
4002     if (( track->GetPoints()[2]- track->GetPoints()[0])>5 && track->GetPoints()[3]>0.8){
4003     }
4004     nclusters[i]=track->GetNumberOfClusters();
4005     alpha[i] = track->GetAlpha();
4006     new (&helixes[i]) AliHelix(*track);
4007     Double_t xyz[3];
4008     helixes[i].Evaluate(0,xyz);
4009     sign[i] = (track->GetC()>0) ? -1:1;
4010     Double_t x,y,z;
4011     x=160;
4012     if (track->GetProlongation(x,y,z)){
4013       zm[i]  = z;
4014       fim[i] = alpha[i]+TMath::ATan2(y,x);
4015     }
4016     else{
4017       zm[i]  = track->GetZ();
4018       fim[i] = alpha[i];
4019     }
4020     z0[i]=1000;
4021     circular[i]= kFALSE;
4022     if (track->GetProlongation(0,y,z))  z0[i] = z;
4023     dca[i] = track->GetD(0,0);
4024   }
4025   //
4026   //
4027   TStopwatch timer;
4028   timer.Start();
4029   Int_t ncandidates =0;
4030   Int_t nall =0;
4031   Int_t ntracks=0;
4032   Double_t phase[2][2],radius[2];
4033
4034   //
4035   // Find circling track
4036   TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
4037   //
4038   for (Int_t i0=0;i0<nentries;i0++){
4039     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i0);
4040     if (!track0) continue;
4041     if (track0->fN<40) continue;
4042     if (TMath::Abs(1./track0->fP4)>200) continue;
4043     for (Int_t i1=i0+1;i1<nentries;i1++){
4044       AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(i1);
4045       if (!track1) continue;
4046       if (track1->fN<40)                  continue;
4047       if ( TMath::Abs(track1->fP3+track0->fP3)>0.1) continue;
4048       if (track0->fBConstrain&&track1->fBConstrain) continue;
4049       if (TMath::Abs(1./track1->fP4)>200) continue;
4050       if (track1->fP4*track0->fP4>0)      continue;
4051       if (track1->fP3*track0->fP3>0)      continue;
4052       if (max(TMath::Abs(1./track0->fP4),TMath::Abs(1./track1->fP4))>190) continue;
4053       if (track0->fBConstrain&&TMath::Abs(track1->fP4)<TMath::Abs(track0->fP4)) continue; //returning - lower momenta
4054       if (track1->fBConstrain&&TMath::Abs(track0->fP4)<TMath::Abs(track1->fP4)) continue; //returning - lower momenta
4055       //
4056       Float_t mindcar = TMath::Min(TMath::Abs(dca[i0]),TMath::Abs(dca[i1]));
4057       if (mindcar<5)   continue;
4058       Float_t mindcaz = TMath::Min(TMath::Abs(z0[i0]-GetZ()),TMath::Abs(z0[i1]-GetZ()));
4059       if (mindcaz<5) continue;
4060       if (mindcar+mindcaz<20) continue;
4061       //
4062       //
4063       Float_t xc0 = helixes[i0].GetHelix(6);
4064       Float_t yc0 = helixes[i0].GetHelix(7);
4065       Float_t r0  = helixes[i0].GetHelix(8);
4066       Float_t xc1 = helixes[i1].GetHelix(6);
4067       Float_t yc1 = helixes[i1].GetHelix(7);
4068       Float_t r1  = helixes[i1].GetHelix(8);
4069
4070       Float_t rmean = (r0+r1)*0.5;
4071       Float_t delta =TMath::Sqrt((xc1-xc0)*(xc1-xc0)+(yc1-yc0)*(yc1-yc0));
4072       //if (delta>30) continue;
4073       if (delta>rmean*0.25) continue;
4074       if (TMath::Abs(r0-r1)/rmean>0.3) continue;
4075       //
4076       Int_t npoints = helixes[i0].GetRPHIintersections(helixes[i1], phase, radius,10);
4077       if (npoints==0) continue;
4078       helixes[i0].GetClosestPhases(helixes[i1], phase);
4079       //
4080       Double_t xyz0[3];
4081       Double_t xyz1[3];
4082       Double_t hangles[3];
4083       helixes[i0].Evaluate(phase[0][0],xyz0);
4084       helixes[i1].Evaluate(phase[0][1],xyz1);
4085
4086       helixes[i0].GetAngle(phase[0][0],helixes[i1],phase[0][1],hangles);
4087       Double_t deltah[2],deltabest;
4088       if (hangles[2]<2.8) continue;
4089       /*
4090       cstream<<"C"<<track0->fLab<<track1->fLab<<
4091         track0->fP3<<track1->fP3<<
4092         track0->fP4<<track1->fP4<<
4093         delta<<rmean<<npoints<<
4094         hangles[0]<<hangles[2]<<
4095         xyz0[2]<<xyz1[2]<<radius[0]<<"\n";
4096       */
4097       if (npoints>0){
4098         Int_t ibest=0;
4099         helixes[i0].ParabolicDCA(helixes[i1],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],deltah[0],2);
4100         if (npoints==2){
4101           helixes[i0].ParabolicDCA(helixes[i1],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],deltah[1],2);
4102           if (deltah[1]<deltah[0]) ibest=1;
4103         }
4104         deltabest  = TMath::Sqrt(deltah[ibest]);
4105         helixes[i0].Evaluate(phase[ibest][0],xyz0);
4106         helixes[i1].Evaluate(phase[ibest][1],xyz1);
4107         helixes[i0].GetAngle(phase[ibest][0],helixes[i1],phase[ibest][1],hangles);
4108         Double_t radiusbest = TMath::Sqrt(radius[ibest]);
4109         //
4110         if (deltabest>6) continue;
4111         if (mindcar+mindcaz<40 && (hangles[2]<3.12||deltabest>3)) continue;
4112         Bool_t sign =kFALSE;
4113         if (hangles[2]>3.06) sign =kTRUE;
4114         //
4115         if (sign){
4116           circular[i0] = kTRUE;
4117           circular[i1] = kTRUE;
4118           if (TMath::Abs(track0->fP4)<TMath::Abs(track1->fP4)){
4119             track0->fCircular += 1;
4120             track1->fCircular += 2;
4121           }
4122           else{
4123             track1->fCircular += 1;
4124             track0->fCircular += 2;
4125           }
4126         }
4127         if (sign&&0){
4128           //debug stream
4129           cstream<<"Curling"<<
4130             "lab0="<<track0->fLab<<
4131             "lab1="<<track1->fLab<<
4132             "Tr0.="<<track0<<
4133             "Tr1.="<<track1<<
4134             "dca0="<<dca[i0]<<
4135             "dca1="<<dca[i1]<<
4136             "mindcar="<<mindcar<<
4137             "mindcaz="<<mindcaz<<
4138             "delta="<<delta<<
4139             "rmean="<<rmean<<
4140             "npoints="<<npoints<<
4141             "hangles0="<<hangles[0]<<
4142             "hangles2="<<hangles[2]<<
4143             "xyz0="<<xyz0[2]<<
4144             "xyzz1="<<xyz1[2]<<
4145             "z0="<<z0[i0]<<
4146             "z1="<<z0[i1]<<
4147             "radius="<<radiusbest<<
4148             "deltabest="<<deltabest<<
4149             "phase0="<<phase[ibest][0]<<
4150             "phase1="<<phase[ibest][1]<<
4151             "\n";
4152         }
4153       }
4154     }
4155   }
4156   //
4157   //  Finf kinks loop
4158   //
4159   //
4160   for (Int_t i =0;i<nentries;i++){
4161     if (sign[i]==0) continue;
4162     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4163     ntracks++;
4164     //
4165     Double_t cradius0 = 40*40;
4166     Double_t cradius1 = 270*270;
4167     Double_t cdist1=8.;
4168     Double_t cdist2=8.;
4169     Double_t cdist3=0.55;
4170     for (Int_t j =i+1;j<nentries;j++){
4171       nall++;
4172       if (sign[j]*sign[i]<1) continue;
4173       if ( (nclusters[i]+nclusters[j])>200) continue;
4174       if ( (nclusters[i]+nclusters[j])<80) continue;
4175       if ( TMath::Abs(zm[i]-zm[j])>60.) continue;
4176       if ( TMath::Abs(fim[i]-fim[j])>0.6 && TMath::Abs(fim[i]-fim[j])<5.7 ) continue;
4177       //AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(j);  Double_t phase[2][2],radius[2];
4178       Int_t npoints = helixes[i].GetRPHIintersections(helixes[j], phase, radius,20);
4179       if (npoints<1) continue;
4180       // cuts on radius
4181       if (npoints==1){
4182         if (radius[0]<cradius0||radius[0]>cradius1) continue;
4183       }
4184       else{
4185         if ( (radius[0]<cradius0||radius[0]>cradius1) && (radius[1]<cradius0||radius[1]>cradius1) ) continue;
4186       }
4187       //
4188       Double_t delta1=10000,delta2=10000;
4189       // cuts on the intersection radius
4190       helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
4191       if (radius[0]<20&&delta1<1) continue; //intersection at vertex
4192       if (radius[0]<10&&delta1<3) continue; //intersection at vertex
4193       if (npoints==2){
4194         helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
4195         if (radius[1]<20&&delta2<1) continue;  //intersection at vertex
4196         if (radius[1]<10&&delta2<3) continue;  //intersection at vertex
4197       }
4198       //
4199       Double_t distance1 = TMath::Min(delta1,delta2);
4200       if (distance1>cdist1) continue;  // cut on DCA linear approximation
4201       //
4202       npoints = helixes[i].GetRPHIintersections(helixes[j], phase, radius,20);
4203       helixes[i].ParabolicDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
4204       if (radius[0]<20&&delta1<1) continue; //intersection at vertex
4205       if (radius[0]<10&&delta1<3) continue; //intersection at vertex
4206       //
4207       if (npoints==2){
4208         helixes[i].ParabolicDCA(helixes[j],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
4209         if (radius[1]<20&&delta2<1) continue;  //intersection at vertex
4210         if (radius[1]<10&&delta2<3) continue;  //intersection at vertex
4211       }
4212       distance1 = TMath::Min(delta1,delta2);
4213       Float_t rkink =0;
4214       if (delta1<delta2){
4215         rkink = TMath::Sqrt(radius[0]);
4216       }
4217       else{
4218         rkink = TMath::Sqrt(radius[1]);
4219       }
4220       if (distance1>cdist2) continue;
4221       //
4222       //
4223       AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(j);
4224       //
4225       //
4226       Int_t row0 = GetRowNumber(rkink);
4227       if (row0<10)  continue;
4228       if (row0>150) continue;
4229       //
4230       //
4231       Float_t dens00=-1,dens01=-1;
4232       Float_t dens10=-1,dens11=-1;
4233       //
4234       Int_t found,foundable,shared;
4235       track0->GetClusterStatistic(0,row0-5, found, foundable,shared,kFALSE);
4236       if (foundable>5) dens00 = Float_t(found)/Float_t(foundable);
4237       track0->GetClusterStatistic(row0+5,155, found, foundable,shared,kFALSE);
4238       if (foundable>5) dens01 = Float_t(found)/Float_t(foundable);
4239       //
4240       track1->GetClusterStatistic(0,row0-5, found, foundable,shared,kFALSE);
4241       if (foundable>10) dens10 = Float_t(found)/Float_t(foundable);
4242       track1->GetClusterStatistic(row0+5,155, found, foundable,shared,kFALSE);
4243       if (foundable>10) dens11 = Float_t(found)/Float_t(foundable);
4244       //
4245       if (dens00<dens10 && dens01<dens11) continue;
4246       if (dens00>dens10 && dens01>dens11) continue;
4247       if (TMath::Max(dens00,dens10)<0.1)  continue;
4248       if (TMath::Max(dens01,dens11)<0.3)  continue;
4249       //
4250       if (TMath::Min(dens00,dens10)>0.6)  continue;
4251       if (TMath::Min(dens01,dens11)>0.6)  continue;
4252
4253       //
4254       AliTPCseed * ktrack0, *ktrack1;
4255       if (dens00>dens10){
4256         ktrack0 = track0;
4257         ktrack1 = track1;
4258       }
4259       else{
4260         ktrack0 = track1;
4261         ktrack1 = track0;
4262       }
4263       if (TMath::Abs(ktrack0->GetC())>5) continue; // cut on the curvature for mother particle
4264       AliExternalTrackParam paramm(*ktrack0);
4265       AliExternalTrackParam paramd(*ktrack1);
4266       if (row0>60&&ktrack1->GetReference().GetX()>90.) new (&paramd) AliExternalTrackParam(ktrack1->GetReference());
4267       //
4268       //
4269       kink->SetMother(paramm);
4270       kink->SetDaughter(paramd);
4271       kink->Update();
4272
4273       Float_t x[3] = { kink->GetPosition()[0],kink->GetPosition()[1],kink->GetPosition()[2]};
4274       Int_t index[4];
4275       fParam->Transform0to1(x,index);
4276       fParam->Transform1to2(x,index);
4277       row0 = GetRowNumber(x[0]);
4278
4279       if (kink->GetR()<100) continue;
4280       if (kink->GetR()>240) continue;
4281       if (kink->GetPosition()[2]/kink->GetR()>AliTPCReconstructor::GetCtgRange()) continue;  //out of fiducial volume
4282       if (kink->GetDistance()>cdist3) continue;
4283       Float_t dird = kink->GetDaughterP()[0]*kink->GetPosition()[0]+kink->GetDaughterP()[1]*kink->GetPosition()[1];  // rough direction estimate
4284       if (dird<0) continue;
4285
4286       Float_t dirm = kink->GetMotherP()[0]*kink->GetPosition()[0]+kink->GetMotherP()[1]*kink->GetPosition()[1];  // rough direction estimate
4287       if (dirm<0) continue;
4288       Float_t mpt = TMath::Sqrt(kink->GetMotherP()[0]*kink->GetMotherP()[0]+kink->GetMotherP()[1]*kink->GetMotherP()[1]);
4289       if (mpt<0.2) continue;
4290
4291       if (mpt<1){
4292         //for high momenta momentum not defined well in first iteration
4293         Double_t qt   =  TMath::Sin(kink->GetAngle(2))*ktrack1->P();
4294         if (qt>0.35) continue;
4295       }
4296
4297       kink->SetLabel(CookLabel(ktrack0,0.4,0,row0),0);
4298       kink->SetLabel(CookLabel(ktrack1,0.4,row0,160),1);
4299       if (dens00>dens10){
4300         kink->SetTPCDensity(dens00,0,0);
4301         kink->SetTPCDensity(dens01,0,1);
4302         kink->SetTPCDensity(dens10,1,0);
4303         kink->SetTPCDensity(dens11,1,1);
4304         kink->SetIndex(i,0);
4305         kink->SetIndex(j,1);
4306       }
4307       else{
4308         kink->SetTPCDensity(dens10,0,0);
4309         kink->SetTPCDensity(dens11,0,1);
4310         kink->SetTPCDensity(dens00,1,0);
4311         kink->SetTPCDensity(dens01,1,1);
4312         kink->SetIndex(j,0);
4313         kink->SetIndex(i,1);
4314       }
4315
4316       if (mpt<1||kink->GetAngle(2)>0.1){
4317         //      angle and densities  not defined yet
4318         if (kink->GetTPCDensityFactor()<0.8) continue;
4319         if ((2-kink->GetTPCDensityFactor())*kink->GetDistance() >0.25) continue;
4320         if (kink->GetAngle(2)*ktrack0->P()<0.003) continue; //too small angle
4321         if (kink->GetAngle(2)>0.2&&kink->GetTPCDensityFactor()<1.15) continue;
4322         if (kink->GetAngle(2)>0.2&&kink->GetTPCDensity(0,1)>0.05) continue;
4323
4324         Float_t criticalangle = track0->fC22+track0->fC33;
4325         criticalangle+= track1->fC22+track1->fC33;
4326         criticalangle= 3*TMath::Sqrt(criticalangle);
4327         if (criticalangle>0.02) criticalangle=0.02;
4328         if (kink->GetAngle(2)<criticalangle) continue;
4329       }
4330       //
4331       Int_t drow = Int_t(2.+0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));  // overlap region defined
4332       Float_t shapesum =0;
4333       Float_t sum = 0;
4334       for ( Int_t row = row0-drow; row<row0+drow;row++){
4335         if (row<0) continue;
4336         if (row>155) continue;
4337         if (ktrack0->fClusterPointer[row]){
4338           AliTPCTrackerPoint *point =ktrack0->GetTrackPoint(row);
4339           shapesum+=point->GetSigmaY()+point->GetSigmaZ();
4340           sum++;
4341         }
4342         if (ktrack1->fClusterPointer[row]){
4343           AliTPCTrackerPoint *point =ktrack1->GetTrackPoint(row);
4344           shapesum+=point->GetSigmaY()+point->GetSigmaZ();
4345           sum++;
4346         }
4347       }
4348       if (sum<4){
4349         kink->SetShapeFactor(-1.);
4350       }
4351       else{
4352         kink->SetShapeFactor(shapesum/sum);
4353       }
4354       //      esd->AddKink(kink);
4355       kinks->AddLast(kink);
4356       kink = new AliESDkink;
4357       ncandidates++;
4358     }
4359   }
4360   //
4361   // sort the kinks according quality - and refit them towards vertex
4362   //
4363   Int_t       nkinks    = kinks->GetEntriesFast();
4364   Float_t    *quality   = new Float_t[nkinks];
4365   Int_t      *indexes   = new Int_t[nkinks];
4366   AliTPCseed *mothers   = new AliTPCseed[nkinks];
4367   AliTPCseed *daughters = new AliTPCseed[nkinks];
4368   //
4369   //
4370   for (Int_t i=0;i<nkinks;i++){
4371     quality[i] =100000;
4372     AliESDkink *kink = (AliESDkink*)kinks->At(i);
4373     //
4374     // refit kinks towards vertex
4375     //
4376     Int_t index0 = kink->GetIndex(0);
4377     Int_t index1 = kink->GetIndex(1);
4378     AliTPCseed * ktrack0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
4379     AliTPCseed * ktrack1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
4380     //
4381     Int_t sumn=ktrack0->fN+ktrack1->fN;
4382     //
4383     // Refit Kink under if too small angle
4384     //
4385     if (kink->GetAngle(2)<0.05){
4386       kink->SetTPCRow0(GetRowNumber(kink->GetR()));
4387       Int_t row0 = kink->GetTPCRow0();
4388       Int_t drow = Int_t(2.+0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
4389       //
4390       //
4391       Int_t last  = row0-drow;
4392       if (last<40) last=40;
4393       if (last<ktrack0->fFirstPoint+25) last = ktrack0->fFirstPoint+25;
4394       AliTPCseed* seed0 = ReSeed(ktrack0,last,kFALSE);
4395       //
4396       //
4397       Int_t first = row0+drow;
4398       if (first>130) first=130;
4399       if (first>ktrack1->fLastPoint-25) first = TMath::Max(ktrack1->fLastPoint-25,30);
4400       AliTPCseed* seed1 = ReSeed(ktrack1,first,kTRUE);
4401       //
4402       if (seed0 && seed1){
4403         kink->SetStatus(1,8);
4404         if (RefitKink(*seed0,*seed1,*kink)) kink->SetStatus(1,9);
4405         row0 = GetRowNumber(kink->GetR());
4406         sumn = seed0->fN+seed1->fN;
4407         new (&mothers[i])   AliTPCseed(*seed0);
4408         new (&daughters[i]) AliTPCseed(*seed1);
4409       }
4410       else{
4411         delete kinks->RemoveAt(i);
4412         if (seed0) delete seed0;
4413         if (seed1) delete seed1;
4414         continue;
4415       }
4416       if (kink->GetDistance()>0.5 || kink->GetR()<110 || kink->GetR()>240) {
4417         delete kinks->RemoveAt(i);
4418         if (seed0) delete seed0;
4419         if (seed1) delete seed1;
4420         continue;
4421       }
4422       //
4423       delete seed0;
4424       delete seed1;
4425     }
4426     //
4427     if (kink) quality[i] = 160*((0.1+kink->GetDistance())*(2.-kink->GetTPCDensityFactor()))/(sumn+40.);  //the longest -clossest will win
4428   }
4429   TMath::Sort(nkinks,quality,indexes,kFALSE);
4430   //
4431   //remove double find kinks
4432   //
4433   for (Int_t ikink0=1;ikink0<nkinks;ikink0++){
4434     AliESDkink * kink0 = (AliESDkink*) kinks->At(indexes[ikink0]);
4435     if (!kink0) continue;
4436     //
4437     for (Int_t ikink1=0;ikink1<ikink0;ikink1++){
4438       if (!kink0) continue;
4439       AliESDkink * kink1 = (AliESDkink*) kinks->At(indexes[ikink1]);
4440       if (!kink1) continue;
4441       // if not close kink continue
4442       if (TMath::Abs(kink1->GetPosition()[2]-kink0->GetPosition()[2])>10) continue;
4443       if (TMath::Abs(kink1->GetPosition()[1]-kink0->GetPosition()[1])>10) continue;
4444       if (TMath::Abs(kink1->GetPosition()[0]-kink0->GetPosition()[0])>10) continue;
4445       //
4446       AliTPCseed &mother0   = mothers[indexes[ikink0]];
4447       AliTPCseed &daughter0 = daughters[indexes[ikink0]];
4448       AliTPCseed &mother1   = mothers[indexes[ikink1]];
4449       AliTPCseed &daughter1 = daughters[indexes[ikink1]];
4450       Int_t row0 = (kink0->GetTPCRow0()+kink1->GetTPCRow0())/2;
4451       //
4452       Int_t same  = 0;
4453       Int_t both  = 0;
4454       Int_t samem = 0;
4455       Int_t bothm = 0;
4456       Int_t samed = 0;
4457       Int_t bothd = 0;
4458       //
4459       for (Int_t i=0;i<row0;i++){
4460         if (mother0.fIndex[i]>0 && mother1.fIndex[i]>0){
4461           both++;
4462           bothm++;
4463           if (mother0.fIndex[i]==mother1.fIndex[i]){
4464             same++;
4465             samem++;
4466           }
4467         }
4468       }
4469
4470       for (Int_t i=row0;i<158;i++){
4471         if (daughter0.fIndex[i]>0 && daughter0.fIndex[i]>0){
4472           both++;
4473           bothd++;
4474           if (mother0.fIndex[i]==mother1.fIndex[i]){
4475             same++;
4476             samed++;
4477           }
4478         }
4479       }
4480       Float_t ratio = Float_t(same+1)/Float_t(both+1);
4481       Float_t ratiom = Float_t(samem+1)/Float_t(bothm+1);
4482       Float_t ratiod = Float_t(samed+1)/Float_t(bothd+1);
4483       if (ratio>0.3 && ratiom>0.5 &&ratiod>0.5) {
4484         Int_t sum0 = mother0.fN+daughter0.fN;
4485         Int_t sum1 = mother1.fN+daughter1.fN;
4486         if (sum1>sum0){
4487           shared[kink0->GetIndex(0)]= kTRUE;
4488           shared[kink0->GetIndex(1)]= kTRUE;
4489           delete kinks->RemoveAt(indexes[ikink0]);
4490         }
4491         else{
4492           shared[kink1->GetIndex(0)]= kTRUE;
4493           shared[kink1->GetIndex(1)]= kTRUE;
4494           delete kinks->RemoveAt(indexes[ikink1]);
4495         }
4496       }
4497     }
4498   }
4499
4500
4501   for (Int_t i=0;i<nkinks;i++){
4502     AliESDkink * kink = (AliESDkink*) kinks->At(indexes[i]);
4503     if (!kink) continue;
4504     kink->SetTPCRow0(GetRowNumber(kink->GetR()));
4505     Int_t index0 = kink->GetIndex(0);
4506     Int_t index1 = kink->GetIndex(1);
4507     if (circular[index0]||circular[index1]&&kink->GetDistance()>0.2) continue;
4508     kink->SetMultiple(usage[index0],0);
4509     kink->SetMultiple(usage[index1],1);
4510     if (kink->GetMultiple()[0]+kink->GetMultiple()[1]>2) continue;
4511     if (kink->GetMultiple()[0]+kink->GetMultiple()[1]>0 && quality[indexes[i]]>0.2) continue;
4512     if (kink->GetMultiple()[0]+kink->GetMultiple()[1]>0 && kink->GetDistance()>0.2) continue;
4513     if (circular[index0]||circular[index1]&&kink->GetDistance()>0.1) continue;
4514
4515     AliTPCseed * ktrack0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
4516     AliTPCseed * ktrack1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
4517     if (!ktrack0 || !ktrack1) continue;
4518     Int_t index = esd->AddKink(kink);
4519     //
4520     //
4521     if ( ktrack0->fKinkIndexes[0]==0 && ktrack1->fKinkIndexes[0]==0) {  //best kink
4522       if (mothers[indexes[i]].fN>20 && daughters[indexes[i]].fN>20 && (mothers[indexes[i]].fN+daughters[indexes[i]].fN)>100){
4523         new (ktrack0) AliTPCseed(mothers[indexes[i]]);
4524         new (ktrack1) AliTPCseed(daughters[indexes[i]]);
4525       }
4526     }
4527     //
4528     ktrack0->fKinkIndexes[usage[index0]] = -(index+1);
4529     ktrack1->fKinkIndexes[usage[index1]] =  (index+1);
4530     usage[index0]++;
4531     usage[index1]++;
4532   }
4533   //
4534   // Remove tracks corresponding to shared kink's
4535   //
4536   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4537     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4538     if (!track0) continue;
4539     if (track0->fKinkIndexes[0]!=0) continue;
4540     if (shared[i]) delete array->RemoveAt(i);
4541   }
4542
4543   //
4544   //
4545   RemoveUsed2(array,0.5,0.4,30);
4546   UnsignClusters();
4547   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4548     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4549     if (!track0) continue;
4550     track0->CookdEdx(0.02,0.6);
4551     track0->CookPID();
4552   }
4553   //
4554   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4555     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4556     if (!track0) continue;
4557     if (track0->Pt()<1.4) continue;
4558     //remove double high momenta tracks - overlapped with kink candidates
4559     Int_t shared=0;
4560     Int_t all   =0;
4561     for (Int_t icl=track0->fFirstPoint;icl<track0->fLastPoint; icl++){
4562       if (track0->fClusterPointer[icl]!=0){
4563         all++;
4564         if (track0->fClusterPointer[icl]->IsUsed(10)) shared++;
4565       }
4566     }
4567     if (Float_t(shared+1)/Float_t(nall+1)>0.5) {
4568       delete array->RemoveAt(i);
4569     }
4570     //
4571     if (track0->fKinkIndexes[0]!=0) continue;
4572     if (track0->GetNumberOfClusters()<80) continue;
4573
4574     AliTPCseed *pmother = new AliTPCseed();
4575     AliTPCseed *pdaughter = new AliTPCseed();
4576     AliESDkink *pkink = new AliESDkink;
4577
4578     AliTPCseed & mother = *pmother;
4579     AliTPCseed & daughter = *pdaughter;
4580     AliESDkink & kink = *pkink;
4581     if (CheckKinkPoint(track0,mother,daughter, kink)){
4582       if (mother.fN<30||daughter.fN<20) {
4583         delete pmother;
4584         delete pdaughter;
4585         delete pkink;
4586         continue;  //too short tracks
4587       }
4588       if (mother.Pt()<1.4) {
4589         delete pmother;
4590         delete pdaughter;
4591         delete pkink;
4592         continue;
4593       }
4594       Int_t row0= kink.GetTPCRow0();
4595       if (kink.GetDistance()>0.5 || kink.GetR()<110. || kink.GetR()>240.) {
4596         delete pmother;
4597         delete pdaughter;
4598         delete pkink;
4599         continue;
4600       }
4601       //
4602       Int_t index = esd->AddKink(&kink);
4603       mother.fKinkIndexes[0] = -(index+1);
4604       daughter.fKinkIndexes[0] = index+1;
4605       if (mother.fN>50) {
4606         delete array->RemoveAt(i);
4607         array->AddAt(new AliTPCseed(mother),i);
4608       }
4609       else{
4610         array->AddLast(new AliTPCseed(mother));
4611       }
4612       array->AddLast(new AliTPCseed(daughter));
4613       for (Int_t icl=0;icl<row0;icl++) {
4614         if (mother.fClusterPointer[icl]) mother.fClusterPointer[icl]->Use(20);
4615       }
4616       //
4617       for (Int_t icl=row0;icl<158;icl++) {
4618         if (daughter.fClusterPointer[icl]) daughter.fClusterPointer[icl]->Use(20);
4619       }
4620       //
4621     }
4622     delete pmother;
4623     delete pdaughter;
4624     delete pkink;
4625   }
4626
4627   delete [] daughters;
4628   delete [] mothers;
4629   //
4630   //
4631   delete [] dca;
4632   delete []circular;
4633   delete []shared;
4634   delete []quality;
4635   delete []indexes;
4636   //
4637   delete kink;
4638   delete[]fim;
4639   delete[] zm;
4640   delete[] z0;
4641   delete [] usage;
4642   delete[] alpha;
4643   delete[] nclusters;
4644   delete[] sign;
4645   delete[] helixes;
4646   kinks->Delete();
4647   delete kinks;
4648
4649   printf("Ncandidates=\t%d\t%d\t%d\t%d\n",esd->GetNumberOfKinks(),ncandidates,ntracks,nall);
4650   timer.Print();
4651 }
4652
4653 void  AliTPCtrackerMI::FindV0s(TObjArray * array, AliESD *esd)
4654 {
4655   //
4656   //  find V0s
4657   //
4658   //
4659   TObjArray *tpcv0s      = new TObjArray(100000);
4660   Int_t     nentries     = array->GetEntriesFast();
4661   AliHelix *helixes      = new AliHelix[nentries];
4662   Int_t    *sign         = new Int_t[nentries];
4663   Float_t  *alpha        = new Float_t[nentries];
4664   Float_t  *z0           = new Float_t[nentries];
4665   Float_t  *dca          = new Float_t[nentries];
4666   Float_t  *sdcar        = new Float_t[nentries];
4667   Float_t  *cdcar        = new Float_t[nentries];
4668   Float_t  *pulldcar     = new Float_t[nentries];
4669   Float_t  *pulldcaz     = new Float_t[nentries];
4670   Float_t  *pulldca      = new Float_t[nentries];
4671   Bool_t   *isPrim       = new Bool_t[nentries];
4672   const AliESDVertex * primvertex = esd->GetVertex();
4673   Double_t             zvertex = primvertex->GetZv();
4674   //
4675   //  nentries = array->GetEntriesFast();
4676   //
4677   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4678     sign[i]=0;
4679     isPrim[i]=0;
4680     AliTPCseed* track = (AliTPCseed*)array->At(i);
4681     if (!track) continue;
4682     track->GetV0Indexes()[0] = 0;  //rest v0 indexes
4683     track->GetV0Indexes()[1] = 0;  //rest v0 indexes
4684     track->GetV0Indexes()[2] = 0;  //rest v0 indexes
4685     //
4686     alpha[i] = track->GetAlpha();
4687     new (&helixes[i]) AliHelix(*track);
4688     Double_t xyz[3];
4689     helixes[i].Evaluate(0,xyz);
4690     sign[i] = (track->GetC()>0) ? -1:1;
4691     Double_t x,y,z;
4692     x=160;
4693     z0[i]=1000;
4694     if (track->GetProlongation(0,y,z))  z0[i] = z;
4695     dca[i] = track->GetD(0,0);
4696     //
4697     // dca error parrameterezation + pulls
4698     //
4699     sdcar[i]      = TMath::Sqrt(0.150*0.150+(100*track->fP4)*(100*track->fP4));
4700     if (TMath::Abs(track->fP3)>1) sdcar[i]*=2.5;
4701     cdcar[i]      = TMath::Exp((TMath::Abs(track->fP4)-0.0106)*525.3);
4702     pulldcar[i]   = (dca[i]-cdcar[i])/sdcar[i];
4703     pulldcaz[i]   = (z0[i]-zvertex)/sdcar[i];
4704     pulldca[i]    = TMath::Sqrt(pulldcar[i]*pulldcar[i]+pulldcaz[i]*pulldcaz[i]);
4705     if (track->fTPCr[1]+track->fTPCr[2]+track->fTPCr[3]>0.5) {
4706       if (pulldca[i]<3.) isPrim[i]=kTRUE;  //pion, muon and Kaon  3 sigma cut
4707     }
4708     if (track->fTPCr[4]>0.5) {
4709       if (pulldca[i]<0.5) isPrim[i]=kTRUE;  //proton 0.5 sigma cut
4710     }
4711     if (track->fTPCr[0]>0.4) {
4712       isPrim[i]=kFALSE;  //electron no  sigma cut
4713     }
4714   }
4715   //
4716   //
4717   TStopwatch timer;
4718   timer.Start();
4719   Int_t ncandidates =0;
4720   Int_t nall =0;
4721   Int_t ntracks=0;
4722   Double_t phase[2][2],radius[2];
4723   //
4724   //  Finf V0s loop
4725   //
4726   //
4727   // //
4728   TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
4729   Float_t fprimvertex[3]={GetX(),GetY(),GetZ()};
4730   AliESDV0MI vertex;
4731   Double_t cradius0 = 10*10;
4732   Double_t cradius1 = 200*200;
4733   Double_t cdist1=3.;
4734   Double_t cdist2=4.;
4735   Double_t cpointAngle = 0.95;
4736   //
4737   Double_t delta[2]={10000,10000};
4738   for (Int_t i =0;i<nentries;i++){
4739     if (sign[i]==0) continue;
4740     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4741     if (!track0) continue;
4742     cstream<<"Tracks"<<
4743       "Tr0.="<<track0<<
4744       "dca="<<dca[i]<<
4745       "z0="<<z0[i]<<
4746       "zvertex="<<zvertex<<
4747       "sdcar0="<<sdcar[i]<<
4748       "cdcar0="<<cdcar[i]<<
4749       "pulldcar0="<<pulldcar[i]<<
4750       "pulldcaz0="<<pulldcaz[i]<<
4751       "pulldca0="<<pulldca[i]<<
4752       "isPrim="<<isPrim[i]<<
4753       "\n";
4754     //
4755     if (track0->fP4<0) continue;
4756     if (track0->GetKinkIndex(0)>0||isPrim[i]) continue;   //daughter kink
4757     //
4758     if (TMath::Abs(helixes[i].GetHelix(4))<0.000000001) continue;
4759     ntracks++;
4760     // debug output
4761
4762
4763     for (Int_t j =0;j<nentries;j++){
4764       AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(j);
4765       if (!track1) continue;
4766       if (track1->GetKinkIndex(0)>0 || isPrim[j]) continue; //daughter kink
4767       if (sign[j]*sign[i]>0) continue;
4768       if (TMath::Abs(helixes[j].GetHelix(4))<0.000001) continue;
4769       if (track0->fCircular+track1->fCircular>1) continue;    //circling -returning track
4770       nall++;
4771       //
4772       // DCA to prim vertex cut
4773       //
4774       //
4775       delta[0]=10000;
4776       delta[1]=10000;
4777
4778       Int_t npoints = helixes[i].GetRPHIintersections(helixes[j], phase, radius,cdist2);
4779       if (npoints<1) continue;
4780       Int_t iclosest=0;
4781       // cuts on radius
4782       if (npoints==1){
4783         if (radius[0]<cradius0||radius[0]>cradius1) continue;
4784         helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta[0]);
4785         if (delta[0]>cdist1) continue;
4786       }
4787       else{
4788         if (TMath::Max(radius[0],radius[1])<cradius0|| TMath::Min(radius[0],radius[1])>cradius1) continue;
4789         helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta[0]);
4790         helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta[1]);
4791         if (delta[1]<delta[0]) iclosest=1;
4792         if (delta[iclosest]>cdist1) continue;
4793       }
4794       helixes[i].ParabolicDCA(helixes[j],phase[iclosest][0],phase[iclosest][1],radius[iclosest],delta[iclosest]);
4795       if (radius[iclosest]<cradius0 || radius[iclosest]>cradius1 || delta[iclosest]>cdist1) continue;
4796       //
4797       Double_t pointAngle = helixes[i].GetPointAngle(helixes[j],phase[iclosest],fprimvertex);
4798       if (pointAngle<cpointAngle) continue;
4799       //
4800       Bool_t isGamma = kFALSE;
4801       vertex.SetP(*track0); //track0 - plus
4802       vertex.SetM(*track1); //track1 - minus
4803       vertex.Update(fprimvertex);
4804       if (track0->fTPCr[0]>0.3&&track1->fTPCr[0]>0.3&&vertex.GetAnglep()[2]<0.15) isGamma=kTRUE;              // gamma conversion candidate
4805       Double_t pointAngle2 = vertex.GetPointAngle();
4806       //continue;
4807       if (vertex.GetPointAngle()<cpointAngle && (!isGamma)) continue; // point angle cut
4808       if (vertex.GetDist2()>2&&(!isGamma)) continue;         // point angle cut
4809       Float_t sigmae     = 0.15*0.15;
4810       if (vertex.GetRr()<80)
4811         sigmae += (sdcar[i]*sdcar[i]+sdcar[j]*sdcar[j])*(1.-vertex.GetRr()/80.)*(1.-vertex.GetRr()/80.);
4812       sigmae+= TMath::Sqrt(sigmae);
4813       if (vertex.GetDist2()/sigmae>3.&&(!isGamma)) continue;
4814       Float_t densb0=0,densb1=0,densa0=0,densa1=0;
4815       Int_t row0 = GetRowNumber(vertex.GetRr());
4816       if (row0>15){
4817         if (vertex.GetDist2()>0.2) continue;
4818         densb0     = track0->Density2(0,row0-5);
4819         densb1     = track1->Density2(0,row0-5);
4820         if (densb0>0.3|| densb1>0.3) continue;            //clusters before vertex
4821         densa0     = track0->Density2(row0+5,row0+40);
4822         densa1     = track1->Density2(row0+5,row0+40);
4823         if ((densa0<0.4|| densa1<0.4)&&(!isGamma)) continue;            //missing clusters after vertex
4824       }
4825       else{
4826         densa0     = track0->Density2(0,40);  //cluster density
4827         densa1     = track1->Density2(0,40);  //cluster density
4828         if ((vertex.GetRr()<80&&densa0+densa1<1.)&&(!isGamma)) continue;
4829       }
4830       vertex.SetLab(0,track0->GetLabel());
4831       vertex.SetLab(1,track1->GetLabel());
4832       vertex.SetChi2After((densa0+densa1)*0.5);
4833       vertex.SetChi2Before((densb0+densb1)*0.5);
4834       vertex.SetIndex(0,i);
4835       vertex.SetIndex(1,j);
4836       vertex.SetStatus(1); // TPC v0 candidate
4837       vertex.SetRp(track0->fTPCr);
4838       vertex.SetRm(track1->fTPCr);
4839       tpcv0s->AddLast(new AliESDV0MI(vertex));
4840       ncandidates++;
4841       {
4842         Int_t eventNr = esd->GetEventNumber();
4843         Double_t radiusm= (delta[0]<delta[1])? TMath::Sqrt(radius[0]):TMath::Sqrt(radius[1]);
4844         Double_t deltam= (delta[0]<delta[1])? TMath::Sqrt(delta[0]):TMath::Sqrt(delta[1]);
4845         cstream<<"V0"<<
4846           "Event="<<eventNr<<
4847           "vertex.="<<&vertex<<
4848           "Tr0.="<<track0<<
4849           "lab0="<<track0->fLab<<
4850           "Helix0.="<<&helixes[i]<<
4851           "Tr1.="<<track1<<
4852           "lab1="<<track1->fLab<<
4853           "Helix1.="<<&helixes[j]<<
4854           "pointAngle="<<pointAngle<<
4855           "pointAngle2="<<pointAngle2<<
4856           "dca0="<<dca[i]<<
4857           "dca1="<<dca[j]<<
4858           "z0="<<z0[i]<<
4859           "z1="<<z0[j]<<
4860           "zvertex="<<zvertex<<
4861           "circular0="<<track0->fCircular<<
4862           "circular1="<<track1->fCircular<<
4863           "npoints="<<npoints<<
4864           "radius0="<<radius[0]<<
4865           "delta0="<<delta[0]<<
4866           "radius1="<<radius[1]<<
4867           "delta1="<<delta[1]<<
4868           "radiusm="<<radiusm<<
4869           "deltam="<<deltam<<
4870           "sdcar0="<<sdcar[i]<<
4871           "sdcar1="<<sdcar[j]<<
4872           "cdcar0="<<cdcar[i]<<
4873           "cdcar1="<<cdcar[j]<<
4874           "pulldcar0="<<pulldcar[i]<<
4875           "pulldcar1="<<pulldcar[j]<<
4876           "pulldcaz0="<<pulldcaz[i]<<
4877           "pulldcaz1="<<pulldcaz[j]<<
4878           "pulldca0="<<pulldca[i]<<
4879           "pulldca1="<<pulldca[j]<<
4880           "densb0="<<densb0<<
4881           "densb1="<<densb1<<
4882           "densa0="<<densa0<<
4883           "densa1="<<densa1<<
4884           "sigmae="<<sigmae<<
4885           "\n";
4886       }
4887     }
4888   }
4889   Float_t *quality = new Float_t[ncandidates];
4890   Int_t *indexes = new Int_t[ncandidates];
4891   Int_t naccepted =0;
4892   for (Int_t i=0;i<ncandidates;i++){
4893     quality[i]     = 0;
4894     AliESDV0MI *v0 = (AliESDV0MI*)tpcv0s->At(i);
4895     quality[i]     = 1./(1.00001-v0->GetPointAngle());   //base point angle
4896     // quality[i]    /= (0.5+v0->GetDist2());
4897     // quality[i]    *= v0->GetChi2After();               //density factor
4898     Double_t minpulldca = TMath::Min(2.+pulldca[v0->GetIndex(0)],(2.+pulldca[v0->GetIndex(1)]) );     //pull
4899     Int_t index0 = v0->GetIndex(0);
4900     Int_t index1 = v0->GetIndex(1);
4901     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
4902     AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
4903     if (track0->fTPCr[0]>0.3&&track1->fTPCr[0]>0.3&&v0->GetAnglep()[2]<0.15) quality[i]+=1000000;              // gamma conversion candidate
4904     if (track0->fTPCr[4]>0.9||track1->fTPCr[4]>0.9&&minpulldca>4) quality[i]*=10;    // lambda candidate candidate
4905   }
4906
4907   TMath::Sort(ncandidates,quality,indexes,kTRUE);
4908   //
4909   //
4910   for (Int_t i=0;i<ncandidates;i++){
4911     AliESDV0MI * v0 = (AliESDV0MI*)tpcv0s->At(indexes[i]);
4912     if (!v0) continue;
4913     Int_t index0 = v0->GetIndex(0);
4914     Int_t index1 = v0->GetIndex(1);
4915     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(index0);
4916     AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(index1);
4917     if (!track0||!track1) {
4918       printf("Bug\n");
4919       continue;
4920     }
4921     Bool_t accept =kTRUE;  //default accept
4922     Int_t *v0indexes0 = track0->GetV0Indexes();
4923     Int_t *v0indexes1 = track1->GetV0Indexes();
4924     //
4925     Int_t order0 = (v0indexes0[0]!=0) ? 1:0;
4926     Int_t order1 = (v0indexes1[0]!=0) ? 1:0;
4927     if (v0indexes0[1]!=0) order0 =2;
4928     if (v0indexes1[1]!=0) order1 =2;
4929     //
4930     if (v0indexes0[2]!=0) {order0=3; accept=kFALSE;}
4931     if (v0indexes0[2]!=0) {order1=3; accept=kFALSE;}
4932     //
4933     AliESDV0MI * v02 = v0;
4934     if (accept){
4935       v0->SetOrder(0,order0);
4936       v0->SetOrder(1,order1);
4937       v0->SetOrder(1,order0+order1);
4938       Int_t index = esd->AddV0MI(v0);
4939       v02 = esd->GetV0MI(index);
4940       v0indexes0[order0]=index;
4941       v0indexes1[order1]=index;
4942       naccepted++;
4943     }
4944     {
4945       Int_t eventNr = esd->GetEventNumber();
4946       cstream<<"V02"<<
4947         "Event="<<eventNr<<
4948         "vertex.="<<v0<<
4949         "vertex2.="<<v02<<
4950         "Tr0.="<<track0<<
4951         "lab0="<<track0->fLab<<
4952         "Tr1.="<<track1<<
4953         "lab1="<<track1->fLab<<
4954         "dca0="<<dca[index0]<<
4955         "dca1="<<dca[index1]<<
4956         "order0="<<order0<<
4957         "order1="<<order1<<
4958         "accept="<<accept<<
4959         "quality="<<quality[i]<<
4960         "pulldca0="<<pulldca[index0]<<
4961         "pulldca1="<<pulldca[index1]<<
4962         "index="<<i<<
4963         "\n";
4964     }
4965   }
4966
4967
4968   //
4969   //
4970   delete []quality;
4971   delete []indexes;
4972 //
4973   delete [] isPrim;
4974   delete [] pulldca;
4975   delete [] pulldcaz;
4976   delete [] pulldcar;
4977   delete [] cdcar;
4978   delete [] sdcar;
4979   delete [] dca;
4980   //
4981   delete[] z0;
4982   delete[] alpha;
4983   delete[] sign;
4984   delete[] helixes;
4985   printf("TPC V0 finder : naccepted\t%d\tncandidates\t%d\tntracks\t%d\tnall\t%d\n",naccepted,ncandidates,ntracks,nall);
4986   timer.Print();
4987 }
4988
4989 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitKink(AliTPCseed &mother, AliTPCseed &daughter, AliESDkink &kink)
4990 {
4991   //
4992   // refit kink towards to the vertex
4993   //
4994   //
4995   Int_t row0 = GetRowNumber(kink.GetR());
4996   FollowProlongation(mother,0);
4997   mother.Reset(kFALSE);
4998   //
4999   FollowProlongation(daughter,row0);
5000   daughter.Reset(kFALSE);
5001   FollowBackProlongation(daughter,158);
5002   daughter.Reset(kFALSE);
5003   Int_t first = TMath::Max(row0-20,30);
5004   Int_t last  = TMath::Min(row0+20,140);
5005   //
5006   const Int_t kNdiv =5;
5007   AliTPCseed  param0[kNdiv];  // parameters along the track
5008   AliTPCseed  param1[kNdiv];  // parameters along the track
5009   AliESDkink   kinks[kNdiv];   // corresponding kink parameters
5010   //
5011   Int_t rows[kNdiv];
5012   for (Int_t irow=0; irow<kNdiv;irow++){
5013     rows[irow] = first +((last-first)*irow)/(kNdiv-1);
5014   }
5015   // store parameters along the track
5016   //
5017   for (Int_t irow=0;irow<kNdiv;irow++){
5018     FollowBackProlongation(mother, rows[irow]);
5019     FollowProlongation(daughter,rows[kNdiv-1-irow]);
5020     new(&param0[irow])     AliTPCseed(mother);
5021     new(&param1[kNdiv-1-irow])   AliTPCseed(daughter);
5022   }
5023   //
5024   // define kinks
5025   for (Int_t irow=0; irow<kNdiv-1;irow++){
5026     if (param0[irow].fN<kNdiv||param1[irow].fN<kNdiv) continue;
5027     kinks[irow].SetMother(param0[irow]);
5028     kinks[irow].SetDaughter(param1[irow]);
5029     kinks[irow].Update();
5030   }
5031   //
5032   // choose kink with best "quality"
5033   Int_t index =-1;
5034   Double_t mindist = 10000;
5035   for (Int_t irow=0;irow<kNdiv;irow++){
5036     if (param0[irow].fN<20||param1[irow].fN<20) continue;
5037     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())>240.) continue;
5038     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())<100.) continue;
5039     //
5040     Float_t normdist = TMath::Abs(param0[irow].fX-kinks[irow].GetR())*(0.1+kink.GetDistance());
5041     normdist/= (param0[irow].fN+param1[irow].fN+40.);
5042     if (normdist < mindist){
5043       mindist = normdist;
5044       index = irow;
5045     }
5046   }
5047   //
5048   if (index==-1) return 0;
5049   //
5050   //
5051   param0[index].Reset(kTRUE);
5052   FollowProlongation(param0[index],0);
5053   //
5054   new (&mother) AliTPCseed(param0[index]);
5055   new (&daughter) AliTPCseed(param1[index]);  // daughter in vertex
5056   //
5057   kink.SetMother(mother);
5058   kink.SetDaughter(daughter);
5059   kink.Update();
5060   kink.SetTPCRow0(GetRowNumber(kink.GetR()));
5061   kink.SetTPCncls(param0[index].fN,0);
5062   kink.SetTPCncls(param1[index].fN,1);
5063   kink.SetLabel(CookLabel(&mother,0.4, 0,kink.GetTPCRow0()),0);
5064   kink.SetLabel(CookLabel(&daughter,0.4, kink.GetTPCRow0(),160),1);
5065   mother.SetLabel(kink.GetLabel(0));
5066   daughter.SetLabel(kink.GetLabel(1));
5067
5068   return 1;
5069 }
5070
5071
5072 void AliTPCtrackerMI::UpdateKinkQualityM(AliTPCseed * seed){
5073   //
5074   // update Kink quality information for mother after back propagation
5075   //
5076   if (seed->GetKinkIndex(0)>=0) return;
5077   for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++){
5078     Int_t index = seed->GetKinkIndex(ikink);
5079     if (index>=0) break;
5080     index = TMath::Abs(index)-1;
5081     AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index);
5082     //kink->fTPCdensity2[0][0]=-1;
5083     //kink->fTPCdensity2[0][1]=-1;
5084     kink->SetTPCDensity2(-1,0,0);
5085     kink->SetTPCDensity2(1,0,1);
5086     //
5087     Int_t row0 = kink->GetTPCRow0() - 2 - Int_t( 0.5/ (0.05+kink->GetAngle(2)));
5088     if (row0<15) row0=15;
5089     //
5090     Int_t row1 = kink->GetTPCRow0() + 2 +  Int_t( 0.5/ (0.05+kink->GetAngle(2)));
5091     if (row1>145) row1=145;
5092     //
5093     Int_t found,foundable,shared;
5094     seed->GetClusterStatistic(0,row0, found, foundable,shared,kFALSE);
5095     if (foundable>5)   kink->SetTPCDensity2(Float_t(found)/Float_t(foundable),0,0);
5096     seed->GetClusterStatistic(row1,155, found, foundable,shared,kFALSE);
5097     if (foundable>5)   kink->SetTPCDensity2(Float_t(found)/Float_t(foundable),0,1);
5098   }
5099
5100 }
5101
5102 void AliTPCtrackerMI::UpdateKinkQualityD(AliTPCseed * seed){
5103   //
5104   // update Kink quality information for daughter after refit
5105   //
5106   if (seed->GetKinkIndex(0)<=0) return;
5107   for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++){
5108     Int_t index = seed->GetKinkIndex(ikink);
5109     if (index<=0) break;
5110     index = TMath::Abs(index)-1;
5111     AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index);
5112     kink->SetTPCDensity2(-1,1,0);
5113     kink->SetTPCDensity2(-1,1,1);
5114     //
5115     Int_t row0 = kink->GetTPCRow0() -2 - Int_t( 0.5/ (0.05+kink->GetAngle(2)));
5116     if (row0<15) row0=15;
5117     //
5118     Int_t row1 = kink->GetTPCRow0() +2 +  Int_t( 0.5/ (0.05+kink->GetAngle(2)));
5119     if (row1>145) row1=145;
5120     //
5121     Int_t found,foundable,shared;
5122     seed->GetClusterStatistic(0,row0, found, foundable,shared,kFALSE);
5123     if (foundable>5)   kink->SetTPCDensity2(Float_t(found)/Float_t(foundable),1,0);
5124     seed->GetClusterStatistic(row1,155, found, foundable,shared,kFALSE);
5125     if (foundable>5)   kink->SetTPCDensity2(Float_t(found)/Float_t(foundable),1,1);
5126   }
5127
5128 }
5129
5130
5131 Int_t  AliTPCtrackerMI::CheckKinkPoint(AliTPCseed*seed,AliTPCseed &mother, AliTPCseed &daughter, AliESDkink &kink)
5132 {
5133   //
5134   // check kink point for given track
5135   // if return value=0 kink point not found
5136   // otherwise seed0 correspond to mother particle
5137   //           seed1 correspond to daughter particle
5138   //           kink  parameter of kink point
5139
5140   Int_t middlerow = (seed->fFirstPoint+seed->fLastPoint)/2;
5141   Int_t first = seed->fFirstPoint;
5142   Int_t last  = seed->fLastPoint;
5143   if (last-first<20) return 0;          // shortest length - 2*30 = 60 pad-rows
5144
5145
5146   AliTPCseed *seed1 = ReSeed(seed,middlerow+20, kTRUE);  //middle of chamber
5147   if (!seed1) return 0;
5148   FollowProlongation(*seed1,seed->fLastPoint-20);
5149   seed1->Reset(kTRUE);
5150   FollowProlongation(*seed1,158);
5151   seed1->Reset(kTRUE);
5152   last = seed1->fLastPoint;
5153   //
5154   AliTPCseed *seed0 = new AliTPCseed(*seed);
5155   seed0->Reset(kFALSE);
5156   seed0->Reset();
5157   //
5158   AliTPCseed  param0[20];  // parameters along the track
5159   AliTPCseed  param1[20];  // parameters along the track
5160   AliESDkink            kinks[20];   // corresponding kink parameters
5161   Int_t rows[20];
5162   for (Int_t irow=0; irow<20;irow++){
5163     rows[irow] = first +((last-first)*irow)/19;
5164   }
5165   // store parameters along the track
5166   //
5167   for (Int_t irow=0;irow<20;irow++){
5168     FollowBackProlongation(*seed0, rows[irow]);
5169     FollowProlongation(*seed1,rows[19-irow]);
5170     new(&param0[irow])     AliTPCseed(*seed0);
5171     new(&param1[19-irow])   AliTPCseed(*seed1);
5172   }
5173   //
5174   // define kinks
5175   for (Int_t irow=0; irow<19;irow++){
5176     kinks[irow].SetMother(param0[irow]);
5177     kinks[irow].SetDaughter(param1[irow]);
5178     kinks[irow].Update();
5179   }
5180   //
5181   // choose kink with biggest change of angle
5182   Int_t index =-1;
5183   Double_t maxchange= 0;
5184   for (Int_t irow=1;irow<19;irow++){
5185     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())>240.) continue;
5186     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())<110.) continue;
5187     Float_t quality = TMath::Abs(kinks[irow].GetAngle(2))/(3.+TMath::Abs(kinks[irow].GetR()-param0[irow].fX));
5188     if ( quality > maxchange){
5189       maxchange = quality;
5190       index = irow;
5191       //
5192     }
5193   }
5194   delete seed0;
5195   delete seed1;
5196   if (index<0) return 0;
5197   //
5198   Int_t row0    = GetRowNumber(kinks[index].GetR());   //row 0 estimate
5199   seed0 = new AliTPCseed(param0[index]);
5200   seed1 = new AliTPCseed(param1[index]);
5201   seed0->Reset(kFALSE);
5202   seed1->Reset(kFALSE);
5203   seed0->ResetCovariance();
5204   seed1->ResetCovariance();
5205   FollowProlongation(*seed0,0);
5206   FollowBackProlongation(*seed1,158);
5207   new (&mother) AliTPCseed(*seed0);  // backup mother at position 0
5208   seed0->Reset(kFALSE);
5209   seed1->Reset(kFALSE);
5210   seed0->ResetCovariance();
5211   seed1->ResetCovariance();
5212   //
5213   first = TMath::Max(row0-20,0);
5214   last  = TMath::Min(row0+20,158);
5215   //
5216   for (Int_t irow=0; irow<20;irow++){
5217     rows[irow] = first +((last-first)*irow)/19;
5218   }
5219   // store parameters along the track
5220   //
5221   for (Int_t irow=0;irow<20;irow++){
5222     FollowBackProlongation(*seed0, rows[irow]);
5223     FollowProlongation(*seed1,rows[19-irow]);
5224     new(&param0[irow])     AliTPCseed(*seed0);
5225     new(&param1[19-irow])   AliTPCseed(*seed1);
5226   }
5227   //
5228   // define kinks
5229   for (Int_t irow=0; irow<19;irow++){
5230     kinks[irow].SetMother(param0[irow]);
5231     kinks[irow].SetDaughter(param1[irow]);
5232     //    param0[irow].Dump();
5233     //param1[irow].Dump();
5234     kinks[irow].Update();
5235   }
5236   //
5237   // choose kink with biggest change of angle
5238   index =-1;
5239   maxchange= 0;
5240   for (Int_t irow=0;irow<20;irow++){
5241     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())>250.) continue;
5242     if (TMath::Abs(kinks[irow].GetR())<90.) continue;
5243     Float_t quality = TMath::Abs(kinks[irow].GetAngle(2))/(3.+TMath::Abs(kinks[irow].GetR()-param0[irow].fX));
5244     if ( quality > maxchange){
5245       maxchange = quality;
5246       index = irow;
5247       //
5248     }
5249   }
5250   //
5251   //
5252   if (index==-1 || param0[index].fN+param1[index].fN<100){
5253     delete seed0;
5254     delete seed1;
5255     return 0;
5256   }
5257   //  Float_t anglesigma = TMath::Sqrt(param0[index].fC22+param0[index].fC33+param1[index].fC22+param1[index].fC33);
5258
5259   kink.SetMother(param0[index]);
5260   kink.SetDaughter(param1[index]);
5261   kink.Update();
5262   row0    = GetRowNumber(kink.GetR());
5263   kink.SetTPCRow0(row0);
5264   kink.SetLabel(CookLabel(seed0,0.5,0,row0),0);
5265   kink.SetLabel(CookLabel(seed1,0.5,row0,158),1);
5266   kink.SetIndex(-10,0);
5267   kink.SetIndex(int(param0[index].fN+param1[index].fN),1);
5268   kink.SetTPCncls(param0[index].fN,0);
5269   kink.SetTPCncls(param1[index].fN,1);
5270   //
5271   //
5272   //  new (&mother) AliTPCseed(param0[index]);
5273   new (&daughter) AliTPCseed(param1[index]);
5274   daughter.SetLabel(kink.GetLabel(1));
5275   param0[index].Reset(kTRUE);
5276   FollowProlongation(param0[index],0);
5277   new (&mother) AliTPCseed(param0[index]);
5278   mother.SetLabel(kink.GetLabel(0));
5279   delete seed0;
5280   delete seed1;
5281   //
5282   return 1;
5283 }
5284
5285
5286
5287
5288 AliTPCseed*  AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *t)
5289 {
5290   //
5291   // reseed - refit -  track
5292   //
5293   Int_t first = 0;
5294   //  Int_t last  = fSectors->GetNRows()-1;
5295   //
5296   if (fSectors == fOuterSec){
5297     first = TMath::Max(first, t->fFirstPoint-fInnerSec->GetNRows());
5298     //last  =
5299   }
5300   else
5301     first = t->fFirstPoint;
5302   //
5303   AliTPCseed * seed = MakeSeed(t,0.1,0.5,0.9);
5304   FollowBackProlongation(*t,fSectors->GetNRows()-1);
5305   t->Reset(kFALSE);
5306   FollowProlongation(*t,first);
5307   return seed;
5308 }
5309
5310
5311
5312
5313
5314
5315
5316 //_____________________________________________________________________________
5317 Int_t AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(const TFile *inp) {
5318   //-----------------------------------------------------------------
5319   // This function reades track seeds.
5320   //-----------------------------------------------------------------
5321   TDirectory *savedir=gDirectory;
5322
5323   TFile *in=(TFile*)inp;
5324   if (!in->IsOpen()) {
5325      cerr<<"AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(): input file is not open !\n";
5326      return 1;
5327   }
5328
5329   in->cd();
5330   TTree *seedTree=(TTree*)in->Get("Seeds");
5331   if (!seedTree) {
5332      cerr<<"AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(): ";
5333      cerr<<"can't get a tree with track seeds !\n";
5334      return 2;
5335   }
5336   AliTPCtrack *seed=new AliTPCtrack;
5337   seedTree->SetBranchAddress("tracks",&seed);
5338
5339   if (fSeeds==0) fSeeds=new TObjArray(15000);
5340
5341   Int_t n=(Int_t)seedTree->GetEntries();
5342   for (Int_t i=0; i<n; i++) {
5343      seedTree->GetEvent(i);
5344      fSeeds->AddLast(new AliTPCseed(*seed/*,seed->GetAlpha()*/));
5345   }
5346
5347   delete seed;
5348   delete seedTree;
5349   savedir->cd();
5350   return 0;
5351 }
5352
5353 Int_t AliTPCtrackerMI::Clusters2Tracks (AliESD *esd)
5354 {
5355   //
5356   if (fSeeds) DeleteSeeds();
5357   fEvent = esd;
5358   Clusters2Tracks();
5359   if (!fSeeds) return 1;
5360   FillESD(fSeeds);
5361   return 0;
5362   //
5363 }
5364
5365
5366 //_____________________________________________________________________________
5367 Int_t AliTPCtrackerMI::Clusters2Tracks() {
5368   //-----------------------------------------------------------------
5369   // This is a track finder.
5370   //-----------------------------------------------------------------
5371   TDirectory *savedir=gDirectory;
5372   TStopwatch timer;
5373
5374   fIteration = 0;
5375   fSeeds = Tracking();
5376
5377   if (fDebug>0){
5378     Info("Clusters2Tracks","Time for tracking: \t");timer.Print();timer.Start();
5379   }
5380   //activate again some tracks
5381   for (Int_t i=0; i<fSeeds->GetEntriesFast(); i++) {
5382     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5383     if (!pt) continue;
5384     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5385     if (nc<20) {
5386       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5387       continue;
5388     }
5389     CookLabel(pt,0.1);
5390     if (pt->fRemoval==10) {
5391       if (pt->GetDensityFirst(20)>0.8 || pt->GetDensityFirst(30)>0.8 || pt->GetDensityFirst(40)>0.7)
5392         pt->Desactivate(10);  // make track again active
5393       else{
5394         pt->Desactivate(20);
5395         delete fSeeds->RemoveAt(i);
5396       }
5397     }
5398   }
5399   //
5400   RemoveUsed2(fSeeds,0.85,0.85,0);
5401   FindKinks(fSeeds,fEvent);
5402   RemoveUsed2(fSeeds,0.5,0.4,20);
5403  //  //
5404 //   // refit short tracks
5405 //   //
5406   Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
5407 //   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5408 //     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5409 //     if (!pt) continue;
5410 //     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5411 //     if (nc<15) {
5412 //       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5413 //       continue;
5414 //     }
5415 //     if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue; // ignore kink candidates
5416 //     if (nc>100) continue;                     // hopefully, enough for ITS
5417 //     AliTPCseed *seed2 = new AliTPCseed(*pt);
5418 //     //seed2->Reset(kFALSE);
5419 //     //pt->ResetCovariance();
5420 //     seed2->Modify(1);
5421 //     FollowBackProlongation(*seed2,158);
5422 //     //seed2->Reset(kFALSE);
5423 //     seed2->Modify(10);
5424 //     FollowProlongation(*seed2,0);
5425 //     TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
5426 //     cstream<<"Crefit"<<
5427 //       "Tr0.="<<pt<<
5428 //       "Tr1.="<<seed2<<
5429 //       "\n";
5430 //     if (seed2->fN>pt->fN){
5431 //       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5432 //       fSeeds->AddAt(seed2,i);
5433 //     }else{
5434 //       delete seed2;
5435 //     }
5436 //   }
5437 //   RemoveUsed2(fSeeds,0.6,0.6,50);
5438
5439 //  FindV0s(fSeeds,fEvent);
5440   //RemoveDouble(fSeeds,0.2,0.6,11);
5441
5442   //
5443   Int_t found = 0;
5444   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5445     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5446     if (!pt) continue;
5447     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5448     if (nc<15) {
5449       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5450       continue;
5451     }
5452     CookLabel(pt,0.1); //For comparison only
5453     //if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )&& nc>50 &&pt->GetNumberOfClusters()>0.4*pt->fNFoundable){
5454     if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )){
5455       found++;
5456       if (fDebug>0) cerr<<found<<'\r';
5457       pt->fLab2 = i;
5458     }
5459     else
5460       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5461   }
5462
5463
5464   //RemoveOverlap(fSeeds,0.99,7,kTRUE);
5465   SignShared(fSeeds);
5466   //RemoveUsed(fSeeds,0.9,0.9,6);
5467   //
5468   nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
5469   found = 0;
5470   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5471     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5472     if (!pt) continue;
5473     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5474     if (nc<15) {
5475       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5476       continue;
5477     }
5478     t.SetUniqueID(i);
5479     t.CookdEdx(0.02,0.6);
5480     //    CheckKinkPoint(&t,0.05);
5481     //if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )&& nc>50 &&pt->GetNumberOfClusters()>0.4*pt->fNFoundable){
5482     if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )){
5483       found++;
5484       if (fDebug>0){
5485         cerr<<found<<'\r';
5486       }
5487       pt->fLab2 = i;
5488     }
5489     else
5490       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5491     //AliTPCseed * seed1 = ReSeed(pt,0.05,0.5,1);
5492     //if (seed1){
5493     //  FollowProlongation(*seed1,0);
5494     //  Int_t n = seed1->GetNumberOfClusters();
5495     //  printf("fP4\t%f\t%f\n",seed1->GetC(),pt->GetC());
5496     //  printf("fN\t%d\t%d\n", seed1->GetNumberOfClusters(),pt->GetNumberOfClusters());
5497     //
5498     //}
5499     //AliTPCseed * seed2 = ReSeed(pt,0.95,0.5,0.05);
5500
5501   }
5502
5503   SortTracks(fSeeds, 1);
5504
5505   /*
5506   fIteration = 1;
5507   PrepareForBackProlongation(fSeeds,5.);
5508   PropagateBack(fSeeds);
5509   printf("Time for back propagation: \t");timer.Print();timer.Start();
5510
5511   fIteration = 2;
5512
5513   PrepareForProlongation(fSeeds,5.);
5514   PropagateForward2(fSeeds);
5515
5516   printf("Time for FORWARD propagation: \t");timer.Print();timer.Start();
5517   // RemoveUsed(fSeeds,0.7,0.7,6);
5518   //RemoveOverlap(fSeeds,0.9,7,kTRUE);
5519
5520   nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
5521   found = 0;
5522   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5523     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5524     if (!pt) continue;
5525     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
5526     if (nc<15) {
5527       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5528       continue;
5529     }
5530     t.CookdEdx(0.02,0.6);
5531     //    CookLabel(pt,0.1); //For comparison only
5532     //if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )&& nc>50 &&pt->GetNumberOfClusters()>0.4*pt->fNFoundable){
5533     if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )){
5534       cerr<<found++<<'\r';
5535     }
5536     else
5537       delete fSeeds->RemoveAt(i);
5538     pt->fLab2 = i;
5539   }
5540   */
5541
5542   //  fNTracks = found;
5543   if (fDebug>0){
5544     Info("Clusters2Tracks","Time for overlap removal, track writing and dedx cooking: \t"); timer.Print();timer.Start();
5545   }
5546   //
5547   //  cerr<<"Number of found tracks : "<<"\t"<<found<<endl;
5548   Info("Clusters2Tracks","Number of found tracks %d",found);
5549   savedir->cd();
5550   //  UnloadClusters();
5551   //
5552   return 0;
5553 }
5554
5555 void AliTPCtrackerMI::Tracking(TObjArray * arr)
5556 {
5557   //
5558   // tracking of the seeds
5559   //
5560
5561   fSectors = fOuterSec;
5562   ParallelTracking(arr,150,63);
5563   fSectors = fOuterSec;
5564   ParallelTracking(arr,63,0);
5565 }
5566
5567 TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking(Int_t seedtype, Int_t i1, Int_t i2, Float_t cuts[4], Float_t dy, Int_t dsec)
5568 {
5569   //
5570   //
5571   //tracking routine
5572   TObjArray * arr = new TObjArray;
5573   //
5574   fSectors = fOuterSec;
5575   TStopwatch timer;
5576   timer.Start();
5577   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
5578     if (seedtype==3) MakeSeeds3(arr,sec,i1,i2,cuts,dy, dsec);
5579     if (seedtype==4) MakeSeeds5(arr,sec,i1,i2,cuts,dy);
5580     if (seedtype==2) MakeSeeds2(arr,sec,i1,i2,cuts,dy);
5581   }
5582   if (fDebug>0){
5583     Info("Tracking","\nSeeding - %d\t%d\t%d\t%d\n",seedtype,i1,i2,arr->GetEntriesFast());
5584     timer.Print();
5585     timer.Start();
5586   }
5587   Tracking(arr);
5588   if (fDebug>0){
5589     timer.Print();
5590   }
5591
5592   return arr;
5593 }
5594
5595 TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking()
5596 {
5597   //
5598   //
5599   TStopwatch timer;
5600   timer.Start();
5601   Int_t nup=fOuterSec->GetNRows()+fInnerSec->GetNRows();
5602
5603   TObjArray * seeds = new TObjArray;
5604   TObjArray * arr=0;
5605
5606   Int_t gap =20;
5607   Float_t cuts[4];
5608   cuts[0] = 0.002;
5609   cuts[1] = 1.5;
5610   cuts[2] = 3.;
5611   cuts[3] = 3.;
5612   Float_t fnumber  = 3.0;
5613   Float_t fdensity = 3.0;
5614
5615   //
5616   //find primaries
5617   cuts[0]=0.0066;
5618   for (Int_t delta = 0; delta<18; delta+=6){
5619     //
5620     cuts[0]=0.0070;
5621     cuts[1] = 1.5;
5622     arr = Tracking(3,nup-1-delta,nup-1-delta-gap,cuts,-1,1);
5623     SumTracks(seeds,arr);
5624     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5625     //
5626     for (Int_t i=2;i<6;i+=2){
5627       // seed high pt tracks
5628       cuts[0]=0.0022;
5629       cuts[1]=0.3;
5630       arr = Tracking(3,nup-i-delta,nup-i-delta-gap,cuts,-1,0);
5631       SumTracks(seeds,arr);
5632       SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5633     }
5634   }
5635   fnumber  = 4;
5636   fdensity = 4.;
5637   //  RemoveUsed(seeds,0.9,0.9,1);
5638   //  UnsignClusters();
5639   //  SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5640
5641   //find primaries
5642   cuts[0]=0.0077;
5643   for (Int_t delta = 20; delta<120; delta+=10){
5644     //
5645     // seed high pt tracks
5646     cuts[0]=0.0060;
5647     cuts[1]=0.3;
5648     cuts[2]=6.;
5649     arr = Tracking(3,nup-delta,nup-delta-gap,cuts,-1);
5650     SumTracks(seeds,arr);
5651     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5652
5653     cuts[0]=0.003;
5654     cuts[1]=0.3;
5655     cuts[2]=6.;
5656     arr = Tracking(3,nup-delta-5,nup-delta-5-gap,cuts,-1);
5657     SumTracks(seeds,arr);
5658     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5659   }
5660
5661   cuts[0] = 0.01;
5662   cuts[1] = 2.0;
5663   cuts[2] = 3.;
5664   cuts[3] = 2.0;
5665   fnumber  = 2.;
5666   fdensity = 2.;
5667
5668   if (fDebug>0){
5669     Info("Tracking()","\n\nPrimary seeding\t%d\n\n",seeds->GetEntriesFast());
5670     timer.Print();
5671     timer.Start();
5672   }
5673   //  RemoveUsed(seeds,0.75,0.75,1);
5674   //UnsignClusters();
5675   //SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5676
5677   // find secondaries
5678
5679   cuts[0] = 0.3;
5680   cuts[1] = 1.5;
5681   cuts[2] = 3.;
5682   cuts[3] = 1.5;
5683
5684   arr = Tracking(4,nup-1,nup-1-gap,cuts,-1);
5685   SumTracks(seeds,arr);
5686   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5687   //
5688   arr = Tracking(4,nup-2,nup-2-gap,cuts,-1);
5689   SumTracks(seeds,arr);
5690   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5691   //
5692   arr = Tracking(4,nup-3,nup-3-gap,cuts,-1);
5693   SumTracks(seeds,arr);
5694   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5695   //
5696
5697
5698   for (Int_t delta = 3; delta<30; delta+=5){
5699     //
5700     cuts[0] = 0.3;
5701     cuts[1] = 1.5;
5702     cuts[2] = 3.;
5703     cuts[3] = 1.5;
5704     arr = Tracking(4,nup-1-delta,nup-1-delta-gap,cuts,-1);
5705     SumTracks(seeds,arr);
5706     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5707     //
5708     arr = Tracking(4,nup-3-delta,nup-5-delta-gap,cuts,4);
5709     SumTracks(seeds,arr);
5710     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5711     //
5712   }
5713   fnumber  = 1;
5714   fdensity = 1;
5715   //
5716   // change cuts
5717   fnumber  = 2.;
5718   fdensity = 2.;
5719   cuts[0]=0.0080;
5720
5721   // find secondaries
5722   for (Int_t delta = 30; delta<90; delta+=10){
5723     //
5724     cuts[0] = 0.3;
5725     cuts[1] = 3.5;
5726     cuts[2] = 3.;
5727     cuts[3] = 3.5;
5728     arr = Tracking(4,nup-1-delta,nup-1-delta-gap,cuts,-1);
5729     SumTracks(seeds,arr);
5730     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5731     //
5732     arr = Tracking(4,nup-5-delta,nup-5-delta-gap,cuts,5 );
5733     SumTracks(seeds,arr);
5734     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
5735   }
5736
5737   if (fDebug>0){
5738     Info("Tracking()","\n\nSecondary seeding\t%d\n\n",seeds->GetEntriesFast());
5739     timer.Print();
5740     timer.Start();
5741   }
5742
5743   return seeds;
5744   //
5745
5746 }
5747
5748
5749 void AliTPCtrackerMI::SumTracks(TObjArray *arr1,TObjArray *arr2) const
5750 {
5751   //
5752   //sum tracks to common container
5753   //remove suspicious tracks
5754   Int_t nseed = arr2->GetEntriesFast();
5755   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5756     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr2->UncheckedAt(i);
5757     if (pt){
5758
5759       // NORMAL ACTIVE TRACK
5760       if (pt->IsActive()){
5761         arr1->AddLast(arr2->RemoveAt(i));
5762         continue;
5763       }
5764       //remove not usable tracks
5765       if (pt->fRemoval!=10){
5766         delete arr2->RemoveAt(i);
5767         continue;
5768       }
5769       // REMOVE VERY SHORT  TRACKS
5770       if (pt->GetNumberOfClusters()<20){
5771         delete arr2->RemoveAt(i);
5772         continue;
5773       }
5774       // ENABLE ONLY ENOUGH GOOD STOPPED TRACKS
5775       if (pt->GetDensityFirst(20)>0.8 || pt->GetDensityFirst(30)>0.8 || pt->GetDensityFirst(40)>0.7)
5776         arr1->AddLast(arr2->RemoveAt(i));
5777       else{
5778         delete arr2->RemoveAt(i);
5779       }
5780     }
5781   }
5782   delete arr2;
5783 }
5784
5785
5786
5787 void  AliTPCtrackerMI::ParallelTracking(TObjArray * arr, Int_t rfirst, Int_t rlast)
5788 {
5789   //
5790   // try to track in parralel
5791
5792   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
5793   //prepare seeds for tracking
5794   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5795     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5796     if (!pt) continue;
5797     if (!t.IsActive()) continue;
5798     // follow prolongation to the first layer
5799     if ( (fSectors ==fInnerSec) || (t.fFirstPoint-fParam->GetNRowLow()>rfirst+1) )
5800       FollowProlongation(t, rfirst+1);
5801   }
5802
5803
5804   //
5805   for (Int_t nr=rfirst; nr>=rlast; nr--){
5806     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
5807       fSectors = fInnerSec;
5808     else
5809       fSectors = fOuterSec;
5810     // make indexes with the cluster tracks for given
5811
5812     // find nearest cluster
5813     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5814       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i), &t=*pt;
5815       if (!pt) continue;
5816       if (nr==80) pt->UpdateReference();
5817       if (!pt->IsActive()) continue;
5818       //      if ( (fSectors ==fOuterSec) && (pt->fFirstPoint-fParam->GetNRowLow())<nr) continue;
5819       if (pt->fRelativeSector>17) {
5820         continue;
5821       }
5822       UpdateClusters(t,nr);
5823     }
5824     // prolonagate to the nearest cluster - if founded
5825     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
5826       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5827       if (!pt) continue;
5828       if (!pt->IsActive()) continue;
5829       // if ((fSectors ==fOuterSec) && (pt->fFirstPoint-fParam->GetNRowLow())<nr) continue;
5830       if (pt->fRelativeSector>17) {
5831         continue;
5832       }
5833       FollowToNextCluster(*pt,nr);
5834     }
5835   }
5836 }
5837
5838 void AliTPCtrackerMI::PrepareForBackProlongation(TObjArray * arr,Float_t fac) const
5839 {
5840   //
5841   //
5842   // if we use TPC track itself we have to "update" covariance
5843   //
5844   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
5845   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5846     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5847     if (pt) {
5848       pt->Modify(fac);
5849       //
5850       //rotate to current local system at first accepted  point
5851       Int_t index  = pt->GetClusterIndex2(pt->fFirstPoint);
5852       Int_t sec    = (index&0xff000000)>>24;
5853       sec = sec%18;
5854       Float_t angle1 = fInnerSec->GetAlpha()*sec+fInnerSec->GetAlphaShift();
5855       if (angle1>TMath::Pi())
5856         angle1-=2.*TMath::Pi();
5857       Float_t angle2 = pt->GetAlpha();
5858
5859       if (TMath::Abs(angle1-angle2)>0.001){
5860         pt->Rotate(angle1-angle2);
5861         //angle2 = pt->GetAlpha();
5862         //pt->fRelativeSector = pt->GetAlpha()/fInnerSec->GetAlpha();
5863         //if (pt->GetAlpha()<0)
5864         //  pt->fRelativeSector+=18;
5865         //sec = pt->fRelativeSector;
5866       }
5867
5868     }
5869
5870   }
5871
5872
5873 }
5874 void AliTPCtrackerMI::PrepareForProlongation(TObjArray * arr, Float_t fac) const
5875 {
5876   //
5877   //
5878   // if we use TPC track itself we have to "update" covariance
5879   //
5880   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
5881   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5882     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5883     if (pt) {
5884       pt->Modify(fac);
5885       pt->fFirstPoint = pt->fLastPoint;
5886     }
5887
5888   }
5889
5890
5891 }
5892
5893 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(TObjArray * arr)
5894 {
5895   //
5896   // make back propagation
5897   //
5898   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
5899   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5900     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5901     if (pt&& pt->GetKinkIndex(0)<=0) {
5902       //AliTPCseed *pt2 = new AliTPCseed(*pt);
5903       fSectors = fInnerSec;
5904       //FollowBackProlongation(*pt,fInnerSec->GetNRows()-1);
5905       //fSectors = fOuterSec;
5906       FollowBackProlongation(*pt,fInnerSec->GetNRows()+fOuterSec->GetNRows()-1);
5907       //if (pt->GetNumberOfClusters()<(pt->fEsd->GetTPCclusters(0)) ){
5908       //        Error("PropagateBack","Not prolonged track %d",pt->GetLabel());
5909       //        FollowBackProlongation(*pt2,fInnerSec->GetNRows()+fOuterSec->GetNRows()-1);
5910       //}
5911     }
5912     if (pt&& pt->GetKinkIndex(0)>0) {
5913       AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(pt->GetKinkIndex(0)-1);
5914       pt->fFirstPoint = kink->GetTPCRow0();
5915       fSectors = fInnerSec;
5916       FollowBackProlongation(*pt,fInnerSec->GetNRows()+fOuterSec->GetNRows()-1);
5917     }
5918
5919   }
5920   return 0;
5921 }
5922
5923
5924 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateForward2(TObjArray * arr)
5925 {
5926   //
5927   // make forward propagation
5928   //
5929   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
5930   //
5931   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5932     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
5933     if (pt) {
5934       FollowProlongation(*pt,0);
5935     }
5936   }
5937   return 0;
5938 }
5939
5940
5941 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateForward()
5942 {
5943   //
5944   // propagate track forward
5945   //UnsignClusters();
5946   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
5947   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
5948     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
5949     if (pt){
5950       AliTPCseed &t = *pt;
5951       Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
5952       if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
5953       if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
5954       t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
5955     }
5956   }
5957
5958   fSectors = fOuterSec;
5959   ParallelTracking(fSeeds,fOuterSec->GetNRows()+fInnerSec->GetNRows()-1,fInnerSec->GetNRows());
5960   fSectors = fInnerSec;
5961   ParallelTracking(fSeeds,fInnerSec->GetNRows()-1,0);
5962   //WriteTracks();
5963   return 1;
5964 }
5965
5966
5967
5968
5969
5970
5971 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliTPCseed * pt, Int_t row0, Int_t row1)
5972 {
5973   //
5974   // make back propagation, in between row0 and row1
5975   //
5976
5977   if (pt) {
5978     fSectors = fInnerSec;
5979     Int_t  r1;
5980     //
5981     if (row1<fSectors->GetNRows())
5982       r1 = row1;
5983     else
5984       r1 = fSectors->GetNRows()-1;
5985
5986     if (row0<fSectors->GetNRows()&& r1>0 )
5987       FollowBackProlongation(*pt,r1);
5988     if (row1<=fSectors->GetNRows())
5989       return 0;
5990     //
5991     r1 = row1 - fSectors->GetNRows();
5992     if (r1<=0) return 0;
5993     if (r1>=fOuterSec->GetNRows()) return 0;
5994     fSectors = fOuterSec;
5995     return FollowBackProlongation(*pt,r1);
5996   }
5997   return 0;
5998 }
5999
6000
6001
6002
6003 void  AliTPCtrackerMI::GetShape(AliTPCseed * seed, Int_t row)
6004 {
6005   //
6006   //
6007   Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
6008   //  Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
6009   Float_t padlength =  GetPadPitchLength(row);
6010   //
6011   Float_t sresy = (seed->fSector < fParam->GetNSector()/2) ? 0.2 :0.3;
6012   Float_t angulary  = seed->GetSnp();
6013   angulary = angulary*angulary/(1-angulary*angulary);
6014   seed->fCurrentSigmaY2 = sd2+padlength*padlength*angulary/12.+sresy*sresy;
6015   //
6016   Float_t sresz = fParam->GetZSigma();
6017   Float_t angularz  = seed->GetTgl();
6018   seed->fCurrentSigmaZ2 = sd2+padlength*padlength*angularz*angularz*(1+angulary)/12.+sresz*sresz;
6019   /*
6020   Float_t wy = GetSigmaY(seed);
6021   Float_t wz = GetSigmaZ(seed);
6022   wy*=wy;
6023   wz*=wz;
6024   if (TMath::Abs(wy/seed->fCurrentSigmaY2-1)>0.0001 || TMath::Abs(wz/seed->fCurrentSigmaZ2-1)>0.0001 ){
6025     printf("problem\n");
6026   }
6027   */
6028 }
6029
6030
6031 Float_t  AliTPCtrackerMI::GetSigmaY(AliTPCseed * seed)
6032 {
6033   //
6034   //
6035   Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
6036   Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
6037   Float_t sres = (seed->fSector < fParam->GetNSector()/2) ? 0.2 :0.3;
6038   Float_t angular  = seed->GetSnp();
6039   angular = angular*angular/(1-angular*angular);
6040   //  angular*=angular;
6041   //angular  = TMath::Sqrt(angular/(1-angular));
6042   Float_t res = TMath::Sqrt(sd2+padlength*padlength*angular/12.+sres*sres);
6043   return res;
6044 }
6045 Float_t  AliTPCtrackerMI::GetSigmaZ(AliTPCseed * seed)
6046 {
6047   //
6048   //
6049   Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
6050   Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
6051   Float_t sres = fParam->GetZSigma();
6052   Float_t angular  = seed->GetTgl();
6053   Float_t res = TMath::Sqrt(sd2+padlength*padlength*angular*angular/12.+sres*sres);
6054   return res;
6055 }
6056
6057
6058 //__________________________________________________________________________
6059 void AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliKalmanTrack *tk, Float_t wrong) const {
6060   //--------------------------------------------------------------------
6061   //This function "cooks" a track label. If label<0, this track is fake.
6062   //--------------------------------------------------------------------
6063   AliTPCseed * t = (AliTPCseed*)tk;
6064   Int_t noc=t->GetNumberOfClusters();
6065   if (noc<10){
6066     //printf("\nnot founded prolongation\n\n\n");
6067     //t->Dump();
6068     return ;
6069   }
6070   Int_t lb[160];
6071   Int_t mx[160];
6072   AliTPCclusterMI *clusters[160];
6073   //
6074   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
6075     clusters[i]=0;
6076     lb[i]=mx[i]=0;
6077   }
6078
6079   Int_t i;
6080   Int_t current=0;
6081   for (i=0; i<160 && current<noc; i++) {
6082
6083      Int_t index=t->GetClusterIndex2(i);
6084      if (index<=0) continue;
6085      if (index&0x8000) continue;
6086      //
6087      //clusters[current]=GetClusterMI(index);
6088      if (t->fClusterPointer[i]){
6089        clusters[current]=t->fClusterPointer[i];
6090        current++;
6091      }
6092   }
6093   noc = current;
6094
6095   Int_t lab=123456789;
6096   for (i=0; i<noc; i++) {
6097     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6098     if (!c) continue;
6099     lab=TMath::Abs(c->GetLabel(0));
6100     Int_t j;
6101     for (j=0; j<noc; j++) if (lb[j]==lab || mx[j]==0) break;
6102     lb[j]=lab;
6103     (mx[j])++;
6104   }
6105
6106   Int_t max=0;
6107   for (i=0; i<noc; i++) if (mx[i]>max) {max=mx[i]; lab=lb[i];}
6108
6109   for (i=0; i<noc; i++) {
6110     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6111     if (!c) continue;
6112     if (TMath::Abs(c->GetLabel(1)) == lab ||
6113         TMath::Abs(c->GetLabel(2)) == lab ) max++;
6114   }
6115
6116   if ((1.- Float_t(max)/noc) > wrong) lab=-lab;
6117
6118   else {
6119      Int_t tail=Int_t(0.10*noc);
6120      max=0;
6121      Int_t ind=0;
6122      for (i=1; i<=160&&ind<tail; i++) {
6123        //       AliTPCclusterMI *c=clusters[noc-i];
6124        AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6125        if (!c) continue;
6126        if (lab == TMath::Abs(c->GetLabel(0)) ||
6127            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(1)) ||
6128            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(2))) max++;
6129        ind++;
6130      }
6131      if (max < Int_t(0.5*tail)) lab=-lab;
6132   }
6133
6134   t->SetLabel(lab);
6135
6136   //  delete[] lb;
6137   //delete[] mx;
6138   //delete[] clusters;
6139 }
6140
6141
6142 //__________________________________________________________________________
6143 Int_t AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliTPCseed *t, Float_t wrong,Int_t first, Int_t last) const {
6144   //--------------------------------------------------------------------
6145   //This function "cooks" a track label. If label<0, this track is fake.
6146   //--------------------------------------------------------------------
6147   Int_t noc=t->GetNumberOfClusters();
6148   if (noc<10){
6149     //printf("\nnot founded prolongation\n\n\n");
6150     //t->Dump();
6151     return -1;
6152   }
6153   Int_t lb[160];
6154   Int_t mx[160];
6155   AliTPCclusterMI *clusters[160];
6156   //
6157   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
6158     clusters[i]=0;
6159     lb[i]=mx[i]=0;
6160   }
6161
6162   Int_t i;
6163   Int_t current=0;
6164   for (i=0; i<160 && current<noc; i++) {
6165     if (i<first) continue;
6166     if (i>last)  continue;
6167      Int_t index=t->GetClusterIndex2(i);
6168      if (index<=0) continue;
6169      if (index&0x8000) continue;
6170      //
6171      //clusters[current]=GetClusterMI(index);
6172      if (t->fClusterPointer[i]){
6173        clusters[current]=t->fClusterPointer[i];
6174        current++;
6175      }
6176   }
6177   noc = current;
6178   if (noc<5) return -1;
6179   Int_t lab=123456789;
6180   for (i=0; i<noc; i++) {
6181     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6182     if (!c) continue;
6183     lab=TMath::Abs(c->GetLabel(0));
6184     Int_t j;
6185     for (j=0; j<noc; j++) if (lb[j]==lab || mx[j]==0) break;
6186     lb[j]=lab;
6187     (mx[j])++;
6188   }
6189
6190   Int_t max=0;
6191   for (i=0; i<noc; i++) if (mx[i]>max) {max=mx[i]; lab=lb[i];}
6192
6193   for (i=0; i<noc; i++) {
6194     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6195     if (!c) continue;
6196     if (TMath::Abs(c->GetLabel(1)) == lab ||
6197         TMath::Abs(c->GetLabel(2)) == lab ) max++;
6198   }
6199
6200   if ((1.- Float_t(max)/noc) > wrong) lab=-lab;
6201
6202   else {
6203      Int_t tail=Int_t(0.10*noc);
6204      max=0;
6205      Int_t ind=0;
6206      for (i=1; i<=160&&ind<tail; i++) {
6207        //       AliTPCclusterMI *c=clusters[noc-i];
6208        AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
6209        if (!c) continue;
6210        if (lab == TMath::Abs(c->GetLabel(0)) ||
6211            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(1)) ||
6212            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(2))) max++;
6213        ind++;
6214      }
6215      if (max < Int_t(0.5*tail)) lab=-lab;
6216   }
6217
6218   //  t->SetLabel(lab);
6219   return lab;
6220   //  delete[] lb;
6221   //delete[] mx;
6222   //delete[] clusters;
6223 }
6224
6225
6226 Int_t  AliTPCtrackerMI::AliTPCSector::GetRowNumber(Double_t x) const
6227 {
6228   //return pad row number for this x
6229   Double_t r;
6230   if (fN < 64){
6231     r=fRow[fN-1].GetX();
6232     if (x > r) return fN;
6233     r=fRow[0].GetX();
6234     if (x < r) return -1;
6235     return Int_t((x-r)/fPadPitchLength + 0.5);}
6236   else{
6237     r=fRow[fN-1].GetX();
6238     if (x > r) return fN;
6239     r=fRow[0].GetX();
6240     if (x < r) return -1;
6241     Double_t r1=fRow[64].GetX();
6242     if(x<r1){
6243       return Int_t((x-r)/f1PadPitchLength + 0.5);}
6244     else{
6245       return (Int_t((x-r1)/f2PadPitchLength + 0.5)+64);}
6246   }
6247 }
6248
6249 Int_t  AliTPCtrackerMI::GetRowNumber(Double_t x[3]) const
6250 {
6251   //return pad row number for given x vector
6252   Float_t phi = TMath::ATan2(x[1],x[0]);
6253   if(phi<0) phi=2.*TMath::Pi()+phi;
6254   //  Get the local angle in the sector philoc
6255   const Float_t kRaddeg = 180/3.14159265358979312;
6256   Float_t phiangle   = (Int_t (phi*kRaddeg/20.) + 0.5)*20./kRaddeg;
6257   Double_t localx    = x[0]*TMath::Cos(phiangle)-x[1]*TMath::Sin(phiangle);
6258   return GetRowNumber(localx);
6259 }
6260
6261 //_________________________________________________________________________
6262 void AliTPCtrackerMI::AliTPCSector::Setup(const AliTPCParam *par, Int_t f) {
6263   //-----------------------------------------------------------------------
6264   // Setup inner sector
6265   //-----------------------------------------------------------------------
6266   if (f==0) {
6267      fAlpha=par->GetInnerAngle();
6268      fAlphaShift=par->GetInnerAngleShift();
6269      fPadPitchWidth=par->GetInnerPadPitchWidth();
6270      fPadPitchLength=par->GetInnerPadPitchLength();
6271      fN=par->GetNRowLow();
6272      fRow=new AliTPCRow[fN];
6273      for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
6274        fRow[i].SetX(par->GetPadRowRadiiLow(i));
6275        fRow[i].fDeadZone =1.5;  //1.5 cm of dead zone
6276      }
6277   } else {
6278      fAlpha=par->GetOuterAngle();
6279      fAlphaShift=par->GetOuterAngleShift();
6280      fPadPitchWidth  = par->GetOuterPadPitchWidth();
6281      fPadPitchLength = par->GetOuter1PadPitchLength();
6282      f1PadPitchLength = par->GetOuter1PadPitchLength();
6283      f2PadPitchLength = par->GetOuter2PadPitchLength();
6284
6285      fN=par->GetNRowUp();
6286      fRow=new AliTPCRow[fN];
6287      for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
6288        fRow[i].SetX(par->GetPadRowRadiiUp(i));
6289        fRow[i].fDeadZone =1.5;  // 1.5 cm of dead zone
6290      }
6291   }
6292 }
6293
6294 AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::AliTPCRow() {
6295   //
6296   // default constructor
6297   fN=0;
6298   fN1=0;
6299   fN2=0;
6300   fClusters1=0;
6301   fClusters2=0;
6302 }
6303
6304 AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::~AliTPCRow(){
6305   //
6306
6307 }
6308
6309
6310
6311 //_________________________________________________________________________
6312 void
6313 AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::InsertCluster(const AliTPCclusterMI* c, UInt_t index) {
6314   //-----------------------------------------------------------------------
6315   // Insert a cluster into this pad row in accordence with its y-coordinate
6316   //-----------------------------------------------------------------------
6317   if (fN==kMaxClusterPerRow) {
6318     cerr<<"AliTPCRow::InsertCluster(): Too many clusters !\n"; return;
6319   }
6320   if (fN==0) {fIndex[0]=index; fClusters[fN++]=c; return;}
6321   Int_t i=Find(c->GetZ());
6322   memmove(fClusters+i+1 ,fClusters+i,(fN-i)*sizeof(AliTPCclusterMI*));
6323   memmove(fIndex   +i+1 ,fIndex   +i,(fN-i)*sizeof(UInt_t));
6324   fIndex[i]=index; fClusters[i]=c; fN++;
6325 }
6326
6327 void AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::ResetClusters() {
6328    //
6329    // reset clusters
6330    fN  = 0;
6331    fN1 = 0;
6332    fN2 = 0;
6333    //delete[] fClusterArray;
6334    if (fClusters1) delete []fClusters1;
6335    if (fClusters2) delete []fClusters2;
6336    //fClusterArray=0;
6337    fClusters1 = 0;
6338    fClusters2 = 0;
6339 }
6340
6341
6342 //___________________________________________________________________
6343 Int_t AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::Find(Double_t z) const {
6344   //-----------------------------------------------------------------------
6345   // Return the index of the nearest cluster
6346   //-----------------------------------------------------------------------
6347   if (fN==0) return 0;
6348   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
6349   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
6350   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
6351   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
6352     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
6353     else e=m;
6354   }
6355   return m;
6356 }
6357
6358
6359
6360 //___________________________________________________________________
6361 AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz) const {
6362   //-----------------------------------------------------------------------
6363   // Return the index of the nearest cluster in z y
6364   //-----------------------------------------------------------------------
6365   Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
6366
6367   AliTPCclusterMI *cl =0;
6368   for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
6369       AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
6370       if (c->GetZ() > z+roadz) break;
6371       if ( (c->GetY()-y) >  roady ) continue;
6372       Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
6373       if (maxdistance>distance) {
6374         maxdistance = distance;
6375         cl=c;
6376       }
6377   }
6378   return cl;
6379 }
6380
6381 AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest2(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz,UInt_t & index) const
6382 {
6383   //-----------------------------------------------------------------------
6384   // Return the index of the nearest cluster in z y
6385   //-----------------------------------------------------------------------
6386   Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
6387   AliTPCclusterMI *cl =0;
6388
6389   //PH Check boundaries. 510 is the size of fFastCluster
6390   Int_t iz1 = Int_t(z-roadz+254.5);
6391   if (iz1<0 || iz1>=510) return cl;
6392   iz1 = TMath::Max(fFastCluster[iz1]-1,0);
6393   Int_t iz2 = Int_t(z+roadz+255.5);
6394   if (iz2<0 || iz2>=510) return cl;
6395   iz2 = TMath::Min(fFastCluster[iz2]+1,fN);
6396
6397   //FindNearest3(y,z,roady,roadz,index);
6398   //  for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
6399   for (Int_t i=iz1; i<iz2; i++) {
6400       AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
6401       if (c->GetZ() > z+roadz) break;
6402       if ( c->GetY()-y >  roady ) continue;
6403       if ( y-c->GetY() >  roady ) continue;
6404       Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
6405       if (maxdistance>distance) {
6406         maxdistance = distance;
6407         cl=c;
6408         index =i;
6409         //roady = TMath::Sqrt(maxdistance);
6410       }
6411   }
6412   return cl;
6413 }
6414
6415
6416
6417 AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest3(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz,UInt_t & index) const
6418 {
6419   //-----------------------------------------------------------------------
6420   // Return the index of the nearest cluster in z y
6421   //-----------------------------------------------------------------------
6422   Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
6423   //  Int_t iz = Int_t(z+255.);
6424   AliTPCclusterMI *cl =0;
6425   for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
6426     //for (Int_t i=fFastCluster[iz-2]; i<fFastCluster[iz+2]; i++) {
6427       AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
6428       if (c->GetZ() > z+roadz) break;
6429       if ( c->GetY()-y >  roady ) continue;
6430       if ( y-c->GetY() >  roady ) continue;
6431       Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
6432       if (maxdistance>distance) {
6433         maxdistance = distance;
6434         cl=c;
6435         index =i;
6436         //roady = TMath::Sqrt(maxdistance);
6437       }
6438   }
6439   return cl;
6440 }
6441
6442
6443
6444
6445
6446 // AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
6447 // {
6448 //   //
6449 //   //
6450 //   return &fTrackPoints[i];
6451 // }
6452
6453