TPC/AliTPCtrackerMI.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17 //-------------------------------------------------------
  18 //          Implementation of the TPC tracker
  19 //
  20 //   Origin: Marian Ivanov   Marian.Ivanov@cern.ch
  21 //
  22 //  AliTPC parallel tracker -
  23 //  How to use?  -
  24 //  run AliTPCFindClusters.C macro - clusters neccessary for tracker are founded
  25 //  run AliTPCFindTracksMI.C macro - to find tracks
  26 //  tracks are written to AliTPCtracks.root file
  27 //  for comparison also seeds are written to the same file - to special branch
  28 //-------------------------------------------------------
  29
  30
  31 /* $Id$ */
  32
  33
  34 #include <TObjArray.h>
  35 #include <TFile.h>
  36 #include <TTree.h>
  37 #include <TClonesArray.h>
  38
  39 #include "Riostream.h"
  40
  41 #include "AliTPCclusterMI.h"
  42 #include "AliComplexCluster.h"
  43 #include "AliTPCParam.h"
  44 #include "AliTPCClustersRow.h"
  45 #include "AliTPCpolyTrack.h"
  46 #include "TStopwatch.h"
  47 #include "AliESD.h"
  48 #include "AliHelix.h"
  49 //
  50 #include "AliRunLoader.h"
  51 //
  52 #include "AliTPCreco.h"
  53 #include "AliTPCtrackerMI.h"
  54
  55
  56
  57 ClassImp(AliTPCseed)
  58 ClassImp(AliTPCtrackerMI)
  59
  60
  61 class AliTPCFastMath {
  62 public:
  63   AliTPCFastMath();
  64   static Double_t FastAsin(Double_t x);
  65  private:
  66   static Double_t fgFastAsin[20000];  //lookup table for fast asin computation
  67 };
  68
  69 Double_t AliTPCFastMath::fgFastAsin[20000];
  70 AliTPCFastMath gAliTPCFastMath;
  71
  72 AliTPCFastMath::AliTPCFastMath(){
  73   //
  74   // initialized lookup table;
  75   for (Int_t i=0;i<10000;i++){
  76     fgFastAsin[2*i] = TMath::ASin(i/10000.);
  77     fgFastAsin[2*i+1] = (TMath::ASin((i+1)/10000.)-fgFastAsin[2*i]);
  78   }
  79 }
  80
  81 Double_t AliTPCFastMath::FastAsin(Double_t x){
  82   //
  83   // return asin using lookup table
  84   if (x>0){
  85     Int_t index = int(x*10000);
  86     return fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1];
  87   }
  88   x*=-1;
  89   Int_t index = int(x*10000);
  90   return -(fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1]);
  91 }
  92
  93
  94
  95
  96 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateTrack(AliTPCseed * track, Int_t accept){
  97   //
  98   //update track information using current cluster - track->fCurrentCluster
  99
 100
 101   AliTPCclusterMI* c =track->fCurrentCluster;
 102   if (accept>0) track->fCurrentClusterIndex1 |=0x8000;  //sign not accepted clusters
 103
 104   UInt_t i = track->fCurrentClusterIndex1;
 105
 106   Int_t sec=(i&0xff000000)>>24;
 107   //Int_t row = (i&0x00ff0000)>>16;
 108   track->fRow=(i&0x00ff0000)>>16;
 109   track->fSector = sec;
 110   //  Int_t index = i&0xFFFF;
 111   if (sec>=fParam->GetNInnerSector()) track->fRow += fParam->GetNRowLow();
 112   track->SetClusterIndex2(track->fRow, i);
 113   //track->fFirstPoint = row;
 114   //if ( track->fLastPoint<row) track->fLastPoint =row;
 115   //  if (track->fRow<0 || track->fRow>160) {
 116   //  printf("problem\n");
 117   //}
 118   if (track->fFirstPoint>track->fRow)
 119     track->fFirstPoint = track->fRow;
 120   if (track->fLastPoint<track->fRow)
 121     track->fLastPoint  = track->fRow;
 122
 123
 124   track->fClusterPointer[track->fRow] = c;
 125   //
 126
 127   Float_t angle2 = track->GetSnp()*track->GetSnp();
 128   angle2 = TMath::Sqrt(angle2/(1-angle2));
 129   //
 130   //SET NEW Track Point
 131   //
 132   //  if (debug)
 133   {
 134     AliTPCTrackerPoint   &point =*(track->GetTrackPoint(track->fRow));
 135     //
 136     point.SetSigmaY(c->GetSigmaY2()/track->fCurrentSigmaY2);
 137     point.SetSigmaZ(c->GetSigmaZ2()/track->fCurrentSigmaZ2);
 138     point.SetErrY(sqrt(track->fErrorY2));
 139     point.SetErrZ(sqrt(track->fErrorZ2));
 140     //
 141     point.SetX(track->GetX());
 142     point.SetY(track->GetY());
 143     point.SetZ(track->GetZ());
 144     point.SetAngleY(angle2);
 145     point.SetAngleZ(track->GetTgl());
 146     if (point.fIsShared){
 147       track->fErrorY2 *= 4;
 148       track->fErrorZ2 *= 4;
 149     }
 150   }
 151
 152   Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2(track->fCurrentCluster);
 153   //
 154   track->fErrorY2 *= 1.3;
 155   track->fErrorY2 += 0.01;
 156   track->fErrorZ2 *= 1.3;
 157   track->fErrorZ2 += 0.005;
 158     //}
 159   if (accept>0) return 0;
 160   if (track->GetNumberOfClusters()%20==0){
 161     //    if (track->fHelixIn){
 162     //  TClonesArray & larr = *(track->fHelixIn);
 163     //  Int_t ihelix = larr.GetEntriesFast();
 164     //  new(larr[ihelix]) AliHelix(*track) ;
 165     //}
 166   }
 167   track->fNoCluster =0;
 168   return track->Update(c,chi2,i);
 169 }
 170
 171
 172
 173 Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluster, Float_t factor,
 174                                       Float_t cory, Float_t corz)
 175 {
 176   //
 177   // decide according desired precision to accept given
 178   // cluster for tracking
 179   Double_t sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
 180   Double_t sz2=ErrZ2(seed,cluster)*corz;
 181   //sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
 182   //sz2=ErrZ2(seed,cluster)*cory;
 183
 184   Double_t sdistancey2 = sy2+seed->GetSigmaY2();
 185   Double_t sdistancez2 = sz2+seed->GetSigmaZ2();
 186
 187   Double_t rdistancey2 = (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())*
 188     (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())/sdistancey2;
 189   Double_t rdistancez2 = (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())*
 190     (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())/sdistancez2;
 191
 192   Double_t rdistance2  = rdistancey2+rdistancez2;
 193   //Int_t  accept =0;
 194
 195   if (rdistance2>16) return 3;
 196
 197
 198   if ((rdistancey2>9.*factor || rdistancez2>9.*factor) && cluster->GetType()==0)
 199     return 2;  //suspisiouce - will be changed
 200
 201   if ((rdistancey2>6.25*factor || rdistancez2>6.25*factor) && cluster->GetType()>0)
 202     // strict cut on overlaped cluster
 203     return  2;  //suspisiouce - will be changed
 204
 205   if ( (rdistancey2>1.*factor || rdistancez2>6.25*factor )
 206        && cluster->GetType()<0){
 207     seed->fNFoundable--;
 208     return 2;
 209   }
 210   return 0;
 211 }
 212
 213
 214
 215
 216 //_____________________________________________________________________________
 217 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCParam *par):
 218 AliTracker(), fkNIS(par->GetNInnerSector()/2), fkNOS(par->GetNOuterSector()/2)
 219 {
 220   //---------------------------------------------------------------------
 221   // The main TPC tracker constructor
 222   //---------------------------------------------------------------------
 223   fInnerSec=new AliTPCSector[fkNIS];
 224   fOuterSec=new AliTPCSector[fkNOS];
 225
 226   Int_t i;
 227   for (i=0; i<fkNIS; i++) fInnerSec[i].Setup(par,0);
 228   for (i=0; i<fkNOS; i++) fOuterSec[i].Setup(par,1);
 229
 230   fN=0;  fSectors=0;
 231
 232   fSeeds=0;
 233   fNtracks = 0;
 234   fParam = par;
 235   Int_t nrowlow = par->GetNRowLow();
 236   Int_t nrowup = par->GetNRowUp();
 237
 238
 239   for (Int_t i=0;i<nrowlow;i++){
 240     fXRow[i]     = par->GetPadRowRadiiLow(i);
 241     fPadLength[i]= par->GetPadPitchLength(0,i);
 242     fYMax[i]     = fXRow[i]*TMath::Tan(0.5*par->GetInnerAngle());
 243   }
 244
 245
 246   for (Int_t i=0;i<nrowup;i++){
 247     fXRow[i+nrowlow]      = par->GetPadRowRadiiUp(i);
 248     fPadLength[i+nrowlow] = par->GetPadPitchLength(60,i);
 249     fYMax[i+nrowlow]      = fXRow[i+nrowlow]*TMath::Tan(0.5*par->GetOuterAngle());
 250   }
 251   fSeeds=0;
 252   //
 253   fInput    = 0;
 254   fOutput   = 0;
 255   fSeedTree = 0;
 256   fTreeDebug =0;
 257   fNewIO     =0;
 258   fDebug     =0;
 259   fEvent     =0;
 260 }
 261
 262 //_____________________________________________________________________________
 263 AliTPCtrackerMI::~AliTPCtrackerMI() {
 264   //------------------------------------------------------------------
 265   // TPC tracker destructor
 266   //------------------------------------------------------------------
 267   delete[] fInnerSec;
 268   delete[] fOuterSec;
 269   if (fSeeds) {
 270     fSeeds->Delete();
 271     delete fSeeds;
 272   }
 273 }
 274
 275 void AliTPCtrackerMI::SetIO()
 276 {
 277   //
 278   fNewIO   =  kTRUE;
 279   fInput   =  AliRunLoader::GetTreeR("TPC", kFALSE,AliConfig::fgkDefaultEventFolderName);
 280
 281   fOutput  =  AliRunLoader::GetTreeT("TPC", kTRUE,AliConfig::fgkDefaultEventFolderName);
 282   if (fOutput){
 283     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 284     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 285     delete iotrack;
 286   }
 287 }
 288
 289
 290 void AliTPCtrackerMI::SetIO(TTree * input, TTree * output, AliESD * event)
 291 {
 292
 293   // set input
 294   fNewIO = kFALSE;
 295   fInput    = 0;
 296   fOutput   = 0;
 297   fSeedTree = 0;
 298   fTreeDebug =0;
 299   fInput = input;
 300   if (input==0){
 301     return;
 302   }
 303   //set output
 304   fOutput = output;
 305   if (output){
 306     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 307     //    iotrack->fHelixIn   = new TClonesArray("AliHelix");
 308     //iotrack->fHelixOut  = new TClonesArray("AliHelix");
 309     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 310     delete iotrack;
 311   }
 312   if (output && (fDebug&2)){
 313     //write the full seed information if specified in debug mode
 314     //
 315     fSeedTree =  new TTree("Seeds","Seeds");
 316     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
 317     //
 318     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
 319     arrtr->ExpandCreateFast(160);
 320     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
 321     //
 322     vseed->fPoints = arrtr;
 323     vseed->fEPoints = arre;
 324     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
 325     fSeedTree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
 326     delete arrtr;
 327     delete arre;
 328     fTreeDebug = new TTree("trackDebug","trackDebug");
 329     TClonesArray * arrd = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint2",0);
 330     fTreeDebug->Branch("debug",&arrd,32000,99);
 331   }
 332
 333
 334   //set ESD event
 335   fEvent  = event;
 336 }
 337
 338 void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
 339 {
 340   //
 341   //
 342   //fill esds using updated tracks
 343   if (fEvent){
 344     // write tracks to the event
 345     // store index of the track
 346     Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
 347     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 348       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
 349       if (!pt) continue;
 350       pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
 351       if (pt->GetNumberOfClusters()>70) {
 352         AliESDtrack iotrack;
 353         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 354         //iotrack.SetTPCindex(i);
 355         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 356       }
 357     }
 358   }
 359 }
 360
 361 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks(TTree * tree)
 362 {
 363   //
 364   // write tracks from seed array to selected tree
 365   //
 366   fOutput  = tree;
 367   if (fOutput){
 368     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 369     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 370   }
 371   WriteTracks();
 372 }
 373
 374 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks()
 375 {
 376   //
 377   // write tracks to the given output tree -
 378   // output specified with SetIO routine
 379   if (!fSeeds)  return;
 380   if (!fOutput){
 381     SetIO();
 382   }
 383
 384   if (fOutput){
 385     AliTPCtrack *iotrack= 0;
 386     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 387     //for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 388     //  iotrack= (AliTPCtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 389     //  if (iotrack) break;
 390     //}
 391     //TBranch * br = fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 392     TBranch * br = fOutput->GetBranch("tracks");
 393     br->SetAddress(&iotrack);
 394     //
 395     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 396       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 397       if (!pt) continue;
 398       AliTPCtrack * track = new AliTPCtrack(*pt);
 399       iotrack = track;
 400       pt->fLab2 =i;
 401       //      br->SetAddress(&iotrack);
 402       fOutput->Fill();
 403       delete track;
 404       iotrack =0;
 405     }
 406     //fOutput->GetDirectory()->cd();
 407     //fOutput->Write();
 408   }
 409   // delete iotrack;
 410   //
 411   if (fSeedTree){
 412     //write the full seed information if specified in debug mode
 413
 414     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
 415     //
 416     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
 417     arrtr->ExpandCreateFast(160);
 418     //TClonesArray * arrcl = new TClonesArray("AliTPCclusterMI",160);
 419     //arrcl->ExpandCreateFast(160);
 420     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
 421     //
 422     vseed->fPoints = arrtr;
 423     vseed->fEPoints = arre;
 424     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
 425     //TBranch * brseed = seedtree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
 426     TBranch * brseed = fSeedTree->GetBranch("seeds");
 427
 428     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 429
 430     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 431       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 432       if (!pt) continue;
 433       pt->fPoints = arrtr;
 434       //      pt->fClusterPoints = arrcl;
 435       pt->fEPoints       = arre;
 436       pt->RebuildSeed();
 437       vseed = pt;
 438       brseed->SetAddress(&vseed);
 439       fSeedTree->Fill();
 440       pt->fPoints  = 0;
 441       pt->fEPoints = 0;
 442       //      pt->fClusterPoints = 0;
 443     }
 444     fSeedTree->Write();
 445     if (fTreeDebug) fTreeDebug->Write();
 446   }
 447
 448 }
 449
 450
 451
 452
 453 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrY2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 454   //
 455   //
 456   //seed->SetErrorY2(0.1);
 457   //return 0.1;
 458   //calculate look-up table at the beginning
 459   static Bool_t  ginit = kFALSE;
 460   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
 461   static Float_t ggg1[10000];
 462   static Float_t ggg2[10000];
 463   static Float_t ggg3[10000];
 464   static Float_t glandau1[10000];
 465   static Float_t glandau2[10000];
 466   static Float_t glandau3[10000];
 467   //
 468   static Float_t gcor01[500];
 469   static Float_t gcor02[500];
 470   static Float_t gcorp[500];
 471   //
 472
 473   //
 474   if (ginit==kFALSE){
 475     for (Int_t i=1;i<500;i++){
 476       Float_t rsigma = float(i)/100.;
 477       gcor02[i] = TMath::Max(0.78 +TMath::Exp(7.4*(rsigma-1.2)),0.6);
 478       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(3.36*(rsigma-1.2)),0.6);
 479       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
 480     }
 481
 482     //
 483     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
 484       //
 485       //
 486       // inner sector
 487       Float_t amp = float(i);
 488       Float_t padlength =0.75;
 489       gnoise1 = 0.0004/padlength;
 490       Float_t nel     = 0.268*amp;
 491       Float_t nprim   = 0.155*amp;
 492       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 493       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 494       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
 495       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;
 496       //
 497       // outer short
 498       padlength =1.;
 499       gnoise2   = 0.0004/padlength;
 500       nel       = 0.3*amp;
 501       nprim     = 0.133*amp;
 502       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 503       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 504       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
 505       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
 506       //
 507       //
 508       // outer long
 509       padlength =1.5;
 510       gnoise3   = 0.0004/padlength;
 511       nel       = 0.3*amp;
 512       nprim     = 0.133*amp;
 513       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 514       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 515       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
 516       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
 517       //
 518     }
 519     ginit = kTRUE;
 520   }
 521   //
 522   //
 523   //
 524   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));
 525   if (amp>9999) {
 526     seed->SetErrorY2(1.);
 527     return 1.;
 528   }
 529   Float_t snoise2;
 530   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 531   Int_t ctype = cl->GetType();
 532   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
 533   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 534   angle2 = angle2/(1-angle2);
 535   //
 536   //cluster "quality"
 537   Int_t rsigmay = int(100.*cl->GetSigmaY2()/(seed->fCurrentSigmaY2));
 538   Float_t res;
 539   //
 540   if (fSectors==fInnerSec){
 541     snoise2 = gnoise1;
 542     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;
 543     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmay];
 544     if ((ctype>0)){
 545       res+=0.002;
 546       res*= gcorp[rsigmay];
 547     }
 548   }
 549   else {
 550     if (padlength<1.1){
 551       snoise2 = gnoise2;
 552       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2;
 553       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
 554       if ((ctype>0)){
 555         res+=0.002;
 556         res*= gcorp[rsigmay];
 557       }
 558     }
 559     else{
 560       snoise2 = gnoise3;
 561       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2;
 562       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
 563       if ((ctype>0)){
 564         res+=0.002;
 565         res*= gcorp[rsigmay];
 566       }
 567     }
 568   }
 569
 570   if (ctype<0){
 571     res+=0.005;
 572     res*=2.4;  // overestimate error 2 times
 573   }
 574   res+= snoise2;
 575
 576   if (res<2*snoise2)
 577     res = 2*snoise2;
 578
 579   seed->SetErrorY2(res);
 580   return res;
 581
 582
 583 }
 584
 585
 586
 587 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 588   //
 589   //
 590   //seed->SetErrorY2(0.1);
 591   //return 0.1;
 592   //calculate look-up table at the beginning
 593   static Bool_t  ginit = kFALSE;
 594   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
 595   static Float_t ggg1[10000];
 596   static Float_t ggg2[10000];
 597   static Float_t ggg3[10000];
 598   static Float_t glandau1[10000];
 599   static Float_t glandau2[10000];
 600   static Float_t glandau3[10000];
 601   //
 602   static Float_t gcor01[1000];
 603   static Float_t gcor02[1000];
 604   static Float_t gcorp[1000];
 605   //
 606
 607   //
 608   if (ginit==kFALSE){
 609     for (Int_t i=1;i<1000;i++){
 610       Float_t rsigma = float(i)/100.;
 611       gcor02[i] = TMath::Max(0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigma-1.2)),0.6);
 612       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigma-1.2)),0.6);
 613       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
 614     }
 615
 616     //
 617     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
 618       //
 619       //
 620       // inner sector
 621       Float_t amp = float(i);
 622       Float_t padlength =0.75;
 623       gnoise1 = 0.0004/padlength;
 624       Float_t nel     = 0.268*amp;
 625       Float_t nprim   = 0.155*amp;
 626       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 627       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 628       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
 629       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;
 630       //
 631       // outer short
 632       padlength =1.;
 633       gnoise2   = 0.0004/padlength;
 634       nel       = 0.3*amp;
 635       nprim     = 0.133*amp;
 636       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 637       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 638       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
 639       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
 640       //
 641       //
 642       // outer long
 643       padlength =1.5;
 644       gnoise3   = 0.0004/padlength;
 645       nel       = 0.3*amp;
 646       nprim     = 0.133*amp;
 647       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 648       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 649       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
 650       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
 651       //
 652     }
 653     ginit = kTRUE;
 654   }
 655   //
 656   //
 657   //
 658   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));
 659   if (amp>9999) {
 660     seed->SetErrorY2(1.);
 661     return 1.;
 662   }
 663   Float_t snoise2;
 664   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 665   Int_t ctype = cl->GetType();
 666   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
 667   //
 668   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 669   //  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
 670   angle2 = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1+angle2/(1-angle2));
 671   //
 672   //cluster "quality"
 673   Int_t rsigmaz = int(100.*cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2));
 674   Float_t res;
 675   //
 676   if (fSectors==fInnerSec){
 677     snoise2 = gnoise1;
 678     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;
 679     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmaz];
 680     if ((ctype>0)){
 681       res+=0.002;
 682       res*= gcorp[rsigmaz];
 683     }
 684   }
 685   else {
 686     if (padlength<1.1){
 687       snoise2 = gnoise2;
 688       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2;
 689       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
 690       if ((ctype>0)){
 691         res+=0.002;
 692         res*= gcorp[rsigmaz];
 693       }
 694     }
 695     else{
 696       snoise2 = gnoise3;
 697       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2;
 698       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
 699       if ((ctype>0)){
 700         res+=0.002;
 701         res*= gcorp[rsigmaz];
 702       }
 703     }
 704   }
 705
 706   if (ctype<0){
 707     res+=0.002;
 708     res*=1.3;
 709   }
 710   if ((ctype<0) &&amp<70){
 711     res+=0.002;
 712     res*=1.3;
 713   }
 714   res += snoise2;
 715   if (res<2*snoise2)
 716      res = 2*snoise2;
 717   if (res>3) res =3;
 718   seed->SetErrorZ2(res);
 719   return res;
 720 }
 721
 722
 723
 724 /*
 725 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 726   //
 727   //
 728   //seed->SetErrorZ2(0.1);
 729   //return 0.1;
 730
 731   Float_t snoise2;
 732   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 733   //
 734   Float_t rsigmaz = cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2);
 735   Int_t ctype = cl->GetType();
 736   Float_t amp = TMath::Abs(cl->GetQ());
 737
 738   Float_t nel;
 739   Float_t nprim;
 740   //
 741   Float_t landau=2 ;    //landau fluctuation part
 742   Float_t gg=2;         // gg fluctuation part
 743   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetX());
 744
 745   if (fSectors==fInnerSec){
 746     snoise2 = 0.0004/padlength;
 747     nel     = 0.268*amp;
 748     nprim   = 0.155*amp;
 749     gg      = (2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 750     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 751     if (landau>1) landau=1;
 752   }
 753   else {
 754     snoise2 = 0.0004/padlength;
 755     nel     = 0.3*amp;
 756     nprim   = 0.133*amp;
 757     gg      = (2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 758     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 759     if (landau>1) landau=1;
 760   }
 761   Float_t sdiff = gg*fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*z;
 762
 763   //
 764   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 765   angle2 = TMath::Sqrt((1-angle2));
 766   if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
 767   //angle2 = 1;
 768
 769   Float_t angle = seed->GetTgl()/angle2;
 770   Float_t angular = landau*angle*angle*padlength*padlength/12.;
 771   Float_t res = sdiff + angular;
 772
 773
 774   if ((ctype==0) && (fSectors ==fOuterSec))
 775     res *= 0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigmaz-1.2));
 776
 777   if ((ctype==0) && (fSectors ==fInnerSec))
 778     res *= 0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigmaz-1.2));
 779
 780   if ((ctype>0)){
 781     res+=0.005;
 782     res*= TMath::Power(rsigmaz+0.5,1.5);  //0.31+0.147*ctype;
 783   }
 784   if (ctype<0){
 785     res+=0.002;
 786     res*=1.3;
 787   }
 788   if ((ctype<0) &&amp<70){
 789     res+=0.002;
 790     res*=1.3;
 791   }
 792   res += snoise2;
 793   if (res<2*snoise2)
 794      res = 2*snoise2;
 795
 796   seed->SetErrorZ2(res);
 797   return res;
 798 }
 799 */
 800
 801
 802
 803 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 804 {
 805   //
 806   //
 807   SetNumberOfClusters(0);
 808   fNFoundable = 0;
 809   SetChi2(0);
 810   ResetCovariance();
 811   /*
 812   if (fTrackPoints){
 813     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 814       delete [] fTrackPoints[i];
 815     }
 816     delete fTrackPoints;
 817     fTrackPoints =0;
 818   }
 819   */
 820
 821   if (all){
 822     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 823     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 824   }
 825
 826 }
 827
 828
 829 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 830 {
 831
 832   //------------------------------------------------------------------
 833   //This function makes a track forget its history :)
 834   //------------------------------------------------------------------
 835   if (factor<=0) {
 836     ResetCovariance();
 837     return;
 838   }
 839   fC00*=factor;
 840   fC10*=0;  fC11*=factor;
 841   fC20*=0;  fC21*=0;  fC22*=factor;
 842   fC30*=0;  fC31*=0;  fC32*=0;  fC33*=factor;
 843   fC40*=0;  fC41*=0;  fC42*=0;  fC43*=0;  fC44*=factor;
 844   SetNumberOfClusters(0);
 845   fNFoundable =0;
 846   SetChi2(0);
 847   fRemoval = 0;
 848   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 849   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 850   fNoCluster     = 0;
 851   //fFirstPoint = 160;
 852   //fLastPoint  = 0;
 853 }
 854
 855
 856
 857
 858 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 859 {
 860   //-----------------------------------------------------------------
 861   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 862   // doesn't change internal state of the track
 863   //-----------------------------------------------------------------
 864
 865   Double_t x1=fX, x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 866
 867   if (TMath::Abs(fP4*xk - fP2) >= 0.999) {
 868     return 0;
 869   }
 870
 871   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 872   Double_t c1=fP4*x1 - fP2, r1=sqrt(1.- c1*c1);
 873   Double_t c2=fP4*x2 - fP2, r2=sqrt(1.- c2*c2);
 874
 875   y = fP0;
 876   z = fP1;
 877   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 878   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 879
 880   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 881   Double_t dz = 0;
 882   //
 883   Double_t delta = fP4*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 884   /*
 885   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 886     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 887   }else{
 888     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 889   }
 890   */
 891   dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 892   //
 893   y+=dy;
 894   z+=dz;
 895
 896
 897   return 1;
 898 }
 899
 900
 901 //_____________________________________________________________________________
 902 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliTPCclusterMI *c) const
 903 {
 904   //-----------------------------------------------------------------
 905   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 906   //-----------------------------------------------------------------
 907   //Double_t r00=c->GetSigmaY2(), r01=0., r11=c->GetSigmaZ2();
 908   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
 909   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
 910
 911   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
 912   if (TMath::Abs(det) < 1.e-10) {
 913     Int_t n=GetNumberOfClusters();
 914     if (n>4) cerr<<n<<" AliKalmanTrack warning: Singular matrix !\n";
 915     return 1e10;
 916   }
 917   Double_t tmp=r00; r00=r11; r11=tmp; r01=-r01;
 918
 919   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
 920
 921   return (dy*r00*dy + 2*r01*dy*dz + dz*r11*dz)/det;
 922 }
 923
 924
 925 //_________________________________________________________________________________________
 926
 927
 928 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 929   //-----------------------------------------------------------------
 930   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 931   //-----------------------------------------------------------------
 932   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 933
 934   if (fSort == 0){
 935     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 936     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 937     Double_t z2 = t->GetZ();
 938     Double_t z1 = GetZ();
 939     if (z2>z1) return 1;
 940     if (z2<z1) return -1;
 941     return 0;
 942   }
 943   else {
 944     Float_t f2 =1;
 945     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->fC44)/(TMath::Abs(t->GetC())+0.0066);
 946     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 947
 948     Float_t f1 =1;
 949     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(fC44)/(TMath::Abs(GetC())+0.0066);
 950
 951     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 952
 953     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 954     else return +1;
 955   }
 956 }
 957
 958 void AliTPCtrackerMI::RotateToLocal(AliTPCseed *seed)
 959 {
 960   //rotate to track "local coordinata
 961   Float_t x = seed->GetX();
 962   Float_t y = seed->GetY();
 963   Float_t ymax = x*TMath::Tan(0.5*fSectors->GetAlpha());
 964
 965   if (y > ymax) {
 966     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector+1) % fN;
 967     if (!seed->Rotate(fSectors->GetAlpha()))
 968       return;
 969   } else if (y <-ymax) {
 970     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector-1+fN) % fN;
 971     if (!seed->Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
 972       return;
 973   }
 974
 975 }
 976
 977
 978
 979
 980 //_____________________________________________________________________________
 981 Int_t AliTPCseed::Update(const AliTPCclusterMI *c, Double_t chisq, UInt_t /*index*/) {
 982   //-----------------------------------------------------------------
 983   // This function associates a cluster with this track.
 984   //-----------------------------------------------------------------
 985   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
 986
 987   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
 988   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
 989   Double_t tmp=r00; r00=r11/det; r11=tmp/det; r01=-r01/det;
 990
 991   Double_t k00=fC00*r00+fC10*r01, k01=fC00*r01+fC10*r11;
 992   Double_t k10=fC10*r00+fC11*r01, k11=fC10*r01+fC11*r11;
 993   Double_t k20=fC20*r00+fC21*r01, k21=fC20*r01+fC21*r11;
 994   Double_t k30=fC30*r00+fC31*r01, k31=fC30*r01+fC31*r11;
 995   Double_t k40=fC40*r00+fC41*r01, k41=fC40*r01+fC41*r11;
 996
 997   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
 998   Double_t cur=fP4 + k40*dy + k41*dz, eta=fP2 + k20*dy + k21*dz;
 999   if (TMath::Abs(cur*fX-eta) >= 0.9) {
1000     return 0;
1001   }
1002
1003   fP0 += k00*dy + k01*dz;
1004   fP1 += k10*dy + k11*dz;
1005   fP2  = eta;
1006   fP3 += k30*dy + k31*dz;
1007   fP4  = cur;
1008
1009   Double_t c01=fC10, c02=fC20, c03=fC30, c04=fC40;
1010   Double_t c12=fC21, c13=fC31, c14=fC41;
1011
1012   fC00-=k00*fC00+k01*fC10; fC10-=k00*c01+k01*fC11;
1013   fC20-=k00*c02+k01*c12;   fC30-=k00*c03+k01*c13;
1014   fC40-=k00*c04+k01*c14;
1015
1016   fC11-=k10*c01+k11*fC11;
1017   fC21-=k10*c02+k11*c12;   fC31-=k10*c03+k11*c13;
1018   fC41-=k10*c04+k11*c14;
1019
1020   fC22-=k20*c02+k21*c12;   fC32-=k20*c03+k21*c13;
1021   fC42-=k20*c04+k21*c14;
1022
1023   fC33-=k30*c03+k31*c13;
1024   fC43-=k40*c03+k41*c13;
1025
1026   fC44-=k40*c04+k41*c14;
1027
1028   Int_t n=GetNumberOfClusters();
1029   //  fIndex[n]=index;
1030   SetNumberOfClusters(n+1);
1031   SetChi2(GetChi2()+chisq);
1032
1033   return 1;
1034 }
1035
1036
1037
1038 //_____________________________________________________________________________
1039 Double_t AliTPCtrackerMI::F1old(Double_t x1,Double_t y1,
1040                    Double_t x2,Double_t y2,
1041                    Double_t x3,Double_t y3)
1042 {
1043   //-----------------------------------------------------------------
1044   // Initial approximation of the track curvature
1045   //-----------------------------------------------------------------
1046   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
1047   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
1048                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
1049   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
1050                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
1051
1052   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
1053   if ( xr*xr+yr*yr<=0.00000000000001) return 100;
1054   return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
1055 }
1056
1057
1058
1059 //_____________________________________________________________________________
1060 Double_t AliTPCtrackerMI::F1(Double_t x1,Double_t y1,
1061                    Double_t x2,Double_t y2,
1062                    Double_t x3,Double_t y3)
1063 {
1064   //-----------------------------------------------------------------
1065   // Initial approximation of the track curvature
1066   //-----------------------------------------------------------------
1067   x3 -=x1;
1068   x2 -=x1;
1069   y3 -=y1;
1070   y2 -=y1;
1071   //
1072   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
1073   if (det==0) {
1074     return 100;
1075   }
1076   //
1077   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
1078   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
1079   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
1080   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
1081   if (det<0) c2*=-1;
1082   return c2;
1083 }
1084
1085
1086 Double_t AliTPCtrackerMI::F2(Double_t x1,Double_t y1,
1087                    Double_t x2,Double_t y2,
1088                    Double_t x3,Double_t y3)
1089 {
1090   //-----------------------------------------------------------------
1091   // Initial approximation of the track curvature
1092   //-----------------------------------------------------------------
1093   x3 -=x1;
1094   x2 -=x1;
1095   y3 -=y1;
1096   y2 -=y1;
1097   //
1098   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
1099   if (det==0) {
1100     return 100;
1101   }
1102   //
1103   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
1104   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
1105   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
1106   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
1107   if (det<0) c2*=-1;
1108   x0+=x1;
1109   x0*=c2;
1110   return x0;
1111 }
1112
1113
1114
1115 //_____________________________________________________________________________
1116 Double_t AliTPCtrackerMI::F2old(Double_t x1,Double_t y1,
1117                    Double_t x2,Double_t y2,
1118                    Double_t x3,Double_t y3)
1119 {
1120   //-----------------------------------------------------------------
1121   // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
1122   //-----------------------------------------------------------------
1123   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
1124   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
1125                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
1126   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
1127                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
1128
1129   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
1130
1131   return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
1132 }
1133
1134 //_____________________________________________________________________________
1135 Double_t AliTPCtrackerMI::F3(Double_t x1,Double_t y1,
1136                    Double_t x2,Double_t y2,
1137                    Double_t z1,Double_t z2)
1138 {
1139   //-----------------------------------------------------------------
1140   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1141   //-----------------------------------------------------------------
1142   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1143 }
1144
1145
1146 Double_t AliTPCtrackerMI::F3n(Double_t x1,Double_t y1,
1147                    Double_t x2,Double_t y2,
1148                    Double_t z1,Double_t z2, Double_t c)
1149 {
1150   //-----------------------------------------------------------------
1151   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1152   //-----------------------------------------------------------------
1153
1154   //  Double_t angle1;
1155
1156   //angle1    =  (z1-z2)*c/(TMath::ASin(c*x1-ni)-TMath::ASin(c*x2-ni));
1157   //
1158   Double_t d  =  TMath::Sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1159   if (TMath::Abs(d*c*0.5)>1) return 0;
1160   //  Double_t   angle2    =  TMath::ASin(d*c*0.5);
1161   //  Double_t   angle2    =  AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1162   Double_t   angle2    = (d*c*0.5>0.1)? TMath::ASin(d*c*0.5): AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1163
1164   angle2  = (z1-z2)*c/(angle2*2.);
1165   return angle2;
1166 }
1167
1168 Bool_t   AliTPCtrackerMI::GetProlongation(Double_t x1, Double_t x2, Double_t x[5], Double_t &y, Double_t &z)
1169 {//-----------------------------------------------------------------
1170   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=x2.
1171   //-----------------------------------------------------------------
1172
1173   Double_t dx=x2-x1;
1174
1175   if (TMath::Abs(x[4]*x1 - x[2]) >= 0.999) {
1176     return kFALSE;
1177   }
1178
1179   Double_t c1=x[4]*x1 - x[2], r1=sqrt(1.- c1*c1);
1180   Double_t c2=x[4]*x2 - x[2], r2=sqrt(1.- c2*c2);
1181   y = x[0];
1182   z = x[1];
1183
1184   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
1185   Double_t dz = 0;
1186   //
1187   Double_t delta = x[4]*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
1188
1189   if (TMath::Abs(delta)>0.01){
1190     dz = x[3]*TMath::ASin(delta)/x[4];
1191   }else{
1192     dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1193   }
1194
1195   //dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1196
1197   y+=dy;
1198   z+=dz;
1199
1200   return kTRUE;
1201 }
1202
1203 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters (TTree *tree)
1204 {
1205   //
1206   //
1207   fInput = tree;
1208   return LoadClusters();
1209 }
1210
1211 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
1212 {
1213   //
1214   // load clusters to the memory
1215   AliTPCClustersRow *clrow= new AliTPCClustersRow;
1216   clrow->SetClass("AliTPCclusterMI");
1217   clrow->SetArray(0);
1218   clrow->GetArray()->ExpandCreateFast(10000);
1219   //
1220   //  TTree * tree = fClustersArray.GetTree();
1221
1222   TTree * tree = fInput;
1223   TBranch * br = tree->GetBranch("Segment");
1224   br->SetAddress(&clrow);
1225   //
1226   Int_t j=Int_t(tree->GetEntries());
1227   for (Int_t i=0; i<j; i++) {
1228     br->GetEntry(i);
1229     //
1230     Int_t sec,row;
1231     fParam->AdjustSectorRow(clrow->GetID(),sec,row);
1232     //
1233     AliTPCRow * tpcrow=0;
1234     Int_t left=0;
1235     if (sec<fkNIS*2){
1236       tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1237       left = sec/fkNIS;
1238     }
1239     else{
1240       tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1241       left = (sec-fkNIS*2)/fkNOS;
1242     }
1243     if (left ==0){
1244       tpcrow->fN1 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1245       tpcrow->fClusters1 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN1];
1246       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN1;i++)
1247         tpcrow->fClusters1[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1248     }
1249     if (left ==1){
1250       tpcrow->fN2 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1251       tpcrow->fClusters2 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN2];
1252       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN2;i++)
1253         tpcrow->fClusters2[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1254     }
1255   }
1256   //
1257   delete clrow;
1258   LoadOuterSectors();
1259   LoadInnerSectors();
1260   return 0;
1261 }
1262
1263
1264 void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
1265 {
1266   //
1267   // unload clusters from the memory
1268   //
1269   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1270   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1271     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1272       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1273       //      if (tpcrow){
1274       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1;
1275       //        if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2;
1276       //}
1277       tpcrow->ResetClusters();
1278     }
1279   //
1280   nrows = fInnerSec->GetNRows();
1281   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1282     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1283       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1284       //if (tpcrow){
1285       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1;
1286       //if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2;
1287       //}
1288       tpcrow->ResetClusters();
1289     }
1290
1291   return ;
1292 }
1293
1294
1295 //_____________________________________________________________________________
1296 Int_t AliTPCtrackerMI::LoadOuterSectors() {
1297   //-----------------------------------------------------------------
1298   // This function fills outer TPC sectors with clusters.
1299   //-----------------------------------------------------------------
1300   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1301   UInt_t index=0;
1302   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1303     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1304       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1305       Int_t sec2 = sec+2*fkNIS;
1306       //left
1307       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1308       while (ncl--) {
1309         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1310         index=(((sec2<<8)+row)<<16)+ncl;
1311         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1312       }
1313       //right
1314       ncl = tpcrow->fN2;
1315       while (ncl--) {
1316         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1317         index=((((sec2+fkNOS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1318         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1319       }
1320       //
1321       // write indexes for fast acces
1322       //
1323       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1324         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1325       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1326         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1327         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1328       }
1329       Int_t last = 0;
1330       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1331         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1332           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1333         else
1334           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1335       }
1336     }
1337   fN=fkNOS;
1338   fSectors=fOuterSec;
1339   return 0;
1340 }
1341
1342
1343 //_____________________________________________________________________________
1344 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadInnerSectors() {
1345   //-----------------------------------------------------------------
1346   // This function fills inner TPC sectors with clusters.
1347   //-----------------------------------------------------------------
1348   Int_t nrows = fInnerSec->GetNRows();
1349   UInt_t index=0;
1350   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1351     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1352       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1353       //
1354       //left
1355       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1356       while (ncl--) {
1357         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1358         index=(((sec<<8)+row)<<16)+ncl;
1359         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1360       }
1361       //right
1362       ncl = tpcrow->fN2;
1363       while (ncl--) {
1364         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1365         index=((((sec+fkNIS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1366         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1367       }
1368       //
1369       // write indexes for fast acces
1370       //
1371       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1372         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1373       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1374         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1375         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1376       }
1377       Int_t last = 0;
1378       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1379         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1380           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1381         else
1382           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1383       }
1384
1385     }
1386
1387   fN=fkNIS;
1388   fSectors=fInnerSec;
1389   return 0;
1390 }
1391
1392
1393
1394 //_________________________________________________________________________
1395 AliTPCclusterMI *AliTPCtrackerMI::GetClusterMI(Int_t index) const {
1396   //--------------------------------------------------------------------
1397   //       Return pointer to a given cluster
1398   //--------------------------------------------------------------------
1399   Int_t sec=(index&0xff000000)>>24;
1400   Int_t row=(index&0x00ff0000)>>16;
1401   Int_t ncl=(index&0x00007fff)>>00;
1402
1403   const AliTPCRow * tpcrow=0;
1404   AliTPCclusterMI * clrow =0;
1405   if (sec<fkNIS*2){
1406     tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1407     if (sec<fkNIS)
1408       clrow = tpcrow->fClusters1;
1409     else
1410       clrow = tpcrow->fClusters2;
1411   }
1412   else{
1413     tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1414     if (sec-2*fkNIS<fkNOS)
1415       clrow = tpcrow->fClusters1;
1416     else
1417       clrow = tpcrow->fClusters2;
1418   }
1419   if (tpcrow==0) return 0;
1420   if (tpcrow->GetN()<=ncl) return 0;
1421   //  return (AliTPCclusterMI*)(*tpcrow)[ncl];
1422   return &(clrow[ncl]);
1423
1424 }
1425
1426
1427
1428 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1429   //-----------------------------------------------------------------
1430   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1431   //-----------------------------------------------------------------
1432   //
1433   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1434
1435   //  if (t.GetRadius()>x+10 ) return 0;
1436   //  t.PropagateTo(x+0.02);
1437   //t.PropagateTo(x+0.01);
1438   if (!t.PropagateTo(x)) {
1439     t.fRemoval = 10;
1440     return 0;
1441   }
1442   //
1443   Double_t  y=t.GetY(), z=t.GetZ();
1444   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1445     if (y > ymax) {
1446       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1447       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1448         return 0;
1449     } else if (y <-ymax) {
1450       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1451       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1452         return 0;
1453     }
1454     //if (!t.PropagateTo(x)) {
1455     //  return 0;
1456     //}
1457     return 1;
1458   }
1459   //
1460   // update current shape info every 3 pad-row
1461   if ( (nr%5==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1462     //t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1463     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1464     GetShape(&t,nr);
1465   }
1466   //
1467   AliTPCclusterMI *cl=0;
1468   UInt_t index=0;
1469
1470
1471   //Int_t nr2 = nr;
1472   if (t.GetClusterIndex2(nr)>0){
1473     //
1474     //cl = GetClusterMI(t.GetClusterIndex2(nr));
1475     index = t.GetClusterIndex2(nr);
1476     cl = t.fClusterPointer[nr];
1477     if ( (cl==0) && (index>0)) cl = GetClusterMI(index);
1478     t.fCurrentClusterIndex1 = index;
1479   }
1480
1481   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1482   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1483   Double_t  roady  =1.;
1484   Double_t  roadz = 1.;
1485   //
1486   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1487     t.fInDead = kTRUE;
1488     t.SetClusterIndex2(nr,-1);
1489     return 0;
1490   }
1491   else
1492     {
1493       if (TMath::Abs(z)<(1.05*x+10)) t.fNFoundable++;
1494       else
1495         return 0;
1496     }
1497   //calculate
1498   if (cl){
1499     t.fCurrentCluster = cl;
1500     t.fRow = nr;
1501     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1502     if (fIteration>0) accept =0;
1503     if (accept<3) {
1504       //if founded cluster is acceptible
1505       UpdateTrack(&t,accept);
1506       return 1;
1507     }
1508   }
1509
1510   if (krow) {
1511     //    cl = krow.FindNearest2(y+10.,z,roady,roadz,index);
1512     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);
1513     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);
1514   }
1515   //  t.fNoCluster++;
1516
1517   if (cl) {
1518     t.fCurrentCluster = cl;
1519     t.fRow = nr;
1520     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1521     /*
1522     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1523       //
1524       //
1525
1526       t.fNShared++;
1527       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1528         t.fRemoval =10;
1529         return 0;
1530       }
1531     }
1532     */
1533     if (accept<3) UpdateTrack(&t,accept);
1534
1535   } else {
1536     if ( fIteration==0 && t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) t.fRemoval=10;
1537
1538   }
1539   return 1;
1540 }
1541
1542 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1543   //-----------------------------------------------------------------
1544   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1545   //-----------------------------------------------------------------
1546   //
1547   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1548   Double_t y,z;
1549   if (!t.GetProlongation(x,y,z)) {
1550     t.fRemoval = 10;
1551     return 0;
1552   }
1553   //
1554   //
1555   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1556
1557     if (y > ymax) {
1558       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1559       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1560         return 0;
1561     } else if (y <-ymax) {
1562       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1563       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1564         return 0;
1565     }
1566     if (!t.PropagateTo(x)) {
1567       return 0;
1568     }
1569     t.GetProlongation(x,y,z);
1570   }
1571   //
1572   // update current shape info every 3 pad-row
1573   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1574     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1575     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1576     GetShape(&t,nr);
1577   }
1578   //
1579   AliTPCclusterMI *cl=0;
1580   UInt_t index=0;
1581
1582
1583   //Int_t nr2 = nr;
1584   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1585   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1586   Double_t  roady  =1.;
1587   Double_t  roadz = 1.;
1588   //
1589   Int_t row = nr;
1590   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1591     t.fInDead = kTRUE;
1592     t.SetClusterIndex2(row,-1);
1593     return 0;
1594   }
1595   else
1596     {
1597       if (TMath::Abs(z)>(1.05*x+10)) t.SetClusterIndex2(row,-1);
1598     }
1599   //calculate
1600
1601   if ((cl==0)&&(krow)) {
1602     //    cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,index);
1603     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);
1604
1605     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);
1606   }
1607
1608   if (cl) {
1609     t.fCurrentCluster = cl;
1610     //    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1611     //if (accept<3){
1612       t.SetClusterIndex2(row,index);
1613       t.fClusterPointer[row] = cl;
1614       //}
1615   }
1616   return 1;
1617 }
1618
1619
1620
1621 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateClusters(AliTPCseed& t,  Int_t nr) {
1622   //-----------------------------------------------------------------
1623   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1624   //-----------------------------------------------------------------
1625   t.fCurrentCluster  = 0;
1626   t.fCurrentClusterIndex1 = 0;
1627
1628   Double_t xt=t.GetX();
1629   Int_t     row = GetRowNumber(xt)-1;
1630   Double_t  ymax= GetMaxY(nr);
1631
1632   if (row < nr) return 1; // don't prolongate if not information until now -
1633   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.9 && t.GetNumberOfClusters()>40. && fIteration!=2) {
1634     t.fRemoval =10;
1635     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1636   }
1637   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95) {
1638     t.fRemoval =10;
1639     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1640   }
1641
1642   Double_t x= GetXrow(nr);
1643   Double_t y,z;
1644   //t.PropagateTo(x+0.02);
1645   //t.PropagateTo(x+0.01);
1646   if (!t.PropagateTo(x)){
1647     return 0;
1648   }
1649   //
1650   y=t.GetY();
1651   z=t.GetZ();
1652
1653   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1654     if (y > ymax) {
1655       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1656       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1657         return 0;
1658     } else if (y <-ymax) {
1659       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1660       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1661         return 0;
1662     }
1663     //    if (!t.PropagateTo(x)){
1664     //  return 0;
1665     //}
1666     return 1;
1667     //y = t.GetY();
1668   }
1669   //
1670
1671   AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1672
1673   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1674     t.fInDead = kTRUE;
1675     t.SetClusterIndex2(nr,-1);
1676     return 0;
1677   }
1678   else
1679     {
1680       if (TMath::Abs(t.GetZ())<(1.05*t.GetX()+10)) t.fNFoundable++;
1681       else
1682         return 0;
1683     }
1684
1685   // update current
1686   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2){
1687     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1688     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1689     GetShape(&t,nr);
1690   }
1691
1692   AliTPCclusterMI *cl=0;
1693   UInt_t index=0;
1694   //
1695   Double_t roady = 1.;
1696   Double_t roadz = 1.;
1697   //
1698
1699   if (!cl){
1700     index = t.GetClusterIndex2(nr);
1701     if ( (index>0) && (index&0x8000)==0){
1702       cl = t.fClusterPointer[nr];
1703       if ( (cl==0) && (index>0)) cl = GetClusterMI(index);
1704       t.fCurrentClusterIndex1 = index;
1705       if (cl) {
1706         t.fCurrentCluster  = cl;
1707         return 1;
1708       }
1709     }
1710   }
1711
1712   if (krow) {
1713     //cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,index);
1714     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);
1715   }
1716
1717   if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);
1718   t.fCurrentCluster  = cl;
1719
1720   return 1;
1721 }
1722
1723
1724 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextCluster(AliTPCseed & t, Int_t nr) {
1725   //-----------------------------------------------------------------
1726   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1727   //-----------------------------------------------------------------
1728
1729   //update error according neighborhoud
1730
1731   if (t.fCurrentCluster) {
1732     t.fRow = nr;
1733     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1734
1735     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1736       //
1737       //
1738       //  t.fErrorZ2*=2;
1739       //  t.fErrorY2*=2;
1740       t.fNShared++;
1741       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1742         t.fRemoval =10;
1743         return 0;
1744       }
1745     }
1746     if (fIteration>0) accept = 0;
1747     if (accept<3)  UpdateTrack(&t,accept);
1748
1749   } else {
1750     if (fIteration==0){
1751       if ( ( (t.GetSigmaY2()+t.GetSigmaZ2())>0.16)&& t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;
1752       if (  t.GetChi2()/t.GetNumberOfClusters()>6 &&t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;
1753
1754       if (( (t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) || t.fNoCluster>15)) t.fRemoval=10;
1755     }
1756   }
1757   return 1;
1758 }
1759
1760
1761
1762 //_____________________________________________________________________________
1763 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1764   //-----------------------------------------------------------------
1765   // This function tries to find a track prolongation.
1766   //-----------------------------------------------------------------
1767   Double_t xt=t.GetX();
1768   //
1769   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1770   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1771   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1772   //
1773   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1774
1775   Int_t first = GetRowNumber(xt)-1;
1776   for (Int_t nr= first; nr>=rf; nr-=step) {
1777     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
1778       fSectors = fInnerSec;
1779     else
1780       fSectors = fOuterSec;
1781     if (FollowToNext(t,nr)==0)
1782       if (!t.IsActive()) return 0;
1783
1784   }
1785   return 1;
1786 }
1787
1788
1789 //_____________________________________________________________________________
1790 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongationFast(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1791   //-----------------------------------------------------------------
1792   // This function tries to find a track prolongation.
1793   //-----------------------------------------------------------------
1794   Double_t xt=t.GetX();
1795   //
1796   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1797   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1798   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1799   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1800
1801   for (Int_t nr=GetRowNumber(xt)-1; nr>=rf; nr-=step) {
1802
1803     if (FollowToNextFast(t,nr)==0)
1804       if (!t.IsActive()) return 0;
1805
1806   }
1807   return 1;
1808 }
1809
1810
1811
1812
1813
1814 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowBackProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf) {
1815   //-----------------------------------------------------------------
1816   // This function tries to find a track prolongation.
1817   //-----------------------------------------------------------------
1818   //  Double_t xt=t.GetX();
1819   //
1820   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1821   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1822   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1823   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1824
1825   Int_t first = 0;
1826   first = t.fFirstPoint+3;
1827   //
1828   if (first<0) first=0;
1829   for (Int_t nr=first+1; nr<=rf; nr++) {
1830     //if ( (t.GetSnp()<0.9))
1831     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
1832       fSectors = fInnerSec;
1833     else
1834       fSectors = fOuterSec;
1835     FollowToNext(t,nr);
1836   }
1837   return 1;
1838 }
1839
1840
1841
1842
1843
1844 Float_t AliTPCtrackerMI::OverlapFactor(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2, Int_t &sum1, Int_t & sum2)
1845 {
1846   //
1847   //
1848   sum1=0;
1849   sum2=0;
1850   Int_t sum=0;
1851   //
1852   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1853   dz2*=dz2;
1854
1855   Float_t dy2 =TMath::Abs((s1->GetY() - s2->GetY()));
1856   dy2*=dy2;
1857   Float_t distance = TMath::Sqrt(dz2+dy2);
1858   if (distance>4.) return 0; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1859
1860   //  Int_t offset =0;
1861   Int_t firstpoint = TMath::Min(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1862   Int_t lastpoint = TMath::Max(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1863   if (lastpoint>160)
1864     lastpoint =160;
1865   if (firstpoint<0)
1866     firstpoint = 0;
1867   if (firstpoint>lastpoint) {
1868     firstpoint =lastpoint;
1869     //    lastpoint  =160;
1870   }
1871
1872
1873   for (Int_t i=firstpoint-1;i<lastpoint+1;i++){
1874     if (s1->GetClusterIndex2(i)>0) sum1++;
1875     if (s2->GetClusterIndex2(i)>0) sum2++;
1876     if (s1->GetClusterIndex2(i)==s2->GetClusterIndex2(i) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1877       sum++;
1878     }
1879   }
1880   if (sum<5) return 0;
1881
1882   Float_t summin = TMath::Min(sum1+1,sum2+1);
1883   Float_t ratio = (sum+1)/Float_t(summin);
1884   return ratio;
1885 }
1886
1887 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2)
1888 {
1889   //
1890   //
1891   if (TMath::Abs(s1->GetC()-s2->GetC())>0.004) return;
1892   if (TMath::Abs(s1->GetTgl()-s2->GetTgl())>0.6) return;
1893
1894   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1895   dz2*=dz2;
1896   Float_t dy2 =(s1->GetY() - s2->GetY());
1897   dy2*=dy2;
1898   Float_t distance = dz2+dy2;
1899   if (distance>325.) return ; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1900
1901   //
1902   Int_t sumshared=0;
1903   //
1904   Int_t firstpoint = TMath::Max(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1905   Int_t lastpoint = TMath::Min(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1906   //
1907   if (firstpoint>=lastpoint-5) return;;
1908
1909   for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1910     //    if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1911     if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1912       sumshared++;
1913     }
1914   }
1915   if (sumshared>4){
1916     // sign clusters
1917     //
1918     for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1919       //      if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1920       if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1921         AliTPCTrackerPoint *p1  = s1->GetTrackPoint(i);
1922         AliTPCTrackerPoint *p2  = s2->GetTrackPoint(i);;
1923         if (s1->IsActive()&&s2->IsActive()){
1924           p1->fIsShared = kTRUE;
1925           p2->fIsShared = kTRUE;
1926         }
1927       }
1928     }
1929   }
1930   //
1931   if (sumshared>10){
1932     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1933       if (s1->fOverlapLabels[3*i]==0){
1934         s1->fOverlapLabels[3*i] = s2->GetLabel();
1935         s1->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1936         s1->fOverlapLabels[3*i+2] = s2->GetUniqueID();
1937         break;
1938       }
1939     }
1940     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1941       if (s2->fOverlapLabels[3*i]==0){
1942         s2->fOverlapLabels[3*i] = s1->GetLabel();
1943         s2->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1944         s2->fOverlapLabels[3*i+2] = s1->GetUniqueID();
1945         break;
1946       }
1947     }
1948   }
1949
1950 }
1951
1952 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(TObjArray * arr)
1953 {
1954   //
1955   //sort trackss according sectors
1956   //
1957   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
1958     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
1959     if (!pt) continue;
1960     //if (pt) RotateToLocal(pt);
1961     pt->fSort = 0;
1962   }
1963   arr->UnSort();
1964   arr->Sort();  // sorting according z
1965   arr->Expand(arr->GetEntries());
1966   //
1967   //
1968   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
1969   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
1970     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
1971     if (!pt) continue;
1972     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
1973       pt->fOverlapLabels[j] =0;
1974     }
1975   }
1976   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
1977     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
1978     if (!pt) continue;
1979     if (pt->fRemoval>10) continue;
1980     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
1981       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
1982       //      if (pt2){
1983       if (pt2->fRemoval<=10) {
1984         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
1985         SignShared(pt,pt2);
1986       }
1987     }
1988   }
1989 }
1990
1991 void  AliTPCtrackerMI::RemoveDouble(TObjArray * arr, Float_t factor1, Float_t factor2,  Int_t removalindex)
1992 {
1993   //
1994   //sort trackss according sectors
1995   //
1996   if (fDebug&1) {
1997     Info("RemoveDouble","Number of tracks before double removal- %d\n",arr->GetEntries());
1998   }
1999   //
2000   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
2001     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2002     if (!pt) continue;
2003     pt->fSort = 0;
2004   }
2005   arr->UnSort();
2006   arr->Sort();  // sorting according z
2007   arr->Expand(arr->GetEntries());
2008   //
2009   //reset overlap labels
2010   //
2011   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2012   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2013     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2014     if (!pt) continue;
2015     pt->SetUniqueID(i);
2016     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2017       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2018     }
2019   }
2020   //
2021   //sign shared tracks
2022   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2023     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2024     if (!pt) continue;
2025     if (pt->fRemoval>10) continue;
2026     Float_t deltac = pt->GetC()*0.1;
2027     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2028       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2029       //      if (pt2){
2030       if (pt2->fRemoval<=10) {
2031         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2032         if (TMath::Abs(pt->GetC()  -pt2->GetC())>deltac) continue;
2033         if (TMath::Abs(pt->GetTgl()-pt2->GetTgl())>0.05) continue;
2034         //
2035         SignShared(pt,pt2);
2036       }
2037     }
2038   }
2039   //
2040   // remove highly shared tracks
2041   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2042     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2043     if (!pt) continue;
2044     if (pt->fRemoval>10) continue;
2045     //
2046     Int_t sumshared =0;
2047     for (Int_t j=0;j<4;j++){
2048       sumshared = pt->fOverlapLabels[j*3+1];
2049     }
2050     Float_t factor = factor1;
2051     if (pt->fRemoval>0) factor = factor2;
2052     if (sumshared/pt->GetNumberOfClusters()>factor){
2053       for (Int_t j=0;j<4;j++){
2054         if (pt->fOverlapLabels[3*j]==0) continue;
2055         if (pt->fOverlapLabels[3*j+1]<5) continue;
2056         if (pt->fRemoval==removalindex) continue;
2057         AliTPCseed * pt2 = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(pt->fOverlapLabels[3*j+2]);
2058         if (!pt2) continue;
2059         if (pt2->GetSigma2C()<pt->GetSigma2C()){
2060           //      pt->fRemoval = removalindex;
2061           delete arr->RemoveAt(i);
2062           break;
2063         }
2064       }
2065     }
2066   }
2067   arr->Compress();
2068   if (fDebug&1) {
2069     Info("RemoveDouble","Number of tracks after double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2070   }
2071 }
2072
2073
2074
2075
2076
2077
2078 void AliTPCtrackerMI::SortTracks(TObjArray * arr, Int_t mode) const
2079 {
2080   //
2081   //sort tracks in array according mode criteria
2082   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2083   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2084     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2085     if (!pt) {
2086       continue;
2087     }
2088     pt->fSort = mode;
2089   }
2090   arr->UnSort();
2091   arr->Sort();
2092 }
2093
2094 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t removalindex)
2095 {
2096
2097   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2098   //
2099   //
2100   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2101   Int_t good =0;
2102
2103   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2104     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2105     if (!pt) {
2106       delete arr->RemoveAt(i);
2107     }
2108     else{
2109       pt->fSort =1;
2110       pt->fBSigned = kFALSE;
2111     }
2112   }
2113   arr->Compress();
2114   nseed = arr->GetEntriesFast();
2115   arr->UnSort();
2116   arr->Sort();
2117   //
2118   //unsign used
2119   UnsignClusters();
2120   //
2121   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2122     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2123     if (!pt) {
2124       continue;
2125     }
2126     Int_t found,foundable,shared;
2127     if (pt->IsActive())
2128       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kFALSE);
2129     else
2130       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kTRUE);
2131     //
2132     Double_t factor = factor2;
2133     if (pt->fBConstrain) factor = factor1;
2134
2135     if ((Float_t(shared)/Float_t(found))>factor){
2136       pt->Desactivate(removalindex);
2137       continue;
2138     }
2139
2140     good++;
2141     for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2142       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2143       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2144       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2145       if (!c) continue;
2146       //      if (!c->IsUsed(10)) c->Use(10);
2147       //if (pt->IsActive())
2148       c->Use(10);
2149       //else
2150       //        c->Use(5);
2151     }
2152
2153   }
2154   fNtracks = good;
2155   if (fDebug>0){
2156     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2157   }
2158 }
2159
2160 void AliTPCtrackerMI::UnsignClusters()
2161 {
2162   //
2163   // loop over all clusters and unsign them
2164   //
2165
2166   for (Int_t sec=0;sec<fkNIS;sec++){
2167     for (Int_t row=0;row<fInnerSec->GetNRows();row++){
2168       AliTPCclusterMI *cl = fInnerSec[sec][row].fClusters1;
2169       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN1;icl++)
2170         //      if (cl[icl].IsUsed(10))
2171         cl[icl].Use(-1);
2172       cl = fInnerSec[sec][row].fClusters2;
2173       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN2;icl++)
2174         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2175           cl[icl].Use(-1);
2176     }
2177   }
2178
2179   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
2180     for (Int_t row=0;row<fOuterSec->GetNRows();row++){
2181       AliTPCclusterMI *cl = fOuterSec[sec][row].fClusters1;
2182       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN1;icl++)
2183         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2184           cl[icl].Use(-1);
2185       cl = fOuterSec[sec][row].fClusters2;
2186       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN2;icl++)
2187         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2188         cl[icl].Use(-1);
2189     }
2190   }
2191
2192 }
2193
2194
2195
2196 void AliTPCtrackerMI::SignClusters(TObjArray * arr, Float_t fnumber, Float_t fdensity)
2197 {
2198   //
2199   //sign clusters to be "used"
2200   //
2201   // snumber and sdensity sign number of sigmas - bellow mean value to be accepted
2202   // loop over "primaries"
2203
2204   Float_t sumdens=0;
2205   Float_t sumdens2=0;
2206   Float_t sumn   =0;
2207   Float_t sumn2  =0;
2208   Float_t sumchi =0;
2209   Float_t sumchi2 =0;
2210
2211   Float_t sum    =0;
2212
2213   TStopwatch timer;
2214   timer.Start();
2215
2216   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2217   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2218     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2219     if (!pt) {
2220       continue;
2221     }
2222     if (!(pt->IsActive())) continue;
2223     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2224     if ( (dens>0.7) && (pt->GetNumberOfClusters()>70)){
2225       sumdens += dens;
2226       sumdens2+= dens*dens;
2227       sumn    += pt->GetNumberOfClusters();
2228       sumn2   += pt->GetNumberOfClusters()*pt->GetNumberOfClusters();
2229       Float_t chi2 = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2230       if (chi2>5) chi2=5;
2231       sumchi  +=chi2;
2232       sumchi2 +=chi2*chi2;
2233       sum++;
2234     }
2235   }
2236
2237   Float_t mdensity = 0.9;
2238   Float_t meann    = 130;
2239   Float_t meanchi  = 1;
2240   Float_t sdensity = 0.1;
2241   Float_t smeann    = 10;
2242   Float_t smeanchi  =0.4;
2243
2244
2245   if (sum>20){
2246     mdensity = sumdens/sum;
2247     meann    = sumn/sum;
2248     meanchi  = sumchi/sum;
2249     //
2250     sdensity = sumdens2/sum-mdensity*mdensity;
2251     sdensity = TMath::Sqrt(sdensity);
2252     //
2253     smeann   = sumn2/sum-meann*meann;
2254     smeann   = TMath::Sqrt(smeann);
2255     //
2256     smeanchi = sumchi2/sum - meanchi*meanchi;
2257     smeanchi = TMath::Sqrt(smeanchi);
2258   }
2259
2260
2261   //REMOVE  SHORT DELTAS or tracks going out of sensitive volume of TPC
2262   //
2263   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2264     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2265     if (!pt) {
2266       continue;
2267     }
2268     if (pt->fBSigned) continue;
2269     if (pt->fBConstrain) continue;
2270     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2271     /*
2272     Int_t found,foundable,shared;
2273     pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared);
2274     if (shared/float(found)>0.3) {
2275       if (shared/float(found)>0.9 ){
2276         //delete arr->RemoveAt(i);
2277       }
2278       continue;
2279     }
2280     */
2281     Bool_t isok =kFALSE;
2282     if ( (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.5) &&pt->GetNumberOfClusters()>60)
2283       isok = kTRUE;
2284     if ((TMath::Abs(1/pt->GetC())<100.) && (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.7))
2285       isok =kTRUE;
2286     if  (TMath::Abs(pt->GetZ()/pt->GetX())>1.1)
2287       isok =kTRUE;
2288     if ( (TMath::Abs(pt->GetSnp()>0.7) && pt->GetD(0,0)>60.))
2289       isok =kTRUE;
2290
2291     if (isok)
2292       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2293         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2294         if (index<0) continue;
2295         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2296         if (!c) continue;
2297         //if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();
2298         c->Use(10);
2299       }
2300   }
2301
2302
2303   //
2304   Double_t maxchi  = meanchi+2.*smeanchi;
2305
2306   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2307     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2308     if (!pt) {
2309       continue;
2310     }
2311     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2312     if (pt->fBSigned) continue;
2313     Double_t chi     = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2314     if (chi>maxchi) continue;
2315
2316     Float_t bfactor=1;
2317     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2318
2319     //sign only tracks with enoug big density at the beginning
2320
2321     if ((pt->GetDensityFirst(40)<0.75) && pt->GetNumberOfClusters()<meann) continue;
2322
2323
2324     Double_t mindens = TMath::Max(double(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor),0.65);
2325     Double_t minn    = TMath::Max(Int_t(meann-fnumber*smeann*bfactor),50);
2326
2327     //    if (pt->fBConstrain) mindens = TMath::Max(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor,0.65);
2328     if ( (pt->fRemoval==10) && (pt->GetSnp()>0.8)&&(dens>mindens))
2329       minn=0;
2330
2331     if ((dens>mindens && pt->GetNumberOfClusters()>minn) && chi<maxchi ){
2332       //Int_t noc=pt->GetNumberOfClusters();
2333       pt->fBSigned = kTRUE;
2334       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2335
2336         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2337         if (index<0) continue;
2338         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2339         if (!c) continue;
2340         //      if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();
2341         c->Use(10);
2342       }
2343     }
2344   }
2345   //  gLastCheck = nseed;
2346   //  arr->Compress();
2347   if (fDebug>0){
2348     timer.Print();
2349   }
2350 }
2351
2352
2353 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(TObjArray * arr, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1, Float_t th2) const
2354 {
2355   // stop not active tracks
2356   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2357   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows
2358   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2359   //
2360   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2361     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2362     if (!pt) {
2363       continue;
2364     }
2365     if (!(pt->IsActive())) continue;
2366     StopNotActive(pt,row0,th0, th1,th2);
2367   }
2368 }
2369
2370
2371
2372 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(AliTPCseed * seed, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1,
2373  Float_t th2) const
2374 {
2375   // stop not active tracks
2376   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2377   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows
2378   Int_t sumgood1  = 0;
2379   Int_t sumgood2  = 0;
2380   Int_t foundable = 0;
2381   Int_t maxindex = seed->fLastPoint;  //last foundable row
2382   if (seed->fNFoundable*th0 > seed->GetNumberOfClusters()) {
2383     seed->Desactivate(10) ;
2384     return;
2385   }
2386
2387   for (Int_t i=row0; i<maxindex; i++){
2388     Int_t index = seed->GetClusterIndex2(i);
2389     if (index!=-1) foundable++;
2390     //if (!c) continue;
2391     if (foundable<=30) sumgood1++;
2392     if (foundable<=50) {
2393       sumgood2++;
2394     }
2395     else{
2396       break;
2397     }
2398   }
2399   if (foundable>=30.){
2400      if (sumgood1<(th1*30.)) seed->Desactivate(10);
2401   }
2402   if (foundable>=50)
2403     if (sumgood2<(th2*50.)) seed->Desactivate(10);
2404 }
2405
2406
2407 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESD *event)
2408 {
2409   //
2410   // back propagation of ESD tracks
2411   //
2412   //return 0;
2413   fEvent = event;
2414   ReadSeeds(event,2);
2415   fIteration=2;
2416   //PrepareForProlongation(fSeeds,1);
2417   PropagateForward2(fSeeds);
2418   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2419   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2420     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2421     seed->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
2422     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2423     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2424     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2425     if (seed->GetNumberOfClusters()>20){
2426       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCrefit);
2427     }
2428     else{
2429       //printf("problem\n");
2430     }
2431   }
2432   fEvent =0;
2433   //WriteTracks();
2434   return 0;
2435 }
2436
2437
2438 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESD *event)
2439 {
2440   //
2441   // back propagation of ESD tracks
2442   //
2443
2444   fEvent = event;
2445   fIteration = 1;
2446   ReadSeeds(event,0);
2447   PropagateBack(fSeeds);
2448   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2449   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2450     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2451     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2452     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2453     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2454     esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCout);
2455   }
2456   fEvent =0;
2457   //WriteTracks();
2458   return 0;
2459 }
2460
2461
2462 void AliTPCtrackerMI::DeleteSeeds()
2463 {
2464   //
2465   //delete Seeds
2466   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2467   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2468     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*)fSeeds->At(i);
2469     if (seed) delete fSeeds->RemoveAt(i);
2470   }
2471   delete fSeeds;
2472   fSeeds =0;
2473 }
2474
2475 void AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(AliESD *event, Int_t direction)
2476 {
2477   //
2478   //read seeds from the event
2479
2480   Int_t nentr=event->GetNumberOfTracks();
2481   if (fDebug>0){
2482     Info("ReadSeeds", "Number of ESD tracks: %d\n", nentr);
2483   }
2484   if (fSeeds)
2485     DeleteSeeds();
2486   if (!fSeeds){
2487     fSeeds = new TObjArray;
2488   }
2489
2490   //  Int_t ntrk=0;
2491   for (Int_t i=0; i<nentr; i++) {
2492     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2493     ULong_t status=esd->GetStatus();
2494     AliTPCtrack t(*esd);
2495     AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t,t.GetAlpha());
2496     if ((status==AliESDtrack::kTPCin)&&(direction==1)) seed->ResetCovariance();
2497     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) == 0 ) seed->ResetCovariance();
2498
2499     //
2500     //
2501     // rotate to the local coordinate system
2502
2503     fSectors=fInnerSec; fN=fkNIS;
2504
2505     Double_t alpha=seed->GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
2506     if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
2507     if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
2508     Int_t ns=Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha())%fN;
2509     alpha =ns*fSectors->GetAlpha() + fSectors->GetAlphaShift();
2510     alpha-=seed->GetAlpha();
2511     if (!seed->Rotate(alpha)) continue;
2512     seed->fEsd = esd;
2513     //
2514     //seed->PropagateTo(fSectors->GetX(0));
2515     //
2516     //    Int_t index = esd->GetTPCindex();
2517     //AliTPCseed * seed2= (AliTPCseed*)fSeeds->At(index);
2518     //if (direction==2){
2519     //  AliTPCseed * seed2  = ReSeed(seed,0.,0.5,1.);
2520     //  if (seed2) {
2521     //  delete seed;
2522     //  seed = seed2;
2523     //  }
2524     //}
2525
2526     fSeeds->AddLast(seed);
2527   }
2528 }
2529
2530
2531
2532 //_____________________________________________________________________________
2533 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds3(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
2534                                  Float_t deltay, Int_t ddsec) {
2535   //-----------------------------------------------------------------
2536   // This function creates track seeds.
2537   // SEEDING WITH VERTEX CONSTRAIN
2538   //-----------------------------------------------------------------
2539   // cuts[0]   - fP4 cut
2540   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
2541   // cuts[2]   - zvertex cut
2542   // cuts[3]   - fP3 cut
2543   Int_t nin0  = 0;
2544   Int_t nin1  = 0;
2545   Int_t nin2  = 0;
2546   Int_t nin   = 0;
2547   Int_t nout1 = 0;
2548   Int_t nout2 = 0;
2549
2550   Double_t x[5], c[15];
2551   //  Int_t di = i1-i2;
2552   //
2553   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
2554   Double_t alpha=fSectors->GetAlpha(), shift=fSectors->GetAlphaShift();
2555   Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
2556   //
2557   //  Double_t x1 =fOuterSec->GetX(i1);
2558   //Double_t xx2=fOuterSec->GetX(i2);
2559
2560   Double_t x1 =GetXrow(i1);
2561   Double_t xx2=GetXrow(i2);
2562
2563   Double_t x3=GetX(), y3=GetY(), z3=GetZ();
2564
2565   Int_t imiddle = (i2+i1)/2;    //middle pad row index
2566   Double_t xm = GetXrow(imiddle); // radius of middle pad-row
2567   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,imiddle); //middle pad -row
2568   //
2569   Int_t ns =sec;
2570
2571   const AliTPCRow& kr1=GetRow(ns,i1);
2572   Double_t ymax  = GetMaxY(i1)-kr1.fDeadZone-1.5;
2573   Double_t ymaxm = GetMaxY(imiddle)-kr1.fDeadZone-1.5;
2574
2575   //
2576   // change cut on curvature if it can't reach this layer
2577   // maximal curvature set to reach it
2578   Double_t dvertexmax  = TMath::Sqrt((x1-x3)*(x1-x3)+(ymax+5-y3)*(ymax+5-y3));
2579   if (dvertexmax*0.5*cuts[0]>0.85){
2580     cuts[0] = 0.85/(dvertexmax*0.5+1.);
2581   }
2582   Double_t r2min = 1/(cuts[0]*cuts[0]);  //minimal square of radius given by cut
2583
2584   //  Int_t ddsec = 1;
2585   if (deltay>0) ddsec = 0;
2586   // loop over clusters
2587   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
2588     //
2589     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
2590     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();
2591     //if (TMath::Abs(y1)>ymax) continue;
2592
2593     if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
2594
2595     // find possible directions
2596     Float_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
2597     Float_t extraz = z1 - anglez*(x1-xx2);  // extrapolated z
2598     //
2599     //
2600     //find   rotation angles relative to line given by vertex and point 1
2601     Double_t dvertex2 = (x1-x3)*(x1-x3)+(y1-y3)*(y1-y3);
2602     Double_t dvertex  = TMath::Sqrt(dvertex2);
2603     Double_t angle13  = TMath::ATan((y1-y3)/(x1-x3));
2604     Double_t cs13     = cos(-angle13), sn13 = sin(-angle13);
2605
2606     //
2607     // loop over 2 sectors
2608     Int_t dsec1=-ddsec;
2609     Int_t dsec2= ddsec;
2610     if (y1<0)  dsec2= 0;
2611     if (y1>0)  dsec1= 0;
2612
2613     Double_t dddz1=0;  // direction of delta inclination in z axis
2614     Double_t dddz2=0;
2615     if ( (z1-z3)>0)
2616       dddz1 =1;
2617     else
2618       dddz2 =1;
2619     //
2620     for (Int_t dsec = dsec1; dsec<=dsec2;dsec++){
2621       Int_t sec2 = sec + dsec;
2622       //
2623       //      AliTPCRow&  kr2  = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][i2];
2624       //AliTPCRow&  kr2m = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][imiddle];
2625       AliTPCRow&  kr2  = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,i2);
2626       AliTPCRow&  kr2m = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,imiddle);
2627       Int_t  index1 = TMath::Max(kr2.Find(extraz-0.6-dddz1*TMath::Abs(z1)*0.05)-1,0);
2628       Int_t  index2 = TMath::Min(kr2.Find(extraz+0.6+dddz2*TMath::Abs(z1)*0.05)+1,kr2);
2629
2630       // rotation angles to p1-p3
2631       Double_t cs13r     = cos(-angle13+dsec*alpha)/dvertex, sn13r = sin(-angle13+dsec*alpha)/dvertex;
2632       Double_t x2,   y2,   z2;
2633       //
2634       //      Double_t dymax = maxangle*TMath::Abs(x1-xx2);
2635
2636       //
2637       Double_t dxx0 =  (xx2-x3)*cs13r;
2638       Double_t dyy0 =  (xx2-x3)*sn13r;
2639       for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
2640         const AliTPCclusterMI *kcl = kr2[js];
2641         if (kcl->IsUsed(10)) continue;
2642         //
2643         //calcutate parameters
2644         //
2645         Double_t yy0 =  dyy0 +(kcl->GetY()-y3)*cs13r;
2646         // stright track
2647         if (TMath::Abs(yy0)<0.000001) continue;
2648         Double_t xx0 =  dxx0 -(kcl->GetY()-y3)*sn13r;
2649         Double_t y0  =  0.5*(xx0*xx0+yy0*yy0-xx0)/yy0;
2650         Double_t r02 = (0.25+y0*y0)*dvertex2;
2651         //curvature (radius) cut
2652         if (r02<r2min) continue;
2653
2654         nin0++;
2655         //
2656         Double_t c0  = 1/TMath::Sqrt(r02);
2657         if (yy0>0) c0*=-1.;
2658
2659
2660         //Double_t dfi0   = 2.*TMath::ASin(dvertex*c0*0.5);
2661         //Double_t dfi1   = 2.*TMath::ASin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2662         Double_t dfi0   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(dvertex*c0*0.5);
2663         Double_t dfi1   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2664         //
2665         //
2666         Double_t z0  =  kcl->GetZ();
2667         Double_t zzzz2    = z1-(z1-z3)*dfi1/dfi0;
2668         if (TMath::Abs(zzzz2-z0)>0.5) continue;
2669         nin1++;
2670         //
2671         Double_t dip    = (z1-z0)*c0/dfi1;
2672         Double_t x0 = (0.5*cs13+y0*sn13)*dvertex*c0;
2673         //
2674         y2 = kcl->GetY();
2675         if (dsec==0){
2676           x2 = xx2;
2677           z2 = kcl->GetZ();
2678         }
2679         else
2680           {
2681             // rotation
2682             z2 = kcl->GetZ();
2683             x2= xx2*cs-y2*sn*dsec;
2684             y2=+xx2*sn*dsec+y2*cs;
2685           }
2686
2687         x[0] = y1;
2688         x[1] = z1;
2689         x[2] = x0;
2690         x[3] = dip;
2691         x[4] = c0;
2692         //
2693         //
2694         // do we have cluster at the middle ?
2695         Double_t ym,zm;
2696         GetProlongation(x1,xm,x,ym,zm);
2697         UInt_t dummy;
2698         AliTPCclusterMI * cm=0;
2699         if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2700           cm = krm.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2701           if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {
2702             continue;
2703           }
2704         }
2705         else{
2706           // rotate y1 to system 0
2707           // get state vector in rotated system
2708           Double_t yr1  = (-0.5*sn13+y0*cs13)*dvertex*c0;
2709           Double_t xr2  =  x0*cs+yr1*sn*dsec;
2710           Double_t xr[5]={kcl->GetY(),kcl->GetZ(), xr2, dip, c0};
2711           //
2712           GetProlongation(xx2,xm,xr,ym,zm);
2713           if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2714             cm = kr2m.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2715             if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {
2716               continue;
2717             }
2718           }
2719         }
2720
2721
2722         Double_t dym = 0;
2723         Double_t dzm = 0;
2724         if (cm){
2725           dym = ym - cm->GetY();
2726           dzm = zm - cm->GetZ();
2727         }
2728         nin2++;
2729
2730
2731         //
2732         //
2733         Double_t sy1=kr1[is]->GetSigmaY2()*2., sz1=kr1[is]->GetSigmaZ2()*2.;
2734         Double_t sy2=kcl->GetSigmaY2()*2.,     sz2=kcl->GetSigmaZ2()*2.;
2735         //Double_t sy3=400*3./12., sy=0.1, sz=0.1;
2736         Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
2737         //Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]*60+0.5, sy=0.1, sz=0.1;
2738
2739         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
2740         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
2741         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
2742         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
2743         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
2744         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
2745
2746         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
2747         Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
2748         Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
2749         Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
2750
2751         c[0]=sy1;
2752         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
2753         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
2754         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
2755                        c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
2756         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
2757         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
2758         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
2759
2760         //      if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
2761
2762         UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
2763         AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, ns*alpha+shift);
2764
2765         track->fIsSeeding = kTRUE;
2766         track->fSeed1 = i1;
2767         track->fSeed2 = i2;
2768         track->fSeedType=3;
2769
2770
2771         //if (dsec==0) {
2772           FollowProlongation(*track, (i1+i2)/2,1);
2773           Int_t foundable,found,shared;
2774           track->GetClusterStatistic((i1+i2)/2,i1, found, foundable, shared, kTRUE);
2775           if ((found<0.55*foundable)  || shared>0.5*found || (track->GetSigmaY2()+track->GetSigmaZ2())>0.5){
2776             seed->Reset();
2777             seed->~AliTPCseed();
2778             continue;
2779           }
2780           //}
2781
2782         nin++;
2783         FollowProlongation(*track, i2,1);
2784
2785
2786         //Int_t rc = 1;
2787         track->fBConstrain =1;
2788         //      track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
2789         track->fLastPoint = i1;  // first cluster in track position
2790         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
2791
2792         if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
2793             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 ||
2794             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters() ) {
2795           seed->Reset();
2796           seed->~AliTPCseed();
2797           continue;
2798         }
2799         nout1++;
2800         // Z VERTEX CONDITION
2801         Double_t zv;
2802         zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
2803           ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
2804         if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]) {
2805           FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-20,0));
2806           zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
2807             ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
2808           if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]){
2809             FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-40,0));
2810             zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
2811               ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
2812             if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2] &&(track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.7)){
2813               // make seed without constrain
2814               AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,1.);
2815               FollowProlongation(*track2, i2,1);
2816               track2->fBConstrain = kFALSE;
2817               track2->fSeedType = 1;
2818               arr->AddLast(track2);
2819               seed->Reset();
2820               seed->~AliTPCseed();
2821               continue;
2822             }
2823             else{
2824               seed->Reset();
2825               seed->~AliTPCseed();
2826               continue;
2827
2828             }
2829           }
2830         }
2831
2832         track->fSeedType =0;
2833         arr->AddLast(track);
2834         seed = new AliTPCseed;
2835         nout2++;
2836         // don't consider other combinations
2837         if (track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.8)
2838           break;
2839       }
2840     }
2841   }
2842   if (fDebug>3){
2843     Info("MakeSeeds3","\nSeeding statistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2);
2844   }
2845   delete seed;
2846 }
2847
2848
2849 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
2850                                  Float_t deltay) {
2851
2852
2853
2854   //-----------------------------------------------------------------
2855   // This function creates track seeds.
2856   //-----------------------------------------------------------------
2857   // cuts[0]   - fP4 cut
2858   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
2859   // cuts[2]   - zvertex cut
2860   // cuts[3]   - fP3 cut
2861
2862
2863   Int_t nin0  = 0;
2864   Int_t nin1  = 0;
2865   Int_t nin2  = 0;
2866   Int_t nin   = 0;
2867   Int_t nout1 = 0;
2868   Int_t nout2 = 0;
2869   Int_t nout3 =0;
2870   Double_t x[5], c[15];
2871   //
2872   // make temporary seed
2873   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
2874   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
2875   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
2876   //
2877   //
2878
2879   // first 3 padrows
2880   Double_t x1 = GetXrow(i1-1);
2881   const    AliTPCRow& kr1=GetRow(sec,i1-1);
2882   Double_t y1max  = GetMaxY(i1-1)-kr1.fDeadZone-1.5;
2883   //
2884   Double_t x1p = GetXrow(i1);
2885   const    AliTPCRow& kr1p=GetRow(sec,i1);
2886   //
2887   Double_t x1m = GetXrow(i1-2);
2888   const    AliTPCRow& kr1m=GetRow(sec,i1-2);
2889
2890   //
2891   //last 3 padrow for seeding
2892   AliTPCRow&  kr3  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-7);
2893   Double_t    x3   =  GetXrow(i1-7);
2894   //  Double_t    y3max= GetMaxY(i1-7)-kr3.fDeadZone-1.5;
2895   //
2896   AliTPCRow&  kr3p  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-6);
2897   Double_t    x3p   = GetXrow(i1-6);
2898   //
2899   AliTPCRow&  kr3m  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-8);
2900   Double_t    x3m   = GetXrow(i1-8);
2901
2902   //
2903   //
2904   // middle padrow
2905   Int_t im = i1-4;                           //middle pad row index
2906   Double_t xm         = GetXrow(im);         // radius of middle pad-row
2907   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,im);   //middle pad -row
2908   //  Double_t ymmax = GetMaxY(im)-kr1.fDeadZone-1.5;
2909   //
2910   //
2911   Double_t deltax  = x1-x3;
2912   Double_t dymax   = deltax*cuts[1];
2913   Double_t dzmax   = deltax*cuts[3];
2914   //
2915   // loop over clusters
2916   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
2917     //
2918     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
2919     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();
2920     //
2921     if (deltay>0 && TMath::Abs(y1max-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
2922     //
2923     Int_t  index1 = TMath::Max(kr3.Find(z1-dzmax)-1,0);
2924     Int_t  index2 = TMath::Min(kr3.Find(z1+dzmax)+1,kr3);
2925     //
2926     Double_t y3,   z3;
2927     //
2928     //
2929     UInt_t index;
2930     for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
2931       const AliTPCclusterMI *kcl = kr3[js];
2932       if (kcl->IsUsed(10)) continue;
2933       y3 = kcl->GetY();
2934       // apply angular cuts
2935       if (TMath::Abs(y1-y3)>dymax) continue;
2936       x3 = x3;
2937       z3 = kcl->GetZ();
2938       if (TMath::Abs(z1-z3)>dzmax) continue;
2939       //
2940       Double_t angley = (y1-y3)/(x1-x3);
2941       Double_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
2942       //
2943       Double_t erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
2944       Double_t errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
2945       //
2946       Double_t yyym = angley*(xm-x1)+y1;
2947       Double_t zzzm = anglez*(xm-x1)+z1;
2948
2949       const AliTPCclusterMI *kcm = krm.FindNearest2(yyym,zzzm,erry,errz,index);
2950       if (!kcm) continue;
2951       if (kcm->IsUsed(10)) continue;
2952
2953       erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
2954       errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
2955       //
2956       //
2957       //
2958       Int_t used  =0;
2959       Int_t found =0;
2960       //
2961       // look around first
2962       const AliTPCclusterMI *kc1m = kr1m.FindNearest2(angley*(x1m-x1)+y1,
2963                                                       anglez*(x1m-x1)+z1,
2964                                                       erry,errz,index);
2965       //
2966       if (kc1m){
2967         found++;
2968         if (kc1m->IsUsed(10)) used++;
2969       }
2970       const AliTPCclusterMI *kc1p = kr1p.FindNearest2(angley*(x1p-x1)+y1,
2971                                                       anglez*(x1p-x1)+z1,
2972                                                       erry,errz,index);
2973       //
2974       if (kc1p){
2975         found++;
2976         if (kc1p->IsUsed(10)) used++;
2977       }
2978       if (used>1)  continue;
2979       if (found<1) continue;
2980
2981       //
2982       // look around last
2983       const AliTPCclusterMI *kc3m = kr3m.FindNearest2(angley*(x3m-x3)+y3,
2984                                                       anglez*(x3m-x3)+z3,
2985                                                       erry,errz,index);
2986       //
2987       if (kc3m){
2988         found++;
2989         if (kc3m->IsUsed(10)) used++;
2990       }
2991       else
2992         continue;
2993       const AliTPCclusterMI *kc3p = kr3p.FindNearest2(angley*(x3p-x3)+y3,
2994                                                       anglez*(x3p-x3)+z3,
2995                                                       erry,errz,index);
2996       //
2997       if (kc3p){
2998         found++;
2999         if (kc3p->IsUsed(10)) used++;
3000       }
3001       else
3002         continue;
3003       if (used>1)  continue;
3004       if (found<3) continue;
3005       //
3006       Double_t x2,y2,z2;
3007       x2 = xm;
3008       y2 = kcm->GetY();
3009       z2 = kcm->GetZ();
3010       //
3011
3012       x[0]=y1;
3013       x[1]=z1;
3014       x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3015       //if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;
3016       nin0++;
3017       //
3018       x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3019       nin1++;
3020       //
3021       x[3]=F3n(x1,y1,x2,y2,z1,z2,x[4]);
3022       //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3023       nin2++;
3024       //
3025       //
3026       Double_t sy1=0.1,  sz1=0.1;
3027       Double_t sy2=0.1,  sz2=0.1;
3028       Double_t sy3=0.1,  sy=0.1, sz=0.1;
3029
3030       Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3031       Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3032       Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3033       Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3034       Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3035       Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3036
3037       Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
3038       Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
3039       Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
3040       Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
3041
3042       c[0]=sy1;
3043       c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3044       c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3045       c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3046       c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3047       c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3048       c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3049       c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3050
3051       //        if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
3052
3053       UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
3054       AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3055
3056       track->fIsSeeding = kTRUE;
3057
3058       nin++;
3059       FollowProlongation(*track, i1-7,1);
3060       if (track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.75 ||
3061           track->fNShared>0.6*track->GetNumberOfClusters() || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.6){
3062         seed->Reset();
3063         seed->~AliTPCseed();
3064         continue;
3065       }
3066       nout1++;
3067       nout2++;
3068       //Int_t rc = 1;
3069       FollowProlongation(*track, i2,1);
3070       track->fBConstrain =0;
3071       track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3072       track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3073
3074       if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
3075           track->GetNumberOfClusters()<track->fNFoundable*0.7 ||
3076           track->fNShared>2. || track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()>6 || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.5 ) {
3077         seed->Reset();
3078         seed->~AliTPCseed();
3079         continue;
3080       }
3081
3082       {
3083         FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-10,0),1);
3084         AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,0.9);
3085         FollowProlongation(*track2, i2,1);
3086         track2->fBConstrain = kFALSE;
3087         track2->fSeedType = 4;
3088         arr->AddLast(track2);
3089         seed->Reset();
3090         seed->~AliTPCseed();
3091       }
3092
3093
3094       //arr->AddLast(track);
3095       //seed = new AliTPCseed;
3096       nout3++;
3097     }
3098   }
3099
3100   if (fDebug>3){
3101     Info("MakeSeeds5","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2,nout3);
3102   }
3103   delete seed;
3104 }
3105
3106
3107 //_____________________________________________________________________________
3108 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds2(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2, Float_t */*cuts[4]*/,
3109                                  Float_t deltay, Bool_t /*bconstrain*/) {
3110   //-----------------------------------------------------------------
3111   // This function creates track seeds - without vertex constraint
3112   //-----------------------------------------------------------------
3113   // cuts[0]   - fP4 cut        - not applied
3114   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3115   // cuts[2]   - zvertex cut    - not applied
3116   // cuts[3]   - fP3 cut
3117   Int_t nin0=0;
3118   Int_t nin1=0;
3119   Int_t nin2=0;
3120   Int_t nin3=0;
3121   //  Int_t nin4=0;
3122   //Int_t nin5=0;
3123
3124
3125
3126   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3127   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3128   Int_t row0 = (i1+i2)/2;
3129   Int_t drow = (i1-i2)/2;
3130   const AliTPCRow& kr0=fSectors[sec][row0];
3131   AliTPCRow * kr=0;
3132
3133   AliTPCpolyTrack polytrack;
3134   Int_t nclusters=fSectors[sec][row0];
3135   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3136
3137   Int_t sumused=0;
3138   Int_t cused=0;
3139   Int_t cnused=0;
3140   for (Int_t is=0; is < nclusters; is++) {  //LOOP over clusters
3141     Int_t nfound =0;
3142     Int_t nfoundable =0;
3143     for (Int_t iter =1; iter<2; iter++){   //iterations
3144       const AliTPCRow& krm=fSectors[sec][row0-iter];
3145       const AliTPCRow& krp=fSectors[sec][row0+iter];
3146       const AliTPCclusterMI * cl= kr0[is];
3147
3148       if (cl->IsUsed(10)) {
3149         cused++;
3150       }
3151       else{
3152         cnused++;
3153       }
3154       Double_t x = kr0.GetX();
3155       // Initialization of the polytrack
3156       nfound =0;
3157       nfoundable =0;
3158       polytrack.Reset();
3159       //
3160       Double_t y0= cl->GetY();
3161       Double_t z0= cl->GetZ();
3162       Float_t erry = 0;
3163       Float_t errz = 0;
3164
3165       Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row0)-kr0.fDeadZone-1.5;
3166       if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3167
3168       erry = (0.5)*cl->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;
3169       errz = (0.5)*cl->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;
3170       polytrack.AddPoint(x,y0,z0,erry, errz);
3171
3172       sumused=0;
3173       if (cl->IsUsed(10)) sumused++;
3174
3175
3176       Float_t roady = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+0.2)+1.)*iter;
3177       Float_t roadz = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaZ2()+0.2)+1.)*iter;
3178       //
3179       x = krm.GetX();
3180       AliTPCclusterMI * cl1 = krm.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3181       if (cl1 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))) {
3182         erry = (0.5)*cl1->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3183         errz = (0.5)*cl1->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3184         if (cl1->IsUsed(10))  sumused++;
3185         polytrack.AddPoint(x,cl1->GetY(),cl1->GetZ(),erry,errz);
3186       }
3187       //
3188       x = krp.GetX();
3189       AliTPCclusterMI * cl2 = krp.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3190       if (cl2) {
3191         erry = (0.5)*cl2->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3192         errz = (0.5)*cl2->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3193         if (cl2->IsUsed(10)) sumused++;
3194         polytrack.AddPoint(x,cl2->GetY(),cl2->GetZ(),erry,errz);
3195       }
3196       //
3197       if (sumused>0) continue;
3198       nin0++;
3199       polytrack.UpdateParameters();
3200       // follow polytrack
3201       roadz = 1.2;
3202       roady = 1.2;
3203       //
3204       Double_t yn,zn;
3205       nfoundable = polytrack.GetN();
3206       nfound     = nfoundable;
3207       //
3208       for (Int_t ddrow = iter+1; ddrow<drow;ddrow++){
3209         Float_t maxdist = 0.8*(1.+3./(ddrow));
3210         for (Int_t delta = -1;delta<=1;delta+=2){
3211           Int_t row = row0+ddrow*delta;
3212           kr = &(fSectors[sec][row]);
3213           Double_t xn = kr->GetX();
3214           Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row)-kr->fDeadZone-1.5;
3215           polytrack.GetFitPoint(xn,yn,zn);
3216           if (TMath::Abs(yn)>ymax) continue;
3217           nfoundable++;
3218           AliTPCclusterMI * cln = kr->FindNearest(yn,zn,roady,roadz);
3219           if (cln) {
3220             Float_t dist =  TMath::Sqrt(  (yn-cln->GetY())*(yn-cln->GetY())+(zn-cln->GetZ())*(zn-cln->GetZ()));
3221             if (dist<maxdist){
3222               /*
3223               erry = (dist+0.3)*cln->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3224               errz = (dist+0.3)*cln->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3225               if (cln->IsUsed(10)) {
3226                 //      printf("used\n");
3227                 sumused++;
3228                 erry*=2;
3229                 errz*=2;
3230               }
3231               */
3232               erry=0.1;
3233               errz=0.1;
3234               polytrack.AddPoint(xn,cln->GetY(),cln->GetZ(),erry, errz);
3235               nfound++;
3236             }
3237           }
3238         }
3239         if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound) || (nfound<0.6*nfoundable))  break;
3240         polytrack.UpdateParameters();
3241       }
3242     }
3243     if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound))  {
3244       //printf("sumused   %d\n",sumused);
3245       continue;
3246     }
3247     nin1++;
3248     Double_t dy,dz;
3249     polytrack.GetFitDerivation(kr0.GetX(),dy,dz);
3250     AliTPCpolyTrack track2;
3251
3252     polytrack.Refit(track2,0.5+TMath::Abs(dy)*0.3,0.4+TMath::Abs(dz)*0.3);
3253     if (track2.GetN()<0.5*nfoundable) continue;
3254     nin2++;
3255
3256     if ((nfound>0.6*nfoundable) &&( nfoundable>0.4*(i1-i2))) {
3257       //
3258       // test seed with and without constrain
3259       for (Int_t constrain=0; constrain<=0;constrain++){
3260         // add polytrack candidate
3261
3262         Double_t x[5], c[15];
3263         Double_t x1,x2,x3,y1,y2,y3,z1,z2,z3;
3264         track2.GetBoundaries(x3,x1);
3265         x2 = (x1+x3)/2.;
3266         track2.GetFitPoint(x1,y1,z1);
3267         track2.GetFitPoint(x2,y2,z2);
3268         track2.GetFitPoint(x3,y3,z3);
3269         //
3270         //is track pointing to the vertex ?
3271         Double_t x0,y0,z0;
3272         x0=0;
3273         polytrack.GetFitPoint(x0,y0,z0);
3274
3275         if (constrain) {
3276           x2 = x3;
3277           y2 = y3;
3278           z2 = z3;
3279
3280           x3 = 0;
3281           y3 = 0;
3282           z3 = 0;
3283         }
3284         x[0]=y1;
3285         x[1]=z1;
3286         x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3287
3288         //      if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;  //
3289         x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3290
3291         //if (TMath::Abs(x[4]*x1-x[2]) >= cuts[1]) continue;
3292         //x[3]=F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
3293         x[3]=F3n(x1,y1,x3,y3,z1,z3,x[4]);
3294         //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3295
3296
3297         Double_t sy =0.1, sz =0.1;
3298         Double_t sy1=0.02, sz1=0.02;
3299         Double_t sy2=0.02, sz2=0.02;
3300         Double_t sy3=0.02;
3301
3302         if (constrain){
3303           sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
3304         }
3305
3306         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3307         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3308         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3309         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3310         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3311         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3312
3313         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x3,y3,z1,z3)-x[3])/sy;
3314         Double_t f31=(F3(x1,y1,x3,y3,z1+sz,z3)-x[3])/sz;
3315         Double_t f32=(F3(x1,y1,x3,y3+sy,z1,z3)-x[3])/sy;
3316         Double_t f34=(F3(x1,y1,x3,y3,z1,z3+sz)-x[3])/sz;
3317
3318
3319         c[0]=sy1;
3320         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3321         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3322         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3323         c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3324         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3325         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3326         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3327
3328         //Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x1);
3329         Int_t row1 = GetRowNumber(x1);
3330
3331         UInt_t index=0;
3332         //kr0.GetIndex(is);
3333         AliTPCseed *track=new (seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3334         track->fIsSeeding = kTRUE;
3335         Int_t rc=FollowProlongation(*track, i2);
3336         if (constrain) track->fBConstrain =1;
3337         else
3338           track->fBConstrain =0;
3339         track->fLastPoint = row1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3340         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3341
3342         if (rc==0 || track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
3343             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 ||
3344             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters()) {
3345           //delete track;
3346           seed->Reset();
3347           seed->~AliTPCseed();
3348         }
3349         else {
3350           arr->AddLast(track);
3351           seed = new AliTPCseed;
3352         }
3353         nin3++;
3354       }
3355     }  // if accepted seed
3356   }
3357   if (fDebug>3){
3358     Info("MakeSeeds2","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin3);
3359   }
3360   delete seed;
3361 }
3362
3363
3364 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::MakeSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3365 {
3366   //
3367   //
3368   //reseed using track points
3369   Int_t p0 = int(r0*track->GetNumberOfClusters());     // point 0
3370   Int_t p1 = int(r1*track->GetNumberOfClusters());
3371   Int_t p2 = int(r2*track->GetNumberOfClusters());   // last point
3372   Int_t pp2=0;
3373   Double_t  x0[3],x1[3],x2[3];
3374   x0[0]=-1;
3375   x0[0]=-1;
3376   x0[0]=-1;
3377
3378   // find track position at given ratio of the length
3379   Int_t  sec0, sec1, sec2;
3380   sec0=0;
3381   sec1=0;
3382   sec2=0;
3383   Int_t index=-1;
3384   Int_t clindex;
3385   for (Int_t i=0;i<160;i++){
3386     if (track->fClusterPointer[i]){
3387       index++;
3388       AliTPCTrackerPoint   *trpoint =track->GetTrackPoint(i);
3389       if ( (index<p0) || x0[0]<0 ){
3390         if (trpoint->GetX()>1){
3391           clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3392           if (clindex>0){
3393             x0[0] = trpoint->GetX();
3394             x0[1] = trpoint->GetY();
3395             x0[2] = trpoint->GetZ();
3396             sec0  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3397           }
3398         }
3399       }
3400
3401       if ( (index<p1) &&(trpoint->GetX()>1)){
3402         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3403         if (clindex>0){
3404           x1[0] = trpoint->GetX();
3405           x1[1] = trpoint->GetY();
3406           x1[2] = trpoint->GetZ();
3407           sec1  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3408         }
3409       }
3410       if ( (index<p2) &&(trpoint->GetX()>1)){
3411         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3412         if (clindex>0){
3413           x2[0] = trpoint->GetX();
3414           x2[1] = trpoint->GetY();
3415           x2[2] = trpoint->GetZ();
3416           sec2  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3417           pp2 = i;
3418         }
3419       }
3420     }
3421   }
3422
3423   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3424   //
3425   alpha = (sec1-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3426   cs = TMath::Cos(alpha);
3427   sn = TMath::Sin(alpha);
3428   xx2= x1[0]*cs-x1[1]*sn;
3429   yy2= x1[0]*sn+x1[1]*cs;
3430   x1[0] = xx2;
3431   x1[1] = yy2;
3432   //
3433   alpha = (sec0-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3434   cs = TMath::Cos(alpha);
3435   sn = TMath::Sin(alpha);
3436   xx2= x0[0]*cs-x0[1]*sn;
3437   yy2= x0[0]*sn+x0[1]*cs;
3438   x0[0] = xx2;
3439   x0[1] = yy2;
3440   //
3441   //
3442   //
3443   Double_t x[5],c[15];
3444   //
3445   x[0]=x2[1];
3446   x[1]=x2[2];
3447   x[4]=F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3448   //  if (x[4]>1) return 0;
3449   x[2]=F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3450   x[3]=F3n(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2],x[4]);
3451   //if (TMath::Abs(x[3]) > 2.2)  return 0;
3452   //if (TMath::Abs(x[2]) > 1.99) return 0;
3453   //
3454   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3455   //
3456   Double_t sy1=0.02+track->GetSigmaY2(), sz1=0.02+track->GetSigmaZ2();
3457   Double_t sy2=0.01+track->GetSigmaY2(), sz2=0.01+track->GetSigmaZ2();
3458   Double_t sy3=0.01+track->GetSigmaY2();
3459   //
3460   Double_t f40=(F1(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3461   Double_t f42=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3462   Double_t f43=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[4])/sy;
3463   Double_t f20=(F2(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3464   Double_t f22=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3465   Double_t f23=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[2])/sy;
3466   //
3467   Double_t f30=(F3(x2[0],x2[1]+sy,x0[0],x0[1],x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3468   Double_t f31=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2]+sz,x0[2])-x[3])/sz;
3469   Double_t f32=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1]+sy,x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3470   Double_t f34=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2]+sz)-x[3])/sz;
3471
3472
3473   c[0]=sy1;
3474   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3475   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3476   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3477   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3478   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3479   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3480   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3481
3482   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x2[0]);
3483   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, x2[0], sec2*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3484   //  Double_t y0,z0,y1,z1, y2,z2;
3485   //seed->GetProlongation(x0[0],y0,z0);
3486   // seed->GetProlongation(x1[0],y1,z1);
3487   //seed->GetProlongation(x2[0],y2,z2);
3488   //  seed =0;
3489   seed->fLastPoint  = pp2;
3490   seed->fFirstPoint = pp2;
3491
3492
3493   return seed;
3494 }
3495
3496
3497 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3498 {
3499   //
3500   //
3501   //reseed using founded clusters
3502   //
3503   // Find the number of clusters
3504   Int_t nclusters = 0;
3505   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
3506     if (track->GetClusterIndex(irow)>0) nclusters++;
3507   }
3508   //
3509   Int_t ipos[3];
3510   ipos[0] = TMath::Max(int(r0*nclusters),0);             // point 0 cluster
3511   ipos[1] = TMath::Min(int(r1*nclusters),nclusters-1);   //
3512   ipos[2] = TMath::Min(int(r2*nclusters),nclusters-1);   // last point
3513   //
3514   //
3515   Double_t  xyz[3][3];
3516   Int_t     row[3],sec[3]={0,0,0};
3517   //
3518   // find track row position at given ratio of the length
3519   Int_t index=-1;
3520   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
3521     if (track->GetClusterIndex2(irow)<0) continue;
3522     index++;
3523     for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3524       if (index<=ipos[ipoint]) row[ipoint] = irow;
3525     }
3526   }
3527   //
3528   //Get cluster and sector position
3529   for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3530     Int_t clindex = track->GetClusterIndex2(row[ipoint]);
3531     AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3532     if (cl==0) {
3533       //Error("Bug\n");
3534       //      AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3535       return 0;
3536     }
3537     sec[ipoint]     = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3538     xyz[ipoint][0]  = GetXrow(row[ipoint]);
3539     xyz[ipoint][1]  = cl->GetY();
3540     xyz[ipoint][2]  = cl->GetZ();
3541   }
3542   //
3543   //
3544   // Calculate seed state vector and covariance matrix
3545
3546   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3547   //
3548   alpha = (sec[1]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3549   cs = TMath::Cos(alpha);
3550   sn = TMath::Sin(alpha);
3551   xx2= xyz[1][0]*cs-xyz[1][1]*sn;
3552   yy2= xyz[1][0]*sn+xyz[1][1]*cs;
3553   xyz[1][0] = xx2;
3554   xyz[1][1] = yy2;
3555   //
3556   alpha = (sec[0]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3557   cs = TMath::Cos(alpha);
3558   sn = TMath::Sin(alpha);
3559   xx2= xyz[0][0]*cs-xyz[0][1]*sn;
3560   yy2= xyz[0][0]*sn+xyz[0][1]*cs;
3561   xyz[0][0] = xx2;
3562   xyz[0][1] = yy2;
3563   //
3564   //
3565   //
3566   Double_t x[5],c[15];
3567   //
3568   x[0]=xyz[2][1];
3569   x[1]=xyz[2][2];
3570   x[4]=F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3571   x[2]=F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3572   x[3]=F3n(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2],x[4]);
3573   //
3574   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3575   //
3576   Double_t sy1=0.2, sz1=0.2;
3577   Double_t sy2=0.2, sz2=0.2;
3578   Double_t sy3=0.2;
3579   //
3580   Double_t f40=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3581   Double_t f42=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3582   Double_t f43=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[4])/sy;
3583   Double_t f20=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3584   Double_t f22=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3585   Double_t f23=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[2])/sy;
3586   //
3587   Double_t f30=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3588   Double_t f31=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2]+sz,xyz[0][2])-x[3])/sz;
3589   Double_t f32=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy,xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3590   Double_t f34=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2]+sz)-x[3])/sz;
3591
3592
3593   c[0]=sy1;
3594   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3595   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3596   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3597   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3598   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3599   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3600   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3601
3602   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(xyz[2][0]);
3603   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, xyz[2][0], sec[2]*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3604   seed->fLastPoint  = row[2];
3605   seed->fFirstPoint = row[2];
3606   return seed;
3607 }
3608
3609 Int_t  AliTPCtrackerMI::CheckKinkPoint(AliTPCseed*seed, Float_t th)
3610 {
3611   //
3612   //
3613   //
3614   for (Int_t i=0;i<12;i++) seed->fKinkPoint[i]=0;
3615   //
3616   if (TMath::Abs(seed->GetC())>0.01) return 0;
3617   //
3618
3619   Float_t x[160], y[160], erry[160], z[160], errz[160];
3620   Int_t sec[160];
3621   Float_t xt[160], yt[160], zt[160];
3622   Int_t i1 = 200;
3623   Int_t i2 = 0;
3624   Int_t secm   = -1;
3625   Int_t padm   = -1;
3626   Int_t middle = seed->GetNumberOfClusters()/2;
3627   //
3628   //
3629   // find central sector, get local cooordinates
3630   Int_t count = 0;
3631   for (Int_t i=seed->fFirstPoint;i<=seed->fLastPoint;i++) {
3632     sec[i]= seed->GetClusterSector(i)%18;
3633     x[i]  = GetXrow(i);
3634     if (sec[i]>=0) {
3635       AliTPCclusterMI * cl = seed->fClusterPointer[i];
3636       //      if (cl==0)        cl = GetClusterMI(seed->GetClusterIndex2(i));
3637       if (cl==0) {
3638         sec[i] = -1;
3639         continue;
3640       }
3641       //
3642       //
3643       if (i>i2)  i2 = i;  //last  point with cluster
3644       if (i2<i1) i1 = i;  //first point with cluster
3645       y[i] = cl->GetY();
3646       z[i] = cl->GetZ();
3647       AliTPCTrackerPoint * point = seed->GetTrackPoint(i);
3648       xt[i] = x[i];
3649       yt[i] = point->GetY();
3650       zt[i] = point->GetZ();
3651
3652       if (point->GetX()>0){
3653         erry[i] = point->GetErrY();
3654         errz[i] = point->GetErrZ();
3655       }
3656
3657       count++;
3658       if (count<middle) {
3659         secm = sec[i];  //central sector
3660         padm = i;       //middle point with cluster
3661       }
3662     }
3663   }
3664   //
3665   // rotate position to global coordinate system connected to  sector at last the point
3666   //
3667   for (Int_t i=i1;i<=i2;i++){
3668     //
3669     if (sec[i]<0) continue;
3670     Double_t alpha = (sec[i2]-sec[i])*fSectors->GetAlpha();
3671     Double_t cs = TMath::Cos(alpha);
3672     Double_t sn = TMath::Sin(alpha);
3673     Float_t xx2= x[i]*cs+y[i]*sn;
3674     Float_t yy2= -x[i]*sn+y[i]*cs;
3675     x[i] = xx2;
3676     y[i] = yy2;
3677     //
3678     xx2= xt[i]*cs+yt[i]*sn;
3679     yy2= -xt[i]*sn+yt[i]*cs;
3680     xt[i] = xx2;
3681     yt[i] = yy2;
3682
3683   }
3684   //get "state" vector
3685   Double_t xh[5],xm = x[padm];
3686   xh[0]=yt[i2];
3687   xh[1]=zt[i2];
3688   xh[4]=F1(xt[i2],yt[i2],xt[padm],yt[padm],xt[i1],yt[i1]);
3689   xh[2]=F2(xt[i2],yt[i2],xt[padm],yt[padm],xt[i1],yt[i1]);
3690   xh[3]=F3n(xt[i2],yt[i2],xt[i1],yt[i1],zt[i2],zt[i1],xh[4]);
3691   //
3692   //
3693   for (Int_t i=i1;i<=i2;i++){
3694     Double_t yy,zz;
3695     if (sec[i]<0) continue;
3696     GetProlongation(x[i2], x[i],xh,yy,zz);
3697     if (TMath::Abs(y[i]-yy)>4||TMath::Abs(z[i]-zz)>4){
3698       //Double_t xxh[5];
3699       //xxh[4]=F1old(x[i2],y[i2],x[padm],y[padm],x[i1],y[i1]);
3700       //xxh[2]=F2old(x[i2],y[i2],x[padm],y[padm],x[i1],y[i1]);
3701       Error("AliTPCtrackerMI::CheckKinkPoint","problem\n");
3702     }
3703     y[i] = y[i] - yy;
3704     z[i] = z[i] - zz;
3705   }
3706   Float_t dyup[160],dydown[160], dzup[160], dzdown[160];
3707   Float_t yup[160], ydown[160],  zup[160],  zdown[160];
3708
3709   AliTPCpolyTrack ptrack1,ptrack2;
3710   //
3711   // derivation up
3712   for (Int_t i=i1;i<=i2;i++){
3713     AliTPCclusterMI * cl = seed->fClusterPointer[i];
3714     if (!cl) continue;
3715     if (cl->GetType()<0) continue;
3716     if (cl->GetType()>10) continue;
3717
3718     if (sec[i]>=0){
3719       ptrack1.AddPoint(x[i]-xm,y[i],z[i],0.1,0.1);
3720     }
3721     if (ptrack1.GetN()>4.){
3722       ptrack1.UpdateParameters();
3723       Double_t ddy,ddz;
3724       ptrack1.GetFitDerivation(x[i]-xm,ddy,ddz);
3725       Double_t yy,zz;
3726       ptrack1.GetFitPoint(x[i]-xm,yy,zz);
3727
3728       dyup[i] = ddy;
3729       dzup[i] = ddz;
3730       yup[i]  = yy;
3731       zup[i]  = zz;
3732
3733     }
3734     else{
3735       dyup[i]=0.;  //not enough points
3736     }
3737   }
3738   //
3739   // derivation down
3740   for (Int_t i=i2;i>=i1;i--){
3741     AliTPCclusterMI * cl = seed->fClusterPointer[i];
3742     if (!cl) continue;
3743     if (cl->GetType()<0) continue;
3744     if (cl->GetType()>10) continue;
3745     if (sec[i]>=0){
3746       ptrack2.AddPoint(x[i]-xm,y[i],z[i],0.1,0.1);
3747     }
3748     if (ptrack2.GetN()>4){
3749       ptrack2.UpdateParameters();
3750       Double_t ddy,ddz;
3751       ptrack2.GetFitDerivation(x[i]-xm,ddy,ddz);
3752       Double_t yy,zz;
3753       ptrack2.GetFitPoint(x[i]-xm,yy,zz);
3754
3755       dydown[i] = ddy;
3756       dzdown[i] = ddz;
3757       ydown[i]  = yy;
3758       zdown[i]  = zz;
3759     }
3760     else{
3761       dydown[i]=0.;  //not enough points
3762     }
3763   }
3764   //
3765   //
3766   // find maximal difference of the derivation
3767   for (Int_t i=0;i<12;i++) seed->fKinkPoint[i]=0;
3768
3769
3770   for (Int_t i=i1+10;i<i2-10;i++){
3771     if ( (TMath::Abs(dydown[i])<0.00000001)  ||  (TMath::Abs(dyup[i])<0.00000001) ||i<30)continue;
3772     //    printf("%f\t%f\t%f\t%f\t%f\n",x[i],dydown[i],dyup[i],dzdown[i],dzup[i]);
3773     //
3774     Float_t ddy = TMath::Abs(dydown[i]-dyup[i]);
3775     Float_t ddz = TMath::Abs(dzdown[i]-dzup[i]);
3776     if ( (ddy+ddz)> th){
3777       seed->fKinkPoint[0] = i;
3778       seed->fKinkPoint[1] = ddy;
3779       seed->fKinkPoint[2] = ddz;
3780       th = ddy+ddz;
3781     }
3782   }
3783
3784   if (fTreeDebug){
3785     //
3786     //write information to the debug tree
3787     TBranch * br = fTreeDebug->GetBranch("debug");
3788     TClonesArray * arr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint2");
3789     arr->ExpandCreateFast(i2-i1);
3790     br->SetAddress(&arr);
3791     //
3792     AliTPCclusterMI cldummy;
3793     cldummy.SetQ(0);
3794     AliTPCTrackPoint2 pdummy;
3795     pdummy.GetTPoint().fIsShared = 10;
3796     //
3797     Double_t alpha = sec[i2]*fSectors->GetAlpha();
3798     Double_t cs    = TMath::Cos(alpha);
3799     Double_t sn    = TMath::Sin(alpha);
3800
3801     for (Int_t i=i1;i<i2;i++){
3802       AliTPCTrackPoint2 *trpoint = (AliTPCTrackPoint2*)arr->UncheckedAt(i-i1);
3803       //cluster info
3804       AliTPCclusterMI * cl0 = seed->fClusterPointer[i];
3805       //
3806       AliTPCTrackerPoint * point = seed->GetTrackPoint(i);
3807
3808       if (cl0){
3809         Double_t x = GetXrow(i);
3810         trpoint->GetTPoint() = *point;
3811         trpoint->GetCPoint() = *cl0;
3812         trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
3813         trpoint->fID    = seed->GetUniqueID();
3814         trpoint->fLab   = seed->GetLabel();
3815         //
3816         trpoint->fGX =  cs *x + sn*point->GetY();
3817         trpoint->fGY = -sn *x + cs*point->GetY() ;
3818         trpoint->fGZ = point->GetZ();
3819         //
3820         trpoint->fDY = y[i];
3821         trpoint->fDZ = z[i];
3822         //
3823         trpoint->fDYU = dyup[i];
3824         trpoint->fDZU = dzup[i];
3825         //
3826         trpoint->fDYD = dydown[i];
3827         trpoint->fDZD = dzdown[i];
3828         //
3829         if (TMath::Abs(dyup[i])>0.00000000001 &&TMath::Abs(dydown[i])>0.00000000001){
3830           trpoint->fDDY = dydown[i]-dyup[i];
3831           trpoint->fDDZ = dzdown[i]-dzup[i];
3832         }else{
3833           trpoint->fDDY = 0.;
3834           trpoint->fDDZ = 0.;
3835         }
3836       }
3837       else{
3838         *trpoint = pdummy;
3839         trpoint->GetCPoint()= cldummy;
3840         trpoint->fID = -1;
3841       }
3842       //
3843     }
3844     fTreeDebug->Fill();
3845   }
3846
3847
3848   return 0;
3849
3850 }
3851
3852
3853
3854
3855
3856 AliTPCseed*  AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *t)
3857 {
3858   //
3859   // reseed - refit -  track
3860   //
3861   Int_t first = 0;
3862   //  Int_t last  = fSectors->GetNRows()-1;
3863   //
3864   if (fSectors == fOuterSec){
3865     first = TMath::Max(first, t->fFirstPoint-fInnerSec->GetNRows());
3866     //last  =
3867   }
3868   else
3869     first = t->fFirstPoint;
3870   //
3871   AliTPCseed * seed = MakeSeed(t,0.1,0.5,0.9);
3872   FollowBackProlongation(*t,fSectors->GetNRows()-1);
3873   t->Reset(kFALSE);
3874   FollowProlongation(*t,first);
3875   return seed;
3876 }
3877
3878
3879
3880
3881
3882
3883
3884 //_____________________________________________________________________________
3885 Int_t AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(const TFile *inp) {
3886   //-----------------------------------------------------------------
3887   // This function reades track seeds.
3888   //-----------------------------------------------------------------
3889   TDirectory *savedir=gDirectory;
3890
3891   TFile *in=(TFile*)inp;
3892   if (!in->IsOpen()) {
3893      cerr<<"AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(): input file is not open !\n";
3894      return 1;
3895   }
3896
3897   in->cd();
3898   TTree *seedTree=(TTree*)in->Get("Seeds");
3899   if (!seedTree) {
3900      cerr<<"AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(): ";
3901      cerr<<"can't get a tree with track seeds !\n";
3902      return 2;
3903   }
3904   AliTPCtrack *seed=new AliTPCtrack;
3905   seedTree->SetBranchAddress("tracks",&seed);
3906
3907   if (fSeeds==0) fSeeds=new TObjArray(15000);
3908
3909   Int_t n=(Int_t)seedTree->GetEntries();
3910   for (Int_t i=0; i<n; i++) {
3911      seedTree->GetEvent(i);
3912      fSeeds->AddLast(new AliTPCseed(*seed,seed->GetAlpha()));
3913   }
3914
3915   delete seed;
3916   delete seedTree;
3917   savedir->cd();
3918   return 0;
3919 }
3920
3921 Int_t AliTPCtrackerMI::Clusters2Tracks (AliESD *esd)
3922 {
3923   //
3924   fEvent = esd;
3925   Clusters2Tracks();
3926   if (!fSeeds) return 1;
3927   FillESD(fSeeds);
3928   return 0;
3929   //
3930 }
3931
3932
3933 //_____________________________________________________________________________
3934 Int_t AliTPCtrackerMI::Clusters2Tracks() {
3935   //-----------------------------------------------------------------
3936   // This is a track finder.
3937   //-----------------------------------------------------------------
3938   TDirectory *savedir=gDirectory;
3939   TStopwatch timer;
3940
3941   fIteration = 0;
3942   fSeeds = Tracking();
3943
3944   if (fDebug>0){
3945     Info("Clusters2Tracks","Time for tracking: \t");timer.Print();timer.Start();
3946   }
3947   //activate again some tracks
3948   for (Int_t i=0; i<fSeeds->GetEntriesFast(); i++) {
3949     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
3950     if (!pt) continue;
3951     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
3952     if (nc<20) {
3953       delete fSeeds->RemoveAt(i);
3954       continue;
3955     }
3956     if (pt->fRemoval==10) {
3957       if (pt->GetDensityFirst(20)>0.8 || pt->GetDensityFirst(30)>0.8 || pt->GetDensityFirst(40)>0.7)
3958         pt->Desactivate(10);  // make track again active
3959       else{
3960         pt->Desactivate(20);
3961         delete fSeeds->RemoveAt(i);
3962       }
3963     }
3964   }
3965   RemoveDouble(fSeeds,0.2,0.6,11);
3966   RemoveUsed(fSeeds,0.5,0.5,6);
3967
3968   //
3969   Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
3970   Int_t found = 0;
3971   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
3972     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
3973     if (!pt) continue;
3974     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
3975     if (nc<15) {
3976       delete fSeeds->RemoveAt(i);
3977       continue;
3978     }
3979     CookLabel(pt,0.1); //For comparison only
3980     //if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )&& nc>50 &&pt->GetNumberOfClusters()>0.4*pt->fNFoundable){
3981     if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )){
3982       cerr<<found++<<'\r';
3983       pt->fLab2 = i;
3984     }
3985     else
3986       delete fSeeds->RemoveAt(i);
3987   }
3988
3989
3990   //RemoveOverlap(fSeeds,0.99,7,kTRUE);
3991   SignShared(fSeeds);
3992   //RemoveUsed(fSeeds,0.9,0.9,6);
3993   //
3994   nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
3995   found = 0;
3996   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
3997     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
3998     if (!pt) continue;
3999     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
4000     if (nc<15) {
4001       delete fSeeds->RemoveAt(i);
4002       continue;
4003     }
4004     t.SetUniqueID(i);
4005     t.CookdEdx(0.02,0.6);
4006     //    CheckKinkPoint(&t,0.05);
4007     //if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )&& nc>50 &&pt->GetNumberOfClusters()>0.4*pt->fNFoundable){
4008     if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )){
4009       found++;
4010       if (fDebug>0){
4011         cerr<<found<<'\r';
4012       }
4013       pt->fLab2 = i;
4014     }
4015     else
4016       delete fSeeds->RemoveAt(i);
4017     //AliTPCseed * seed1 = ReSeed(pt,0.05,0.5,1);
4018     //if (seed1){
4019     //  FollowProlongation(*seed1,0);
4020     //  Int_t n = seed1->GetNumberOfClusters();
4021     //  printf("fP4\t%f\t%f\n",seed1->GetC(),pt->GetC());
4022     //  printf("fN\t%d\t%d\n", seed1->GetNumberOfClusters(),pt->GetNumberOfClusters());
4023     //
4024     //}
4025     //AliTPCseed * seed2 = ReSeed(pt,0.95,0.5,0.05);
4026
4027   }
4028
4029   SortTracks(fSeeds, 1);
4030
4031   /*
4032   fIteration = 1;
4033   PrepareForBackProlongation(fSeeds,5.);
4034   PropagateBack(fSeeds);
4035   printf("Time for back propagation: \t");timer.Print();timer.Start();
4036
4037   fIteration = 2;
4038
4039   PrepareForProlongation(fSeeds,5.);
4040   PropagateForward2(fSeeds);
4041
4042   printf("Time for FORWARD propagation: \t");timer.Print();timer.Start();
4043   // RemoveUsed(fSeeds,0.7,0.7,6);
4044   //RemoveOverlap(fSeeds,0.9,7,kTRUE);
4045
4046   nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
4047   found = 0;
4048   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
4049     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
4050     if (!pt) continue;
4051     Int_t nc=t.GetNumberOfClusters();
4052     if (nc<15) {
4053       delete fSeeds->RemoveAt(i);
4054       continue;
4055     }
4056     t.CookdEdx(0.02,0.6);
4057     //    CookLabel(pt,0.1); //For comparison only
4058     //if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )&& nc>50 &&pt->GetNumberOfClusters()>0.4*pt->fNFoundable){
4059     if ((pt->IsActive() || (pt->fRemoval==10) )){
4060       cerr<<found++<<'\r';
4061     }
4062     else
4063       delete fSeeds->RemoveAt(i);
4064     pt->fLab2 = i;
4065   }
4066   */
4067
4068   //  fNTracks = found;
4069   if (fDebug>0){
4070     Info("Clusters2Tracks","Time for overlap removal, track writing and dedx cooking: \t"); timer.Print();timer.Start();
4071   }
4072   //
4073   //  cerr<<"Number of found tracks : "<<"\t"<<found<<endl;
4074   Info("Clusters2Tracks","Number of found tracks %d",found);
4075   savedir->cd();
4076   //  UnloadClusters();
4077   //
4078   return 0;
4079 }
4080
4081 void AliTPCtrackerMI::Tracking(TObjArray * arr)
4082 {
4083   //
4084   // tracking of the seeds
4085   //
4086
4087   fSectors = fOuterSec;
4088   ParallelTracking(arr,150,63);
4089   fSectors = fOuterSec;
4090   ParallelTracking(arr,63,0);
4091 }
4092
4093 TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking(Int_t seedtype, Int_t i1, Int_t i2, Float_t cuts[4], Float_t dy, Int_t dsec)
4094 {
4095   //
4096   //
4097   //tracking routine
4098   TObjArray * arr = new TObjArray;
4099   //
4100   fSectors = fOuterSec;
4101   TStopwatch timer;
4102   timer.Start();
4103   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
4104     if (seedtype==3) MakeSeeds3(arr,sec,i1,i2,cuts,dy, dsec);
4105     if (seedtype==4) MakeSeeds5(arr,sec,i1,i2,cuts,dy);
4106     if (seedtype==2) MakeSeeds2(arr,sec,i1,i2,cuts,dy);
4107   }
4108   if (fDebug>0){
4109     Info("Tracking","\nSeeding - %d\t%d\t%d\t%d\n",seedtype,i1,i2,arr->GetEntriesFast());
4110     timer.Print();
4111     timer.Start();
4112   }
4113   Tracking(arr);
4114   if (fDebug>0){
4115     timer.Print();
4116   }
4117
4118   return arr;
4119 }
4120
4121 TObjArray * AliTPCtrackerMI::Tracking()
4122 {
4123   //
4124   //
4125   TStopwatch timer;
4126   timer.Start();
4127   Int_t nup=fOuterSec->GetNRows()+fInnerSec->GetNRows();
4128
4129   TObjArray * seeds = new TObjArray;
4130   TObjArray * arr=0;
4131
4132   Int_t gap =20;
4133   Float_t cuts[4];
4134   cuts[0] = 0.002;
4135   cuts[1] = 1.5;
4136   cuts[2] = 3.;
4137   cuts[3] = 3.;
4138   Float_t fnumber  = 3.0;
4139   Float_t fdensity = 3.0;
4140
4141   //
4142   //find primaries
4143   cuts[0]=0.0066;
4144   for (Int_t delta = 0; delta<18; delta+=6){
4145     //
4146     cuts[0]=0.0070;
4147     cuts[1] = 1.5;
4148     arr = Tracking(3,nup-1-delta,nup-1-delta-gap,cuts,-1,1);
4149     SumTracks(seeds,arr);
4150     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4151     //
4152     for (Int_t i=2;i<6;i+=2){
4153       // seed high pt tracks
4154       cuts[0]=0.0022;
4155       cuts[1]=0.3;
4156       arr = Tracking(3,nup-i-delta,nup-i-delta-gap,cuts,-1,0);
4157       SumTracks(seeds,arr);
4158       SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4159     }
4160   }
4161   fnumber  = 4;
4162   fdensity = 4.;
4163   //  RemoveUsed(seeds,0.9,0.9,1);
4164   //  UnsignClusters();
4165   //  SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4166
4167   //find primaries
4168   cuts[0]=0.0077;
4169   for (Int_t delta = 20; delta<120; delta+=10){
4170     //
4171     // seed high pt tracks
4172     cuts[0]=0.0060;
4173     cuts[1]=0.3;
4174     cuts[2]=6.;
4175     arr = Tracking(3,nup-delta,nup-delta-gap,cuts,-1);
4176     SumTracks(seeds,arr);
4177     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4178
4179     cuts[0]=0.003;
4180     cuts[1]=0.3;
4181     cuts[2]=6.;
4182     arr = Tracking(3,nup-delta-5,nup-delta-5-gap,cuts,-1);
4183     SumTracks(seeds,arr);
4184     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4185   }
4186
4187   cuts[0] = 0.01;
4188   cuts[1] = 2.0;
4189   cuts[2] = 3.;
4190   cuts[3] = 2.0;
4191   fnumber  = 2.;
4192   fdensity = 2.;
4193
4194   if (fDebug>0){
4195     Info("Tracking()","\n\nPrimary seeding\t%d\n\n",seeds->GetEntriesFast());
4196     timer.Print();
4197     timer.Start();
4198   }
4199   //  RemoveUsed(seeds,0.75,0.75,1);
4200   //UnsignClusters();
4201   //SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4202
4203   // find secondaries
4204
4205   cuts[0] = 0.3;
4206   cuts[1] = 1.5;
4207   cuts[2] = 3.;
4208   cuts[3] = 1.5;
4209
4210   arr = Tracking(4,nup-1,nup-1-gap,cuts,-1);
4211   SumTracks(seeds,arr);
4212   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4213   //
4214   arr = Tracking(4,nup-2,nup-2-gap,cuts,-1);
4215   SumTracks(seeds,arr);
4216   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4217   //
4218   arr = Tracking(4,nup-3,nup-3-gap,cuts,-1);
4219   SumTracks(seeds,arr);
4220   SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4221   //
4222
4223
4224   for (Int_t delta = 3; delta<30; delta+=5){
4225     //
4226     cuts[0] = 0.3;
4227     cuts[1] = 1.5;
4228     cuts[2] = 3.;
4229     cuts[3] = 1.5;
4230     arr = Tracking(4,nup-1-delta,nup-1-delta-gap,cuts,-1);
4231     SumTracks(seeds,arr);
4232     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4233     //
4234     arr = Tracking(4,nup-3-delta,nup-5-delta-gap,cuts,4);
4235     SumTracks(seeds,arr);
4236     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4237     //
4238   }
4239   fnumber  = 1;
4240   fdensity = 1;
4241   //
4242   // change cuts
4243   fnumber  = 2.;
4244   fdensity = 2.;
4245   cuts[0]=0.0080;
4246
4247   // find secondaries
4248   for (Int_t delta = 30; delta<70; delta+=10){
4249     //
4250     cuts[0] = 0.3;
4251     cuts[1] = 1.5;
4252     cuts[2] = 3.;
4253     cuts[3] = 1.5;
4254     arr = Tracking(4,nup-1-delta,nup-1-delta-gap,cuts,-1);
4255     SumTracks(seeds,arr);
4256     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4257     //
4258     arr = Tracking(4,nup-5-delta,nup-5-delta-gap,cuts,5 );
4259     SumTracks(seeds,arr);
4260     SignClusters(seeds,fnumber,fdensity);
4261   }
4262
4263   if (fDebug>0){
4264     Info("Tracking()","\n\nSecondary seeding\t%d\n\n",seeds->GetEntriesFast());
4265     timer.Print();
4266     timer.Start();
4267   }
4268
4269   return seeds;
4270   //
4271
4272 }
4273
4274
4275 void AliTPCtrackerMI::SumTracks(TObjArray *arr1,TObjArray *arr2) const
4276 {
4277   //
4278   //sum tracks to common container
4279   //remove suspicious tracks
4280   Int_t nseed = arr2->GetEntriesFast();
4281   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
4282     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr2->UncheckedAt(i);
4283     if (pt){
4284
4285       // NORMAL ACTIVE TRACK
4286       if (pt->IsActive()){
4287         arr1->AddLast(arr2->RemoveAt(i));
4288         continue;
4289       }
4290       //remove not usable tracks
4291       if (pt->fRemoval!=10){
4292         delete arr2->RemoveAt(i);
4293         continue;
4294       }
4295       // REMOVE VERY SHORT  TRACKS
4296       if (pt->GetNumberOfClusters()<20){
4297         delete arr2->RemoveAt(i);
4298         continue;
4299       }
4300       // ENABLE ONLY ENOUGH GOOD STOPPED TRACKS
4301       if (pt->GetDensityFirst(20)>0.8 || pt->GetDensityFirst(30)>0.8 || pt->GetDensityFirst(40)>0.7)
4302         arr1->AddLast(arr2->RemoveAt(i));
4303       else{
4304         delete arr2->RemoveAt(i);
4305       }
4306     }
4307   }
4308   delete arr2;
4309 }
4310
4311
4312
4313 void  AliTPCtrackerMI::ParallelTracking(TObjArray * arr, Int_t rfirst, Int_t rlast)
4314 {
4315   //
4316   // try to track in parralel
4317
4318   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
4319   //prepare seeds for tracking
4320   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
4321     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i), &t=*pt;
4322     if (!pt) continue;
4323     if (!t.IsActive()) continue;
4324     // follow prolongation to the first layer
4325     if ( (fSectors ==fInnerSec) || (t.fFirstPoint-fParam->GetNRowLow()>rfirst+1) )
4326       FollowProlongation(t, rfirst+1);
4327   }
4328
4329
4330   //
4331   for (Int_t nr=rfirst; nr>=rlast; nr--){
4332     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
4333       fSectors = fInnerSec;
4334     else
4335       fSectors = fOuterSec;
4336     // make indexes with the cluster tracks for given
4337
4338     // find nearest cluster
4339     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
4340       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i), &t=*pt;
4341       if (!pt) continue;
4342       if (!pt->IsActive()) continue;
4343       //      if ( (fSectors ==fOuterSec) && (pt->fFirstPoint-fParam->GetNRowLow())<nr) continue;
4344       if (pt->fRelativeSector>17) {
4345         continue;
4346       }
4347       UpdateClusters(t,nr);
4348     }
4349     // prolonagate to the nearest cluster - if founded
4350     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
4351       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
4352       if (!pt) continue;
4353       if (!pt->IsActive()) continue;
4354       // if ((fSectors ==fOuterSec) && (pt->fFirstPoint-fParam->GetNRowLow())<nr) continue;
4355       if (pt->fRelativeSector>17) {
4356         continue;
4357       }
4358       FollowToNextCluster(*pt,nr);
4359     }
4360   }
4361 }
4362
4363 void AliTPCtrackerMI::PrepareForBackProlongation(TObjArray * arr,Float_t fac) const
4364 {
4365   //
4366   //
4367   // if we use TPC track itself we have to "update" covariance
4368   //
4369   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
4370   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
4371     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
4372     if (pt) {
4373       pt->Modify(fac);
4374       //
4375       //rotate to current local system at first accepted  point
4376       Int_t index  = pt->GetClusterIndex2(pt->fFirstPoint);
4377       Int_t sec    = (index&0xff000000)>>24;
4378       sec = sec%18;
4379       Float_t angle1 = fInnerSec->GetAlpha()*sec+fInnerSec->GetAlphaShift();
4380       if (angle1>TMath::Pi())
4381         angle1-=2.*TMath::Pi();
4382       Float_t angle2 = pt->GetAlpha();
4383
4384       if (TMath::Abs(angle1-angle2)>0.001){
4385         pt->Rotate(angle1-angle2);
4386         //angle2 = pt->GetAlpha();
4387         //pt->fRelativeSector = pt->GetAlpha()/fInnerSec->GetAlpha();
4388         //if (pt->GetAlpha()<0)
4389         //  pt->fRelativeSector+=18;
4390         //sec = pt->fRelativeSector;
4391       }
4392
4393     }
4394
4395   }
4396
4397
4398 }
4399 void AliTPCtrackerMI::PrepareForProlongation(TObjArray * arr, Float_t fac) const
4400 {
4401   //
4402   //
4403   // if we use TPC track itself we have to "update" covariance
4404   //
4405   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
4406   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
4407     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
4408     if (pt) {
4409       pt->Modify(fac);
4410       pt->fFirstPoint = pt->fLastPoint;
4411     }
4412
4413   }
4414
4415
4416 }
4417
4418 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(TObjArray * arr)
4419 {
4420   //
4421   // make back propagation
4422   //
4423   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
4424   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
4425     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
4426     if (pt) {
4427       AliTPCseed *pt2 = new AliTPCseed(*pt);
4428       fSectors = fInnerSec;
4429       //FollowBackProlongation(*pt,fInnerSec->GetNRows()-1);
4430       //fSectors = fOuterSec;
4431       FollowBackProlongation(*pt,fInnerSec->GetNRows()+fOuterSec->GetNRows()-1);
4432
4433       if (fDebug>1 && pt->GetNumberOfClusters()<20 && pt->GetLabel()>0 ){
4434         Error("PropagateBack","Not prolonged track %d",pt->GetLabel());
4435         fSectors = fInnerSec;
4436         //FollowBackProlongation(*pt2,fInnerSec->GetNRows()-1);
4437         //fSectors = fOuterSec;
4438         FollowBackProlongation(*pt2,fInnerSec->GetNRows()+fOuterSec->GetNRows()-1);
4439       }
4440     }
4441   }
4442   return 0;
4443 }
4444
4445
4446 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateForward2(TObjArray * arr)
4447 {
4448   //
4449   // make forward propagation
4450   //
4451   Int_t nseed= arr->GetEntriesFast();
4452   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
4453     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
4454     if (pt) {
4455       AliTPCseed *pt2 = new AliTPCseed(*pt);
4456       FollowProlongation(*pt,0);
4457       if (pt->GetNumberOfClusters()<35 && pt->GetLabel()>0 ){
4458         FollowProlongation(*pt2,0);
4459       }
4460       delete pt2;
4461     }
4462   }
4463   return 0;
4464 }
4465
4466
4467 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateForward()
4468 {
4469   //
4470   // propagate track forward
4471   UnsignClusters();
4472   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
4473   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
4474     AliTPCseed *pt = (AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
4475     if (pt){
4476       AliTPCseed &t = *pt;
4477       Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
4478       if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
4479       if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
4480       t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
4481     }
4482   }
4483
4484   fSectors = fOuterSec;
4485   ParallelTracking(fSeeds,fOuterSec->GetNRows()+fInnerSec->GetNRows()-1,fInnerSec->GetNRows());
4486   fSectors = fInnerSec;
4487   ParallelTracking(fSeeds,fInnerSec->GetNRows()-1,0);
4488   //WriteTracks();
4489   return 1;
4490 }
4491
4492
4493
4494
4495
4496
4497 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliTPCseed * pt, Int_t row0, Int_t row1)
4498 {
4499   //
4500   // make back propagation, in between row0 and row1
4501   //
4502
4503   if (pt) {
4504     fSectors = fInnerSec;
4505     Int_t  r1;
4506     //
4507     if (row1<fSectors->GetNRows())
4508       r1 = row1;
4509     else
4510       r1 = fSectors->GetNRows()-1;
4511
4512     if (row0<fSectors->GetNRows()&& r1>0 )
4513       FollowBackProlongation(*pt,r1);
4514     if (row1<=fSectors->GetNRows())
4515       return 0;
4516     //
4517     r1 = row1 - fSectors->GetNRows();
4518     if (r1<=0) return 0;
4519     if (r1>=fOuterSec->GetNRows()) return 0;
4520     fSectors = fOuterSec;
4521     return FollowBackProlongation(*pt,r1);
4522   }
4523   return 0;
4524 }
4525
4526
4527
4528
4529 void  AliTPCtrackerMI::GetShape(AliTPCseed * seed, Int_t row)
4530 {
4531   //
4532   //
4533   Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
4534   //  Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
4535   Float_t padlength =  GetPadPitchLength(row);
4536   //
4537   Float_t sresy = (seed->fSector < fParam->GetNSector()/2) ? 0.2 :0.3;
4538   Float_t angulary  = seed->GetSnp();
4539   angulary = angulary*angulary/(1-angulary*angulary);
4540   seed->fCurrentSigmaY2 = sd2+padlength*padlength*angulary/12.+sresy*sresy;
4541   //
4542   Float_t sresz = fParam->GetZSigma();
4543   Float_t angularz  = seed->GetTgl();
4544   seed->fCurrentSigmaZ2 = sd2+padlength*padlength*angularz*angularz*(1+angulary)/12.+sresz*sresz;
4545   /*
4546   Float_t wy = GetSigmaY(seed);
4547   Float_t wz = GetSigmaZ(seed);
4548   wy*=wy;
4549   wz*=wz;
4550   if (TMath::Abs(wy/seed->fCurrentSigmaY2-1)>0.0001 || TMath::Abs(wz/seed->fCurrentSigmaZ2-1)>0.0001 ){
4551     printf("problem\n");
4552   }
4553   */
4554 }
4555
4556
4557 Float_t  AliTPCtrackerMI::GetSigmaY(AliTPCseed * seed)
4558 {
4559   //
4560   //
4561   Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
4562   Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
4563   Float_t sres = (seed->fSector < fParam->GetNSector()/2) ? 0.2 :0.3;
4564   Float_t angular  = seed->GetSnp();
4565   angular = angular*angular/(1-angular*angular);
4566   //  angular*=angular;
4567   //angular  = TMath::Sqrt(angular/(1-angular));
4568   Float_t res = TMath::Sqrt(sd2+padlength*padlength*angular/12.+sres*sres);
4569   return res;
4570 }
4571 Float_t  AliTPCtrackerMI::GetSigmaZ(AliTPCseed * seed)
4572 {
4573   //
4574   //
4575   Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
4576   Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
4577   Float_t sres = fParam->GetZSigma();
4578   Float_t angular  = seed->GetTgl();
4579   Float_t res = TMath::Sqrt(sd2+padlength*padlength*angular*angular/12.+sres*sres);
4580   return res;
4581 }
4582
4583
4584
4585
4586 //__________________________________________________________________________
4587 void AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliTPCseed *t, Float_t wrong) const {
4588   //--------------------------------------------------------------------
4589   //This function "cooks" a track label. If label<0, this track is fake.
4590   //--------------------------------------------------------------------
4591   Int_t noc=t->GetNumberOfClusters();
4592   if (noc<10){
4593     //printf("\nnot founded prolongation\n\n\n");
4594     //t->Dump();
4595     return ;
4596   }
4597   Int_t lb[160];
4598   Int_t mx[160];
4599   AliTPCclusterMI *clusters[160];
4600   //
4601   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
4602     clusters[i]=0;
4603     lb[i]=mx[i]=0;
4604   }
4605
4606   Int_t i;
4607   Int_t current=0;
4608   for (i=0; i<160 && current<noc; i++) {
4609
4610      Int_t index=t->GetClusterIndex2(i);
4611      if (index<=0) continue;
4612      if (index&0x8000) continue;
4613      //
4614      //clusters[current]=GetClusterMI(index);
4615      if (t->fClusterPointer[i]){
4616        clusters[current]=t->fClusterPointer[i];
4617        current++;
4618      }
4619   }
4620   noc = current;
4621
4622   Int_t lab=123456789;
4623   for (i=0; i<noc; i++) {
4624     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
4625     if (!c) continue;
4626     lab=TMath::Abs(c->GetLabel(0));
4627     Int_t j;
4628     for (j=0; j<noc; j++) if (lb[j]==lab || mx[j]==0) break;
4629     lb[j]=lab;
4630     (mx[j])++;
4631   }
4632
4633   Int_t max=0;
4634   for (i=0; i<noc; i++) if (mx[i]>max) {max=mx[i]; lab=lb[i];}
4635
4636   for (i=0; i<noc; i++) {
4637     AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
4638     if (!c) continue;
4639     if (TMath::Abs(c->GetLabel(1)) == lab ||
4640         TMath::Abs(c->GetLabel(2)) == lab ) max++;
4641   }
4642
4643   if ((1.- Float_t(max)/noc) > wrong) lab=-lab;
4644
4645   else {
4646      Int_t tail=Int_t(0.10*noc);
4647      max=0;
4648      Int_t ind=0;
4649      for (i=1; i<=160&&ind<tail; i++) {
4650        //       AliTPCclusterMI *c=clusters[noc-i];
4651        AliTPCclusterMI *c=clusters[i];
4652        if (!c) continue;
4653        if (lab == TMath::Abs(c->GetLabel(0)) ||
4654            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(1)) ||
4655            lab == TMath::Abs(c->GetLabel(2))) max++;
4656        ind++;
4657      }
4658      if (max < Int_t(0.5*tail)) lab=-lab;
4659   }
4660
4661   t->SetLabel(lab);
4662
4663   //  delete[] lb;
4664   //delete[] mx;
4665   //delete[] clusters;
4666 }
4667
4668
4669 Int_t  AliTPCtrackerMI::AliTPCSector::GetRowNumber(Double_t x) const
4670 {
4671   //return pad row number for this x
4672   Double_t r;
4673   if (fN < 64){
4674     r=fRow[fN-1].GetX();
4675     if (x > r) return fN;
4676     r=fRow[0].GetX();
4677     if (x < r) return -1;
4678     return Int_t((x-r)/fPadPitchLength + 0.5);}
4679   else{
4680     r=fRow[fN-1].GetX();
4681     if (x > r) return fN;
4682     r=fRow[0].GetX();
4683     if (x < r) return -1;
4684     Double_t r1=fRow[64].GetX();
4685     if(x<r1){
4686       return Int_t((x-r)/f1PadPitchLength + 0.5);}
4687     else{
4688       return (Int_t((x-r1)/f2PadPitchLength + 0.5)+64);}
4689   }
4690 }
4691
4692 //_________________________________________________________________________
4693 void AliTPCtrackerMI::AliTPCSector::Setup(const AliTPCParam *par, Int_t f) {
4694   //-----------------------------------------------------------------------
4695   // Setup inner sector
4696   //-----------------------------------------------------------------------
4697   if (f==0) {
4698      fAlpha=par->GetInnerAngle();
4699      fAlphaShift=par->GetInnerAngleShift();
4700      fPadPitchWidth=par->GetInnerPadPitchWidth();
4701      fPadPitchLength=par->GetInnerPadPitchLength();
4702      fN=par->GetNRowLow();
4703      fRow=new AliTPCRow[fN];
4704      for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
4705        fRow[i].SetX(par->GetPadRowRadiiLow(i));
4706        fRow[i].fDeadZone =1.5;  //1.5 cm of dead zone
4707      }
4708   } else {
4709      fAlpha=par->GetOuterAngle();
4710      fAlphaShift=par->GetOuterAngleShift();
4711      fPadPitchWidth  = par->GetOuterPadPitchWidth();
4712      fPadPitchLength = par->GetOuter1PadPitchLength();
4713      f1PadPitchLength = par->GetOuter1PadPitchLength();
4714      f2PadPitchLength = par->GetOuter2PadPitchLength();
4715
4716      fN=par->GetNRowUp();
4717      fRow=new AliTPCRow[fN];
4718      for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
4719        fRow[i].SetX(par->GetPadRowRadiiUp(i));
4720        fRow[i].fDeadZone =1.5;  // 1.5 cm of dead zone
4721      }
4722   }
4723 }
4724
4725 AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::AliTPCRow() {
4726   //
4727   // default constructor
4728   fN=0;
4729   fN1=0;
4730   fN2=0;
4731   fClusters1=0;
4732   fClusters2=0;
4733 }
4734
4735 AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::~AliTPCRow(){
4736   //
4737
4738 }
4739
4740
4741
4742 //_________________________________________________________________________
4743 void
4744 AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::InsertCluster(const AliTPCclusterMI* c, UInt_t index) {
4745   //-----------------------------------------------------------------------
4746   // Insert a cluster into this pad row in accordence with its y-coordinate
4747   //-----------------------------------------------------------------------
4748   if (fN==kMaxClusterPerRow) {
4749     cerr<<"AliTPCRow::InsertCluster(): Too many clusters !\n"; return;
4750   }
4751   if (fN==0) {fIndex[0]=index; fClusters[fN++]=c; return;}
4752   Int_t i=Find(c->GetZ());
4753   memmove(fClusters+i+1 ,fClusters+i,(fN-i)*sizeof(AliTPCclusterMI*));
4754   memmove(fIndex   +i+1 ,fIndex   +i,(fN-i)*sizeof(UInt_t));
4755   fIndex[i]=index; fClusters[i]=c; fN++;
4756 }
4757
4758 void AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::ResetClusters() {
4759    //
4760    // reset clusters
4761    fN  = 0;
4762    fN1 = 0;
4763    fN2 = 0;
4764    //delete[] fClusterArray;
4765    if (fClusters1) delete []fClusters1;
4766    if (fClusters2) delete []fClusters2;
4767    //fClusterArray=0;
4768    fClusters1 = 0;
4769    fClusters2 = 0;
4770 }
4771
4772
4773 //___________________________________________________________________
4774 Int_t AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::Find(Double_t z) const {
4775   //-----------------------------------------------------------------------
4776   // Return the index of the nearest cluster
4777   //-----------------------------------------------------------------------
4778   if (fN==0) return 0;
4779   if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
4780   if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
4781   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
4782   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
4783     if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
4784     else e=m;
4785   }
4786   return m;
4787 }
4788
4789
4790
4791 //___________________________________________________________________
4792 AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz) const {
4793   //-----------------------------------------------------------------------
4794   // Return the index of the nearest cluster in z y
4795   //-----------------------------------------------------------------------
4796   Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
4797
4798   AliTPCclusterMI *cl =0;
4799   for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
4800       AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
4801       if (c->GetZ() > z+roadz) break;
4802       if ( (c->GetY()-y) >  roady ) continue;
4803       Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
4804       if (maxdistance>distance) {
4805         maxdistance = distance;
4806         cl=c;
4807       }
4808   }
4809   return cl;
4810 }
4811
4812 AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest2(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz,UInt_t & index) const
4813 {
4814   //-----------------------------------------------------------------------
4815   // Return the index of the nearest cluster in z y
4816   //-----------------------------------------------------------------------
4817   Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
4818   Int_t iz1 = TMath::Max(fFastCluster[Int_t(z-roadz+254.5)]-1,0);
4819   Int_t iz2 = TMath::Min(fFastCluster[Int_t(z+roadz+255.5)]+1,fN);
4820
4821   AliTPCclusterMI *cl =0;
4822   //FindNearest3(y,z,roady,roadz,index);
4823   //  for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
4824   for (Int_t i=iz1; i<iz2; i++) {
4825       AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
4826       if (c->GetZ() > z+roadz) break;
4827       if ( c->GetY()-y >  roady ) continue;
4828       if ( y-c->GetY() >  roady ) continue;
4829       Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
4830       if (maxdistance>distance) {
4831         maxdistance = distance;
4832         cl=c;
4833         index =i;
4834         //roady = TMath::Sqrt(maxdistance);
4835       }
4836   }
4837   return cl;
4838 }
4839
4840
4841
4842 AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest3(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz,UInt_t & index) const
4843 {
4844   //-----------------------------------------------------------------------
4845   // Return the index of the nearest cluster in z y
4846   //-----------------------------------------------------------------------
4847   Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
4848   //  Int_t iz = Int_t(z+255.);
4849   AliTPCclusterMI *cl =0;
4850   for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
4851     //for (Int_t i=fFastCluster[iz-2]; i<fFastCluster[iz+2]; i++) {
4852       AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
4853       if (c->GetZ() > z+roadz) break;
4854       if ( c->GetY()-y >  roady ) continue;
4855       if ( y-c->GetY() >  roady ) continue;
4856       Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
4857       if (maxdistance>distance) {
4858         maxdistance = distance;
4859         cl=c;
4860         index =i;
4861         //roady = TMath::Sqrt(maxdistance);
4862       }
4863   }
4864   return cl;
4865 }
4866
4867
4868
4869
4870 AliTPCseed::AliTPCseed():AliTPCtrack(){
4871   //
4872   fRow=0;
4873   fRemoval =0;
4874   for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
4875   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
4876
4877   fPoints = 0;
4878   fEPoints = 0;
4879   fNFoundable =0;
4880   fNShared  =0;
4881   fRemoval = 0;
4882   fSort =0;
4883   fFirstPoint =0;
4884   fNoCluster =0;
4885   fBSigned = kFALSE;
4886   fSeed1 =-1;
4887   fSeed2 =-1;
4888   fCurrentCluster =0;
4889 }
4890
4891 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):AliTPCtrack(t){
4892   //
4893   //copy constructor
4894   fPoints = 0;
4895   fEPoints = 0;
4896   fNShared  =0;
4897   //  fTrackPoints =0;
4898   fRemoval =0;
4899   fSort =0;
4900   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
4901     fClusterPointer[i] = 0;
4902     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
4903     if (index>0) {
4904       SetClusterIndex2(i,index);
4905     }
4906     else{
4907       SetClusterIndex2(i,-3);
4908     }
4909   }
4910   fFirstPoint =0;
4911   fNoCluster =0;
4912   fBSigned = kFALSE;
4913   fSeed1 =-1;
4914   fSeed2 =-1;
4915   fCurrentCluster =0;
4916
4917 }
4918
4919 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliKalmanTrack &t, Double_t a):AliTPCtrack(t,a){
4920   //
4921   //copy constructor
4922   fRow=0;
4923   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
4924     fClusterPointer[i] = 0;
4925     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
4926     SetClusterIndex2(i,index);
4927   }
4928
4929   fPoints = 0;
4930   fEPoints = 0;
4931   fNFoundable =0;
4932   fNShared  =0;
4933   //  fTrackPoints =0;
4934   fRemoval =0;
4935   fSort = 0;
4936   fFirstPoint =0;
4937   fNoCluster =0;
4938   fBSigned = kFALSE;
4939   fSeed1 =-1;
4940   fSeed2 =-1;
4941   fCurrentCluster =0;
4942 }
4943
4944 AliTPCseed::AliTPCseed(UInt_t index, const Double_t xx[5], const Double_t cc[15],
4945                                         Double_t xr, Double_t alpha):
4946   AliTPCtrack(index, xx, cc, xr, alpha) {
4947   //
4948   //
4949   //constructor
4950   fRow =0;
4951   for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
4952   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
4953   fPoints = 0;
4954   fEPoints = 0;
4955   fNFoundable =0;
4956   fNShared  = 0;
4957   //  fTrackPoints =0;
4958   fRemoval =0;
4959   fSort =0;
4960   fFirstPoint =0;
4961   //  fHelixIn = new TClonesArray("AliHelix",0);
4962   //fHelixOut = new TClonesArray("AliHelix",0);
4963   fNoCluster =0;
4964   fBSigned = kFALSE;
4965   fSeed1 =-1;
4966   fSeed2 =-1;
4967   fCurrentCluster =0;
4968
4969 }
4970
4971 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
4972   //
4973   // destructor
4974   if (fPoints) delete fPoints;
4975   fPoints =0;
4976   if (fEPoints) delete fEPoints;
4977   fEPoints = 0;
4978   fNoCluster =0;
4979 }
4980
4981 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
4982 {
4983   //
4984   //
4985   return &fTrackPoints[i];
4986 }
4987
4988 void AliTPCseed::RebuildSeed()
4989 {
4990   //
4991   // rebuild seed to be ready for storing
4992   AliTPCclusterMI cldummy;
4993   cldummy.SetQ(0);
4994   AliTPCTrackPoint pdummy;
4995   pdummy.GetTPoint().fIsShared = 10;
4996   for (Int_t i=0;i<160;i++){
4997     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
4998     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);
4999     if (cl0){
5000       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
5001       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
5002       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
5003     }
5004     else{
5005       *trpoint = pdummy;
5006       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
5007     }
5008
5009   }
5010
5011 }
5012
5013
5014 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
5015 {
5016   //
5017   //
5018   // return cluster for n rows bellow first point
5019   Int_t nfoundable = 1;
5020   Int_t nfound      = 1;
5021   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
5022     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
5023     if (index!=-1) nfoundable++;
5024     if (index>0) nfound++;
5025   }
5026   if (nfoundable<n) return 0;
5027   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
5028
5029 }
5030
5031
5032 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
5033 {
5034   // get cluster stat.  on given region
5035   //
5036   found       = 0;
5037   foundable   = 0;
5038   shared      =0;
5039   for (Int_t i=first;i<last; i++){
5040     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
5041     if (index!=-1) foundable++;
5042     if (fClusterPointer[i]) {
5043       found++;
5044     }
5045     else
5046       continue;
5047
5048     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
5049       shared++;
5050       continue;
5051     }
5052     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
5053     //
5054     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
5055       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
5056         shared++;
5057         continue;
5058       }
5059     }
5060     if ( fClusterPointer[i+1]){
5061       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
5062         shared++;
5063         continue;
5064       }
5065     }
5066
5067   }
5068   //if (shared>found){
5069     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
5070   //}
5071 }
5072
5073 //_____________________________________________________________________________
5074 void AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
5075   //-----------------------------------------------------------------
5076   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
5077   //-----------------------------------------------------------------
5078
5079   Float_t amp[200];
5080   Float_t angular[200];
5081   Float_t weight[200];
5082   Int_t index[200];
5083   //Int_t nc = 0;
5084   //  TClonesArray & arr = *fPoints;
5085   Float_t meanlog = 100.;
5086
5087   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
5088   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
5089   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
5090   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
5091   //
5092   //
5093   fNShared =0;
5094
5095   for (Int_t of =0; of<4; of++){
5096     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
5097       {
5098         Int_t index = fIndex[i];
5099         if (index<0||index&0x8000) continue;
5100
5101         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
5102         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
5103         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
5104         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
5105         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
5106
5107         if (point==0) continue;
5108         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
5109         if (cl==0) continue;
5110         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
5111         if (cl->IsUsed(11)) {
5112           fNShared++;
5113           continue;
5114         }
5115         Int_t   type   = cl->GetType();
5116         //if (point->fIsShared){
5117         //  fNShared++;
5118         //  continue;
5119         //}
5120         //if (pointm)
5121         //  if (pointm->fIsShared) continue;
5122         //if (pointp)
5123         //  if (pointp->fIsShared) continue;
5124
5125         if (type<0) continue;
5126         //if (type>10) continue;
5127         //if (point->GetErrY()==0) continue;
5128         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
5129
5130         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
5131         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
5132         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
5133
5134
5135         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
5136         if (cl->GetMax()<5) continue;
5137         Float_t angley = point->GetAngleY();
5138         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
5139
5140         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
5141         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
5142         /*
5143         Float_t ns = 1.;
5144         if (pointm){
5145           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
5146           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
5147           ns+=1.;
5148         }
5149         if (pointp){
5150           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
5151           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
5152           ns+=1.;
5153         }
5154         rsigmay/=ns;
5155         rsigmaz/=ns;
5156         */
5157
5158         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
5159
5160         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
5161         if (i>64){
5162           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
5163           ampc = 1.*cl->GetMax();
5164           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
5165           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
5166           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
5167           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
5168           //Float_t dz =
5169           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
5170           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
5171           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
5172           //      Float_t zfactor = (1.05-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
5173           //ampc               *=zfactor;
5174         }
5175         else{
5176           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
5177           ampc = 1.0*cl->GetMax();
5178           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
5179           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
5180           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
5181           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
5182           //Float_t dz =
5183           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
5184
5185           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
5186           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
5187           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
5188           //ampc               *=zfactor;
5189
5190         }
5191         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
5192         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
5193         Float_t w      =  1.;
5194         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
5195         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
5196         if (i<64) {
5197           ampc /= 0.6;
5198           //ampc /= (1+0.0008*z);
5199         } else
5200           if (i>128){
5201             ampc /=1.5;
5202             //ampc /= (1+0.0008*z);
5203           }else{
5204             //ampc /= (1+0.0008*z);
5205           }
5206
5207         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
5208           // w*= 2.;
5209
5210           continue;
5211         }
5212         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
5213         amp[nc[of]]        = ampc;
5214         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
5215         weight[nc[of]]     = w;
5216         nc[of]++;
5217       }
5218
5219     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
5220     Float_t sumamp=0;
5221     Float_t sumamp2=0;
5222     Float_t sumw=0;
5223     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
5224     meanlog = 50;
5225     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
5226       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
5227       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
5228       //
5229       sumw    += weight[index[i]];
5230       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
5231       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
5232       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
5233     }
5234     if (sumw<1){
5235       SetdEdx(0);
5236     }
5237     else {
5238       norm[of] /= sumw;
5239       mean[of]  = sumamp/sumw;
5240       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
5241       if (sigma[of]>0.1)
5242         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
5243       else
5244         sigma[of] = 1000;
5245
5246     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
5247     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
5248     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
5249     }
5250   }
5251
5252   Float_t dedx =0;
5253   fSdEdx =0;
5254   fMAngular =0;
5255   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
5256   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
5257
5258
5259   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
5260   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
5261
5262   Int_t norm2 = 0;
5263   Int_t norm3 = 0;
5264   for (Int_t i =0;i<4;i++){
5265     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
5266       dedx      += mean[i] *nc[i];
5267       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
5268       fMAngular += norm[i] *nc[i];
5269       norm2     += nc[i];
5270       norm3     += nc[i]-2;
5271     }
5272     fDEDX[i]  = mean[i];
5273     fSDEDX[i] = sigma[i];
5274     fNCDEDX[i]= nc[i];
5275   }
5276
5277   if (norm3>0){
5278     dedx   /=norm2;
5279     fSdEdx /=norm3;
5280     fMAngular/=norm2;
5281   }
5282   else{
5283     SetdEdx(0);
5284     return;
5285   }
5286   //  Float_t dedx1 =dedx;
5287   /*
5288   dedx =0;
5289   for (Int_t i =0;i<4;i++){
5290     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
5291       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
5292       dedx      += mean[i] *nc[i];
5293     }
5294     fDEDX[i]  = mean[i];
5295   }
5296   dedx /= norm2;
5297   */
5298
5299
5300   SetdEdx(dedx);
5301
5302   //mi deDX
5303
5304
5305
5306   //Very rough PID
5307   Double_t p=TMath::Sqrt((1.+ GetTgl()*GetTgl())/(Get1Pt()*Get1Pt()));
5308
5309   if (p<0.6) {
5310     if (dedx < 39.+ 12./(p+0.25)/(p+0.25)) { SetMass(0.13957); return;}
5311     if (dedx < 39.+ 12./p/p) { SetMass(0.49368); return;}
5312     SetMass(0.93827); return;
5313   }
5314
5315   if (p<1.2) {
5316     if (dedx < 39.+ 12./(p+0.25)/(p+0.25)) { SetMass(0.13957); return;}
5317     SetMass(0.93827); return;
5318   }
5319
5320   SetMass(0.13957); return;
5321
5322 }
5323
5324
5325
5326 /*
5327
5328
5329
5330 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
5331   //-----------------------------------------------------------------
5332   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
5333   //-----------------------------------------------------------------
5334
5335   Float_t amp[200];
5336   Float_t angular[200];
5337   Float_t weight[200];
5338   Int_t index[200];
5339   Bool_t inlimit[200];
5340   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
5341   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
5342   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
5343
5344
5345   //
5346   Float_t meanlog = 100.;
5347   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
5348
5349   Float_t amean     =0;
5350   Float_t asigma    =0;
5351   Float_t anc       =0;
5352   Float_t anorm     =0;
5353
5354   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
5355   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
5356   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
5357   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
5358   //
5359   //
5360   fNShared =0;
5361
5362   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){
5363   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
5364   for (Int_t i =0; i<160;i++)
5365     {
5366         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
5367         if (point==0) continue;
5368         if (point->fIsShared){
5369           fNShared++;
5370           continue;
5371         }
5372         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
5373         if (type<0) continue;
5374         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
5375         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
5376         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
5377         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
5378         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
5379         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
5380
5381         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
5382         if (i>64){
5383           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
5384         }
5385         else{
5386           ampc = point->GetCPoint().GetMax();
5387         }
5388         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
5389         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
5390
5391         Float_t w      =  1.;
5392         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
5393         if (i<64) {
5394           ampc /= 0.63;
5395         } else
5396           if (i>128){
5397             ampc /=1.51;
5398           }
5399         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
5400           continue;
5401         }
5402         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
5403         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
5404         amp[i]        = ampc/angular[i];
5405         weight[i]     = w;
5406         anc++;
5407     }
5408
5409   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
5410   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){
5411     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
5412   }
5413
5414   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
5415   meanlog =10000.;
5416   for (Int_t of =0; of<3; of++){
5417     Float_t sumamp=0;
5418     Float_t sumamp2=0;
5419     Float_t sumw=0;
5420    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
5421       {
5422         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
5423         Float_t ampl      = amp[i];
5424         ///angular[i];
5425         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
5426         //
5427         sumw    += weight[i];
5428         sumamp  += weight[i]*ampl;
5429         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
5430         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
5431         nc[of]++;
5432       }
5433    if (sumw<1){
5434      SetdEdx(0);
5435    }
5436    else {
5437      norm[of] /= sumw;
5438      mean[of]  = sumamp/sumw;
5439      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
5440      if (sigma[of]>0.1)
5441        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
5442      else
5443        sigma[of] = 1000;
5444      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
5445    }
5446   }
5447
5448   Float_t dedx =0;
5449   fSdEdx =0;
5450   fMAngular =0;
5451   //
5452   Int_t norm2 = 0;
5453   Int_t norm3 = 0;
5454   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
5455   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
5456
5457   for (Int_t i =0;i<3;i++){
5458     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
5459       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
5460       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
5461       fMAngular += norm[i] *nc[i];
5462       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
5463       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
5464     }
5465     fDEDX[i]  = mean[i];
5466     fSDEDX[i] = sigma[i];
5467     fNCDEDX[i]= nc[i];
5468   }
5469
5470   if (norm3>0){
5471     dedx   /=norm2;
5472     fSdEdx /=norm3;
5473     fMAngular/=norm2;
5474   }
5475   else{
5476     SetdEdx(0);
5477     return;
5478   }
5479   //  Float_t dedx1 =dedx;
5480
5481   dedx =0;
5482   Float_t norm4 = 0;
5483   for (Int_t i =0;i<3;i++){
5484     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
5485       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
5486       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
5487       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
5488     }
5489     fDEDX[i]  = mean[i];
5490   }
5491   if (norm4>0) dedx /= norm4;
5492
5493
5494
5495   SetdEdx(dedx);
5496
5497   //mi deDX
5498
5499 }
5500
5501 */