TPC/DA/TPCPEDESTALda.cxx

   1 /*
   2 TPC DA for online calibration
   3
   4 Contact: Haavard.Helstrup@cern.ch
   5 Link:
   6 Run Type: PEDESTAL
   7 DA Type: LDC
   8 Number of events needed: 100
   9 Input Files:
  10 Output Files: tpcPedestal.root, to be exported to the DAQ FXS
  11 fileId:   pedestals
  12 Trigger types used: CALIBRATION_EVENT
  13 */
  14 /// \file TPCPEDESTALda.cxx
  15 ///
  16 /// TPC DA for online calibration
  17 ///
  18 /// Contact: Haavard.Helstrup@cern.ch
  19 /// Link:
  20 /// Run Type: PEDESTAL
  21 /// DA Type: LDC
  22 /// Number of events needed: 100
  23 /// Input Files:
  24 /// Output Files: tpcPedestal.root, to be exported to the DAQ FXS
  25 /// fileId:   pedestals
  26 /// Trigger types used: CALIBRATION_EVENT
  27 ///
  28 /// TPCda_pedestal.cxx - calibration algorithm for TPC pedestal runs
  29 ///
  30 /// 10/06/2007  sylvain.chapeland@cern.ch :  first version - clean skeleton based on DAQ DA case1
  31 /// 19/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Possibility to write output to ASCII file
  32 /// 24/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Including pedestal calibration for time bins
  33 /// 23/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Fix in order to avoid streamer problems in case of
  34 ///                                           invalid ROOTSTYS. The famous magic line provided by Rene.
  35 /// 28/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  TPC mapping file is read from DaqDetDB
  36 /// 18/09/2008  christian.lippmann@cern.ch :  Noisy channels are output to ASCII file. Use max noise in ALTRO.
  37 /// 19/09/2008  J.Wiechula@gsi.de:            Added export of the calibration data to the AMORE data base.
  38 ///                                           Added support for configuration files.
  39 /// 31/01/2011  Christian.Lippmann@cern.ch :  Updates for changed setup at P2 with 2 LDCs per sector
  40 /// 26/09/2014  Christian.Lippmann@cern.ch :  Updates for changed setup at P2 1 CRORC per LDC
  41 /// 26/09/2014  Jens.Wiechula@cern.ch      :  comment out obsolete AliTPCRawStream
  42 ///
  43 /// \author marian.ivanov@cern.ch
  44 ///
  45 /// This process reads RAW data from the files provided as command line arguments
  46 /// and save results in a file (named from RESULT_FILE define - see below).
  47
  48 #define RESULT_FILE  "tpcPedestal.root"
  49 #define FILE_ID "pedestals"
  50 #define MAPPING_FILE "tpcMapping.root"
  51 #define CONFIG_FILE "TPCPEDESTALda.conf"
  52 #define PED_FILE "tpcPedestals.data"
  53 #define NOISE_FILE "tpcNoise.data"
  54 #define PEDMEM_FILE "tpcPedestalMem.data"
  55 #define NOISY_FILE "tpcNoisyChannels.data"
  56 #define VERYNOISY_FILE "tpcVeryNoisyChannels.data"
  57 #define DEAD_FILE "tpcDeadChannels.data"
  58 #define AliDebugLevel() -1
  59
  60 extern "C" {
  61 #include <daqDA.h>
  62 }
  63 #include "event.h"
  64 #include "monitor.h"
  65
  66 #include "stdio.h"
  67 #include "stdlib.h"
  68 #include <fstream>
  69
  70 // Root includes
  71
  72 #include "TFile.h"
  73 #include "TArrayF.h"
  74 #include "TROOT.h"
  75 #include "TPluginManager.h"
  76 #include "TSystem.h"
  77 #include "TString.h"
  78 #include "TObjString.h"
  79 #include "TDatime.h"
  80 //
  81 //AliRoot includes
  82 //
  83 #include "AliRawReader.h"
  84 #include "AliRawReaderDate.h"
  85 #include "AliTPCmapper.h"
  86 //#include "AliTPCRawStreamV3.h"
  87 #include "AliTPCROC.h"
  88 #include "AliTPCCalROC.h"
  89 #include "AliTPCCalPad.h"
  90 #include "AliMathBase.h"
  91 #include "TTreeStream.h"
  92 #include "AliLog.h"
  93 #include "AliTPCConfigDA.h"
  94
  95 //
  96 //AMORE
  97 //
  98 #include <AmoreDA.h>
  99
 100 //
 101 // TPC calibration algorithm includes
 102 //
 103 #include "AliTPCCalibPedestal.h"
 104
 105
 106 int main(int argc, char **argv) {
 107   /// Main routine, TPC pedestal detector algorithm to be run on TPC LDC
 108   /// Arguments: list of DATE raw data files
 109   /// Main for TPC pedestal detector algorithm
 110
 111   // log start of process
 112   printf("TPC DA started - %s\n",__FILE__);
 113
 114   if (argc<2) {
 115     printf("Wrong number of arguments\n");
 116     return -1;
 117   }
 118
 119   /*
 120   TString daterolename(gSystem->Getenv("DATE_ROLE_NAME"));
 121   if ( daterolename == "" ) {
 122     printf("Error: Variable DATE_ROLE_NAME not defined! Exiting ...\n");
 123     return -1;
 124   }
 125   bool inner;
 126   if      ( daterolename.EndsWith("-0") ) inner = true;
 127   else if ( daterolename.EndsWith("-1") ) inner = false;
 128   else {
 129     printf("Error: Variable DATE_ROLE_NAME neither ends with -0 nor -1 (E.g. ldc-TPC-C12-1)! Exiting ...\n");
 130     return -1;
 131   }
 132   */
 133
 134   //AliLog::SetClassDebugLevel("AliTPCRawStreamV3",-5);
 135   AliLog::SetClassDebugLevel("AliRawReaderDate",-5);
 136   AliLog::SetClassDebugLevel("AliTPCAltroMapping",-5);
 137   AliLog::SetModuleDebugLevel("RAW",-5);
 138
 139   /* magic line */
 140   gROOT->GetPluginManager()->AddHandler("TVirtualStreamerInfo",
 141                                         "*",
 142                                         "TStreamerInfo",
 143                                         "RIO",
 144                                         "TStreamerInfo()");
 145
 146   /* declare monitoring program */
 147   int i, status;
 148   status=monitorDeclareMp( __FILE__ );
 149   if (status!=0) {
 150     printf("monitorDeclareMp() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 151     return -1;
 152   }
 153
 154   // variables
 155   AliTPCmapper *mapping = 0;   // The TPC mapping
 156   char localfile[255];
 157   unsigned long32 runNb=0;     // run number
 158   // configuration options
 159   Bool_t timeAnalysis = kTRUE;
 160   Bool_t fastDecoding = kFALSE;
 161
 162   if (!mapping){
 163     /* copy locally the mapping file from daq detector config db */
 164     sprintf(localfile,"./%s",MAPPING_FILE);
 165     status = daqDA_DB_getFile(MAPPING_FILE,localfile);
 166     if (status) {
 167       printf("Failed to get mapping file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", MAPPING_FILE, status);
 168       return -1;
 169     }
 170
 171     /* open the mapping file and retrieve mapping object */
 172     TFile *fileMapping = new TFile(MAPPING_FILE, "read");
 173     mapping = (AliTPCmapper*) fileMapping->Get("tpcMapping");
 174     delete fileMapping;
 175   }
 176
 177   if (mapping == 0) {
 178     printf("Failed to get mapping object from %s.  ...\n", MAPPING_FILE);
 179     return -1;
 180   } else {
 181     printf("Got mapping object from %s\n", MAPPING_FILE);
 182   }
 183
 184   //
 185   // DA configuration from configuration file
 186   //
 187   // retrieve configuration file
 188   sprintf(localfile,"./%s",CONFIG_FILE);
 189   status = daqDA_DB_getFile(CONFIG_FILE,localfile);
 190   if (status) {
 191     printf("Failed to get configuration file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", CONFIG_FILE, status);
 192     return -1;
 193   }
 194   AliTPCConfigDA config(CONFIG_FILE);
 195   // check configuration
 196   Bool_t  skipAmore=kFALSE;
 197
 198   if ( (Int_t)config.GetValue("NoTimeAnalysis") == 1 ) {
 199     printf("WARNING: Time analysis was switched off in the configuration file!\n");
 200     timeAnalysis=kFALSE;
 201   }
 202
 203   if ( (Int_t)config.GetValue("UseFastDecoder") == 1 ){
 204     printf("Info: The fast decoder will be used for the processing.\n");
 205     fastDecoding=kTRUE;
 206   }
 207
 208   if ( config.GetConfigurationMap()->GetValue("SkipAmore") ) {
 209     skipAmore=((TObjString*)config.GetConfigurationMap()->GetValue("SkipAmore"))->GetString().Atoi();
 210     printf("TPCPEDESTALda: Skip Amore set in config\n");
 211   }
 212
 213
 214   // create calibration object
 215   AliTPCCalibPedestal calibPedestal(config.GetConfigurationMap()); // pedestal and noise calibration
 216   calibPedestal.SetAltroMapping(mapping->GetAltroMapping()); // Use altro mapping we got from daqDetDb
 217   calibPedestal.SetTimeAnalysis(timeAnalysis);               // pedestal(t) calibration
 218
 219   //===========================//
 220   // loop over RAW data files //
 221   //==========================//
 222   int nevents=0;
 223   for ( i=1; i<argc; i++ ) {
 224
 225     /* define data source : this is argument i */
 226     printf("Processing file %s\n", argv[i]);
 227     status=monitorSetDataSource( argv[i] );
 228     if (status!=0) {
 229       printf("monitorSetDataSource() failed. Error=%s. Exiting ...\n", monitorDecodeError(status));
 230       return -1;
 231     }
 232
 233     /* read until EOF */
 234     for ( ; ; ) {
 235       struct eventHeaderStruct *event;
 236
 237       /* check shutdown condition */
 238       if (daqDA_checkShutdown()) {break;}
 239
 240       /* get next event (blocking call until timeout) */
 241       status=monitorGetEventDynamic((void **)&event);
 242       if (status==MON_ERR_EOF) {
 243         printf ("End of File %d (%s) detected\n", i, argv[i]);
 244         break; /* end of monitoring file has been reached */
 245       }
 246
 247       if (status!=0) {
 248         printf("monitorGetEventDynamic() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 249         break;
 250       }
 251
 252       /* retry if got no event */
 253       if (event==NULL)
 254         continue;
 255
 256       /* skip start/end of run events */
 257       if ( (event->eventType != physicsEvent) && (event->eventType != calibrationEvent) )
 258         continue;
 259
 260       nevents++;
 261       // get the run number
 262       runNb = event->eventRunNb;
 263       //  Pedestal calibration
 264       calibPedestal.ProcessEvent(event);
 265
 266       /* free resources */
 267       free(event);
 268     }
 269   }
 270
 271   //
 272   // Analyse pedestals and write them to rootfile
 273   //
 274   calibPedestal.Analyse();
 275   calibPedestal.AnalyseTime(nevents);
 276   printf ("%d physics/calibration events processed.\n",nevents);
 277
 278   TFile *fileTPC = new TFile(RESULT_FILE, "recreate");
 279   calibPedestal.Write("tpcCalibPedestal");
 280   delete fileTPC;
 281   printf("Wrote %s.\n",RESULT_FILE);
 282
 283   /* store the result file on FES */
 284   status=daqDA_FES_storeFile(RESULT_FILE,FILE_ID);
 285   if (status) {
 286     status = -2;
 287   }
 288   //
 289   //Send objects to the AMORE DB
 290   //
 291   if (!skipAmore){
 292     printf ("AMORE part\n");
 293     const char *amoreDANameorig=gSystem->Getenv("AMORE_DA_NAME");
 294     //cheet a little -- temporary solution (hopefully)
 295     //
 296     //currently amoreDA uses the environment variable AMORE_DA_NAME to create the mysql
 297     //table in which the calib objects are stored. This table is dropped each time AmoreDA
 298     //is initialised. This of course makes a problem if we would like to store different
 299     //calibration entries in the AMORE DB. Therefore in each DA which writes to the AMORE DB
 300     //the AMORE_DA_NAME env variable is overwritten.
 301
 302     //find processed sector
 303     Char_t sideName='A';
 304     Int_t sector = -1;
 305     for ( Int_t roc = 0; roc < 72; roc++ ) {
 306       if ( !calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc) ) continue;
 307       if (mapping->GetSideFromRoc(roc)==1) sideName='C';
 308       sector = mapping->GetSectorFromRoc(roc);
 309     }
 310   //   gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",Form("TPC-%c%02d-%s",sideName,sector,FILE_ID));
 311     gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",Form("%s-%s",gSystem->Getenv("DATE_ROLE_NAME"),FILE_ID));
 312
 313     //
 314     // end cheet
 315     if (sector>-1){
 316       TDatime time;
 317       TObjString info(Form("Run: %u; Date: %s",runNb,time.AsSQLString()));
 318
 319       amore::da::AmoreDA amoreDA(amore::da::AmoreDA::kSender);
 320       Int_t statusDA=0;
 321       statusDA+=amoreDA.Send("Pedestals",calibPedestal.GetCalPadPedestal());
 322       statusDA+=amoreDA.Send("Noise",calibPedestal.GetCalPadRMS());
 323       statusDA+=amoreDA.Send("Info",&info);
 324       if ( statusDA )
 325         printf("Warning: Failed to write one of the calib objects to the AMORE database\n");
 326     }  else {
 327       printf("Warning: No data found!\n");
 328     }
 329     // reset env var
 330     if (amoreDANameorig) gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",amoreDANameorig);
 331   }
 332
 333   //
 334   // Now prepare ASCII files for local ALTRO configuration through DDL.
 335   //
 336   ofstream pedfile;
 337   ofstream noisefile;
 338   ofstream pedmemfile;
 339   ofstream noisychannelfile;
 340   ofstream verynoisychannelfile;
 341   ofstream deadchannelfile;
 342
 343   pedfile.open(PED_FILE);
 344   noisefile.open(NOISE_FILE);
 345   pedmemfile.open(PEDMEM_FILE);
 346   noisychannelfile.open(NOISY_FILE);
 347   verynoisychannelfile.open(VERYNOISY_FILE);
 348   deadchannelfile.open(DEAD_FILE);
 349
 350   TArrayF **timePed = calibPedestal.GetTimePedestals();  // pedestal values for each time bin
 351
 352   Int_t ctr_channel = 0;
 353   Int_t ctr_altro   = 0;
 354   Int_t ctr_pattern = 0;
 355   Int_t ctr_noisy   = 0;
 356   Int_t ctr_vnoisy  = 0;
 357   Int_t ctr_dead    = 0;
 358
 359   pedfile              << 10 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALS per channel
 360   noisefile            << 11 << std::endl; // Mark file to contain NOISE per altro
 361   pedmemfile           << 12 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALs per time bin
 362   noisychannelfile     << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 363   verynoisychannelfile << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 364   deadchannelfile      << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 365
 366   // inner==true : calROC from ldc-0 contains: rcus 0,1 for IROC and rcu 2 for OROC
 367   // inner==false: calROC from ldc-1 contains: nothing  for IROC and rcus 3,4,5 for OROC
 368   for ( Int_t roc = 0; roc < 72; roc++ ) {
 369     if ( !calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc) ) continue;
 370     bool isIROC  = mapping->IsIROC(roc);
 371     Int_t side   = mapping->GetSideFromRoc(roc);
 372     Int_t sector = mapping->GetSectorFromRoc(roc);
 373     Int_t minrcu, maxrcu;
 374     if      ( isIROC ) { minrcu=0; maxrcu=1; }
 375     //else if ( inner  ) { minrcu=2; maxrcu=2; }
 376     //else               { minrcu=3; maxrcu=5; }
 377     else               { minrcu=2; maxrcu=5; }
 378     for ( int rcu = minrcu; rcu <= maxrcu; rcu++ ) {
 379       //Int_t patch = mapping->IsIROC(roc) ? rcu : rcu+2;
 380       for ( int branch = 0; branch < 2; branch++ ) {
 381         for ( int fec = 0; fec < mapping->GetNfec(rcu, branch); fec++ ) {
 382           for ( int altro = 0; altro < 8; altro++ ) {
 383             Float_t rms = 0.;
 384             Float_t maxrms = 0.;
 385             Float_t ctr_altrochannel = 0.;
 386             for ( int channel = 0; channel < 16; channel++ ) {
 387               Int_t hwadd     = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, channel);
 388               Int_t row       = mapping->GetPadRow(rcu, hwadd);        // row in a ROC
 389               Int_t globalrow = mapping->GetGlobalPadRow(rcu, hwadd);  // row in full sector
 390               Int_t pad       = mapping->GetPad(rcu, hwadd);
 391               Float_t ped     = calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc)->GetValue(row,pad);
 392               // fixed pedestal
 393               pedfile << ctr_channel++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 394                       << hwadd << "\t" << ped << std::endl;
 395               // pedestal(t)=pedestal memories
 396               if ( timePed && fabs(timePed[globalrow][pad].GetSum()) > 1e-10 ) {
 397                 pedmemfile << ctr_pattern++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu
 398                     << "\t" << hwadd;
 399                 for ( Int_t timebin = 0; timebin < 1024; timebin++ )
 400                   pedmemfile << "\t" << timePed[globalrow][pad].At(timebin);
 401                 pedmemfile << std::endl;
 402               }
 403               // rms=noise
 404               Float_t rms2 = calibPedestal.GetCalRocRMS(roc)->GetValue(row,pad);
 405               if ( fabs(ped) < 1.e-10 ) {                        // dead channel
 406                 deadchannelfile << ctr_dead++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 407                                 << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 408               } else if ( (ped > 1.e-10) && (rms2 > 1.e-10) ) {  // not dead
 409                 // Find noisy channels
 410                 if ( rms2 > 6.0 ) { // VERY noisy
 411                   verynoisychannelfile << ctr_vnoisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 412                                        << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 413
 414                 } else if ( ((roc<36)             && (rms2 > 2.0))  ||  // IROC
 415                             ((roc>35) && (row<65) && (rms2 > 2.0))  ||  // OROC, small pads
 416                             ((roc>35) && (row>64) && (rms2 > 3.0)) ) {  // OROC, large pads (50% more signal)
 417                   noisychannelfile << ctr_noisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 418                                    << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 419                 } else {
 420                   // Not noisy. Get average and maximum noise in this ALTRO
 421                   rms += rms2;
 422                   ctr_altrochannel += 1.;
 423                   if (rms2 > maxrms) maxrms = rms2;
 424                 } // end if noisy
 425               } // end if some signal
 426             } // end channel for loop
 427             Int_t hwadd = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, 0);   // ALTRO address
 428             // Noise data (rms) averaged over all channels in this ALTRO.
 429             if ( ctr_altrochannel > 1.e-10 ) {
 430               /*
 431               // average noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 432               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 433               << hwadd << "\t" << rms/ctr_altrochannel << std::endl;
 434               */
 435               // maximum noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 436               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 437                         << hwadd << "\t" << maxrms << std::endl;
 438               ctr_altro++;
 439             }
 440           } // end altro for loop
 441         } // end fec for loop
 442       } // end branch for loop
 443     } // end rcu for loop
 444   } // end roc loop
 445
 446   pedfile.close();
 447   noisefile.close();
 448   pedmemfile.close();
 449   noisychannelfile.close();
 450   verynoisychannelfile.close();
 451   deadchannelfile.close();
 452   printf("Wrote ASCII files. Found %d noisy, %d very noisy and %d dead channels.\n", ctr_noisy, ctr_vnoisy, ctr_dead);
 453
 454   return status;
 455
 456 }