TPC/scripts/filterCorrupted.sh

   1 #!/bin/sh
   2 # 1 argument      - qname
   3
   4 # marian.ivanov@cern.ch
   5 # filter corrupted files
   6 # batch farm internaly used
   7 #
   8 # Assumption - the data organize in the Workspace - predefined directory structure
   9 #            - each directory contain the list of files
  10 #            - raw.txt and esd.txt
  11 # Output:
  12 # esd.txt => esd.txt.Good and esd.txt.Bad
  13 # eaw.txt -> raw.txt.Good and raw.txt.Bad
  14
  15 qname=$1
  16 mydir=`pwd`
  17 for adir in `cat run.list`; do
  18     cd $adir
  19     up=`cat  raw.txt | grep -c .root`
  20     if [ $up -gt 0 ] ; then
  21         echo bsub -q $qname  aliroot -b -q  $ALICE_ROOT/TPC/macros/filterRAW.C
  22         bsub -q $qname  aliroot -b -q  $ALICE_ROOT/TPC/macros/filterRAW.C
  23     fi;
  24     cd $mydir
  25 done
  26
  27 mydir=`pwd`
  28 for adir in `cat run.list`; do
  29     cd $adir
  30     up=`cat  esd.txt | grep -c .root`
  31     if [ $up -gt 1 ] ; then
  32         echo bsub -q $qname  aliroot -b -q  $ALICE_ROOT/TPC/macros/filterESD.C
  33         bsub -q $qname  aliroot -b -q  $ALICE_ROOT/TPC/macros/filterESD.C
  34     fi;
  35     cd $mydir
  36 done
  37
  38