TPC/scripts/submitCalib.sh

   1 #
   2 # Submit calibration in predefined workspace
   3 # argument 1 - runlist
   4 # argument 2 - batch queues
   5 # arument  3 - step
   6 # Assumptions:
   7 # 1. Workspace defined before using the script $ALICE_ROOT/TPC/scripts/makeWorkspace.sh
   8 # 2. The data were filtered before using the $ALICE_ROOT/TPC/scripts/filterCorrupted.sh
   9
  10 runlist=$1
  11 bqueues=$2
  12 step=$3
  13 echo runlist"      "$runlist
  14 echo queues"       "$bqueues
  15 echo step"         "$step
  16 echo
  17 mydir=`pwd`
  18 for adir in `cat $runlist`; do
  19     cd $mydir
  20     up=`cat  $adir/esd.txt.Good | grep -c .root`
  21     if [ $up -gt 1 ] ; then
  22         myvar=0;
  23         cd $adir
  24         echo SUBMITING DIRECTORY $adir
  25         cp ../ConfigOCDB.C .
  26         cp ../CalibrateTPC.C .
  27         rm -rf *_*
  28         rm *.log
  29         rm -rf */V3/
  30         while [ $myvar -le ${up} ] ; do
  31         bsub -q $bqueues  -oo out$myvar.log -eo err$myvar.log $ALICE_ROOT/TPC/scripts/submitCalibJob.sh $myvar $(($myvar+step))  `pwd`/esd.txt.Good $adir;
  32         myvar=$(( $myvar + $step )) ;
  33         echo $myvar ;
  34     done;
  35 fi;
  36 done;