TPC/scripts/submitCalib.sh

   1 #
   2 # Submit calibration in predefined workspace
   3 # argument 1 - runlist
   4 # argument 2 - batch queues
   5 # arument  3 - step
   6 # Assumptions:
   7 # 1. Workspace defined before using the script $ALICE_ROOT/TPC/scripts/makeWorkspace.sh
   8 # 2. The data were filtered before using the $ALICE_ROOT/TPC/scripts/filterCorrupted.sh
   9
  10 runlist=$1
  11 bqueues=$2
  12 step=$3
  13 echo runlist"      "$runlist
  14 echo queues"       "$bqueues
  15 echo step"         "$step
  16 echo
  17 mydir=`pwd`
  18 for adir in `cat $runlist`; do
  19     cd $mydir
  20     #
  21     #remove old data
  22     rm -f *.log
  23     rm -f core*
  24     rm -rf $mydir/$adir/core*
  25     rm -rf $mydir/$adir/*/core*
  26     rm -rf $mydir/$adir/*.root
  27     rm -rf $mydir/$adir/*.log
  28     rm -rf $mydir/$adir/*_*
  29     #end of remove old data
  30     #
  31     up=`cat  $adir/esd.txt.Good | grep -c .root`
  32     if [ $up -gt 0 ] ; then
  33         myvar=0;
  34         cd $adir
  35         echo SUBMITING DIRECTORY $adir
  36         cp ../ConfigOCDB.C .
  37         cp ../CalibrateTPC.C .
  38         while [ $myvar -le ${up} ] ; do
  39         bsub -q $bqueues  -oo out$myvar.log -eo err$myvar.log $ALICE_ROOT/TPC/scripts/submitCalibJob.sh $myvar $(($myvar+step))  `pwd`/esd.txt.Good $adir;
  40         myvar=$(( $myvar + $step )) ;
  41         echo $myvar ;
  42     done;
  43 fi;
  44 done;