]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - TRD/AliTRDrawData.cxx
updates in the cluster error parameterization task
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDrawData.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 //                                                                           //
20 //  TRD raw data conversion class                                            //
21 //                                                                           //
22 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
23
24 #include <TMath.h>
25 #include "TClass.h"
26
27 #include "AliDAQ.h"
28 #include "AliRawDataHeaderSim.h"
29 #include "AliRawReader.h"
30 #include "AliLog.h"
31 #include "AliFstream.h"
32
33 #include "AliTRDrawData.h"
34 #include "AliTRDdigitsManager.h"
35 #include "AliTRDgeometry.h"
36 #include "AliTRDarrayDictionary.h"
37 #include "AliTRDarrayADC.h"
38 #include "AliTRDrawStreamBase.h"
39 #include "AliTRDrawOldStream.h"
40 #include "AliTRDRawStreamV2.h"
41 #include "AliTRDcalibDB.h"
42 #include "AliTRDSignalIndex.h"
43 #include "AliTRDfeeParam.h"
44 #include "AliTRDmcmSim.h"
45
46 ClassImp(AliTRDrawData)
47
48 Int_t AliTRDrawData::fgRawFormatVersion = AliTRDrawData::kRawOldFormat;
49
50 //_____________________________________________________________________________
51 AliTRDrawData::AliTRDrawData()
52   :TObject()
53   ,fGeo(NULL)
54   ,fFee(NULL)
55   ,fNumberOfDDLs(0)
56 {
57   //
58   // Default constructor
59   //
60
61   fFee = AliTRDfeeParam::Instance();
62   fNumberOfDDLs = AliDAQ::NumberOfDdls("TRD");
63
64 }
65
66 //_____________________________________________________________________________
67 AliTRDrawData::AliTRDrawData(const AliTRDrawData &r)
68   :TObject(r)
69   ,fGeo(NULL)
70   ,fFee(NULL)
71   ,fNumberOfDDLs(0)
72 {
73   //
74   // Copy constructor
75   //
76
77   fFee = AliTRDfeeParam::Instance();
78   fNumberOfDDLs = AliDAQ::NumberOfDdls("TRD");
79
80 }
81
82 //_____________________________________________________________________________
83 AliTRDrawData::~AliTRDrawData()
84 {
85   //
86   // Destructor
87   //
88
89 }
90
91 //_____________________________________________________________________________
92 Bool_t AliTRDrawData::Digits2Raw(TTree *digitsTree, TTree *tracks )
93 {
94   //
95   // Initialize necessary parameters and call one
96   // of the raw data simulator selected by SetRawVersion.
97   //
98   // Currently tracklet output is not spported yet and it
99   // will be supported in higher version simulator.
100   //
101
102   AliTRDdigitsManager* digitsManager = new AliTRDdigitsManager();
103
104   if (!digitsManager->ReadDigits(digitsTree)) {
105     delete digitsManager;
106     return kFALSE;
107   }
108
109   if (tracks != NULL) {
110     delete digitsManager;
111     AliError("Tracklet input is not supported yet.");
112     return kFALSE;
113   }
114
115   fGeo = new AliTRDgeometry();
116
117   if (!AliTRDcalibDB::Instance()) {
118     AliError("Could not get calibration object");
119     delete fGeo;
120     delete digitsManager;
121     return kFALSE;
122   }
123
124   Int_t retval = kTRUE;
125   Int_t rv     = fFee->GetRAWversion();
126
127   // Call appropriate Raw Simulator
128   if ( rv > 0 && rv <= 3 ) retval = Digits2Raw(digitsManager); 
129   else {
130     retval = kFALSE;
131     AliWarning(Form("Unsupported raw version (%d).", rv));
132   }
133
134   // Cleanup
135   delete fGeo;
136   delete digitsManager;
137
138   return retval;
139
140 }
141
142 //_____________________________________________________________________________
143 Bool_t AliTRDrawData::Digits2Raw(AliTRDdigitsManager *digitsManager)
144 {
145   //
146   // Raw data simulator for all versions > 0. This is prepared for real data.
147   // This version simulate only raw data with ADC data and not with tracklet.
148   //
149
150   const Int_t kMaxHcWords = (fGeo->TBmax()/3)
151                           * fGeo->ADCmax()
152                           * fGeo->MCMmax()
153                           * fGeo->ROBmaxC1()/2 
154                           + 100 + 20;
155
156   // Buffer to temporary store half chamber data
157   UInt_t     *hcBuffer    = new UInt_t[kMaxHcWords];
158   
159   Bool_t newEvent = kFALSE;  // only for correct readout tree
160
161   // sect is same as iDDL, so I use only sect here.
162   for (Int_t sect = 0; sect < fGeo->Nsector(); sect++) { 
163
164     char name[1024];
165     sprintf(name,"TRD_%d.ddl",sect + AliTRDrawOldStream::kDDLOffset);
166
167     AliFstream* of = new AliFstream(name);
168
169     // Write a dummy data header
170     AliRawDataHeaderSim  header;  // the event header
171     UInt_t hpos = of->Tellp();
172     of->WriteBuffer((char *) (& header), sizeof(header));
173
174     // Reset payload byte size (payload does not include header).
175     Int_t npayloadbyte = 0;
176
177     
178         if ( fgRawFormatVersion == 0 ){
179     // GTU common data header (5x4 bytes per super module, shows link mask)
180     for( Int_t stack = 0; stack < fGeo->Nstack(); stack++ ) {
181       UInt_t gtuCdh = (UInt_t)(0xe << 28);
182       for( Int_t layer = 0; layer < fGeo->Nlayer(); layer++) {
183         Int_t iDet = fGeo->GetDetector(layer, stack, sect);
184         
185         // If chamber status is ok, we assume that the optical link is also OK.
186         // This is shown in the GTU link mask.
187         if ( AliTRDcalibDB::Instance()->GetChamberStatus(iDet) )
188           gtuCdh = gtuCdh | (3 << (2*layer));
189       }
190       of->WriteBuffer((char *) (& gtuCdh), sizeof(gtuCdh));
191       npayloadbyte += 4;
192     }
193         }
194
195     // Prepare chamber data
196     for( Int_t stack = 0; stack < fGeo->Nstack(); stack++) {
197       for( Int_t layer = 0; layer < fGeo->Nlayer(); layer++) {
198
199         Int_t iDet = fGeo->GetDetector(layer,stack,sect);
200         if (iDet == 0) newEvent = kTRUE; // it is expected that each event has at least one tracklet; this is only needed for correct readout tree
201         // Get the digits array
202         AliTRDarrayADC *digits = (AliTRDarrayADC *) digitsManager->GetDigits(iDet);
203         if (digits->HasData() ) {  // second part is new!! and is for indicating a new event
204
205           digits->Expand();
206
207           Int_t hcwords = 0;
208           Int_t rv = fFee->GetRAWversion();
209
210
211         if ( fgRawFormatVersion == 0 ){
212       // Process A side of the chamber
213           if ( rv >= 1 && rv <= 2 ) {
214             hcwords = ProduceHcDataV1andV2(digits,0,iDet,hcBuffer,kMaxHcWords);
215           }
216           if ( rv == 3 ) { 
217    
218               hcwords = ProduceHcDataV3     (digits,0,iDet,hcBuffer,kMaxHcWords,newEvent);
219               //hcwords = ProduceHcDataV3     (digits,0,iDet,hcBuffer,kMaxHcWords);
220             if(newEvent == kTRUE) newEvent = kFALSE;
221           }
222
223           of->WriteBuffer((char *) hcBuffer, hcwords*4);
224           npayloadbyte += hcwords*4;
225
226       // Process B side of the chamber
227           if ( rv >= 1 && rv <= 2 ) {
228             hcwords = ProduceHcDataV1andV2(digits,1,iDet,hcBuffer,kMaxHcWords);
229           }
230           if ( rv >= 3 ) {
231            
232               hcwords = ProduceHcDataV3     (digits,1,iDet,hcBuffer,kMaxHcWords,newEvent);
233               //hcwords = ProduceHcDataV3     (digits,1,iDet,hcBuffer,kMaxHcWords);
234           }
235
236           of->WriteBuffer((char *) hcBuffer, hcwords*4);
237           npayloadbyte += hcwords*4;
238
239         } else { // real data format
240                 // Process A side of the chamber
241                 hcwords = ProduceHcData(digits,0,iDet,hcBuffer,kMaxHcWords,newEvent);
242                 if(newEvent == kTRUE) newEvent = kFALSE;
243         of->WriteBuffer((char *) hcBuffer, hcwords*4);
244         npayloadbyte += hcwords*4;
245                 //for ( Int_t i=0; i<hcwords; i++ ) AliInfo(Form("Buf : %X",hcBuffer[i]));
246
247                 // Process B side of the chamber
248                 hcwords = ProduceHcData(digits,1,iDet,hcBuffer,kMaxHcWords,newEvent);
249         of->WriteBuffer((char *) hcBuffer, hcwords*4);
250         npayloadbyte += hcwords*4;
251         }
252
253         }
254
255       }
256     }
257
258     // Complete header
259     header.fSize = UInt_t(of->Tellp()) - hpos;
260     header.SetAttribute(0);  // Valid data
261     of->Seekp(hpos);         // Rewind to header position
262     of->WriteBuffer((char *) (& header), sizeof(header));
263     delete of;
264   }
265
266   delete [] hcBuffer;
267
268   return kTRUE;
269
270 }
271
272 //_____________________________________________________________________________
273 void AliTRDrawData::ProduceSMIndexData(UInt_t *buf, Int_t& nw){
274         // 
275         // This function generates 
276         //       1) SM index words : ssssssss ssssssss vvvv rrrr r d t mmmmm
277         //          - s : size of SM header (number of header, default = 0x0001)
278         //          - v : SM header version (default = 0xa)
279         //          - r : reserved for future use (default = 00000)
280         //          - d : track data enabled bit (default = 0)
281         //          - t : tracklet data enabled bit (default = 1)
282         //          - m : stack mask (each bit corresponds a stack, default = 11111)
283         //
284         //       2) SM header : rrr c vvvv vvvvvvvv vvvv rrrr bbbbbbbb
285         //          - r : reserved for future use (default = 000)
286         //          - c : clean check out flag (default = 1)
287         //          - v : hardware design revision (default = 0x0404)
288         //          - r : reserved for future use (default = 0x0)
289         //          - b : physical board ID (default = 0x71)
290         //
291         //       3) stack index words : ssssssss ssssssss vvvv mmmm mmmmmmmm
292         //          - s : size of stack header (number of header, (default = 0x0007)
293         //          - v : header version (default = 0xa)
294         //          - m : link mask (default = 0xfff)
295         //
296         //       4) stack header : vvvvvvvv vvvvvvvv bbbbbbbb rrrr rrr c
297         //          - v : hardware design revision (default = 0x0404)
298         //          - b : physical board ID (default = 0x5b)
299         //          - r : reserved for future use (default = 0000 000)
300         //          - c : clean checkout flag (default = 1)
301         //      
302         //       and 6 dummy words(0x00000000)
303         //
304         
305         buf[nw++] = 0x0001a03f; // SM index words
306         buf[nw++] = 0x10404071; // SM header
307
308         for (Int_t istack=0; istack<5; istack++){
309                 buf[nw++] = 0x0007afff; // stack index words
310                 buf[nw++] = 0x04045b01; // stack header
311                 for (Int_t i=0;i<6;i++) buf[nw++] = 0x00000000; // 6 dummy words
312         } // loop over 5 stacks
313
314 }
315
316 //_____________________________________________________________________________
317 Int_t AliTRDrawData::ProduceHcData(AliTRDarrayADC *digits, Int_t side, Int_t det, UInt_t *buf, Int_t maxSize, Bool_t newEvent = kFALSE){
318         //
319         // This function can be used for both ZS and NZS data
320         //
321
322         Int_t           nw = 0;                       // Number of written    words
323         Int_t           of = 0;                       // Number of overflowed words
324         Int_t        layer = fGeo->GetLayer( det );   // Layer
325         Int_t        stack = fGeo->GetStack( det );   // Stack
326         Int_t         sect = fGeo->GetSector( det );  // Sector (=iDDL)
327         Int_t         nRow = fGeo->GetRowMax( layer, stack, sect );
328         Int_t         nCol = fGeo->GetColMax( layer );
329         const Int_t kNTBin = AliTRDcalibDB::Instance()->GetNumberOfTimeBins();
330         Int_t       kCtype = 0;                       // Chamber type (0:C0, 1:C1)
331
332         Bool_t tracklet_on = fFee->GetTracklet();     // **new**   
333
334         // Check the nCol and nRow.
335         if ((nCol == 144) && (nRow == 16 || nRow == 12)) {
336         kCtype = (nRow-12) / 4;
337         } else {
338         AliError(Form("This type of chamber is not supported (nRow=%d, nCol=%d).",nRow,nCol));
339         return 0;
340         }
341
342         AliDebug(1,Form("Producing raw data for sect=%d layer=%d stack=%d side=%d",sect,layer,stack,side));
343
344         AliTRDmcmSim** mcm = new AliTRDmcmSim*[(kCtype + 3)*(fGeo->MCMmax())];
345
346         if (newEvent) ProduceSMIndexData(buf, nw);              // SM index words , Stack index words
347
348         if (!tracklet_on) WriteIntermediateWordsV2(buf,nw,of,maxSize,det,side); // no tracklet or NZS
349  
350         
351         // scanning direction such, that tracklet-words are sorted in ascending z and then in ascending y order
352         // ROB numbering on chamber and MCM numbering on ROB increase with decreasing z and increasing y
353         for (Int_t iRobRow =  (kCtype + 3)-1; iRobRow >= 0; iRobRow-- ) {
354         Int_t iRob = iRobRow * 2 + side;
355         // MCM on one ROB
356         for (Int_t iMcmRB = 0; iMcmRB < fGeo->MCMmax(); iMcmRB++ ) {
357                 Int_t iMcm = 16 - 4*(iMcmRB/4 + 1) + (iMcmRB%4);
358                 Int_t entry = iRobRow*(fGeo->MCMmax()) + iMcm;
359         
360                 mcm[entry] = new AliTRDmcmSim();
361                 mcm[entry]->Init( det, iRob, iMcm , newEvent);
362                 //mcm[entry]->Init( det, iRob, iMcm);
363                 if (newEvent == kTRUE) newEvent = kFALSE; // only one mcm is concerned with new event
364                 Int_t padrow = mcm[entry]->GetRow();
365
366                 // Copy ADC data to MCM simulator
367                 for (Int_t iAdc = 0; iAdc < 21; iAdc++ ) {
368                     Int_t padcol = mcm[entry]->GetCol( iAdc );
369                     if ((padcol >=    0) && (padcol <  nCol)) {
370                                 for (Int_t iT = 0; iT < kNTBin; iT++) { 
371                                   mcm[entry]->SetData( iAdc, iT, digits->GetData( padrow, padcol, iT) );
372                                 } 
373                     } 
374                 else {  // this means it is out of chamber, and masked ADC
375                                 mcm[entry]->SetDataPedestal( iAdc );
376                         }
377                 }
378
379                 // Simulate process in MCM
380                 //              mcm[entry]->Filter();     // Apply filter
381                 //              mcm[entry]->ZSMapping();  // Calculate zero suppression mapping
382                 mcm[entry]->CopyArrays();
383                 mcm[entry]->GeneratefZSM1Dim();
384
385                 if (tracklet_on) {
386                     mcm[entry]->Tracklet(); 
387                     Int_t tempNw =  mcm[entry]->ProduceTrackletStream( &buf[nw], maxSize - nw );
388                     //Int_t tempNw = 0;
389                     if( tempNw < 0 ) {
390                                 of += tempNw;
391                                 nw += maxSize - nw;
392                                 AliError(Form("Buffer overflow detected. Please increase the buffer size and recompile."));
393                     } else {
394                                 nw += tempNw;
395                     }
396                 } else { // no tracklets: write raw-data already in this loop 
397                     // Write MCM data to buffer
398                     Int_t tempNw =  mcm[entry]->ProduceRawStreamV2( &buf[nw], maxSize - nw );
399                     if( tempNw < 0 ) {
400                                 of += tempNw;
401                                 nw += maxSize - nw;
402                                 AliError(Form("Buffer overflow detected. Please increase the buffer size and recompile."));
403                     } else {
404                                 nw += tempNw;
405                     }
406                     
407                     delete mcm[entry];
408                 }
409
410                 //mcm->DumpData( "trdmcmdata.txt", "RFZS" ); // debugging purpose
411         }
412         }
413
414         // if tracklets are switched on, raw-data can be written only after all tracklets
415         if (tracklet_on) {
416         WriteIntermediateWordsV2(buf,nw,of,maxSize,det,side); 
417   
418         // Scan for ROB and MCM
419         for (Int_t iRobRow =  (kCtype + 3)-1; iRobRow >= 0; iRobRow-- ) {
420                 //Int_t iRob = iRobRow * 2 + side;
421                 // MCM on one ROB
422                         for (Int_t iMcmRB = 0; iMcmRB < fGeo->MCMmax(); iMcmRB++ ) {
423                         Int_t iMcm = 16 - 4*(iMcmRB/4 + 1) + (iMcmRB%4);
424               
425                         Int_t entry = iRobRow*(fGeo->MCMmax()) + iMcm; 
426                       
427                         // Write MCM data to buffer
428                         Int_t tempNw =  mcm[entry]->ProduceRawStreamV2( &buf[nw], maxSize - nw );
429                         if( tempNw < 0 ) {
430                                         of += tempNw;
431                                         nw += maxSize - nw;
432                                         AliError(Form("Buffer overflow detected. Please increase the buffer size and recompile."));
433                         } else {
434                                         nw += tempNw;
435                         }
436               
437                       delete mcm[entry];
438           
439                         }       
440         }
441         }
442
443         delete [] mcm;
444   
445         // Write end of raw data marker
446         if (nw < maxSize) {
447         buf[nw++] = kEndofrawdatamarker; 
448         } else {
449         of++;
450         }
451         
452         if (of != 0) {
453         AliError("Buffer overflow. Data is truncated. Please increase buffer size and recompile.");
454         }
455
456         return nw;
457 }
458
459
460 //_____________________________________________________________________________
461 Int_t AliTRDrawData::ProduceHcDataV1andV2(AliTRDarrayADC *digits, Int_t side
462                                         , Int_t det, UInt_t *buf, Int_t maxSize)
463 {
464   //
465   // This function simulates: 1) SM-I commissiong data Oct. 06 (Raw Version == 1).
466   //                          2) Full Raw Production Version   (Raw Version == 2)
467   //
468   // Produce half chamber data (= an ORI data) for the given chamber (det) and side (side)
469   // where
470   //
471   //   side=0 means A side with ROB positions 0, 2, 4, 6.
472   //   side=1 means B side with ROB positions 1, 3, 5, 7.
473   //
474   // Chamber type (C0 orC1) is determined by "det" automatically.
475   // Appropriate size of buffer (*buf) must be prepared prior to calling this function.
476   // Pointer to the buffer and its size must be given to "buf" and "maxSize".
477   // Return value is the number of valid data filled in the buffer in unit of 32 bits
478   // UInt_t words.
479   // If buffer size if too small, the data is truncated with the buffer size however
480   // the function will finish without crash (this behaviour is similar to the MCM).
481   //
482
483   Int_t           nw = 0;                       // Number of written    words
484   Int_t           of = 0;                       // Number of overflowed words
485   Int_t        layer = fGeo->GetLayer( det );   // Layer
486   Int_t        stack = fGeo->GetStack( det );   // Stack
487   Int_t         sect = fGeo->GetSector( det );  // Sector (=iDDL)
488   Int_t         nRow = fGeo->GetRowMax( layer, stack, sect );
489   Int_t         nCol = fGeo->GetColMax( layer );
490   const Int_t kNTBin = AliTRDcalibDB::Instance()->GetNumberOfTimeBins();
491   Int_t       kCtype = 0;                       // Chamber type (0:C0, 1:C1)
492   Int_t          iEv = 0xA;                     // Event ID. Now fixed to 10, how do I get event id?
493   UInt_t           x = 0;                       // General used number
494   Int_t           rv = fFee->GetRAWversion();
495
496   // Check the nCol and nRow.
497   if ((nCol == 144) && 
498       (nRow == 16 || nRow == 12)) {
499     kCtype = (nRow-12) / 4;
500   } 
501   else {
502     AliError(Form("This type of chamber is not supported (nRow=%d, nCol=%d)."
503                  ,nRow,nCol));
504     return 0;
505   }
506
507   AliDebug(1,Form("Producing raw data for sect=%d layer=%d stack=%d side=%d"
508                  ,sect,layer,stack,side));
509
510   // Tracklet should be processed here but not implemented yet
511
512   // Write end of tracklet marker
513   if (nw < maxSize) {
514     buf[nw++] = kEndoftrackletmarker;
515   } 
516   else {
517     of++;
518   }
519
520   // Half Chamber header
521   if      ( rv == 1 ) {
522     // Now it is the same version as used in SM-I commissioning.
523     Int_t  dcs = det+100;      // DCS Serial (in simulation, it is meaningless
524     x = (dcs<<20) | (sect<<15) | (layer<<12) | (stack<<9) | (side<<8) | 1;
525     if (nw < maxSize) {
526       buf[nw++] = x; 
527     }
528     else {
529       of++;
530     }
531   } 
532   else if ( rv == 2 ) {
533     // h[0] (there are 3 HC header)
534     Int_t minorv = 0;      // The minor version number
535     Int_t add    = 2;      // The number of additional header words to follow
536     x = (1<<31) | (rv<<24) | (minorv<<17) | (add<<14) | (sect<<9) | (layer<<6) | (stack<<3) | (side<<2) | 1;
537     if (nw < maxSize) {
538       buf[nw++] = x; 
539     }
540     else {
541       of++;
542     }
543     // h[1]
544     Int_t bcCtr   = 99; // bunch crossing counter. Here it is set to 99 always for no reason
545     Int_t ptCtr   = 15; // pretrigger counter. Here it is set to 15 always for no reason
546     Int_t ptPhase = 11; // pretrigger phase. Here it is set to 11 always for no reason
547     x = (bcCtr<<16) | (ptCtr<<12) | (ptPhase<<8) | ((kNTBin-1)<<2) | 1;
548     if (nw < maxSize) {
549       buf[nw++] = x; 
550     }
551     else {
552       of++;
553     }
554     // h[2]
555     Int_t pedSetup       = 1;    // Pedestal filter setup (0:1). Here it is always 1 for no reason
556     Int_t gainSetup      = 1;    // Gain filter setup (0:1). Here it is always 1 for no reason
557     Int_t tailSetup      = 1;    // Tail filter setup (0:1). Here it is always 1 for no reason
558     Int_t xtSetup        = 0;    // Cross talk filter setup (0:1). Here it is always 0 for no reason
559     Int_t nonlinSetup    = 0;    // Nonlinearity filter setup (0:1). Here it is always 0 for no reason
560     Int_t bypassSetup    = 0;    // Filter bypass (for raw data) setup (0:1). Here it is always 0 for no reason
561     Int_t commonAdditive = 10;   // Digital filter common additive (0:63). Here it is always 10 for no reason
562     x = (pedSetup<<31) | (gainSetup<<30) | (tailSetup<<29) | (xtSetup<<28) | (nonlinSetup<<27)
563       | (bypassSetup<<26) | (commonAdditive<<20) | 1;
564     if (nw < maxSize) {
565       buf[nw++] = x; 
566     }
567     else {
568       of++;
569     }
570   }
571
572   // Scan for ROB and MCM
573   for (Int_t iRobRow = 0; iRobRow < (kCtype + 3); iRobRow++ ) {
574     Int_t iRob = iRobRow * 2 + side;
575     for (Int_t iMcm = 0; iMcm < fGeo->MCMmax(); iMcm++ ) {
576       Int_t padrow = iRobRow * 4 + iMcm / 4;
577
578       // MCM header
579       x = ((iRob * fGeo->MCMmax() + iMcm) << 24) | ((iEv % 0x100000) << 4) | 0xC;
580       if (nw < maxSize) {
581         buf[nw++] = x; 
582       }
583       else {
584         of++;
585       }
586
587       // ADC data
588       for (Int_t iAdc = 0; iAdc < 21; iAdc++ ) {
589         Int_t padcol = fFee->GetPadColFromADC(iRob, iMcm, iAdc);
590         UInt_t aa = !(iAdc & 1) + 2;
591         UInt_t *a = new UInt_t[kNTBin+2];
592         // 3 timebins are packed into one 32 bits word
593         for (Int_t iT = 0; iT < kNTBin; iT+=3) { 
594           if ((padcol >=    0) && (padcol <  nCol)) {
595             a[iT  ] = ((iT    ) < kNTBin ) ? digits->GetData(padrow,padcol,iT    ) : 0;
596             a[iT+1] = ((iT + 1) < kNTBin ) ? digits->GetData(padrow,padcol,iT + 1) : 0;
597             a[iT+2] = ((iT + 2) < kNTBin ) ? digits->GetData(padrow,padcol,iT + 2) : 0; 
598           } 
599           else {
600             a[iT] = a[iT+1] = a[iT+2] = 0; // This happenes at the edge of chamber (should be pedestal! How?)
601           }
602           x = (a[iT+2] << 22) | (a[iT+1] << 12) | (a[iT] << 2) | aa;
603           if (nw < maxSize) {
604             buf[nw++] = x; 
605           }
606           else {
607             of++;
608           }
609         }
610         // Diagnostics
611         Float_t avg = 0;
612         Float_t rms = 0;
613         for (Int_t iT = 0; iT < kNTBin; iT++) {
614           avg += (Float_t) (a[iT]);
615         }
616         avg /= (Float_t) kNTBin;
617         for (Int_t iT = 0; iT < kNTBin; iT++) {
618           rms += ((Float_t) (a[iT]) - avg) * ((Float_t) (a[iT]) - avg);
619         }
620         rms = TMath::Sqrt(rms / (Float_t) kNTBin);
621         if (rms > 1.7) {
622           AliDebug(2,Form("Large RMS (>1.7)  (ROB,MCM,ADC)=(%02d,%02d,%02d), avg=%03.1f, rms=%03.1f"
623                           ,iRob,iMcm,iAdc,avg,rms));
624         }
625         delete [] a;
626       }
627     }
628   }
629
630   // Write end of raw data marker
631   if (nw < maxSize) {
632     buf[nw++] = kEndofrawdatamarker; 
633   }
634   else {
635     of++;
636   }
637   if (of != 0) {
638     AliWarning("Buffer overflow. Data is truncated. Please increase buffer size and recompile.");
639   }
640
641   return nw;
642
643 }
644
645 //_____________________________________________________________________________
646
647 //Int_t AliTRDrawData::ProduceHcDataV3(AliTRDarrayADC *digits, Int_t side , Int_t det, UInt_t *buf, Int_t maxSize)
648 Int_t AliTRDrawData::ProduceHcDataV3(AliTRDarrayADC *digits, Int_t side , Int_t det, UInt_t *buf, Int_t maxSize, Bool_t newEvent = kFALSE)
649 {
650   //
651   // This function simulates: Raw Version == 3 (Zero Suppression Prototype)
652   //
653
654   Int_t           nw = 0;                       // Number of written    words
655   Int_t           of = 0;                       // Number of overflowed words
656   Int_t        layer = fGeo->GetLayer( det );   // Layer
657   Int_t        stack = fGeo->GetStack( det );   // Stack
658   Int_t         sect = fGeo->GetSector( det );  // Sector (=iDDL)
659   Int_t         nRow = fGeo->GetRowMax( layer, stack, sect );
660   Int_t         nCol = fGeo->GetColMax( layer );
661   const Int_t kNTBin = AliTRDcalibDB::Instance()->GetNumberOfTimeBins();
662   Int_t       kCtype = 0;                       // Chamber type (0:C0, 1:C1)
663   //Int_t          iEv = 0xA;                     // Event ID. Now fixed to 10, how do I get event id?
664
665  
666
667   Bool_t tracklet_on = fFee->GetTracklet();     // **new**
668
669   // Check the nCol and nRow.
670   if ((nCol == 144) && 
671       (nRow == 16 || nRow == 12)) {
672     kCtype = (nRow-12) / 4;
673   } 
674   else {
675     AliError(Form("This type of chamber is not supported (nRow=%d, nCol=%d)."
676                  ,nRow,nCol));
677     return 0;
678   }
679
680   AliDebug(1,Form("Producing raw data for sect=%d layer=%d stack=%d side=%d"
681                  ,sect,layer,stack,side));
682
683   AliTRDmcmSim** mcm = new AliTRDmcmSim*[(kCtype + 3)*(fGeo->MCMmax())];
684
685   // in case no tracklet-words are processed: write the tracklet-endmarker as well as all additional words immediately and write 
686   // raw-data in one go; if tracklet-processing is enabled, first all tracklet-words of a half-chamber have to be processed before the
687   // additional words (tracklet-endmarker,headers,...)are written. Raw-data is written in a second loop;
688   
689   if (!tracklet_on) {
690       WriteIntermediateWords(buf,nw,of,maxSize,det,side); 
691   }
692   
693   // Scan for ROB and MCM
694   // scanning direction such, that tracklet-words are sorted in ascending z and then in ascending y order
695   // ROB numbering on chamber and MCM numbering on ROB increase with decreasing z and increasing y
696   for (Int_t iRobRow =  (kCtype + 3)-1; iRobRow >= 0; iRobRow-- ) {
697     Int_t iRob = iRobRow * 2 + side;
698     // MCM on one ROB
699     for (Int_t iMcmRB = 0; iMcmRB < fGeo->MCMmax(); iMcmRB++ ) {
700         Int_t iMcm = 16 - 4*(iMcmRB/4 + 1) + (iMcmRB%4);
701         Int_t entry = iRobRow*(fGeo->MCMmax()) + iMcm;
702         
703         mcm[entry] = new AliTRDmcmSim();
704         mcm[entry]->Init( det, iRob, iMcm , newEvent);
705         //mcm[entry]->Init( det, iRob, iMcm);
706         if (newEvent == kTRUE) newEvent = kFALSE; // only one mcm is concerned with new event
707         Int_t padrow = mcm[entry]->GetRow();
708
709         // Copy ADC data to MCM simulator
710         for (Int_t iAdc = 0; iAdc < 21; iAdc++ ) {
711             Int_t padcol = mcm[entry]->GetCol( iAdc );
712             if ((padcol >=    0) && (padcol <  nCol)) {
713                 for (Int_t iT = 0; iT < kNTBin; iT++) { 
714                   mcm[entry]->SetData( iAdc, iT, digits->GetData( padrow, padcol, iT) );
715                 } 
716             } 
717             else {  // this means it is out of chamber, and masked ADC
718                 mcm[entry]->SetDataPedestal( iAdc );
719             }
720         }
721
722         // Simulate process in MCM
723         //      mcm[entry]->Filter();     // Apply filter
724         //      mcm[entry]->ZSMapping();  // Calculate zero suppression mapping
725         mcm[entry]->CopyArrays();
726         mcm[entry]->GeneratefZSM1Dim();
727
728         if (tracklet_on) {
729             mcm[entry]->Tracklet(); 
730             Int_t tempNw =  mcm[entry]->ProduceTrackletStream( &buf[nw], maxSize - nw );
731             //Int_t tempNw = 0;
732             if( tempNw < 0 ) {
733                 of += tempNw;
734                 nw += maxSize - nw;
735                 AliError(Form("Buffer overflow detected. Please increase the buffer size and recompile."));
736             } else {
737                 nw += tempNw;
738             }
739         }
740         // no tracklets: write raw-data already in this loop
741         else {
742              // Write MCM data to buffer
743             Int_t tempNw =  mcm[entry]->ProduceRawStream( &buf[nw], maxSize - nw );
744             if( tempNw < 0 ) {
745                 of += tempNw;
746                 nw += maxSize - nw;
747                 AliError(Form("Buffer overflow detected. Please increase the buffer size and recompile."));
748             } else {
749                 nw += tempNw;
750             }
751             
752             delete mcm[entry];
753         }
754             
755         
756
757
758         //mcm->DumpData( "trdmcmdata.txt", "RFZS" ); // debugging purpose
759     }
760   }
761
762   // if tracklets are switched on, raw-data can be written only after all tracklets
763   if (tracklet_on) {
764       WriteIntermediateWords(buf,nw,of,maxSize,det,side); 
765   
766   
767       // Scan for ROB and MCM
768       for (Int_t iRobRow =  (kCtype + 3)-1; iRobRow >= 0; iRobRow-- ) {
769           //Int_t iRob = iRobRow * 2 + side;
770           // MCM on one ROB
771           for (Int_t iMcmRB = 0; iMcmRB < fGeo->MCMmax(); iMcmRB++ ) {
772               Int_t iMcm = 16 - 4*(iMcmRB/4 + 1) + (iMcmRB%4);
773               
774               Int_t entry = iRobRow*(fGeo->MCMmax()) + iMcm; 
775               
776               // Write MCM data to buffer
777               Int_t tempNw =  mcm[entry]->ProduceRawStream( &buf[nw], maxSize - nw );
778               if( tempNw < 0 ) {
779                   of += tempNw;
780                   nw += maxSize - nw;
781                   AliError(Form("Buffer overflow detected. Please increase the buffer size and recompile."));
782               } else {
783                   nw += tempNw;
784               }
785               
786               delete mcm[entry];
787           
788           }
789       }
790   }
791
792   delete [] mcm;
793   
794   // Write end of raw data marker
795   if (nw < maxSize) {
796     buf[nw++] = kEndofrawdatamarker; 
797   }
798   else {
799     of++;
800   }
801   if (of != 0) {
802     AliError("Buffer overflow. Data is truncated. Please increase buffer size and recompile.");
803   }
804
805
806   return nw;
807
808 }
809
810 //_____________________________________________________________________________
811 AliTRDdigitsManager *AliTRDrawData::Raw2Digits(AliRawReader *rawReader)
812 {
813   //
814   // Vx of the raw data reading
815   //
816
817   AliTRDarrayADC *digits = 0;
818   AliTRDarrayDictionary *track0 = 0;
819   AliTRDarrayDictionary *track1 = 0;
820   AliTRDarrayDictionary *track2 = 0;  
821
822   //AliTRDSignalIndex *indexes = 0;
823   // Create the digits manager
824   AliTRDdigitsManager* digitsManager = new AliTRDdigitsManager();
825   digitsManager->CreateArrays();
826
827   //AliTRDrawOldStream input(rawReader);
828   //   AliTRDRawStreamV2 input(rawReader);
829   //   input.SetRawVersion( fFee->GetRAWversion() );
830   //   input.Init();
831
832   AliTRDrawStreamBase *pinput = AliTRDrawStreamBase::GetRawStream(rawReader);
833   AliTRDrawStreamBase &input = *pinput;
834   input.SetRawVersion( fFee->GetRAWversion() ); //<= ADDED by MinJung
835
836   AliInfo(Form("Stream version: %s", input.IsA()->GetName()));
837
838   // Loop through the digits
839   Int_t det    = 0;
840
841   while (det >= 0)
842     {
843       det = input.NextChamber(digitsManager);
844       if (det >= 0)
845         {
846           // get...
847           digits = (AliTRDarrayADC *) digitsManager->GetDigits(det);
848           track0 = (AliTRDarrayDictionary *) digitsManager->GetDictionary(det,0);
849           track1 = (AliTRDarrayDictionary *) digitsManager->GetDictionary(det,1);
850           track2 = (AliTRDarrayDictionary *) digitsManager->GetDictionary(det,2);
851           // and compress
852           if (digits) digits->Compress();  
853           if (track0) track0->Compress();   
854           if (track1) track1->Compress();     
855           if (track2) track2->Compress();
856         }
857     }
858
859   delete pinput;
860   pinput = NULL;
861
862   return digitsManager;
863 }
864
865
866 //_____________________________________________________________________________
867 void AliTRDrawData::WriteIntermediateWords(UInt_t* buf, Int_t& nw, Int_t& of, const Int_t& maxSize, const Int_t& det, const Int_t& side) {
868     
869     Int_t        layer = fGeo->GetLayer( det );   // Layer
870     Int_t        stack = fGeo->GetStack( det );   // Stack
871     Int_t         sect = fGeo->GetSector( det );  // Sector (=iDDL)
872     Int_t           rv = fFee->GetRAWversion();
873     const Int_t kNTBin = AliTRDcalibDB::Instance()->GetNumberOfTimeBins();
874     UInt_t           x = 0;
875
876     // Write end of tracklet marker
877     if (nw < maxSize) {
878         buf[nw++] = kEndoftrackletmarker;
879     } 
880     else {
881         of++;
882     }
883     
884   // Half Chamber header
885   // h[0] (there are 3 HC header)
886     Int_t minorv = 0;    // The minor version number
887     Int_t add    = 2;    // The number of additional header words to follow
888     x = (1<<31) | (rv<<24) | (minorv<<17) | (add<<14) | (sect<<9) | (layer<<6) | (stack<<3) | (side<<2) | 1;
889     if (nw < maxSize) {
890         buf[nw++] = x; 
891     }
892     else {
893         of++;
894     }
895     // h[1]
896     Int_t bcCtr   = 99; // bunch crossing counter. Here it is set to 99 always for no reason
897     Int_t ptCtr   = 15; // pretrigger counter. Here it is set to 15 always for no reason
898     Int_t ptPhase = 11; // pretrigger phase. Here it is set to 11 always for no reason
899     x = (bcCtr<<16) | (ptCtr<<12) | (ptPhase<<8) | ((kNTBin-1)<<2) | 1;
900     if (nw < maxSize) {
901         buf[nw++] = x; 
902     }
903     else {
904         of++;
905     }
906     // h[2]
907     Int_t pedSetup       = 1;  // Pedestal filter setup (0:1). Here it is always 1 for no reason
908     Int_t gainSetup      = 1;  // Gain filter setup (0:1). Here it is always 1 for no reason
909     Int_t tailSetup      = 1;  // Tail filter setup (0:1). Here it is always 1 for no reason
910     Int_t xtSetup        = 0;  // Cross talk filter setup (0:1). Here it is always 0 for no reason
911     Int_t nonlinSetup    = 0;  // Nonlinearity filter setup (0:1). Here it is always 0 for no reason
912     Int_t bypassSetup    = 0;  // Filter bypass (for raw data) setup (0:1). Here it is always 0 for no reason
913     Int_t commonAdditive = 10; // Digital filter common additive (0:63). Here it is always 10 for no reason
914     x = (pedSetup<<31) | (gainSetup<<30) | (tailSetup<<29) | (xtSetup<<28) | (nonlinSetup<<27)
915         | (bypassSetup<<26) | (commonAdditive<<20) | 1;
916     if (nw < maxSize) {
917         buf[nw++] = x; 
918     }
919     else {
920         of++;
921     } 
922 }
923
924 //_____________________________________________________________________________
925 void AliTRDrawData::WriteIntermediateWordsV2(UInt_t* buf, Int_t& nw, Int_t& of, const Int_t& maxSize, const Int_t& det, const Int_t& side) {
926     
927     Int_t        layer = fGeo->GetLayer( det );   // Layer
928     Int_t        stack = fGeo->GetStack( det );   // Stack
929     Int_t         sect = fGeo->GetSector( det );  // Sector (=iDDL)
930     Int_t           rv = fFee->GetRAWversion();
931     const Int_t kNTBin = AliTRDcalibDB::Instance()->GetNumberOfTimeBins();
932         Bool_t tracklet_on = fFee->GetTracklet();
933     UInt_t           x = 0;
934
935     // Write end of tracklet marker
936     if (nw < maxSize) buf[nw++] = fgkEndOfTrackletMarker; else of++;
937    
938         // Half Chamber header
939         // h[0] (there are 2 HC headers) xmmm mmmm nnnn nnnq qqss sssp ppcc ci01
940         //      , where  x : Raw version speacial number (=1)
941         //                   m : Raw version major number (test pattern, ZS, disable tracklet, 0, options)
942         //                   n : Raw version minor number
943         //                   q : number of addtional header words (default = 1)
944         //                   s : SM sector number (ALICE numbering)
945         //                   p : plane(layer) number
946         //                       c : chamber(stack) number
947         //                       i : side number (0:A, 1:B)
948         Int_t majorv = 0;       // The major version number 
949     Int_t minorv = 0;   // The minor version number
950     Int_t add    = 1;   // The number of additional header words to follow : now 1, previous 2
951         Int_t TP         = 0;   // test pattern (default=0)
952         Int_t ZS         = (rv==3) ? 1 : 0;                     // zero suppression
953         Int_t DT         = (tracklet_on) ? 0 : 1;       // disable tracklet 
954
955         majorv = (TP<<6) | (ZS<<5) | (DT<<4) | 1;       // major version
956
957     x = (1<<31) | (majorv<<24) | (minorv<<17) | (add<<14) | (sect<<9) | (layer<<6) | (stack<<3) | (side<<2) | 1;
958     if (nw < maxSize) buf[nw++] = x; else of++;
959    
960     // h[1]             tttt ttbb bbbb bbbb bbbb bbpp pphh hh01
961         // , where  t : number of time bins
962         //          b : bunch crossing number
963         //          p : pretrigger counter
964         //          h : pretrigger phase
965     Int_t bcCtr   = 99; // bunch crossing counter. Here it is set to 99 always for no reason
966     Int_t ptCtr   = 15; // pretrigger counter. Here it is set to 15 always for no reason
967     Int_t ptPhase = 11; // pretrigger phase. Here it is set to 11 always for no reason
968     //x = (bcCtr<<16) | (ptCtr<<12) | (ptPhase<<8) | ((kNTBin-1)<<2) | 1;       // old format
969     x = ((kNTBin-1)<<26) | (bcCtr<<10) | (ptCtr<<6) | (ptPhase<<2) | 1;
970     if (nw < maxSize) buf[nw++] = x; else of++;
971   
972 }
973
974 //_____________________________________________________________________________
975 AliTRDdigitsManager *AliTRDrawData::Raw2DigitsOLD(AliRawReader *rawReader)
976 {
977   //
978   // Vx of the raw data reading
979   //
980
981   AliTRDarrayADC *digits = 0;
982   AliTRDarrayDictionary *track0 = 0;
983   AliTRDarrayDictionary *track1 = 0;
984   AliTRDarrayDictionary *track2 = 0; 
985
986   AliTRDSignalIndex *indexes = 0;
987   // Create the digits manager
988   AliTRDdigitsManager* digitsManager = new AliTRDdigitsManager();
989   digitsManager->CreateArrays();
990
991   //AliTRDrawOldStream input(rawReader);
992   AliTRDRawStreamV2 input(rawReader);
993   input.SetRawVersion( fFee->GetRAWversion() );
994   input.Init();
995
996   AliInfo(Form("Stream version: %s", input.IsA()->GetName()));
997
998   // Loop through the digits
999   Int_t lastdet = -1;
1000   Int_t det    = 0;
1001   Int_t it = 0;
1002   while (input.Next()) {
1003
1004       det    = input.GetDet();
1005
1006       if (det != lastdet) { // If new detector found
1007         
1008           lastdet = det;
1009
1010           if (digits) digits->Compress();
1011           if (track0) track0->Compress();       
1012           if (track1) track1->Compress();       
1013           if (track2) track2->Compress();
1014         
1015           // Add a container for the digits of this detector
1016           digits = (AliTRDarrayADC *) digitsManager->GetDigits(det);
1017           track0 = (AliTRDarrayDictionary *) digitsManager->GetDictionary(det,0);
1018           track1 = (AliTRDarrayDictionary *) digitsManager->GetDictionary(det,1);
1019           track2 = (AliTRDarrayDictionary *) digitsManager->GetDictionary(det,2);
1020
1021           // Allocate memory space for the digits buffer
1022           if (digits->GetNtime() == 0) 
1023             {
1024               digits->Allocate(input.GetMaxRow(),input.GetMaxCol(), input.GetNumberOfTimeBins());
1025               track0->Allocate(input.GetMaxRow(),input.GetMaxCol(), input.GetNumberOfTimeBins());
1026               track1->Allocate(input.GetMaxRow(),input.GetMaxCol(), input.GetNumberOfTimeBins());
1027               track2->Allocate(input.GetMaxRow(),input.GetMaxCol(), input.GetNumberOfTimeBins());
1028             }
1029
1030           indexes = digitsManager->GetIndexes(det);
1031           indexes->SetSM(input.GetSM());
1032           indexes->SetStack(input.GetStack());
1033           indexes->SetLayer(input.GetLayer());
1034           indexes->SetDetNumber(det);
1035           if (indexes->IsAllocated() == kFALSE)
1036             indexes->Allocate(input.GetMaxRow(), input.GetMaxCol(), input.GetNumberOfTimeBins());
1037         }
1038     
1039       // 3 timebin data are stored per word
1040       for (it = 0; it < 3; it++)
1041         {
1042           if ( input.GetTimeBin() + it < input.GetNumberOfTimeBins() )
1043             {
1044               if (input.GetSignals()[it] > 0)
1045                 {
1046                   digits->SetData(input.GetRow(), input.GetCol(),input.GetTimeBin() + it, input.GetSignals()[it]);
1047
1048                   indexes->AddIndexTBin(input.GetRow(), input.GetCol(),
1049                                         input.GetTimeBin() + it);
1050                   track0->SetData(input.GetRow(), input.GetCol(), input.GetTimeBin() + it, 0);
1051                   track1->SetData(input.GetRow(), input.GetCol(), input.GetTimeBin() + it, 0);
1052                   track2->SetData(input.GetRow(), input.GetCol(), input.GetTimeBin() + it, 0);
1053                 }
1054             }
1055         }
1056   }
1057
1058   if (digits) digits->Compress();
1059   if (track0) track0->Compress();        
1060   if (track1) track1->Compress();       
1061   if (track2) track2->Compress();
1062
1063   return digitsManager;
1064
1065 }