TRD/AliTRDseedV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 ////
  20 //  The TRD offline tracklet
  21 //
  22 // The running horse of the TRD reconstruction. The following tasks are preformed:
  23 //   1. Clusters attachment to tracks based on prior information stored at tracklet level (see AttachClusters)
  24 //   2. Clusters position recalculation based on track information (see GetClusterXY and Fit)
  25 //   3. Cluster error parametrization recalculation (see Fit)
  26 //   4. Linear track approximation (Fit)
  27 //   5. Optimal position (including z estimate for pad row cross tracklets) and covariance matrix of the track fit inside one TRD chamber (Fit)
  28 //   6. Tilt pad correction and systematic effects (GetCovAt)
  29 //   7. dEdx calculation (CookdEdx)
  30 //   8. PID probabilities estimation (CookPID)
  31 //
  32 //  Authors:                                                              //
  33 //    Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>                                     //
  34 //    Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>                                       //
  35 //                                                                        //
  36 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  37
  38 #include "TMath.h"
  39 #include "TLinearFitter.h"
  40 #include "TClonesArray.h" // tmp
  41 #include <TTreeStream.h>
  42
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliMathBase.h"
  45 #include "AliCDBManager.h"
  46 #include "AliTracker.h"
  47
  48 #include "AliTRDpadPlane.h"
  49 #include "AliTRDcluster.h"
  50 #include "AliTRDseedV1.h"
  51 #include "AliTRDtrackV1.h"
  52 #include "AliTRDcalibDB.h"
  53 #include "AliTRDchamberTimeBin.h"
  54 #include "AliTRDtrackingChamber.h"
  55 #include "AliTRDtrackerV1.h"
  56 #include "AliTRDReconstructor.h"
  57 #include "AliTRDrecoParam.h"
  58 #include "AliTRDCommonParam.h"
  59
  60 #include "Cal/AliTRDCalPID.h"
  61 #include "Cal/AliTRDCalROC.h"
  62 #include "Cal/AliTRDCalDet.h"
  63
  64 ClassImp(AliTRDseedV1)
  65
  66 //____________________________________________________________________
  67 AliTRDseedV1::AliTRDseedV1(Int_t det)
  68   :AliTRDtrackletBase()
  69   ,fReconstructor(0x0)
  70   ,fClusterIter(0x0)
  71   ,fExB(0.)
  72   ,fVD(0.)
  73   ,fT0(0.)
  74   ,fS2PRF(0.)
  75   ,fDiffL(0.)
  76   ,fDiffT(0.)
  77   ,fClusterIdx(0)
  78   ,fN(0)
  79   ,fDet(det)
  80   ,fPt(0.)
  81   ,fdX(0.)
  82   ,fX0(0.)
  83   ,fX(0.)
  84   ,fY(0.)
  85   ,fZ(0.)
  86   ,fS2Y(0.)
  87   ,fS2Z(0.)
  88   ,fC(0.)
  89   ,fChi2(0.)
  90 {
  91   //
  92   // Constructor
  93   //
  94   for(Int_t ic=kNclusters; ic--;) fIndexes[ic] = -1;
  95   memset(fClusters, 0, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
  96   memset(fPad, 0, 3*sizeof(Float_t));
  97   fYref[0] = 0.; fYref[1] = 0.;
  98   fZref[0] = 0.; fZref[1] = 0.;
  99   fYfit[0] = 0.; fYfit[1] = 0.;
 100   fZfit[0] = 0.; fZfit[1] = 0.;
 101   memset(fdEdx, 0, kNslices*sizeof(Float_t));
 102   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) fProb[ispec]  = -1.;
 103   fLabels[0]=-1; fLabels[1]=-1; // most freq MC labels
 104   fLabels[2]=0;  // number of different labels for tracklet
 105   memset(fRefCov, 0, 7*sizeof(Double_t));
 106   // covariance matrix [diagonal]
 107   // default sy = 200um and sz = 2.3 cm
 108   fCov[0] = 4.e-4; fCov[1] = 0.; fCov[2] = 5.3;
 109   SetStandAlone(kFALSE);
 110 }
 111
 112 //____________________________________________________________________
 113 AliTRDseedV1::AliTRDseedV1(const AliTRDseedV1 &ref)
 114   :AliTRDtrackletBase((AliTRDtrackletBase&)ref)
 115   ,fReconstructor(0x0)
 116   ,fClusterIter(0x0)
 117   ,fExB(0.)
 118   ,fVD(0.)
 119   ,fT0(0.)
 120   ,fS2PRF(0.)
 121   ,fDiffL(0.)
 122   ,fDiffT(0.)
 123   ,fClusterIdx(0)
 124   ,fN(0)
 125   ,fDet(-1)
 126   ,fPt(0.)
 127   ,fdX(0.)
 128   ,fX0(0.)
 129   ,fX(0.)
 130   ,fY(0.)
 131   ,fZ(0.)
 132   ,fS2Y(0.)
 133   ,fS2Z(0.)
 134   ,fC(0.)
 135   ,fChi2(0.)
 136 {
 137   //
 138   // Copy Constructor performing a deep copy
 139   //
 140   if(this != &ref){
 141     ref.Copy(*this);
 142   }
 143   SetBit(kOwner, kFALSE);
 144   SetStandAlone(ref.IsStandAlone());
 145 }
 146
 147
 148 //____________________________________________________________________
 149 AliTRDseedV1& AliTRDseedV1::operator=(const AliTRDseedV1 &ref)
 150 {
 151   //
 152   // Assignment Operator using the copy function
 153   //
 154
 155   if(this != &ref){
 156     ref.Copy(*this);
 157   }
 158   SetBit(kOwner, kFALSE);
 159
 160   return *this;
 161 }
 162
 163 //____________________________________________________________________
 164 AliTRDseedV1::~AliTRDseedV1()
 165 {
 166   //
 167   // Destructor. The RecoParam object belongs to the underlying tracker.
 168   //
 169
 170   //printf("I-AliTRDseedV1::~AliTRDseedV1() : Owner[%s]\n", IsOwner()?"YES":"NO");
 171
 172   if(IsOwner()) {
 173     for(int itb=0; itb<kNclusters; itb++){
 174       if(!fClusters[itb]) continue;
 175       //AliInfo(Form("deleting c %p @ %d", fClusters[itb], itb));
 176       delete fClusters[itb];
 177       fClusters[itb] = 0x0;
 178     }
 179   }
 180 }
 181
 182 //____________________________________________________________________
 183 void AliTRDseedV1::Copy(TObject &ref) const
 184 {
 185   //
 186   // Copy function
 187   //
 188
 189   //AliInfo("");
 190   AliTRDseedV1 &target = (AliTRDseedV1 &)ref;
 191
 192   target.fReconstructor = fReconstructor;
 193   target.fClusterIter   = 0x0;
 194   target.fExB           = fExB;
 195   target.fVD            = fVD;
 196   target.fT0            = fT0;
 197   target.fS2PRF         = fS2PRF;
 198   target.fDiffL         = fDiffL;
 199   target.fDiffT         = fDiffT;
 200   target.fClusterIdx    = 0;
 201   target.fN             = fN;
 202   target.fDet           = fDet;
 203   target.fPt            = fPt;
 204   target.fdX            = fdX;
 205   target.fX0            = fX0;
 206   target.fX             = fX;
 207   target.fY             = fY;
 208   target.fZ             = fZ;
 209   target.fS2Y           = fS2Y;
 210   target.fS2Z           = fS2Z;
 211   target.fC             = fC;
 212   target.fChi2          = fChi2;
 213
 214   memcpy(target.fIndexes, fIndexes, kNclusters*sizeof(Int_t));
 215   memcpy(target.fClusters, fClusters, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
 216   memcpy(target.fPad, fPad, 3*sizeof(Float_t));
 217   target.fYref[0] = fYref[0]; target.fYref[1] = fYref[1];
 218   target.fZref[0] = fZref[0]; target.fZref[1] = fZref[1];
 219   target.fYfit[0] = fYfit[0]; target.fYfit[1] = fYfit[1];
 220   target.fZfit[0] = fZfit[0]; target.fZfit[1] = fZfit[1];
 221   memcpy(target.fdEdx, fdEdx, kNslices*sizeof(Float_t));
 222   memcpy(target.fProb, fProb, AliPID::kSPECIES*sizeof(Float_t));
 223   memcpy(target.fLabels, fLabels, 3*sizeof(Int_t));
 224   memcpy(target.fRefCov, fRefCov, 7*sizeof(Double_t));
 225   memcpy(target.fCov, fCov, 3*sizeof(Double_t));
 226
 227   TObject::Copy(ref);
 228 }
 229
 230
 231 //____________________________________________________________
 232 Bool_t AliTRDseedV1::Init(AliTRDtrackV1 *track)
 233 {
 234 // Initialize this tracklet using the track information
 235 //
 236 // Parameters:
 237 //   track - the TRD track used to initialize the tracklet
 238 //
 239 // Detailed description
 240 // The function sets the starting point and direction of the
 241 // tracklet according to the information from the TRD track.
 242 //
 243 // Caution
 244 // The TRD track has to be propagated to the beginning of the
 245 // chamber where the tracklet will be constructed
 246 //
 247
 248   Double_t y, z;
 249   if(!track->GetProlongation(fX0, y, z)) return kFALSE;
 250   Update(track);
 251   return kTRUE;
 252 }
 253
 254
 255 //_____________________________________________________________________________
 256 void AliTRDseedV1::Reset()
 257 {
 258   //
 259   // Reset seed
 260   //
 261   fExB=0.;fVD=0.;fT0=0.;fS2PRF=0.;
 262   fDiffL=0.;fDiffT=0.;
 263   fClusterIdx=0;
 264   fN=0;
 265   fDet=-1;
 266   fPt=0.;
 267   fdX=0.;fX0=0.; fX=0.; fY=0.; fZ=0.;
 268   fS2Y=0.; fS2Z=0.;
 269   fC=0.; fChi2 = 0.;
 270
 271   for(Int_t ic=kNclusters; ic--;) fIndexes[ic] = -1;
 272   memset(fClusters, 0, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
 273   memset(fPad, 0, 3*sizeof(Float_t));
 274   fYref[0] = 0.; fYref[1] = 0.;
 275   fZref[0] = 0.; fZref[1] = 0.;
 276   fYfit[0] = 0.; fYfit[1] = 0.;
 277   fZfit[0] = 0.; fZfit[1] = 0.;
 278   memset(fdEdx, 0, kNslices*sizeof(Float_t));
 279   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) fProb[ispec]  = -1.;
 280   fLabels[0]=-1; fLabels[1]=-1; // most freq MC labels
 281   fLabels[2]=0;  // number of different labels for tracklet
 282   memset(fRefCov, 0, 7*sizeof(Double_t));
 283   // covariance matrix [diagonal]
 284   // default sy = 200um and sz = 2.3 cm
 285   fCov[0] = 4.e-4; fCov[1] = 0.; fCov[2] = 5.3;
 286 }
 287
 288 //____________________________________________________________________
 289 void AliTRDseedV1::Update(const AliTRDtrackV1 *trk)
 290 {
 291   // update tracklet reference position from the TRD track
 292
 293   Double_t fSnp = trk->GetSnp();
 294   Double_t fTgl = trk->GetTgl();
 295   fPt = trk->Pt();
 296   Double_t norm =1./TMath::Sqrt(1. - fSnp*fSnp);
 297   fYref[1] = fSnp*norm;
 298   fZref[1] = fTgl*norm;
 299   SetCovRef(trk->GetCovariance());
 300
 301   Double_t dx = trk->GetX() - fX0;
 302   fYref[0] = trk->GetY() - dx*fYref[1];
 303   fZref[0] = trk->GetZ() - dx*fZref[1];
 304 }
 305
 306 //_____________________________________________________________________________
 307 void AliTRDseedV1::UpdateUsed()
 308 {
 309   //
 310   // Calculate number of used clusers in the tracklet
 311   //
 312
 313   Int_t nused = 0, nshared = 0;
 314   for (Int_t i = kNclusters; i--; ) {
 315     if (!fClusters[i]) continue;
 316     if(fClusters[i]->IsUsed()){
 317       nused++;
 318     } else if(fClusters[i]->IsShared()){
 319       if(IsStandAlone()) nused++;
 320       else nshared++;
 321     }
 322   }
 323   SetNUsed(nused);
 324   SetNShared(nshared);
 325 }
 326
 327 //_____________________________________________________________________________
 328 void AliTRDseedV1::UseClusters()
 329 {
 330   //
 331   // Use clusters
 332   //
 333   // In stand alone mode:
 334   // Clusters which are marked as used or shared from another track are
 335   // removed from the tracklet
 336   //
 337   // In barrel mode:
 338   // - Clusters which are used by another track become shared
 339   // - Clusters which are attached to a kink track become shared
 340   //
 341   AliTRDcluster **c = &fClusters[0];
 342   for (Int_t ic=kNclusters; ic--; c++) {
 343     if(!(*c)) continue;
 344     if(IsStandAlone()){
 345       if((*c)->IsShared() || (*c)->IsUsed()){
 346         if((*c)->IsShared()) SetNShared(GetNShared()-1);
 347         else SetNUsed(GetNUsed()-1);
 348         (*c) = 0x0;
 349         fIndexes[ic] = -1;
 350         SetN(GetN()-1);
 351         continue;
 352       }
 353     } else {
 354       if((*c)->IsUsed() || IsKink()){
 355         (*c)->SetShared();
 356         continue;
 357       }
 358     }
 359     (*c)->Use();
 360   }
 361 }
 362
 363
 364
 365 //____________________________________________________________________
 366 void AliTRDseedV1::CookdEdx(Int_t nslices)
 367 {
 368 // Calculates average dE/dx for all slices and store them in the internal array fdEdx.
 369 //
 370 // Parameters:
 371 //  nslices : number of slices for which dE/dx should be calculated
 372 // Output:
 373 //  store results in the internal array fdEdx. This can be accessed with the method
 374 //  AliTRDseedV1::GetdEdx()
 375 //
 376 // Detailed description
 377 // Calculates average dE/dx for all slices. Depending on the PID methode
 378 // the number of slices can be 3 (LQ) or 8(NN).
 379 // The calculation of dQ/dl are done using the tracklet fit results (see AliTRDseedV1::GetdQdl(Int_t))
 380 //
 381 // The following effects are included in the calculation:
 382 // 1. calibration values for t0 and vdrift (using x coordinate to calculate slice)
 383 // 2. cluster sharing (optional see AliTRDrecoParam::SetClusterSharing())
 384 // 3. cluster size
 385 //
 386
 387   Int_t nclusters[kNslices];
 388   memset(nclusters, 0, kNslices*sizeof(Int_t));
 389   memset(fdEdx, 0, kNslices*sizeof(Float_t));
 390
 391   const Double_t kDriftLength = (.5 * AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
 392
 393   AliTRDcluster *c = 0x0;
 394   for(int ic=0; ic<AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); ic++){
 395     if(!(c = fClusters[ic]) && !(c = fClusters[ic+kNtb])) continue;
 396     Float_t dx = TMath::Abs(fX0 - c->GetX());
 397
 398     // Filter clusters for dE/dx calculation
 399
 400     // 1.consider calibration effects for slice determination
 401     Int_t slice;
 402     if(dx<kDriftLength){ // TODO should be replaced by c->IsInChamber()
 403       slice = Int_t(dx * nslices / kDriftLength);
 404     } else slice = c->GetX() < fX0 ? nslices-1 : 0;
 405
 406
 407     // 2. take sharing into account
 408     Float_t w = /*c->IsShared() ? .5 :*/ 1.;
 409
 410     // 3. take into account large clusters TODO
 411     //w *= c->GetNPads() > 3 ? .8 : 1.;
 412
 413     //CHECK !!!
 414     fdEdx[slice]   += w * GetdQdl(ic); //fdQdl[ic];
 415     nclusters[slice]++;
 416   } // End of loop over clusters
 417
 418   //if(fReconstructor->GetPIDMethod() == AliTRDReconstructor::kLQPID){
 419   if(nslices == AliTRDpidUtil::kLQslices){
 420   // calculate mean charge per slice (only LQ PID)
 421     for(int is=0; is<nslices; is++){
 422       if(nclusters[is]) fdEdx[is] /= nclusters[is];
 423     }
 424   }
 425 }
 426
 427 //_____________________________________________________________________________
 428 void AliTRDseedV1::CookLabels()
 429 {
 430   //
 431   // Cook 2 labels for seed
 432   //
 433
 434   Int_t labels[200];
 435   Int_t out[200];
 436   Int_t nlab = 0;
 437   for (Int_t i = 0; i < kNclusters; i++) {
 438     if (!fClusters[i]) continue;
 439     for (Int_t ilab = 0; ilab < 3; ilab++) {
 440       if (fClusters[i]->GetLabel(ilab) >= 0) {
 441         labels[nlab] = fClusters[i]->GetLabel(ilab);
 442         nlab++;
 443       }
 444     }
 445   }
 446
 447   fLabels[2] = AliMathBase::Freq(nlab,labels,out,kTRUE);
 448   fLabels[0] = out[0];
 449   if ((fLabels[2]  > 1) && (out[3] > 1)) fLabels[1] = out[2];
 450 }
 451
 452
 453 //____________________________________________________________________
 454 Float_t AliTRDseedV1::GetdQdl(Int_t ic, Float_t *dl) const
 455 {
 456 // Using the linear approximation of the track inside one TRD chamber (TRD tracklet)
 457 // the charge per unit length can be written as:
 458 // BEGIN_LATEX
 459 // #frac{dq}{dl} = #frac{q_{c}}{dx * #sqrt{1 + #(){#frac{dy}{dx}}^{2}_{fit} + #(){#frac{dz}{dx}}^{2}_{ref}}}
 460 // END_LATEX
 461 // where qc is the total charge collected in the current time bin and dx is the length
 462 // of the time bin.
 463 // The following correction are applied :
 464 //   - charge : pad row cross corrections
 465 //              [diffusion and TRF assymetry] TODO
 466 //   - dx     : anisochronity, track inclination - see Fit and AliTRDcluster::GetXloc()
 467 //              and AliTRDcluster::GetYloc() for the effects taken into account
 468 //
 469 //Begin_Html
 470 //<img src="TRD/trackletDQDT.gif">
 471 //End_Html
 472 // In the picture the energy loss measured on the tracklet as a function of drift time [left] and respectively
 473 // drift length [right] for different particle species is displayed.
 474 // Author : Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 475 //
 476   Float_t dq = 0.;
 477   // check whether both clusters are inside the chamber
 478   Bool_t hasClusterInChamber = kFALSE;
 479   if(fClusters[ic] && fClusters[ic]->IsInChamber()){
 480     hasClusterInChamber = kTRUE;
 481     dq += TMath::Abs(fClusters[ic]->GetQ());
 482   }else if(fClusters[ic+kNtb] && fClusters[ic+kNtb]->IsInChamber()){
 483     hasClusterInChamber = kTRUE;
 484     dq += TMath::Abs(fClusters[ic+kNtb]->GetQ());
 485   }
 486   if(!hasClusterInChamber) return 0.;
 487   if(dq<1.e-3) return 0.;
 488
 489   Double_t dx = fdX;
 490   if(ic-1>=0 && ic+1<kNtb){
 491     Float_t x2(0.), x1(0.);
 492     // try to estimate upper radial position (find the cluster which is inside the chamber)
 493     if(fClusters[ic-1] && fClusters[ic-1]->IsInChamber()) x2 = fClusters[ic-1]->GetX();
 494     else if(fClusters[ic-1+kNtb] && fClusters[ic-1+kNtb]->IsInChamber()) x2 = fClusters[ic-1+kNtb]->GetX();
 495     else if(fClusters[ic] && fClusters[ic]->IsInChamber()) x2 = fClusters[ic]->GetX()+fdX;
 496     else x2 = fClusters[ic+kNtb]->GetX()+fdX;
 497     // try to estimate lower radial position (find the cluster which is inside the chamber)
 498     if(fClusters[ic+1] && fClusters[ic+1]->IsInChamber()) x1 = fClusters[ic+1]->GetX();
 499     else if(fClusters[ic+1+kNtb] && fClusters[ic+1+kNtb]->IsInChamber()) x1 = fClusters[ic+1+kNtb]->GetX();
 500     else if(fClusters[ic] && fClusters[ic]->IsInChamber()) x1 = fClusters[ic]->GetX()-fdX;
 501     else x1 = fClusters[ic+kNtb]->GetX()-fdX;
 502
 503     dx = .5*(x2 - x1);
 504   }
 505   dx *= TMath::Sqrt(1. + fYfit[1]*fYfit[1] + fZref[1]*fZref[1]);
 506   if(dl) (*dl) = dx;
 507   return dq/dx;
 508 }
 509
 510 //____________________________________________________________
 511 Float_t AliTRDseedV1::GetMomentum(Float_t *err) const
 512 {
 513 // Returns momentum of the track after update with the current tracklet as:
 514 // BEGIN_LATEX
 515 // p=#frac{1}{1/p_{t}} #sqrt{1+tgl^{2}}
 516 // END_LATEX
 517 // and optionally the momentum error (if err is not null).
 518 // The estimated variance of the momentum is given by:
 519 // BEGIN_LATEX
 520 // #sigma_{p}^{2} = (#frac{dp}{dp_{t}})^{2} #sigma_{p_{t}}^{2}+(#frac{dp}{dtgl})^{2} #sigma_{tgl}^{2}+2#frac{dp}{dp_{t}}#frac{dp}{dtgl} cov(tgl,1/p_{t})
 521 // END_LATEX
 522 // which can be simplified to
 523 // BEGIN_LATEX
 524 // #sigma_{p}^{2} = p^{2}p_{t}^{4}tgl^{2}#sigma_{tgl}^{2}-2p^{2}p_{t}^{3}tgl cov(tgl,1/p_{t})+p^{2}p_{t}^{2}#sigma_{1/p_{t}}^{2}
 525 // END_LATEX
 526 //
 527
 528   Double_t p = fPt*TMath::Sqrt(1.+fZref[1]*fZref[1]);
 529   Double_t p2 = p*p;
 530   Double_t tgl2 = fZref[1]*fZref[1];
 531   Double_t pt2 = fPt*fPt;
 532   if(err){
 533     Double_t s2 =
 534       p2*tgl2*pt2*pt2*fRefCov[4]
 535      -2.*p2*fZref[1]*fPt*pt2*fRefCov[5]
 536      +p2*pt2*fRefCov[6];
 537     (*err) = TMath::Sqrt(s2);
 538   }
 539   return p;
 540 }
 541
 542
 543 //____________________________________________________________________
 544 Float_t* AliTRDseedV1::GetProbability(Bool_t force)
 545 {
 546   if(!force) return &fProb[0];
 547   if(!CookPID()) return 0x0;
 548   return &fProb[0];
 549 }
 550
 551 //____________________________________________________________
 552 Bool_t AliTRDseedV1::CookPID()
 553 {
 554 // Fill probability array for tracklet from the DB.
 555 //
 556 // Parameters
 557 //
 558 // Output
 559 //   returns pointer to the probability array and 0x0 if missing DB access
 560 //
 561 // Detailed description
 562
 563
 564   // retrive calibration db
 565   AliTRDcalibDB *calibration = AliTRDcalibDB::Instance();
 566   if (!calibration) {
 567     AliError("No access to calibration data");
 568     return kFALSE;
 569   }
 570
 571   if (!fReconstructor) {
 572     AliError("Reconstructor not set.");
 573     return kFALSE;
 574   }
 575
 576   // Retrieve the CDB container class with the parametric detector response
 577   const AliTRDCalPID *pd = calibration->GetPIDObject(fReconstructor->GetPIDMethod());
 578   if (!pd) {
 579     AliError("No access to AliTRDCalPID object");
 580     return kFALSE;
 581   }
 582   //AliInfo(Form("Method[%d] : %s", fReconstructor->GetRecoParam() ->GetPIDMethod(), pd->IsA()->GetName()));
 583
 584   // calculate tracklet length TO DO
 585   Float_t length = (AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
 586   /// TMath::Sqrt((1.0 - fSnp[iPlane]*fSnp[iPlane]) / (1.0 + fTgl[iPlane]*fTgl[iPlane]));
 587
 588   //calculate dE/dx
 589   CookdEdx(fReconstructor->GetNdEdxSlices());
 590
 591   // Sets the a priori probabilities
 592   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) {
 593     fProb[ispec] = pd->GetProbability(ispec, GetMomentum(), &fdEdx[0], length, GetPlane());
 594   }
 595
 596   return kTRUE;
 597 }
 598
 599 //____________________________________________________________________
 600 Float_t AliTRDseedV1::GetQuality(Bool_t kZcorr) const
 601 {
 602   //
 603   // Returns a quality measurement of the current seed
 604   //
 605
 606   Float_t zcorr = kZcorr ? GetTilt() * (fZfit[0] - fZref[0]) : 0.;
 607   return
 608       .5 * TMath::Abs(18.0 - GetN())
 609     + 10.* TMath::Abs(fYfit[1] - fYref[1])
 610     + 5. * TMath::Abs(fYfit[0] - fYref[0] + zcorr)
 611     + 2. * TMath::Abs(fZfit[0] - fZref[0]) / GetPadLength();
 612 }
 613
 614 //____________________________________________________________________
 615 void AliTRDseedV1::GetCovAt(Double_t x, Double_t *cov) const
 616 {
 617 // Computes covariance in the y-z plane at radial point x (in tracking coordinates)
 618 // and returns the results in the preallocated array cov[3] as :
 619 //   cov[0] = Var(y)
 620 //   cov[1] = Cov(yz)
 621 //   cov[2] = Var(z)
 622 //
 623 // Details
 624 //
 625 // For the linear transformation
 626 // BEGIN_LATEX
 627 // Y = T_{x} X^{T}
 628 // END_LATEX
 629 //   The error propagation has the general form
 630 // BEGIN_LATEX
 631 // C_{Y} = T_{x} C_{X} T_{x}^{T}
 632 // END_LATEX
 633 //  We apply this formula 2 times. First to calculate the covariance of the tracklet
 634 // at point x we consider:
 635 // BEGIN_LATEX
 636 // T_{x} = (1 x); X=(y0 dy/dx); C_{X}=#(){#splitline{Var(y0) Cov(y0, dy/dx)}{Cov(y0, dy/dx) Var(dy/dx)}}
 637 // END_LATEX
 638 // and secondly to take into account the tilt angle
 639 // BEGIN_LATEX
 640 // T_{#alpha} = #(){#splitline{cos(#alpha) __ sin(#alpha)}{-sin(#alpha) __ cos(#alpha)}}; X=(y z); C_{X}=#(){#splitline{Var(y)    0}{0   Var(z)}}
 641 // END_LATEX
 642 //
 643 // using simple trigonometrics one can write for this last case
 644 // BEGIN_LATEX
 645 // C_{Y}=#frac{1}{1+tg^{2}#alpha} #(){#splitline{(#sigma_{y}^{2}+tg^{2}#alpha#sigma_{z}^{2}) __ tg#alpha(#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})}{tg#alpha(#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2}) __ (#sigma_{z}^{2}+tg^{2}#alpha#sigma_{y}^{2})}}
 646 // END_LATEX
 647 // which can be aproximated for small alphas (2 deg) with
 648 // BEGIN_LATEX
 649 // C_{Y}=#(){#splitline{#sigma_{y}^{2} __ (#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})tg#alpha}{((#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})tg#alpha __ #sigma_{z}^{2}}}
 650 // END_LATEX
 651 //
 652 // before applying the tilt rotation we also apply systematic uncertainties to the tracklet
 653 // position which can be tunned from outside via the AliTRDrecoParam::SetSysCovMatrix(). They might
 654 // account for extra misalignment/miscalibration uncertainties.
 655 //
 656 // Author :
 657 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 658 // Date : Jan 8th 2009
 659 //
 660
 661
 662   Double_t xr     = fX0-x;
 663   Double_t sy2    = fCov[0] +2.*xr*fCov[1] + xr*xr*fCov[2];
 664   Double_t sz2    = fS2Z;
 665   //GetPadLength()*GetPadLength()/12.;
 666
 667   // insert systematic uncertainties
 668   if(fReconstructor){
 669     Double_t sys[15]; memset(sys, 0, 15*sizeof(Double_t));
 670     fReconstructor->GetRecoParam()->GetSysCovMatrix(sys);
 671     sy2 += sys[0];
 672     sz2 += sys[1];
 673   }
 674   // rotate covariance matrix
 675   Double_t t2 = GetTilt()*GetTilt();
 676   Double_t correction = 1./(1. + t2);
 677   cov[0] = (sy2+t2*sz2)*correction;
 678   cov[1] = GetTilt()*(sz2 - sy2)*correction;
 679   cov[2] = (t2*sy2+sz2)*correction;
 680
 681   //printf("C(%6.1f %+6.3f %6.1f)  [%s]\n", 1.e4*TMath::Sqrt(cov[0]), cov[1], 1.e4*TMath::Sqrt(cov[2]), IsRowCross()?" RC ":"-");
 682 }
 683
 684 //____________________________________________________________
 685 Double_t AliTRDseedV1::GetCovSqrt(Double_t *c, Double_t *d)
 686 {
 687 // Helper function to calculate the square root of the covariance matrix.
 688 // The input matrix is stored in the vector c and the result in the vector d.
 689 // Both arrays have to be initialized by the user with at least 3 elements. Return negative in case of failure.
 690 //
 691 // For calculating the square root of the symmetric matrix c
 692 // the following relation is used:
 693 // BEGIN_LATEX
 694 // C^{1/2} = VD^{1/2}V^{-1}
 695 // END_LATEX
 696 // with V being the matrix with the n eigenvectors as columns.
 697 // In case C is symmetric the followings are true:
 698 //   - matrix D is diagonal with the diagonal given by the eigenvalues of C
 699 //   - V = V^{-1}
 700 //
 701 // Author A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 702 // Date   Mar 19 2009
 703
 704   Double_t L[2], // eigenvalues
 705            V[3]; // eigenvectors
 706   // the secular equation and its solution :
 707   // (c[0]-L)(c[2]-L)-c[1]^2 = 0
 708   // L^2 - L*Tr(c)+DET(c) = 0
 709   // L12 = [Tr(c) +- sqrt(Tr(c)^2-4*DET(c))]/2
 710   Double_t Tr = c[0]+c[2],           // trace
 711           DET = c[0]*c[2]-c[1]*c[1]; // determinant
 712   if(TMath::Abs(DET)<1.e-20) return -1.;
 713   Double_t DD = TMath::Sqrt(Tr*Tr - 4*DET);
 714   L[0] = .5*(Tr + DD);
 715   L[1] = .5*(Tr - DD);
 716   if(L[0]<0. || L[1]<0.) return -1.;
 717
 718   // the sym V matrix
 719   // | v00   v10|
 720   // | v10   v11|
 721   Double_t tmp = (L[0]-c[0])/c[1];
 722   V[0] = TMath::Sqrt(1./(tmp*tmp+1));
 723   V[1] = tmp*V[0];
 724   V[2] = V[1]*c[1]/(L[1]-c[2]);
 725   // the VD^{1/2}V is:
 726   L[0] = TMath::Sqrt(L[0]); L[1] = TMath::Sqrt(L[1]);
 727   d[0] = V[0]*V[0]*L[0]+V[1]*V[1]*L[1];
 728   d[1] = V[0]*V[1]*L[0]+V[1]*V[2]*L[1];
 729   d[2] = V[1]*V[1]*L[0]+V[2]*V[2]*L[1];
 730
 731   return 1.;
 732 }
 733
 734 //____________________________________________________________
 735 Double_t AliTRDseedV1::GetCovInv(Double_t *c, Double_t *d)
 736 {
 737 // Helper function to calculate the inverse of the covariance matrix.
 738 // The input matrix is stored in the vector c and the result in the vector d.
 739 // Both arrays have to be initialized by the user with at least 3 elements
 740 // The return value is the determinant or 0 in case of singularity.
 741 //
 742 // Author A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 743 // Date   Mar 19 2009
 744
 745   Double_t Det = c[0]*c[2] - c[1]*c[1];
 746   if(TMath::Abs(Det)<1.e-20) return 0.;
 747   Double_t InvDet = 1./Det;
 748   d[0] = c[2]*InvDet;
 749   d[1] =-c[1]*InvDet;
 750   d[2] = c[0]*InvDet;
 751   return Det;
 752 }
 753
 754 //____________________________________________________________________
 755 UShort_t AliTRDseedV1::GetVolumeId() const
 756 {
 757   Int_t ic=0;
 758   while(ic<kNclusters && !fClusters[ic]) ic++;
 759   return fClusters[ic] ? fClusters[ic]->GetVolumeId() : 0;
 760 }
 761
 762
 763 //____________________________________________________________________
 764 void AliTRDseedV1::Calibrate()
 765 {
 766 // Retrieve calibration and position parameters from OCDB.
 767 // The following information are used
 768 //  - detector index
 769 //  - column and row position of first attached cluster. If no clusters are attached
 770 // to the tracklet a random central chamber position (c=70, r=7) will be used.
 771 //
 772 // The following information is cached in the tracklet
 773 //   t0 (trigger delay)
 774 //   drift velocity
 775 //   PRF width
 776 //   omega*tau = tg(a_L)
 777 //   diffusion coefficients (longitudinal and transversal)
 778 //
 779 // Author :
 780 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 781 // Date : Jan 8th 2009
 782 //
 783
 784   AliCDBManager *cdb = AliCDBManager::Instance();
 785   if(cdb->GetRun() < 0){
 786     AliError("OCDB manager not properly initialized");
 787     return;
 788   }
 789
 790   AliTRDcalibDB *calib = AliTRDcalibDB::Instance();
 791   AliTRDCalROC  *vdROC = calib->GetVdriftROC(fDet),
 792                 *t0ROC = calib->GetT0ROC(fDet);;
 793   const AliTRDCalDet *vdDet = calib->GetVdriftDet();
 794   const AliTRDCalDet *t0Det = calib->GetT0Det();
 795
 796   Int_t col = 70, row = 7;
 797   AliTRDcluster **c = &fClusters[0];
 798   if(GetN()){
 799     Int_t ic = 0;
 800     while (ic<kNclusters && !(*c)){ic++; c++;}
 801     if(*c){
 802       col = (*c)->GetPadCol();
 803       row = (*c)->GetPadRow();
 804     }
 805   }
 806
 807   fT0    = t0Det->GetValue(fDet) + t0ROC->GetValue(col,row);
 808   fVD    = vdDet->GetValue(fDet) * vdROC->GetValue(col, row);
 809   fS2PRF = calib->GetPRFWidth(fDet, col, row); fS2PRF *= fS2PRF;
 810   fExB   = AliTRDCommonParam::Instance()->GetOmegaTau(fVD);
 811   AliTRDCommonParam::Instance()->GetDiffCoeff(fDiffL,
 812   fDiffT, fVD);
 813   SetBit(kCalib, kTRUE);
 814 }
 815
 816 //____________________________________________________________________
 817 void AliTRDseedV1::SetOwner()
 818 {
 819   //AliInfo(Form("own [%s] fOwner[%s]", own?"YES":"NO", fOwner?"YES":"NO"));
 820
 821   if(TestBit(kOwner)) return;
 822   for(int ic=0; ic<kNclusters; ic++){
 823     if(!fClusters[ic]) continue;
 824     fClusters[ic] = new AliTRDcluster(*fClusters[ic]);
 825   }
 826   SetBit(kOwner);
 827 }
 828
 829 //____________________________________________________________
 830 void AliTRDseedV1::SetPadPlane(AliTRDpadPlane *p)
 831 {
 832 // Shortcut method to initialize pad geometry.
 833   if(!p) return;
 834   SetTilt(TMath::Tan(TMath::DegToRad()*p->GetTiltingAngle()));
 835   SetPadLength(p->GetLengthIPad());
 836   SetPadWidth(p->GetWidthIPad());
 837 }
 838
 839
 840 //____________________________________________________________________
 841 Bool_t  AliTRDseedV1::AttachClusters(AliTRDtrackingChamber *chamber, Bool_t tilt)
 842 {
 843 //
 844 // Projective algorithm to attach clusters to seeding tracklets. The following steps are performed :
 845 // 1. Collapse x coordinate for the full detector plane
 846 // 2. truncated mean on y (r-phi) direction
 847 // 3. purge clusters
 848 // 4. truncated mean on z direction
 849 // 5. purge clusters
 850 //
 851 // Parameters
 852 //  - chamber : pointer to tracking chamber container used to search the tracklet
 853 //  - tilt    : switch for tilt correction during road building [default true]
 854 // Output
 855 //  - true    : if tracklet found successfully. Failure can happend because of the following:
 856 //      -
 857 // Detailed description
 858 //
 859 // We start up by defining the track direction in the xy plane and roads. The roads are calculated based
 860 // on tracking information (variance in the r-phi direction) and estimated variance of the standard
 861 // clusters (see AliTRDcluster::SetSigmaY2()) corrected for tilt (see GetCovAt()). From this the road is
 862 // BEGIN_LATEX
 863 // r_{y} = 3*#sqrt{12*(#sigma^{2}_{Trk}(y) + #frac{#sigma^{2}_{cl}(y) + tg^{2}(#alpha_{L})#sigma^{2}_{cl}(z)}{1+tg^{2}(#alpha_{L})})}
 864 // r_{z} = 1.5*L_{pad}
 865 // END_LATEX
 866 //
 867 // Author Alexandru Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 868
 869   Bool_t kPRINT = kFALSE;
 870   if(!fReconstructor->GetRecoParam() ){
 871     AliError("Seed can not be used without a valid RecoParam.");
 872     return kFALSE;
 873   }
 874   // Initialize reco params for this tracklet
 875   // 1. first time bin in the drift region
 876   Int_t t0 = 14;
 877   Int_t kClmin = Int_t(fReconstructor->GetRecoParam() ->GetFindableClusters()*AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins());
 878
 879   Double_t s2yTrk= fRefCov[0],
 880            s2yCl = 0.,
 881            s2zCl = GetPadLength()*GetPadLength()/12.,
 882            syRef = TMath::Sqrt(s2yTrk),
 883            t2    = GetTilt()*GetTilt();
 884   //define roads
 885   Double_t kroady = 1., //fReconstructor->GetRecoParam() ->GetRoad1y();
 886            kroadz = GetPadLength() * 1.5 + 1.;
 887   // define probing cluster (the perfect cluster) and default calibration
 888   Short_t sig[] = {0, 0, 10, 30, 10, 0,0};
 889   AliTRDcluster cp(fDet, 6, 75, 0, sig, 0);
 890   Calibrate();
 891
 892   if(kPRINT) printf("AttachClusters() sy[%f] road[%f]\n", syRef, kroady);
 893
 894   // working variables
 895   const Int_t kNrows = 16;
 896   AliTRDcluster *clst[kNrows][kNclusters];
 897   Double_t cond[4], dx, dy, yt, zt,
 898     yres[kNrows][kNclusters];
 899   Int_t idxs[kNrows][kNclusters], ncl[kNrows], ncls = 0;
 900   memset(ncl, 0, kNrows*sizeof(Int_t));
 901   memset(clst, 0, kNrows*kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
 902
 903   // Do cluster projection
 904   AliTRDcluster *c = 0x0;
 905   AliTRDchamberTimeBin *layer = 0x0;
 906   Bool_t kBUFFER = kFALSE;
 907   for (Int_t it = 0; it < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); it++) {
 908     if(!(layer = chamber->GetTB(it))) continue;
 909     if(!Int_t(*layer)) continue;
 910     // get track projection at layers position
 911     dx   = fX0 - layer->GetX();
 912     yt = fYref[0] - fYref[1] * dx;
 913     zt = fZref[0] - fZref[1] * dx;
 914     // get standard cluster error corrected for tilt
 915     cp.SetLocalTimeBin(it);
 916     cp.SetSigmaY2(0.02, fDiffT, fExB, dx, -1./*zt*/, fYref[1]);
 917     s2yCl = (cp.GetSigmaY2() + t2*s2zCl)/(1.+t2);
 918     // get estimated road
 919     kroady = 3.*TMath::Sqrt(12.*(s2yTrk + s2yCl));
 920
 921     if(kPRINT) printf("  %2d dx[%f] yt[%f] zt[%f] sT[um]=%6.2f sy[um]=%6.2f syTilt[um]=%6.2f yRoad[mm]=%f\n", it, dx, yt, zt, 1.e4*TMath::Sqrt(s2yTrk), 1.e4*TMath::Sqrt(cp.GetSigmaY2()), 1.e4*TMath::Sqrt(s2yCl), 1.e1*kroady);
 922
 923     // select clusters
 924     cond[0] = yt; cond[2] = kroady;
 925     cond[1] = zt; cond[3] = kroadz;
 926     Int_t n=0, idx[6];
 927     layer->GetClusters(cond, idx, n, 6);
 928     for(Int_t ic = n; ic--;){
 929       c  = (*layer)[idx[ic]];
 930       dy = yt - c->GetY();
 931       dy += tilt ? GetTilt() * (c->GetZ() - zt) : 0.;
 932       // select clusters on a 3 sigmaKalman level
 933 /*      if(tilt && TMath::Abs(dy) > 3.*syRef){
 934         printf("too large !!!\n");
 935         continue;
 936       }*/
 937       Int_t r = c->GetPadRow();
 938       if(kPRINT) printf("\t\t%d dy[%f] yc[%f] r[%d]\n", ic, TMath::Abs(dy), c->GetY(), r);
 939       clst[r][ncl[r]] = c;
 940       idxs[r][ncl[r]] = idx[ic];
 941       yres[r][ncl[r]] = dy;
 942       ncl[r]++; ncls++;
 943
 944       if(ncl[r] >= kNclusters) {
 945         AliWarning(Form("Cluster candidates reached limit %d. Some may be lost.", kNclusters));
 946         kBUFFER = kTRUE;
 947         break;
 948       }
 949     }
 950     if(kBUFFER) break;
 951   }
 952   if(kPRINT) printf("Found %d clusters\n", ncls);
 953   if(ncls<kClmin) return kFALSE;
 954
 955   // analyze each row individualy
 956   Double_t mean, syDis;
 957   Int_t nrow[] = {0, 0, 0}, nr = 0, lr=-1;
 958   for(Int_t ir=kNrows; ir--;){
 959     if(!(ncl[ir])) continue;
 960     if(lr>0 && lr-ir != 1){
 961       if(kPRINT) printf("W - gap in rows attached !!\n");
 962     }
 963     if(kPRINT) printf("\tir[%d] lr[%d] n[%d]\n", ir, lr, ncl[ir]);
 964     // Evaluate truncated mean on the y direction
 965     if(ncl[ir] > 3) AliMathBase::EvaluateUni(ncl[ir], yres[ir], mean, syDis, Int_t(ncl[ir]*.8));
 966     else {
 967       mean = 0.; syDis = 0.;
 968       continue;
 969     }
 970
 971     // TODO check mean and sigma agains cluster resolution !!
 972     if(kPRINT) printf("\tr[%2d] m[%f %5.3fsigma] s[%f]\n", ir, mean, TMath::Abs(mean/syDis), syDis);
 973     // select clusters on a 3 sigmaDistr level
 974     Bool_t kFOUND = kFALSE;
 975     for(Int_t ic = ncl[ir]; ic--;){
 976       if(yres[ir][ic] - mean > 3. * syDis){
 977         clst[ir][ic] = 0x0; continue;
 978       }
 979       nrow[nr]++; kFOUND = kTRUE;
 980     }
 981     // exit loop
 982     if(kFOUND) nr++;
 983     lr = ir; if(nr>=3) break;
 984   }
 985   if(kPRINT) printf("lr[%d] nr[%d] nrow[0]=%d nrow[1]=%d nrow[2]=%d\n", lr, nr, nrow[0], nrow[1], nrow[2]);
 986
 987   // classify cluster rows
 988   Int_t row = -1;
 989   switch(nr){
 990   case 1:
 991     row = lr;
 992     break;
 993   case 2:
 994     SetBit(kRowCross, kTRUE); // mark pad row crossing
 995     if(nrow[0] > nrow[1]){ row = lr+1; lr = -1;}
 996     else{
 997       row = lr; lr = 1;
 998       nrow[2] = nrow[1];
 999       nrow[1] = nrow[0];
1000       nrow[0] = nrow[2];
1001     }
1002     break;
1003   case 3:
1004     SetBit(kRowCross, kTRUE); // mark pad row crossing
1005     break;
1006   }
1007   if(kPRINT) printf("\trow[%d] n[%d]\n\n", row, nrow[0]);
1008   if(row<0) return kFALSE;
1009
1010   // Select and store clusters
1011   // We should consider here :
1012   //  1. How far is the chamber boundary
1013   //  2. How big is the mean
1014   Int_t n = 0;
1015   for (Int_t ir = 0; ir < nr; ir++) {
1016     Int_t jr = row + ir*lr;
1017     if(kPRINT) printf("\tattach %d clusters for row %d\n", ncl[jr], jr);
1018     for (Int_t ic = 0; ic < ncl[jr]; ic++) {
1019       if(!(c = clst[jr][ic])) continue;
1020       Int_t it = c->GetPadTime();
1021       // TODO proper indexing of clusters !!
1022       fIndexes[it+kNtb*ir]  = chamber->GetTB(it)->GetGlobalIndex(idxs[jr][ic]);
1023       fClusters[it+kNtb*ir] = c;
1024
1025       //printf("\tid[%2d] it[%d] idx[%d]\n", ic, it, fIndexes[it]);
1026
1027       n++;
1028     }
1029   }
1030
1031   // number of minimum numbers of clusters expected for the tracklet
1032   if (n < kClmin){
1033     //AliWarning(Form("Not enough clusters to fit the tracklet %d [%d].", n, kClmin));
1034     return kFALSE;
1035   }
1036   SetN(n);
1037
1038   // Load calibration parameters for this tracklet
1039   Calibrate();
1040
1041   // calculate dx for time bins in the drift region (calibration aware)
1042   Float_t x[2] = {0.,0.}; Int_t tb[2]={0,0};
1043   for (Int_t it = t0, irp=0; irp<2 && it < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); it++) {
1044     if(!fClusters[it]) continue;
1045     x[irp]  = fClusters[it]->GetX();
1046     tb[irp] = fClusters[it]->GetLocalTimeBin();
1047     irp++;
1048   }
1049   Int_t dtb = tb[1] - tb[0];
1050   fdX = dtb ? (x[0] - x[1]) / dtb : 0.15;
1051   return kTRUE;
1052 }
1053
1054 //____________________________________________________________
1055 void AliTRDseedV1::Bootstrap(const AliTRDReconstructor *rec)
1056 {
1057 //   Fill in all derived information. It has to be called after recovery from file or HLT.
1058 //   The primitive data are
1059 //   - list of clusters
1060 //   - detector (as the detector will be removed from clusters)
1061 //   - position of anode wire (fX0) - temporary
1062 //   - track reference position and direction
1063 //   - momentum of the track
1064 //   - time bin length [cm]
1065 //
1066 //   A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de> Oct 30th 2008
1067 //
1068   fReconstructor = rec;
1069   AliTRDgeometry g;
1070   AliTRDpadPlane *pp = g.GetPadPlane(fDet);
1071   fPad[0] = pp->GetLengthIPad();
1072   fPad[1] = pp->GetWidthIPad();
1073   fPad[3] = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*pp->GetTiltingAngle());
1074   //fSnp = fYref[1]/TMath::Sqrt(1+fYref[1]*fYref[1]);
1075   //fTgl = fZref[1];
1076   Int_t n = 0, nshare = 0, nused = 0;
1077   AliTRDcluster **cit = &fClusters[0];
1078   for(Int_t ic = kNclusters; ic--; cit++){
1079     if(!(*cit)) return;
1080     n++;
1081     if((*cit)->IsShared()) nshare++;
1082     if((*cit)->IsUsed()) nused++;
1083   }
1084   SetN(n); SetNUsed(nused); SetNShared(nshare);
1085   Fit();
1086   CookLabels();
1087   GetProbability();
1088 }
1089
1090
1091 //____________________________________________________________________
1092 Bool_t AliTRDseedV1::Fit(Bool_t tilt, Bool_t zcorr)
1093 {
1094 //
1095 // Linear fit of the clusters attached to the tracklet
1096 //
1097 // Parameters :
1098 //   - tilt : switch for tilt pad correction of cluster y position based on
1099 //            the z, dzdx info from outside [default false].
1100 //   - zcorr : switch for using z information to correct for anisochronity
1101 //            and a finner error parameterization estimation [default false]
1102 // Output :
1103 //  True if successful
1104 //
1105 // Detailed description
1106 //
1107 //            Fit in the xy plane
1108 //
1109 // The fit is performed to estimate the y position of the tracklet and the track
1110 // angle in the bending plane. The clusters are represented in the chamber coordinate
1111 // system (with respect to the anode wire - see AliTRDtrackerV1::FollowBackProlongation()
1112 // on how this is set). The x and y position of the cluster and also their variances
1113 // are known from clusterizer level (see AliTRDcluster::GetXloc(), AliTRDcluster::GetYloc(),
1114 // AliTRDcluster::GetSX() and AliTRDcluster::GetSY()).
1115 // If gaussian approximation is used to calculate y coordinate of the cluster the position
1116 // is recalculated taking into account the track angle. The general formula to calculate the
1117 // error of cluster position in the gaussian approximation taking into account diffusion and track
1118 // inclination is given for TRD by:
1119 // BEGIN_LATEX
1120 // #sigma^{2}_{y} = #sigma^{2}_{PRF} + #frac{x#delta_{t}^{2}}{(1+tg(#alpha_{L}))^{2}} + #frac{x^{2}tg^{2}(#phi-#alpha_{L})tg^{2}(#alpha_{L})}{12}
1121 // END_LATEX
1122 //
1123 // Since errors are calculated only in the y directions, radial errors (x direction) are mapped to y
1124 // by projection i.e.
1125 // BEGIN_LATEX
1126 // #sigma_{x|y} = tg(#phi) #sigma_{x}
1127 // END_LATEX
1128 // and also by the lorentz angle correction
1129 //
1130 //            Fit in the xz plane
1131 //
1132 // The "fit" is performed to estimate the radial position (x direction) where pad row cross happens.
1133 // If no pad row crossing the z position is taken from geometry and radial position is taken from the xy
1134 // fit (see below).
1135 //
1136 // There are two methods to estimate the radial position of the pad row cross:
1137 //   1. leading cluster radial position : Here the lower part of the tracklet is considered and the last
1138 // cluster registered (at radial x0) on this segment is chosen to mark the pad row crossing. The error
1139 // of the z estimate is given by :
1140 // BEGIN_LATEX
1141 // #sigma_{z} = tg(#theta) #Delta x_{x_{0}}/12
1142 // END_LATEX
1143 // The systematic errors for this estimation are generated by the following sources:
1144 //   - no charge sharing between pad rows is considered (sharp cross)
1145 //   - missing cluster at row cross (noise peak-up, under-threshold signal etc.).
1146 //
1147 //   2. charge fit over the crossing point : Here the full energy deposit along the tracklet is considered
1148 // to estimate the position of the crossing by a fit in the qx plane. The errors in the q directions are
1149 // parameterized as s_q = q^2. The systematic errors for this estimation are generated by the following sources:
1150 //   - no general model for the qx dependence
1151 //   - physical fluctuations of the charge deposit
1152 //   - gain calibration dependence
1153 //
1154 //            Estimation of the radial position of the tracklet
1155 //
1156 // For pad row cross the radial position is taken from the xz fit (see above). Otherwise it is taken as the
1157 // interpolation point of the tracklet i.e. the point where the error in y of the fit is minimum. The error
1158 // in the y direction of the tracklet is (see AliTRDseedV1::GetCovAt()):
1159 // BEGIN_LATEX
1160 // #sigma_{y} = #sigma^{2}_{y_{0}} + 2xcov(y_{0}, dy/dx) + #sigma^{2}_{dy/dx}
1161 // END_LATEX
1162 // and thus the radial position is:
1163 // BEGIN_LATEX
1164 // x = - cov(y_{0}, dy/dx)/#sigma^{2}_{dy/dx}
1165 // END_LATEX
1166 //
1167 //            Estimation of tracklet position error
1168 //
1169 // The error in y direction is the error of the linear fit at the radial position of the tracklet while in the z
1170 // direction is given by the cluster error or pad row cross error. In case of no pad row cross this is given by:
1171 // BEGIN_LATEX
1172 // #sigma_{y} = #sigma^{2}_{y_{0}} - 2cov^{2}(y_{0}, dy/dx)/#sigma^{2}_{dy/dx} + #sigma^{2}_{dy/dx}
1173 // #sigma_{z} = Pad_{length}/12
1174 // END_LATEX
1175 // For pad row cross the full error is calculated at the radial position of the crossing (see above) and the error
1176 // in z by the width of the crossing region - being a matter of parameterization.
1177 // BEGIN_LATEX
1178 // #sigma_{z} = tg(#theta) #Delta x_{x_{0}}/12
1179 // END_LATEX
1180 // In case of no tilt correction (default in the barrel tracking) the tilt is taken into account by the rotation of
1181 // the covariance matrix. See AliTRDseedV1::GetCovAt() for details.
1182 //
1183 // Author
1184 // A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
1185
1186   if(!IsCalibrated()) Calibrate();
1187
1188   const Int_t kClmin = 8;
1189
1190   // get track direction
1191   Double_t y0   = fYref[0];
1192   Double_t dydx = fYref[1];
1193   Double_t z0   = fZref[0];
1194   Double_t dzdx = fZref[1];
1195   Double_t yt, zt;
1196
1197   //AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare fitterZ;
1198   TLinearFitter  fitterY(1, "pol1");
1199   TLinearFitter  fitterZ(1, "pol1");
1200
1201   // book cluster information
1202   Double_t qc[kNclusters], xc[kNclusters], yc[kNclusters], zc[kNclusters], sy[kNclusters];
1203
1204   Int_t n = 0;
1205   AliTRDcluster *c=0x0, **jc = &fClusters[0];
1206   for (Int_t ic=0; ic<kNtb; ic++, ++jc) {
1207     xc[ic]  = -1.;
1208     yc[ic]  = 999.;
1209     zc[ic]  = 999.;
1210     sy[ic]  = 0.;
1211     if(!(c = (*jc))) continue;
1212     if(!c->IsInChamber()) continue;
1213
1214     Float_t w = 1.;
1215     if(c->GetNPads()>4) w = .5;
1216     if(c->GetNPads()>5) w = .2;
1217
1218     // cluster charge
1219     qc[n]   = TMath::Abs(c->GetQ());
1220     // pad row of leading
1221
1222     // Radial cluster position
1223     //Int_t jc = TMath::Max(fN-3, 0);
1224     //xc[fN]   = c->GetXloc(fT0, fVD, &qc[jc], &xc[jc]/*, z0 - c->GetX()*dzdx*/);
1225     xc[n]   = fX0 - c->GetX();
1226
1227     // extrapolated track to cluster position
1228     yt = y0 - xc[n]*dydx;
1229     zt = z0 - xc[n]*dzdx;
1230
1231     // Recalculate cluster error based on tracking information
1232     c->SetSigmaY2(fS2PRF, fDiffT, fExB, xc[n], zcorr?zt:-1., dydx);
1233     sy[n]  = TMath::Sqrt(c->GetSigmaY2());
1234
1235     yc[n]   = fReconstructor->UseGAUS() ?
1236       c->GetYloc(y0, sy[n], GetPadWidth()): c->GetY();
1237     zc[n]   = c->GetZ();
1238     //optional tilt correction
1239     if(tilt) yc[n] -= (GetTilt()*(zc[n] - zt));
1240
1241     fitterY.AddPoint(&xc[n], yc[n], TMath::Sqrt(sy[n]));
1242     fitterZ.AddPoint(&xc[n], qc[n], 1.);
1243     n++;
1244   }
1245   // to few clusters
1246   if (n < kClmin) return kFALSE;
1247
1248   // fit XY
1249   fitterY.Eval();
1250   fYfit[0] = fitterY.GetParameter(0);
1251   fYfit[1] = -fitterY.GetParameter(1);
1252   // store covariance
1253   Double_t *p = fitterY.GetCovarianceMatrix();
1254   fCov[0] = p[0]; // variance of y0
1255   fCov[1] = p[1]; // covariance of y0, dydx
1256   fCov[2] = p[3]; // variance of dydx
1257   // the ref radial position is set at the minimum of
1258   // the y variance of the tracklet
1259   fX   = -fCov[1]/fCov[2];
1260
1261   // fit XZ
1262   if(IsRowCross()){
1263 /*    // THE LEADING CLUSTER METHOD
1264     Float_t xMin = fX0;
1265     Int_t ic=n=kNclusters-1; jc = &fClusters[ic];
1266     AliTRDcluster *c0 =0x0, **kc = &fClusters[kNtb-1];
1267     for(; ic>kNtb; ic--, --jc, --kc){
1268       if((c0 = (*kc)) && c0->IsInChamber() && (xMin>c0->GetX())) xMin = c0->GetX();
1269       if(!(c = (*jc))) continue;
1270       if(!c->IsInChamber()) continue;
1271       zc[kNclusters-1] = c->GetZ();
1272       fX = fX0 - c->GetX();
1273     }
1274     fZfit[0] = .5*(zc[0]+zc[kNclusters-1]); fZfit[1] = 0.;
1275     // Error parameterization
1276     fS2Z     = fdX*fZref[1];
1277     fS2Z    *= fS2Z; fS2Z    *= 0.2887; //  1/sqrt(12)*/
1278
1279     // THE FIT X-Q PLANE METHOD
1280     Int_t ic=n=kNclusters-1; jc = &fClusters[ic];
1281     for(; ic>kNtb; ic--, --jc){
1282       if(!(c = (*jc))) continue;
1283       if(!c->IsInChamber()) continue;
1284       qc[n]   = TMath::Abs(c->GetQ());
1285       xc[n]   = fX0 - c->GetX();
1286       zc[n]   = c->GetZ();
1287       fitterZ.AddPoint(&xc[n], -qc[n], 1.);
1288       n--;
1289     }
1290     // fit XZ
1291     fitterZ.Eval();
1292     if(fitterZ.GetParameter(1)!=0.){
1293       fX = -fitterZ.GetParameter(0)/fitterZ.GetParameter(1);
1294       fX=(fX<0.)?0.:fX;
1295       Float_t dl = .5*AliTRDgeometry::CamHght()+AliTRDgeometry::CdrHght();
1296       fX=(fX> dl)?dl:fX;
1297       fX-=.055; // TODO to be understood
1298     }
1299
1300     fZfit[0] = .5*(zc[0]+zc[kNclusters-1]); fZfit[1] = 0.;
1301     // temporary external error parameterization
1302     fS2Z     = 0.05+0.4*TMath::Abs(fZref[1]); fS2Z *= fS2Z;
1303     // TODO correct formula
1304     //fS2Z     = sigma_x*TMath::Abs(fZref[1]);
1305   } else {
1306     fZfit[0] = zc[0]; fZfit[1] = 0.;
1307     fS2Z     = GetPadLength()*GetPadLength()/12.;
1308   }
1309   fS2Y = fCov[0] +2.*fX*fCov[1] + fX*fX*fCov[2];
1310   return kTRUE;
1311 }
1312
1313
1314 /*
1315 //_____________________________________________________________________________
1316 void AliTRDseedV1::FitMI()
1317 {
1318 //
1319 // Fit the seed.
1320 // Marian Ivanov's version
1321 //
1322 // linear fit on the y direction with respect to the reference direction.
1323 // The residuals for each x (x = xc - x0) are deduced from:
1324 // dy = y - yt             (1)
1325 // the tilting correction is written :
1326 // y = yc + h*(zc-zt)      (2)
1327 // yt = y0+dy/dx*x         (3)
1328 // zt = z0+dz/dx*x         (4)
1329 // from (1),(2),(3) and (4)
1330 // dy = yc - y0 - (dy/dx + h*dz/dx)*x + h*(zc-z0)
1331 // the last term introduces the correction on y direction due to tilting pads. There are 2 ways to account for this:
1332 // 1. use tilting correction for calculating the y
1333 // 2. neglect tilting correction here and account for it in the error parametrization of the tracklet.
1334   const Float_t kRatio  = 0.8;
1335   const Int_t   kClmin  = 5;
1336   const Float_t kmaxtan = 2;
1337
1338   if (TMath::Abs(fYref[1]) > kmaxtan){
1339                 //printf("Exit: Abs(fYref[1]) = %3.3f, kmaxtan = %3.3f\n", TMath::Abs(fYref[1]), kmaxtan);
1340                 return;              // Track inclined too much
1341         }
1342
1343   Float_t  sigmaexp  = 0.05 + TMath::Abs(fYref[1] * 0.25); // Expected r.m.s in y direction
1344   Float_t  ycrosscor = GetPadLength() * GetTilt() * 0.5;           // Y correction for crossing
1345   Int_t fNChange = 0;
1346
1347   Double_t sumw;
1348   Double_t sumwx;
1349   Double_t sumwx2;
1350   Double_t sumwy;
1351   Double_t sumwxy;
1352   Double_t sumwz;
1353   Double_t sumwxz;
1354
1355         // Buffering: Leave it constant fot Performance issues
1356   Int_t    zints[kNtb];            // Histograming of the z coordinate
1357                                          // Get 1 and second max probable coodinates in z
1358   Int_t    zouts[2*kNtb];
1359   Float_t  allowedz[kNtb];         // Allowed z for given time bin
1360   Float_t  yres[kNtb];             // Residuals from reference
1361   //Float_t  anglecor = GetTilt() * fZref[1];  // Correction to the angle
1362
1363   Float_t pos[3*kNtb]; memset(pos, 0, 3*kNtb*sizeof(Float_t));
1364   Float_t *fX = &pos[0], *fY = &pos[kNtb], *fZ = &pos[2*kNtb];
1365
1366   Int_t fN  = 0; AliTRDcluster *c = 0x0;
1367   fN2 = 0;
1368   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); i++) {
1369     yres[i] = 10000.0;
1370     if (!(c = fClusters[i])) continue;
1371     if(!c->IsInChamber()) continue;
1372     // Residual y
1373     //yres[i] = fY[i] - fYref[0] - (fYref[1] + anglecor) * fX[i] + GetTilt()*(fZ[i] - fZref[0]);
1374     fX[i] = fX0 - c->GetX();
1375     fY[i] = c->GetY();
1376     fZ[i] = c->GetZ();
1377     yres[i] = fY[i] - GetTilt()*(fZ[i] - (fZref[0] - fX[i]*fZref[1]));
1378     zints[fN] = Int_t(fZ[i]);
1379     fN++;
1380   }
1381
1382   if (fN < kClmin){
1383     //printf("Exit fN < kClmin: fN = %d\n", fN);
1384     return;
1385   }
1386   Int_t nz = AliTRDtrackerV1::Freq(fN, zints, zouts, kFALSE);
1387   Float_t fZProb   = zouts[0];
1388   if (nz <= 1) zouts[3] = 0;
1389   if (zouts[1] + zouts[3] < kClmin) {
1390     //printf("Exit zouts[1] = %d, zouts[3] = %d\n",zouts[1],zouts[3]);
1391     return;
1392   }
1393
1394   // Z distance bigger than pad - length
1395   if (TMath::Abs(zouts[0]-zouts[2]) > 12.0) zouts[3] = 0;
1396
1397   Int_t  breaktime = -1;
1398   Bool_t mbefore   = kFALSE;
1399   Int_t  cumul[kNtb][2];
1400   Int_t  counts[2] = { 0, 0 };
1401
1402   if (zouts[3] >= 3) {
1403
1404     //
1405     // Find the break time allowing one chage on pad-rows
1406     // with maximal number of accepted clusters
1407     //
1408     fNChange = 1;
1409     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); i++) {
1410       cumul[i][0] = counts[0];
1411       cumul[i][1] = counts[1];
1412       if (TMath::Abs(fZ[i]-zouts[0]) < 2) counts[0]++;
1413       if (TMath::Abs(fZ[i]-zouts[2]) < 2) counts[1]++;
1414     }
1415     Int_t  maxcount = 0;
1416     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); i++) {
1417       Int_t after  = cumul[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()][0] - cumul[i][0];
1418       Int_t before = cumul[i][1];
1419       if (after + before > maxcount) {
1420         maxcount  = after + before;
1421         breaktime = i;
1422         mbefore   = kFALSE;
1423       }
1424       after  = cumul[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()-1][1] - cumul[i][1];
1425       before = cumul[i][0];
1426       if (after + before > maxcount) {
1427         maxcount  = after + before;
1428         breaktime = i;
1429         mbefore   = kTRUE;
1430       }
1431     }
1432     breaktime -= 1;
1433   }
1434
1435   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1436     if (i >  breaktime) allowedz[i] =   mbefore  ? zouts[2] : zouts[0];
1437     if (i <= breaktime) allowedz[i] = (!mbefore) ? zouts[2] : zouts[0];
1438   }
1439
1440   if (((allowedz[0] > allowedz[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()]) && (fZref[1] < 0)) ||
1441       ((allowedz[0] < allowedz[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()]) && (fZref[1] > 0))) {
1442     //
1443     // Tracklet z-direction not in correspondance with track z direction
1444     //
1445     fNChange = 0;
1446     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1447       allowedz[i] = zouts[0];  // Only longest taken
1448     }
1449   }
1450
1451   if (fNChange > 0) {
1452     //
1453     // Cross pad -row tracklet  - take the step change into account
1454     //
1455     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1456       if (!fClusters[i]) continue;
1457       if(!fClusters[i]->IsInChamber()) continue;
1458       if (TMath::Abs(fZ[i] - allowedz[i]) > 2) continue;
1459       // Residual y
1460       //yres[i] = fY[i] - fYref[0] - (fYref[1] + anglecor) * fX[i] + GetTilt()*(fZ[i] - fZref[0]);
1461       yres[i] = fY[i] - GetTilt()*(fZ[i] - (fZref[0] - fX[i]*fZref[1]));
1462 //       if (TMath::Abs(fZ[i] - fZProb) > 2) {
1463 //         if (fZ[i] > fZProb) yres[i] += GetTilt() * GetPadLength();
1464 //         if (fZ[i] < fZProb) yres[i] -= GetTilt() * GetPadLength();
1465       }
1466     }
1467   }
1468
1469   Double_t yres2[kNtb];
1470   Double_t mean;
1471   Double_t sigma;
1472   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1473     if (!fClusters[i]) continue;
1474     if(!fClusters[i]->IsInChamber()) continue;
1475     if (TMath::Abs(fZ[i] - allowedz[i]) > 2) continue;
1476     yres2[fN2] = yres[i];
1477     fN2++;
1478   }
1479   if (fN2 < kClmin) {
1480                 //printf("Exit fN2 < kClmin: fN2 = %d\n", fN2);
1481     fN2 = 0;
1482     return;
1483   }
1484   AliMathBase::EvaluateUni(fN2,yres2,mean,sigma, Int_t(fN2*kRatio-2.));
1485   if (sigma < sigmaexp * 0.8) {
1486     sigma = sigmaexp;
1487   }
1488   //Float_t fSigmaY = sigma;
1489
1490   // Reset sums
1491   sumw   = 0;
1492   sumwx  = 0;
1493   sumwx2 = 0;
1494   sumwy  = 0;
1495   sumwxy = 0;
1496   sumwz  = 0;
1497   sumwxz = 0;
1498
1499   fN2    = 0;
1500   Float_t fMeanz = 0;
1501   Float_t fMPads = 0;
1502   fUsable = 0;
1503   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1504     if (!fClusters[i]) continue;
1505     if (!fClusters[i]->IsInChamber()) continue;
1506     if (TMath::Abs(fZ[i] - allowedz[i]) > 2){fClusters[i] = 0x0; continue;}
1507     if (TMath::Abs(yres[i] - mean) > 4.0 * sigma){fClusters[i] = 0x0;  continue;}
1508     SETBIT(fUsable,i);
1509     fN2++;
1510     fMPads += fClusters[i]->GetNPads();
1511     Float_t weight = 1.0;
1512     if (fClusters[i]->GetNPads() > 4) weight = 0.5;
1513     if (fClusters[i]->GetNPads() > 5) weight = 0.2;
1514
1515
1516     Double_t x = fX[i];
1517     //printf("x = %7.3f dy = %7.3f fit %7.3f\n", x, yres[i], fY[i]-yres[i]);
1518
1519     sumw   += weight;
1520     sumwx  += x * weight;
1521     sumwx2 += x*x * weight;
1522     sumwy  += weight * yres[i];
1523     sumwxy += weight * (yres[i]) * x;
1524     sumwz  += weight * fZ[i];
1525     sumwxz += weight * fZ[i] * x;
1526
1527   }
1528
1529   if (fN2 < kClmin){
1530                 //printf("Exit fN2 < kClmin(2): fN2 = %d\n",fN2);
1531     fN2 = 0;
1532     return;
1533   }
1534   fMeanz = sumwz / sumw;
1535   Float_t correction = 0;
1536   if (fNChange > 0) {
1537     // Tracklet on boundary
1538     if (fMeanz < fZProb) correction =  ycrosscor;
1539     if (fMeanz > fZProb) correction = -ycrosscor;
1540   }
1541
1542   Double_t det = sumw * sumwx2 - sumwx * sumwx;
1543   fYfit[0]    = (sumwx2 * sumwy  - sumwx * sumwxy) / det;
1544   fYfit[1]    = (sumw   * sumwxy - sumwx * sumwy)  / det;
1545
1546   fS2Y = 0;
1547   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1548     if (!TESTBIT(fUsable,i)) continue;
1549     Float_t delta = yres[i] - fYfit[0] - fYfit[1] * fX[i];
1550     fS2Y += delta*delta;
1551   }
1552   fS2Y = TMath::Sqrt(fS2Y / Float_t(fN2-2));
1553         // TEMPORARY UNTIL covariance properly calculated
1554         fS2Y = TMath::Max(fS2Y, Float_t(.1));
1555
1556   fZfit[0]   = (sumwx2 * sumwz  - sumwx * sumwxz) / det;
1557   fZfit[1]   = (sumw   * sumwxz - sumwx * sumwz)  / det;
1558 //   fYfitR[0] += fYref[0] + correction;
1559 //   fYfitR[1] += fYref[1];
1560 //  fYfit[0]   = fYfitR[0];
1561   fYfit[1]   = -fYfit[1];
1562
1563   UpdateUsed();
1564 }*/
1565
1566 //___________________________________________________________________
1567 void AliTRDseedV1::Print(Option_t *o) const
1568 {
1569   //
1570   // Printing the seedstatus
1571   //
1572
1573   AliInfo(Form("Det[%3d] X0[%7.2f] Pad{L[%5.2f] W[%5.2f] Tilt[%+6.2f]}", fDet, fX0, GetPadLength(), GetPadWidth(), GetTilt()));
1574   AliInfo(Form("N[%2d] Nused[%2d] Nshared[%2d] [%d]", GetN(), GetNUsed(), GetNShared(), fN));
1575   AliInfo(Form("FLAGS : RC[%c] Kink[%c] SA[%c]", IsRowCross()?'y':'n', IsKink()?'y':'n', IsStandAlone()?'y':'n'));
1576
1577   Double_t cov[3], x=GetX();
1578   GetCovAt(x, cov);
1579   AliInfo("    |  x[cm]  |      y[cm]       |      z[cm]      |  dydx |  dzdx |");
1580   AliInfo(Form("Fit | %7.2f | %7.2f+-%7.2f | %7.2f+-%7.2f| %5.2f | ----- |", x, GetY(), TMath::Sqrt(cov[0]), GetZ(), TMath::Sqrt(cov[2]), fYfit[1]));
1581   AliInfo(Form("Ref | %7.2f | %7.2f+-%7.2f | %7.2f+-%7.2f| %5.2f | %5.2f |", x, fYref[0]-fX*fYref[1], TMath::Sqrt(fRefCov[0]), fZref[0]-fX*fYref[1], TMath::Sqrt(fRefCov[2]), fYref[1], fZref[1]))
1582
1583
1584   if(strcmp(o, "a")!=0) return;
1585
1586   AliTRDcluster* const* jc = &fClusters[0];
1587   for(int ic=0; ic<kNclusters; ic++, jc++) {
1588     if(!(*jc)) continue;
1589     (*jc)->Print(o);
1590   }
1591 }
1592
1593
1594 //___________________________________________________________________
1595 Bool_t AliTRDseedV1::IsEqual(const TObject *o) const
1596 {
1597   // Checks if current instance of the class has the same essential members
1598   // as the given one
1599
1600   if(!o) return kFALSE;
1601   const AliTRDseedV1 *inTracklet = dynamic_cast<const AliTRDseedV1*>(o);
1602   if(!inTracklet) return kFALSE;
1603
1604   for (Int_t i = 0; i < 2; i++){
1605     if ( fYref[i] != inTracklet->fYref[i] ) return kFALSE;
1606     if ( fZref[i] != inTracklet->fZref[i] ) return kFALSE;
1607   }
1608
1609   if ( fS2Y != inTracklet->fS2Y ) return kFALSE;
1610   if ( GetTilt() != inTracklet->GetTilt() ) return kFALSE;
1611   if ( GetPadLength() != inTracklet->GetPadLength() ) return kFALSE;
1612
1613   for (Int_t i = 0; i < kNclusters; i++){
1614 //     if ( fX[i] != inTracklet->GetX(i) ) return kFALSE;
1615 //     if ( fY[i] != inTracklet->GetY(i) ) return kFALSE;
1616 //     if ( fZ[i] != inTracklet->GetZ(i) ) return kFALSE;
1617     if ( fIndexes[i] != inTracklet->fIndexes[i] ) return kFALSE;
1618   }
1619 //   if ( fUsable != inTracklet->fUsable ) return kFALSE;
1620
1621   for (Int_t i=0; i < 2; i++){
1622     if ( fYfit[i] != inTracklet->fYfit[i] ) return kFALSE;
1623     if ( fZfit[i] != inTracklet->fZfit[i] ) return kFALSE;
1624     if ( fLabels[i] != inTracklet->fLabels[i] ) return kFALSE;
1625   }
1626
1627 /*  if ( fMeanz != inTracklet->GetMeanz() ) return kFALSE;
1628   if ( fZProb != inTracklet->GetZProb() ) return kFALSE;*/
1629   if ( fN != inTracklet->fN ) return kFALSE;
1630   //if ( fNUsed != inTracklet->fNUsed ) return kFALSE;
1631   //if ( fFreq != inTracklet->GetFreq() ) return kFALSE;
1632   //if ( fNChange != inTracklet->GetNChange() ) return kFALSE;
1633
1634   if ( fC != inTracklet->fC ) return kFALSE;
1635   //if ( fCC != inTracklet->GetCC() ) return kFALSE;
1636   if ( fChi2 != inTracklet->fChi2 ) return kFALSE;
1637   //  if ( fChi2Z != inTracklet->GetChi2Z() ) return kFALSE;
1638
1639   if ( fDet != inTracklet->fDet ) return kFALSE;
1640   if ( fPt != inTracklet->fPt ) return kFALSE;
1641   if ( fdX != inTracklet->fdX ) return kFALSE;
1642
1643   for (Int_t iCluster = 0; iCluster < kNclusters; iCluster++){
1644     AliTRDcluster *curCluster = fClusters[iCluster];
1645     AliTRDcluster *inCluster = inTracklet->fClusters[iCluster];
1646     if (curCluster && inCluster){
1647       if (! curCluster->IsEqual(inCluster) ) {
1648         curCluster->Print();
1649         inCluster->Print();
1650         return kFALSE;
1651       }
1652     } else {
1653       // if one cluster exists, and corresponding
1654       // in other tracklet doesn't - return kFALSE
1655       if(curCluster || inCluster) return kFALSE;
1656     }
1657   }
1658   return kTRUE;
1659 }
1660